1S7YA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core in complex with glutamate at 1.75 a resolution orthorhombic form
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: Molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 precursor
total genus 86
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s7yA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s7yA02
4XXUA 5EYFA 3MP1A 2D21A 4XKQA 1MS7A 3GXAA 4RPNA 4R73A 3ECRA 4UA8A 1B9JA 4U21A 3KGCA 2F5XA 4F29A 3B6TA 1O64A 1Y4TA 4NWDA 3QYTA 2IEEA 2HCAA 4EDPA 4U1OA 4R2BA 2I48A 4O3BA 3MZ1A 2OLBA 3LSWA 4F1YA 4GD5A 2E1SA 4NF5A 3N5LA 2THIA 2KLFA 5FHOA 5KDTB 3LSLA 1N84A 3SEWA 3SEYA 1ELJA 4R75A 1H45A 2I0CA 4JWYA 3OXNA 3MAMA 3V89B 3IJOB 1ZLQA 1MY4A 3O6GA 3VE1B 3EHUA 2DVZA 1R9QA 2HAVA 3PUVE 4Q5TA 3MVXA 3G3FA 3IK6B 3OEMA 3TZAA 3DP4A 3TDJA 3MVZA 4NF4B 4ZEFA 3DLNA 5I59A 1MXUA 4EQBA 3ZSFA 1Y3QA 4JSOA 4OEVA 2O7IA 4DIGA 4PE5B 4IO7A 4GF8A 1NMUA 5JTYB 2VHAA 2FA7A 3EPEA 3G3GA 1WVJA 3C32A 4KYEA 4GXSB 2AL4A 3O97A 2UVGA 1I6AA 3BFUA 2F6GA 3MBPA 5CMCA 4MLVA 2WKYA 4NF5B 5H8HA 1NNTA 4GL0A 4FAJA 4R2FA 1EZ9A 2ZYOA 1IEJA 5F1QA 1B3HA 2QPQA 3H7MA 4G2ZA 3LC8A 2XX9A 3E13X 1B3LA 1I6BA 1UTBB 3K02A 4KD5A 1MH3A 1VR5A 1PBQA 1QULA 4I62A 4NMYA 1BIYA 3R26A 1GTKA 4ZDMA 3B7DA 2F8DA 4MBPA 1HSEA 5H8FA 1QUIA 2Q8JA 3OELA 5I58A 3C9HA 3HO7A 4K3FA 3U72A 4H1XA 5TP9A 3OSRA 4OXVA 4NF8A 3RGYA 2Q88A 3DP6A 4OERA 1AOVA 4P0IA 5CMBA 4RPOA 3THIA 3N94A 3PPPA 1NKXA 5H8SA 4PQJA 4IGRA 4YB5A 5B70A 4IO5A 3OO7A 5I2KA 1B7ZA 3S2VA 1US4A 1B5JA 3V8XB 3FV1A 2E0SA 4R72A 2X26A 3K6VA 2Y7PA 3VLUA 4POXA 3HN0A 4ELOA 3C35A 2DXRA 1IXHA 2AIXA 1M5DA 3L6GA 4Z0IA 4JWOA 3TYHA 4H0WA 1FW0A 1DOTA 4G68C 1MY1A 2H9BA 3TQWA 1LAHE 2NOOA 1OLCA 2LAOA 3ILTB 3RY3A 3IR1A 1H76A 2XXTA 4L17A 1B4ZA 1FQAA 3M3FA 3P7IA 1QKAA 3CRBA 3PPOA 3HV1A 1Y3PA 3M3KA 2ESNA 4NF8B 4E0WA 3O6IA 2AYSA 2XXVA 3KOSA 3O29A 1DMBA 4U1ZA 2RINA 2OZZA 1LFIA 1B0HA 2PBWA 4JXIA 4R9GA 1D3KA 4LVQA 1DTGA 2F36A 5FTHA 4YKIA 3H3GA 5ITOA 4XKPA 2VOZA 4ISUA 2Y7KA 2I3VA 3PMXA 2V3QA 4RK9A 3S9EA 1B6HA 1A7LA 3O28A 4N6PA 3K6XA 3U8QA 1B0LA 3IAZA 2ZNTA 1ZIUA 4PFUA 5CRYA 1I6QA 4H8IA 1EU8A 3T9UA 4YKKA 1LFGA 1R1NA 1FQEA 4F18A 1US5A 4EXLA 1IITA 1Z7NE 4F39A 4EQ9A 3K1PA 3KN7A 3UP9A 4ESWA 2REGA 3SETA 5CMKA 1FQCA 1POY1 4QRZA 3VVEA 4QFNA 4OFJA 2R9JA 3BFTA 1HSJA 5H8QB 1BP5A 5I84A 5HM4B 3HPIA 1LSTA 5ELVA 1MPBA 4EF1A 4HTGA 2H99A 3K1NA 3TTKA 5I57A 1SW1A 3FD3A 5ICTA 3T9HB 4FORA 4G4PA 5FTIA 1R6ZA 3LUYA 2F7BA 3KFMA 4GFRA 4ZEDA 2B3BA 5ICQA 3A3UA 4F1VA 3PPRA 1M5FA 2PT1A 3CFZA 3SESA 4YKPA 2O84X 4MF3A 3K6WA 4OZ9A 3C31A 5JEIA 3W9VA 1B40A 2UVHA 4F2OA 1P1WA 1PB7A 1YCJA 2XXRA 4KPTA 3K4UA 4X9TA 2OCUA 4FE8A 1P99A 2Y7IA 2O1LA 1LCFA 3H6VA 3FATA 2O6AA 3OD7A 2I4CA 1UTHA 3TMGA 3PGFA 3VV5A 1PEBA 1URGA 3TTRA 1VFEA 3VLWA 4QFKA 3IO4A 2P1SA 1NH8A 3RT6B 1O7TA 3C36A 3KG2A 4M1VA 4N07A 3K2DA 3EHSA 3EN3A 5L9SA 1PB8A 3HHFA 3BBRA 1KWHA 2CMOA 3TCHA 3FVGA 2YPNA 5B7DA 3ZS6A 3HHGA 2A5TB 2Y84A 1MXXA 3G3HA 4RK2A 1Y20A 1MH4A 3PPQA 4X1DA 4ELRA 1ATGA 2X7PA 4KQPA 2V25A 4OFOA 4IO2A 3FXUA 1FQDA 4XKNA 4FECA 4FATA 1B3GA 1RYOA 1XVXA 4KYSA 2YJPA 5DTBA 2XXUA 4PFTA 4ZE9A 1LFHA 2D3IA 3U92A 1QKBA 4JWXA 1VFDA 3HSTA 1DPEA 3TCGA 3EF7A 2ANJA 2DOJA 3UIFA 1B1XA 1TFAA 4DXBA 3S9LC 4ZECA 4QF9A 3VLVA 2QMWA 4GIZA 1ZMGA 1MPCA 4BDMA 2Z22A 4AQ4A 2UVIA 4I8CA 1MRPA 4WXJA 1A40A 4JSDA 3CSBA 4NE4A 1PBPA 2QRYA 1Y1MA 2GHBA 1OLAA 2DQVA 3SEXA 3PMVA 2V84A 4LQ2A 1JQFA 4WEPA 3T66A 2HEUA 4X48A 3KOTA 2ZMBA 3FGSA 4BDRA 4M4GA 3UA8A 4NF6A 3CG1A 1SW5A 5DEXA 3RPWA 1MXYA 3A09A 2XHDA 3OMBA 2XX7A 2DE3A 3QXMA 1VE4A 4KCDA 3FZVA 1MQJA 2O1MA 2ZYNA 4N13A 4KI0E 1P1OA 2V3TA 3TFLA 1XVYA 3LR1A 2XXIA 4OFLA 3ONMA 1N76A 1PC3A 1SW2A 1B7UA 1XC1A 4DXCA 1FTMA 3K00A 4EXKA 3W15C 2ZNSA 3LSXA 2HZLA 1IXIA 1H43A 1MG1A 3KEIA 3MPLA 3KBRA 4QSEA 3RT8A 4F3BA 3CI8A 3QK6A 4G8HA 4R6HA 1MQHA 2P2AA 3WAEA 3N26A 3IOWA 2OWSA 4H8JA 1LGBC 1IIWA 1R9LA 5HBCA 4OTEA 4I1DA 2ONSA 1URSA 4U23A 4HW8A 4PETA 3L6HA 3MP6A 2Y7WA 5ISUA 5A5XA 4WKMA 3MC2A 2QMXA 2UXAA 1XOCA 2QSXA 1PB9A 2F78A 3MJNA 4YB7A 3IB2A 3SEVA 3O66A 4GOTA 5I59B 1ZTYA 1YPNA 3D4GA 5DVFA 3PV0E 1FTLA 2QS4A 1A55A 1SBPA 1Q35A 1JVYA 3OSQA 4F19A 1F9BA 1DSNA 1S7YA 1NNKA 3WAFA 3ODBA 1JW1A 2RKMA 4Q8RA 3Q27A 2V3UA 3IOVA 1XHYA 2Z8FA 3DP8A 3PD9A 4ND9A 3G3JA 3BKIB 2AL5A 3OO9A 4LP2B 2PYYA 1JW5A 4ELQA 3S9NC 2O51A 3GZGA 3B6QA 3UK4A 5TPAA 5H8NA 1P1NA 1SI1A 5H8HB 4ZZAA 2PX1A 3Q28A 4JDFA 4OMBA 3MZ9A 1MM7A 1T0KA 3OENA 2P0SA 1JEVA 4FEDA 1LLSA 4RY1A 3T9VA 4R9FA 4JBZA 1B51A 1TT1A 1DPPA 4H6DA 3IJXB 3G3KA 3LBSA 2M8CA 1NFTA 1AIVA 3Q29A 2NVUB 2D5WA 1N7WA 2REJA 1B7HA 3ZKKA 4PP0A 3QSLA 2OK2A 5H8FB 3MPKA 4RJZA 5I58B 1ANFA 1EZPA 1S9TA 4WEDA 3E4RA 3A3CA 1FCKA 1MDP1 3OOAA 5TP9B 2UYFA 3IOUA 1GR2A 2I49A 3MVWA 4DE8A 4EF2A 2DE2A 2O7UA 2XXHA 4QFPA 2GFEA 2DVCA 4THIA 2OBGA 3H6WA 1OVTA 4EQ7A 5I2KB 2HZKA 4ESXA 1BTJA 3IL1B 2X7QA 5TPAB 1MXZA 4YMBA 3TTNA 1MQDA 4AB5A 3IB1A 2Z8EA 4OVJA 3SERA 4F31B 3O2AA 4XTCQ 3SKPA 1HSLA 4IY6A 2O68A 1TXFA 3Q25A 4G8MA 3TODA 4I9DA 2F6PA 1NNPA 4G77A 5HPQA 1N04A 5CM6A 1P1QA 2VD3A 4ZS9A 1QUKA 1MDQA 3KSXA 5CBRA 2FNCA 4YB6A 1UQWA 1GVCA 3MW0A 4LA9A 1MM6A 2B65A 1URDA 4ZEKA 3RN8A 4ZEIA 1B1HA 2Q2CA 3QAXA 3PUYE 4EUOA 1OVBA 4YMAA 3I3VA 3Q26A 3KJTA 3GBBA 3FVOA 3CFLA 3ILUB 1DTZA 2QL3A 4YICA 3MWBA 1CB6A 4LATA 1FQBA 5L9MA 2PT2A 5AE4A 1YAEA 1L5TA 3DM0A 1SW4A 1B3FA 5CBSA 5DYHA 4DDDA 1EZOA 2I4BA 4LUBA 3EHTA 5BUUA 3H6TA 1IUDA 3FXQA 4YKJA 3H03A 2DSFA 4YZZA 4OETA 2VGQA 1GV8A 1LCTA 4F1UA 3UGWA 4KR5A 2BJJX 3K01A 5I56A 3GBAA 1MXVA 3HCQA 3PD8A 1MQGA 5AA1A 1MXWA 4P0GA 2DYXA 2FYIA 1VSOA 3CG3A 1JNFA 4FJPA 2GH9A 1USYH 3E3KA 4QSCA 1Q1KA 4ZEBA 4OESA 3C4MA 3FVKA 2Q9TA 5KDTA 4QSDA 1Y1ZA 2NWJA 5IKBA 3VDFA 1B52A 1JETA 4OQOA 4RXLA 1AL3A 3CSGA 4MFIA 1BKAA 5I57B 1M5BA 4LZ7A 3O6HA 1SDXA 4TQUQ 1D4NA 4ZZEA 4AB6A 2RC7A 5AA2A 1LAFE 2OWTA 4BDNA 1II5A 5BWJA 3VVDA 4TOZA 4NF4A 1M5EA 1FTKA 2QS2A 2VD2A 1NNFA 1SYHA 1QJMA 4HCYA 4PFYA 4DCYA 3IOTA 2RC8A 3C33A 5JTYA 3U1OA 5I56B 1PDAA 4QFOA 3OEKA 3OO8A 2G29A 2XXYA 3ZKLA 2I0BA 3TCFA 3U93A 1ZKBA 5I2NA 5DVIA 5J1DA 3QIMA 1N3WA 1B32A 4DXUA 2ZYMA 5LOMA 1NH7A 1UTHB 3CVGA 4MLQA 5CMMA 1B05A 1JVXA 2NUVA 3V5AA 1IZ1A 2G93A 3FJGA 3USDA 3O9PA 2Z23A 3RNNA 1OQHA 3KJ7A 1LB8A 5K2XA 2UYEA 2F35A 2RC9A 1UTBA 4QFLA 4R6YA 4QHQA 1P1UA 3SEUA 1IQ7A 1B2HA 3JYRA 3VXCA 3FASA 1B58A 2ALUA 2R6GE 4GL8A 5AA2B 2F97A 3FJMA 3FV2A 1QW0A 2XX8A 2XXQA 3FIRA 1A8EA 2ZXTA 5KCJA 4DLDA 1GGGA 3AXFA 1ZBMA 3FVNA 4GLIA 3CR9A 4F3PA 1MQIA 2NXOA 3T96B 5I2NB 3UN6A 2DWJA 4R74A 1S50A 3W9WA 1ZU0A 1BLFA 2DWHA 2H4IA 2RF1A 4KHZE 5M2VA 1Z7ME 2W7YA 1FQFA 4GRKA 3QUJA 3JV9A 3RUMA 1YTVA 1MY0A 4F2QA 4KCCA 4FEBA 3RTFB 3M3LA 2HAUA 2H98A 4NTLA 3KZGA 2DWAA 4O3CA 2ABHA 1I69A 1SVXB 2I3WA 4BLAA 1LAXA 3TKDA 4NF6B 2PVUA 4H65A 3T93B 3UORA 4GQOA 5DEXB 1D9YA 3GLBA 1MPDA 5DVJA 4KFQA 4GWOA 4OEUA 2F7CA 4RA1A 4JB7A 1POTA 5KCJB 3OO6A 1LB9A 1N0TA 3VVFA 3S4UA 4NEDA 3H6UA 4X1BA 2I6EA 2PMSA 1LBCA 3TTLA 3N6TA 4RNSA 3I6VA 3TPAA 3R7XA 4BDOA 1IXGA 1QUJA 4XKRA 2DWIA 3PUZE 3G3IA 2QS3A 4UACA 5ITPA 1N7XA 1SI0A 1USYE 1UIUA 4YAHX 3TEPA 3N6UA 5CC2A 5IAIA 1JEUA 3QUFA 3K6UA 3PUWE 4U2RA 2RCAA 3T22A 4OWDA 2QJEA 4ECFA 3MVYA 2XXXA 1WODA 5EHSA 4BDLA 3KN3A 5TU0A 5DT6A 2V93A 1N3XA 3MP8A 1OMPA 4G68A 2GHAA 1RKMA 5A5XB 3TELA 4TLLB 5JK4A 4FIMA 1OQGA 4O3AA 4LZ5A 1ZJLA 1EH3A 1CE2A 2F7AA 1IXCA 1B5IA 4H5FA 1H3DA 3PUXE 1M5CA 4U4SA 1SQYA 3PMWA 2QS1A 3G7WA 1H44A 1TFDA 5AA2D 1WDNA 3S9MC 2XXPA 1Y3NA 1NL5A 4IY5A 3FXRA 1A99A 5KZTA 3KSJA 5CI5A 5H8QA 3SDFA 4LONB 5FHNA 4E0XA 5H8NB 2CZLA 1A8FA 2Y7RA 4LQ5A 3IB0A 3E9XA 3TAJA 1B4HA 4G8NA 2O69A 3IO6A 1A54A 2GRVA 2HQ0A 2Q89A 3H4ZA 2B3FA 3RTWB 4ZE8A 1AMFA 4F3GA 5K2YA 4DCXA 4TLMB 1O63A 4Q30B 4XIGQ 5AA4A 2OJTA 1SD3A 4U22A 2I58A 4G68B 2YLNA 4Z7EA 4RYAA 1B5HA 5FHMA 1D9VA 3V83A 1J1NA 2HFBA 2DXYA 3MQ9A 3PU5A 4C1UA 4HCWA 4Q0CA 1FTJA 4DZ1A 2ZNUA 3FJ7A 3M8UA 5AA3A 1LAGE 2DP8A 2A5SA 3IORA 4OHNA 3D4CA 4IGTA 3I5OA 4C0RA 3F11A 2XD2A 2H5YA 4P11A 4HS7A 1XT8A 4ELPA 1QVSA 1MY3A 1FTOA 2Z8DA 1B46A 4IO3A 3K0VA 1AH5A 2ONRA 3TTMA 2Q2AA 4IO6A 5EHMA 5F7VA 4ONYA 4BDQA 2H25A 3EQ1A 3T9XB 4GVOA 2ONKE 3RLFE 4POWA 2F34A 1B3EA 1Y9UA 3MZBA 3PPNA 3LSFB 3U94A 3H06B 3RQTA 2A5TA 2RCBA 2ZYKA 1SYIA 5AA4B 1UIVA 4R6KA 4MH5A 2HXWA 1RYXA 2XXWA 3JZJA 4LZ8A 2DS9A 4H67A 2IA4A 3TUSA 1MY2A 1OIBA 3DELB 3VXBA 3VFJA 3CFXA 3KN8A 4H5GA 2UVJA 4OYVA 3C34A 3K1MA 4F3SA 4OENA 5L8DA 1JW4A 3TQLA 4C1TA 1LBBA 1XS5A 1TWYA 1Y4CA 4GXAA 2DE4A 3B6WA 3IX1A 3R6UA 2XD3A 4F22A 4U4XA 3FUZA 2VP1A 3MUQA 4NWCA 4IO4A 4PFWA 4KYDA 2R71A 5L9OA 4YU0A 4IB2A 3CIJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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