1II5A

Crystal structure of the glur0 ligand binding core complex with l-glutamate
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
226
structure length
221
Chain Sequence
GSAMALKVGVVGNPPFVFYGAFTGISLDVWRAVAESQKWNSEYVRQNSISAGITAVAEGELDILIGPISVTPERAAIEGITFTQPYFSSGIGLLIPGTATPLFRSVGDLKNKEVAVVRDTTAVDWANFYQADVRETNNLTAAITLLQKKQVEAVMFDRPALIYYTRQNPNLNLEVTEIRVSLEPYGFVLKENSPLQKTINVEMLNLLYSRVIAEFTERWLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for ligand binding to GluR0 ion channels: crystal structures of the glutamate and serine complexes and a closed apo state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Slr1257 protein
molecule tags Membrane protein
source organism Synechocystis sp. pcc 6803 substr. kazusa
total genus 72
structure length 221
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ii5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ii5A02
4OZ9A 1IIWA 2REJA 4ZEKA 1MQIA 1SVXB 4F22A 5CMCA 1B7HA 4EUOA 3G3JA 4PE5B 1A8FA 3EHUA 1ZIUA 1AMFA 3DLNA 5TP9B 1N7WA 1NNFA 3FD3A 5IAIA 3PD9A 1ANFA 2DQVA 4OTEA 1AL3A 3UA8A 1ZTYA 3DP8A 2NVUB 2H9BA 1B3GA 4YU0A 4GWOA 3I3VA 4JB7A 2VP1A 2HEUA 3CFZA 4F3BA 5AA4B 4X1DA 5DVFA 3TTRA 2O1LA 3QAXA 4R2BA 1Y3NA 3U94A 3PMVA 1I69A 5CBRA 5B70A 3OMBA 2I48A 1FW0A 4U4XA 4KI0E 1B05A 3MZBA 2NWJA 2Y7KA 4Z0IA 1B52A 2F6PA 2ANJA 2OCUA 3O6IA 4QF9A 1FQBA 4G8HA 4OFLA 3TTKA 2V93A 2DVCA 4M1VA 1GR2A 3VXCA 1JW5A 1CE2A 2XD3A 1NNPA 4DXUA 4BDQA 2UVIA 4ZEFA 2UYEA 3MPKA 1B46A 1B58A 4RXLA 3KBRA 4BLAA 4JXIA 2F7BA 1NH7A 1BLFA 3TAJA 3RPWA 3QXMA 3M8UA 4PFYA 1H76A 4JWYA 3BKIB 2X26A 3A3CA 1B3HA 5CI5A 3IL1B 3VVDA 5H8QA 2UYFA 1QW0A 2LAOA 2CZLA 1UTHB 1NNTA 3CG1A 3RY3A 5CRYA 1ZU0A 1YPNA 3PUVE 4ZS9A 3G3HA 1JEVA 2OK2A 4PQJA 3SEWA 3Q27A 2XXWA 2THIA 4HTGA 3IK6B 2PT2A 5DEXB 3K00A 3FXUA 1POTA 3USDA 5BWJA 1Q35A 4NF6A 1EZOA 1D9VA 3K6WA 3C34A 1JVXA 1Y20A 3K1NA 3QUJA 3U1OA 2D21A 3K1MA 3UK4A 3ONMA 2HAVA 3U72A 4YMBA 1MPDA 2BJJX 2QRYA 4R6YA 1ELJA 1IQ7A 1OIBA 5L9SA 1B40A 2R71A 4H6DA 2ZMBA 3HCQA 1MPCA 4G68A 3U8QA 1AOVA 1MXWA 3MC2A 4Q0CA 1GGGA 1OQHA 1DSNA 2HCAA 5I2NB 3FVOA 1OMPA 3VV5A 2XXRA 3V89B 1H45A 2ZNUA 3N6TA 3FVGA 1N7XA 2Y84A 2I4CA 1B5HA 2O68A 3MZ1A 2ONRA 5KCJB 5EHSA 1M5DA 4F1VA 3I5OA 2ALUA 2AIXA 3UP9A 4ELQA 1WDNA 3KOSA 3MWBA 4ZE8A 1QUJA 3MP6A 3B7DA 3N5LA 4FE8A 1URGA 1EZPA 1Y9UA 3C35A 4QRZA 3SDFA 3FV2A 1JQFA 1MXVA 4Q30B 4NF8B 4H1XA 4H5FA 3AXFA 1OLCA 2DVZA 1NKXA 3IR1A 4FEDA 4C1UA 3A3UA 3MVWA 3EHTA 4QFNA 4IO3A 4IY5A 4F19A 3PUYE 4DE8A 2P0SA 1MDP1 3T9HB 3TTMA 3H7MA 3K6UA 3RTFB 5TPAA 3K4UA 3KG2A 4E0XA 2DWJA 3I6VA 4F1UA 5H8SA 5BUUA 3IORA 5HBCA 2F7AA 1B6HA 4U4SA 4IO5A 4F2QA 2O6AA 4BDRA 4E0WA 3SEUA 3LC8A 1EU8A 1LB8A 3QUFA 3HO7A 4NF6B 2H5YA 3TTLA 3T96B 3E3KA 1XOCA 4KR5A 2RC9A 4YMAA 2R6GE 1BKAA 4EQ7A 3T93B 5I57B 4DCYA 4NWDA 4ZE9A 1B1XA 2QS3A 1MH3A 3MP8A 5ICQA 1B51A 3VE1B 3TODA 3ECRA 5FHOA 2QS1A 3K1PA 3MW0A 4HW8A 1O63A 2XXVA 1NL5A 1VR5A 2NXOA 4G68B 1M5BA 3VLWA 1T0KA 2F7CA 2PMSA 2QS2A 3UGWA 4TLLB 4OWDA 3VLUA 3E4RA 2GHBA 3S9EA 1O7TA 4GLIA 5AA4A 4JSDA 3FXRA 3G3GA 4PFWA 4YKIA 3CFXA 1EZ9A 4DZ1A 3VVFA 5JEIA 3D4GA 3KSXA 4X1BA 4R9FA 3WAFA 4LZ8A 2DWIA 3V8XB 1MQHA 3IAZA 3OO6A 3MZ9A 3PUXE 1SW5A 4YKKA 3TQLA 3VXBA 1PEBA 4POWA 4KD5A 4F31B 4XTCQ 3C36A 4KQPA 5L9MA 2P1SA 1R9QA 3H6TA 2AYSA 5F7VA 1SDXA 5CMBA 4EXLA 1I6QA 3VFJA 3IOVA 4RK2A 1OVTA 2Q88A 1TWYA 2E0SA 1OQGA 5ELVA 3IO6A 4F3PA 2ZYOA 1N76A 2VOZA 3TTNA 1IITA 2XX9A 3ODBA 1P1NA 1USYH 5TU0A 5H8HA 4C1TA 1NNKA 4OEVA 1POY1 1S7YA 5TPAB 3OO7A 2DE3A 3SEYA 2CMOA 5I56B 1FTMA 1UTHA 3L6GA 3ZKKA 3GBBA 4NTLA 4RPOA 1DTZA 3IB2A 1O64A 1PB9A 3Q28A 3CIJA 1B3FA 2GHAA 3OENA 1LLSA 4FORA 4XKQA 2F36A 1QULA 1R6ZA 1A55A 1A7LA 2HFBA 4GVOA 3MVYA 3N26A 5DEXA 2H4IA 1LAFE 2O84X 1SBPA 3DP4A 3IO4A 3RNNA 1AH5A 3MAMA 4R72A 4WEPA 2A5SA 1Y3PA 5B7DA 5HM4B 3TDJA 1LSTA 4GOTA 4MH5A 1ZMGA 1MPBA 4F18A 3RT8A 1EH3A 3H3GA 5IKBA 4P0GA 5K2XA 1GV8A 3PPNA 4P0IA 4FJPA 1US4A 1S9TA 1MM6A 4G2ZA 1I6BA 2V3UA 3A09A 2YPNA 2VHAA 3O2AA 4EDPA 3PPOA 4FATA 3JYRA 3W15C 4YAHX 1SYHA 1UTBA 5FHNA 5I2NA 4ISUA 3C9HA 4JDFA 5I58A 1XT8A 2ONSA 1JW4A 3R26A 3EF7A 4I62A 4AQ4A 4ZEDA 2QSXA 1A40A 3CR9A 1Z7NE 5KCJA 4IY6A 4RK9A 4UA8A 4KYEA 3H6VA 3KOTA 2AL4A 2V3TA 1MY4A 5AA3A 3G7WA 2PVUA 3OEKA 2W7YA 1Y4TA 2Z8FA 2H25A 3KSJA 4WEDA 1MS7A 1LCTA 3CFLA 5CBSA 1IEJA 3K01A 4KCDA 5H8HB 4H8JA 4HS7A 4OESA 4R75A 4XIGQ 2QMWA 4NF8A 2HZKA 2Z8EA 1B32A 1SW2A 1LFHA 3K6VA 3TYHA 4ZZAA 1D3KA 5I2KB 4GXAA 3T9VA 4H65A 3KEIA 5H8NA 1D4NA 3B6WA 1F9BA 3L6HA 4BDOA 4GF8A 3K6XA 3KFMA 4ZEBA 3EQ1A 1N3WA 3C31A 1QUKA 2XXIA 1MY1A 3M3KA 3MP1A 4IO7A 4NWCA 4XKRA 3EPEA 2ZNTA 1USYE 1FTKA 3C33A 2XXTA 4F29A 2Q89A 4OMBA 4QSCA 1US5A 2B3FA 3EN3A 3ZSFA 1B5JA 1BIYA 1JW1A 4RY1A 3FXQA 3S9NC 3QK6A 3G3IA 3O28A 1LFIA 4FIMA 2F35A 5I57A 3FGSA 3SEVA 1FQDA 2E1SA 3MVXA 3O6HA 4ELOA 1BTJA 4LP2B 1P1QA 4DLDA 3TCFA 4TLMB 1H3DA 2F8DA 3LSWA 4GL8A 4ELPA 3PGFA 1Q1KA 4PETA 4YICA 2UVHA 3BFUA 3TPAA 1YAEA 4GIZA 1UTBB 4OQOA 1XVYA 1PB8A 5ICTA 5I58B 4YB5A 1VFEA 1IZ1A 3OD7A 3PUZE 3SEXA 2Y7WA 2Z8DA 1FQFA 1LCFA 3GBAA 1LAHE 1ZLQA 5CC2A 3P7IA 5JTYA 4F2OA 5I84A 3IJXB 4OFJA 4RJZA 3KJ7A 4IO2A 1JEUA 1YTVA 3IOTA 4RYAA 3Q26A 2A5TB 3FV1A 2V3QA 2YLNA 3RTWB 3FJGA 4PFUA 4H5GA 1MY3A 3U93A 5ITOA 3W9WA 3HSTA 4F3GA 4YKPA 1OVBA 4PP0A 4LQ5A 4NMYA 4ZDMA 3SESA 1RKMA 1JETA 3B6QA 1VFDA 4KFQA 2O1MA 3ILUB 3FZVA 4O3BA 3BFTA 1FQEA 4WXJA 3T22A 5H8NB 3KJTA 1IXGA 4DCXA 2ZXTA 2DXRA 3TCGA 5AA2D 1MXUA 3FATA 2V25A 4C0RA 1P1WA 3IB1A 2REGA 3T9UA 4RA1A 2OWSA 4H8IA 2FNCA 5I56A 1H43A 4QFKA 1YCJA 3BBRA 4O3AA 1B3LA 4I8CA 1QVSA 3CSBA 1VE4A 3OO8A 4EQ9A 4U2RA 4GQOA 4RPNA 5DTBA 1XC1A 3LSLA 3O29A 4TQUQ 3MQ9A 1B3EA 2DXYA 1B4HA 1H44A 1XHYA 4UACA 4ZZEA 3KN3A 4HCYA 1UQWA 2Q8JA 3SERA 3OOAA 2RKMA 2I49A 1MY2A 1IXCA 3HPIA 3O97A 4QFLA 2RC7A 3RGYA 4EF2A 2XXYA 4BDLA 5I59A 4N07A 3GZGA 3R6UA 1TFAA 1ZJLA 4GXSB 2Z22A 2IA4A 3S9MC 4FAJA 3TMGA 5JTYB 4Q5TA 4RNSA 2XXQA 5CMMA 1URSA 3SKPA 4MF3A 3N94A 1SI0A 3LSXA 4G77A 3H6WA 3TCHA 2XXPA 3TUSA 3RQTA 4N6PA 2WKYA 4XKNA 4H67A 1M5EA 3RLFE 4R6HA 3WAEA 2PYYA 2Q9TA 4F1YA 2F97A 2VGQA 3M3LA 4DXBA 1SI1A 2HZLA 5FHMA 2OWTA 1QKBA 3FVNA 3W9VA 4NF5B 5M2VA 3RUMA 2I0BA 5I2KA 3OO9A 3PU5A 3OELA 2UVGA 3CI8A 3G3FA 4ESXA 4HCWA 2Y7IA 1HSLA 4PFTA 3MUQA 3QSLA 2KLFA 4X9TA 2DE4A 4LQ2A 2XHDA 2XXXA 4THIA 2DWHA 3OSQA 5AA1A 2D5WA 4NF4A 1N0TA 3GLBA 1N3XA 2Q2AA 4U23A 3T9XB 2O51A 4IB2A 4O3CA 4YKJA 2XD2A 1QKAA 1L5TA 1TFDA 3O6GA 3TQWA 4JWXA 2Y7RA 1ZBMA 3EHSA 3UN6A 3N6UA 1IXHA 1WVJA 2HQ0A 2RINA 2QJEA 3H03A 5FTHA 4LZ7A 4EQBA 5I59B 1IUDA 2X7QA 3RT6B 3CVGA 2O69A 4FECA 1DMBA 2Y7PA 3TELA 3KGCA 3DELB 1FTLA 2O7UA 3KZGA 3ILTB 5H8FB 5L8DA 5K2YA 1LGBC 4R9GA 3Q29A 4QFPA 4ZEIA 4OETA 3Q25A 2Z23A 5J1DA 5ISUA 4R73A 2IEEA 2XX7A 2G93A 4JBZA 1MXYA 1URDA 2YJPA 1DPEA 4ONYA 2H99A 4U1ZA 4LONB 5CM6A 1ATGA 2A5TA 4U21A 4JWOA 3DM0A 1B5IA 5LOMA 1SYIA 1ZKBA 4JSOA 4OERA 3OEMA 5A5XA 1FQCA 2GH9A 4LATA 4YB7A 4AB6A 1Y4CA 1LB9A 2RC8A 3G3KA 3V83A 4OXVA 1IXIA 4IGRA 3OXNA 4F3SA 5F1QA 2AL5A 3O66A 1Z7ME 4N13A 2I0CA 5AA2A 3IB0A 3T66A 4ZECA 2PT1A 3PUWE 1MQGA 3FASA 3FVKA 2F78A 3PD8A 4LZ5A 2ONKE 2RCAA 1WODA 1MRPA 4DIGA 5HPQA 1I6AA 4NF4B 1GVCA 2DE2A 1HSEA 4EF1A 1DOTA 3FJ7A 2QPQA 4AB5A 2R9JA 1S50A 2P2AA 3CRBA 4MLQA 1B7ZA 4P11A 1N04A 4BDMA 3PPPA 3H6UA 3GXAA 3E13X 2HXWA 1FTOA 5DVJA 3MJNA 4OVJA 1LFGA 1MY0A 2I3VA 4G8NA 1R1NA 4K3FA 4R2FA 4NEDA 5AE4A 3HHFA 4R6KA 2RCBA 2DYXA 3C4MA 1SW1A 2DS9A 2XXHA 4X48A 2FYIA 1Y3QA 3PPRA 3UIFA 2OBGA 1MDQA 1NFTA 3K0VA 1PBQA 4XXUA 2ZYNA 1DTGA 4IGTA 3K02A 2QMXA 4EXKA 4ND9A 1P1UA 3VVEA 4KPTA 3KN8A 4BDNA 1OLAA 1LAXA 4H0WA 1AIVA 5KDTA 1SQYA 2XX8A 4IO4A 1M5FA 2XXUA 1MXZA 3PMXA 3QYTA 2B65A 2ZYMA 4QSDA 4I1DA 4LA9A 1SD3A 5A5XB 3S4UA 1CB6A 3TFLA 5DVIA 3IOUA 2ZYKA 3H06B 2I4BA 3O9PA 1MM7A 1M5CA 1P99A 3KN7A 4ECFA 5CMKA 2DSFA 1A8EA 1NH8A 1B0HA 3B6TA 2X7PA 4QHQA 3FIRA 2H98A 4OHNA 1KWHA 1QUIA 5AA2B 1SW4A 1PB7A 2OJTA 3D4CA 4G4PA 4NF5A 5H8QB 2I6EA 3ZKLA 3S9LC 3CG3A 4GFRA 1R9LA 2NUVA 2GRVA 4KYDA 4MBPA 2V84A 2HAUA 4XKPA 3LSFB 2RF1A 4L17A 5EHMA 4LUBA 4Q8RA 4OFOA 3M3FA 2G29A 4WKMA 2B3BA 2ZNSA 3IX1A 3LBSA 5JK4A 1B4ZA 4KHZE 4OEUA 3H4ZA 3ZS6A 1LAGE 4IO6A 4NE4A 4YB6A 1PDAA 1FQAA 1II5A 4G68C 1PC3A 5DT6A 1UIUA 4I9DA 4OENA 3U92A 1LBCA 4U22A 1B7UA 4R74A 2NOOA 5TP9A 4DDDA 1B0LA 2F34A 1HSJA 4DXCA 3PV0E 4GRKA 1TT1A 3E9XA 3PMWA 3LUYA 1Y1MA 4Z7EA 3V5AA 1DPPA 4ESWA 3LR1A 2ABHA 4GL0A 3QIMA 3UORA 4G8MA 1MQJA 5FTIA 1RYOA 2QL3A 1XVXA 1JVYA 3PPQA 3K2DA 4KCCA 3SETA 3OSRA 4U1OA 5EYFA 3JZJA 5H8FA 3TZAA 5KDTB 5DYHA 3DP6A 1NMUA 3C32A 2F6GA 3THIA 4OYVA 5L9OA 1MH4A 1UIVA 2VD2A 1VSOA 2DP8A 2O7IA 4M4GA 5KZTA 3IJOB 3MBPA 2DWAA 2ESNA 2FA7A 4QFOA 1P1OA 1GTKA 1JNFA 3JV9A 3MVZA 1PBPA 1BP5A 3TEPA 3RN8A 3VLVA 1MQDA 2PX1A 3HV1A 3IOWA 4YZZA 2UVJA 4LVQA 1D9YA 5ITPA 1J1NA 4TOZA 4QSEA 1FTJA 3MPLA 4GD5A 3CSGA 3TKDA 3VDFA 2OLBA 4F39A 4FEBA 3FJMA 4ELRA 1A54A 2Q2CA 4MFIA 4MLVA 2VD3A 1B9JA 4KYSA 2D3IA 1LBBA 3HHGA 1MG1A 2PBWA 2OZZA 4POXA 2I58A 1QJMA 2M8CA 1Y1ZA 1FCKA 1XS5A 1B2HA 3S2VA 2GFEA 3FUZA 1A99A 2UXAA 1TXFA 1B1HA 2F5XA 2DOJA 3F11A 3R7XA 3HN0A 2I3WA 1N84A 2QS4A 1RYXA 1MXXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OZ9A 1IIWA 2REJA 4GWWA 4ZEKA 1MQIA 1SVXB 4F22A 5CMCA 1B7HA 4EUOA 3G3JA 2FIXA 2HHMA 4PE5B 1A8FA 3EHUA 1ZIUA 2V4CA 1AMFA 4LN5A 3DLNA 5TP9B 1N7WA 1XI6A 1NNFA 3FD3A 5IAIA 3PD9A 1ANFA 1FBPA 2DQVA 4OTEA 1AL3A 2F3BA 3UA8A 1ZTYA 3DP8A 2NVUB 2H9BA 1NI9A 1B3GA 4YU0A 4GWOA 3I3VA 4JB7A 4UABA 2FHYA 2VP1A 2HEUA 3CFZA 4F3BA 5AA4B 4X1DA 1DBZA 5DVFA 1EYKA 2PFZA 3TTRA 2O1LA 3QAXA 4R2BA 1Y3NA 3QMFA 3U94A 3PMVA 4O7IA 3RPLB 1I69A 5CBRA 5LDZA 5B70A 3OMBA 2I48A 1FW0A 4U4XA 4KI0E 4X8RA 1B05A 3MZBA 2NWJA 2Y7KA 4Z0IA 1B52A 5ESYA 2F6PA 2ANJA 2OCUA 2CEYA 3O6IA 4QF9A 1FQBA 4G8HA 3NOHA 4OFLA 4GBWA 3TTKA 2V93A 2DVCA 4M1VA 1G0IA 4X04A 1GR2A 3VXCA 1JW5A 1CE2A 5LTCA 2XD3A 1NNPA 4DXUA 4BDQA 2UVIA 4ZEFA 2UYEA 3MPKA 1B46A 1FBEA 1B58A 4RXLA 3KBRA 4BLAA 3IFAA 2F7BA 1NH7A 4JXIA 1BLFA 3TAJA 3RPWA 3QXMA 3M8UA 4PFYA 1H76A 4JWYA 3BKIB 2X26A 4PCDA 3A3CA 1B3HA 5CI5A 3IL1B 3VVDA 5H8QA 2UYFA 1QW0A 2LAOA 2CZLA 1UTHB 2WEFA 1NNTA 3CG1A 1FPEA 4O94A 2FIEA 3RY3A 5CRYA 1ZU0A 1YPNA 4OANA 3PUVE 4ZS9A 3G3HA 1JEVA 2OK2A 2ZZWA 4PQJA 3SEWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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