5H8NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with nam
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 79
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nB02
2OWSA 5I2NA 2F7AA 4F3GA 1MM6A 1MY1A 4JWOA 4EQ7A 1DOTA 1MXUA 3CG3A 2GHAA 2VHAA 1B3GA 3TUSA 1B05A 4AB5A 4XKPA 4PFUA 5F1QA 3TQLA 4JDFA 2GHBA 3K6VA 1NNTA 4GVOA 3CG1A 4QFNA 1IXCA 3VVEA 1MM7A 4GOTA 3VXBA 2D3IA 2KLFA 4FE8A 1QVSA 4FECA 5KCJB 1ANFA 2HFBA 3ZKLA 4TQUQ 1XC1A 2DVCA 4XKNA 5CBRA 2DXYA 1PB8A 1PC3A 1LB8A 3O28A 3UIFA 2HAVA 1B40A 3H6WA 1B7HA 4GF8A 2XXIA 1XVXA 2UXAA 2AL4A 4ONYA 3FV1A 1EZPA 3MPKA 1M5CA 4NF4B 3HO7A 2YLNA 3N94A 3FD3A 4KPTA 1R9QA 3IX1A 1AIVA 1FQCA 4GQOA 1B2HA 3CVGA 4POWA 2UYEA 4BDOA 1SDXA 1B5JA 1FTKA 1WDNA 5I2KA 1SVXB 1PBQA 1S50A 4H5GA 3IJXB 3HN0A 1JEUA 5B70A 4X1DA 5J1DA 3MW0A 2NXOA 3IAZA 1Y1MA 1B7ZA 3UK4A 5AA4B 1H76A 5A5XB 3IO6A 2B65A 1IQ7A 4OYVA 4IY6A 4EXLA 3SEUA 4R6HA 2PMSA 4OXVA 3K6WA 2D21A 4NWCA 1NKXA 3LUYA 4EDPA 2PT1A 1UTBB 2PBWA 4F1VA 5TU0A 2ZNSA 3KJ7A 1UTHB 4WXJA 3MC2A 4RXLA 4F2QA 1SI1A 3SEVA 1ZMGA 1LAFE 4FEBA 3S4UA 3G3FA 4F3SA 1P1OA 1A40A 3W9VA 3H03A 4OESA 1RKMA 3CR9A 1XS5A 3KOSA 1P99A 5L9SA 3UGWA 2R71A 2D5WA 1P1NA 3F11A 4FIMA 4X48A 1UIVA 1DPEA 4R9FA 3K6XA 4NWDA 3TTNA 4F31B 3ILUB 4N07A 4U22A 1EZOA 1N04A 2QMXA 3PUZE 1NL5A 1GTKA 4GFRA 3LBSA 1MPDA 1H44A 2VD3A 5H8HB 3RTWB 5FHNA 3K00A 4GXSB 3O97A 3DP4A 1LAGE 3UA8A 1QKBA 1DMBA 3WAFA 4F2OA 4LA9A 3MAMA 3MBPA 4OEUA 2R6GE 2O68A 2YPNA 1FTJA 4H65A 3ONMA 4N13A 3T9HB 1EH3A 5KDTA 1NFTA 4DXUA 4GLIA 3RN8A 2V3UA 1B1HA 5ITPA 3N26A 1OLCA 1P1QA 4IO3A 3QYTA 1QULA 1MY3A 5H8FA 4HS7A 4AQ4A 5DT6A 1LCTA 4DZ1A 5ELVA 3H3GA 4OFJA 1VE4A 4F39A 1B3LA 3PPQA 3GBBA 3LC8A 1LGBC 2Q8JA 2VOZA 2PX1A 4ELQA 1A7LA 5FTHA 1B3EA 4NF5A 2DS9A 3LSWA 3IOTA 4ECFA 4DDDA 1EU8A 3K0VA 5L9MA 4P0IA 4QFKA 4YB7A 5DYHA 3H6VA 1A8FA 4QFLA 3O6IA 3B7DA 4R72A 3GBAA 3P7IA 5I2KB 3KG2A 4BLAA 2DWHA 4G4PA 1B3HA 1UIUA 4F22A 1DSNA 3OOAA 1LSTA 1SQYA 3V8XB 2XXPA 3OEMA 4YKIA 1FW0A 4LQ2A 2Z8FA 3K4UA 2ZNTA 1YPNA 1FQBA 2DE2A 3K1PA 2FYIA 4DIGA 3KOTA 4DXBA 4Z7EA 3IB2A 4Q30B 1N3WA 2DSFA 3OELA 3T96B 4F18A 4ZEDA 3O29A 5B7DA 4EXKA 2HXWA 3T93B 3O6GA 3V83A 4AB6A 1NNFA 5AA4A 1I6QA 2XXHA 3GZGA 3W15C 3OO6A 4NF6A 2QS4A 3PPPA 3MJNA 3FXQA 1MY2A 4GXAA 3MVZA 2QPQA 3TDJA 1A99A 3FVKA 4KYSA 3MVYA 3OENA 4ZEBA 2ONSA 4ISUA 1Y3NA 4R73A 2NOOA 2R9JA 5TPAA 2NWJA 1PB7A 1DTZA 4MLQA 3TQWA 1JVYA 2ZYOA 5DEXA 4JSDA 4X9TA 4MFIA 4TLMB 1B32A 3T66A 4KCDA 5EHMA 1N0TA 3QUFA 3O66A 1BKAA 1BLFA 1Y3QA 4WEPA 2E0SA 1N3XA 4DE8A 1MXVA 1PB9A 3MZ1A 1ZU0A 5AA1A 3HV1A 3R26A 3USDA 2YJPA 1HSLA 2DP8A 4OZ9A 3VV5A 3S2VA 3EPEA 1ZLQA 1MDP1 1B58A 2IEEA 4G8MA 4U21A 3IB0A 2RKMA 3KFMA 4M1VA 3IOWA 5IAIA 5H8HA 3L6HA 5M2VA 5KDTB 2F36A 2HAUA 5FHOA 1GR2A 1I6BA 4QRZA 3IOUA 4QF9A 3S9NC 2QS1A 3M3KA 1MQJA 5H8SA 3AXFA 3QUJA 1KWHA 3VLUA 4OWDA 3C33A 4MLVA 3HHGA 4HCYA 3SESA 4P0GA 3RUMA 1OLAA 5H8FB 2G93A 3VLWA 5AA3A 2UVJA 2X26A 3SEWA 1O64A 2ALUA 3UORA 4HW8A 3TMGA 2Z22A 4MBPA 2OLBA 4QSEA 1P1UA 3C4MA 3M3FA 1Y4CA 4HCWA 4R74A 4Q0CA 3OO7A 3TAJA 3MPLA 5L8DA 2RC8A 4H0WA 1B6HA 5DTBA 4KCCA 4OTEA 1M5FA 1XOCA 1TWYA 1Y4TA 4POXA 4NF5B 5JTYA 1OQHA 2O69A 1Z7ME 2O1LA 3ECRA 1T0KA 2O7UA 3RGYA 2F7CA 1P1WA 1ZTYA 1DPPA 1HSJA 4PQJA 1NH8A 4G77A 5TP9B 3E3KA 1D3KA 3TZAA 1BTJA 1LBBA 2XHDA 3SDFA 2H4IA 4O3BA 3PU5A 1MS7A 1MRPA 4YU0A 4QSDA 3C9HA 3V89B 5CMMA 3IOVA 3MQ9A 4Q5TA 5ISUA 5CRYA 1IZ1A 3N6UA 4ZZEA 3VVFA 4NTLA 3KZGA 1AMFA 3FVOA 2ONRA 1D9YA 2F7BA 1VSOA 3KSJA 3TELA 3KN8A 4FEDA 3BFTA 3C34A 3RNNA 4NF6B 2RC9A 2HCAA 2ZYKA 1LFGA 4YKKA 1US5A 3DM0A 1SI0A 3KJTA 3QK6A 3A09A 3L6GA 2ZYMA 1TXFA 3FUZA 2I49A 5TPAB 4OHNA 3R7XA 2Q2CA 2I48A 4UACA 5DEXB 3TEPA 3Q28A 2I58A 3RT6B 2XXRA 5LOMA 4YMAA 4LZ8A 1FQEA 3C31A 4U4SA 4YB6A 4BDQA 4FATA 3SETA 1SYHA 2UYFA 4IO2A 4LZ5A 3PMWA 1SBPA 1QUIA 3FZVA 3K1MA 4OERA 1SD3A 4NF8B 2HEUA 2W7YA 4ZEIA 4KYDA 4GL0A 2Y7PA 5I58A 2F5XA 5ITOA 1S7YA 4XTCQ 4DCXA 3H6UA 5AE4A 1MPBA 2XXUA 3EHUA 1Z7NE 5K2XA 4THIA 5AA2B 3ODBA 4RA1A 4ZECA 2NVUB 1AH5A 3E13X 4XIGQ 5DVIA 4TOZA 2I4CA 3OO8A 1AOVA 2DE4A 4ZEKA 4RJZA 3D4GA 4RK9A 4RK2A 3SEYA 1IXGA 3PD8A 1LAHE 1DTGA 1MXZA 2REGA 4BDLA 1N7WA 2XXQA 2OZZA 3N6TA 1B0LA 2DQVA 1GV8A 2ABHA 2QMWA 3RT8A 1WODA 1B9JA 3FGSA 1LLSA 2V3TA 1ZKBA 4PFTA 2UVGA 1VR5A 1PEBA 2I6EA 1A54A 1CB6A 2ZXTA 2O7IA 1VFDA 4G68A 2DOJA 3CFZA 4NMYA 1BIYA 2F6GA 2ESNA 1D4NA 4G2ZA 2F6PA 3S9LC 1FTLA 5JTYB 3H06B 4QFOA 1QW0A 1MQDA 3PUYE 3QXMA 4EQ9A 3PPOA 3GXAA 2OJTA 4P11A 4JSOA 4WKMA 3DLNA 4YZZA 4OFLA 3C35A 3G3IA 5CMBA 1YCJA 4ZDMA 1LFIA 2X7QA 1WVJA 2RCBA 1AL3A 1MY4A 4ZEFA 2A5SA 4PP0A 2RCAA 4F3BA 3FIRA 5H8NB 2Y7WA 3VDFA 3BBRA 3M8UA 1LFHA 2UVHA 4ND9A 3MVXA 2I3VA 4OQOA 3GLBA 5TP9A 2QSXA 3BFUA 5H8QA 4LONB 1YTVA 2XXTA 4O3AA 1FCKA 2PT2A 4RPOA 5I84A 2QS2A 1UQWA 3OSQA 2B3BA 3CFXA 1S9TA 3TPAA 5I56B 2Q88A 4PFWA 4EUOA 1OQGA 3U72A 2F78A 1B3FA 2DWIA 4X1BA 4LUBA 4EQBA 3IK6B 2Y7RA 3TTRA 1MXWA 4JWXA 4R2FA 1MG1A 1US4A 4C1TA 4U1ZA 1Y9UA 2M8CA 2A5TA 4HTGA 1IUDA 4KQPA 1OVBA 3ZKKA 3O9PA 2BJJX 1SW5A 4QSCA 4R75A 4ESXA 1JETA 3BKIB 3TCGA 1LB9A 3JV9A 3OEKA 2O84X 5DVJA 3SKPA 3ZS6A 3LSFB 2Q89A 2ZYNA 2OK2A 1IXHA 3CIJA 1HSEA 3B6QA 3RPWA 1JEVA 2XXVA 5I58B 1N84A 1PDAA 2VD2A 1XHYA 1OIBA 1B4ZA 4I9DA 4U4XA 4G68C 3K6UA 2I3WA 2RC7A 3FXRA 1B1XA 4ELPA 3SERA 4FAJA 3PUWE 4NF8A 3CRBA 4R9GA 4F3PA 2P2AA 3PPRA 3Q25A 1NMUA 2DYXA 1R9LA 2XXWA 4GIZA 5DVFA 1YAEA 3MUQA 1IITA 1MXXA 2O6AA 1ZJLA 4KR5A 2H98A 4FORA 5AA2A 1FQDA 1IXIA 4Q8RA 4JWYA 1GGGA 3PMXA 3RLFE 2F8DA 3H4ZA 4KD5A 3E9XA 3TTMA 2AYSA 4H5FA 4U1OA 3W9WA 1B51A 1JVXA 5AA2D 4H8JA 3Q29A 4G68B 3KEIA 4F1YA 1RYOA 2DVZA 3HHFA 3VVDA 3IB1A 3KSXA 3U8QA 1R1NA 5CMKA 4MH5A 5HBCA 3RTFB 2V3QA 1QUJA 1TT1A 3KN7A 3U92A 2B3FA 3U1OA 4DXCA 4G8NA 4IO7A 4LZ7A 5JK4A 4H6DA 2I0CA 4FJPA 1BP5A 3V5AA 3MWBA 1MDQA 4M4GA 4ZE9A 3TCHA 3MZBA 2CZLA 1B0HA 2I0BA 2ONKE 2OWTA 4IO4A 1XT8A 3LSLA 5IKBA 2XD3A 2VP1A 1SW2A 3MVWA 3MP8A 4OMBA 5CM6A 1NNKA 3UN6A 4EF2A 5H8QB 1I69A 1OVTA 2F34A 4PFYA 4PETA 4ESWA 1VFEA 3EHTA 3G7WA 3ILTB 5H8NA 3VLVA 2GH9A 3D4CA 1M5BA 1TFAA 4RPNA 3T9VA 3DP8A 1A55A 2Z23A 1MH3A 3DP6A 2ANJA 3OO9A 1POTA 1JW5A 3PMVA 1MQHA 2THIA 4XKQA 1N76A 2DXRA 5I59A 1EZ9A 4I1DA 1FTMA 5EYFA 2A5TB 3FJGA 5I56A 3H7MA 5CMCA 2HZKA 4H8IA 2X7PA 4U2RA 2V93A 4RYAA 3K02A 2REJA 5CBSA 2O51A 4R6KA 3FJMA 3QSLA 5F7VA 2CMOA 4ELOA 4QHQA 4BDMA 3T9XB 4TLLB 3G3GA 3OD7A 4KHZE 2F35A 2DWAA 2UVIA 1O7TA 3IORA 4LVQA 3CI8A 3G3JA 3MP6A 1LBCA 3TODA 2NUVA 3R6UA 1Q1KA 2XXXA 3IO4A 4ZZAA 1L5TA 1QKAA 2VGQA 2WKYA 4H67A 1Y3PA 3A3UA 4N6PA 1B5IA 1IIWA 5ICTA 4YKJA 2OCUA 5HPQA 4E0WA 3TTLA 3KBRA 5KZTA 2HQ0A 5I57A 4RNSA 3IJOB 5K2YA 3MZ9A 3TFLA 1Q35A 4E0XA 2PVUA 3Q27A 5HM4B 1LCFA 5BWJA 4JXIA 1J1NA 4C0RA 4EF1A 3PUVE 4BDRA 4KI0E 1PBPA 2Y7IA 1ZBMA 3I3VA 5EHSA 3TCFA 5CI5A 1H45A 4RY1A 3K2DA 3K01A 3C32A 1I6AA 4JBZA 2P1SA 2QS3A 1JW4A 2O1MA 1B5HA 3U94A 2ZMBA 3CSGA 4ZE8A 2XX9A 1SYIA 3O2AA 3KN3A 3H6TA 5BUUA 4IB2A 1A8EA 4GL8A 4ELRA 3ZSFA 1MH4A 3JYRA 3B6WA 2H25A 4OVJA 2RINA 5I2NB 3PGFA 3MP1A 4JB7A 3N5LA 4KFQA 3C36A 4GD5A 2QL3A 2LAOA 4LATA 4YMBA 1F9BA 4KYEA 3EQ1A 3FXUA 1USYH 3OSRA 3OXNA 1D9VA 1MXYA 4O3CA 4XKRA 1O63A 3B6TA 1JNFA 2P0SA 3HPIA 3A3CA 2Y7KA 1B7UA 1MQIA 1RYXA 3FATA 2QJEA 1CE2A 3HCQA 2PYYA 1B46A 2E1SA 4F29A 4IO5A 1MY0A 2HZLA 4GRKA 5CC2A 3EF7A 1URDA 1URGA 1XVYA 4IGRA 4NEDA 4BDNA 1OMPA 1USYE 2AIXA 4L17A 3QIMA 3IR1A 1M5EA 3FVGA 5I59B 2V84A 5KCJA 4DCYA 4IGTA 4I8CA 1Y1ZA 4QFPA 3THIA 2F97A 2Z8DA 2Q9TA 4LP2B 1FQAA 4LQ5A 4OFOA 3FVNA 3DELB 4OEVA 4NF4A 5L9OA 2DE3A 3VXCA 4OENA 4XXUA 4Z0IA 4NE4A 3EHSA 3FV2A 3PD9A 4YICA 3PUXE 2Z8EA 3O6HA 1NH7A 2RF1A 3I6VA 1ELJA 3WAEA 1MQGA 1QJMA 2AL5A 3PPNA 1II5A 4PE5B 4IY5A 2H99A 4K3FA 3G3KA 4R2BA 3RQTA 3T9UA 2G29A 4G8HA 1H43A 3IL1B 1H3DA 5A5XA 2H5YA 1GVCA 3S9MC 3EN3A 4I62A 3K1NA 4DLDA 1FTOA 2ZNUA 4H1XA 4U23A 3Q26A 2IA4A 4R6YA 1B52A 1UTBA 1ATGA 2V25A 4WEDA 1SW4A 1Y20A 1IEJA 1URSA 3RY3A 1UTHA 4YKPA 5I57B 3JZJA 2GFEA 4YAHX 3CFLA 3LR1A 3OMBA 1JW1A 1M5DA 3U93A 2I4BA 3T22A 4YB5A 3TTKA 3SEXA 2Q2AA 3LSXA 2XXYA 4IO6A 3KGCA 5FTIA 1TFDA 1JQFA 3TYHA 1QUKA 1LAXA 3UP9A 2Y84A 3E4RA 1R6ZA 2FNCA 5ICQA 3HSTA 3M3LA 1MPCA 3G3HA 4MF3A 3FJ7A 3S9EA 2H9BA 1B4HA 2XX7A 4C1UA 1N7XA 1SW1A 4GWOA 2XD2A 5JEIA 4UA8A 2QRYA 3VE1B 4F19A 4OETA 1NNPA 2GRVA 3FASA 2DWJA 1ZIUA 3CSBA 2OBGA 4F1UA 2FA7A 2XX8A 1POY1 3QAXA 4ZS9A 1FQFA 3TKDA 5FHMA 3I5OA 3PV0E 3VFJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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