3DLNA

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur3 bound to glutamate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dlnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dlnA02
2AL4A 3MVXA 1H43A 3KEIA 3MPKA 2RC8A 4EDPA 4OEUA 5I56B 3DP8A 2QL3A 4F29A 5IAIA 2I48A 2E1SA 4I9DA 4X1BA 1B4ZA 1OLAA 2HCAA 1S7YA 3K02A 3IOTA 5I57B 4IO4A 3MAMA 3CVGA 2B65A 1BTJA 2V3QA 3N6TA 4DDDA 2Y7RA 3RTFB 2ZXTA 3IB1A 3D4CA 4I62A 1Y20A 3IL1B 4NF5A 4NF6A 3GXAA 2QS4A 3ZKLA 4EXKA 2UXAA 1I6BA 2ONSA 4Q30B 4OYVA 3MC2A 3TQWA 4X9TA 1PB7A 3SERA 5JTYA 3CIJA 4TOZA 2OWTA 3PMXA 4F1UA 5KCJB 3QSLA 1B6HA 3KG2A 3N94A 3QAXA 3TTMA 3ZSFA 4O3AA 1YTVA 3SEYA 1N04A 4R2FA 2PVUA 4H1XA 2DWIA 4XKNA 1BIYA 3RT6B 1B3EA 4KYDA 2B3FA 3G3JA 4PFWA 3LBSA 3KJTA 4DCYA 5H8QB 3KOSA 1SW4A 2UYEA 4U2RA 1R9QA 2DXYA 1ANFA 1SI1A 4PP0A 1SQYA 2XD2A 1F9BA 2UVGA 3TPAA 2CMOA 3GBBA 3MZBA 4C1UA 3PPRA 1Y9UA 3A3CA 1UTHA 3DP6A 1B9JA 1M5DA 3M8UA 4QSEA 1S50A 1Y3PA 3G7WA 3HSTA 1S9TA 5EHMA 4TQUQ 2QRYA 4KR5A 1B7UA 2Z8FA 1A55A 3IOVA 1P1WA 3S9MC 4GD5A 4XKPA 2RC7A 5A5XB 3VLVA 1DPEA 5H8FB 4R73A 5AA4B 4WXJA 3CSGA 4ZDMA 4OQOA 2I4CA 5TPAA 2I6EA 3SESA 1O7TA 1OLCA 4RYAA 4KPTA 1QULA 3FXQA 4IO3A 4QHQA 1R1NA 4ZEDA 1P1NA 4H5GA 4RJZA 1I69A 2XXHA 2D3IA 3H03A 1FTMA 2LAOA 4ELRA 3QUJA 4RK2A 1YPNA 1PBQA 3C32A 3CG1A 3HHFA 2V93A 4IO2A 1RKMA 1IQ7A 1MQIA 2X7PA 4R75A 4JSDA 5ITPA 4C0RA 1EZ9A 3PU5A 2Q9TA 5AA1A 5H8HB 1YAEA 4U23A 1P1QA 4LZ8A 4R9FA 2UVIA 1B3HA 2Z8DA 4BDLA 3K1NA 5DVIA 4OFJA 4Q8RA 1FCKA 1B32A 4RK9A 4ND9A 1JEUA 5H8NB 1T0KA 5IKBA 3GZGA 5JEIA 2Y7PA 1AMFA 2E0SA 4M1VA 2ALUA 1EH3A 2QS2A 1B7ZA 3IX1A 3MVWA 4HS7A 4WEPA 1MDQA 4UA8A 2AL5A 2F97A 2Q2AA 3LR1A 3OO7A 3IJOB 1TXFA 4ZS9A 1AIVA 4U4SA 5ISUA 2UVHA 1ZTYA 1NFTA 1TFAA 1JVXA 3TTRA 3SDFA 2Z8EA 3MUQA 4JSOA 4NF4A 2O7UA 2IEEA 2GH9A 2PX1A 1IITA 3O97A 4OHNA 2F36A 3IO4A 2M8CA 4OFOA 4LONB 2PBWA 3PD9A 5I84A 4IY5A 3RNNA 5I56A 4KHZE 1CB6A 4MF3A 2QMWA 5L9SA 1GTKA 3K0VA 2HZLA 3KSXA 4ZEBA 3OD7A 1GV8A 2QMXA 2PYYA 3LSWA 4IY6A 1FQDA 5I57A 1MS7A 1MDP1 3IJXB 4AB5A 2HAUA 3C36A 5EHSA 5CMBA 3A09A 3WAEA 3VDFA 1LCFA 4Q5TA 4JWYA 2Q2CA 3PPNA 2UVJA 1L5TA 2DE3A 2O69A 5DVFA 2XXXA 3VV5A 3S9LC 1HSJA 4NWCA 3CG3A 4MLVA 4G68A 4NE4A 1ZJLA 5DYHA 3SETA 4YKJA 5KCJA 3H7MA 4BDMA 1UQWA 1VE4A 2VHAA 1LLSA 4YKKA 1US5A 1Z7NE 3O29A 4F3SA 3BFUA 4XIGQ 1H44A 1MXVA 3KOTA 2GHBA 4HCYA 4BDOA 4AQ4A 5H8QA 1JQFA 4QFNA 4RPNA 4NF8B 4YB6A 5CI5A 3IAZA 3M3LA 2OK2A 4JBZA 4QFLA 4KYEA 1DMBA 4UACA 1B2HA 1LSTA 2DYXA 3E3KA 2NXOA 3UIFA 4P0GA 1USYE 4WEDA 2QS3A 2H25A 3E9XA 4OENA 1MXZA 2DE4A 1Y3QA 2R6GE 1FQFA 5CMKA 3MZ9A 2DE2A 3TMGA 1YCJA 3LUYA 2F7AA 4I8CA 2RC9A 2XX7A 2OJTA 4G68C 5AA4A 4G2ZA 2DWAA 4KYSA 2HFBA 1SW1A 2Y7WA 4PFYA 1FTLA 3TQLA 2HZKA 3TTLA 5CMCA 1B3FA 4QFPA 2XHDA 1NMUA 4G77A 4R2BA 2GFEA 1SW5A 5CBSA 3OENA 4P0IA 5F7VA 4RPOA 1MY2A 3T93B 2V84A 1B3LA 1PEBA 2F6GA 3MBPA 4EQ7A 1JW5A 5JK4A 3LC8A 3C4MA 5I2KA 5H8HA 2V3UA 5HM4B 3K6VA 3U93A 3K2DA 2RKMA 2QS1A 3ONMA 4FEBA 1B0HA 1JVYA 1MG1A 5L9MA 1EZPA 2FNCA 4NMYA 3D4GA 2DQVA 2O7IA 1IXIA 3UA8A 3OSQA 4PE5B 5I59B 1R6ZA 2FYIA 1LGBC 2Y7KA 4I1DA 4R72A 3C9HA 1MXUA 2ZYOA 3QYTA 3F11A 3FATA 4H65A 2O1MA 1M5FA 4U1OA 1B1XA 4IGTA 3DELB 3CI8A 3TAJA 3UN6A 1LBBA 1UTBB 3K6WA 3IO6A 1A8FA 4EQ9A 3H6WA 3RTWB 5DTBA 4IO6A 1N7XA 3VVFA 3PUZE 4H6DA 3W9WA 3TODA 2ESNA 4GFRA 2RINA 5CC2A 2F35A 4GQOA 4BDNA 1D9VA 2ZYKA 2A5SA 1SBPA 2OLBA 4LQ2A 4F3BA 2VD3A 4FATA 4QSCA 3BBRA 4EF1A 2HAVA 4IGRA 2F78A 1B58A 5I58A 4THIA 1QKAA 3TKDA 1XHYA 2QSXA 1UIUA 4ESXA 1Y4TA 4FAJA 3R26A 4X1DA 3PPPA 2REJA 3G3IA 4MH5A 3OMBA 4LVQA 1MH3A 1JW4A 1LB8A 3RN8A 1A99A 4LA9A 1VSOA 4H8IA 4ZEIA 3VE1B 1BKAA 4YKIA 2I0CA 1H76A 3EF7A 4JB7A 3RLFE 1QVSA 4GIZA 4QFKA 5AA3A 4FIMA 5CM6A 3ECRA 1WVJA 1LFHA 4F18A 3S9EA 3FXUA 4DXCA 2DOJA 3QUFA 2X7QA 5FHMA 1URGA 2H9BA 4DLDA 3ILUB 3U92A 3K00A 3R6UA 1WDNA 5ICTA 5I2NB 5KDTA 1NL5A 1M5CA 4ZEFA 3IK6B 3I5OA 5FHOA 3QIMA 1Q35A 1XVXA 4EF2A 3KSJA 4LP2B 3H4ZA 3FXRA 4K3FA 1FW0A 3AXFA 4YB5A 4EUOA 3W9VA 3RT8A 2XXIA 3THIA 1Y1MA 3IOWA 1P99A 4JDFA 4LUBA 3FVOA 2GHAA 2O51A 4DCXA 4IB2A 4FORA 3K01A 4NF8A 3O66A 5ITOA 1P1UA 2DSFA 1ZMGA 4KI0E 1RYOA 4YMBA 3IORA 1PBPA 3IB0A 3M3FA 1URDA 1JW1A 3MW0A 1Z7ME 1EU8A 3SEXA 4OMBA 1QUIA 2Z23A 2RF1A 2XXVA 4GWOA 3V5AA 3TTNA 2I4BA 5K2YA 5F1QA 1MXYA 3ODBA 1SD3A 1R9LA 4TLLB 1MY3A 3SEWA 1IUDA 3U94A 3FUZA 4YZZA 2DWJA 2G29A 1LAXA 2PT2A 4NTLA 2P0SA 2Q8JA 4O3CA 3GLBA 3GBAA 4DZ1A 1B1HA 2OCUA 2DP8A 2DXRA 2XXTA 1BP5A 1MY1A 2DS9A 1XOCA 1LAGE 1POTA 4XKRA 4OFLA 3MP8A 3PUVE 3S4UA 3PUYE 5B7DA 3I3VA 1KWHA 2ZNTA 1A7LA 3WAFA 4H67A 3IR1A 5TP9B 1IEJA 3S2VA 4U1ZA 1ZIUA 4GRKA 3G3HA 1B5JA 4OXVA 3BKIB 1TFDA 1IIWA 1LAFE 2OWSA 2AYSA 1PDAA 4RY1A 3PMVA 2F6PA 2RCBA 2DVZA 3B6TA 2D5WA 5HPQA 4POXA 4FECA 1M5BA 1OQGA 1FQEA 3T96B 1O63A 5FHNA 4LZ5A 4KCCA 3KZGA 1DOTA 4YB7A 1MM6A 4DXBA 4YICA 4N6PA 3O9PA 2VOZA 3MWBA 5I59A 4L17A 4H5FA 4LQ5A 1SVXB 4F1VA 2XXUA 3QXMA 5BWJA 1I6AA 1NNFA 4PETA 2I58A 1FQAA 3HCQA 1D9YA 1USYH 1UTBA 1Y3NA 4KD5A 1MH4A 3TCFA 3H6VA 4LZ7A 1MY0A 3TFLA 4ESWA 2VGQA 3KBRA 4F2QA 4F3GA 4U22A 2KLFA 4F2OA 2H98A 2PMSA 3CSBA 4AB6A 3L6GA 4GF8A 3TTKA 1B5HA 1DSNA 3FASA 1N84A 3PMWA 4TLMB 3OO9A 1SDXA 4MFIA 1POY1 3H6TA 5K2XA 1TT1A 3PGFA 3HPIA 3O28A 4GXSB 1CE2A 1D4NA 4POWA 3C31A 1Y1ZA 4ELQA 2QJEA 2ZNUA 3CFXA 1MXXA 2P2AA 1OVBA 2AIXA 2WKYA 3MZ1A 5A5XA 3MQ9A 3M3KA 3RGYA 1MPCA 3TELA 5H8FA 2ZMBA 3FVGA 4ECFA 3VXCA 1NH8A 1N76A 2ONRA 1VFEA 3OOAA 1VFDA 1XC1A 4G8NA 3I6VA 5J1DA 4KQPA 3LSLA 2XXYA 2O68A 2Y7IA 2HXWA 1FTKA 3FZVA 3N5LA 3T9VA 3QK6A 1Y4CA 4NF4B 5FTHA 3EHSA 1IXHA 3PPOA 3JV9A 4IO7A 2DVCA 2VP1A 4NWDA 1FTOA 4R6HA 1FTJA 1LFGA 4PFUA 4JXIA 2OBGA 4Z0IA 1QJMA 3RUMA 2I3VA 2XXQA 3MJNA 1QUKA 1OVTA 1AH5A 2UYFA 5HBCA 4EQBA 4PQJA 1PC3A 4MLQA 3ZS6A 1Q1KA 1AOVA 4YU0A 5H8NA 2DWHA 3B6QA 1NNKA 3L6HA 4E0WA 4DXUA 1DTZA 1JETA 1MQGA 1URSA 5FTIA 3SEVA 4ZE8A 3C34A 4HW8A 3SEUA 2XXWA 4R74A 4YAHX 2GRVA 1GGGA 5H8SA 1RYXA 5AA2B 1QW0A 4DIGA 3H06B 1N3XA 4NEDA 3FVKA 1VR5A 4G68B 1QKBA 4XTCQ 3KN7A 1B0LA 1M5EA 2Q89A 3FV1A 3VFJA 3KN8A 1A40A 3RPWA 3KGCA 2Z22A 2YLNA 1ZU0A 4FE8A 3PD8A 4ZEKA 4QSDA 2A5TB 3EN3A 3K1MA 4F39A 4E0XA 1J1NA 5TP9A 4RXLA 4F22A 1H45A 1HSEA 2THIA 3PPQA 4OZ9A 3T9XB 3B6WA 3CFZA 3FVNA 4WKMA 2XXRA 2VD2A 1MM7A 4OWDA 1DPPA 2H5YA 2CZLA 3USDA 5CBRA 1MPBA 1MQJA 3V8XB 4BDRA 4M4GA 3G3FA 5DEXB 3UORA 3K6XA 3TYHA 4R9GA 1ZBMA 1XVYA 3KN3A 4N13A 5LOMA 3E4RA 3G3KA 1LAHE 4O3BA 1D3KA 4KFQA 4G8MA 3OO8A 5ICQA 4FEDA 3OXNA 5M2VA 4ZE9A 1HSLA 3O6HA 1WODA 3V83A 1QUJA 4XKQA 4BDQA 1PB9A 4XXUA 1SYIA 5B70A 2F8DA 3SKPA 3FGSA 3N26A 4OETA 2HQ0A 3KJ7A 3TUSA 1PB8A 3V89B 2B3BA 1MXWA 1N7WA 1B40A 1MQHA 4HCWA 2XX8A 3VXBA 2F7CA 1B51A 1US4A 2I0BA 3TDJA 3OELA 3BFTA 1ATGA 1EZOA 3ILTB 2REGA 3Q27A 4Z7EA 3MVZA 3U8QA 3O2AA 3RQTA 5ELVA 3P7IA 5L9OA 2V25A 3T22A 3R7XA 3VLUA 1JNFA 3MPLA 4ZZAA 5I2KB 4KCDA 3IOUA 3CRBA 4ZZEA 3UGWA 3FJMA 4FJPA 1SYHA 1OMPA 1ELJA 2PT1A 5EYFA 5AA2D 1B05A 3OEKA 3PUWE 3VLWA 4DE8A 1OIBA 3T9HB 1MY4A 3LSFB 4NF5B 4NF6B 3FIRA 2OZZA 2XXPA 4QF9A 3T9UA 3PV0E 2XX9A 4GL0A 3S9NC 2YJPA 3VVEA 5JTYB 1IXGA 1JEVA 4R6YA 4F31B 3DM0A 4OERA 3O6IA 3LSXA 1NNTA 2O1LA 3TEPA 4QFOA 1LFIA 1B7HA 3HHGA 1AL3A 3MP1A 2XD3A 2RCAA 1MQDA 2F7BA 3EHTA 1N3WA 4OTEA 1NNPA 2FA7A 2NUVA 2H99A 2IA4A 2O6AA 3FV2A 2Q88A 3EPEA 1SW2A 2ZNSA 4H0WA 2NWJA 4QRZA 3U1OA 2NOOA 2Y84A 3E13X 1ZLQA 5I58B 1LB9A 4ELPA 1H3DA 1UIVA 4PFTA 3UK4A 2V3TA 3DLNA 1IZ1A 2ABHA 4ZECA 4JWXA 2X26A 4X48A 1UTHB 5CRYA 2I49A 1TWYA 3HN0A 5KZTA 2ZYMA 4G8HA 3Q25A 4F3PA 4GL8A 2YPNA 3OEMA 1B46A 1B52A 1ZKBA 5AE4A 2QPQA 3C35A 2O84X 1B3GA 1IXCA 4N07A 1MPDA 4RNSA 2D21A 3W15C 2F5XA 3UP9A 3TCGA 5AA2A 2HEUA 4EXLA 3FJ7A 1DTGA 5TPAB 3FJGA 3O6GA 3CR9A 5L8DA 2NVUB 3IB2A 5KDTB 1B4HA 4GOTA 3MP6A 1XT8A 3Q28A 1NH7A 3H6UA 3HO7A 3ZKKA 4OVJA 5DT6A 2ANJA 2R71A 3OSRA 1II5A 2A5TA 4YKPA 3C33A 4P11A 3TCHA 1O64A 4U4XA 1LCTA 4BLAA 3N6UA 3JYRA 3MVYA 4OESA 2W7YA 1A54A 5CMMA 2ONKE 2G93A 1OQHA 3JZJA 3CFLA 1N0TA 3HV1A 1GVCA 3H3GA 1A8EA 3K4UA 4GLIA 4Q0CA 3Q26A 5DEXA 1NKXA 5BUUA 3OO6A 5DVJA 3KFMA 4LATA 4H8JA 1SI0A 3TZAA 4RA1A 4MBPA 4ELOA 4F1YA 3DP4A 3RY3A 1XS5A 2I3WA 4OEVA 2F34A 2P1SA 4ONYA 3G3GA 4GXAA 3Q29A 1B5IA 5I2NA 4HTGA 2R9JA 3U72A 3A3UA 3FD3A 3EQ1A 4C1TA 3VVDA 4R6KA 2H4IA 4G4PA 1MRPA 1BLFA 3K6UA 3EHUA 3PUXE 2ZYNA 4ISUA 5TU0A 4JWOA 3B7DA 4F19A 1FQBA 4GVOA 1I6QA 1P1OA 3T66A 4IO5A 1FQCA 1LBCA 2BJJX 4YMAA 4U21A 1GR2A 3K1PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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