4FORA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with flurbiprofen at 1.58 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Flurbiprofen at 1.58 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA02
3IORA 2G29A 2E0SA 3KOSA 2RKMA 5I58B 1A7LA 1OMPA 1LFHA 4RPNA 1DPPA 3IO6A 1B1HA 4OTEA 3K01A 2REGA 1LBCA 5KDTB 1MPDA 1PB8A 3OEKA 1IXCA 1B32A 4BDQA 4OESA 3SERA 5F7VA 3RT8A 3K00A 3KGCA 2A5TB 3R7XA 3PUWE 1B3FA 2XXPA 3K02A 2HCAA 4IB2A 2I58A 4NWCA 1XC1A 2ZNSA 4YZZA 2DVZA 1JW4A 1B51A 2DVCA 1O63A 1LFGA 3CR9A 4ELPA 4QSCA 3MVYA 4FEDA 3FD3A 4FE8A 1M5FA 4U4SA 5H8QB 4YB7A 1B7HA 1QUJA 1ATGA 1OQHA 3VLWA 4F3SA 3Q26A 3PPNA 1IZ1A 4FJPA 1MM7A 1HSLA 5DTBA 1LCTA 2QL3A 3IOUA 3DP6A 3MWBA 4K3FA 5FHMA 3IB1A 3KSJA 4GFRA 1N3WA 4KHZE 4U21A 2DXYA 4TLLB 2F97A 3T9XB 3G3JA 4JWOA 2PYYA 3DLNA 1H76A 2UVIA 4NMYA 1Y3QA 4PFYA 2Y7RA 4ZECA 2GHAA 5I56A 1AMFA 4KYSA 2RC7A 2QS1A 3C32A 1LAHE 2GH9A 1PC3A 2DWAA 3CSGA 3RPWA 1XHYA 1LSTA 1P1WA 4POXA 3O66A 3OEMA 4KYEA 5KZTA 1WVJA 4G68C 1BKAA 2QSXA 3HO7A 4LATA 4OWDA 2QPQA 3CG3A 4X48A 2DE3A 2RC8A 1NNTA 3FXQA 5AA2B 4X1DA 5CMBA 3QK6A 3S2VA 5FTHA 1SQYA 1A55A 1B4HA 1JW5A 1B58A 2G93A 3OXNA 2XXQA 3LUYA 1UIVA 4N07A 3FASA 1B7UA 3FV2A 3TTNA 1CB6A 4ZEFA 1QW0A 1WDNA 3PUYE 4GWOA 3G7WA 4KYDA 1LB8A 3WAFA 1Z7NE 2D21A 2E1SA 2RC9A 3QSLA 4XKPA 5F1QA 3W15C 5AA1A 1DTGA 4LQ2A 1JNFA 4ZEDA 1OLCA 2F78A 5CI5A 4OYVA 4OETA 2AYSA 4R9FA 3TDJA 3DP8A 5I2NA 3IOTA 1H45A 1US5A 4IO2A 2VGQA 3KSXA 1MDQA 5BWJA 5L9SA 3K1MA 1F9BA 3QXMA 3U8QA 3Q27A 4Z0IA 1JVXA 5I58A 1OVTA 1B9JA 4QFKA 3OO6A 1B5HA 5KDTA 3GBBA 2HZLA 4XXUA 1EH3A 4LZ7A 2NOOA 3UN6A 2ONKE 1QJMA 2A5TA 2O51A 5M2VA 3USDA 2B3FA 1UTBB 3K6UA 3W9VA 2Z8DA 2XX8A 1A54A 3KN7A 4ESXA 3THIA 2O7UA 4YB5A 4H65A 3PUXE 4OQOA 1URGA 4ND9A 2ESNA 1FQEA 2Z22A 1SW1A 4XKRA 3C36A 4PFUA 4U1OA 3V89B 3ODBA 1SW4A 3HPIA 2GRVA 5H8QA 1VR5A 3H03A 3MZBA 3PPQA 2XXHA 3H3GA 2X7PA 4KFQA 1B05A 5L8DA 3LR1A 4IO7A 4F29A 1SDXA 5AA3A 1LBBA 4G8MA 3RUMA 4BDNA 4WKMA 3BFUA 3SEYA 3FXUA 3DM0A 3EN3A 1Y1MA 5ELVA 2V25A 3ECRA 4OHNA 4ELRA 2XXYA 2DXRA 5I57B 4NWDA 5FHOA 2R6GE 1PB7A 3KFMA 1FQDA 2IEEA 1NNPA 4XIGQ 3FJ7A 3KN8A 1A8EA 3CI8A 1I6AA 4YICA 1GVCA 1SW2A 3MP8A 2UVGA 4U22A 3SEUA 3H7MA 5CC2A 1MDP1 2H98A 4MBPA 3TMGA 4QFPA 4M4GA 1ANFA 2RINA 3ZS6A 5A5XB 5B70A 3ONMA 3OO7A 3HHGA 4Q8RA 2Q89A 3K6VA 1T0KA 4JSOA 2R71A 3EQ1A 1R6ZA 4R6KA 1DTZA 4QSDA 2Q9TA 3TPAA 4RJZA 2I0CA 4X9TA 3M3LA 2GHBA 3EHSA 1GV8A 3D4GA 2XHDA 2P2AA 3D4CA 1Z7ME 1ZMGA 4ESWA 4GF8A 4R74A 4F2QA 4I8CA 3B7DA 4TLMB 4NF8B 1P1UA 3O6IA 4NF4B 3GBAA 3K1PA 4YMAA 4R6HA 1B5JA 1MXWA 1M5EA 5DT6A 4U23A 4YKPA 1URDA 4U2RA 2D3IA 1JVYA 3IOWA 4BDOA 3H6TA 4WEPA 2I48A 5J1DA 3TTRA 1XVXA 4QF9A 3MZ9A 4NTLA 3FVOA 3VV5A 1BTJA 1Y3PA 2R9JA 2D5WA 4YAHX 4Q0CA 2OWSA 1MXUA 2XXUA 4DZ1A 4LP2B 1URSA 3QUJA 2HAUA 5JTYB 2PX1A 3SKPA 4OEVA 4H6DA 4F3GA 1MH3A 3PGFA 4P11A 2ANJA 3A09A 3MW0A 1PB9A 3SEVA 2QJEA 3G3IA 4PE5B 3T22A 2XXIA 4R72A 5EYFA 4R2FA 4AB6A 1LB9A 3ZKKA 1FQCA 5CRYA 4GRKA 5IKBA 4OEUA 5DVJA 3MC2A 4R2BA 4JSDA 1UTBA 3C33A 1IIWA 2Y84A 1Q35A 3UK4A 1SI0A 2ABHA 3UP9A 1LGBC 4G77A 4GOTA 3L6GA 2OBGA 3KOTA 3TTKA 1B6HA 4GXAA 1UIUA 2VD2A 3C9HA 5JK4A 1N76A 3T66A 1MQGA 2AL5A 4F3BA 4YMBA 3VXCA 4OXVA 2CMOA 1S50A 1QVSA 4NEDA 4HS7A 2HEUA 3KZGA 3TCGA 1B40A 1HSJA 1OLAA 1R9QA 4IO5A 3U93A 2B3BA 5AA2D 3JYRA 3IJOB 2NXOA 4Q30B 1FCKA 2DP8A 4GL0A 1NMUA 2FYIA 4YKKA 1ZBMA 3GZGA 3TTMA 4LUBA 5I57A 1H43A 3V5AA 4H67A 2XXXA 4ZDMA 2F6GA 1D4NA 2XXTA 2RCBA 3TCHA 3QAXA 1WODA 1B0LA 1J1NA 2VP1A 2QS2A 3PUZE 4ONYA 2V3TA 1MQHA 4G68B 3RN8A 1MS7A 3TYHA 3VVDA 1P1QA 3IB0A 3AXFA 5H8NB 2HFBA 5A5XA 3B6TA 3E13X 1ELJA 5I2KB 2I4CA 1D9YA 4GXSB 4GLIA 1MY1A 4RK2A 4BDRA 4YU0A 1VFEA 1O64A 1Y9UA 2THIA 4IGTA 3U1OA 4M1VA 1ZIUA 4THIA 3CG1A 3T93B 2RCAA 3SEXA 1Y4CA 5L9MA 4JBZA 4ZEIA 3MAMA 4H5FA 4E0WA 3RNNA 3TQWA 3G3KA 3K0VA 3PMWA 5ITPA 2AIXA 4NF8A 4QRZA 4NF4A 5TP9B 2VHAA 4O3AA 2H9BA 2XXVA 3RGYA 2F7BA 1MQDA 1N84A 3GXAA 1ZU0A 3IOVA 4ZZAA 2O1LA 4N13A 1XT8A 1USYH 3PPOA 3CSBA 1BP5A 2DWIA 1MY0A 1ZKBA 4H5GA 3UGWA 3TAJA 1B7ZA 3RY3A 4N6PA 2HAVA 4RPOA 4FEBA 5DYHA 2UXAA 3OO9A 1PBPA 5JTYA 2UYEA 2Y7IA 2B65A 4IY6A 1RYOA 3V83A 2ONRA 1TFAA 1PDAA 4GL8A 3IJXB 4TQUQ 5CM6A 1YTVA 4WXJA 2V3QA 2PVUA 4KD5A 3EHUA 4G4PA 2F7AA 4F39A 5K2XA 1AIVA 2ZYMA 3VXBA 4H8IA 2YJPA 1FTKA 2F35A 4EF2A 2O1MA 2RF1A 3FGSA 3IL1B 3OELA 1JW1A 4XTCQ 1YPNA 3T96B 2ZNUA 1MPCA 4NF5B 4GIZA 5TPAB 4KCCA 3UORA 4AQ4A 1AOVA 2OJTA 3G3HA 3O28A 1IXGA 4LZ5A 3TKDA 4KCDA 2HQ0A 4F1YA 1YAEA 1FTOA 2ZYNA 4UA8A 2DQVA 2O69A 5B7DA 2YLNA 3U72A 3H06B 3MVZA 3VVFA 4H1XA 2DE4A 4F1VA 4C0RA 1Y3NA 3IK6B 3TQLA 4HTGA 3HHFA 3VLVA 1S7YA 3VDFA 4R9GA 5DEXB 4E0XA 1CE2A 2W7YA 4G68A 3HN0A 1NKXA 3Q28A 5H8NA 4OZ9A 5EHMA 2PBWA 2F5XA 1MXYA 4ZZEA 5I2KA 1QKBA 3FJMA 3IB2A 5K2YA 4F31B 3Q29A 2HZKA 4RNSA 1MQJA 4LA9A 2UVJA 4DXBA 5FHNA 1JQFA 3PPPA 1EZPA 1B1XA 2OZZA 1R9LA 4EUOA 4O3BA 1MH4A 3Q25A 3R26A 3V8XB 3U92A 1LAXA 3K4UA 4FORA 2OK2A 1SYIA 3I5OA 5I59B 1POY1 4DE8A 3S9MC 4IGRA 5HM4B 1MXZA 1ZJLA 3DELB 3SEWA 3IAZA 4DXUA 5TP9A 1JEUA 2F8DA 1MQIA 4DDDA 3LBSA 3OSRA 3EPEA 4PETA 3BBRA 5H8HB 3KG2A 4JXIA 3CFXA 3CRBA 1FTJA 4EDPA 2O84X 2P0SA 4IY5A 1MPBA 3LC8A 2O6AA 3S4UA 2QMXA 1O7TA 3E9XA 4F2OA 5I84A 4EQBA 3FVKA 2F34A 5CBRA 3PPRA 4KI0E 3JV9A 3N26A 5CBSA 3QYTA 4FIMA 4R6YA 1NNKA 4I1DA 4NF6B 3OO8A 4MLVA 1BLFA 2NVUB 1DSNA 2V84A 3A3CA 2VD3A 1IQ7A 1N0TA 1VSOA 3N6UA 4PFTA 4EXLA 4FECA 2P1SA 2ZMBA 4ISUA 4EQ7A 1S9TA 2ALUA 2VOZA 3E3KA 4I62A 2QS4A 5ISUA 4PQJA 4FAJA 5AE4A 3CVGA 1I6BA 4G2ZA 3MBPA 4X1BA 4AB5A 2I6EA 2OCUA 1TFDA 4NF5A 2Z8FA 3UA8A 4POWA 5CMCA 1M5BA 5TPAA 1B3HA 1AL3A 1I6QA 2AL4A 1MY2A 3OENA 4U4XA 3U94A 4F1UA 4RYAA 2DYXA 2I49A 2Q8JA 2BJJX 3PMXA 3BFTA 2UYFA 4MLQA 1B3GA 1RKMA 1MM6A 2Q88A 3M3KA 3VE1B 2I0BA 4OVJA 4R73A 4C1TA 2DSFA 4GQOA 1LCFA 1N3XA 2FA7A 1IUDA 1GGGA 5HBCA 1FW0A 3I3VA 1FQBA 5L9OA 4ECFA 3OSQA 5DEXA 3W9WA 3K6WA 4RA1A 3FVGA 1US4A 2PMSA 4F22A 1IXHA 3OD7A 4YKIA 4ZS9A 2ZXTA 1SI1A 3FV1A 4BDLA 1DOTA 3FJGA 1LLSA 3T9VA 1P1OA 4DCYA 3HV1A 2O68A 4PP0A 3KEIA 1B0HA 3EF7A 3FXRA 4OFLA 1FTMA 1XOCA 3FUZA 5KCJB 4F3PA 4OERA 1N7WA 1FQAA 4RK9A 3MZ1A 2XX7A 1D3KA 3HCQA 4ZE9A 3I6VA 3H4ZA 4MH5A 1DPEA 3S9NC 3PU5A 3K6XA 1OVBA 4YKJA 1H44A 3L6HA 1GTKA 5I59A 3KN3A 5FTIA 4WEDA 1DMBA 3O2AA 2X26A 2UVHA 1LAGE 4JWXA 2M8CA 2XD2A 2XXRA 4KR5A 2DS9A 2ZYOA 2DWHA 5DVIA 1SW5A 1TT1A 1SYHA 2I3WA 3RTFB 4H0WA 5H8HA 3A3UA 3M8UA 4XKNA 3RLFE 1EZ9A 5ICQA 3GLBA 2HXWA 1M5DA 5TU0A 2XD3A 2X7QA 2Z8EA 4IO3A 3FATA 2PT2A 1TXFA 1SVXB 5CMKA 1PEBA 3TTLA 1PBQA 2Y7KA 5CMMA 1XVYA 5H8FB 4I9DA 1BIYA 4OFOA 4Z7EA 3O6HA 3PD8A 1D9VA 1N04A 4NF6A 4LQ5A 3VVEA 3O97A 1B46A 3N5LA 2I4BA 4IO6A 1JETA 3CIJA 4OMBA 2O7IA 3FIRA 4RY1A 4TOZA 4DLDA 4JWYA 1A8FA 4IO4A 1NFTA 3TZAA 3VLUA 2DE2A 1Y4TA 3K2DA 3VFJA 3T9HB 1QULA 2A5SA 4PFWA 3G3GA 4ELQA 3TELA 2Z23A 1I69A 1QUKA 3ILTB 4QHQA 2YPNA 1FQFA 3P7IA 3S9EA 1LAFE 3O9PA 2CZLA 2H99A 1UTHB 5EHSA 3IO4A 2F36A 4U1ZA 1B2HA 3QIMA 2Y7PA 4GVOA 3C31A 4F19A 1VE4A 4H8JA 4ELOA 5JEIA 4G8NA 2XXWA 5IAIA 4L17A 4C1UA 2Y7WA 4EQ9A 1L5TA 2FNCA 3KJ7A 5AA4B 2NUVA 1B5IA 4OFJA 4OENA 3K1NA 4ZEBA 4QFLA 4P0GA 2DWJA 3O29A 4GD5A 3PMVA 4Q5TA 4DIGA 3TEPA 3FVNA 1YCJA 1POTA 2LAOA 1R1NA 2Q2AA 3KJTA 3N94A 5KCJA 1II5A 4ZEKA 4HCWA 3LSXA 2IA4A 3R6UA 1NNFA 2KLFA 2PT1A 1H3DA 5BUUA 3BKIB 3ZSFA 2QS3A 3MQ9A 3RT6B 2ZNTA 1QKAA 2DOJA 4XKQA 4FATA 1RYXA 3DP4A 4LZ8A 1JEVA 2V93A 1EZOA 3TFLA 3ZKLA 4O3CA 3QUFA 1QUIA 1IEJA 1SBPA 1AH5A 4MF3A 1LFIA 3C34A 2REJA 3SESA 3MP6A 3SDFA 1MG1A 1ZTYA 2V3UA 2I3VA 3C35A 1A40A 3LSLA 4G8HA 3UIFA 2QMWA 3CFZA 4JDFA 1Q1KA 1B3EA 4MFIA 3OOAA 1USYE 3O6GA 3PD9A 3SETA 5H8FA 4R75A 5LOMA 2ZYKA 3LSWA 1OQGA 3MVWA 1NH8A 3H6UA 3MP1A 4DCXA 1VFDA 3M3FA 5ITOA 3B6WA 1Y1ZA 3IX1A 4HCYA 3H6VA 3B6QA 4F18A 2F7CA 3MPLA 3H6WA 3OMBA 3TODA 4ZE8A 2H4IA 3WAEA 1KWHA 1Y20A 4HW8A 1NL5A 1XS5A 1OIBA 1TWYA 3T9UA 5HPQA 3RTWB 1SD3A 1P99A 5I56B 3C4MA 1MXXA 5AA2A 1MY4A 3MVXA 4UACA 1IITA 1M5CA 3IR1A 1P1NA 1B3LA 1MY3A 4BLAA 4QSEA 1B52A 5ICTA 3CFLA 4BDMA 1FTLA 2OLBA 2GFEA 3PV0E 4KQPA 3E4RA 4EF1A 1UQWA 4QFNA 3TCFA 1UTHA 4KPTA 2H5YA 3S9LC 3ILUB 2NWJA 4RXLA 3EHTA 3FZVA 3HSTA 1A99A 2XX9A 1GR2A 4DXCA 3KBRA 1EU8A 1MRPA 5H8SA 3JZJA 1IXIA 2H25A 1B4ZA 2QRYA 5DVFA 3TUSA 4JB7A 3MPKA 2WKYA 5AA4A 3N6TA 3F11A 2OWTA 1N7XA 1NH7A 2F6PA 4NE4A 4LVQA 2Q2CA 3G3FA 4QFOA 4YB6A 2ONSA 3RQTA 3LSFB 3PUVE 4LONB 4P0IA 1MXVA 3MUQA 3MJNA 4EXKA 1ZLQA 5I2NB 1HSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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