3TTRA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with lidocaine at 2.27 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with Lidocaine at 2.27 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA02
2P0SA 1B3FA 1B52A 1P1NA 1YCJA 3V8XB 4XKRA 5H8HA 3GLBA 4GFRA 1SDXA 4GD5A 1ATGA 4FORA 2Z22A 3G3IA 4PFWA 5ICTA 1SW1A 2XXTA 1UTBB 3Q27A 1WVJA 5LOMA 4FATA 4YKPA 1MXZA 3TCFA 5HPQA 2OBGA 3OOAA 5I2NA 4LZ7A 1GGGA 2RC7A 4BDMA 2NVUB 1B1XA 4KYDA 4NWCA 4QSCA 2M8CA 1DTZA 2H98A 3SEYA 1QW0A 2G29A 1JW5A 3GBAA 3QYTA 3E4RA 1DTGA 3FVOA 3G3FA 1YTVA 3IOVA 4YKIA 2V93A 4ELOA 3IOUA 3FVGA 4LQ2A 3RN8A 5CM6A 1H44A 3VDFA 4Z0IA 3PPRA 4DCYA 4XKNA 1UTHB 4R2BA 4U4SA 1IXGA 4YB6A 3VV5A 3ZSFA 5FTIA 4BDRA 1Y20A 1OLCA 1OMPA 3QUFA 4O3CA 2QMWA 2PMSA 2XX8A 1MRPA 3CFLA 1LAGE 3TAJA 5AA1A 1B40A 2H25A 2NUVA 3SEWA 5I84A 1P1WA 2REJA 3RLFE 1FQCA 1N76A 3IO6A 2F7AA 3A3UA 3SEVA 1LB9A 3CFXA 4ZEKA 3TQWA 3IJOB 3IOWA 2DP8A 3LSFB 4JSDA 4U1ZA 4WEDA 3MZ1A 2QL3A 4ISUA 2ZNTA 3T9UA 1QUKA 3FIRA 4R73A 4X9TA 4M1VA 4R6HA 5I2KB 5AA2B 5TPAA 4MF3A 1XOCA 4KPTA 2OWTA 1URGA 2DS9A 4G8NA 3KBRA 4GXSB 4IY6A 1A8EA 1LLSA 4R74A 3QXMA 4FEBA 1A7LA 5H8HB 3S9NC 2Y7IA 3WAEA 4F2OA 4NF4B 3MW0A 2OLBA 3P7IA 1Q35A 3G7WA 3ILTB 4DXUA 3CI8A 3T96B 2CMOA 2F7BA 3U94A 4GF8A 1P1UA 2DE3A 4JSOA 1LFIA 4ELRA 3IJXB 2CZLA 4QSDA 1VFEA 4Q30B 3KSXA 4KHZE 5H8FB 4OTEA 2ZYMA 2O1LA 2O69A 5H8FA 4IO4A 1Y4CA 2LAOA 3M3KA 4DLDA 3PUXE 2KLFA 3RY3A 3B7DA 1SQYA 3EHSA 5DEXA 3UA8A 4AB5A 1XVYA 3GXAA 2ONKE 4F31B 4X1DA 5DEXB 4IY5A 1R9QA 4NF6B 4HW8A 5H8NB 1S7YA 4QSEA 4K3FA 4XTCQ 4YKKA 3H4ZA 3K02A 1ELJA 2FNCA 2YPNA 1ZMGA 2Y7RA 4RPOA 3RGYA 3W15C 3MZBA 4E0WA 1IQ7A 2O6AA 4H1XA 3OEMA 4DXCA 1IEJA 2F36A 1FTKA 1AL3A 1SW5A 4QRZA 2H9BA 3B6WA 4BLAA 1MS7A 3VFJA 3V83A 2IA4A 2Z8EA 4PETA 4DXBA 2DWAA 1USYH 3RPWA 4N13A 4WKMA 5I58A 5AA2D 1LFHA 3ECRA 4MFIA 1N7WA 1FQEA 1US5A 3ZKLA 4F3BA 3K6WA 2Q88A 4ZE8A 3K6UA 1P1OA 3DP6A 4PFUA 3TZAA 1IXHA 4FEDA 4OYVA 3EQ1A 3TFLA 3CSGA 2I58A 3WAFA 3D4GA 2F5XA 1QUIA 2I3WA 3T22A 1ZIUA 3E3KA 5L9MA 3HN0A 1DSNA 4FECA 1Z7NE 3MPLA 1DOTA 1O64A 1MG1A 2OCUA 5KDTB 2I48A 3S2VA 2PT2A 3DLNA 1N3WA 2D21A 3OEKA 4NF6A 2H4IA 1LBCA 5H8NA 4AB6A 3C34A 3L6GA 3H7MA 1FTJA 3IOTA 4H8JA 1DPEA 1JEUA 4OENA 3TTMA 3O6HA 4XKQA 5F7VA 4ECFA 1DMBA 5A5XB 3OO9A 4NF8B 4H67A 4IO3A 3SERA 4EQBA 1OVTA 5KZTA 4OVJA 1CB6A 3TTLA 3PUVE 3TELA 1LSTA 4FAJA 1FQDA 3PMXA 4NMYA 1EZOA 1O7TA 2XXQA 4LZ5A 3JZJA 1Q1KA 3PPNA 1MQJA 4EUOA 4EDPA 2HAVA 3KZGA 2GHAA 2QJEA 5I57A 3TMGA 2DE2A 1WODA 4MH5A 5BUUA 1T0KA 4I9DA 4RA1A 5CMMA 4OERA 1ANFA 3RTWB 3TODA 1MQIA 4O3AA 4IGRA 5FHMA 5B70A 3MQ9A 1B9JA 1I6BA 3TQLA 3UP9A 4RJZA 2NOOA 3MAMA 2VHAA 4YB7A 5I59B 2OWSA 2D3IA 2Q2AA 3KJTA 4IO7A 1MY0A 2F97A 3E13X 1LBBA 1MY3A 3N94A 4GQOA 4H0WA 4MLQA 4TLLB 5BWJA 2DVZA 2AIXA 1AH5A 3IX1A 4RYAA 4QFNA 3M8UA 1SD3A 4XKPA 1Y3QA 1B0LA 2F6GA 3O6IA 1B3LA 1MM7A 5DT6A 2A5TA 4EF1A 3EHUA 1NH8A 4GXAA 3CSBA 1B5JA 3PU5A 4LP2B 4MLVA 3DM0A 5K2YA 2I4BA 2UYFA 4H5GA 3GBBA 4BDLA 2HAUA 1LCTA 4THIA 3ILUB 4YU0A 2V3TA 3T9VA 1FCKA 4YKJA 5TP9A 4OHNA 1B2HA 3TKDA 3UK4A 1MY4A 1F9BA 1R6ZA 3C33A 3KSJA 5A5XA 1UIVA 2HZKA 1AOVA 4G77A 3HO7A 4ZEBA 1ZTYA 3PMWA 4G8MA 2O68A 3FXRA 5TPAB 3KGCA 2AL5A 5TU0A 4EF2A 3S9MC 1Z7ME 1P99A 4ONYA 3QAXA 1ZKBA 2XXXA 4H8IA 3T9XB 4EQ9A 1FQAA 1B32A 3TPAA 1VR5A 3M3FA 3IR1A 3HHFA 1OVBA 2H99A 1B3GA 1MQDA 1SYIA 2THIA 2Z23A 3UN6A 1HSJA 4I62A 5AE4A 1JW4A 1MH4A 1MXVA 1EZ9A 1PB9A 1XHYA 1R9LA 3FD3A 3G3KA 3QK6A 4GL0A 1N7XA 2XX7A 3AXFA 1TFAA 3H03A 3K6VA 5JTYB 1R1NA 2O7IA 5CMKA 3FJMA 5JEIA 4LQ5A 3MZ9A 1IZ1A 1IXIA 4R9FA 1PBPA 3SDFA 2W7YA 3VVDA 4I8CA 4N6PA 4OZ9A 1UIUA 3RNNA 4NF5B 1FTLA 4AQ4A 1SI1A 2I0CA 4KI0E 3G3HA 3EHTA 4M4GA 2A5SA 1NH7A 1OQGA 2O1MA 4UA8A 4F22A 3VLWA 4HCYA 4R6YA 5AA3A 5I56B 1BIYA 2HCAA 3TYHA 5B7DA 3U93A 2YJPA 1JETA 1M5FA 1O63A 1QKBA 3V89B 2ONSA 3Q25A 2E1SA 3QUJA 2ESNA 5AA4A 1VE4A 3UIFA 5TP9B 2GHBA 5H8SA 3TCGA 4X48A 1B7ZA 1QJMA 1Y3PA 2OK2A 3VVFA 1GR2A 3F11A 5FHNA 1MH3A 4ZDMA 4ZEIA 3K0VA 1EU8A 1GVCA 5JK4A 1GV8A 1LAFE 4JB7A 3EF7A 4U22A 4DDDA 2DVCA 1XVXA 4U4XA 1BLFA 4EQ7A 3H6UA 1SVXB 2P1SA 3H3GA 2P2AA 4R2FA 3HHGA 2I0BA 1GTKA 5KDTA 2R71A 3FXQA 1IXCA 1FW0A 3G3JA 3FV2A 3T9HB 1NKXA 2QS2A 2VD3A 2F35A 3IL1B 3JV9A 5CBSA 3U1OA 3U72A 4XIGQ 4F29A 5L9SA 2RKMA 1TT1A 2PT1A 1SI0A 4HTGA 3U8QA 4YMBA 1QKAA 1TWYA 3FGSA 5F1QA 4FE8A 2VOZA 2VP1A 3A3CA 4G68B 2D5WA 4GOTA 5KCJB 1MQGA 3IK6B 4RPNA 2QS1A 4PFTA 5ICQA 1IIWA 1SW4A 2AYSA 4JWYA 2V84A 1B51A 1BP5A 3TTKA 5EHMA 3K4UA 1B05A 1NL5A 1XS5A 4OEUA 3H6TA 3VLUA 1LAHE 1SYHA 3MBPA 3C31A 3LUYA 2DSFA 4ESWA 1EZPA 4RNSA 3FZVA 1MPBA 2ZNSA 1B58A 3Q26A 3C9HA 3L6HA 2DWJA 5ISUA 1Y3NA 5AA4B 1B3EA 2Y7WA 3MP6A 4P0GA 4F1YA 1D9VA 1NNKA 2X26A 4F3PA 1H43A 2F8DA 3HSTA 4F1VA 2PYYA 4Q8RA 2VGQA 3BBRA 4R75A 3MUQA 3MP1A 2QS3A 3BKIB 1ZU0A 4R9GA 3FASA 4LONB 2XXPA 3N5LA 3IB0A 2DYXA 2Z8DA 5I58B 5I57B 5JTYA 3W9WA 1I69A 1MM6A 2XXUA 3K00A 4NF5A 2R9JA 2DWIA 4KYSA 3IB2A 2NXOA 5K2XA 4Z7EA 3BFUA 2FYIA 2A5TB 3LR1A 4LUBA 5HBCA 4ZEDA 1S50A 1Y4TA 4QHQA 5FHOA 4ND9A 4QFKA 5I56A 1US4A 2ALUA 4U2RA 1KWHA 2XXHA 3TTNA 1I6QA 2GRVA 1HSEA 1FTOA 3PUWE 4R72A 3RT8A 4IGTA 2I6EA 3B6TA 1H45A 4GRKA 3W9VA 2G93A 4GWOA 3N6UA 3IORA 2Q8JA 4RY1A 1QULA 4H5FA 3PGFA 4LATA 4ZZEA 1RKMA 1MXWA 4G68A 4OQOA 5KCJA 2XXIA 1MPCA 2HZLA 5EYFA 1MY2A 1RYXA 1ZJLA 1UQWA 1OLAA 3M3LA 4JDFA 2DWHA 1OIBA 1A99A 1H76A 2RF1A 3GZGA 4JWXA 4HS7A 5CI5A 2XXRA 3CG1A 3FV1A 3RUMA 3H6WA 5DVFA 2UXAA 3O29A 3UGWA 3I6VA 4DIGA 2OZZA 3K01A 5DYHA 4IO5A 4NF4A 3MVWA 2HEUA 2H5YA 3G3GA 4NEDA 1JVYA 4KCDA 3SEXA 1PB7A 3VE1B 3HV1A 4BDOA 3SEUA 1BTJA 4FIMA 1LFGA 4POXA 3OO8A 4R6KA 1B6HA 4TLMB 2ZMBA 5ITOA 1M5EA 2AL4A 3C36A 2I4CA 2XX9A 1PB8A 3DP4A 4OEVA 4WEPA 3LSWA 4DZ1A 5IAIA 4ELPA 1VFDA 4C1UA 3TEPA 1MY1A 1B7HA 2FA7A 1LB8A 3K1NA 3K1MA 3MWBA 4OETA 4RXLA 3BFTA 1UTHA 3MC2A 4N07A 3TUSA 3B6QA 1S9TA 2UVIA 3N26A 1MDP1 1BKAA 3C4MA 1VSOA 3KG2A 4G4PA 1SBPA 1MXUA 4KFQA 4PP0A 3PUYE 4F39A 3O97A 2O84X 4MBPA 1POY1 4POWA 3MVYA 1I6AA 5DVIA 2RC9A 3LBSA 3Q29A 1NNTA 2OJTA 1A54A 4YICA 3TCHA 2B3FA 3EPEA 3LC8A 1NFTA 3Q28A 5ITPA 4I1DA 3MJNA 4KQPA 3CG3A 3OSRA 4ZZAA 1PC3A 1LAXA 4PE5B 4KYEA 3TTRA 4ELQA 1AMFA 1LCFA 4BDNA 2VD2A 3OD7A 4XXUA 3O66A 3R7XA 1P1QA 4UACA 1JQFA 3EN3A 1XT8A 2GH9A 3MVXA 2BJJX 1D9YA 1CE2A 2ONRA 3PD8A 1A55A 1EH3A 2Y84A 3FXUA 1M5CA 1NNPA 1USYE 2ZNUA 2I49A 4G2ZA 3DELB 2UVJA 3OSQA 4NF8A 4NTLA 2X7PA 5CRYA 4NE4A 5CBRA 1ZLQA 1II5A 2V3UA 4GIZA 4ZECA 3H6VA 2R6GE 3D4CA 5AA2A 1A40A 3OENA 2NWJA 2RCAA 2Y7KA 4JBZA 2X7QA 4G68C 3KEIA 3PPOA 3RTFB 4ESXA 4IO2A 4LVQA 2E0SA 3MVZA 4ZS9A 3OO6A 1QUJA 5J1DA 1DPPA 1Y9UA 2Z8FA 4EXKA 1B4HA 1M5DA 3HCQA 4P11A 4QFOA 4P0IA 3U92A 4E0XA 2DQVA 1FQFA 3FATA 3FUZA 2HQ0A 4KR5A 3OELA 4QFLA 2UYEA 1POTA 2F78A 3ODBA 4QFPA 4F3SA 4F18A 4C0RA 2GFEA 3PV0E 2WKYA 2XD2A 1XC1A 3MPKA 3QIMA 4OWDA 3SKPA 5HM4B 4KD5A 2V25A 2B3BA 2UVHA 3LSLA 2F6PA 2ZYNA 3S9EA 2DOJA 4X1BA 3UORA 2QPQA 3O2AA 4LA9A 5CC2A 4WXJA 4U23A 3KN3A 3VXBA 3FVNA 3CRBA 5IKBA 1OQHA 2HFBA 2XXYA 1TXFA 5L9OA 1D3KA 3CVGA 4YZZA 1TFDA 5H8QA 1B3HA 5EHSA 4DCXA 5CMBA 3IAZA 2ZYOA 1NNFA 1PDAA 4JWOA 4YAHX 4Q0CA 3KN7A 1Y1ZA 2I3VA 5H8QB 3V5AA 4ZE9A 2ZXTA 3C35A 3KFMA 1J1NA 2PBWA 1JNFA 3PMVA 2Q9TA 4Q5TA 3VVEA 1JW1A 4JXIA 3OO7A 2ABHA 2RINA 2O7UA 4RK9A 3KJ7A 3TDJA 4QF9A 1ZBMA 2XHDA 5I2NB 3I5OA 1NMUA 1L5TA 3KOSA 3ZKKA 2XD3A 3USDA 4C1TA 1IITA 3CFZA 3H06B 2Q2CA 4F1UA 1B5HA 2ANJA 2XXWA 2YLNA 3K1PA 2Y7PA 5ELVA 2RCBA 3RQTA 3O6GA 4HCWA 2IEEA 3FVKA 3KOTA 4YB5A 4GLIA 4BDQA 1IUDA 3CR9A 1N04A 4F3GA 1B1HA 4EXLA 2V3QA 1PBQA 2QS4A 2HXWA 3A09A 3HPIA 3I3VA 3ONMA 4NWDA 1MPDA 4F19A 2REGA 5I59A 4KCCA 4O3BA 4TQUQ 3QSLA 3R26A 2QRYA 2RC8A 1RYOA 1AIVA 2XXVA 1JEVA 3K6XA 1N3XA 2Q89A 3SESA 4U1OA 4F2QA 1MQHA 2PVUA 3LSXA 3RT6B 3C32A 4OFLA 1M5BA 1MXYA 4LZ8A 3IO4A 3PPQA 1URDA 3MP8A 5FTHA 3K2DA 1N0TA 3CIJA 3O28A 4RK2A 4OMBA 3E9XA 3T93B 4TOZA 3JYRA 4PQJA 1UTBA 3KN8A 4YMAA 5CMCA 3SETA 3PUZE 1PEBA 2F7CA 3OMBA 1MXXA 1D4NA 3R6UA 1MDQA 4OFJA 2DXYA 1HSLA 2ZYKA 4OFOA 4H6DA 3VLVA 3ZS6A 3DP8A 4H65A 4L17A 2O51A 4GL8A 2F34A 4PFYA 4U21A 1URSA 4G8HA 1B4ZA 3O9PA 4IB2A 1B5IA 1QVSA 1N84A 5DVJA 3VXCA 1B46A 1YAEA 2QSXA 1B7UA 3N6TA 3PPPA 4OESA 4DE8A 1WDNA 3S9LC 1LGBC 1H3DA 1B0HA 1Y1MA 1FQBA 1YPNA 3S4UA 3THIA 3IB1A 1JVXA 1FTMA 3T66A 1A8FA 3FJGA 1SW2A 2DE4A 4IO6A 5M2VA 5L8DA 2PX1A 3PD9A 2B65A 2DXRA 2UVGA 4FJPA 3FJ7A 5I2KA 4GVOA 4ZEFA 4OXVA 2QMXA 3OXNA 5DTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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