3IAZA

Structural basis of the prevention of nsaid-induced damage of the gastrointestinal tract by c-terminal half (c-lobe) of bovine colostrum protein lactoferrin: binding and structural studies of the c-lobe complex with aspirin
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title The structural basis for the prevention of nonsteroidal antiinflammatory drug-induced gastrointestinal tract damage by the C-lobe of bovine colostrum lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2009-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iazA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iazA02
3E3KA 2GH9A 2X7PA 3UN6A 4Z7EA 1ELJA 2HFBA 2Z23A 1SW1A 1JVXA 4R9GA 5H8FA 4LQ5A 5FTIA 1GV8A 1OQGA 3S2VA 1MXXA 5CC2A 4RPNA 3VXBA 1FQCA 2VOZA 3O2AA 2OBGA 2OZZA 2GHAA 2UVGA 1HSEA 1JW1A 1MRPA 1UIVA 1A55A 2DWAA 4JWYA 1LAFE 3VXCA 4ELRA 3MAMA 3RT8A 4NF5A 4U23A 1MPBA 2O51A 1IXIA 4F3BA 3SEUA 1FQFA 3HHGA 4G68A 4F19A 1N76A 4G8MA 4NF8A 1PBPA 3H6TA 4EF2A 1BTJA 3O97A 1B6HA 2F78A 3B6WA 1Y3QA 4DXBA 1FQEA 3RPWA 3FXUA 1FQDA 4RK2A 1XVYA 1VR5A 1ZLQA 1II5A 3TTMA 4F29A 4BDNA 1PB7A 4GRKA 3PPQA 3U93A 1YCJA 3K6UA 3V5AA 5EYFA 2XXUA 3L6HA 3KJTA 4YICA 1O63A 3HO7A 4P11A 3G3JA 4NTLA 1S50A 3TYHA 5TP9A 2Q2AA 4GL8A 4GF8A 3OELA 3QXMA 1LBCA 4H67A 1ZMGA 2H98A 1MM6A 4XKPA 2AYSA 1UTBA 2I49A 4M4GA 4QSDA 3KZGA 1NMUA 2CZLA 4ZZAA 1B3HA 3MVWA 5JK4A 1US5A 1FQBA 2OK2A 4AQ4A 4KR5A 3TTRA 4QHQA 1EZOA 5I2KA 2OJTA 1R9QA 3TCHA 1IXHA 4JXIA 5AE4A 2VHAA 3G3HA 4WKMA 1NFTA 3E9XA 4XIGQ 3DELB 5H8QB 3IO4A 3VLWA 5I57A 3IAZA 3IR1A 4RA1A 4ZEBA 3N26A 3K0VA 2V25A 3JV9A 4PP0A 1SVXB 3T96B 1S7YA 4UACA 3QYTA 5JTYA 3IX1A 3K1NA 4OEVA 4QRZA 5CRYA 2Z8EA 3N5LA 1JNFA 4FEDA 5M2VA 1OVBA 3TKDA 1B1HA 4OZ9A 4JDFA 1ZU0A 3MJNA 1YAEA 2H99A 4GOTA 4EQ9A 4U1OA 3M3KA 4JSOA 4OETA 3TZAA 2H4IA 4N13A 4U4XA 2Q8JA 1FTKA 4R72A 4OTEA 1LBBA 3K6XA 4G8HA 5B7DA 4EXLA 3QK6A 1H76A 1JQFA 3HPIA 5I56A 3D4CA 3A09A 4YZZA 1MG1A 1POY1 2XXQA 1MQDA 1MQHA 4XKNA 1M5DA 1Y1ZA 2Y7WA 2Z8FA 1SI1A 2G29A 1DSNA 4I1DA 1JEVA 3FD3A 1EH3A 2XHDA 5FTHA 2HZLA 3FIRA 3S9LC 1N3WA 3VVEA 3UP9A 4OVJA 4IO5A 1B32A 2PT1A 3RTWB 2QS2A 1B7UA 2ZMBA 4RK9A 3DM0A 2W7YA 1N7XA 3N6UA 4H65A 2H9BA 3ONMA 2DE4A 4IO4A 4FORA 1MPDA 4GLIA 3DP4A 3DP8A 2BJJX 3K00A 2OWSA 5H8HB 4ONYA 2A5TA 2REGA 2O7IA 2DOJA 3IJXB 1QUJA 4GVOA 1B4HA 4R6YA 5CMBA 3V8XB 4OMBA 3U72A 3Q25A 3EHSA 4FECA 1CE2A 1XVXA 3W9VA 2RKMA 3FVGA 1MH3A 1RYXA 5FHMA 4IGRA 4F2QA 5A5XA 1LAGE 1IXCA 3K02A 4DZ1A 4EQBA 5DVJA 4ZEIA 2QMWA 3K6WA 4IB2A 3VDFA 3H03A 2UYFA 3DP6A 3G7WA 4QFNA 4I62A 1O7TA 1SW2A 1DPPA 4OFJA 4DXUA 1Z7ME 1P1UA 4DE8A 1US4A 5IKBA 1Y4CA 4AB5A 4NF6A 3IL1B 3VLVA 2XXTA 4G68C 5I58A 3G3IA 3MC2A 3P7IA 4R6HA 4WEPA 2Q2CA 1BIYA 5I84A 1LFIA 3LSXA 1Y1MA 4R74A 2XXYA 3H6UA 3PUWE 2O68A 1S9TA 4PE5B 3OO6A 2DSFA 4RY1A 4ESXA 2E1SA 4H5GA 4N6PA 2RF1A 3IK6B 4F1UA 4R73A 1ZIUA 4UA8A 3SESA 2HCAA 1B2HA 1LB8A 3PPPA 2OLBA 3CI8A 3H6VA 4RJZA 3KG2A 2NUVA 1WODA 4YMAA 1HSJA 4LP2B 4Q5TA 1T0KA 3DLNA 1I6AA 5AA2B 2I48A 3KN8A 3WAFA 3O6HA 4QFPA 1MXUA 4MF3A 1BP5A 1Y3PA 3O66A 5KCJA 1B5IA 3C4MA 2XXXA 1N7WA 1FTLA 5H8NA 3IJOB 2DXYA 4C1UA 2I58A 2RC7A 3ZKKA 1MDQA 3PU5A 3TTLA 1VFDA 4ZEFA 4EF1A 1MDP1 3GZGA 1MS7A 5I2NA 3O9PA 1B5JA 4RPOA 4F22A 4I9DA 3T9HB 4MLQA 4GIZA 4OHNA 2Q88A 1MPCA 4BLAA 3Q29A 4AB6A 3CG1A 1B3EA 3MQ9A 1BLFA 4GQOA 4KYEA 2ZNSA 1B3GA 4LQ2A 1N3XA 3T66A 4MBPA 1LB9A 4YKKA 3EHTA 5DYHA 4NF4B 3OO7A 4LA9A 2F36A 1VE4A 3T9XB 4IY6A 3O29A 4G4PA 2HXWA 1QUKA 3V89B 4ELOA 1SYIA 2F6PA 1IIWA 4KYDA 2ZNTA 1SDXA 1URDA 3KN7A 1FTOA 4KD5A 5HM4B 3VFJA 3PUXE 2AL5A 3OEKA 3MP1A 2RCBA 1A8EA 3GBBA 4NF5B 4C1TA 3B7DA 4U22A 2DWIA 4WXJA 2YJPA 1D4NA 4NE4A 1OLCA 5CMKA 1NNPA 4XXUA 2FNCA 3WAEA 3MW0A 3KFMA 1OIBA 4ECFA 3TMGA 3W9WA 4IO6A 3ILUB 5JEIA 1NL5A 1GGGA 1N04A 1B4ZA 4P0IA 4YAHX 5EHSA 1JEUA 3MVXA 2RCAA 1B46A 1SBPA 4XTCQ 1P99A 1UQWA 3KBRA 3FUZA 3I5OA 2O84X 3MZ1A 5TP9B 2ONKE 4G8NA 1MXWA 2G93A 1VSOA 3K1PA 3MPKA 4K3FA 1UTHB 1SYHA 4R2FA 5FHOA 4NWDA 1MM7A 3R7XA 3B6TA 3I6VA 3T9UA 3FV1A 5DVIA 1MQJA 2PX1A 4O3AA 2UVIA 2XX9A 4PFYA 1AOVA 5I2KB 1ATGA 4LATA 5LOMA 4EUOA 5AA2D 2I0BA 3EPEA 4OEUA 1AMFA 1N0TA 4KCDA 1MXZA 3LBSA 3O6IA 3PMWA 4F3SA 2F7CA 3LSFB 1QKAA 5BWJA 3MBPA 3FZVA 3CFXA 3OXNA 3K1MA 2V3QA 5H8QA 3CSBA 3AXFA 2F5XA 4YKIA 3HHFA 5DTBA 4KFQA 3F11A 3SEYA 3TTNA 2QS3A 4OWDA 1IUDA 3FJMA 3OO8A 2DXRA 3C35A 5JTYB 1R6ZA 5CMMA 5K2XA 4OYVA 2GFEA 4F1VA 1XC1A 1USYE 2GRVA 3GLBA 3OENA 2O69A 3CFZA 4H5FA 4O3CA 2V84A 3IOVA 2DS9A 3BKIB 2XXIA 5CM6A 3LC8A 3CFLA 2QMXA 3EQ1A 4JWOA 1N84A 5B70A 4F2OA 1P1NA 3KN3A 1P1QA 4QF9A 1NNKA 1M5EA 2UVJA 3TCGA 5ITOA 3PMVA 3B6QA 4ZEKA 3USDA 3U1OA 1MQIA 1LFGA 2HZKA 4LZ8A 3C9HA 4C0RA 4LZ7A 1MY4A 3PMXA 4KI0E 1IZ1A 2ABHA 1PB9A 5I56B 3LSLA 1B3LA 3RY3A 2AL4A 3FXRA 3BBRA 2PBWA 3VVFA 5IAIA 4U2RA 4BDMA 3FVKA 2IEEA 3I3VA 1GR2A 5TPAB 2Y84A 3FJGA 2P1SA 5ICQA 4HTGA 4GFRA 3PPOA 4DXCA 5KZTA 3PGFA 3W15C 3ZSFA 2V3UA 4GL0A 3FASA 3LSWA 5CI5A 4TLMB 4FATA 3KSJA 1HSLA 5L9SA 4MFIA 4F39A 4POXA 1NNFA 2HEUA 4U1ZA 2ZXTA 4JB7A 4OFLA 2QS4A 2RINA 2X7QA 3A3CA 2RC8A 2A5TB 2HAVA 3RNNA 1IQ7A 2XXVA 4M1VA 2ESNA 1O64A 1XS5A 1QULA 2NVUB 5H8HA 4YMBA 3M8UA 4N07A 1YPNA 4F1YA 1OVTA 1LCFA 2OCUA 3ECRA 2VP1A 1PEBA 2ZYKA 4HCWA 1OLAA 4NEDA 3VE1B 3E13X 2YLNA 1ZKBA 1AH5A 2P0SA 2XD3A 2O1MA 4YKPA 2NWJA 5CBRA 4MH5A 3O28A 1A54A 4DDDA 4LONB 3TTKA 2VD2A 3MZ9A 2PYYA 2XXPA 3THIA 3TFLA 4R9FA 4X9TA 1YTVA 4LVQA 4R75A 1IITA 1NNTA 3OEMA 5AA4B 4P0GA 3CIJA 3C31A 4DCXA 1PBQA 3CG3A 2XD2A 5L9MA 3MVZA 2Q9TA 3H6WA 1LAHE 2V3TA 4KYSA 1URSA 1TWYA 4EDPA 4JSDA 3VLUA 3CSGA 3HSTA 5H8SA 3IB1A 1QVSA 1EZPA 4QSEA 3KOSA 1B7HA 1PC3A 3ILTB 3UK4A 2I6EA 2NXOA 4BDOA 2X26A 5F1QA 4FE8A 1SW5A 3S9NC 3Q28A 2FA7A 3HN0A 5KCJB 4Q8RA 3CRBA 1LAXA 4RXLA 1FQAA 5KDTB 1MXYA 2QS1A 4GWOA 3QIMA 1I6QA 5DEXB 1URGA 1AL3A 1OMPA 3H06B 3TQWA 2A5SA 4F3PA 2Z8DA 4QSCA 1NH8A 1H45A 2QJEA 2FYIA 5I2NB 1MY0A 3PD8A 2UVHA 3IOWA 3IO6A 4IO3A 3EF7A 5L8DA 5I59B 1ZBMA 4L17A 2Q89A 4WEDA 3S9MC 4E0WA 3KSXA 4HW8A 3K01A 2PT2A 2QRYA 4F3GA 1FTJA 3BFTA 4GD5A 2ZYMA 2ALUA 2F35A 1UIUA 3QSLA 3L6GA 3N94A 4IGTA 2DYXA 3IOUA 3R26A 3MUQA 4NMYA 2ANJA 4HCYA 1JW5A 5H8FB 2KLFA 5EHMA 4NF4A 3VV5A 1IXGA 1TXFA 1Y20A 3RTFB 3T93B 3C36A 4YB5A 1M5BA 1DTGA 1GTKA 3SETA 3PD9A 3TUSA 2F6GA 5FHNA 2I4BA 1B7ZA 1LLSA 1NKXA 5F7VA 3HV1A 1DPEA 3MWBA 1Q35A 4R6KA 4ZDMA 4G68B 4NF8B 1B40A 1Z7NE 1VFEA 3RQTA 4F18A 2UYEA 3RN8A 3OO9A 4ZE9A 3FATA 1JW4A 3U8QA 1LFHA 3UA8A 3H3GA 4FJPA 3KGCA 4H6DA 1A7LA 3U92A 4TQUQ 1B52A 1D3KA 4FEBA 5CMCA 3S4UA 2XX7A 2VD3A 3JYRA 4PETA 1SQYA 1GVCA 1DMBA 5AA3A 3KEIA 4EXKA 3IB0A 3EHUA 4IO2A 2WKYA 4O3BA 4ISUA 1UTBB 2F97A 2HQ0A 2H25A 1MXVA 4X1BA 3TQLA 4EQ7A 1UTHA 1IEJA 3TCFA 4ESWA 4U21A 1P1OA 1M5FA 3SKPA 1R1NA 3RUMA 4KCCA 4YB7A 2Y7PA 1B1XA 4IO7A 2I4CA 1QUIA 2Y7KA 3PUVE 4XKQA 5I57B 3RGYA 4OQOA 4YU0A 4G2ZA 1MY1A 5HPQA 5J1DA 2THIA 2QL3A 2QPQA 3C33A 4OENA 1WDNA 1NH7A 1QW0A 1XOCA 3R6UA 3KJ7A 4RYAA 1ANFA 2DQVA 1A8FA 4G77A 2F8DA 2NOOA 2I0CA 3HCQA 3U94A 1ZTYA 4MLVA 1FCKA 3E4RA 4U4SA 1EU8A 3UIFA 3PUYE 1J1NA 3Q26A 4ELPA 3SEXA 4KQPA 1Y3NA 3T22A 3G3KA 3JZJA 5AA1A 3BFUA 2VGQA 1MY2A 2B3FA 3K6VA 2F34A 4JWXA 1JETA 4R2BA 1L5TA 4DIGA 1BKAA 4RNSA 4ND9A 1A99A 1I6BA 2AIXA 1B0HA 3TDJA 2LAOA 4NWCA 4Q30B 1SI0A 4OXVA 4X48A 2HAUA 1TFDA 3QUJA 4X1DA 3FVOA 3D4GA 2XXHA 2ZYNA 2D5WA 4ZEDA 3RLFE 3TODA 3LR1A 1MH4A 1RKMA 5DT6A 2IA4A 1H43A 5ELVA 2F7BA 4GXSB 2V93A 4PFTA 3H7MA 4JBZA 3EN3A 1LCTA 1EZ9A 3O6GA 4OFOA 5L9OA 1H44A 1RYOA 1PDAA 2B3BA 1F9BA 5TPAA 4OERA 3TAJA 4ELQA 2DE3A 3FJ7A 3H4ZA 4KHZE 4KPTA 1FTMA 1H3DA 2H5YA 3PUZE 2DVCA 4E0XA 3G3FA 4ZS9A 2PMSA 1B5HA 2O1LA 1D9YA 1B58A 5ITPA 4GXAA 4LZ5A 2OWTA 3SDFA 3TELA 4BDQA 2CMOA 5DVFA 4I8CA 4H8JA 2P2AA 5K2YA 5CBSA 1KWHA 1QJMA 4TOZA 2R6GE 3CVGA 3PV0E 1WVJA 2ONSA 2REJA 3MVYA 5A5XB 1LGBC 3ZS6A 2O6AA 2I3VA 2Y7IA 1LSTA 3OSRA 2ONRA 3C32A 4TLLB 3V83A 3A3UA 4QFOA 5TU0A 1TT1A 2D3IA 3FGSA 4PFWA 5HBCA 1Q1KA 4BDLA 3FVNA 2D21A 3VVDA 2ZNUA 3MPLA 3IB2A 2RC9A 4YKJA 4DLDA 2XX8A 1XHYA 3TPAA 3ODBA 3SEVA 5ISUA 1ZJLA 4NF6B 1SW4A 5I58B 1TFAA 1SD3A 4POWA 4QFKA 2QSXA 2R9JA 3KOTA 3UGWA 5BUUA 3IOTA 3Q27A 1XT8A 2O7UA 4PQJA 4BDRA 2DP8A 4FAJA 3PPNA 4F31B 3K2DA 3LUYA 1USYH 5AA4A 1P1WA 4H0WA 4HS7A 4PFUA 1M5CA 1B9JA 1A40A 5ICTA 3MZBA 3QUFA 4DCYA 2UXAA 1OQHA 3IORA 2ZYOA 2XXRA 1R9LA 4Z0IA 4ZE8A 3GXAA 4QFLA 2DVZA 1D9VA 4THIA 3N6TA 3RT6B 2Z22A 2F7AA 2E0SA 4LUBA 2DE2A 1POTA 3FXQA 3CR9A 5AA2A 3C34A 4H1XA 1B05A 3GBAA 4OESA 5H8NB 2YPNA 2I3WA 4H8IA 2DWHA 3OD7A 3MP6A 1B51A 3M3FA 2R71A 1B3FA 5KDTA 4YB6A 1MY3A 2XXWA 5DEXA 4IY5A 1CB6A 3UORA 1FW0A 3TEPA 3SEWA 2DWJA 2B65A 3T9VA 3FV2A 4ZECA 4XKRA 3OOAA 4FIMA 1PB8A 1Y4TA 1DTZA 2M8CA 3OSQA 3ZKLA 1JVYA 4Q0CA 3K4UA 3M3LA 2PVUA 1Y9UA 5I59A 1DOTA 2GHBA 3QAXA 4ZZEA 1QKBA 1I69A 2Y7RA 3G3GA 3SERA 1MQGA 3MP8A 3OMBA 3PPRA 1B0LA 3S9EA 1AIVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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