4FATA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Functional analysis of a novel positive allosteric modulator of AMPA receptors derived from a structure-based drug design strategy.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 91
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA02
3KN8A 4FEBA 3RPWA 4R74A 4Q5TA 4NF6B 1VSOA 1YTVA 2A5TA 3OO6A 2UVGA 4WXJA 1NH7A 3MJNA 2NXOA 1N7WA 1BTJA 1GGGA 2PT1A 1B52A 1UTHB 1Z7ME 5I58A 3SEWA 1HSLA 2NWJA 5EYFA 3RLFE 4FORA 1MQHA 3IOVA 3K1PA 1NKXA 1AIVA 1FTJA 2RF1A 2XXWA 5HBCA 3KG2A 1A7LA 4MLVA 1N04A 1N0TA 4OEUA 2V3QA 4OZ9A 4C0RA 4R9GA 4IO7A 1DTZA 5AA2B 3CSBA 4NE4A 2G29A 4GL0A 1T0KA 4IO2A 3H7MA 1JW1A 1ZJLA 1AOVA 1TWYA 3QUFA 4R6HA 2PX1A 3R6UA 3RQTA 2XXUA 4QFNA 3TPAA 3CRBA 5F1QA 1N7XA 3N26A 1Y1ZA 5DVJA 3TKDA 5K2XA 3TYHA 1B3HA 1P1NA 2CMOA 3OMBA 2DYXA 1B3LA 3LR1A 1EU8A 3MVXA 3C33A 3N6UA 2DOJA 5I56B 2F6PA 3ODBA 2RCBA 1Q1KA 4LZ8A 3TCHA 3H6UA 2XXHA 1HSJA 1QUKA 3SERA 5J1DA 3HCQA 2E0SA 4NF4B 4NEDA 2RKMA 4XKPA 2ZNUA 2VD3A 2AIXA 4NF5B 1LFGA 3RUMA 4UA8A 2X7PA 4OENA 4F3GA 2WKYA 4JWOA 2QS2A 1H45A 2ESNA 3PUWE 2DXYA 1ANFA 1IXCA 2Z8EA 5AA1A 2HZKA 1B7HA 4DDDA 2R9JA 1IZ1A 3RNNA 3HO7A 5H8HB 4XXUA 2OWSA 1XHYA 2R6GE 1QKBA 3IB2A 3FJ7A 4RK9A 3UP9A 2UXAA 4DIGA 3PUZE 2O6AA 1IITA 3DP8A 3RGYA 4LA9A 3PPPA 3G3FA 1XVYA 2XD2A 2F35A 2I3VA 4IB2A 1MQGA 3G3JA 4F1YA 1D4NA 3PMXA 3N6TA 4X48A 1GTKA 4I8CA 1S50A 3D4GA 4MLQA 2I3WA 3Q26A 4C1UA 2QPQA 4GLIA 3MVYA 1A55A 5KCJA 3QUJA 3ZSFA 3CR9A 4X9TA 1Y4CA 2M8CA 3SEXA 3LC8A 3BKIB 1DSNA 4P11A 1NH8A 4F3PA 1ZLQA 4N07A 4GIZA 4QHQA 5H8QA 1BLFA 4RPOA 4O3AA 1DMBA 4AB5A 3K4UA 3VLWA 2ZYKA 4YAHX 1YCJA 4P0IA 4LUBA 4OFLA 4ZECA 3QSLA 4LZ7A 3HV1A 1B2HA 2Y84A 4BLAA 1FTLA 3DP4A 4QSEA 3FVGA 1MXZA 2UVJA 2ZYOA 1OMPA 2HQ0A 4JB7A 2RC7A 3I5OA 4OERA 1R9QA 1EZ9A 1MG1A 1CE2A 4F29A 4X1BA 1H3DA 2DWHA 1A54A 4POXA 1NNFA 1LBCA 4FIMA 3PV0E 4FAJA 5I57A 3V5AA 2GRVA 3C36A 4TQUQ 3TTKA 1IUDA 4H67A 4RYAA 4N6PA 5DT6A 2ZNTA 5CC2A 1MXXA 1B7UA 4QFPA 3RN8A 3LSWA 3MVWA 4XKRA 1URSA 1UIUA 3K1NA 1FCKA 1DPPA 1MXVA 2ZNSA 3S9LC 4EXLA 1M5CA 3O6GA 5IAIA 5I2KA 2D3IA 5I2NA 3FV2A 4OESA 2B3BA 2VHAA 3PMWA 4RY1A 4JWYA 3H6WA 5CMMA 4EXKA 4O3BA 2ZMBA 4QFLA 4U1OA 1ZU0A 1B1HA 2ONRA 5FHOA 4K3FA 2RINA 1LAGE 3PPOA 2F34A 4F18A 2ONKE 1TT1A 1JQFA 2HXWA 1AL3A 3MVZA 2QS4A 4MH5A 3KOTA 1URDA 5EHSA 1B1XA 4H1XA 2OWTA 3QYTA 1R6ZA 4IO3A 4RJZA 3T9VA 5A5XA 3W15C 3T9UA 2BJJX 1Y3NA 2O1MA 5ITOA 5TP9B 3PU5A 1BIYA 5AA3A 4DLDA 4NMYA 4R6KA 3FGSA 1I6QA 3U92A 4Z7EA 3KBRA 4YB7A 1B5IA 1GR2A 3SDFA 2IA4A 1VE4A 1OQHA 4BDOA 3O29A 3H3GA 3GBAA 5KCJB 1XOCA 4GRKA 1N84A 1QULA 1MY3A 3DLNA 2I48A 1TFAA 3EHSA 3MWBA 4YB5A 1S7YA 1B58A 1JEVA 2THIA 2UYEA 2QS3A 3PUYE 3K02A 3LSLA 4R75A 3DP6A 2XXIA 3O2AA 3JZJA 2B65A 1M5EA 3FJMA 3FVNA 1MY2A 1JVXA 2QS1A 3E3KA 3ZKLA 2QSXA 1QW0A 4FE8A 1A40A 4GXAA 4OXVA 4GOTA 3MAMA 4G68C 4F31B 3EQ1A 3VV5A 3HHGA 3VXCA 4TOZA 3QAXA 3GBBA 4ELPA 1MDP1 1B5JA 1LGBC 3T93B 2VP1A 4RXLA 3LUYA 2HAUA 4PFUA 4XKNA 3RY3A 3LSFB 4KCDA 1MDQA 4L17A 1N3WA 5DVIA 5L9MA 2Q9TA 4E0WA 1B40A 2OCUA 2YPNA 4OWDA 5TPAA 5I57B 5HPQA 3CVGA 5DEXA 4WEPA 5F7VA 2V3TA 3OEMA 4THIA 5ISUA 4PQJA 5I59A 3OO9A 3C4MA 3WAFA 4JDFA 3PUXE 3B6TA 1JETA 3KFMA 5H8SA 1VR5A 1MXWA 4GL8A 2H98A 3E9XA 3Q29A 4R2BA 3CFZA 4NF8A 4RK2A 1CB6A 3ZS6A 2Z23A 2ANJA 5CMCA 5I2NB 4NTLA 2XXPA 3MZ1A 4E0XA 4H8IA 3E4RA 4PFTA 1SD3A 3T9HB 4NWCA 1B05A 3KOSA 3V83A 1PB9A 1UTBA 5JTYB 3UORA 3QK6A 4BDRA 1M5DA 3B6QA 3CIJA 4U22A 1TFDA 5CMBA 5EHMA 3M3KA 4MF3A 1LFIA 4KCCA 2QJEA 3KN3A 4N13A 4F39A 2OBGA 2DP8A 3G3HA 3MW0A 5A5XB 4G68A 3Q28A 2GHAA 4YICA 4F3SA 3N5LA 4IY5A 2AL5A 3VE1B 4GVOA 1FQDA 3WAEA 3U72A 1M5BA 4DZ1A 3H4ZA 1IXIA 1SI1A 4KPTA 3VFJA 1JEUA 1B9JA 2I6EA 1JW4A 4YMAA 2D5WA 5AE4A 1IIWA 2A5SA 3K6XA 1ZTYA 3C31A 1DTGA 5ITPA 3IL1B 2XXRA 3JV9A 4KQPA 5CBRA 1OLCA 4MBPA 1JVYA 1POTA 2O69A 3FVOA 3M8UA 1FQBA 3USDA 1LCFA 4OEVA 4LQ2A 3W9WA 4X1DA 3TQLA 4GFRA 3K0VA 3PPNA 2QL3A 4ZE8A 3U94A 1MXUA 3UK4A 2CZLA 2Q88A 3EHUA 2X7QA 4OFJA 1NNTA 4IGTA 1MQDA 3TELA 3FXRA 1SQYA 1R9LA 4TLMB 5AA4B 1SW5A 3PPRA 4R9FA 1QJMA 3G3IA 1LAXA 5KDTA 3K2DA 4GXSB 3GXAA 5I84A 3QXMA 4AQ4A 4R73A 1NNPA 3PUVE 3UIFA 1XT8A 2A5TB 4AB6A 2DWJA 1LBBA 2ONSA 1YPNA 4LATA 4U21A 4DCYA 1A8EA 5IKBA 1M5FA 1B46A 4IO5A 2V84A 4IGRA 3EHTA 4OVJA 3FJGA 5I58B 3HHFA 2RC9A 2I0CA 3A3UA 3KN7A 3GZGA 1IEJA 1Y20A 4EF1A 4YKKA 4QRZA 1AH5A 1FQCA 1II5A 1I69A 3D4CA 3IAZA 5L9OA 1Y3PA 1TXFA 3TFLA 2Q8JA 3FXUA 3MC2A 5FHNA 1UTBB 4YZZA 1UQWA 4U1ZA 1MPDA 3G3GA 1I6AA 4F2OA 3F11A 2RC8A 2PT2A 3H6VA 1EZPA 3I3VA 2H9BA 4RPNA 1MXYA 4G68B 1MM7A 4XIGQ 3Q27A 3HSTA 3GLBA 4OQOA 3OENA 1BP5A 3VLVA 4LP2B 2V25A 1B3EA 1FTOA 4OTEA 3IR1A 3RT8A 4IO4A 2AL4A 1YAEA 2FA7A 5B7DA 3P7IA 3TUSA 4IO6A 4GF8A 5FTHA 4IY6A 2Q2CA 3PMVA 4LONB 4ZEFA 1FTKA 4GWOA 3TQWA 3VVFA 3ZKKA 4Z0IA 3IORA 1PC3A 2UYFA 5CI5A 2Z22A 3BBRA 4KFQA 1D3KA 5CM6A 1Y3QA 3VVDA 1B6HA 5ELVA 3PPQA 1LLSA 2DWIA 4F2QA 4EQBA 1LAFE 2QMWA 1UTHA 5H8NA 3M3LA 3KZGA 2ZYMA 4ELOA 1QVSA 4G2ZA 1MPCA 4ZEBA 4DXUA 4YMBA 3FV1A 1PB7A 3R7XA 4QF9A 2DS9A 1JW5A 2XXTA 5KDTB 3PD9A 3H03A 1FW0A 3MP6A 4F1UA 4DXBA 3L6GA 2X26A 4HCWA 1SBPA 2AYSA 4H5GA 2F78A 2H25A 2XX9A 2H99A 1P1OA 2H5YA 1GVCA 1PDAA 4ZE9A 5DTBA 3DELB 5I56A 3MBPA 3T96B 2GH9A 3LBSA 2P1SA 2YJPA 4LQ5A 4HCYA 4DE8A 3TCFA 2HEUA 4H8JA 4EDPA 4NF4A 3SESA 3O6IA 1B0HA 5L9SA 3SEVA 3IJXB 4PFYA 1P1UA 3C32A 1MS7A 4JXIA 4ELRA 3S4UA 1I6BA 2PBWA 2V3UA 3SEUA 1Y9UA 2IEEA 1EZOA 2Y7WA 4NF5A 2REGA 4H0WA 3SEYA 2I0BA 2O68A 1POY1 1USYH 3BFTA 3C9HA 4PE5B 5H8QB 3TTLA 3H06B 4DXCA 4ND9A 4YB6A 2UVIA 1NL5A 4BDQA 1PBQA 1B3FA 3FZVA 4GQOA 3MPKA 1H76A 2Z8FA 4Q30B 1ELJA 2GFEA 1UIVA 1NFTA 1FQAA 4I62A 3SETA 1L5TA 3MZBA 3R26A 1O64A 5BWJA 2PVUA 3TDJA 1ZKBA 3S2VA 4JWXA 3O6HA 5CBSA 2XD3A 3EN3A 3KJTA 3Q25A 1A99A 1MH4A 2W7YA 2I49A 1URGA 1EH3A 1MY4A 4POWA 4QFKA 5M2VA 2XXQA 1OIBA 1MRPA 4MFIA 4U2RA 3KSXA 4P0GA 3FVKA 1Y4TA 3TTRA 3QIMA 5FTIA 4YKIA 1VFDA 4ZDMA 1KWHA 5H8FA 4HTGA 2NOOA 1GV8A 3VVEA 5I2KB 3O97A 5H8NB 3VXBA 1RYXA 4LVQA 2F36A 1O7TA 2HFBA 2HCAA 2V93A 5AA2D 2I4BA 1MH3A 4I1DA 4R2FA 4M4GA 3THIA 2REJA 2F7BA 2XHDA 4KD5A 3MP8A 4G8MA 4RA1A 3TEPA 4KI0E 3FATA 1NNKA 4H5FA 2F7CA 4YU0A 1XVXA 1IQ7A 3FUZA 3IO6A 3OO8A 2Y7KA 3T66A 4F1VA 1B4HA 4KYDA 1RKMA 3TZAA 4ESWA 2DQVA 3EPEA 1B4ZA 1F9BA 4BDMA 2OJTA 3K6UA 3UA8A 4R72A 4KYEA 2UVHA 5ICQA 4ZS9A 2F7AA 1OVBA 3OOAA 1N76A 3K00A 3OXNA 5K2YA 3CI8A 1NMUA 4F22A 3H6TA 4ISUA 4G77A 1B5HA 3K01A 2E1SA 1ZIUA 1B7ZA 4U4XA 3ECRA 4ECFA 4QSCA 2F8DA 1R1NA 2XXYA 4F3BA 2QMXA 3IOUA 3OSRA 3EF7A 3IX1A 5HM4B 3O66A 3I6VA 1WVJA 4BDNA 2P0SA 4TLLB 4YKPA 1USYE 2Y7PA 4OFOA 3VDFA 2O1LA 1DOTA 5TU0A 2D21A 4H6DA 4KHZE 3SKPA 3KJ7A 4KYSA 4Q0CA 2O7IA 2DVCA 1US4A 4G8HA 2R71A 3FIRA 2XX8A 3KEIA 3ONMA 4OHNA 4ZEDA 4HW8A 5JK4A 1N3XA 3VLUA 2HZLA 3A3CA 5TPAB 3N94A 3S9MC 1D9VA 3KSJA 1QKAA 3S9NC 4PETA 5DEXB 4OMBA 1IXHA 3W9VA 1MY0A 4JSOA 4R6YA 1QUIA 5I59B 4ONYA 1SI0A 3IOWA 4G8NA 5JEIA 5TP9A 5DYHA 3RT6B 1Z7NE 2Q2AA 2F6GA 3IB1A 3CG1A 5H8FB 4EQ7A 2NVUB 4QFOA 4NF8B 2VOZA 1P99A 4XKQA 1SYIA 4PFWA 3TCGA 2KLFA 1LB9A 3S9EA 3OO7A 2O7UA 3OEKA 2XX7A 4ZZAA 3TAJA 3O9PA 2B3FA 1PB8A 4FECA 4RNSA 4XTCQ 3TODA 5CRYA 2PMSA 4C1TA 3TMGA 4ZEKA 4FEDA 1JNFA 2RCAA 2ZYNA 3U93A 5DVFA 1B51A 5BUUA 4GD5A 2OK2A 3FD3A 3UN6A 1QUJA 1D9YA 1MM6A 1US5A 3RTFB 1H43A 1Y1MA 2HAVA 4OETA 2F97A 4YKJA 3U1OA 4EUOA 4HS7A 1WODA 4DCXA 1OVTA 3MUQA 1SYHA 3G7WA 3BFUA 4I9DA 3T22A 2FYIA 3V89B 2DSFA 4ZEIA 1IXGA 2DE3A 3LSXA 1BKAA 3OD7A 2DE4A 2XXVA 2VGQA 3V8XB 3ILUB 3DM0A 2LAOA 2OZZA 3OSQA 2Y7RA 4UACA 2GHBA 3KGCA 1SW4A 1B3GA 4EQ9A 4NF6A 3U8QA 2OLBA 1O63A 3ILTB 1FQFA 5ICTA 4O3CA 3TTNA 3M3FA 3B6WA 2DWAA 4EF2A 2QRYA 3MZ9A 3CFXA 2NUVA 1S9TA 3O28A 4U4SA 3K6VA 1J1NA 2XXXA 1MQIA 3FXQA 1OLAA 1DPEA 3JYRA 3C35A 1HSEA 1MQJA 1FTMA 2O51A 3PD8A 3L6HA 3A09A 1ZMGA 1AMFA 1SW2A 1B32A 4BDLA 1MPBA 1XC1A 1Q35A 2Z8DA 3K1MA 5AA2A 2F5XA 3HPIA 3G3KA 2DXRA 2Y7IA 4OYVA 3K6WA 2ALUA 4ZZEA 1A8FA 5JTYA 3E13X 3AXFA 3IJOB 5FHMA 1LB8A 2H4IA 4FATA 1FQEA 2VD2A 1ZBMA 4KR5A 1PEBA 5CMKA 1LCTA 4H65A 2Q89A 3TTMA 4LZ5A 1XS5A 1P1WA 2I58A 4WEDA 1RYOA 5B70A 1SVXB 3IOTA 1PBPA 3IK6B 3CG3A 1P1QA 2DVZA 4NWDA 3MQ9A 3UGWA 5LOMA 1SDXA 4M1VA 3IO4A 3PGFA 4F19A 3IB0A 2YLNA 2PYYA 2G93A 1OQGA 3RTWB 3CSGA 3B7DA 2O84X 1LFHA 4U23A 1B0LA 4G4PA 5KZTA 4FJPA 3HN0A 2I4CA 5H8HA 5L8DA 3MPLA 4Q8RA 2FNCA 3C34A 1MY1A 1H44A 4PP0A 3T9XB 2DE2A 4ELQA 3OELA 3FASA 2ZXTA 4JSDA 2P2AA 3MP1A 4JBZA 4QSDA 1SW1A 4ESXA 1ATGA 5AA4A 1LSTA 1WDNA 1LAHE 2ABHA 1VFEA 3CFLA 4WKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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