4F18A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 8.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
b'MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Putative alkaline phosphatase
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f18A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f18A01
2PYYA 2REGA 5EHSA 3MPLA 4K3FA 2UVHA 5I57A 2XXXA 1FQAA 1FTOA 1S9TA 3FJ7A 1A55A 5ELVA 2UYEA 3IR1A 4ZZAA 3TTNA 1GTKA 2ANJA 1SW5A 2I48A 3Q29A 3QIMA 1MXWA 3EPEA 1ZMGA 5TP9A 3IO4A 4EUOA 4WEDA 3V8XB 4I8CA 3R26A 3H6UA 4NF4B 3PUYE 3KSXA 1N84A 4R75A 2HEUA 3TTRA 4P0GA 5BUUA 2R71A 3V83A 5TPAB 4QFLA 4EXLA 4R2BA 2QS3A 5L9SA 1N7XA 3U1OA 2NUVA 4N13A 3IB1A 2I6EA 1S50A 1JEVA 3B7DA 4RA1A 4OENA 2QS2A 5KCJB 1CE2A 4QFPA 1O64A 1I6BA 2AYSA 1M5BA 1Z7NE 4F1VA 2X7QA 2F5XA 3PPOA 4G68B 2GH9A 3LR1A 3LSXA 2Q89A 1TFDA 1B9JA 3KJTA 1VFDA 2VD2A 1OVTA 2OWSA 1N3WA 3DM0A 5TU0A 2RC8A 3VV5A 4OWDA 5AA2D 3FD3A 4F22A 3U92A 5I2KB 1A7LA 1B3EA 4U2RA 1TWYA 2ZYOA 2V84A 4POXA 4QFOA 1MPBA 4ZZEA 4EF1A 2CZLA 4DE8A 3OELA 3DP4A 3GBAA 3KFMA 5CMMA 4R2FA 3C33A 3TQLA 3CG1A 2REJA 1QUJA 1ZTYA 1T0KA 2IEEA 1Y3QA 3U8QA 3VFJA 4UACA 2F36A 2RF1A 3SEUA 4I1DA 1WVJA 4FATA 1UTBA 2XXTA 1PB8A 1O7TA 2XX7A 1MY0A 4OVJA 3BFUA 2QMXA 3A3UA 2M8CA 3ZSFA 4MFIA 1II5A 1GV8A 5JK4A 4IY5A 1WODA 3TUSA 5F7VA 1I6AA 4R74A 4NF8A 3T66A 4WKMA 3FATA 1NNPA 2V3QA 1M5DA 4F18A 4F3PA 1UIUA 1Y3NA 3G3KA 1Q1KA 1POY1 2F7AA 4JWYA 3K6XA 1ZU0A 4JSOA 4Q5TA 1Z7ME 3T22A 4F2QA 3ZS6A 4Q30B 1JNFA 4FAJA 1B3HA 3HCQA 4ZEDA 1SQYA 3L6HA 2Z8FA 2ONSA 1JVYA 4NMYA 2DXYA 5A5XA 3OO8A 3PUVE 4AB5A 4QF9A 3IJOB 3TODA 1R1NA 4Z7EA 1IQ7A 1HSLA 4EXKA 4OQOA 3DELB 4YMBA 2H99A 1OLAA 1B5HA 1AOVA 2O51A 3D4CA 2V3TA 1VE4A 2VD3A 2HZKA 5H8NB 4NF4A 2FA7A 3K01A 3MP1A 3CSGA 3H6VA 1IXCA 4WXJA 3KN8A 4OZ9A 4LZ5A 4YKIA 1H43A 2F35A 1FW0A 1FCKA 3MZBA 4IO2A 3MWBA 1WDNA 3OEKA 5AA4B 3MQ9A 3VXBA 2AL5A 1MXZA 4JWXA 2Y7KA 2QS4A 3GBBA 1N04A 3OOAA 4GIZA 2XX9A 4NF6B 2F7CA 4BDMA 3EHUA 3RT6B 5DVIA 3FXUA 3JZJA 1B46A 1B52A 2DWJA 1M5FA 4WEPA 4FIMA 5CC2A 1MXXA 4F1UA 5AA2B 4E0XA 4GQOA 5H8QB 3S2VA 2F34A 5HM4B 4DCYA 1JW1A 2DYXA 1FTLA 5JEIA 4LP2B 3VE1B 3MBPA 3PMVA 4KYEA 4GF8A 4P11A 1LAFE 1OMPA 1B2HA 2ZXTA 4RJZA 1AL3A 5KDTA 1P1UA 1DMBA 1VFEA 2Y7PA 4NEDA 4FEDA 4KQPA 3DP6A 3EHSA 1QUKA 5I56A 2Z8DA 2F97A 2G93A 3AXFA 3KG2A 2CMOA 3RPWA 3ONMA 3C36A 3BBRA 1DPEA 2OBGA 3SKPA 1NMUA 3OEMA 4XKRA 4IO5A 5DTBA 4PFUA 3K1NA 4QRZA 4F3GA 5CI5A 4R72A 2XXWA 4PFYA 1FTJA 1IUDA 3MVXA 1IZ1A 4ELOA 4F29A 5EHMA 4IGTA 1FQBA 2HXWA 4LVQA 4IO4A 1GGGA 3K0VA 4U1ZA 3G3GA 1NNTA 2KLFA 1B5JA 2DE3A 3N5LA 1A8EA 4GFRA 4U4SA 1LBCA 4EQ9A 1JETA 1RYOA 1ANFA 2O84X 1N76A 3RT8A 1MY3A 3KJ7A 3QUFA 4QSCA 2I4BA 5I84A 4XIGQ 3BFTA 3H6WA 1DSNA 1NH7A 1UQWA 3U93A 5KZTA 4ZDMA 1SYHA 5I59A 3TMGA 2NVUB 2XXVA 3VVFA 1MQDA 2I49A 3HHFA 2P2AA 1F9BA 4RYAA 2ZYNA 2O7IA 4X1DA 4O3AA 3VLUA 1JEUA 1NH8A 1O63A 5I2NA 5H8NA 4N07A 3THIA 3W15C 3LUYA 1H3DA 3TELA 2ONRA 4YZZA 1MM7A 2Z23A 1GVCA 3OSRA 4ELQA 5AA4A 2E0SA 5CMKA 2RCBA 3N6TA 5H8HB 4QSDA 4G8HA 2OK2A 3MZ9A 1MXUA 4U4XA 2OCUA 3H4ZA 4UA8A 3M3FA 2Q2CA 2O68A 5DVJA 2Y7RA 4BDQA 4OMBA 4BDOA 4DZ1A 3UN6A 5JTYB 4BLAA 3KSJA 4ECFA 4LATA 4F3SA 1PDAA 3PUWE 4NE4A 2XXIA 1S7YA 3VDFA 1P1WA 1MQJA 5M2VA 1XVXA 2XXYA 2RINA 4KCCA 3RGYA 3HHGA 4U22A 2DXRA 3MC2A 3R7XA 4YMAA 5B70A 3KBRA 1EH3A 4NF5B 3CIJA 3O66A 2P1SA 4H5FA 4RY1A 4YKPA 1B6HA 1USYH 3OD7A 4OETA 1DPPA 1MPDA 3QK6A 2PX1A 2DP8A 3QYTA 2GFEA 2DE2A 4ZE8A 2F8DA 1R6ZA 3Q27A 1OQGA 4NWDA 4N6PA 4RPNA 5FHNA 3UIFA 1XHYA 2OWTA 1B7UA 1TFAA 1SVXB 1QUIA 3M3KA 1FQDA 3S4UA 2Z22A 4G8MA 4AQ4A 2Y84A 3R6UA 3FVNA 3TZAA 3BKIB 4MF3A 3QUJA 4HTGA 1USYE 2THIA 3MVWA 2G29A 4PFWA 1RKMA 1US4A 2DWIA 4HCWA 4G8NA 3LSFB 4R6HA 1QJMA 4IGRA 3CFXA 3S9EA 1IITA 4I9DA 1R9QA 1MXYA 3EHTA 4ONYA 1R9LA 4OEVA 1MQGA 5HBCA 2RC9A 4Q0CA 3CR9A 5J1DA 1MDQA 3IOTA 3T96B 1EU8A 3RLFE 3UA8A 2NXOA 3QSLA 3VVEA 1URDA 2IA4A 2X26A 1PEBA 2A5SA 2VHAA 3G3FA 2DVCA 4ISUA 1M5CA 3M3LA 3Q26A 4DLDA 1EZPA 1ZJLA 4KHZE 1JQFA 2X7PA 4IB2A 4MH5A 1LCFA 1N0TA 2V93A 1NKXA 2GRVA 2NOOA 3T9HB 4I62A 3K6UA 5K2XA 4GXSB 2PT2A 2OJTA 5CM6A 4OFOA 1SYIA 1LGBC 4GWOA 4PP0A 3PUXE 1QKBA 3C4MA 3HN0A 2VOZA 5L8DA 4M1VA 1FQEA 2F7BA 5H8HA 3T9UA 4U1OA 4EDPA 2DS9A 2B3FA 4ELPA 4O3BA 1TT1A 3A3CA 4LONB 3SEWA 3IB2A 3LC8A 3TAJA 4YB7A 2D5WA 3MPKA 4E0WA 5H8SA 1YTVA 3PPPA 2A5TB 3PV0E 3HO7A 4XXUA 1LAHE 2XXPA 2HZLA 1LFGA 3RN8A 5JTYA 3SERA 5FHMA 4U21A 2YLNA 1VSOA 1AH5A 3O6IA 2ESNA 1NL5A 3O9PA 1D9YA 4PFTA 5B7DA 5TPAA 1Y4TA 3N6UA 2D21A 3ILUB 3Q28A 1MY4A 3PUZE 3MZ1A 4L17A 1ZLQA 4QFNA 4HS7A 1M5EA 5DEXB 4LZ7A 2I0BA 2ZNTA 3C32A 3K1PA 3E3KA 3G7WA 1D3KA 3M8UA 3RQTA 1ATGA 5KCJA 3IOVA 4G68C 1MH3A 4G2ZA 5I57B 3CSBA 1IXGA 4DIGA 1SI0A 4KYDA 1BP5A 4G68A 4R73A 4BDRA 1MS7A 2GHAA 1DOTA 1Y20A 3UP9A 4EQBA 3IOWA 4ZEIA 2VGQA 4BDLA 5ICQA 1B7ZA 4JB7A 1LBBA 4GD5A 3H03A 4QSEA 3SDFA 5I2KA 1PBQA 2O7UA 4G4PA 3E9XA 3KGCA 1DTGA 3DLNA 4YKJA 1HSEA 1MQIA 4DXUA 1LFIA 1GR2A 3K6WA 3PPRA 5FHOA 3O6GA 5I58B 1URGA 2W7YA 1FQFA 3KZGA 1URSA 1AMFA 2XD3A 1BLFA 4KI0E 1B4ZA 1YCJA 4H67A 4XKQA 4C0RA 4PQJA 3TTLA 5EYFA 4KR5A 4AB6A 2QMWA 1LCTA 1Y9UA 2GHBA 3KN3A 4ZEBA 3H7MA 4C1UA 1A8FA 1SW4A 4BDNA 2B3BA 1B1XA 2O69A 3KOSA 3CFZA 5HPQA 1P1OA 1H45A 3FXRA 3QAXA 3VLWA 4FJPA 3UGWA 2FNCA 1ZIUA 4P0IA 4QHQA 5ITPA 1OIBA 2XXQA 4JXIA 1LLSA 2PBWA 1ZKBA 2BJJX 5BWJA 3K00A 3I3VA 3DP8A 3O29A 4H1XA 1MG1A 5CBSA 4ESXA 5AE4A 1MY1A 2R6GE 1N7WA 4LQ2A 3H6TA 2YJPA 1MQHA 5F1QA 3PPNA 1SW1A 4MLVA 5CMBA 1Y4CA 1MXVA 3D4GA 3MAMA 3G3JA 3T9XB 2O6AA 1PB7A 3B6WA 1UTBB 4EQ7A 1PBPA 4X1BA 4RPOA 4DXBA 4KYSA 3C34A 3B6QA 3QXMA 1VR5A 4C1TA 3T93B 5CBRA 4F31B 4R9GA 1XC1A 4OESA 5DYHA 3KEIA 4F19A 2ONKE 1B51A 3MP6A 4H6DA 1XS5A 5DVFA 2ZNUA 3H3GA 1D9VA 4QFKA 2H9BA 4Z0IA 1H44A 3FIRA 1SBPA 3HPIA 4F39A 4G77A 2HAVA 2VP1A 2FYIA 1SI1A 3TDJA 2LAOA 4LQ5A 1B3FA 4M4GA 3MP8A 4NF6A 3IL1B 5ISUA 2XXHA 2ZMBA 4XKNA 4RXLA 5A5XB 2Q88A 2Q2AA 1POTA 3P7IA 4YAHX 1FTKA 1JW5A 3RY3A 3USDA 1IXHA 5CMCA 1IEJA 3G3HA 1ZBMA 2V25A 5AA2A 3FVGA 5H8QA 1BIYA 5H8FB 3LSLA 1I6QA 3RNNA 4R6YA 3VLVA 3ODBA 2Q9TA 4JSDA 3KOTA 3C35A 1FTMA 3W9VA 3TYHA 5FTHA 1JW4A 3FVOA 1B4HA 3G3IA 1IIWA 2QRYA 3TTMA 3FV1A 4KFQA 2B65A 4KD5A 1MY2A 3FJGA 3F11A 1D4NA 1UTHB 5I58A 1ELJA 1B7HA 4JBZA 2I0CA 1LB9A 3ECRA 1BKAA 2QSXA 3WAEA 1L5TA 2Y7IA 4HW8A 4GXAA 3GXAA 3TFLA 1CB6A 2ALUA 1LSTA 3SETA 2XXRA 3TTKA 4YU0A 4PETA 3C31A 3L6GA 1Y1ZA 2QS1A 1SD3A 4H0WA 2F6PA 2QPQA 4IO7A 2H25A 2UXAA 1NNKA 3IK6B 3OENA 3TEPA 3SEXA 3O97A 2NWJA 1LAGE 2DE4A 4DXCA 2I58A 3A09A 2XHDA 3MJNA 2V3UA 3OO6A 4F3BA 2HQ0A 4FORA 1AIVA 2H98A 2Q8JA 1OVBA 2PMSA 3N94A 3IB0A 5KDTB 2DVZA 1LAXA 2DOJA 1A54A 2WKYA 2DSFA 3CVGA 5I56B 3N26A 2HCAA 1Y3PA 3MVYA 4THIA 3OO7A 3TCFA 3OSQA 3S9LC 1UIVA 4MLQA 1SDXA 3LSWA 3RUMA 1B3GA 1HSJA 2DWAA 3UORA 4EF2A 2ZYMA 3PPQA 3JYRA 2F6GA 2HFBA 4GLIA 5CRYA 5IKBA 3CFLA 3SEVA 4H8IA 3VVDA 1OLCA 1TXFA 2O1MA 3K1MA 4DCXA 4LA9A 2ABHA 4FEBA 3HV1A 4ZS9A 2UYFA 4NTLA 1EZ9A 1NFTA 2HAUA 5K2YA 3I5OA 1MDP1 3FGSA 1QULA 1I69A 1SW2A 2QL3A 3GZGA 2RKMA 4LUBA 1FQCA 3PD9A 4FECA 2P0SA 4RK9A 2UVIA 3K4UA 5I59B 2DQVA 3IJXB 1BTJA 4IO3A 3TKDA 4ELRA 1YAEA 1B40A 2UVJA 1Q35A 1LB8A 5DT6A 3TPAA 4OTEA 4PE5B 1A99A 2PT1A 2YPNA 4YICA 2I4CA 4JDFA 5H8FA 3VXCA 2RCAA 1MRPA 3CI8A 4F1YA 4GL0A 1IXIA 1MM6A 3CRBA 5I2NB 1B3LA 3FUZA 2QJEA 3PD8A 3K6VA 3V5AA 2OLBA 5IAIA 1B0LA 4TOZA 4Q8RA 4NF5A 4ND9A 4R9FA 3GLBA 2XD2A 4OERA 3K2DA 4XTCQ 3TQWA 3MUQA 4O3CA 1UTHA 2Y7WA 2ZNSA 4IY6A 1P99A 4ZEKA 3RTFB 2PVUA 1RYXA 4ZE9A 5ICTA 5LOMA 4OXVA 1PC3A 4RNSA 2ZYKA 1US5A 3SESA 3ZKKA 4FE8A 1N3XA 5TP9B 3U94A 1QKAA 3KN7A 1PB9A 2I3VA 4GVOA 3CG3A 1MPCA 3TCHA 4H8JA 4LZ8A 2H4IA 3ILTB 1YPNA 2H5YA 3FV2A 3B6TA 2XX8A 4R6KA 3I6VA 1B0HA 1A40A 4KPTA 4H65A 3C9HA 3EQ1A 4U23A 2R9JA 3OO9A 4TQUQ 1J1NA 4ZECA 1QVSA 4MBPA 1B32A 3S9NC 1XOCA 3OMBA 3PGFA 3T9VA 1B5IA 1B05A 3O6HA 4JWOA 1DTZA 3E4RA 1KWHA 1OQHA 1MH4A 3IAZA 3O28A 1XVYA 4OEUA 3EF7A 1NNFA 2O1LA 4YKKA 4GOTA 3IO6A 2D3IA 2Z8EA 4YB5A 3PMXA 3H06B 2I3WA 4YB6A 4DDDA 3U72A 4IO6A 1P1QA 3JV9A 1Y1MA 4POWA 1EZOA 3UK4A 3IOUA 4GL8A 2DWHA 3IX1A 3MVZA 1B1HA 4OYVA 3MW0A 4HCYA 2OZZA 4OFJA 3FJMA 3PMWA 5AA1A 3FXQA 4OHNA 1JVXA 4TLLB 2AL4A 5AA3A 1LFHA 1QW0A 1XT8A 2RC7A 5L9MA 3ZKLA 2E1SA 3FZVA 3IORA 4F2OA 2F78A 3V89B 4ESWA 4X9TA 2A5TA 4TLMB 5L9OA 3PU5A 3O2AA 4H5GA 4KCDA 4NF8B 3S9MC 4NWCA 3Q25A 3E13X 1H76A 4XKPA 3WAFA 3HSTA 1P1NA 1B58A 3EN3A 3RTWB 3LBSA 4ZEFA 5ITOA 4RK2A 3K02A 5FTIA 3W9WA 4X48A 4GRKA 3SEYA 4OFLA 5DEXA 2XXUA 3OXNA 2UVGA 3FASA 3FVKA 2AIXA 3TCGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PYYA 1NUXA 4XEQA 2REGA 5EHSA 3MPLA 4K3FA 2UVHA 5I57A 2XXXA 1FQAA 1FTOA 1S9TA 3FJ7A 1LBYA 1A55A 5ELVA 2UYEA 3IR1A 4ZZAA 1BK4A 3TTNA 1GTKA 2ANJA 1SW5A 2CEYA 2I48A 3EKIA 3Q29A 1MXWA 3QIMA 4OVPA 1FPDA 3EPEA 1ZMGA 5TP9A 2VT5A 3IO4A 4EUOA 4WEDA 3V8XB 4I8CA 3R26A 3H6UA 4NF4B 3PUYE 3KSXA 1N84A 4R75A 2HEUA 3TTRA 3A29A 4P0GA 5BUUA 2R71A 3V83A 5TPAB 4QFLA 4EXLA 4JVIA 4R2BA 4NAPA 2QS3A 5L9SA 1N7XA 3U1OA 5I7IA 3B50A 2NUVA 4N13A 4PBQA 3IB1A 2I6EA 1S50A 1JEVA 3B7DA 3T0JA 4RA1A 3IFCA 4OENA 2QS2A 5KCJB 1CE2A 4QFPA 5EYGA 1O64A 1I6BA 2AYSA 1M5BA 1Z7NE 2WBDA 4F1VA 2X7QA 2F5XA 3PPOA 4G68B 2GH9A 3LR1A 3LSXA 2Q89A 4OVTA 1TFDA 1B9JA 3KJTA 1VFDA 2VD2A 1OVTA 4GWSA 2OWSA 1N3WA 3DM0A 5TU0A 2RC8A 3VV5A 4OWDA 5AA2D 3FD3A 1KA1A 4F22A 3U92A 5I2KB 4G61A 1A7LA 1B3EA 4U2RA 1TWYA 2ZYOA 2V84A 4POXA 4QFOA 1MPBA 5LDZA 4ZZEA 4EF1A 2CZLA 4DE8A 3OELA 3HFUA 3DP4A 3GBAA 3KFMA 5CMMA 4R2FA 3C33A 3TQLA 3CG1A 2REJA 1QUJA 1ZTYA 1T0KA 2IEEA 1D9QA 3NOHA 1Y3QA 3U8QA 3VFJA 4UACA 2F36A 2RF1A 1CNQA 4PBHA 3SEUA 4I1DA 1WVJA 4FATA 1LBXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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