2NXOA

Crystal structure of protein sco4506 from streptomyces coelicolor, pfam duf178
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
277
structure length
272
Chain Sequence
TRPRVGHIQFLNCLPLYWGLARTGTLLDFELTKDTPEKLSEQLVRGDLDIGPVTLVEFLKNADDLVAFPDIAVGCDGPVMSCVIVSQVPLDRLDGARVALGSTSRTSVRLAQLLLSERFGVQPDYYTCPPDLSLMAAVLIGDAALRANMIDGPRYGLDVHDLGALWKEWTGLPFVFAVWAARRDYAEREPVITRKVHEAFLASRNLSLEEVEKVAEQAARWEAFDEDTLAKYFTTLDFRFGAPQLEAVTEFARRVGPTTGFPADVKVELLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Hypothetical protein SCO4506
publication title The crystal structure of a hypothetical protein SCO4506 (gene ID: Q9L0T8) from Streptomyces coelicolor to 2.04 Angstrom resolution
rcsb
source organism Streptomyces coelicolor
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 91
structure length 272
sequence length 277
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.151: Chorismate dehydratase.
pdb deposition date 2006-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02621 VitK2_biosynth Menaquinone biosynthesis
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nxoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nxoA02
1N7XA 3U94A 1B6HA 3CI8A 3K01A 2UYFA 3OO6A 1A55A 3A3CA 3B6TA 4FATA 3T66A 4OQOA 2NUVA 3OO7A 4KR5A 1JEUA 5L9SA 3IX1A 1QKAA 4YU0A 1Y3QA 4F2QA 1IIWA 3GXAA 5JTYA 4F22A 1H45A 2VD3A 1M5EA 4G68A 1A8FA 2ZYOA 1IITA 2GH9A 4RA1A 4RK9A 3IOUA 3IB0A 2Y7IA 3N6UA 1JETA 1ELJA 4F3SA 3O97A 1DSNA 1B4ZA 2HQ0A 1FQAA 4PFUA 3ONMA 3DM0A 4R75A 4I62A 1LSTA 3HO7A 3C31A 3OEMA 1SW4A 3SEYA 5EHMA 3FV1A 2YLNA 1ZKBA 1H76A 3S9EA 5I59B 1MM6A 1NH7A 3RT6B 5I57A 5KDTB 2XD2A 3B6QA 4FJPA 4N6PA 5CMBA 1B0HA 1TWYA 2QS3A 4NMYA 3U8QA 1P1WA 4F1YA 2D5WA 2HFBA 3RLFE 2GHAA 2ZYKA 5H8SA 2H4IA 4C1UA 3UORA 4LA9A 3RTWB 3TCHA 3C35A 1VFDA 4KCCA 4EQ9A 1YTVA 1AL3A 2HZLA 2XXYA 4XIGQ 3DP4A 1SVXB 4PP0A 3FXRA 1LFHA 4EXLA 1USYH 5J1DA 3GBAA 4I9DA 4IO4A 5L9MA 5H8NA 1JVYA 1B3LA 2CMOA 1B5JA 4YKKA 1FCKA 2RKMA 4OXVA 1RKMA 1N7WA 1IXHA 5DT6A 1MRPA 4GVOA 3VXCA 1P1UA 2PT2A 3L6HA 4FECA 3FZVA 4NF8B 4YB5A 1B1HA 4QSCA 3FATA 4MLVA 4NF6B 3IO4A 3MW0A 3G3JA 2DQVA 2I4CA 2O69A 3CRBA 1Q35A 4YMBA 3QAXA 4JWXA 2DP8A 3FXQA 3C36A 2F35A 4F1UA 5JK4A 2DVCA 1AH5A 4ISUA 3PUZE 3W9VA 4RPNA 4O3CA 2DYXA 4XXUA 1TXFA 4KHZE 1LB8A 2XX8A 3FJMA 4G77A 4X9TA 4ESWA 1D9VA 5TPAB 2I3WA 2F36A 1YAEA 5AE4A 1R6ZA 1B05A 4JWYA 2DWIA 3RY3A 3PPNA 2ONSA 1B40A 3K6XA 3SKPA 2F6GA 2O51A 3Q28A 2Z22A 2VP1A 4H6DA 1JQFA 1N84A 1F9BA 1QUIA 1P1NA 2HAUA 4QSEA 4NTLA 4KYEA 4FORA 5AA3A 4F19A 1Q1KA 5CMKA 3FIRA 2Q9TA 3WAEA 1IQ7A 1Z7NE 4WKMA 5FHNA 1XOCA 5H8FB 2HAVA 2A5TA 2OZZA 1LAFE 1O64A 1IEJA 1OIBA 5I2NA 1D9YA 5B70A 3ILUB 3H03A 4OMBA 1AOVA 4G8NA 2G29A 3OD7A 1CE2A 1RYOA 4U23A 4XKPA 2V3UA 2PMSA 3PUWE 3KN7A 3ECRA 3F11A 1NNTA 1NNKA 2AL4A 4PE5B 4ZEIA 3FASA 1QKBA 3DP6A 1GV8A 5AA2A 4F3GA 2REJA 1NNFA 4U4XA 4MH5A 3D4CA 1B1XA 3SDFA 4LQ5A 1B5HA 3EHUA 4KYSA 1SYIA 4FEDA 4PFYA 4LATA 4OWDA 2DXRA 2Y7KA 4ELRA 1DTGA 4RJZA 1DPPA 4ZEDA 1N04A 2HEUA 2UVHA 1D4NA 4Z0IA 3L6GA 3MP8A 2HZKA 4O3BA 2E1SA 3CSGA 3OEKA 1FTOA 2VD2A 1FQDA 3MZ1A 5CM6A 1VFEA 2QS4A 2YPNA 2XX7A 4G8HA 3TODA 1VR5A 3C34A 4H8JA 2Q2CA 1MY0A 2ONKE 4ZEFA 3H3GA 1MQIA 2X7QA 4NEDA 5IAIA 5DEXB 4ZE9A 1O7TA 3CR9A 1MQHA 3K0VA 3UA8A 3ZKKA 1YPNA 4EQBA 1T0KA 3VFJA 1M5FA 1D3KA 2XXUA 4U1OA 3KEIA 2H5YA 2AIXA 5ELVA 3EQ1A 5LOMA 1R9LA 1FTJA 1B0LA 2ZNUA 4GIZA 4YMAA 3H6VA 1NH8A 2VGQA 4P11A 1BKAA 4F39A 5CBRA 4EQ7A 4FEBA 1B46A 3G3KA 2VOZA 1I6BA 3EPEA 1GGGA 2XXXA 2F7AA 3CVGA 3OXNA 2OBGA 2RC7A 3TUSA 3TZAA 5B7DA 4OFOA 2NVUB 1TFDA 1XVXA 2W7YA 3ZS6A 3BBRA 3UN6A 1ZLQA 2RC8A 2ALUA 5AA4B 3FVNA 2RC9A 2QPQA 5CC2A 4F31B 1DTZA 3EF7A 4H8IA 5I58A 5I2KB 3O6GA 1LB9A 2XHDA 1UTHB 3RPWA 3CG1A 4U4SA 1FTMA 3VVDA 4JSDA 4LVQA 3TTKA 3O6HA 1Z7ME 1B3FA 3BFTA 3RQTA 4I1DA 4OHNA 2GFEA 4ZZAA 3UGWA 3LBSA 4DE8A 3KSJA 4RK2A 5M2VA 1DMBA 3TKDA 4H1XA 1OQHA 3MPKA 2DWAA 2ZNSA 4YZZA 3T93B 1MQDA 2Y7RA 2OWSA 3EHTA 3A3UA 3FD3A 4P0GA 2NOOA 3ZSFA 1DPEA 5I84A 2XXPA 2I49A 5K2YA 2XXHA 3SEVA 1PB9A 1IUDA 2I4BA 3O2AA 5H8QB 4G4PA 1VSOA 3PMVA 2O1MA 3OO9A 3PV0E 3CG3A 1LAHE 2DOJA 4U22A 5TP9A 3R6UA 3MP1A 1Y1ZA 2R9JA 2XXWA 3OO8A 4ZZEA 4NF5B 3HHGA 4HCWA 5KCJB 5H8HA 4ZECA 1AIVA 4MBPA 4LZ5A 1SDXA 1LCFA 4DLDA 4GOTA 2OJTA 4BDQA 2I3VA 3CFLA 5AA2D 2Z8DA 4HCYA 3KOSA 2D21A 2V25A 2UVJA 4F18A 3E3KA 3TCGA 1R9QA 4G68C 5TU0A 4DXUA 4AB6A 1URGA 2F5XA 3M3LA 3LSXA 1UIUA 2XXQA 1QUJA 2Q88A 2FA7A 1IXCA 2DXYA 1BTJA 1IZ1A 1MDQA 4AQ4A 3PUXE 1TFAA 2ZNTA 3MJNA 3O9PA 3MWBA 1NNPA 3IK6B 1XVYA 2RCBA 3W9WA 1N3XA 1WODA 2F6PA 4BDLA 3N26A 4F2OA 2ZYNA 4XKNA 4EDPA 5FHOA 4IGRA 3RN8A 1OQGA 4OFLA 4WXJA 4DIGA 5K2XA 4BDRA 3HSTA 3C33A 2DWJA 3H6UA 2O7UA 4NWDA 3T22A 1Y3NA 1PB8A 3IJOB 4YAHX 4EUOA 4E0WA 1UTBA 4JBZA 4BLAA 4UA8A 2FNCA 4OTEA 1RYXA 3KSXA 2H25A 2ZMBA 3SEUA 4GRKA 3U1OA 2A5TB 1N3WA 1MXYA 3VLVA 2B65A 4ELPA 4M1VA 5BWJA 3MVXA 5I59A 3B7DA 4KFQA 2DE2A 1BLFA 4ZDMA 2Y7PA 1POY1 1Y4TA 4U2RA 1MH3A 2WKYA 5KDTA 4N07A 2QL3A 3T9UA 3O29A 3SESA 3G3IA 2FYIA 4NE4A 3CFXA 1S50A 2O6AA 1US4A 2OCUA 1A7LA 3MUQA 1N76A 4HTGA 1M5BA 4F1VA 1PB7A 4QSDA 3QSLA 2O84X 1LBBA 3H6TA 4TQUQ 4P0IA 1SW5A 3TQWA 3G3HA 2H99A 1B7UA 5CRYA 3I3VA 1URDA 4Q30B 4O3AA 3QYTA 3PMXA 4H5GA 5A5XB 4H0WA 3MPLA 4OFJA 4GFRA 3V5AA 3K1NA 1ZMGA 3HPIA 2QRYA 2UVIA 3MVZA 3MC2A 2DVZA 3B6WA 4NF8A 3TDJA 2QMWA 4NF6A 3RNNA 1MY1A 4OYVA 3Q26A 3UK4A 3IJXB 4R2BA 2DWHA 1WDNA 4OZ9A 3VE1B 5HM4B 1MQJA 1MM7A 4MF3A 4K3FA 4R6KA 1NKXA 3V89B 1Y4CA 3IL1B 3WAFA 1L5TA 1JEVA 1SD3A 2ABHA 2Z23A 1EU8A 1EZOA 4EF2A 4F29A 2G93A 1ZIUA 1QJMA 3HCQA 3K4UA 3KN3A 3C4MA 3MVYA 2QJEA 5ICQA 1OLAA 1NFTA 4X48A 3PU5A 5TPAA 4IY5A 3S9MC 1NL5A 1SI0A 1LGBC 2V3QA 4KD5A 4ZEKA 3DLNA 4AB5A 4L17A 3MAMA 2ESNA 3TYHA 1PEBA 2Y84A 1YCJA 4GD5A 4BDOA 3M8UA 3K02A 1FQFA 4IB2A 3T96B 3THIA 3JYRA 5FTHA 3SETA 2ONRA 3H7MA 4LONB 4YKIA 1MS7A 3KJTA 3K1MA 1QW0A 2XXIA 3E4RA 2VHAA 5H8FA 3O28A 2IA4A 1B7ZA 3D4GA 4OEUA 4DCYA 4THIA 1WVJA 5HPQA 4NF4B 1MH4A 3FV2A 3RT8A 3IOVA 4FAJA 1H3DA 4JSOA 1B52A 4OESA 4YB6A 1LAXA 3AXFA 3KBRA 5DTBA 4MLQA 1LBCA 5KZTA 4DZ1A 1IXIA 4Q5TA 3V83A 5CI5A 3CIJA 4PQJA 1FQEA 5DVJA 2ZXTA 5CBSA 1A40A 4OETA 4TLMB 3PUVE 5EYFA 3MVWA 1Y1MA 3PPRA 4JXIA 3TTRA 4PFTA 3MZBA 3C32A 5JTYB 1LCTA 3MQ9A 1ATGA 4Q0CA 4EF1A 4HS7A 4FE8A 4OVJA 1MY2A 3U92A 5JEIA 4G68B 3SEXA 1PDAA 1QVSA 3PPOA 4QFLA 3E13X 4OERA 3PMWA 3N6TA 2O1LA 1OMPA 1LAGE 1XC1A 1MXWA 3PD9A 1MXZA 1O63A 3P7IA 3LSFB 4YKPA 5DEXA 3HV1A 3PGFA 3O66A 2PX1A 1NMUA 2PVUA 4QFKA 1LFGA 4XTCQ 4OEVA 5ITOA 1HSJA 2HCAA 4BDMA 5I57B 1GTKA 2BJJX 3K1PA 3VXBA 2AYSA 3QIMA 3RTFB 1MXVA 4QHQA 4MFIA 3TMGA 4IO7A 4YB7A 1B32A 4Q8RA 3S9NC 3O6IA 4IO3A 4IO2A 2H98A 4ZS9A 3HN0A 3G7WA 2X26A 3SERA 1B3EA 3KJ7A 5BUUA 2P1SA 4LZ8A 3QK6A 2V84A 1FQBA 1ZTYA 3K6UA 1M5DA 5DVFA 3Q25A 2I0CA 3DP8A 3IOTA 4BDNA 3T9HB 3V8XB 4PETA 3TFLA 1MPCA 1II5A 3TEPA 3TTNA 1B4HA 1JW1A 4QFOA 5H8NB 3MBPA 4RNSA 1MY4A 1IXGA 4FIMA 4ND9A 3R7XA 3VVFA 2GHBA 3ODBA 5I56A 4QFNA 1UQWA 1VE4A 3K00A 1MQGA 2KLFA 5HBCA 5AA4A 1I6QA 3FGSA 1XS5A 1S7YA 1ANFA 1UTBB 3FVOA 1M5CA 2RINA 1SI1A 1TT1A 4R2FA 2F7CA 5I2KA 1MXUA 3CSBA 3M3KA 5L9OA 4GQOA 1UTHA 2QMXA 3IOWA 2F97A 3IB1A 4R74A 3OSRA 4G2ZA 3FVKA 3QUFA 1ZU0A 1Y20A 4M4GA 3LSWA 1MY3A 4ZEBA 1GVCA 4ONYA 2QS2A 3GBBA 4IGTA 2OK2A 3MZ9A 2Q2AA 1P1OA 3OENA 4YKJA 5ICTA 3C9HA 3W15C 3FXUA 4OENA 1US5A 4GLIA 5EHSA 4LUBA 1FQCA 4H5FA 3KZGA 3QXMA 4GXSB 5H8QA 4H65A 4C1TA 3VDFA 3SEWA 2Z8FA 1OLCA 1FTKA 4NF5A 4NWCA 5KCJA 3EHSA 4EXKA 4ZE8A 1SQYA 3H4ZA 3UIFA 2NWJA 3Q27A 2XXTA 1XT8A 2PT1A 3LR1A 3H6WA 5I2NB 3VLWA 1FW0A 3TCFA 1R1NA 1JVXA 4R6HA 4GWOA 4WEPA 5ISUA 3G3GA 2DE4A 1BIYA 3KN8A 1HSEA 4POXA 2F34A 1ZJLA 4R72A 3OSQA 4GXAA 2PBWA 3S2VA 3KFMA 2QS1A 5AA2B 4XKRA 2Y7WA 4LP2B 3IO6A 2UXAA 3ILTB 1B51A 2R71A 3IAZA 4Z7EA 5AA1A 2OWTA 3S9LC 1H44A 4PFWA 3FJ7A 1POTA 1QUKA 2XX9A 2DS9A 3JZJA 2NXOA 3TTMA 2RF1A 3Q29A 1A99A 3PD8A 2UVGA 4YICA 2F7BA 3OMBA 5ITPA 4ELQA 3IR1A 2D3IA 1FTLA 4N13A 3R26A 2HXWA 4E0XA 4QFPA 3IB2A 4KCDA 4QF9A 4H67A 1SW1A 2AL5A 3ZKLA 3TTLA 2M8CA 3GZGA 2THIA 1B2HA 2XD3A 3U93A 1SBPA 4IY6A 4F3BA 1CB6A 2REGA 1P1QA 4RPOA 3OELA 3EN3A 3UP9A 5FTIA 4X1DA 1JW5A 2DE3A 3FUZA 3LC8A 4U1ZA 3TELA 2GRVA 4XKQA 2V3TA 1MPBA 1GR2A 4ELOA 1Y3PA 1S9TA 1BP5A 3KGCA 1QULA 2O7IA 2R6GE 4GL0A 3LUYA 3TQLA 4RY1A 4IO6A 4KQPA 1EZ9A 1H43A 3N94A 3RUMA 2I48A 2H9BA 2Q89A 4I8CA 4DXBA 4KI0E 3GLBA 3LSLA 1B58A 4ECFA 4RXLA 3G3FA 4ESXA 2I6EA 3DELB 3OOAA 3N5LA 1B3HA 3I5OA 4IO5A 3BFUA 1LFIA 1AMFA 1KWHA 4G8MA 5CMMA 2PYYA 1EZPA 2ANJA 5A5XA 4R73A 1MXXA 4TOZA 2OLBA 4GF8A 4F3PA 1LLSA 1B5IA 3E9XA 2F8DA 2O68A 3FJGA 5I58B 4KPTA 4DDDA 4GL8A 3KOTA 2Z8EA 5F1QA 3H06B 2B3BA 1HSLA 3TAJA 5L8DA 1ZBMA 3S4UA 4X1BA 2RCAA 4TLLB 3VV5A 5DVIA 4HW8A 3K6WA 1EH3A 4DCXA 2QSXA 1A8EA 1A54A 1Y9UA 1B3GA 1PBQA 3IORA 2P2AA 1USYE 3K6VA 1PBPA 4QRZA 1B7HA 2I0BA 4JDFA 1J1NA 4R9GA 1I6AA 5CMCA 5F7VA 5DYHA 3VLUA 3T9VA 3PPPA 5FHMA 3CFZA 1OVTA 5IKBA 2P0SA 2XXVA 2B3FA 2YJPA 4U21A 4R6YA 5TP9B 2F78A 4C0RA 2E0SA 3VVEA 1UIVA 3K2DA 4WEDA 3HHFA 1MPDA 1N0TA 1SYHA 2Q8JA 3RGYA 2CZLA 4KYDA 5H8HB 2DSFA 3I6VA 3KG2A 5I56B 3U72A 4POWA 2LAOA 2IEEA 1B9JA 3M3FA 4UACA 2ZYMA 4LQ2A 1JW4A 2UYEA 2X7PA 4JWOA 3JV9A 1DOTA 4LZ7A 3PUYE 3BKIB 1I69A 3TPAA 3T9XB 2XXRA 3FVGA 4NF4A 2I58A 3A09A 1OVBA 4JB7A 1SW2A 1JNFA 1MDP1 3QUJA 3USDA 3PPQA 2A5SA 1URSA 2V93A 4RYAA 1P99A 4R9FA 1PC3A 1MG1A 3MP6A 4DXCA 1XHYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N7XA 3U94A 1B6HA 3CI8A 3K01A 2UYFA 3OO6A 1FBCA 1A55A 3A3CA 3B6TA 4FATA 3T66A 4OQOA 2NUVA 2L5VA 3OO7A 4KR5A 1JEUA 5L9SA 1NUYA 3IX1A 1QKAA 4YU0A 1Y3QA 4F2QA 4NQ8A 1IIWA 3GXAA 5JTYA 4F22A 1H45A 4H45A 3B8BA 4O7MA 2VD3A 1NUXA 1M5EA 4G68A 1A8FA 2ZYOA 1IITA 2GH9A 4RA1A 4RK9A 3IOUA 3IB0A 2Y7IA 3N6UA 1JETA 4JVCA 1ELJA 4F3SA 3O97A 1DSNA 1B4ZA 4I3EA 2HQ0A 1FQAA 4PFUA 3ONMA 5EYHA 3DM0A 4PAFA 4R75A 4I62A 1LSTA 2ZZXA 3C31A 3HO7A 1NV1A 1NV5A 3OEMA 1SW4A 3SEYA 1K9YA 1FBFA 5EHMA 1FPEA 3FV1A 2YLNA 1ZKBA 1H76A 3S9EA 5I59B 1MM6A 1NH7A 3RT6B 5I57A 5KDTB 2VT5A 2XD2A 3B6QA 4FJPA 4N6PA 5CMBA 1B0HA 1FBGA 1TWYA 2QS3A 4NMYA 3U8QA 1P1WA 4F1YA 2D5WA 2HFBA 3LV0A 3RLFE 2GHAA 2ZYKA 2Q8MA 5H8SA 2H4IA 4C1UA 3UORA 1AWBA 4LA9A 3RTWB 3TCHA 3C35A 4GWWA 1VFDA 4KCCA 4EQ9A 1YTVA 1AL3A 1CNQA 4MHFA 2HZLA 2XXYA 4XIGQ 3DP4A 1SVXB 4PP0A 3FXRA 1NV3A 1LFHA 4PF8A 4PBQA 4EXLA 1USYH 5J1DA 3GBAA 4I9DA 4IO4A 5L9MA 3U65A 5H8NA 4PAKA 3NOHA 1JVYA 1B3LA 2CMOA 1B5JA 4YKKA 1FCKA 2RKMA 4OXVA 1RKMA 1N7WA 1IXHA 5DT6A 4N81A 4N6KA 1MRPA 4GVOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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