3TTRA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with lidocaine at 2.27 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with Lidocaine at 2.27 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA02
2OBGA 3E9XA 3GBBA 1SYHA 4QFPA 4EDPA 4L17A 3A09A 5BUUA 4ELOA 4U1ZA 3O6HA 3TYHA 4MFIA 4EXLA 5ITOA 1URDA 4IGRA 1JW1A 3FXRA 4NTLA 1MY4A 1FQAA 3N6UA 1SQYA 4GXAA 5IKBA 2P2AA 1HSLA 3RPWA 1XOCA 4ZZAA 1POY1 5K2YA 2V3UA 3O97A 4G77A 2Z8FA 3MW0A 1UTBA 2I4CA 2XXWA 2ZNUA 1LLSA 3CIJA 2I3WA 4IB2A 2O1MA 1SW5A 4KCDA 5H8NA 2XXXA 1VFEA 3RT6B 1R9QA 2I4BA 1B58A 4GWOA 3V83A 3KN3A 3R6UA 1BKAA 1MDQA 2IA4A 2Y7KA 4M1VA 3OEMA 5AA2A 1FQFA 1FQBA 1M5DA 2AIXA 4H5GA 1JQFA 1ZMGA 1P1WA 1US5A 1NH7A 4LUBA 4U23A 3EF7A 3VXCA 1BP5A 3IJXB 4OYVA 5KZTA 2O1LA 2PYYA 2VD2A 3FUZA 1L5TA 2O7IA 1XC1A 2GHBA 4ONYA 4KPTA 3VFJA 1A99A 5HBCA 1ANFA 2V3QA 2ZNSA 3IR1A 2DS9A 1B7UA 1F9BA 4I1DA 5I57B 3IJOB 5I59A 3PD8A 5FTIA 2O69A 2QS4A 2B3FA 3G3KA 4MBPA 4WEDA 2HQ0A 3QUJA 1N7WA 4HCWA 5KCJA 3GXAA 3MPLA 3UK4A 2I58A 4TOZA 5CMBA 4YB6A 4F2OA 1LAFE 3HHGA 1HSJA 1T0KA 5JK4A 1AIVA 1Y4CA 2PT1A 1MG1A 5AA4B 3K02A 4GXSB 2DE3A 3DLNA 3E13X 3TTMA 2RC8A 1OVBA 4IY6A 3KJ7A 3BBRA 3VVDA 2Z8EA 1RYXA 5J1DA 4TLLB 5AA2D 1IITA 2Q2AA 3RTFB 3JZJA 4KYSA 4X1BA 3B7DA 4DXBA 2DWIA 1PB9A 1MH4A 1M5CA 2I0BA 2ZYMA 1H45A 2ONRA 1YPNA 1ZU0A 3L6HA 2H98A 3TMGA 3FJGA 4XXUA 1GV8A 2I48A 1B6HA 1RKMA 2Q9TA 2R6GE 2QSXA 4OEVA 3TQLA 5DVJA 3TUSA 1SBPA 1N3WA 3C35A 1JW5A 4F39A 1Z7NE 3MZBA 3I5OA 3K6XA 3EQ1A 2UVGA 3PGFA 2AYSA 1JW4A 3SEWA 3PPRA 3T66A 5TPAB 2GH9A 1MXVA 4OMBA 2QJEA 1UTHA 4FE8A 1TXFA 1QKBA 1VR5A 2I49A 3EHSA 3KSJA 4G4PA 3SDFA 4M4GA 3ZKKA 1PB7A 4F31B 1OIBA 1IEJA 2QS3A 4GQOA 5CMCA 3I6VA 4C0RA 4EQ7A 2OWTA 2A5SA 3TCFA 5CBSA 3FXUA 3PUVE 3IB2A 1LCTA 3RT8A 5KDTB 3BKIB 3Q26A 4MLVA 4OXVA 2Y84A 3RUMA 1FTOA 4LQ2A 3VE1B 5CMKA 2O6AA 3FIRA 1LSTA 3UA8A 1URSA 1O7TA 2ONSA 3H6WA 4ZEIA 1QUKA 2HFBA 3PUZE 3LBSA 5CMMA 3K1MA 3CRBA 5DVIA 1FCKA 3FATA 1I6AA 4I9DA 4F19A 5F1QA 1B5JA 1R6ZA 3O2AA 4F22A 3EPEA 2A5TA 4MF3A 1B3HA 2HCAA 4Q5TA 5DYHA 3RNNA 4EF1A 3MVYA 5TP9B 4LZ8A 3U93A 1AL3A 2ZYOA 4N13A 1VSOA 4E0WA 3CI8A 3H6VA 4QSCA 2ANJA 3W15C 3MVXA 3SEXA 1EZ9A 3IOTA 5FHNA 1IXIA 1Y4TA 4X1DA 2GHAA 1FTJA 1Z7ME 1BTJA 2X7PA 1I69A 1US4A 4RYAA 1JVYA 4U2RA 4ISUA 5I57A 4JWXA 4F3GA 3KN7A 1B3GA 4NE4A 3HCQA 3IAZA 3VLUA 3MQ9A 3D4CA 1POTA 4U1OA 1QVSA 5I58B 3FASA 1S50A 2H5YA 1D9YA 3CG3A 4C1TA 2PVUA 3MP6A 3C33A 2R9JA 4YMBA 5JTYA 3MVWA 2DP8A 4QSDA 5LOMA 3FVGA 3M3FA 1H3DA 4ELQA 4H5FA 3O6IA 4ZECA 1B4HA 2F78A 1JEUA 4EQBA 3RY3A 3JV9A 1B0LA 4IO6A 2Q8JA 2X26A 3IB0A 2REJA 1B3EA 3AXFA 3G3IA 4H6DA 2DYXA 5CRYA 2XX9A 1NNFA 4KCCA 5HM4B 1GR2A 3IO4A 2RC7A 4OHNA 1USYH 2RC9A 3N94A 3RGYA 5F7VA 3TQWA 4PP0A 4IO7A 2QS2A 1JVXA 2KLFA 2QL3A 5FHMA 3SKPA 3U1OA 1NH8A 1LGBC 1PBQA 1N76A 3W9VA 1FTKA 4N07A 4R6KA 1M5EA 1MPDA 1SW4A 2ZNTA 4AB6A 4QRZA 1QULA 2DWJA 4GD5A 2WKYA 3OEKA 3QXMA 4OFJA 2Y7RA 3CFZA 2F6PA 3JYRA 1LFIA 4NMYA 1NKXA 3C31A 3G3FA 2OLBA 3IL1B 3I3VA 3K00A 1N3XA 2ABHA 1OVTA 2IEEA 1MXWA 4F1YA 3B6TA 4JBZA 4BDRA 2B65A 3MJNA 4FJPA 3PU5A 4RXLA 5FHOA 4XKRA 2M8CA 2XD2A 4R75A 4TLMB 2NXOA 4P0GA 2O84X 1IIWA 1JEVA 3K6WA 1MQJA 4UA8A 4XKPA 2DQVA 4OTEA 3Q29A 1Y3QA 5DEXB 4ZZEA 2HEUA 5H8HB 2ZYKA 3TPAA 4EUOA 3ODBA 4PFUA 4QFOA 2HZLA 1DPEA 4GF8A 5ISUA 1A54A 2H25A 4JSDA 3PMVA 3G7WA 4OFLA 5ELVA 1FQCA 4HTGA 1B3LA 4TQUQ 1TFAA 1IZ1A 1P1QA 1ZJLA 1SDXA 2VD3A 2QMWA 3U8QA 3WAEA 1CB6A 2RCAA 4PFWA 2DVCA 3DP6A 1Y9UA 4R2BA 1DTZA 2UXAA 4LP2B 5HPQA 3PD9A 4XIGQ 3U92A 4EQ9A 2X7QA 1UTBB 4R72A 2H9BA 3HHFA 4GRKA 2A5TB 2AL4A 4O3AA 5TP9A 3OMBA 2H99A 3ZKLA 2RF1A 3TTNA 1LBBA 3WAFA 2ONKE 3TDJA 3IOVA 2P0SA 3EHTA 5FTHA 5L8DA 5DVFA 5AA2B 2XHDA 4HS7A 4PQJA 3LR1A 3OO7A 3F11A 4DXCA 2Z22A 1AOVA 1A8EA 3PUXE 3CFXA 5ICQA 2D3IA 5M2VA 4HCYA 1A40A 2PT2A 5B7DA 2Z23A 1B1HA 4F3PA 2DVZA 4P0IA 2E0SA 4F18A 1M5BA 5I59B 5DT6A 1MY2A 1LFGA 2NOOA 2O7UA 4NF6A 1N7XA 5I2KB 4FATA 3T22A 3TKDA 3O6GA 3H6UA 3M3LA 5IAIA 1MPBA 2DXYA 2ZXTA 1D9VA 4G2ZA 3FGSA 4OESA 3SEUA 3VVEA 2NWJA 3N5LA 4IO3A 2Q89A 4KFQA 4O3BA 1MXYA 1ZKBA 1SVXB 2DWAA 2F35A 4FECA 3QIMA 3IK6B 3USDA 1LFHA 2PBWA 4G68A 4MLQA 2CZLA 2HAUA 4YB5A 3T9UA 1Y1MA 1FQDA 3OELA 5K2XA 3FV1A 1B52A 4RA1A 4F3SA 2Q2CA 5ICTA 2F36A 4U4SA 3DM0A 2Y7PA 3TEPA 3H3GA 3ECRA 3M3KA 3V8XB 3VLWA 2VHAA 1SW1A 3C36A 1OQHA 3CVGA 3ILTB 4POWA 4RK2A 4NF5B 4KHZE 1D3KA 2FNCA 3KSXA 2XXVA 1OLCA 3TELA 1MPCA 2XXQA 3FVKA 3MPKA 2UVIA 4R9GA 3T93B 3ZSFA 3N6TA 1PC3A 2VOZA 1SYIA 1MQDA 2OJTA 2Y7IA 3LSXA 4KR5A 4IO5A 4OQOA 2XXIA 4PETA 4Z0IA 5H8QA 3OSQA 4H8IA 3UN6A 2ESNA 4U22A 1WVJA 1XVXA 2XXRA 1DOTA 1YAEA 3HO7A 3T9VA 2V84A 3SEVA 2F6GA 3OO9A 5DEXA 1NNTA 4O3CA 3OSRA 3S9NC 1GTKA 3KOSA 4KQPA 1JNFA 2F5XA 4I8CA 4YKPA 4U4XA 4G8MA 3DELB 4DE8A 5KDTA 5AE4A 4ZE9A 2ZYNA 4YU0A 1B5HA 1XVYA 1AMFA 2FA7A 3KFMA 5AA1A 4XKQA 3VV5A 4H0WA 3O28A 1O63A 3TTLA 5CI5A 1N04A 1YTVA 3U72A 2XX8A 4ND9A 1MY3A 1B0HA 1MQIA 4YZZA 2XXYA 4JWOA 1B32A 1MQHA 3UORA 3ZS6A 4OZ9A 2DE2A 4OEUA 4FAJA 1PDAA 2OK2A 2REGA 3VVFA 3G3GA 3BFTA 4POXA 4QSEA 2NVUB 2DE4A 2O51A 4BDMA 2UVJA 1XT8A 1EU8A 2F8DA 3K0VA 3PMXA 3C32A 2UYFA 2Y7WA 1IXCA 3LSLA 5H8FB 3T9XB 4Q8RA 2AL5A 4JWYA 3QSLA 3CFLA 2UYEA 1URGA 5DTBA 1Q1KA 4JB7A 3V89B 2QRYA 5CM6A 1YCJA 2D21A 2DOJA 4NEDA 3FV2A 4AQ4A 2GFEA 3CSBA 5I2NB 1P1OA 1MQGA 4MH5A 3M8UA 4K3FA 4F2QA 2F7AA 1Y1ZA 3C34A 2Q88A 3GZGA 3QAXA 1N0TA 4NF8A 4R6HA 3UIFA 1A55A 3OO8A 4GL0A 3S2VA 1JETA 2XXTA 3H06B 1A7LA 2RINA 4JDFA 1LB9A 2O68A 3Q28A 4H67A 4NF6B 4BDLA 5I2KA 1MXZA 1B51A 3IX1A 3KOTA 4LA9A 3UP9A 3MZ9A 1FTMA 4R9FA 4BDOA 4IGTA 4ZE8A 4R74A 4RJZA 2OCUA 4LZ5A 3W9WA 1ZBMA 3C9HA 3N26A 4U21A 5EHMA 1MXXA 4N6PA 3OD7A 4DXUA 1ZIUA 3QYTA 4OWDA 4YICA 3MAMA 1FTLA 4ESXA 4OENA 3RTWB 2RCBA 1H44A 4PE5B 4Q0CA 1R9LA 3D4GA 4EXKA 1NMUA 4F29A 4ZEDA 1LBCA 4OETA 1B9JA 3TAJA 4G8NA 3PV0E 1DSNA 3LSFB 2OZZA 3FD3A 2F7BA 3FZVA 4RPNA 1I6QA 1ZLQA 2YLNA 4IO4A 5A5XB 3CG1A 4XTCQ 3L6GA 1MY1A 1NNKA 3E4RA 1LAHE 1H76A 4IO2A 4QFLA 3FJ7A 3B6WA 3RLFE 2THIA 5H8QB 1UIVA 2XXPA 2ZMBA 3IOUA 3Q25A 3H7MA 4QHQA 4X48A 4E0XA 4DDDA 2DSFA 2H4IA 4PFYA 2YPNA 3TCHA 1R1NA 1XHYA 4KI0E 4FORA 4THIA 2ALUA 2I3VA 4ECFA 3LUYA 1USYE 3G3HA 4GL8A 4NF4B 2VP1A 4H65A 2XXHA 2LAOA 4WKMA 4C1UA 3C4MA 3K01A 2F97A 1WODA 1B4ZA 4QFNA 4EF2A 1J1NA 1ZTYA 3IB1A 3CSGA 4GFRA 4DCYA 5AA4A 5I56A 2I0CA 5AA3A 1DTGA 1WDNA 3SERA 1PBPA 1SD3A 1B05A 2D5WA 3OO6A 3IORA 5L9OA 1GVCA 1MS7A 2V25A 3P7IA 3A3CA 3K1NA 3MZ1A 2RKMA 5H8SA 4YMAA 1NFTA 4ZEKA 3HV1A 2QS1A 2CMOA 3ONMA 4GLIA 1N84A 4YKKA 1IQ7A 1OQGA 2QMXA 3VDFA 4AB5A 4BDQA 2DWHA 1O64A 3CR9A 1CE2A 4DLDA 4DZ1A 4ELRA 4WEPA 3HSTA 5EHSA 1MXUA 4GOTA 5I84A 1EZPA 5I2NA 4NWDA 3O66A 3LSWA 3SETA 1MY0A 1Y3PA 2BJJX 4LVQA 3OXNA 5EYFA 3TTRA 4R73A 3TZAA 4FEBA 3K1PA 3SEYA 1EH3A 1IXHA 5TPAA 3RQTA 3R26A 1Q35A 1LAGE 4RNSA 1B3FA 1MH3A 3G3JA 4PFTA 3HPIA 4LZ7A 1VFDA 3V5AA 2YJPA 4NWCA 4JXIA 1DMBA 1RYOA 1ELJA 3MVZA 4RPOA 1MDP1 2XD3A 1XS5A 2F7CA 4OERA 3ILUB 2NUVA 1MRPA 3R7XA 2P1SA 4ESWA 3Q27A 3FJMA 3DP4A 3QK6A 4X9TA 1P99A 1SW2A 3IO6A 3K2DA 4ZEBA 4ZEFA 1IXGA 1B7ZA 4G68C 1TWYA 2HZKA 1OLAA 3S9EA 2PMSA 4Q30B 1A8FA 4DIGA 3KN8A 1QW0A 4G68B 3OENA 1FQEA 1B7HA 2GRVA 1MM7A 3U94A 3PUWE 1QUIA 4QF9A 3SESA 5H8NB 4ZS9A 1B2HA 5TU0A 3VXBA 1MM6A 5L9SA 1HSEA 3K6UA 5JEIA 5A5XA 3FVNA 3KBRA 3FVOA 4JSOA 4IY5A 4G8HA 4NF5A 2XXUA 3B6QA 4YKJA 4BLAA 1Y20A 5CBRA 2OWSA 1II5A 1OMPA 3KG2A 2W7YA 3TODA 3KJTA 1LAXA 3T96B 3MP8A 1S7YA 4DCXA 5BWJA 1TFDA 3QUFA 2DXRA 2QPQA 3VLVA 3FXQA 3LC8A 1UIUA 4RY1A 5ITPA 3MBPA 3PUYE 4XKNA 1M5FA 5I58A 4KYDA 3TCGA 3GBAA 3RN8A 1SI1A 3T9HB 4NF4A 2E1SA 4YKIA 1NL5A 2PX1A 3MWBA 5JTYB 4LONB 2V3TA 5B70A 1NNPA 1AH5A 1PEBA 3E3KA 3IOWA 4HW8A 1B40A 3H6TA 5CC2A 1LB8A 5KCJB 3PPQA 4I62A 4YAHX 3THIA 3MP1A 1I6BA 1KWHA 5I56B 2XX7A 3DP8A 1UQWA 3H4ZA 4F1VA 3K4UA 1IUDA 3BFUA 3UGWA 2G29A 3S9MC 3A3UA 4GIZA 2G93A 3PPPA 3KEIA 4FIMA 4KD5A 5L9MA 3S9LC 3PPNA 3TTKA 1B46A 4ELPA 4R2FA 4YB7A 3KGCA 3MUQA 1EZOA 4KYEA 1PB8A 3PPOA 4BDNA 4F3BA 4GVOA 4LQ5A 1QKAA 4P11A 4UACA 3O29A 1FW0A 1H43A 1SI0A 1GGGA 2HXWA 2HAVA 3EHUA 3EN3A 4FEDA 1BLFA 1LCFA 1BIYA 1P1NA 2F34A 4ZDMA 5H8FA 2B3BA 1Y3NA 3MC2A 1QJMA 2Z8DA 3K6VA 3HN0A 4LATA 3PMWA 4OVJA 4RK9A 4F1UA 3OOAA 1VE4A 2R71A 2I6EA 2UVHA 4Z7EA 4H1XA 3O9PA 4OFOA 1B1XA 1DPPA 2VGQA 1P1UA 1ATGA 1D4NA 3TFLA 4R6YA 2V93A 3GLBA 3KZGA 1TT1A 4H8JA 1UTHB 1B5IA 3H03A 1S9TA 2FYIA 4NF8B 5H8HA 4WXJA 1QUJA 3S4UA 4QFKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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