2NXOA

Crystal structure of protein sco4506 from streptomyces coelicolor, pfam duf178
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
277
structure length
272
Chain Sequence
TRPRVGHIQFLNCLPLYWGLARTGTLLDFELTKDTPEKLSEQLVRGDLDIGPVTLVEFLKNADDLVAFPDIAVGCDGPVMSCVIVSQVPLDRLDGARVALGSTSRTSVRLAQLLLSERFGVQPDYYTCPPDLSLMAAVLIGDAALRANMIDGPRYGLDVHDLGALWKEWTGLPFVFAVWAARRDYAEREPVITRKVHEAFLASRNLSLEEVEKVAEQAARWEAFDEDTLAKYFTTLDFRFGAPQLEAVTEFARRVGPTTGFPADVKVELLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a hypothetical protein SCO4506 (gene ID: Q9L0T8) from Streptomyces coelicolor to 2.04 Angstrom resolution
rcsb
source organism Streptomyces coelicolor
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Hypothetical protein SCO4506
total genus 91
structure length 272
sequence length 277
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.151: Chorismate dehydratase.
pdb deposition date 2006-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02621 VitK2_biosynth Menaquinone biosynthesis
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nxoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nxoA02
3PMVA 2ZYKA 3VVEA 4XKNA 1YCJA 3K0VA 4H0WA 4H8IA 3HO7A 4YKKA 3TTLA 3PMXA 4FAJA 1N76A 1QUIA 4N6PA 2OZZA 2O1MA 1B2HA 3IORA 3FJMA 3ILTB 3MUQA 3PD9A 4IO6A 3Q26A 4OEUA 3TTRA 2UVGA 4UA8A 4G68B 5ELVA 4KD5A 2NWJA 4JB7A 3E9XA 4DXCA 2ANJA 2DWJA 5I58B 4OXVA 1US5A 2Q2CA 1N7WA 1AOVA 5B7DA 3PPOA 2Y7IA 1VR5A 3IOUA 5H8FB 2O1LA 1N04A 1SW1A 3CFXA 1N3WA 4TQUQ 4NWCA 1UIUA 4YICA 2GFEA 3H6VA 3U93A 4Q0CA 3B6WA 1B1HA 3TQLA 2RC9A 1IXIA 4C1TA 3PV0E 3UORA 2QSXA 4KYEA 2ZNUA 3QSLA 5H8NB 1B58A 4H8JA 4XIGQ 4ESWA 4WEPA 3DP6A 1FCKA 1BKAA 4OESA 1P1QA 2ALUA 1IZ1A 4H5FA 3FATA 3VFJA 4YB5A 2I4CA 1B52A 1QULA 4DXUA 1LFGA 3TCHA 4PFWA 4QFOA 4RK9A 3SEYA 5H8HB 2HZKA 1M5EA 4LZ5A 5BWJA 2ONSA 4IGRA 4OMBA 1MXUA 3T9HB 5CBSA 1Y20A 1D3KA 3BKIB 4ELOA 3EHSA 4F19A 3VV5A 1R9QA 1N84A 2XD2A 3C34A 4F1YA 1TFDA 2OCUA 2QRYA 4DCYA 1SQYA 3FD3A 4C1UA 4U2RA 2DS9A 1URSA 3C35A 4XKQA 4X9TA 3T96B 1RYXA 5H8QA 5I57B 3FJGA 2ABHA 3O66A 1PEBA 1QKBA 4GVOA 4LA9A 4R6YA 4P0IA 2GH9A 1SI0A 3UP9A 1B40A 1DMBA 4U1OA 2D3IA 4RA1A 3VLVA 1Z7NE 3MBPA 1B7ZA 1DTZA 1SW2A 2HAUA 1R9LA 3L6HA 3VDFA 2DYXA 2I6EA 2XXTA 2VD2A 3FVNA 5L9SA 1O7TA 3U8QA 4U4SA 4F31B 2F78A 5F1QA 3VXBA 4BDQA 1MG1A 3ZS6A 4THIA 4R75A 3CFZA 3GZGA 4DXBA 3FASA 3SKPA 1JVYA 1MY0A 4F3BA 5AA2D 5I2NB 5FTIA 2RCAA 3K1NA 1CB6A 1L5TA 2XXWA 4JBZA 1IXGA 4OFLA 2V3QA 4H1XA 1MM6A 3SETA 4LATA 3K02A 5K2XA 1URGA 3N26A 2ZMBA 1ZKBA 1B4HA 3RGYA 5JK4A 2Z8DA 4YKPA 3ZSFA 2R71A 4OWDA 4POXA 3OXNA 3Q28A 4I62A 4KFQA 3K6XA 1JEUA 1JNFA 4QSEA 4R9FA 2GRVA 3KOSA 1JQFA 4KI0E 3TODA 2I58A 3HSTA 1Q35A 3IO4A 3RLFE 3SEWA 2WKYA 1MPCA 1JETA 1LB8A 4R2BA 4DIGA 4Z0IA 5AA1A 4BDRA 4AQ4A 4LQ2A 1HSJA 5JEIA 1PB7A 3S2VA 4IO7A 2HXWA 5I59B 1Y1ZA 5A5XB 4EF2A 1B1XA 1LCFA 3D4GA 4EXKA 2I49A 1GR2A 3IOWA 1LBBA 3S4UA 2H25A 4H6DA 3PPNA 3G3IA 2AL5A 2DXRA 1XS5A 3G3HA 3IJXB 3MVZA 1LLSA 1ZLQA 3ZKLA 2IEEA 3HHGA 4JSDA 1ZU0A 4YAHX 1TWYA 2P1SA 3FVOA 2PBWA 3MWBA 3AXFA 5ICTA 1B3FA 3PMWA 2Z22A 2DVCA 2VGQA 4MFIA 1BLFA 2UVHA 1LCTA 1H3DA 2RINA 1UTHA 2UVJA 2XXRA 3CG1A 1S9TA 3CSGA 3Q25A 3QK6A 3TFLA 1EZ9A 4DE8A 1PC3A 3H3GA 4Q8RA 5KDTB 1M5CA 4LZ7A 1HSLA 2AIXA 2HEUA 4NTLA 4ELRA 5FHMA 2V93A 3K1MA 4JWXA 5F7VA 3SERA 2OJTA 2RKMA 1MQGA 3B6QA 1B9JA 5TP9B 4P11A 3KG2A 4ECFA 4HCWA 3DLNA 3RPWA 1B4ZA 1YPNA 1GTKA 1MXZA 4I9DA 5JTYB 4LUBA 2HFBA 4IO2A 1NKXA 4OETA 2Z8FA 4Q5TA 1N3XA 3S9MC 2D21A 1MQIA 1POTA 3TTMA 3THIA 1B5HA 3KSXA 2F7AA 1A54A 4GXSB 4XXUA 2QL3A 3IB1A 1A7LA 3KSJA 5TPAA 3TMGA 4TOZA 2I3WA 1POY1 2DOJA 4FECA 3BFUA 2Y84A 4ZEIA 4ZEDA 3KFMA 2QPQA 2REGA 2P0SA 3I5OA 1LB9A 1D9VA 1MY4A 2PT2A 1FTJA 3UA8A 5AA4B 3MPLA 3OEMA 2ZNSA 1A8EA 1MPBA 3C31A 1FQEA 1B3EA 1KWHA 1NNFA 4IO3A 4ZE8A 4O3CA 3S9NC 1LSTA 4KCCA 3FV1A 4GRKA 1LBCA 1USYH 3IX1A 4NF6B 3M3LA 3RT8A 4EDPA 3N6UA 1XHYA 3I3VA 3RTFB 3C33A 3MP1A 3HN0A 2LAOA 5DYHA 5TU0A 1IITA 2F6GA 2F5XA 3A3UA 4JSOA 4ISUA 4XTCQ 5EHSA 3SESA 5KCJA 1EZOA 2THIA 4I1DA 2Y7PA 2RC7A 3OEKA 2Y7KA 5I56A 4RXLA 1B05A 1MDQA 3CVGA 5TP9A 4O3AA 5EYFA 1NH7A 4H65A 2NXOA 2ZNTA 4F3GA 3KOTA 3MZBA 1O63A 4QHQA 4U1ZA 1II5A 1S7YA 3KBRA 4G4PA 2PVUA 3IAZA 3QUFA 1UTBB 3O29A 4HTGA 4N07A 4PETA 2RCBA 1P99A 2E1SA 3G3JA 3TTNA 2DXYA 2Q88A 1AH5A 2F6PA 1MY2A 1FQDA 3EHTA 1I6AA 3PUYE 5K2YA 1SVXB 4OZ9A 1AMFA 1AIVA 1B0HA 3MVYA 5AA2B 4GWOA 3CR9A 3D4CA 3K4UA 1FTLA 1JW5A 1F9BA 3H6WA 4LVQA 3SEUA 3V8XB 1NMUA 4BDOA 3BBRA 4F1VA 3MJNA 2HZLA 2DP8A 1QW0A 1BP5A 1US4A 1DOTA 3FGSA 3JZJA 3N6TA 2XXYA 4RYAA 3KEIA 2CMOA 2DWHA 3HV1A 2DQVA 2NUVA 1MPDA 1B5JA 4FIMA 1FQFA 2W7YA 3EHUA 5M2VA 1Y3NA 2XX7A 3TELA 1MXWA 4KYDA 1DTGA 4RY1A 5I57A 1R6ZA 4C0RA 3U92A 4ZZEA 4K3FA 2OLBA 3WAFA 5ICQA 1LAHE 3MC2A 2A5TA 1OLCA 3QIMA 2XXXA 4YMBA 3DELB 3EPEA 1Q1KA 4X1DA 3TQWA 5DEXB 3H7MA 3IOTA 1DPEA 3LSWA 3FV2A 3O6HA 3PD8A 1B51A 4QF9A 4H5GA 4XKRA 2F8DA 1XOCA 3QUJA 2RF1A 4NF4A 4X48A 3TCFA 4F2QA 3LUYA 1B7HA 2VOZA 1YAEA 4GLIA 4M1VA 4F22A 1I6BA 3H4ZA 4PE5B 4NMYA 1N0TA 3UIFA 4YKJA 4LZ8A 2NOOA 3O2AA 1FQAA 2VHAA 2ZXTA 2CZLA 1XT8A 1UQWA 2O69A 2PMSA 1NL5A 2FYIA 1MXVA 3LR1A 3U94A 1MQHA 3QXMA 4EQ9A 4NEDA 1B3LA 1OMPA 4DDDA 1T0KA 3GXAA 2O7IA 2YPNA 4F39A 1TT1A 2E0SA 1LFHA 1UTHB 4JDFA 5EHMA 3PUZE 3KGCA 3SEXA 4QFKA 1SBPA 3T66A 1Y9UA 1LAGE 1Y4CA 1QJMA 3UK4A 4G2ZA 1GVCA 2DWIA 2ONKE 3TUSA 5CRYA 1B7UA 3FUZA 3KJ7A 2H5YA 3OO8A 3SEVA 4E0WA 5JTYA 4WKMA 1VFDA 4U22A 4YB7A 4F2OA 2DE3A 1Y3QA 5KZTA 1NNKA 4RPNA 4YB6A 3T9XB 3VLWA 3K1PA 3TZAA 1MDP1 2X7QA 4I8CA 1I6QA 4KYSA 3C9HA 1B0LA 1GGGA 2IA4A 3R6UA 4G77A 4IY6A 4M4GA 3G7WA 3TTKA 4QFPA 3O97A 3N5LA 1USYE 3TYHA 5B70A 5CMBA 1MH3A 4NWDA 4QFLA 2QMXA 4LONB 1H76A 1M5BA 1CE2A 1SD3A 2XXHA 3O6GA 3VE1B 2F7BA 2X7PA 4LQ5A 4OVJA 3OO6A 4X1BA 5DVJA 1FTKA 3KN7A 2B3BA 3K00A 1UIVA 4AB6A 2QS1A 5I84A 3IK6B 5TPAB 1D4NA 3T9VA 1MRPA 1Y3PA 3ONMA 4KPTA 1IIWA 1NNPA 2DVZA 2RC8A 2G29A 2XXIA 5DVIA 1ELJA 4QSCA 5KCJB 3S9EA 3RUMA 4QFNA 5H8FA 5HM4B 1EZPA 3N94A 2OK2A 4GFRA 3PPRA 5I56B 3GBBA 3O9PA 3Q27A 4U21A 3VLUA 1OIBA 1WVJA 3K2DA 1H44A 2XD3A 4QSDA 1B46A 3IOVA 4OERA 3LSFB 5CMMA 1NFTA 4ND9A 4NF5B 4IB2A 2B65A 4BDLA 1FTMA 4XKPA 3H03A 4PFYA 3O6IA 4NF8B 1NNTA 2VD3A 3FXUA 3VVFA 4ELPA 3PPQA 4DZ1A 3FXQA 1B32A 1FTOA 1PDAA 1SYHA 1ZTYA 2UVIA 3E3KA 3G3GA 3H6TA 4GL0A 3UGWA 3IO6A 3V5AA 4E0XA 3M8UA 4FJPA 4OENA 5AA4A 3JV9A 3T93B 4R72A 2F34A 2XX8A 3ODBA 5L9OA 4R73A 1QKAA 2H9BA 3RQTA 1OLAA 3IB0A 3IL1B 3CG3A 4YKIA 1P1UA 3U1OA 3KN3A 3RT6B 3W15C 1XC1A 2Q2AA 3LC8A 4GD5A 3EQ1A 2X26A 1MM7A 1GV8A 3TKDA 1FW0A 4RPOA 3S9LC 5CMKA 3V83A 5H8QB 4PP0A 2H4IA 1URDA 1QUKA 3OMBA 3VXCA 2HQ0A 3TDJA 3MZ9A 3K6UA 4ZECA 4IY5A 2B3FA 3CIJA 4G8HA 4KHZE 3IJOB 3OO7A 3Q29A 4AB5A 4EXLA 3I6VA 1LAXA 1M5DA 2Q8JA 2KLFA 3B6TA 1B5IA 3DP4A 3LSXA 2XXPA 2ZYOA 1MQJA 2V25A 3CI8A 3P7IA 1S50A 2F35A 4PFTA 4TLMB 5H8NA 4MH5A 1VSOA 3OSRA 4GQOA 4BDNA 3RTWB 4YU0A 5LOMA 4OFJA 5CMCA 1R1NA 2AYSA 5I2NA 1I69A 3FJ7A 3OSQA 2QJEA 4G8MA 4R6KA 1SW5A 5L9MA 1OVTA 2XXVA 3ECRA 1QVSA 4MLVA 1OQHA 3E4RA 3U72A 1M5FA 2ESNA 4H67A 4GXAA 1XVYA 4KQPA 2PYYA 4G68A 4UACA 5I2KA 2REJA 3RN8A 1MH4A 2XHDA 4Z7EA 1NH8A 3HCQA 2DWAA 1DPPA 3GLBA 3OD7A 2H99A 4R74A 4G8NA 2XXQA 2QS4A 4R6HA 1RKMA 4MLQA 2ZYNA 4EQBA 4P0GA 5IKBA 3TAJA 1TXFA 3MVXA 3TCGA 1B3HA 3PUXE 1JEVA 1YTVA 3USDA 2F36A 5CBRA 3MW0A 2O6AA 2FA7A 3QYTA 3R7XA 3TPAA 1B6HA 3IR1A 3WAEA 2FNCA 4FEBA 4TLLB 2F7CA 1VFEA 4HCYA 4F3PA 2V3UA 5DT6A 2DSFA 3C4MA 4G68C 1P1NA 4EUOA 5I58A 2Z8EA 3MP6A 3M3KA 5ISUA 2UYEA 5L8DA 5KDTA 1EH3A 4KCDA 5HBCA 3PU5A 2ZYMA 5DTBA 3PUVE 3M3FA 1JW1A 4R9GA 4F18A 5H8HA 1OQGA 5ITPA 2QS2A 3KN8A 3HPIA 3W9VA 3B7DA 1SW4A 3R26A 4OFOA 5FTHA 1Y4TA 4NE4A 3EF7A 4N13A 4OQOA 4OYVA 4QRZA 1P1OA 5H8SA 2GHAA 1D9YA 3OELA 2GHBA 1ANFA 1MXYA 2I0BA 3HHFA 1ZMGA 3LBSA 3DP8A 1IUDA 2OWTA 2XX9A 5CI5A 3C32A 2PT1A 4IO5A 2QMWA 1IEJA 3E13X 3FIRA 3L6GA 4FE8A 5BUUA 4OHNA 4U4XA 2Q89A 4JWOA 4EQ7A 3FZVA 1JW4A 2Q9TA 3JYRA 3MP8A 4MF3A 4ONYA 1MQDA 1MXXA 4O3BA 3UN6A 3SDFA 3F11A 1BIYA 2P2AA 3O28A 1EU8A 4FATA 4GOTA 2H98A 4PQJA 1A99A 4JWYA 1UTBA 3CSBA 1SDXA 1LFIA 2I4BA 4MBPA 3A09A 3CFLA 1H45A 1PBQA 2A5SA 5CM6A 1PB8A 1IXHA 2BJJX 1FQBA 3H06B 3G3FA 3MQ9A 3RNNA 4NF6A 4BDMA 2XXUA 2O68A 3KJTA 1WDNA 3OOAA 2R6GE 3T22A 2DE2A 2V3TA 3GBAA 4IGTA 3V89B 4F1UA 3FXRA 4DCXA 3FVGA 5I59A 1VE4A 1ZBMA 2G93A 2YJPA 2D5WA 4FORA 2ONRA 2OWSA 1A55A 1DSNA 4JXIA 1MY3A 4U23A 2O84X 1OVBA 3W9WA 4ZDMA 3T9UA 3MAMA 1N7XA 2O51A 2O7UA 4Q30B 4ZS9A 1FQCA 2I0CA 3ILUB 3K6WA 4OEVA 2OBGA 4ZEKA 3DM0A 3OO9A 5CC2A 3EN3A 4KR5A 1BTJA 5IAIA 1O64A 2F97A 2AL4A 3H6UA 3K01A 3PPPA 4ZEFA 5ITOA 3KZGA 4WXJA 1ATGA 1A40A 1J1NA 1PB9A 2DE4A 1H43A 3A3CA 4ZEBA 4WEDA 4GF8A 2R9JA 3PGFA 3ZKKA 4ELQA 3QAXA 5FHOA 4YMAA 1ZJLA 1SYIA 2Y7RA 5FHNA 5AA2A 5J1DA 1XVXA 2I48A 2Z23A 3MZ1A 1P1WA 2A5TB 4RNSA 4RK2A 3RY3A 4GL8A 4BLAA 2M8CA 2V84A 3OENA 4GIZA 4F29A 3G3KA 4FEDA 3LSLA 4NF5A 5DVFA 5A5XA 1JVXA 2UXAA 3MPKA 3VVDA 2Y7WA 2YLNA 4NF8A 4DLDA 2NVUB 4EF1A 3IB2A 1WODA 1AL3A 1QUJA 2VP1A 1Y1MA 2PX1A 2HAVA 4LP2B 3C36A 2HCAA 1IQ7A 4L17A 4NF4B 1Z7ME 1TFAA 1B3GA 4PFUA 4F3SA 4ZE9A 1RYOA 2I3VA 1MY1A 5AA3A 4RJZA 5DEXA 3K6VA 1LAFE 3TEPA 2QS3A 2UYFA 1IXCA 3BFTA 4IO4A 4HS7A 1PBPA 4R2FA 5I2KB 4POWA 4YZZA 3FVKA 1LGBC 1A8FA 4ZZAA 3PUWE 1ZIUA 3MVWA 5HPQA 4ESXA 1HSEA 1MS7A 3CRBA 5AE4A 4OTEA 4HW8A 1SI1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZYKA 4PTKA 3PMXA 4N6PA 2O1MA 1B2HA 3MUQA 3FJMA 3ILTB 4JB7A 4GWYA 1N7WA 5B7DA 4N17A 1SW1A 2GFEA 3H6VA 5J16A 4PAKA 3B6WA 1B1HA 2RC9A 3PV0E 4KYEA 1B58A 4XIGQ 4WEPA 1BKAA 4OESA 2ALUA 4H5FA 4DXUA 3TCHA 3SEYA 4QFOA 1EYKA 1MXUA 2XD2A 5T3JA 4GWSA 4DCYA 1IMEA 1EYJA 1URSA 3C35A 4XKQA 3O66A 4R6YA 2GH9A 1B40A 4MNCA 1Z7NE 1SW2A 3VDFA 2VD2A 4F31B 3VXBA 3CFZA 4DXBA 3FASA 3SKPA 1JVYA 4F3BA 4X04A 1CB6A 3SETA 5FBPA 4LATA 3K02A 5K2XA 1B4HA 5JK4A 2Y5LA 2Z8DA 3Q28A 4GX3A 4KI0E 3TODA 4NG7A 5AA1A 1FPBA 4LQ2A 5EYGA 1PB7A 2HXWA 5I59B 4EF2A 1B1XA 1LCFA 2I49A 1LBBA 2H25A 4H6DA 3PPNA 1XS5A 1LLSA 3MWBA 2P1SA 4PBQA 3PMVA 1LCTA 3Q25A 3CG1A 3VLVA 3CSGA 1EZ9A 1PC3A 2RKMA 3KG2A 3DLNA 1B4ZA 1GTKA 1FJ9A 4OVQA 5JTYB 2HFBA 1N3XA 1MQIA 2F7AA 4GXSB 3IB1A 3D1RA 4FECA 3BFUA 4ZEDA 4ZEIA 3KFMA 2REGA 2P0SA 4NF0A 5IZ1A 5AA4B 2ZNSA 1A8EA 1MPBA 3C31A 1FQEA 1NNFA 3S9NC 4O7IA 4HE0A 1USYH 4QBAA 3B8BA 1XHYA 3RTFB 3C33A 3MP1A 3HN0A 2F6GA 2F5XA 5EHSA 2THIA 2Y7PA 3CVGA 4O3AA 1NH7A 4H65A 4F3GA 2WYPA 3KBRA 2PVUA 4HTGA 1UTBB 3O29A 3TTNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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