1MXWA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 1 mm brw)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxwA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxwA01
4ISUA 4DE8A 3TDJA 4GVOA 3K2DA 2Z8DA 4R2FA 4ZEKA 5KDTB 1QVSA 4O3CA 2FNCA 3U93A 4OFLA 2QS1A 1POTA 4F19A 1B6HA 1R6ZA 1UTBB 3Q29A 3R26A 3IOUA 1JEUA 3GXAA 2DE2A 3PUYE 1MXZA 3JZJA 1QUIA 4MLVA 4PP0A 3B6QA 2M8CA 3KN3A 3MC2A 4TLLB 1Y3PA 4MF3A 1B3FA 1P1UA 2DE3A 5CMMA 4EXKA 2R71A 3C31A 4IY5A 1AIVA 1J1NA 3PV0E 3N94A 3CFXA 2VHAA 1O7TA 2WKYA 4FEBA 4H1XA 1LSTA 1H45A 5B70A 4OZ9A 1FQEA 3EHSA 5AA4B 3VXCA 3TAJA 2XXWA 3VXBA 5CBSA 5ICQA 1B3EA 2XXYA 1LCTA 4G8NA 3RNNA 2HAVA 4P0GA 1N76A 1GGGA 5TPAA 1RKMA 2F97A 5FHMA 3PD9A 3QAXA 3CRBA 2GFEA 3M3FA 4F39A 2QL3A 4X9TA 1P99A 1SI1A 1A99A 3G7WA 1FQDA 3PPPA 4G4PA 1D4NA 2XXRA 1OVBA 5I58B 2V25A 4JDFA 5CMCA 4OWDA 3TPAA 1MXYA 4RJZA 3S9EA 3U1OA 3MBPA 4DCYA 3T93B 3DM0A 3A09A 4EDPA 3IJXB 4U23A 4GRKA 1B3GA 2IEEA 4F2QA 1SQYA 1TXFA 4EQBA 4OERA 1OQGA 4FE8A 3TYHA 5EYFA 4LZ8A 3UK4A 5K2XA 1DPPA 4N6PA 3FVNA 3TTRA 3LSLA 3LBSA 3LUYA 2OZZA 1DPEA 2OJTA 1A40A 4FECA 3M3LA 2NXOA 3KOTA 4IGTA 1FCKA 3T22A 1B0HA 4TLMB 3JV9A 3MPLA 3MQ9A 2OLBA 3MAMA 1ZMGA 4P11A 3EHUA 3PUWE 4EUOA 4EQ9A 1US4A 4GLIA 3TCHA 1HSJA 2FYIA 1FQAA 3W9VA 4PFYA 3QXMA 1I6QA 2ZYKA 1HSEA 1IZ1A 4DIGA 2Q2CA 3RY3A 4YKPA 3PMXA 4GF8A 2RC7A 4H8IA 3H6UA 3MVWA 4F3GA 4RK2A 3RT6B 4O3BA 4HW8A 4KQPA 2AIXA 4ECFA 1MY0A 2A5TB 1Z7NE 4GQOA 4LUBA 1B9JA 5CBRA 1GV8A 3TQWA 1N3XA 1A54A 2QMXA 3H7MA 5HBCA 1MY4A 4MBPA 3OENA 5M2VA 4Q5TA 4NF6A 4NWDA 2HZLA 4TQUQ 3H06B 3BBRA 1MQHA 3SEUA 3D4CA 3CVGA 1R9LA 3FXQA 1XS5A 2QJEA 3PD8A 3VLVA 1PB9A 2XXVA 3FUZA 3DLNA 2I3VA 1MY3A 5CC2A 3OSRA 4G68C 4C1TA 4JWYA 1O64A 3G3KA 1D9YA 4H5FA 4JSOA 5LOMA 1PEBA 3S9LC 5DVFA 2ZYOA 4U22A 1PB7A 2Y84A 1PBPA 3OO6A 3SDFA 3B6TA 3EQ1A 2CMOA 3GBAA 1JW4A 1MQDA 2UVHA 4G68B 4R2BA 3SEYA 1Y20A 5L9MA 1R1NA 1MY2A 1N0TA 1I69A 1UTHB 2D21A 1OMPA 2VD3A 5DVIA 4GOTA 3U8QA 4KYEA 2HCAA 5AA1A 3I3VA 1MG1A 2H25A 3KOSA 2XHDA 1IXGA 2F7BA 3L6HA 2GH9A 1FTLA 1JQFA 1EZOA 3C9HA 3EF7A 3EHTA 4JWOA 3H3GA 2RCBA 1USYE 4IB2A 1Q35A 4F1VA 1LAGE 2RC9A 5JK4A 4X48A 3TCGA 4H5GA 5H8NA 3VVFA 2DSFA 1JW5A 3CFZA 3OO8A 1MPBA 5A5XA 4GL8A 1B0LA 3PUZE 3HHGA 5DEXA 2ZYNA 1XHYA 3KSXA 3FATA 4U1ZA 4XIGQ 3SEVA 4I62A 5H8QB 2PVUA 4Q8RA 3P7IA 4F29A 4JB7A 2VOZA 1EZ9A 3FXUA 3K00A 3Q27A 3OO9A 3RQTA 4AB6A 3LC8A 3C36A 4N13A 5H8HA 4YB7A 3VFJA 3FVKA 3E13X 3T9VA 5KCJB 5CM6A 3PGFA 2XXPA 2HEUA 2XXIA 2Q88A 2DYXA 1A8FA 2I3WA 1ZTYA 3KJTA 3OSQA 4QFNA 4U21A 1MS7A 1NH7A 5FTHA 3PUXE 4FJPA 5L9SA 1L5TA 5I56B 5HM4B 4PFTA 4R9GA 2DVZA 1M5CA 3LSXA 4NF4B 2NWJA 1MXVA 3TTKA 1DTGA 5KCJA 5CMKA 4R72A 1IIWA 4U4SA 1ZIUA 1JVXA 1GVCA 3PPRA 4RXLA 2I0CA 2I0BA 2PMSA 3R7XA 1MM7A 5FHNA 4E0XA 4LQ5A 1Y4TA 1DMBA 1Y4CA 4OMBA 1PDAA 2CZLA 1URSA 2VP1A 3KEIA 1SBPA 3ECRA 3DP6A 3S9MC 2V3UA 4YB5A 2QPQA 3RN8A 5F7VA 3HPIA 2UYEA 3K1MA 3H6WA 3IX1A 5I84A 3E3KA 1DTZA 4EF2A 4H8JA 1B5HA 4P0IA 2ONRA 4QSDA 3IOWA 4ZEFA 2H9BA 1CE2A 5CI5A 2XX9A 4ZZAA 3T9UA 1TFAA 2A5SA 1H44A 1NNFA 2RINA 3K1NA 2KLFA 4RPOA 3IB2A 2ONSA 4Z7EA 1B05A 2ZYMA 3PMWA 3ZS6A 1S7YA 2Q8JA 1FQFA 5JTYA 3IORA 3GBBA 4KFQA 4F3BA 5CRYA 4C0RA 5KDTA 1VSOA 4Z0IA 3CFLA 4IO2A 4QFKA 3V8XB 2UYFA 3HSTA 1QJMA 5H8SA 1UTBA 3TTLA 3FASA 4KPTA 1QULA 1SDXA 3VV5A 4I9DA 3B7DA 1ANFA 3H4ZA 4R73A 3PPOA 4F3SA 1YCJA 1MH4A 3O66A 3TZAA 3G3GA 1B3LA 1OLAA 1SVXB 4K3FA 2Z8EA 3OEKA 2DP8A 1WDNA 3PPQA 5AE4A 2F78A 1P1NA 2Z22A 4GFRA 2B65A 3KZGA 2DWAA 3KG2A 3TEPA 4R74A 4BDNA 2I58A 2OBGA 1BKAA 1B58A 1LBBA 4XKNA 4YKKA 5AA4A 4RA1A 2O68A 2QMWA 1WODA 4R6HA 3MW0A 2O84X 2G93A 4DDDA 3ODBA 2PX1A 3USDA 3TELA 3G3FA 2OCUA 5AA2B 2V93A 2ANJA 3VE1B 2XXTA 2UVJA 3UP9A 3C32A 3FV1A 2B3BA 3ZKKA 4N07A 1SYIA 1FTJA 5I58A 1PB8A 3OXNA 1ZBMA 2Y7RA 2H5YA 1XT8A 3JYRA 1B7ZA 2I49A 1P1WA 4WEDA 1SW4A 1S50A 1LAXA 1Y1MA 2ZMBA 3BKIB 4F22A 4XXUA 2V3QA 2O1LA 5DTBA 2FA7A 2QS3A 4LATA 1MXUA 1IUDA 3OELA 1IEJA 3IR1A 4OFOA 3TMGA 3FZVA 3TUSA 1MQGA 3UIFA 5JEIA 3IB0A 4C1UA 3CSGA 3QUFA 4ZZEA 3EN3A 4PETA 2XXUA 1A55A 1XC1A 2QSXA 3FIRA 2BJJX 3O97A 4FORA 2HAUA 2ZNTA 2HFBA 5TP9B 1FQBA 2GRVA 2H4IA 4M4GA 4HS7A 3ZKLA 4OXVA 1N84A 2ZNSA 3C33A 3K6UA 4BDLA 3CR9A 3G3HA 1JW1A 2Y7WA 4HCYA 4I8CA 4ZECA 3WAEA 2DWIA 4DLDA 4LONB 5HPQA 1PBQA 3FGSA 2F8DA 4LQ2A 2H98A 1M5DA 3FJMA 5DYHA 1H3DA 1LCFA 4RPNA 4HCWA 2XXXA 2A5TA 4ELQA 5I2NB 3PU5A 1I6AA 4NWCA 1Q1KA 3W9WA 1B4ZA 4F1YA 1SI0A 1Z7ME 2P0SA 1S9TA 3IO6A 4WKMA 1LFIA 1B51A 2ONKE 3Q28A 5DVJA 3MJNA 4Q30B 1FTKA 5CMBA 1IXCA 1USYH 1LB9A 4YAHX 3KGCA 1DSNA 3MVYA 3K01A 3U94A 1B5IA 5EHMA 4KHZE 2OK2A 2Y7IA 1B32A 2XD3A 1XOCA 3V89B 3T66A 3HCQA 3HV1A 5FHOA 4GXAA 1KWHA 1EZPA 3O29A 3H6VA 5TU0A 4GD5A 4NTLA 3DP8A 3ILUB 3IO4A 4PFUA 3SERA 4G68A 2RCAA 4PQJA 2NUVA 4XKRA 3VLWA 3KJ7A 5ITOA 2ZXTA 4ZE9A 1ZJLA 1ATGA 3C4MA 4OENA 3TQLA 3IOVA 2F36A 5BWJA 4NF8B 2XD2A 1UTHA 1P1QA 4FIMA 3T9XB 3HHFA 3KSJA 1PC3A 2P1SA 5F1QA 4G77A 2OWTA 3B6WA 3LSFB 2X7PA 4RK9A 1QW0A 2Q89A 3CSBA 3RGYA 4FATA 3QIMA 3E9XA 3OEMA 2R9JA 4OEVA 2E0SA 3T96B 5ELVA 1ZU0A 4LA9A 3C35A 2XX7A 1Y3NA 3VDFA 1SD3A 4PE5B 3K6WA 4UACA 3S2VA 4THIA 3MZ9A 4NF8A 1OQHA 2O69A 4QF9A 3KBRA 1N04A 2DE4A 3CIJA 4QFPA 2PBWA 5H8QA 3OD7A 4R75A 1BLFA 3WAFA 4ONYA 3T9HB 2I4BA 3CG1A 4MH5A 3RPWA 1AMFA 2UXAA 4XKQA 4BDOA 4Q0CA 1A7LA 2HZKA 3MPKA 1B2HA 1IITA 4WXJA 1FTOA 4R9FA 4NE4A 4BDRA 4AQ4A 1NKXA 1MPCA 4OHNA 3SETA 1EH3A 4G8HA 2DXYA 1BTJA 3UGWA 2I4CA 4OEUA 3ZSFA 1NFTA 3OOAA 1LB8A 4U1OA 4ELPA 3QYTA 2Z8FA 4ELOA 3FVGA 5I56A 3PUVE 2QS4A 4KYDA 4X1DA 2F7AA 4NF4A 1MDP1 1OVTA 3VVEA 3FV2A 5DT6A 1MY1A 4X1BA 3QUJA 3AXFA 2QS2A 3O9PA 1Y3QA 3A3UA 4I1DA 4KCDA 3KFMA 4DZ1A 4YICA 3SEXA 5TPAB 2THIA 3Q25A 3IL1B 1B4HA 3Q26A 3LR1A 2X26A 2XXHA 1SW1A 1US5A 4OESA 4IGRA 1F9BA 2IA4A 1GR2A 1TWYA 2ZNUA 2O7IA 4F1UA 2Y7PA 3RUMA 1M5FA 2DXRA 2GHBA 4F3PA 1D9VA 1MQIA 3MVZA 3FXRA 4WEPA 4EXLA 1VFDA 2P2AA 4MLQA 2DOJA 5J1DA 2DQVA 3O28A 4XKPA 4OTEA 5IAIA 2NOOA 4U4XA 2REGA 4QFLA 1N7WA 4RYAA 1B7UA 1LBCA 2YLNA 3CG3A 3TCFA 3GZGA 1HSLA 3DP4A 1SYHA 3I5OA 1NH8A 1YPNA 4ZS9A 1WVJA 3DELB 3RLFE 1NL5A 1MRPA 4PFWA 1CB6A 2NVUB 1AL3A 3GLBA 3IOTA 3A3CA 4L17A 1N3WA 4LZ7A 3SEWA 1N7XA 4FAJA 2D5WA 4H6DA 5L9OA 2D3IA 4IO3A 2O7UA 5I59B 4LZ5A 1P1OA 4ZEIA 4YKJA 1R9QA 3K4UA 3UA8A 1YAEA 4YU0A 1MH3A 2F5XA 4NF5B 1MXXA 5AA2A 3SESA 3EPEA 4JWXA 3RTFB 4POXA 4GIZA 4KI0E 4R6KA 3TFLA 3R6UA 1UIVA 3C34A 1JVYA 2H99A 1H43A 4KYSA 3SKPA 5AA3A 4NF6B 1IXHA 4QHQA 4IO4A 3IK6B 5I2KB 4F31B 3TTNA 4YB6A 4OVJA 1QKAA 3UORA 3MP6A 1EU8A 1IQ7A 4KD5A 5ICTA 1POY1 4KCCA 3BFUA 1LGBC 1URGA 4H67A 5I59A 1DOTA 4XTCQ 3TKDA 3W15C 4AB5A 3OMBA 3O6HA 4JXIA 3VVDA 3LSWA 1T0KA 1XVXA 1JETA 3S4UA 4NF5A 3RT8A 1SW5A 4R6YA 2UVIA 1QUKA 4M1VA 1OLCA 2Y7KA 3G3JA 4ND9A 3K0VA 3BFTA 3G3IA 3IB1A 2F34A 3FD3A 4G8MA 3ILTB 4ZEDA 1LAHE 4MFIA 3OO7A 4LVQA 5I2KA 4HTGA 4IO7A 4JSDA 3MZ1A 1LLSA 4ESXA 5EHSA 3MUQA 5TP9A 4YMBA 1NNKA 4QSEA 2O1MA 2V3TA 3S9NC 1TFDA 2PYYA 5I57B 1B1HA 2R6GE 1LFHA 3MZBA 4GL0A 2HQ0A 3N5LA 5L8DA 1B7HA 1AOVA 3V83A 1BP5A 2VD2A 2F35A 1LFGA 1Y1ZA 1NNPA 1B1XA 4H0WA 4JBZA 4NMYA 1A8EA 3M3KA 4G2ZA 3F11A 1UQWA 3MP1A 2Z23A 1VFEA 1B3HA 3MWBA 5H8NB 1B5JA 1UIUA 2I6EA 2REJA 5A5XB 1ZKBA 2HXWA 3TODA 4OQOA 3PMVA 5I2NA 1RYXA 3M8UA 5DEXB 4DXBA 3MP8A 3K6VA 1AH5A 2UVGA 3RTWB 4QSCA 5AA2D 2I48A 4OFJA 1GTKA 5I57A 2VGQA 2ESNA 4TOZA 3QK6A 4YMAA 4O3AA 1I6BA 3THIA 2OWSA 1M5BA 2LAOA 2DWHA 2O6AA 5H8HB 3UN6A 2XX8A 2DVCA 1YTVA 4QFOA 3FJGA 4YZZA 4BDMA 4UA8A 3L6GA 4U2RA 1M5EA 1JNFA 4IO5A 1MQJA 1JEVA 3K1PA 1FTMA 4BLAA 3I6VA 1MDQA 4BDQA 1MPDA 1D3KA 2F6GA 5KZTA 2PT1A 2RKMA 2G29A 4GWOA 3TTMA 2DS9A 1URDA 2AL4A 4KR5A 1OIBA 1FQCA 5BUUA 3N26A 2YPNA 1ELJA 5H8FB 1NMUA 3KN8A 3O6GA 4NEDA 3FVOA 4RY1A 3MVXA 4DXUA 4YKIA 4OETA 4RNSA 1VR5A 4E0WA 3IAZA 4IO6A 4EQ7A 1Y9UA 3U72A 1MXWA 5IKBA 3VLUA 1TT1A 1RYOA 1O63A 1II5A 3U92A 4ELRA 3H03A 1MM6A 1NNTA 1XVYA 2AL5A 2Q9TA 3CI8A 2DWJA 2RC8A 1B40A 1QKBA 2GHAA 3O6IA 3O2AA 4F2OA 2X7QA 1BIYA 3IJOB 5H8FA 1IXIA 1SW2A 5ITPA 4LP2B 4ZEBA 4F18A 2V84A 3HO7A 2XXQA 3H6TA 1B52A 4GXSB 3D4GA 2E1SA 2F7CA 3K6XA 2B3FA 3V5AA 4ZE8A 5B7DA 1LAFE 2PT2A 2ABHA 3ONMA 2W7YA 2AYSA 1VE4A 2RF1A 3N6UA 4DCXA 5ISUA 2F6PA 1B46A 4OYVA 4ESWA 1H76A 3N6TA 4IY6A 2O51A 2YJPA 3FJ7A 3QSLA 5K2YA 1FW0A 1ZLQA 4QRZA 4H65A 5FTIA 1QUJA 3HN0A 4POWA 2ALUA 2QRYA 3K02A 2Q2AA 5JTYB 3PPNA 3E4RA 3KN7A 4FEDA 4DXCA 4EF1A 4ZDMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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