3IAZA

Structural basis of the prevention of nsaid-induced damage of the gastrointestinal tract by c-terminal half (c-lobe) of bovine colostrum protein lactoferrin: binding and structural studies of the c-lobe complex with aspirin
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal binding protein
publication title The structural basis for the prevention of nonsteroidal antiinflammatory drug-induced gastrointestinal tract damage by the C-lobe of bovine colostrum lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2009-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iazA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iazA02
1D4NA 2OCUA 4DXBA 4JSDA 4F18A 1MQIA 5AA4A 4WEDA 2OLBA 3FXRA 3RQTA 3PMWA 1P1WA 4NTLA 1MQGA 3M8UA 4HTGA 4LZ8A 1FQDA 2UVIA 3EHUA 2QMXA 4M4GA 2PT1A 5ITOA 1HSEA 5DEXB 3I5OA 5M2VA 3K2DA 3A09A 4FEBA 2O7IA 1GVCA 4KFQA 1N7XA 3U8QA 4LP2B 3G3KA 2Y7RA 1NKXA 3IO6A 3S4UA 4POWA 4U23A 2YLNA 4KHZE 1EZPA 1OLAA 3GBAA 3FVOA 4JDFA 1QVSA 2XXIA 1B2HA 1BTJA 3K00A 1P99A 1OQGA 2NUVA 1T0KA 3O6IA 3G3FA 2Z22A 4H0WA 2PT2A 2NXOA 4H5GA 2Y7KA 3VVDA 3TPAA 3USDA 5I58B 3Q26A 1LLSA 2V84A 2VOZA 3PPNA 3U92A 4ZEIA 3D4GA 2F8DA 5K2YA 3T9XB 1P1QA 2XXHA 3FJMA 1BLFA 1B3GA 3FIRA 3BFTA 3C34A 1R9QA 4ELRA 3JYRA 1N7WA 2LAOA 2D5WA 4PQJA 2CZLA 2VHAA 3IOTA 4JWYA 3WAEA 4PETA 1NMUA 1PEBA 1PDAA 3KN3A 3MVXA 1UIUA 3H6VA 4U1ZA 3SEYA 5L9SA 4X1DA 4P11A 4FAJA 3ECRA 3BKIB 1DPEA 2H98A 4I62A 4P0GA 2FYIA 1QW0A 4HW8A 1ZJLA 2HCAA 1B46A 1N0TA 3MAMA 1II5A 3UN6A 1GV8A 3VLUA 2DYXA 4ZEBA 4OFLA 2ZYNA 3CFXA 1GGGA 4N13A 3Q27A 4DIGA 2GHBA 3VVEA 3FUZA 4BLAA 3RLFE 5A5XA 3PD8A 3ODBA 4BDOA 4QFNA 3FASA 2IEEA 3BBRA 1CE2A 4XIGQ 3IOWA 2O68A 4R6HA 1O64A 3V89B 5KCJB 4OVJA 2A5TA 2UYEA 3QK6A 3G3GA 4RK2A 3KZGA 5EHSA 4Z7EA 1LCTA 3FVNA 1MY2A 1VE4A 1ATGA 4GLIA 3PMXA 3PU5A 1MG1A 1VFDA 3U72A 1QULA 3KSXA 4MH5A 5HPQA 5I56A 4K3FA 4DLDA 2DS9A 1TXFA 4BDQA 4JWXA 3E3KA 2Q89A 2XXXA 1Z7ME 5I2NA 5AA2A 1LFGA 1M5EA 3GBBA 4KCCA 2QL3A 4H8JA 3MJNA 1JEVA 1UTBB 4F2OA 2H5YA 4AB6A 4FORA 4LA9A 4TOZA 2DXYA 3IB1A 3IR1A 4POXA 1I6QA 4U4SA 2DOJA 1QJMA 4F1YA 2P1SA 4YU0A 4R6YA 1SW5A 4LQ2A 1I6AA 3M3KA 3K6WA 2G93A 2I49A 4DE8A 3TTNA 1Q1KA 3N5LA 1M5DA 4OENA 4X9TA 5CMBA 5H8QB 3TELA 3A3UA 4GF8A 3E4RA 4G8NA 2V3TA 3EPEA 4ND9A 1H45A 2A5SA 2O1LA 3KJTA 4XKNA 4Q0CA 3PPOA 1RYOA 3O6HA 1MQHA 2G29A 4ESWA 3SEUA 4QSCA 3S2VA 1B05A 5JTYB 4DXCA 4IO3A 2GHAA 2VP1A 2F34A 3BFUA 2Z23A 1YCJA 4LQ5A 3DP6A 3C9HA 4JBZA 2HFBA 3IO4A 4YKIA 3C35A 3UIFA 2ZXTA 1IZ1A 3PD9A 1S9TA 1B6HA 4NF5B 2BJJX 3TKDA 2XXRA 3HPIA 4R2FA 1DPPA 2REGA 5TPAB 4F1UA 3OO6A 1Q35A 4R75A 3JZJA 4QSEA 1DOTA 1MDQA 1FTLA 5KDTA 4BDRA 5TP9A 3IJXB 3K1MA 4OHNA 4OESA 1H43A 3TCGA 3LSWA 3O29A 4PP0A 5H8NA 1PB8A 3A3CA 2F35A 3VV5A 2H9BA 2X7PA 3OEMA 1NH8A 4H1XA 5H8HB 2RKMA 3OOAA 2YJPA 4ZEDA 1POY1 4MF3A 1A40A 1DSNA 2P2AA 3H6TA 2V3UA 5DVFA 3CFLA 2PMSA 2H99A 2XX8A 1UIVA 3K6XA 3LSXA 5DTBA 1MM6A 1OVTA 4G68B 1Y1ZA 4OMBA 1JW1A 3KN8A 2DWJA 3S9EA 3QSLA 3MP8A 3W15C 1PBQA 2AL5A 3RUMA 2AYSA 4KYDA 4YB5A 4IO2A 5H8FB 1LSTA 1JW5A 3RTWB 3IORA 3LBSA 1I69A 4AB5A 3MQ9A 3ONMA 4NE4A 3T9UA 3LC8A 2B3FA 5B7DA 4R9GA 3R6UA 2E1SA 4FECA 4UA8A 1A8FA 3N6UA 3TQLA 4KD5A 1IXHA 3VDFA 1D3KA 1VR5A 2VD2A 4RA1A 1IIWA 2PYYA 5IAIA 1L5TA 4TLMB 1KWHA 1LBBA 2I3VA 4EXLA 1EZ9A 2ZNSA 3K1NA 2I48A 5FHOA 1FQCA 1B52A 2DWAA 3CIJA 3S9LC 4R74A 4H6DA 2ONRA 4Q5TA 4F3PA 3QAXA 4IO7A 5FTHA 3ILTB 5FHMA 2YPNA 1FCKA 4X1BA 4DZ1A 3N6TA 3RPWA 2PX1A 2AIXA 3QIMA 2I6EA 1B7HA 1ZLQA 3TYHA 4IO6A 5JEIA 3PPQA 2ESNA 4NF6A 4Q30B 2Z8DA 4GWOA 1SYHA 2RC8A 3MZ9A 3TTMA 1FW0A 4C0RA 2F5XA 5EHMA 4NF4A 1MPBA 2V93A 4YKKA 4F3GA 1EU8A 1XVYA 3ZSFA 1VSOA 5HM4B 2O69A 1A8EA 1ZMGA 3B6QA 1MH4A 1XOCA 2XXPA 3OEKA 2VGQA 1IXIA 2E0SA 2FA7A 1MRPA 3O28A 5LOMA 5I59A 1JETA 2XD2A 3SESA 3IB2A 3HHGA 3L6HA 4LZ5A 2THIA 4U1OA 4H8IA 4YB6A 1S7YA 2F7BA 1NNPA 1RKMA 1GTKA 2I4BA 2QMWA 3V5AA 3H6UA 4KPTA 1SYIA 1M5BA 3HO7A 4QFKA 4R73A 2DVZA 5I57A 1UTHA 1XVXA 1FTJA 3PUXE 3KG2A 1OMPA 4PFUA 4BDMA 3E9XA 4NF5A 3C33A 4H65A 3VFJA 3ZS6A 4Q8RA 4GXSB 3OO9A 4MLVA 2H25A 1EH3A 3VXCA 3MUQA 4NF8B 3IK6B 3VXBA 1PBPA 2DWIA 1B5JA 5DVIA 1JW4A 4MLQA 4G8HA 3Q29A 4BDLA 3MZ1A 4F39A 3SDFA 4IGTA 2DWHA 5CMCA 4KCDA 3O97A 2Q8JA 5I2KB 1AOVA 4O3BA 3FGSA 3EHTA 3TODA 1B51A 3DP4A 3FVKA 4R6KA 1HSLA 1IITA 3CSBA 4OETA 4RXLA 3OMBA 2ZYOA 3T96B 1F9BA 3K6UA 3SERA 2B3BA 3O6GA 4XKRA 1AMFA 4F1VA 3N26A 2R6GE 5CM6A 4DCXA 1Y4TA 4ZZEA 3MP6A 2H4IA 2GFEA 2O6AA 1B4HA 3TTRA 4LUBA 3O9PA 1N04A 2D3IA 3PMVA 5AA4B 2ALUA 3PUYE 3CI8A 1ANFA 3T9HB 4IY6A 1Y1MA 3LSFB 4DXUA 3KJ7A 4OFOA 4ZE9A 3M3FA 4P0IA 4C1TA 4JB7A 3VE1B 1SI1A 1JVXA 5DVJA 4F22A 1D9YA 3HV1A 1H76A 4E0XA 3RT8A 1LB9A 3TMGA 3O2AA 3FV2A 2I3WA 3HCQA 4RYAA 3PGFA 3IJOB 3VLWA 3EF7A 4I1DA 4JSOA 3K4UA 4QSDA 2XXVA 4RY1A 2GRVA 3OXNA 1R6ZA 3Q28A 4MBPA 3IAZA 2I0CA 1SD3A 3T22A 1MY3A 2HQ0A 1IUDA 1N84A 3FATA 1AIVA 1B7ZA 5DEXA 2ANJA 1OQHA 3G3JA 5K2XA 5JK4A 1MH3A 4KYEA 2UVGA 3MPKA 1P1NA 4LZ7A 4ZS9A 1SI0A 1D9VA 3LUYA 2IA4A 2D21A 1US5A 4FATA 4THIA 4F3SA 4ZECA 1PB7A 3KGCA 2CMOA 5HBCA 1B4ZA 4KI0E 3ZKKA 2XXQA 3TQWA 1TFDA 3TCHA 3MVWA 1M5CA 2ONSA 3K1PA 3TUSA 2UVJA 3CR9A 5FHNA 1MY4A 1XC1A 1YPNA 4U22A 2HEUA 2R9JA 3IB0A 1VFEA 4OZ9A 1Y9UA 4ECFA 4YMAA 3UA8A 3CRBA 2Q9TA 5CBSA 4ZDMA 3C4MA 1OIBA 4FE8A 1WVJA 2FNCA 3MW0A 3I3VA 4YZZA 5I58A 4R9FA 3F11A 3TDJA 4N6PA 1DTGA 1BP5A 4C1UA 4IO5A 2R71A 3H6WA 3SEXA 4NWDA 1SW4A 3O66A 4OYVA 1JQFA 2ZYKA 4OEUA 3K02A 2I0BA 3OENA 2A5TB 5F1QA 2F6GA 1CB6A 1WDNA 5CI5A 2NOOA 3OO8A 5CRYA 2QSXA 3KEIA 1ZIUA 4H5FA 4EDPA 1NFTA 3RY3A 1Y3NA 3MC2A 2XX7A 3CG1A 2HAVA 3CVGA 4GIZA 2QPQA 3KSJA 2PBWA 2HZLA 2ONKE 4ZEKA 3MWBA 5I56B 3FV1A 1N76A 4R72A 3TAJA 1A7LA 2XD3A 3QYTA 3RT6B 4GRKA 1MXWA 2WKYA 5I2NB 5AA2B 3KN7A 2P0SA 4NMYA 1JNFA 1B40A 1Y3PA 2Z8FA 2OWTA 3S9NC 3OSRA 3FJGA 2RF1A 1MXVA 2ZYMA 3C31A 2Q2AA 4OERA 1SQYA 3DP8A 3U1OA 4G2ZA 2NVUB 5KCJA 2DE3A 3B6TA 3TCFA 5AA3A 2B65A 3U93A 2RCBA 4TQUQ 3Q25A 1IXCA 2QJEA 3DM0A 4QHQA 4FEDA 4RPOA 1GR2A 1PB9A 3MPLA 3T9VA 1H44A 5KZTA 1Y3QA 4YKJA 2HZKA 4LVQA 4ZEFA 1IEJA 2Q88A 1SW1A 4MFIA 5IKBA 3FXQA 3PV0E 1UTBA 2Q2CA 3MVZA 4TLLB 4IB2A 4GVOA 1B5HA 4OQOA 4R2BA 4YICA 5FTIA 5AA2D 1B1HA 3MVYA 3LSLA 3C32A 3R26A 5DYHA 2QS3A 5DT6A 4JWOA 1MXZA 4H67A 1QUIA 1QUKA 4YB7A 4PFWA 3G3HA 1MPCA 5H8QA 3P7IA 2OBGA 4WXJA 4RNSA 5KDTB 1P1OA 1S50A 5TP9B 1QUJA 4G77A 4ISUA 4ELPA 1O63A 4ELQA 5ISUA 5H8NB 3UP9A 1RYXA 3HN0A 1MXXA 1A99A 3VVFA 3RTFB 3THIA 1MQJA 4DCYA 1ZBMA 3N94A 2RCAA 3PUZE 2VD3A 5JTYA 2X7QA 2OWSA 3U94A 4EXKA 1Y4CA 2AL4A 2F6PA 1QKAA 1USYH 3FXUA 4KQPA 1XT8A 4E0WA 4GL8A 3OELA 4BDNA 4RK9A 1ZU0A 2DE2A 3K01A 4YAHX 3B6WA 3SEVA 2RC7A 2QRYA 1B3HA 1A54A 4NEDA 5ITPA 2W7YA 5TPAA 4U21A 2XXUA 3CSGA 4OFJA 4QFLA 3H4ZA 1XS5A 4QF9A 2OZZA 1FTOA 3OO7A 4UACA 1NH7A 1NL5A 3E13X 1LAXA 1TWYA 1N3XA 3IOUA 4F19A 1BIYA 1MXYA 2HXWA 3L6GA 3V83A 1N3WA 3LR1A 1NNFA 1YAEA 2QS2A 3ZKLA 2F7CA 3IX1A 5J1DA 1ELJA 5AA1A 4QFOA 3I6VA 1LBCA 1SVXB 3OD7A 1LAHE 5H8HA 2F7AA 2NWJA 1SBPA 2UVHA 4PFYA 3MP1A 4LATA 1Z7NE 3D4CA 3FZVA 3FJ7A 5CC2A 4PE5B 1R1NA 3WAFA 2Y84A 5L8DA 1POTA 1DMBA 5L9MA 3HHFA 4G68C 1MDP1 3DLNA 4OEVA 1O7TA 1B3LA 4G68A 4KYSA 2ZNTA 1OVBA 3JV9A 3MZBA 1XHYA 1URDA 3PUWE 4G4PA 3S9MC 3UGWA 4XXUA 1FQBA 1B58A 4YKPA 4GL0A 3QUJA 5H8FA 4WKMA 1B5IA 4FIMA 5I84A 1FQAA 1SDXA 4EQBA 3IL1B 1LFHA 4XKPA 1LAFE 3QUFA 3KBRA 4NF6B 1LFIA 1DTZA 3FD3A 3RN8A 3G3IA 1NNTA 4ESXA 5AE4A 4IO4A 2XXTA 5TU0A 3TTLA 2HAUA 4RJZA 4NF4B 2UXAA 2RINA 3W9WA 4GXAA 1IXGA 2Y7PA 3HSTA 1YTVA 4FJPA 3MBPA 4HCWA 4EUOA 3EHSA 4HS7A 1PC3A 3QXMA 4KR5A 1B9JA 4EQ9A 1ZTYA 4AQ4A 1Y20A 2DQVA 1P1UA 4HCYA 1MPDA 3PPPA 4OXVA 4F31B 1B0LA 4JXIA 2F36A 1FTKA 1B1XA 4GQOA 4QFPA 1FTMA 4XKQA 4LONB 3KFMA 1IQ7A 5I59B 4N07A 5BUUA 1HSJA 2Y7WA 5ICQA 1MY1A 4IY5A 5L9OA 1QKBA 3K6VA 3RNNA 5H8SA 1H3DA 4ELOA 4EF1A 1AH5A 3UORA 3B7DA 2X26A 3EN3A 1FQFA 3FVGA 5B70A 1WODA 3EQ1A 4WEPA 5I57B 2DVCA 1B0HA 3H7MA 5F7VA 2REJA 1UTHB 3GZGA 3TTKA 3C36A 3PUVE 3T66A 3DELB 2XX9A 3SETA 4OWDA 1LCFA 3SKPA 1TT1A 3SEWA 2F78A 3TEPA 5EYFA 3W9VA 4F3BA 5CBRA 3OSQA 4XTCQ 3RGYA 3M3LA 1MM7A 1MQDA 3PPRA 4I8CA 4X48A 2Z8EA 2V25A 3T93B 2XXWA 3CG3A 1M5FA 1FQEA 2OK2A 2PVUA 4G8MA 4EQ7A 2XXYA 2V3QA 1NNKA 4O3CA 3AXFA 1B32A 3GLBA 1B3FA 3UK4A 3KOSA 4ONYA 4DDDA 4ZE8A 5A5XB 2O1MA 1MS7A 5BWJA 5ICTA 4U4XA 2I58A 1JEUA 1TFAA 1URGA 1AL3A 4F29A 1MY0A 2OJTA 2DSFA 4F2QA 2I4CA 2KLFA 2O84X 4L17A 1UQWA 2QS1A 1I6BA 4IGRA 2DP8A 2M8CA 3KOTA 3V8XB 4GOTA 2O51A 3IOVA 4NF8A 4YMBA 1OLCA 4EF2A 4ZZAA 1ZKBA 2RC9A 5CMMA 3H03A 3H3GA 1J1NA 4PFTA 1JVYA 1LAGE 3TFLA 3H06B 4Z0IA 2DXRA 4GFRA 4M1VA 4QRZA 4I9DA 4OTEA 2GH9A 5I2KA 4O3AA 3ILUB 3CFZA 3VLVA 4GD5A 1LB8A 4RPNA 3TZAA 2DE4A 3K0VA 1B3EA 2Y7IA 2QS4A 5ELVA 2O7UA 3R7XA 1A55A 4NWCA 1USYE 3G7WA 1LGBC 1US4A 4U2RA 5CMKA 2F97A 1URSA 3GXAA 2ABHA 1R9LA 2ZMBA 1SW2A 2XHDA 2ZNUA 1EZOA 1B7UA 1MXUA 1BKAA 2UYFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D4NA 1NV6A 2OCUA 4DXBA 4OANA 5IZZA 5EQAA 4JSDA 4F18A 1MQIA 5AA4A 4WEDA 2OLBA 3FXRA 3RQTA 3PMWA 1P1WA 4NTLA 1CNQA 1MQGA 3M8UA 4HTGA 4LZ8A 1FQDA 2UVIA 3EHUA 2QMXA 5EQ8A 4M4GA 2PT1A 5ITOA 1HSEA 5DEXB 3I5OA 5M2VA 1FBDA 3K2DA 4HXVA 3A09A 4FEBA 2O7IA 1GVCA 4KFQA 1N7XA 3U8QA 4LP2B 1D9QA 4PE3A 3G3KA 1JP4A 2Y7RA 1NKXA 3B50A 2HHMA 3IO6A 4PGNA 2WEFA 3S4UA 4POWA 4U23A 2YLNA 4KHZE 1EZPA 1OLAA 3RYDA 4GWYA 3GBAA 3FVOA 2FBPA 4JDFA 1QVSA 2XXIA 1B2HA 1BTJA 3K00A 4MX6A 1P99A 1OQGA 2NUVA 1T0KA 3O6IA 2VT5A 1EYKA 3G3FA 2KR0A 1NV5A 2Z22A 4H0WA 2PT2A 2B4LA 2NXOA 4H5GA 2Y7KA 3VVDA 3TPAA 3ISPA 3USDA 2XWKA 5I58B 3Q26A 1LLSA 2V84A 2VOZA 3PPNA 3U92A 4ZEIA 3D4GA 2F8DA 5K2YA 3T9XB 1P1QA 2XXHA 3FJMA 1BLFA 2B4MA 1B3GA 3FIRA 3BFTA 3C34A 1R9QA 4ELRA 3JYRA 1N7WA 2LAOA 2D5WA 4PQJA 2CZLA 2VHAA 1DK4A 3IOTA 4JWYA 1NV7A 3WAEA 4PETA 1NMUA 1PEBA 4MMPA 1PDAA 3KN3A 3MVXA 2V4CA 4NG7A 1UIUA 3H6VA 4U1ZA 1KA1A 3SEYA 5L9SA 1FJ9A 4X1DA 4P11A 2PFYA 1KZ8A 4FAJA 3ECRA 3BKIB 1DPEA 2H98A 4I62A 4P0GA 3HFUA 2FYIA 1QW0A 4HW8A 1ZJLA 4PFIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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