3TTRA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with lidocaine at 2.27 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with Lidocaine at 2.27 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA02
5K2XA 3FVOA 3O66A 3FJGA 1AL3A 1OQHA 2QSXA 1IUDA 4XIGQ 2XXHA 3N6UA 4QSDA 4U22A 3T22A 3SETA 2YJPA 5JTYB 1Y4TA 2ZNTA 1JVXA 4G8NA 4F39A 3C9HA 4GXAA 4DXCA 1SVXB 4DXUA 2ONKE 3G3KA 2XXRA 2I6EA 2NOOA 3Q26A 4OXVA 1RYOA 4XKNA 4NF5A 3MQ9A 3V8XB 4H5FA 2PYYA 4MF3A 1P1UA 3ZKLA 3CI8A 2RINA 3VLWA 1B05A 4R9FA 1URSA 5A5XB 3H6WA 3K02A 1MQDA 3ONMA 3TELA 1MH3A 4DXBA 4MLQA 4GQOA 4OTEA 5CBRA 1B7UA 1MS7A 4N6PA 1QW0A 2DE3A 3N5LA 3I3VA 1B3FA 4EUOA 3Q27A 3PUYE 2O69A 2F7CA 1UTBB 4F18A 4R75A 3PUZE 1UIVA 3C31A 4TOZA 3FATA 4FATA 1XVXA 1DTGA 3K1MA 2DWJA 4H8IA 1Y4CA 3T96B 4KYSA 3P7IA 3K01A 4FIMA 1N76A 4G4PA 4LP2B 3TTNA 5I2NB 2Y7KA 1S9TA 4RJZA 2UYFA 2F34A 2O7IA 1FQBA 3EF7A 2O6AA 4F1VA 2OBGA 2Q89A 5B70A 1PBPA 1H44A 1LCFA 1IXGA 5H8QA 4N13A 2OJTA 1MDQA 4PFWA 3H6UA 1H3DA 2WKYA 4F1UA 1N0TA 4KFQA 2XD3A 3S2VA 1HSEA 4GRKA 3TTLA 4LATA 4WXJA 2AIXA 3G3FA 1ZLQA 1YCJA 4R9GA 1B32A 4JWXA 2XXWA 2B65A 2XXPA 3HV1A 1MM7A 5DEXB 5H8NB 5I84A 3K6VA 1H43A 4L17A 3MPLA 3TQWA 3OELA 5CMCA 1Z7NE 3FJMA 1TXFA 4F1YA 4P11A 3VVDA 3TKDA 3U8QA 1SYHA 3KN7A 1MY2A 1MXVA 3IB1A 4KYDA 1LAGE 4JSOA 2F6GA 3B6TA 1IIWA 3N6TA 2ONRA 4F22A 1USYE 2O84X 2IEEA 2I3WA 4H5GA 1NH7A 1IZ1A 1A7LA 1LB8A 4NWDA 4RXLA 3G3GA 5L9OA 2ONSA 5HBCA 5AA2B 4R73A 2GHBA 4DE8A 1ATGA 3OSQA 1SW5A 4F3SA 3OOAA 1RYXA 1EU8A 1R1NA 3VXBA 1B3LA 1NNKA 2E1SA 4YAHX 5JEIA 2P1SA 3T9UA 2PT2A 4FECA 1M5FA 3VXCA 2G29A 1FCKA 3C33A 2Q2AA 1LFHA 1BKAA 1QVSA 2V3QA 2DXRA 3K0VA 4Z0IA 4GFRA 1B7HA 1II5A 5HM4B 3O6IA 2R71A 1Y1ZA 1B46A 1BIYA 3MPKA 2Z23A 4FORA 3TTRA 1S50A 3T9XB 1DPPA 4G2ZA 4P0IA 4ZZAA 3UN6A 3V83A 3C34A 3O29A 1P1OA 3Q28A 3QYTA 1I6AA 5JTYA 4I62A 4GF8A 2W7YA 5AA1A 1I6BA 2DWAA 4JXIA 4FEDA 5ITPA 4IGRA 3MC2A 4IO3A 3OENA 1JW1A 1A54A 3VV5A 4UACA 3OMBA 1ZMGA 2HAUA 1UQWA 3G3IA 1POTA 1LFIA 4ZEBA 1F9BA 2UVJA 4OMBA 1NFTA 4LZ5A 3U93A 1SW4A 4OERA 5IKBA 1MPBA 3FVKA 4YKPA 4O3CA 1LAHE 4R6HA 2ANJA 4RYAA 3DM0A 2ZMBA 4HCWA 3ILTB 4BDOA 2B3FA 3L6GA 5I56B 3UGWA 4C1UA 3DP4A 4GLIA 1LFGA 2CMOA 4NF4A 1HSJA 4HS7A 5TP9A 4JWOA 2HEUA 1MQHA 4GWOA 1JW5A 2NUVA 5M2VA 2H99A 3IB0A 3MZBA 3K00A 4Q5TA 1A55A 2Z8EA 3TCFA 1NMUA 2XXYA 3IJOB 4R6YA 3JZJA 3TMGA 1L5TA 3S9MC 3BFTA 1PC3A 4H6DA 3M3FA 5I2NA 2OWSA 1MY0A 2XX7A 3O28A 4ZE9A 1DPEA 2UVGA 4F3GA 5AE4A 3B6QA 3GXAA 1B52A 3VVEA 3PD9A 4POXA 4F3PA 3U94A 3TYHA 3PPQA 3MUQA 3KG2A 3PPNA 1MG1A 4PFUA 3T9VA 1OMPA 3EHUA 1JVYA 2DOJA 4QHQA 1FQAA 3HCQA 3T93B 4OETA 2I3VA 4BDNA 4OEVA 2F7AA 1MXZA 4FAJA 4GL0A 5DEXA 5H8NA 4YMAA 3L6HA 1IXIA 3EN3A 5CBSA 4IO6A 4PETA 4LZ7A 1B1HA 1CB6A 2Q2CA 3GBBA 4MFIA 5LOMA 1PDAA 3MVXA 2Y7IA 4E0WA 1WDNA 4YKKA 3USDA 4G8HA 5FTHA 2VP1A 3IOTA 3DP6A 3Q25A 1O63A 1DSNA 3HHGA 3FUZA 4ZEFA 1IXCA 3HPIA 1SYIA 1B5IA 4PQJA 4Q30B 3TODA 3U72A 2XX9A 1A99A 3ILUB 4BDMA 2I48A 4DZ1A 2XD2A 4NF6B 4NE4A 2GFEA 3O97A 1Z7ME 1Y9UA 5ELVA 1AH5A 3D4GA 5AA4A 2DS9A 1SI0A 3BBRA 3QUFA 5ICTA 4YKJA 1LGBC 3FV2A 4ECFA 2HAVA 2Z8FA 1FTKA 4OEUA 1GGGA 4JSDA 2F78A 2XHDA 3MJNA 5DVIA 3TUSA 2VD3A 3PUVE 3FASA 4PFTA 2XXIA 4KI0E 1QJMA 4DLDA 3FV1A 2ZYNA 2I4CA 4X1BA 3PMWA 4H0WA 3GLBA 4KCDA 1MXYA 1NNPA 3BFUA 1PB7A 4Q8RA 3OO9A 4KD5A 1OIBA 5ICQA 1B4HA 1M5BA 3RTWB 4KYEA 4DCYA 4G8MA 2A5TA 4I1DA 2AL5A 2F5XA 3N94A 2OK2A 3SDFA 1R6ZA 4NEDA 5KCJA 3KJ7A 1ELJA 1JW4A 4YB7A 4HTGA 2QS4A 1VSOA 2XXUA 4U23A 4KR5A 3IO6A 4F2QA 2H5YA 3LC8A 3V5AA 3AXFA 4RPNA 5I57B 3PU5A 3E3KA 4JWYA 1D3KA 4XKQA 3MWBA 3R7XA 3TQLA 4LZ8A 3MP1A 4TLMB 3CFXA 5CMMA 2I0CA 4E0XA 3R26A 4NMYA 1JQFA 2HXWA 2I0BA 5I56A 1OQGA 2D21A 2PBWA 3OEKA 4YZZA 1YTVA 1B7ZA 1B6HA 2O68A 1SW2A 4O3AA 2OZZA 2ESNA 2XX8A 4RK9A 1TFDA 3IOWA 2QS3A 3Q29A 1I6QA 4LUBA 4KQPA 5J1DA 2R9JA 1UTHB 3N26A 4X48A 3O6GA 3KEIA 4GD5A 4EQ9A 3OO8A 1J1NA 1VR5A 2H4IA 1VE4A 4U4SA 1RKMA 1BP5A 3QUJA 1GR2A 4RNSA 4U2RA 2X26A 4F3BA 3CG3A 3M8UA 2D3IA 2HQ0A 4MLVA 2UVHA 1Q1KA 1GTKA 4WEPA 1N3WA 4LVQA 1M5EA 5CC2A 3TAJA 1D4NA 4H1XA 2OLBA 3KJTA 1WODA 1Y3QA 1MH4A 2PVUA 1B5HA 5CM6A 5I58A 4OESA 5BUUA 2YPNA 2GRVA 5H8SA 4O3BA 1B9JA 4N07A 1HSLA 4C0RA 3H7MA 3PMVA 2HZKA 4RPOA 4C1TA 3B6WA 2ZYKA 3IL1B 2O51A 1XVYA 2XXTA 2NVUB 4YB5A 1NL5A 2DYXA 4F19A 3TFLA 3O9PA 4ZS9A 4OFLA 3THIA 4RK2A 4BDLA 1SW1A 4ZECA 2QJEA 4XKPA 1P1WA 4ESWA 4I9DA 3TZAA 4NF6A 5L9SA 4H8JA 1ZJLA 2ALUA 2P0SA 5DYHA 3RY3A 2LAOA 4UA8A 1MM6A 3G3HA 3PV0E 1JETA 5K2YA 3QXMA 1CE2A 1MRPA 5A5XA 4WEDA 4IO5A 4QF9A 2HCAA 4GXSB 5FTIA 4I8CA 3CSBA 3MVWA 3HO7A 1Y3PA 3U92A 2NXOA 1DTZA 1A8FA 3IJXB 2O1MA 2RCBA 4POWA 4X1DA 1FQFA 5H8QB 2D5WA 1EZOA 1TT1A 2Z22A 4QFKA 1FTOA 3TTMA 4G68C 1LAFE 3S4UA 1UTBA 4K3FA 3IOUA 2F8DA 4XXUA 3MW0A 3CR9A 3LSFB 3RPWA 1EH3A 3W15C 5FHMA 1N84A 3LR1A 5EHMA 4PE5B 1B0HA 2I58A 3K6XA 1POY1 3CFLA 1Y20A 2DWHA 4U1ZA 4NF8B 1ZIUA 3PUWE 3SEYA 2F35A 3KOSA 3H06B 1EZ9A 4GOTA 4OVJA 3OO7A 3EQ1A 3IOVA 4ONYA 3JV9A 2IA4A 3LUYA 4U21A 5I57A 3KN8A 1NNFA 2HFBA 1FTJA 3C32A 2Z8DA 3OO6A 3E9XA 4R2FA 2Q8JA 3MZ1A 4F29A 3SKPA 3K1PA 1USYH 1VFEA 4AB5A 3R6UA 2I4BA 1S7YA 4HW8A 5TPAB 3IO4A 4ZEIA 1N3XA 4F31B 1QUJA 3CSGA 3K2DA 5ITOA 2XXQA 2PT1A 3FXQA 1ANFA 3O6HA 4EXKA 2FYIA 2VOZA 1MPCA 1O64A 3K6UA 2Y84A 2DP8A 3ODBA 3E4RA 2F6PA 1P99A 3KSJA 1YAEA 2RC7A 4GVOA 3SEXA 3LSXA 1B3HA 5FHNA 3MVYA 4EF1A 3PMXA 3FXUA 1IEJA 3KZGA 4DIGA 3UA8A 5H8FB 3E13X 3WAFA 3RLFE 1IITA 5DTBA 3VLUA 4RY1A 1LCTA 4TLLB 3H4ZA 1R9QA 1ZU0A 3FD3A 4OWDA 1IXHA 3KSXA 4QFLA 5AA3A 2H98A 5I59B 5AA2A 4LQ2A 1FQEA 1SDXA 3RT6B 1OVBA 4EQ7A 3TTKA 3GZGA 4AB6A 2F97A 3C36A 4U4XA 1R9LA 2OWTA 3UK4A 4FE8A 3U1OA 1MXWA 5EYFA 4OQOA 2VGQA 1Q35A 4OZ9A 4RA1A 3IK6B 3PD8A 4F2OA 1MQJA 3LBSA 2V93A 2GHAA 2UXAA 4ND9A 3OD7A 5KZTA 1LLSA 1N7XA 4YICA 4EF2A 3A3UA 3FJ7A 2DE2A 1SI1A 2E0SA 4M1VA 3V89B 4G68B 4ELPA 4ISUA 3C35A 4YKIA 4PP0A 4TQUQ 3D4CA 3CIJA 1A8EA 1QULA 1JEVA 1N7WA 5BWJA 4ESXA 4IO7A 1B40A 2THIA 2RCAA 3ZSFA 4OFJA 2CZLA 3KGCA 2REJA 1B51A 1ZKBA 2RF1A 3ZS6A 1DMBA 4BDQA 3B7DA 3HN0A 3TPAA 1AIVA 3W9VA 4WKMA 4NF4B 2ZXTA 3G3JA 3WAEA 4IY5A 4KHZE 5TP9B 4X9TA 1FQDA 3CVGA 5CRYA 3TCHA 3FIRA 4ZE8A 3UP9A 5DVJA 3MZ9A 1Y1MA 4OFOA 1MXUA 2O7UA 1TWYA 2DWIA 4PFYA 3IR1A 4U1OA 3RNNA 1XC1A 1KWHA 3TDJA 3SEVA 2H25A 4H67A 1OLAA 1NH8A 2RKMA 1JNFA 1XT8A 3H6TA 2V25A 4JBZA 2QPQA 1H76A 2Y7PA 2ZYMA 3FGSA 3H03A 1BTJA 4FJPA 2ZNSA 2A5SA 2Q9TA 1FQCA 4ELQA 3S9NC 5F1QA 2UYEA 4IB2A 1UIUA 3DELB 3PGFA 2P2AA 3DLNA 1MY3A 5KDTB 1SQYA 3QSLA 5H8HB 4GL8A 1M5DA 5I2KB 1H45A 3BKIB 1PB9A 3PPPA 2F7BA 2B3BA 2ABHA 4ZZEA 1MPDA 1Y3NA 5IAIA 5TU0A 2VHAA 2QS2A 4NF8A 1VFDA 3VFJA 2RC9A 3CFZA 1QUIA 3H6VA 3SEWA 1WVJA 2VD2A 2QL3A 4OENA 3FVGA 1GV8A 4JDFA 4THIA 3FXRA 3JYRA 3MVZA 2Q88A 4NTLA 4P0GA 1URGA 3RUMA 3VE1B 4XTCQ 3RGYA 2PMSA 1P1QA 3TCGA 4ELRA 1PEBA 4R74A 4ZEKA 2QS1A 3C4MA 4DCXA 5TPAA 2AYSA 4OHNA 3KOTA 1N04A 3MP8A 4HCYA 3O2AA 1EZPA 2BJJX 3W9WA 2XXVA 1PB8A 3I5OA 3HSTA 1XS5A 2GH9A 3HHFA 1XHYA 4XKRA 3CG1A 2DSFA 5AA4B 1JEUA 3IB2A 4KCCA 3EPEA 3LSLA 4NF5B 3M3KA 3PUXE 3RT8A 3MAMA 4YB6A 4G77A 3SESA 4QRZA 1AMFA 1LSTA 2F36A 4QFOA 5AA2D 4ZDMA 5H8FA 2H9BA 2Y7WA 3TEPA 2X7QA 1FW0A 3EHTA 1MQIA 5HPQA 3IAZA 4YMBA 5FHOA 2YLNA 5I59A 2M8CA 4LA9A 3I6VA 4IO4A 1LB9A 3T9HB 1D9YA 3KBRA 4R72A 4ZEDA 4FEBA 4JB7A 2FA7A 4EQBA 1ZTYA 4NWCA 1PBQA 4KPTA 1LBBA 4IGTA 2V84A 5L9MA 1LAXA 1QKAA 3KN3A 2A5TB 4QFNA 4MBPA 5DVFA 3IX1A 2ZNUA 3VDFA 3QAXA 2AL4A 1LBCA 3UORA 1URDA 1OLCA 5KCJB 2V3UA 3ECRA 3F11A 1O7TA 3KFMA 5B7DA 3RQTA 3FZVA 1BLFA 2QMWA 2XXXA 3G7WA 5CMBA 3PPOA 4G68A 3MBPA 3ZKKA 2REGA 3SEUA 5CMKA 2NWJA 3OSRA 2QRYA 1YPNA 4GIZA 2RC8A 3EHSA 1D9VA 1ZBMA 5L8DA 1OVTA 4R6KA 1SD3A 5EHSA 3IORA 3OXNA 4LONB 1NKXA 3RN8A 1US4A 1B4ZA 4LQ5A 3LSWA 2QMXA 1DOTA 2DVCA 4OYVA 2DQVA 3VVFA 1T0KA 1NNTA 1MY1A 3T66A 4Z7EA 2Y7RA 3H3GA 5DT6A 4QSEA 2R6GE 3PPRA 1B5JA 3S9LC 1AOVA 4IO2A 2KLFA 3OEMA 5F7VA 1MDP1 4QSCA 4DDDA 4MH5A 1FTMA 1FTLA 5JK4A 2ZYOA 3DP8A 4QFPA 1B1XA 1QUKA 1XOCA 1TFAA 2G93A 3SERA 1A40A 4ELOA 2PX1A 3QK6A 1B3GA 4M4GA 4BLAA 1M5CA 4Q0CA 3QIMA 1B3EA 2UVIA 1MY4A 2FNCA 3K6WA 3MP6A 1B2HA 3GBAA 3RTFB 4EXLA 3A09A 1MXXA 2DE4A 1GVCA 5KDTA 5H8HA 4IY6A 4R2BA 5I2KA 3CRBA 1I69A 3FVNA 1SBPA 4H65A 2HZLA 2I49A 1B0LA 4AQ4A 1B58A 5CI5A 3UIFA 3M3LA 4YU0A 3K4UA 2DXYA 2X7PA 4BDRA 2DVZA 2O1LA 1IQ7A 3K1NA 3VLVA 1MQGA 5I58B 3S9EA 1UTHA 2OCUA 2V3TA 1QKBA 5ISUA 1P1NA 4EDPA 1US5A 3A3CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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