2ZXTA

Crystal structure of tim40/mia40, a disulfide relay system in mitochondria, solved as mbp fusion protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
451
structure length
451
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSSVPGRGSIEGRPEFAYNPDTGEINWDCPCLGGMAHGPCGEEFKSAFSCFVYSEAEPKGIDCVEKFQHMQDCFRKYPEHYAEQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, LINKER, Mitochondrial i
publication title Structural basis of yeast Tim40/Mia40 as an oxidative translocator in the mitochondrial intermembrane space.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli (strain k12)
molecule tags Protein transport
total genus 127
structure length 451
sequence length 451
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF06747 CHCH CHCH domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zxtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zxtA01
3E3KA 4R9GA 1NNKA 5I58B 4R6KA 2I6EA 3CIJA 3PUYE 3N5LA 3H06B 1LLSA 4DCYA 1FQBA 1H45A 3JYRA 1QKBA 3OO8A 4H6DA 2HCAA 4PP0A 3FVGA 4OVJA 3UIFA 2OBGA 3QUFA 1Y20A 1M5CA 2FNCA 3A3UA 3GZGA 3UP9A 4ZDMA 1MXWA 1JETA 3IB1A 4P0GA 3ZSFA 4U1OA 4U23A 4FEBA 2F97A 2QMXA 1MY4A 3IB2A 3VLUA 4BDOA 1AL3A 4F39A 2O1MA 3VXBA 3FV2A 5CMKA 1VFEA 2RC7A 5FHNA 2ANJA 3HSTA 5FTHA 4U2RA 3VLWA 1DOTA 2O6AA 5IAIA 4P11A 3HO7A 5AE4A 4P0IA 4AQ4A 3THIA 2H5YA 5KCJB 1PB7A 3TCFA 2HAUA 3CSBA 3IOTA 3UGWA 4JB7A 3MW0A 2UVIA 5I57A 3O6GA 3TZAA 3IOWA 3MP1A 3IO6A 1ELJA 3N26A 1WDNA 2B3BA 4LATA 2DXRA 1I6AA 2V3QA 4ONYA 5B70A 4UA8A 1KWHA 2LAOA 4G8HA 3QUJA 1SBPA 1EZOA 4YICA 1Z7ME 2HEUA 3O6HA 2XX9A 2XXIA 3HHGA 4OESA 3KSJA 1S7YA 3S4UA 3SESA 1LCFA 3SEUA 4ZECA 5DEXB 1UTBB 1R6ZA 3KEIA 2G93A 1Y1MA 2XXYA 5I2NA 2DWJA 3K6VA 2Q89A 2F5XA 1NFTA 3FV1A 4DDDA 4YU0A 3K00A 3PUWE 1URDA 1B5JA 3TUSA 3Q26A 3R6UA 4KYEA 2ZMBA 4ZEDA 4GQOA 1SW4A 2A5TA 5L9MA 2VOZA 3CFLA 2I48A 3FVKA 3DELB 2THIA 2XD3A 3CG1A 1XOCA 4JBZA 1NH7A 4KCDA 2RCAA 3KBRA 2XX7A 1PBPA 4K3FA 4RXLA 4NF8A 1ZJLA 5CRYA 1P1QA 4RY1A 1N7XA 1BP5A 3K6WA 2XXRA 1PB8A 2NWJA 1P1UA 3VXCA 1O64A 3OEMA 5JK4A 1IXGA 5AA3A 4WEDA 4WEPA 1MY0A 2ZNSA 1I6BA 2I0CA 3KN7A 3QXMA 3GBBA 4EQ7A 2F78A 1FTOA 2Y7RA 2V93A 3RTWB 2E1SA 2V84A 1MXUA 4HCWA 2D21A 3SERA 1IEJA 2OWSA 5TPAB 2VP1A 3C4MA 2OWTA 2XXQA 4NF6A 3U8QA 2F34A 2ZYOA 2XXTA 2F6PA 2NOOA 5JEIA 3OSRA 5TU0A 3VLVA 2ZYNA 2D3IA 1IXIA 1YAEA 3B6WA 1Z7NE 3LSWA 2BJJX 1XVYA 4YB7A 1R1NA 3PUZE 4IO4A 5KDTA 1US4A 2ZYMA 4LZ8A 1EH3A 1XC1A 1NL5A 1A7LA 2PBWA 3FXRA 2UYEA 4ESXA 3T22A 1B7UA 1USYH 3EHUA 3DLNA 1UTHA 3KZGA 1MH3A 4POXA 4EF2A 5H8QA 2VD3A 1DSNA 3T66A 2UVHA 2I0BA 4EDPA 5CI5A 4Q5TA 1FCKA 4R2BA 1NNPA 2AYSA 3K1PA 4EQBA 1URGA 4F1YA 1MH4A 4EXKA 2GFEA 3LBSA 2IA4A 2UYFA 4XXUA 1H3DA 4ELPA 3H7MA 4H1XA 1EZPA 4F2QA 3MVYA 1NNFA 4Q0CA 4RJZA 4BDNA 3RQTA 3KGCA 4YB5A 1B0HA 4ZEBA 1SI1A 3K2DA 2DSFA 2X7PA 3SETA 1EU8A 2VGQA 4NF5A 2XXWA 3ODBA 3ILUB 4MLQA 3OO9A 1QULA 5CBRA 3FASA 2AIXA 1B2HA 4FORA 3TFLA 1L5TA 3M8UA 5ISUA 2R71A 1LAGE 2DOJA 2OK2A 4GVOA 3PMWA 4NF4B 3PPNA 5I2KB 3SEYA 1ZTYA 3U92A 3QAXA 3HCQA 2XXVA 3MUQA 3MP6A 1B40A 4R9FA 3G3GA 5H8HB 4YKJA 4KHZE 4QF9A 3KSXA 1TFDA 3KG2A 4FE8A 3I5OA 5ELVA 3A3CA 5H8NA 1DPPA 1SVXB 3O29A 1JEUA 4PFTA 3G3JA 2Z22A 4OEVA 1LCTA 4ZZAA 4I62A 4JSOA 3K1NA 2Y7PA 1DMBA 1CB6A 3TODA 4MBPA 4ZEKA 3UA8A 4YKIA 4ZE8A 4FECA 3RT8A 3TTKA 3H6UA 4LP2B 2GRVA 1YCJA 4BDRA 3B6TA 1SW2A 1SW1A 5K2YA 1I6QA 2F7CA 2P2AA 3BBRA 4NWDA 3V83A 4AB5A 4DZ1A 3TTNA 1URSA 3MZBA 3FXUA 3IAZA 3H03A 4BDQA 1OMPA 3H6VA 2F6GA 4U1ZA 3K6UA 5EYFA 3LUYA 2F36A 3ZKKA 1FTLA 3V8XB 1ZLQA 4H8JA 4YKKA 4KQPA 3QIMA 2ALUA 4PETA 3CFXA 1N04A 3OOAA 1AIVA 4F3BA 1RKMA 1A55A 1OVTA 4FJPA 3H6WA 2UVJA 1IQ7A 4F1UA 1FQAA 3MZ9A 1MQGA 2QSXA 1OLCA 4QRZA 1A99A 5A5XA 3FVOA 2DP8A 4UACA 4U4SA 1TWYA 3B7DA 5L9OA 2REGA 3GXAA 1JW5A 3RGYA 3PGFA 4HW8A 1PB9A 1Y3NA 2W7YA 5TP9B 2WKYA 2Q2AA 2Y7KA 3D4GA 1P1NA 2QL3A 1SI0A 1MXXA 3T9HB 2RKMA 3P7IA 5JTYA 1LBCA 4EQ9A 3RNNA 4QSEA 2AL5A 3KN8A 1FQFA 1P1OA 2XD2A 1B32A 2QRYA 3VDFA 5HM4B 5K2XA 1NKXA 4GD5A 2QS2A 4F3GA 3TYHA 2DVZA 3C33A 4BLAA 2PT1A 5I59A 2DE2A 4YAHX 4IGRA 2ZXTA 3L6GA 5H8FA 3VV5A 3MPKA 3CR9A 2HAVA 4F1VA 3QYTA 3Q25A 2O7UA 5AA2A 3C35A 4KI0E 4XKQA 3K4UA 5EHMA 4Z0IA 1MY2A 1Y3QA 2XHDA 1B7HA 2HXWA 1NNTA 5HBCA 3ZS6A 3KJ7A 2DQVA 3G3IA 2B3FA 3W15C 3TQLA 1LB8A 4KFQA 2XX8A 4HS7A 4JSDA 4F2OA 1WODA 3BFTA 4G77A 2Q2CA 4YMBA 4FIMA 5L8DA 4THIA 1ATGA 1TT1A 3MBPA 1MM7A 4L17A 4N6PA 1JW1A 1B46A 1SYIA 1USYE 4OQOA 3FJ7A 3S9MC 4XKRA 3U1OA 1LAFE 3KOSA 1T0KA 4GL8A 3ZKLA 3MVWA 4ZEIA 4RPNA 3OO7A 1Y4TA 4HTGA 1B51A 1MXZA 2I3WA 1H43A 1AH5A 4C0RA 5CC2A 1M5DA 3PV0E 2ZYKA 4OFOA 4G8MA 2Y7IA 4OYVA 2I4BA 5I57B 1S9TA 1D9VA 2CZLA 3H4ZA 1H44A 4YB6A 3EN3A 4H67A 3N6UA 3Q28A 4QFPA 4OENA 3BFUA 4O3CA 3OO6A 2ABHA 5H8FB 1SW5A 5I56A 3IX1A 3RN8A 3E4RA 2F7BA 1NMUA 5KZTA 5F1QA 1LBBA 2ONKE 2O7IA 1EZ9A 1POY1 4YMAA 3PUXE 4KD5A 1M5FA 4LA9A 4KPTA 4C1UA 4EXLA 5AA4A 3OELA 2I49A 2O84X 1B4HA 4NWCA 1S50A 5L9SA 2I4CA 2GHBA 1R9QA 4G68A 5I2NB 1QUKA 3IL1B 1JEVA 4GIZA 1IXCA 1O63A 2Q9TA 5M2VA 1B6HA 4IY6A 4O3BA 4JWOA 3R7XA 3O66A 3K02A 2A5TB 1OQHA 4OTEA 3ILTB 3W9WA 3E9XA 1LAHE 1I69A 1LAXA 2IEEA 4LONB 3S9EA 3UK4A 4F22A 1MY1A 2RC9A 4RYAA 3PD8A 1B3EA 2CMOA 3I3VA 1LGBC 1ANFA 1D3KA 5AA1A 4F18A 3PMXA 4ESWA 4QFOA 2R9JA 1TXFA 3O6IA 1SDXA 4EUOA 4NF8B 4R72A 1OLAA 2YPNA 3PU5A 1ZBMA 1ZKBA 4DXCA 4KYSA 3OXNA 5H8SA 2O1LA 1PEBA 3VE1B 2YLNA 1JNFA 1GGGA 4XKNA 3FD3A 2ONSA 4OXVA 1SD3A 1Y9UA 1ZIUA 2O68A 1BKAA 3RPWA 3V89B 4X1BA 4JWXA 3K01A 2Q8JA 5AA2D 1B4ZA 3K1MA 3RY3A 3TCGA 5CBSA 1Y4CA 4OFLA 2PT2A 4F3PA 4MF3A 4I1DA 3TTLA 1B1XA 3PPRA 1WVJA 5DVIA 4Q8RA 3LSFB 4NF6B 2XXPA 4YZZA 1UQWA 1PC3A 1B7ZA 2ESNA 3TELA 2QPQA 4M1VA 3RTFB 4F31B 1B3HA 5DTBA 5I58A 1N0TA 4FEDA 4DXBA 5HPQA 3WAFA 2A5SA 3MC2A 3IK6B 4H5GA 4TLMB 5BUUA 1B5IA 3FIRA 3OD7A 3KN3A 3C36A 1DTZA 2QS1A 1MXYA 3IO4A 3IJXB 5KDTB 3UORA 4F3SA 4PFWA 4G4PA 3JV9A 3SKPA 2RINA 4OWDA 3SEXA 4IGTA 3TAJA 3RLFE 1B5HA 3MQ9A 2PYYA 2XXUA 1B58A 3HHFA 3H6TA 1UTHB 1LFIA 1R9LA 4IO5A 1SYHA 1MDP1 4RPOA 5DT6A 3EF7A 5H8QB 4DIGA 1OIBA 4ECFA 1M5BA 4OETA 2H99A 2UXAA 3H3GA 2DVCA 5DYHA 3BKIB 3PD9A 5ICTA 3E13X 3PPPA 2H9BA 4Z7EA 4X48A 3WAEA 3DP4A 3B6QA 3OSQA 1LSTA 1Y3PA 2UVGA 3C31A 3KJTA 1DPEA 2GHAA 3DM0A 3OENA 4RNSA 3U93A 1ZU0A 2REJA 3S9LC 1JQFA 3RT6B 5I84A 5KCJA 3W9VA 4BDMA 2ZNTA 4ZS9A 1A8EA 3VVEA 1VFDA 3EHTA 4IO6A 3FZVA 3FATA 3IORA 1LFHA 3IOVA 2HZKA 4I9DA 3TDJA 1A40A 4KYDA 4PFUA 4LZ7A 2QJEA 4R74A 1B3FA 1MQJA 2HFBA 4R2FA 4NF5B 2YJPA 3MVZA 3K0VA 5J1DA 3IR1A 4C1TA 2ZNUA 1MS7A 3HN0A 1NH8A 1JVYA 1QUIA 1D9YA 5DVJA 3FVNA 1N3WA 3T9UA 4YKPA 5BWJA 4QSDA 1H76A 4OZ9A 1N84A 4MFIA 4RK9A 4NEDA 5DEXA 1UTBA 2Y7WA 4QSCA 1N3XA 2R6GE 5CM6A 5H8NB 3DP8A 3LC8A 2OCUA 2P1SA 2Z23A 3T9XB 4LQ5A 4LUBA 1MRPA 4RK2A 4WXJA 4E0WA 2F8DA 4DE8A 1A54A 1RYOA 3M3KA 4XIGQ 3SDFA 4H0WA 4GXAA 1UIVA 4GL0A 4U4XA 1B3GA 4GLIA 4NMYA 1Q1KA 5CMBA 2Z8DA 4GOTA 3TTRA 2DE3A 3QK6A 2RC8A 3CVGA 2OJTA 5CMCA 1IIWA 4U21A 3T9VA 3FXQA 1GV8A 2E0SA 3GLBA 4I8CA 1Y1ZA 1AOVA 1XT8A 3Q29A 3GBAA 1MY3A 4NE4A 4U22A 4JDFA 2I3VA 3O2AA 2O51A 3CRBA 4X9TA 1II5A 4DCXA 1FQEA 2AL4A 4QHQA 2PMSA 1B1HA 3V5AA 1N76A 3VVDA 3IB0A 3CSGA 2H25A 3MWBA 4Q30B 4DXUA 1Q35A 5TPAA 3PPOA 3LR1A 4G68C 3MP8A 5F7VA 3G3FA 4ELRA 3EPEA 5A5XB 3U94A 4E0XA 3O28A 4JWYA 5FTIA 4R73A 3AXFA 4R75A 4H5FA 3TKDA 4H65A 4G2ZA 4TOZA 1A8FA 3S2VA 5CMMA 1O7TA 1VE4A 2DYXA 3FJGA 4KCCA 1XHYA 2QMWA 1AMFA 2H4IA 2NXOA 5JTYB 1B0LA 2DWAA 1IUDA 2X26A 1MM6A 2GH9A 1YTVA 3OMBA 4QFNA 2D5WA 1D4NA 3MVXA 4QFLA 3EQ1A 4OHNA 2O69A 3MJNA 3LSXA 3PPQA 4EF1A 2HZLA 1XVXA 3KOTA 5FHOA 4N07A 1JVXA 3JZJA 5I59B 4ZE9A 1N7WA 2XXXA 3C34A 4POWA 1BLFA 1B3LA 3Q27A 5AA2B 4H8IA 4F19A 1IITA 4PE5B 4LVQA 4LZ5A 4QFKA 1FW0A 1FTMA 4ELOA 1HSJA 3CFZA 3R26A 1P99A 2B65A 2M8CA 2QS4A 2DXYA 2P0SA 5ITOA 3ECRA 2X7QA 1MXVA 3IJOB 4NTLA 3ONMA 1MQHA 1QW0A 1QJMA 4XKPA 1MQDA 4IO3A 4OFJA 2DS9A 3SEWA 1YPNA 1MPDA 3KFMA 1MG1A 2OLBA 2V3UA 3MAMA 2NVUB 4KR5A 2PX1A 2FA7A 4LQ2A 4IO7A 2F35A 2NUVA 4AB6A 1IXHA 4X1DA 1B05A 3LSLA 1US5A 4NF4A 5I2KA 4DLDA 1QKAA 4GFRA 1B9JA 1M5EA 2Z8FA 5FHMA 3TCHA 2QS3A 4M4GA 4GXSB 1MPBA 5H8HA 2ONRA 4ZZEA 5EHSA 3A09A 3EHSA 5LOMA 3TPAA 3RUMA 4ISUA 3N94A 3OEKA 2Y84A 5DVFA 2H98A 3O9PA 3USDA 3TMGA 4GRKA 3F11A 3MPLA 3QSLA 2DWIA 2RCBA 5B7DA 3FGSA 4JXIA 4N13A 2VD2A 3G3HA 5I56B 3VVFA 5IKBA 1LB9A 3UN6A 3HPIA 2RF1A 3L6HA 1F9BA 1POTA 1BIYA 2PVUA 5AA4B 4TLLB 3TEPA 3K6XA 1CE2A 2G29A 1UIUA 3C32A 2DWHA 1TFAA 1PDAA 1MPCA 1OVBA 4MLVA 1OQGA 4G68B 3TTMA 4PQJA 1QVSA 1RYXA 1FQDA 4OEUA 3G7WA 3N6TA 3M3FA 4WKMA 4ND9A 3T96B 4ELQA 1GR2A 4TQUQ 2HQ0A 1MQIA 4F29A 3G3KA 4PFYA 2I58A 3TQWA 4OMBA 3C9HA 3FJMA 4R6HA 4R6YA 4IY5A 1VR5A 1HSLA 1P1WA 1LFGA 5ICQA 1XS5A 3VFJA 2V25A 3FUZA 4OERA 3D4CA 4IB2A 3M3LA 3U72A 4HCYA 2XXHA 1GVCA 4RA1A 1BTJA 1J1NA 4G8NA 1QUJA 3I6VA 1VSOA 2OZZA 1SQYA 1MDQA 1ZMGA 2Q88A 2DE4A 3T93B 4XTCQ 3DP6A 2V3TA 4O3AA 1FTJA 4BDLA 3MZ1A 4FATA 4MH5A 2F7AA 5TP9A 2VHAA 4IO2A 3HV1A 3CG3A 3PUVE 1IZ1A 3IOUA 4ZEFA 3S9NC 2KLFA 4GWOA 1PBQA 1FQCA 1DTGA 3SEVA 5ITPA 2Z8EA 1JW4A 3O97A 2FYIA 1GTKA 1FTKA 3PMVA 1HSEA 4GF8A 3CI8A 4FAJA 1B52A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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