4F18A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 8.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f18A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f18A01
2Y7IA 3VVEA 5AA3A 4RA1A 1MDP1 4IO6A 2ZNUA 4E0XA 1B46A 4KR5A 1P1OA 2HZLA 3TCGA 2NVUB 3PPRA 3MP6A 2DVZA 3RT6B 4THIA 3FD3A 3C31A 4NMYA 1II5A 3BFUA 4XXUA 3OSRA 4H65A 2UVIA 5ISUA 4OFOA 1GV8A 2Z23A 4NF5B 5KCJB 4H0WA 2I0CA 1ANFA 1EZOA 5I57B 3LSWA 1P1UA 3CFZA 3KJ7A 1QVSA 2HCAA 4H1XA 2V3TA 3VV5A 1HSLA 4ZDMA 2O68A 5FTHA 2PVUA 2HXWA 2F34A 4NEDA 3T9HB 5B7DA 3PUWE 1FTOA 1P1QA 3C35A 1TT1A 3R7XA 4ELRA 3IOTA 4XKPA 4PFTA 4KCCA 1POY1 2QPQA 1B7UA 4UACA 2NXOA 2I3VA 4QHQA 3A3UA 3PD9A 4G4PA 4XIGQ 1NKXA 3MP1A 2I4CA 3O9PA 2O7UA 4Q0CA 4DXBA 4GLIA 4LQ5A 5F7VA 4FE8A 4P0IA 1MY3A 3O6GA 1H3DA 3N26A 4RPOA 3QK6A 5FTIA 3OEMA 2B3FA 4QSDA 2M8CA 4OEUA 2YLNA 1P99A 1LSTA 3Q25A 4R2FA 2VOZA 3CR9A 4IO5A 5CI5A 4GD5A 1BLFA 1M5CA 3KSJA 4G8MA 3Q28A 1Y3PA 3PD8A 5DVFA 1MXUA 3RY3A 2RC8A 4ONYA 1B3FA 4LONB 1R1NA 4O3BA 4IO3A 1LAGE 2F7CA 4POWA 2ZYKA 2ONKE 5JTYA 3QUFA 2OZZA 4MBPA 1I69A 2V25A 4M1VA 2V3QA 4ELOA 1MQDA 3RQTA 1SYIA 3WAFA 3QIMA 4ECFA 1B58A 3Q29A 1M5DA 1LCTA 3G3KA 4G68C 3KFMA 5I59A 2AYSA 2ONRA 2Z8FA 2DE2A 3PMWA 1VFDA 2XX7A 1IXGA 3FJGA 4KYSA 2RINA 2RCBA 2XX8A 4GQOA 4PQJA 1LGBC 1GGGA 3V83A 2OLBA 1B5HA 2FA7A 5HM4B 4EXKA 3S9NC 3G3IA 1B3GA 1PB9A 4NF4B 4F3PA 3FV2A 1R9LA 2D21A 4NF5A 4OYVA 5KCJA 3OENA 2HZKA 4U21A 5BUUA 5I57A 2XXWA 1EZ9A 4R2BA 3H6UA 3WAEA 1SW5A 4F22A 2THIA 3TELA 4F29A 4HW8A 3RNNA 4AQ4A 1TFAA 1O64A 1LBCA 1OQGA 4YKPA 5I58B 1FQCA 5TP9B 2XXXA 3O28A 3MZBA 1Z7NE 4U4SA 2HEUA 3K6WA 4XTCQ 1A8EA 1OMPA 3CG3A 4POXA 4R6KA 5CRYA 3FXQA 3B6WA 3FV1A 3MBPA 4DCYA 3VVDA 4YB6A 1IITA 4H67A 1SI1A 2RKMA 1SW4A 4GWOA 3B7DA 1D9VA 4BDRA 3FXRA 1RYOA 3SEWA 2VD3A 4QRZA 1OIBA 1QKAA 1LB9A 3EPEA 3HHFA 1MDQA 4BDQA 4RK2A 2QS4A 3TFLA 5ITOA 3PPQA 1SW2A 4TLLB 4QFOA 2REJA 4LQ2A 3CIJA 4U4XA 1Y4CA 1GVCA 1HSJA 4PE5B 1O63A 2ZYMA 1DOTA 3TTKA 4YICA 4GF8A 5M2VA 2XXRA 2FNCA 1RKMA 4JWYA 1NNPA 3O6HA 4KI0E 2XXTA 1Y1ZA 3O97A 3CFXA 4LVQA 2P1SA 1B4HA 2O6AA 4RXLA 2LAOA 3KN8A 2ZNTA 5KDTA 3MVWA 4RY1A 4NWDA 3EHTA 3G7WA 4WEPA 4DDDA 3UORA 4F3SA 1MM7A 1AIVA 3SEYA 1L5TA 3TAJA 3GBAA 1JVYA 2UVJA 2ZMBA 1B3LA 3C4MA 4F1UA 1UIVA 3V89B 1IEJA 4OZ9A 4OTEA 4R9GA 3PV0E 4U1ZA 2DWHA 1BKAA 1IXHA 2GHAA 4PFUA 3SEXA 5IAIA 3TZAA 3PPOA 1OLCA 1QUJA 2PX1A 1A40A 4P11A 1IXIA 2XHDA 3OELA 3K6XA 4ELQA 4MLQA 3ILTB 5H8NB 3CG1A 4G68B 4F2QA 4F2OA 3EN3A 2CMOA 2Q9TA 2QS2A 3AXFA 3JYRA 3HPIA 1QUKA 5I58A 2DE3A 4TOZA 3S9LC 2QS3A 1B32A 4KD5A 1A99A 3ONMA 1D3KA 3EF7A 2OWTA 1US5A 4IY6A 3KN7A 3FVGA 4PFYA 4KQPA 4N07A 1OLAA 5H8QB 1LFIA 2A5TA 1FTLA 2R6GE 3DELB 1DTZA 4YU0A 3KBRA 2DXRA 1MM6A 2AL5A 2Y7WA 4FEBA 4DXUA 1MQJA 1URDA 4H6DA 2NUVA 3MAMA 4OXVA 2FYIA 4FIMA 2V93A 3G3GA 3D4GA 3OXNA 1JW4A 1SW1A 2Q89A 3ZSFA 4QSCA 4OERA 4RYAA 1VSOA 5A5XA 3RN8A 2QRYA 3ODBA 4I1DA 5JEIA 1UTBA 1QKBA 4XKNA 4AB6A 1YAEA 2O7IA 1D9YA 1DSNA 3FXUA 3H7MA 3SEVA 4JDFA 1B2HA 2QMWA 1IZ1A 1GTKA 3QXMA 3FVOA 1A7LA 2H4IA 3ZKLA 2OCUA 2GFEA 2DYXA 4KHZE 3V8XB 1FTJA 2H9BA 2R9JA 1B05A 5FHNA 2A5SA 3DLNA 3E13X 1B5IA 1MQIA 3DP8A 2ZYNA 3HHGA 1EZPA 5CBSA 4ND9A 3H6WA 3FGSA 3G3HA 1QUIA 1B5JA 4JSDA 3EHUA 2DP8A 4LUBA 3TTMA 5AA2B 4FECA 4JSOA 4NF8B 1HSEA 4I62A 2W7YA 1XS5A 4KFQA 2UYFA 4GRKA 3MPKA 2XXVA 3GLBA 4N13A 5H8SA 2DSFA 2ALUA 5EHSA 5L8DA 5EHMA 3OO8A 3KEIA 3C34A 3TUSA 1DPPA 3A09A 4Q30B 4EQ9A 1PB7A 4YMAA 3W15C 1N84A 3SKPA 1B40A 4KYEA 1H45A 4DZ1A 4X48A 3CSBA 2E0SA 1PB8A 1H44A 1T0KA 4DIGA 3TTLA 5TU0A 3K0VA 3THIA 1NFTA 1ZLQA 1BIYA 4R74A 5DTBA 1MY1A 5CMBA 3L6GA 3IX1A 3H3GA 2Q2AA 4BDMA 2NWJA 1NH8A 1O7TA 4OVJA 2DWAA 1AH5A 1LBBA 5DEXA 4QFKA 5AA2D 3N94A 4H8IA 5H8HB 3C32A 2XD3A 1ZTYA 2UVHA 3C9HA 4GIZA 4P0GA 1DPEA 1B0HA 3TQWA 3MZ1A 4RNSA 2D5WA 4HCWA 4GVOA 4XKRA 2QMXA 4Z7EA 1OVTA 4F3GA 3OSQA 2XXUA 4R75A 3DP6A 5FHMA 3W9VA 1SI0A 3FUZA 4EUOA 1VE4A 4IB2A 5K2YA 3VXCA 3VLUA 3N6UA 4I8CA 1IQ7A 2O84X 1VR5A 4E0WA 2H98A 3O6IA 3LSXA 1D4NA 1N3WA 4TQUQ 2GHBA 1RYXA 5ICTA 3S9EA 5ITPA 2AIXA 2ZNSA 5AE4A 4LZ8A 3B6QA 2X7PA 2PT2A 4OFLA 3CSGA 5I84A 3BFTA 3GBBA 4KYDA 3DM0A 3UIFA 1FQDA 1UTHB 1IXCA 3PU5A 3IR1A 2I4BA 3H4ZA 1USYE 4OHNA 1LFGA 3G3FA 3OO9A 4RPNA 3RTWB 1MY4A 3RPWA 3PPPA 3IK6B 5ICQA 3R26A 4YAHX 4GL8A 3SDFA 1N04A 4YKKA 2I58A 2PMSA 1EH3A 4H8JA 1LLSA 2IEEA 3U8QA 1AL3A 3USDA 5I2KB 1B1XA 3LC8A 4R6YA 3V5AA 5CMMA 3T9XB 1R9QA 5AA4B 1ZU0A 1S50A 4YB5A 5I56B 1SDXA 2F97A 3MPLA 1GR2A 1PBQA 2ZYOA 3SESA 1H43A 4EXLA 1MXYA 2RF1A 4QFLA 4YB7A 2ESNA 2Q2CA 3QAXA 1MXXA 3TPAA 4R6HA 3RTFB 1WVJA 3JV9A 3VVFA 4JXIA 4BDLA 1B1HA 1JW5A 1MXVA 4ZS9A 1ZKBA 2XXQA 4L17A 4G8NA 1MY2A 1TFDA 2XD2A 1BP5A 2XX9A 1POTA 2B65A 3E4RA 3KOTA 4NE4A 1MH3A 3EHSA 1MRPA 2F5XA 3PUVE 3M8UA 3N5LA 3H6VA 1JW1A 3U92A 1MG1A 4QF9A 3KN3A 5H8FB 3H6TA 2F6GA 3IOUA 2QL3A 3S2VA 2B3BA 3LR1A 2AL4A 4F19A 4NF4A 3SERA 2UVGA 4HCYA 3PMVA 1Y1MA 1NNFA 3U93A 4N6PA 4ESXA 4YKJA 3R6UA 2Z22A 2ONSA 3HCQA 2VD2A 1SYHA 4YZZA 2DWIA 4XKQA 1ELJA 4MF3A 3LBSA 1I6BA 1YCJA 3OO6A 5J1DA 3IO6A 3O2AA 4KPTA 3TQLA 2P2AA 3IORA 2GH9A 5K2XA 2QS1A 1WODA 5CBRA 4X1BA 4C1UA 1ZMGA 4ZZEA 1FW0A 4F39A 4JWXA 3I6VA 5TP9A 4Q8RA 3MVYA 4GXAA 4JB7A 4MLVA 1MQHA 4K3FA 4AB5A 3MJNA 4DE8A 3VLWA 3F11A 3PGFA 3C36A 1ZJLA 4X1DA 2DE4A 5BWJA 1URGA 2WKYA 5FHOA 3Q26A 2Y84A 1EU8A 2HQ0A 1FTKA 3JZJA 3T22A 3Q27A 3KG2A 1MXZA 3E9XA 4WEDA 4OMBA 4QSEA 3HV1A 3PMXA 3ECRA 2Z8DA 4HS7A 4QFPA 3MC2A 3MP8A 1M5EA 4EQ7A 1A54A 1Y4TA 3MZ9A 5AA1A 2RC9A 3RLFE 1FQFA 3IB0A 4ZE9A 1B9JA 2VP1A 4YMBA 4R73A 5HPQA 1OVBA 1N7XA 1FQBA 2ZXTA 1AOVA 3LSFB 4HTGA 5I2NB 5B70A 2BJJX 1LAHE 1PBPA 1JEUA 4C1TA 5I59B 1JEVA 4QFNA 3MUQA 3W9WA 1ATGA 4PP0A 3RUMA 4F3BA 3VFJA 2RC7A 1MPCA 3K01A 1MQGA 5L9SA 1MS7A 1P1WA 2H99A 3MVZA 3K02A 4G8HA 3UA8A 3MQ9A 3H06B 3M3KA 3TODA 3FASA 4BDNA 3T96B 4ZEDA 2X26A 3M3LA 3H03A 3TKDA 3EQ1A 4LP2B 3U94A 1ZIUA 2F8DA 2ANJA 2XXYA 2Q88A 3PUZE 5H8NA 4LATA 4G68A 3RT8A 4F1VA 1Q1KA 1JVXA 1NNKA 4OFJA 5TPAB 2V3UA 1LCFA 3N6TA 4LZ7A 2IA4A 2DXYA 2CZLA 4LZ5A 5DVIA 2Z8EA 1FQAA 4IO4A 1N0TA 2I49A 4EDPA 3GXAA 3IO4A 3TTRA 3CI8A 4PETA 3KZGA 1TXFA 5H8QA 3E3KA 5CMCA 2DWJA 1UIUA 1US4A 4RJZA 3K1PA 4KCDA 3S4UA 4FEDA 1CE2A 3FJMA 1MPDA 3C33A 2F6PA 1XVYA 3OO7A 3UN6A 5LOMA 3T9VA 3KJTA 4ESWA 1BTJA 3O66A 4Z0IA 3K00A 4UA8A 4DXCA 2XXIA 4G77A 4U23A 4EF1A 4M4GA 3ZS6A 1Y20A 1PEBA 2PT1A 3K6VA 2F7AA 3RGYA 1XT8A 3FIRA 4U1OA 2R71A 2H5YA 4ZEFA 1JNFA 4JWOA 5I2NA 1N3XA 4FJPA 1NNTA 1QULA 4U2RA 4F1YA 3FVNA 3L6HA 1JQFA 1P1NA 1YPNA 3HN0A 1LAFE 4NTLA 4YKIA 5KDTB 1IIWA 2DQVA 2I48A 1Y3QA 1WDNA 2DVCA 1NL5A 4ZEKA 3G3JA 3S9MC 1J1NA 3M3FA 4U22A 2Y7PA 4ISUA 2O1MA 2RCAA 2E1SA 2X7QA 5AA2A 2O51A 2PYYA 3KSXA 4NF8A 1Y9UA 4GL0A 3IAZA 5JK4A 4ELPA 3TCHA 4ZEIA 3T93B 3I3VA 1YTVA 1JETA 1KWHA 1Q35A 3IJXB 1URSA 1SQYA 1N7WA 4FORA 1QW0A 2ABHA 2O1LA 3MWBA 3PUXE 4MH5A 1Z7ME 2OBGA 1B7HA 4O3AA 3IL1B 1LFHA 1NMUA 5TPAA 3FATA 3BKIB 2I0BA 1B51A 2F35A 3U72A 3OEKA 4X9TA 3A3CA 3IOWA 4Q5TA 3SEUA 1DMBA 4NF6B 5L9OA 1N76A 1B7ZA 2I3WA 5F1QA 3UGWA 3K1NA 1VFEA 5ELVA 5IKBA 1I6QA 3IOVA 3MW0A 2A5TB 3D4CA 3I5OA 3O29A 4O3CA 4OQOA 3VLVA 4OEVA 2DOJA 1MPBA 2Y7KA 4BDOA 2G93A 3CFLA 2OJTA 4F18A 4JBZA 4GOTA 1B3HA 1PC3A 2PBWA 5H8HA 3VDFA 2O69A 1M5BA 4H5FA 3TDJA 4TLMB 4IO2A 1XOCA 3KOSA 5A5XB 5EYFA 4C0RA 1S9TA 1TWYA 1UTBB 2D3IA 1OQHA 1QJMA 2F78A 3MVXA 4RK9A 1I6AA 2DS9A 1NH7A 1USYH 5KZTA 3IB2A 1DTGA 4GXSB 1F9BA 2NOOA 2XXPA 2QJEA 4IGTA 3OMBA 1MXWA 2QSXA 3B6TA 4LA9A 3IB1A 4IO7A 1UQWA 2VHAA 3QSLA 3CRBA 2GRVA 2OK2A 3K4UA 1ZBMA 2XXHA 3FJ7A 3FVKA 3OOAA 4ZEBA 2VGQA 3QYTA 3CVGA 1B0LA 2G29A 1A55A 3LUYA 4ZE8A 2KLFA 3OD7A 4FATA 5CM6A 3U1OA 1UTHA 4OETA 4ZZAA 1CB6A 1LB8A 2I6EA 3K2DA 4BLAA 3LSLA 3UP9A 1B4ZA 1FTMA 3SETA 3IJOB 2P0SA 4NWCA 4OWDA 1R6ZA 2UXAA 3VXBA 2Q8JA 4PFWA 1XC1A 1MH4A 3ZKKA 4ZECA 4IGRA 1FQEA 1MY0A 1PDAA 3K1MA 3TTNA 3QUJA 1AMFA 2UYEA 1IUDA 3K6UA 3PPNA 5I2KA 4NF6A 3PUYE 3DP4A 5AA4A 3UK4A 1H76A 1M5FA 1B52A 5I56A 1LAXA 1SVXB 2F7BA 4MFIA 3GZGA 2HAUA 1B6HA 4H5GA 2YPNA 5HBCA 2HFBA 2HAVA 3TCFA 5DVJA 4DLDA 4WKMA 5CC2A 4EQBA 4EF2A 4G2ZA 1A8FA 3KGCA 3P7IA 1SD3A 3BBRA 4R9FA 1Y3NA 3VE1B 4FAJA 5DYHA 2V84A 4OESA 5CMKA 3TMGA 5DEXB 4WXJA 4IY5A 5L9MA 5JTYB 2OWSA 4R72A 2Y7RA 3HO7A 2REGA 3HSTA 3FZVA 4OENA 3T66A 3TEPA 3T9UA 3TYHA 4DCXA 1B3EA 1S7YA 1XVXA 2H25A 2YJPA 5DT6A 4GFRA 1XHYA 4I9DA 5H8FA 1SBPA 2F36A 3ILUB 4F31B 1FCKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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