1H43A

R210e n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
b'SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIEESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 83
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h43A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h43A02
3OOAA 2F5XA 5H8HA 2NXOA 4EDPA 4NF5A 3N6TA 1MY1A 2V3QA 4ZE9A 1LAGE 3B6WA 3K1MA 1B7UA 1LAXA 1IUDA 1AH5A 4PQJA 1GVCA 4QSDA 3KEIA 2KLFA 1TWYA 4EQ7A 5AA1A 4Q0CA 5CI5A 3FVGA 2F35A 4E0WA 3HN0A 1Y20A 1A55A 4YB5A 3N5LA 2OJTA 3GZGA 4FEDA 4JXIA 3Q25A 4DXCA 1N04A 3SKPA 4H67A 2P0SA 1LB8A 3IR1A 2PT2A 3FV1A 2R9JA 1D9VA 1D4NA 4R6YA 5LOMA 3FVOA 4E0XA 2FNCA 3SERA 1JQFA 4IGRA 2HEUA 3K1PA 1ZKBA 4F2OA 3PD8A 3H6TA 4MH5A 2AYSA 1IITA 1N76A 3PPPA 2CZLA 2O1LA 4R75A 3PUZE 4OHNA 4Q8RA 4LQ5A 3U8QA 3FD3A 3KJ7A 4BDQA 2OK2A 5L8DA 1VFDA 4ZEIA 1J1NA 2DE3A 3Q28A 3TYHA 3I3VA 3K6UA 4BDRA 2HQ0A 4IO3A 4KR5A 5ITPA 3DP4A 1DTZA 1ZBMA 2GRVA 3R26A 4BDLA 3OO8A 4H8JA 1MQDA 1CB6A 5CMKA 4PETA 3LSWA 3VVEA 3I6VA 2B3FA 2D5WA 2D21A 3K0VA 3OEKA 3K00A 1MQGA 3M3LA 1US5A 2VGQA 4PFTA 3M3KA 3TAJA 3PMWA 3C35A 1ELJA 3SDFA 2Q88A 3UIFA 3SEXA 2XXYA 5HM4B 1POY1 3H6WA 3VV5A 1TFDA 3L6GA 3SEWA 3TFLA 5JTYA 3RN8A 2ONKE 5AA3A 5L9OA 2ZNTA 3G3GA 3C9HA 4XKPA 4NE4A 3D4CA 3G3KA 1PBQA 1B0HA 3MP1A 3T9VA 2XD2A 1SW1A 4ECFA 3SEVA 1RKMA 3PUXE 4JB7A 1B7HA 4FORA 2Q89A 2Q9TA 3UA8A 3MZBA 2P1SA 2BJJX 3P7IA 1N7WA 2QMWA 2AL4A 3TTKA 3MPLA 1S7YA 4KCDA 3MP6A 3K2DA 4KHZE 1FTJA 1TT1A 3SESA 3S9MC 3LSXA 1IXHA 2F6GA 1YTVA 1LCTA 3RPWA 2GH9A 4FEBA 5IAIA 1Y3PA 4IO2A 2HAVA 4QSCA 1FQFA 2A5TA 3THIA 2F7CA 3TCHA 1NNFA 4OWDA 1B3GA 3EHUA 3FXQA 1P1WA 2I6EA 3ZS6A 3FASA 5HPQA 2G29A 1NMUA 1SBPA 3MVZA 4UACA 1FCKA 1CE2A 3BKIB 4GF8A 4RXLA 5BUUA 1N84A 1UIVA 4DZ1A 1MS7A 3K1NA 4Q5TA 1JW4A 1UIUA 1D3KA 5ITOA 4RPOA 3LUYA 1B6HA 4OETA 4U21A 4NF6A 3D4GA 1I6QA 3CFZA 4NF6B 4PP0A 1WVJA 3MZ9A 2QPQA 3FXRA 4IB2A 2OWTA 4G8NA 1B51A 3KGCA 2XXVA 4EXLA 4YKPA 3CG3A 1XT8A 3BFTA 2Z23A 3TPAA 1N7XA 4GVOA 1B05A 3G3FA 4H0WA 5FHNA 4K3FA 1S9TA 4R74A 1USYH 3Q29A 4IY6A 1N3WA 2I4CA 1SDXA 1VFEA 3C32A 2ZYKA 5ICQA 4GQOA 5I58B 1JVYA 2H9BA 1SYHA 1MY2A 3ZKLA 1AMFA 2QS3A 4JSDA 4F39A 1QVSA 5KDTA 2M8CA 4F1VA 3HSTA 2V84A 1O64A 4F3SA 2NWJA 2DWJA 3IJOB 5K2XA 1OLCA 1YPNA 3IOWA 3TMGA 4YMBA 3VLUA 2QS4A 1NNPA 1VR5A 3PMXA 1MPCA 2XXTA 2DWIA 5JEIA 1GGGA 3QAXA 1FQDA 4LZ8A 3EHTA 1I6AA 4GLIA 3QSLA 3TZAA 1H3DA 2PT1A 4QFKA 4BDOA 5CM6A 3E3KA 1D9YA 3QUFA 3M3FA 2XXIA 4X48A 3KOTA 1MH3A 1HSJA 3CR9A 3MPKA 1ZU0A 4DLDA 2X7QA 1B7ZA 1NNTA 1QULA 1B0LA 4IO7A 4P0GA 3IOUA 3G3JA 3KG2A 2QRYA 4ZEKA 5ISUA 2GFEA 4OZ9A 1SD3A 1MXWA 2I3VA 2F34A 4RJZA 3FGSA 2ZYOA 1MXXA 3VVFA 3VVDA 1JETA 3S9LC 4O3BA 4NMYA 3H6UA 3U92A 3DP8A 1YAEA 5EYFA 4GL0A 4HW8A 4KFQA 4GD5A 4KYEA 3AXFA 1B3FA 2I58A 2DE4A 3OO6A 1SQYA 5M2VA 1OLAA 5I59A 3KFMA 3T93B 4YU0A 2IA4A 1B4HA 3TQLA 1FQBA 1PB9A 4MLVA 2I49A 5I59B 2HXWA 2RC8A 2PMSA 4U23A 3TQWA 1JNFA 2OZZA 4G68A 3K6WA 2X7PA 1SW5A 3GBBA 4G68B 1MQIA 4Z0IA 4ZEDA 4YKJA 2RF1A 2PX1A 3DELB 3SEYA 2ABHA 5KZTA 4KCCA 4YMAA 3IO4A 1LAFE 4N13A 3HO7A 2O7IA 1PB7A 3HV1A 4R2FA 1A8EA 4ZEFA 5H8HB 4NF5B 1ZIUA 1H45A 4F2QA 4H6DA 1IXGA 4FAJA 4I9DA 4G2ZA 1BP5A 1MQJA 2XXPA 5H8SA 3EPEA 2FYIA 1LSTA 4KYDA 3JYRA 1URSA 3LBSA 5K2YA 1B5HA 2UVHA 1XOCA 2I48A 4P0IA 1OVBA 2F78A 4ZZEA 1VE4A 3K01A 1LB9A 3PUWE 2Q8JA 1I6BA 2OCUA 1B9JA 2PBWA 4XKQA 4OFOA 1FTKA 2QS1A 5I2NA 1QUJA 2ZNUA 1FQAA 3TODA 4F3PA 1DPPA 4XTCQ 4OENA 5I57A 1US4A 1ATGA 4F18A 2O84X 4U4XA 4JDFA 5I57B 1USYE 3S4UA 1FQCA 3A3UA 1Y4CA 4TLMB 3IB2A 1LBBA 2HCAA 4DXUA 4I62A 1JW1A 4XKNA 2O69A 3KN8A 1LBCA 2UVGA 1MPDA 3KSXA 4F29A 2I3WA 3ZKKA 2ESNA 3VLWA 1GTKA 1B2HA 4R72A 4Z7EA 4MF3A 4OVJA 4H1XA 1EU8A 1P1NA 4BDNA 2ZXTA 3O9PA 1IEJA 5TP9A 2ANJA 4GXSB 4FE8A 3SEUA 2QL3A 3VFJA 5TP9B 5EHSA 3U94A 5H8NA 1BLFA 2D3IA 2DVZA 4XIGQ 2O68A 5H8NB 4PFYA 3OSRA 4NF8A 2F97A 5JTYB 1Y3NA 2VD2A 1JEUA 1TFAA 1UQWA 3Q26A 3K4UA 1M5FA 3DP6A 1QKAA 3TCFA 3OO7A 2REGA 3MBPA 2Z8DA 3G3IA 4P11A 1LGBC 3BFUA 3RUMA 5F1QA 4NWDA 1A99A 3O6HA 2NUVA 2YLNA 3DM0A 4FIMA 3MJNA 2F8DA 4LQ2A 4U1ZA 3RTFB 3CSBA 2B65A 1MXZA 3GXAA 3CFLA 3G3HA 1XS5A 2PYYA 2ZYNA 3PUYE 1EZOA 3VXCA 1ANFA 3MC2A 3TKDA 2PVUA 1UTBA 1MXUA 2A5TB 2ZNSA 1Z7ME 3H06B 4RK9A 4EF1A 4JWYA 3C33A 4TQUQ 3TTRA 1IIWA 2DE2A 3PMVA 3KSJA 3V8XB 3O66A 4HTGA 4ZDMA 4QHQA 2CMOA 4GXAA 2QS2A 1QW0A 5DEXA 1RYOA 1H76A 5H8QA 2OWSA 2Y7WA 4YICA 5DEXB 4GOTA 4QFNA 4JSOA 4TOZA 1N0TA 4O3AA 5L9SA 3FZVA 4ND9A 3OO9A 1IXIA 1B32A 2Z22A 4NWCA 3H03A 1TXFA 1YCJA 2Z8EA 1BTJA 4BDMA 3O2AA 3USDA 1NH7A 2R71A 4U1OA 3V89B 4X1DA 1Y9UA 2A5SA 3A09A 1Q1KA 4ELQA 5FHOA 3QYTA 2XXHA 4ELOA 4G8HA 1SI1A 5TPAA 2RC9A 4BLAA 4QFLA 2XXRA 1NKXA 3CI8A 3U72A 4JBZA 4AQ4A 2Y7KA 4IO4A 1ZMGA 3N6UA 3HHGA 1MDQA 1B52A 4EQBA 1LFIA 3FV2A 3QUJA 3PUVE 4TLLB 4F3BA 2XXUA 3IL1B 4ESXA 1UTHA 3S9NC 3QXMA 5J1DA 2ZMBA 5CBRA 5KDTB 4R6KA 1UTHB 4JWXA 4LP2B 4AB5A 5B70A 4UA8A 3IB1A 2DSFA 3TELA 2E0SA 3Q27A 1NL5A 2V3UA 2O7UA 4MFIA 1GR2A 2O6AA 2G93A 1HSEA 1MY3A 3HPIA 3E4RA 2AL5A 4Q30B 4JWOA 2OBGA 2H98A 3U93A 3HHFA 4QFOA 3ONMA 3PPQA 4PFUA 2V3TA 4ZEBA 4RA1A 3T9HB 3OENA 3GLBA 4FECA 3ILTB 1OQHA 1NFTA 4DXBA 1QUKA 2ONRA 3FATA 4RYAA 2X26A 4LATA 3H7MA 4C1TA 5DVJA 3IX1A 2I0BA 4O3CA 3CG1A 1FW0A 4F1UA 1SI0A 2XD3A 4EUOA 1A8FA 1Y3QA 4WXJA 3O29A 4KPTA 3QIMA 4FJPA 4MBPA 1OQGA 4LUBA 1QUIA 3CSGA 4ISUA 1ZTYA 1OVTA 3KN3A 1MG1A 4F1YA 3EQ1A 2QSXA 4RY1A 4X1BA 4I8CA 1EH3A 3KBRA 2LAOA 1ZJLA 3V5AA 2GHBA 3MP8A 5AA4A 4QFPA 2Y84A 5HBCA 4HCWA 3RT6B 3C36A 1MXYA 5AA4B 4KI0E 4C1UA 4OQOA 3PPOA 1B5IA 4YKKA 3I5OA 3ECRA 3UK4A 2REJA 2VP1A 2O1MA 1FTOA 3G7WA 4N07A 3FVNA 1WODA 2RCAA 4POWA 3SETA 3TDJA 3RGYA 4DCYA 3MVXA 4YKIA 5DT6A 4POXA 2RINA 5JK4A 4U22A 1LFGA 1P1OA 3B7DA 5L9MA 4F22A 1AOVA 2ONSA 3T96B 2Z8FA 4ONYA 3H3GA 3MVYA 1LFHA 3C31A 2GHAA 4H5GA 4H5FA 1R6ZA 4IY5A 3IOVA 1PEBA 3S9EA 2ALUA 2QJEA 5DTBA 4OESA 5B7DA 4RNSA 4ZZAA 4I1DA 3IAZA 2IEEA 1S50A 2YPNA 4KD5A 3R6UA 3LR1A 4HS7A 1M5CA 3IOTA 3L6HA 1XC1A 3W9WA 3K6XA 3CRBA 3S2VA 3H6VA 4WKMA 4XKRA 3TUSA 1FQEA 1JW5A 2DYXA 4X9TA 3FIRA 4F3GA 3RT8A 5I2NB 4F31B 1XVYA 4RK2A 1M5DA 3OMBA 1P1UA 3OD7A 3E13X 3CFXA 5AA2D 1QKBA 4GWOA 1LLSA 4OEUA 1NNKA 1NH8A 3PPNA 1B3HA 1PDAA 5FTIA 1Y1ZA 1H43A 5I56A 2THIA 1URGA 5CMMA 5I56B 4U2RA 5CMCA 3C4MA 3BBRA 4HCYA 4G68C 5AE4A 3PD9A 1GV8A 1BKAA 4LZ5A 1L5TA 1B3LA 1II5A 1BIYA 4YB7A 1Y4TA 4OEVA 2I4BA 4R2BA 2V93A 3TEPA 2XHDA 3E9XA 1MY4A 3EN3A 2P2AA 1AIVA 3N94A 3UGWA 1URDA 2H99A 5F7VA 1I69A 2UVIA 3O97A 4LZ7A 1JEVA 2DOJA 4GL8A 4R6HA 1MDP1 1M5EA 4NF8B 1Y1MA 4ZECA 2XXXA 4M1VA 5H8FA 4M4GA 5CMBA 1VSOA 2DVCA 1FTMA 3RTWB 1MRPA 2H4IA 3MWBA 1A40A 2W7YA 1SW2A 5H8FB 3OELA 2Y7PA 1KWHA 1F9BA 4ZE8A 3R7XA 3TTMA 2O51A 4EXKA 3OSQA 4KQPA 4WEDA 3ODBA 1EZ9A 4IO6A 1PB8A 4QRZA 3IORA 4EQ9A 4OERA 3LC8A 2WKYA 2V25A 4C0RA 3PV0E 5DVIA 2F7BA 3MW0A 5I2KA 2NVUB 4ELRA 3C34A 4FATA 1JVXA 1B3EA 2QMXA 5IKBA 5I2KB 3TTLA 2H25A 3KJTA 4DE8A 1UTBB 3VLVA 1DMBA 2UYFA 2XX8A 3H4ZA 1DOTA 2HAUA 4EF2A 5ICTA 3UORA 1IQ7A 4DDDA 3T22A 4R9FA 2YJPA 4GFRA 4OMBA 1SW4A 1O63A 3T66A 4R73A 3JZJA 3VE1B 4QF9A 1EZPA 2F7AA 2H5YA 3TCGA 3MZ1A 3W15C 2I0CA 5FHMA 1FTLA 2DWHA 4YAHX 4G8MA 5H8QB 1B40A 3RQTA 1DTGA 4DIGA 2XX7A 4OXVA 1ZLQA 3PGFA 5KCJA 3WAEA 1H44A 3U1OA 5EHMA 2FA7A 4QSEA 5KCJB 3O6IA 5DVFA 2Q2AA 1MM6A 1MY0A 1MQHA 3GBAA 3K02A 3O28A 1IXCA 4N6PA 3VDFA 3IO6A 1OIBA 3A3CA 4ESWA 2R6GE 2E1SA 2B3BA 3OEMA 4H65A 5BWJA 1MM7A 2RCBA 1O7TA 3FJMA 3FVKA 5A5XA 5TPAB 3CIJA 3M8UA 1PC3A 4PFWA 4L17A 2DXRA 3T9UA 5A5XB 2Q2CA 1POTA 4R9GA 2DXYA 3MUQA 4PE5B 3RY3A 3FJGA 2HZKA 4H8IA 2Y7IA 2F36A 5I58A 1LAHE 5TU0A 3CVGA 2RKMA 3PU5A 3PPRA 1B1HA 1P99A 1R1NA 1B1XA 1WDNA 3F11A 1HSLA 1P1QA 4ZS9A 4AB6A 1MH4A 2VD3A 2OLBA 3KN7A 4G4PA 4IO5A 4GRKA 4YZZA 3B6QA 3VXBA 1Z7NE 1N3XA 4LVQA 3UP9A 3MVWA 4XXUA 3QK6A 2HZLA 1A54A 5AA2A 3IJXB 3MAMA 4OFLA 2AIXA 3RNNA 1B46A 1SYIA 5AA2B 1RYXA 1OMPA 3KOSA 2DWAA 3DLNA 4YB6A 2DQVA 1MXVA 2DP8A 1XHYA 4OFJA 2ZYMA 4NEDA 1B4ZA 5I84A 3IB0A 2DS9A 4U4SA 1A7LA 4DCXA 1PBPA 1QJMA 2VOZA 2XX9A 3EF7A 3FUZA 4IGTA 2UXAA 2Y7RA 4OYVA 4G77A 3TTNA 4ELPA 2VHAA 1T0KA 4KYSA 3KZGA 4NF4A 1AL3A 2HFBA 4LONB 1R9LA 3FJ7A 5CBSA 1XVXA 1MPBA 5CRYA 5FTHA 2UVJA 4NF4B 5CC2A 1B5JA 3MQ9A 2XXQA 1M5BA 4LA9A 4OTEA 2XXWA 3RLFE 4GIZA 4WEPA 5DYHA 3UN6A 1B58A 3LSLA 4RPNA 3LSFB 3HCQA 3O6GA 4F19A 3V83A 3B6TA 2F6PA 3N26A 4NTLA 1LCFA 3T9XB 5ELVA 3WAFA 2NOOA 3EHSA 2UYEA 3OXNA 1DPEA 1Q35A 1IZ1A 1DSNA 3ILUB 1SVXB 4MLQA 3JV9A 4THIA 3K6VA 3W9VA 3ZSFA 2RC7A 3FXUA 1R9QA 3IK6B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OOAA 2F5XA 5H8HA 2NXOA 4EDPA 4NF5A 3N6TA 1MY1A 2V3QA 4ZE9A 1LAGE 3B6WA 2CEYA 3K1MA 1B7UA 1LAXA 1IUDA 1AH5A 4GWUA 4PQJA 1GVCA 3B8BA 4QSDA 4N8YA 3KEIA 2WBBA 2KLFA 1TWYA 4EQ7A 5AA1A 4Q0CA 5CI5A 3FVGA 2F35A 4E0WA 3HN0A 1Y20A 4MJOA 1A55A 4YB5A 1NUXA 2FIXA 2OJTA 3N5LA 4MNIA 3GZGA 4FEDA 4JXIA 3Q25A 4DXCA 1N04A 3SKPA 4H67A 2P0SA 1LB8A 4O8MA 2FHYA 3IR1A 2PT2A 3FV1A 2GQ1A 2R9JA 1D9VA 1D4NA 4R6YA 3KC0A 5LOMA 3FVOA 4E0XA 2FNCA 3SERA 1JQFA 4IGRA 2HEUA 3K1PA 1ZKBA 4F2OA 3PD8A 3H6TA 4MH5A 2AYSA 4MHFA 1IITA 5DW8A 1N76A 3PPPA 2CZLA 2O1LA 4R75A 3PUZE 4OHNA 4Q8RA 4LQ5A 3U8QA 3FD3A 3KJ7A 1FBGA 4BDQA 2OK2A 5L8DA 2XWKA 1VFDA 4ZEIA 1J1NA 2DE3A 3Q28A 3TYHA 3I3VA 3K6UA 4BDRA 2HQ0A 5A5LA 5IZ3B 4IO3A 4KR5A 4PGPA 5ITPA 3DP4A 1DTZA 1ZBMA 2GRVA 3R26A 4BDLA 3OO8A 4H8JA 1MQDA 1CB6A 5CMKA 4PETA 3LSWA 3VVEA 3I6VA 2B3FA 2D5WA 2D21A 3K0VA 3OEKA 3K00A 1MQGA 3M3LA 5ET7A 1US5A 2VGQA 5IZZA 4PFTA 3M3KA 3TAJA 3PMWA 3C35A 1ELJA 3SDFA 2Q88A 3UIFA 3SEXA 2XXYA 5HM4B 4I3EA 1POY1 2L5VA 3H6WA 3VV5A 4PFIA 1TFDA 3L6GA 3SEWA 3TFLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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