4P0GA

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with bulgecin and muropeptide
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
429
structure length
429
Chain Sequence
APTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with bulgecin and muropeptide
rcsb
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 152
structure length 429
sequence length 429
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p0gA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p0gA02
2F7CA 2DWAA 4RYAA 4F1VA 1I69A 3M8UA 1Y9UA 3KJTA 2P2AA 1A99A 3IOWA 2DWIA 3VE1B 2VOZA 3A09A 3K1NA 1TFAA 3EN3A 4ZZAA 1AMFA 4GXAA 2IEEA 4F2QA 1GR2A 3HO7A 2Y84A 3KSXA 3MBPA 2UVIA 2DOJA 2R71A 1R9LA 2RCAA 5DTBA 3OEKA 4WEDA 4IY6A 3QXMA 4E0XA 3RT6B 1XOCA 4YB7A 2Z23A 4GFRA 3QIMA 4Q30B 2FNCA 1DPPA 2B3FA 4G77A 4XXUA 3I5OA 1IXIA 2R6GE 3RT8A 3W9VA 3FJ7A 1B6HA 2RINA 4AB6A 4XIGQ 2HQ0A 3ONMA 4JSOA 4NF8A 5CBRA 1DTGA 1LLSA 1OLAA 2GH9A 1LGBC 1ZTYA 3RUMA 3FVGA 3KZGA 3MC2A 1WODA 5KCJB 1Z7ME 2DP8A 3VDFA 2Y7IA 2D5WA 1MM6A 2Y7RA 1Y3QA 3B7DA 4KPTA 1A8FA 1MDP1 4IO5A 2QJEA 3FVNA 1QW0A 4U22A 2RKMA 2FYIA 2XXWA 3KOSA 4F19A 2Q89A 3KG2A 1KWHA 1MQJA 3C32A 4U21A 4MFIA 5DEXB 3PD8A 4BDOA 3BFTA 3G3FA 3MWBA 3EHSA 2HXWA 1ZIUA 3OSRA 4F1YA 2DVZA 1WDNA 3OOAA 2I4BA 4JXIA 3UIFA 1B0HA 5I59B 4U1ZA 1B3HA 4OEVA 3UP9A 3HV1A 1IXCA 2VHAA 4TOZA 1MXYA 4H1XA 1MQGA 2XXVA 1URSA 1MQIA 4RK9A 5I84A 3LR1A 4IY5A 5F7VA 4BDQA 1URGA 2HCAA 3K2DA 4YMAA 2WKYA 4I1DA 1AOVA 4ELPA 4DCYA 2NUVA 3V89B 3Q26A 2F34A 3FATA 4K3FA 5K2YA 2QS4A 1H43A 4IO7A 2GFEA 1MXWA 2Q9TA 4IGTA 3FUZA 4OEUA 3USDA 1DTZA 1XS5A 4FAJA 3IO6A 3SEWA 5I56A 1GGGA 5I2KB 3E13X 1UTHA 3PUZE 1QJMA 4OESA 4ZS9A 4JWOA 4YKJA 3CIJA 4NF4B 4Q0CA 4IO4A 3RTFB 1P1NA 2QPQA 3UK4A 3L6HA 4QFNA 1US5A 4ZE8A 4FATA 4F39A 1T0KA 1R1NA 2HZLA 2CMOA 5TP9A 5AA4B 3ODBA 5ICTA 5A5XB 4QFOA 1SD3A 3CG3A 4RPOA 3KFMA 1P1WA 3HPIA 2UYFA 1DMBA 4M1VA 1P1OA 1HSLA 1VR5A 2XX8A 4WKMA 5FTHA 4OYVA 2ZNUA 4GOTA 4EUOA 2HEUA 3FXQA 4RA1A 4KYDA 4QFLA 4ZECA 1MQDA 3GBAA 3QAXA 3TODA 1LFHA 1XHYA 1H3DA 1PBPA 4LONB 1Y3PA 2OBGA 1FTKA 4U4SA 1PDAA 2VD3A 4YICA 2QS1A 2DYXA 3TTRA 1S50A 3G7WA 3CR9A 1FTMA 1YCJA 3Q27A 2GHBA 2XXPA 4LZ5A 2VGQA 4DXUA 2I3VA 2E1SA 3S9MC 3RQTA 2Y7WA 3WAEA 1ZMGA 4NTLA 4U2RA 3OENA 4PP0A 2ZMBA 3LSFB 4MF3A 2I58A 2CZLA 2H5YA 5DVIA 4C0RA 3CVGA 3ZS6A 1NNPA 1RYOA 2O7IA 3OMBA 5JEIA 3TELA 4HCYA 3FJMA 2XD2A 4MBPA 4N6PA 1N76A 4TQUQ 2V84A 3CG1A 4R6HA 1P99A 3A3UA 3U8QA 2ZYOA 3VXBA 3IAZA 3H6TA 1TWYA 3VLWA 5L8DA 3KN8A 2XX9A 1VFDA 4LZ7A 4RNSA 2QMXA 4OENA 3T66A 5I2KA 3QSLA 3G3JA 4RPNA 1JEUA 4NF8B 3ZSFA 3CSGA 1QULA 1OMPA 2RCBA 2O1LA 3PGFA 1NH8A 4G8HA 4GIZA 5FHOA 3C4MA 4ONYA 2UVHA 3PPPA 1A54A 5L9OA 5JTYA 4YB6A 3K6WA 1Y3NA 4PFYA 1FW0A 4DXBA 2AYSA 1Y4CA 2BJJX 1A7LA 4PFWA 2PMSA 4UACA 4C1UA 1SI0A 3U93A 4L17A 2XD3A 3FVKA 2ESNA 1PB7A 1AL3A 1WVJA 4TLMB 1FQBA 1J1NA 3O9PA 3M3FA 1DSNA 4R2FA 4R2BA 3A3CA 3JYRA 1Z7NE 3CRBA 4ELOA 3MVYA 4BLAA 2DE2A 3G3HA 4Q5TA 4FEBA 2XXQA 3IB0A 1SYIA 1QUIA 2P0SA 1O7TA 2QMWA 3TQLA 1AH5A 1ELJA 5I58A 1BLFA 1FQDA 1LCFA 1H44A 4C1TA 3N6TA 4ZEKA 3U1OA 3S9LC 3D4GA 4O3BA 1FQEA 1JVXA 4GL0A 2AIXA 1EH3A 1XVYA 3IOUA 3L6GA 2QS2A 3O6HA 2W7YA 1B9JA 4MLQA 2NVUB 4EF1A 5EHSA 2F97A 2VD2A 4QHQA 3EF7A 1I6BA 1EZPA 3D4CA 2Q2CA 2IA4A 1ZKBA 3VV5A 2XXRA 3SERA 2QS3A 1S9TA 1Y20A 4G2ZA 4I62A 5LOMA 1Q35A 5I56B 1ZBMA 2DWJA 5HPQA 1UTHB 2FA7A 3IOVA 3TCHA 4BDRA 1MG1A 2O68A 4G4PA 2H98A 4KQPA 4Z7EA 1IUDA 4EXKA 3O29A 1D9YA 1HSEA 3IX1A 5ISUA 4YKKA 3B6QA 4QFPA 3HHGA 1MQHA 2V3QA 5TP9B 1NKXA 5HM4B 1PC3A 3PPRA 5DYHA 2O1MA 1YPNA 4F3SA 1B52A 5H8FA 5DVJA 4NF6A 3IJXB 1R9QA 3IL1B 5AA3A 3PPOA 5KZTA 4ELQA 3K6UA 4F18A 1JEVA 2NWJA 3BFUA 3K1MA 2P1SA 1M5FA 1D9VA 4ECFA 1FQAA 2RC7A 3IB2A 2ZNSA 1FCKA 4O3CA 3N26A 1ATGA 1GTKA 4NWCA 4GRKA 3RPWA 1LB9A 3PUXE 4R75A 3T22A 2OCUA 3H6VA 4WEPA 4WXJA 4H67A 1JW4A 1LFGA 2R9JA 1LAGE 3I6VA 3GBBA 1QUKA 3G3IA 4POXA 5TU0A 3PUWE 2O51A 5IAIA 3O66A 1JVYA 3QYTA 4OQOA 2H4IA 2HAVA 4THIA 2Q8JA 2H99A 3FV1A 4EQ7A 2ONRA 2X26A 3T96B 1MY2A 1H76A 2YJPA 1GVCA 2XXTA 5H8SA 2I4CA 3B6TA 4AB5A 1MPCA 4GD5A 4G8NA 2UYEA 1OQGA 3IO4A 1IXGA 4GL8A 1M5BA 3TTMA 4YKIA 3VFJA 1YTVA 3LBSA 2F35A 1Y1ZA 3S2VA 3GZGA 3MQ9A 3MAMA 4ND9A 1B2HA 1BIYA 1B3GA 1B7ZA 3OO8A 2A5TA 1B4HA 5CC2A 3T9HB 4OHNA 1IEJA 1B58A 3MP6A 4PFTA 3KBRA 3EHUA 1B51A 2ZYKA 1UQWA 4IB2A 2ANJA 3V83A 1UIUA 1MRPA 5AA1A 4OTEA 4X1BA 5CMMA 4DLDA 2B65A 1SW5A 3WAFA 4NWDA 2XXUA 3MPKA 2Q2AA 1NMUA 4YU0A 1PB9A 1H45A 4KHZE 4YMBA 3HN0A 4R6YA 4X9TA 5J1DA 1B1XA 1LCTA 5JTYB 3RNNA 1VSOA 1D4NA 3UA8A 4EQBA 3O97A 3E3KA 3UGWA 3FVOA 2V93A 3O2AA 1HSJA 4OETA 3PUYE 1LAXA 4GWOA 3O28A 1NL5A 1VFEA 5KDTA 1USYH 2AL5A 1B0LA 2PX1A 3E4RA 4OMBA 5ICQA 1XC1A 4JWXA 5TPAA 3MVWA 1MXXA 3S9EA 3PPQA 3TTNA 3IORA 1IQ7A 5H8QA 3W15C 2XXIA 4XKNA 3QUJA 4ELRA 3T9XB 1FQCA 5I58B 4JSDA 3IOTA 1SW4A 1B40A 2YPNA 4F31B 4H5FA 4GVOA 4F3BA 2RC8A 5HBCA 3V5AA 1MY0A 3TYHA 1P1QA 4JB7A 4X1DA 1RYXA 5FTIA 4XKPA 2GHAA 5CMBA 2HFBA 4GF8A 4F3GA 3MVZA 3FJGA 3FIRA 2B3BA 3TAJA 4F1UA 3PU5A 1B7HA 1N3XA 2OZZA 4OFJA 4QFKA 3H7MA 3RY3A 4FEDA 1JW5A 4Z0IA 4KYSA 4G68C 5BUUA 1IXHA 3MUQA 1CB6A 3S9NC 5B7DA 5L9MA 1LBCA 3PUVE 3VLUA 1SW1A 2AL4A 1II5A 3EQ1A 3DP4A 3IJOB 4R6KA 2RC9A 4ZEBA 5H8NA 2REJA 1SQYA 3OO6A 4LQ5A 3PV0E 4RK2A 4PFUA 1PEBA 1XVXA 4YZZA 3VVEA 3MPLA 1ZLQA 3ZKKA 1JQFA 2DE3A 5H8FB 4NF6B 2DSFA 1CE2A 4ESWA 4N07A 2XXXA 1JETA 1FTOA 3MZ9A 4H6DA 4H0WA 3OD7A 4LUBA 3MZ1A 3U94A 3C31A 2Y7KA 4LZ8A 2DXYA 1O63A 5DT6A 2Z8FA 2F8DA 1TXFA 3F11A 1OVTA 4GLIA 3TZAA 2DVCA 2XHDA 3LUYA 4FECA 4KR5A 1PBQA 1MY3A 4UA8A 1ZJLA 3LSXA 2PBWA 2Z8DA 2YLNA 2F7AA 2X7PA 3RTWB 2HAUA 5AA2A 4KYEA 2DE4A 4FIMA 3OO7A 3QK6A 3H4ZA 2DXRA 1R6ZA 4ISUA 2I48A 3N5LA 2OLBA 1IITA 3FXRA 1JNFA 1A55A 4R74A 4EXLA 3ILUB 4RY1A 1B3FA 4POWA 1N7XA 2F6GA 3SESA 3T93B 1OQHA 1UTBA 2V3TA 2F78A 1B5HA 2DS9A 3MP1A 4OXVA 4IO2A 1EZ9A 5I2NA 3H06B 2F36A 2A5TB 3UORA 3SEVA 5I57A 2A5SA 4O3AA 3IR1A 4G68A 3FZVA 4NF5A 4TLLB 1TFDA 2Z8EA 2F6PA 1N3WA 2RF1A 3FV2A 3TKDA 4QSDA 2REGA 3TMGA 4I8CA 4RXLA 1BP5A 3OELA 3K6VA 3KN3A 3KJ7A 4LA9A 4YAHX 3ILTB 1DPEA 2H25A 4IO6A 3H6WA 1OLCA 1POY1 1EZOA 3K1PA 1NNKA 3FD3A 2OK2A 3G3GA 1F9BA 1EU8A 1UIVA 1LBBA 2XXHA 2ALUA 3C9HA 1MXUA 3CFLA 3JV9A 3OSQA 5KDTB 1M5EA 1M5DA 3N94A 4FJPA 5B70A 3THIA 3UN6A 5TPAB 1Q1KA 2ZYMA 3C33A 1RKMA 2XXYA 1USYE 5ITPA 2X7QA 3H03A 5K2XA 1GV8A 1LB8A 3SKPA 3QUFA 3AXFA 2I3WA 5H8QB 3TEPA 4KI0E 2I6EA 1NFTA 1SDXA 3FASA 3EHTA 3RGYA 4KCCA 2OJTA 4ZEDA 4LQ2A 3FXUA 4DE8A 4F3PA 4QF9A 1BTJA 2O6AA 4ZDMA 2OWTA 2DWHA 1MXZA 4F29A 2PT2A 2PVUA 4NE4A 3LSLA 4X48A 3ZKLA 3R7XA 3Q29A 3N6UA 4JBZA 3DP6A 5EYFA 1MS7A 3KSJA 2F5XA 3SDFA 2I0CA 2HZKA 5ITOA 4GQOA 4DIGA 1SBPA 3KGCA 2PYYA 3MW0A 1B3LA 1QUJA 3DM0A 3SEYA 2NOOA 3C36A 2ZNTA 1US4A 4U23A 3TTLA 2ABHA 4OZ9A 1Y1MA 4FE8A 1OVBA 3K01A 5H8HA 2O69A 5H8NB 3E9XA 4OWDA 2G93A 1B4ZA 3LC8A 5CBSA 2V3UA 3VVFA 1JW1A 2H9BA 1QVSA 2O84X 1MPDA 2UVJA 1I6QA 3KOTA 3GXAA 1P1UA 4DDDA 4I9DA 1O64A 4QSEA 3PPNA 1B46A 4ZE9A 5AE4A 4HTGA 3O6IA 4F2OA 2PT1A 3JZJA 1NNTA 3P7IA 2QSXA 1DOTA 1Y4TA 4PETA 5IKBA 1IZ1A 3BKIB 1QKAA 5DVFA 2VP1A 3K00A 4JWYA 3K02A 3IK6B 3MP8A 1ZU0A 3EPEA 1A40A 1URDA 4QSCA 2D21A 3U92A 4ZZEA 3PMVA 1L5TA 3CSBA 4EQ9A 1MDQA 1N0TA 2I0BA 1D3KA 2DQVA 4OFOA 3DELB 2ONKE 5CRYA 1SYHA 5AA2B 4H65A 4LVQA 3W9WA 3PMXA 1LAFE 4DXCA 4P0GA 3H6UA 1N04A 4JDFA 5FHNA 4IGRA 3B6WA 1LFIA 4NEDA 5KCJA 3TUSA 3PMWA 3Q28A 1A8EA 3TCGA 5CMKA 4H8JA 4IO3A 2V25A 1OIBA 3H3GA 3HCQA 3ECRA 1B7UA 3R6UA 1SI1A 1UTBB 1IIWA 3R26A 2E0SA 5EHMA 3TCFA 1MY1A 1VE4A 2LAOA 3OEMA 1B1HA 4XKRA 3RLFE 4YB5A 5DEXA 1M5CA 4EF2A 3GLBA 5I2NB 2KLFA 3O6GA 3VXCA 2NXOA 3T9UA 1LAHE 3TDJA 3KEIA 5ELVA 4HW8A 3U72A 5I57B 3SEUA 4F22A 3HSTA 5F1QA 5I59A 2F7BA 4G68B 4HS7A 4NF5B 3K6XA 4R72A 4XTCQ 3KN7A 3TTKA 1B3EA 2QL3A 2GRVA 3IB1A 3BBRA 1MH3A 4LP2B 4H5GA 3K4UA 3HHFA 4M4GA 2D3IA 2UVGA 3RN8A 3G3KA 4U4XA 1MPBA 5CM6A 1XT8A 1POTA 5M2VA 4R9FA 4P11A 3K0VA 3TFLA 4OERA 3CI8A 1TT1A 5FHMA 4HCWA 4OVJA 1MH4A 4ESXA 2UXAA 4DZ1A 4R9GA 2ZYNA 2ONSA 2O7UA 4GXSB 1QKBA 5CMCA 3M3LA 3V8XB 4YKPA 3C34A 3TQWA 1YAEA 4OFLA 3MJNA 1N7WA 2G29A 3TPAA 3SETA 4ZEIA 4P0IA 4PE5B 2OWSA 3VVDA 4DCXA 1MY4A 3Q25A 1B5IA 4PQJA 4NF4A 3MVXA 4BDNA 4ZEFA 1B5JA 4G8MA 1MXVA 3M3KA 1I6AA 2XX7A 4Q8RA 4EDPA 5AA4A 5A5XA 2THIA 3OO9A 1NH7A 1S7YA 1AIVA 1NNFA 1FTJA 1ANFA 4E0WA 2ZXTA 2QRYA 1SW2A 4N13A 1N84A 3DLNA 4KCDA 4U1OA 4MH5A 3DP8A 2I49A 3OXNA 3I3VA 4KFQA 3T9VA 3LSWA 5AA2D 4FORA 2Z22A 1MM7A 1LSTA 2Q88A 1B32A 4MLVA 3CFXA 3SEXA 4R73A 4QRZA 4XKQA 3S4UA 5L9SA 4LATA 3PD9A 3CFZA 5BWJA 4H8IA 1FQFA 3C35A 3VLVA 4AQ4A 1PB8A 4BDLA 4BDMA 1BKAA 5CI5A 5JK4A 3MZBA 1FTLA 3FGSA 2M8CA 4NMYA 1B05A 4RJZA 5H8HB 2Y7PA 4KD5A 1SVXB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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