4U4XA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam37 at 1.56 a resolution.
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 90
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4xA02
1P1OA 3OENA 3TELA 5KCJA 2Z8EA 2PBWA 3T22A 3O2AA 4GXAA 3ZKKA 2ABHA 1HSLA 2DWHA 2X26A 4G68C 3HPIA 2DVCA 4X1DA 4DXCA 4WKMA 3O29A 3G3FA 3RNNA 1TFAA 3TTNA 2DSFA 1SDXA 5CI5A 1IXCA 1SYIA 3T96B 4FORA 1O64A 4AQ4A 1OVBA 1Y4TA 3EHUA 4OZ9A 2XXIA 1CE2A 3MPKA 4XIGQ 3GBAA 3KJ7A 3G3IA 4XTCQ 1Y1MA 2XXRA 2VD3A 3KZGA 3TAJA 1LCFA 1J1NA 3IJXB 4YB5A 1Q35A 2D5WA 4H6DA 3THIA 3QK6A 4F1VA 3IR1A 1FQEA 3PMWA 4QSEA 2DE2A 2OCUA 2Q2CA 5CM6A 4ZZAA 1I6AA 3IOTA 3V8XB 2DE3A 2G93A 4DE8A 4F39A 2RC9A 1B4HA 1SW5A 4BDMA 4JWXA 1IXHA 1M5EA 3IL1B 3KGCA 2PX1A 1Y1ZA 1IQ7A 1D4NA 5F7VA 2HFBA 3FUZA 4ELRA 1YAEA 1N04A 2O84X 4XKNA 4U4SA 4R74A 5DYHA 1BKAA 5CMCA 2PMSA 1KWHA 1DTGA 3IO6A 5AE4A 4ND9A 2Y7RA 2I4BA 4L17A 2Q88A 1OMPA 3G3KA 4OFLA 1ATGA 4ZZEA 4POWA 3HSTA 1LLSA 4NMYA 1IUDA 2Y7IA 5FTIA 4F22A 4ZECA 2DWJA 4GF8A 2ONKE 4TQUQ 4KCCA 3TCFA 5L8DA 3UIFA 3FXQA 3WAEA 4NF4A 2OWSA 3K01A 4YKIA 5I2NA 3V89B 5ITOA 5JK4A 3OXNA 3K1NA 5B70A 2XD3A 3FVKA 4ZE8A 3QAXA 3K6WA 2AL4A 3RN8A 2YJPA 3SETA 3TTMA 3CIJA 3ILUB 3DP4A 1B5JA 3Q26A 2DQVA 4LONB 3PU5A 5CMKA 1B58A 4GRKA 1MY1A 3D4GA 4IGRA 4IO2A 2HQ0A 3MWBA 3MVWA 1UTBB 5I56B 5DEXA 2D21A 4THIA 3LSFB 5F1QA 4YMBA 5H8QB 1NH8A 3Q29A 3PGFA 1FCKA 1B3LA 3PMVA 4M1VA 1VFEA 2UYFA 1OQGA 5TP9A 3TODA 1OLCA 1LBBA 4MH5A 1IIWA 1FTMA 3TFLA 2I4CA 3CG1A 4H67A 3IOVA 2KLFA 4OEUA 3MQ9A 1SQYA 4ECFA 1AOVA 3S4UA 1MY0A 1VFDA 1P1UA 4QRZA 5TPAA 4JWYA 2BJJX 3FJMA 3S2VA 4R72A 1LFHA 4IO6A 1JEUA 1QJMA 2F7BA 4FEDA 1LAXA 5JEIA 4IB2A 4M4GA 2D3IA 3TKDA 4H8JA 2OZZA 2OLBA 3DLNA 5L9SA 5EHSA 4DZ1A 3RUMA 2ANJA 4TLMB 4BDNA 3B6WA 3A3CA 3FV2A 1D9YA 2O69A 3TDJA 3T9VA 4U1ZA 3RGYA 1Y3PA 1ZBMA 1JW1A 2RKMA 1SBPA 2F7CA 2UVGA 4LA9A 5FHOA 4F3GA 1MQDA 1HSJA 1B7HA 5EYFA 4R6YA 3TCGA 4LZ5A 3ODBA 1NNKA 1UIVA 3SKPA 3S9EA 4OETA 3G7WA 4NF8B 3MPLA 2RCBA 1R9QA 2I6EA 5I59B 4G68B 2V25A 3SEUA 1AH5A 3KJTA 4XKQA 4QSCA 4Q5TA 1SD3A 3LUYA 2QS1A 5FHNA 4U4XA 2ZNUA 3N5LA 3KN7A 3RPWA 3CFXA 3ILTB 1POY1 5AA2D 4HS7A 4YKKA 4P0GA 2FA7A 1POTA 4F3SA 1QUJA 4KFQA 4F2OA 3WAFA 2O1LA 2QS4A 4QFPA 4ZS9A 4LQ2A 1DMBA 3MW0A 2HZKA 3GLBA 3SEWA 4EDPA 3U94A 4MBPA 2H4IA 2M8CA 3LSLA 4G8HA 4OVJA 2ZYNA 3T93B 3I3VA 4NF5A 3H7MA 4EXKA 1N3WA 3IB1A 3GZGA 3SDFA 5FHMA 3HCQA 1MG1A 4OHNA 2A5SA 3EQ1A 2V3UA 1PBQA 5ITPA 1NH7A 1M5DA 5H8HB 5IKBA 5ELVA 1A99A 3N94A 4H65A 3M8UA 3PUXE 4YKPA 4PQJA 1I6QA 1MXWA 2QMWA 4ZEKA 1NFTA 5CBSA 3FZVA 1Y4CA 4LATA 4AB6A 4G77A 5CMMA 5CC2A 4NEDA 3S9MC 2XXVA 3IB0A 3PPOA 3EPEA 1MQJA 4GFRA 4QFKA 3RTWB 4C1TA 3BFUA 1ELJA 2OJTA 3O6HA 4FECA 1OLAA 1D9VA 4X9TA 2QJEA 1IXGA 3MVYA 1QW0A 5AA2B 1XHYA 3T9XB 3T66A 5I57A 4XXUA 3H3GA 5DT6A 4JSOA 3M3KA 4DXUA 2VGQA 3MZ1A 3FVGA 1MY4A 2P0SA 3B6TA 1QKBA 2P2AA 3A3UA 1D3KA 1HSEA 1JNFA 1R1NA 2DWAA 2HEUA 3PUZE 1B32A 5J1DA 3PD8A 2OWTA 3U92A 4H0WA 1BP5A 1SVXB 3VVFA 5A5XB 4ZDMA 1USYE 4Q0CA 3MP1A 3IAZA 1R9LA 2E0SA 2H25A 2AL5A 4N6PA 1P1NA 5L9OA 2Y7WA 3U93A 4RJZA 1GTKA 1ZJLA 2CZLA 5KCJB 3HV1A 2GHBA 4GWOA 1A54A 3RQTA 2DP8A 3W9WA 4P0IA 2H98A 4DLDA 1MXYA 3O9PA 4HTGA 4KQPA 4X1BA 3OEMA 2DXRA 3OMBA 3O6IA 4PE5B 1GV8A 2WKYA 5CMBA 4QHQA 2F97A 1Y20A 3IJOB 1UTHA 3G3GA 2XX8A 2AIXA 1US4A 4G8NA 4EUOA 1B5IA 2B65A 3BKIB 3S9NC 1UIUA 2Z22A 4KPTA 1II5A 1A40A 4PFUA 4KYEA 3JZJA 3C33A 3EN3A 1NL5A 3IB2A 1SI1A 3IOUA 3UP9A 1EU8A 3VVEA 1PDAA 2QRYA 1N76A 5K2XA 3C31A 1FTLA 1S50A 3UORA 3VLWA 4F1UA 4YZZA 3VV5A 3R7XA 4HCYA 3KFMA 1JW4A 1B3EA 4FEBA 1UTHB 1LAFE 4MFIA 2DYXA 3O6GA 1AIVA 4ELPA 4R6KA 4R2BA 1L5TA 4GL0A 4H1XA 1EZOA 3N6TA 2I0BA 2VOZA 1H76A 3FJ7A 3TTLA 4OERA 3O28A 1PBPA 3TQWA 1GVCA 3CSGA 2UVJA 1Z7ME 1A55A 3OSQA 2UXAA 1VE4A 2H99A 1MQGA 2HCAA 4H5FA 5KZTA 1GR2A 4Z0IA 1B3GA 2RF1A 4U1OA 4HCWA 3CI8A 3EHTA 4LUBA 4I62A 2XX9A 2Z8DA 2I3WA 5ICQA 4KHZE 2P1SA 1I69A 1I6BA 4LZ7A 2QS2A 3CFLA 1RYOA 3N26A 3B7DA 2PT1A 4H5GA 4OWDA 5H8FA 3CRBA 3K0VA 1R6ZA 5FTHA 3CG3A 3VXCA 2XXTA 2PT2A 3MBPA 2GH9A 3TEPA 2DE4A 1NNFA 3BFTA 4NF4B 4ZE9A 5AA4A 4X48A 4DCYA 5I2NB 1S7YA 3ZKLA 3JYRA 2ZNTA 4RXLA 1AMFA 3PV0E 3SEVA 3DP8A 4NTLA 5DVIA 2Y7KA 3O97A 1MPBA 4U22A 1FTKA 1M5FA 1WODA 3HHGA 2QL3A 2ZYKA 4QF9A 3EHSA 2HZLA 3VE1B 4RYAA 1P99A 3TQLA 1JW5A 1ZMGA 4YMAA 4POXA 3U1OA 2OK2A 2QSXA 1PEBA 3FD3A 1B2HA 2NOOA 4KYDA 2XXYA 1Z7NE 1N0TA 2XXUA 3KG2A 3GBBA 1DPEA 4ZEBA 1QULA 3UK4A 4QSDA 5DEXB 1B6HA 5I58A 4ELOA 1DOTA 5ICTA 4RPNA 3ONMA 3B6QA 3FXRA 3LBSA 4JXIA 4I8CA 2G29A 1XS5A 4P11A 2PYYA 4RA1A 3MZBA 5KDTA 1MRPA 1UQWA 5TP9B 4R2FA 3M3FA 1BTJA 3VXBA 2Q2AA 4FIMA 4FAJA 1A8FA 2XD2A 4DIGA 4O3AA 1LSTA 4RNSA 1MXXA 1XOCA 3N6UA 3OD7A 4F1YA 5TPAB 2ZYOA 1PC3A 2NUVA 4F31B 2H5YA 1US5A 2FYIA 5JTYA 3MJNA 4Q8RA 1H44A 3E3KA 3QXMA 1RYXA 3K1PA 1BIYA 1H3DA 3MZ9A 4R73A 4G4PA 3HHFA 4NF6A 3V5AA 4F29A 3K6UA 3QUFA 2REJA 1O7TA 2DXYA 4R6HA 3RT6B 2B3FA 4C1UA 3I5OA 2F35A 2UYEA 3F11A 3H03A 3K1MA 1MQIA 3W9VA 2VP1A 4OXVA 1QUIA 1DTZA 1NKXA 2IEEA 3SEXA 5HPQA 2HAVA 5CBRA 4F18A 3H6WA 1Y9UA 1URDA 2I48A 4LQ5A 2Z8FA 3LR1A 4N13A 3C32A 4TOZA 1BLFA 3TTKA 1USYH 3L6HA 5EHMA 2QS3A 3PPPA 5H8NA 2Y7PA 2DOJA 1H45A 1MXZA 3IO4A 1MXUA 1Q1KA 1N7WA 1JETA 3HN0A 4OFJA 5L9MA 2Q89A 1N7XA 2R6GE 4PFYA 1B0HA 3MAMA 5CRYA 2ONRA 3RT8A 3IOWA 4WXJA 4RY1A 2O7IA 3RTFB 1VR5A 3K02A 2RC8A 5ISUA 2B3BA 3MVZA 1B1HA 3QSLA 4DCXA 3D4CA 1SI0A 2V84A 5I84A 2XHDA 3Q25A 3RLFE 1FQFA 4KI0E 3FJGA 3GXAA 2QMXA 3KN8A 3P7IA 3H06B 3PMXA 1LGBC 3G3JA 4NF5B 2O6AA 4KCDA 3OO8A 1ZIUA 3SEYA 3VVDA 1SW4A 1WVJA 4OEVA 4JSDA 4EF1A 2RINA 2GRVA 4NWCA 3V83A 2Y84A 2F34A 1SYHA 4QFLA 5DTBA 3SESA 1LFGA 4OMBA 4R9GA 2Q8JA 4BLAA 1LBCA 1MQHA 1URGA 2DVZA 3TMGA 1EH3A 4LZ8A 1JVYA 1OVTA 4BDLA 1WDNA 3OELA 2QPQA 1M5CA 4RK2A 3FXUA 3LC8A 4PFWA 4G2ZA 4ZEFA 1FTJA 1TXFA 3KN3A 4O3CA 1FQAA 3TTRA 1SW1A 3CR9A 1FTOA 3MUQA 4GIZA 4ESWA 3H6UA 5I57B 1XVYA 1MM7A 4IO3A 5LOMA 4EQ7A 5AA3A 3VLVA 4ZEIA 2O7UA 1ZKBA 3KEIA 2CMOA 1GGGA 2XXQA 4YB6A 2W7YA 4F19A 1B0LA 2REGA 1B46A 2R71A 3OO9A 2X7PA 3JV9A 1LAHE 2LAOA 5BUUA 1Y3QA 2NVUB 5K2YA 4RPOA 5I2KA 4Z7EA 3U8QA 2ZMBA 2VHAA 1P1WA 3VLUA 1AL3A 4BDRA 3S9LC 3MC2A 1FQDA 1IXIA 3DM0A 4OFOA 4MF3A 4H8IA 3R6UA 3U72A 4F2QA 1LCTA 2PVUA 1B3HA 3Q27A 4IO5A 3PPRA 2UVIA 3Q28A 4C0RA 3IK6B 2F8DA 1IITA 4IY5A 5I2KB 3KOSA 4GLIA 4FATA 2Q9TA 4KYSA 1LFIA 4OENA 3C36A 4MLVA 4K3FA 2THIA 4PP0A 1NNTA 4EF2A 1YCJA 1F9BA 4IO4A 3PPQA 2RC7A 3TPAA 3FATA 2DS9A 2ONSA 3QUJA 3C9HA 4OESA 5BWJA 1MH3A 1MDP1 3T9UA 3IORA 3K00A 3KSJA 4PFTA 3G3HA 1JQFA 4XKRA 3L6GA 4BDOA 4ZEDA 1EZ9A 3OO6A 4FJPA 1OQHA 2O1MA 2XX7A 3PD9A 1MPDA 1ZLQA 2ESNA 1B5HA 1UTBA 5I56A 1B3FA 3A09A 3TZAA 4U23A 3VDFA 1N3XA 3OEKA 2YLNA 3UN6A 2F6GA 3TCHA 3CFZA 2VD2A 2X7QA 3MVXA 5H8QA 1IZ1A 4FE8A 1ZTYA 4GOTA 4NWDA 4EQBA 1A7LA 2XXPA 2ZNSA 3LSXA 1TT1A 1MY2A 3CSBA 4UA8A 4OYVA 3FIRA 3E9XA 3H6TA 4OTEA 4HW8A 2XXXA 3PPNA 3FVOA 5DVJA 3EF7A 3M3LA 3PUWE 1QKAA 3PUVE 3C4MA 4O3BA 1TFDA 4I9DA 1B52A 4Q30B 1XVXA 5H8FB 1XC1A 2O51A 4YICA 1B4ZA 1JVXA 2OBGA 1T0KA 1O63A 3I6VA 5AA4B 4UACA 4E0XA 4EQ9A 3O66A 2I49A 3TUSA 3K6XA 4E0WA 3KSXA 1ANFA 1SW2A 4N07A 1OIBA 1JEVA 3K2DA 1B05A 1MPCA 3FV1A 4DXBA 4ESXA 4EXLA 3HO7A 4GVOA 2F6PA 3AXFA 3H6VA 4DDDA 3BBRA 4NF8A 3FASA 2IA4A 1CB6A 2H9BA 3TYHA 5I59A 2R9JA 4R9FA 1M5BA 4F3BA 4G68A 2XXHA 3QIMA 4LVQA 2I3VA 4YU0A 5I58B 4TLLB 4ELQA 5HM4B 3MP8A 1N84A 1TWYA 1URSA 1YPNA 2NXOA 1B7UA 3W15C 1A8EA 1QVSA 2V93A 5KDTB 2ALUA 4GD5A 1LB9A 3KOTA 1PB8A 1B51A 3C35A 4ISUA 5M2VA 2A5TA 3FVNA 1P1QA 2HXWA 3KBRA 4KR5A 5HBCA 1MS7A 4GL8A 4U2RA 1FQCA 4F3PA 2RCAA 3OSRA 4IY6A 4LP2B 4WEDA 5IAIA 1ZU0A 2GHAA 3UA8A 3DP6A 3E13X 4PETA 5JTYB 1NMUA 2ZXTA 4IGTA 1MH4A 2Z23A 2GFEA 1S9TA 1Y3NA 4XKPA 4JB7A 3OOAA 4R75A 2A5TB 1IEJA 4NF6B 2HAUA 2FNCA 4QFOA 3DELB 3C34A 2V3TA 5H8HA 4MLQA 4QFNA 2YPNA 3T9HB 1PB9A 1VSOA 5B7DA 1MY3A 3K4UA 5TU0A 2ZYMA 2V3QA 1H43A 2I0CA 3H4ZA 1DPPA 4BDQA 1B40A 3E4RA 4ONYA 4RK9A 1EZPA 2UVHA 3FGSA 3CVGA 4I1DA 4U21A 2DWIA 4GXSB 2O68A 4KD5A 3R26A 1PB7A 2NWJA 3ZSFA 4OQOA 4G8MA 5H8SA 3K6VA 2AYSA 3QYTA 4IO7A 1B9JA 1RKMA 3RY3A 5AA2A 5H8NB 3MP6A 2F78A 3IX1A 1LAGE 4YAHX 1FQBA 1FW0A 1MXVA 1YTVA 3ECRA 4AB5A 2F36A 3ZS6A 4JBZA 1XT8A 2E1SA 3UGWA 3PUYE 2XXWA 4YB7A 5DVFA 3SERA 1QUKA 4WEPA 2I58A 3VFJA 4NE4A 3OO7A 1B7ZA 2F5XA 4YKJA 1B1XA 5A5XA 4JDFA 3USDA 4GQOA 1MM6A 3LSWA 1LB8A 1MDQA 2F7AA 1NNPA 4JWOA 1DSNA 5AA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P1OA 3OENA 3TELA 5KCJA 2Z8EA 2PBWA 2V4CA 3T22A 3O2AA 4GXAA 3PTYA 3ZKKA 2ABHA 1HSLA 2DWHA 2X26A 4G68C 3HPIA 2DVCA 4X1DA 4DXCA 4WKMA 3O29A 3G3FA 3RNNA 1TFAA 3TTNA 2DSFA 1SDXA 5CI5A 1IXCA 1SYIA 3T96B 4FORA 1O64A 4AQ4A 1OVBA 1Y4TA 3EHUA 4OZ9A 4NAPA 2XXIA 3QMFA 1CE2A 3MPKA 4XIGQ 3GBAA 3KJ7A 3G3IA 4XTCQ 1YZ0A 1JP4A 1Y1MA 2F3BA 2XXRA 2VD3A 3KZGA 3TAJA 1LCFA 1J1NA 2WBDA 3IJXB 4YB5A 1Q35A 2D5WA 4H6DA 3THIA 3QK6A 4GWYA 4F1VA 3IR1A 1FQEA 3PMWA 3IFCA 4QSEA 2DE2A 2OCUA 2Q2CA 5CM6A 3BIHA 4ZZAA 1I6AA 3IOTA 3V8XB 2DE3A 2G93A 4DE8A 4F39A 2RC9A 1B4HA 1SW5A 4BDMA 4JWXA 1IXHA 1M5EA 3IL1B 3KGCA 2PX1A 1Y1ZA 1IQ7A 1D4NA 5F7VA 2QVUA 2HFBA 2BJIA 3FUZA 4ELRA 1YAEA 4PAIA 1N04A 2O84X 4XKNA 4U4SA 4R74A 5DYHA 1BKAA 5CMCA 2PMSA 1KWHA 4JVCA 1DTGA 3IO6A 5AE4A 4ND9A 2Y7RA 2I4BA 3B50A 2Q88A 4L17A 1OMPA 3G3KA 4OFLA 1ATGA 4ZZEA 4POWA 3HSTA 1LLSA 4IR8A 4NMYA 1IUDA 2Y7IA 5FTIA 4F22A 2WYPA 4ZECA 2DWJA 4GF8A 2ONKE 4TQUQ 4KCCA 4PAFA 3TCFA 5L8DA 3UIFA 1FTAA 3FXQA 3WAEA 4NF4A 2OWSA 2FHYA 3K01A 4YKIA 5I2NA 1INPA 3V89B 5ITOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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