1LFIA

Metal substitution in transferrins: the crystal structure of human copper-lactoferrin at 2.1 angstroms resolution
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron transport
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Metal substitution in transferrins: the crystal structure of human copper-lactoferrin at 2.1-A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 203
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA03
1EU8A 3OELA 1WVJA 1MXWA 4JSDA 1IEJA 4IB2A 4IO6A 4OETA 1AMFA 1QUKA 4X1BA 3FIRA 1B32A 4F3GA 4YU0A 5FTIA 3UGWA 3FVKA 2F97A 2HZKA 5JTYB 4DE8A 1FTLA 4PQJA 2YLNA 2OLBA 1N3WA 4JB7A 5I58A 3ECRA 3VVEA 3FJ7A 2DWHA 4ZS9A 1AIVA 3IOVA 3S4UA 4KI0E 4G8NA 3U92A 3O2AA 4R6YA 3KG2A 3VLUA 1GGGA 2E1SA 3E9XA 3O6IA 1B51A 3K6VA 2V3UA 1Y9UA 4LA9A 2DVCA 2XX9A 3K6UA 3OENA 3PD8A 4QFLA 1PC3A 3HN0A 5I58B 4EUOA 3OXNA 3K01A 1SW2A 2ESNA 3H6VA 4HTGA 4YB5A 5DVJA 3MWBA 2ZXTA 4R9FA 4KR5A 3FVNA 1QULA 4JWYA 2OZZA 5TP9A 3FATA 2ZNTA 3CG1A 1N84A 4H65A 4LZ5A 2R9JA 1A54A 4DIGA 4EXKA 4LVQA 1PBQA 4OWDA 1M5EA 2HAUA 1D4NA 4QSEA 1B3GA 2HEUA 3LUYA 1US5A 4F1YA 3KGCA 3BKIB 1ZLQA 1TFAA 1L5TA 3T9VA 1B1HA 2ABHA 5ELVA 1ZIUA 5AE4A 3VLVA 4R73A 5TP9B 4OQOA 1NH7A 5L9MA 1NNPA 4DXBA 1Y3QA 1VSOA 3VVDA 4F3SA 3MUQA 3M8UA 3M3LA 4QSDA 1SI1A 3IB1A 2RKMA 4GL0A 3CR9A 1IUDA 4AB6A 5KCJA 3ONMA 4MLVA 3U72A 3TMGA 4Q5TA 4XIGQ 4JSOA 4LQ5A 3N6TA 3G3JA 4RPOA 3S9EA 2H5YA 2RCAA 2ONRA 4RY1A 4TLLB 4EXLA 2A5SA 1LGBC 1DSNA 1FQBA 1I6QA 5CM6A 3M3FA 4YICA 3G7WA 4EF2A 3KSJA 3VE1B 4Q8RA 1GV8A 3FZVA 4RJZA 5ITOA 2D21A 4I9DA 1JNFA 3VFJA 4KYDA 5I2KA 3PPPA 3U93A 1LB9A 4IO4A 3H6TA 2H99A 4HS7A 1P1WA 3SERA 1LFHA 4YKKA 1LAFE 4XKQA 3B7DA 4YMAA 4H1XA 4ZECA 3K4UA 4BLAA 1CE2A 3DP8A 1FQDA 4UACA 1UIUA 4ZEFA 2VHAA 4NEDA 3G3KA 1LFIA 2P2AA 5CMKA 3ZSFA 2RC8A 5I2KB 3RTFB 2I48A 3FV2A 4ISUA 2XXXA 2Z8EA 2B65A 2O7IA 3BFTA 1NL5A 4U21A 2FNCA 2DWIA 4POXA 4ONYA 2VD3A 1O64A 1JEVA 4BDLA 1S7YA 5HM4B 2Y7RA 1N3XA 3RN8A 3RT8A 1WODA 1R9LA 3RQTA 2QMWA 3OO9A 3KN3A 4R9GA 1F9BA 1EZPA 3SEXA 4QFNA 4Q0CA 2XXYA 2XXQA 5AA2A 1NFTA 3PV0E 1MQDA 2ZYKA 3FASA 4KCDA 1ZMGA 2QS3A 3OSQA 4LQ2A 3EHUA 3O6HA 3OMBA 1MXZA 3H06B 2AL4A 1MRPA 1MH3A 2NWJA 1ELJA 1MDQA 1OMPA 2VD2A 1B58A 3SETA 1SYHA 2ZMBA 1B4HA 2XXUA 5I56A 1NNTA 3MW0A 3VXCA 4OFOA 3TQLA 4N6PA 3C31A 1USYE 1BTJA 3FJMA 3CIJA 4N07A 2H9BA 2F7CA 1A55A 4FATA 3IK6B 3T9HB 5AA2B 3IJOB 1FTKA 2PMSA 5A5XA 2Y7PA 4ZEBA 3RY3A 3V83A 2F34A 3OSRA 3C9HA 4G4PA 1H44A 3KJTA 3IORA 5I56B 2QSXA 4OEUA 2M8CA 5AA2D 4C1TA 2X7PA 4OMBA 3I5OA 3TDJA 4GLIA 2HAVA 1SI0A 5I59A 5HPQA 2P0SA 5KZTA 2I4CA 3OEKA 2XXRA 3SEVA 3PMVA 2Z22A 2THIA 1IXIA 4R2BA 4YMBA 1LAHE 4O3CA 1DOTA 3PUYE 5A5XB 2HFBA 4C0RA 4NE4A 2DXYA 5DTBA 2HXWA 2D5WA 5CI5A 1N76A 3BBRA 4R6KA 1Y1ZA 3H6WA 4ND9A 2AIXA 1LCFA 3QAXA 3SDFA 3S9MC 1P1QA 3KN7A 5I59B 3IO4A 3K1NA 3L6GA 3DP4A 3E3KA 2OBGA 3T9UA 3CFLA 1NMUA 2ZNSA 3PPQA 3GZGA 2AYSA 3MZBA 2Z8DA 3O66A 1JVXA 4F39A 3TFLA 3MJNA 4RPNA 1N04A 4DXUA 1FCKA 3R26A 4H8IA 1YAEA 2CMOA 3F11A 2XXWA 3FXUA 1SW1A 2DWAA 4WKMA 1PBPA 4BDMA 2R6GE 2PBWA 1II5A 3H3GA 2Y7KA 1MH4A 1RKMA 3UORA 3MVZA 3K1PA 4QF9A 4NF5A 1LAXA 3M3KA 1B2HA 3JZJA 4ECFA 4Z0IA 5IAIA 5I84A 1GR2A 2Y7IA 2V25A 4KYEA 2F36A 1EH3A 3MVWA 4YAHX 1DTZA 3CSBA 3HO7A 1MY0A 4WXJA 3MVXA 4OEVA 2I4BA 2ONSA 2H98A 3PPNA 4G77A 2DE3A 3N5LA 3HHGA 3VVFA 5ISUA 3PUVE 3RPWA 1UTBA 2GHBA 4DZ1A 4NF5B 1FQCA 3W15C 2Z23A 1T0KA 2Q9TA 3KBRA 1BLFA 3HHFA 4ELRA 1ZJLA 5AA4A 1MS7A 1Z7ME 2F6GA 4F18A 4Q30B 4R6HA 5TU0A 3DLNA 1MQJA 2F5XA 1SW4A 4DDDA 5JEIA 3W9WA 3A3CA 1HSJA 1OVTA 1LBCA 3IB0A 4H5GA 1UTBB 5CMCA 1JQFA 3H4ZA 2DQVA 5KDTA 4G68C 2E0SA 3KOTA 4U4XA 5IKBA 3LSFB 3FD3A 3UA8A 4H6DA 3OEMA 2V84A 1O7TA 4LUBA 5ICTA 3UK4A 3PMWA 3G3FA 5AA4B 1D9YA 3TTRA 3S9LC 1NKXA 3U8QA 4IO3A 1YPNA 1URDA 4F2OA 4FAJA 1PB8A 1DPEA 3VV5A 4P11A 3TTKA 4HCYA 4H5FA 1N7WA 2DE2A 3ZKLA 4JWOA 3TTLA 1PB9A 1MM6A 3HSTA 4OFLA 3C32A 4XKRA 3C35A 3CI8A 4F3PA 4FJPA 2DYXA 4EQBA 5FHNA 3EN3A 4QHQA 4G8MA 3VXBA 3I6VA 4RA1A 3WAEA 1JW4A 3FUZA 3MZ9A 2HCAA 2QPQA 1Y4CA 4RYAA 1Q1KA 3O9PA 3EF7A 2DP8A 1H76A 3IOWA 2XXIA 2Q88A 1QVSA 4KCCA 1WDNA 4THIA 2QMXA 1BKAA 1A7LA 5H8QA 3FV1A 4ZDMA 3MAMA 4GOTA 4N13A 1JEUA 5L8DA 1B4ZA 2PT2A 1P1UA 2NVUB 3U1OA 1MDP1 4K3FA 2DSFA 1MQGA 2W7YA 1B05A 3H7MA 3BFUA 3RLFE 2I58A 4F22A 1XT8A 4OYVA 4P0IA 1LBBA 5B70A 4KQPA 3TTMA 1VFEA 4IGRA 1LSTA 4OENA 2OJTA 1VFDA 2XHDA 3MC2A 5H8QB 5KCJB 1P1OA 2OWSA 3TCHA 4U2RA 3KEIA 1UTHA 4GIZA 5H8HA 3G3IA 5ITPA 1SD3A 4OFJA 4XTCQ 3JV9A 3OOAA 1M5DA 2QRYA 1JETA 3CFXA 3PUXE 4IO7A 1B3LA 1SW5A 3KFMA 1DPPA 2RC9A 1B40A 2ZYMA 4U23A 3D4CA 3T22A 5H8NA 5B7DA 1MY4A 3G3HA 2DXRA 2KLFA 3C4MA 2DE4A 2F78A 1Y1MA 1MXVA 1FTOA 4OESA 4IO2A 5H8FA 3IB2A 5K2XA 1AH5A 1HSLA 4GL8A 1UTHB 2I3WA 4RXLA 3TPAA 1XHYA 1IITA 4G68A 4EQ9A 4KPTA 1FTJA 2QL3A 4GVOA 5CMMA 1B5JA 2GH9A 3O29A 3IOTA 4PFYA 1QUIA 3EHSA 2F35A 3LC8A 2XX8A 5H8NB 4KYSA 3FGSA 3IR1A 4DXCA 3PGFA 4KD5A 4HCWA 3OO8A 4I62A 4MBPA 3CG3A 2R71A 5H8FB 2UVJA 4NF6A 2Q8JA 3K6XA 4F19A 2O68A 3LR1A 3MP8A 2WKYA 2ZYOA 2H4IA 1I69A 2XD2A 3C36A 3FXRA 4G68B 3W9VA 1SBPA 3TAJA 1LB8A 2GFEA 1GTKA 2G93A 3RT6B 4FE8A 1B1XA 2ALUA 4U4SA 1OLCA 4IGTA 5CMBA 1BP5A 3IOUA 2HQ0A 4GFRA 4O3AA 2ZNUA 4G8HA 5F7VA 1O63A 2O1MA 1TT1A 4NF6B 1B7ZA 5EHSA 4I1DA 1SVXB 1DTGA 1R6ZA 4P0GA 4R2FA 1N0TA 1B3EA 2X7QA 5K2YA 3K6WA 2GHAA 4G2ZA 3E4RA 2XXVA 4FEBA 4H67A 4NTLA 1IXCA 1MY1A 3KN8A 3V89B 5LOMA 1B0HA 4FIMA 4JDFA 3HV1A 1QUJA 4EF1A 1XVYA 4YB7A 3VLWA 1OIBA 3UN6A 1SYIA 1B0LA 1Y3NA 3O97A 3FXQA 3TUSA 5FHOA 3K02A 3QYTA 4NMYA 4WEPA 5CRYA 4MLQA 1B7UA 1PDAA 2PX1A 3GBAA 2A5TA 1LLSA 4PFTA 2CZLA 2QS4A 1Q35A 2PVUA 1NNKA 1MY3A 1KWHA 3DM0A 1N7XA 3EPEA 5DVFA 1FQAA 4PETA 4ZZEA 2ZYNA 4OXVA 1MXXA 4LATA 3OO6A 4PFUA 2QS1A 4EQ7A 5I57A 1B5HA 2F7AA 4OZ9A 2ANJA 1MM7A 1D9VA 2A5TB 5HBCA 1I6AA 4GXSB 4GXAA 3HCQA 1XS5A 4YZZA 3QIMA 1B52A 4U1ZA 5BWJA 2VGQA 1A8FA 4XKNA 2O1LA 1TXFA 3RGYA 3OO7A 3R7XA 1B3FA 1QW0A 1R1NA 3SKPA 5I57B 3GBBA 5CBSA 5BUUA 1ANFA 3KJ7A 4OHNA 3V5AA 3EQ1A 3Q27A 2NUVA 4MF3A 3ILUB 4OVJA 1FQFA 1B6HA 2YJPA 1NH8A 3H6UA 4R74A 1M5BA 1RYOA 2I6EA 1R9QA 4OERA 3KZGA 4RK9A 3T9XB 4GRKA 4PP0A 2O69A 3ODBA 1AOVA 4DLDA 1AL3A 4F31B 2V93A 4H0WA 1TWYA 2O51A 2XXPA 5CBRA 4MH5A 4PFWA 1TFDA 4QFPA 2DOJA 2XD3A 2YPNA 4LONB 3TELA 4QFOA 4NF8A 3TYHA 1GVCA 3E13X 3L6HA 1VE4A 4XKPA 5EYFA 1POTA 1ZKBA 2O7UA 4RK2A 3N6UA 1MPDA 1XVXA 1P1NA 4AB5A 4ZEIA 2RINA 1RYXA 4FEDA 3MBPA 2Y84A 2IA4A 2AL5A 1H43A 4BDQA 2DS9A 3TKDA 2FYIA 5L9SA 4DCXA 5FTHA 1Y3PA 1EZ9A 1MQHA 4X9TA 2REJA 1D3KA 1P99A 4YB6A 3K2DA 3CSGA 4YKPA 2I0BA 4ESWA 4JBZA 4QFKA 5L9OA 1OVBA 4NF8B 5KDTB 2Q2CA 3ILTB 3SESA 3TTNA 2F7BA 4QSCA 4ELQA 3RTWB 1URGA 2I0CA 2REGA 1PEBA 1QJMA 1M5CA 1FQEA 1EZOA 4H8JA 3P7IA 3S2VA 2P1SA 3IL1B 3MP6A 2BJJX 2NXOA 3U94A 5ICQA 4X1DA 4U22A 4BDOA 4GF8A 3IX1A 1UQWA 4TQUQ 3JYRA 4M4GA 4NWCA 5AA3A 4EDPA 1OQHA 4AQ4A 4R72A 1IQ7A 3LBSA 4ESXA 2O84X 3TCGA 3MP1A 4GD5A 3TODA 3TQWA 3QK6A 1URSA 3IJXB 2NOOA 3G3GA 2O6AA 4ZE8A 1ZBMA 3LSWA 3UP9A 4ZEKA 5AA1A 1QKAA 1MY2A 1US4A 4E0WA 3QUFA 2OWTA 3THIA 5EHMA 4POWA 2UVGA 1SQYA 4OTEA 3B6QA 1FTMA 3S9NC 1SDXA 2UVHA 2RC7A 2UYFA 3A09A 3K1MA 4NF4A 2V3TA 1B7HA 5CC2A 2F6PA 4BDRA 3T96B 3SEWA 4HW8A 3PPRA 4F1VA 1VR5A 3MVYA 3T93B 3QXMA 1JW5A 4O3BA 3IAZA 1IZ1A 4F3BA 4ZZAA 1YTVA 3Q25A 4IY6A 2I3VA 1MPBA 2OCUA 3PPOA 1I6BA 1HSEA 3SEYA 1B5IA 3PD9A 3B6TA 1UIVA 3UIFA 4NF4B 3AXFA 3C33A 5H8HB 1M5FA 3FVOA 2G29A 3PUWE 4I8CA 4ZE9A 2VOZA 1JW1A 2Q2AA 5I2NA 1H45A 1MXUA 1Y20A 4LZ8A 4ELOA 2XXTA 4JXIA 1S9TA 3T66A 4ZEDA 4MFIA 1A8EA 1Z7NE 4YKIA 1Y4TA 3MQ9A 1DMBA 3I3VA 4IO5A 4TLMB 3HPIA 3KOSA 3Q29A 3LSLA 1IIWA 1ZU0A 1ATGA 4GWOA 2XXHA 5DYHA 2IEEA 1MQIA 4F1UA 2Z8FA 3Q28A 4IY5A 3TZAA 3GLBA 4E0XA 3KSXA 5I2NB 1LCTA 3OD7A 3O6GA 3FJGA 3Q26A 3K00A 4LZ7A 1YCJA 4F2QA 1XC1A 2X26A 1MPCA 2OK2A 3CRBA 3DELB 3RUMA 1MG1A 3QUJA 3A3UA 2PT1A 3RNNA 2RF1A 4PE5B 5DT6A 4M1VA 2Q89A 1B9JA 2B3FA 3V8XB 4QRZA 4R75A 3K0VA 5TPAA 4C1UA 4F29A 1A99A 1IXGA 4YKJA 4RNSA 3PMXA 1CB6A 4NWDA 2XX7A 4FECA 3H03A 1LAGE 4Z7EA 1POY1 2DVZA 1B3HA 3MPKA 4X48A 4U1OA 4FORA 1USYH 2QJEA 4L17A 4JWXA 5F1QA 4UA8A 2D3IA 1BIYA 3D4GA 2V3QA 5TPAB 3GXAA 3IO6A 5M2VA 3DP6A 3LSXA 1IXHA 3ZS6A 5J1DA 5DVIA 2I49A 5DEXA 3O28A 1H3DA 3EHTA 2PYYA 4GQOA 1LFGA 3SEUA 2QS2A 2RCBA 2GRVA 5H8SA 2FA7A 3CFZA 1ZTYA 3PUZE 3N26A 2HZLA 3PU5A 4TOZA 1QKBA 3CVGA 1XOCA 1PB7A 1B46A 3ZKKA 3MZ1A 3R6UA 2VP1A 3USDA 4BDNA 3N94A 3TCFA 3FVGA 1NNFA 5DEXB 2ONKE 2DWJA 2LAOA 5FHMA 3QSLA 1MXYA 1FW0A 1JVYA 4KHZE 2UXAA 3B6WA 3MPLA 2F8DA 2B3BA 4ELPA 3VDFA 1OLAA 2UVIA 4XXUA 5JTYA 4KFQA 2H25A 3TEPA 4LP2B 4WEDA 2UYEA 2Y7WA 3WAFA 1S50A 4DCYA 1J1NA 1A40A 5JK4A 1OQGA 3C34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EU8A 4UABA 3OELA 1WVJA 1FTAA 2QFLA 1MXWA 4P1EA 4JSDA 1IEJA 4IB2A 4IO6A 4OETA 1AMFA 1QUKA 3MYUA 4X1BA 3FIRA 1B32A 4F3GA 2MKZA 4YU0A 2XWOA 5FTIA 3UGWA 3FVKA 2F97A 2HZKA 5JTYB 4DE8A 1FTLA 4PQJA 2YLNA 2OLBA 1N3WA 4JB7A 5I58A 3ECRA 3VVEA 3FJ7A 2DWHA 4ZS9A 1AIVA 3IOVA 3S4UA 1KA1A 4G8NA 4KI0E 3U92A 3O2AA 4R6YA 3KG2A 3VLUA 1GGGA 1FBGA 3IFCA 2E1SA 4PE3A 3E9XA 3O6IA 1B51A 3K6VA 2V3UA 1Y9UA 1FBCA 4LA9A 2DVCA 4GWUA 2XX9A 3K6UA 2FIXA 2P3VA 3OENA 3PD8A 4QFLA 1PC3A 3HN0A 5I58B 4EUOA 1FBPA 3OXNA 1RDYA 3K01A 1SW2A 2ESNA 3H6VA 2HPGA 4HTGA 4N91A 4YB5A 5DVJA 3MWBA 2ZXTA 4R9FA 2WEFA 4KR5A 3FVNA 1QULA 4JWYA 2OZZA 2CZKA 4LN5A 3E78A 5TP9A 1DBZA 3FATA 4FBPA 2ZNTA 3CG1A 1N84A 4H65A 4LZ5A 2R9JA 1A54A 4DIGA 4EXKA 4LVQA 1PBQA 4OWDA 1M5EA 2HAUA 1D4NA 4QSEA 1B3GA 2HEUA 3LUYA 1US5A 4F1YA 1K9YA 3KGCA 3BKIB 3FBPA 1ZLQA 1TFAA 1L5TA 2XA5A 3T9VA 1B1HA 2ABHA 5ELVA 1ZIUA 5AE4A 3VLVA 4R73A 5TP9B 4OQOA 1NH7A 4MAGA 5ET8A 5L9MA 4H46A 1NNPA 4DXBA 1Y3QA 1VSOA 3VVDA 3LUZA 4I3EA 4NHBA 4F3SA 5EYHA 3MUQA 3M8UA 3M3LA 4QSDA 5J16A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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