4NWCA

Crystal structure of the gluk3 ligand-binding domain (s1s2) in complex with the agonist (2s,4r)-4-(3-methoxy-3-oxopropyl)glutamic acid at 2.01 a resolution.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
TNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein, receptor/agonist
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 3
publication title Molecular Recognition of Two 2,4-syn-Functionalized (S)-Glutamate Analogues by the Kainate Receptor GluK3 Ligand Binding Domain.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nwcA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nwcA02
3G3JA 3S2VA 3A09A 2XX8A 4KI0E 3T9XB 4Q30B 2DWJA 5IKBA 2Q9TA 3G3IA 4JDFA 1SI0A 2I0BA 3IJXB 2ZNUA 2PMSA 4R72A 1R9QA 3T22A 3O6IA 3ZSFA 3FV1A 4F2QA 3P7IA 4YKPA 2HZKA 2I58A 4GIZA 3V83A 3MJNA 1Y4TA 4HS7A 4AB5A 1MXXA 2F6GA 2R6GE 4K3FA 3GBAA 4XKQA 3S4UA 4YB6A 3I5OA 3PPPA 4ZDMA 3FVNA 3IOWA 5FHNA 3SEXA 3C33A 1VSOA 2I49A 3FJ7A 2PT2A 4F1VA 4NF4A 4HTGA 3KG2A 1LAGE 4OFLA 3VXBA 4I1DA 4MLQA 2Y84A 3TZAA 4FAJA 1O63A 1OVTA 3OSQA 1VFDA 3B6WA 3FIRA 4ESWA 5F1QA 3MVYA 3D4CA 5H8HB 3EHUA 4PE5B 4YB7A 2HAVA 5FTHA 2DYXA 1P1UA 1PB9A 3FATA 2AL5A 3N6UA 2M8CA 3B6TA 1MDP1 5KDTA 1FQAA 1I69A 1SYIA 5AA4B 4RXLA 2O7UA 4TOZA 4EQ7A 2OK2A 5M2VA 4POXA 3IJOB 2P2AA 1SW5A 3VDFA 3A3CA 4QFOA 3FV2A 4PFWA 1R1NA 1B9JA 3Q29A 3TEPA 1ZKBA 2DQVA 5I59B 3KSXA 1MG1A 4M1VA 1D3KA 1DTGA 4G2ZA 4NMYA 1SW1A 5TPAB 2P1SA 3USDA 1YAEA 1B3GA 2GHBA 3TODA 4XIGQ 1MRPA 3RNNA 3VVFA 1CE2A 4NF5A 1YTVA 4EQBA 4OFJA 3VLUA 1JW5A 5I57B 4F22A 1B3LA 2DP8A 1B0LA 4MH5A 3KN8A 2W7YA 4TLMB 2D21A 3PPRA 1NNTA 3R7XA 3HN0A 1RYXA 4IO2A 4OVJA 1GGGA 1UTHA 4FATA 1OIBA 4YMAA 1MQJA 3H06B 2DWHA 5L9SA 1PBQA 2CMOA 1JEVA 3FASA 4OENA 1FTKA 1MDQA 1LLSA 4G8NA 4F1YA 3S9LC 5KCJB 2H99A 1XVYA 3TYHA 2OJTA 3IOTA 2REGA 5AA2A 3IB2A 4NF6A 1LFHA 3F11A 5H8QA 4DDDA 3EHTA 3ILTB 1BTJA 1O7TA 4GVOA 1TXFA 1T0KA 3K1PA 3K4UA 3FVGA 2PT1A 1FTMA 2DVCA 4KYDA 3KOSA 5KZTA 3MUQA 3KN3A 3FZVA 3C32A 5AA1A 1QW0A 2XD2A 5I2NB 3WAEA 4YAHX 4F3BA 4EF1A 3E9XA 3PMVA 1J1NA 4IO4A 2RF1A 3I6VA 4G8MA 2E0SA 5CRYA 2F7BA 4H1XA 1DSNA 3CSBA 3MP6A 4R74A 5L8DA 3KOTA 3KZGA 3PUYE 1SQYA 4JBZA 3H7MA 1Y9UA 2ZNTA 2HAUA 3MZ9A 3E4RA 4F29A 4IO5A 3EN3A 5JEIA 1Y20A 2XD3A 1MQDA 3RTFB 3K1MA 2RCBA 3ZS6A 4KPTA 1MY4A 5CMCA 2I4BA 1UTBB 4WXJA 1A8EA 3L6HA 2Q88A 1RYOA 1Y1ZA 4KCCA 3IX1A 4ELRA 4OYVA 2I6EA 5FTIA 3W9WA 4Q8RA 1PBPA 1QUIA 2XXWA 4QF9A 3VV5A 2XXRA 3DLNA 1MH4A 1SW4A 4QSDA 1Y4CA 4U1ZA 4IO6A 2DSFA 1WDNA 3RPWA 5DEXB 3PV0E 5K2YA 3HV1A 4JSOA 2AYSA 1LFGA 4F2OA 3HCQA 3K6WA 3LSWA 5JTYB 4HCYA 3PU5A 3PPQA 3RGYA 2VD3A 1NH7A 2OBGA 1JVYA 4H65A 1QJMA 1I6BA 4JXIA 2QS2A 1AIVA 4KYSA 4GL0A 3FXRA 1B4HA 1NL5A 3U94A 3O28A 1ZTYA 3CG3A 4E0XA 3FUZA 4LVQA 2IA4A 2Q2AA 2ZXTA 4P11A 3OO6A 2FYIA 3RT6B 3HHFA 4RYAA 2H98A 3N5LA 4FEBA 1JNFA 2OZZA 1VE4A 2VP1A 3U1OA 2HQ0A 3QSLA 1MM7A 1IIWA 1SW2A 3TTNA 2THIA 3UP9A 4X1DA 1I6AA 5TPAA 1PDAA 4ELQA 2X26A 1GR2A 4BDQA 5IAIA 3MVWA 4ZECA 2F35A 1H43A 5DTBA 4MF3A 2O6AA 4OWDA 4OFOA 4KR5A 4QRZA 3KBRA 1MPCA 4GRKA 4IB2A 2H4IA 4U21A 2Y7RA 1H44A 2Y7IA 1LAFE 2F7CA 2GH9A 3TMGA 4OTEA 4F3SA 1OQGA 4LZ5A 3OSRA 2XHDA 3SETA 1M5DA 1P99A 1XS5A 1MM6A 4GLIA 1A55A 4LZ8A 2NOOA 3N26A 1N3XA 3IO6A 3B6QA 1FQCA 3K6XA 3FJGA 3SERA 3H6WA 3UA8A 4GOTA 1M5CA 4LQ2A 4OEUA 3SKPA 3KEIA 3Q25A 2XXPA 1CB6A 4UA8A 3PUWE 3H3GA 3T9VA 1FW0A 1ZLQA 4R9GA 3OD7A 1B7ZA 4H5GA 5ELVA 4YMBA 5I58A 2P0SA 4DXBA 1F9BA 4WKMA 4F1UA 4ZS9A 2ABHA 1IQ7A 4NWDA 3M3KA 3QUFA 2PX1A 3Q28A 1TWYA 2V3TA 3OOAA 3RT8A 1RKMA 1D4NA 1ELJA 4OZ9A 1MY0A 4H6DA 2B3FA 1LFIA 2UYFA 3O29A 4AB6A 5ICQA 1B0HA 3K02A 1EZ9A 2RC8A 3D4GA 4O3AA 5CBRA 2H9BA 1MH3A 4YB5A 2QL3A 3CRBA 4QFKA 3O2AA 3U92A 1P1WA 4OMBA 3H6TA 1NNKA 2YJPA 3C9HA 4UACA 1USYH 1P1OA 1SI1A 3RY3A 3UORA 3G3GA 1NMUA 1BP5A 2Y7PA 3MZBA 1B3HA 1N7XA 3OMBA 1BKAA 4QFLA 1XOCA 2NXOA 1UTBA 2HZLA 1MXVA 2OWSA 4HCWA 3IOUA 3EHSA 5H8SA 3E13X 2QRYA 2ZNSA 2XXQA 1XVXA 1GTKA 1ZMGA 4OESA 3DM0A 4FE8A 2O84X 4O3CA 1JQFA 3O97A 3V8XB 4BDNA 2Q8JA 2XXVA 3ODBA 1A7LA 3VXCA 3O66A 5H8FB 3W9VA 1NNPA 1A99A 3CVGA 3MVXA 1B1HA 1SVXB 1MY3A 5DEXA 1JEUA 1HSJA 3FVKA 3K6VA 3H4ZA 3DP4A 2RINA 4PFYA 5JTYA 2UVGA 1NFTA 2G93A 4U2RA 1AL3A 4FECA 3T93B 2FNCA 1XT8A 2I0CA 3T9HB 1P1NA 1EU8A 1UIVA 3BFUA 3UN6A 3MW0A 2ZMBA 3MZ1A 4KFQA 5JK4A 5BUUA 4P0GA 3CG1A 4G8HA 2DOJA 5I84A 5I2KB 2YPNA 2OLBA 1QUJA 4L17A 3TCFA 3I3VA 4XTCQ 2F8DA 1UIUA 5A5XB 3EF7A 3PPOA 4G77A 3CFXA 3LBSA 5F7VA 3TCGA 3K6UA 3S9EA 3QAXA 3TTLA 1POTA 4RA1A 3IOVA 3QUJA 1FQBA 1B5JA 3JZJA 3LSXA 4N6PA 2Z22A 3PGFA 4IGTA 3IR1A 5TP9B 2XXIA 2HCAA 1WVJA 5H8NB 1VR5A 3H6VA 1DOTA 1M5FA 5CI5A 2NVUB 1MQGA 4FIMA 4H8JA 4Q5TA 4NF8A 4U4SA 1N76A 1I6QA 5ICTA 5ITOA 5FHMA 1FTJA 4NTLA 2HXWA 4R2FA 3S9NC 1OMPA 1GV8A 1TFDA 2LAOA 5ITPA 3V5AA 1IUDA 4DIGA 5CC2A 4R9FA 3EPEA 1Z7NE 3RQTA 1Y3NA 2DE4A 2D5WA 4C1TA 3LR1A 2VOZA 3HSTA 4DXCA 3KGCA 1GVCA 2OCUA 1L5TA 4ND9A 2XXTA 2B65A 1EZOA 1POY1 3OO8A 4TLLB 1B05A 2HFBA 3FXUA 4OERA 5AA2D 4U1OA 4OEVA 1IZ1A 1LGBC 1JETA 3KFMA 2VGQA 4LATA 3PUZE 4R6KA 3OO7A 2DS9A 2NUVA 4GFRA 1PB7A 1XHYA 3E3KA 4JB7A 4BDRA 1IXIA 3G7WA 2UYEA 1XC1A 1II5A 2WKYA 3K01A 5KDTB 3OXNA 2PBWA 1YPNA 2R71A 4LQ5A 5EYFA 4DCYA 4ZEKA 1WODA 1B40A 4OXVA 4EUOA 1O64A 2V84A 4FJPA 4ZEDA 4GXAA 3SEVA 1N3WA 3PD9A 2O69A 2QS1A 2I3VA 3G3HA 3S9MC 1B3EA 1OQHA 3ILUB 1Y3QA 1H45A 3M3LA 2A5TB 1ZBMA 1QULA 3M8UA 5H8HA 4QFPA 2QPQA 1DTZA 3MBPA 4RNSA 5HPQA 1IXCA 2NWJA 1B2HA 2QMWA 3TTRA 1LB8A 1Z7ME 4QSCA 1FQDA 2Z8EA 2Z8FA 5AA4A 4XKRA 2ZYKA 1MXZA 4JWXA 4JSDA 3TTKA 2REJA 1US4A 4EXLA 1H3DA 4X1BA 3T66A 1N0TA 1URDA 4FORA 1ZJLA 3BBRA 2ZYOA 2G29A 3B7DA 1DPEA 2O1LA 4GL8A 3U8QA 1KWHA 4AQ4A 5I59A 5TU0A 2UVJA 2I4CA 4ELOA 2DWAA 4ZEBA 1N7WA 2PVUA 5AA2B 4YKJA 3W15C 4IO7A 3IO4A 1LB9A 3KJ7A 1UQWA 3PUVE 5H8QB 3FVOA 3RN8A 3JV9A 3IORA 4U4XA 3MP8A 3TTMA 1S50A 3TDJA 4YKKA 3PUXE 1BLFA 1OLCA 2Z8DA 4X48A 5I57A 3PPNA 5BWJA 1Q35A 3ECRA 4PP0A 2RKMA 4OQOA 1FTLA 5CBSA 2QSXA 3AXFA 5I2KA 2GRVA 3FGSA 1AMFA 3TQLA 1M5EA 1USYE 3C35A 1MS7A 1NH8A 1B1XA 5AA3A 5A5XA 3TUSA 3IL1B 5KCJA 2UXAA 4THIA 5DVIA 4ELPA 1SDXA 1D9YA 2DXRA 4H8IA 2ALUA 4NE4A 3QXMA 3HPIA 3HHGA 1LBCA 2X7PA 4DLDA 5H8NA 3SDFA 3CIJA 3SEWA 3LSFB 4PETA 4QSEA 4GXSB 2QS3A 1JVXA 3MVZA 1LCTA 5DYHA 2X7QA 4F19A 2R9JA 3O6GA 3ZKLA 1M5BA 4N13A 5I2NA 2AL4A 4ISUA 1EH3A 4XKPA 3VLVA 4KHZE 3T96B 4QFNA 3QK6A 1TT1A 2F5XA 4R73A 1H76A 4G68B 1B32A 4KCDA 4WEDA 4Z7EA 4IGRA 1NNFA 1B46A 1SYHA 1IXGA 4LONB 3GBBA 4FEDA 1QKBA 5ISUA 2XX7A 1BIYA 3OEKA 2XX9A 2ZYMA 4ONYA 3V89B 2F6PA 2OWTA 4P0IA 3VVEA 2ONSA 1VFEA 1R9LA 5DT6A 3R6UA 3HO7A 1QVSA 3MQ9A 1S9TA 3RTWB 1FQEA 1PC3A 4KYEA 4DXUA 4RPOA 4MFIA 3K2DA 4C0RA 4DE8A 1URGA 2I3WA 3KN7A 4JWOA 2ANJA 1ZU0A 4IO3A 2XXHA 4G68C 4ZE9A 4ZEIA 3K00A 3CFZA 2F7AA 3CSGA 3MWBA 3K1NA 4RK2A 5EHMA 2IEEA 1FQFA 4F31B 3N6TA 4BLAA 1MY1A 2CZLA 1N04A 1FTOA 4Z0IA 4PFUA 1MQIA 3DP6A 4DCXA 5HM4B 1LCFA 4KD5A 1DMBA 1LAHE 1SD3A 3UIFA 2A5TA 4RY1A 4EDPA 2UVIA 4EQ9A 4RPNA 1PB8A 3A3UA 3GLBA 4H67A 3IB0A 1Y3PA 1B5IA 1R6ZA 5L9MA 4G4PA 4PQJA 3THIA 1TFAA 4H0WA 1MY2A 4ZE8A 3M3FA 4ZZEA 5CMKA 1AH5A 4MLVA 2RCAA 3VE1B 3LSLA 5I56B 3CI8A 3MPKA 3O9PA 2Y7KA 2XXUA 4OHNA 2Y7WA 3G3FA 3RUMA 2UVHA 1NKXA 4R6YA 3JYRA 5DVJA 3IB1A 3LC8A 1YCJA 2ONRA 4M4GA 3U93A 4XKNA 3UK4A 4LP2B 3U72A 3WAFA 4R2BA 2HEUA 4YICA 3OENA 4C1UA 3FJMA 4F39A 2KLFA 4LZ7A 5I58B 4F3GA 5LOMA 1MPDA 2V25A 1A8FA 4I8CA 3BFTA 2DE2A 3PMXA 3UGWA 4NF4B 2F34A 4GQOA 2VHAA 3C4MA 4GF8A 4ZEFA 1Q1KA 2PYYA 1B6HA 2H5YA 3TQWA 2XXXA 2ESNA 1ATGA 3SESA 3PMWA 2V93A 2DE3A 3H6UA 3G3KA 1SBPA 1EZPA 4NWCA 2GHAA 4E0WA 3T9UA 3GZGA 1B7HA 3SEUA 3TELA 3EQ1A 3C34A 1QUKA 5L9OA 3FXQA 4GD5A 3ZKKA 5AE4A 4YZZA 2O1MA 4YU0A 3Q27A 1QKAA 2D3IA 3RLFE 1Y1MA 2DXYA 1IXHA 3CR9A 4OETA 4EF2A 1LSTA 2F36A 1HSEA 4F3PA 3O6HA 4G68A 4R75A 3QYTA 4X9TA 3VFJA 2O51A 3FD3A 1B51A 4GWOA 1B4ZA 3IAZA 4BDOA 3KSJA 5B7DA 3OELA 1S7YA 3KJTA 3MAMA 4N07A 1AOVA 4R6HA 1MQHA 2YLNA 5CMMA 1B5HA 2AIXA 2V3UA 3SEYA 4NF5B 1MXUA 1IITA 1MXYA 1LBBA 4RK9A 4ECFA 5J1DA 3QIMA 2ONKE 1B52A 1A54A 2RC7A 1JW4A 3IK6B 3LUYA 4O3BA 4MBPA 2O68A 3CFLA 3PD8A 1UTHB 1HSLA 4KQPA 5K2XA 1N84A 5B70A 2VD2A 4YKIA 2DWIA 4Q0CA 4TQUQ 3C36A 4ZZAA 1PEBA 2V3QA 3MPLA 5CM6A 3OEMA 4EXKA 4XXUA 3GXAA 4ESXA 4JWYA 2O7IA 3DP8A 3TAJA 3MP1A 4I9DA 2XXYA 2ZYNA 4NF6B 5H8FA 3VVDA 3TPAA 1US5A 1LAXA 2F78A 2H25A 1FCKA 3DELB 2DVZA 1B3FA 3K0VA 1ANFA 4IY6A 1B7UA 1JW1A 3BKIB 2QS4A 2A5SA 4NF8B 3TKDA 2Z23A 4H5FA 4QHQA 1DPPA 2B3BA 1MPBA 3H03A 1URSA 3C31A 4BDMA 5HBCA 1MXWA 2QJEA 4BDLA 4F18A 3Q26A 2QMXA 2RC9A 3ONMA 1IEJA 5EHSA 3OO9A 1D9VA 3TFLA 4WEPA 3R26A 1OLAA 3L6GA 2FA7A 3N94A 4POWA 4HW8A 1OVBA 5I56A 4NEDA 3TCHA 4U23A 4RJZA 4U22A 2F97A 4I62A 1B58A 4IY5A 2Q2CA 1A40A 5DVFA 4PFTA 2I48A 4LUBA 5CMBA 1P1QA 1ZIUA 5FHOA 3MC2A 2Q89A 2GFEA 2BJJX 5TP9A 3VLWA 2E1SA 4DZ1A 4LA9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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