3KJTA

Stimulation of the maltose transporter by a mutant sucrose binding protein gives insights into abc transporter coupling
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGLFGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFYAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVYALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli k-12
publication title Studies of the maltose transport system reveal a mechanism for coupling ATP hydrolysis to substrate translocation without direct recognition of substrate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kjtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kjtA01
1HSEA 1MY1A 2Z8DA 2XX9A 1SW1A 3KFMA 3UGWA 4F1UA 2VHAA 4IO6A 4YKIA 1MY0A 4G2ZA 4KR5A 2V25A 4QFOA 3L6HA 1D4NA 4FJPA 1DTZA 1UQWA 4EQBA 1B40A 1B4ZA 3I6VA 3VVEA 2F97A 1MXYA 2IEEA 2O68A 4OTEA 4X48A 2HQ0A 4WXJA 4C1TA 3PUXE 5H8HA 5CBSA 4M1VA 2UXAA 4NE4A 1SW5A 3QAXA 4EQ7A 4DXBA 1JW4A 2DP8A 3O29A 4OENA 2VP1A 4JSDA 4KI0E 1FTKA 4JWOA 3TKDA 3KOSA 2AYSA 4H5FA 1B9JA 4ZE9A 3MP1A 4YKKA 3M3KA 1ZMGA 4IO5A 2P2AA 3HCQA 1FW0A 1XOCA 1MQJA 5CM6A 5DVJA 2RC9A 2R6GE 3IL1B 4KYSA 4GOTA 5ICQA 4FATA 5A5XA 3U72A 2DVCA 5DVIA 2HCAA 4R2BA 5H8SA 1PBQA 3H06B 2O69A 2I58A 2B65A 1PB8A 3ONMA 2UVGA 3OOAA 4RK9A 4GFRA 3DELB 3RY3A 5H8NB 1EZOA 2E0SA 1FQEA 3PUYE 3SKPA 3C34A 3U93A 3OMBA 2X7PA 2RCAA 1MXUA 3M3FA 5AA2D 2GRVA 3PPNA 3C33A 3EQ1A 4QSDA 3FXRA 2XD2A 5K2YA 4F18A 5TP9B 3I5OA 4P0GA 1QW0A 1VR5A 4UA8A 2Q88A 2ZYNA 3DP8A 3QSLA 3ODBA 4FEDA 1FQBA 2UVHA 4GLIA 5CI5A 4YB6A 2RCBA 4OYVA 4F3BA 5I59A 4XKQA 3TCGA 1T0KA 5AE4A 2REJA 4N07A 1ZJLA 2H98A 4ZE8A 3H6WA 3K4UA 5ITPA 1EZPA 3VLUA 1HSJA 4JB7A 5H8FA 3FUZA 2XHDA 4LP2B 4KYDA 2QL3A 2UYEA 1LFIA 2V84A 4ZEDA 2DXYA 4R2FA 4FECA 4X1BA 4P0IA 4MBPA 3LSLA 3BFTA 4DDDA 3MP8A 5L9OA 3OO6A 3GZGA 1QUIA 3EHUA 4LQ5A 3MJNA 3IK6B 3SDFA 5ICTA 2E1SA 3IR1A 5LOMA 4F29A 3HHFA 4DCYA 3ZS6A 1NH7A 1O64A 2NXOA 3EPEA 1FQDA 1LAHE 4I9DA 2X26A 3V89B 1QUKA 3IORA 3PPPA 4G77A 1RYOA 1YAEA 5I56A 4FIMA 3S4UA 4TOZA 4GL0A 3TCHA 1AOVA 3B7DA 3C35A 3PGFA 1YPNA 1MG1A 2RINA 4K3FA 2VD3A 2ONSA 4LONB 4F1YA 2G29A 2H9BA 3E13X 4KPTA 2AIXA 5K2XA 2OWTA 4NF4A 1R6ZA 3IO6A 4OEVA 1URDA 1MH3A 1QULA 3SEVA 2Q8JA 1OLAA 3EF7A 2ABHA 3KGCA 4PP0A 5KZTA 3OO8A 3PPQA 1JW5A 2ZYKA 3U94A 3K6VA 4I1DA 4R74A 3IB2A 1D9YA 1S9TA 4RYAA 3TFLA 4U21A 2I49A 2F7BA 1SYIA 2R9JA 1MXWA 3JYRA 4JSOA 3M3LA 4QFLA 1M5EA 4H6DA 4OFOA 1FTLA 4GIZA 1VFDA 4YMAA 3QYTA 4EF1A 3C9HA 2RC7A 1B3GA 1B5HA 3MUQA 2PVUA 4ONYA 1JEVA 3I3VA 3M8UA 4HW8A 1DOTA 3THIA 1GTKA 2P0SA 3VDFA 3P7IA 4OFLA 1Y9UA 5TU0A 4OESA 1B52A 3FXUA 2H99A 5I59B 1HSLA 2F7CA 4EXLA 3FVOA 4EF2A 1M5FA 4X1DA 1MH4A 2Q2AA 3G3JA 5CMKA 3TTLA 3VVDA 1MY2A 3GLBA 3C32A 1MY3A 2NWJA 2DS9A 2DE4A 3R26A 1I6QA 1VFEA 1A7LA 4G8NA 4IO7A 4F3GA 4F2QA 3VE1B 3KJTA 3MZ9A 2F78A 1YCJA 3B6TA 5CRYA 1DSNA 1B7HA 1D3KA 1XVYA 1CB6A 4H0WA 1ELJA 4UACA 3IOTA 4RJZA 1SW4A 3RNNA 1M5CA 3EHSA 1P1QA 4U2RA 3EN3A 1SDXA 3WAFA 3S9NC 5H8NA 3E4RA 3T9HB 3MVWA 4ZZAA 1ZU0A 2XXIA 3L6GA 1IXHA 3UORA 1FTOA 1B3LA 1SI1A 3LR1A 5FTHA 4DIGA 4L17A 2XXRA 3C31A 2QSXA 5TP9A 2GFEA 3KJ7A 2I4BA 3K0VA 1CE2A 2GH9A 3VLVA 3E9XA 3SERA 3TZAA 2QRYA 1H44A 1MXXA 3CFLA 5ELVA 3H6TA 2OBGA 2FYIA 4DLDA 3D4CA 3RN8A 4F2OA 2Q89A 3CR9A 3MPKA 4ELQA 4LATA 3K1PA 3PUVE 1B5JA 3KSXA 1UIUA 2P1SA 4NTLA 3FJMA 4C0RA 2XXQA 1OIBA 3CSGA 3FV2A 2YLNA 3U92A 3O6GA 3W15C 4I8CA 1GR2A 3TQLA 4ZEBA 4NF8B 1SD3A 4DCXA 3A3CA 1AIVA 4TQUQ 4TLLB 1NL5A 3TYHA 2O84X 3HV1A 1Z7NE 3BFUA 1R9QA 4F31B 3PPOA 5DEXB 1SI0A 5KDTB 1H3DA 2QMWA 2O7UA 5ITOA 4DXUA 3TELA 1B51A 3T9XB 1TFDA 1YTVA 4ZECA 3CVGA 4POWA 1OVTA 2FA7A 4R6HA 1Z7ME 2FNCA 1SQYA 3QIMA 3Q27A 4LUBA 3W9WA 3RPWA 3KN8A 4RPOA 2Z22A 3PD8A 3S2VA 3R7XA 5AA3A 1Y4TA 5AA1A 3G3KA 4H8JA 2WKYA 3KEIA 3IOUA 4H67A 4R73A 5H8QA 2I3VA 1TWYA 1A99A 4NF5A 4MFIA 3U1OA 2PBWA 4KCCA 2F6PA 1ZLQA 3O6HA 1QKBA 4OZ9A 2XXHA 3VV5A 1AMFA 1RKMA 1P99A 2NOOA 3PMWA 3FJGA 1L5TA 2M8CA 2DWIA 4U1OA 3RQTA 2XXYA 4F22A 1GVCA 2I4CA 2REGA 3FVKA 3SEUA 4H1XA 3T66A 1LGBC 2Y7KA 3QUJA 3KOTA 2V3UA 2XD3A 2Y7RA 4YB7A 4IGRA 1QVSA 4YKPA 3GXAA 4HS7A 3LSFB 3LSWA 4QHQA 1UTHB 1PDAA 3HN0A 3B6WA 3DP6A 3USDA 1IEJA 2DWAA 4KD5A 4U4SA 3C4MA 4XTCQ 3MPLA 1OLCA 5FHOA 5AA2B 1M5BA 1JEUA 3FVNA 2QS1A 1GGGA 2OLBA 2YPNA 5CMBA 5JTYB 2O51A 2F35A 2VOZA 3IAZA 1P1UA 3Q28A 1B4HA 3B6QA 1B6HA 1XS5A 3QK6A 5AA4B 3KSJA 3D4GA 3H6VA 3VXBA 4XKPA 1B2HA 1N3WA 5CBRA 4JWYA 3SEXA 3OXNA 2Q2CA 5TPAB 3RGYA 2UVIA 1ZKBA 1B32A 3F11A 4I62A 5M2VA 2XXXA 2V3QA 4R9FA 5L9SA 5ISUA 3ILTB 4ZEKA 2DE3A 4RXLA 2CZLA 3EHTA 2XXPA 4YKJA 3K6WA 5KCJB 3IB1A 4QRZA 3MVXA 1SBPA 1EH3A 3RTFB 1QJMA 4BDLA 1MDQA 2PX1A 4ISUA 1H43A 1US4A 1RYXA 5FHMA 1JVXA 4G68C 3IX1A 1VE4A 2Q9TA 3U8QA 4XKNA 2ZNUA 2OZZA 3A3UA 4F3PA 2XXTA 2V93A 4OMBA 1Y3QA 1BLFA 2QJEA 2OK2A 1MQDA 4XIGQ 4GXAA 3ECRA 5H8QB 4GVOA 2W7YA 4E0XA 4NF5B 3H4ZA 3CI8A 4BDMA 1O7TA 3GBBA 1A40A 3O66A 4YAHX 4NMYA 3OSQA 2ESNA 3GBAA 3OO9A 2PT1A 4IGTA 5F1QA 2AL5A 1EZ9A 3H6UA 1MDP1 1BIYA 3DM0A 3MP6A 5HPQA 4IY5A 1JW1A 1ATGA 1IXCA 4KYEA 4Q5TA 3T22A 1QUJA 4QFKA 2H25A 2RKMA 3KBRA 4YICA 4NF8A 1NKXA 4GL8A 4RY1A 3T93B 1S50A 2RF1A 3CG3A 1OMPA 2B3FA 4PE5B 5DEXA 4OEUA 5KDTA 3O6IA 3AXFA 1PBPA 1N3XA 1DPPA 2PYYA 1FQFA 2I3WA 3G7WA 4QF9A 1USYH 3PV0E 2ANJA 1IXGA 3FATA 4FORA 2THIA 4GXSB 2I48A 4N13A 1B0HA 2G93A 1FCKA 3FASA 4KHZE 2F36A 5IAIA 1TT1A 2DE2A 1MQIA 1B58A 3K02A 4M4GA 4O3AA 2HAVA 1A8FA 1FQAA 3CSBA 2ZMBA 5I2NA 4XKRA 5EYFA 3IJOB 4ESXA 5DYHA 3SEWA 1DMBA 3H3GA 1VSOA 4WEPA 1P1NA 1LB9A 4KCDA 3MQ9A 3G3FA 4MLQA 4POXA 1GV8A 5I57B 3TMGA 4JBZA 4OFJA 5HBCA 1POY1 5IKBA 1J1NA 5L9MA 4IB2A 3OD7A 4O3BA 1NMUA 1N0TA 1UTHA 4F1VA 4Q8RA 3CG1A 4WKMA 3MVYA 3FD3A 1MXZA 4OVJA 4ECFA 1N84A 1F9BA 5AA2A 3IOVA 1H76A 1SW2A 2XXWA 4PQJA 1N7WA 4XXUA 4H65A 4MH5A 2QS3A 5JTYA 3H03A 3IOWA 3TCFA 4BDQA 2A5SA 1M5DA 2PT2A 1R9LA 2XX7A 5AA4A 3O2AA 4AB5A 4H5GA 1R1NA 1NNKA 4G8MA 4QFNA 3PPRA 5J1DA 1FTMA 1MS7A 5TPAA 3C36A 3K1MA 3FIRA 1WVJA 1AL3A 1AH5A 1MM6A 2KLFA 2DWJA 4PETA 2XXUA 1WDNA 1USYE 2GHAA 4BDNA 4OQOA 3IO4A 1POTA 5CC2A 5F7VA 4RPNA 4PFUA 2VGQA 1MPDA 1Y20A 4LVQA 1FQCA 3MWBA 5KCJA 1I6BA 1B3EA 2ZNSA 1MY4A 1UTBA 4IO3A 1PB9A 1LB8A 1Y4CA 3LSXA 3RTWB 2ALUA 4TLMB 1OVBA 1PC3A 4U1ZA 1TFAA 3K01A 3BKIB 1IXIA 4R72A 3HO7A 1QKAA 3QXMA 4P11A 2XXVA 4U4XA 2DWHA 3OSRA 4G68B 3UIFA 3FVGA 3O97A 3Q25A 4PFTA 2DQVA 5JK4A 4Q30B 3N26A 4ELOA 3IB0A 1EU8A 3N5LA 2NVUB 2QPQA 1FTJA 4FE8A 1DPEA 5I2NB 3LBSA 1B05A 5DT6A 4GF8A 1B0LA 3VVFA 4YMBA 3OELA 3N94A 4R6YA 3MC2A 3TUSA 4EQ9A 3T9UA 1B7UA 4LZ8A 3LUYA 1UIVA 4U23A 1NNTA 2PMSA 4ZZEA 3S9MC 3PMXA 5EHMA 5B7DA 3DLNA 3N6TA 3FV1A 3FJ7A 1LAXA 3UK4A 1O63A 1LFGA 2Z23A 1MPCA 1MQHA 4GWOA 1B3HA 2VD2A 3TDJA 1B5IA 3RT6B 3TODA 5I84A 4JXIA 5JEIA 3T9VA 5BUUA 3FXQA 2HFBA 4MF3A 3SESA 4YU0A 4ZDMA 2V3TA 1MQGA 3MW0A 3ILUB 1Y1ZA 4ZEFA 1S7YA 1XC1A 5I58A 4QSEA 2ZYOA 3VFJA 3TQWA 3N6UA 5I2KB 3CRBA 4HCYA 3OENA 4BDRA 4YZZA 1PB7A 2H5YA 2GHBA 2Y7PA 1MRPA 2I6EA 5CMCA 4R6KA 4EXKA 2D3IA 2DSFA 3V83A 1P1OA 1NFTA 3LC8A 4THIA 4G4PA 1LSTA 2Y7WA 1H45A 4Z0IA 3E3KA 3TTRA 1SVXB 3O9PA 4X9TA 3H7MA 3MAMA 2YJPA 2A5TB 1I6AA 1B1HA 2QMXA 1URSA 1A54A 3PUWE 3SETA 1ZTYA 3VLWA 5B70A 5I57A 1UTBB 2RC8A 5DTBA 4DZ1A 3TEPA 4KQPA 4ESWA 3UA8A 4BLAA 3OO7A 3MZ1A 2F34A 3V5AA 3RUMA 2AL4A 3Q29A 2Y84A 3FGSA 3S9EA 1JVYA 2HZLA 1LAFE 2ZNTA 4R9GA 4LQ2A 4NF6A 1A55A 3PMVA 4LZ5A 4ELPA 5H8HB 3IJXB 4AB6A 2UYFA 1XVXA 1LBBA 4NEDA 4Q0CA 1N7XA 4LA9A 4N6PA 1JNFA 2ONKE 3DP4A 3KN7A 4OERA 3HSTA 3R6UA 3OEMA 3V8XB 4R75A 3QUFA 4IY6A 1B3FA 4NWCA 1WODA 3HPIA 1Q35A 2NUVA 1I69A 1LCFA 3PD9A 3O28A 1MPBA 4PFYA 3CFXA 3ZSFA 5FHNA 3W9VA 1IQ7A 3UP9A 2F8DA 1LBCA 4LZ7A 2LAOA 2HEUA 1LCTA 4U22A 5A5XB 2D21A 3KN3A 4MLVA 4RA1A 1XHYA 2UVJA 3G3IA 3TAJA 3TTKA 1BTJA 1SYHA 4F19A 4G8HA 3CFZA 1MXVA 3G3HA 2I0CA 2F7AA 5FTIA 2OCUA 3OEKA 2CMOA 3KZGA 1NNPA 2Z8FA 2D5WA 3FZVA 4FAJA 3RLFE 3T96B 3BBRA 4ND9A 1D9VA 1KWHA 4JDFA 1US5A 1ZIUA 2Z8EA 4Z7EA 2H4IA 3JV9A 1N76A 4DE8A 1JQFA 2IA4A 1A8EA 5I58B 4O3CA 1NNFA 3K6XA 2O6AA 2ZXTA 3TTNA 5EHSA 4GD5A 4IO2A 4ELRA 3ZKKA 4G68A 1Q1KA 3WAEA 4AQ4A 4HTGA 3G3GA 3K6UA 1IZ1A 4OXVA 3RT8A 4BDOA 1XT8A 1IUDA 5DVFA 2DXRA 2QS2A 2Y7IA 1B7ZA 4ZS9A 2B3BA 4EDPA 2X7QA 1ANFA 4RK2A 2DVZA 2F6GA 4IO4A 1B46A 2QS4A 3TTMA 3S9LC 3A09A 1LAGE 4H8IA 5H8FB 1P1WA 1LLSA 1ZBMA 1TXFA 4QFPA 3TPAA 1B1XA 4WEDA 3Q26A 2HXWA 3K00A 4OETA 2ONRA 3K2DA 3ZKLA 1OQHA 2HAUA 2O1LA 2DYXA 3UN6A 4NF6B 1IIWA 2OJTA 5HM4B 4JWXA 1BP5A 1MM7A 4F39A 4OWDA 1LFHA 3PU5A 3CIJA 4GRKA 4NWDA 1Y3NA 1BKAA 3HHGA 1IITA 2O7IA 1Y1MA 2OWSA 4E0WA 4C1UA 1URGA 1PEBA 1JETA 3JZJA 5BWJA 5L8DA 2BJJX 3K1NA 1Y3PA 4PFWA 3VXCA 5I56B 4ZEIA 5I2KA 1OQGA 2F5XA 2O1MA 4FEBA 4YB5A 2ZYMA 2DOJA 5CMMA 4GQOA 4DXCA 2R71A 4QSCA 1DTGA 4OHNA 4KFQA 1II5A 3PUZE 1N04A 4EUOA 4HCWA 3MZBA 4RNSA 2HZKA 3MBPA 2XX8A 4NF4B 4F3SA 2A5TA 3KG2A 3SEYA 1NH8A 3MVZA 2I0BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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