1LFIA

Metal substitution in transferrins: the crystal structure of human copper-lactoferrin at 2.1 angstroms resolution
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metal substitution in transferrins: the crystal structure of human copper-lactoferrin at 2.1-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
total genus 203
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA03
3L6HA 2RKMA 3DP8A 3U94A 4G8HA 4H1XA 3DELB 4DXUA 4G77A 3PD9A 3RY3A 2E1SA 4G8NA 2XXPA 2O69A 2O68A 1LBCA 4WEDA 4EF2A 1A8EA 4JSOA 4LUBA 3SEVA 1UIUA 3OMBA 1MY4A 2OJTA 4H8IA 4JWOA 1ZIUA 2R9JA 3OENA 3IX1A 3LR1A 2XXUA 2VOZA 3H3GA 3K1PA 3KFMA 3TUSA 1EZ9A 2F5XA 4ESWA 1M5BA 1H44A 5CI5A 2Y7IA 1H76A 3PUXE 1HSJA 5FTIA 3MQ9A 2UXAA 5B7DA 2ESNA 4O3CA 5ITPA 3TCHA 3MAMA 4NWCA 1M5FA 4F31B 1ZMGA 3CG1A 1MXVA 3LSLA 3W15C 4NF4A 3O2AA 4U1ZA 1T0KA 4X1DA 3IB2A 2V3QA 4BDLA 3MW0A 3TQWA 4R2FA 4H65A 4FORA 5IAIA 2X7QA 2XHDA 4G68B 4IGTA 1B2HA 3FXRA 3C9HA 3SEXA 2REGA 3T9UA 4HTGA 2F6PA 1SQYA 3R6UA 2OCUA 3PMWA 1POY1 4HCWA 4JB7A 1MDP1 1N3XA 4M4GA 3TTLA 2XXWA 4GIZA 3TCFA 1MXWA 5I59A 3TQLA 2F6GA 4YKIA 4KHZE 5FTHA 1SD3A 4ISUA 2QPQA 4LONB 5AA1A 2RC9A 3C31A 4KYEA 4MH5A 1NNTA 4EF1A 3ZS6A 2GFEA 3VXBA 4JBZA 1LFGA 4FEBA 3TKDA 3MZ1A 2H9BA 5JTYA 1LB8A 3VVFA 1AL3A 4XIGQ 4F1VA 3D4CA 2V84A 3JZJA 5I58B 5TPAA 1CB6A 3O28A 4N07A 2P1SA 4IO4A 1IITA 1XHYA 4U21A 2V93A 1SYHA 2YJPA 3QK6A 1QVSA 1N7WA 5DT6A 2PVUA 3R26A 1B52A 5DYHA 5I2KB 4H67A 2DOJA 1BKAA 1N76A 3PU5A 3RTWB 3A3UA 1MPDA 5H8HB 3RT8A 3USDA 1GVCA 4DDDA 3B6QA 2AIXA 3I3VA 2UVHA 4OMBA 1JQFA 3K1MA 2ZNSA 4OENA 5ISUA 1MG1A 1P1NA 2XXYA 1ZJLA 3FASA 4OHNA 1IXGA 5TU0A 3TCGA 4NF5A 4POXA 4U23A 3Q26A 2GRVA 4FIMA 3T9VA 1II5A 2D3IA 3DP4A 2IA4A 5HM4B 3O9PA 4LA9A 5DEXB 2DE2A 3LUYA 3FJMA 3MUQA 3TDJA 1NKXA 4YU0A 1OVBA 4KPTA 4H5GA 4JXIA 4Q5TA 3H6WA 2Q88A 2I49A 3FATA 4LP2B 3ONMA 1MQIA 4ELQA 3B6TA 4DXBA 4RY1A 4QFPA 4F2OA 3GLBA 2QMXA 4Z7EA 4RPNA 2ZYOA 5DVJA 3SDFA 2RC7A 4DLDA 1FQEA 4DCYA 4MFIA 2OWSA 2I0BA 2Z22A 1URSA 1FTMA 5JEIA 1JEVA 3EQ1A 3MP6A 4IB2A 4KCCA 3SETA 3UK4A 4EUOA 1MXZA 1ANFA 4ZEKA 1LSTA 1YTVA 3H7MA 3G3GA 2DE3A 4GF8A 4R72A 5H8FA 2O6AA 3JYRA 3C35A 3S2VA 3AXFA 3IJOB 2ZMBA 3OSRA 2Z23A 1B9JA 1B0HA 3S9MC 4LZ5A 3E13X 1A99A 4BDRA 1H45A 5AA4B 1S7YA 3E9XA 1I69A 5CMCA 2RCBA 1B51A 5DTBA 5BWJA 5I59B 4ZE8A 4NF8A 1F9BA 5L9SA 4OVJA 3WAEA 2R71A 4QFLA 4F3PA 4IY6A 2RF1A 4IO7A 2QS2A 4FAJA 2CZLA 4ZECA 3C34A 4I62A 4RK2A 4C1UA 1GV8A 3MVZA 4F18A 2XXVA 3V5AA 1Y4TA 4FATA 4PFUA 2VD2A 4LATA 5AE4A 3THIA 2QS1A 3EHSA 4ZE9A 1EH3A 1Z7ME 1NMUA 3BFUA 5JTYB 3TYHA 1BP5A 2DXYA 3OEMA 1IEJA 2XXXA 3S9LC 5TPAB 1Y4CA 2OWTA 3IOVA 1ELJA 2OK2A 4C0RA 2FYIA 3KSJA 1FQCA 3HHGA 4M1VA 1DMBA 2I58A 2Q2AA 4KD5A 1MM7A 1MXXA 2NOOA 1LBBA 4U2RA 1Y1MA 4PE5B 3EHUA 3UIFA 2P2AA 1Y20A 1N84A 4G8MA 1IXIA 3EHTA 2HZKA 2I48A 4C1TA 3ODBA 3FJ7A 5FHNA 3RNNA 2B65A 3TODA 1PC3A 2XD2A 4OTEA 1H43A 2QMWA 3P7IA 3QUFA 3PUZE 3A3CA 5AA2B 4NF5B 3UGWA 3VFJA 4OESA 3HSTA 1JVXA 1PB8A 2ZNUA 5CC2A 1FTKA 4IO6A 4PFWA 3A09A 1UTBA 1PBPA 1UQWA 2I3VA 3PPRA 2ZYKA 2GH9A 4TQUQ 4ELPA 4HW8A 1SW1A 2KLFA 5A5XB 1XVYA 3O6GA 1MQDA 4QFOA 4JWXA 4KYDA 4OEVA 1MS7A 3PPOA 3QIMA 5I84A 3KJTA 3MJNA 3KOTA 3U8QA 3FVOA 4RA1A 1MQGA 2G93A 1FQDA 1LCTA 3MPLA 4EQ7A 2PX1A 2AL5A 1H3DA 3LSFB 4IY5A 3T9HB 2NUVA 4ECFA 4KCDA 5KZTA 3LBSA 1ZBMA 1RYOA 1P1UA 3CSGA 2HAUA 3ZSFA 2OBGA 2FA7A 3BBRA 4OFJA 2A5SA 4YICA 1I6QA 2DVCA 3FXUA 1SW4A 3TEPA 4YKKA 4LQ5A 2B3BA 2H99A 1VR5A 3MZ9A 3PPNA 1OLAA 5BUUA 5I56A 4MLVA 5H8FB 3H6UA 2DVZA 1QULA 1FTJA 2VP1A 3L6GA 4H0WA 4ELRA 3IR1A 1LB9A 4IGRA 4NF6A 4GXSB 4PFYA 3Q28A 1ZTYA 3CI8A 2PT1A 2XXTA 1N04A 3MVXA 1QKBA 1DPEA 1SDXA 4KI0E 2I4CA 4ZZEA 1EZOA 5L9MA 1US5A 2Y7RA 4QF9A 4HCYA 4JSDA 1OMPA 4NF8B 1AOVA 1IZ1A 1UIVA 5K2XA 1M5DA 1B5IA 3KN7A 3G3HA 1NNPA 3T93B 4NEDA 5ELVA 3GBAA 4E0WA 3Q29A 3FXQA 3QAXA 4F29A 3K6UA 4FEDA 1EU8A 2QS3A 2F34A 4ZZAA 1M5CA 3C33A 1LAXA 3TTRA 2I0CA 3CG3A 4ONYA 4GOTA 5TP9B 4UACA 1URDA 4R6YA 3I6VA 4YAHX 4F19A 2PMSA 2I3WA 1JNFA 2QJEA 1B3FA 3W9WA 2PBWA 1SI0A 4X1BA 2Q89A 2F7AA 2HQ0A 5CMKA 2W7YA 3HCQA 3N6UA 1MXYA 5ICTA 3U93A 2UYFA 1A7LA 4OETA 4IO5A 2HAVA 3FGSA 3S9EA 3CIJA 1DPPA 3O97A 4OFLA 2DYXA 4DZ1A 4OZ9A 5DVIA 1Z7NE 3O29A 3CFXA 4GVOA 2AYSA 4FJPA 1UTBB 3TTNA 3U1OA 4I9DA 2A5TB 2QRYA 4ZS9A 3OXNA 1NL5A 5H8QB 3DP6A 1B1HA 4MF3A 2F8DA 1SW2A 2NXOA 1MH3A 3HO7A 2F36A 4GL0A 2H4IA 3KJ7A 4R6KA 3K6WA 3BKIB 4POWA 3IB1A 4EQ9A 3GZGA 4R9FA 4PETA 4R75A 4ZEIA 2X26A 2Z8EA 1JW1A 2XXIA 1MPCA 2ABHA 3M3LA 3OO8A 3UP9A 3HV1A 3KOSA 1P1OA 4R9GA 3KN8A 5F7VA 4WEPA 2O1LA 3QYTA 4X48A 5I2NA 1AH5A 3IAZA 4WKMA 1B7UA 1B7HA 2THIA 4NTLA 1I6AA 1OIBA 3G3IA 5H8NA 5I56B 3MBPA 1LLSA 1WODA 1MXUA 4RK9A 3MVWA 4Q0CA 1CE2A 1B46A 2XXRA 2RINA 3W9VA 1Y1ZA 5LOMA 4KFQA 2ZXTA 5ITOA 3IK6B 1NFTA 3IORA 1MDQA 2WKYA 4QHQA 4KYSA 2H25A 3EN3A 3M3KA 3FZVA 4LZ7A 3KZGA 4NF4B 5CRYA 1OQGA 1MY2A 1B1XA 3VVDA 1B0LA 3TTMA 5HBCA 3VDFA 1LAFE 2O84X 2V3TA 3N94A 4IO3A 2RC8A 4ND9A 3PMVA 1JEUA 1HSLA 4E0XA 4BDNA 4MBPA 3RT6B 2ONSA 1AIVA 3E3KA 1TFDA 2LAOA 1USYH 3TMGA 3IJXB 3BFTA 5CMBA 4TLLB 4YMAA 3N26A 2XD3A 2Y7WA 4YB5A 3K01A 1ATGA 4N6PA 2DSFA 5M2VA 1PDAA 1N3WA 4FECA 1B58A 3PPQA 2Y84A 4YB6A 1FQFA 5KCJA 3RQTA 1FTOA 4WXJA 4L17A 1AMFA 3VLVA 3UN6A 4RXLA 3G3FA 2NWJA 1DTGA 1O64A 3FV2A 1B3LA 3CSBA 1R1NA 4O3AA 2DP8A 3OD7A 3TELA 1GGGA 1MY0A 1Y9UA 4AB5A 1Q1KA 1BLFA 3O6IA 3KN3A 5EYFA 3ECRA 5F1QA 2HEUA 1B4HA 3FVKA 2DQVA 4F3BA 3SESA 3VV5A 1MY3A 1XC1A 3LSWA 5EHMA 3HN0A 2ZYNA 4RNSA 1IUDA 1MPBA 4QSEA 1D9YA 3IOUA 1NH7A 3LSXA 3PGFA 4R6HA 4ELOA 3OSQA 3PMXA 3C32A 4G2ZA 3C4MA 1M5EA 4BDMA 5I57A 3VVEA 2FNCA 3SEYA 3T9XB 1JETA 3K4UA 1LFIA 1NNFA 5ICQA 3K1NA 2H98A 2XX9A 2DE4A 1B3HA 3RTFB 4N13A 2AL4A 3G3JA 1S9TA 4HS7A 2G29A 1KWHA 4Q30B 2DWJA 2DXRA 1QUJA 2R6GE 4OQOA 4DCXA 3UA8A 3PUYE 3MWBA 4XXUA 2F97A 3TFLA 2D21A 1O63A 1MY1A 1QW0A 1TWYA 4F2QA 3PD8A 5CMMA 3FJGA 4NWDA 3IL1B 5H8NB 1MRPA 2NVUB 3LC8A 4OEUA 3FUZA 3H03A 4O3BA 4Q8RA 1XT8A 1B5HA 4GQOA 1J1NA 5CBRA 1YCJA 1WVJA 3EF7A 4Z0IA 3K0VA 4BDQA 1N0TA 3PV0E 3S9NC 4BDOA 2YLNA 1VFDA 3N5LA 4R2BA 5DEXA 2H5YA 1LAHE 3SEUA 2CMOA 1HSEA 1PB9A 4ZDMA 2X7PA 1PB7A 5CM6A 5FHMA 4AQ4A 3RGYA 1IQ7A 4EXKA 1B6HA 2DWHA 3KEIA 4DE8A 3IOTA 3OO6A 4GWOA 2F35A 1DSNA 5AA2D 1Y3QA 4UA8A 4U4XA 4F1YA 4ZEFA 4EDPA 2UYEA 4TOZA 3VLWA 3U92A 4LQ2A 2M8CA 4F3SA 2PT2A 1Y3NA 1JVYA 2QS4A 3T96B 5EHSA 4FE8A 4PFTA 2HXWA 3DLNA 5KCJB 1P99A 4YKPA 3KG2A 3FVGA 3WAFA 1OQHA 2I4BA 2VGQA 3TTKA 4U1OA 5KDTA 3MP8A 1VSOA 4H5FA 2XXHA 2Y7KA 1YAEA 3E4RA 3EPEA 1O7TA 1B3EA 3U72A 4XKQA 3UORA 2HCAA 4QFNA 2REJA 5L8DA 4YZZA 4LZ8A 2XXQA 3OEKA 1P1WA 3K00A 3D4GA 1JW4A 1URGA 3T66A 5AA4A 4R74A 1VE4A 4F1UA 1BTJA 2ANJA 3QSLA 4LVQA 1QUIA 3DM0A 1FCKA 3PUVE 2ONRA 1ZKBA 4XKRA 1SVXB 2DWIA 1PEBA 1YPNA 5I57B 3T22A 2F7BA 2F78A 1D3KA 2V25A 1LFHA 3CR9A 3KSXA 2PYYA 1UTHA 3ILTB 4XKPA 2V3UA 2D5WA 2O7IA 4H6DA 3IB0A 4GLIA 3CFLA 5L9OA 3S4UA 1R9QA 3TZAA 3ZKLA 4OWDA 1VFEA 1SBPA 3VLUA 2ONKE 3ZKKA 2E0SA 3FD3A 1TXFA 3M3FA 4F3GA 4ZEDA 1LCFA 1D4NA 1D9VA 2O1MA 1R9LA 1S50A 2Q8JA 1A55A 3PUWE 3MC2A 3SKPA 4QRZA 4I1DA 4BLAA 3HHFA 5HPQA 4YMBA 3QUJA 5AA2A 4OXVA 2ZNTA 2DWAA 1POTA 5AA3A 4MLQA 3K6XA 3OO9A 1A40A 1Y3PA 2Q9TA 1IXHA 1B05A 2B3FA 4KR5A 3H06B 5B70A 3PPPA 2OLBA 1RYXA 2HFBA 1B5JA 4AB6A 4XTCQ 5A5XA 3K2DA 4RPOA 4IO2A 1L5TA 4EXLA 3GXAA 3H6VA 4YB7A 1ZLQA 4QFKA 1FW0A 3CRBA 4XKNA 3KBRA 3V83A 2O7UA 3KGCA 4U22A 4NF6B 3FV1A 1FQAA 3OELA 3RLFE 4G4PA 1LGBC 2QSXA 5J1DA 3N6TA 5CBSA 2I6EA 3TAJA 3Q25A 2ZYMA 2UVGA 4F39A 2BJJX 1MH4A 1OLCA 5IKBA 1USYE 3V8XB 5H8SA 2Z8FA 2YPNA 4KQPA 5KDTB 3MP1A 3IO4A 1RKMA 3M8UA 3IO6A 3B7DA 4QSCA 3R7XA 1SI1A 1B40A 3G3KA 2Y7PA 4GXAA 1MQJA 3MZBA 2OZZA 2IEEA 4GRKA 4NMYA 3RN8A 3FVNA 1B32A 3OO7A 1MQHA 5K2YA 1EZPA 1R6ZA 3ILUB 5DVFA 4K3FA 1BIYA 4DIGA 4G68C 4ZEBA 2O51A 1A54A 1B7ZA 4PP0A 4P0GA 2VHAA 4QSDA 3CFZA 4JDFA 1N7XA 3IOWA 4DXCA 4P0IA 4PQJA 3RUMA 4H8JA 1I6BA 1NNKA 3CVGA 3H6TA 1DTZA 2Q2CA 1QUKA 1FTLA 4G68A 2F7CA 1OVTA 4F22A 4EQBA 1MM6A 2Z8DA 3MPKA 2XX7A 1XVXA 3I5OA 2XX8A 1DOTA 1TT1A 1GR2A 3VXCA 1IIWA 5JK4A 3K6VA 5TP9A 1UTHB 3F11A 1NH8A 1TFAA 2RCAA 1QJMA 3B6WA 4X9TA 3HPIA 1WDNA 4OYVA 3VE1B 1PBQA 3JV9A 2GHAA 3SERA 3C36A 1JW5A 2UVIA 2UVJA 1QKAA 1Q35A 4THIA 1LAGE 3K02A 4RJZA 4OFOA 4OERA 3QXMA 3OOAA 1ZU0A 2DS9A 1FQBA 1GTKA 1XS5A 3O6HA 1P1QA 2P0SA 3SEWA 4TLMB 4U4SA 4NE4A 3RPWA 1US4A 2ALUA 2GHBA 1B4ZA 3H4ZA 5I58A 4RYAA 1SW5A 2HZLA 4R73A 1IXCA 3FIRA 4I8CA 4GFRA 4ESXA 3O66A 5I2NB 5I2KA 3Q27A 2A5TA 4GL8A 5H8HA 2VD3A 1A8FA 5FHOA 3G7WA 5H8QA 1XOCA 4GD5A 4JWYA 1SYIA 1B3GA 3GBBA 4YKJA 3TPAA 4P11A 3V89B 3MVYA 2QL3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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