3SEXA

Ni-mediated dimer of maltose-binding protein a216h/k220h by synthetic symmetrization (form ii)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEHAFNHGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 124
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sexA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sexA01
2YLNA 4NTLA 2XX7A 1UTHB 2ONKE 4QFNA 1IQ7A 1H76A 1IUDA 3LC8A 3FV2A 1B58A 4OFOA 4R2FA 3CG3A 3PPPA 3KN3A 1IXHA 3UA8A 2XXIA 3HV1A 3TZAA 3IOWA 5L8DA 1IITA 1JEUA 3O6HA 4IGTA 2ONRA 1DPEA 3FVGA 1P99A 1M5EA 4O3BA 3VXBA 3MP8A 2F34A 4KYEA 5AA4A 2HZKA 3IAZA 4OENA 2AL5A 3QIMA 3PUVE 1B0LA 1XHYA 5ITOA 3HSTA 3K4UA 4WEDA 3ECRA 3E3KA 4HTGA 2O68A 5DVIA 2V25A 1SVXB 3IL1B 1H3DA 1SYIA 1FQDA 4G4PA 4GLIA 3LSXA 3HPIA 1Z7ME 3MC2A 4WXJA 1H45A 5LOMA 3OSQA 1B32A 2UVIA 4M4GA 1OLCA 1T0KA 5I56A 2QL3A 3OSRA 1O7TA 1MS7A 3MUQA 4YB7A 4LQ2A 5JTYA 4HCWA 1Y9UA 4IB2A 4Q30B 2CZLA 4Q5TA 1B3FA 3IK6B 4K3FA 4PFWA 3ZS6A 1AOVA 5JTYB 5TPAB 3B6WA 3TTRA 4H65A 1QKBA 2A5SA 3T96B 1MH4A 1B40A 2I0BA 1Y1MA 4KFQA 4IO2A 4O3AA 3GZGA 2P2AA 2PYYA 1NH8A 4XKQA 2Q89A 4MLQA 2I3WA 2REGA 4MFIA 3L6HA 4FAJA 5L9OA 2P1SA 3TCFA 2NXOA 4BDRA 1US4A 3EF7A 3TAJA 3O66A 4E0XA 3MBPA 3O2AA 1HSLA 1A40A 3DP8A 2DP8A 1AL3A 2BJJX 1Y1ZA 1N0TA 4I1DA 4R6KA 3TFLA 3WAEA 3UORA 1N7XA 2PBWA 3VE1B 3EPEA 1ZKBA 4ZZAA 3TDJA 1SI0A 1UQWA 3MP6A 1Y3NA 4ZE8A 1MXXA 4JWXA 3BBRA 2ANJA 3LUYA 3FZVA 2I6EA 1CB6A 4YU0A 4NWDA 5H8HA 3KN7A 5AA2D 2KLFA 4LVQA 3MPKA 2ZNUA 5H8HB 4XXUA 1JNFA 1LGBC 1VFEA 1MPDA 5EHMA 3MPLA 4ELPA 1LFHA 3MVZA 1LFGA 1PDAA 1YTVA 3SEUA 2X26A 3KOSA 1B4ZA 1ELJA 2F6GA 2XXXA 4G68A 1B7ZA 1MPCA 4RXLA 4IO3A 2RC8A 3PUWE 4NWCA 4C1UA 4R73A 2F7AA 4F31B 2V3QA 3CFZA 5I2NB 3H3GA 4G68B 3RTWB 4PQJA 4F3SA 4ISUA 3U92A 4YICA 3T22A 1A8FA 1FTKA 2RCBA 3FD3A 1MDP1 3BFTA 4R9FA 3CIJA 2Y7IA 2Y7RA 3PGFA 3H06B 3IJOB 1MPBA 5CMBA 2QS3A 4YZZA 1Y3PA 4ZEDA 4ZDMA 2E0SA 1DSNA 3G3FA 5I84A 3K00A 3ZKLA 2O6AA 3FVOA 1TWYA 4C0RA 4U23A 3K0VA 4FJPA 4UACA 4GXSB 2Y7PA 3K01A 4RJZA 3N5LA 1B5JA 3TMGA 2OZZA 3HCQA 1B5IA 5FHMA 3T9UA 3OOAA 2XD3A 1O64A 1FTLA 3O97A 3E4RA 1TFDA 3RY3A 2F36A 4EDPA 2ZNSA 3SKPA 3K6VA 3RN8A 4OEVA 3T66A 2HFBA 1VSOA 4FEDA 3UP9A 1OMPA 3S2VA 3N6TA 5H8SA 2DWAA 2VD2A 3KEIA 4KYSA 3EQ1A 3RLFE 2I4CA 3U8QA 1M5DA 4R9GA 3I5OA 3CR9A 3SESA 3IOUA 2X7QA 3HN0A 4EQ7A 3PMXA 3KSXA 4X48A 1USYH 1P1OA 3LBSA 1P1NA 5FTIA 1R6ZA 1S7YA 3CRBA 3VDFA 2QS1A 1QUIA 1IZ1A 1M5BA 4MBPA 1FTJA 1TT1A 4PFUA 4QHQA 2DXYA 4R6HA 5KCJA 2QMWA 3LSLA 1URGA 2ZYOA 2E1SA 2XXPA 4ZEIA 4GF8A 5DVFA 1POY1 1US5A 4TLLB 1BLFA 3SETA 5I2KB 3SEYA 3B7DA 1FCKA 3K6XA 4KQPA 2DYXA 2G93A 3AXFA 4WKMA 4YMAA 2HXWA 1FQCA 4G68C 2VHAA 4LA9A 2IA4A 4XKPA 4YB6A 3IB2A 3ZKKA 4FATA 3CFLA 2V3UA 4POXA 3GBAA 3ODBA 4JXIA 4EXLA 3DLNA 3KJ7A 5TP9B 3GBBA 1UIUA 4R74A 4JDFA 3VV5A 1MXYA 1DMBA 2Y7WA 4F1UA 4DXUA 1B0HA 3U1OA 5ELVA 2YJPA 3RT6B 3V89B 2Q9TA 1B2HA 3MQ9A 4U21A 3ILTB 5H8QA 1S9TA 1URSA 5KDTA 2O7UA 3BKIB 3SEWA 4RPNA 5DTBA 3M3LA 1JW4A 3TTNA 2B65A 2ZYNA 5FHNA 3FVKA 4OERA 1UTHA 5KDTB 4P11A 5F7VA 1QW0A 2A5TB 2UVJA 2XXTA 2XXVA 3IB1A 3ZSFA 2ZYMA 1I69A 4ESWA 1LAGE 2QPQA 1Y4CA 3F11A 1MY1A 1JEVA 3KSJA 4EQBA 3VLUA 1B7UA 2FA7A 4Z7EA 4QRZA 4NMYA 4L17A 1Z7NE 1PBPA 5TU0A 2Q88A 3MWBA 3TCGA 3T9HB 3VLWA 3I3VA 3K1MA 1PBQA 5IAIA 1P1QA 3PPNA 2XXHA 2OCUA 4QFPA 1VFDA 4LZ7A 3LSWA 2LAOA 2RINA 2NUVA 3P7IA 3FXQA 2HAUA 2Y84A 3S9EA 3PPQA 4EF2A 1D9YA 3A3UA 3H7MA 2O1LA 4H8IA 2I3VA 2ABHA 4ELQA 2DS9A 1MRPA 1B05A 3UK4A 2QJEA 1A54A 4H6DA 5HPQA 2RF1A 1LAHE 4IY5A 1LBBA 3C4MA 2Q2CA 5BUUA 5H8FA 2GRVA 1POTA 2IEEA 1ZMGA 2GFEA 1NMUA 2XD2A 5H8FB 1S50A 4YMBA 4GL8A 1EZOA 3TELA 5TPAA 2PMSA 2Q8JA 4DIGA 3TUSA 4FECA 2OK2A 2XXUA 3S9NC 4H0WA 4XKRA 3V5AA 4OFLA 4ZEKA 3QXMA 4LUBA 1DPPA 2QRYA 4QSDA 3JV9A 3PMWA 1OVTA 2DE4A 1KWHA 3D4GA 3H6WA 1MQIA 3MZ9A 3FUZA 4U2RA 3V83A 2NWJA 3S4UA 4U4SA 3MJNA 1GVCA 4EUOA 1LB8A 3TTKA 1R9QA 3RNNA 3C9HA 2G29A 4YKJA 1VR5A 1MQDA 4OHNA 4YAHX 5J1DA 1EH3A 3KZGA 1CE2A 2W7YA 4YKIA 1NNTA 5CMKA 1ZTYA 5K2XA 4ECFA 1EZPA 1IEJA 2DXRA 1N84A 1B3GA 5H8NA 4F3PA 5AA2A 1WDNA 3T9VA 4R2BA 3RPWA 1DOTA 4Q0CA 1NL5A 4DCYA 5H8NB 5AA2B 4YB5A 4EQ9A 3T93B 4MLVA 4QFKA 3CFXA 4GRKA 4JSDA 5M2VA 1M5CA 3JYRA 3FJ7A 2ZXTA 1NFTA 3KOTA 5AE4A 3DP6A 1XT8A 4ELRA 5KZTA 5I58B 3H6VA 4F1YA 3OO6A 5CC2A 1GR2A 4XTCQ 3IOVA 1B9JA 4OESA 4PP0A 1B3HA 1ZU0A 3VLVA 3HHFA 1OLAA 1A99A 2REJA 2RKMA 3TQLA 4Z0IA 5ISUA 1GTKA 5B70A 4BDNA 2HAVA 4QSCA 1I6AA 3PUYE 4LQ5A 1TFAA 3FIRA 3MZBA 5I2NA 4IO4A 2FYIA 1BP5A 1QKAA 1I6QA 2UYFA 2I0CA 2Z22A 1PB8A 3IORA 3N94A 4G2ZA 1XVYA 1N7WA 2VD3A 1QUJA 2THIA 3N6UA 3V8XB 4QF9A 4F2OA 1ZJLA 2F7BA 1A55A 3IO6A 1N3XA 4O3CA 1ZBMA 2I4BA 2XHDA 4H8JA 2OLBA 4G8MA 1MG1A 4HS7A 2F78A 4NF4B 1OVBA 5DYHA 4DLDA 1BIYA 3M3KA 1MY2A 3R7XA 2Z23A 5A5XB 2H98A 4R6YA 1I6BA 4UA8A 3UIFA 4F19A 2I48A 3PPOA 1HSJA 1VE4A 3B6TA 3C32A 1WVJA 5CRYA 1AH5A 4P0IA 1B7HA 2VGQA 5EHSA 2AL4A 1EU8A 2M8CA 2Y7KA 1D3KA 1QULA 2AIXA 4KD5A 4F39A 2D5WA 5K2YA 1MXWA 1MXVA 4N13A 4PFYA 3MAMA 1SW1A 5ICQA 2O51A 5I57B 3EN3A 4ZEFA 4EXKA 3K2DA 1SQYA 1B1HA 5CMCA 3U93A 3G3KA 4F2QA 1OIBA 1BKAA 2Z8DA 3PPRA 5DEXB 4YKKA 3MVXA 3SDFA 4BDOA 3TPAA 2WKYA 3BFUA 3THIA 3N26A 3EHTA 5CBSA 1SYHA 4X1DA 3I6VA 5AA3A 4JWYA 4F29A 4G8NA 5ICTA 1P1WA 1FTMA 5I2KA 1MM7A 3QAXA 4NEDA 4LZ8A 3C33A 4IO6A 3Q26A 2FNCA 1B5HA 2RC9A 1DTGA 4JB7A 4TLMB 4KPTA 3TCHA 1M5FA 3EHSA 3WAFA 2RC7A 4WEPA 3OEMA 1XS5A 3O9PA 1LSTA 1MQGA 5TP9A 1SW2A 1MQHA 5JEIA 2H4IA 1MM6A 1AIVA 2DE3A 4OETA 4IO5A 4ZECA 3K6WA 1LB9A 1FTOA 1NH7A 3OENA 2HZLA 1UTBB 2ESNA 5BWJA 2XXRA 1JQFA 2GHBA 2OJTA 3VXCA 1H43A 4G8HA 3W9WA 1XVXA 1SW4A 4GXAA 2PVUA 3OXNA 4POWA 5L9MA 1B3LA 2VP1A 3RQTA 1URDA 3GXAA 2A5TA 2F5XA 1YAEA 1SBPA 2PT1A 5CM6A 3EHUA 4LZ5A 1ATGA 2B3FA 4N07A 3FXUA 1B6HA 3VVDA 4H5FA 4M1VA 3G3HA 3IB0A 4R75A 3IOTA 1Y4TA 4RY1A 4DCXA 5CMMA 4RPOA 3W9VA 1B51A 1FW0A 4EF1A 1NKXA 4LP2B 3QK6A 2DVCA 4X9TA 2O1MA 2OBGA 1MY3A 1USYE 1B52A 4U1OA 4RYAA 1BTJA 4AQ4A 2AYSA 3SEXA 2PT2A 4XKNA 4KR5A 3MZ1A 3QUJA 2H5YA 2UVHA 4QSEA 1Y3QA 2R71A 1MY0A 4H1XA 1B4HA 3CSBA 1QJMA 4BLAA 1EZ9A 1QVSA 3IJXB 2Z8EA 4X1BA 4KHZE 4RNSA 4U22A 4GIZA 1PEBA 2HCAA 1RYXA 1OQGA 1R1NA 1FQBA 3MW0A 3TQWA 4OFJA 1L5TA 3DP4A 3GLBA 4I8CA 4PETA 3KBRA 3IX1A 2XX9A 3G3JA 5AA4B 3CSGA 2ONSA 4MH5A 3TTMA 4HW8A 4BDLA 3SERA 4JSOA 3FJMA 3Q25A 3C31A 3OO8A 4OQOA 2ZNTA 4NF6A 4BDMA 3FGSA 4OXVA 1NNKA 2GHAA 1ANFA 4F3GA 1SI1A 1MY4A 2X7PA 4OVJA 3O6IA 4LATA 4NF6B 3VVEA 3K1PA 4AB6A 2OWSA 1ZIUA 2D21A 3E13X 3K6UA 3OO9A 4OYVA 1XC1A 3PUXE 4DXCA 1YCJA 3MP1A 2H25A 1MH3A 5I56B 4ND9A 2XXYA 4NE4A 4LONB 3CVGA 1F9BA 1ZLQA 3TKDA 2R6GE 3TYHA 3CI8A 3QYTA 3QUFA 3Q29A 3G7WA 5DVJA 1FQEA 1PC3A 3RTFB 1SDXA 3QSLA 3IO4A 1DTZA 1PB9A 4F18A 1JW5A 3H6UA 4U1ZA 4GFRA 3R6UA 4G77A 2F8DA 4FIMA 1D9VA 3ILUB 1IXGA 3H4ZA 3ONMA 1N04A 1N76A 3PD8A 4R72A 2O7IA 1B46A 3JZJA 3VVFA 3M3FA 4FEBA 3R26A 4AB5A 4PE5B 2ZYKA 5I58A 4OMBA 3U72A 4YKPA 4IO7A 3RT8A 4F22A 3E9XA 1A8EA 3KG2A 3SEVA 1II5A 1GGGA 5I59A 1RKMA 3LSFB 1LCTA 1YPNA 2I58A 1A7LA 3OEKA 3CG1A 4DZ1A 4F3BA 5I59B 2DE2A 4GOTA 2DVZA 1MXUA 4KCDA 1MQJA 1JVXA 3Q28A 3PD9A 1HSEA 3FV1A 1H44A 2ZMBA 3TTLA 2OWTA 3KGCA 4H5GA 5HM4B 5FTHA 4ZZEA 3HO7A 2XX8A 1SD3A 2NVUB 3FXRA 4DE8A 3M8UA 3PMVA 3T9XB 3U94A 3S9LC 1JW1A 3MVYA 2QS2A 1JETA 5DT6A 3PU5A 4RK2A 2V93A 4OTEA 4NF4A 4JBZA 1FQAA 1N3WA 1NNFA 4KI0E 1IXCA 5A5XA 3MVWA 1NNPA 5F1QA 2P0SA 2NOOA 2O69A 3OD7A 4ZS9A 1O63A 4IY6A 1LFIA 4P0GA 1LAFE 2ALUA 3D4CA 1UIVA 1AMFA 1LAXA 2F6PA 3Q27A 1MXZA 1LCFA 3W15C 4MF3A 1RYOA 3HHGA 2UVGA 2H99A 2XXWA 4ONYA 5L9SA 1B1XA 2QSXA 5HBCA 3TEPA 3O29A 3IR1A 3K02A 5I57A 4I62A 2F7CA 3G3IA 1LBCA 3O6GA 2O84X 1Q35A 3LR1A 4THIA 5ITPA 4ESXA 3S9MC 5DEXA 1WODA 5AA1A 2H9BA 4PFTA 2CMOA 3USDA 1P1UA 4XIGQ 3VFJA 4OWDA 3H03A 3C34A 4GL0A 2QS4A 2HQ0A 2DWIA 4E0WA 1IIWA 2Z8FA 2PX1A 4ZEBA 3L6GA 1JVYA 5CBRA 1Y20A 4NF5A 4I9DA 1MDQA 3KFMA 1TXFA 2GH9A 1D4NA 4DDDA 3DM0A 1LLSA 2DWHA 1B3EA 2F35A 4NF5B 1FQFA 4IGRA 3UN6A 4DXBA 5FHOA 5IKBA 4QFLA 3PV0E 4NF8A 3B6QA 1OQHA 4H67A 3A3CA 3KJTA 1QUKA 4HCYA 5JK4A 3A09A 5KCJB 4NF8B 2R9JA 4N6PA 2VOZA 4JWOA 4ELOA 5CI5A 3OO7A 5EYFA 2I49A 3PUZE 3UGWA 1XOCA 4GWOA 3OMBA 1UTBA 5B7DA 4TOZA 1GV8A 4OZ9A 4FE8A 4TQUQ 2UYEA 2UXAA 4GD5A 2B3BA 2DWJA 4U4XA 3FATA 1PB7A 4KYDA 3KN8A 4Q8RA 3OELA 4ZE9A 3O28A 3DELB 4QFOA 3FJGA 3RUMA 2DOJA 2V3TA 3FVNA 3FASA 2YPNA 2HEUA 1Q1KA 2Q2AA 3C35A 3TODA 2F97A 4RA1A 2D3IA 4C1TA 2DQVA 1R9LA 4RK9A 4BDQA 2QMXA 3K1NA 2RCAA 3H6TA 4OEUA 4GQOA 1J1NA 4FORA 1IXIA 5H8QB 3RGYA 4F1VA 2V84A 3G3GA 4GVOA 1SW5A 2DSFA 4KCCA 2XXQA 3C36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YLNA 4PDHA 4NTLA 2XX7A 1UTHB 2ONKE 4QFNA 4HE0A 1IQ7A 1H76A 1IUDA 4P9KA 3LC8A 3FV2A 1B58A 4OFOA 4R2FA 3CG3A 3PPPA 3BIHA 3KN3A 1IXHA 5T3JA 3UA8A 2XXIA 3HV1A 3TZAA 3IOWA 5L8DA 1IITA 1JEUA 3O6HA 4IGTA 2ONRA 5FBPA 1DPEA 3FVGA 1P99A 1M5EA 4O3BA 3VXBA 3MP8A 2F34A 2PCRA 4KYEA 2HZKA 5AA4A 3IAZA 4PDDA 4OENA 1SPIA 2AL5A 3QIMA 3PUVE 1B0LA 1XHYA 5ITOA 3HSTA 3K4UA 4WEDA 5EQ9A 3ECRA 3E3KA 4HTGA 4MNPA 2O68A 5DVIA 2V25A 1SVXB 3IL1B 1H3DA 1SYIA 1FQDA 4G4PA 4GLIA 3LSXA 3HPIA 1Z7ME 4N6KA 3MC2A 4WXJA 1H45A 2HHMA 5LOMA 3OSQA 1B32A 4N15A 1FPKA 2UVIA 4M4GA 1OLCA 1T0KA 5I56A 2CZKA 2QL3A 3OSRA 1O7TA 1MS7A 3MUQA 4YB7A 4LQ2A 5JTYA 4GWWA 4HCWA 1Y9UA 5IZ3B 4IB2A 4Q30B 2CZLA 4Q5TA 5I7IA 1B3FA 3IK6B 4K3FA 4PFWA 3ZS6A 1AOVA 5JTYB 4P1EA 5TPAB 4MMPA 3B6WA 3TTRA 4OVPA 4H65A 1QKBA 2A5SA 3T96B 1MH4A 1B40A 2I0BA 1Y1MA 3CHGA 1FBHA 4KFQA 4IO2A 4O3AA 3GZGA 2P2AA 2PYYA 1NH8A 4XKQA 2Q89A 2Q74A 2XWOA 4MLQA 2WBBA 2I3WA 1NV1A 2REGA 4MFIA 3L6HA 4FAJA 2QFLA 5L9OA 2P1SA 3T0JA 3TCFA 2NXOA 4BDRA 1US4A 3EF7A 3TAJA 3O66A 3EKIA 4E0XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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