3IO6A

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c92-a
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
416
structure length
400
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQPPPPPPPPPPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli k-12, homo sapiens
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, HUNTINGTIN FUSION PROTE
total genus 116
structure length 400
sequence length 416
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3io6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3io6A02
3PMVA 1NNKA 1FTJA 4OWDA 2XD3A 2IEEA 1HSLA 2NUVA 4TQUQ 1N0TA 4U21A 2HXWA 1XVYA 4E0XA 3RUMA 5FHNA 3CSGA 2GRVA 3D4CA 1R1NA 4ELOA 1PC3A 5CBSA 1IXIA 4MLQA 4F22A 2A5TB 2LAOA 5TPAA 4F3BA 4H8JA 1TXFA 4H8IA 3G3GA 3K6WA 3G3IA 4G68C 2B3FA 3VXBA 4DE8A 2Q9TA 3QXMA 5FTIA 3CFXA 3HCQA 4GLIA 2QS2A 3HHGA 3T93B 2AYSA 2Q8JA 5CRYA 2XXVA 1MM7A 1SW1A 3QIMA 3V5AA 5B70A 2ZNTA 1FQEA 1JW1A 1D3KA 1LCTA 3Q25A 4TOZA 4IO6A 4ESXA 3DP6A 1PEBA 2F7CA 4RK2A 4R6KA 1GR2A 1MRPA 3VVDA 4IO2A 4WKMA 4IO5A 3L6GA 2Y7KA 2W7YA 3T66A 4ZEKA 1ZMGA 3HV1A 4QFPA 1P1OA 1POTA 1WVJA 3T9HB 3O6GA 4FORA 4TLLB 2HQ0A 2DVZA 4P0IA 3MVXA 1P99A 1A54A 5KDTB 1Y1ZA 2F5XA 3VFJA 2WKYA 4I8CA 3DM0A 3ZKLA 3MP8A 3SEWA 4M1VA 2F6PA 1TWYA 3PUWE 4O3CA 4G68B 2D3IA 1SVXB 1B0LA 2E1SA 3W9VA 3M3KA 3MWBA 4NMYA 3S9NC 1DTZA 1B46A 2QS4A 1AOVA 4QF9A 3VV5A 2CMOA 4IY5A 1A7LA 3U94A 4F18A 3G3JA 3FXQA 5KCJB 5DEXA 2I3WA 1J1NA 2O69A 5JTYB 3TCFA 5TP9B 3T9VA 2H4IA 2VGQA 1ZTYA 3MZBA 1I6BA 5AA2A 3IB0A 4ZEIA 1Y4CA 2ZNSA 3USDA 1SW4A 2ZYNA 4N6PA 1MM6A 3EPEA 4YKIA 2PMSA 2OZZA 2RC7A 4NWDA 3IORA 1OQHA 3CIJA 2O68A 3PPRA 3MC2A 3G7WA 1LFGA 3AXFA 5K2XA 2D5WA 3N5LA 4QFNA 3CFZA 3GLBA 2RC9A 5DVJA 1YCJA 1MY2A 5I58A 3UP9A 4KD5A 4C1UA 3PD9A 3H03A 5H8FA 4KPTA 2ZYMA 3RTWB 4BDRA 1N04A 3FVGA 3U8QA 5I56A 1LCFA 4F3GA 2F8DA 2OJTA 1FTMA 1H43A 4EF2A 4PFWA 2UYEA 4GVOA 3N94A 4F3PA 1FTOA 3R7XA 3UN6A 2QSXA 4O3BA 4N13A 1PB7A 3UA8A 1SI1A 2QRYA 4ONYA 1UTHB 3U1OA 3O28A 5KZTA 1DOTA 4KR5A 3A3UA 2VP1A 1B2HA 1HSEA 3P7IA 1MY1A 2D21A 4FIMA 3BFTA 3PUXE 3V8XB 3TDJA 1MQGA 4Q30B 4G2ZA 3BBRA 1SQYA 2YPNA 2GHAA 1WDNA 1O63A 2PYYA 3MVWA 1N84A 4DLDA 3O6HA 3TFLA 1LGBC 4G77A 5L9MA 3EF7A 4N07A 2X7PA 4XTCQ 2REJA 4WEDA 1N76A 1IITA 1DTGA 1NH8A 1MY0A 2XXYA 1B3LA 4OETA 1FW0A 4P11A 3OELA 4QSDA 3TCGA 2O51A 3H3GA 2I3VA 4H0WA 3FVKA 4X1DA 5HBCA 3E4RA 5I84A 4HW8A 4EQBA 4YKKA 2RINA 3IL1B 2FNCA 1DSNA 5DVIA 3PV0E 3W15C 3CR9A 1IXCA 2VD3A 1TFAA 3UORA 1FCKA 2KLFA 3KFMA 4LZ7A 4H5FA 2HAUA 3TTNA 5FHMA 3N6TA 4IB2A 4YMBA 4XKRA 4H65A 1IIWA 2F35A 1XVXA 5H8HA 4HCWA 3ILTB 1NMUA 2UXAA 4LONB 4DXUA 3OOAA 3KZGA 1ATGA 5H8NA 1B4HA 1MY4A 1ZBMA 3OEKA 4JWYA 4ELPA 5CBRA 3FZVA 1USYE 1A8EA 4NF6B 4C1TA 1KWHA 4FEDA 4POWA 1FQFA 4U4XA 1OMPA 4ISUA 3FVOA 4EXKA 2P1SA 1PB9A 4NF8B 2H25A 1UTBA 2X7QA 5AA1A 3EHTA 3EHSA 3RNNA 4OXVA 3IAZA 4ZS9A 4POXA 1VFEA 4ZE8A 4ELRA 1FQDA 3KSJA 1IXGA 4G8NA 3H6UA 4ZEFA 1B7ZA 3FJGA 2B65A 3OO8A 3KG2A 4K3FA 5AA2B 3QYTA 2QS1A 4JBZA 2O1LA 3FVNA 3CG3A 1URSA 4NEDA 4JWXA 4IO3A 1VFDA 4R74A 1MXVA 1JW4A 1II5A 2XXIA 4XKNA 4PP0A 5H8QB 2ALUA 3C35A 3N26A 4OESA 1L5TA 4WXJA 1I69A 1Y9UA 3OSRA 2F7BA 3IOVA 4G8MA 3VE1B 5HPQA 3UIFA 2I4BA 3OO7A 1OVBA 1LB9A 1MS7A 3G3KA 1M5DA 4XIGQ 1ZU0A 2Z8FA 4OEVA 2V3QA 3IR1A 4KYEA 3K1PA 1MQIA 2ZNUA 4H67A 2GFEA 3MW0A 3IX1A 5DT6A 2F97A 1IZ1A 3DELB 3E13X 4YZZA 4L17A 4Q5TA 3ECRA 3QAXA 1B7UA 1FTKA 4FATA 1JETA 1XHYA 4R9GA 1MPDA 2R9JA 3MZ1A 4ESWA 3S4UA 3Q27A 1DPPA 4XKPA 4EQ7A 3D4GA 4KYDA 3KEIA 2NOOA 5JEIA 5ITPA 3LSFB 3I6VA 1NNPA 2RCAA 4ZZAA 4ZZEA 3ONMA 4F29A 2AL5A 4YMAA 1Y3QA 5TU0A 1RKMA 1B40A 2XX9A 3MPLA 5CM6A 1H3DA 3ODBA 3G3FA 3LC8A 3FIRA 2I58A 1LFHA 1B3GA 4RXLA 3GXAA 2XXXA 3M3FA 3IJXB 5CI5A 4NTLA 3R26A 1M5EA 4MH5A 3Q29A 5H8SA 1SW2A 3N6UA 3MQ9A 1XC1A 1BP5A 3TTKA 3PUZE 1N3XA 4QSEA 4BDMA 1A55A 3VLVA 4KI0E 4HS7A 4P0GA 2Q89A 4U1ZA 2UYFA 3S9MC 4XXUA 4R6HA 1NNTA 4AB6A 1XT8A 3RGYA 1P1WA 2DWIA 1MDQA 3ZS6A 2I0BA 1H45A 5AA4A 4F3SA 1PBPA 1Z7NE 2RCBA 4OFOA 5I59A 1SDXA 3T9UA 2R71A 1MXWA 5J1DA 2XXWA 2F7AA 5H8HB 1ZJLA 3PGFA 4OHNA 1O7TA 2H9BA 4AB5A 3CVGA 2XHDA 1DPEA 4JSOA 3B6QA 3OMBA 2DXRA 4TLMB 2O84X 4F31B 4LQ5A 3TTRA 2DP8A 1RYOA 3BFUA 2NVUB 1MH3A 1AIVA 1GTKA 4LA9A 4WEPA 2YJPA 4NF5B 4U22A 1B1XA 5FHOA 3ZSFA 2DWJA 2XD2A 4I62A 4DCXA 4QFKA 3MUQA 3MJNA 5DVFA 5I2NA 1UTBB 2Q2CA 1ELJA 2REGA 1P1NA 2XX8A 4PETA 3PPQA 3DLNA 3FASA 4PFTA 3ZKKA 1QUJA 1N7WA 3Q26A 4RPOA 1M5BA 2DWAA 4BDLA 1IXHA 4QRZA 4JDFA 1UIUA 1AMFA 1NH7A 1QJMA 2B3BA 1LFIA 3SETA 2Z23A 1UIVA 2BJJX 4I1DA 1QUIA 3PPNA 1PDAA 3TTLA 4QFLA 1S50A 1B51A 1URDA 1BIYA 3M8UA 2HZKA 1B3FA 1LB8A 4KFQA 4RK9A 3K02A 5ITOA 1MDP1 4F1VA 1Y1MA 4Q0CA 3FV2A 3KGCA 4QSCA 2A5TA 2XX7A 4GOTA 5DTBA 4IGTA 4NF4A 1AL3A 3C36A 2P0SA 3K4UA 1BTJA 3KJTA 3TYHA 1A8FA 4GF8A 2F34A 1LAHE 1GV8A 3K01A 1IQ7A 4X9TA 1P1UA 3K6VA 1B0HA 3IO4A 3V89B 3L6HA 5TPAB 4RA1A 1SW5A 1I6AA 5F7VA 2UVHA 3MP6A 3CI8A 4DZ1A 4DIGA 3S2VA 2Y7WA 1LAGE 1H76A 3K2DA 1YAEA 1ZIUA 3CFLA 4IO4A 2HEUA 2QS3A 2Z22A 4BDOA 2ANJA 4ZE9A 3QUFA 4LQ2A 3JYRA 5IAIA 1ANFA 1FQAA 3ILUB 2QJEA 3LSLA 1NNFA 1MXYA 2PBWA 5KDTA 1TFDA 1SBPA 2H5YA 5CMCA 5AA3A 4U1OA 4X48A 3RQTA 3A3CA 2RF1A 5A5XA 2A5SA 4YU0A 4G68A 4R9FA 2OCUA 1H44A 4U4SA 1POY1 2ONKE 2XXQA 2ABHA 1FQCA 2HAVA 4MF3A 4ECFA 3SEVA 4IGRA 3RT6B 5AA2D 2XXPA 2QL3A 4YAHX 2DQVA 4GRKA 1A40A 1M5FA 3FXUA 2DXYA 5TP9A 3U92A 4U23A 3SEXA 3H4ZA 2ZMBA 2DE4A 4YB6A 2F36A 3H6WA 3OO9A 1YPNA 2E0SA 1D9VA 4JWOA 4EF1A 4JB7A 2FYIA 3MPKA 3LR1A 1B58A 3O66A 1AH5A 5CMMA 3IK6B 1LAXA 2OWTA 4OEUA 4DXBA 4BDQA 1B32A 1JVYA 3RPWA 5DEXB 3MAMA 3IOTA 1OIBA 3FXRA 2ONRA 3OXNA 4FEBA 2ZYOA 2X26A 1T0KA 3MVZA 1TT1A 1B9JA 1MQJA 1JNFA 3RLFE 3U72A 2DYXA 5ELVA 5I2KA 4HCYA 3T9XB 4GIZA 2FA7A 2Z8DA 4ZEBA 3UK4A 2G93A 1B05A 2PVUA 4F2OA 3V83A 1SYIA 1MH4A 1MG1A 3PUVE 3LBSA 1QW0A 2QPQA 3EQ1A 4DCYA 4OZ9A 3MBPA 1NL5A 1FTLA 3IO6A 5I2NB 1LLSA 5I58B 1MXZA 5ICTA 1P1QA 5H8FB 1IUDA 3K0VA 4F2QA 2O6AA 4MBPA 1JEVA 1PB8A 3TQLA 5I56B 1LSTA 1SI0A 3THIA 2VD2A 1QKAA 4BDNA 5BUUA 1S9TA 1ZLQA 4G4PA 1MQDA 3SEUA 1MPBA 2UVIA 1N7XA 4QHQA 4AQ4A 1ZKBA 2YLNA 3O2AA 2PT2A 3KN7A 2O1MA 3C31A 2Z8EA 4RYAA 3TMGA 3H06B 4LP2B 4OFLA 3K1MA 1JEUA 3TELA 3PPPA 4ELQA 2I0CA 2Y84A 3OSQA 1CE2A 1RYXA 2G29A 3IOWA 1PBQA 2THIA 3F11A 2R6GE 1R9LA 4GL8A 2AIXA 3HPIA 3CRBA 5IKBA 3KN8A 3CG1A 2PT1A 4RNSA 3FUZA 4YKJA 1IEJA 3IB2A 4NF4B 4F39A 3JZJA 2I49A 4R72A 1B6HA 4PE5B 2P2AA 2V84A 1LBCA 3VDFA 2OBGA 2RC8A 3SDFA 5ICQA 4ND9A 4FECA 4X1BA 1YTVA 3TKDA 1MY3A 2VHAA 2M8CA 2NXOA 5I57A 3I5OA 2F78A 3TQWA 4LATA 1B1HA 3R6UA 5K2YA 3LUYA 3SESA 3C34A 3SERA 2V3TA 3EHUA 5DYHA 1VE4A 3KN3A 4EDPA 4YKPA 3KBRA 3K6UA 3T22A 4KCDA 4LZ5A 4F1YA 4GL0A 3SKPA 3IB1A 3G3HA 2OLBA 4ZECA 4C0RA 1LAFE 5L9OA 3MZ9A 3B6TA 3LSXA 4RPNA 2QMWA 5L8DA 3VVEA 1GVCA 4OYVA 3TTMA 3OO6A 1EZOA 1XOCA 4NF6A 4F19A 2NWJA 1MQHA 1F9BA 1M5CA 3WAFA 3B6WA 4NF8A 3KSXA 2VOZA 4IY6A 4NWCA 1BLFA 4R75A 4EQ9A 4GXAA 3T96B 5L9SA 2GH9A 5LOMA 5A5XB 3BKIB 4ZEDA 4THIA 3PPOA 2ONSA 1URGA 3UGWA 1B7HA 1Z7ME 1QUKA 4PFUA 3E9XA 4G8HA 2AL4A 4UA8A 5H8NB 3VLUA 1DMBA 3TCHA 1HSJA 1OVTA 4FAJA 4R6YA 3PMXA 2XXHA 3Q28A 4I9DA 1JQFA 3C4MA 4KYSA 1I6QA 3RTFB 1NFTA 4JSDA 4NE4A 3O97A 2HZLA 4H5GA 3VXCA 4ZDMA 4U2RA 3EN3A 4EUOA 2H99A 5JK4A 2DWHA 3GBAA 3TAJA 4OVJA 5B7DA 2DS9A 5H8QA 4BLAA 3TUSA 1QULA 3C9HA 1EH3A 5ISUA 3MP1A 1EU8A 1R9QA 3O6IA 3TODA 2HFBA 3QSLA 3U93A 2ZYKA 3GBBA 2H98A 1SD3A 4OERA 4Z7EA 4RJZA 1Y3NA 5EHSA 1B5JA 5I2KB 1OQGA 1O64A 1VSOA 2F6GA 4RY1A 4GD5A 5EHMA 2V3UA 2V25A 1USYH 3OEMA 4DDDA 1MXUA 1WODA 3TZAA 4PQJA 3VVFA 1OLAA 2I4CA 1QVSA 3DP4A 3W9WA 2PX1A 3B7DA 2ZXTA 3WAEA 2I6EA 1QKBA 4Q8RA 4EXLA 1US4A 4GFRA 3C33A 3HO7A 3HSTA 4Z0IA 4MFIA 3E3KA 3RN8A 4OENA 3OENA 4DXCA 2HCAA 3O9PA 3KOSA 5CMKA 4HTGA 3PMWA 1B5IA 1B4ZA 2UVJA 3IJOB 5M2VA 2Y7IA 3KOTA 1R6ZA 4KQPA 3I3VA 4R2BA 2DE2A 4FJPA 3O29A 3DP8A 2UVGA 4OFJA 4GWOA 3RT8A 4YICA 1Q1KA 3K00A 5AE4A 3H6VA 4YB5A 4OQOA 3H6TA 4R2FA 3H7MA 3PU5A 2GHBA 3M3LA 2DOJA 1OLCA 1Q35A 1NKXA 4O3AA 2Q88A 1Y3PA 1B3HA 1B52A 2IA4A 4KHZE 1CB6A 1JW5A 3K6XA 3HN0A 2Q2AA 3VLWA 5I57B 1JVXA 3QK6A 3CSBA 3OD7A 1FQBA 1UQWA 5F1QA 4GXSB 4H6DA 1B5HA 1VR5A 5KCJA 3TEPA 1BKAA 5JTYA 1SYHA 1Y4TA 2XXUA 2O7UA 4FE8A 1XS5A 4R73A 3S9LC 4E0WA 3A09A 3MVYA 4H1XA 3TPAA 2DE3A 1MXXA 2XXTA 3PD8A 3RY3A 3GZGA 1GGGA 4F1UA 4GQOA 4YB7A 2O7IA 3PUYE 3QUJA 4OTEA 4NF5A 5AA4B 1N3WA 4KCCA 2RKMA 2CZLA 5BWJA 5I59B 3FD3A 3IOUA 3SEYA 2Y7RA 4UACA 4XKQA 4QFOA 5CC2A 1EZPA 1S7YA 1MPCA 4LVQA 2OWSA 2ESNA 3KJ7A 1D9YA 3FV1A 4PFYA 3C32A 3JV9A 4IO7A 1A99A 3FATA 5EYFA 4MLVA 2QMXA 2V93A 3FJ7A 3LSWA 2XXRA 5FTHA 4M4GA 2DSFA 3FGSA 1D4NA 5HM4B 1UTHA 1Y20A 5CMBA 1US5A 2Y7PA 1B3EA 3FJMA 1EZ9A 3K1NA 2DVCA 3HHFA 4OMBA 2OK2A 3S9EA 1LBBA 4JXIA 4LZ8A 2I48A 4LUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PMVA 1NNKA 1FTJA 4OWDA 2XD3A 2IEEA 1HSLA 2NUVA 4TQUQ 1N0TA 4U21A 2HXWA 4N8YA 1XVYA 4E0XA 4N17A 3RUMA 1DBZA 5FHNA 4O8MA 3CSGA 2GRVA 3D4CA 1R1NA 4ELOA 1PC3A 5CBSA 1IXIA 4MLQA 1EYJA 4F22A 5ET5A 2A5TB 2LAOA 3MSTA 5TPAA 4F3BA 4H8JA 1TXFA 2WEFA 4H8IA 3G3GA 3K6WA 2CZKA 2XWOA 4QXDA 3G3IA 4G68C 2B3FA 2GQ1A 3VXBA 4DE8A 2Q9TA 3QXMA 5FTIA 3PTYA 3CFXA 3HCQA 4GLIA 2QS2A 1AWBA 5FBPA 4X8RA 2P3VA 3HHGA 3T93B 2AYSA 2Q8JA 5CRYA 2XXVA 1MM7A 1SW1A 3QIMA 3V5AA 5B70A 2ZNTA 1FQEA 2DDKA 1JW1A 2L5VA 1D3KA 1LCTA 3Q25A 4TOZA 4IO6A 4ESXA 4P1EA 3DP6A 1PEBA 2F7CA 4RK2A 4R6KA 1GR2A 1MRPA 3VVDA 4IO2A 4MEVA 4WKMA 4IO5A 3L6GA 2Y7KA 2W7YA 3T66A 4ZEKA 1ZMGA 3HV1A 4QFPA 1P1OA 1IMCA 1POTA 1WVJA 3T9HB 3O6GA 4FORA 4TLLB 2HQ0A 2DVZA 4P0IA 3MVXA 1P99A 1DCUA 1A54A 5KDTB 2F3BA 1Y1ZA 2F5XA 3VFJA 2WKYA 4I8CA 3DM0A 3ZKLA 3MP8A 3SEWA 1G0IA 4M1VA 2F6PA 1TWYA 3PUWE 4O3CA 4G68B 2D3IA 1SVXB 1B0LA 2E1SA 3W9VA 3M3KA 3MWBA 4NMYA 3S9NC 1DTZA 1B46A 2QS4A 1AOVA 4QF9A 3VV5A 2CMOA 3HFUA 3KBZA 4IY5A 1A7LA 3U94A 4F18A 3G3JA 3FXQA 5KCJB 5DEXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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