1MXWA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 1 mm brw)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxwA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxwA01
1POY1 1VFDA 2O6AA 4ZEBA 4MFIA 3KG2A 5H8QA 1XOCA 1EZOA 4QFPA 3IO6A 4POWA 4ONYA 3RN8A 3MZ9A 2DSFA 4EQBA 4RPNA 1YPNA 2G29A 2RF1A 1P1OA 1A55A 3FV2A 1P1UA 2Z8EA 1R6ZA 3QUJA 3PMVA 2ONSA 5I2KA 3T96B 2F7AA 4H5GA 1JNFA 3SDFA 1IXCA 3FUZA 4R9GA 5CMMA 1Y3NA 3QYTA 1B3GA 4RNSA 2H98A 3LSLA 1N3WA 3OO7A 1XT8A 2XXWA 3FVGA 1ANFA 1BKAA 4EXKA 2X26A 2RINA 3EQ1A 2PX1A 1SW4A 4H65A 3B6WA 2Y7WA 3S9MC 3TEPA 2PVUA 2ONRA 5KZTA 4DCXA 4EF1A 2XD3A 5AA4A 2YJPA 1UTHA 1XC1A 3PD9A 1Y20A 4IY5A 4P0GA 4G68C 3K0VA 3CFLA 4LATA 3E3KA 1N0TA 5DEXA 3N94A 2PYYA 5H8NB 1SD3A 2DYXA 2ZYKA 3AXFA 5A5XB 4GL0A 1N84A 4ZDMA 3N6TA 4TOZA 2OZZA 4C1UA 4NF5B 4M1VA 4R9FA 1AIVA 1SW2A 5TP9A 4QF9A 4RYAA 3LSFB 3IOVA 1XHYA 3OMBA 4R6KA 2NUVA 5TU0A 1SI0A 5FHMA 3CRBA 1PC3A 4WKMA 4GL8A 1ATGA 5AA2D 1NL5A 4NTLA 3KBRA 4R6YA 4FECA 4QFOA 1SYHA 4PE5B 1YTVA 4OFJA 3OEMA 3O29A 5JTYB 1LSTA 4C0RA 1PBPA 1SI1A 3TCHA 4Q5TA 4KQPA 2RKMA 5L9OA 3N6UA 1EZPA 3VVFA 1OLAA 1BLFA 1EH3A 4DLDA 4ELPA 3TTKA 3JYRA 3EHTA 3C35A 2ZXTA 1OMPA 3U1OA 5H8HA 3KN8A 4G68B 3T9UA 4BDQA 1I6AA 1IXHA 4JDFA 3MBPA 2Y7KA 1NKXA 2VGQA 4LA9A 1MH4A 2M8CA 1B1XA 1A40A 1Y4TA 3OEKA 3VLVA 3K1MA 4RK2A 3T66A 3ZS6A 5EHSA 2F78A 1LFHA 3MZ1A 2DXYA 3P7IA 3IL1B 4FEBA 1MY0A 3TUSA 4PFYA 1B0LA 2VOZA 1JEUA 4U1OA 4IO4A 3CIJA 5L8DA 1H76A 3TPAA 2O7UA 4BDRA 1D9YA 4RY1A 3TODA 2QPQA 2HAUA 4XIGQ 4LQ5A 3OO6A 5K2XA 4N07A 3PU5A 1R1NA 5I58B 4G77A 3IAZA 3G3KA 3PUYE 3ZKKA 1B46A 4MF3A 4X9TA 1MRPA 1MXUA 4EXLA 3O28A 4OHNA 4U2RA 4F29A 3OSQA 2QS4A 1ZIUA 1US4A 4YAHX 4RPOA 5I59B 3PV0E 1TT1A 4F18A 1MQHA 1RYOA 4ZEIA 2XXRA 1D9VA 3A3UA 1B3HA 1M5CA 1LAXA 3O6IA 3T22A 1M5FA 5DYHA 5F7VA 4ND9A 1SDXA 3PMXA 3KJ7A 4F3PA 4F2QA 5JK4A 3T93B 3FVOA 4PFUA 3RT6B 3W9VA 5AA3A 1YAEA 2G93A 3M8UA 5HM4B 4F3GA 3K1NA 1LFGA 1MY4A 2H99A 4H8IA 3TKDA 3HPIA 2DWJA 1FCKA 2XXVA 1LBBA 2DWIA 3VE1B 2Y7IA 4OFLA 4UA8A 1QULA 2O1LA 3PPNA 4JSOA 2H5YA 1VFEA 2XXUA 3VLUA 3FXRA 4GD5A 4ELRA 2I4BA 3RY3A 1MXWA 2HQ0A 1NNPA 2IA4A 1GGGA 2H25A 3HSTA 3K6WA 2I4CA 3S2VA 4DXBA 4O3AA 1XVYA 3SETA 3M3FA 2R6GE 3SEUA 1IEJA 4H8JA 2F8DA 4YB7A 4H0WA 1B0HA 3FJMA 2OBGA 1HSLA 2I3VA 3O2AA 3H4ZA 3A09A 3SERA 3SKPA 3PPOA 1Y4CA 2RCAA 2NWJA 3K1PA 3TTNA 3CVGA 5KCJB 2GFEA 4HTGA 1Y1ZA 2Z8FA 3BBRA 4IO6A 1JW1A 3MP8A 5IAIA 3QIMA 3V8XB 5H8NA 4XXUA 4JWOA 2ABHA 1DOTA 3KJTA 4PETA 3KSXA 4IGTA 4YKPA 3TYHA 1B3FA 5CMKA 3N26A 2OK2A 4NWDA 1Q35A 3KN3A 1NFTA 4IGRA 4NWCA 4ZEDA 1B32A 3O97A 3O66A 1TXFA 2V3UA 3VV5A 1LAHE 1B4ZA 2ANJA 4DDDA 1MDQA 5JEIA 5H8SA 5CMBA 2XXXA 4DZ1A 3TMGA 2QL3A 4N6PA 1LLSA 2UXAA 3QSLA 2A5SA 1JVXA 4F39A 1WODA 3FXQA 4G8HA 2I3WA 1B40A 1FTJA 3TQLA 5K2YA 1JW5A 4ZEFA 4LP2B 3PUVE 3HCQA 2THIA 4YMBA 1O63A 3IORA 4G68A 2F34A 1AL3A 5IKBA 3IB2A 1I6QA 2VP1A 1Y3PA 5FTIA 3G3HA 4GIZA 1P1NA 3ZKLA 2GHAA 3E9XA 3OO8A 1MY3A 2I0CA 4MLVA 3KGCA 4OENA 1I6BA 1MPBA 4OESA 3DELB 3OENA 4O3CA 3S9NC 4WEDA 3I5OA 5FHOA 1J1NA 2QSXA 3H3GA 2F6GA 1M5BA 4WEPA 2XXYA 4X1BA 3Q28A 1FQCA 4OYVA 4Q30B 1R9QA 2OWTA 1ELJA 2FNCA 4LQ2A 4EDPA 2O1MA 1IIWA 5I58A 1Q1KA 4YZZA 1A54A 1GV8A 1LB9A 4FEDA 3T9XB 2VD3A 2ZYOA 4YB5A 3HN0A 1A99A 2O7IA 4BDNA 2AIXA 1MS7A 1PB9A 5I59A 3B7DA 2UYFA 2DOJA 4YB6A 1AMFA 4OETA 2QMXA 5CMCA 2AL5A 4IO3A 3RQTA 4ZE8A 2DQVA 3IB1A 1AH5A 1B7ZA 2DE4A 1RYXA 3C32A 2A5TB 3MAMA 2VHAA 2V3TA 4JXIA 1QJMA 3LUYA 1JW4A 1ZTYA 4K3FA 2ESNA 5M2VA 2UVGA 1O64A 4KHZE 3WAFA 2HEUA 4KCDA 3JZJA 2ZNTA 4C1TA 3HV1A 1UIVA 1B5JA 3K2DA 2PBWA 3TDJA 4I9DA 2HZKA 1LBCA 3MZBA 2QMWA 3IOUA 4QSDA 3TTMA 4ELQA 3Q29A 1UTBB 3FGSA 4IB2A 2Z8DA 3USDA 1FQAA 4KD5A 3C31A 3LR1A 4KYSA 1NNFA 3IO4A 2Z23A 4MH5A 3KOSA 3IX1A 3IB0A 3FXUA 3L6HA 1PBQA 3A3CA 3K02A 2E1SA 3MPLA 2AYSA 2P2AA 4PFWA 5KCJA 4H1XA 4LUBA 3IK6B 3EN3A 3CFXA 2F7BA 3CR9A 3OELA 3UIFA 2F5XA 3M3LA 3RUMA 5AE4A 2X7PA 3H6TA 2E0SA 4GRKA 3SEYA 2I58A 3OXNA 1B58A 4DCYA 2DS9A 3TTRA 3PPQA 3RTFB 4Z0IA 1QKAA 4GOTA 1FQFA 5ITOA 3LSXA 1NMUA 1D3KA 2RC7A 5CBSA 2XHDA 5L9SA 1MPCA 1H45A 2R71A 4Q0CA 1N3XA 4KFQA 3KOTA 3ONMA 3MP1A 3K6XA 4ZZEA 1B7UA 3CI8A 3O9PA 4AB6A 4OQOA 5BUUA 3EHUA 3MPKA 3QXMA 4IO5A 5AA2B 3U93A 3CG3A 1B51A 3S9EA 4NF4B 3K6UA 4ZZAA 3W15C 2ZYNA 2F35A 4LZ7A 1UIUA 4R2FA 3PGFA 5ISUA 2D21A 2F97A 4GXAA 3OSRA 4U23A 3V5AA 4RXLA 1S50A 3WAEA 3UA8A 4R72A 3GZGA 4BLAA 4P11A 4KCCA 1PB7A 2UVJA 3DM0A 5FHNA 1MY2A 3TQWA 3C34A 5AA4B 3R6UA 3TELA 2ZYMA 1LGBC 5I2NB 2KLFA 3TZAA 2DWAA 1ZKBA 2REGA 4KYEA 3KSJA 5DEXB 1FTLA 2I49A 1MY1A 1Y9UA 1PEBA 1QUKA 1B6HA 2UYEA 4OMBA 1URDA 4BDLA 1SVXB 1XVXA 4G2ZA 4WXJA 3S4UA 1B05A 4ESXA 1VSOA 1LCFA 3KFMA 2D3IA 2HCAA 1YCJA 1USYE 3U72A 1BIYA 2FA7A 5ICQA 1B5IA 3V83A 3B6QA 4JBZA 3MQ9A 4JWYA 2OLBA 3CSBA 3MJNA 4F3SA 3BFUA 3HO7A 5DVIA 4YICA 2V84A 5F1QA 2Z22A 4XKQA 4H67A 2BJJX 1S7YA 2PT2A 2Q2CA 4IO7A 3TAJA 5H8FB 2Q89A 4U1ZA 3MC2A 1VR5A 5I84A 3U8QA 4R74A 1IQ7A 3K00A 4P0IA 2HAVA 3PUXE 2V93A 4GQOA 5KDTB 3HHFA 2HXWA 2CMOA 3ZSFA 2ONKE 1F9BA 4L17A 2O68A 2A5TA 1SBPA 3I3VA 3G3JA 5ITPA 5H8HB 4ESWA 5A5XA 3EF7A 1SW5A 3RT8A 1OLCA 1MQGA 4YKKA 3SEXA 4NF5A 3PUZE 1Z7ME 1B1HA 3IR1A 1H43A 4THIA 2R9JA 4XKPA 4NF6B 4H6DA 3V89B 3OOAA 1HSEA 1DTZA 3G3FA 1O7TA 2Y7PA 4U22A 2Y7RA 4JSDA 3G3GA 5JTYA 1BP5A 4OEUA 3MWBA 1M5EA 4H5FA 1UTBA 3IJXB 4OTEA 3D4GA 4Q8RA 1MXVA 1MDP1 4JWXA 4DIGA 4FIMA 4AB5A 2B3FA 4FJPA 5I57B 3UP9A 1FTKA 2YLNA 4TQUQ 5EHMA 1B4HA 1MH3A 4NF8B 3U92A 4DE8A 3IOWA 4U21A 1MM7A 1N7WA 1AOVA 2DE3A 3TFLA 1NNKA 4F1UA 3E4RA 1MXZA 2XX7A 2B65A 3K6VA 1JQFA 5EYFA 1DMBA 1JVYA 2RC9A 4PQJA 4NE4A 3VVEA 1FQEA 1OIBA 1TFAA 1MQDA 2O69A 1MXYA 4EQ9A 4ZS9A 1PDAA 2DP8A 3EHSA 2AL4A 3SEWA 5DTBA 2ZNSA 4FE8A 1FTOA 1HSJA 3QAXA 4LZ5A 1FTMA 2FYIA 5BWJA 4KPTA 3B6TA 4KYDA 2REJA 1OQGA 2P1SA 4YKIA 3PD8A 3Q26A 4OWDA 3JV9A 3SEVA 2OJTA 1FQBA 4M4GA 2LAOA 2X7QA 5AA2A 2XXPA 5ICTA 2GH9A 3KZGA 3UGWA 4IY6A 4NF4A 4I8CA 4FAJA 3TCFA 1LAGE 1SQYA 1XS5A 2QRYA 4QSEA 3ILTB 2DXRA 4X48A 1NH7A 4NMYA 5CM6A 1URGA 4GVOA 2YPNA 1CB6A 2NXOA 5DVFA 4EF2A 3MVXA 3CSGA 4EQ7A 3I6VA 3PMWA 1LB8A 1ZLQA 3HHGA 3FVNA 4R2BA 4GXSB 5CRYA 3VFJA 4DXUA 2W7YA 2DWHA 4POXA 5B7DA 3RTWB 1MQIA 2PMSA 4R75A 5TPAB 5I2NA 3EPEA 2RCBA 1N76A 4F3BA 2GHBA 2P0SA 3GLBA 1US5A 1H44A 2ZMBA 3MP6A 3FIRA 3F11A 3RGYA 1DPPA 3MUQA 1GR2A 5ELVA 4F22A 4OERA 4QSCA 3C36A 4QFNA 2XXTA 2GRVA 1A8EA 2ZNUA 2Q9TA 2I6EA 4HCYA 5CI5A 4UACA 1WDNA 5I56B 3KN7A 1B52A 3O6GA 1DPEA 1P1QA 4KR5A 4RK9A 4IO2A 1CE2A 1QUJA 4I62A 2OCUA 4GF8A 4LONB 2V3QA 4OZ9A 3K4UA 4RA1A 3BFTA 4PFTA 4XKRA 4X1DA 3N5LA 2HZLA 1FW0A 4F19A 2B3BA 5H8FA 2O51A 1II5A 1QVSA 4ECFA 2QJEA 4E0XA 1I69A 2F7CA 5KDTA 3PPPA 1QW0A 2NOOA 1QKBA 1ZMGA 4DXCA 4F2OA 1NNTA 1NH8A 3UN6A 3DP4A 4PP0A 3QUFA 3UORA 1DSNA 1FQDA 3FJ7A 2Q88A 4E0WA 5J1DA 2XXQA 2XXHA 4ISUA 3FD3A 4N13A 1URSA 2XX8A 2Y84A 1S9TA 1BTJA 4YU0A 2ALUA 4NF6A 5H8QB 4XKNA 3D4CA 3RLFE 3LBSA 3U94A 3O6HA 1P1WA 3KEIA 1LCTA 4GWOA 4YKJA 2OWSA 3Q25A 5I2KB 1Y1MA 1B9JA 4G8MA 1MG1A 1SYIA 5I57A 2DE2A 1IZ1A 3T9HB 1ZBMA 1A7LA 5HBCA 2I48A 3M3KA 3H7MA 4NF8A 3S9LC 3MVWA 1USYH 1TFDA 1WVJA 1P99A 2CZLA 3GBAA 3GBBA 2HFBA 4GLIA 1JETA 4G4PA 4FORA 3C9HA 1IXGA 1JEVA 1OVBA 4QHQA 4ELOA 3ODBA 3RNNA 3K01A 4AQ4A 3PUWE 3TTLA 3LC8A 2XD2A 1UTHB 1B3EA 2UVHA 3FVKA 1MM6A 1GVCA 5CC2A 1N7XA 4OVJA 3BKIB 2VD2A 4R73A 1B3LA 3VLWA 3W9WA 4MBPA 1LAFE 1RKMA 3C33A 2F36A 1POTA 4G8NA 4BDMA 3IJOB 3OD7A 4EUOA 5HPQA 2NVUB 3QK6A 1MPDA 4LVQA 4F1VA 4XTCQ 3VXCA 5TP9B 3UK4A 3FASA 3L6GA 2H4IA 2XX9A 1PB8A 2UVIA 2DVCA 1IUDA 3VDFA 5LOMA 4MLQA 4O3BA 1OVTA 4GFRA 3OO9A 2Q8JA 3DLNA 3H6UA 4OXVA 3CG1A 3C4MA 3MW0A 2IEEA 3LSWA 4QRZA 5B70A 4HW8A 4NEDA 4U4XA 3DP8A 1B5HA 1IXIA 2XXIA 4JB7A 1UQWA 3DP6A 4I1DA 2H9BA 3G7WA 2QS3A 4LZ8A 1TWYA 1DTGA 4Z7EA 5TPAA 1N04A 2Q2AA 4RJZA 4BDOA 3RPWA 1B7HA 1ZU0A 1Y3QA 3E13X 4FATA 1VE4A 3H6WA 4TLMB 3T9VA 3FJGA 4TLLB 3CFZA 3R26A 1OQHA 1QUIA 1D4NA 1MQJA 4U4SA 1KWHA 5CBRA 2I0BA 3SESA 1T0KA 2WKYA 3H03A 2RC8A 5DT6A 1H3DA 5I56A 3FV1A 1R9LA 3R7XA 1GTKA 3H06B 1M5DA 1MXXA 4F1YA 3TCGA 1SW1A 4OFOA 4QFLA 5FTHA 1IITA 1B2HA 4OEVA 1LFIA 2QS1A 3FZVA 2D5WA 3VVDA 3GXAA 3FATA 3G3IA 2DVZA 3IOTA 3ILUB 4YMAA 5L9MA 2QS2A 4ZEKA 4ZE9A 3MVZA 2PT1A 3Q27A 4KI0E 3PPRA 4ZECA 5AA1A 3MVYA 3H6VA 1A8FA 2O84X 1L5TA 1Z7NE 1EZ9A 1ZJLA 4R6HA 2F6PA 3VXBA 4HS7A 3THIA 4HCWA 4QFKA 1EU8A 4F31B 2V25A 3ECRA 5DVJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1POY1 5IZ3A 2QFLA 1NV0A 1NV3A 1VFDA 2PFYA 2O6AA 4ZEBA 4MFIA 3KG2A 2V4CA 3ISPA 5H8QA 1XOCA 1EZOA 4QFPA 2WBDA 3IO6A 4POWA 4ONYA 3RN8A 3MZ9A 2DSFA 4EQBA 4RPNA 1YPNA 2G29A 2RF1A 1P1OA 4PAIA 1A55A 4X04A 3FV2A 1P1UA 2Z8EA 1R6ZA 4OVTA 3QUJA 3CHGA 3PMVA 4GWWA 3NOHA 2ONSA 5I2KA 3T96B 2F7AA 4H5GA 1JNFA 3SDFA 2VT5A 1IXCA 3FUZA 4R9GA 5CMMA 1Y3NA 3QYTA 1B3GA 4RNSA 2H98A 4IR8A 3LSLA 1N3WA 3OO7A 1XT8A 2XXWA 3FVGA 1ANFA 1BKAA 4EXKA 2X26A 2XXKA 2RINA 1FTAA 3EQ1A 2PX1A 1SW4A 4H65A 3B6WA 2Y7WA 1YXIA 3S9MC 3TEPA 2PVUA 2ONRA 4O7MA 5KZTA 4DCXA 4EF1A 2XD3A 5AA4A 2YJPA 4MMPA 4HE1A 1UTHA 1XC1A 2KQZA 2ZZWA 3PD9A 1Y20A 4IY5A 4P0GA 4G68C 3K0VA 3MYUA 2FVZA 3CFLA 4LATA 3E3KA 1N0TA 5DEXA 3N94A 2PYYA 5H8NB 1SD3A 2DYXA 2ZYKA 3AXFA 5A5XB 4GL0A 4HXVA 1N84A 4ZDMA 3N6TA 4TOZA 2OZZA 4C1UA 4NF5B 4M1VA 2FHYA 4R9FA 1AIVA 1SW2A 5TP9A 3U65A 2P3NA 4P3LA 4QF9A 4RYAA 3LSFB 3IOVA 1XHYA 3OMBA 4R6KA 2NUVA 5TU0A 1SI0A 5FHMA 3CRBA 1PC3A 4WKMA 4GL8A 3RYDA 1ATGA 5AA2D 1NL5A 4NTLA 3KBRA 4R6YA 4FECA 4QFOA 1SYHA 4PE5B 1YTVA 4OFJA 3OEMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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