3OOAA

Crystal structures and biochemical characterization of the bacterial solute receptor acbh reveal an unprecedented exclusive substrate preference for b-d-galactopyranose
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
b'MSVSDGNGPITFGSNYSDEAPKAAFASLMQQATTSTTVPVTVNTTDHNTFQNNISNYLQGTPDSLATWFAGYRLQFFAAQGLLTPIDDVWDKIGGTFNDAAKSLSKGLDGHYYLVPLYNYPWVVFYNKSVFQSKGYEVPASWEAFIALARKMQSDGLVPLAFADKDGWPALGTFDILNLRINGYDYHIKLMKHEVPWTDPGVTKVFDQWRELAAYQQKGANGRTWQDAAKALENKQAGMMFQGSNQVAANYSAKNLPDLDFFVFPAINPQYGTDYMDAPTDGFILPKKGKNAAAAKKVLQYIGTAEAEAAFLKTDHWDVGLANGLIAPTYNDIQKKSVAEIGKCKSVSQFMDADTVPDMANAMIKLIQQFIDQPTPETIATVQKSAEDQAKTIFR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ABC transporter binding protein AcbH
publication title Crystal structures of the bacterial solute receptor AcbH displaying an exclusive substrate preference for beta-D-galactopyranose
pubmed doi rcsb
source organism Actinoplanes
molecule tags Sugar binding protein
total genus 138
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ooaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ooaA02
1UIUA 4OYVA 2A5SA 1POY1 2QMWA 2QMXA 1PC3A 1R9QA 3TDJA 1RYOA 4LONB 1JEVA 2DWJA 3VE1B 3D4GA 4GOTA 4OXVA 5KCJA 3OO7A 1MY0A 4OFJA 3RY3A 1UTHA 1XVXA 4YKPA 4F1UA 2Z8FA 4QFLA 3KZGA 3OELA 4H65A 4LP2B 4ZE8A 4MH5A 2X26A 1MM6A 4PETA 1SW2A 2Z22A 4NF6B 2PT1A 4MF3A 3PD8A 2A5TB 4F18A 5I2NA 4GRKA 3T93B 3FIRA 2DSFA 4U22A 2ESNA 4TLMB 3MVXA 4QFNA 4HTGA 4ELQA 1I6QA 4RNSA 3K2DA 3EF7A 1WODA 4TQUQ 5L9MA 2XXXA 4FEDA 1MXUA 4QF9A 3IB0A 4IO2A 3S4UA 3O2AA 2O51A 1LAXA 4R72A 4WEPA 3TCHA 3SERA 4E0WA 3EQ1A 2VOZA 4M1VA 3GBAA 3FXQA 4X9TA 1TFAA 2Z23A 3WAFA 3VXCA 3FV2A 2DQVA 3VXBA 4NWCA 1EZOA 5DEXA 5JTYB 2DS9A 5AE4A 3PPRA 3U92A 3OO8A 2ANJA 1AOVA 4F3SA 1LBBA 3CFLA 4TOZA 2RINA 3G3GA 4F1VA 5JK4A 1B5IA 5TPAB 4XIGQ 3MVZA 3S2VA 1GTKA 1FQFA 3MZ9A 3MVWA 4P11A 3PV0E 4RK2A 2F78A 1FW0A 3ZS6A 2F35A 2REJA 3OXNA 2ZNSA 5CMBA 3UK4A 4NEDA 5ISUA 4U4XA 3CRBA 1S9TA 3MVYA 4IY6A 3RGYA 4F31B 3K6XA 4KCDA 4QFPA 2ZYMA 1SD3A 3OO9A 1HSEA 3JYRA 1OQGA 1CB6A 3HO7A 5EYFA 4RXLA 1B46A 5DTBA 5H8QB 4F3PA 1B5JA 5IAIA 1XC1A 2V3QA 2XXRA 3TAJA 3G3JA 1B0HA 4FJPA 4GWOA 1Y3PA 3RT8A 4P0IA 3OSQA 1TT1A 1FCKA 5AA3A 3TUSA 1H43A 2H5YA 2UVJA 3FXUA 3VVEA 4K3FA 3IJXB 4NE4A 4G68C 2UVHA 1JVXA 1M5FA 4U23A 5I58A 4YU0A 1OVBA 1LB8A 3ZKLA 1IUDA 1FQEA 3OENA 4RY1A 4YICA 2V3UA 3QSLA 2Z8EA 1BLFA 3M8UA 3TELA 5L8DA 3N94A 3ONMA 4PFWA 4MFIA 3LSFB 1QULA 3ECRA 3RTFB 3PD9A 4I8CA 4OERA 4H67A 1LAGE 1MRPA 2R9JA 3ILUB 4EQ9A 4ZEKA 2I48A 3TQWA 4L17A 5F7VA 1TFDA 2F8DA 3PUXE 3UN6A 1MXXA 1II5A 1MM7A 3HCQA 5DVJA 1LSTA 2OWSA 3MP8A 1DTGA 1WDNA 2R6GE 3TTMA 3HPIA 3CFXA 4KHZE 4BDOA 2G93A 4YZZA 5HM4B 3B7DA 4LQ2A 1P99A 2YPNA 4KQPA 4FEBA 5IKBA 1LFIA 5HPQA 3SEWA 1PDAA 4BDNA 3K6WA 1B1HA 1NNKA 3FGSA 3QUFA 4G68A 3PMXA 1RKMA 1R9LA 3FZVA 4DE8A 3B6TA 3KGCA 5CRYA 5H8HA 3FJMA 5CI5A 4RPOA 3KSXA 3UP9A 3FD3A 4GIZA 4C1TA 4G2ZA 5TU0A 3RNNA 4U1OA 3UIFA 2GHBA 2XXIA 2X7PA 2Y7WA 3GBBA 2O84X 4FAJA 2O6AA 1T0KA 2XD3A 3MUQA 2IEEA 4ZZEA 4OENA 3PMVA 4UACA 2Q89A 1D4NA 1US4A 3C32A 5KZTA 3V8XB 4NF5A 1SDXA 3HHFA 2RC8A 5AA4A 4I62A 3RQTA 3UGWA 4DDDA 2F34A 3T9HB 1B52A 3SKPA 2QS3A 5ITPA 3C35A 4F2QA 3CVGA 4OEVA 2A5TA 4H6DA 4G8HA 1FTJA 5DVIA 1B51A 1ZTYA 5I58B 1FTOA 4DLDA 5CBSA 1QW0A 2ZYNA 4H8JA 4R9FA 4EXKA 3E4RA 4OWDA 1B3GA 3TQLA 4RJZA 2Y7PA 4LZ5A 2ZNTA 3FASA 1BKAA 3T22A 3V5AA 3DM0A 2M8CA 1VSOA 2QPQA 3MQ9A 3PU5A 1PBQA 4XTCQ 5J1DA 3MJNA 4ONYA 4XKPA 3T96B 4ZEDA 2F5XA 3RUMA 4ELPA 3TCGA 5KDTB 4F39A 2XXYA 3O28A 1QJMA 2XX8A 3PMWA 2DVCA 3BFTA 3C4MA 2XX9A 3SEXA 1B6HA 3KBRA 5JTYA 4YB6A 2OZZA 4LA9A 2G29A 3Q29A 4IGRA 4YB5A 4R2BA 4LVQA 2WKYA 3N6TA 3N6UA 4BDLA 4BDQA 4DCYA 1MDP1 2ONSA 5CMKA 4XXUA 5LOMA 4EXLA 1MY4A 4Q0CA 1MPBA 2AYSA 2F7AA 2HZKA 1ANFA 1M5BA 1LBCA 1FQBA 1USYE 2UYFA 3MZBA 3SEVA 3S9MC 5I56B 4ELOA 4FE8A 3DLNA 4C0RA 5FHMA 3JZJA 2FNCA 1NL5A 3H6WA 1B4ZA 4AB6A 1M5EA 5H8SA 4GF8A 3G3IA 1Q1KA 3IK6B 4DXBA 3AXFA 4DIGA 3PUZE 3CIJA 3Q26A 3KN8A 5H8HB 1MXZA 4IO7A 3O66A 2XXWA 1S50A 2Q2CA 3E3KA 5FHNA 4IY5A 5H8QA 3FJGA 3FVNA 1GGGA 4OFLA 1MG1A 4KYDA 1N3WA 5HBCA 1J1NA 3K1MA 2XXHA 4XKRA 2P0SA 1HSLA 1B5HA 4NF5B 1QUKA 2XXPA 3R6UA 5FTHA 2NXOA 2UYEA 5AA4B 1AMFA 3DP8A 5H8NB 5ITOA 1B32A 3LBSA 5EHSA 5CMCA 2UXAA 4TLLB 4OTEA 3EHTA 1XS5A 2DXYA 1M5CA 1OVTA 5AA2D 4H0WA 4RA1A 1QKAA 1NNPA 3K01A 1Y3QA 4YB7A 3RTWB 1IEJA 3TODA 1Y4CA 2DWHA 2O1MA 2O1LA 5FTIA 1O64A 2W7YA 1UTBB 1PB7A 1QKBA 2P1SA 3A3UA 3K6VA 3EPEA 3KG2A 4EUOA 2RCAA 2XXTA 1YPNA 4QRZA 1A8FA 2HQ0A 4KR5A 1LCTA 4DZ1A 2QSXA 3MBPA 1ELJA 2GRVA 1MPDA 3A3CA 4RYAA 4GD5A 4Q5TA 3IOTA 2X7QA 1VE4A 4R6YA 3MPLA 2I4CA 3FV1A 1P1OA 1Q35A 4P0GA 2YJPA 4ISUA 4KPTA 3VLUA 2NUVA 1LB9A 2IA4A 1KWHA 3MPKA 4ZEFA 4QHQA 4WXJA 1PEBA 3U72A 3VLVA 1N7XA 1QVSA 3LSXA 4NMYA 3TCFA 3M3LA 2H98A 4POWA 3H7MA 2DWAA 4Z7EA 4MBPA 1ZU0A 5CBRA 1YAEA 5K2YA 2V84A 4I9DA 2Z8DA 3IB2A 1OQHA 1I6AA 3SETA 2NOOA 3LUYA 1LCFA 3I5OA 2QL3A 4ZE9A 3MC2A 2F97A 1O7TA 2I3VA 4F1YA 2D5WA 2V93A 4ZDMA 2VD3A 3B6QA 4NTLA 2DYXA 2V3TA 3OEMA 2GHAA 3USDA 2DE3A 3O6HA 1MY1A 2NVUB 4GLIA 2DE2A 4O3AA 5I84A 4PFYA 4HCYA 5CC2A 4THIA 3DP4A 1A7LA 3IAZA 4JBZA 4O3BA 2XXQA 1NH8A 1EH3A 2Q9TA 1F9BA 2VGQA 4MLVA 5KDTA 1A99A 4EF2A 2P2AA 2HAUA 5M2VA 4EF1A 4R73A 5JEIA 1JEUA 2OLBA 3BFUA 3B6WA 1HSJA 3MAMA 4E0XA 1US5A 1MQHA 3SDFA 3IO6A 4YMBA 4RK9A 1CE2A 4F29A 1GV8A 4EDPA 2O68A 3H6VA 3GLBA 3CSBA 5FHOA 3U94A 5I56A 1JW1A 3M3FA 3IX1A 2ZYOA 3BBRA 3LR1A 4I1DA 1NNTA 3PPNA 4G8NA 4EQBA 3IR1A 1IXHA 5H8FA 3ILTB 4JB7A 3TZAA 2FA7A 3GXAA 5A5XB 1BTJA 1NFTA 3H06B 4N07A 2XX7A 3CSGA 1PB8A 4LATA 3S9LC 1Y9UA 5DVFA 2VHAA 1XVYA 2ZNUA 1OLAA 3A09A 2ZMBA 3Q28A 3IOWA 1JVYA 1YTVA 4JSDA 1B3LA 4BDRA 3QXMA 1A55A 2AL4A 3P7IA 3EHUA 4ZEIA 4G77A 3TFLA 3V83A 2XXVA 2RKMA 4OESA 2HXWA 1UQWA 5H8NA 1TWYA 2O7UA 1NMUA 4HW8A 2KLFA 3KN7A 1IIWA 4Z0IA 1OIBA 3FATA 3L6HA 4KI0E 1EZ9A 4QSDA 4C1UA 1IQ7A 1BP5A 3O9PA 3QIMA 1JW5A 4R6HA 2Y7IA 4FORA 2I58A 4ESWA 2I49A 1MXYA 2H99A 5L9OA 2QJEA 3ZKKA 3PUWE 3TTLA 4QSEA 2B3FA 3V89B 4IO5A 3HV1A 3MWBA 3QYTA 3Q25A 1LFGA 1PB9A 3TKDA 4F19A 1OMPA 4QSCA 3VVDA 2O7IA 3DP6A 4OEUA 1MY3A 2HEUA 3S9EA 4R6KA 4F3BA 5CMMA 1UTBA 3K02A 1SQYA 2AIXA 5I2KB 3TYHA 1P1QA 5TP9A 3C9HA 3ODBA 2HZLA 2F6PA 4RPNA 3SESA 2BJJX 1R6ZA 2DXRA 2Q8JA 4H1XA 1NKXA 3TTNA 1DOTA 1FQAA 2V25A 5I57B 3E9XA 2ONKE 3LC8A 1MH3A 1ZBMA 2DP8A 3T9VA 3OD7A 1EZPA 1DPEA 4H5GA 1B3EA 3N26A 4KCCA 1IXCA 4ELRA 2CZLA 2E0SA 1SW5A 5DYHA 3T9XB 1IITA 1XOCA 3TPAA 1B0LA 3TTKA 1QUJA 4X1DA 2B3BA 1NH7A 3I3VA 3O29A 1Z7NE 1BIYA 1MDQA 3O97A 1ZLQA 3KFMA 5EHMA 4NWDA 5H8FB 1NNFA 1MQJA 1B40A 2DE4A 2OWTA 3PUVE 3T9UA 3QUJA 3HSTA 3M3KA 5F1QA 3K0VA 3G3HA 3FVGA 1N04A 1B7HA 3H6TA 2VD2A 4JWXA 3MZ1A 4GFRA 4GL0A 5DT6A 3D4CA 3ZSFA 1URDA 4R9GA 2OCUA 5ICQA 4LZ7A 3RPWA 1D3KA 5I59A 1MS7A 1B05A 1Y4TA 2NWJA 1Y20A 1P1WA 1SYHA 4LQ5A 1YCJA 4NF4A 3VFJA 3O6IA 1SBPA 2RC7A 3UORA 3N5LA 2F6GA 2DVZA 3SEUA 4NF8B 2Y7RA 2I6EA 3WAEA 4LUBA 4PQJA 4YKKA 5ICTA 3IB1A 3THIA 1MQDA 3IOVA 1H3DA 1EU8A 1ZIUA 2PBWA 4FIMA 1SI1A 4QFOA 1S7YA 1FTLA 4Q8RA 3CR9A 3FUZA 3RN8A 5B70A 2QRYA 1OLCA 1MH4A 5B7DA 3W9VA 4UA8A 4PFUA 4IO6A 3K00A 1O63A 2RCBA 3K1PA 1URSA 3VV5A 1I6BA 4M4GA 1B7ZA 4BLAA 4YKIA 4YMAA 4U21A 2ONRA 1DMBA 2THIA 4U1ZA 1N7WA 4ECFA 4FECA 5AA1A 4IGTA 5TP9B 2F36A 4JSOA 4XKNA 4X1BA 1DSNA 3IORA 2OJTA 3FVKA 5L9SA 2PMSA 4AB5A 1ZMGA 1PBPA 4QFKA 1MXWA 3KSJA 3IOUA 1H45A 3F11A 4Q30B 4GXAA 3VLWA 1D9VA 1B58A 2FYIA 1DTZA 2YLNA 1FQDA 1USYH 1ATGA 2UVGA 5A5XA 2QS2A 3C34A 4GL8A 3KN3A 1IZ1A 1FQCA 4FATA 1B3FA 4POXA 1M5DA 3BKIB 1N76A 1I69A 3IJOB 3KJTA 3PPQA 4G8MA 2DOJA 4OHNA 2VP1A 4ZS9A 4N13A 1SW1A 2PYYA 4OVJA 2I3WA 4PP0A 1VR5A 5I59B 3HN0A 4OFOA 2XD2A 3CG1A 4U2RA 1FTMA 3K4UA 1AL3A 3O6GA 3W15C 4NF4B 5KCJB 2LAOA 3Q27A 3EN3A 3H03A 3C36A 1UTHB 1DPPA 3R7XA 1URGA 3HHGA 1B1XA 1VFDA 2H4IA 3CG3A 4F22A 1B7UA 3JV9A 5I2NB 3H3GA 3PPOA 3RT6B 4ESXA 3U93A 3KOSA 2RC9A 4HS7A 5I2KA 2Q88A 4X48A 2I4BA 4KYSA 4H5FA 2PT2A 4XKQA 3H6UA 2ZXTA 1QUIA 1LLSA 3K6UA 1MXVA 1XT8A 2ZYKA 4JXIA 4EQ7A 4YKJA 4R74A 2F7CA 3GZGA 1GVCA 3CFZA 1MQGA 4ZECA 1A8EA 5I57A 3IO4A 2OBGA 5BUUA 2R71A 3E13X 4DCXA 1B2HA 1Y3NA 2RF1A 3FVOA 1LAHE 2GFEA 5AA2A 1LFHA 3KJ7A 1Y1ZA 4R75A 5DEXB 2UVIA 1MQIA 5CM6A 3LSLA 4ZZAA 4HCWA 3KOTA 3T66A 4OMBA 1ZKBA 1IXIA 1MY2A 4AQ4A 2B65A 2AL5A 4GVOA 4DXUA 1N3XA 3IL1B 3R26A 4JWYA 3VDFA 3PGFA 2ALUA 3FXRA 3TMGA 2PVUA 4IO4A 1Y1MA 3VVFA 3OO6A 1MPCA 4MLQA 1B3HA 3K1NA 5BWJA 2H9BA 4WKMA 4BDMA 4IO3A 3SEYA 3QAXA 1JNFA 2REGA 3I6VA 4O3CA 1POTA 3DELB 1SVXB 4R2FA 4F2OA 4G4PA 2Y84A 3RLFE 4OETA 1N84A 1JETA 1D9YA 2OK2A 2HAVA 4H8IA 2D21A 1B9JA 4NF8A 1Z7ME 2D3IA 4F3GA 3OOAA 2GH9A 1B4HA 4JWOA 3G3KA 3L6GA 2E1SA 2XHDA 4OZ9A 1SW4A 1AH5A 3U1OA 2QS1A 2HCAA 3MP6A 1JW4A 4IB2A 1TXFA 4NF6A 1IXGA 1SI0A 3CI8A 4ZEBA 1A54A 3TEPA 3U8QA 4KFQA 4U4SA 2H25A 3PUYE 4DXCA 1JQFA 2PX1A 3MP1A 1N0TA 4N6PA 1LAFE 3QK6A 3G7WA 1P1NA 5ELVA 3EHSA 4ND9A 4PFTA 3W9WA 2XXUA 2F7BA 4WEDA 1VFEA 3LSWA 1UIVA 1A40A 1SYIA 3G3FA 2DWIA 3C33A 4OQOA 4KYEA 3OEKA 4GQOA 4PE5B 1RYXA 4JDFA 2O69A 3FJ7A 5K2XA 3TTRA 3S9NC 1P1UA 3UA8A 1AIVA 3KEIA 5AA2B 3H4ZA 1GR2A 3OSRA 1R1NA 2Q2AA 1XHYA 5TPAA 2I0BA 3MW0A 2CMOA 1WVJA 2HFBA 2ABHA 2I0CA 2QS4A 2Y7KA 1ZJLA 4YAHX 3PPPA 4GXSB 3OMBA 1FTKA 1L5TA 1H76A 4G68B 1LGBC 1H44A 4LZ8A 3C31A 4KD5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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