1Z7ME

Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
204
structure length
200
Chain Sequence
MIKIAITKGRIQKQVTKLLENADYDVEPIRELQIKTKDDLQIIFGKPNDVITFLEHGIVDIGFVGKDTLDENDFDDYYELLYLKIGQCIFALASYPDFSNKNFQRHKRIASKYPRVTKKYFAQKQEDIEIIKLEGSVELGPVVGLADAIVDIVETGNTLSANGLEVIEKISDISTRMIVNKSSFKFKKDKIIEMVERLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Lactococcus lactis
publication title Activation of the hetero-octameric ATP phosphoribosyl transferase through subunit interface rearrangement by a tRNA synthetase paralog.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit
total genus 59
structure length 200
sequence length 204
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2005-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7mE01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7mE02
1UTHA 1O64A 2Q89A 3IJOB 2X26A 4FECA 2RC8A 3K4UA 5ELVA 3RT6B 1WVJA 2ZXTA 2B65A 3TPAA 3M3FA 3FUZA 5I58A 4OENA 1MPCA 3L6HA 1JW5A 2UVGA 4ZEDA 4UACA 2HFBA 1FQAA 5HPQA 2O68A 1B40A 3LBSA 4NF5A 4EDPA 4LQ5A 3CVGA 5KDTA 3E3KA 2A5TA 4YMBA 4F3GA 3OXNA 2THIA 4ZEFA 1LCTA 3TAJA 3VVEA 4OZ9A 4QFNA 4OMBA 1URGA 4TLMB 1OVBA 4G68A 2F7CA 5DEXB 4F19A 2XD3A 4DLDA 1P1OA 4R6KA 3TZAA 1LAGE 4I8CA 1B58A 3QIMA 2Z23A 1URSA 1BIYA 1Y3PA 3PD8A 3K6XA 4EQ7A 2QS4A 1XC1A 3H06B 1IUDA 3H6WA 4Q8RA 5ITPA 5A5XB 4LONB 1Y3QA 2V3UA 3S2VA 3TCFA 4F31B 2ZMBA 1MY1A 2XX9A 3C9HA 4QHQA 4C0RA 3ZKKA 5K2YA 1GV8A 1ELJA 3N6TA 2ZNSA 3PUWE 1Z7NE 1S50A 4POXA 1FTJA 1LBCA 2E1SA 3PMXA 2Q2AA 3THIA 3G7WA 3TYHA 2OWTA 2VD2A 1VE4A 4F3BA 3M8UA 3S9MC 3S4UA 4DCYA 3TCHA 1M5DA 1B3LA 2I4CA 1B5JA 5KZTA 3FATA 3OO6A 4F1UA 5FHMA 4ZEKA 2OJTA 1JVYA 4K3FA 1IIWA 5JEIA 4BLAA 3C34A 3RQTA 1US5A 1UQWA 1YPNA 3O2AA 4NF6A 1LAXA 4NF8B 1B51A 1VR5A 5H8SA 2DVCA 1UTBB 4IGTA 3MP1A 1B7ZA 4WXJA 2IEEA 1ZBMA 1MPBA 4OFJA 3TFLA 2OWSA 1B46A 4R75A 1Q35A 4RJZA 3IB0A 1OVTA 1SW4A 2QS1A 2O6AA 4ELRA 2NVUB 3OSQA 3HHGA 4IO6A 4N6PA 1JNFA 3KG2A 2Z8DA 3UN6A 5I57B 3MAMA 4LA9A 1BP5A 5M2VA 3SERA 1XVYA 1DMBA 1AOVA 2ALUA 4XKPA 3K1PA 4ZDMA 3TUSA 4LQ2A 3VFJA 3M3LA 3K6WA 2Y7IA 2FNCA 1MRPA 2XD2A 1LLSA 4KCCA 3H4ZA 2GFEA 3WAFA 3UIFA 2QL3A 2NWJA 4GXSB 4PQJA 5L8DA 3E13X 4QRZA 4MLVA 2W7YA 3Q25A 2A5SA 2XXQA 3VXBA 2V3TA 4H67A 2PT1A 1B0LA 1B52A 2OK2A 3ODBA 3S9EA 4YICA 2H9BA 3OEMA 2XXTA 3JZJA 3DELB 3JV9A 1PEBA 1B7UA 5DVFA 5JK4A 3CSGA 3TCGA 3K00A 3MC2A 4IO4A 2Z22A 3FASA 3MVXA 3K02A 2LAOA 2XXHA 3MP8A 3FIRA 2O1LA 3H7MA 4POWA 3OSRA 4IO2A 4LZ8A 4U21A 4ELPA 2Q88A 5B7DA 1N3XA 3O6HA 3KN8A 4U2RA 2PMSA 3BFUA 1PB9A 3MUQA 4THIA 2UYEA 3SEWA 2YPNA 1FQFA 1EZ9A 4OTEA 1VSOA 3FV2A 3L6GA 3CSBA 3MWBA 5EHSA 1EU8A 1RYXA 3H03A 2QSXA 2XXVA 1TFAA 1NNFA 2XX8A 1MQHA 4F3SA 2O69A 3PMWA 1P99A 4QFKA 1A8FA 1H3DA 4U22A 3RTWB 3HCQA 5FTHA 3I6VA 4E0XA 5I2NA 2M8CA 1JQFA 2VGQA 2ONKE 4QFOA 3IB2A 1MQDA 4N07A 1B1XA 3VDFA 1A99A 2DXRA 4ZS9A 5DVJA 1ATGA 3IOUA 5LOMA 2DWHA 2RINA 4FEBA 3KN3A 5JTYB 4NF4A 2RCAA 2P2AA 4RK2A 2D21A 4IGRA 1MH4A 1LCFA 4P11A 4KI0E 4GWOA 3ECRA 1JEUA 2H4IA 4ISUA 3FZVA 2HQ0A 5AA2B 1UTHB 1USYH 3FD3A 2DYXA 1BTJA 5FTIA 1POY1 1TT1A 5I58B 2PX1A 4Q0CA 2FYIA 4KFQA 4ESWA 5L9MA 4F29A 1I6QA 1MM7A 1B3EA 4RNSA 4I62A 3CRBA 3T22A 4EF1A 5F1QA 3RUMA 4NF5B 2UXAA 4LATA 2F35A 2DVZA 4XKRA 2O1MA 2A5TB 4F1YA 4EQBA 1IITA 4FORA 3TTKA 1NNTA 1TFDA 4GL0A 3A3UA 3C32A 4G68B 1NH8A 1USYE 1B32A 3T9VA 1T0KA 4OVJA 1FQBA 4Z7EA 4ELQA 1H76A 3TTNA 4FJPA 1TWYA 4KYSA 4OETA 3ILUB 1LFHA 3CG3A 1PB8A 4YZZA 3CIJA 1HSEA 1XOCA 2REGA 3V89B 4RY1A 4F1VA 1B3FA 3PD9A 1R9LA 1D9YA 4H5GA 1D3KA 4FIMA 4R72A 3Q28A 1GTKA 3ILTB 2HAVA 4X1DA 3TODA 3KZGA 3K6VA 1YCJA 2CMOA 3V8XB 3LSLA 1LAHE 3DP6A 3TTLA 4NE4A 4KQPA 1JVXA 3IOVA 1PBQA 1QKAA 3EN3A 4RXLA 1A7LA 4F39A 2F8DA 1Y20A 5I2KA 2DOJA 2KLFA 4NF6B 3K01A 4H8JA 1MXZA 3T9XB 5H8FA 1QJMA 1LFGA 4EUOA 4XKQA 1FQCA 2R6GE 3TDJA 1US4A 4EF2A 4H65A 3KOSA 3B6QA 2VD3A 3CFLA 4F18A 5HM4B 2V93A 5TU0A 4PFWA 1P1UA 3H6VA 2I3WA 2DE3A 4YKIA 1MPDA 3MP6A 1IZ1A 4GLIA 3S9NC 5TP9A 1B4ZA 4F3PA 5IKBA 3MBPA 4IY6A 1MDP1 2OZZA 3H6UA 1MY2A 3T96B 1HSLA 3FVGA 5I59B 2BJJX 1B1HA 2GRVA 3LC8A 4TOZA 1N3WA 2Z8FA 5CBSA 3PPPA 3V83A 4DCXA 3FVKA 4BDRA 4ZEIA 1WDNA 4NWCA 3G3HA 5DTBA 2XXYA 3UGWA 1LFIA 1NKXA 4NEDA 4QSEA 3O9PA 5CC2A 3OEKA 1B3GA 3IOWA 1EZPA 4GL8A 2Q2CA 1L5TA 5AE4A 4X9TA 5CI5A 3ONMA 2Q8JA 1S9TA 2OBGA 4RK9A 3QK6A 1MQJA 2F78A 4DIGA 2RC9A 4YU0A 4XKNA 1R1NA 2DWAA 1NNKA 2DXYA 4UA8A 1IXHA 3A09A 5TPAB 1F9BA 2H5YA 1IQ7A 1Y4CA 1IXGA 3TTRA 4MH5A 3SKPA 3DP4A 3TKDA 2Y7RA 3UP9A 1GR2A 3MZ1A 2ZYNA 4QFPA 3RNNA 1JEVA 1CB6A 2QRYA 3BFTA 3R26A 2DE2A 3IB1A 1S7YA 2V25A 3SETA 4QF9A 5CMMA 3SESA 3FXQA 2DE4A 3B7DA 4PFUA 1FTLA 3PUYE 2GHBA 3SEVA 5KCJB 3T93B 3JYRA 3B6TA 4H0WA 2AIXA 2PT2A 1QULA 2X7QA 5I84A 5FHOA 4ZE8A 3LSXA 4H6DA 4R9FA 1BKAA 4MLQA 2AL5A 1M5FA 3LR1A 4E0WA 1R9QA 1P1QA 2QMWA 3K1NA 3U72A 1P1NA 3FJ7A 3EHTA 4M1VA 2F34A 1M5CA 3USDA 1IXIA 2NXOA 2DSFA 2ZYOA 3D4CA 4PFTA 3IORA 4JDFA 3O29A 5CBRA 3TEPA 3C36A 1MQIA 1NNPA 3RPWA 5EHMA 2G93A 5AA2D 1AIVA 4R2FA 1FW0A 2H25A 3N6UA 4F2OA 3CG1A 2Y7KA 3EHSA 3DP8A 5I2NB 1JW1A 1N7XA 1IEJA 1OLAA 4ZZAA 5FHNA 1RKMA 1R6ZA 3BBRA 4HCYA 4IO5A 1FTKA 4H1XA 3KJ7A 3SDFA 1B6HA 3C4MA 5AA4A 3RGYA 3C35A 1B5IA 2XX7A 3I5OA 1DTZA 2PVUA 4RA1A 3IOTA 3GZGA 3Q29A 2Y7WA 3U92A 3KSXA 1ZKBA 3N5LA 1Z7ME 4NF4B 4BDQA 3TTMA 3UORA 2NUVA 2QJEA 1A40A 4RPNA 2QS2A 2X7PA 2F5XA 4OWDA 4ZZEA 1SD3A 1SW2A 3MVYA 1M5EA 3AXFA 4DE8A 3E4RA 2I58A 1POTA 4GQOA 4BDOA 4Q30B 4EQ9A 2I3VA 1ZU0A 1MH3A 4LZ7A 4TLLB 3MPLA 1O7TA 3QUFA 1WODA 1MXWA 3KJTA 4AQ4A 3OMBA 4G8HA 2HCAA 1B3HA 2ZYMA 2I6EA 4U4SA 3O97A 2F7AA 1Y1MA 5HBCA 3SEXA 1DOTA 4XTCQ 3GXAA 3PU5A 3HSTA 4OYVA 3RTFB 3MJNA 1MXVA 4JB7A 4KD5A 3DLNA 1MXXA 1MDQA 3C33A 3GBAA 3LSWA 4PE5B 5DYHA 4DXUA 4H5FA 3RY3A 2XXXA 3QUJA 3PMVA 4FATA 2GH9A 2F6GA 1SYHA 3OO8A 3OELA 4RYAA 4FE8A 1FTOA 1SDXA 2O7IA 3WAEA 2VHAA 2QPQA 4NMYA 4KYEA 3KSJA 1QW0A 4YB6A 4OHNA 4ND9A 2V3QA 3VV5A 3ZS6A 1DSNA 1MM6A 4EXKA 1MG1A 1CE2A 4G8NA 2DP8A 4YB7A 3VVFA 3D4GA 3U94A 3VLUA 3O6GA 1A55A 2R71A 1JW4A 4HCWA 5F7VA 3W9WA 1B5HA 2ZNTA 1FQDA 1BLFA 5KDTB 3OOAA 4MFIA 2XXUA 2XXPA 3MPKA 4F22A 2UVJA 1QUIA 5H8QA 4IB2A 3OENA 3HO7A 5ITOA 3TQLA 1QVSA 3N26A 2AYSA 2F36A 4G2ZA 3K0VA 4ZECA 3O6IA 5BUUA 1AH5A 4AB6A 5L9SA 1LGBC 2H98A 4YMAA 4GXAA 2HZKA 5I2KB 1N0TA 4IO3A 4JWYA 2HXWA 1I69A 3H6TA 3T9HB 3KOTA 3SEUA 4YAHX 3EPEA 1UIUA 2ZNUA 5H8FB 3UA8A 3FGSA 3IJXB 1MY3A 4U4XA 3FV1A 1SYIA 2RCBA 2ESNA 4YKPA 4R73A 5H8HA 3K6UA 5I56A 1NFTA 3FXRA 1H43A 2Y84A 2Q9TA 3CR9A 1PC3A 3TQWA 3E9XA 2I0CA 4R6YA 2I49A 5TP9B 3U8QA 2Z8EA 4EXLA 4R74A 1N7WA 1J1NA 2VOZA 3G3FA 2V84A 3S9LC 4BDMA 3TMGA 1NMUA 2QMXA 4GOTA 1PDAA 4GRKA 4GF8A 5H8NA 1B7HA 3VE1B 2XXWA 3G3JA 1OQHA 2REJA 3QXMA 2GHAA 1II5A 1FQEA 2F6PA 1XHYA 3RT8A 3KN7A 1AMFA 3KGCA 1MS7A 3ZSFA 2I48A 1D4NA 3BKIB 1PB7A 2AL4A 1UIVA 1MQGA 5ICTA 4JXIA 4G77A 2XXIA 4RPOA 3HPIA 3LSFB 1IXCA 1XS5A 4OEVA 4YKJA 3Q27A 4WKMA 3IAZA 3C31A 4O3BA 3CFXA 1ZMGA 5CM6A 3I3VA 4C1UA 1ZLQA 3SEYA 3FVNA 3IK6B 2YJPA 4OESA 2CZLA 4GFRA 4JWOA 5DEXA 3HHFA 4ESXA 2ZYKA 3H3GA 1XVXA 4Z0IA 5DVIA 3FVOA 3EQ1A 4WEPA 2O7UA 2F97A 2RKMA 3LUYA 1MY4A 3K1MA 4PETA 2H99A 3DM0A 1OLCA 1A8EA 1NL5A 2ONRA 2R9JA 4ZEBA 1MXYA 5A5XA 4R9GA 2OCUA 1MY0A 3G3KA 3R6UA 2RC7A 1YTVA 4PP0A 4JSOA 5K2XA 4WEDA 4FAJA 3OO9A 1ZIUA 1URDA 2DQVA 4HW8A 3QAXA 4MF3A 4HS7A 3GBBA 4OERA 4QSCA 1D9VA 3HN0A 3VLVA 3RN8A 4GIZA 3IO4A 5CMBA 1LBBA 5AA3A 3IL1B 1MXUA 3HV1A 1JETA 1SW1A 5I59A 2DS9A 2P0SA 3PV0E 3RLFE 1SQYA 2NOOA 4JWXA 1I6AA 1N76A 4NWDA 4NF8A 1Y3NA 4DXCA 3OD7A 1UTBA 4I1DA 3MVWA 2YLNA 1FTMA 4BDNA 4IY5A 2PYYA 3MW0A 2IA4A 5AA4B 2B3BA 3MZBA 1A54A 3MVZA 2VP1A 3QSLA 1VFDA 3B6WA 1B2HA 2O84X 4O3CA 3VXCA 2O51A 4KR5A 4LZ5A 4U1OA 1P1WA 4GVOA 4X48A 2OLBA 4OXVA 3M3KA 2F7BA 3FJGA 5TPAA 4LUBA 3G3GA 4JBZA 5I57A 1OIBA 4QFLA 4ZE9A 1RYOA 4N13A 4KHZE 4P0GA 1XT8A 1M5BA 4IO7A 4M4GA 3U93A 2P1SA 4F2QA 5DT6A 2HAUA 2QS3A 1OMPA 3VLWA 4MBPA 2UYFA 1B9JA 1DPPA 5J1DA 1NH7A 1Q1KA 3PUVE 2ONSA 2WKYA 1LB8A 5KCJA 4ELOA 4FEDA 4QSDA 4G68C 3T66A 5BWJA 4H8IA 4G8MA 1N84A 3PUXE 4HTGA 1SBPA 5CRYA 1DTGA 2B3FA 3VVDA 1TXFA 2DWJA 4XXUA 3PGFA 1Y1ZA 3IX1A 2XXRA 5EYFA 4OFOA 3QYTA 4U23A 4LVQA 4ECFA 3PUZE 2Y7PA 4O3AA 4X1BA 3MQ9A 1ZTYA 3PPOA 1YAEA 1LAFE 1B4HA 5CMKA 2G29A 3PPNA 2HZLA 2XHDA 1KWHA 4KPTA 3FXUA 2UVHA 1SW5A 3IO6A 3Q26A 4DDDA 1H45A 1EZOA 1GVCA 3W9VA 3EF7A 3U1OA 4KYDA 1ZJLA 4P0IA 2DWIA 3G3IA 3R7XA 2RF1A 3F11A 3W15C 5ISUA 3TELA 1I6BA 1SVXB 4YKKA 4PFYA 4GD5A 1LSTA 1QKBA 1QUJA 5H8QB 2PBWA 2ABHA 1N04A 5IAIA 1PBPA 2UVIA 5L9OA 4LP2B 4YB5A 1SI1A 3K2DA 1EH3A 4NTLA 3KBRA 4L17A 3PPRA 1FCKA 3CI8A 1Y9UA 3EHUA 3KFMA 2I0BA 3PPQA 1VFEA 4KCDA 4ONYA 3T9UA 1QUKA 3P7IA 4OEUA 4TQUQ 4XIGQ 4OQOA 4DZ1A 3CFZA 4Q5TA 4R2BA 1SI0A 5CMCA 1LB9A 5ICQA 5B70A 4G4PA 3O66A 3FJMA 3GLBA 1DPEA 5AA1A 5H8HB 4BDLA 5I56B 3ZKLA 2D5WA 3N94A 1OQGA 2FA7A 4C1TA 1ANFA 1GGGA 2HEUA 1O63A 1H44A 5JTYA 4I9DA 2I4BA 3UK4A 4R6HA 4DXBA 3IR1A 1B0HA 4AB5A 2D3IA 3O28A 2E0SA 3MZ9A 4JSDA 3A3CA 2ANJA 3V5AA 1B05A 3KEIA 3OO7A 5H8NB 1Y4TA 1HSJA 1AL3A 4U1ZA 5AA2A 4OFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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