4F18A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 8.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Phosphate-binding protein
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f18A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f18A01
4LUBA 4DE8A 2W7YA 3CG1A 4BDRA 1IXCA 5DVFA 2ZYOA 3BFTA 4HCWA 5H8HB 2UVJA 3T22A 1B51A 4IO7A 4LP2B 1US4A 1SDXA 2F7BA 3N26A 1LCTA 3PMWA 3PPOA 2UVHA 1II5A 5DVIA 5EYFA 1AL3A 3PUYE 3O6GA 4NTLA 4R2FA 1WDNA 4YMBA 4YKKA 3GLBA 5F1QA 3CFLA 4F3BA 3MZ1A 5L9SA 4BDMA 3HCQA 1UTBB 1RYXA 3G3IA 2LAOA 4GD5A 2HXWA 4XKRA 2Z8EA 1JVYA 3FXQA 1B1XA 1MQJA 1Y3NA 3K6WA 2OK2A 4G68B 5I57A 3AXFA 1XVXA 1UIUA 3Q29A 3HN0A 4FECA 3O66A 2UYEA 3TTLA 4NF8B 1NNPA 4X1BA 4ZDMA 4JDFA 4WKMA 4ISUA 4YB5A 4OEUA 1LLSA 2DWIA 4NF5A 4KD5A 5H8FA 4IO2A 3OEMA 1PBPA 1M5FA 2V3TA 5DTBA 3OOAA 4KFQA 4EF2A 2ZYKA 2XXPA 2QS4A 4R6HA 4ELRA 3N5LA 4XTCQ 4H5GA 1WODA 1CB6A 4X1DA 3N6UA 4BDNA 3UA8A 2AYSA 4R73A 2WKYA 5I59B 3H7MA 2RCAA 1LAFE 2D3IA 2XXIA 2GHAA 4QF9A 4YB7A 4P0IA 3MQ9A 1I6AA 1MPDA 1MRPA 3PUXE 3VFJA 3MVZA 5AE4A 1ZIUA 4O3AA 1MDP1 4Z7EA 3I5OA 4JSOA 3IJXB 3TCGA 3U92A 1IEJA 5AA2B 2ESNA 2O6AA 3O29A 4OEVA 5AA2D 1MG1A 4PFYA 2NVUB 3MP6A 4NF4B 2A5TB 2DVCA 4U23A 3T9XB 3WAFA 1R9QA 2PT2A 2X26A 1QW0A 4THIA 5DEXB 4ZEFA 4F1UA 5BWJA 4EQ9A 4FJPA 2XD2A 3IB2A 4O3CA 5DVJA 1SW5A 4F2QA 4AQ4A 1TT1A 3ZSFA 3V89B 4U1ZA 1MPBA 2Z8FA 3IB1A 1SI1A 5I58B 1LB9A 5JTYB 1VFDA 4Q30B 5IAIA 2DE4A 3TQWA 5HPQA 3QAXA 2OWTA 2B3BA 1LBBA 3T93B 5L8DA 4LQ5A 4U22A 2B3FA 4O3BA 2RCBA 5F7VA 3LC8A 3K4UA 5CM6A 1Y3PA 2ALUA 5H8QB 1QUKA 2ABHA 3HSTA 3LR1A 3IO4A 2HZLA 5ISUA 1WVJA 3C34A 2Q2CA 1ZKBA 1GV8A 1JVXA 2IA4A 3OO8A 3TUSA 4R75A 5CMCA 5CBRA 3D4CA 3KG2A 3FJGA 1NKXA 5KCJA 4GFRA 3UGWA 1PC3A 3K01A 1SYIA 2Y84A 3ODBA 3PPNA 5TU0A 1OLCA 4POWA 3OENA 3C31A 4N6PA 4F19A 1UTHA 1LGBC 3SEWA 1EZ9A 1QJMA 5AA1A 3MBPA 4TLLB 5JK4A 1FQEA 1NNTA 4KYDA 3K0VA 3TAJA 2E0SA 3SEXA 4G4PA 4F1YA 3UK4A 1DTZA 5I57B 4WEDA 4ELOA 4IGTA 4KPTA 4LZ8A 3U94A 4IY6A 1H43A 3JV9A 4BDOA 3USDA 5DYHA 4NWCA 3CFXA 3FIRA 2UYFA 5M2VA 2DQVA 3CSGA 3SEYA 4H67A 3FD3A 3RLFE 2IEEA 4OVJA 4RPNA 3K6UA 4NF5B 2Z8DA 3G3FA 3GBAA 5H8FB 4OZ9A 1I6BA 1Z7ME 4TOZA 4PETA 4K3FA 4HCYA 3H6VA 1ATGA 4R2BA 3EHUA 3H06B 2I58A 3O9PA 2O84X 5CI5A 3S2VA 4YAHX 1LFGA 3OSRA 3I3VA 1OVBA 2GHBA 3M3LA 3MWBA 2OJTA 3QUJA 5TPAA 3S4UA 4QFKA 2PX1A 1MPCA 1S9TA 1A55A 4OETA 2OCUA 3PUVE 3C35A 3DP4A 3BKIB 2I49A 4DIGA 3FVOA 4JWOA 1SD3A 3KJTA 4OQOA 3ZKLA 3KFMA 3R7XA 2G29A 4XKNA 4YICA 2Q8JA 4NF6A 2R71A 1FTLA 4F3PA 1ANFA 4I9DA 5ICTA 2XD3A 3IOTA 1P1OA 2I3VA 1HSLA 2O68A 3HPIA 3MVXA 3U1OA 4FORA 1MH3A 4H5FA 2ZYMA 1XC1A 3O28A 4QHQA 2THIA 1US5A 4FEBA 1ZJLA 3G3KA 3LSFB 5BUUA 2H98A 2F6PA 1DPEA 5I2KA 3MW0A 1ZTYA 3PMXA 3IOVA 3OMBA 1B9JA 1UIVA 3IORA 4ZE9A 2VD2A 1FW0A 3EPEA 1MXVA 4OTEA 1M5EA 2XXQA 3FZVA 5H8NA 3VXCA 4FATA 2DE2A 3PPRA 1GTKA 1GR2A 1A8FA 3U93A 1B3HA 3VE1B 3OO6A 5AA3A 1FCKA 1H44A 1EU8A 1B32A 3FUZA 2F78A 4OFJA 4I8CA 3O2AA 5HM4B 2XXXA 2ZNTA 3KJ7A 3FASA 1Q1KA 3Q25A 1DPPA 1FTJA 2QSXA 3IR1A 4RY1A 2VD3A 1UTHB 4R74A 1B6HA 4XKQA 1UQWA 2XXHA 2RC8A 2QRYA 4KCCA 3SEVA 2DYXA 3FXUA 3KOSA 2O7IA 1XOCA 4EF1A 2I0CA 3QXMA 1FTOA 3FATA 4HW8A 3D4GA 2PMSA 1NL5A 3G3GA 4YMAA 1H76A 3UP9A 1DMBA 4ND9A 4G68C 1BLFA 2QS2A 1B1HA 4YKJA 2ONRA 2HQ0A 3T66A 1H3DA 2P0SA 4KYSA 4OFOA 1M5DA 4PP0A 4OYVA 1SVXB 3H4ZA 1S7YA 4LATA 1XT8A 3EQ1A 4OESA 3KN7A 2RC7A 4M4GA 1DSNA 4PQJA 2QS3A 3B6QA 3Q27A 5K2YA 3RY3A 4Z0IA 3L6GA 5TPAB 4F39A 2NXOA 4WXJA 3IX1A 3VVDA 4DCYA 2I48A 3M8UA 4UACA 2NOOA 3FV1A 5KZTA 3TYHA 2Q88A 1FQCA 1IIWA 4YB6A 3JZJA 4I62A 3MPKA 4QSEA 1ELJA 4IO3A 2ZNSA 3FGSA 4U4SA 4NF6B 3DP8A 1BKAA 2ONSA 3MVYA 3PU5A 1NH7A 1B3FA 4ZEDA 3BBRA 4N13A 3TFLA 2ONKE 4YZZA 2ZNUA 4KQPA 1LBCA 4U2RA 2P2AA 4OMBA 1HSJA 3TDJA 3UIFA 4GL8A 1B58A 2F6GA 1XS5A 3GXAA 2O51A 3W15C 4JBZA 5I2KB 1IXIA 3ILUB 1QKAA 1N7WA 2F35A 3K1MA 5H8NB 4FE8A 4GOTA 2XXTA 1P1UA 3TCFA 3K1NA 5EHMA 1OMPA 4MBPA 4YKPA 1JNFA 4YU0A 1ZBMA 5ICQA 3LBSA 4XKPA 3O6IA 3TTKA 4RK9A 5I84A 4BLAA 1MXYA 3ZKKA 3T96B 4N07A 4TLMB 3MZBA 3THIA 1B5HA 3EHTA 1EH3A 4L17A 3T9UA 2H5YA 1LCFA 2HAUA 5CMKA 1AIVA 4TQUQ 4NWDA 1IXGA 4QFPA 3H6UA 2REJA 3LUYA 1T0KA 2XXYA 1XHYA 1Z7NE 1Y4CA 4JSDA 1F9BA 5KDTA 5I56A 3PV0E 4H1XA 4RPOA 4KR5A 1QUJA 4YKIA 3MZ9A 4GVOA 1B3LA 1R9LA 1B46A 2KLFA 2UVIA 3DELB 4POXA 2OWSA 4Q8RA 2OBGA 1SBPA 2UVGA 1DTGA 3RT8A 3TTRA 3VVFA 3LSLA 3EN3A 2Y7WA 2G93A 1D3KA 1QKBA 2V93A 3PMVA 1POTA 3E4RA 3EF7A 1B5IA 1N3WA 3P7IA 2PT1A 1GVCA 1B7ZA 2DXRA 3MP8A 1S50A 2VHAA 3CG3A 1GGGA 4RYAA 1URSA 2DWAA 2QMXA 3CR9A 3IOUA 4I1DA 3MAMA 4EDPA 3RT6B 2PVUA 3RPWA 4FEDA 4U21A 4IGRA 3T9VA 5L9MA 3UORA 3KBRA 3M3FA 4R6YA 1PB7A 2ZMBA 4U1OA 1SW1A 5EHSA 1ZMGA 2Q9TA 5A5XA 2D21A 2VOZA 4ZZEA 3IAZA 3FJ7A 1VSOA 1KWHA 3PUZE 5CMBA 3RQTA 5FTHA 2Y7KA 1Y1ZA 4H0WA 2Q2AA 5LOMA 4ZE8A 3C4MA 4JB7A 3SEUA 2YPNA 3MPLA 3F11A 4QFNA 3E9XA 2RC9A 3TELA 1LAHE 1O63A 4QFLA 3HV1A 5TP9A 1A7LA 2CMOA 4DZ1A 2OLBA 3U72A 3B6TA 2YLNA 3PGFA 4F3SA 2A5SA 1OVTA 3R26A 3DP6A 2GRVA 1YAEA 1YPNA 4R6KA 1URGA 1Y20A 3IB0A 1RKMA 2HZKA 1QUIA 1FQDA 3OXNA 3IL1B 3KGCA 3TQLA 5FHOA 4ZZAA 1PEBA 4G8NA 3A3CA 1O64A 1MXUA 2HEUA 1MM7A 3K6XA 2D5WA 3MVWA 3PPPA 3S9MC 1TXFA 5FHMA 4OHNA 2DXYA 1OQHA 5HBCA 3VVEA 2F34A 4C0RA 5KDTB 1YTVA 2XX7A 2DWHA 2PYYA 3QYTA 5I56B 1ZLQA 3K6VA 2I6EA 1NMUA 2AL5A 2XX9A 3B6WA 1MXWA 1JW5A 2DSFA 3V83A 3GZGA 5K2XA 3PPQA 3V5AA 1BIYA 4FIMA 3TCHA 2ANJA 2F7AA 2YJPA 1H45A 3C33A 3FVGA 4BDLA 3K00A 4QSCA 4BDQA 3VDFA 4GL0A 3O6HA 3TODA 2XXRA 4RNSA 5AA2A 4PFTA 4Q0CA 4OENA 4G2ZA 4F22A 5KCJB 3CRBA 4G77A 2RF1A 2I0BA 1N7XA 4F31B 2Y7PA 3MP1A 3K02A 3RTFB 3T9HB 3DM0A 4PFWA 1PDAA 1Y1MA 3L6HA 4G8HA 3LSWA 4XXUA 3VV5A 4MF3A 4DCXA 5CRYA 3K1PA 3HHGA 4GXAA 4NMYA 1B05A 4ELQA 4FAJA 3W9WA 5FHNA 1B52A 2DOJA 3RGYA 1IXHA 1MY4A 2V3QA 3IO6A 3QK6A 4X9TA 4AB6A 5L9OA 4DXUA 4H8JA 1B0LA 2X7PA 3C9HA 4R72A 2REGA 1P1WA 1PBQA 5A5XB 1IUDA 1QVSA 3OO7A 1BP5A 1A54A 1LAGE 1MH4A 5CBSA 4KCDA 1D9VA 3KEIA 4Q5TA 1M5BA 2I4CA 3BFUA 3FXRA 4R9GA 1R1NA 4HS7A 1B3GA 3TEPA 1IQ7A 1A40A 4H6DA 1B4HA 1D9YA 2XXUA 2V25A 3U8QA 1VR5A 4IY5A 1P99A 4P0GA 3N94A 5TP9B 1FQBA 5I2NA 4RXLA 4G8MA 3IJOB 3I6VA 1FTKA 2V3UA 1YCJA 4EXKA 1OIBA 1J1NA 3TZAA 1XVYA 3E3KA 3RN8A 5B7DA 1IITA 4EQ7A 1MQIA 4HTGA 2R6GE 5CC2A 4ECFA 4XIGQ 3KSXA 2QS1A 4MH5A 3M3KA 4NEDA 3CVGA 1ZU0A 2CZLA 5AA4A 1I6QA 1FQFA 1MY3A 3MC2A 4GWOA 1P1QA 2O69A 3W9VA 1LFIA 3SESA 1B7HA 4GXSB 2AIXA 4OERA 4RK2A 4EQBA 3G3JA 4M1VA 2X7QA 1Y3QA 1O7TA 3SETA 1Y9UA 1MQGA 3RNNA 1TFAA 1MY1A 4C1TA 1A8EA 4MLQA 4DXBA 3A09A 3PD9A 4LONB 3HO7A 2HAVA 2DE3A 2XHDA 1PB9A 4F18A 1NNFA 2ZYNA 4OWDA 4JXIA 3SERA 1PB8A 2H99A 3RTWB 4LVQA 2XX8A 5ITPA 2F5XA 4QFOA 3ONMA 2H9BA 2B65A 4U4XA 4E0XA 3OO9A 3KZGA 4IO6A 1IZ1A 1NNKA 4DXCA 2QJEA 2Q89A 2VP1A 1FTMA 3TKDA 5JEIA 3TTMA 2DS9A 4QSDA 3N6TA 4ESWA 3EHSA 2P1SA 1DOTA 2QPQA 1LB8A 5CMMA 1B5JA 4IO5A 1MXXA 4RA1A 2OZZA 1P1NA 2R9JA 1NH8A 4KI0E 2F36A 1MY2A 4E0WA 1N84A 2RINA 4F2OA 3C36A 2E1SA 4ELPA 5DT6A 1JW4A 1B40A 3VLVA 5IKBA 1JEUA 2DVZA 1N0TA 3QIMA 3SKPA 4P11A 3A3UA 4LZ5A 3WAEA 1MDQA 5ELVA 3OEKA 4ZEIA 4RJZA 3HHFA 4ZS9A 4DDDA 5ITOA 4ZECA 5FTIA 2F97A 1B4ZA 4QRZA 3OSQA 3TMGA 1B3EA 4ESXA 1SW4A 5J1DA 4DLDA 2Y7RA 1M5CA 2F8DA 3CI8A 3PD8A 1NFTA 3Q28A 2O1MA 4LQ2A 5I2NB 4GF8A 2Y7IA 1VFEA 3GBBA 2BJJX 3TTNA 4GIZA 1AH5A 3ZS6A 5H8SA 4EUOA 1MS7A 2NWJA 3OD7A 2H25A 1B0HA 4R9FA 2RKMA 3C32A 3G7WA 4GQOA 3TPAA 3O97A 3E13X 4PE5B 4WEPA 1SW2A 4NE4A 4IB2A 3S9LC 3MUQA 3ILTB 3H6WA 1JEVA 1N3XA 3FVNA 2O7UA 5H8HA 3LSXA 3V8XB 4ZEKA 5AA4B 1N04A 2O1LA 3H03A 2DP8A 3FV2A 2F7CA 2I3WA 2I4BA 3VXBA 1JQFA 1LAXA 4KHZE 4H65A 4KYEA 1B2HA 1MQDA 1UTBA 1USYE 4JWYA 1MQHA 1AOVA 3ECRA 2FA7A 3IOWA 3PUWE 1EZPA 2QMWA 2GH9A 4IO4A 4G68A 4UA8A 4X48A 2FYIA 3H6TA 1R6ZA 5B70A 1VE4A 3SDFA 2M8CA 1JETA 4ONYA 3JYRA 4MFIA 4F29A 4OFLA 4NF8A 3MJNA 3G3HA 3OELA 1A99A 3VLWA 3FVKA 1L5TA 4LZ7A 3IK6B 1CE2A 2Z23A 1SYHA 3K2DA 4GRKA 3CSBA 1I69A 2NUVA 2UXAA 1QULA 5I59A 4MLVA 1JW1A 4C1UA 4EXLA 1OLAA 1TWYA 3QSLA 2PBWA 2XXVA 4H8IA 3R6UA 1SI0A 3CIJA 4GLIA 3S9EA 2GFEA 1SQYA 4AB5A 1B7UA 3UN6A 1RYOA 1MY0A 1N76A 2V84A 3VLUA 1AMFA 3H3GA 1LSTA 3QUFA 3KN8A 3DLNA 4PFUA 2H4IA 2Z22A 1Q35A 1EZOA 4NF4A 2ZXTA 2A5TA 1POY1 1BTJA 2HFBA 1MM6A 2HCAA 2AL4A 1LFHA 4F3GA 5DEXA 2XXWA 4ZEBA 3CFZA 2DWJA 3FJMA 4JWXA 1MXZA 1FQAA 3RUMA 1D4NA 5I58A 3Q26A 5JTYA 2QL3A 4F1VA 3S9NC 3KSJA 1URDA 1TFDA 1OQGA 2FNCA 1Y4TA 4OXVA 4LA9A 5H8QA 2VGQA 1USYH 3KN3A 3KOTA 1HSEA 3B7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IZ1A 2FIEA 4HE0A 4LUBA 3T1BA 4DE8A 2W7YA 3CG1A 4BDRA 1IXCA 5DVFA 2ZYOA 3BFTA 4HCWA 5H8HB 2UVJA 3T22A 1B51A 4IO7A 4LP2B 1US4A 1SDXA 5EYGA 2F7BA 3N26A 1LCTA 3PMWA 3PPOA 2GQ1A 2UVHA 1EYKA 1II5A 5DVIA 5EYFA 1AL3A 3PUYE 3O6GA 4NTLA 4R2FA 4MNPA 1WDNA 4YMBA 4YKKA 3GLBA 5F1QA 3CFLA 4F3BA 3MZ1A 5L9SA 4BDMA 3HCQA 1UTBB 1RYXA 3CHGA 3G3IA 2LAOA 4GD5A 5LDZA 2HXWA 4XKRA 2Z8EA 1JVYA 5I5PA 3FXQA 5FBPA 1B1XA 1MQJA 1FPLA 1Y3NA 3K6WA 2OK2A 4G68B 5I57A 4GWXA 3AXFA 1XVXA 1UIUA 3Q29A 3HN0A 4PBHA 4FECA 2XXKA 3O66A 2QFLA 4GBVA 2UYEA 1FPKA 3TTLA 4NF8B 1NNPA 4X1BA 1NI9A 4ZDMA 4JDFA 4WKMA 4ISUA 4YB5A 4OEUA 1LLSA 4GBWA 2DWIA 4NF5A 4KD5A 5H8FA 4IO2A 3OEMA 1PBPA 1M5FA 2V3TA 5DTBA 3OOAA 4KFQA 4EF2A 2ZYKA 2XXPA 2QS4A 4R6HA 4ELRA 3N5LA 4XTCQ 4H5GA 1WODA 1CB6A 4X1DA 4AS5A 4NF0A 3N6UA 4BDNA 3UA8A 2AYSA 4R73A 2WKYA 5I59B 3H7MA 2RCAA 1LAFE 2D3IA 2XXIA 1KA0A 2GHAA 4QF9A 4YB7A 4P0IA 3MQ9A 1NV6A 1I6AA 1IMFA 4N8GA 1MPDA 1MRPA 3PUXE 2ZZXA 3VFJA 3MVZA 5AE4A 1ZIUA 4O3AA 1MDP1 4Z7EA 3I5OA 4JSOA 3IJXB 3TCGA 3U92A 1IEJA 5AA2B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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