4P0GA

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with bulgecin and muropeptide
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
429
structure length
429
Chain Sequence
APTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with bulgecin and muropeptide
rcsb
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
total genus 152
structure length 429
sequence length 429
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p0gA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p0gA02
1N3WA 1MG1A 3LUYA 2X7PA 3EQ1A 2RF1A 3MWBA 4WKMA 3A3CA 3TTKA 3S2VA 3KG2A 2F6PA 2V93A 2HZLA 4ZZEA 3SDFA 2XX9A 4P11A 1PBPA 4H67A 4OMBA 1JW4A 1OVBA 2O6AA 2F7AA 3SEXA 3ZS6A 2GFEA 2I0BA 3IB2A 1P99A 3OEKA 3FUZA 3GBAA 3VXCA 3IB1A 4O3BA 1LAHE 4G77A 4LATA 1D9YA 4K3FA 1NNPA 3UGWA 3TQLA 4G4PA 1YAEA 2ZNUA 2B65A 2Z22A 2F97A 4OWDA 4UA8A 3C35A 5AA2D 4M1VA 2QPQA 1LFHA 1PDAA 3FVKA 2XXIA 2WKYA 1GGGA 4OXVA 3G3JA 4ECFA 1O64A 4X1BA 4N07A 4JXIA 1MQDA 1POTA 1LGBC 1ELJA 4U23A 5JEIA 2AIXA 1QUJA 1WDNA 1B3GA 1MY4A 1B3FA 1SI0A 4U2RA 5I2KB 3MJNA 1XVYA 3JV9A 1Z7ME 3ONMA 1Y3NA 1POY1 4FEBA 5BWJA 3IORA 2D21A 5AA4B 1TWYA 2IA4A 2HAUA 1FQDA 2ONRA 5JTYA 3K6XA 1USYH 3ZSFA 4R6HA 2XXHA 3RTWB 1N7XA 1B58A 2V84A 3N6TA 3RT8A 2REJA 1Y9UA 3SKPA 1NL5A 4F1UA 5CMKA 1B32A 4JDFA 3SEYA 2QMWA 2RINA 1ZJLA 2XXTA 1AL3A 2VOZA 4R9FA 5ITOA 3QIMA 1RKMA 2R9JA 2OZZA 1B5JA 3PPOA 3S4UA 2QMXA 4RYAA 5H8NB 3V89B 1VE4A 3CIJA 4ZEDA 1XOCA 3V5AA 4BDOA 2Y7RA 3CVGA 3KBRA 4F2OA 3FJGA 1JEVA 2XX8A 1SW2A 1Y4TA 3KFMA 1O7TA 2F6GA 3QK6A 4FATA 2DWHA 3O28A 2Z23A 1B5IA 4FECA 2HCAA 3PU5A 3PPRA 3S9MC 1SQYA 4OENA 3FJ7A 4EXKA 3TFLA 3K01A 1IITA 3L6HA 3MVYA 2F35A 5IKBA 4H5FA 2UVGA 1FQEA 4RNSA 1PB7A 4ELQA 3KGCA 4IO7A 1LAFE 1OLCA 3T9UA 4DCXA 4QFKA 4KR5A 4ZEBA 1QUIA 1ZBMA 3TZAA 1OMPA 4PFUA 2PMSA 4GOTA 2D5WA 2ESNA 3Q25A 3PUWE 2QS3A 1QJMA 3G3GA 3VLVA 3OO7A 3N5LA 3C4MA 4DIGA 1QUKA 4C1TA 3VLWA 4ZE9A 3BBRA 2E0SA 4TLLB 2V3QA 1OQHA 2DE2A 1B46A 3K1PA 4IO6A 3M8UA 4Q30B 3ECRA 4QRZA 3PUVE 3C9HA 4C0RA 4GRKA 4FJPA 3H6WA 4KD5A 3DLNA 2THIA 2H5YA 1JNFA 4G68B 1URSA 1JQFA 3MW0A 3IOVA 1JVYA 1DPPA 2XXRA 3FVOA 3MUQA 4GWOA 1MY2A 3FGSA 1A8FA 3UORA 3MC2A 3FD3A 3Q29A 1GR2A 2Y7IA 3OO6A 1ZTYA 4EQ9A 3TTRA 4OZ9A 2REGA 4QHQA 1TXFA 2GH9A 4BDQA 3T9XB 5KCJB 3SESA 3CFXA 5AA1A 5CBSA 4QF9A 3G3FA 3H03A 4LQ5A 4P0IA 4GQOA 3IOWA 3VDFA 2XXPA 2VGQA 3EHUA 4JB7A 1LB8A 2F8DA 3PV0E 1Y1ZA 2I4CA 5LOMA 5DEXB 1VR5A 3UA8A 4IY6A 4U4XA 1I69A 2W7YA 4KI0E 4IO3A 1LLSA 2Q88A 3PUXE 2HQ0A 2VD2A 4OEUA 3PMXA 4DDDA 5TPAA 2F7CA 2Y84A 3VLUA 5AA3A 2QSXA 5AE4A 3OD7A 3KOTA 3BFUA 4EQBA 5I84A 2YJPA 5B7DA 3OMBA 1UQWA 2OLBA 4OYVA 2XD2A 4QFNA 1IXHA 3PUYE 1UIUA 3FASA 4JWXA 1QULA 5FHMA 2Q8JA 1LAXA 1ZKBA 3TELA 4R73A 4YKPA 3EHSA 1LFIA 5FHNA 1OVTA 1MY1A 3LSWA 3ODBA 1MXYA 3QYTA 4TOZA 3VV5A 1MXWA 1PB9A 2DOJA 4ISUA 4NF8B 5H8QA 3LSFB 1OIBA 1MY0A 3U93A 4KPTA 4H6DA 3IOUA 3LR1A 3HPIA 3VFJA 4WEPA 1QVSA 3QXMA 3U94A 2I49A 4ZEKA 3LBSA 3B6WA 1DSNA 1SW5A 1D4NA 3RTFB 1PB8A 4XKNA 4GL8A 3RY3A 3KJ7A 1VFEA 2F7BA 5DVFA 4YKKA 4GFRA 4OTEA 4YZZA 3N94A 2I58A 4NWDA 5ISUA 4LZ8A 3WAFA 3G3HA 3FXUA 3OSQA 3H6TA 4LP2B 1UTBA 2DWJA 5I59A 1H43A 3RLFE 4NF4A 5A5XA 3BFTA 3ILTB 1FQBA 2CZLA 3T66A 5CRYA 5CC2A 4EF2A 4ZECA 3K1NA 1N04A 4DCYA 4DLDA 4DXBA 4HCWA 3T22A 1KWHA 5DVJA 2OCUA 1A54A 4EF1A 3D4GA 1B7ZA 1VFDA 1MM6A 3VVFA 1M5BA 3M3KA 1YTVA 1O63A 2Q2CA 3MVWA 2ZYMA 2I3WA 4NF5A 4YMAA 5L9OA 3MP1A 1N0TA 3TTLA 2FA7A 3N26A 1XS5A 2ALUA 1P1QA 4PETA 3O6GA 4KHZE 3E4RA 4BDNA 2H9BA 5CI5A 3UP9A 3K4UA 2YLNA 1ZMGA 5JTYB 2H99A 5F7VA 1N84A 3SETA 1FCKA 3KN3A 1B4HA 3HHGA 4QSDA 1FTLA 4DXUA 2ZNSA 2Z8DA 1XHYA 4WEDA 5DTBA 1B0LA 2DYXA 2UYFA 3PUZE 4GXSB 5EHSA 3PD8A 3DP8A 3RN8A 5ITPA 2X7QA 4ONYA 1MDQA 1JVXA 4KCDA 4EXLA 1BKAA 2RKMA 4Z0IA 4JSOA 1Q35A 1A8EA 3MVXA 2H25A 4F19A 2UVJA 5H8HA 2DWIA 2RC9A 4RK2A 4F39A 3WAEA 3I5OA 2E1SA 1MQJA 3M3LA 3GXAA 5I2NA 4KFQA 2HAVA 3PD9A 3TKDA 1I6AA 3W9WA 3MQ9A 4IY5A 4I1DA 4LZ5A 1DMBA 3OSRA 3O97A 1IUDA 4ESWA 3OENA 4Q0CA 5L9MA 3VVDA 4R74A 4QFPA 4U1ZA 1D9VA 2DS9A 1IQ7A 4ELOA 1P1UA 1EZ9A 3CFZA 4MF3A 3G3KA 3HHFA 3S9LC 1B5HA 4ZZAA 3U72A 3HV1A 2QS1A 5F1QA 1NNFA 2O51A 2I48A 4KYDA 3T93B 1I6BA 3UN6A 4YB7A 2I4BA 4ZS9A 3DP6A 3RGYA 1R9QA 5H8FA 2ZYNA 3R6UA 1Y3QA 4YMBA 2O1MA 4IGTA 5FTHA 2RC8A 1MH4A 3A3UA 1FQFA 3M3FA 5TP9B 3IAZA 3MBPA 3KOSA 1H44A 1CE2A 3FVNA 2ZYOA 5K2XA 1N3XA 3E13X 4G8MA 2P2AA 2PT2A 4YB5A 3OO8A 1ZIUA 1EZOA 5H8NA 4I62A 1MXVA 3O2AA 4M4GA 2X26A 1EH3A 3G3IA 4ZEIA 1MXUA 5AA2A 2Y7KA 4KYSA 5ELVA 1ZU0A 5CBRA 1CB6A 3A09A 4YKIA 2Y7WA 5FTIA 1RYOA 1OLAA 3IL1B 3IJOB 1SYHA 1HSJA 2Z8FA 4OERA 2P1SA 3K0VA 3P7IA 5HM4B 1FTJA 3EHTA 4FAJA 4ZEFA 3K6WA 4NF6A 3O6IA 3I3VA 5CMBA 4BLAA 1DOTA 4H0WA 4ND9A 1PC3A 4XKQA 3LSLA 3S9NC 1B4ZA 3MP8A 1VSOA 3FATA 4I8CA 4R6YA 2I6EA 3KN8A 4TLMB 3MZ1A 3MP6A 3PPPA 2QRYA 3TCGA 4F1YA 3GLBA 4BDMA 5I56A 4NMYA 2O1LA 3T9HB 4OETA 1LB9A 2NWJA 4U4SA 4E0XA 1BP5A 4LUBA 1Q1KA 4YU0A 3TAJA 5I58A 4MFIA 3MVZA 1UIVA 1US5A 1TT1A 3ILUB 4GVOA 4YAHX 4R72A 3QSLA 2HFBA 1FTKA 4AB6A 4XKPA 1OQGA 4BDLA 2PVUA 3KSXA 1ZLQA 3IO4A 3RT6B 1B6HA 3V8XB 5CMMA 4F18A 1LBCA 2O7UA 2DSFA 3KJTA 3RPWA 3JZJA 4X48A 3FVGA 1NNTA 4ZDMA 3I6VA 3SERA 3RUMA 3K6VA 1B3HA 3EF7A 1B7HA 5B70A 4G68A 4EUOA 2NVUB 2RCAA 2UVHA 5ICTA 1M5EA 2GHAA 4HCYA 2ANJA 2O68A 3SEVA 5H8QB 1MQIA 1I6QA 1EZPA 1LSTA 3TTNA 3E3KA 4Z7EA 1H45A 4NEDA 2G29A 3K1MA 1BLFA 3UK4A 1LCFA 2DP8A 2F5XA 4LQ2A 3W9VA 3C32A 4U22A 3FV2A 4IO5A 4U21A 4KCCA 1P1WA 2ONKE 3K2DA 3KSJA 2ZNTA 4X9TA 4ELPA 4E0WA 4JBZA 1ATGA 2O7IA 3MAMA 1B1HA 1DTZA 4RY1A 2GHBA 1FTOA 5M2VA 3TPAA 3EN3A 2XXVA 3R26A 1FTMA 1MH3A 2XXXA 4RPNA 3W15C 3Q26A 1QKAA 5I59B 3OXNA 5A5XB 4L17A 3ZKKA 2A5TA 1PBQA 1B3LA 4ZE8A 4R6KA 2UYEA 5KDTA 1T0KA 1QKBA 2DVZA 2Q2AA 4YICA 3FJMA 1B0HA 3TEPA 3SEWA 1JETA 3PGFA 1AMFA 4LZ7A 2DE3A 3B7DA 1H3DA 5I57A 2OBGA 1A7LA 3L6GA 2O84X 3H06B 2UXAA 3JYRA 1DTGA 2DXYA 3C36A 1USYE 4G8NA 1UTHA 2PYYA 1LBBA 3FV1A 2AL5A 4F3SA 2NOOA 3AXFA 3TUSA 1S9TA 3H7MA 2ONSA 4G68C 4Q5TA 3TYHA 2UVIA 4DE8A 2H4IA 2HZKA 1A55A 1N7WA 1JEUA 1B1XA 4NF8A 4OHNA 4F3GA 5L8DA 4F3BA 2DE4A 3U92A 4R9GA 3IJXB 1M5DA 3OO9A 5HBCA 5K2YA 4ESXA 3H4ZA 1SDXA 1B3EA 3IB0A 4IGRA 3RNNA 1LAGE 3THIA 2P0SA 3MZBA 1AH5A 1M5CA 4H65A 4YB6A 3TQWA 4F31B 2FNCA 5EHMA 2BJJX 3PMWA 3RQTA 4F22A 5IAIA 2OK2A 4GD5A 3H6VA 1FQCA 1MY3A 1SW4A 4GL0A 4KQPA 5H8HB 3HO7A 3VVEA 4KYEA 5I2NB 1IIWA 2XX7A 1J1NA 1Y3PA 4LVQA 4NTLA 3TTMA 4RXLA 2DXRA 4DXCA 2OJTA 4OFLA 4FE8A 3TDJA 1MXZA 2IEEA 4HTGA 1B9JA 4FIMA 2R71A 3CI8A 1GTKA 2GRVA 3Q28A 2HEUA 1Y1MA 3B6QA 4QFLA 3CG3A 2XXWA 1LFGA 4NE4A 1A99A 1L5TA 3DM0A 2DWAA 2CMOA 4H1XA 1MXXA 4OFOA 4JWOA 1S50A 2NUVA 1US4A 4AQ4A 1N76A 3LC8A 5H8FB 1A40A 1XC1A 2Y7PA 3OELA 3U1OA 1DPEA 2XXYA 1F9BA 2PX1A 2QS4A 3T9VA 4Q8RA 3T96B 1SW1A 5HPQA 5I2KA 2O69A 5DVIA 2VHAA 4G8HA 3HSTA 2XXQA 2ZMBA 1D3KA 4H8JA 1SD3A 3TODA 3S9EA 5DYHA 4PFWA 4RA1A 4GF8A 5AA4A 4XTCQ 5AA2B 4PP0A 2XHDA 1IEJA 4U1OA 5H8SA 2OWSA 5FHOA 4F1VA 4HW8A 3LSXA 1EU8A 1TFDA 1P1NA 1AOVA 3GZGA 1NKXA 1IXIA 3C34A 3DELB 2V25A 1B2HA 2AL4A 5J1DA 4NF6B 2B3FA 3C31A 4YKJA 4WXJA 3FZVA 3O6HA 3O9PA 4C1UA 1FQAA 2ZXTA 1MQHA 4X1DA 1PEBA 4H8IA 3CSGA 1Y4CA 3H3GA 5CM6A 2B3BA 1QW0A 3Q27A 2DVCA 4LONB 3F11A 1MPBA 4AB5A 2Q89A 3K02A 4LA9A 2ABHA 4QFOA 2V3TA 4GLIA 4OEVA 5I56B 4OQOA 4IO4A 3SEUA 2I0CA 3QAXA 2F34A 5KZTA 2FYIA 3VE1B 2V3UA 1YCJA 3FXQA 5I58B 4RPOA 3KN7A 1SVXB 4H5GA 3R7XA 1HSEA 1NNKA 1SYIA 2PT1A 5TP9A 1Z7NE 4JWYA 1B52A 2NXOA 1FW0A 3USDA 4ELRA 4QSEA 3HN0A 2I3VA 2RCBA 4RK9A 1MPCA 3TCFA 3UIFA 2XXUA 1B05A 1SBPA 4QSCA 3OOAA 2OWTA 1H76A 1MS7A 4FEDA 2KLFA 3FIRA 4MLVA 4P0GA 1IXCA 2PBWA 4IB2A 4DZ1A 3IX1A 5TPAB 1TFAA 4TQUQ 1HSLA 3D4CA 1R6ZA 5CMCA 1MRPA 3MPKA 3TCHA 4EQ7A 1B7UA 5JK4A 3B6TA 1WODA 2QL3A 1GVCA 4GXAA 3O66A 3CR9A 4I9DA 1P1OA 4OVJA 3H6UA 4XXUA 1II5A 4G2ZA 4R2FA 1NH7A 2DQVA 1MDP1 3KEIA 1NMUA 3PPQA 3TMGA 2D3IA 2Z8EA 1AIVA 4MH5A 5BUUA 3CFLA 2VP1A 1XT8A 3V83A 4O3CA 1S7YA 1JW1A 3C33A 2Q9TA 2A5TB 3IO6A 5KDTB 1YPNA 3CSBA 4MBPA 1BIYA 2QS2A 1NFTA 3CG1A 2YPNA 3IR1A 1Y20A 4XIGQ 5KCJA 3FXRA 3IOTA 5DT6A 3HCQA 1ANFA 1RYXA 5I57B 4XKRA 3K6UA 2AYSA 3EPEA 2A5SA 4NWCA 3ZKLA 4MLQA 1IZ1A 3QUFA 3PMVA 1UTHB 5TU0A 1R9LA 2LAOA 4PFTA 1MQGA 3K00A 1MPDA 1XVXA 1UTBB 4PQJA 4HS7A 4NF4B 5DEXA 3GBBA 3G7WA 3U8QA 2H98A 4POXA 4RJZA 1MM7A 1BTJA 4UACA 1URDA 2F78A 5ICQA 1M5FA 3E9XA 3O29A 1GV8A 5EYFA 2R6GE 1WVJA 3MZ9A 4FORA 1SI1A 4N6PA 3DP4A 3CRBA 1LCTA 4F29A 3MPLA 4PE5B 1URGA 4IO2A 4R75A 1NH8A 4PFYA 4NF5B 2F36A 2M8CA 3VXBA 2HXWA 3OEMA 5L9SA 4N13A 2RC7A 4F2QA 3IK6B 3PPNA 4R2BA 1R1NA 2XD3A 4GIZA 3QUJA 4OFJA 3KZGA 2QJEA 1B40A 4OESA 1IXGA 4POWA 4F3PA 4JSDA 2ZYKA 4EDPA 1JW5A 2VD3A 4BDRA 2G93A 1B51A 4THIA 3N6UA 3BKIB 4O3AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XI6A 3B8BA 1N3WA 1MG1A 3LUYA 2X7PA 3EQ1A 2RF1A 3MWBA 4WKMA 4XEQA 3A3CA 3TTKA 4GWUA 2HXRA 3S2VA 4PDDA 3KG2A 2F6PA 2V93A 2HZLA 4ZZEA 3SDFA 4O8MA 4HE1A 2XX9A 4P11A 1PBPA 3HFUA 2WYPA 4H67A 4OMBA 1JW4A 1OVBA 2O6AA 2F7AA 3SEXA 3ZS6A 2GFEA 1NUZA 2I0BA 3IB2A 1P99A 3OEKA 3FUZA 4NAPA 5EYGA 1FPKA 5IZ3B 3GBAA 1RDYA 3VXCA 3IB1A 4O3BA 1LAHE 4G77A 4LATA 1D9YA 4K3FA 1NNPA 3UGWA 3TQLA 4G4PA 1YAEA 2ZNUA 2B65A 2Z22A 2JJKA 2F97A 4OWDA 4UA8A 3C35A 5AA2D 4M1VA 2B4MA 2QPQA 1PDAA 1LFHA 3FVKA 2XXIA 2WKYA 1GGGA 2WYKA 4OXVA 3G3JA 1VDWA 4ECFA 1O64A 4XF5A 4X1BA 4N07A 4JXIA 1MQDA 1POTA 1LGBC 1ELJA 4U23A 1K9YA 5JEIA 2AIXA 1QUJA 1WDNA 1B3GA 1MY4A 1B3FA 1SI0A 1FPBA 4U2RA 5I2KB 5ET5A 3MJNA 1XVYA 3JV9A 1Z7ME 4I3EA 2XWVA 3ONMA 1Y3NA 4H46A 1POY1 4FEBA 5BWJA 3IORA 1DCUA 3EKIA 4PBQA 2D21A 4N8YA 5AA4B 1TWYA 2IA4A 2HAUA 1FQDA 2ONRA 5JTYA 3K6XA 3RPLA 1USYH 3ZSFA 4R6HA 2XWOA 2XXHA 3RTWB 1N7XA 1B58A 2V84A 3N6TA 3U65A 3RT8A 2REJA 1Y9UA 3SKPA 1NL5A 4F1UA 5CMKA 4MNCA 2WEFA 1B32A 4JDFA 3SEYA 2QMWA 2RINA 1ZJLA 5LDZA 2XXTA 1AL3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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