1N3XA

Ligand-free high-affinity maltose-binding protein
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYGDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Insights into the Conformational Equilibria of Maltose-binding Protein by Analysis of High Affinity Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 121
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3xA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3xA01
3S9LC 3DP8A 4XKRA 4DZ1A 4XKPA 5CRYA 2HAUA 2I58A 2P0SA 1NNPA 1A8EA 4JSDA 1D4NA 1QJMA 2DP8A 5A5XA 4JXIA 3ECRA 4YKJA 2F8DA 2GRVA 3I5OA 4LA9A 4P0IA 1OVTA 3TCHA 2XXRA 5CMKA 1IZ1A 4JWOA 5BWJA 3K6WA 1OQHA 2LAOA 2XXYA 4R75A 3SDFA 4LQ5A 5AE4A 1H44A 2D21A 4G68B 4GLIA 3S9NC 4XTCQ 2DWAA 3B7DA 3FXUA 5I2KA 3OXNA 3CFLA 2XXWA 2CMOA 3W9WA 4YMAA 3VDFA 2XX8A 3IB1A 4IY5A 3FV1A 5J1DA 3C33A 5TP9A 1UTHB 4EXKA 1NL5A 3S9EA 1MQGA 1IQ7A 5H8QA 3U93A 3EF7A 3TPAA 4HCWA 4X48A 1WODA 2I48A 1JETA 4NF5A 4N07A 1QUJA 1OLAA 2V3UA 2UVJA 5HPQA 3T22A 5DVFA 4WKMA 4Q0CA 1A54A 3O66A 5HM4B 1AIVA 4GVOA 5I59B 5DYHA 4R9GA 2XXQA 1BTJA 1O64A 4Q30B 2HCAA 3D4CA 4RYAA 3PUYE 3SKPA 3IR1A 3BKIB 2A5TB 5L9MA 3IOVA 3MUQA 3N6UA 5H8NA 1FQCA 5CMCA 2DWIA 3G3JA 5ITOA 2ONSA 3DP4A 1URDA 1MXXA 4OQOA 1QULA 1SD3A 3K1NA 1YTVA 2Z8DA 4LP2B 4OFOA 4ZZAA 2Y7KA 1D9VA 4G4PA 4R74A 1B3HA 1O7TA 1Z7ME 3LSWA 1FQDA 2F7BA 4ZZEA 5AA4B 1UTBA 1YAEA 1BKAA 1UIVA 1MXYA 1I6BA 4O3BA 2PT2A 2UVGA 3PMVA 3M3KA 4IO5A 1YCJA 2H9BA 4U1ZA 4EDPA 4NEDA 1SVXB 4ESWA 4OHNA 5I57A 3IO6A 1US5A 3OENA 3OO9A 2GH9A 4BDMA 4WEPA 3K0VA 2R9JA 2PT1A 4NWDA 1FCKA 3IX1A 2Q8JA 1N7XA 1ZIUA 3O6GA 2O69A 3T9XB 2XXVA 3ZKLA 1I6AA 3RGYA 2Z22A 3EN3A 1NH8A 2V3QA 1DPPA 1ZBMA 4U4SA 1B3EA 3PV0E 4DLDA 3CG1A 1I6QA 1LFHA 1USYE 2V93A 5H8SA 3FJ7A 4U22A 1GGGA 3MBPA 5ELVA 4ONYA 5AA2B 3MAMA 4TLLB 2QS3A 1EU8A 2VGQA 2QMXA 4GRKA 1MM7A 3VVEA 1HSEA 2ZNTA 1IITA 2R6GE 5DT6A 4MBPA 4F1UA 1B3FA 4ELQA 3OO7A 4MF3A 2OCUA 4O3AA 5TPAB 1B52A 4F18A 1NMUA 2UYEA 2VOZA 5I84A 3ILUB 3FGSA 4OXVA 4H5FA 4F3PA 5JTYA 3H6WA 3VLVA 2R71A 1ELJA 4G77A 5CM6A 1N04A 5I2NA 5DEXB 3TZAA 5ICQA 4H6DA 4F2OA 3A09A 4U23A 3OELA 2CZLA 3BFUA 2UXAA 1B7UA 3IJOB 4JWYA 1Y1ZA 4BDLA 4TQUQ 3TDJA 2REJA 1MY3A 2ONRA 1B51A 3PPNA 2NOOA 2Y84A 2QSXA 4IO4A 4EQ7A 4POXA 4KHZE 3RUMA 1P1QA 3BBRA 4N13A 3T93B 3A3UA 2ZXTA 3EPEA 1XHYA 4JBZA 4PE5B 3FIRA 1AMFA 2XXXA 4JDFA 3FJMA 3IAZA 1MY2A 3K6XA 2NXOA 3OD7A 2G93A 5EYFA 3RT6B 2XD3A 3N5LA 2PVUA 2HQ0A 3HHFA 1VFEA 4GWOA 4GF8A 5BUUA 1SYIA 2REGA 3T96B 1B4ZA 1B1XA 2I3WA 5KDTA 3S9MC 3KOSA 3CIJA 3O9PA 1MPCA 1SBPA 1MPDA 1IXCA 3G3GA 5IAIA 2O6AA 3RTWB 1JQFA 1B0LA 4OEVA 5AA1A 5KCJB 5HBCA 3ODBA 2YLNA 4UA8A 1FTLA 1IXIA 4OYVA 4E0XA 1ZMGA 4H5GA 3K2DA 3TTLA 4BDOA 3FVNA 4OWDA 3H3GA 2O1LA 5FTHA 1RKMA 3K00A 3SERA 2AYSA 3TMGA 3EHSA 2DSFA 4GFRA 4OVJA 4KCCA 5DTBA 1SI0A 1XOCA 3LC8A 4ELRA 4LVQA 1LCTA 1MPBA 2ZNSA 1ATGA 3MZ1A 4FE8A 4R6KA 2H4IA 4E0WA 4UACA 2FNCA 2XXTA 1DTGA 3U1OA 1OQGA 3UK4A 4F2QA 4F39A 3U72A 2QMWA 1NNTA 3RNNA 5ISUA 1N3WA 4H8IA 4EQBA 3PMWA 2XD2A 4XXUA 1LAGE 3QK6A 1FQEA 3G3HA 3OO6A 4GIZA 2RCAA 1GTKA 2DVZA 1B6HA 4MLVA 4HW8A 4NF4B 3K02A 3M3LA 2HFBA 1DPEA 1BP5A 4QRZA 1GR2A 4AB6A 4H65A 1OVBA 4QFPA 5I58A 5I56A 5AA4A 1TFAA 4NMYA 4OERA 1GVCA 4U4XA 1B46A 1R9QA 2OWSA 4ZDMA 5B70A 3S2VA 3DP6A 3O97A 3OOAA 3QIMA 2RINA 1S9TA 2ALUA 3CSGA 4YKKA 4R9FA 3QYTA 1B3GA 3GBAA 2RF1A 3QUFA 1DMBA 4IO3A 4ZEDA 3TQWA 3OSQA 4N6PA 4FATA 1OIBA 1D9YA 4OEUA 4P0GA 2O7IA 1QKAA 2OBGA 2P2AA 4QFNA 1PC3A 4MH5A 3G3IA 3ZKKA 1ZTYA 3MP6A 1ZJLA 4R72A 2F34A 2VHAA 1UIUA 3L6GA 4EXLA 3U92A 4FAJA 2W7YA 3G7WA 2DXRA 3IO4A 1Y20A 4YKIA 4PP0A 1URGA 1JW4A 4GOTA 2DOJA 2I0CA 4G8HA 4TLMB 3O2AA 2DE2A 4YICA 2B3BA 3VXBA 3UP9A 4KYEA 5DVJA 4FEBA 4R6HA 3QSLA 4XIGQ 3C32A 4QFOA 4YU0A 4NF6A 4DE8A 3KG2A 2RCBA 1N84A 4LZ7A 3HCQA 1Y4CA 4ZE9A 4KCDA 5FHMA 5FHNA 3IORA 5H8FB 1QUIA 3HO7A 3FVOA 4LATA 4ELOA 4ZEKA 2ZYMA 1B05A 1WDNA 4QFKA 1QW0A 3TTMA 2XXHA 3MVXA 3TEPA 2IEEA 2O7UA 1OLCA 4EF1A 1JW5A 4EF2A 3M8UA 3U8QA 5H8HA 3KSJA 2DWJA 2O68A 1POTA 2ESNA 4NWCA 1XS5A 1P1NA 5L9OA 4F31B 3PPQA 1BLFA 1DSNA 3HPIA 3VV5A 3RLFE 2VP1A 4PFYA 1S7YA 3KN3A 4MFIA 4RNSA 5K2XA 1P1OA 3K01A 1MXZA 3PUVE 1IXGA 3H06B 3VVDA 1B0HA 1VR5A 4JSOA 2DE4A 3KN8A 4F1YA 3MVYA 3IB0A 5I2KB 3IB2A 3K6UA 3MZBA 2Y7RA 2P1SA 1MQIA 5L9SA 4NF8B 1MS7A 2H98A 4Q5TA 5TP9B 3N6TA 2H99A 1N7WA 3CVGA 3PPPA 2NWJA 5H8QB 2ABHA 3FVGA 1XVYA 4YB7A 3R26A 1EZOA 2HXWA 5AA2D 4K3FA 1A55A 4GXSB 3USDA 5CMBA 1TFDA 2F78A 4PETA 1S50A 4G68C 5KCJA 1PEBA 2I3VA 3OSRA 2F7AA 1EZPA 3UIFA 1NKXA 4F22A 5CBRA 5LOMA 1B7ZA 4G8MA 4YAHX 1JW1A 3PUXE 3EQ1A 1B58A 4H8JA 1CB6A 1B7HA 3DLNA 2O51A 1B1HA 5KZTA 4XKNA 3E3KA 3IOUA 2DYXA 5H8NB 3N94A 4YB5A 5B7DA 3VE1B 2PYYA 1MY0A 4FEDA 4KPTA 2PMSA 2UYFA 4Z0IA 2ZYOA 4XKQA 3KZGA 5ITPA 4OTEA 2OJTA 1II5A 3A3CA 3PUWE 1QUKA 4QF9A 4ECFA 2Y7WA 4WXJA 1Y3PA 4PFUA 4X1BA 1LB8A 1N0TA 1UTBB 2XXUA 4QSDA 4NF4A 3VVFA 1POY1 3MPLA 3TFLA 3B6QA 4QSCA 1NH7A 4BLAA 3V8XB 2Z8FA 1LBCA 2OK2A 2RC9A 2I6EA 5I57B 3K4UA 4QSEA 4YMBA 4DDDA 2OZZA 3TYHA 1FTJA 1MQJA 1LLSA 1USYH 3FV2A 3VFJA 4GL0A 5EHMA 1DTZA 1A8FA 3KGCA 5IKBA 3H6VA 4G68A 3UN6A 1Q35A 1TT1A 1ZU0A 3HSTA 5JK4A 3VLWA 5FTIA 2GHBA 4TOZA 3HN0A 2UVIA 4EUOA 3KOTA 4RK2A 4RPNA 1UTHA 1P1UA 4YB6A 4H0WA 3MW0A 1FW0A 2Q89A 5ICTA 4F19A 4R2BA 1JVXA 5CBSA 1OMPA 3TQLA 1NFTA 4IGRA 4FIMA 3FUZA 1B40A 4F3SA 3KJTA 3H7MA 3SEVA 1SW5A 4I9DA 3T9HB 3TTNA 3UGWA 2HAVA 2HEUA 3GLBA 2DQVA 4P11A 4F3BA 3H4ZA 3OMBA 3UORA 1N76A 5I59A 3U94A 3SEYA 1JVYA 3H6TA 4IGTA 2UVHA 3PGFA 1B9JA 2ZYKA 4M1VA 4Z7EA 2YPNA 2XX9A 3JZJA 3FATA 3V5AA 3KFMA 3CRBA 4FORA 4HCYA 2DXYA 3I3VA 3GZGA 4GXAA 1P99A 4X1DA 2A5TA 4OMBA 3C35A 4NTLA 4R6YA 5JTYB 3CFZA 3Q25A 1FTMA 1MY1A 5I2NB 4KR5A 2HZLA 5H8FA 3TTKA 1M5BA 1SDXA 1Y3NA 4HS7A 4BDNA 3LSXA 1I69A 1LAHE 3G3FA 3HHGA 1MH4A 2ONKE 1PBPA 2B65A 3IOTA 3WAFA 1IEJA 2AL5A 2ZNUA 3K1PA 3C31A 1SQYA 4O3CA 1L5TA 3FXRA 1QVSA 5FHOA 4FJPA 4KYSA 4JWXA 4IO6A 1MH3A 2I4BA 1FQBA 3DM0A 4OESA 2IA4A 3JYRA 3VLUA 1ANFA 2Z23A 4DXCA 4C0RA 1LCFA 2XHDA 1R1NA 3MQ9A 3RTFB 1LSTA 5AA3A 4ZECA 2OLBA 1EZ9A 2F5XA 1M5EA 1B4HA 1UQWA 3I6VA 1SYHA 3TCFA 2NVUB 2GHAA 3T66A 4LZ5A 2QL3A 3K1MA 3JV9A 3MP8A 2F97A 3C34A 2F6GA 1JEVA 4DXBA 3FZVA 1B3LA 1MM6A 5KDTB 3KEIA 4NF8A 1LB9A 1YPNA 3Q29A 4U2RA 5CMMA 1MG1A 3ZS6A 3WAEA 1M5DA 4KI0E 3F11A 3O28A 3T9UA 3EHUA 3THIA 2THIA 1MQDA 1Y4TA 4BDRA 3IOWA 2FA7A 5AA2A 1Z7NE 1N3XA 1MDQA 3H03A 1MXWA 3TKDA 3O6HA 1T0KA 3DELB 1LAXA 1H76A 3KN7A 1PBQA 4THIA 2PBWA 4I1DA 2X7QA 1VE4A 4OENA 1SI1A 2VD3A 1RYXA 4WEDA 1MXVA 2V25A 4NE4A 4JB7A 3MVWA 3B6TA 3M3FA 5CC2A 4U1OA 1LBBA 3FASA 2KLFA 5TPAA 4ISUA 5M2VA 1Y9UA 1A99A 3W9VA 3SEUA 1PB9A 2ZYNA 4L17A 4H67A 3IK6B 3H6UA 2AIXA 2GFEA 4ZEBA 3MPKA 5DEXA 4X9TA 3KBRA 4F29A 3E4RA 1QKBA 3LSFB 3KJ7A 4LZ8A 2F35A 3QAXA 2ZMBA 1A7LA 3GBBA 1NNFA 2B3FA 2QS2A 3TODA 4OFLA 1HSJA 2Q2AA 2OWTA 1ZLQA 1F9BA 3V89B 2DVCA 3LR1A 3MZ9A 1US4A 3G3KA 2HZKA 3T9VA 3SESA 4LUBA 4DCXA 1H45A 3OEMA 5I58B 2VD2A 3SETA 5I56B 3O6IA 1B2HA 5A5XB 1LAFE 3CSBA 1KWHA 2XXIA 1BIYA 1ZKBA 3O29A 1B32A 3PPRA 2H5YA 3PD9A 4G2ZA 3PD8A 4YKPA 4RY1A 1Q1KA 2QJEA 4RPOA 2BJJX 1B5IA 3QUJA 3V83A 2Q88A 5CI5A 4IY6A 3KSXA 1IXHA 3Q27A 3AXFA 2I49A 2Q2CA 1B5HA 4GL8A 1IIWA 2QS1A 2O1MA 1XT8A 3GXAA 3SEXA 4PFWA 3SEWA 1URSA 4IB2A 4I62A 3RQTA 4F3GA 2D5WA 3LBSA 4AB5A 1XC1A 2PX1A 1P1WA 2DWHA 2RKMA 2NUVA 5F7VA 1WVJA 4IO7A 1M5CA 1FTKA 4GQOA 3FVKA 4NF5B 2RC8A 3CG3A 3ILTB 1GV8A 1EH3A 2F7CA 1LGBC 3FD3A 2G29A 4U21A 4I8CA 3PMXA 2O84X 3TAJA 2QRYA 4IO2A 2M8CA 4ND9A 3ONMA 2X26A 4R2FA 3IL1B 3D4GA 4C1TA 4OETA 5JEIA 3Q28A 4RK9A 2F6PA 4ZEIA 2Q9TA 3LUYA 3CFXA 1TWYA 1MXUA 1VSOA 4DIGA 3S4UA 4R73A 4ZEFA 1MY4A 4NF6B 1PB7A 3E9XA 4PFTA 1AOVA 3TELA 1NNKA 1H3DA 2A5SA 4Q8RA 3E13X 3TUSA 3TCGA 1D3KA 2I4CA 5K2YA 1AL3A 3MWBA 3QXMA 2QPQA 1R6ZA 3RY3A 2RC7A 3UA8A 2Z8EA 1A40A 1Y1MA 4HTGA 4KD5A 5H8HB 4AQ4A 2ANJA 1O63A 1MQHA 3LSLA 2AL4A 2V3TA 5F1QA 3W15C 1LFGA 3R6UA 2I0BA 3FXQA 1DOTA 1J1NA 1B5JA 3RN8A 3K6VA 3C4MA 1H43A 4BDQA 4POWA 1JEUA 4RA1A 3L6HA 4M4GA 4QHQA 1FQAA 1VFDA 2FYIA 1TXFA 3MP1A 3RPWA 4RXLA 2V84A 3IJXB 4KQPA 1RYOA 4DXUA 3P7IA 3Q26A 3R7XA 1M5FA 2D3IA 2F36A 2Y7PA 3N26A 2E1SA 3EHTA 4RJZA 3OEKA 1MDP1 1FQFA 1HSLA 1AH5A 5L8DA 2Y7IA 4YZZA 4OZ9A 2DS9A 1CE2A 4GD5A 1R9LA 3MC2A 3PPOA 1XVXA 1JNFA 3BFTA 4DCYA 1MRPA 2DE3A 4OFJA 1PDAA 2H25A 3MJNA 3RT8A 3C9HA 4H1XA 4ZS9A 4LONB 4G8NA 3FJGA 3PUZE 1LFIA 3ZSFA 1PB8A 4MLQA 3HV1A 5DVIA 1SW2A 4ZE8A 4FECA 2XX7A 4LQ2A 1FTOA 3MVZA 3CR9A 3C36A 1IUDA 5EHSA 4KFQA 4C1UA 2XXPA 3CI8A 1SW1A 3OO8A 3TTRA 4QFLA 4ESXA 4KYDA 3B6WA 1SW4A 4ELPA 4PQJA 2WKYA 2YJPA 3PU5A 1Y3QA 4EQ9A 2X7PA 2QS4A 5TU0A 3VXCA 2E0SA 4F1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S9LC 3DP8A 4XKRA 4DZ1A 4XKPA 5CRYA 2HAUA 2I58A 2P0SA 1NNPA 1A8EA 4JSDA 4NQ8A 1D4NA 1QJMA 5EQAA 2DP8A 5A5XA 4JXIA 1IMFA 3ECRA 4YKJA 2FIEA 2F8DA 4P9KA 2GRVA 3I5OA 4LA9A 4P0IA 1OVTA 3TCHA 2XXRA 5CMKA 1IZ1A 2HPGA 4JWOA 5BWJA 3K6WA 1FPLA 1OQHA 2LAOA 2XXYA 4R75A 3SDFA 4LQ5A 5AE4A 1H44A 2D21A 4G68B 4GLIA 3S9NC 4XTCQ 2DWAA 3B7DA 3FXUA 5I2KA 3OXNA 3CFLA 2XXWA 2CMOA 3W9WA 4YMAA 3VDFA 2XX8A 3IB1A 4IY5A 3FV1A 5J1DA 3C33A 5TP9A 1UTHB 4EXKA 1NL5A 3S9EA 1JP4A 5ET8A 1MQGA 1IQ7A 3QMFA 5H8QA 3U93A 3EF7A 5A5LA 4QBAA 3TPAA 4HCWA 3BIHA 4X48A 1WODA 2I48A 1IMBA 1JETA 4JVCA 4NF5A 4N07A 1QUJA 1OLAA 2V3UA 2UVJA 5HPQA 3T22A 1NV1A 5DVFA 4WKMA 4Q0CA 1A54A 3O66A 5HM4B 1AIVA 4GVOA 5I59B 5DYHA 4R9GA 2XXQA 1BTJA 1O64A 4Q30B 2HCAA 3D4CA 1FBPA 4RYAA 3PUYE 3SKPA 3IR1A 3BKIB 2A5TB 5L9MA 3IOVA 3MUQA 3N6UA 5H8NA 1FQCA 5CMCA 2DWIA 3G3JA 5ITOA 2ONSA 3DP4A 1URDA 1MXXA 5T3JA 4OQOA 1QULA 1SD3A 3K1NA 1YTVA 4HE1A 2Z8DA 4LP2B 4OFOA 3E78A 4ZZAA 2Y7KA 5LDZA 1D9VA 4G4PA 4R74A 4IR8A 1B3HA 1O7TA 1Z7ME 3LSWA 1FQDA 2F7BA 4ZZEA 5AA4B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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