4F18A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 8.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Putative alkaline phosphatase
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f18A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f18A01
3QYTA 1LAHE 2Q8JA 4NEDA 1AIVA 4BDMA 4H8JA 2DE2A 2E1SA 3KG2A 4BLAA 4U22A 4PFUA 4O3BA 4QSCA 2E0SA 5HM4B 4BDOA 2OWSA 1PDAA 3E3KA 3TZAA 1MXVA 1FW0A 4R6HA 2H99A 4C1UA 1Y20A 3IB0A 3VDFA 2ZXTA 4ZEDA 3H6VA 1M5EA 5M2VA 3O97A 1NH8A 3IX1A 1FTLA 1UQWA 1B0HA 4F2OA 2XXVA 4NF6B 3UGWA 1SW5A 3IO4A 3A3UA 1I6BA 5ITOA 5CC2A 4HW8A 3FVGA 3OO9A 1YTVA 1XHYA 1M5DA 4LZ5A 1Q35A 2XXPA 1TT1A 1MXYA 1DMBA 3G3IA 2IEEA 4FEDA 1II5A 4KQPA 3IO6A 3UORA 4DXUA 5I59B 4U2RA 3UIFA 2XD2A 4QSEA 1ZBMA 3ZKLA 3DP8A 2DS9A 5F7VA 2I0BA 5FHNA 1IXGA 4I8CA 3E9XA 4ISUA 2O51A 5I58B 3O28A 2KLFA 3CFXA 5DEXA 1QKAA 1J1NA 4EXLA 4IO3A 4IO6A 1NKXA 1JW4A 4YMBA 4EXKA 5JTYA 5I84A 1Y1ZA 1YCJA 4LP2B 4PETA 3IJOB 2B65A 2NOOA 4JDFA 4RY1A 4OWDA 1IXHA 4RA1A 1XVYA 3UP9A 3KJ7A 2UVIA 1JEVA 1R9QA 3LSLA 2O1LA 1B6HA 3O6IA 4M1VA 1O63A 4WKMA 3MUQA 1XS5A 5H8HA 1SBPA 1Y1MA 2AYSA 4M4GA 5TP9B 3G3HA 3I6VA 3T9HB 2R9JA 3KJTA 1MH3A 3T66A 5B7DA 4ND9A 1LSTA 3H03A 3N94A 3HN0A 3U8QA 4ZECA 4E0XA 4IGRA 4FECA 1S7YA 4L17A 4PQJA 1MS7A 3EF7A 5H8NB 1PBQA 2HZKA 4BDRA 4H1XA 2XXWA 2Z8EA 2F7AA 2H25A 2P1SA 1S9TA 2AIXA 4QFKA 5KDTB 4OTEA 4XKNA 1MY2A 1MY0A 4POXA 1B32A 3KFMA 1MRPA 1AH5A 4G68A 3SKPA 2GH9A 2O7UA 3N6UA 5EHSA 3S9NC 4R75A 5JEIA 2ANJA 3RUMA 2Y7IA 4OYVA 1A99A 3B6QA 3P7IA 3SETA 4GD5A 2I58A 1MPDA 3G3KA 3KGCA 2G29A 3I3VA 1A7LA 3K1PA 5A5XB 2Z8DA 3UN6A 3QK6A 3QSLA 5AA2A 1DPPA 3E4RA 4DXBA 4ZS9A 2B3BA 3IL1B 3PPRA 1BIYA 1UIUA 3D4CA 5CMMA 3R26A 5CM6A 1NNKA 3ODBA 2O68A 4RYAA 2RCBA 1NNPA 1B1XA 3TUSA 3FV1A 1B9JA 4ESXA 4F3GA 3PMXA 1IZ1A 2RKMA 3G3FA 2DXYA 2P2AA 4EQ9A 5I2KA 1MY1A 5F1QA 4AB6A 3ECRA 2ZNSA 4RK2A 2OWTA 4O3CA 1MM6A 3PMWA 4OXVA 3FGSA 2RC7A 1XVXA 3KBRA 2Y7RA 3KEIA 1B2HA 3SDFA 1PB8A 3VVDA 1SW2A 3K01A 1HSJA 4OENA 4F3BA 3M3FA 4FATA 3ILTB 3TTNA 2RC9A 5KZTA 1IQ7A 2Q89A 1H44A 4YB7A 4YKJA 4MF3A 3O9PA 1L5TA 1LGBC 4MLVA 4FE8A 3C9HA 3C35A 4G68C 2O7IA 5I57A 3C33A 2B3FA 4KFQA 2A5SA 1R1NA 3H7MA 1GR2A 1LLSA 5J1DA 1NNFA 3GXAA 3OXNA 4G8NA 2F97A 3TELA 3RQTA 3TFLA 3UK4A 1P1UA 1Q1KA 1B3FA 4NF5A 3VXBA 3BFUA 3MJNA 3N26A 5DVFA 4R9FA 3HCQA 3KOTA 3VE1B 1CE2A 5DTBA 2X7QA 1QUKA 3MP1A 2A5TB 4DCXA 3BBRA 4LUBA 5KCJA 4ECFA 3T9VA 3IR1A 4NMYA 3MZ1A 1A8EA 3B7DA 1EZPA 2NUVA 2I3VA 3V89B 3OSRA 5FHOA 5I56A 3K6XA 3WAEA 3QXMA 1QVSA 3LR1A 4AQ4A 1USYH 4YICA 1MG1A 4NWCA 4F2QA 3H6TA 4X1DA 5BWJA 4KHZE 3DM0A 3WAFA 4ONYA 3SEVA 3RLFE 1UTBB 3TTRA 2X26A 4YB6A 2AL4A 5ISUA 4U23A 4KYSA 4R74A 3C32A 4E0WA 1SI0A 2R71A 5I2NB 3I5OA 2VD3A 3CI8A 2UYFA 1RKMA 4F29A 1OQGA 1MY3A 2DYXA 4U1ZA 4NF6A 4KCDA 4YKPA 2QS1A 4XKRA 4LQ5A 1I6QA 3SEUA 2PVUA 3ONMA 2RINA 4R72A 1LAFE 3KZGA 2WKYA 5TPAA 3EHSA 1DPEA 3UA8A 1LB8A 1MQHA 3RT8A 4I9DA 4H67A 2W7YA 1MDQA 2F35A 1SW1A 3LSWA 4LZ7A 2NXOA 1H45A 5AA3A 3OO7A 3MVXA 1B46A 3MZ9A 1TFDA 1B4ZA 3FUZA 2V93A 1O64A 4H6DA 3IK6B 3USDA 4GOTA 4YZZA 5LOMA 4O3AA 1N84A 1YPNA 2F36A 2HFBA 1FCKA 2Q2AA 2HZLA 2XXQA 1B3HA 4BDNA 5I58A 4YAHX 1Y4CA 1QW0A 3KSJA 3K6VA 2RF1A 2REJA 4F39A 4QF9A 2D21A 3PUXE 4OHNA 5B70A 1B7HA 1IUDA 4PFYA 3RPWA 4ESWA 1MY4A 4GF8A 1B51A 3U94A 4IO4A 2CMOA 3MZBA 3ILUB 4JB7A 1D4NA 1B05A 2HEUA 2OZZA 4GWOA 4QFLA 1R9LA 1EZ9A 3EQ1A 1P1NA 4FJPA 2O6AA 2I48A 5TP9A 4NF4B 1MXZA 1B40A 2P0SA 1FQDA 1JQFA 3CIJA 5L8DA 1SQYA 3CVGA 3TDJA 2DVCA 1GV8A 3O6HA 4IB2A 3OO6A 1LAXA 1LAGE 1FQEA 3FIRA 1TXFA 5KDTA 4GRKA 1BKAA 4JXIA 4Q5TA 2Z22A 4G2ZA 1VR5A 3OD7A 5IKBA 1VFDA 1AOVA 2OK2A 4YU0A 3V8XB 1QJMA 4F22A 2PBWA 3G3JA 3RGYA 4HCYA 2FA7A 4N13A 5HPQA 5AA4B 2XX7A 3H4ZA 4H5FA 4MLQA 4RK9A 3MP8A 5L9SA 4R2FA 3PPNA 2YLNA 4KCCA 5A5XA 1VE4A 1LBBA 3B6TA 2BJJX 3OSQA 2D3IA 4F1UA 1FQFA 1PB9A 3K00A 1N7WA 3O2AA 3IORA 1MXUA 2DWIA 3FVKA 2ESNA 2YPNA 4ELOA 4KI0E 2R6GE 4EDPA 4OEVA 4ZEKA 4ELPA 2Z8FA 1US5A 3TCGA 2QMWA 5AA1A 3C4MA 4Q8RA 4Q0CA 3HHGA 3GBBA 1B58A 4H0WA 4HCWA 3RTWB 2VOZA 4R9GA 3H6WA 3IB2A 2HAUA 2ZYOA 3U93A 1IXIA 3S9LC 4N6PA 1NFTA 3KN3A 3OEKA 4R6YA 4OESA 2QS2A 1N3WA 3RNNA 1R6ZA 3CG1A 1EU8A 2GHBA 4TOZA 4KPTA 5K2YA 3HO7A 4QRZA 4Z7EA 2ZNTA 2UVJA 2Q2CA 2REGA 3RTFB 4TLLB 3SEYA 4ZEFA 3CRBA 5AE4A 5CBSA 4K3FA 1A40A 3T96B 1OQHA 1BLFA 1B3LA 2ZNUA 3OMBA 3CR9A 4U4SA 4XXUA 2ZYNA 2XX9A 4NF8A 1B0LA 3K4UA 1M5BA 1VSOA 3K2DA 3HV1A 3K1MA 1FTMA 4AB5A 2XX8A 5DVJA 3KN7A 1N76A 1FQAA 5H8HB 1DTZA 4KYDA 1Z7ME 4G8HA 2F5XA 4H8IA 4DE8A 3A3CA 4QSDA 3S4UA 1BTJA 4P0GA 4DZ1A 2ONKE 3PD9A 5H8FB 3QAXA 4Z0IA 1N04A 1ZKBA 4F3SA 2OJTA 4RNSA 3PPPA 1SI1A 2QRYA 4YKKA 2QSXA 3FXRA 5ITPA 2PT2A 2QMXA 3Q26A 3K6UA 3W15C 5FTHA 1UTHA 1B5HA 4GXAA 3V5AA 3JZJA 2H4IA 4DCYA 2QPQA 2PMSA 4ZE8A 3GLBA 2O69A 4R2BA 2F34A 4KR5A 1UTBA 3PUZE 3MVWA 4OQOA 5H8QA 2O84X 4OVJA 1OIBA 4N07A 1QULA 3PV0E 2XXIA 4ELRA 2I4CA 4Q30B 5AA2B 3LUYA 1GGGA 3FXQA 3AXFA 5I2NA 2GRVA 1A8FA 3T9UA 4F31B 1MPCA 2Q88A 3ZKKA 1IXCA 1KWHA 2RCAA 1MXWA 3L6HA 1USYE 3PUVE 1LB9A 4U21A 4F1VA 2DWAA 3TAJA 2ONSA 3TCFA 1A54A 4F1YA 3F11A 3CFZA 1DTGA 3LSXA 5ICQA 4RJZA 2THIA 1B5JA 4G77A 3FJGA 4JWOA 1D9VA 1MH4A 3PGFA 4ZZEA 3G7WA 2I0CA 4BDLA 4ZEBA 1SYHA 4PFWA 2IA4A 5CMCA 3JYRA 5H8SA 2UYEA 3M3LA 1RYXA 2O1MA 3KN8A 1Y3QA 2FNCA 2HAVA 1MQJA 3DELB 3MQ9A 1PBPA 3EN3A 4ELQA 3BFTA 1XT8A 4PFTA 5DVIA 1IIWA 4WEDA 4P11A 3PD8A 2XXRA 4WEPA 5JK4A 3BKIB 3K6WA 2QS3A 3KOSA 3D4GA 5ICTA 4JWXA 2ZMBA 3U72A 1POY1 5L9OA 3VVEA 2F78A 1TWYA 2NVUB 1P1OA 3T9XB 3TYHA 2XD3A 4OETA 4X48A 2DE3A 4GL8A 1ZMGA 4X9TA 2XXTA 3FJ7A 1T0KA 4NF4A 2VP1A 3IAZA 4MBPA 3IOUA 3TCHA 2DP8A 4EF2A 3H06B 3DP6A 1JETA 1LCTA 2DWJA 3Q27A 4F3PA 2PYYA 3TTKA 4HTGA 3EPEA 1URGA 5I59A 2Y84A 1NNTA 2I49A 4ZE9A 3O6GA 1WODA 2I6EA 4XKPA 4EQ7A 1IEJA 4FORA 4P0IA 1POTA 4BDQA 3TTLA 3PUYE 4LQ2A 3W9VA 1UIVA 3MP6A 5AA4A 1FQCA 3LSFB 2UVHA 3MC2A 1LFGA 5CI5A 4OMBA 2RC8A 4PE5B 3OOAA 4OFJA 1P99A 4IY6A 3K1NA 3MPLA 3OELA 3HPIA 1EZOA 3EHUA 3TMGA 1JW1A 2F6GA 1LBCA 1I6AA 2ONRA 2LAOA 3GZGA 4QFOA 4C0RA 4XIGQ 4GLIA 2HCAA 4GIZA 3T22A 3FD3A 1Z7NE 3VLVA 4GQOA 4DDDA 4UA8A 4H5GA 5DYHA 1B4HA 4RPNA 1B7UA 2I3WA 5H8NA 5TPAB 4GFRA 4LATA 5IAIA 4DLDA 3O66A 1NL5A 1I69A 3TQWA 5TU0A 1NMUA 2Y7PA 1D9YA 2VGQA 3C31A 1N7XA 2XXXA 4QFPA 2NWJA 3M8UA 3OO8A 3PPQA 3B6WA 1OLCA 2PT1A 3DLNA 2OLBA 1QUJA 4TLMB 3R7XA 4OFOA 3Q29A 3K0VA 4YKIA 4YB5A 1FTKA 2ABHA 2V3QA 3N5LA 4LONB 2V25A 2DSFA 2ZYKA 1MQGA 2Q9TA 1QKBA 2HXWA 4JSOA 1O7TA 1JEUA 3FZVA 4F18A 2M8CA 4XKQA 1ATGA 3O29A 4OZ9A 4X1BA 5EYFA 2Y7KA 4R73A 2I4BA 4JBZA 5DT6A 3U92A 1OLAA 5FTIA 1DSNA 2DWHA 2D5WA 3OEMA 2QS4A 5H8FA 3FATA 2XXUA 1LFIA 4QFNA 1GTKA 2X7PA 1PB7A 4U1OA 2DVZA 4IO5A 4OFLA 1HSLA 1ZU0A 3HHFA 3SESA 1FTJA 1IITA 4EQBA 1YAEA 3G3GA 4F19A 3QUJA 4WXJA 3M3KA 3DP4A 4DIGA 1DOTA 2UVGA 1SDXA 4THIA 3TPAA 3FV2A 4IO7A 3SEWA 4OEUA 5DEXB 3E13X 1BP5A 3H3GA 3W9WA 4PP0A 2DOJA 3IOWA 2V84A 4XTCQ 1AMFA 1ZJLA 5JTYB 2F6PA 4JSDA 1NH7A 3VFJA 2ZYMA 1VFEA 2QJEA 3S9MC 4LA9A 2V3UA 2OBGA 5HBCA 3TTMA 3THIA 2F8DA 3T93B 4GXSB 1SYIA 1JVXA 3OENA 3MPKA 3PMVA 3FXUA 3ZS6A 2VHAA 3K02A 2H98A 1ANFA 2FYIA 3FVOA 5L9MA 2XHDA 4R6KA 2G93A 3RY3A 4FEBA 3TQLA 4UACA 1TFAA 1Y3PA 4OERA 1M5CA 1MM7A 3LBSA 3VLWA 1MPBA 1WVJA 1MDP1 2UXAA 1H76A 2A5TA 4G4PA 1SD3A 1OMPA 1US4A 4LZ8A 4QHQA 1M5FA 1ZTYA 3LC8A 2PX1A 4RPOA 1Y4TA 3N6TA 5CRYA 4G68B 4KYEA 4IGTA 4IY5A 2Z23A 4EF1A 3R6UA 4YMAA 2DQVA 3U1OA 1EH3A 3VLUA 3MWBA 4POWA 3EHTA 4EUOA 3C34A 2YJPA 5FHMA 3A09A 2GHAA 2XXHA 4G8MA 3VV5A 2QL3A 4GVOA 1SVXB 4MH5A 3MBPA 3MW0A 3MVYA 1XOCA 3VXCA 3SERA 3QIMA 4NF8B 5CMBA 1FQBA 4IO2A 4HS7A 2HQ0A 1B3EA 3CG3A 3Q25A 5I2KB 1JW5A 3TEPA 3Q28A 1LFHA 3IOVA 5CBRA 4KD5A 1H43A 3ZSFA 1URDA 1LCFA 3MAMA 1JVYA 3TODA 1AL3A 1FTOA 1HSEA 4C1TA 4I62A 2H5YA 2DXRA 1MQIA 4U4XA 4ZEIA 1P1QA 4NTLA 3QUFA 5EHMA 5AA2D 3SEXA 1Y9UA 3IOTA 1B7ZA 1JNFA 1CB6A 3HSTA 3CSBA 1RYOA 3JV9A 1ELJA 1B52A 4RXLA 1ZIUA 1UTHB 3FJMA 3VVFA 1P1WA 3H6UA 5CMKA 3KSXA 1N0TA 4I1DA 1PC3A 1OVTA 1GVCA 1SW4A 4JWYA 5H8QB 3S9EA 4NE4A 1MQDA 1F9BA 3FASA 1QUIA 1WDNA 4TQUQ 3IJXB 4DXCA 3C36A 3MVZA 5I57B 2OCUA 5BUUA 1Y3NA 2XXYA 4FIMA 4H65A 2Y7WA 1B3GA 1B5IA 2VD2A 3GBAA 3S2VA 4ZZAA 3PUWE 2F7BA 1A55A 2DE4A 2H9BA 4MFIA 4NF5B 3IB1A 3CFLA 3PU5A 4NWDA 4GL0A 1URSA 2AL5A 4FAJA 3FVNA 2V3TA 3CSGA 2ALUA 1PEBA 3RT6B 4LVQA 1ZLQA 3RN8A 5ELVA 1N3XA 1XC1A 1D3KA 3V83A 1S50A 5KCJB 2GFEA 3PPOA 3L6GA 1H3DA 2CZLA 5K2XA 4ZDMA 3TKDA 5I56B 1MXXA 2F7CA 1B1HA 1OVBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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