2ZXTA

Crystal structure of tim40/mia40, a disulfide relay system in mitochondria, solved as mbp fusion protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
451
structure length
451
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSSVPGRGSIEGRPEFAYNPDTGEINWDCPCLGGMAHGPCGEEFKSAFSCFVYSEAEPKGIDCVEKFQHMQDCFRKYPEHYAEQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Protein transport
source organism Escherichia coli (strain k12)
publication title Structural basis of yeast Tim40/Mia40 as an oxidative translocator in the mitochondrial intermembrane space.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, LINKER, Mitochondrial i
total genus 127
structure length 451
sequence length 451
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF06747 CHCH CHCH domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zxtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zxtA01
3TAJA 3OXNA 3PPNA 5ICTA 4JBZA 3C32A 4EF1A 2I48A 1D9YA 4GIZA 1MY3A 1OLCA 2QSXA 4ND9A 1R6ZA 3OENA 5KDTA 1BIYA 3U94A 1EZPA 1N3XA 2ESNA 2HAVA 5I2KA 3PMXA 4LUBA 3O6HA 3LSFB 3A3UA 4EDPA 1FQDA 2GHBA 3R26A 3A3CA 4F39A 5EHMA 1B46A 2V3TA 3OMBA 2Q2AA 1XVYA 2ONRA 3M8UA 4YB6A 5B70A 2REJA 2F34A 4IO5A 5I2NB 4RJZA 3G7WA 4KYDA 2DWHA 1EZ9A 4RA1A 4F3BA 2O51A 2ZNSA 4KR5A 4G2ZA 3KJ7A 4K3FA 3DELB 3G3HA 2REGA 2IA4A 3GBAA 5HPQA 4MBPA 3VLWA 3OO9A 2CMOA 2GFEA 4FORA 4XKQA 5I2NA 4GF8A 3OSRA 2HCAA 3C31A 1JETA 1MM7A 4FATA 2OZZA 1JW4A 3R6UA 1LB9A 3GXAA 2F8DA 1XOCA 4ZECA 1ZKBA 1PC3A 1XC1A 1MXXA 5KZTA 1MXUA 3UP9A 2O1MA 3Q26A 1OQGA 2XXXA 4OTEA 3KGCA 3EQ1A 3C9HA 4I1DA 5LOMA 1CE2A 5K2XA 4NF4B 4R72A 4UACA 3FXUA 3T22A 4H8IA 3K01A 4M4GA 3FD3A 4KCDA 3PMWA 4YAHX 4NF6B 3T96B 4R2BA 2O1LA 4QFOA 3L6GA 2OJTA 1SQYA 1S9TA 1SYHA 3Q27A 3DM0A 4F3SA 3MVYA 4NF4A 4P0IA 1Q1KA 3TMGA 4ELQA 2NOOA 4JWYA 3TCGA 4Z7EA 1MY4A 3JYRA 1EZOA 4LP2B 3S4UA 3G3FA 3FUZA 2NWJA 4ZS9A 1ZJLA 4G8MA 4G68C 2O6AA 3PU5A 1YTVA 4IO6A 2YJPA 1CB6A 4E0WA 5IAIA 3I6VA 1JVYA 2I0BA 5H8QB 2Q8JA 5TU0A 1ZTYA 1QUJA 4DXCA 1M5FA 2ANJA 3TELA 2UVJA 3QSLA 3CSBA 4MLQA 3E3KA 1LBCA 5IKBA 4R6KA 2DE4A 1VFDA 4DXUA 4U4XA 1XS5A 3RY3A 3KN3A 1XT8A 2F35A 2GRVA 2XXUA 3OO8A 3CG1A 1O7TA 5H8QA 5TP9B 4ZDMA 3MC2A 4OFLA 1HSJA 3CFXA 4OZ9A 1PB8A 3EHSA 4R73A 1JVXA 1MQGA 3M3FA 2D3IA 4IO7A 2F7BA 1MPDA 2HEUA 4ZZAA 1H45A 2ZYOA 3IL1B 3BBRA 1GV8A 1LAXA 3FASA 3PMVA 5TP9A 2HQ0A 2VGQA 3SEVA 5DVIA 4FAJA 4U1ZA 1I6AA 4EF2A 1TFDA 3HO7A 2H9BA 1B32A 3QK6A 4QFKA 3CFZA 1LGBC 4N13A 3TCFA 3C35A 1NFTA 1PBPA 1XVXA 5F1QA 1IIWA 5AE4A 4M1VA 2DVCA 3T9XB 1IXIA 3TTNA 3EHUA 4KFQA 4R9FA 1Y20A 4YMAA 4FE8A 1B5JA 1URSA 1B2HA 4FJPA 1N0TA 4U4SA 1R9LA 1MH4A 3V89B 3DP8A 1MQHA 4ZEKA 3PD8A 4GVOA 3DP4A 3MAMA 2NVUB 3I5OA 2B3FA 4PFTA 5B7DA 4XTCQ 3PD9A 1OMPA 3RUMA 3SETA 1JQFA 2PT1A 2BJJX 5AA4B 1M5EA 3H4ZA 1SYIA 1B5HA 1B7UA 4H67A 1DMBA 1TXFA 3E9XA 3PUWE 4OEUA 4Q5TA 3TEPA 1SW4A 3TTLA 3TODA 4TOZA 1GGGA 4BDMA 2Z8FA 4GOTA 3L6HA 3TTKA 4OESA 3H7MA 4OWDA 3MUQA 3CI8A 4O3BA 1MPBA 4YMBA 1NNTA 3IB2A 5L9SA 1YCJA 1PEBA 2RC7A 4DCXA 3PGFA 4X9TA 4DIGA 1RYXA 4ELRA 1SD3A 2XXQA 3E4RA 4PE5B 3ZS6A 4JSDA 3O29A 1IZ1A 3O6GA 4KPTA 2Y84A 1Y4CA 2I4BA 4IO2A 5I58B 3SERA 1FCKA 4OFJA 4YB5A 4ONYA 5K2YA 4HCWA 5L8DA 1UIVA 3CRBA 3IX1A 4IB2A 2ZXTA 3O97A 3FXRA 3KOTA 5I58A 4RPNA 2XXTA 3KFMA 3FJ7A 4C0RA 2A5TB 5H8HB 2PMSA 3UK4A 2I49A 1YPNA 4XKNA 3IOUA 4HCYA 2Q2CA 3H03A 1JW5A 1M5DA 4KHZE 5FHOA 3QUFA 4GXAA 4C1TA 2DYXA 2A5TA 1M5CA 1ZU0A 1TT1A 3IOVA 1QJMA 1QULA 3OO7A 2Z8DA 3HV1A 4XKRA 4NEDA 1Y3PA 2H99A 4DLDA 4GD5A 1VR5A 4QRZA 3FVNA 5FTHA 1MXYA 1NNPA 1P99A 4F3GA 1B5IA 3FVKA 4DZ1A 5AA2B 2XD3A 1I6QA 4GRKA 1JEVA 1NMUA 4DDDA 1IXGA 3LSLA 1B58A 2I0CA 1QKBA 4HTGA 2V3QA 2VD2A 1QUIA 3H3GA 3AXFA 4TLLB 2XXWA 2WKYA 3RPWA 5AA2A 3THIA 3ONMA 4RK9A 2PX1A 3SDFA 4JB7A 2D21A 5I56B 4JDFA 1Y3NA 1B3EA 1EU8A 2I58A 5CBRA 1DOTA 2G29A 2F6PA 2VOZA 2ONKE 4BDNA 4WEDA 1AL3A 4POWA 3EHTA 2QS3A 4GLIA 1JEUA 4QF9A 3ILTB 5CBSA 4AB6A 2X26A 2E0SA 1LCFA 3TZAA 1KWHA 3UIFA 5I56A 2F7AA 5FHNA 1GVCA 4JXIA 2H5YA 2NXOA 5CI5A 5DEXB 5CMBA 3UA8A 4IGRA 3ODBA 3Q29A 4X1BA 1ATGA 1IITA 2XXPA 4O3CA 3N5LA 2DSFA 3EN3A 3VXCA 3KOSA 4P11A 3FV1A 3FVGA 3V5AA 2KLFA 1A99A 5DEXA 3E13X 4ZE8A 3LBSA 2XD2A 3OO6A 2AIXA 1QKAA 3H6VA 1DPEA 4QFPA 2NUVA 2H98A 4GXSB 1H43A 3PUVE 2F97A 5AA1A 1VSOA 3N6TA 1NH7A 3JV9A 5I57B 4YZZA 1MQDA 5ICQA 1J1NA 1B0HA 4OMBA 3M3LA 4U2RA 2D5WA 4KCCA 4PETA 1POTA 1FTOA 4NF6A 2XXHA 5CMCA 3F11A 3K00A 5CM6A 4AB5A 5CC2A 3K6UA 2DVZA 1MDP1 3G3IA 4DE8A 1I69A 2QS1A 3Q25A 3HPIA 3IB0A 1IUDA 1QUKA 2O84X 3RLFE 4OEVA 5L9MA 5AA3A 3SESA 3D4CA 4YU0A 4GL8A 4G8NA 1NNKA 3MP6A 2I3WA 4YKKA 5H8FB 1ZLQA 3KSJA 3UORA 2OBGA 3FIRA 2DP8A 3UN6A 1IEJA 2Q89A 3U93A 1QVSA 3VXBA 2QMXA 4KYEA 3EPEA 5A5XB 4R75A 2VHAA 4FECA 1IXHA 4KQPA 4F3PA 3KBRA 3I3VA 2V3UA 5H8FA 3A09A 3ILUB 1B3GA 3MVZA 1IQ7A 1OVTA 3D4GA 4QSEA 1Y1ZA 5CRYA 1NNFA 3MZ1A 2GHAA 4GQOA 1MPCA 5A5XA 5I59B 4RXLA 3VVFA 3W9WA 3OSQA 1Z7ME 2I4CA 4ZEBA 4TQUQ 5JEIA 1VFEA 1LAHE 3KN7A 1MG1A 3IOWA 3TQLA 4KI0E 2XXYA 3SEYA 3IORA 1LB8A 4EUOA 3VDFA 3Q28A 5I59A 1A54A 2QMWA 1MY0A 1LAFE 1SI1A 2OLBA 4F2OA 3RN8A 3IO6A 1MY1A 1A55A 3LSWA 1B7ZA 4G8HA 1B3FA 1B05A 1WODA 2ZYMA 4OQOA 4FEBA 1LFIA 2ONSA 4RNSA 1RYOA 2Y7RA 4LQ2A 1NKXA 3FGSA 1AIVA 2G93A 2XHDA 3VLUA 1TWYA 5M2VA 1HSLA 4F1UA 3DP6A 1US4A 3FXQA 1UIUA 1B40A 4OERA 2XXIA 3GBBA 1DTGA 3RT6B 1VE4A 4QHQA 2X7PA 1URGA 4IGTA 3K6XA 1H3DA 1T0KA 1ANFA 3QAXA 3MP1A 3C34A 5EYFA 1PB7A 3B6QA 5I84A 2PYYA 3DLNA 2ZNUA 4F2QA 5CMMA 4BDQA 2XXRA 4H5FA 2LAOA 1GR2A 2DWIA 4ZEIA 2RC8A 4YKIA 4EQBA 2P1SA 4ISUA 4LATA 3FV2A 1NL5A 3O9PA 1FQFA 1B4HA 2R71A 1MQJA 2QRYA 5AA4A 4F31B 1F9BA 2H4IA 3G3JA 1A8FA 4JWXA 3MBPA 3KJTA 2XX9A 3GLBA 4PP0A 1BTJA 2UVIA 1D3KA 1WDNA 1UTBB 2R9JA 3PUXE 4XIGQ 4X48A 3T9UA 2DOJA 2RCAA 3UGWA 2QJEA 1II5A 4POXA 4ESXA 2YPNA 4R74A 3JZJA 3MW0A 3B7DA 1IXCA 3OEMA 1P1QA 1XHYA 1BP5A 2F5XA 1B51A 4LA9A 4G68B 4H6DA 1MY2A 2FNCA 3HCQA 2QS2A 1UTBA 2E1SA 4R6HA 5DT6A 3FATA 5DTBA 1O64A 1UQWA 1MM6A 2P2AA 4Q0CA 4F1VA 2DWAA 4F22A 4F29A 2Y7IA 4QFLA 3OD7A 3SEXA 4BDLA 3IAZA 4G68A 3MPKA 4N6PA 3K6VA 1SW2A 5AA2D 2CZLA 4R9GA 3HHFA 4FEDA 3KZGA 1POY1 4IO3A 1S7YA 2R6GE 2OCUA 2V84A 4F19A 2Y7WA 4ELPA 2Y7PA 3PUZE 1PB9A 4LZ7A 2P0SA 4ELOA 4IY6A 2O69A 1LSTA 4PFYA 3IR1A 1TFAA 5H8HA 1SW1A 1N84A 3IK6B 3K1PA 3U1OA 5CMKA 2ZMBA 2A5SA 3K02A 4LZ8A 5BWJA 3K0VA 1SW5A 1DPPA 4BLAA 2XXVA 5ITPA 3P7IA 3S9LC 1OVBA 1MXZA 4P0GA 1R1NA 1D4NA 3N94A 3LR1A 1OLAA 5JTYB 3TTRA 1B1HA 3TPAA 4EQ7A 3BFTA 3VVEA 5I2KB 4O3AA 2Y7KA 2ZNTA 2PBWA 3G3KA 1N76A 3VLVA 3U92A 3KN8A 1B7HA 4ZZEA 5DVFA 5JTYA 4QSCA 3TKDA 2AL4A 4DCYA 4PFWA 4H0WA 4H1XA 1FQCA 4EXLA 4GFRA 2O68A 1FW0A 2HZKA 3V83A 4YKPA 3VFJA 3T9HB 5H8NB 2B65A 1MRPA 1B1XA 4EXKA 3IO4A 4OXVA 1USYH 2Z23A 4OVJA 3QIMA 3IJXB 4DXBA 4E0XA 1YAEA 1MH3A 4H8JA 3H06B 1FTLA 1FTKA 4ESWA 3C4MA 1OIBA 1MS7A 5DYHA 3KSXA 4NWDA 1Z7NE 3EF7A 5H8NA 1PDAA 1URDA 3MQ9A 2OK2A 3QUJA 4YB7A 4Q8RA 1Q35A 3N26A 4U22A 3TFLA 2PT2A 4MLVA 3CR9A 4UA8A 3MZBA 4NF8B 1UTHB 2DXRA 4BDOA 4WXJA 3MJNA 4GWOA 4KD5A 3T93B 1LLSA 3C33A 3TUSA 3FZVA 2QS4A 1PBQA 3T9VA 2ALUA 3O66A 1LFGA 4X1DA 1Y4TA 4Z0IA 4XXUA 2Z22A 3PPRA 3OELA 2HXWA 3RNNA 1NH8A 3W15C 4NF8A 3VVDA 3VV5A 1UTHA 2DXYA 1SDXA 3U72A 2AL5A 1B3HA 4HS7A 4NF5B 4JWOA 2W7YA 5KCJB 2DQVA 3H6WA 2THIA 3HHGA 2UXAA 4U1OA 4PQJA 4MF3A 1QW0A 3W9VA 5TPAB 3RGYA 1AH5A 3ECRA 4NF5A 2Q88A 1I6BA 2HAUA 5I57A 5KCJA 2RCBA 5H8SA 3CG3A 4C1UA 1Y1MA 4U23A 4G4PA 3T66A 1FTMA 5JK4A 4OHNA 3S2VA 4YKJA 3TQWA 5F7VA 5TPAA 1MXWA 1ZIUA 4ECFA 3WAFA 2F6GA 1A7LA 2OWSA 4XKPA 2ZYKA 1N3WA 2O7IA 4U21A 1MQIA 4F1YA 4HW8A 2Z8EA 2F7CA 3PPOA 4NWCA 2IEEA 1B9JA 4OENA 4L17A 2RC9A 4NTLA 4TLMB 2UYEA 1A40A 4LONB 2V25A 3CVGA 3FJMA 1LFHA 1H76A 4I62A 2UYFA 4ZEDA 4QSDA 1BKAA 2HZLA 2ZYNA 1SI0A 4H5GA 1JW1A 4RY1A 4EQ9A 1P1OA 2RF1A 3WAEA 4GL0A 1L5TA 3HN0A 3MP8A 1B3LA 2H25A 3HSTA 4LQ5A 1B52A 3PPPA 4IY5A 3LSXA 3H6TA 5ITOA 4WEPA 2DE2A 4PFUA 3K2DA 1P1WA 1S50A 4N07A 4OETA 1OQHA 3SEWA 3S9NC 3R7XA 4BDRA 4H65A 1JNFA 3C36A 5EHSA 1ZBMA 2I6EA 4KYSA 4RK2A 2ABHA 4I8CA 1P1UA 3LUYA 2VD3A 1LBBA 1B6HA 1LAGE 1AMFA 3B6TA 2RINA 3MWBA 3K1MA 1FQAA 2GH9A 2VP1A 2AYSA 4IO4A 5HBCA 1DSNA 3CIJA 1R9QA 1SBPA 3PPQA 3S9MC 3SEUA 3ZKLA 2DE3A 4LZ5A 5J1DA 1MDQA 1O63A 1FQEA 3BKIB 4MFIA 5ISUA 3FJGA 2I3VA 1EH3A 2DS9A 4AQ4A 3MPLA 3K4UA 2UVHA 3O2AA 3OOAA 4MH5A 3BFUA 4ZEFA 3TTMA 3K6WA 3MZ9A 2F36A 3TYHA 4WKMA 2PVUA 3RTWB 4ZE9A 2DWJA 4THIA 4FIMA 2XX8A 3CSGA 1ZMGA 1DTZA 5HM4B 3SKPA 2Q9TA 3MVWA 2FA7A 4RPOA 1N04A 2F78A 3S9EA 3CFLA 5L9OA 2M8CA 1ELJA 1FTJA 1N7WA 3O28A 3OEKA 4RYAA 1A8EA 3O6IA 3TDJA 3RTFB 1AOVA 4OYVA 4JSOA 4Q30B 2FYIA 4NE4A 4R6YA 1HSEA 2XX7A 3QXMA 3G3GA 3MVXA 2UVGA 4NMYA 1GTKA 4QFNA 4I9DA 3IJOB 1H44A 1RKMA 1SVXB 5FTIA 3N6UA 3IB1A 2RKMA 5BUUA 1M5BA 3U8QA 3GZGA 5DVJA 2X7QA 2HFBA 3IOTA 1B4ZA 3PUYE 2B3BA 3V8XB 1D9VA 3RT8A 3FVOA 2YLNA 1US5A 3M3KA 3K1NA 2QPQA 4LVQA 1FQBA 4OFOA 2QL3A 3H6UA 2O7UA 1Y9UA 3ZKKA 1WVJA 3QYTA 1P1NA 2OWTA 4F18A 3TCHA 3VE1B 5FHMA 3ZSFA 3KEIA 4G77A 1Y3QA 1BLFA 3RQTA 1USYE 5ELVA 1N7XA 5KDTB 1B0LA 3B6WA 3PV0E 2V93A 3KG2A 4R2FA 4YICA 1MXVA 1LCTA 3LC8A 3USDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EQ8A 3TAJA 1CNQA 3OXNA 3PPNA 5ICTA 4JBZA 3C32A 4EF1A 2I48A 1D9YA 4GIZA 1MY3A 1OLCA 2QSXA 4ND9A 1R6ZA 3OENA 4MHFA 5KDTA 1BIYA 3U94A 1EZPA 1N3XA 2ESNA 2HAVA 5I2KA 3PMXA 4LUBA 3O6HA 3LSFB 1Q9DA 3A3UA 5T3JA 4PCDA 4EDPA 1FQDA 2GHBA 3R26A 3A3CA 4F39A 5EHMA 1B46A 2V3TA 3OMBA 2Q2AA 1XVYA 2ONRA 3M8UA 4YB6A 5B70A 2REJA 2F34A 4IO5A 5I2NB 4RJZA 3G7WA 4KYDA 2DWHA 1EZ9A 1NV2A 4RA1A 4F3BA 2O51A 2ZNSA 4GWUA 4HXVA 4KR5A 1AWBA 4G2ZA 3KJ7A 4K3FA 3DELB 3G3HA 2REGA 2IA4A 3GBAA 5HPQA 4MBPA 3VLWA 3OO9A 2CMOA 2P3NA 2GFEA 4FORA 4XKQA 5I2NA 4GF8A 3OSRA 2HCAA 3C31A 1JETA 1LBYA 1MM7A 4FATA 2OZZA 1JW4A 3R6UA 1LB9A 3GXAA 2MKZA 2F8DA 4O94A 1XOCA 4ZECA 1ZKBA 1PC3A 1INPA 1XC1A 1MXXA 5KZTA 1MXUA 3UP9A 5EQ9A 2O1MA 3Q26A 3T1BA 1OQGA 2XXXA 4OTEA 4P47A 3KGCA 3EQ1A 3C9HA 4I1DA 5LOMA 1CE2A 4QBAA 5K2XA 2CZHA 4NF4B 4R72A 4UACA 3FXUA 3T22A 4H8IA 3K01A 4M4GA 3FD3A 4KCDA 3PMWA 1QGXA 4YAHX 4NF6B 3T96B 4R2BA 2O1LA 4QFOA 3L6GA 2OJTA 1SQYA 1S9TA 1SYHA 2GQ1A 3Q27A 3DM0A 4F3SA 3MVYA 4NF4A 4P0IA 1Q1KA 3TMGA 4ELQA 4MNIA 2NOOA 4JWYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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