1N3XA

Ligand-free high-affinity maltose-binding protein
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYGDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Insights into the Conformational Equilibria of Maltose-binding Protein by Analysis of High Affinity Mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 121
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3xA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3xA01
1MQGA 3MP1A 5TPAA 3C36A 3KOTA 2LAOA 2F36A 1GVCA 5I56A 1KWHA 3PPPA 1P1WA 2UVGA 4LA9A 4G77A 1B3HA 4Q5TA 4X48A 3FZVA 4EXKA 4I8CA 2NUVA 3M3FA 3K6XA 4P0GA 4QHQA 5DTBA 2RC9A 3SKPA 1PB9A 3PGFA 3R6UA 2X26A 1B58A 3FV1A 1MXWA 3Q29A 4F3GA 3PV0E 4GFRA 1PBQA 1R9LA 1MXXA 1O64A 4GRKA 1T0KA 1US4A 3RTWB 4LQ5A 2RCBA 4QSCA 4DXUA 1UIVA 4NF4B 1US5A 4YMBA 3N94A 4R2BA 3IX1A 3OO9A 4FECA 1D9VA 4FIMA 2F78A 3IORA 3G7WA 4KCCA 1SQYA 2GRVA 1ZKBA 5I56B 3C32A 4JSOA 2P2AA 1N76A 4N07A 2UVJA 3VDFA 2XXXA 3B7DA 5L9MA 4TOZA 5DVIA 3KZGA 1ELJA 4YAHX 4U4SA 4IGTA 1H44A 1DSNA 3QSLA 2V3QA 2ZNTA 1AL3A 3KOSA 2QRYA 3PMWA 1WODA 5K2YA 1POY1 3I6VA 3FJGA 1MM7A 3IL1B 4HCYA 1A40A 2D5WA 1NNTA 4QFOA 1LFIA 3K1NA 2O7IA 1N84A 4F18A 4U1OA 4EXLA 1GTKA 1JEUA 2UVHA 1EZOA 4ELQA 4RPOA 3RNNA 4RXLA 3CR9A 5LOMA 2QS2A 4PFWA 3RT6B 4G2ZA 5JEIA 4ESWA 4HW8A 4DLDA 1LFGA 3MZ1A 5ELVA 3OSRA 2R6GE 4IO3A 5I58A 3UIFA 5ICQA 1IXIA 2H98A 3CG3A 3PUYE 4OFOA 1UQWA 3ECRA 3I3VA 3G3FA 4ZEIA 2DE4A 1B0HA 3JV9A 3TTNA 3MUQA 3LSXA 1M5CA 3ILTB 1SBPA 3SESA 4U4XA 4H65A 4OESA 3CRBA 4BDQA 1NNKA 3AXFA 4Q8RA 1ZLQA 2H99A 4FATA 3K01A 4O3CA 3DLNA 1FTKA 3RTFB 2ESNA 4KYSA 4KYEA 4PP0A 1BTJA 3CSGA 1FQAA 4PFUA 3QXMA 4KYDA 3T9UA 4E0XA 4R6KA 1LB8A 2PT2A 2B65A 4DXCA 2VOZA 1S7YA 3W9WA 4G8HA 2I4BA 2DE2A 3K00A 1OQHA 3LR1A 1DTGA 2Y84A 4LZ7A 4F31B 3ILUB 1F9BA 3VLVA 4NWDA 4GL0A 1MG1A 3B6WA 2AL4A 5I58B 4GOTA 3EHTA 1R1NA 2Q8JA 1BP5A 4LP2B 1CE2A 2O1MA 1H43A 3MVYA 3TELA 1VR5A 3RLFE 2HXWA 1B0LA 2Y7PA 2PMSA 1OQGA 4N6PA 4E0WA 2F8DA 1M5BA 2OK2A 4ZEBA 3S9NC 3EHUA 1B3EA 4ZECA 2M8CA 3IO6A 1B52A 3O2AA 4O3AA 4OMBA 4IO6A 1AH5A 3TQLA 3RQTA 2HCAA 1WDNA 3HPIA 1PB8A 3TMGA 2UXAA 3M3KA 1MY1A 3T93B 4C1UA 3FXUA 1EZ9A 2QPQA 3IOTA 1HSJA 3ZKKA 3T66A 3SERA 4IY5A 1I6BA 1B7ZA 2R71A 3KGCA 3C35A 3TTLA 4KHZE 4YKIA 3TAJA 4IY6A 1MQIA 2XX7A 1ANFA 4XKPA 1I69A 3VVEA 3VVDA 2O1LA 2H5YA 3W9VA 3UGWA 5TU0A 1LLSA 4DDDA 3IR1A 4ZS9A 3TODA 1HSEA 1QW0A 1D9YA 1JW4A 2V84A 3D4CA 3A3CA 1OVBA 1Y9UA 3RPWA 5HPQA 1MQJA 4YKJA 2HFBA 4POWA 1OLAA 3VVFA 4F3BA 4LZ5A 4NF5A 1SYIA 1ZU0A 1Z7ME 1MXVA 2DQVA 2ONSA 2RF1A 4ZEDA 3KJTA 5I2NA 1P1UA 2F7BA 3CIJA 4OEUA 1N0TA 2ONRA 3KG2A 1RYXA 5ISUA 3S4UA 1URSA 1FQEA 2DE3A 1LFHA 4JWYA 4GF8A 1UTHA 1WVJA 1NH7A 2XXRA 4AB5A 2ZYOA 3QUFA 1BIYA 3IJXB 5H8HA 1CB6A 2REJA 1S9TA 3CFZA 5I57A 1A7LA 4YB5A 4F2QA 4WEPA 3FATA 1TFDA 2YJPA 4KQPA 4F1VA 2I6EA 4WKMA 3G3JA 5FTIA 1B5HA 3K6WA 4NF5B 4R2FA 4K3FA 2V3UA 2NVUB 3N6UA 1LAXA 3GLBA 2RC7A 3MW0A 1B40A 2VD2A 1AMFA 5I2NB 1SI0A 3TTMA 5TP9A 3R26A 4OENA 4EQBA 2IA4A 3FASA 4MLVA 5JTYA 1LAHE 1FQFA 3LC8A 3F11A 1UTHB 4I1DA 2ZYNA 5FHNA 1MH4A 3OENA 5H8HB 4AB6A 1J1NA 4QFNA 1M5DA 5I57B 5ICTA 1O7TA 4EDPA 1MRPA 4GL8A 3PPRA 3SEWA 1LB9A 3TDJA 5CM6A 4GVOA 4EUOA 2OLBA 2GHBA 1I6QA 4POXA 2DOJA 3TTKA 1YAEA 3K4UA 3V5AA 3LSWA 2I48A 3PD9A 1IXHA 3VXBA 3FJMA 4DZ1A 3DELB 1IXCA 3T9XB 1A54A 2O68A 3IAZA 1P1QA 1S50A 2Z8FA 2O7UA 1SD3A 3QAXA 4TLMB 2ZYKA 2HZKA 5TP9B 3B6QA 1Y1ZA 1H76A 2WKYA 4OZ9A 1D3KA 4ELPA 2Z23A 1VSOA 3SETA 5JTYB 1URDA 5CMCA 3IJOB 3HV1A 3MPLA 2A5SA 2G29A 2ALUA 4G68A 1B4ZA 4ZE9A 3MZ9A 3HN0A 3FD3A 3ONMA 5A5XB 3CFXA 3VLWA 1LCTA 1PDAA 1Q1KA 2I4CA 3K1MA 4Q0CA 4U2RA 3MP6A 2KLFA 1P99A 3ZSFA 4OEVA 2DVCA 3O66A 2XD3A 2QMWA 1TWYA 1L5TA 4RK9A 3V8XB 4QRZA 1Y4CA 3CVGA 4G8MA 4HCWA 5AA3A 1MH3A 1B05A 5FHOA 4PETA 3TZAA 4IB2A 1ZMGA 4OETA 2VHAA 1QULA 1LCFA 5M2VA 1IUDA 2XXUA 1JETA 1JVYA 1MY3A 4F1YA 2XXPA 4G68B 3IO4A 1GR2A 3PMVA 1PB7A 2VGQA 2NWJA 2O6AA 5H8NA 4WXJA 2DWJA 3K2DA 4F3SA 4ELOA 1BKAA 2Q2CA 2QMXA 4RNSA 1JNFA 1SW4A 3G3IA 2Y7RA 1B51A 4H8JA 4UACA 4BDNA 5I84A 1MM6A 4N13A 1XVXA 3MVZA 1LBBA 3LSLA 5AA2A 4IO2A 2O51A 5DT6A 3HSTA 1A55A 5DYHA 3PPQA 4MLQA 1B6HA 4GIZA 4NWCA 2F35A 4QF9A 3EPEA 3KN3A 2B3BA 1B2HA 4OERA 1MDP1 4YICA 4YB7A 3LBSA 3MQ9A 3E4RA 3DP8A 3PPOA 4U1ZA 5H8NB 4RJZA 3U92A 1GGGA 4Q30B 1OLCA 4XTCQ 4EF2A 3ODBA 3UORA 3PUZE 5DVJA 3THIA 2F6GA 4XXUA 2XXQA 1B9JA 4BDLA 3PUVE 4HS7A 1YCJA 4OVJA 4QSEA 2ONKE 1FTLA 3EQ1A 1SW5A 2DSFA 1XT8A 5AA2B 2XX9A 4M4GA 1QKBA 1SI1A 1VFEA 2XXHA 1D4NA 3OELA 1P1OA 4QFLA 3C4MA 1RKMA 2Z8DA 1A8FA 3GXAA 1QUKA 3FIRA 4BDOA 2UYEA 1USYH 2DXYA 1H45A 1QVSA 4FE8A 3TEPA 4XKQA 1XVYA 2X7QA 4QFKA 3N26A 4R6HA 2Y7IA 3CSBA 1B1XA 1NL5A 3MC2A 3U8QA 2DS9A 3P7IA 4H67A 1FTMA 1MQHA 5AA4B 3TUSA 1Y3NA 2QJEA 1DTZA 5CBRA 3VXCA 4EF1A 5H8QA 4YB6A 3V83A 2OJTA 5CMKA 2QS4A 5CMMA 4FEDA 4ZDMA 2RC8A 4GXSB 1LBCA 1XHYA 2PT1A 1OMPA 3O28A 3HHFA 1MPDA 4O3BA 3OXNA 5J1DA 3Q28A 4IGRA 1LGBC 3G3KA 4EQ9A 4H5GA 4ZZAA 3S2VA 4F1UA 2FYIA 1QUIA 3OO8A 1YTVA 4OHNA 5B7DA 4H1XA 5CMBA 1NNFA 3VFJA 2AL5A 4DCYA 5KDTA 1OVTA 5KCJA 1HSLA 3S9LC 2XXWA 3U93A 1B7UA 4PQJA 4TQUQ 5H8QB 5IKBA 3QK6A 2FA7A 4NTLA 1FTOA 3S9MC 2R9JA 2Q9TA 4ESXA 1B5IA 4BLAA 1BLFA 2ZXTA 4ZZEA 4NF8A 3BBRA 1UTBA 3T9VA 1PC3A 4JXIA 3QIMA 3CG1A 3USDA 4XIGQ 5BWJA 3SEUA 1XS5A 5EHMA 3FXRA 3K02A 4X9TA 2ZNSA 2D3IA 1B3LA 3RUMA 3RY3A 1IZ1A 4NEDA 2AIXA 3OO7A 1I6AA 1QUJA 5I59A 4HTGA 2ZNUA 5KDTB 1R9QA 3PD8A 5KCJB 4U22A 2DXRA 3T9HB 3RGYA 3CFLA 1ZJLA 4GD5A 2DWHA 1MDQA 1NH8A 3MAMA 2DWIA 4YKKA 4H6DA 5CI5A 5B70A 1MY4A 1PEBA 4OYVA 4NF8B 3R7XA 1UTBB 3IOWA 2H9BA 2QS1A 2E0SA 3KN7A 5KZTA 1LAFE 3UK4A 3GBAA 3KBRA 2CZLA 2QL3A 3WAEA 2GH9A 4DCXA 5DVFA 5A5XA 5CRYA 2IEEA 1B32A 1MS7A 3HHGA 3N6TA 4R75A 3HO7A 4QSDA 1MPBA 4P0IA 4IO5A 4H0WA 1N3XA 4Z0IA 3EN3A 5I59B 2F5XA 4GXAA 3RN8A 2PBWA 3C33A 1O63A 2F6PA 2OWTA 1SDXA 3KJ7A 2ABHA 4LATA 5DEXA 4BDRA 4H5FA 1XOCA 4NF6A 4F22A 2I0BA 3FVOA 3C9HA 2ZYMA 4KCDA 4P11A 1EZPA 4JDFA 2E1SA 3OEMA 4LZ8A 3TCFA 3PUXE 4NE4A 1NKXA 1Y3QA 5ITOA 4DXBA 4GQOA 3OSQA 2G93A 2XXYA 3IB2A 3JYRA 1ATGA 2GHAA 1A8EA 4WEDA 4Z7EA 1H3DA 3H06B 4X1DA 2NOOA 4KFQA 2X7PA 5ITPA 2OCUA 2Z8EA 3C34A 5HM4B 3JZJA 2Y7KA 5DEXB 1SVXB 3H4ZA 3FV2A 4NF6B 1VE4A 2V3TA 3U1OA 3L6HA 3IB0A 4ISUA 4ND9A 4YZZA 2H25A 1FQDA 2OBGA 1URGA 1R6ZA 3IK6B 3MWBA 4RY1A 3KSJA 2W7YA 2VD3A 3G3HA 4R72A 5TPAB 4R74A 1B3GA 3GBBA 1M5FA 4OXVA 5L9SA 3H6TA 1MY0A 5F1QA 4YKPA 3G3GA 3OO6A 3V89B 3KEIA 3W15C 1DPPA 5CBSA 2YPNA 3CI8A 4OFJA 1DOTA 4DIGA 4FEBA 3IOVA 3MVXA 1PBPA 1Q35A 1ZBMA 1FTJA 1JW1A 1JEVA 2XXVA 5K2XA 4PFTA 3BFTA 4RK2A 1DMBA 2H4IA 3SEVA 3LUYA 2OWSA 4R73A 1IITA 4FAJA 2ZMBA 1B4HA 2P1SA 1UIUA 1YPNA 4ZE8A 3TCHA 3FXQA 1JW5A 3K6VA 3QUJA 3KN8A 4MBPA 4IO7A 3ZS6A 1MXUA 1Y1MA 1ZTYA 3DP6A 2UVIA 2XXTA 4KD5A 3FVNA 4KPTA 4OWDA 4BDMA 3L6GA 3PU5A 2HQ0A 2O84X 4U23A 5H8FA 1SW1A 3VV5A 3A09A 4ZEFA 4XKNA 5AA2D 2OZZA 4JWXA 2V25A 4R9GA 1RYOA 1MXZA 3TQWA 1Y20A 1FQCA 3FGSA 2O69A 1NFTA 4I9DA 1N04A 1TT1A 3MPKA 3PPNA 3PUWE 1MXYA 4F19A 3TCGA 2DP8A 1LSTA 3E9XA 3M8UA 4DE8A 3BKIB 2XD2A 4F2OA 3H6WA 3FVGA 1IQ7A 4H8IA 3SEYA 1II5A 1USYE 5IAIA 1FW0A 4QFPA 1FCKA 4JSDA 2Q89A 1POTA 5FHMA 5AA4A 5H8FB 4LQ2A 4PFYA 3FUZA 2HAVA 2QSXA 3EHSA 3H6VA 2RKMA 1M5EA 1B5JA 1P1NA 3C31A 5AA1A 2PVUA 2I0CA 2Z22A 3ZKLA 1MPCA 3O29A 3PMXA 3I5OA 1Z7NE 4MF3A 1QJMA 4M1VA 2I3VA 1SW2A 3D4GA 2RINA 4C0RA 4C1TA 4G8NA 3UA8A 2XXIA 3DP4A 5H8SA 3EF7A 2DWAA 3MBPA 4TLLB 1IXGA 3MVWA 3UN6A 4OTEA 4LVQA 1JVXA 4FORA 5I2KA 4OQOA 2FNCA 3OMBA 2V93A 2AYSA 5F7VA 1VFDA 1N7XA 4ONYA 3RT8A 3MZBA 4NMYA 5BUUA 3WAFA 1DPEA 2REGA 4JB7A 3TTRA 2BJJX 3T96B 1Y4TA 2GFEA 2I49A 4G68C 2THIA 4YMAA 3BFUA 3K1PA 3A3UA 4THIA 3U94A 4AQ4A 2DYXA 3SDFA 2D21A 2NXOA 1Y3PA 4RPNA 1IEJA 3KFMA 4IO4A 3K0VA 3TFLA 5I2KB 3Q26A 2PX1A 2HZLA 3UP9A 3O6GA 1B3FA 2A5TA 1FQBA 1MY2A 4YU0A 3S9EA 4JWOA 4L17A 2VP1A 3IB1A 1N3WA 5AE4A 3K6UA 3HCQA 4ELRA 3IOUA 1B46A 3LSFB 1SYHA 3U72A 3B6TA 1N7WA 2I58A 3QYTA 2UYFA 4RA1A 4F39A 1QKAA 3DM0A 2YLNA 1MQDA 2B3FA 4KR5A 4FJPA 5L9OA 1AOVA 4KI0E 4XKRA 2CMOA 2ANJA 1OIBA 3N5LA 2A5TB 1JQFA 3H03A 4R6YA 1B1HA 3O6IA 3MP8A 4OFLA 3SEXA 3Q25A 3T22A 1EU8A 1TFAA 2QS3A 4EQ7A 2HAUA 5EHSA 2XHDA 4GLIA 3FJ7A 4R9FA 3VLUA 3H7MA 2Y7WA 2P0SA 2XX8A 3TYHA 1A99A 3GZGA 3KSXA 2Q88A 3M3LA 1LAGE 4G4PA 1NNPA 2Q2AA 2I3WA 3O6HA 3OD7A 5FTHA 1AIVA 3H6UA 2F97A 5L8DA 4F3PA 5EYFA 3E3KA 1NMUA 2HEUA 2F7CA 1XC1A 3Q27A 4RYAA 4I62A 4ZEKA 1IIWA 4F29A 1EH3A 4X1BA 2DVZA 3TPAA 4MFIA 1TXFA 3MJNA 3H3GA 5JK4A 3TKDA 2F7AA 3O97A 4ECFA 3OOAA 3E13X 4MH5A 2RCAA 1ZIUA 4UA8A 2PYYA 4U21A 3VE1B 1B7HA 5CC2A 3FVKA 3OEKA 5HBCA 4NF4A 4GWOA 1GV8A 2F34A 3O9PA 4LONB 4LUBA 4JBZA 4PE5B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MQGA 3MP1A 5TPAA 5T3JA 3C36A 1DK4A 3KOTA 2LAOA 2F36A 1GVCA 5I56A 1KWHA 3PPPA 1P1WA 2UVGA 4NN3A 4LA9A 1NV2A 4G77A 1B3HA 4Q5TA 4PAFA 5FBPA 4X48A 3FZVA 4EXKA 4I8CA 2NUVA 3M3FA 3K6XA 4P0GA 4P1LA 4QHQA 5DTBA 2RC9A 3SKPA 1PB9A 3PGFA 3R6UA 2X26A 1B58A 3FV1A 1MXWA 3Q29A 1FBCA 4F3GA 3PV0E 4GFRA 1PBQA 1R9LA 1MXXA 1O64A 4GRKA 1T0KA 1NV6A 1US4A 3RTWB 4LQ5A 2RCBA 4QSCA 2V4CA 4DXUA 1UIVA 3FBPA 4N6KA 4NF4B 1US5A 4YMBA 1FPJA 3BIHA 3N94A 4R2BA 3IX1A 3OO9A 4FECA 1D9VA 4FIMA 1NV4A 3KBZA 2F78A 3IORA 3G7WA 4KCCA 1SQYA 4P47A 2GRVA 1ZKBA 5I56B 4PCDA 3C32A 2KQZA 4JSOA 2P2AA 5I7IA 1N76A 4N07A 2UVJA 3VDFA 2XXXA 3B7DA 5L9MA 1NUZA 4TOZA 4MMPA 5DVIA 2L5VA 3KZGA 1ELJA 4YAHX 4U4SA 4IGTA 1H44A 4PAIA 4PE3A 1DSNA 3QSLA 2V3QA 2ZNTA 5ET6A 1AL3A 3KOSA 2QRYA 3PMWA 4MIJA 1WODA 5K2YA 1POY1 3I6VA 1NUWA 3FJGA 1MM7A 3IL1B 4HCYA 1A40A 2D5WA 1NNTA 4QFOA 1LFIA 3K1NA 2O7IA 1N84A 4F18A 4U1OA 4EXLA 1GTKA 5ESYA 1JEUA 4N15A 2UVHA 3B8BA 4XEQA 1EZOA 3A29A 4ELQA 4RPOA 3RNNA 2QVUA 4RXLA 3CR9A 5LOMA 4NQ8A 2QS2A 3ISPA 4PFWA 3RT6B 4G2ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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