3TTRA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with lidocaine at 2.27 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with Lidocaine at 2.27 A resolution
rcsb
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA02
3FVOA 2Z8FA 4P0GA 3GBBA 4PFYA 4LUBA 3W15C 1NMUA 2DXYA 2G93A 2NXOA 3LR1A 1MY3A 2O7UA 3UP9A 2O84X 4YKIA 5FHOA 3PGFA 1A40A 1HSLA 4HCWA 4IO7A 1SI1A 3ILTB 5AA2D 3H06B 2YJPA 5I58B 5I57B 1XC1A 4PFUA 4NMYA 2OK2A 4TLMB 5H8SA 3U94A 5KZTA 1B52A 3EPEA 1SW2A 4RPNA 4C1UA 1MY4A 1B40A 3H3GA 3C35A 3CI8A 2RKMA 1JW5A 3FVGA 4GXAA 2ESNA 3PPPA 3K2DA 5I58A 5I57A 4R74A 1DPPA 1KWHA 1EZOA 2R9JA 4H1XA 4YKJA 4YB6A 4POXA 4H67A 3C36A 1D9YA 3IORA 2XXRA 3IJXB 4I1DA 2DWHA 1MM6A 3N94A 3PPNA 4YU0A 3CFLA 1M5EA 5L9MA 3UN6A 1P1QA 5A5XB 2F7BA 5I2NB 1JVXA 4OEUA 4YKPA 2OLBA 1RYOA 5I59A 2DWAA 1ZMGA 1EZ9A 3V89B 2RINA 3OO8A 3K6XA 2Z22A 3O6HA 1H43A 4JWYA 1B0LA 5L9SA 4YICA 1VR5A 1BKAA 2HAUA 3UIFA 4IO5A 3H6WA 3HPIA 1XVYA 1QKAA 1I69A 1NNPA 2P2AA 3SEUA 1M5DA 4JSOA 1AMFA 3MVWA 4DXBA 4GL8A 5CMKA 2ZYKA 2ABHA 4N6PA 3M3KA 3A09A 2XXIA 3FATA 1S7YA 4EXLA 3FXUA 4IY5A 4OYVA 2DWJA 4F2QA 3IOVA 4ONYA 3G3KA 3IOTA 4QHQA 1FW0A 4RXLA 2I4CA 5DVJA 2OZZA 5H8QB 1MY0A 4F1YA 2NUVA 4Z7EA 2QRYA 1OLAA 3RNNA 5CI5A 3KOTA 1R6ZA 3K6VA 4LQ5A 4QFLA 1N84A 1AIVA 3I5OA 5ITOA 4G8NA 4RY1A 4X9TA 4YB7A 1QKBA 1IXIA 1MQIA 5H8QA 4L17A 1B0HA 5B70A 3C32A 3TTRA 3TCHA 1UIUA 2PYYA 1USYH 3O66A 3USDA 4P11A 3LSXA 2UVHA 3MZ1A 3MZ9A 1SW5A 3O2AA 3OELA 4PQJA 2X7QA 4EDPA 1NNTA 3QAXA 3K6UA 4EF2A 1UTHA 2RCBA 4YMBA 3IX1A 5JTYB 1MXVA 2Y7KA 1B3EA 5HBCA 3B7DA 4H8JA 3VVEA 4FAJA 2OBGA 2Z8EA 2YLNA 3TUSA 1B3HA 1DOTA 4POWA 2PBWA 4P0IA 4OXVA 2F34A 5B7DA 3L6GA 2UVIA 3PUXE 4XTCQ 3UORA 4KHZE 4U4SA 2D21A 2B3BA 1YPNA 2AL4A 2I4BA 3E3KA 4F3PA 4ZDMA 1B05A 2VGQA 3BKIB 2KLFA 4TOZA 2XX7A 2GFEA 3KJ7A 1NNKA 3U93A 1J1NA 2HXWA 1XT8A 5I56B 2B65A 4NTLA 4WKMA 4XXUA 1MRPA 3FXRA 3KJTA 5L9OA 4LZ7A 3S2VA 3V8XB 1XVXA 4EQ7A 3W9WA 1FQFA 4LQ2A 2PX1A 3QSLA 2HFBA 3FJ7A 3PPOA 4U4XA 4NF5A 4R72A 4RNSA 1B4ZA 4IB2A 3RTWB 2F7AA 3EHUA 4F2OA 2O69A 1NH8A 3MZBA 5I56A 3PPQA 3IJOB 3S9LC 1MPBA 5CC2A 1B58A 1B5IA 1Y3QA 4PP0A 1QVSA 1B51A 1SW4A 4DCYA 5KDTA 1MQDA 2DWIA 2Y7RA 5ISUA 3T9HB 5H8NA 4R73A 3KG2A 1BLFA 1ZBMA 5EHSA 5ELVA 4TLLB 1IUDA 4R9GA 4H6DA 1MM7A 3VVDA 2Q8JA 3CFZA 2QMWA 4UA8A 3LC8A 2Q88A 2Y7PA 3B6WA 4BLAA 3U72A 2Q89A 1GR2A 3CFXA 1LLSA 2ONSA 3PU5A 2CMOA 1IQ7A 3VXBA 3PUYE 1I6BA 4OEVA 5KCJB 1Y1ZA 3RTFB 3HHFA 5L8DA 3IL1B 4MH5A 4G77A 1FTOA 2X26A 4DIGA 4WEDA 1GVCA 1ZKBA 3KN8A 3Q25A 3ILUB 1B3GA 1Y9UA 3D4GA 4FEBA 2W7YA 1H3DA 1LGBC 1RKMA 5KCJA 2PT2A 4JXIA 1Y3PA 2XXXA 2I0CA 1BIYA 2XXQA 1BTJA 4JWXA 3IOWA 1ZIUA 1O63A 3AXFA 2QJEA 4DCXA 3TTLA 4O3BA 3G3FA 3M3FA 3TODA 1XOCA 3IK6B 3OSQA 4JSDA 1B9JA 3IB1A 1LAGE 2O6AA 3MC2A 2GRVA 1P1UA 1H76A 4BDNA 3PUZE 3B6TA 1II5A 3UGWA 3RQTA 1UQWA 1EH3A 4M4GA 1O7TA 4ZE9A 1B4HA 4C0RA 3LSWA 4QFOA 3CIJA 4OESA 2V3TA 3H6TA 4H0WA 2PT1A 3VVFA 1Z7ME 5DTBA 2FA7A 4F3BA 3VLVA 1LCFA 3MP8A 3RPWA 1D3KA 3TELA 1QULA 4THIA 1JW1A 2XD2A 3R26A 2XXHA 3W9VA 4ECFA 1P99A 1MY2A 1YAEA 2R71A 4KYSA 4ZEFA 1MH4A 1Z7NE 1Y20A 2VHAA 3WAFA 2QS4A 4UACA 3HO7A 3FVNA 4GD5A 4IGRA 1ZU0A 1NL5A 4GRKA 3E9XA 4OENA 1MQHA 4HS7A 1A55A 1SYIA 4Q8RA 1DTGA 2F6GA 5H8HB 5IKBA 1VSOA 4G8MA 1PB7A 3LSFB 4I8CA 1MG1A 3QUFA 1ELJA 1A7LA 1OIBA 3VV5A 4KPTA 2XXYA 4QFNA 3GZGA 3OSRA 2ONRA 4OFJA 2RC7A 1QJMA 4OVJA 4MFIA 3T93B 2REGA 1OQGA 4R2BA 3UK4A 3H4ZA 3TKDA 3S4UA 3MPLA 3C31A 3S9EA 2XX8A 3E13X 1L5TA 1B5JA 5H8HA 1VE4A 4H65A 3RT8A 4YB5A 1LFGA 1P1NA 3K00A 4QSDA 1POY1 2O7IA 2P0SA 4C1TA 1GV8A 1WODA 2ZMBA 4DZ1A 3THIA 3G3HA 3N6TA 5A5XA 4I62A 5I2NA 2NVUB 1TXFA 3R6UA 2QS3A 1PBPA 3L6HA 1LCTA 5EYFA 2DP8A 5AA2B 3MPKA 3TYHA 4NE4A 4R2FA 1BP5A 2AYSA 3TMGA 1IXGA 3A3CA 3DM0A 5TPAB 2GHBA 3KBRA 3LSLA 1PEBA 4F1VA 1QUJA 2VD2A 3GXAA 5K2YA 4QFPA 4GVOA 2DOJA 3A3UA 1ZLQA 1PB9A 1P1OA 3FUZA 1LBCA 1MPCA 1H44A 2VOZA 4OMBA 3RUMA 1MXUA 4QRZA 1SVXB 4OHNA 4LZ5A 2REJA 5TPAA 4KI0E 3N6UA 5JEIA 1T0KA 4ZEDA 5HPQA 1NH7A 2F35A 2DVCA 2Q9TA 3EHSA 4ZEBA 2OWTA 4ZZAA 3KOSA 1B2HA 3DELB 1B1XA 2UXAA 4JB7A 3VFJA 3C9HA 2RCAA 1MS7A 1AOVA 2IEEA 1SYHA 1H45A 2P1SA 3CRBA 4NEDA 2ONKE 4N07A 2XXPA 5J1DA 4G4PA 3S9MC 2F5XA 3PPRA 4PFTA 2XXWA 2OCUA 2V25A 4M1VA 4MLVA 4F29A 5I84A 1IXCA 3O9PA 2ZYOA 5BWJA 1RYXA 1B7HA 2DXRA 2ZNUA 4NF8B 5FHMA 4Q30B 4G2ZA 3TQWA 3BBRA 5JTYA 4RPOA 3U8QA 3OD7A 1B3FA 3ECRA 2QL3A 2DE2A 2A5TB 3JYRA 1ZTYA 4XKRA 5I2KB 3MAMA 3MWBA 2AL5A 2Q2CA 2M8CA 1O64A 4X1DA 4ELPA 2XHDA 4NF8A 3FGSA 4F1UA 1M5BA 4IY6A 3VLWA 4U1ZA 2F8DA 5ICQA 2QS2A 2VP1A 3SKPA 1NFTA 4ZECA 1TWYA 3TDJA 3ZKKA 1UTBB 2VD3A 1Y3NA 1MY1A 4GFRA 5I2KA 3T96B 1MQGA 1MXWA 3H6VA 2ZNSA 4HCYA 4OTEA 3IR1A 4MBPA 3CSGA 1SI0A 3F11A 2XX9A 3OEMA 3QUJA 2F97A 2E0SA 4G68B 4LONB 3JZJA 1FQEA 1UTBA 4LP2B 3RT6B 3K01A 3DLNA 1HSJA 3HCQA 1WVJA 3KEIA 3OMBA 2V84A 1MPDA 1DTZA 3O28A 3SETA 4G68A 4MLQA 4PFWA 1XHYA 4OWDA 2O1LA 1IEJA 5JK4A 1B32A 2D3IA 4OERA 5FTIA 2XXVA 4ZEIA 2Z8DA 1SQYA 4MF3A 3O6GA 1QUIA 1US4A 1PC3A 1AL3A 5AA4B 1Q35A 1Y4TA 3V83A 1JW4A 3PMWA 1B7ZA 1Y4CA 5ICTA 3MUQA 4R6HA 1LFIA 3QYTA 4F22A 5TU0A 1OQHA 5LOMA 4WEPA 1R9LA 4RJZA 3M3LA 4NF6B 1Q1KA 4F3SA 3SEYA 5HM4B 4FE8A 4YKKA 1AH5A 3SEXA 4RA1A 1PDAA 2NWJA 3GLBA 2OWSA 4KFQA 4XKPA 3ODBA 4X48A 5F7VA 4YZZA 3Q29A 4PE5B 4O3AA 4ZE8A 4JDFA 4IO4A 3IO6A 3DP8A 3C4MA 1XS5A 2DQVA 3BFUA 5TP9B 2UVGA 3CSBA 1FTLA 1LAXA 1FTJA 3IB2A 4U1OA 1ATGA 3H6UA 3MP6A 1NNFA 3TTKA 4R6KA 3VE1B 4DLDA 1UIVA 2AIXA 3U1OA 3OEKA 3TAJA 3RY3A 3Q26A 1YTVA 3WAEA 1URGA 4BDOA 4DXUA 3JV9A 3CG3A 1POTA 1IZ1A 4RYAA 1LB9A 3SERA 4ESXA 1Y1MA 4ISUA 4F19A 2DVZA 1B6HA 2I49A 3GBAA 4IGTA 4YMAA 4ZS9A 3TQLA 1MH3A 4ZZEA 4Q5TA 5FHNA 1TT1A 1A8FA 2HAVA 3PMXA 3R7XA 5M2VA 3VXCA 1N0TA 4LATA 4QSCA 4F31B 1GGGA 2X7PA 3FXQA 3KZGA 3BFTA 3SEVA 2V93A 4EQ9A 4HTGA 5FTHA 2OJTA 1JEVA 1TFDA 3FJMA 1MDP1 4NF4B 4KCCA 4FECA 2Z23A 3T9XB 4FEDA 3QIMA 2UYEA 2ZNTA 3MQ9A 3K1PA 4KD5A 1LFHA 4LVQA 3FIRA 2PMSA 3HV1A 4ELQA 4QF9A 3LUYA 3KSXA 5AA3A 2HZKA 3ZS6A 1QW0A 4GQOA 2QSXA 4NF4A 2CZLA 1PBQA 2DE4A 1N3WA 2FYIA 3EF7A 5I59B 1N3XA 1SDXA 3CR9A 4AB6A 2RC9A 1R9QA 4N13A 3VDFA 4XKNA 1MXYA 3PV0E 5H8FB 3K1MA 4IO3A 1JETA 4I9DA 2O1MA 2I6EA 5ITPA 1I6QA 2FNCA 4U2RA 3K02A 2RF1A 5F1QA 4DE8A 3K4UA 4BDMA 3Q27A 1A8EA 4H5GA 4ELRA 2HQ0A 1IITA 2I3VA 1NKXA 2H9BA 4K3FA 3O97A 3PUVE 3I6VA 5H8FA 3EN3A 2F78A 3IB0A 3FD3A 3O29A 3EQ1A 3IAZA 2YPNA 2Y7IA 3TCGA 1CE2A 3SDFA 4OFOA 3OOAA 1GTKA 4R6YA 3H7MA 1JNFA 4GF8A 2ZYNA 3D4CA 1JVYA 1MDQA 1PB8A 3K6WA 5AA2A 3IOUA 3QK6A 1M5FA 3FZVA 3MVYA 1SD3A 3TCFA 3K0VA 2QPQA 1B1HA 4FIMA 4E0WA 1SW1A 3VLUA 1SBPA 1LBBA 1OVBA 4PETA 3RLFE 3OXNA 2D5WA 3G3IA 2H5YA 1ZJLA 1I6AA 2DSFA 2BJJX 1D4NA 1UTHB 2R6GE 3T9VA 5CMMA 5CMBA 4KCDA 1URDA 2XXUA 3MJNA 1WDNA 4RK2A 2THIA 3SESA 4F18A 1LB8A 2V3UA 3IO4A 1M5CA 2XD3A 4XKQA 1FQCA 1FCKA 1LAFE 3KN7A 4R9FA 3MW0A 1B5HA 2IA4A 1DMBA 2XXTA 3FV2A 3LBSA 3N26A 3CVGA 3M8UA 4AB5A 2DE3A 4ZEKA 1EU8A 3EHTA 1B3LA 4U22A 1OVTA 3PD8A 4H8IA 4R75A 1OLCA 1A54A 3OO6A 1N04A 3RN8A 5DVFA 4EUOA 3H03A 4YAHX 4EXKA 1N76A 1USYE 4GWOA 3E4RA 3PMVA 3ZSFA 3TTMA 2F36A 2H98A 1N7XA 3HN0A 5EHMA 4BDLA 3KFMA 2HEUA 1P1WA 1URSA 3MVXA 3G3GA 1YCJA 4RK9A 4F39A 4GLIA 2QMXA 3G7WA 5AE4A 2O51A 1S9TA 4Z0IA 3DP4A 3B6QA 3ZKLA 3DP6A 3T22A 4FORA 3OENA 1OMPA 2G29A 2LAOA 3V5AA 3MBPA 2A5TA 4NF5B 4QSEA 4GXSB 3S9NC 5DEXB 2RC8A 4DXCA 4Q0CA 1D9VA 2ZXTA 4GIZA 4FATA 1IXHA 3TZAA 4OQOA 3P7IA 1S50A 2PVUA 3FV1A 2HCAA 2E1SA 2I58A 1B46A 4NWCA 2I48A 5KDTB 4LA9A 4OFLA 4OETA 3HSTA 4G8HA 4HW8A 2F7CA 1QUKA 5H8NB 2B3FA 2H25A 3T66A 3C33A 3Q28A 5DEXA 1MXXA 4FJPA 3MVZA 2GHAA 3MP1A 5CM6A 5IAIA 3KGCA 1MQJA 4ESWA 1ANFA 4U21A 3TTNA 3O6IA 4QFKA 4F3GA 5CBRA 2H4IA 3OO9A 3TPAA 4JBZA 4OZ9A 5DT6A 3N5LA 3FJGA 3K1NA 2NOOA 4KR5A 5AA1A 4ND9A 1FQBA 1VFDA 2QS1A 4TQUQ 1LSTA 4GOTA 2Q2AA 2GH9A 4BDRA 3KSJA 4U23A 3KN3A 4DDDA 1F9BA 2DYXA 1LAHE 3OO7A 4WXJA 5DVIA 1B7UA 1N7WA 2I3WA 2F6PA 4O3CA 5CMCA 4BDQA 2UVJA 2UYFA 3TFLA 4IO6A 2H99A 3HHGA 1DSNA 5AA4A 1JQFA 5CBSA 2Y84A 2HZLA 3QXMA 3T9UA 3FVKA 3U92A 4X1BA 2Y7WA 4LZ8A 1A99A 4NF6A 1FQDA 1IIWA 1FTMA 3UA8A 4E0XA 4G68C 4EQBA 1FQAA 4KQPA 4KYEA 2O68A 5CRYA 3PD9A 3SEWA 1JEUA 2ALUA 2I0BA 3FASA 5BUUA 3I3VA 3CG1A 1FTKA 3RGYA 4NWDA 1TFAA 4EF1A 2ZYMA 3G3JA 4GL0A 1EZPA 5TP9A 1HSEA 4IO2A 4XIGQ 1MXZA 5K2XA 4JWOA 2A5SA 4KYDA 4ELOA 1DPEA 1R1NA 1CB6A 5DYHA 2WKYA 4H5FA 2V3QA 2ANJA 3C34A 3PUWE 4AQ4A 3TEPA 1VFEA 3ONMA 1US5A 2DS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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