3KJTA

Stimulation of the maltose transporter by a mutant sucrose binding protein gives insights into abc transporter coupling
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGLFGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFYAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVYALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Studies of the maltose transport system reveal a mechanism for coupling ATP hydrolysis to substrate translocation without direct recognition of substrate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli k-12
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kjtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kjtA01
1ELJA 1MXXA 2HAUA 2ONSA 4IO2A 2P0SA 3JV9A 1SI1A 2V3UA 4DXUA 4EQ7A 4QFPA 5AE4A 1UTHA 4OFJA 3T9XB 1BIYA 3QUJA 3OEKA 5LOMA 5I2KA 3A09A 3T93B 3H3GA 4KHZE 2OJTA 3ILTB 5AA2D 3H6TA 2YLNA 3KJ7A 2F7CA 3PPNA 5L9MA 3PUVE 3C9HA 1I69A 2Q2CA 4UA8A 4TOZA 1TXFA 2Y7RA 2Q8JA 3K2DA 2ONRA 3QSLA 5H8FB 3C36A 2GHBA 3E3KA 3OOAA 3FVKA 4OYVA 2Z8FA 1POY1 4I8CA 5I57A 3G3FA 3FV2A 4QSDA 2Z8EA 4LZ8A 4OHNA 3FATA 5B70A 1OQHA 2AL4A 5AA4A 3VV5A 3PUXE 2BJJX 4GFRA 1IUDA 3DELB 1P1WA 1XC1A 1LBBA 4QFOA 1ZU0A 2GRVA 3MZ1A 3E9XA 2YJPA 3MVWA 4RPOA 3OENA 4IO6A 3V89B 1DPPA 2UYFA 2Q88A 4BLAA 4G8NA 2IA4A 4RNSA 1Y4CA 4YICA 1MXVA 3EQ1A 1JW5A 2O84X 3H03A 2UVJA 3TODA 1DPEA 3O29A 1MY0A 2XXTA 4FEDA 4QFLA 4EQBA 1LB8A 2OCUA 1B1HA 4FECA 1B7HA 3TUSA 5M2VA 4PQJA 1B40A 4TLLB 3MW0A 3SEXA 4PFYA 4DCXA 3PPRA 1IITA 1Z7ME 2M8CA 5A5XA 4EF1A 3MVXA 2O1LA 4FE8A 3O6IA 4NMYA 5B7DA 1LFHA 1DTZA 2XXRA 1EZPA 4ZE9A 3PPOA 4ZECA 1M5CA 1SW1A 1OVTA 2DWAA 1NH7A 1NL5A 3H6WA 2ZYKA 4O3AA 4EF2A 5FTHA 2D5WA 1B5IA 1N3WA 3CSBA 2PBWA 1LGBC 3LBSA 1SBPA 2FYIA 4R74A 4GL0A 2QPQA 5I2NA 4QF9A 2Y7KA 3T96B 3Q25A 2GHAA 2F8DA 4FIMA 1B51A 1OQGA 2VGQA 3TZAA 4ESWA 1MQGA 3DM0A 1JEVA 3ZS6A 4N07A 4XKPA 4IGRA 4G4PA 4GF8A 4PP0A 1N0TA 2ZNSA 1SI0A 3T9UA 3OO8A 2THIA 3SESA 1Y1MA 1ZIUA 3OO7A 4Q0CA 3TFLA 1FQAA 3MVZA 3O66A 2F5XA 1B58A 4C0RA 4LATA 4GWOA 1N84A 5CC2A 4KI0E 3L6HA 1GGGA 5JEIA 3KG2A 3MPLA 5L9SA 3IX1A 4ZEFA 2A5SA 4ZZAA 1BTJA 2O7UA 4ZE8A 1H3DA 3LSXA 1A40A 5I58A 4FEBA 3LUYA 3TCGA 5I56B 1P1UA 1UIVA 2HZLA 2F35A 1JETA 3CFLA 4DDDA 3VXBA 1B5HA 3OXNA 2DWHA 2ZYOA 2D3IA 1N04A 3TEPA 2ZXTA 5H8NB 1B32A 2RKMA 4H5FA 3IB0A 4LQ5A 4LA9A 4YKIA 1TT1A 5I59A 2Y7IA 1ZLQA 1MY2A 2DXYA 4MLVA 5F7VA 1MPDA 3U93A 4U21A 4ZS9A 4LQ2A 1M5BA 4NF8B 4H8JA 4RPNA 3ONMA 4G77A 1MM7A 4THIA 2XXHA 4BDNA 1OLCA 2ZMBA 2XXXA 5AA3A 4NWCA 4EXKA 1B0HA 1H76A 3FXQA 4YMAA 4F3BA 2HAVA 2I0BA 2G93A 3G7WA 1BP5A 1MPBA 3PPPA 4F1YA 3CI8A 4AB5A 5DTBA 1MQHA 3FJGA 4F2QA 3T22A 1N7XA 2QMXA 3TKDA 1VSOA 4R6YA 3HN0A 4WEDA 2DQVA 4P0GA 2QSXA 5TP9B 1GR2A 4C1UA 3HSTA 1MH4A 1JW4A 5FHMA 4N6PA 4F22A 3ZKKA 4P11A 1UTBB 1D9YA 3GXAA 3FVGA 2HZKA 3O6HA 1NKXA 1URGA 2DE4A 5AA2B 4IO5A 2F6GA 5ICTA 5CRYA 2DYXA 3C4MA 4H67A 2XXVA 3SETA 1M5EA 5CBRA 3KGCA 3KEIA 2CZLA 1LAHE 3I5OA 4HTGA 4F1VA 1FW0A 4JWXA 3HHGA 5DYHA 3TCHA 3K4UA 3V8XB 5EHSA 4ELQA 4EDPA 3VLUA 2DE3A 1IIWA 1XOCA 4G8MA 1S50A 2OZZA 3VDFA 3H7MA 3QIMA 3VVFA 4XKRA 5ICQA 3O6GA 1FQDA 3CG3A 1FTLA 4JDFA 1XVXA 5IKBA 3DLNA 2O51A 2R71A 5JTYB 1Z7NE 3TYHA 5IAIA 1Y1ZA 3DP4A 3V83A 4YKPA 4C1TA 3SEWA 3C31A 1SVXB 3G3JA 3K6WA 3LSLA 3TMGA 3S2VA 4PFTA 1FQCA 4ELOA 4OENA 1DOTA 1UIUA 3SKPA 4LP2B 2UVGA 1FCKA 3I3VA 3N6UA 5CMBA 1Y9UA 4YMBA 2UVIA 2I4BA 3R7XA 3H6UA 4G68A 2DP8A 1MPCA 3FD3A 3FXUA 1A99A 3PGFA 3B6QA 4NF6A 4IO7A 3Q29A 3C35A 5H8HA 1VFDA 4TLMB 2PMSA 1VFEA 1O7TA 4XTCQ 4DZ1A 1HSLA 3JZJA 1URDA 1SW5A 2DVZA 3C33A 3IOWA 4MF3A 1EU8A 2VD2A 3WAEA 4BDMA 1B7ZA 5K2YA 3OSQA 1EZOA 3PD8A 1JVYA 4RYAA 2HFBA 3PPQA 2QS1A 4F3PA 4E0XA 1B3HA 1P1QA 1ANFA 3K1MA 3RGYA 4O3BA 4WKMA 3FVNA 4NF4A 3FIRA 1IZ1A 3VXCA 4RXLA 3IB2A 3TAJA 1LBCA 4MFIA 3K1PA 2NWJA 4ND9A 1NNTA 1EZ9A 4G2ZA 1ZTYA 4F29A 1LLSA 3R6UA 4GIZA 3S9LC 4JSDA 4KFQA 1FQEA 3MBPA 2I6EA 4IO3A 1USYE 2V84A 3K0VA 4POWA 3G3GA 4I9DA 3K6UA 1II5A 4U2RA 3S9EA 1QVSA 4KYSA 5L8DA 2GFEA 3U1OA 4GQOA 1JNFA 2VOZA 3PU5A 1XS5A 3O2AA 3MC2A 4R2BA 1LFIA 2OBGA 3C34A 4XKNA 2QRYA 1DMBA 3MP6A 2OWSA 3FV1A 4GVOA 3L6GA 5H8FA 4OXVA 1MXYA 3EHTA 1AOVA 4UACA 1Y3PA 2HCAA 1A8EA 1B5JA 1HSEA 4F3GA 2ZNTA 3IO6A 3Q26A 1B05A 1I6BA 3TTRA 2PT1A 3UORA 2I0CA 4KCDA 3USDA 3IK6B 3K6XA 1SYIA 4F2OA 1LCTA 3KJTA 4X9TA 2Z8DA 2ONKE 1NFTA 5EHMA 5BUUA 3H06B 4R75A 3FGSA 4H5GA 4KR5A 1Q35A 1AMFA 1VR5A 3MPKA 2P1SA 5DVIA 3KN7A 4Z0IA 4RK9A 1R1NA 4ECFA 5L9OA 4H8IA 4U4XA 2B3FA 5I58B 2A5TB 3B6TA 1LFGA 1GTKA 1HSJA 5KCJB 3N94A 4H65A 1MQJA 1H44A 3DP6A 1WVJA 1BKAA 4OQOA 4GXSB 1FQBA 3FJMA 2QS2A 2O1MA 1CB6A 1IQ7A 3HPIA 3D4CA 4RY1A 1RKMA 2B65A 1A7LA 2OK2A 3H6VA 5DEXB 3MAMA 4OFOA 4R9GA 1TWYA 4I1DA 3N6TA 3MZ9A 4YB5A 1XVYA 2XXPA 1YAEA 3PMXA 2F6PA 3R26A 4KPTA 3THIA 1FTMA 2GH9A 5TU0A 4POXA 2RC8A 3GBAA 2F7AA 2D21A 2NUVA 2DS9A 2V93A 1MRPA 1N76A 3BFUA 3RT8A 1FTJA 4M1VA 4JWOA 4ESXA 1NMUA 3CRBA 4U4SA 3HCQA 1A54A 4PETA 4P0IA 5HM4B 1IXGA 4EUOA 3IAZA 4LUBA 3IOVA 4F39A 3ILUB 1B0LA 1RYOA 4NF5B 3TCFA 1AIVA 3IL1B 5CI5A 4OERA 3HHFA 5CBSA 4TQUQ 2I58A 3KFMA 2RC7A 4OZ9A 3T9HB 5DVJA 4H6DA 4MLQA 4ZDMA 1LAGE 1M5FA 2ZNUA 4DCYA 1LAFE 3IOTA 4OETA 4G8HA 3G3IA 4KCCA 3E13X 3RQTA 3HV1A 1US5A 3G3KA 4LVQA 2H25A 3ECRA 2AL5A 2DWJA 2KLFA 2PT2A 3H4ZA 3HO7A 4FAJA 1MH3A 4ISUA 4GXAA 5KZTA 2ALUA 5KDTB 3CFXA 3S4UA 3MJNA 1MDQA 2ZYMA 4EQ9A 2F7BA 1RYXA 4QRZA 1D3KA 1FQFA 4DLDA 3KOTA 3BBRA 4HS7A 1QJMA 1SD3A 4JB7A 1SDXA 1A8FA 1B3EA 2RF1A 1AH5A 1TFAA 1BLFA 1QUIA 2CMOA 1MXUA 1FTKA 3OMBA 4OWDA 2UXAA 1PDAA 3RNNA 5ELVA 4H0WA 4JWYA 3Q27A 3UIFA 4YZZA 3ZKLA 3N26A 5I56A 1UTHB 1ATGA 4IB2A 4GLIA 4LONB 3LC8A 1MDP1 1AL3A 5TPAA 4BDOA 5I2KB 4IO4A 5I84A 2Q2AA 3M3KA 1QKAA 5ISUA 1B1XA 3QAXA 2REJA 4OEVA 4JBZA 3TELA 3IR1A 4PE5B 5H8QA 1B3LA 3PMWA 1F9BA 4DXCA 1PB8A 4N13A 4MBPA 2OLBA 3UK4A 1OLAA 4F1UA 1YCJA 4NEDA 4NF8A 1WODA 3RN8A 4JXIA 3EHSA 1R9LA 1MG1A 3MP1A 3E4RA 2X26A 5I57B 1H45A 4ZEDA 1I6AA 2DWIA 5J1DA 4IY5A 4YAHX 5DT6A 1B52A 3PUYE 3CR9A 1MY1A 5AA4B 4Z7EA 4U23A 1B3GA 1OVBA 4XXUA 3W15C 1M5DA 3U94A 1LB9A 4XIGQ 5TP9A 3K01A 3V5AA 3FJ7A 1UTBA 2H99A 4YB6A 3O28A 4U22A 5FHOA 1MQDA 5AA2A 3S9MC 1ZKBA 1GV8A 1D4NA 1SW4A 1URSA 2E1SA 3VE1B 5EYFA 1WDNA 1B2HA 2DSFA 4ZEKA 2O6AA 3PUZE 2Y7WA 1YPNA 2H4IA 4ELRA 3W9VA 2V25A 1PBQA 3QUFA 2O68A 2I49A 4OEUA 2XX7A 5BWJA 2F34A 3KZGA 3MWBA 2P2AA 4QSEA 1LCFA 4E0WA 4F3SA 1EH3A 1OMPA 3KN8A 1Y20A 2RINA 3FUZA 5A5XB 3TTMA 3GLBA 2H98A 4BDRA 5FHNA 5JTYA 4R9FA 1S7YA 5ITOA 3TQLA 1VE4A 4GD5A 2ESNA 1LSTA 5CMCA 3PD9A 1SW2A 3RUMA 3IJXB 4QFNA 2XHDA 1MQIA 4PFWA 4FATA 2WKYA 2HQ0A 4ZEIA 1PB7A 1I6QA 4GOTA 4OVJA 3TTLA 1Q1KA 1Y3NA 3G3HA 2XD3A 1J1NA 4NWDA 4RA1A 1IEJA 4LZ7A 3EHUA 2RCBA 3MP8A 5K2XA 2XD2A 3IB1A 3JYRA 3W9WA 4X1BA 3OSRA 5I2NB 3IJOB 3MUQA 2NXOA 4KYEA 1Y4TA 3LSWA 4RJZA 3K00A 2I4CA 1PC3A 1B3FA 2Z22A 3UN6A 2RCAA 1SYHA 2I48A 4DE8A 4HW8A 1LAXA 3MQ9A 4U1OA 5HBCA 5FTIA 4DIGA 2AIXA 1NNKA 5CMKA 4Q5TA 3M3FA 1L5TA 1JEUA 1B6HA 2NVUB 2I3WA 3UP9A 4OFLA 3U92A 1JW1A 1QW0A 1CE2A 1XHYA 2R6GE 1N3XA 1O64A 3IOUA 1JVXA 3T9VA 3A3UA 4R6KA 3FZVA 1MS7A 3UGWA 3ODBA 3EN3A 4LZ5A 4DXBA 2DVCA 2W7YA 3VLVA 3S9NC 2F78A 3N5LA 4QHQA 2HEUA 2PVUA 2R9JA 4BDQA 3QYTA 4K3FA 1US4A 2VP1A 2QS4A 5CMMA 3EF7A 4YU0A 2XXIA 2FA7A 4QFKA 1GVCA 2UVHA 4OESA 1B9JA 4U1ZA 4R2FA 3AXFA 5I59B 2B3BA 2F97A 4F31B 5HPQA 1B46A 1TFDA 3CSGA 2IEEA 3EPEA 3TDJA 4X1DA 2V3QA 1Y3QA 3C32A 4H1XA 4FJPA 3WAFA 3LSFB 4Q8RA 1ZBMA 3IO4A 3FXRA 1MXZA 2QL3A 2Z23A 3KN3A 4QSCA 2DOJA 2G29A 2X7PA 4RK2A 2E0SA 3FASA 3TTNA 2DE2A 3PUWE 1P1NA 1T0KA 3SEYA 3RTFB 1N7WA 1YTVA 2HXWA 3SEVA 4F19A 3PV0E 3SEUA 3TTKA 1B4ZA 3KBRA 4WXJA 2H9BA 5CM6A 3MZBA 3U8QA 5AA1A 1QKBA 1B4HA 3I6VA 2PYYA 3GBBA 3BKIB 5JK4A 1ZJLA 1QUJA 1NNPA 5ITPA 4OMBA 1OIBA 3FVOA 4XKQA 3GZGA 2V3TA 2YPNA 4MH5A 2A5TA 2QMWA 2FNCA 4NTLA 5KCJA 2F36A 3RY3A 1H43A 2X7QA 5TPAB 1B7UA 3K02A 1PB9A 3CG1A 3KOSA 2XX9A 1NH8A 2Q89A 3UA8A 3B6WA 4ONYA 1POTA 1DSNA 5H8QB 3BFTA 4YKJA 1D9VA 4L17A 4FORA 1QULA 1USYH 3VLWA 3KSXA 5DEXA 5F1QA 2VHAA 2Y84A 3T66A 2ANJA 4IY6A 2O69A 3TQWA 2Q9TA 3OEMA 1IXCA 2QJEA 4R6HA 1S9TA 4Q30B 1NNFA 1PEBA 1KWHA 3IORA 2PX1A 3SERA 3VVDA 1R6ZA 3OD7A 2Y7PA 5DVFA 3VVEA 3LR1A 2RC9A 2I3VA 3K6VA 4YB7A 4GRKA 2XXWA 3OELA 1QUKA 2DXRA 2VD3A 4WEPA 3DP8A 3D4GA 3CIJA 3RTWB 4OTEA 4I62A 4M4GA 3B7DA 3QK6A 4G68B 2QS3A 1IXHA 4NF5A 3OO9A 3M3LA 1SQYA 2AYSA 4O3CA 4PFUA 3SDFA 4NF6B 5H8NA 3O9PA 3CFZA 5H8HB 4NE4A 2LAOA 1MY4A 1P99A 1DTGA 3P7IA 4AQ4A 3RT6B 5H8SA 4KD5A 3M8UA 2ZYNA 4IGTA 2UYEA 4EXLA 3RPWA 1MXWA 2REGA 5KDTA 1MM6A 1JQFA 4YKKA 3ZSFA 3QXMA 4G68C 2XX8A 3O97A 4GL8A 3PMVA 3K1NA 4HCYA 4BDLA 1PBPA 3A3CA 3KSJA 2H5YA 3MVYA 3RLFE 4ZEBA 4NF4B 1ZMGA 1O63A 3Q28A 1FTOA 1R9QA 4R73A 4ZZEA 2ABHA 4HCWA 4ELPA 3F11A 4AB6A 4R72A 2XXUA 1UQWA 3CVGA 2XXQA 2OWTA 2NOOA 3OO6A 4JSOA 1A55A 3VFJA 2O7IA 1P1OA 4KYDA 3U72A 4KQPA 3TPAA 2XXYA 4X48A 1MY3A 1IXIA 1XT8A 4F18A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ELJA 1MXXA 2HAUA 2ONSA 4IO2A 2P0SA 3JV9A 1SI1A 2V3UA 4DXUA 4EQ7A 4QFPA 5AE4A 1UTHA 4PAFA 4OFJA 3T9XB 1BIYA 3QUJA 3OEKA 5LOMA 5I2KA 3A09A 3T93B 3H3GA 4KHZE 2OJTA 3ILTB 5AA2D 3H6TA 2YLNA 3KJ7A 2F7CA 4I3EA 3PPNA 5L9MA 3PUVE 3C9HA 1I69A 2Q2CA 4OVRA 4UA8A 4TOZA 1TXFA 2Y7RA 2Q8JA 3K2DA 2ONRA 3QSLA 5H8FB 1FBCA 3C36A 2GHBA 3E3KA 3OOAA 3FVKA 4OYVA 5I7IA 2Z8FA 1POY1 4I8CA 5I57A 3G3FA 3FV2A 4P56A 4QSDA 2Z8EA 4LZ8A 4OHNA 3FATA 5B70A 1OQHA 2AL4A 5ET7A 5AA4A 3VV5A 3PUXE 5ET8A 2BJJX 4GFRA 1IUDA 3DELB 1P1WA 1XC1A 1LBBA 1FSAA 4QFOA 1ZU0A 3E78A 2GRVA 3MZ1A 3E9XA 2YJPA 3MVWA 4RPOA 3OENA 4IO6A 3V89B 1DPPA 2UYFA 2Q88A 3A29A 2L5VA 4BLAA 4G8NA 2IA4A 1IMEA 3PTYA 4RNSA 1XI6A 1Y4CA 5IZ3B 3LUZA 4YICA 1MXVA 1EYKA 3EQ1A 1JW5A 2O84X 3H03A 2UVJA 3TODA 2B4MA 1DPEA 2VT5A 3O29A 1MY0A 1KZ8A 3D1RA 2XXTA 1NUXA 4FEDA 4QFLA 4EQBA 1LB8A 2OCUA 1B1HA 3B8BA 4FECA 1B7HA 3TUSA 5M2VA 1EYIA 4PQJA 1B40A 4TLLB 3MW0A 3SEXA 4PFYA 4DCXA 3PPRA 1NV2A 1IITA 1Z7ME 4HE1A 2M8CA 5A5XA 4EF1A 3MVXA 4O8MA 2O1LA 4FE8A 4PFBA 2FIEA 3O6IA 4NMYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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