4NWCA

Crystal structure of the gluk3 ligand-binding domain (s1s2) in complex with the agonist (2s,4r)-4-(3-methoxy-3-oxopropyl)glutamic acid at 2.01 a resolution.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
TNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Recognition of Two 2,4-syn-Functionalized (S)-Glutamate Analogues by the Kainate Receptor GluK3 Ligand Binding Domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 3
molecule tags Membrane protein, receptor/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nwcA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nwcA02
4ZEDA 2WKYA 3FV1A 3IAZA 3MJNA 3U93A 2QPQA 4C1UA 4XKNA 3GBAA 4GIZA 5HBCA 3MQ9A 5IAIA 2A5TB 1TXFA 1ZKBA 4KYEA 5AA2B 3CR9A 4BLAA 2F35A 3TTKA 2DXRA 5I84A 1IUDA 1BKAA 1N7XA 5H8FB 3FVNA 4K3FA 1AIVA 1A99A 2XXXA 1AL3A 1P1NA 3MVZA 3KOTA 1UIVA 5ISUA 3H6TA 2NXOA 4OVJA 3A3CA 3S4UA 3D4CA 3T66A 3VLVA 3CRBA 4ZEIA 1P1OA 3RT6B 1ZTYA 2I49A 1Z7NE 3K6UA 1GR2A 3HN0A 3OOAA 3K0VA 3MW0A 3IJXB 5H8SA 1YAEA 4N07A 5H8HA 1B32A 1JVYA 2HQ0A 4IO2A 1JEVA 1QVSA 3SEUA 5FHOA 3EN3A 2A5SA 4BDRA 3K1MA 2QS1A 1DTZA 1TT1A 3SEVA 5DVFA 5CI5A 4R2FA 3G3HA 3R26A 1O64A 1R9LA 3FIRA 1NH8A 4EDPA 1B3FA 4MFIA 4KCDA 5I59B 3TCGA 2VHAA 3VLWA 2XXWA 5EHSA 4ELQA 1M5BA 1B2HA 3KFMA 2P1SA 4DZ1A 4F39A 4NMYA 1MPCA 5FTIA 3HSTA 2PT2A 4LZ7A 3ZS6A 2AL4A 2H25A 1OLAA 2Z23A 3PPRA 4NF6B 4XTCQ 4YICA 4QFKA 1NKXA 4I62A 1PBQA 1MG1A 1SW2A 5CBRA 3QSLA 4JWXA 5BWJA 3TTMA 1UTBA 2YPNA 3GZGA 3V8XB 4EF1A 4U1ZA 3IOWA 3PD8A 4YMAA 3C35A 2OCUA 4KI0E 4H8JA 1TFDA 4NF5A 3VVDA 2DQVA 3I5OA 3IO6A 5EHMA 2OBGA 2CMOA 2PYYA 1ZMGA 2P2AA 3T96B 1B6HA 1L5TA 4NF8A 2PVUA 1D9VA 4FJPA 1UIUA 5ITOA 2ZYNA 1B3GA 1USYE 4G77A 3K01A 1DOTA 1B5IA 4I9DA 1SW1A 3UN6A 3TEPA 4AB5A 3VE1B 1B5JA 3OENA 3ONMA 3U72A 2DWAA 2I4CA 3KZGA 3ZKKA 1XVYA 3KG2A 2F7CA 4N13A 5JEIA 1OQHA 3LSWA 3EF7A 4JWYA 3FXRA 4POXA 1FTLA 3ILUB 1SW5A 1MQDA 1MDP1 1XC1A 5I58A 1B5HA 3ILTB 3EHTA 5CC2A 2W7YA 4NF4B 1POTA 2OWTA 3Q29A 2H4IA 3AXFA 2F6PA 3OO6A 4GVOA 4ZEKA 5TPAB 3RNNA 1OVTA 3N94A 1MH3A 4JSDA 4H0WA 4ZECA 4IO6A 2ZNUA 3MP1A 4N6PA 3VFJA 3IOVA 2RC8A 3LSFB 4EXKA 1B58A 1DPEA 1M5EA 4X1DA 4TLLB 2NUVA 5L9MA 1FTKA 3V83A 3L6GA 2XXPA 3HV1A 2UYFA 3R6UA 5ICQA 3TQLA 2V84A 5I2NA 4KR5A 4U22A 4XXUA 2HAVA 2V3TA 3THIA 3N5LA 1DPPA 3KJTA 4DCXA 4RA1A 2O1LA 4G2ZA 1A8EA 1D3KA 3PU5A 3PV0E 4LZ8A 4QFOA 1FQBA 1GV8A 1B9JA 3TTLA 4BDLA 3I6VA 3IOTA 3K00A 3UA8A 3SERA 2QSXA 3G3JA 2Z8EA 4Q30B 3U1OA 5DEXB 1H3DA 1WVJA 1I6QA 3DLNA 2PBWA 1IZ1A 3K02A 4DXBA 3OO8A 4KYSA 4P11A 3E3KA 3TCHA 2HXWA 1PB8A 3PGFA 1QUIA 4PP0A 1M5FA 3OMBA 4U21A 4XKPA 1SYHA 1ZBMA 4PFYA 3VVFA 3SKPA 1J1NA 4RJZA 1SQYA 4EQBA 1M5DA 2ZNTA 3ODBA 3SEXA 1B1XA 1MH4A 5IKBA 4FAJA 1QUJA 4DIGA 1YCJA 3MPKA 3RTFB 2ZNSA 3TUSA 1B05A 3MBPA 4DCYA 4KQPA 2Q2AA 3E9XA 1TWYA 4GRKA 3IOUA 4FECA 4YB5A 1IIWA 3JYRA 2D21A 4RK2A 3PUVE 3T9XB 4F22A 5ELVA 1P1UA 1JW5A 3VDFA 1B52A 4WXJA 2DYXA 5CRYA 1NFTA 1ZJLA 3QYTA 4R74A 2DVCA 2Q89A 2YLNA 3Q26A 4OFLA 5H8HB 5AA4B 5CMCA 4U2RA 1A7LA 5L9SA 4H5FA 1XHYA 1MXVA 1Y4TA 1MY1A 3V5AA 2OJTA 4ZS9A 1VFEA 2Z8DA 3FATA 4ELPA 2UVIA 1QKBA 2F36A 1VR5A 3PUYE 1URDA 2F34A 2HZLA 4FORA 2DVZA 1QW0A 4GD5A 1JVXA 3FD3A 5CMMA 5KDTA 1B7ZA 1SW4A 4F1UA 1R1NA 3KOSA 3TKDA 3K6WA 3CFLA 1Y1ZA 2V25A 4Q5TA 5L8DA 4JB7A 1VE4A 5CMKA 3TODA 4G68B 1MS7A 1MXZA 4QSEA 3O6GA 3C31A 4Q8RA 3O6HA 3CFZA 3MP6A 1O7TA 4G8MA 2GHAA 3HHFA 3TYHA 1URSA 4Z0IA 1FTMA 1N84A 4QFLA 4YKIA 4TOZA 2Q88A 2X26A 4OYVA 1DSNA 3CG1A 1WDNA 3KEIA 1MY4A 3T93B 3DP8A 3KSXA 2V3QA 3FJMA 2RCAA 3OO9A 2O84X 1JW1A 2R71A 4NF5B 3MWBA 3IL1B 4R9FA 3B6TA 3HPIA 1IXIA 4PFWA 3SEYA 2ONKE 3CFXA 2F97A 2Z8FA 1N7WA 2NOOA 2G29A 1AOVA 2DSFA 4NF8B 3M3LA 1UTHB 3PUWE 3H6VA 4ZZEA 2DE2A 4KHZE 2H9BA 4MLVA 4ND9A 2CZLA 1IXGA 2RKMA 2VD2A 5JK4A 5I2KA 5F1QA 3CI8A 3N6TA 3SESA 2FYIA 1SI0A 2Y7RA 1OMPA 3HO7A 3A09A 1URGA 3PMWA 3TAJA 2O68A 1LAXA 2XXVA 1N0TA 4M4GA 1CB6A 4IGRA 2PMSA 5I58B 3D4GA 4ZEBA 4AB6A 3WAFA 4F3BA 1EZPA 2HZKA 2OLBA 2QS4A 1Y3NA 2DS9A 3EHUA 3Q27A 4KCCA 1D4NA 2RC7A 3N6UA 4IY5A 3BFTA 1I69A 4YB7A 4ONYA 1NH7A 3PPPA 5M2VA 4MLQA 5FHMA 1SD3A 4YKKA 3O29A 1EZ9A 2DXYA 2A5TA 1II5A 1HSEA 3M3KA 4PETA 1B0LA 5KCJB 4R6YA 3TDJA 1MPDA 3W9WA 1Y3PA 1RKMA 2V3UA 1IQ7A 4ISUA 4HW8A 3RUMA 4FEDA 2OK2A 4U23A 5AA2D 3TTRA 3OSRA 3S9EA 4R6HA 1QJMA 5ITPA 1A40A 1IXHA 2REGA 1PDAA 5I2NB 2D3IA 3H6UA 1OVBA 1S7YA 1R6ZA 2H5YA 1I6BA 5B7DA 1XT8A 3LBSA 2XD2A 4OENA 2XXRA 1MQHA 2RCBA 4NTLA 2Q8JA 3TZAA 2ESNA 4H67A 4BDMA 4QSDA 3QUFA 4BDOA 2BJJX 4GOTA 1WODA 4O3BA 4PQJA 4BDNA 3CVGA 3PUZE 2UYEA 1Y3QA 3O66A 1TFAA 5B70A 2UVHA 4LATA 4PE5B 4RK9A 1B4ZA 1MXXA 2PT1A 3FVKA 1VFDA 4O3AA 2O6AA 3S9MC 3Q28A 1B3EA 3O28A 1DMBA 3T9UA 1SYIA 4WEPA 3S9NC 4ELOA 1ZU0A 3H03A 3KBRA 4XKQA 1LFHA 3EHSA 3SDFA 3RLFE 4YB6A 4YAHX 4KFQA 4ZZAA 3UGWA 2IEEA 1RYOA 2H99A 4OTEA 4OFJA 2VOZA 1OIBA 2FNCA 2I3VA 4JDFA 2UXAA 1IEJA 4MF3A 2DE3A 2KLFA 1ELJA 3B7DA 3MVWA 1Q1KA 1AMFA 2NWJA 4LONB 4YKJA 5JTYB 4LUBA 3RY3A 4FIMA 4JWOA 3IR1A 1NL5A 1GVCA 3VVEA 3OXNA 4OETA 1N76A 1B7HA 3TCFA 1LB9A 3U8QA 5H8QA 3LSLA 4OMBA 4RY1A 1B3LA 3KN7A 1F9BA 2VP1A 3KJ7A 3DM0A 1US4A 1MQGA 1MRPA 2Y7IA 4F2QA 4F29A 1H44A 2XXQA 3O6IA 1LCFA 1LLSA 2O51A 3MZBA 4F2OA 4AQ4A 5FHNA 2ONRA 2B3BA 5KDTB 4C0RA 3EPEA 2H98A 3RT8A 2R9JA 4ESWA 2Z22A 3UORA 4ZE8A 2M8CA 4DDDA 3QAXA 4JSOA 4LQ2A 4LVQA 5K2YA 1HSJA 1EZOA 1POY1 4NF4A 3FV2A 5I56A 4FEBA 1S50A 3N26A 5DVIA 1PB7A 4OEVA 4GQOA 4H8IA 4PFUA 1XVXA 3OD7A 4IO4A 5K2XA 4I8CA 4P0GA 3U94A 2Y84A 2DWJA 3TPAA 4XKRA 3MC2A 5AE4A 1USYH 3LSXA 3FVGA 1M5CA 4EUOA 2O7UA 4IO3A 3IORA 2QRYA 3CSBA 3HHGA 2QS2A 5J1DA 1BP5A 3DP4A 4P0IA 3RGYA 5LOMA 1FQFA 2E0SA 4Z7EA 4F3PA 1QULA 2PX1A 1Y1MA 3M8UA 4H6DA 3GBBA 4X48A 3O9PA 1FW0A 2GH9A 2HFBA 3T9VA 2F7BA 1H76A 2XXUA 2GRVA 1MM6A 3RPWA 4EQ9A 2Y7PA 2G93A 1SDXA 1P1WA 4QHQA 1JETA 4G68C 4R72A 2QMXA 3QK6A 5TU0A 1B0HA 3C4MA 4OESA 2E1SA 4G8NA 4KPTA 1NNKA 1LFIA 1SI1A 4NEDA 1HSLA 1IITA 2OZZA 1H45A 2P0SA 4X1BA 3B6QA 2VD3A 4L17A 3G3IA 1FTOA 4RPOA 2ABHA 4GWOA 1EH3A 1MPBA 2I48A 1JW4A 3I3VA 2Q2CA 1B40A 3KN8A 3UIFA 3ZKLA 2IA4A 2V93A 3QXMA 4NWCA 4HS7A 1MXYA 4R6KA 4OQOA 2DOJA 4WKMA 1GTKA 1UTBB 4GLIA 1MY2A 5H8NA 3CG3A 4ELRA 4QFPA 3DELB 5CMBA 3KSJA 4HTGA 2GHBA 3GXAA 4R9GA 3WAEA 4F19A 3FUZA 5A5XA 1A54A 1LBBA 1FQDA 4U4SA 4LQ5A 3ZSFA 2RINA 3CSGA 1O63A 2DE4A 2YJPA 2O1MA 4QRZA 3TTNA 3MP8A 2RC9A 1RYXA 3H3GA 1ZIUA 1MXUA 4NE4A 2XX8A 3MAMA 2XX9A 2X7PA 5AA4A 3H4ZA 2LAOA 2UVGA 5I57A 5ICTA 2ALUA 1MY3A 3BBRA 2XXHA 3PMXA 1CE2A 4C1TA 1MY0A 1GGGA 3IK6B 3IO4A 3FVOA 4IGTA 4ZE9A 5TP9A 3UP9A 3PD9A 3MUQA 4X9TA 1IXCA 3M3FA 2XXTA 3G3FA 4OHNA 5AA1A 1PB9A 4G68A 3KN3A 2QJEA 4PFTA 4IY6A 3PPNA 4F1YA 3KGCA 2O69A 1PEBA 4R2BA 1XOCA 4H1XA 4RYAA 4QF9A 5AA2A 1Y20A 4TLMB 1LAHE 3IB0A 4RPNA 3TMGA 4XIGQ 1MDQA 1NMUA 1N04A 1DTGA 4OZ9A 5H8FA 4U4XA 2I6EA 3BKIB 3K4UA 3OEMA 2GFEA 4RXLA 1LSTA 1EU8A 4F1VA 3S9LC 1Z7ME 4THIA 3FJ7A 1LGBC 3EQ1A 2FA7A 1US5A 4E0XA 1A55A 4OERA 3PPQA 3H7MA 1Q35A 4UACA 4IO5A 1ZLQA 2AL5A 1FTJA 3B6WA 4OFOA 2ZMBA 5H8QB 4GF8A 1SVXB 1QUKA 2DWIA 3MPLA 2NVUB 3W15C 3HCQA 5CBSA 2DWHA 4E0WA 2XXIA 1UTHA 3PUXE 2AYSA 1OLCA 2I58A 3FASA 3T22A 3CIJA 4F18A 1B7UA 1YTVA 2HAUA 2F8DA 4EF2A 3IB2A 4NWDA 4ZEFA 1D9YA 2HCAA 4G8HA 3JV9A 2R6GE 3FZVA 1SBPA 2XX7A 2THIA 1Y9UA 1ATGA 3IB1A 3MZ9A 3FJGA 1PC3A 3FXUA 4POWA 4OEUA 1FQAA 3VXCA 5I59A 2F7AA 3SEWA 3K6VA 3RN8A 4R73A 4M1VA 1P99A 3C32A 1BLFA 4GL0A 3K6XA 3TQWA 4FATA 2REJA 3K1PA 4U1OA 1B3HA 1N3XA 5I56B 3OSQA 4QSCA 2I0CA 3U92A 2RF1A 4UA8A 3PMVA 4Q0CA 2XD3A 4H65A 1LFGA 3O97A 4I1DA 4DLDA 1XS5A 4NF6A 3VLUA 4EQ7A 2UVJA 3USDA 1B4HA 4OWDA 3QUJA 2XXYA 3OO7A 2Q9TA 5KCJA 4RNSA 1ANFA 2XHDA 4BDQA 2D5WA 2ZXTA 4YU0A 3P7IA 4JBZA 3TELA 4GXAA 1BIYA 4YMBA 1S9TA 3C9HA 3UK4A 4G4PA 1T0KA 4F31B 4IO7A 4LA9A 4WEDA 3W9VA 4LZ5A 3RQTA 2QL3A 1AH5A 2Y7WA 4ECFA 3LC8A 3RTWB 3IJOB 3G7WA 4TQUQ 3LR1A 1Y4CA 3T9HB 3E4RA 5F7VA 2QS3A 4YZZA 4EXLA 3MVXA 1PBPA 2F6GA 1MXWA 2O7IA 3A3UA 1LCTA 3C34A 2ZYOA 3H06B 3Q25A 1QKAA 1NNPA 1H43A 1FQCA 3C36A 2ANJA 4JXIA 4YKPA 3L6HA 2Y7KA 1LAGE 1YPNA 4ZDMA 4OXVA 5HPQA 5EYFA 1JQFA 2X7QA 4FE8A 2B65A 5BUUA 5TPAA 1LB8A 3ECRA 2VGQA 3IX1A 4GL8A 4DXUA 2I3WA 4F3GA 1I6AA 3MZ1A 3R7XA 1BTJA 3V89B 1KWHA 1LAFE 1NNTA 3GLBA 3BFUA 3K1NA 4DXCA 2F78A 5H8NB 2ZYKA 1N3WA 2HEUA 3C33A 5DTBA 5DVJA 1VSOA 5AA3A 5DYHA 3PPOA 2OWSA 1JEUA 4GFRA 4O3CA 4QFNA 5JTYA 3LUYA 5A5XB 1UQWA 2B3FA 1OQGA 4DE8A 3O2AA 2I4BA 3OELA 2I0BA 4LP2B 3G3KA 1JNFA 1MM7A 5KZTA 1NNFA 1LBCA 4MBPA 3JZJA 1A8FA 3K2DA 4IB2A 3QIMA 1FQEA 3MVYA 4GXSB 5CM6A 3VXBA 3FGSA 4HCYA 2QMWA 1B51A 4KD5A 5DT6A 4ESXA 3F11A 3H6WA 5I57B 3OEKA 2DP8A 4H5GA 4KYDA 5I2KB 1MQJA 1P1QA 4F3SA 2F5XA 3FXQA 5DEXA 3VV5A 3SETA 4HCWA 3E13X 4MH5A 3G3GA 5HM4B 5L9OA 3TFLA 1B1HA 5TP9B 2ZYMA 1B46A 2ONSA 3DP6A 2AIXA 5FTHA 1MQIA 3S2VA 1R9QA 1FCKA 4R75A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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