4F18A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 8.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule tags Phosphate-binding protein
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f18A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f18A01
5B70A 3FJ7A 4QFLA 3RUMA 2ZMBA 1QKAA 1VE4A 1SD3A 3TTMA 2AL5A 2R6GE 2QRYA 4M1VA 3DELB 4R9FA 1UIUA 3O29A 4LP2B 2HAVA 1NMUA 5FHNA 2Z22A 4DXCA 4PFWA 3DLNA 3BFTA 3PUXE 1YPNA 2REGA 3CR9A 4Q30B 4ONYA 1P1OA 2DWIA 2RC7A 2XD2A 4G2ZA 1B3FA 1OLAA 2QS4A 2XXRA 2V3QA 3RT6B 3QSLA 3V5AA 5I58B 1FW0A 2Y84A 4ZE9A 4P0GA 1B1HA 2PYYA 1FQDA 1UTHB 2Z8FA 4C1TA 1OLCA 1T0KA 1FQEA 2G93A 2I3VA 5DVFA 5AA2A 4ZE8A 1JQFA 2NUVA 1MDP1 4MH5A 3RPWA 1N76A 3O28A 3OSQA 1M5CA 3KG2A 4BDOA 3IX1A 3G3IA 5EHMA 3T9HB 4GL8A 2F7BA 4EUOA 1MH4A 4THIA 2ZNTA 4PQJA 2Q88A 5AA2B 2H4IA 3PPPA 4F2QA 1GR2A 1MXUA 4RK9A 2PX1A 1LLSA 5ICQA 3RN8A 1LB8A 5I59A 2DOJA 4KHZE 1DPPA 4IGRA 4N13A 3FV1A 4EQ9A 1JVYA 2CMOA 4WKMA 3MW0A 4KYDA 2OWTA 1MH3A 1S7YA 1SDXA 3C33A 3CVGA 3MBPA 4QFPA 5CMBA 2RF1A 5ISUA 4JB7A 2Q8JA 2W7YA 2NVUB 1FCKA 3R26A 2F97A 4G8MA 3PPRA 3CSBA 3K00A 4KFQA 4MLQA 1GV8A 3VVDA 5CM6A 3SESA 3K02A 3FJGA 1J1NA 4F1VA 3A09A 3OO8A 1ZBMA 1B4ZA 1LAHE 1XHYA 2A5TA 3EHSA 3IO4A 3OMBA 3R6UA 1CE2A 2XXQA 3E13X 4H5FA 4R6HA 3JV9A 3SKPA 1PEBA 3U1OA 3VFJA 1MPDA 4R73A 4NF4A 3VLWA 5CC2A 3M3KA 2I4BA 4GWOA 3TTRA 4QSEA 3QUJA 1ATGA 4NMYA 1JETA 4WXJA 1N3WA 4YU0A 1URGA 1AL3A 2IEEA 3KGCA 4KCDA 4U23A 3W15C 2O68A 5I57B 3MP1A 4H6DA 4F3PA 4JBZA 3TCGA 3QUFA 3MZ1A 3OD7A 3G7WA 3IOUA 1HSLA 2ZYKA 4OQOA 2LAOA 1JEVA 3IB1A 1B5JA 2XXPA 4RJZA 4I9DA 1M5BA 3SEUA 4RPNA 3VDFA 2R9JA 4OEVA 4IY5A 5JTYB 1DTGA 4JXIA 4LVQA 3PV0E 1SQYA 1IXCA 1DMBA 4H65A 4YKPA 4OHNA 3G3FA 2D21A 2DS9A 1AIVA 3FIRA 2X26A 1FQBA 3MUQA 4HCWA 3C36A 1ZIUA 4XXUA 2DQVA 2HZKA 1QVSA 3ECRA 4QFOA 3TFLA 4BDNA 4FIMA 4LZ8A 3OXNA 4YB7A 2ANJA 4IGTA 4XIGQ 3WAFA 1SYIA 1NNTA 3CRBA 2F6GA 3H6VA 1JW5A 1RYOA 3KJ7A 4GXSB 4F18A 4F3GA 3G3HA 1GTKA 5A5XA 4R72A 2OLBA 4ZS9A 1FTLA 1BKAA 3Q29A 2DE3A 2DVZA 2V3TA 5L9MA 2D3IA 3FASA 4LZ7A 2XXVA 3N6UA 4H5GA 3MZ9A 1ANFA 2XXIA 4KQPA 1R6ZA 3N94A 4I8CA 5M2VA 3RNNA 1B0HA 3U93A 2A5SA 5H8FA 1P1NA 3O66A 1USYH 2Y7PA 4OYVA 1R1NA 4LATA 4U22A 5H8QA 3UK4A 2YLNA 3RY3A 4DDDA 1NNKA 3QIMA 4OETA 3SEYA 2GH9A 3EPEA 3H6WA 3PMWA 3OO6A 3DP4A 3FXUA 1R9LA 3OEKA 3FZVA 3Q28A 3RT8A 4Z0IA 1NL5A 1MDQA 2OJTA 2DWJA 1US4A 1PBQA 3F11A 3GZGA 5FTIA 4JDFA 3K6VA 3N26A 4DXUA 1JW4A 1LBBA 2UXAA 1L5TA 2I0BA 3RLFE 3M3FA 4OZ9A 2ZXTA 4U21A 3PUZE 2HEUA 3PMXA 4FJPA 3EF7A 3N5LA 4GIZA 4K3FA 1MXWA 2XX9A 1VFDA 4NTLA 2PMSA 4OVJA 4RNSA 4U4SA 3MVZA 4QSDA 3B6TA 1FQAA 5AA3A 4EDPA 3LSXA 3S9EA 4ZZEA 2ZYNA 5AA4B 3K4UA 3S9LC 1BTJA 4F2OA 3C32A 1MXZA 1US5A 3K6UA 5KCJB 1MY1A 1N04A 5JEIA 4N07A 1TT1A 5BUUA 4LONB 1SW1A 2ZYMA 4GD5A 2DP8A 1A8EA 1B4HA 1D4NA 4ND9A 4EF1A 5BWJA 1B1XA 1I6AA 1ZU0A 2Q2CA 4QHQA 5I58A 3KJTA 4EXKA 5HPQA 4YB5A 2QJEA 1ELJA 4IO7A 1SYHA 4POWA 3KOTA 2F5XA 1RYXA 3PUVE 1H3DA 5FTHA 2I6EA 4IO4A 1IZ1A 1H45A 3S2VA 1XVXA 1B7HA 3D4GA 3CG3A 3LSWA 4KYEA 4LA9A 5K2XA 1HSJA 3C34A 3VXCA 5B7DA 1EZPA 1CB6A 1FQFA 1B58A 2F8DA 2GHAA 1M5FA 3MVXA 3O9PA 2D5WA 5TPAA 3K01A 3SEXA 3IAZA 4GLIA 4OTEA 5DYHA 4OESA 3FXQA 3VVEA 4BLAA 3CFLA 5KZTA 3O6GA 3PD8A 3KSJA 1B05A 3K1NA 4X1DA 1HSEA 4TOZA 2I49A 3DP8A 5DTBA 2Q2AA 3IORA 4P0IA 5AA4A 3IB0A 3T93B 1MG1A 4NWDA 4GXAA 1MM7A 4QRZA 4ZEFA 2WKYA 3K1MA 1ZTYA 5I84A 3VV5A 3V89B 3H7MA 1B9JA 2R71A 4IO3A 3SETA 1B5HA 3W9VA 4YMBA 1ZJLA 1BIYA 1A99A 2Z8DA 3KBRA 4PFUA 3ZKKA 3ODBA 4QFKA 1OQHA 2DXRA 1NNPA 3GLBA 2HAUA 4PP0A 4U1OA 5FHOA 3RQTA 1UTBB 3H6TA 5IAIA 2GHBA 3PUYE 4DCYA 4G68A 3RGYA 5CRYA 3BBRA 2RINA 3WAEA 5I56A 4ZDMA 3TUSA 3KFMA 5F7VA 1TXFA 4NF5B 1IXGA 1MS7A 4FAJA 3CFZA 1MQJA 3KZGA 4ELQA 4YMAA 4LZ5A 3IK6B 2RC9A 3QAXA 4F31B 3VLUA 1FTMA 1P1QA 4FEBA 5ITPA 2I0CA 1SW4A 2X7QA 3MAMA 1II5A 3LSFB 2O7IA 4QSCA 5DVIA 4LQ2A 3TQLA 4NE4A 3H4ZA 2QMWA 3VLVA 2QSXA 4IB2A 4XKRA 3SEVA 2F7AA 4IY6A 4DE8A 4C0RA 4G68C 5CI5A 3HPIA 1I6BA 1LFGA 1LAXA 2ALUA 2E1SA 1QULA 1RKMA 3G3JA 1P1UA 3IJXB 1UTBA 1LFIA 2HXWA 4QFNA 4G8NA 4ISUA 1DSNA 2Q89A 4H8JA 5DEXB 1WODA 5EHSA 3C9HA 5JTYA 4RA1A 3CIJA 2UVJA 2F7CA 1AMFA 3A3CA 2DWHA 4ELPA 1Y3PA 5AE4A 2CZLA 2XHDA 1JEUA 2F35A 3KOSA 3U72A 3C4MA 2OCUA 1B40A 1SBPA 1QUIA 4RY1A 4MF3A 1TFDA 4HTGA 5LOMA 3ZS6A 4KYSA 2PBWA 2I3WA 3ZSFA 1IXHA 2DE4A 3MWBA 3FVOA 2THIA 1LAFE 1MQDA 1R9QA 3QXMA 1S9TA 4GRKA 3TMGA 4U2RA 2H99A 2REJA 3UORA 5CBSA 1B6HA 4H67A 4MBPA 3HO7A 3TELA 2UVGA 4X1BA 3PPNA 3IOTA 3LBSA 4MFIA 3FGSA 4NWCA 4PETA 3E3KA 4RPOA 4F22A 4Q8RA 1MY0A 2XXHA 4G4PA 4KD5A 3OOAA 2B65A 5A5XB 4Q0CA 3TYHA 3HCQA 3O97A 3HHGA 1H43A 1A54A 1ZMGA 2QS2A 2QS3A 2XX8A 3T66A 2YPNA 1D9VA 2ONRA 3OENA 2DVCA 3EN3A 1B3LA 1MY4A 2B3FA 1A40A 3GBAA 4JWOA 2P2AA 2O7UA 1OVTA 4X9TA 1Y4CA 1B7ZA 2V3UA 3Q27A 2DYXA 4YZZA 5H8HA 3T9UA 2BJJX 2OZZA 1Q35A 3H3GA 2IA4A 4POXA 3V83A 1M5DA 5DT6A 3N6TA 1FTJA 3THIA 3TKDA 1DPEA 1O63A 3FJMA 1JW1A 4G8HA 3CG1A 2ONSA 4U1ZA 3SDFA 1Z7ME 4DLDA 4R2FA 4YAHX 4OERA 4F19A 1B46A 3T22A 1N84A 3JZJA 3TCFA 1Y3NA 1Y3QA 4NEDA 5HM4B 3S9MC 2KLFA 3KN7A 1XS5A 1MQHA 3B7DA 3C31A 3OSRA 4M4GA 4NF8B 3TTLA 3W9WA 4BDQA 3USDA 2XD3A 4OMBA 5DVJA 1TFAA 2FYIA 1TWYA 4O3BA 2VD3A 3QYTA 4EQ7A 5I2KA 3B6WA 2F6PA 5I57A 3T96B 1B51A 3PD9A 2P0SA 2V93A 1B7UA 2VHAA 3QK6A 1QKBA 3FUZA 5TPAB 4YKKA 4EQBA 3B6QA 1SW2A 2VD2A 2G29A 5H8SA 1NH8A 3T9VA 2O1MA 5K2YA 4NF5A 4R2BA 4O3AA 3SEWA 3U94A 4ELRA 5KDTA 3L6GA 5I2NB 3GXAA 4R6YA 2Z23A 3H6UA 5EYFA 4F3SA 3TODA 1SI1A 2H98A 1USYE 4PFYA 4F29A 1FQCA 3IOVA 2HQ0A 2FNCA 5ELVA 1LCTA 3ILTB 2PT2A 4IO6A 5FHMA 1XC1A 5HBCA 4R6KA 1B5IA 1MY3A 1N0TA 3K2DA 4UA8A 2YJPA 2NOOA 3PGFA 4FE8A 2OK2A 3U8QA 5TU0A 3S9NC 1EZOA 4KCCA 4RXLA 2DXYA 3K6XA 1P1WA 3IO6A 1PC3A 3MPLA 2UYFA 3O2AA 3O6HA 3OO7A 4HCYA 4KR5A 3UN6A 1A7LA 2H25A 1LBCA 1OIBA 3I3VA 5L9SA 4XTCQ 3SERA 4OENA 1D3KA 1B3HA 3FXRA 1MM6A 1Z7NE 4DZ1A 1MRPA 2O6AA 2DWAA 4ZEBA 1AH5A 3I5OA 4GQOA 1ZLQA 3AXFA 4FORA 2XX7A 5AA1A 3EHTA 1MXVA 1YAEA 1M5EA 2I4CA 3TPAA 4ECFA 2HFBA 2AL4A 3DP6A 4G77A 1VR5A 2QMXA 2Y7IA 4L17A 1UQWA 2H5YA 4R75A 4NF4B 4F3BA 1LAGE 5IKBA 1JVXA 4BDRA 3HHFA 1N7WA 4JWXA 3VXBA 1NNFA 4ZZAA 3K0VA 4E0XA 2ABHA 4I62A 2RCAA 4GFRA 1SVXB 4IO5A 1NH7A 2FA7A 3MVYA 5AA2D 1OQGA 3ZKLA 5H8NB 4FEDA 4G68B 1B3EA 3G3GA 4XKPA 3CSGA 3PPOA 4EXLA 5I2KB 3Q25A 4LQ5A 1UIVA 3PPQA 1IQ7A 1WDNA 1I6QA 4N6PA 5ICTA 1N3XA 4GVOA 3ILUB 5JK4A 4XKNA 1PDAA 1EU8A 2O1LA 2DE2A 2ZNUA 4I1DA 2UVHA 4WEDA 1BP5A 2X7PA 1A55A 2XXXA 1H44A 2F36A 4C1UA 4OFLA 2I58A 3IB2A 4RK2A 4UACA 5I56B 1URDA 2O51A 3TTKA 1LCFA 2O84X 1N7XA 3FVGA 3S4UA 3UP9A 2OWSA 1PB8A 2V84A 1QUKA 3MJNA 4P11A 5J1DA 1POTA 3BKIB 1S50A 3FVNA 2UVIA 1B0LA 3FV2A 3M8UA 3OO9A 4GL0A 3KN3A 3ONMA 2F78A 4GOTA 1H76A 5DEXA 2F34A 2UYEA 3D4CA 3FATA 5H8QB 2E0SA 2B3BA 4YKIA 4DIGA 3JYRA 1ZKBA 1O7TA 4JSOA 1OMPA 1PB7A 5CMMA 3CFXA 5H8HB 3HN0A 4F1UA 4IO2A 4NF6B 2XXWA 1P99A 1F9BA 3A3UA 1FTOA 4ZEKA 3FD3A 3OELA 3PMVA 3V8XB 5L9OA 3PUWE 4FECA 4U4XA 1GGGA 1Y9UA 1MQGA 2A5TB 3UGWA 3IL1B 1QW0A 3MPKA 1VFEA 1OVBA 2H9BA 2Y7WA 2I48A 4O3CA 1NFTA 3EQ1A 4RYAA 3Q26A 3DM0A 4OFOA 1MXYA 4OXVA 3IOWA 4JWYA 3UIFA 3TEPA 1EZ9A 1KWHA 3EHUA 4Z7EA 3TZAA 1B2HA 3KEIA 1YTVA 2XXTA 3OEMA 3MP8A 5TP9B 3HV1A 3C35A 2QPQA 3R7XA 1YCJA 2V25A 4H1XA 1SW5A 1IITA 3LR1A 2OBGA 4OWDA 4TLLB 3MP6A 3I6VA 2XXUA 4NF8A 5TP9A 4WEPA 3T9XB 4AQ4A 2ESNA 1QJMA 2P1SA 4H8IA 1B32A 2ZNSA 4YICA 2Q9TA 5CBRA 1LGBC 4AB6A 3GBBA 1SI0A 4E0WA 1A8FA 1QUJA 3MZBA 3MC2A 4QF9A 4ZEIA 5L8DA 3HSTA 1Y1MA 1LSTA 4KI0E 4Q5TA 1URSA 5H8FB 4DCXA 2VOZA 1IEJA 2PVUA 5I2NA 1Y4TA 3H03A 4ELOA 4F39A 4JSDA 2QL3A 3TDJA 2HCAA 2O69A 4EF2A 4FATA 1Q1KA 2GFEA 4LUBA 4R9GA 4XKQA 1JNFA 1XT8A 1MXXA 2GRVA 4ESXA 3RTWB 4HW8A 4NF6A 3O6IA 2AIXA 4PE5B 4R74A 1DTZA 3M3LA 2M8CA 4YB6A 3VVFA 3L6HA 2Y7RA 3PU5A 2RKMA 5F1QA 4TQUQ 3P7IA 4GF8A 5CMCA 3FVKA 2Z8EA 3K1PA 3TTNA 2NXOA 2PT1A 2QS1A 1D9YA 4DXBA 4ESWA 4H0WA 1FTKA 4OEUA 5I59B 2VP1A 1XVYA 3KN8A 1I69A 4MLVA 3TCHA 1EH3A 4F1YA 1WVJA 3CI8A 1BLFA 3E4RA 1POY1 1DOTA 4BDLA 5ITOA 1IIWA 4ZEDA 3LSLA 5KCJA 3G3KA 4X48A 1MPCA 1LFHA 2HZLA 1XOCA 2RC8A 2ONKE 4YKJA 2RCBA 4KPTA 3TAJA 4ZECA 1PBPA 3E9XA 2XXYA 3LUYA 3BFUA 3RTFB 1MY2A 1GVCA 3U92A 1B3GA 4BDMA 2Y7KA 4PFTA 1AOVA 1IUDA 2ZYOA 2VGQA 3K6WA 4TLMB 3TQWA 3IR1A 2NWJA 1VSOA 4OFJA 1LB9A 1Y20A 3IJOB 3KSXA 3MQ9A 4HS7A 5H8NA 3VE1B 4AB5A 1Y1ZA 1UTHA 3UA8A 5CMKA 2AYSA 5KDTB 1B52A 3MVWA 3H06B 1PB9A 1IXIA 1O64A 2DSFA 3LC8A 1MPBA 1NKXA 1MQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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