4F18A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 8.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule tags Phosphate-binding protein
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f18A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f18A01
4OQOA 3N5LA 4NF5B 2I0BA 3U1OA 3TQWA 3UK4A 4ELQA 5I59A 3PUZE 1N84A 2FYIA 4H67A 4GOTA 4LATA 3IB2A 1NFTA 4KD5A 2F8DA 4N13A 2GFEA 4DIGA 1FQDA 1LGBC 2NXOA 4PP0A 4MLQA 2ANJA 2H9BA 3KJ7A 4LZ8A 4QFPA 4TOZA 4ELRA 3W9WA 2UVIA 3CFZA 1P1NA 4NWDA 2P2AA 1EU8A 4G68B 3QK6A 4ND9A 1OLAA 3IK6B 3O97A 5H8NA 1LAHE 4QHQA 3B6TA 1I69A 3KGCA 4NF8A 3CSGA 2UYEA 1JW5A 2HQ0A 2I6EA 1LCTA 1UQWA 3VVDA 2E1SA 4M4GA 3SEVA 3JYRA 3MZBA 1JEVA 1B0LA 3HHFA 2QS1A 3PPQA 1ANFA 2QJEA 3I6VA 1B5IA 4RJZA 3CFLA 1FQBA 4WXJA 3T96B 3TODA 2RF1A 1S7YA 2DWJA 4F39A 1AIVA 1N3XA 5TP9A 3VE1B 3CIJA 3C9HA 3DELB 3QUJA 2D5WA 3RT6B 5H8FA 3LSXA 4RK2A 3PUWE 4F18A 1MY4A 4Z7EA 5KCJA 1P99A 1LAXA 4H65A 5L9OA 2AYSA 3MZ9A 1O7TA 3U94A 1OVBA 2O7IA 3KZGA 1SVXB 3T9VA 4X9TA 3UIFA 3IOUA 3K6VA 4PQJA 4ELOA 3O28A 4HCWA 1MXUA 4OFLA 4NF6A 1ZJLA 1N04A 4LZ5A 1GV8A 3K6UA 3TCHA 2ZYMA 1NL5A 2H98A 3A3CA 2RCAA 5I2KB 3FXRA 4MH5A 2ZMBA 1D3KA 3Q29A 2O69A 4QFLA 4C0RA 4DXUA 4RPOA 4WEDA 3KOTA 3IOWA 3TTMA 5KZTA 3UORA 1MM6A 1ZMGA 1LBCA 3N6UA 1MM7A 2PT2A 3LR1A 2XHDA 3O9PA 4U1ZA 2UVGA 4IY5A 1R9LA 1B7ZA 1NNPA 2OZZA 1B46A 1BKAA 3FD3A 3HSTA 4JSOA 3RN8A 3WAEA 2V3UA 3RTWB 2D3IA 2XXYA 3ZKLA 2RC7A 1SDXA 3DP8A 4RXLA 1B7HA 1LFGA 2I3VA 3R26A 5FHNA 4DCYA 4F1YA 5HPQA 4ZEFA 3TPAA 3V5AA 2VD2A 4DXCA 1ZIUA 3PV0E 2UYFA 1ZLQA 3QAXA 3T22A 3G3FA 2DSFA 2XD2A 4ZE8A 5H8SA 1PC3A 3Q28A 3L6HA 3T66A 3IJXB 4XKRA 3BFTA 5AA2B 1FQEA 2Y7RA 2HFBA 3MW0A 1OIBA 4OFJA 4ZEBA 5ICTA 5HBCA 4F2QA 1B9JA 3CSBA 1FTOA 3EQ1A 3MAMA 1DOTA 2H99A 2HXWA 4M1VA 4RNSA 2NVUB 3OSRA 1O64A 5CBRA 2I4CA 4UA8A 2HZKA 4ZEDA 4QRZA 2IA4A 3DP4A 4EUOA 1Z7NE 3PD8A 1URGA 3U93A 5KDTB 1US5A 4GD5A 2P1SA 3FXQA 4LUBA 2DXRA 3H06B 4GRKA 4N6PA 2ZXTA 2Y84A 3CG3A 2O51A 3IAZA 3K6WA 4POXA 4R6HA 2XX8A 4P0GA 2VGQA 4ZEKA 2PVUA 4O3AA 2OWTA 2Q88A 1UTBA 2XD3A 2PYYA 3LSFB 3RY3A 3GXAA 2B65A 3MP8A 3H6WA 4OEUA 3MVXA 2THIA 4TQUQ 1XVXA 1PEBA 1N0TA 1D9YA 2ONKE 1FQFA 3HN0A 1D9VA 3MVYA 1GVCA 3W15C 4E0WA 4JSDA 1QUIA 2FNCA 4BDLA 1QKAA 1GR2A 5I56B 3VFJA 1N7XA 4POWA 2Y7PA 3FXUA 5FTIA 4GFRA 3TQLA 1L5TA 3QUFA 5H8NB 3KN3A 4C1TA 2ZNUA 3D4CA 4LZ7A 4QFKA 5F7VA 4OERA 2B3BA 3OELA 2A5TB 2W7YA 4H6DA 3SEWA 3S9MC 1TFDA 1GTKA 4BDNA 5EHSA 4R74A 1B3EA 1BP5A 1HSEA 1FTMA 1I6AA 2DOJA 1QUJA 2Q2AA 3CVGA 3IO4A 5LOMA 3FJ7A 4QFOA 3FJMA 2O84X 3FIRA 3Q25A 4U22A 4GXAA 3KFMA 1FW0A 1MPBA 2WKYA 3N94A 4NF4B 3PGFA 3TTNA 2OWSA 5A5XA 2DVCA 5H8HB 1MRPA 1B40A 3C4MA 1Y3NA 2PT1A 3RT8A 1B7UA 4THIA 3T9XB 1LFHA 4QF9A 3K4UA 4JWOA 5CMKA 5DVJA 4YICA 2GRVA 3BFUA 4RA1A 5TP9B 3FUZA 2QL3A 1BIYA 1O63A 2HAVA 3H6UA 4F2OA 1B3LA 1N7WA 2P0SA 4PE5B 1SW1A 4NF6B 1ZU0A 3BBRA 1A7LA 5IAIA 4R73A 1DSNA 3UN6A 4F3BA 3T9HB 1ELJA 1P1QA 3MP6A 5TU0A 1LFIA 1US4A 2XX7A 5TPAB 4Z0IA 5JTYA 4H8JA 1A8EA 2DWIA 3GLBA 2H5YA 3FV2A 1D4NA 3OSQA 3ILTB 3G7WA 4ZECA 2QMXA 5AA1A 4OENA 3V89B 3MQ9A 4O3BA 3OEMA 2FA7A 5K2XA 3KOSA 3SEXA 4F1VA 5I57A 4F31B 1B4ZA 1WDNA 1Z7ME 3K01A 3OO6A 4TLLB 1XT8A 4QSDA 3W9VA 1B52A 3CI8A 4PETA 3FATA 3SDFA 4R9FA 1Y3PA 1KWHA 4NTLA 3FVNA 4FAJA 2F7BA 4GXSB 5I84A 3ZS6A 4JWXA 3LBSA 1VFEA 2R71A 5AE4A 1M5CA 3T93B 1IZ1A 1LAFE 1ZBMA 2QS4A 4I8CA 4X1BA 5CI5A 4X48A 4YB7A 1LB8A 4ZEIA 3E13X 3I5OA 1B1XA 1UTHB 2XXRA 1B4HA 2XXUA 4OXVA 1B0HA 5I2KA 4IO5A 1RYOA 3KEIA 3O6HA 3JZJA 3OO8A 4E0XA 4DCXA 1B3HA 3ODBA 2H25A 1IQ7A 3B7DA 4LA9A 3TMGA 4IO3A 4EXKA 3DLNA 1A99A 5CBSA 3Q26A 4ZDMA 4KFQA 1JW4A 2KLFA 3B6QA 3KJTA 1P1OA 2YLNA 3PU5A 1IIWA 3EHTA 4X1DA 5FTHA 3WAFA 5B70A 1SW2A 4GL8A 5L9SA 2XXTA 3HV1A 4GF8A 4BLAA 4ZE9A 2Y7KA 3BKIB 1Y4TA 3E3KA 3VVEA 2DE4A 1LSTA 1MQJA 2X7QA 4IGRA 4R6YA 4U23A 4RPNA 3GBBA 3OD7A 4F22A 4MF3A 3RQTA 2Q2CA 3G3IA 1M5EA 1FTLA 1II5A 4Q30B 3MJNA 1TXFA 1GGGA 3VXCA 2UVJA 4L17A 2RKMA 3HCQA 3K1NA 1NKXA 3H03A 2I48A 3TAJA 5I58B 3M3FA 1OLCA 3OENA 3ONMA 3PD9A 3G3JA 2UXAA 4MFIA 5EHMA 1P1UA 4G8HA 1S50A 2HCAA 2OCUA 5BUUA 4XKPA 3TTRA 5ITPA 4H5FA 2DWHA 1DPEA 4KYEA 3VXBA 3O2AA 1Y9UA 2HAUA 1N76A 2F78A 2LAOA 4YKJA 1EZOA 2QS3A 1PB8A 2A5SA 2F36A 3A3UA 2DQVA 3G3GA 3MWBA 3S9NC 5ELVA 4IY6A 4YKPA 4OFOA 4TLMB 4N07A 4C1UA 5L8DA 5J1DA 5DEXA 1URDA 4KI0E 4KR5A 4XXUA 5B7DA 4OEVA 3MC2A 1MY1A 4YKKA 3G3HA 1UIVA 1SW4A 1DPPA 4G4PA 2F5XA 2DYXA 1M5FA 1Y4CA 4YU0A 4BDRA 1TWYA 2Q89A 3PMVA 5DT6A 4JXIA 1I6QA 3OO7A 4OVJA 3M3KA 5H8HA 4PFUA 3HPIA 5H8FB 1FTKA 1FCKA 3GBAA 2GHAA 3H3GA 1LB9A 3N26A 5JEIA 4XIGQ 1JETA 2NOOA 1MXVA 1PBPA 2E0SA 3L6GA 2G93A 1MY0A 2VP1A 4RYAA 4ELPA 1QW0A 4ONYA 4F3PA 1TT1A 1A55A 1EZ9A 1SI0A 3CR9A 4FECA 4KYDA 5DVIA 3SEYA 1ZKBA 3H7MA 5AA4B 1ATGA 2YPNA 3KG2A 4DDDA 2RINA 3KN7A 1AH5A 2QS2A 5FHMA 3U72A 1B3FA 1URSA 3IORA 2DE3A 2O1LA 2REJA 3QSLA 5CMBA 3THIA 3H6TA 3IJOB 1VSOA 2GHBA 4GL0A 4Q0CA 3PUXE 3TEPA 2Z8FA 3PUYE 2XXQA 2I58A 4FJPA 4QFNA 4EXLA 4YZZA 1R9QA 4AQ4A 1JVYA 1IITA 2OK2A 3EN3A 1PDAA 3M3LA 3VDFA 4BDMA 2F35A 5AA2D 2B3FA 4OWDA 3JV9A 2F7CA 4OZ9A 1MPCA 1UTBB 2O68A 4R75A 2QSXA 1AL3A 3E4RA 4FE8A 3A09A 1BLFA 3TCGA 4IGTA 4BDOA 3IB0A 4LVQA 1YAEA 1MQDA 3PPPA 4GVOA 5I59B 2YJPA 1NNTA 1T0KA 1WVJA 2PMSA 4BDQA 1Y1MA 4H1XA 1EH3A 3KBRA 3MVWA 5ISUA 1R1NA 1Q1KA 1QVSA 3M8UA 2OLBA 2CZLA 4U4XA 5M2VA 2CMOA 3RTFB 5I58A 1LLSA 1MQIA 3KSXA 2M8CA 2DWAA 1JQFA 3OXNA 4FEBA 1VR5A 1WODA 3HHGA 2ALUA 2X7PA 3PPNA 4H8IA 1EZPA 2NUVA 1B6HA 1B58A 2F6PA 1H76A 2XX9A 3CG1A 3H4ZA 1B5HA 1MDQA 2I3WA 1Q35A 3I3VA 3O29A 3C33A 1YPNA 3FVKA 2G29A 1FQAA 4NF8B 5DYHA 3VLWA 4F3GA 1MH3A 3C32A 5DEXB 4U1OA 2H4IA 3SERA 1UIUA 4F3SA 3CRBA 1JW1A 3EHSA 2XXIA 3E9XA 2REGA 4WEPA 3RNNA 5CRYA 3OMBA 4XKNA 4F29A 1B2HA 4G77A 2R6GE 1XC1A 1M5DA 4G68C 3SKPA 4HCYA 1PB9A 3V83A 1B51A 1SBPA 3TELA 5FHOA 3EHUA 4NF4A 1QUKA 2DE2A 1ZTYA 4H0WA 4MLVA 1NH8A 4KCDA 4R9GA 5EYFA 5H8QA 4DZ1A 1XVYA 3IO6A 1BTJA 1MDP1 3FASA 3IB1A 3T9UA 2ZYOA 4R2BA 5K2YA 2V3TA 3HO7A 4U2RA 1H3DA 2XXPA 4NMYA 4QSCA 4KYSA 1FQCA 2V25A 3K02A 4P11A 4KHZE 3MP1A 3LSWA 3SETA 4OMBA 1YTVA 3ECRA 4IO2A 1P1WA 1POTA 3FJGA 4RY1A 2PX1A 4YMBA 2DS9A 4G8NA 2Z22A 3C36A 1JEUA 1YCJA 4OTEA 3MUQA 3SESA 5I2NB 3B6WA 1NMUA 3PMXA 1Y20A 3O6GA 3P7IA 4DLDA 3KN8A 4OETA 2XXWA 2V84A 3EF7A 1AOVA 1AMFA 4WKMA 3TUSA 2ZYNA 1I6BA 2ZYKA 2ZNTA 3IOVA 4PFTA 4ESWA 2D21A 4YB6A 3SEUA 1MXYA 3OEKA 2V93A 4R72A 1A40A 1IUDA 1MG1A 4RK9A 3UA8A 2OJTA 4IO4A 1OQHA 1SYIA 2GH9A 4HS7A 4KCCA 2DP8A 4HW8A 1B3GA 3ZKKA 2OBGA 3O6IA 4JB7A 3EPEA 4NE4A 1IXCA 1DTZA 3FGSA 3K1MA 3VVFA 2I0CA 2BJJX 3DM0A 4EQ9A 2NWJA 2XXXA 5CM6A 2I4BA 3MZ1A 1VE4A 3QXMA 1J1NA 5KCJB 2O6AA 3GZGA 5DVFA 3PUVE 4YMAA 1UTHA 1MQGA 4U21A 1TFAA 4GQOA 4KPTA 5CC2A 2VD3A 4JDFA 3VV5A 1H43A 1MS7A 5AA4A 3U8QA 1PB7A 3MPKA 3R6UA 4I9DA 2Z8DA 4JWYA 1SYHA 1USYH 1IEJA 3IOTA 3LUYA 1MY3A 4FIMA 4IO7A 5KDTA 4YKIA 3D4GA 3H6VA 3PPOA 4HTGA 4ISUA 4R2FA 3C34A 5DTBA 4QSEA 1MXWA 2QPQA 4F19A 3LC8A 3MBPA 1H45A 2Y7IA 1IXGA 5L9MA 5CMMA 3UGWA 4XKQA 3V8XB 3OO9A 3TCFA 3F11A 1JVXA 1MPDA 2ESNA 1VFDA 2XXHA 4NF5A 1R6ZA 1NNFA 4PFWA 2AL4A 3PMWA 5CMCA 3K0VA 3QIMA 1OVTA 1Y3QA 2ONSA 3ILUB 1QJMA 3TYHA 1QKBA 2HZLA 3OOAA 2QRYA 2R9JA 1SQYA 4FORA 4NEDA 3TFLA 3RUMA 3Q27A 3USDA 4DE8A 1NH7A 2Z23A 2AL5A 1B32A 3S4UA 3O66A 1SW5A 3N6TA 1CE2A 4OESA 4H5GA 5AA3A 1LCFA 1QULA 4IB2A 4P0IA 4ZZEA 4LQ2A 3UP9A 2F7AA 4AB5A 4OYVA 1RKMA 3RGYA 2RC9A 1MY2A 4UACA 4ECFA 2X26A 2ONRA 4PFYA 3S2VA 3FVGA 1SD3A 1IXHA 2V3QA 4LQ5A 5JTYB 5TPAA 2Q8JA 1MH4A 4Q8RA 1B05A 3RPWA 1B1HA 3K00A 3K1PA 4JBZA 1IXIA 1NNKA 4ZS9A 1USYE 4U4SA 2Q9TA 3IX1A 3VLVA 4ESXA 2F6GA 1LBBA 1DTGA 3MVZA 4XTCQ 3FVOA 3KSJA 2RCBA 3C31A 1SI1A 1MQHA 2AIXA 2IEEA 3PPRA 2DXYA 2Y7WA 2ABHA 3TTLA 4YB5A 3TTKA 3RLFE 2ZNSA 2O1MA 1XHYA 2VOZA 1A8FA 4EQ7A 3MPLA 2QMWA 1B5JA 1M5BA 1JNFA 2DVZA 4EDPA 1OMPA 2F34A 3R7XA 2F97A 3TZAA 4R6KA 4ZZAA 4DXBA 1OQGA 2HEUA 3G3KA 4I62A 5AA2A 5HM4B 1FTJA 4Q5TA 1LAGE 4MBPA 3CFXA 1CB6A 1MXXA 1H44A 5ITOA 3ZSFA 4EF1A 4EF2A 5BWJA 4G2ZA 3LSLA 5I56A 3S9EA 3DP6A 3IL1B 4G68A 4GLIA 2Z8EA 3C35A 1N3WA 1XOCA 2UVHA 4IO6A 5F1QA 3TDJA 3TKDA 1PBQA 4LP2B 1Y1ZA 2I49A 5A5XB 4EQBA 1RYXA 4NWCA 3S9LC 1HSLA 1S9TA 1XS5A 1F9BA 2A5TA 2RC8A 2VHAA 3AXFA 4GIZA 4GWOA 4I1DA 4F1UA 5ICQA 3U92A 2XXVA 3VLUA 5I57B 2PBWA 5I2NA 3K2DA 4FEDA 4G8MA 5JK4A 4FATA 1A54A 4O3CA 1POY1 4AB6A 5IKBA 3QYTA 3IR1A 3FV1A 3FZVA 3K6XA 4KQPA 4OHNA 1MXZA 4K3FA 4YAHX 5H8QB 4LONB 1HSJA 2O7UA 1DMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I0BA 3TQWA 3UK4A 1EYIA 4LATA 4GOTA 1FJ9A 2F8DA 4N6KA 1FQDA 2ANJA 4LZ8A 4X8RA 4TOZA 4NWDA 4ND9A 1I69A 3KGCA 3IFAA 4MMPA 2HQ0A 2I6EA 3VVDA 3SEVA 3MZBA 1B0LA 3PPQA 1ANFA 2QJEA 1IMDA 5ESYA 1N3XA 5TP9A 4HE2A 4PDDA 5KCJA 4Z7EA 2FHYA 3U94A 3T9VA 4I40A 2FIXA 1FBPA 4LZ5A 3TCHA 3K6UA 4N81A 4NQ8A 2ZMBA 1MM6A 1LBCA 2PT2A 2FBPA 5I3SA 2OZZA 3WAEA 3RTWB 2D3IA 3ZKLA 2RC7A 1SDXA 3DP8A 2I3VA 2OWZA 5HPQA 4OA4A 3TPAA 3KBZA 4DXCA 1ZIUA 1ZLQA 3QAXA 3T22A 1PC3A 3IJXB 2WBDA 4QBAA 1FQEA 5IZ3B 1O64A 2I4CA 2IA4A 1URGA 3U93A 2DXRA 2ZXTA 4R6HA 2XX8A 2OWTA 4I3EA 3H6WA 4ELOA 4ZEKA 1D9VA 1QUIA 4BDLA 3VFJA 3QUFA 5H8NB 4OVSA 4H6DA 2A5TB 1D9QA 1HSEA 3IO4A 2Q2AA 5LOMA 4QFOA 3Q25A 2O84X 1FW0A 2WKYA 3TTNA 3PGFA 5H8HB 3LV0A 1B40A 2PT1A 4JWOA 4I3YA 3FUZA 4PCDA 1BIYA 2MKZA 1ZU0A 5IAIA 4R73A 1DSNA 1P1QA 3MP6A 1US4A 5JTYA 4PF6A 4H8JA 2DWIA 2H5YA 2XA5A 3ILTB 1FPDA 3MQ9A 4O3BA 3SEXA 5K2XA 1WDNA 2F3BA 3W9VA 3CI8A 4PETA 3FATA 5I84A 4FAJA 4GXSB 3E79A 3LBSA 2QS4A 4X1BA 1KA1A 4ZEIA 4MNCA 1B3HA 1LBZA 4IO3A 4GX6A 4KFQA 3KJTA 2YLNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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