3M3KA

Ligand binding domain (s1s2) of glua3 (flop)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title Molecular mechanism of flop selectivity and subsite recognition for an AMPA receptor allosteric modulator: structures of GluA2 and GluA3 in complexes with PEPA.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3kA02
2I0CA 3EHTA 3HV1A 1MQIA 3ZSFA 4F2OA 1SDXA 1MG1A 2OCUA 1B0LA 3CR9A 1Y4TA 4OXVA 3IB2A 1IQ7A 1ZKBA 1LCTA 3V89B 2DXYA 2XXXA 1USYH 4TOZA 2OK2A 4R73A 3VDFA 4OEUA 4KD5A 3M8UA 2V3TA 3QIMA 1SI1A 1ZTYA 2QS1A 2Q88A 3O9PA 4F22A 2DS9A 2ESNA 5FHMA 2H4IA 2I58A 1PEBA 3JYRA 1FTLA 4ZZAA 4ESXA 3DM0A 4NWCA 3EHUA 1DSNA 3M3FA 3ZKLA 1B40A 1LCFA 4I1DA 4N13A 3M3LA 3FJGA 5F1QA 2I3WA 3TTLA 3MC2A 4R6KA 1A8FA 1MQJA 2D3IA 3MVYA 3TCGA 3PV0E 4KFQA 1AH5A 1MXWA 3EHSA 4GL0A 3TQLA 2QSXA 4JSDA 1YAEA 1MQHA 2DWAA 5H8HB 3U93A 1LBBA 4ZEDA 4GLIA 1H3DA 1SW4A 2XHDA 3MZ1A 2UVHA 1URDA 1FCKA 1S50A 1B7HA 3S9EA 2RC8A 2PMSA 4OFJA 4EQ9A 1Y20A 3UA8A 3VXBA 1FQCA 4GVOA 3GZGA 2Z22A 3N94A 3TTMA 3R6UA 2QPQA 3FV2A 2QMXA 4NF5B 3I3VA 1A54A 4H5FA 1GR2A 4XKQA 3TEPA 3RLFE 3ODBA 5I57B 2VD2A 5DVIA 1I6AA 4Q0CA 4F3BA 2HAUA 1B3GA 1B05A 4IO4A 3PPRA 2CMOA 2XXUA 3PPPA 5H8NB 3HPIA 2F35A 3VVEA 4QSEA 4DDDA 1QKBA 3IAZA 3HSTA 3IX1A 3TKDA 1OVTA 4IO2A 4TLMB 3CFLA 4KYSA 5JEIA 1ZIUA 3SEXA 5H8HA 1B2HA 3H7MA 1I6BA 1B58A 4IY5A 2UVIA 4GRKA 3TYHA 3U72A 1HSLA 2DWIA 1IIWA 1IZ1A 3IOTA 3EPEA 2ZYMA 3CG1A 3GBAA 3CSGA 1S7YA 4FEBA 5ICTA 2XXVA 3C34A 4GD5A 4O3AA 1VFDA 3SEWA 1B7UA 3HO7A 3HHFA 5JTYA 3S9LC 5AA1A 1EZOA 1I69A 3KOTA 2V3QA 3PUYE 3TUSA 4BLAA 4IGTA 2THIA 1P99A 4FECA 1A55A 4O3CA 1IEJA 2PT1A 1D3KA 3TTNA 1JVXA 4IGRA 5I57A 3G3JA 3TCHA 2RCAA 2Y7PA 1MXZA 3K02A 3UN6A 2Q2CA 1B3EA 4FJPA 4PE5B 1B6HA 3H6TA 2W7YA 4M4GA 4P11A 1FQDA 1FTOA 5H8NA 4BDRA 4E0WA 4X1DA 3S4UA 2OWTA 3MP6A 1JW1A 3PMWA 4AQ4A 1BP5A 1B5IA 2Q2AA 4EQ7A 1DMBA 2QRYA 3DELB 3EQ1A 1URGA 2DWJA 1JEUA 3G3GA 4YAHX 1IXIA 4DIGA 2DVCA 4KI0E 1PB7A 2P2AA 1MH4A 2QL3A 1H44A 4IO3A 5DVJA 2XXPA 4P0IA 1LAXA 4ELQA 3BBRA 4YZZA 3V83A 1FTMA 2O1LA 3LSXA 4EXKA 5AA2B 1UTHB 2RKMA 3MP1A 3U8QA 4ONYA 4KCDA 3Q29A 4P0GA 5DTBA 4TQUQ 2NUVA 3VE1B 2QS4A 3CI8A 5TP9B 3FVNA 4Q8RA 3R26A 4MH5A 1ELJA 1VFEA 4ESWA 4H0WA 1QW0A 2O7UA 2F8DA 1D9YA 1H43A 4ELPA 4JWXA 3ZS6A 1FQBA 1JW5A 3QUJA 5I59B 4OMBA 5ICQA 3MQ9A 4KHZE 1BLFA 2F78A 2DOJA 3UIFA 3USDA 3FVKA 4R6YA 1XS5A 4ELRA 2ZNSA 4MBPA 1JNFA 2VD3A 2HQ0A 1FQAA 3KN7A 1XHYA 3LR1A 2UYEA 4GQOA 4OENA 3S9MC 4QSDA 2HAVA 3JZJA 1SW1A 1WDNA 1N3WA 2YLNA 1P1WA 3OEMA 4LONB 1POTA 3IOVA 2XD3A 3H3GA 5H8QB 4X1BA 4XKNA 5L8DA 3W9VA 1R1NA 2Q89A 4RYAA 1GVCA 1QKAA 1TXFA 1LB8A 2I3VA 2Y84A 3PGFA 3RN8A 5HPQA 2E1SA 1EZPA 3VXCA 3K1NA 4F3SA 5CMBA 2GFEA 2GH9A 5TU0A 2Y7IA 4GWOA 4LZ5A 3CRBA 4KYDA 2ABHA 2UVJA 3B6TA 3H6WA 4HCYA 1FTKA 5FHOA 5AA3A 1OLCA 4PFYA 4EF1A 3R7XA 2F34A 5CBRA 4N6PA 3W9WA 5TP9A 1NNTA 1M5EA 4NE4A 2DQVA 3RTWB 2GHAA 1AOVA 3K4UA 3TPAA 5H8FB 3CIJA 4HTGA 2ONRA 3K0VA 4R74A 5I59A 1PB8A 3AXFA 1SD3A 2OJTA 3KG2A 3OO7A 1B0HA 2ZNTA 1EH3A 3TZAA 2AL4A 4QFPA 1VSOA 2I4BA 2G93A 3GXAA 1Q1KA 2R71A 5HM4B 2LAOA 3K6XA 2ALUA 2PBWA 3PUVE 2GRVA 3O6HA 4LATA 3PPNA 5H8QA 2KLFA 3M3KA 3MWBA 3UK4A 3GBBA 4WEDA 4YB7A 2O6AA 1DPEA 3K01A 1SI0A 3OOAA 1NFTA 3IOWA 3TDJA 3T93B 3BFUA 1CB6A 1ZJLA 3IR1A 4R75A 2Z8DA 3S2VA 1ANFA 1XVXA 3G3HA 1MRPA 1JEVA 2I4CA 4IO6A 3H03A 4MLVA 4RY1A 4ZEIA 1XT8A 3OO8A 2V3UA 3MBPA 4XXUA 1B9JA 5DEXB 5H8FA 4G77A 3JV9A 3TCFA 2F6GA 1UTBB 3KBRA 3OENA 2ZYOA 2O51A 2DE4A 4H65A 1QJMA 3TAJA 2DVZA 2GHBA 2IEEA 4H67A 4LP2B 4C0RA 3PPQA 3DP8A 1IUDA 3LC8A 1PBPA 2I6EA 2I49A 1SBPA 2F7AA 4QF9A 4ZEBA 1Y3PA 1LAGE 4DE8A 4HS7A 4PETA 3G3IA 4U23A 4DXBA 4LUBA 4ZZEA 5JTYB 4G8NA 3MZ9A 4XTCQ 4AB5A 1D4NA 3FVOA 4EUOA 4HW8A 4XKPA 5AA4B 1US5A 1MY4A 1O63A 4I62A 2AL5A 3U92A 3FASA 2H5YA 5KDTB 1RYOA 3T9UA 1LB9A 1Q35A 1UIUA 3K6VA 1MM6A 3PPOA 4DZ1A 2E0SA 1JQFA 3IJXB 4RJZA 1N7XA 4L17A 5A5XA 3C31A 1M5DA 3V5AA 2AYSA 3KN3A 4X9TA 3RT6B 3H6VA 5L9MA 5DEXA 3RQTA 2Z8FA 1UTBA 5TPAB 1EU8A 3MPKA 3CFXA 1MQDA 4IB2A 1MQGA 4BDLA 3HHGA 3KGCA 1SYHA 5CC2A 3SEUA 3K2DA 3OSRA 1AMFA 2VP1A 3PD9A 3H06B 4XIGQ 5JK4A 3T66A 3MPLA 5CMMA 1N0TA 3HN0A 2FA7A 1Y9UA 4ZEKA 3DLNA 2BJJX 4OEVA 2RINA 5AA4A 4Z7EA 4OYVA 1QVSA 4OHNA 2O68A 5CBSA 3RUMA 2RC9A 5AE4A 5KDTA 2XX7A 4FAJA 1B1HA 1TFAA 2DE2A 3BFTA 4NF4B 4GIZA 3BKIB 1B4HA 2H25A 3QUFA 3K6UA 1US4A 3MVZA 3LBSA 3I5OA 3KOSA 3SDFA 1ZBMA 2QS3A 1MDQA 4UACA 3S9NC 3VFJA 4FE8A 3LSFB 4ECFA 3MJNA 4FORA 1OMPA 3U1OA 5TPAA 4H1XA 1LGBC 3QXMA 5B70A 1ZLQA 4YICA 2X7QA 3N6TA 3QK6A 4OWDA 1XC1A 4YMAA 3K1MA 4QFOA 5FTIA 2CZLA 2R9JA 1SW5A 4QFNA 2B65A 4NEDA 1Y1MA 3EN3A 3VLWA 4YKIA 4LA9A 2XXWA 3KSXA 4GL8A 5CMCA 4ZEFA 4Z0IA 3PUWE 3T9HB 1UIVA 2HEUA 3A09A 3FATA 4U4XA 1QUKA 1NMUA 3I6VA 3ILUB 3SETA 1N3XA 4IO5A 1S9TA 3Q27A 1NKXA 3RY3A 1MXUA 4MFIA 4NF4A 3K1PA 5F7VA 3RNNA 1MH3A 4U4SA 1PB9A 4YKPA 3IL1B 1MY0A 4ZS9A 1A99A 4F1YA 4GOTA 3OD7A 4GFRA 1NL5A 3HCQA 4F39A 5J1DA 2XXRA 3F11A 4DXCA 5H8SA 4G2ZA 1R9QA 4BDQA 3CVGA 5L9OA 1SVXB 3Q28A 5KCJB 1MPDA 2O84X 4JBZA 1MXXA 3OO9A 5HBCA 3A3CA 2YJPA 2VGQA 1MXVA 1LBCA 1N04A 3MVWA 2O7IA 4OFOA 4JWOA 1LFGA 3SERA 2OWSA 3PUZE 2QMWA 3D4CA 2ZYNA 1DPPA 2VOZA 3IOUA 4ZE9A 5FHNA 1PBQA 3OMBA 4C1TA 4G8HA 1NNFA 1MY1A 2ZNUA 4F3GA 3WAEA 3TMGA 1LAFE 5FTHA 4RXLA 1P1OA 4F29A 2DXRA 4GXSB 5CM6A 3N5LA 2PVUA 3K6WA 1BTJA 3THIA 2B3FA 2D21A 3MP8A 4YKJA 3MAMA 5CMKA 4POWA 4R6HA 3O28A 1A7LA 3RTFB 2Q8JA 2XD2A 2XXHA 1WODA 4YB5A 1OLAA 2F5XA 3C4MA 3MVXA 1BKAA 3KN8A 5EHMA 3FZVA 3P7IA 4NMYA 3WAFA 4G4PA 4U2RA 5DT6A 4JDFA 2V84A 5BWJA 5EHSA 4HCWA 1POY1 4E0XA 4C1UA 4QFKA 4WXJA 1PC3A 3QAXA 1B4ZA 4OVJA 3A3UA 4BDMA 3LUYA 3ONMA 2XXYA 5B7DA 1XVYA 4H6DA 2ZXTA 4JB7A 4POXA 1NH7A 2F7CA 5KCJA 3T9VA 1LFIA 3E4RA 2PYYA 4OTEA 4F3PA 4GF8A 2PX1A 1Y1ZA 3O66A 3MW0A 2F36A 4WKMA 3G3KA 4ZDMA 3C9HA 2A5TB 1B3LA 4NWDA 3FJMA 4ZE8A 2O69A 4G68B 2IA4A 1HSJA 3IO6A 4ND9A 4OESA 3PMVA 1WVJA 4JWYA 4YKKA 1M5CA 3TTKA 3O97A 1LAHE 1DTGA 5I2NA 1KWHA 4R2FA 1ATGA 4KCCA 1TWYA 5KZTA 1B51A 3CFZA 1CE2A 4KR5A 1OIBA 2Q9TA 5I58B 4PFTA 1Y3QA 1IXHA 1VR5A 4EDPA 4EQBA 3C35A 3TTRA 5ITOA 3KSJA 3OO6A 2HXWA 5A5XB 1TFDA 3V8XB 5AA2D 3W15C 1IITA 3VLUA 4F18A 2QS2A 2OZZA 4FIMA 4BDNA 3B6QA 4YU0A 1H45A 2XXTA 2H98A 3CG3A 1DOTA 3FD3A 1TT1A 3OSQA 3L6HA 2REJA 3O2AA 5LOMA 3TFLA 1AIVA 2DP8A 3E3KA 4I9DA 3SEVA 1JVYA 1Y3NA 1ZU0A 3MZBA 2UXAA 2B3BA 2YPNA 1T0KA 3C36A 4O3BA 3FIRA 1MPCA 2ZYKA 1ZMGA 3GLBA 4THIA 3FXQA 4LQ2A 2ANJA 5K2XA 4FATA 4PQJA 1Z7NE 2Z8EA 2A5TA 1YPNA 4RK9A 2D5WA 3EF7A 4G68A 2Y7KA 3L6GA 3LSWA 1EZ9A 3SEYA 1B7ZA 3MUQA 3D4GA 1LLSA 4DCYA 1QULA 2Y7RA 4NF6B 5I56B 5I58A 1USYE 2G29A 2F97A 3N6UA 3O6IA 1NNKA 3O29A 3B6WA 3DP6A 1A8EA 1L5TA 5ISUA 1P1NA 2V25A 1MY2A 4H8JA 3UORA 1PDAA 2A5SA 4Q30B 1N76A 4OFLA 5BUUA 3FVGA 1P1QA 1N84A 3H6UA 4AB6A 5DVFA 3RT8A 4G8MA 3FUZA 4OETA 3KEIA 3PU5A 3E13X 3IJOB 3IORA 3UP9A 1YTVA 2FNCA 3FGSA 2QJEA 5CI5A 2OLBA 1IXGA 1B32A 1R9LA 5DYHA 2M8CA 1NNPA 4DCXA 3C32A 1O7TA 2Z23A 4ZECA 3ECRA 2HZLA 4NTLA 2NVUB 1MY3A 3KFMA 5L9SA 1N7WA 2F7BA 3RGYA 4QHQA 1SYIA 1A40A 4NF5A 1MDP1 2HCAA 3SESA 1SW2A 4LZ7A 4MLQA 4GXAA 4H5GA 4NF6A 5I56A 3ZKKA 3IB0A 4NF8B 3K00A 2FYIA 3LSLA 4WEPA 3KZGA 4F1UA 4LZ8A 1B52A 2PT2A 3QSLA 4OERA 1B46A 4U22A 4DLDA 3VLVA 3PD8A 2DYXA 2UYFA 2VHAA 1Z7ME 2DSFA 4IO7A 2AIXA 1QUJA 4FEDA 1GV8A 3VVDA 3E9XA 4M1VA 1HSEA 4I8CA 4PP0A 2NWJA 1FQFA 1OVBA 5I84A 1FTJA 2XXQA 1P1UA 4RPOA 1H76A 2XX8A 1RKMA 4UA8A 4EF2A 1OQGA 4ISUA 3TODA 3T9XB 2RC7A 5ITPA 4R9FA 1LFHA 1FQEA 4U1ZA 3OEKA 1MXYA 3B7DA 3C33A 1I6QA 1B3FA 1B5JA 4QFLA 4JXIA 4KPTA 1M5BA 1B3HA 3U94A 2I48A 5I2KB 1OQHA 3IK6B 2X26A 2XX9A 3VVFA 4IY6A 4LQ5A 2HZKA 2V93A 2ZMBA 1Y4CA 2P1SA 3TELA 4DXUA 4N07A 4F1VA 3O6GA 1J1NA 3ILTB 4MF3A 4QRZA 4NF8A 4Q5TA 4K3FA 5IKBA 2WKYA 2DWHA 3T96B 4KQPA 3UGWA 1F9BA 4PFUA 4BDOA 2OBGA 4EXLA 2R6GE 2REGA 2O1MA 1B1XA 1MS7A 3IO4A 4RNSA 1AL3A 1JW4A 3RPWA 4KYEA 3Q25A 3CSBA 4F2QA 1QUIA 3FXRA 2P0SA 4U1OA 3G3FA 4PFWA 4LVQA 2I0BA 1R6ZA 1B5HA 4F19A 4R9GA 3OELA 4TLLB 3Q26A 3QYTA 4YMBA 4QSCA 5ELVA 3H4ZA 1RYXA 5IAIA 1O64A 2RCBA 4G68C 3DP4A 4R2BA 1UQWA 4JSOA 4R72A 4U21A 1BIYA 5M2VA 1VE4A 1DTZA 3KJ7A 5I2NB 3SKPA 3PUXE 1JETA 2H9BA 2XXIA 3G7WA 5I2KA 2HFBA 1LSTA 1MM7A 4YB6A 4RK2A 3KJTA 5EYFA 4H8IA 4F31B 1SQYA 3FJ7A 5AA2A 1YCJA 1UTHA 2NOOA 3TQWA 2F6PA 3VV5A 1II5A 1FW0A 2ONSA 3FV1A 1GGGA 2ONKE 2X7PA 4X48A 2RF1A 1GTKA 2UVGA 4XKRA 3N26A 1URSA 4ELOA 1MPBA 3PMXA 1XOCA 2Y7WA 3FXUA 4RPNA 3OXNA 3T22A 1NH8A 1M5FA 2NXOA 4OZ9A 5K2YA 5CRYA 1D9VA 4OQOA 1IXCA 4RA1A 2DE3A 3IB1A 2H99A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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