5I59B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx 007
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
279
structure length
275
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 275
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59B02
3FV1A 2OK2A 3SEYA 1MQJA 1IITA 1IQ7A 4DXUA 3G7WA 3FGSA 4NF4A 5CBSA 1MS7A 3IR1A 1D9YA 4IB2A 4BDLA 2F5XA 1J1NA 5H8NB 4NF4B 3IB0A 3TEPA 2QMWA 2O51A 1NFTA 1Z7ME 1A7LA 1H3DA 4RK2A 3CI8A 2V93A 2V84A 1RYXA 1N0TA 1MXVA 1B52A 4TLMB 4G68A 5F7VA 4BDRA 2Y7KA 2ESNA 3O9PA 4F22A 5EHMA 1A8EA 4EQ7A 4UACA 1ZU0A 3TYHA 2ALUA 3MWBA 1WDNA 5AA4A 1HSJA 4GF8A 1FTKA 3VXBA 3OO7A 5ELVA 2XXRA 2O84X 1BIYA 3RUMA 4HCWA 1LCFA 5AA4B 1O63A 2IEEA 1UQWA 4ZZAA 3QYTA 2XHDA 5LOMA 4GQOA 3RQTA 1Y3NA 2ZNSA 4ELQA 3BFUA 1OMPA 1FQFA 1EZPA 2ZNTA 4QSCA 2XXYA 2I0BA 4XXUA 2FYIA 5FHOA 3C35A 1VFEA 5CMBA 1R9LA 3PV0E 3Q25A 3UIFA 3FUZA 1VFDA 3IORA 3ZS6A 1O7TA 1AOVA 4U22A 3TQWA 3KEIA 2VHAA 4U1OA 4F29A 4LZ5A 1N76A 2R9JA 4KI0E 4KCDA 1O64A 4NF8B 4MLVA 2PT1A 5FHMA 4OFJA 1MY0A 4I1DA 3MJNA 3W15C 5K2XA 4LVQA 3W9WA 3MVWA 4PFUA 3MVXA 3O97A 3N94A 2A5TA 4DXBA 2PX1A 1MH4A 1QJMA 5TU0A 1M5FA 2ABHA 1LAHE 1B0LA 4R2BA 2AL4A 1MM6A 5DT6A 5IKBA 2H99A 3PPOA 1GR2A 3CSGA 4NWCA 3S9EA 5KDTB 2XXUA 3LSFB 1BLFA 2GHAA 3O29A 1XT8A 1DTGA 4N13A 1DSNA 1B9JA 3H4ZA 3BFTA 1N3WA 1B3LA 1Y4TA 4GWOA 2QS3A 3H7MA 3IOUA 2DVZA 3LC8A 3IX1A 1EZOA 1M5CA 4R72A 3IJOB 4NF5B 3IK6B 3O6GA 4NWDA 3EHUA 1NH8A 3ILTB 2B65A 3K6UA 1NKXA 1LSTA 3TQLA 4IO4A 5AA2D 4EXKA 2I4CA 1A8FA 3OSQA 3D4GA 1HSLA 2UVHA 3USDA 1JETA 1L5TA 3VXCA 3R26A 1WODA 1Y9UA 1B5HA 3THIA 3DELB 2F7CA 4HS7A 5ITOA 2GH9A 2D21A 1MQHA 3QSLA 4QFPA 4C1UA 4YKKA 5TP9A 3DLNA 1NNPA 4OENA 4U4SA 4YKIA 2NOOA 1I6BA 1H44A 5TP9B 4X1DA 1MQGA 1MH3A 4HW8A 2QMXA 1LAFE 4IO3A 3HSTA 3U92A 3MZ9A 4QFKA 4JDFA 3B6TA 2AL5A 5L9OA 4R75A 4ZEIA 3FZVA 4AQ4A 4ESXA 1B46A 4LQ5A 3Q27A 2I3VA 4ZEDA 1B4HA 2OZZA 5CC2A 5I2KA 4F3BA 1UTBB 2XXTA 1A99A 3K1MA 4IGRA 3PU5A 5HPQA 2H9BA 3FXRA 3D4CA 2I3WA 5I2KB 2ZNUA 4YZZA 1B3HA 5AA3A 3GXAA 1A54A 5TPAA 4G4PA 1B4ZA 5ITPA 2Q88A 4DLDA 2HZLA 3U72A 4JWOA 2QSXA 4EUOA 1FW0A 2RC8A 4KCCA 4P0IA 4GLIA 3K00A 4IO5A 3KGCA 5TPAB 5H8FB 5B7DA 4XKPA 1JQFA 1H76A 2OWSA 1N7WA 1IXGA 3OO8A 3K01A 3H6VA 3TTKA 5H8QA 3H3GA 1DOTA 3PUWE 1ELJA 2GFEA 4ISUA 4O3AA 2F78A 3OO6A 4ZE8A 3V89B 1LFGA 4ELPA 4F39A 1RYOA 4PP0A 4PQJA 4OWDA 1MRPA 4TLLB 5I2NA 1EH3A 4THIA 4XTCQ 3IAZA 1I69A 4R73A 1N84A 1HSEA 5I2NB 2XXIA 4HTGA 2ZYNA 4F1VA 3FD3A 3V8XB 3KOSA 3G3GA 1XHYA 4FORA 2G93A 2ZXTA 5DVJA 4LONB 4U23A 3VE1B 1P1WA 3RTFB 1QUKA 2F8DA 4NE4A 2W7YA 2QJEA 1A40A 1B7ZA 4X48A 2ONKE 4P0GA 5CRYA 2VD3A 1S7YA 1IUDA 1YAEA 4F19A 5ICQA 4F1YA 2AYSA 2RC7A 5BUUA 2OBGA 3HN0A 3MP1A 1II5A 5B70A 4EDPA 1PBPA 3RPWA 5I59A 1US4A 1H45A 3UK4A 3G3IA 3UA8A 3TTRA 4OTEA 5AA2A 3RGYA 2THIA 3UP9A 1SDXA 5I59B 2XD2A 3JYRA 4F31B 2Y7RA 4R9GA 3P7IA 1A55A 3K1NA 4MFIA 1PDAA 5DVIA 2QS4A 2OLBA 4JWYA 1TXFA 4KYSA 4R9FA 5DEXA 3SKPA 2RINA 1URSA 2H25A 4C1TA 1N04A 2DS9A 5DTBA 2H98A 3EQ1A 5DEXB 4F1UA 1SYHA 4FEBA 1MXXA 1DTZA 3LSLA 4NTLA 1B51A 3TAJA 5H8NA 1JW5A 4QFLA 3T9UA 1QW0A 2X7PA 4DDDA 4PFTA 2UVJA 4QSDA 1B05A 3OSRA 3GZGA 3CFXA 3S2VA 2BJJX 3ONMA 1MXWA 4ZEFA 1LLSA 3MPLA 4FECA 3KFMA 3RNNA 3FVOA 4X9TA 1FQBA 4ZS9A 4Q30B 5KZTA 2V25A 5L8DA 1OLCA 3EHTA 2Z8FA 3TODA 4U2RA 1B7HA 1OVTA 3C34A 1PB8A 3K6XA 5A5XB 2B3BA 4QFOA 3FVGA 4EF1A 2F7AA 4H8JA 2HFBA 2RF1A 1UTHB 3FJMA 3JV9A 5FTHA 1OVBA 3O2AA 4NMYA 1USYE 2Z8DA 2DE4A 4I9DA 2NVUB 3TMGA 3CG3A 4F2QA 3S9NC 1NMUA 5M2VA 3KZGA 4G8MA 1QKAA 1B1HA 3ECRA 4F3PA 3BKIB 4Z7EA 4LA9A 1ZLQA 1JW1A 1MY1A 2UVIA 4MBPA 2HQ0A 1P1NA 2RCAA 1VE4A 3VVFA 3FV2A 3KBRA 1FQCA 1DPEA 4I62A 3IB2A 1FQDA 1PB7A 4LZ7A 3M3KA 4DCYA 3U8QA 4R6HA 2REJA 5H8HB 5I84A 2F34A 3OD7A 1SD3A 3TTLA 4FE8A 5I56B 4BDOA 3TDJA 4EXLA 3FVKA 1LAXA 3A3CA 3PMVA 5JK4A 3RT6B 4Q0CA 3B6QA 2UYFA 4EF2A 2V3QA 3PPQA 4NF8A 1LB8A 3KN3A 5L9SA 3H06B 2XX7A 4H0WA 4KD5A 4ECFA 4QF9A 3OENA 1EZ9A 3L6GA 3OOAA 4KFQA 1I6QA 1D9VA 3TCHA 2Z8EA 1PB9A 3TUSA 1JEVA 4BDMA 3I3VA 4GXAA 3MP8A 3WAFA 5KDTA 4MH5A 1QKBA 2OCUA 3RT8A 3G3JA 5CMMA 2YPNA 3KSXA 4OEVA 1B32A 2XXPA 2DP8A 2P2AA 3ILUB 3Q28A 5HBCA 3IOVA 4G8NA 4YAHX 4QHQA 5ISUA 2F6PA 1MM7A 1MDQA 1OQHA 1QVSA 1B6HA 4Q5TA 3G3KA 3UORA 1FTMA 3LR1A 1D4NA 4IO2A 4OXVA 4NF5A 2ZYKA 4ELRA 3RTWB 4MLQA 1QUIA 3LSWA 4IY5A 3K2DA 4H67A 1DMBA 4JWXA 1XVYA 3IJXB 4IGTA 4G68C 2O7IA 2Q2AA 1IXCA 3O28A 5AE4A 1MXYA 4GL8A 1Y4CA 3QK6A 4KYDA 4KPTA 2O1LA 3I5OA 2Q9TA 1SI1A 3PMXA 1B7UA 3H6WA 3BBRA 1WVJA 4JBZA 1SW2A 5F1QA 3VVEA 2VGQA 4GOTA 2DOJA 3PPPA 3FIRA 3FJGA 2E1SA 4H65A 2DXRA 1JVYA 2DQVA 4TOZA 2I49A 1P1QA 2ANJA 3KG2A 1GVCA 3LSXA 1S50A 3HPIA 3QXMA 2DWIA 1S9TA 3O6IA 4L17A 3PUXE 3QUFA 4GL0A 4R74A 2M8CA 1MXUA 1SW1A 1MDP1 4H6DA 2QL3A 3VDFA 3MP6A 4OESA 4NEDA 3TTMA 4OZ9A 2XX8A 2RC9A 1NNKA 3K0VA 1UTBA 4WXJA 3IB1A 1R6ZA 2NUVA 2RCBA 3CRBA 5CMKA 3TELA 1B2HA 4O3CA 3IOWA 4GFRA 4POWA 3ZKKA 3C4MA 3HO7A 4FIMA 1UIUA 4C0RA 4DIGA 1ATGA 3S4UA 3FATA 1ZJLA 3TTNA 4E0WA 3KOTA 5H8FA 3K6WA 2XXHA 2GHBA 2IA4A 1AIVA 5JEIA 3M3FA 3DM0A 3E3KA 4UA8A 2I0CA 1GTKA 4F3SA 4Z0IA 3QIMA 4YU0A 3V83A 3EF7A 2E0SA 4YB5A 5EHSA 3ZSFA 3LBSA 5I57A 2DXYA 3LUYA 1RKMA 3C36A 4ZECA 4YICA 3T9VA 1LAGE 4U4XA 5I57B 5J1DA 5CM6A 3OMBA 3GBBA 4RPOA 2QPQA 4ESWA 2VD2A 1B3GA 1Y20A 3HHGA 4R2FA 1PBQA 2Q8JA 4R6YA 1POY1 4ZEKA 2QS1A 1Y1MA 4LATA 4RXLA 5DYHA 3C33A 4N6PA 3Q26A 1OLAA 1SI0A 1TT1A 1FTJA 4NF6A 4QSEA 1TFDA 4XKQA 4FAJA 5IAIA 4NF6B 4YB6A 3VV5A 2F35A 2DSFA 2Q89A 1MPCA 4DXCA 2NWJA 1Q35A 3T66A 2V3TA 3TPAA 2WKYA 1IIWA 3H03A 3W9VA 2KLFA 3U1OA 1QUJA 3U93A 4QFNA 1OIBA 4JXIA 2O68A 3MVYA 1IXHA 1B0HA 1I6AA 1FCKA 3C31A 3IO4A 1YTVA 1AL3A 3SESA 3F11A 2Z23A 1LFIA 1JVXA 3PGFA 5AA1A 4JSDA 3TKDA 4XIGQ 2ONSA 4ZEBA 3QUJA 1CE2A 2RKMA 2XX9A 2PBWA 4DE8A 4LP2B 4DZ1A 5JTYB 2ZMBA 3FXQA 2FNCA 1URDA 3QAXA 3PD9A 4U1ZA 4H5FA 3TZAA 3VLVA 4JB7A 3MZ1A 3MBPA 5A5XA 1LFHA 3PUYE 4N07A 5DVFA 3PMWA 4ONYA 3EHSA 3CG1A 1UTHA 1XOCA 4OETA 1BP5A 2CZLA 3PPNA 3TCFA 1MQDA 4ELOA 2DE3A 1R1NA 2DE2A 4X1BA 1LBCA 2F97A 4I8CA 3T22A 4H1XA 4OERA 3FJ7A 4G2ZA 2XXQA 2PVUA 1VR5A 4F2OA 2VOZA 3MAMA 2I6EA 2UYEA 3SDFA 1P1UA 2AIXA 3CFZA 1YPNA 1EU8A 1BTJA 2PT2A 4G68B 3G3HA 2HAUA 5FHNA 5H8HA 1B5IA 2F36A 4U21A 3OEKA 3L6HA 1KWHA 4FATA 3HHFA 5I56A 2ONRA 3K4UA 1NNFA 2O69A 3AXFA 3PUVE 4AB6A 3IO6A 3OELA 2REGA 2Y84A 3ZKLA 2X7QA 4GVOA 4ZDMA 2HEUA 3CFLA 1BKAA 3V5AA 2HCAA 3M3LA 1ZTYA 3PD8A 1JNFA 4IO6A 3T96B 1B3FA 2D3IA 2R71A 3S9LC 4OFLA 4K3FA 1MXZA 3VFJA 3MUQA 1B58A 2X26A 1CB6A 3I6VA 2XXXA 3HCQA 1GV8A 1P99A 4YKJA 2V3UA 1OQGA 3PUZE 4GD5A 4HCYA 3S9MC 1MPBA 1DPPA 4ZZEA 3VVDA 3FASA 1JW4A 3PPRA 2DWHA 2OWTA 2D5WA 3M8UA 1ZMGA 4YKPA 2A5TB 3C32A 2F7BA 2Q2CA 2PYYA 2XXWA 2XXVA 5H8SA 3IOTA 4FJPA 1Q1KA 2Y7WA 1B40A 1B1XA 1AH5A 2F6GA 4BDQA 4BDNA 4O3BA 4RJZA 1VSOA 3OXNA 2Y7IA 4POXA 1B5JA 4LUBA 1XVXA 3SEVA 2NXOA 1YCJA 4OHNA 2UXAA 5CMCA 2Y7PA 1MY3A 2YJPA 4QRZA 1NL5A 4PETA 3SEXA 3T9HB 1R9QA 3R7XA 1MY4A 1M5EA 3KN7A 4RY1A 3E13X 3GBAA 1FTOA 3O66A 5KCJA 1SW4A 2O7UA 2XD3A 4WKMA 3Q29A 1H43A 3WAEA 1MPDA 4E0XA 3CVGA 5KCJB 3C9HA 5I58A 1ZBMA 4PFWA 2QRYA 3K02A 3OO9A 3OEMA 1F9BA 2HXWA 3TCGA 4WEDA 1LCTA 1MY2A 5I58B 4KYEA 4OQOA 3HV1A 1ZIUA 2I58A 4F18A 1T0KA 5BWJA 4PFYA 3EPEA 4RA1A 1UIVA 3KJ7A 1URGA 3SEUA 1Z7NE 1SBPA 1P1OA 3MVZA 3UN6A 1N7XA 3KSJA 3CSBA 1IEJA 1JEUA 1TFAA 4OVJA 2LAOA 2G29A 2VP1A 3MZBA 4OEUA 3U94A 1IZ1A 1N3XA 3VLUA 4OFOA 2HZKA 2UVGA 1XS5A 1NH7A 1GGGA 4LQ2A 3K6VA 4BLAA 4RK9A 2H4IA 4IO7A 4XKNA 4RYAA 4JSOA 1Y1ZA 1B3EA 4H5GA 1M5DA 1Y3PA 4AB5A 4KR5A 3N5LA 2DYXA 1Y3QA 1LGBC 2GRVA 3RY3A 4ND9A 3IL1B 1PEBA 1POTA 1US5A 4Q8RA 3DP6A 3SERA 1ANFA 4IY6A 4MF3A 3E4RA 3KJTA 4G77A 1IXIA 2DVCA 3H6UA 1MQIA 2A5SA 2I4BA 4RNSA 5EYFA 3SEWA 4GRKA 3R6UA 3G3FA 2R6GE 1PC3A 4F3GA 3ODBA 2P1SA 3A3UA 4H8IA 3T9XB 3O6HA 4ZE9A 4GIZA 5L9MA 1XC1A 3EN3A 3N6TA 3CR9A 1AMFA 2ZYMA 1ZKBA 3E9XA 4GXSB 2ZYOA 5H8QB 3B6WA 5ICTA 1LBBA 1SYIA 3T93B 2I48A 3CIJA 4XKRA 1SQYA 2O6AA 1TWYA 1D3KA 4OMBA 4WEPA 1FTLA 2DWAA 3RLFE 3UGWA 1MG1A 2P0SA 4M4GA 4PE5B 3N6UA 1FQEA 3SETA 4P11A 1SW5A 3MPKA 1USYH 3DP4A 4RPNA 4YMBA 1LB9A 2H5YA 2O1MA 4DCXA 3FVNA 3MQ9A 3VLWA 2PMSA 5K2YA 3RN8A 4EQBA 4TQUQ 1FQAA 5FTIA 2FA7A 3N26A 3H6TA 3FXUA 2Z22A 3MC2A 3K1PA 5CBRA 3JZJA 3TFLA 3GLBA 3KN8A 3DP8A 3B7DA 4YMAA 4R6KA 4KHZE 5CI5A 5AA2B 4YB7A 4KQPA 4M1VA 2YLNA 3MW0A 2CMOA 4EQ9A 3A09A 2OJTA 4G8HA 1QULA 4LZ8A 5JTYA 2DWJA 1NNTA 2HAVA 2B3FA 2QS2A 5HM4B 1M5BA 4OYVA 1SVXB 4FEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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