2NXOA

Crystal structure of protein sco4506 from streptomyces coelicolor, pfam duf178
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
277
structure length
272
Chain Sequence
TRPRVGHIQFLNCLPLYWGLARTGTLLDFELTKDTPEKLSEQLVRGDLDIGPVTLVEFLKNADDLVAFPDIAVGCDGPVMSCVIVSQVPLDRLDGARVALGSTSRTSVRLAQLLLSERFGVQPDYYTCPPDLSLMAAVLIGDAALRANMIDGPRYGLDVHDLGALWKEWTGLPFVFAVWAARRDYAEREPVITRKVHEAFLASRNLSLEEVEKVAEQAARWEAFDEDTLAKYFTTLDFRFGAPQLEAVTEFARRVGPTTGFPADVKVELLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a hypothetical protein SCO4506 (gene ID: Q9L0T8) from Streptomyces coelicolor to 2.04 Angstrom resolution
rcsb
source organism Streptomyces coelicolor
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Hypothetical protein SCO4506
total genus 91
structure length 272
sequence length 277
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.151: Chorismate dehydratase.
pdb deposition date 2006-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02621 VitK2_biosynth Menaquinone biosynthesis
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nxoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nxoA02
3OOAA 2XXQA 4TLLB 4AB6A 2Z22A 4DXCA 4YMBA 3QK6A 1DMBA 5H8FB 3FV1A 1ZLQA 3IJXB 1NH7A 3JYRA 3PMWA 4PFTA 1VR5A 3VV5A 2I4BA 4AQ4A 4FATA 2DWHA 4F39A 4X1DA 3MQ9A 3O9PA 1IXIA 4G8HA 3MBPA 4OESA 1RYXA 3A3UA 3LBSA 4EQBA 4G8MA 1GR2A 1LBBA 3TPAA 1H45A 2NOOA 3RGYA 5DTBA 3C33A 4QFLA 4LA9A 3S9NC 4OZ9A 4QHQA 1MDQA 4R6HA 3TEPA 1POTA 3FZVA 2QL3A 3OD7A 2FNCA 4GXAA 4ECFA 2H9BA 3N26A 3C32A 1LAHE 5LOMA 1B4HA 1O64A 4XKPA 4DZ1A 1MQHA 1WODA 4C1TA 1AH5A 1SDXA 4GRKA 4FEBA 3S9EA 4IO7A 5ITOA 2Z8FA 1OQGA 1LAXA 4H65A 4BDLA 3FUZA 3E4RA 1ATGA 2OBGA 2Z23A 3MWBA 1B32A 2Q2CA 3PGFA 3Q28A 4MF3A 4RYAA 2QRYA 3OXNA 1MH3A 1N76A 3T9VA 3W9WA 4KFQA 4R9GA 2B3FA 1BTJA 1B4ZA 2V3UA 3C34A 4OFLA 4F29A 2F6GA 2Y7WA 1MQDA 1OVTA 1ZMGA 1OVBA 1B7HA 2RKMA 2ZXTA 2PT2A 3IR1A 2QS3A 3PPNA 3CSBA 4DCYA 5FTHA 5ITPA 1B3HA 3QUJA 3SEYA 2RC8A 2VHAA 4BDOA 5H8FA 1M5CA 1MQIA 1NMUA 1NNPA 3QIMA 4IY5A 1OLAA 3U8QA 3U92A 2DVCA 2QPQA 3EHUA 2UYFA 2YPNA 4YICA 1VSOA 1AIVA 3PV0E 3IJOB 2QS1A 1URGA 4KCCA 2I0CA 1DOTA 1AMFA 1CB6A 2OJTA 3A3CA 3M8UA 4YB5A 1NH8A 4GF8A 2PVUA 2HXWA 3HHFA 3BFUA 2R9JA 3ODBA 4R74A 2DSFA 2XXHA 4NF6A 3R7XA 3T96B 3UA8A 1IXHA 3RT8A 1B7ZA 2F78A 3KOTA 2V3TA 4PFUA 5H8QA 3RTWB 1JNFA 3THIA 1RYOA 4NF8B 3TZAA 4ESXA 4EXKA 4OHNA 1R1NA 4GQOA 1H76A 4WXJA 5I58A 3FIRA 1FTKA 4H0WA 5DEXB 5HBCA 2Q8JA 3TUSA 1B46A 4ELQA 3T9UA 4YAHX 5K2YA 4ZECA 4NEDA 3U93A 2QS2A 4MH5A 3K01A 4I62A 1B5JA 3KJ7A 1B3LA 5ICTA 4ZZAA 2P2AA 4FIMA 5I2NA 4FORA 3KZGA 4F18A 1B3GA 1B0LA 2GFEA 3IOUA 4TOZA 1SI0A 2UVHA 5L9SA 3HPIA 1ZTYA 2ZYOA 1CE2A 3QAXA 3C36A 4OFOA 3FVOA 1T0KA 4WEDA 5H8QB 4OVJA 1LFHA 1Z7NE 3IO6A 4OYVA 1SW4A 2I49A 4H6DA 1LGBC 4ELPA 4ZDMA 1ZIUA 1B2HA 2O1MA 4POXA 5I59B 1Y20A 3RN8A 2ABHA 1Y3NA 3G3JA 1M5EA 1OMPA 2M8CA 2R71A 4I8CA 3OO9A 1DTZA 3MW0A 1GV8A 3MVWA 3ZSFA 1GTKA 4G2ZA 3U1OA 3FXRA 4AB5A 1SYIA 4Q8RA 4FE8A 2VOZA 3ECRA 4U22A 4F1YA 4FAJA 2DE2A 2GH9A 4F3GA 3K6WA 3K1NA 5A5XA 1A8EA 1ZKBA 2D21A 4OFJA 4Q0CA 4RPOA 2HQ0A 2D3IA 2O68A 4LQ5A 3SERA 5I56A 1LB9A 2CZLA 1A40A 3O29A 1PDAA 3G7WA 4U1ZA 3MP6A 1YAEA 1IQ7A 4M1VA 4WKMA 3ZS6A 3V89B 4EF1A 2DE3A 2GHAA 4MLVA 4RK2A 2ZYNA 1EZPA 4U21A 1IXGA 3KSXA 4BDNA 1S50A 4PP0A 1M5FA 2UYEA 3FATA 1PEBA 3G3FA 4XIGQ 5JTYB 3EN3A 3G3IA 4EF2A 3LC8A 1AOVA 1JW5A 2Y7KA 2F97A 5AA1A 4IO6A 2Y7RA 4U23A 3MPLA 2I4CA 4LP2B 3HN0A 1US5A 1YPNA 3O6IA 1O63A 4YZZA 4PE5B 1LFIA 2DP8A 2NXOA 2W7YA 5TP9A 5CBRA 2ZNTA 2ZYMA 4U2RA 3O6HA 5HM4B 2X26A 2F5XA 4OENA 5AA3A 1TWYA 3SDFA 1B5HA 4IGTA 4P11A 3OMBA 4JDFA 4OWDA 4POWA 4LQ2A 1B5IA 1IIWA 3HO7A 4R6YA 4YKKA 5K2XA 3U94A 4FJPA 3ZKKA 4JB7A 1FW0A 5KCJA 4F2QA 1H43A 1MQJA 2IA4A 3K2DA 5CBSA 3FXUA 3T9XB 2XD3A 4I1DA 5ELVA 2G93A 4R2BA 3IOWA 1ANFA 3PPQA 4NF6B 1QUKA 3Q27A 3TCHA 1LCTA 3DM0A 1JVYA 4KCDA 1MQGA 3MZBA 1EZOA 3PUZE 4QSCA 1B05A 1B1HA 1SD3A 4ZEBA 2AYSA 3PU5A 3PUVE 4F1UA 4KI0E 5AA2A 3FVGA 4K3FA 4GVOA 1PB9A 2XHDA 2BJJX 4NTLA 1ZBMA 1J1NA 5DVJA 4O3AA 1FTOA 2O7IA 3MPKA 2OWSA 3B6WA 4MLQA 2D5WA 1B58A 2XXUA 1QW0A 1D3KA 1JW1A 1P1OA 1Z7ME 1MDP1 2VP1A 4H5FA 4UA8A 5BWJA 1MPDA 5FHOA 2F35A 3H4ZA 3RT6B 3H7MA 4RK9A 5KCJB 3SEXA 2F7BA 1R9QA 2THIA 1TT1A 2UVIA 2DS9A 5B7DA 2RC9A 4YKJA 3M3LA 3H6UA 1FQDA 4GD5A 4YMAA 1SQYA 4LZ8A 1MPBA 2AL4A 2CMOA 1Y3QA 1B3EA 1MH4A 3T22A 3M3KA 2I48A 1NKXA 3VDFA 3EHTA 1N7WA 4H67A 4KPTA 4DCXA 2Y7PA 1JEVA 1OQHA 3MAMA 1P1WA 3PUYE 2YLNA 1MXZA 4EQ7A 1LFGA 2PMSA 3L6GA 2DE4A 3RQTA 3CG3A 3KOSA 4KHZE 2H99A 4ZS9A 2O6AA 1JW4A 1P1UA 1Q35A 2RCBA 3TTLA 1DTGA 1D9VA 3WAFA 5CMBA 5I57B 2P0SA 1FQEA 2A5SA 2PX1A 3M3FA 5DT6A 2HZKA 1I6QA 1P99A 3MVYA 1MXUA 4F1VA 3PUXE 1D4NA 4QFKA 3UP9A 1MG1A 1A8FA 4IO3A 5AE4A 4N07A 3IB0A 4QFOA 1Y3PA 1B1XA 3IB2A 4MFIA 5EHSA 4R6KA 3S4UA 1AL3A 4NE4A 4NF5B 3VLWA 3VVFA 3HCQA 3PMVA 3TTRA 1B6HA 1POY1 5I56B 3LUYA 1XC1A 3QSLA 4QF9A 1D9YA 5TU0A 1MRPA 1IZ1A 1FQBA 2VGQA 1XVXA 1IEJA 1PC3A 4WEPA 2I0BA 1B9JA 2DVZA 1L5TA 4ISUA 3S2VA 3HV1A 2OLBA 5B70A 3MC2A 1N0TA 3TTMA 1Y4CA 1VFEA 4OTEA 1NFTA 3LSLA 3LSWA 4DIGA 3PUWE 4RXLA 1QULA 5FHMA 2ZNUA 1XOCA 2Q88A 1MPCA 2RINA 3FJMA 4OERA 3TCGA 4ZE9A 4GIZA 2UVGA 1P1NA 3G3HA 5DVFA 1B52A 5M2VA 2HAVA 3H6VA 3UORA 1MM7A 3K00A 3O6GA 1UIUA 4NF8A 4XTCQ 4TQUQ 4YKIA 3FXQA 5IKBA 1IITA 4OEVA 4DXBA 4QSDA 2ZMBA 3GLBA 2YJPA 4H8IA 4JWXA 4LZ7A 3RTFB 3USDA 3IB1A 3UK4A 3VXCA 2QJEA 3HHGA 1MXWA 2XXVA 2ZNSA 3FVNA 2E1SA 4HCWA 1US4A 3CI8A 4P0IA 2PT1A 1LB8A 4QFNA 4E0WA 2QSXA 3G3KA 4IY6A 1I69A 5FHNA 3PPRA 3B6TA 3EF7A 2G29A 3N6TA 3K1MA 3I6VA 4NF4A 4L17A 2F7CA 3O66A 3R26A 1B40A 4QFPA 2ANJA 2H5YA 4KYDA 3K6UA 4YKPA 3MVXA 4Q5TA 2I3VA 3OO7A 2DXRA 5A5XB 3TKDA 3VXBA 3W9VA 4THIA 2X7QA 4GLIA 1MM6A 3VFJA 4XKNA 1FCKA 4RJZA 2Q9TA 1MY0A 3QYTA 1LAFE 3SEVA 3GZGA 4LVQA 3IAZA 4KYSA 4F2OA 2E0SA 2UXAA 3K02A 4G8NA 1LCFA 4N6PA 4U1OA 3V8XB 2HFBA 2ESNA 3FASA 4X48A 5H8HB 2HEUA 1USYE 4I9DA 1QVSA 1Y9UA 1M5BA 2QS4A 1PB8A 3CVGA 4F19A 2ALUA 3B6QA 1N7XA 4NMYA 1JETA 3RY3A 1QKAA 4JWOA 5ICQA 2VD3A 3CRBA 1JQFA 1RKMA 3H3GA 3OO6A 3OEKA 2ONRA 3MVZA 3FJGA 3H03A 4NWCA 1MY1A 3HSTA 3A09A 4G4PA 5F1QA 5HPQA 3BFTA 1LAGE 3KEIA 3W15C 3TQWA 1TXFA 1WDNA 3K1PA 4X9TA 2XXWA 4NF4B 3K6XA 5CC2A 4OETA 2Y84A 3IOVA 2RF1A 4ZE8A 1SI1A 1MY4A 2V25A 3EPEA 4OXVA 2O84X 4PQJA 4H1XA 3SETA 3SKPA 4F3PA 2KLFA 3CFLA 3E3KA 5CMKA 3V83A 1DSNA 3C4MA 5BUUA 4PFWA 2Q89A 3OENA 4F22A 1IUDA 1N3WA 2PYYA 2Z8DA 1HSLA 2ZYKA 1FTMA 3IK6B 3KJTA 1BLFA 1XVYA 3PPPA 3Q25A 4GWOA 5H8HA 1SVXB 2F36A 5H8SA 2R6GE 4ZEKA 1N3XA 1IXCA 1FTLA 3KG2A 3C31A 5JTYA 3EHSA 5F7VA 2LAOA 4IGRA 3ONMA 3KN7A 1N84A 4GXSB 4KQPA 1LBCA 2WKYA 4LATA 4EQ9A 2IEEA 3TQLA 1FQFA 3O97A 3IO4A 1BIYA 4H5GA 1UTBA 3UGWA 3CFXA 5I59A 3KN8A 1A7LA 3DLNA 4F31B 2DYXA 3RLFE 2XX8A 4U4SA 5AA2B 4JWYA 3S9LC 4ZEDA 2Q2AA 4GL8A 4BDMA 4NF5A 2FYIA 2F6PA 3FGSA 1Y4TA 5KDTA 3S9MC 3GBAA 1NL5A 1TFAA 2O51A 3I5OA 3OEMA 1B51A 2XXYA 4X1BA 4G68B 4Z0IA 2DXYA 3TTNA 2DWAA 5JEIA 4ONYA 1QKBA 3IORA 3VVDA 4OMBA 2HCAA 4LUBA 5EYFA 3PPOA 5TPAA 1B0HA 4R2FA 1S9TA 1B7UA 3TYHA 5IAIA 5KDTB 4JSOA 2HZLA 4F3BA 3TDJA 3O2AA 3OSQA 4FEDA 4GL0A 4LZ5A 3WAEA 1WVJA 1YCJA 1YTVA 3CFZA 5CRYA 2XXPA 3K6VA 3VLUA 2NVUB 5L9MA 2I6EA 1H44A 3PD8A 1URDA 2QMWA 2REJA 4U4XA 3QXMA 3N6UA 4JXIA 1OIBA 1VFDA 2V3QA 4BDRA 1UIVA 3R6UA 2O7UA 2AIXA 2B3BA 2HAUA 3GXAA 1JVXA 1HSEA 4RPNA 4EXLA 4RY1A 3H06B 3SEWA 3VVEA 3UIFA 1EU8A 4HS7A 3Q29A 3L6HA 1QJMA 3IL1B 3LSFB 2OCUA 2Z8EA 3F11A 3MZ9A 4KD5A 4KYEA 4QSEA 1PBQA 1SBPA 5I2KB 2NWJA 1EH3A 4G68A 5CMCA 1UTBB 5FTIA 1SW5A 4DDDA 5I2KA 5L8DA 1A55A 3LR1A 4MBPA 3T66A 2PBWA 3E9XA 5TPAB 2GHBA 2XX9A 4O3CA 4R73A 3G3GA 4ND9A 1QUJA 4EUOA 1EZ9A 2V93A 3OO8A 3N94A 4IB2A 1VE4A 4RNSA 5DEXA 5H8NB 4XKRA 1XS5A 1H3DA 3I3VA 5H8NA 2XXXA 1FTJA 1ZU0A 3TELA 1UQWA 1ZJLA 1Y1MA 4JBZA 1PBPA 1P1QA 4E0XA 2OZZA 1M5DA 3AXFA 4O3BA 2XXRA 5I2NB 1URSA 3E13X 2UVJA 2I3WA 1I6BA 1USYH 2GRVA 3H6TA 4H8JA 4Q30B 4ZEFA 3RUMA 3BBRA 4R72A 1QUIA 4C1UA 5I57A 2H4IA 4ELRA 3KSJA 3N5LA 2XXTA 1Q1KA 4LONB 3SESA 1FQCA 3DELB 3FJ7A 1MXVA 2H98A 3FVKA 3D4GA 1BP5A 2F8DA 3H6WA 2ONSA 3IOTA 1OLCA 4GFRA 4KR5A 4OEUA 2I58A 3Q26A 2REGA 4DLDA 4HCYA 2A5TA 3BKIB 4M4GA 4RA1A 4C0RA 1KWHA 3IX1A 3CG1A 4NWDA 3KFMA 5EHMA 1NNFA 1Y1ZA 5I84A 1MY2A 2O1LA 3K0VA 3MUQA 3TAJA 2DOJA 4XKQA 3MP8A 4G77A 2O69A 3OELA 3KN3A 4GOTA 5J1DA 3TMGA 3ILTB 1FQAA 3K4UA 3KBRA 5DVIA 4DE8A 1JEUA 4ESWA 3P7IA 3MZ1A 2DWIA 2X7PA 4IO5A 2OK2A 4P0GA 3TFLA 3DP4A 1R6ZA 4PETA 3C35A 3VLVA 2XD2A 3B7DA 3MP1A 4N13A 3EQ1A 2RC7A 4OQOA 1GVCA 1MY3A 2XXIA 2DQVA 2NUVA 4FECA 1SW1A 3OSRA 4ZEIA 3ILUB 4QRZA 3GBBA 5KZTA 1HSJA 2QMXA 4HTGA 3VE1B 5CI5A 1MXXA 3C9HA 4UACA 3PD9A 2AL5A 3FD3A 3U72A 1ELJA 3D4CA 3ZKLA 4DXUA 3JZJA 1I6AA 1B3FA 1SYHA 2A5TB 2V84A 5AA4B 2DWJA 2B65A 1LLSA 4ZZEA 3CIJA 4BDQA 5AA4A 3V5AA 4PFYA 2OWTA 4HW8A 1DPEA 1O7TA 5I58B 1TFDA 3QUFA 1DPPA 1BKAA 5DYHA 2H25A 3RPWA 3O28A 2ONKE 1N04A 3JV9A 3CR9A 3DP8A 3PMXA 1MXYA 4XXUA 3LSXA 3TODA 4F3SA 3CSGA 4BLAA 4JSDA 5JK4A 3TTKA 1GGGA 4YB7A 3UN6A 2FA7A 1A54A 5L9OA 3MJNA 4IO2A 1XT8A 1R9LA 3T9HB 4EDPA 2F7AA 5CM6A 4R9FA 3TCFA 1F9BA 1NNTA 1PB7A 2Y7IA 3FV2A 2F34A 1S7YA 2RCAA 1LSTA 3DP6A 3RNNA 3SEUA 4YB6A 1UTHB 2XX7A 4G68C 4R75A 1SW2A 3T93B 1XHYA 1UTHA 5CMMA 4YU0A 4IO4A 1A99A 3KGCA 2VD2A 4Z7EA 1NNKA 1II5A 1MS7A 2P1SA 5AA2D 5ISUA 4ELOA 4TLMB 5TP9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XXQA 4AB6A 5I3SA 2B4LA 4KXPA 1NH7A 3JYRA 3PMWA 1VR5A 4X1DA 4G8HA 3TPAA 5DTBA 3C33A 3S9NC 4QHQA 4ECFA 2FNCA 2H9BA 4C1TA 4IO7A 1OQGA 1ATGA 2OBGA 2Z23A 4MF3A 4GX3A 1MH3A 2B3FA 4F29A 2F6GA 2Y7WA 1OVTA 4G61A 4PF8A 3PPNA 5KCJA 2QS3A 3SEYA 1MQIA 3V83A 4PAFA 3EHUA 4MJOA 2YPNA 2QS1A 4KCCA 5IZZA 1LBVA 4YB5A 2HXWA 4I3YA 2R9JA 3T96B 1IXHA 2V3TA 1YXIA 1RYOA 4EXKA 1H76A 3FIRA 4H0WA 5HBCA 4PGNA 2OX3A 4ZECA 1B3LA 4FORA 1B3GA 1B0LA 3BIGA 1NUZA 5ET5A 1SI0A 5L9SA 4WEDA 1Z7NE 2XWVA 4QXDA 4H6DA 4ELPA 1ZIUA 4I40A 1DCUA 2M8CA 3OO9A 1FBDA 4GWYA 3ZSFA 4AB5A 1SYIA 4FE8A 3ECRA 4JVCA 5A5XA 2HHMA 3SERA 1LB9A 1A40A 3G7WA 4M1VA 1IQ7A 4EF1A 2GHAA 4MLVA 4MX6A 5JTYB 3EN3A 4DI3D 2Y7KA 3HN0A 1US5A 4PE5B 1LFIA 2W7YA 5CBRA 4GX4A 3O6HA 2X26A 1TWYA 4IGTA 4OWDA 4PE3A 2R8TA 2IA4A 4I1DA 5ELVA 4NF6B 2PFZA 1LCTA 3DM0A 1CNQA 1EZOA 3PUZE 1B1HA 4ZEBA 2AYSA 3PU5A 3QMFA 3KC1A 1LBXA 4GVOA 4NTLA 4O3AA 3MPKA 4E0XA 2VP1A 1Z7ME 5BWJA 2F7BA 2UVIA 4YKJA 1SQYA 1FBEA 1B3EA 1MH4A 3M3KA 4H67A 2QFLA 1OQHA 3PUYE 3L6GA 2DE4A 3CG3A 4O8MA 1DTGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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