1Z7ME

Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
204
structure length
200
Chain Sequence
MIKIAITKGRIQKQVTKLLENADYDVEPIRELQIKTKDDLQIIFGKPNDVITFLEHGIVDIGFVGKDTLDENDFDDYYELLYLKIGQCIFALASYPDFSNKNFQRHKRIASKYPRVTKKYFAQKQEDIEIIKLEGSVELGPVVGLADAIVDIVETGNTLSANGLEVIEKISDISTRMIVNKSSFKFKKDKIIEMVERLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Activation of the hetero-octameric ATP phosphoribosyl transferase through subunit interface rearrangement by a tRNA synthetase paralog.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit
molecule tags Transferase
source organism Lactococcus lactis
total genus 59
structure length 200
sequence length 204
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2005-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7mE01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7mE02
2XXQA 3CIJA 5IAIA 3H6VA 4R73A 4R75A 4OFLA 3FATA 3I5OA 5F1QA 3I6VA 1S50A 4ESWA 3ECRA 2F5XA 1LSTA 3OEKA 3UIFA 3H7MA 1H3DA 2I0CA 4H1XA 4POXA 4GFRA 3S9LC 1IXCA 4PFUA 4KHZE 2AL5A 1LGBC 1Y3NA 3O9PA 1XHYA 3H03A 4R2BA 4F18A 3MP8A 3V8XB 3HN0A 4FIMA 1LCFA 1BP5A 3FGSA 4GF8A 4KYEA 4RJZA 4FE8A 1N7XA 5ELVA 1R1NA 2XHDA 4KYSA 3R6UA 3K2DA 4PP0A 4Q5TA 5TU0A 1US5A 3H3GA 3VDFA 4O3AA 4AQ4A 4H6DA 1LAHE 4H65A 1SI0A 3K6VA 1FTLA 1NNPA 3G3HA 1N76A 3IOVA 2O7IA 1DTZA 5I58A 4NF5A 3VFJA 5B70A 1FQEA 5TP9B 2XD2A 1JW1A 1XC1A 5H8QA 1FTJA 4P11A 3MPKA 2OZZA 4ONYA 1NNFA 1JEUA 3CSBA 1Y3PA 4IY6A 1VSOA 2H98A 4NWCA 1YPNA 2P1SA 4TLMB 1B2HA 3UORA 1NL5A 3PGFA 1B5JA 3TMGA 3FIRA 4HS7A 4ZEIA 1QKBA 1GR2A 3S4UA 1B58A 4U23A 1M5BA 2ZNUA 1A7LA 1UQWA 4BDQA 1Y9UA 3E13X 1H44A 4XXUA 1LFGA 3OO8A 3N94A 2DE2A 2V93A 4QRZA 2B65A 5CBRA 4ELOA 4KCDA 5JK4A 4LQ2A 3T96B 4OEUA 4C1TA 4TLLB 4I1DA 3C4MA 1FTMA 2DQVA 1B7ZA 2LAOA 3PD9A 1T0KA 3T66A 5AA1A 3PU5A 4FAJA 3OD7A 3HO7A 2R71A 3CSGA 4HCWA 3RNNA 3BFTA 2XD3A 5I58B 1PBPA 2XXXA 4NF5B 2QMXA 4FEBA 1I69A 2R9JA 3HV1A 4M4GA 1PDAA 4F3GA 1MH4A 3IJOB 2OWSA 1RKMA 5CMKA 3LSFB 5BUUA 4K3FA 3S2VA 2YJPA 1ZBMA 3PUWE 4EQ7A 3G3GA 2ZYMA 4NF4A 3OSRA 3WAEA 4NE4A 2Y7IA 3U8QA 1H43A 1WDNA 2D3IA 1QUJA 1ANFA 1BIYA 1II5A 3BFUA 3KFMA 5EHMA 1AMFA 4JXIA 4ESXA 4R72A 3ZSFA 4LATA 4NF8B 4O3CA 1BKAA 3TPAA 1B32A 3CFXA 1ZJLA 3C33A 2YLNA 2Z22A 3K6UA 3T9HB 1Q1KA 2O1LA 3IOTA 1SW1A 1MM7A 3QUJA 4U2RA 1QJMA 1ZU0A 3BBRA 2ANJA 4GWOA 1MY1A 5DT6A 4QSEA 3VE1B 2XXVA 1SI1A 1N3WA 4P0IA 2OWTA 1LFIA 2Q88A 3D4CA 2F7BA 1N3XA 4GL8A 1Y1MA 4M1VA 2Q9TA 5I57B 2D5WA 3PUXE 3EF7A 2GHBA 1DPPA 1M5CA 1IIWA 1YAEA 1B05A 3CFLA 4NF4B 4NEDA 1ZIUA 3UGWA 1QULA 4O3BA 1NFTA 3LR1A 4EXKA 3O6HA 2X26A 3MC2A 4LUBA 3S9MC 1P1WA 1B40A 2X7QA 4U4XA 3C35A 1HSEA 1POTA 4LVQA 3MQ9A 4GQOA 2DE4A 3DLNA 2RKMA 1TWYA 3TODA 2I58A 1LAFE 2V84A 2W7YA 2O1MA 3DELB 3UP9A 4MFIA 5FHMA 1MDQA 2PVUA 4GVOA 3U72A 4H5FA 3H6TA 5HBCA 2XX8A 5KCJA 4FORA 3M3LA 4L17A 1B4HA 1XOCA 4OEVA 1DSNA 3DM0A 4EQBA 4UACA 3TUSA 1B52A 1R6ZA 3ZKLA 1FQAA 1ZLQA 4WKMA 1B7HA 3SEVA 4AB6A 1QVSA 2HXWA 1MDP1 4BLAA 3C36A 2UVJA 4JDFA 2DYXA 4QHQA 3FVGA 4RY1A 4OQOA 3FVNA 2CMOA 4N07A 3LUYA 1DMBA 3M8UA 1B3HA 1N7WA 3OO7A 1ZMGA 1USYE 2XXPA 3KN7A 3S9NC 5CMBA 1WODA 3IR1A 2KLFA 1IQ7A 4ZZEA 1FQFA 2Y7PA 3C32A 1MH3A 4C1UA 3T22A 2ZYKA 1XVXA 5I56A 3FVKA 3FXQA 4F1UA 3K6WA 1PEBA 1FQBA 5DTBA 3PMXA 3Q28A 3HCQA 3SERA 3O97A 2OCUA 2F7AA 5H8FB 5KCJB 5JTYA 4LA9A 3H06B 4JWYA 5KDTA 2PMSA 4OMBA 1B1XA 1QKAA 2HFBA 4YKKA 1SYIA 2H4IA 4YKJA 2DWIA 1DPEA 2XXHA 3M3FA 4F3SA 4JB7A 2B3BA 4JWOA 3EN3A 4YAHX 5DVJA 1UTBB 1AH5A 3ODBA 1B9JA 4QSCA 2DXRA 1JNFA 1UIVA 4AB5A 3ONMA 1M5FA 3OO6A 2UVGA 4IB2A 2AIXA 3KJTA 1QUIA 3D4GA 1Y3QA 3MVWA 4BDOA 2DP8A 3FXRA 4E0XA 3I3VA 1UIUA 1OQHA 1MG1A 4EF2A 4F3BA 2O84X 3KN3A 1JVYA 2QS3A 3FJ7A 3N26A 3TZAA 5AA4A 2F35A 1B4ZA 3G3IA 2PX1A 3TKDA 2I3WA 4F1YA 4C0RA 4KYDA 4IO6A 4YB7A 3RT8A 3TEPA 1P1OA 4TQUQ 2DS9A 3TQWA 4Q0CA 3JZJA 2OLBA 1RYOA 3MW0A 4HW8A 2I4CA 2Y7KA 4XKPA 5B7DA 3DP6A 3N5LA 3CR9A 3O66A 2X7PA 4R2FA 5JTYB 4ZECA 5KDTB 2XXRA 4ZEDA 4GIZA 5DEXA 1B0LA 2YPNA 3OMBA 1XS5A 2Y7WA 1MRPA 2UYEA 3TTMA 4ELQA 4H8IA 4IO4A 1URSA 3SEXA 4ISUA 3VVEA 4F19A 2FNCA 4NMYA 2ALUA 3IOWA 3MVXA 3KJ7A 1GVCA 3EPEA 4YKIA 4Z7EA 2I6EA 2ZXTA 3FV1A 4MLVA 2XXWA 5L9SA 1SD3A 3VLUA 5AA3A 3FVOA 4GD5A 4KFQA 5AA4B 2F78A 2QS2A 1M5DA 2F7CA 5J1DA 1YTVA 4BDRA 2NUVA 3CVGA 2QSXA 4H8JA 4WEPA 2I4BA 1USYH 5I2NA 3PD8A 4N6PA 4RXLA 4H5GA 3G3FA 1B3GA 5CMMA 5ISUA 2V3TA 1H45A 1A54A 1JW4A 3LC8A 2ZNSA 2XXTA 4OESA 1GTKA 1I6BA 3V5AA 5M2VA 4X1BA 4OXVA 3FXUA 3EHTA 1NNKA 5DEXB 2O68A 5L8DA 2Z23A 3Q26A 2F6PA 4ZDMA 3Q29A 2F36A 3T9XB 4IO2A 3IORA 4GXAA 4OERA 4F2QA 2XX9A 3HPIA 5H8QB 3RN8A 4OTEA 3RUMA 3QUFA 3A3CA 3VV5A 1TFAA 3QXMA 2Y84A 2THIA 5K2YA 2H99A 3VVFA 4YB6A 1M5EA 2UVHA 1O64A 4U21A 4G68C 1OMPA 1JVXA 2HQ0A 3AXFA 3FJMA 4U1OA 2HZLA 4OHNA 2Q2CA 1US4A 3BKIB 4KPTA 2E0SA 5A5XA 1SYHA 3IO4A 3IK6B 5CI5A 1MXXA 4GLIA 1EZOA 2B3FA 2H9BA 3TTRA 3TFLA 2ONSA 1LAXA 3SKPA 3TDJA 5CRYA 3HHFA 1ELJA 3O2AA 4R6YA 1I6AA 4XTCQ 1SW4A 2PYYA 1D9VA 1QW0A 1SW2A 2Q2AA 3H6WA 1P99A 3LSXA 4R9FA 1CE2A 2ZYOA 2FA7A 3K1NA 2Q8JA 4OETA 3K6XA 1SDXA 2I0BA 2VOZA 3DP8A 2UVIA 1B5HA 1MXUA 1XT8A 1PC3A 3IOUA 3FV2A 1I6QA 4RPNA 3O29A 3PPRA 5IKBA 2RINA 4RA1A 1TT1A 2A5SA 4EQ9A 4OFJA 1GV8A 2NXOA 2NVUB 4X9TA 1O7TA 4H67A 2PT1A 5KZTA 1ATGA 2DOJA 3GBAA 4WXJA 2R6GE 4MF3A 3C31A 1B3FA 4POWA 4YZZA 4F1VA 4PQJA 2H25A 1Y1ZA 2O69A 3SETA 1EH3A 4HTGA 2V3QA 1FQCA 3L6GA 4GL0A 3W9WA 1OVBA 4F3PA 1MQJA 1SBPA 3H6UA 4DXUA 5TPAA 1MXWA 4F39A 4U4SA 3O6IA 3EHSA 1RYXA 4HCYA 4MH5A 4RK9A 4G68A 1B3LA 4OENA 3MBPA 3TCFA 4ELRA 1SVXB 3U1OA 1PB8A 4PFTA 4LONB 4G8HA 1QUKA 4RYAA 2G93A 3FASA 4QSDA 1VFEA 4RPOA 1J1NA 5H8HA 4NWDA 2XX7A 1URDA 5I2KA 5JEIA 4IGRA 3OSQA 1NKXA 4IO5A 2IEEA 3IB0A 3PPPA 2QS1A 2UYFA 4LP2B 2DVCA 1MQDA 2DWAA 3TTKA 3PMVA 1S9TA 3W9VA 3QSLA 4Q30B 2XXUA 4DE8A 3PPNA 2D21A 4KQPA 5ITPA 1P1NA 5F7VA 3IAZA 2G29A 2QRYA 4KCCA 3KN8A 1POY1 5TPAB 4R6HA 4QFOA 3V83A 3QAXA 3ZKKA 2ABHA 5ITOA 1IXHA 3GZGA 3OENA 4P0GA 2WKYA 3PUVE 4ZEFA 4G68B 5FHOA 4YU0A 1MPCA 3U92A 4YMBA 2I3VA 5HPQA 5DVIA 1IUDA 1MM6A 4G77A 4Q8RA 4EF1A 1R9QA 2OK2A 4XKRA 3RGYA 5H8HB 3THIA 2XXIA 4LZ8A 1EU8A 3RT6B 2Z8FA 4I9DA 3IJXB 5AE4A 4YB5A 3G3JA 2OJTA 3K00A 4PFYA 1LAGE 1TFDA 5EYFA 3R26A 1GGGA 1R9LA 4EUOA 1NMUA 3KSXA 4KD5A 3O6GA 4BDNA 2XXYA 1D4NA 3K1PA 4GOTA 4JSDA 3EQ1A 2GH9A 3S9EA 3CG3A 3FD3A 4FEDA 3TAJA 1MS7A 1O63A 4R9GA 3KOTA 2QPQA 5CBSA 3TQLA 1MPDA 3MZBA 3SDFA 3IB2A 3T9VA 4G8MA 1FCKA 4RNSA 2O51A 3GLBA 2AL4A 1NH7A 4PFWA 1LB9A 1IXIA 4FATA 3GBBA 3Q25A 3TCGA 3QYTA 5I56B 1FTOA 4MBPA 4GRKA 3B6QA 1FW0A 5I59A 1B1HA 1MXYA 3M3KA 3FJGA 1A99A 2HAUA 2HCAA 4LZ7A 1B3EA 3A3UA 4BDMA 3L6HA 3OEMA 4BDLA 2QJEA 2M8CA 3SEYA 3R7XA 1LBBA 1JW5A 1JEVA 3KGCA 1A40A 4NTLA 3E3KA 3FZVA 4DZ1A 4IY5A 3PMWA 1DTGA 1NH8A 2I48A 4LQ5A 3MJNA 1IZ1A 2I49A 3GXAA 3EHUA 1NNTA 2PBWA 5BWJA 3VLWA 3OXNA 4LZ5A 3USDA 3SEWA 4XKNA 1BLFA 2Q89A 3ZS6A 2REJA 1JETA 3Q27A 1A55A 3U94A 3TYHA 2BJJX 1PB9A 2VHAA 4QFKA 5ICQA 2VP1A 4OFOA 1VFDA 5AA2D 4DIGA 2DWJA 1Y4TA 2RC7A 1PBQA 5I59B 3N6UA 3TTNA 1OQGA 4G4PA 1P1UA 1WVJA 1XVYA 5H8NA 1D9YA 1URGA 5K2XA 1PB7A 3MVZA 1MQIA 4QF9A 1HSJA 2FYIA 4ND9A 2ZYNA 3E9XA 4IGTA 2Y7RA 2CZLA 3P7IA 4NF8A 4TOZA 4ZZAA 1MPBA 1YCJA 3VXCA 2V3UA 3G7WA 3MPLA 1UTHA 4UA8A 3TCHA 1OIBA 2REGA 3CI8A 3K1MA 3WAFA 3MVYA 4R6KA 4GXSB 1A8EA 2V25A 2Z8DA 5L9MA 5CMCA 2ESNA 1B7UA 2F6GA 4ZEBA 2DWHA 3E4RA 1EZ9A 4X48A 1VE4A 3VLVA 1LB8A 1B51A 3CFZA 4DCXA 5I57A 3FUZA 3RLFE 2HEUA 4THIA 4ZE9A 5I2NB 5HM4B 2ONRA 4DLDA 2F8DA 5DVFA 2ZMBA 4F2OA 3H4ZA 4FJPA 3SEUA 5H8NB 3T9UA 3RPWA 1Z7ME 3V89B 4DDDA 4ZEKA 5EHSA 2P2AA 3PPOA 1IEJA 4F22A 3B7DA 4OYVA 3W15C 3ILUB 3C34A 4QFLA 4RK2A 3ILTB 3UN6A 3KEIA 5CM6A 1EZPA 1UTHB 3K4UA 3CG1A 3OOAA 1Z7NE 1H76A 3K01A 2DE3A 2E1SA 3RY3A 1MXZA 1F9BA 5LOMA 2H5YA 4NF6A 1MY3A 4R74A 4XKQA 1B46A 2NWJA 1Y20A 3OELA 2O6AA 2Z8EA 4JSOA 4ECFA 3B6WA 2IA4A 3LSLA 3UK4A 3IL1B 3PUZE 4YKPA 3JV9A 1SQYA 2OBGA 3C9HA 5A5XB 4IO7A 2DVZA 1LCTA 1MQHA 4U1ZA 1S7YA 1VR5A 1LFHA 3TTLA 2QL3A 1AIVA 2RCBA 3A09A 1L5TA 3JYRA 1KWHA 4PE5B 1JQFA 3PUYE 3QIMA 1MQGA 2GRVA 1AL3A 3QK6A 4OZ9A 2F97A 2GHAA 4QFPA 4G2ZA 1AOVA 2A5TA 3B6TA 1B0HA 2QS4A 3VXBA 3U93A 3G3KA 1LLSA 1MY4A 4DXCA 1SW5A 4Z0IA 1A8FA 5FHNA 3IX1A 1P1QA 4JWXA 4OVJA 3MWBA 3RTFB 1OLCA 3KBRA 1BTJA 4H0WA 4QFNA 3HHGA 3F11A 4JBZA 3MZ9A 4ELPA 3KG2A 2GFEA 3KOSA 2AYSA 4KI0E 4DCYA 2DSFA 1D3KA 4EXLA 4YMAA 5CC2A 3K0VA 5H8SA 4NF6B 2ONKE 3UA8A 1N04A 5H8FA 2QMWA 1ZKBA 2HZKA 3LBSA 5DYHA 1Q35A 1MY2A 3IO6A 3MUQA 3VVDA 1B5IA 2VD3A 3TELA 1OLAA 1UTBA 2DXYA 2ZNTA 1LBCA 4FECA 1N84A 4F29A 5FTIA 5AA2A 3MZ1A 5I84A 4ZE8A 4E0WA 3K02A 4DXBA 4ZS9A 3IB1A 2O7UA 1Y4CA 2A5TB 4YICA 4G8NA 3OO9A 1FTKA 3KSJA 1CB6A 3T93B 3KZGA 3RTWB 3MP6A 4U22A 4I8CA 2RF1A 3RQTA 3CRBA 1HSLA 3LSWA 3MP1A 5I2KB 3O28A 2VD2A 4I62A 4N13A 2RC8A 3HSTA 2NOOA 2UXAA 3PV0E 1ZTYA 2HAVA 1MY0A 2PT2A 3MAMA 2RCAA 3N6TA 4PETA 1MXVA 4OWDA 4IO3A 1DOTA 4EDPA 2P0SA 1N0TA 1IITA 4WEDA 4KR5A 1IXGA 1FQDA 2F34A 1TXFA 5L9OA 4MLQA 4X1DA 5FTHA 5TP9A 3DP4A 4F31B 1OVTA 5ICTA 3SESA 1B6HA 5AA2B 3PPQA 2VGQA 2RC9A 4XIGQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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