4U4XA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam37 at 1.56 a resolution.
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 90
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4xA02
3HHFA 1XHYA 1XOCA 3K1PA 4OETA 2D5WA 1TWYA 3KJ7A 2E0SA 2H5YA 4X1BA 1MXWA 5B7DA 1FQFA 2V93A 4GWOA 2XXVA 1MXXA 3OMBA 4G8HA 3Q26A 3LSFB 4OXVA 3KN3A 3VLWA 2XXXA 3U1OA 3L6HA 1LAGE 4I1DA 1PB9A 4GF8A 1MXZA 4AB5A 4ELRA 1Z7ME 4YZZA 4NF5A 5DVIA 1Y20A 4POXA 3I6VA 4F3SA 1OVTA 4OHNA 4PFYA 4LVQA 2H99A 2AL5A 2ZYNA 1GVCA 1SDXA 1FW0A 2DXRA 1Y3NA 2ZNUA 4AB6A 2Y7WA 1NNFA 3IX1A 5I59B 4KFQA 3CSGA 2NWJA 3M8UA 3SEWA 4C1UA 4EDPA 4U4XA 2XXRA 4YKPA 3K1MA 4IGTA 3SKPA 1HSLA 3PPOA 2UVHA 4R73A 4YICA 4R74A 3TCHA 1Y3QA 2XXHA 4KQPA 4H65A 4ONYA 4ISUA 5CBSA 2Q2CA 3K4UA 4YMBA 3PUWE 2B3FA 4GFRA 3IAZA 3H3GA 4NTLA 3WAEA 3OSRA 3TTRA 1PB7A 3MBPA 4ESWA 4OEUA 4GQOA 2XXTA 3N6UA 1SW5A 1CB6A 2Q8JA 4OFLA 1URSA 2OLBA 3LUYA 4RA1A 4DDDA 2OK2A 3C4MA 4R2FA 3B6WA 1SYHA 4LQ2A 1US5A 4LP2B 3O66A 3TQWA 1B5JA 5CMMA 3O29A 4YB6A 2NXOA 3FATA 1LCTA 4ZS9A 4QFKA 1I6BA 3O9PA 1OMPA 3O6IA 1MH3A 2DS9A 3TYHA 2GHAA 4THIA 3VLUA 1B3FA 1GV8A 4R75A 4FJPA 4X1DA 3SESA 4BDNA 3LBSA 1EU8A 2VOZA 4PP0A 4MLVA 4R9FA 1MH4A 2R9JA 1WODA 2QL3A 4FIMA 4U22A 4LUBA 3KOSA 4F3BA 1B7ZA 2F7AA 1MS7A 4RXLA 1J1NA 3DP8A 4FORA 5CRYA 5K2YA 1IXCA 3QAXA 1POY1 3ZKLA 1SVXB 4PE5B 2XXWA 3D4CA 1B32A 3QIMA 3PUVE 5ELVA 1MPCA 2F6PA 5EHMA 1WVJA 2YLNA 1DTZA 3KBRA 5KDTA 2A5TA 1JEUA 2FA7A 1Q1KA 3MW0A 1USYH 1BLFA 3PPRA 4ELQA 4JSOA 1IXGA 4F1VA 4E0WA 2O84X 2XHDA 1VSOA 4DIGA 2XX7A 3IB2A 5DEXB 2ALUA 3LSWA 3IOUA 3UA8A 2PYYA 1URGA 2OJTA 4M1VA 2NUVA 5TPAB 5DYHA 1SBPA 2Z8EA 3IO4A 3U93A 4GIZA 5DTBA 4ZZAA 3QUJA 5TP9B 1XVXA 2RC7A 1T0KA 1IEJA 3MZ9A 3T9VA 4XKNA 4GLIA 4H5FA 2DSFA 2HAVA 2Y7KA 3KSJA 3M3LA 1DPPA 1R1NA 3K6UA 3VFJA 5H8HA 2DWIA 2HCAA 2XD2A 3G7WA 5AA2D 2W7YA 2DE3A 2I58A 3K6WA 1LCFA 3A09A 4QFPA 2P0SA 1MY1A 1R6ZA 3CFZA 4OERA 1NL5A 4ZDMA 2F34A 3RN8A 4ND9A 3DM0A 3C9HA 2VP1A 4PQJA 3H03A 3PUZE 2BJJX 4U4SA 2AYSA 3E4RA 2Q9TA 3EN3A 4GOTA 2B3BA 2O6AA 3C33A 1M5FA 2UXAA 4GRKA 2ZMBA 4IO2A 1IZ1A 1LLSA 3BBRA 3L6GA 5DVFA 3G3HA 3THIA 1LFHA 3C36A 4IO4A 4YB7A 5A5XB 2QS1A 2DQVA 4F3GA 5F7VA 1RYXA 3CRBA 3OSQA 4IO5A 5FTHA 5ICQA 3O2AA 3U92A 4F2OA 3RT6B 3C31A 2Q88A 3FJGA 3IORA 3TODA 4RY1A 3TZAA 2PMSA 4GD5A 1B3HA 5H8FA 4PFWA 4F18A 2Y7PA 2RINA 3RT8A 4IO7A 4NE4A 2XX9A 2P1SA 4MF3A 2ZNSA 4P11A 4NF4B 3T9XB 4H67A 3LC8A 1SW1A 1IXHA 4ZEDA 3FD3A 4O3BA 4G68C 3CSBA 3ZSFA 3RUMA 4QFLA 2ZNTA 3SEXA 2XXPA 3JYRA 1NFTA 4YB5A 1IITA 5ITOA 3MP1A 3VXBA 4QHQA 4Z0IA 3PPNA 3CFLA 4TOZA 3HN0A 1MQDA 3V89B 1NNPA 4BLAA 3S2VA 4I8CA 4AQ4A 2D3IA 1NH7A 5A5XA 2RKMA 2O1MA 1NKXA 4JSDA 1SI0A 4EF2A 4TLMB 4HTGA 3UN6A 1DOTA 2QSXA 1Y1ZA 1ZKBA 3Q29A 5L8DA 1VFDA 1N04A 4U1OA 4IGRA 3VXCA 5AE4A 3EHUA 1TXFA 4FAJA 1UTBB 3PUYE 3TKDA 3O97A 3FIRA 3E9XA 2AL4A 4QSDA 5BUUA 2QS2A 3SDFA 4JB7A 4EXLA 2ANJA 2UVIA 3SEUA 2G29A 2Y7RA 4NF4A 4Z7EA 3GLBA 3EF7A 2AIXA 2VD2A 5M2VA 2V25A 3TDJA 4I9DA 2QJEA 1USYE 3G3FA 4NWCA 3K6XA 2PVUA 3V5AA 2O69A 2V84A 3H6UA 2Z23A 5HPQA 3CG1A 4WXJA 1SYIA 3CFXA 3SEVA 4GL8A 4U2RA 4H5GA 1O64A 1WDNA 2DVZA 4OVJA 2Y84A 4BDMA 1IQ7A 2M8CA 3PPQA 2Q2AA 2ABHA 3T66A 4DXBA 3BFUA 3DELB 1QUIA 4RK9A 1OQGA 5IKBA 2XD3A 3VVEA 3KN7A 3KZGA 4GXAA 3FVGA 5CMBA 3TTKA 5ISUA 3N94A 3SEYA 1PBQA 1AL3A 1P1QA 5AA3A 4M4GA 1B7HA 1JEVA 1B9JA 2DE2A 3PMWA 1DTGA 3OO7A 4MBPA 4TLLB 4RNSA 4F29A 1FQAA 3CIJA 3MQ9A 5HBCA 4EXKA 4ZE8A 3GZGA 3V8XB 1LFGA 1TFAA 1HSJA 1JW1A 1MXUA 2UVGA 2GHBA 4G68B 4KYSA 4KCDA 2OWSA 1B3LA 2XX8A 4KCCA 4U21A 3VVDA 3I5OA 2O7UA 2DWAA 5I58B 2O1LA 4JXIA 4R6KA 3HPIA 3FXUA 4OESA 2I0BA 1Y4TA 1N76A 1H43A 1Q35A 3RGYA 4G2ZA 2F8DA 1B6HA 4RPOA 1EZPA 2ONKE 4DXCA 3Q28A 2O7IA 4FE8A 3MVYA 5L9OA 1O63A 2O51A 2REJA 4LZ8A 4NF8B 3GBAA 1ZLQA 1D4NA 4WKMA 4R6YA 5I59A 1MXYA 3KJTA 1FTOA 3H6TA 1B5IA 1MDQA 1H45A 2Q89A 2V3TA 1FQDA 5AA1A 1XS5A 1M5BA 5I57B 4WEDA 3QK6A 2LAOA 1FCKA 3G3KA 5EYFA 3U94A 3TPAA 1P1OA 2RC8A 3B7DA 2Z8DA 1KWHA 1N0TA 5I84A 3B6QA 3ILUB 1TFDA 1PBPA 5H8SA 5EHSA 3C35A 1B51A 1GGGA 1PEBA 4QSCA 3W9WA 3EHSA 1UTHB 5FHMA 4YAHX 4XIGQ 2H25A 3B6TA 1MY0A 4RPNA 4ESXA 3MZ1A 4P0GA 3R26A 1QKAA 3IOVA 4R9GA 3MZBA 5FTIA 1MQGA 2XXUA 4YKJA 1B52A 4GL0A 3IL1B 2DP8A 2X7PA 4NEDA 4ELOA 1IUDA 2H98A 5LOMA 3FVNA 3D4GA 3OO9A 4Q0CA 3O6HA 2THIA 2REGA 1QULA 1YPNA 4GVOA 2DVCA 5ICTA 4HS7A 1Y9UA 2QS3A 3FXRA 3HHGA 1LB8A 4DCXA 3HSTA 5L9MA 2V3QA 5I57A 1YTVA 5B70A 1IXIA 4KYEA 4NWDA 5AA2B 4DE8A 3E13X 1N7XA 1MG1A 2QMWA 2FYIA 3TAJA 2O68A 1MPDA 3A3UA 3GBBA 1OVBA 3OEMA 3TMGA 1OLCA 2QPQA 1I69A 1ZU0A 5FHNA 1RYOA 3IO6A 3F11A 1B3GA 3S9NC 3KG2A 3IR1A 1EH3A 2HZKA 3LSLA 3Q27A 5CM6A 4ZECA 3S9LC 4RK2A 3ZKKA 1MQJA 4PFUA 3K2DA 1AOVA 3V83A 1P1UA 1B58A 4OYVA 3MJNA 5DEXA 3FVOA 3S4UA 2PT2A 5TPAA 1N3WA 2F5XA 3KFMA 3K00A 1LAXA 2QRYA 3N26A 2XXYA 3QUFA 3C32A 2ZYMA 5TP9A 4R2BA 4O3CA 4DCYA 1UIVA 3Q25A 2PX1A 4RJZA 1AMFA 1P1WA 3BFTA 3KN8A 5DT6A 3LR1A 1MPBA 1VFEA 4P0IA 3FXQA 4KHZE 4YU0A 5AA2A 1NMUA 3OXNA 3UP9A 4HW8A 3A3CA 3PV0E 3H06B 1LAHE 4C0RA 4XTCQ 1DMBA 4EQBA 2I4CA 3SERA 3ODBA 3K02A 4XKQA 4OENA 3FV1A 3OENA 1QJMA 1EZ9A 1IIWA 1LSTA 4ZZEA 3TCFA 3UORA 1FQBA 2DE4A 2DOJA 4R6HA 5H8QB 4NF5B 2DWJA 1A55A 2G93A 1ZMGA 4IB2A 2IEEA 3IOWA 2OBGA 4IO6A 2RF1A 2I3WA 1SW2A 3OOAA 4KR5A 3ECRA 5I2KB 3FASA 3MPKA 4JDFA 1QUJA 4G4PA 1S9TA 4HCWA 1A7LA 4X9TA 1B2HA 1S50A 3PD8A 3PD9A 4QFNA 1US4A 1SD3A 1BKAA 4IY6A 4DZ1A 4R72A 3BKIB 1TT1A 4QSEA 1BIYA 2F97A 4YKKA 3T9HB 1URDA 3DP4A 5CC2A 1HSEA 2ZXTA 1FTKA 2ZYKA 1ZBMA 3TUSA 4GXSB 1FQCA 4OMBA 1A40A 3P7IA 4NF6B 2NOOA 1M5EA 4RYAA 2VGQA 2RCBA 3PPPA 2NVUB 1B4HA 1MY4A 1P99A 3KEIA 1QUKA 2WKYA 1B7UA 1MM7A 4BDOA 3TEPA 5H8QA 4DLDA 3PGFA 4EF1A 3TCGA 3S9MC 1B3EA 1DPEA 3DP6A 4KI0E 3OELA 1FQEA 5L9SA 2H4IA 2P2AA 4MLQA 2FNCA 4LA9A 2R71A 4FEDA 4Q8RA 2I6EA 3H6WA 3DLNA 1B1HA 1B46A 2H9BA 5TU0A 4N07A 3U72A 3MP6A 1Y4CA 1UTBA 1ZIUA 1A8EA 3K1NA 1B4ZA 1R9LA 5I2KA 3MWBA 1MY2A 3T9UA 2ZYOA 3USDA 1QVSA 1PB8A 4WEPA 1B1XA 3VE1B 3TELA 3CI8A 1B0LA 2X7QA 3T22A 1GR2A 3KOTA 4ZEIA 2V3UA 1H76A 4BDQA 1N84A 1YAEA 3I3VA 4EQ9A 1MQIA 4G77A 3LSXA 5FHOA 1MY3A 1NH8A 3FV2A 4NF6A 1SI1A 3FVKA 3OD7A 2XXQA 3N6TA 2HQ0A 3UK4A 3HO7A 1PC3A 3IB0A 2ESNA 3TTMA 3C34A 3PMXA 5KDTB 3MVXA 2A5TB 5CMCA 3K6VA 2F36A 3RLFE 4OFJA 1BTJA 2RCAA 4KPTA 4MFIA 4FECA 1I6AA 4F22A 4H8IA 2F78A 1LGBC 4OWDA 2PT1A 4LQ5A 5JK4A 3R7XA 4C1TA 1Z7NE 2QMXA 1VR5A 1QW0A 5J1DA 1CE2A 1NNTA 1SW4A 2UYEA 4ZEBA 4XKRA 2CMOA 4NMYA 4U1ZA 4XKPA 2X26A 3RPWA 4TQUQ 3MC2A 1ANFA 3RY3A 3M3FA 1RKMA 3UIFA 4DXUA 2F7CA 1D9YA 2Y7IA 3FUZA 2I4BA 1ZTYA 1LAFE 3FZVA 3QSLA 1UQWA 2OWTA 4LONB 4X48A 2F7BA 3RTWB 3G3JA 1JW4A 2I48A 2I0CA 4Q5TA 3MUQA 4LATA 2A5SA 4G68A 4JWYA 3ILTB 2R6GE 1H44A 4F2QA 3JV9A 1B40A 4I62A 5H8HB 4LZ7A 5KCJB 3PMVA 1DSNA 4OEVA 1ZJLA 4BDLA 5I58A 4N6PA 1MDP1 3EQ1A 3SETA 2DYXA 3GXAA 1A8FA 1AH5A 1XVYA 4H8JA 1UIUA 3AXFA 1ELJA 4KD5A 2Z22A 2DWHA 3PUXE 3MPLA 1S7YA 2ONSA 1AIVA 1N3XA 3M3KA 1POTA 2UVJA 2GH9A 5BWJA 3TTNA 3G3IA 5K2XA 3TQLA 1R9QA 4E0XA 3U8QA 3TFLA 3MP8A 4UACA 1YCJA 4NF8A 3EPEA 4Q30B 2OCUA 4LZ5A 2F6GA 5KZTA 1MQHA 4ELPA 4QFOA 3RQTA 3CR9A 3T93B 1NNKA 4QRZA 4K3FA 3UGWA 3EHTA 4H0WA 3O6GA 1JW5A 2RC9A 4PETA 1B0HA 1JVXA 3FJMA 1ATGA 3KGCA 1FTJA 1B5HA 2HAUA 5H8FB 3HV1A 5AA4B 3W15C 2HZLA 3ZS6A 5KCJA 1D9VA 4ECFA 1B05A 4UA8A 3MAMA 3IB1A 1H3DA 1UTHA 3QYTA 5CMKA 3VVFA 4F19A 4H1XA 1MXVA 1P1NA 2XXIA 3IOTA 2VHAA 3VLVA 3MVWA 3OO8A 3E3KA 4QF9A 4MH5A 1Y1MA 4U23A 1N7WA 2B65A 1JQFA 5CI5A 4POWA 4F1UA 5H8NB 4KYDA 1LBBA 3OO6A 2QS4A 3H7MA 3T96B 3CVGA 5JEIA 4PFTA 5I2NB 4JBZA 4F39A 2YJPA 3OEKA 4G8MA 1XT8A 4H6DA 1VE4A 1JVYA 2VD3A 1EZOA 4L17A 1I6QA 3W9VA 5JTYB 5I56B 4EUOA 3K0VA 3H6VA 2CZLA 1Y3PA 1F9BA 3N5LA 2UYFA 3IJXB 2E1SA 3KSXA 2PBWA 1LB9A 3FGSA 3PU5A 3VDFA 5DVJA 2D21A 2HEUA 4IO3A 1JETA 1M5CA 4N13A 1MM6A 3O28A 2F35A 3HCQA 3RNNA 1M5DA 4ZEKA 5AA4A 2I3VA 3ONMA 2Z8FA 2I49A 3WAFA 4BDRA 1FTMA 1O7TA 1A54A 3CG3A 1LFIA 1A99A 1II5A 1SQYA 4JWOA 2ONRA 4F31B 4OQOA 2OZZA 4ZE9A 1MRPA 4F1YA 3JZJA 5F1QA 2YPNA 4OFOA 1FTLA 3K01A 3MVZA 4IY5A 3G3GA 5H8NA 5HM4B 3S9EA 4FATA 1QKBA 3TTLA 4EQ7A 4XXUA 1BP5A 1OLAA 5IAIA 3H4ZA 4OZ9A 4G8NA 4YKIA 1OIBA 2HXWA 4OTEA 4HCYA 3R6UA 5I2NA 1GTKA 4ZEFA 1D3KA 3VV5A 2IA4A 3IK6B 5ITPA 4FEBA 1JNFA 3FJ7A 5JTYA 5I56A 4YMAA 1LBCA 1XC1A 2HFBA 1PDAA 2DXYA 5CBRA 4F3PA 3QXMA 1L5TA 2KLFA 4JWXA 2GFEA 2GRVA 3IJOB 1OQHA 3RTFB 4O3AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HHFA 1XHYA 1XOCA 1KA0A 3K1PA 3RYDA 4OETA 2D5WA 1TWYA 3KJ7A 2E0SA 2H5YA 4X1BA 1MXWA 5B7DA 1FQFA 2V93A 2PCRA 4O7IA 4I3YA 4GWOA 2XXVA 1MXXA 3OMBA 4G8HA 4MCOA 3Q26A 3LSFB 4OXVA 1LBYA 3KN3A 3PTYA 3VLWA 2XXXA 3U1OA 3L6HA 1FSAA 1LAGE 4I1DA 1PB9A 4GF8A 1EYIA 1MXZA 2QVRA 4AB5A 4ELRA 1Z7ME 4YZZA 2HHMA 4NF5A 1FPEA 5IZ3A 5DVIA 1Y20A 1NUYA 3GYYA 4POXA 3I6VA 4F3SA 1OVTA 4OHNA 5IZZA 4PFYA 4JVIA 4LVQA 4PE3A 4XF5A 2H99A 2AL5A 2ZYNA 2CEYA 1GVCA 1RDXA 2Y5KA 4PF8A 1SDXA 1FW0A 2DXRA 1Y3NA 2ZNUA 4AB6A 2Y7WA 2FIEA 1NNFA 3IX1A 5I59B 2WYKA 4KFQA 3CSGA 2NWJA 3M8UA 3SEWA 4C1UA 4MNIA 4EDPA 4U4XA 2XXRA 4YKPA 3K1MA 4IGTA 3SKPA 2BJIA 1HSLA 4N6KA 3PPOA 2UVHA 4R73A 3FBPA 4YICA 4R74A 3TCHA 1SPIA 4GWYA 1Y3QA 2QVUA 2XXHA 4KQPA 4H65A 4ONYA 4ISUA 5CBSA 2Q2CA 4QBAA 3ROJA 4N4UA 3K4UA 4YMBA 3PUWE 2B3FA 4GFRA 3IAZA 3H3GA 4NTLA 3WAEA 3OSRA 3TTRA 1PB7A 3MBPA 4ESWA 4OEUA 4GQOA 2XXTA 2VPNA 3N6UA 1SW5A 1CB6A 2Q8JA 4OFLA 1URSA 2OLBA 3LUYA 4RA1A 4DDDA 2OK2A 4NGUA 3C4MA 4R2FA 3B6WA 1SYHA 4LQ2A 1US5A 2JJKA 4LP2B 3O66A 3TQWA 1B5JA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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