1H43A

R210e n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIEESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 83
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h43A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h43A02
2VP1A 2DVCA 1B3GA 4IB2A 5DVIA 4O3BA 2PMSA 1USYE 2F34A 3TTLA 4F2QA 1ZBMA 5H8HB 2RKMA 4OTEA 1PBQA 2R71A 2QS4A 2V25A 2HXWA 4RXLA 4I9DA 3PU5A 4KR5A 3S9EA 3IL1B 4OXVA 1IIWA 3Q25A 1B32A 2GHAA 2HFBA 4H8IA 1A7LA 3S4UA 3PPRA 4TQUQ 2R9JA 4O3CA 3VFJA 2H98A 2QPQA 1IXCA 4FEBA 3O6GA 3QAXA 3DLNA 3C36A 3IB2A 4G8HA 4GLIA 2I48A 3G3HA 3HPIA 4XIGQ 1LGBC 1NNPA 4F19A 5I59B 1JQFA 4RPOA 2NXOA 1O64A 2QRYA 4KPTA 3KN8A 4ESXA 4N6PA 4F3PA 3T93B 5TU0A 2AL4A 3RN8A 3DELB 1I69A 2ONKE 5H8NA 1MY4A 3SETA 4XKNA 4BDMA 1QUKA 1QJMA 3MVXA 3MPLA 1MM7A 2NWJA 4FIMA 4OHNA 1H43A 4BDLA 4RPNA 3TTKA 2PT2A 3KOTA 4QFPA 3MZBA 4YB5A 4JB7A 3V8XB 1B1HA 2F6PA 3GZGA 3AXFA 2UVIA 4U1ZA 2AYSA 3CIJA 5H8NB 1FCKA 5I58A 4EQ9A 4OERA 3TMGA 3TFLA 3LSFB 4IO6A 3IK6B 3O28A 3RT8A 1Y20A 3P7IA 4U1OA 1FW0A 4QFNA 1BP5A 4RK2A 3FATA 4AB5A 1XT8A 4FORA 3JV9A 5FTIA 2BJJX 4G68A 2X7QA 4FEDA 1TFDA 4FJPA 3N94A 3LUYA 1MY2A 2DOJA 4LA9A 2PYYA 1R6ZA 4XKQA 4N07A 3G7WA 5I58B 1UTHA 4JDFA 3N6UA 1I6QA 1UIVA 3HSTA 1MPBA 1LAGE 4GXSB 2Y84A 5B7DA 1Q35A 2NOOA 4LQ5A 2M8CA 4G68B 1TWYA 3PD8A 2A5TB 4R72A 3K6XA 1O7TA 4ZEBA 4DCXA 3OEKA 1B3EA 2ZXTA 1IITA 1MQJA 5CC2A 4PETA 1D9YA 3LBSA 4EUOA 2VD2A 3EF7A 4NF6A 1B3HA 4RK9A 2V84A 1SVXB 3MP6A 3S9LC 1BKAA 4DZ1A 2XXXA 3A3CA 2FYIA 3I3VA 1D4NA 3ILUB 1YAEA 4R6KA 5AE4A 3GXAA 1H76A 1J1NA 5ICQA 4IO5A 1PB9A 3R26A 2ONRA 4POWA 4XXUA 1EZOA 3PGFA 2I0CA 3ILTB 1MY0A 2Z8DA 3I5OA 1MRPA 2ANJA 3TAJA 3LSLA 3PUZE 4NF6B 4X1BA 5L8DA 4IGTA 1QKAA 1GGGA 3TZAA 1MQGA 3RT6B 2H99A 4PQJA 1T0KA 3MW0A 5TP9A 4DDDA 1OIBA 3TYHA 4FECA 3R7XA 3OOAA 1UTBB 2Q2CA 1NNFA 2UXAA 3K2DA 4LUBA 4R73A 3V89B 1PBPA 4ESWA 4KYDA 3PD9A 1B40A 1P1NA 1B5JA 1MDQA 3Q29A 3LR1A 4NE4A 3W15C 3FJMA 4R9GA 5AA3A 2QSXA 2DWJA 3U72A 4WEPA 4NEDA 4X9TA 2H4IA 1N0TA 5TP9B 4OFJA 3FV2A 3DP8A 2F36A 3VVEA 3OSQA 4KCDA 3RGYA 3MVWA 4ZEFA 5ITOA 5CMCA 3PUXE 1M5BA 3H6TA 2H9BA 4GWOA 3HV1A 1N76A 2D21A 5A5XA 1JW4A 1O63A 3K02A 4NF8A 4TLLB 4F1YA 2CZLA 3MP1A 4R6YA 4KCCA 4F3BA 3VV5A 4PFYA 4G2ZA 1Z7NE 4I62A 1IXGA 3UN6A 1B5HA 1S7YA 3USDA 2XXYA 2AIXA 1FQAA 1PB8A 2DP8A 1H3DA 5AA4A 2UVHA 3EPEA 3C9HA 3R6UA 2AL5A 1HSLA 5A5XB 4OQOA 4OENA 3FZVA 4NF8B 3RTWB 3W9VA 1PC3A 3RPWA 1B0HA 4QSCA 1R1NA 5KCJA 1FTLA 4E0XA 2DVZA 5BUUA 5DVJA 3MBPA 4QRZA 4H67A 4Q30B 3B7DA 2OJTA 5ELVA 3RY3A 5AA2D 2HEUA 3FVOA 5JTYA 2O7UA 1I6BA 1XVYA 3WAEA 2I6EA 3VDFA 3EHTA 2XXRA 5AA4B 3HO7A 1EZ9A 2XXTA 3SERA 4OEVA 5KCJB 1NL5A 2ALUA 2XXVA 3LSWA 4OWDA 3CFZA 2DQVA 4IO4A 1ZIUA 1FTJA 1MH3A 4PFUA 4F18A 4F3GA 2E1SA 4NF5A 2G29A 3K4UA 3JYRA 4YMBA 3PPNA 1P99A 4ZE8A 3IO4A 4LZ5A 3L6HA 4R2BA 4L17A 3QUFA 1ANFA 3PMXA 4R75A 4H6DA 1YCJA 4G68C 4YKJA 3FV1A 3FD3A 3OO8A 5ICTA 1B52A 3C33A 4G8MA 1Q1KA 3VVFA 2Z8FA 5FHMA 2DWAA 2V3TA 4ZDMA 3ZKLA 3E13X 2HAUA 3HHGA 3OMBA 2Y7WA 1N3XA 2O84X 4E0WA 3CVGA 1EH3A 2DXRA 3T9XB 3MQ9A 4NF5B 1POTA 1N7XA 2V3UA 2F7AA 4JWXA 4F22A 2YPNA 3IORA 1Y1ZA 4ISUA 1XHYA 2ZYNA 1AH5A 3VLWA 1B9JA 1H44A 4KQPA 3Q28A 4R2FA 5LOMA 3PPOA 3PV0E 2ONSA 3ZS6A 3RUMA 3VXCA 2X7PA 3MC2A 2Q2AA 2FA7A 2ZNSA 4BDOA 4HTGA 5TPAA 5I2NA 3KGCA 4KI0E 1SI0A 3MVZA 4TOZA 3C4MA 4OYVA 1JVYA 5B70A 4PFWA 4N13A 3FVGA 4H5FA 3VE1B 4ZE9A 2I58A 3Q26A 5HM4B 5I2KA 1IEJA 4OESA 3H03A 1N04A 2XHDA 3MUQA 4RA1A 1MXXA 2I3WA 3SEWA 1P1QA 1SW1A 1DOTA 3TDJA 3VLUA 1NKXA 1FQBA 3IJOB 3DM0A 1B2HA 2Q9TA 1TXFA 3O2AA 2DS9A 1Y3PA 5K2YA 3THIA 1MM6A 4LVQA 5I84A 1JEUA 3UORA 3BFUA 3VLVA 3K6WA 2XXQA 3CRBA 2QS2A 5H8SA 3T9HB 4TLMB 1RKMA 4NTLA 1H45A 1FTOA 4DXCA 5M2VA 3O9PA 5JK4A 2ZNUA 3A3UA 3M3LA 2GHBA 2V93A 1QW0A 1MG1A 4NF4A 2I49A 3IJXB 4JSOA 5IAIA 4H65A 4OFOA 4ELRA 3OELA 5FTHA 5FHOA 3O66A 1B3FA 1EZPA 1VR5A 3LC8A 3TQWA 1QVSA 2HZKA 3O6HA 4ELOA 1B4HA 1A55A 4MBPA 3UIFA 2QS3A 4RNSA 4QFKA 1MQDA 4ZEKA 4DE8A 4YB6A 1URGA 1PB7A 3MP8A 4NF4B 1NFTA 4JWOA 2Q8JA 1D9VA 1FTMA 1CE2A 1ELJA 3OD7A 3UK4A 3O6IA 4H5GA 3QUJA 3B6WA 4PP0A 3KSXA 1LAHE 3PUWE 4H0WA 4GL0A 4XKPA 3TPAA 2OBGA 3F11A 1BTJA 1B1XA 1UTHB 1VE4A 4ZEDA 1IUDA 1P1OA 1GTKA 3PMVA 1I6AA 3G3KA 4H1XA 3RNNA 4MF3A 4X48A 3TTNA 1B7HA 1LBCA 4MLQA 1SW4A 4LATA 3KSJA 2RC9A 4GIZA 1DPEA 3TTMA 3IB0A 1JW5A 3SEYA 1A99A 1B7UA 3KEIA 2Y7RA 4BDQA 4ZZEA 1A8FA 2DE2A 2RCAA 2I4CA 1FQEA 3L6GA 1ATGA 1N84A 3FGSA 5H8QA 4HCYA 4OFLA 3PUVE 4ND9A 3PUYE 1HSEA 1R9LA 3QK6A 3W9WA 3QXMA 4G77A 4HW8A 3H6UA 5ITPA 5EHMA 4F1UA 1EU8A 4Z0IA 3OO7A 1OLCA 1FTKA 3QYTA 3TKDA 3SEVA 3K6UA 4LZ7A 2KLFA 3ZKKA 1OQGA 4IGRA 2O51A 1OLAA 3TEPA 1LB9A 5H8QB 1MXYA 2UYEA 1POY1 1XC1A 3E9XA 5KZTA 2THIA 5DEXA 1LAXA 3CSBA 1AOVA 5BWJA 4MH5A 4KHZE 1WDNA 3S2VA 1DSNA 1S9TA 1YPNA 4GFRA 2ZNTA 1B46A 1CB6A 2I0BA 1S50A 3CSGA 4OVJA 2Z23A 4GVOA 2O1MA 4YZZA 1L5TA 2Q89A 1NMUA 2F35A 3TUSA 3LSXA 3C34A 4O3AA 2PT1A 2YJPA 1QUIA 3WAFA 3SESA 3H6VA 1B7ZA 2O68A 2ZMBA 3HCQA 1MXUA 1WVJA 4IY5A 4RY1A 4GL8A 2RF1A 1JNFA 4WKMA 2XXUA 1Z7ME 4UA8A 2QJEA 2RINA 3T9UA 5CBSA 4C1TA 1B05A 4DIGA 4OETA 4FE8A 4ONYA 2P0SA 1DTGA 2OK2A 4BDNA 3ZSFA 1MXWA 3IOTA 5EHSA 5I56A 2B3FA 3N5LA 4YMAA 1URSA 3MJNA 2XD3A 1BIYA 4OZ9A 1IXHA 2RC7A 3OENA 5H8FA 2P2AA 1II5A 3C31A 3FASA 1Y4CA 2DXYA 4XKRA 3EN3A 2ABHA 4NWCA 2F7BA 4POXA 4HCWA 2A5SA 4Q5TA 1DPPA 1SYHA 2OWSA 3UP9A 2QMXA 4YICA 3SDFA 4F2OA 4QF9A 3KG2A 1ZMGA 3FXUA 3MPKA 1FQCA 4KFQA 3IO6A 5CBRA 3KOSA 1FQDA 3IAZA 5CI5A 4YKPA 2O69A 2F8DA 3PPPA 5CM6A 4OEUA 3O29A 4X1DA 5H8FB 1M5CA 4YAHX 3T96B 2IEEA 4IO3A 1IZ1A 4EF2A 3B6QA 1DTZA 5JTYB 4U23A 2GFEA 1AL3A 2UYFA 1NH7A 1HSJA 3SKPA 4EXLA 3H3GA 3M8UA 1ZTYA 3FJGA 5F1QA 2X26A 4F1VA 3ECRA 1VFEA 3EHUA 2XXWA 4P0GA 2OWTA 3E3KA 1Y4TA 5FHNA 5L9MA 2ZYMA 2REJA 4RJZA 2NVUB 1GV8A 4JBZA 4EXKA 2DYXA 5L9SA 1Y3NA 1SDXA 3EQ1A 3VXBA 3S9NC 5DTBA 3DP4A 1LCTA 3D4GA 1OVBA 3GLBA 3KN3A 1MPCA 2IA4A 1MH4A 5HPQA 3TCHA 3HHFA 2HQ0A 1UIUA 3N26A 3N6TA 5CMMA 5I59A 1IXIA 4U4XA 5AA2A 4R74A 3H06B 2Z8EA 4JXIA 5IKBA 1YTVA 2F7CA 4QFLA 1F9BA 4LP2B 4ZECA 1OQHA 3TELA 3G3JA 1QUJA 3K1PA 4ELPA 3MZ1A 1LFIA 3DP6A 1ZU0A 4PE5B 4U4SA 3IOUA 2H25A 4ZS9A 1OVTA 4BLAA 2XXIA 3A09A 1NNTA 4I8CA 1A8EA 5AA2B 1B0LA 4U2RA 4GXAA 2DWHA 2DE3A 3V83A 4GD5A 3QSLA 4THIA 4Q8RA 4Q0CA 2PX1A 3V5AA 5TPAB 5I2NB 3MZ9A 3IR1A 1UQWA 2F6GA 3O97A 4U22A 1Y3QA 3VVDA 1TT1A 1N3WA 2Y7IA 1LSTA 1ZLQA 3KFMA 4DCYA 1M5FA 4M1VA 3KJ7A 2QL3A 1PEBA 1MXVA 5I2KB 3PMWA 1VFDA 2REGA 5JEIA 3OO6A 4FATA 1US5A 2RC8A 2G93A 1QKBA 3OXNA 1XOCA 3E4RA 3I6VA 4WXJA 3K6VA 3G3GA 3MAMA 3JZJA 3MWBA 1LLSA 4KYSA 3D4CA 4H8JA 3CG3A 3M3KA 3OSRA 3GBBA 1M5DA 4I1DA 2A5TA 3BFTA 1LCFA 2GRVA 4GOTA 4F39A 5DYHA 4M4GA 4F31B 4JSDA 3SEUA 1MY1A 2XD2A 1RYXA 2V3QA 3IX1A 3G3FA 4ECFA 1LAFE 1OMPA 4YKIA 1SW5A 1MQIA 3FXRA 2OCUA 3CG1A 1LB8A 4IO7A 2WKYA 2XX9A 2Q88A 1IQ7A 4YU0A 4ELQA 4MLVA 2HCAA 1VSOA 5CMBA 4EQ7A 1NNKA 1B51A 2O7IA 1FQFA 3PPQA 4LONB 4C1UA 2D5WA 1MS7A 2H5YA 4R9FA 2HAVA 2UVJA 4IO2A 1MXZA 2O1LA 1JW1A 4QSDA 1XS5A 4GF8A 2PBWA 3U94A 1AIVA 1B58A 4EQBA 2ESNA 2VGQA 4WEDA 4P11A 1P1UA 4GQOA 3UGWA 1R9QA 3KBRA 4MFIA 3UA8A 2W7YA 1Y1MA 3TCFA 2I4BA 3FIRA 2VHAA 1GVCA 2DWIA 2CMOA 1SD3A 2DE4A 1SBPA 1SW2A 1UTBA 2HZLA 4P0IA 2LAOA 4AB6A 2R6GE 3GBAA 5CMKA 2O6AA 3H6WA 4LQ2A 4KD5A 1A40A 1SYIA 4DXUA 4HS7A 5K2XA 3KN7A 2UVGA 3ONMA 1SQYA 3K1MA 4KYEA 3U92A 1RYOA 4Z7EA 3C35A 4LZ8A 1JVXA 5I57A 4F3SA 3K00A 1B4ZA 1GR2A 1B6HA 1BLFA 2VD3A 3U93A 3TQLA 2E0SA 3TCGA 3KJTA 3U1OA 1URDA 3KZGA 4QSEA 1WODA 5HBCA 1DMBA 4UACA 4ZZAA 2QMWA 3OEMA 4QHQA 4QFOA 3U8QA 3FVNA 4FAJA 4JWYA 3EHSA 3OO9A 5EYFA 3FVKA 5I57B 5F7VA 3IOWA 3T66A 4NMYA 2I3VA 5DEXB 3H4ZA 4U21A 3T9VA 4G8NA 1ZJLA 3SEXA 3BKIB 2FNCA 2ZYOA 2NUVA 3TTRA 3M3FA 3CFLA 3RQTA 4EF1A 2F5XA 3CI8A 1LFGA 3CFXA 4ZEIA 3TODA 2Y7PA 1MQHA 5DT6A 4R6HA 4XTCQ 2XX8A 1QULA 2F97A 1Y9UA 1MDP1 1KWHA 1USYH 1MPDA 4IY6A 4EDPA 3ODBA 3T22A 1B5IA 2YLNA 1JETA 1N7WA 4BDRA 4YB7A 5KDTA 1XVXA 2DSFA 1US4A 2QS1A 4NWDA 2Z22A 4GRKA 3MVYA 1NH8A 2OZZA 2RCBA 1PDAA 1JEVA 4PFTA 3CR9A 5J1DA 4C0RA 2GH9A 2P1SA 3G3IA 4DLDA 4F29A 2ZYKA 1M5EA 4YKKA 5I56B 1ZKBA 5ISUA 5AA1A 3H7MA 5DVFA 1P1WA 2D3IA 3K0VA 5KDTB 2XXPA 2VOZA 2XXHA 2B65A 3S9MC 3FJ7A 2PVUA 3C32A 4G4PA 3Q27A 4DXBA 1D3KA 3IB1A 3QIMA 4AQ4A 3B6TA 5CRYA 3K1NA 1AMFA 3FUZA 2OLBA 1TFAA 3HN0A 5H8HA 1MY3A 1SI1A 2Y7KA 3RTFB 5L9OA 1LBBA 3RLFE 1B3LA 2B3BA 3FXQA 2F78A 1A54A 3K01A 1LFHA 4K3FA 4OMBA 4RYAA 2XX7A 3IOVA 3BBRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VP1A 2DVCA 1B3GA 4IB2A 5DVIA 4O3BA 2PMSA 1YYZA 1USYE 2F34A 3TTLA 1FPGA 2HXRA 4F2QA 1ZBMA 5H8HB 2RKMA 4OTEA 1PBQA 2R71A 2QS4A 2V25A 2HXWA 1LBVA 4RXLA 4I9DA 4N17A 1LBXA 3PU5A 4KR5A 3S9EA 3IL1B 4OXVA 1IIWA 2ZZXA 3Q25A 1B32A 2GHAA 2HFBA 4H8IA 4NQ8A 1A7LA 3S4UA 3PPRA 4TQUQ 4N4UA 2R9JA 4O3CA 2FHYA 3VFJA 2H98A 2QPQA 1IXCA 4FEBA 4GWSA 3O6GA 3QAXA 3DLNA 3C36A 1DK4A 3IB2A 4G8HA 4P47A 4GLIA 3NOHA 2I48A 3G3HA 3HPIA 4XIGQ 1LGBC 1NNPA 4F19A 5I59B 1JQFA 4RPOA 2NXOA 1O64A 4QBAA 2QRYA 4PAFA 4KPTA 3KN8A 4H46A 4ESXA 3B50A 4N6PA 2VPOA 4F3PA 3T93B 5TU0A 2AL4A 3RN8A 3DELB 4PAKA 1I69A 2ONKE 4N15A 5IZZA 5H8NA 1MY4A 3SETA 4XKNA 2B4MA 4BDMA 1QUKA 1QJMA 3MVXA 3MPLA 1MM7A 2NWJA 4FIMA 4OHNA 1H43A 4BDLA 4RPNA 3TTKA 2PT2A 1BK4A 3KOTA 1KA0A 4QFPA 3PTYA 1EYIA 3MZBA 4YB5A 1DBZA 4JB7A 3V8XB 4P1EA 1B1HA 2F6PA 5LTCA 3GZGA 3AXFA 2UVIA 4U1ZA 2AYSA 2DDKA 3CIJA 5H8NB 1FCKA 5I58A 3LV0A 3B8BA 4EQ9A 4OERA 3TMGA 3MSTA 3TFLA 3LSFB 4IO6A 3IK6B 3O28A 3RT8A 1Y20A 3P7IA 4U1OA 1FW0A 4QFNA 1BP5A 4RK2A 4I3EA 3FATA 1FBHA 4AB5A 1XT8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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