4FORA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with flurbiprofen at 1.58 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Flurbiprofen at 1.58 A Resolution
rcsb
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA02
1LFHA 1AH5A 1NH7A 4KPTA 1FTLA 3UP9A 1MQGA 5CI5A 3KN3A 4ESXA 5DVJA 3QSLA 1SW1A 1HSJA 1CB6A 2AL5A 4Q30B 3UGWA 2UVIA 3MP8A 2GFEA 3IB2A 3IX1A 4NEDA 4BDLA 5H8QB 4U1ZA 1OVTA 1MY3A 4YKIA 4AQ4A 1JQFA 3I6VA 4ELQA 1RYOA 1POY1 1ZLQA 5TP9B 1NNPA 3FJMA 1FQFA 4P0GA 2DXRA 1LCTA 3CRBA 3SESA 1XVYA 4U4SA 3PUWE 3IK6B 3GZGA 2ALUA 1UTBA 4QSDA 3T9XB 1SBPA 3H03A 1Y20A 2HEUA 1FCKA 3MJNA 5B70A 4TLMB 1B3HA 3SEYA 3U8QA 3FVKA 1NH8A 2OCUA 1D4NA 3PD9A 5IAIA 4GOTA 3U94A 2V84A 1AOVA 3H6VA 3O66A 2FYIA 5K2YA 5CMCA 2XD2A 2UXAA 3G3IA 2Y7WA 3RTFB 2AIXA 3TYHA 1JVYA 4IO7A 3RNNA 3TTKA 3EHSA 4YMAA 3IAZA 4N6PA 1MM6A 3A3UA 4PFWA 1I6BA 4NF6B 1OVBA 5I2NB 4ZZEA 1S9TA 4FEBA 1N7WA 1PB9A 4NF8B 3H7MA 3O2AA 1JW5A 2QS2A 5L9MA 4TOZA 2CZLA 1JNFA 2RC7A 1HSLA 3S9EA 1IXIA 3CVGA 2A5SA 2PYYA 2LAOA 1MDP1 4N07A 4GVOA 4EQ7A 1GVCA 3RQTA 3KBRA 1O63A 3LR1A 3RY3A 1A55A 4YU0A 3RT8A 2G93A 4XKQA 3MQ9A 3K6VA 3CG1A 3TTRA 3EQ1A 1N84A 2WKYA 3UN6A 3O6GA 1XVXA 2F8DA 2B3BA 1XOCA 4X1BA 4OZ9A 2A5TA 3K1MA 5A5XA 4LVQA 3HSTA 1NMUA 3Q25A 1B0LA 5J1DA 3C32A 3ILUB 3R6UA 4G2ZA 1OMPA 4JSOA 2DWAA 3MP6A 3DELB 4POXA 4HCWA 3D4CA 3TMGA 1IIWA 3OD7A 1P1OA 2QL3A 1QUKA 3UK4A 4ELOA 1POTA 4DCYA 1Z7NE 4NMYA 5F7VA 4HTGA 5AA4A 3QK6A 1A54A 3C31A 1FTKA 2OJTA 3PPPA 1IXHA 2F7BA 3K0VA 4OYVA 4R74A 5CBRA 1B52A 3DM0A 4GIZA 2E0SA 4MH5A 4UACA 2R9JA 4BDNA 2B3FA 4KYDA 3MZ1A 2XX8A 2F6PA 1DOTA 1NNKA 2FA7A 2O69A 4KYSA 2P0SA 3QXMA 4RJZA 2ZXTA 1PB7A 4G68C 1FW0A 2I3VA 3MBPA 3FATA 4XKPA 3O29A 3FD3A 2YPNA 4RXLA 2F36A 5DT6A 1SW5A 2ZYNA 5JTYB 1B51A 3HCQA 4YZZA 4Q8RA 1LB8A 3S2VA 1MXUA 3KN8A 1VSOA 1JETA 3KEIA 4FORA 3L6HA 1JW1A 1R6ZA 2DE2A 3C9HA 3K1NA 3Q27A 4BDOA 3ZKLA 1LB9A 1BIYA 4JXIA 4H65A 4NWCA 4ZZAA 4IO5A 1FQDA 2XXWA 2VP1A 3SERA 3FJ7A 3SETA 3IB1A 4FAJA 2H9BA 4F3BA 1XS5A 4YKKA 4PETA 1FTMA 2P1SA 5AA2A 5TP9A 1TT1A 5CBSA 1MPDA 1BLFA 4PP0A 3FVOA 4DCXA 4MLVA 4GF8A 3VDFA 3ODBA 5H8NB 1EH3A 1H43A 4OXVA 4ZEKA 1LBBA 4EF2A 1ZIUA 2OLBA 5TU0A 1FQAA 2V93A 5EHSA 2UYFA 4GL8A 1PB8A 3D4GA 3IORA 1NFTA 3QUFA 1D9VA 1EZOA 1ZKBA 3FGSA 4X9TA 3UIFA 4RNSA 2QSXA 2DWIA 4JWXA 4JBZA 1O7TA 4HS7A 2DXYA 3MVWA 2NUVA 2XXXA 3N5LA 2H99A 2QS4A 2QS1A 3IOWA 4U1OA 4JSDA 3TQLA 5I56B 5AA3A 4C1UA 3ZSFA 4PFYA 4ZEDA 1QKBA 3OO7A 5FHNA 4LZ7A 4DXUA 3CFZA 4NF6A 2XXUA 4KHZE 5I2NA 3CFLA 2D21A 2R6GE 3K6WA 2Y7RA 4FEDA 1GR2A 1QUJA 4MBPA 1UTHA 3FXRA 4LZ8A 1YCJA 3VV5A 4NF5A 1YTVA 1MH4A 4ZS9A 5H8HB 5KDTA 3HHGA 4X48A 2I4CA 4LQ2A 4IO2A 4R9GA 1N7XA 1Y3PA 1SW2A 4OHNA 4QSCA 2X26A 3V8XB 4H8JA 2HQ0A 3FVNA 4PQJA 5CMBA 1B6HA 2H5YA 3S4UA 2AYSA 1A8FA 1SI1A 2VD2A 3DP4A 4RPOA 3AXFA 4H67A 3USDA 4KI0E 3MVXA 2XXQA 2XXTA 2O68A 3M3LA 3K2DA 3OO6A 1S7YA 4F18A 3PV0E 3O97A 3K6XA 2HFBA 1IXGA 3MWBA 1ZU0A 1MXWA 1B4ZA 2O51A 2DS9A 3BBRA 4Q0CA 5DEXA 4LATA 2Y7PA 4I62A 4KFQA 3FXQA 3RLFE 5LOMA 4RA1A 4EQBA 4OEUA 4JB7A 3THIA 3ZKKA 4RK9A 4ZEFA 5ELVA 3H4ZA 2RF1A 4H1XA 4EUOA 3MW0A 1B3GA 3PUZE 4OERA 4XTCQ 3VVEA 4KQPA 5I2KA 1MXYA 3R26A 1UQWA 5AA2D 2REJA 3MZ9A 4WEDA 1TFAA 1DTGA 1TFDA 3VFJA 1ZJLA 1R1NA 4R73A 1PBPA 3SEXA 3V89B 1LAFE 3T93B 2M8CA 4ZECA 1N3XA 4O3CA 5H8FB 4R2FA 1H45A 5BUUA 2W7YA 2I48A 5I58B 5K2XA 5I57B 4YB7A 2F34A 3PPNA 2QMWA 3N26A 1I69A 3V5AA 1VE4A 5L9SA 3TKDA 3TPAA 1B7ZA 1LCFA 3PPRA 4H5GA 5CC2A 3TDJA 1MRPA 1MDQA 1M5DA 4ZE9A 4U22A 1B5HA 4F3SA 1M5BA 3C33A 1MQJA 1A40A 4RYAA 1SVXB 3RT6B 2ZYMA 3ONMA 5CM6A 2Y7IA 1L5TA 4PFUA 4MF3A 4GWOA 2FNCA 4YAHX 2YLNA 5B7DA 3O6IA 4YKJA 4BLAA 2PX1A 5KCJA 1Y1MA 1ANFA 1CE2A 1DPEA 3KG2A 3C34A 2GRVA 2HCAA 1SYHA 2HZKA 3A3CA 1YAEA 3OXNA 5I59A 1BKAA 3GLBA 2F7CA 4EQ9A 3E4RA 2RCAA 4ONYA 5IKBA 4F2OA 4F31B 2RC9A 2ONRA 3B7DA 2NOOA 4F39A 1EZ9A 1B5JA 4IGTA 2QPQA 1OIBA 4Q5TA 4NTLA 4NE4A 3U92A 1I6AA 1B9JA 1URSA 3CFXA 5TPAA 2XXVA 3ECRA 3HPIA 3HV1A 4DZ1A 1ZBMA 2AL4A 1D3KA 5H8NA 2DYXA 3EHTA 3MVYA 2ONSA 5L9OA 4H5FA 4ISUA 1S50A 3IOUA 1MQIA 1F9BA 1OLCA 2DE4A 4R2BA 2XXIA 2XXRA 4GLIA 1B05A 4QRZA 1H76A 3G7WA 3TAJA 2HZLA 2VD3A 3F11A 1TWYA 1OQGA 3KJTA 2OZZA 4U21A 2Q88A 3RTWB 1P1NA 5DVFA 3WAFA 3HO7A 3K01A 4M1VA 5AE4A 1JEUA 1QULA 2VOZA 2DE3A 3HN0A 3CG3A 3N6TA 2DSFA 3EHUA 4H6DA 1II5A 4UA8A 1RYXA 2ABHA 2PMSA 3KSJA 2REGA 4GD5A 4NF4A 1ELJA 1QUIA 3E9XA 3MZBA 1P1QA 2Z22A 3B6TA 1B3LA 3G3KA 2G29A 1IXCA 2V3QA 3TELA 2Q2AA 1B58A 4R72A 2Q8JA 3T66A 1UTBB 2YJPA 3ZS6A 2O84X 3IR1A 4C0RA 2GH9A 3VVFA 3PPQA 4AB5A 2HAUA 2THIA 2XXYA 3PD8A 4KYEA 1P99A 4R6KA 2Q89A 3PMVA 3FJGA 4FATA 3LUYA 2DQVA 4C1TA 4FIMA 1Y4CA 4F2QA 3EN3A 1PBQA 1H3DA 3LSFB 2XX7A 2IEEA 4I8CA 4DE8A 3JZJA 2ONKE 1ZMGA 1H44A 3OSQA 2H4IA 5BWJA 4ELPA 1AIVA 4LZ5A 3KN7A 1EZPA 4LA9A 3CSBA 3IO4A 5H8QA 1MH3A 2F6GA 3T96B 1Y9UA 4FJPA 3ILTB 4JDFA 3P7IA 1Y1ZA 3IO6A 4ELRA 2DVZA 2RCBA 4BDQA 2XXHA 3M8UA 3OEMA 4HW8A 4PFTA 3I3VA 3MC2A 1B32A 3Q28A 4FECA 5CMKA 4QFNA 5FTIA 3T9HB 1B2HA 2DWHA 3G3HA 5I58A 3DP8A 2XHDA 1JVXA 1B40A 3MPLA 4RY1A 1SYIA 1DSNA 3SKPA 3LSWA 3K6UA 3MP1A 2DWJA 2E1SA 4O3BA 5A5XB 3WAEA 3FV1A 5ITPA 1IZ1A 3HHFA 4RPNA 1ATGA 3LSLA 1IITA 1B3EA 4XIGQ 4F1VA 4GXSB 3R7XA 4OWDA 3O9PA 3O28A 1GGGA 4IY6A 4LP2B 4EXKA 2Z8DA 2F97A 1NKXA 2CMOA 3IOVA 4U2RA 1FTJA 2H25A 3TTNA 1WDNA 3GXAA 4OESA 4OEVA 4GFRA 2QS3A 4G68B 3RGYA 3VLUA 2RC8A 1UIVA 4IB2A 4F3PA 3K00A 3K4UA 2ANJA 3BFUA 3PGFA 2QMXA 1URGA 3KJ7A 2X7QA 4NF8A 1NL5A 3KOSA 3FV2A 1MPBA 5HM4B 2Z8FA 1Q35A 3U1OA 3TFLA 1N0TA 2KLFA 4DXBA 4OMBA 3M3FA 4QFPA 1FQBA 2ESNA 1Z7ME 3KFMA 2O7IA 3A09A 1VFEA 1B3FA 3OO9A 4E0XA 4OFLA 4EXLA 4ZEIA 3B6QA 5EYFA 2X7PA 3OEKA 5CMMA 3PU5A 2O7UA 5CRYA 3T9VA 4THIA 2IA4A 2I49A 2UYEA 1Y3NA 3OELA 1IUDA 4ESWA 3OMBA 4XKNA 4H8IA 3LSXA 4NWDA 3N94A 3W9VA 4P11A 3OENA 5DYHA 4OETA 5L8DA 1N76A 1A7LA 2P2AA 4U23A 4Z7EA 4OVJA 2Q9TA 2Z23A 4QFOA 1PDAA 4O3AA 5AA2B 2I0CA 4YKPA 2RINA 1LAGE 1LAXA 4YB6A 1Y4TA 2I58A 3VXCA 4QFKA 4F22A 5EHMA 3MUQA 4QHQA 1B0HA 1MY1A 4ZEBA 4F3GA 4LQ5A 2ZNTA 4OENA 5ITOA 1MPCA 1A8EA 1NNFA 3Q29A 4GRKA 4QFLA 3TTMA 4OQOA 2R71A 3H06B 2PBWA 3UA8A 3C35A 4R9FA 2NWJA 1XC1A 5F1QA 2UVJA 1OLAA 3TCFA 2I4BA 1SDXA 4GXAA 5ICQA 4G8HA 1B46A 1TXFA 5JTYA 3G3JA 1US5A 3H3GA 1UIUA 1KWHA 4ECFA 3TQWA 1QJMA 3VE1B 1EU8A 5FTHA 4F1YA 1D9YA 3T9UA 3SEWA 2H98A 4MFIA 3E13X 1XT8A 3CSGA 2PT1A 2BJJX 4KCDA 2VGQA 1JW4A 1N04A 3CR9A 4XKRA 1A99A 2O1MA 5KZTA 2F35A 2HAVA 3JYRA 2O6AA 2I0BA 3PUYE 4N13A 1USYH 1UTHB 3IJXB 4NF5B 3SEUA 4R75A 4GL0A 3PUXE 1M5EA 4PE5B 5KDTB 4RK2A 1MG1A 2B65A 1DMBA 4IGRA 3B6WA 3DP6A 2D5WA 4F1UA 1MXZA 1YPNA 3EF7A 4Z0IA 1PC3A 3LBSA 4G77A 1MY4A 1QKAA 2OBGA 3MVZA 3LC8A 4ZDMA 3OSRA 3RPWA 5I84A 3H6WA 3U93A 2D3IA 3DLNA 3U72A 4OFJA 3QAXA 5DVIA 2NVUB 4ZE8A 4X1DA 4MLQA 1R9QA 5DEXB 3FVGA 1FQCA 3VVDA 1SQYA 2DVCA 4TQUQ 3EPEA 3VLWA 3FIRA 3Q26A 1M5CA 4DIGA 1PEBA 4K3FA 2ZNUA 3K1PA 2PVUA 3TEPA 1B7UA 3CI8A 3M3KA 2OWSA 2QRYA 3L6GA 5I2KB 4R6YA 1DTZA 2PT2A 3GBAA 1MY0A 5I56A 4AB6A 2I3WA 4QSEA 3SEVA 1J1NA 4BDRA 5ICTA 2GHBA 1HSEA 1R9LA 4G68A 4DDDA 4I9DA 1BP5A 4JWYA 2QJEA 3QYTA 3S9MC 3IB0A 3QUJA 1MQHA 1RKMA 1MM7A 1QVSA 5DTBA 1Q1KA 3UORA 3C36A 4YB5A 1B1XA 3RUMA 3BFTA 3S9LC 4P0IA 1SD3A 1LAHE 4KCCA 4TLLB 5H8HA 4IO6A 3CIJA 2V25A 1DPPA 1Y3QA 4FE8A 4WKMA 3FUZA 1URDA 4HCYA 2ZYKA 2Q2CA 3VLVA 3TODA 1I6QA 3KZGA 1LBCA 4OFOA 2GHAA 1GV8A 3W15C 3KGCA 3GBBA 3T22A 2NXOA 3TTLA 3KOTA 2OK2A 3JV9A 4G8NA 1B1HA 5M2VA 4E0WA 4G8MA 1XHYA 5HBCA 2ZMBA 1B7HA 1MXXA 3O6HA 3FXUA 1GTKA 4YMBA 3K02A 3MPKA 3G3FA 3SDFA 3PUVE 5KCJB 1OQHA 3TCHA 5I59B 4G4PA 4XXUA 2OWTA 3IOTA 4ND9A 3PMWA 1MY2A 1AL3A 1FQEA 3PMXA 5JK4A 2UVGA 4IO4A 3VXBA 2XX9A 3TCGA 5AA1A 1WVJA 3H6UA 4R6HA 1JEVA 1QW0A 1LGBC 3C4MA 2ZYOA 3FASA 3QIMA 1VFDA 4F29A 5H8FA 1M5FA 4IO3A 4LUBA 5TPAB 3OOAA 2F78A 4WEPA 5I57A 4WXJA 2RKMA 3IJOB 1WODA 3TUSA 2O1LA 4DXCA 2Y84A 1SW4A 2A5TB 2V3UA 1LFIA 3G3GA 3H6TA 2F7AA 1MQDA 1P1WA 2HXWA 1AMFA 1LSTA 3RN8A 3BKIB 4QF9A 5FHOA 4LONB 4KD5A 2UVHA 2Y7KA 1IEJA 1O64A 2V3TA 4EF1A 4H0WA 3TZAA 1P1UA 1ZTYA 3I5OA 3PPOA 2XXPA 1MS7A 1USYE 4OTEA 2DOJA 4L17A 3N6UA 5HPQA 3OO8A 2DP8A 1SI0A 1IQ7A 1BTJA 5AA4B 1FTOA 1NNTA 4NF4B 1B4HA 4U4XA 5H8SA 4JWOA 4F19A 4IY5A 1MXVA 2I6EA 3E3KA 4KR5A 4DLDA 4EDPA 4BDMA 3MAMA 3IL1B 1LLSA 5JEIA 1N3WA 2Z8EA 1LFGA 4GQOA 2VHAA 3FZVA 3W9WA 3KSXA 2XD3A 4POWA 3S9NC 2ZNSA 1US4A 4I1DA 4M4GA 4YICA 5ISUA 2F5XA 1T0KA 5FHMA 1B5IA 1VR5A 3V83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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