5DTBA

Crystal structure of the drosophila cg3822 kair1d ligand binding domain complex with glutamate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
KNKTLVVTTILSNPYCMRKESAIPLSGNDQFEGYAVDLIHEISKSLGFNYKIQLVPDGSYGSLNKLTGEWNGMIRELLEQRADLAIADLTITFEREQAVDFTTPFMNLGVSILYRKGTPIESAEDLAKQTRIKYGALKGGSTAAFFRDSKISTYQRMWSFMESARPSVFTASNGEGVERVAKGKGSYAFLMESTSIEYVTERNCELTQVGGMLDTKSYGIATPPNSPYRTAINSVILKLQEEGKLHILKTKWWKEKRGGGKCR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords CG3822
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 80
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dtbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dtbA02
3KFMA 5HM4B 1WDNA 4QFKA 1EZPA 3D4GA 4LZ8A 3MUQA 1N0TA 5EYFA 3A3UA 2OWSA 4MLVA 1UTBB 1OVTA 2DVCA 4EUOA 5KDTB 2Y7PA 2UVJA 4IY5A 3C9HA 5I57A 2A5TA 3E9XA 3VVEA 4F39A 3HO7A 1LAGE 2XXIA 3N5LA 3FXQA 1SI0A 3MQ9A 3UN6A 4X1BA 4N6PA 4R73A 1B5JA 3FZVA 4FAJA 1GR2A 2O1LA 5ICQA 5HPQA 2QSXA 3PPOA 3G3KA 3O28A 3MC2A 5TPAB 3EQ1A 4XKNA 1T0KA 4PP0A 4FJPA 4G4PA 3ONMA 5I58B 4I8CA 2OK2A 4DDDA 1Y3NA 1J1NA 5IAIA 4IO3A 3LBSA 2O7UA 2G29A 2Q2AA 1R9QA 4U4SA 3TPAA 4AB5A 3HV1A 1MY3A 3FVOA 1FQEA 4F3BA 2ZYOA 2GHBA 3MP6A 2F78A 5EHMA 4YMBA 3SEWA 3C4MA 1H76A 2VD2A 3HPIA 2DWAA 1MPBA 3LUYA 2AIXA 1N76A 3FV2A 5J1DA 5H8FA 1B40A 1PBQA 2Z8FA 1F9BA 3U72A 5L9MA 3K4UA 4LQ5A 2ALUA 2YLNA 4NF8A 5I57B 1LB9A 4XXUA 1QUKA 1PB8A 3JV9A 3K6WA 3VVDA 2O84X 1MY1A 4POXA 1NFTA 1FQBA 1M5FA 4WEPA 4ELRA 2XXUA 1BP5A 2XD3A 4G2ZA 3V5AA 3B6WA 3TCHA 1ANFA 2A5SA 3K6VA 3QUFA 3IJOB 4OQOA 3RY3A 3FVGA 3H6VA 1HSJA 2ANJA 1NL5A 2XX8A 2NUVA 3AXFA 4PFWA 4JWXA 2F7AA 2HAUA 4HS7A 3QXMA 3FJMA 1PDAA 4DIGA 2Y7IA 2R6GE 2DE3A 1LCFA 2XD2A 4PE5B 4YKPA 1FTOA 4KPTA 1XVXA 3Q29A 4ONYA 1OMPA 3C35A 3MWBA 4OERA 1SI1A 3V8XB 1DTZA 1JW1A 5H8QA 2HAVA 4ZE9A 4E0XA 3U1OA 3FVNA 5TP9A 4BDQA 5H8FB 1RYXA 4DXCA 4NF8B 2WKYA 2OCUA 3MP8A 3C34A 3LSFB 2AL4A 3USDA 3FIRA 4PQJA 2DE2A 3M3FA 4QFNA 3MPKA 3HN0A 4OFOA 1IIWA 5CBSA 3K1NA 3V89B 1YAEA 1P1NA 2VHAA 3CFXA 3MVZA 1H45A 3MVWA 1LGBC 2DXYA 2VD3A 2D5WA 4OEUA 1MQIA 3FVKA 4MLQA 3T9UA 3FUZA 4EXLA 5ITPA 2DVZA 3UORA 2H5YA 3G3GA 1B5IA 1ZKBA 1MY2A 3DM0A 1FQCA 2PVUA 3DP8A 2XXTA 3QK6A 2QL3A 4IO2A 3PD8A 3K6UA 3T93B 2M8CA 2PT1A 3IOUA 3CSBA 1LBBA 2ZMBA 1P1OA 5BUUA 3TCFA 4FECA 3SEUA 5TP9B 3RT8A 3H03A 1IXCA 1TXFA 5CBRA 3PMXA 5ELVA 4QFLA 3FXRA 3TZAA 1MQGA 3T9VA 5JEIA 3T22A 5DVIA 2Y7RA 2F97A 3PUYE 3OO8A 1R1NA 3VE1B 3TQWA 4IY6A 2QS2A 2F5XA 3SETA 4IO4A 3N94A 3N6UA 3P7IA 2XXWA 3TCGA 2I0BA 4U22A 2DQVA 2ZNUA 2NOOA 4G68A 3VLWA 1N7WA 2HFBA 3THIA 1H44A 2UVGA 5F1QA 1DPPA 2RCAA 4FIMA 2Z8DA 4JWYA 4GRKA 1NH8A 1RYOA 2YPNA 1LBCA 4OFLA 2X7QA 3CFLA 1SYHA 4QRZA 4IO7A 1EZOA 1MY0A 4OESA 1B46A 2IA4A 2O68A 5H8SA 5ISUA 4RK2A 3SDFA 1SW2A 2DWHA 4YAHX 1II5A 3R7XA 4ZE8A 3H6WA 4P0GA 3O97A 2RKMA 2DWIA 3K1MA 2V25A 1JW4A 1B1XA 4OXVA 1P1WA 3SKPA 2OLBA 1XVYA 2REJA 2ONKE 1DPEA 4OWDA 3ECRA 3TMGA 4U1ZA 1D3KA 1IEJA 4Q8RA 4N13A 3OEKA 2RC7A 4RA1A 1MM6A 3PUXE 3TDJA 4XTCQ 3Q27A 3KZGA 1AOVA 3FATA 2FNCA 3IO4A 3WAFA 1US5A 2NXOA 5TPAA 2F8DA 3TQLA 4TLLB 4EXKA 4FEBA 5I58A 3KN8A 3KG2A 1IUDA 5AA2A 1B7HA 1HSEA 3K00A 2THIA 3K0VA 5FTHA 1UIVA 3OSRA 3C31A 5JTYB 3LC8A 3PMVA 3UGWA 4GF8A 1USYE 4OETA 4IB2A 3B7DA 2E1SA 4F1UA 2F34A 4POWA 1SD3A 3S9EA 4ECFA 3CI8A 5L9OA 1NMUA 4MH5A 3W15C 1D9YA 3LSLA 4LZ5A 1JEVA 2Z8EA 4C0RA 1PB7A 1GTKA 1XS5A 3U94A 3GXAA 2Z23A 4IO6A 1BKAA 3KN7A 1O7TA 1SW5A 4NMYA 3U93A 4O3BA 1N04A 4WXJA 4AQ4A 3M8UA 1A40A 5F7VA 3TODA 4PFYA 3TTLA 4NF6B 1TFDA 4OTEA 1DMBA 3S4UA 4YKKA 1A54A 4I1DA 4HCYA 4GL0A 5DEXA 4DZ1A 2Q8JA 5FTIA 5A5XA 1O63A 3T66A 3BFUA 1IXIA 4P0IA 4ZZAA 1LCTA 5AA2B 3OD7A 4NF5A 5AA3A 5CI5A 3LR1A 3N26A 4KYEA 3ZS6A 2O6AA 1IQ7A 2V93A 3PUZE 3BBRA 3KEIA 1CB6A 3O2AA 2Q2CA 2LAOA 3S9NC 4JSDA 1MY4A 3TYHA 3IB1A 4RNSA 3PUVE 1AL3A 3R6UA 3SEXA 1QKBA 4KCDA 3FJGA 1VFDA 4N07A 3VLUA 1OIBA 4H0WA 3MP1A 2GRVA 1OQGA 4H65A 3CVGA 4FEDA 4H5GA 1ATGA 3B6TA 1QVSA 5K2XA 1IITA 1WODA 2X7PA 2V3TA 3OOAA 5CC2A 1I69A 4ELPA 1P99A 3IB0A 2AL5A 1Q35A 4XKPA 4IGRA 2QS3A 3CRBA 5DEXB 5EHSA 2P0SA 1URDA 1XOCA 1MH4A 2PX1A 3KGCA 2DE4A 3U92A 3MAMA 5A5XB 2XXRA 4DCYA 4ISUA 1R6ZA 2UVIA 4F19A 1SDXA 4YB7A 4M4GA 1QUIA 4JDFA 4NF5B 4KI0E 2O69A 1H3DA 4GVOA 5I84A 1OLAA 3BFTA 3IJXB 3SERA 1MXYA 4NWCA 4GXSB 1Y20A 1SQYA 1Y3PA 3G3JA 4G8MA 1ZMGA 2P1SA 1SBPA 1CE2A 4KYSA 3K6XA 1B5HA 1MG1A 2OWTA 4HW8A 1IXGA 1GV8A 4KYDA 1NNPA 2GHAA 1OVBA 2I48A 2HQ0A 1B4HA 1TWYA 2Q9TA 3EHUA 4NE4A 1MRPA 3CIJA 4EDPA 1VE4A 3QAXA 4P11A 1NNKA 1AMFA 5AA4A 3FJ7A 3ODBA 2H4IA 1B7ZA 1RKMA 4LUBA 2DS9A 1POTA 3SEYA 2I58A 5H8NA 5IKBA 3IB2A 2G93A 5KCJB 2D3IA 3HCQA 1N3WA 3OSQA 1VSOA 1QKAA 4RPOA 5DT6A 3IX1A 1N7XA 1UTHB 4PFTA 2GFEA 3OEMA 3RN8A 1B05A 3KSJA 1DSNA 5CMMA 1B51A 4F18A 1SYIA 3VFJA 4EF2A 4ELOA 4K3FA 4EQ9A 4THIA 3ZKLA 3PPRA 1DOTA 2XHDA 1I6BA 2Y7WA 2XX9A 4IO5A 1IXHA 4LZ7A 1D9VA 1M5CA 2R71A 4I62A 2REGA 4LVQA 4FORA 1S7YA 3ILUB 1N3XA 3OO7A 1OQHA 3RLFE 3TUSA 2V3UA 3MZ1A 4GQOA 2DYXA 3EPEA 2O1MA 3GZGA 4MFIA 4H8IA 4F1YA 3VXBA 3VDFA 4XKRA 3M3LA 5AA4B 4ZEDA 4F29A 4X9TA 1LFHA 4WKMA 5FHOA 1FQDA 3JZJA 1FTLA 3QUJA 2Y84A 4JBZA 1B2HA 3OMBA 5AE4A 3GBBA 4H67A 5H8NB 3L6GA 4U23A 1B1HA 4TOZA 3H7MA 4GLIA 4XKQA 1FTMA 1JNFA 3VLVA 4LQ2A 1H43A 1PEBA 4U4XA 1OLCA 2H98A 2ZYKA 2HXWA 4RY1A 1Q1KA 4EQ7A 3UP9A 3N6TA 3KOTA 5ICTA 1MXVA 1Y1ZA 3H06B 4OVJA 1Y3QA 3UK4A 5JTYA 3UIFA 1BLFA 4LP2B 1NNFA 4Q30B 1B52A 2DP8A 4GIZA 3QSLA 3SEVA 4QSDA 4KHZE 4QFOA 3CG1A 4EQBA 3DP4A 1P1QA 2ZYNA 4HCWA 4QSEA 4LA9A 3HSTA 3PU5A 1B3EA 1EH3A 3S9MC 1PC3A 2F6PA 3HHFA 4R6YA 4PETA 1S50A 1ELJA 2E0SA 1QUJA 3GLBA 3IOWA 4LONB 1Z7NE 4OENA 4YB6A 2I6EA 2QS4A 2RCBA 5H8HA 1FW0A 4U21A 2H9BA 3M3KA 2RF1A 4ZEKA 3EHTA 1B9JA 2F35A 4OYVA 3RUMA 4NF6A 2NVUB 3FD3A 4BDOA 4PFUA 1JEUA 3ILTB 2AYSA 3C33A 4KR5A 2RC8A 2VGQA 3O29A 4R74A 2Z22A 4G8NA 1FTJA 2I4BA 3DELB 3Q28A 1QULA 1YTVA 2I49A 3O6HA 1LSTA 2Y7KA 4O3AA 4E0WA 3MW0A 3I3VA 1A8FA 3H3GA 1XC1A 2HCAA 4YICA 3TFLA 2OJTA 3TAJA 3WAEA 2UVHA 5AA2D 5I2NA 3EHSA 3IORA 1AH5A 4OZ9A 4ZZEA 3OXNA 4GXAA 4F3GA 5K2YA 4F2OA 1A7LA 3KSXA 4NF4A 3KBRA 5FHNA 2XXHA 2IEEA 2XX7A 1LAFE 4H5FA 2UYEA 1NKXA 1GGGA 3E13X 1HSLA 3H6TA 3RTFB 4ESWA 3S9LC 4DE8A 3R26A 4WEDA 3CR9A 1NNTA 1EZ9A 3LSWA 4H6DA 3W9VA 3IR1A 4LATA 2F36A 3G3IA 3PUWE 2QPQA 4JWOA 2X26A 4TLMB 1MDP1 5H8HB 3RNNA 5ITOA 4ND9A 4I9DA 3E4RA 3TTKA 1SW4A 3TELA 3IAZA 3HHGA 4X48A 1A55A 1GVCA 4R72A 5CRYA 4G77A 2OBGA 4DLDA 2ZYMA 2QJEA 3FV1A 1ZTYA 4BLAA 1Y4TA 3E3KA 4U2RA 3CG3A 2PYYA 5HBCA 2NWJA 1LLSA 2XXXA 5CMCA 1DTGA 5FHMA 4F22A 3C36A 1BIYA 2DOJA 2I4CA 3BKIB 4Z7EA 2XXQA 3RPWA 5DTBA 5KZTA 1I6AA 5B70A 5DYHA 4G8HA 4R9GA 5I2NB 5L9SA 3PPNA 2GH9A 2DSFA 1B3HA 1JVXA 4GOTA 4R9FA 4NF4B 3RTWB 3EF7A 1IZ1A 1QW0A 1BTJA 5I56A 1FQFA 2ZNSA 4C1TA 5B7DA 2B65A 4F31B 1LFIA 1YPNA 3OENA 4OEVA 1M5DA 4YZZA 1B3GA 4OMBA 1B58A 3H6UA 3RGYA 3LSXA 3DP6A 3K1PA 1Z7ME 1VFEA 3PMWA 4YMAA 1MQHA 3A3CA 3FXUA 2A5TB 1UIUA 5KCJA 4X1DA 1MPCA 4C1UA 4AB6A 2I3VA 4GL8A 1AIVA 1UTHA 3H4ZA 1B6HA 1YCJA 4RYAA 5M2VA 4F3SA 3O66A 4KCCA 1MDQA 4RJZA 4R75A 2ESNA 1US4A 4NEDA 3Q25A 1Y1MA 1S9TA 1MXWA 2ZNTA 2VP1A 2I0CA 4ELQA 3DLNA 4ESXA 2QS1A 4TQUQ 4YKJA 1B7UA 3IOTA 1JQFA 5I56B 3W9WA 1KWHA 3K01A 1UQWA 4G68C 4HTGA 3EN3A 4U1OA 3JYRA 4KQPA 4BDMA 3KJTA 4NWDA 2D21A 1I6QA 1Y4CA 3VV5A 4IGTA 1URSA 4Q5TA 3OO6A 3L6HA 1B4ZA 4BDLA 2F7CA 1B0LA 2P2AA 1PB9A 3FASA 2PMSA 2V3QA 2KLFA 2QMWA 3MZ9A 1B0HA 2ZXTA 3OELA 4FE8A 2F7BA 3G3FA 3F11A 1ZLQA 1ZBMA 3MPLA 2ONSA 4R2BA 3KJ7A 5DVFA 3RT6B 4H8JA 3VVFA 4MBPA 5I59A 5CMKA 3MVYA 2HZKA 4QHQA 3PV0E 2V84A 2PT2A 3MJNA 1LAHE 1JW5A 2DWJA 1ZIUA 4GWOA 1LB8A 5CM6A 1TFAA 1PBPA 1L5TA 1A99A 2UYFA 3PPQA 1MS7A 1URGA 1M5EA 4UACA 3ZKKA 5JK4A 1B32A 1XT8A 4BDRA 1XHYA 4DXUA 3T9XB 2O51A 1MQDA 1SVXB 4H1XA 5H8QB 2UXAA 1TT1A 2XXPA 3FGSA 1R9LA 1MPDA 1O64A 4ZECA 3MVXA 3PGFA 1Y9UA 4YB5A 1LFGA 3PD9A 4UA8A 4JSOA 3OO9A 1B3LA 3KOSA 4JB7A 2F6GA 3A09A 2O7IA 4GD5A 3B6QA 4KD5A 5AA1A 3K2DA 1MXZA 2VOZA 5LOMA 1WVJA 4XIGQ 2B3FA 4BDNA 3D4CA 2Q88A 1MXXA 1MH3A 3QYTA 1JVYA 5I59B 5I2KA 1POY1 2CZLA 4FATA 2W7YA 4QSCA 3TTRA 4GFRA 2FA7A 5L8DA 2RINA 3TTNA 4DXBA 4ZEBA 2BJJX 3PPPA 3TEPA 1MXUA 3IO6A 3K02A 3O6IA 4DCXA 2B3BA 1N84A 2HZLA 4RK9A 3O9PA 3TKDA 2OZZA 1FQAA 3SESA 2HEUA 3T96B 4OFJA 2XXVA 4ZDMA 1FTKA 3KN3A 1ZJLA 4O3CA 2PBWA 4QFPA 1A8EA 3IOVA 4OHNA 3ZSFA 5BWJA 2ABHA 1JETA 4R6KA 4ZEIA 4YU0A 1B3FA 3G3HA 1M5BA 1UTBA 2QMXA 2XXYA 1MQJA 5KDTA 3T9HB 3I6VA 1QJMA 3S2VA 4R2FA 2FYIA 2Q89A 2H25A 3CSGA 4ZS9A 1SW1A 4JXIA 2QRYA 4M1VA 1FCKA 1NH7A 1EU8A 2YJPA 2CMOA 4RPNA 4F3PA 3TTMA 1D4NA 4EF1A 3MBPA 3U8QA 3CFZA 1ZU0A 2H99A 3G7WA 3C32A 4QF9A 3I5OA 2DXRA 3QIMA 4RXLA 4KFQA 1MM7A 3UA8A 3GBAA 4R6HA 5CMBA 1LAXA 5I2KB 2ONRA 4ZEFA 4L17A 2R9JA 1P1UA 5TU0A 4G68B 4Z0IA 3MZBA 4F2QA 4F1VA 2I3WA 4NTLA 3V83A 3VXCA 4Q0CA 3RQTA 2RC9A 3Q26A 1VR5A 1USYH 5DVJA 3O6GA 4MF3A 4YKIA 3IL1B 3IK6B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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