3DLNA

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur3 bound to glutamate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 3
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dlnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dlnA02
1B6HA 1LGBC 4JSOA 3U8QA 1HSJA 5ELVA 3I5OA 5EHSA 4JSDA 1QVSA 3LSXA 1B7HA 5DVFA 3BFTA 1SBPA 3BKIB 4MLQA 2V3QA 1MDP1 5I57B 3W15C 4LATA 4XKPA 1PB8A 3RT6B 1NFTA 2I48A 5ITOA 4TQUQ 4IB2A 2DP8A 4RNSA 3T9XB 2F78A 1VSOA 4JWXA 5I59B 4GXAA 3FXQA 4NF6A 4U1OA 4OYVA 4WKMA 3PUXE 3ILTB 2UVHA 4ZEIA 1MQJA 1OLCA 1MY2A 1DOTA 4U22A 2FYIA 5H8QB 2D21A 5H8NB 2NVUB 1B05A 1BTJA 1QKAA 2Q2CA 4QFPA 2DXRA 1LBBA 4F19A 4I8CA 3OO6A 1NKXA 3TQLA 3VVDA 1LAFE 2DS9A 2Z8FA 1MXWA 1B2HA 5H8SA 3H03A 4G77A 3V89B 1GGGA 1F9BA 2NUVA 4ZDMA 1AOVA 5FHOA 4QHQA 5AA2D 4I62A 1MXXA 3TQWA 4ZE9A 1A8EA 4GXSB 3RTFB 4IY6A 4EXLA 4F1VA 3LSWA 1VFEA 4F39A 3DLNA 3IORA 3HN0A 2QSXA 5I2NB 3H7MA 1JEUA 1P1WA 1ZMGA 4OZ9A 5HM4B 1I69A 3TELA 4THIA 3SEUA 2THIA 3EQ1A 3TTKA 3CG1A 4POXA 2OWSA 5CI5A 3IOTA 1YTVA 2ESNA 3PUVE 5K2YA 1ZJLA 3G7WA 1US4A 4QFOA 4BDNA 2UYEA 3MUQA 3ZSFA 3LC8A 3T9HB 2OWTA 1Y1ZA 1LLSA 3OD7A 4OFOA 5I56A 5F1QA 3FJGA 3VXBA 2G29A 1RKMA 4RA1A 5H8HB 3G3KA 3T22A 4AB5A 3OENA 1UTBB 2OZZA 1FTKA 2FA7A 4H8IA 5DYHA 2H9BA 1HSEA 2DWAA 2HXWA 3VLVA 2NXOA 3FVOA 1B32A 3KFMA 3UK4A 1H3DA 3GLBA 4F18A 5LOMA 3IO6A 2O6AA 4BDMA 3I3VA 3RQTA 3C34A 4ISUA 4PFWA 3MVWA 3GBAA 4O3AA 1LAXA 4OWDA 4ZS9A 4OHNA 4KI0E 4IO5A 2H4IA 1PC3A 4KYEA 2Q88A 3USDA 2XX7A 4YB6A 1CE2A 3PPQA 4QFNA 4RY1A 5I58B 3KSJA 2AL5A 4U2RA 4P0IA 2DE4A 1B52A 4ONYA 3VDFA 1ZU0A 3K0VA 4DXUA 4ELRA 2HEUA 2UVJA 5AA1A 3KJ7A 4U4XA 2GH9A 2YJPA 5CMCA 1P1NA 4U4SA 5DT6A 2LAOA 3Q28A 4YKJA 3PU5A 3PD9A 3JYRA 3SEXA 3VE1B 1OVTA 1LFGA 3QUFA 1NNFA 4MF3A 3MZ9A 4YKKA 3RY3A 4JDFA 1SW5A 3CSGA 3KG2A 3TEPA 3A09A 4ELQA 2PT1A 1POY1 1H76A 2I3WA 4H65A 4MBPA 3DM0A 3ECRA 4FIMA 1GTKA 1TFAA 2I6EA 4RYAA 1B3GA 4X9TA 3B6QA 1PB9A 2A5TB 4PP0A 2QRYA 4DXCA 4HW8A 1O64A 1P1UA 1NNPA 4QF9A 1A99A 4R9GA 2DSFA 4XXUA 3H4ZA 1MDQA 3AXFA 3PMXA 2VOZA 4C1UA 1O7TA 4G4PA 3V5AA 4U21A 5DVJA 2Y7WA 4PE5B 3C35A 3LR1A 4WEDA 3R7XA 1R9QA 1XS5A 1S9TA 3O66A 2QS4A 3THIA 4MLVA 3O9PA 1TXFA 4XKQA 5FTIA 3GBBA 3KSXA 2I58A 4R72A 4YZZA 3IJOB 1IXIA 5KCJB 4F3SA 1Q35A 5ICTA 3C36A 1BLFA 4H8JA 1EZPA 1SYIA 2XXXA 3O6GA 2ZNTA 5AE4A 1FTOA 3UN6A 2F34A 2G93A 1JVYA 2QMWA 3ZKLA 3TCFA 3L6GA 1FTMA 1MY3A 3OSQA 4R6KA 5I57A 2F6PA 3O28A 4PETA 3SERA 4BDRA 1DPEA 3G3HA 4JWYA 2VD2A 2Q89A 3KN7A 1NNKA 3R6UA 3G3IA 5AA4B 1BKAA 5I59A 1A7LA 4MH5A 1MQGA 4GWOA 2W7YA 3IK6B 4F31B 5H8QA 3U1OA 3TDJA 3LSLA 5TP9B 3HHFA 2ONRA 3S4UA 3KEIA 1I6AA 3M8UA 4G2ZA 2PBWA 2NOOA 2HZLA 4ZEDA 3KN8A 3S2VA 4ZEKA 5DTBA 2F7BA 3OO8A 3RGYA 3IOVA 5CBRA 3PUZE 3C9HA 4GVOA 2O1LA 3VLUA 3N94A 4IGTA 2HQ0A 1SW2A 3S9MC 4ESXA 3K6XA 1J1NA 1JW5A 3MAMA 4LQ5A 4F3BA 2DWJA 4IGRA 3P7IA 1TT1A 3FXUA 3RTWB 1B0HA 1UIUA 2DVZA 3KBRA 3E9XA 1IQ7A 4IO7A 3JZJA 2F97A 3O97A 5I2NA 4POWA 1II5A 1OQGA 1MQIA 3QYTA 4QSEA 2PMSA 4GIZA 5M2VA 3V8XB 1SQYA 1A8FA 4K3FA 4FAJA 4Z7EA 5CMKA 2V25A 2O7UA 3ZS6A 3O29A 1KWHA 4LA9A 4KFQA 4H5FA 1LB9A 3G3FA 4KYSA 4TLLB 5FHNA 2OLBA 2ZYKA 1B3FA 3FD3A 2VHAA 4YKPA 4U1ZA 2B3BA 1OLAA 4E0WA 3S9EA 4H67A 1Z7NE 4NF4A 4KCDA 3RNNA 3H6TA 1P99A 3DELB 1JVXA 2V93A 1SW4A 4F3GA 1GVCA 3MPLA 1MH3A 2R6GE 3K6UA 2ZYNA 3C32A 2UVGA 3LUYA 5J1DA 5H8HA 1MXZA 1UTBA 1LAHE 1DTZA 1P1QA 2GFEA 3K6WA 1GV8A 3SDFA 2UYFA 1WODA 3TAJA 3OSRA 5H8FB 1FQAA 4NMYA 1SI0A 1POTA 4R6HA 2XXRA 1EH3A 1XC1A 2F5XA 2XD3A 2F35A 2DOJA 4UACA 1L5TA 3U92A 3TTLA 2Z8DA 4DCXA 1WDNA 4GFRA 2XXTA 4GD5A 4LONB 1AH5A 1B51A 3TMGA 2P0SA 4R6YA 3MP1A 3F11A 4R74A 5I58A 3H06B 4F2OA 3N26A 3EHTA 4R73A 2Z23A 3TTRA 2RF1A 1B3EA 1XOCA 1PDAA 1ANFA 3TPAA 3A3UA 4LQ2A 2Q8JA 4N6PA 3G3JA 1OMPA 2RC7A 4TLMB 2QS2A 3B6TA 3T66A 3QSLA 1B5IA 1B1XA 5I84A 4NE4A 5ITPA 4OERA 5BUUA 3FV2A 2ZMBA 3CRBA 1ZTYA 3HSTA 1Y20A 4GRKA 4OETA 2X7QA 3OMBA 1B3HA 1LSTA 1QUKA 4N07A 2A5TA 1SW1A 5KDTB 3IB2A 2F7CA 4TOZA 2OJTA 2Y7IA 3QK6A 2OK2A 2ZYOA 3LSFB 2QL3A 4ZE8A 1SI1A 3S9LC 3PPOA 4QFKA 1IITA 3TZAA 1FTLA 1EZOA 4C0RA 2GHBA 3FV1A 4YICA 1DTGA 1B5HA 4BDQA 4XIGQ 2PX1A 1MM7A 2CZLA 1A40A 2VP1A 1QW0A 4Q0CA 3UGWA 3HHGA 1IXCA 1IUDA 3OOAA 2Q9TA 2I0CA 1PBPA 4XTCQ 5JK4A 3D4CA 3K1NA 4WXJA 5KCJA 4LZ8A 1P1OA 2HAVA 4DCYA 4QSCA 5HBCA 4I9DA 4DDDA 2XXUA 3FXRA 4X1BA 1ELJA 3H6UA 4JB7A 4ZZEA 1MH4A 1OVBA 1N0TA 2Q2AA 3BBRA 4OMBA 4UA8A 2Y7RA 4OTEA 1OIBA 1Y3PA 4OESA 4RK9A 4XKRA 5AA3A 5AA4A 4FE8A 5HPQA 2QJEA 5FTHA 1NNTA 4N13A 2RCBA 4YB7A 3IB1A 3HV1A 3CI8A 3N5LA 1A55A 3CG3A 3T96B 3D4GA 4PFYA 4KD5A 3GXAA 3MP6A 2DYXA 2VGQA 4NTLA 4R2FA 3K02A 3SKPA 5TP9A 1UTHB 3FVGA 5L8DA 3K01A 1LFHA 2UXAA 2XXWA 2GHAA 3OELA 3VV5A 2PT2A 3CR9A 1H44A 2RINA 2Y84A 2ANJA 4GQOA 3CFXA 1QJMA 5L9OA 1DMBA 1AIVA 2O68A 4KQPA 1S7YA 4DIGA 1NL5A 2A5SA 2XD2A 2O51A 4FECA 4YAHX 3V83A 2QPQA 3VVFA 4F1YA 1AL3A 2PYYA 3W9WA 4RXLA 2I4BA 3HPIA 2RC9A 2REJA 2Y7PA 2IEEA 1ATGA 4NWCA 2QMXA 2Y7KA 1DSNA 4DXBA 3DP4A 1FW0A 3TUSA 1USYE 1Y3QA 4JWOA 2ZXTA 4KHZE 1JW4A 1LCTA 3CVGA 2BJJX 3IOUA 2DQVA 4I1DA 2O7IA 3MVYA 1LAGE 4YU0A 3E13X 2ZNUA 1Y3NA 1M5DA 4EXKA 3SEWA 1IXGA 2HCAA 4C1TA 5KZTA 3WAEA 1URSA 3PPPA 3FGSA 2OCUA 5BWJA 4RK2A 1BIYA 3HCQA 4PFUA 2O84X 3QAXA 2I3VA 1B40A 3RPWA 2O1MA 3M3FA 1M5BA 4G8MA 5H8NA 1RYOA 4H6DA 3SESA 3JV9A 4ELOA 4NF8B 4G68C 4F3PA 2H5YA 3VVEA 4Q5TA 3SETA 3Q27A 5L9MA 5H8FA 2Z22A 1Y4CA 4ELPA 1B4ZA 1MS7A 2QS1A 1N3XA 2XXVA 1FQBA 3TYHA 5I2KB 1ZIUA 3EF7A 1EU8A 3M3LA 3BFUA 1NH8A 3B6WA 3CSBA 3IB0A 3H3GA 4FEDA 5JTYB 5ICQA 2H98A 1SVXB 3RUMA 3FZVA 1T0KA 3KN3A 1JNFA 1QUIA 3RT8A 5AA2B 3VFJA 1Y4TA 3FJ7A 1S50A 2X7PA 2V84A 2GRVA 4FJPA 1B7ZA 2F36A 4GOTA 1MY0A 1MRPA 3TTNA 3PMVA 2Z8EA 4R75A 2I4CA 5DEXB 3SEYA 5FHMA 1MPCA 1FQDA 4LZ7A 5CMBA 1NMUA 4FATA 3O6HA 5DVIA 3FIRA 4G68B 4OFJA 3KZGA 1I6QA 3KGCA 5F7VA 4X48A 4AB6A 1Z7ME 3QXMA 3EHSA 1B1HA 3TKDA 2XHDA 2V3TA 4M4GA 2HAUA 4M1VA 4O3CA 4RPNA 2REGA 1VFDA 4FEBA 3Q25A 4ESWA 4PFTA 1XVYA 2RCAA 5TPAB 2VD3A 1RYXA 2B3FA 4L17A 1M5FA 4KYDA 4ZEBA 3PMWA 3U72A 1N7WA 5CRYA 5KDTA 1O63A 4KCCA 4H5GA 4OQOA 3LBSA 1ZKBA 4IO2A 1YCJA 1FQCA 3MP8A 3MPKA 3H6VA 3K2DA 2R9JA 5EYFA 2QS3A 3MJNA 1LFIA 1I6BA 3M3KA 1NH7A 2KLFA 2OBGA 1TWYA 2I49A 3RN8A 2ONSA 1FQEA 4NF5B 4YMAA 3PUYE 3Q29A 5IAIA 1N7XA 1SDXA 3TFLA 3MBPA 3FVKA 5A5XB 5JEIA 5L9SA 5CMMA 3FJMA 4X1DA 2DWHA 1IEJA 1XT8A 3T93B 4OFLA 5TU0A 2DXYA 3O2AA 4ECFA 4LVQA 1WVJA 4U23A 3T9UA 3I6VA 1B0LA 2F8DA 4HS7A 3H6WA 2E0SA 3N6TA 4OEUA 3FASA 3OEMA 3TODA 2XX9A 4ZZAA 4LZ5A 1MG1A 2ZYMA 3IJXB 5EHMA 2F7AA 1MXVA 3KOSA 2AL4A 3EHUA 1MY4A 3OO9A 3K4UA 4OXVA 1MQHA 4MFIA 1B58A 4G8HA 4EQBA 4NF4B 4LUBA 1R6ZA 4NF6B 4OEVA 1SD3A 4YB5A 4BLAA 5B7DA 1FQFA 3HO7A 4DZ1A 1D3KA 1PEBA 1URGA 3OO7A 3PD8A 5IKBA 3VXCA 1FCKA 1FTJA 2O69A 2RKMA 3MC2A 1UQWA 4AQ4A 4OENA 2ABHA 3U93A 3PPRA 2RC8A 5K2XA 1MPBA 1UTHA 4HTGA 3CIJA 2P2AA 1M5EA 5CC2A 4G8NA 3DP6A 4EF1A 3FATA 3UA8A 2AYSA 4BDLA 5CM6A 3N6UA 1R1NA 4NWDA 3VLWA 1B4HA 2I0BA 3QUJA 1D9YA 1QULA 1MPDA 4E0XA 4LP2B 4H0WA 1URDA 3EPEA 4EDPA 3PV0E 1Y1MA 4R9FA 3TCGA 4QSDA 2WKYA 5CBSA 3C4MA 4KPTA 2UVIA 2ZNSA 2H25A 3B7DA 4XKNA 3K00A 4EUOA 3KJTA 2XX8A 4HCYA 4BDOA 1R9LA 4KR5A 3FUZA 3R26A 4P11A 3U94A 4H1XA 1CB6A 3MWBA 1IIWA 2D5WA 1Y9UA 1N76A 3MZ1A 2B65A 4DE8A 2DE2A 4FORA 1VR5A 1B3LA 5I56B 4HCWA 3T9VA 3IO4A 2D3IA 2H99A 1GR2A 2XXPA 3W9VA 4EQ7A 4R2BA 4F29A 4YKIA 4GL8A 1USYH 1QKBA 1H43A 1B46A 1LBCA 3IOWA 2AIXA 3OEKA 1D9VA 1MXYA 4IO4A 4NF8A 4YMBA 3GZGA 1OQHA 2ONKE 3ONMA 4EQ9A 1B7UA 4P0GA 1Q1KA 3S9NC 1JQFA 1VE4A 2M8CA 1ZBMA 2FNCA 2DVCA 5B70A 5I2KA 3E4RA 3UP9A 2NWJA 1QUJA 1N04A 2XXIA 3MVZA 1JW1A 1YAEA 4Q8RA 1UIVA 1MM6A 5JTYA 4PQJA 2YLNA 1LB8A 4GLIA 1PBQA 1IZ1A 1IXHA 1JETA 3PPNA 3UORA 3MZBA 2YPNA 3TCHA 5AA2A 3EN3A 4DLDA 4OVJA 3ODBA 3L6HA 3SEVA 1MQDA 2DWIA 1B5JA 5DEXA 1N3WA 1XHYA 1B9JA 1M5CA 3MQ9A 1LCFA 4WEPA 1MXUA 3MVXA 1BP5A 3MW0A 3ILUB 4GL0A 2CMOA 3PGFA 4RPOA 3ZKKA 3QIMA 4G68A 1H45A 3K1PA 3CFLA 1MY1A 3K1MA 4RJZA 3WAFA 4GF8A 3CFZA 1DPPA 3C33A 2PVUA 4QFLA 2X26A 3DP8A 2IA4A 4Z0IA 4IY5A 4ND9A 4IO6A 3PUWE 3C31A 4QRZA 5TPAA 2F6GA 3G3GA 4JXIA 4Q30B 3O6IA 2XXHA 2V3UA 3K6VA 1ZLQA 2XXQA 3IX1A 2R71A 3FVNA 2E1SA 3Q26A 4EF2A 4ZEFA 4NEDA 3UIFA 2HZKA 4JBZA 3RLFE 1HSLA 2P1SA 3A3CA 2ALUA 1AMFA 1SYHA 1TFDA 1XVXA 1EZ9A 3OXNA 4O3BA 3KOTA 1YPNA 2HFBA 3IAZA 3IR1A 3IL1B 4ZECA 4IO3A 3TTMA 4NF5A 4F22A 1N84A 1A54A 5A5XA 2DE3A 3E3KA 5ISUA 4F1UA 1PB7A 1D4NA 4F2QA 1US5A 2XXYA 1JEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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