4FORA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with flurbiprofen at 1.58 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Flurbiprofen at 1.58 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA02
3KGCA 3H6UA 2B65A 1LFIA 5H8NB 4LA9A 3TDJA 4KPTA 3TAJA 3BFTA 1SW2A 1B5JA 1OMPA 3G3KA 3OENA 3USDA 1MH4A 1Q35A 2VGQA 2REJA 4AB6A 4LQ2A 1B3FA 1JVXA 2XX8A 5K2XA 5DYHA 1N84A 3MZ9A 1VFDA 3LSLA 2OWTA 4LATA 1R9QA 1BIYA 1IITA 3VLWA 1D9YA 4U2RA 1FTKA 4OQOA 2XX9A 4RA1A 2QPQA 1WDNA 2VP1A 1PB7A 1TFDA 4YAHX 5JTYA 2H25A 1LBCA 4HTGA 4C1UA 2UVGA 1FQCA 3LSXA 2XXQA 3UORA 4DXCA 3TQWA 2P2AA 2QS2A 3LUYA 3SKPA 3TFLA 4NF6A 4I9DA 2F34A 3RQTA 5J1DA 3FUZA 1NKXA 3IO4A 1ZIUA 2HZLA 2GRVA 1D4NA 2QS3A 4G8HA 3U94A 1QVSA 1II5A 4YB6A 3P7IA 3C34A 2THIA 3CI8A 3OEKA 3UK4A 4PFYA 5AA2D 3RUMA 2XXPA 1NH7A 4EQ9A 1M5EA 4ZECA 2F35A 3O97A 1NNPA 4DE8A 2F8DA 1VE4A 1LB9A 5K2YA 4LONB 3V8XB 2M8CA 1YAEA 1SQYA 3U93A 1TWYA 2Y84A 3FIRA 4FEBA 4HCWA 4BDOA 1JVYA 1N7WA 2FNCA 2I3VA 3UA8A 4BDMA 4NF5B 2R9JA 2Z22A 1B9JA 4JXIA 4F29A 1WODA 4WEPA 3H03A 2PYYA 3QUJA 5DT6A 3OO6A 3VLVA 5DEXB 3IOVA 1LCTA 3K6XA 1OVBA 3SEYA 3F11A 2ONSA 4ELQA 4F1VA 1QULA 4G77A 5CMMA 1B1HA 4NTLA 5LOMA 3UGWA 4DCXA 1MH3A 2IA4A 3Q27A 3MVZA 3GXAA 4RJZA 3S9EA 2RCBA 4G2ZA 4L17A 4QFOA 3TPAA 1MS7A 5TP9B 2ZNSA 5I84A 3T96B 2V93A 2DWIA 3CFXA 4N07A 5B70A 4NWCA 2XD2A 2E0SA 5I56A 2H98A 1DMBA 3PPRA 3K00A 4PFWA 3OOAA 2H4IA 1S9TA 4JB7A 1ZKBA 3VFJA 2GFEA 3I6VA 4M4GA 1QUJA 4MBPA 2Y7IA 1ZLQA 3HHFA 4I1DA 1NFTA 3QYTA 4HCYA 2F5XA 5TPAB 1TFAA 4WXJA 1IQ7A 1MPDA 2O84X 4KI0E 4YZZA 3Q29A 1SDXA 1N0TA 5IAIA 2AIXA 5H8SA 1Y3QA 2OZZA 4RY1A 5HM4B 3PGFA 4U22A 2UVIA 4YKIA 1IUDA 3FGSA 2FYIA 3ZS6A 4KYEA 1ZBMA 4IY5A 1SVXB 1B2HA 1MXVA 3N94A 1A8EA 5EYFA 1QKAA 4LZ8A 1NH8A 1TT1A 2UYFA 1B05A 3EN3A 3G7WA 4Q8RA 1Z7NE 4OTEA 3C31A 1IIWA 2UVJA 4GL8A 3H6WA 4DZ1A 3A3CA 4LQ5A 5I57B 1RYOA 3KOTA 1LFGA 2XXXA 1NNFA 2F6GA 4JDFA 2NVUB 3H6VA 4UACA 3VE1B 4OESA 3K0VA 2DYXA 4POXA 2QJEA 3MJNA 2NOOA 3O9PA 3E9XA 1MY4A 5A5XA 3U1OA 3JYRA 1JEUA 4UA8A 1MY1A 3QIMA 4XKNA 3SDFA 4EQ7A 4P0IA 3KFMA 4X1BA 2RC7A 3KN7A 2VD2A 3RLFE 2XXWA 3MZ1A 3IAZA 5ICTA 3KN3A 4GQOA 2Q89A 1N3XA 1SYIA 3KEIA 3B6TA 1B7HA 4P0GA 3TELA 3U72A 2NWJA 3RT8A 4Z7EA 2DXYA 2QS4A 2X26A 2GHBA 1SW5A 4YMBA 3R26A 3S9NC 1POTA 3R7XA 4F22A 1USYH 5CMBA 4OFJA 3TCGA 1MQIA 3KSXA 4R75A 5H8FA 5I56B 1QKBA 5H8HB 4G68C 3IO6A 2KLFA 1EH3A 3ILUB 4OXVA 3CIJA 3O29A 4H1XA 1A55A 4BDRA 3IORA 3O6HA 2DE2A 4Q30B 3TCHA 1B4HA 3I3VA 2O51A 3U8QA 4F2OA 4QRZA 3K01A 2QMWA 3DP8A 4BLAA 4Q5TA 1O63A 4H6DA 3EPEA 2H9BA 4TLLB 1SI0A 2DVCA 2DE4A 3BFUA 1A40A 2Z8DA 3QAXA 2F97A 2F7CA 1ATGA 3HCQA 3KG2A 4OEVA 1IXHA 5L9OA 1P1NA 4NF4B 4NWDA 3C4MA 3L6HA 3EF7A 3RT6B 1PBPA 3N6TA 2B3FA 3PPOA 2RCAA 3S9LC 3N5LA 3FVGA 3LBSA 3QXMA 4F3PA 3TTLA 2VD3A 2E1SA 1PB8A 5FHNA 4ESXA 4DXBA 3HPIA 4PFTA 4GRKA 1PEBA 1B0HA 4H8IA 1OLAA 3OO9A 4OWDA 1PDAA 4U4SA 3M3KA 3C32A 4IO3A 2W7YA 4WEDA 1NNTA 3VXBA 1N76A 1LCFA 4H5FA 3UIFA 2DE3A 4H8JA 4GFRA 4G4PA 4DDDA 5FHMA 4MLQA 5A5XB 1B4ZA 1MM7A 5H8QB 2QL3A 2YLNA 1ANFA 1UIVA 3OMBA 5CMKA 4ND9A 3TEPA 4K3FA 5AA2B 4POWA 1OVTA 4XKPA 1Y9UA 4LZ7A 3VVEA 1LFHA 2O1LA 2O1MA 4DCYA 3IOWA 1TXFA 5L9SA 2ONRA 4YB7A 4YMAA 1EZ9A 4H65A 3EHSA 3MP6A 3QUFA 3G3JA 2Z8EA 4GVOA 3O6GA 1HSJA 5B7DA 3C36A 5CBRA 3QK6A 1MDQA 1DPPA 2DP8A 4R2FA 1H3DA 2P1SA 4R6YA 2F6PA 4KYSA 1MXUA 4IGTA 1Y20A 4ZDMA 4TOZA 1LAXA 5KCJA 1LGBC 4H0WA 1M5CA 4YKPA 2ONKE 3K1MA 2WKYA 3PUXE 1MXWA 5CBSA 1Y3NA 4FAJA 4JWYA 5KDTB 3VVDA 4LUBA 2FA7A 3MPKA 1JNFA 1DTGA 3HHGA 1UTHA 1MQHA 4BDLA 2OBGA 2PX1A 5CMCA 4JSDA 1ZMGA 1SD3A 4GIZA 1RKMA 1ZU0A 4OERA 3IOUA 3C35A 2A5TB 4ONYA 4HW8A 1OIBA 2HZKA 3CG1A 2Q2CA 2XXIA 2ZYMA 1J1NA 4TQUQ 1GR2A 2OWSA 4RK2A 1LAGE 1VFEA 3IOTA 2RKMA 1L5TA 4G68A 4MF3A 1URSA 1B3GA 3GZGA 1B3HA 3K2DA 4BDNA 3O66A 1H44A 2O7IA 3RTWB 2I6EA 4IO6A 4M1VA 3CR9A 5BUUA 2I48A 4OMBA 2HQ0A 4H67A 4AB5A 2ZNTA 4YB5A 1JQFA 4GF8A 4ZEDA 1ZTYA 5CRYA 3V83A 4QFLA 4U23A 3AXFA 1MXXA 3T9XB 5AA4A 5DVJA 1HSLA 4JBZA 1P1OA 3T9UA 1B58A 3DELB 4OEUA 1I6AA 5ITOA 4F31B 3Q26A 4U1ZA 1H76A 4X48A 4ELPA 1UTBA 3T66A 1GVCA 3N26A 1POY1 5ITPA 2PMSA 3PV0E 2DWHA 1XS5A 1AL3A 5ISUA 4THIA 5I2NA 3FV1A 3T9HB 5M2VA 5CC2A 3TKDA 1T0KA 4FE8A 1RYXA 1Y1MA 3KSJA 3TTNA 3TTRA 1B52A 4TLMB 3PPPA 1O64A 1Y4CA 4IO2A 4AQ4A 2CMOA 2D21A 3CSGA 3PPNA 3HN0A 5I59A 1AMFA 1GGGA 3A09A 4KYDA 3G3GA 5JTYB 1LSTA 1OQHA 2YJPA 1CB6A 4DLDA 4OZ9A 4ESWA 3W15C 2I3WA 5TU0A 1B46A 4NF6B 1IXIA 2H99A 2REGA 3ZKLA 5CM6A 3OO7A 1VSOA 3FJGA 2XXVA 3H4ZA 4QFKA 4IO7A 4EF1A 3GBAA 4EXLA 2NUVA 4QSCA 2HFBA 2F78A 3K1NA 3ZSFA 4QHQA 1SW1A 2DS9A 2HAUA 3LR1A 2X7PA 2CZLA 3PMWA 1GV8A 3HSTA 3PD8A 4O3BA 3VDFA 3ZKKA 3RGYA 2G93A 3PUWE 1MRPA 5DTBA 3BKIB 1R1NA 2O6AA 3MAMA 3SERA 2AYSA 4IY6A 3FVNA 1URDA 5H8NA 2XX7A 4MH5A 1H45A 4LZ5A 3TYHA 3SETA 4G68B 3LSWA 3EHTA 4JWOA 3T22A 4N13A 3TZAA 3GBBA 1MM6A 3PD9A 4R9GA 5I58A 2O68A 1DOTA 4ZZAA 3VLUA 3KOSA 4OFLA 4ELRA 2I58A 3E4RA 3SESA 1IXCA 2HEUA 3CSBA 2IEEA 3UP9A 2I49A 1PBQA 4YKKA 2ZMBA 3S2VA 2ESNA 1BLFA 1SI1A 5IKBA 2XD3A 2O7UA 3OSQA 3UN6A 2OLBA 1S50A 4XTCQ 4I62A 3G3IA 5EHMA 2DVZA 2Q9TA 4F18A 4KR5A 2DOJA 3VV5A 4F3BA 1VR5A 1UTBB 1IEJA 1FQBA 3R6UA 1DTZA 2QSXA 1B3LA 3E3KA 3MPLA 4X9TA 5F7VA 3K4UA 4FORA 4R74A 4XXUA 5I2NB 2YPNA 1PC3A 1A99A 2V3UA 1UQWA 1B6HA 3GLBA 4E0XA 3H6TA 1ELJA 3PUVE 3IB2A 3WAFA 4IB2A 3T9VA 4R73A 4R72A 5DVFA 4RNSA 5I59B 3S9MC 3V5AA 3N6UA 4YU0A 2D5WA 5I2KA 2Z8FA 3TCFA 4ZEBA 3SEVA 2V25A 3FXUA 3HO7A 3SEUA 2PBWA 4ZEIA 2ABHA 2UVHA 3PMVA 4O3CA 1FCKA 2Z23A 4RXLA 3FXRA 3MQ9A 3KJTA 3MVXA 4JSOA 3MZBA 3VVFA 2VOZA 1FTJA 1XVYA 1Y3PA 2NXOA 1B7ZA 1R6ZA 3FXQA 3THIA 1I6QA 4NF5A 3ODBA 4NEDA 4DXUA 5DEXA 3O2AA 3EQ1A 1FW0A 3CVGA 2AL4A 3DP4A 2QS1A 5AA3A 5KZTA 3OD7A 3EHUA 2ALUA 3SEXA 5TP9A 4GLIA 1FQEA 3V89B 1N3WA 1AOVA 1I69A 2RINA 3C9HA 1BP5A 3M3FA 2DQVA 2V3QA 3MVYA 1MQJA 3DM0A 3IR1A 4QSEA 1A54A 4O3AA 3G3HA 1JW5A 3IB1A 3E13X 1MPBA 5L9MA 5FTIA 3B6QA 5I58B 2Y7WA 1YCJA 1NMUA 1SBPA 1US5A 4YKJA 4PFUA 4OENA 3PUZE 4KQPA 1H43A 3TUSA 2Y7KA 4ZE8A 2P0SA 3WAEA 4H5GA 5TPAA 4IO5A 1IZ1A 3MWBA 3DLNA 4F2QA 3Q28A 4XIGQ 4HS7A 3CFLA 2XXUA 4KD5A 1D9VA 4PQJA 5H8FB 2R6GE 1ZJLA 4EDPA 4OYVA 1BTJA 4X1DA 2O69A 3RNNA 3OO8A 2I4BA 3H7MA 4F39A 4ZS9A 4GOTA 4C0RA 2ZYOA 3B6WA 1QJMA 1MG1A 3W9WA 4QF9A 4EXKA 3LC8A 3ILTB 2F7BA 4OHNA 4F1YA 3IL1B 3JV9A 1FTLA 1GTKA 1P99A 3K6UA 2OCUA 5I57A 3MVWA 1NL5A 4F1UA 3A3UA 5I2KB 4QSDA 4RPOA 1MY0A 3TODA 1B5HA 5HPQA 4NMYA 4U21A 3FZVA 4G8MA 2HXWA 5CI5A 3IX1A 4XKQA 2PVUA 3KN8A 3CRBA 3KZGA 3O6IA 4U4XA 1O7TA 4LP2B 3MW0A 5AA1A 4FIMA 1FTOA 4GWOA 1SYHA 4GD5A 1MDP1 2UXAA 3PU5A 1MXYA 3HV1A 3PMXA 1LAFE 3RY3A 2I0CA 5F1QA 4R2BA 2F36A 2ANJA 5FTHA 2ZYNA 1AIVA 4G8NA 3RN8A 3KJ7A 1F9BA 4IO4A 3KBRA 4ECFA 2XHDA 4KFQA 3OXNA 1IXGA 4Q0CA 3ECRA 5DVIA 3L6GA 3U92A 1PB9A 1XOCA 1HSEA 2Y7PA 2H5YA 4NF8A 3C33A 2I0BA 4F3GA 4ZEKA 4P11A 1MY2A 3PUYE 5H8HA 4FECA 1JEVA 1FTMA 4E0WA 1JW4A 1EZPA 2ZNUA 3IB0A 3D4GA 4MFIA 4ZZEA 4OVJA 5BWJA 1P1UA 2UYEA 3OSRA 2DSFA 4OFOA 1B1XA 1URGA 3IJOB 1MQGA 4DIGA 4PP0A 2A5SA 3W9VA 3TQLA 1YPNA 3ONMA 3FVOA 5KCJB 1B51A 1Y1ZA 1B3EA 2Q2AA 4ZE9A 1MQDA 1OQGA 1FQAA 1M5BA 4RYAA 2VHAA 2DWJA 4ZEFA 4F19A 4NF4A 3MC2A 2OJTA 1A8FA 3PPQA 4PE5B 4EF2A 3RTFB 2V3TA 4BDQA 3K6VA 1UTHB 1EZOA 1M5DA 4EUOA 5AE4A 2XXTA 3B7DA 1MY3A 3MP8A 4ISUA 1FQDA 3S4UA 2I4CA 1R9LA 2B3BA 1Q1KA 5L8DA 4N6PA 2PT2A 4GXAA 1OLCA 3T93B 3FJMA 3TTKA 4XKRA 4WKMA 3D4CA 2F7AA 2XXRA 4FJPA 4GXSB 4IGRA 4LVQA 3FV2A 1LBBA 5H8QA 3DP6A 1UIUA 3G3FA 2Q88A 1S7YA 1LAHE 3TMGA 3TTMA 1B5IA 4Z0IA 5AA2A 3RPWA 1US4A 4KCDA 4U1OA 3MP1A 3M8UA 3K6WA 3FD3A 3IJXB 1BKAA 5HBCA 2D3IA 1XVXA 2PT1A 4C1TA 1P1WA 1LLSA 2HCAA 3LSFB 4RPNA 5AA4B 4FEDA 1YTVA 4NE4A 5ICQA 4R6KA 1EU8A 4RK9A 1P1QA 1QUKA 1MPCA 3FATA 1N04A 3H06B 4NF8B 1MXZA 1QW0A 3VXCA 2AL5A 1QUIA 4QFPA 1D3KA 4ELOA 2GHAA 4I8CA 5FHOA 3SEWA 1FQFA 2RC9A 3FVKA 2QMXA 3Q25A 5ELVA 3K02A 3K1PA 3JZJA 5KDTA 2RC8A 1XHYA 2Y7RA 4MLVA 3QSLA 4EQBA 3MBPA 1KWHA 2G29A 2GH9A 4R6HA 3CFZA 2ZXTA 3CG3A 2X7QA 1A7LA 2OK2A 2R71A 2HAVA 5JK4A 3BBRA 1B32A 1XC1A 1USYE 2Q8JA 3FJ7A 1DPEA 1AH5A 3FASA 1SW4A 4PETA 2A5TA 2DXRA 1I6BA 3OEMA 4F3SA 1Z7ME 1CE2A 3O28A 4YICA 4GL0A 3IK6B 1B7UA 1LB8A 2QRYA 3OELA 2ZYKA 2XXYA 2V84A 5EHSA 1N7XA 4QFNA 3MUQA 5JEIA 3I5OA 1B40A 1XT8A 1NNKA 2LAOA 1Y4TA 4JWXA 2DWAA 2RF1A 3M3LA 2BJJX 1WVJA 4FATA 1JETA 1B0LA 2XXHA 4R9FA 1M5FA 4OETA 1JW1A 4KHZE 1DSNA 4KCCA 3H3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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