4FATA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Functional analysis of a novel positive allosteric modulator of AMPA receptors derived from a structure-based drug design strategy.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 91
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA02
4NF8B 2ZNTA 1SD3A 1B5HA 3H6TA 4FJPA 4XKNA 1QUJA 2ONRA 5CBSA 5AA2D 2DE2A 1SVXB 3F11A 4HTGA 1RKMA 3GXAA 1SW5A 2OBGA 2HZKA 1LAHE 4DXUA 2I3VA 4F19A 1VSOA 5KDTB 4Q0CA 4KPTA 1H3DA 3I6VA 1Y3QA 3IJOB 1URDA 1M5BA 3MJNA 4WKMA 3PPRA 3U8QA 1Y20A 3W15C 3OELA 2RKMA 2VHAA 3LR1A 4OFLA 5I58B 5H8SA 2F8DA 4ELPA 1CE2A 3MVYA 5CBRA 3S9MC 1SI1A 1XOCA 4WEPA 4ZS9A 4U21A 4I62A 1I6QA 4DIGA 3DM0A 1IQ7A 2PMSA 4KD5A 4I8CA 3IOVA 4EF2A 2FNCA 2F7BA 4U22A 2REJA 3TQWA 3TPAA 3QK6A 1KWHA 3HCQA 3Q27A 1ZBMA 3I3VA 1EH3A 4OWDA 2ZNSA 4ESXA 2Y7PA 4QSEA 2DS9A 2F7AA 4GXAA 4BDLA 1QVSA 5TP9A 2DWHA 3LUYA 2Z23A 4QFNA 3UN6A 4C1UA 4AB6A 4GRKA 2G29A 1PEBA 3QAXA 5KCJA 4F3BA 1RYOA 2Y7WA 3SEVA 4MF3A 1P1UA 1POTA 3SEXA 3RQTA 4OFJA 1JW1A 1YPNA 2VOZA 3K00A 1TXFA 2DE4A 5DVFA 1FQDA 1EZOA 3KOTA 4IO5A 3HO7A 4OERA 4H1XA 1T0KA 2XXTA 2DSFA 3U92A 1QULA 1D9VA 3VVFA 2NOOA 3SDFA 2VGQA 1SYIA 4QF9A 4AQ4A 4LUBA 3KSJA 3SEWA 4EQBA 3PV0E 1BKAA 3JZJA 3IO6A 3T22A 3O6GA 1ZLQA 2AL5A 5HBCA 4RJZA 3V89B 2RC9A 4G8MA 4R2FA 5M2VA 4YKKA 1OMPA 4C0RA 3TTNA 4RXLA 4AB5A 3H6VA 3E13X 2ZXTA 4F1UA 3SERA 4R9GA 3R26A 2REGA 4U23A 5JTYB 2D21A 1JEUA 3GBBA 4YKPA 1Y4TA 3TQLA 3Q25A 5F7VA 3K02A 1N3XA 3HPIA 5AA4A 4M4GA 5I84A 4RYAA 1BLFA 4UA8A 1LAFE 3SKPA 1R9LA 3IOWA 5TPAA 3TCGA 1MM6A 4PE5B 1B1XA 3TMGA 5H8QA 2ZMBA 4E0WA 5B70A 3EQ1A 4F18A 4ZE9A 2NWJA 1GR2A 2F35A 3U93A 1MPDA 1DPEA 4FEDA 2NUVA 4Q5TA 2QS3A 2X7QA 4H65A 2R9JA 3FXRA 1B4HA 4H8IA 4P0GA 1MH3A 5TU0A 3C9HA 3PD8A 2O7IA 3A3UA 4JWYA 2XX9A 4ESWA 3KN3A 4IO4A 1FTLA 1IUDA 3GZGA 1IEJA 3H7MA 1LFGA 3C31A 2H99A 4EXKA 2IEEA 3WAFA 1IXHA 4G68A 1P99A 3PMWA 4EDPA 3MAMA 4FAJA 1AH5A 3FGSA 4PFTA 2FYIA 4BDQA 2X7PA 1LBBA 4KR5A 3IR1A 1IITA 1OQHA 4H5FA 4NEDA 4H6DA 1VFDA 2CMOA 3PPNA 4OVJA 4X1DA 4GFRA 3C36A 3CSGA 3C34A 1IXCA 3PUVE 5I59B 2X26A 4OXVA 4H5GA 5JTYA 1A7LA 4LATA 1UQWA 3H03A 3OD7A 3FVKA 4OMBA 3T9HB 3M3LA 3R6UA 3M3FA 4K3FA 3MC2A 1MS7A 2Y7RA 4GOTA 5H8FA 1PBQA 3DP8A 1NNFA 5DT6A 2I6EA 2DWJA 2G93A 5JK4A 4QFPA 5ICQA 1R1NA 1A55A 5ICTA 1OIBA 5L9OA 1IXGA 3ILUB 4OETA 4ZZAA 2Y84A 1J1NA 4N07A 1MXWA 4I9DA 5DYHA 1N84A 1B3LA 1US5A 3CIJA 2DOJA 1LCFA 3CSBA 1B3HA 4IY5A 3IORA 1OLCA 3S9NC 1QKBA 5H8NA 4XXUA 3MVZA 4F1YA 4KCDA 5DEXA 2V3QA 4BLAA 2ZNUA 3RY3A 1MRPA 3PUWE 4ISUA 1EZPA 2P0SA 2DVCA 2ALUA 3I5OA 3QXMA 2HXWA 1HSLA 4FATA 4YICA 4DCXA 3MQ9A 1VE4A 1LLSA 3O66A 4HCYA 5FTHA 1Q35A 1IZ1A 4GL8A 4NTLA 5K2YA 4R72A 3OENA 4YB7A 4F3GA 4GVOA 3CR9A 4P0IA 3EF7A 3FXUA 3W9WA 1MQJA 1B46A 1UTBA 3C4MA 1WVJA 3Q26A 3E3KA 3KEIA 1PC3A 1FCKA 4F22A 3HHGA 4ND9A 4NF6A 3T66A 1SI0A 4OFOA 2H9BA 4PFUA 4OEVA 1AOVA 5I2KB 3RT8A 5AA3A 3CVGA 4LZ7A 3TCHA 1CB6A 1B1HA 1Y3PA 4QFKA 4X1BA 2QL3A 4MFIA 4OQOA 3B7DA 1Y4CA 4IO2A 2RC7A 1B0HA 2PVUA 5FHOA 1VR5A 1Y9UA 2XXRA 4F2OA 2Q8JA 4DCYA 3K1NA 4R6KA 2ZYOA 3L6GA 3K6WA 4RK2A 4NF4A 4M1VA 5CMBA 2NVUB 2NXOA 2V3TA 1MXUA 1I6AA 1SW2A 1AIVA 2O6AA 3TFLA 2ONSA 3CFXA 4ELRA 3KN7A 5LOMA 1NKXA 3VLVA 1UIVA 2V25A 1ZTYA 4OHNA 4TLMB 1MH4A 1MXYA 4LA9A 3FJMA 3Q28A 3RGYA 4GXSB 4PFYA 4X9TA 4F39A 2XXXA 3IL1B 3RN8A 3DP4A 3PPPA 5ITPA 4R74A 3T9UA 4G4PA 4KYDA 3IK6B 2I0CA 1WDNA 1TWYA 4QFOA 2I49A 5ISUA 2ZYKA 3RTWB 4UACA 5I57B 4HS7A 1A8FA 4NF5A 5H8HB 1PDAA 3PUYE 2Z8EA 2M8CA 3PD9A 4H67A 1B58A 3KJ7A 3JV9A 1SBPA 1EU8A 1H44A 3LSXA 1B2HA 1NH8A 1FQAA 2Q9TA 4EUOA 4LVQA 2H25A 1D9YA 1JW5A 5I56A 1M5FA 3OO6A 1NH7A 5IKBA 3PPQA 2XD2A 3FV2A 1LFHA 5CC2A 4JSOA 1A99A 1MQIA 1ATGA 2P2AA 3L6HA 4ZEIA 4O3AA 3C32A 2Q2CA 2A5TB 4JWOA 1N0TA 4U4SA 4F2QA 2PBWA 1XS5A 3O2AA 5CM6A 2IA4A 1S9TA 4NF8A 2F5XA 5B7DA 3S9LC 2V84A 3PUXE 2QSXA 4RNSA 3KZGA 4FECA 1MPCA 2OK2A 3DELB 4JDFA 3MZBA 3JYRA 4U1OA 1HSEA 2ANJA 2UYFA 5CMKA 5KDTA 3PU5A 3C35A 5DVJA 4G2ZA 1LFIA 3IB1A 1MY1A 5AA2B 3MW0A 2BJJX 1B51A 3HN0A 3A09A 3UK4A 1B0LA 4YB5A 3SEYA 5AE4A 5I58A 2XXIA 2F34A 1YAEA 3CFZA 2HCAA 3MPKA 3RT6B 3R7XA 3PGFA 1FW0A 3IX1A 1YCJA 3ECRA 3MWBA 3B6QA 5CMCA 5I57A 4I1DA 4ZE8A 4KCCA 4XKQA 4LQ5A 1Y1ZA 4U2RA 2I48A 5L9SA 5CI5A 3G3JA 4R6YA 4RPOA 1PB8A 3CRBA 3QUFA 3S2VA 4DE8A 2GHAA 3H6UA 4Z0IA 4PP0A 1AMFA 4YU0A 1DPPA 2RF1A 5K2XA 3OEKA 4KYEA 4LZ8A 4QSDA 2B3FA 3IO4A 2QRYA 2DP8A 5I2NB 5L8DA 2HFBA 3V5AA 2DE3A 4U1ZA 1UTHB 5EYFA 2XX7A 4QRZA 1XC1A 5CRYA 3TDJA 1SW1A 2OWSA 2H5YA 1LB9A 1XT8A 3N5LA 2P1SA 3HV1A 1QUKA 1MPBA 3WAEA 1MQDA 4IO3A 4GF8A 2O1MA 3ZKKA 2ESNA 2V93A 4R6HA 4EQ9A 1TFDA 1LCTA 1ZKBA 4BDMA 1QW0A 3K6VA 2QS2A 4R9FA 1IIWA 1USYE 4YMAA 3THIA 1II5A 1B32A 3KBRA 3FXQA 1XVXA 1S7YA 2Z8FA 4EXLA 3K6XA 3W9VA 2UYEA 4POXA 2D5WA 3DP6A 1QJMA 5IAIA 5A5XB 1TT1A 3IB2A 3RPWA 2KLFA 2DYXA 4THIA 3OOAA 1JW4A 4LZ5A 1BP5A 4U4XA 3TTMA 4TQUQ 1OVTA 1FTJA 4Z7EA 2H4IA 3S9EA 5L9MA 3T9VA 3ILTB 3IB0A 1I6BA 3KJTA 4JSDA 3CG3A 3G3GA 2THIA 1L5TA 4XTCQ 4EQ7A 2YPNA 2VD2A 3TCFA 4JB7A 3VLWA 2OZZA 1SYHA 3IOUA 1Z7ME 1ZMGA 2XD3A 4OYVA 4YAHX 2QMXA 2Q89A 4GIZA 2XXQA 1ANFA 2I4CA 1P1OA 3M8UA 1UIUA 3U94A 2ZYMA 2CZLA 4DDDA 3VDFA 3A3CA 1AL3A 1WODA 1MXZA 3VLUA 4ELQA 4HW8A 1IXIA 5ITOA 1NNTA 3TODA 4BDOA 2FA7A 1MQGA 4WXJA 2I4BA 4O3BA 2UVHA 2WKYA 3SESA 2O69A 2YJPA 4YZZA 2HZLA 1SQYA 3DLNA 2XHDA 1B3EA 1JQFA 1RYXA 3K01A 1FQEA 1B6HA 2I58A 1B05A 1H45A 3ZS6A 3ZKLA 3RLFE 1QKAA 3EHTA 1MQHA 2D3IA 2UVIA 3KFMA 3QUJA 3LSFB 1GVCA 3Q29A 3H4ZA 4F3SA 4RK9A 4XKRA 1BTJA 4ZDMA 3MP8A 3GBAA 5FHMA 2OWTA 3CI8A 3LSWA 1TFAA 3O97A 3N94A 5JEIA 4C1TA 4L17A 1B7HA 2PT1A 1A8EA 1OQGA 3IJXB 1EZ9A 3FVOA 3EHUA 3VVEA 1FQBA 1N76A 5I59A 2GHBA 2DXYA 2ONKE 3EPEA 5TP9B 3TUSA 2F6PA 4LONB 1MY0A 3MUQA 3K6UA 1B7ZA 1ZIUA 4ZZEA 2B65A 5KCJB 1ELJA 3VE1B 3FD3A 1OVBA 1P1NA 2DWAA 3TEPA 3AXFA 3PPOA 1R9QA 3OO9A 4TOZA 4MLVA 4FIMA 4F31B 1DTGA 5EHSA 1D4NA 4F29A 1US4A 2W7YA 3FJGA 3MVXA 3UA8A 3TTLA 1F9BA 4ZEBA 4H8JA 1PBPA 1M5EA 2RC8A 3G3KA 1URGA 1PB9A 1FQFA 1MDP1 3EHSA 4JWXA 1MG1A 3PUZE 1YTVA 3CFLA 5J1DA 2Q2AA 3K1MA 4FE8A 3VV5A 1LAXA 3O6HA 2PT2A 4LQ2A 2QS1A 2RINA 3TELA 3KGCA 1LB8A 2QMWA 4R73A 3SETA 1A54A 2I0BA 2XXYA 4G8NA 4IO6A 1GTKA 4KI0E 3H3GA 5BUUA 1Q1KA 1B5JA 1LBCA 1GV8A 1A40A 1ZJLA 2F78A 5AA4B 1JVYA 1NFTA 3KSXA 3VXBA 2GFEA 5AA1A 4PETA 4IB2A 3O6IA 5TPAB 4ONYA 4MBPA 3U72A 5H8QB 4ZEFA 1D3KA 2F97A 4ZEDA 5I2KA 2YLNA 1DSNA 3FIRA 1GGGA 4MLQA 3OO8A 4F3PA 3CG1A 4YKJA 3UGWA 1USYH 4DXCA 2O1LA 3LC8A 4DZ1A 2E1SA 1I69A 1DMBA 3GLBA 3N6UA 1JVXA 3BFUA 1O63A 3E4RA 3UIFA 4TLLB 4PQJA 4PFWA 3O9PA 3FJ7A 2B3BA 3KN8A 2I3WA 3MBPA 2O7UA 1B40A 3O29A 1FTKA 2OJTA 4GD5A 2HQ0A 4GLIA 3OO7A 4JBZA 3KG2A 3KOSA 4KQPA 2Y7KA 2F36A 3TYHA 2Y7IA 3PMVA 3FV1A 3BFTA 1P1WA 1XVYA 3G3FA 4G68B 4OEUA 2GH9A 2OCUA 2PX1A 3MP6A 3TAJA 2O84X 1POY1 3FZVA 3FATA 4FORA 4MH5A 1MY4A 3C33A 3UORA 1FQCA 4OESA 5KZTA 4N13A 1S50A 4Q8RA 3USDA 3V8XB 5H8HA 5DTBA 2XX8A 3T9XB 2UXAA 2XXUA 3B6WA 3SEUA 4QHQA 1URSA 1O64A 3U1OA 3K1PA 2A5SA 3D4CA 3H06B 2ZYNA 5H8FB 1LSTA 2HAVA 3FUZA 3K0VA 1DOTA 4KHZE 4H0WA 4YKIA 5CMMA 2ABHA 4GWOA 3HHFA 2VP1A 1B4ZA 4ELOA 1B3GA 3K2DA 3S4UA 1Y1MA 4DXBA 3V83A 1P1QA 4P11A 4POWA 2A5TA 2HAUA 3E9XA 1VFEA 4NWCA 3VFJA 4OENA 1SDXA 1FTMA 3MZ9A 3EN3A 5H8NB 2DQVA 4DLDA 4GQOA 1MY3A 5DEXB 4YB6A 1R6ZA 4NE4A 1MXXA 3QIMA 4XKPA 3H6WA 4RPNA 2V3UA 3OSRA 3MP1A 4KYSA 3RUMA 4NMYA 2DVZA 2AYSA 3ODBA 5AA2A 3MZ1A 3P7IA 1NNPA 4QFLA 1PB7A 4X48A 3TTKA 1H43A 1NL5A 1UTBB 1N04A 4HCWA 1FTOA 1M5CA 1MDQA 3RTFB 1SW4A 3OSQA 3QSLA 4Q30B 4NWDA 5FTIA 2RCAA 4R2BA 4NF6B 2Z8DA 4YMBA 4WEDA 2AL4A 1LGBC 1JEVA 3FVGA 1Z7NE 4E0XA 1B9JA 1B52A 1N7XA 4OTEA 4OZ9A 2GRVA 4RY1A 4GL0A 1HSJA 1NNKA 4KFQA 1DTZA 2F6GA 4RA1A 2QJEA 1NMUA 3K4UA 3T96B 1JNFA 1JETA 3MPLA 3LSLA 4BDRA 1MM7A 4IGRA 2H98A 3MVWA 3FVNA 1OLAA 2Q88A 4NF4B 4R75A 3TTRA 4ECFA 5I2NA 3QYTA 4BDNA 3N26A 3O28A 3OXNA 1UTHA 5HM4B 1O7TA 1MXVA 1N3WA 2OLBA 1H76A 4LP2B 4ZEKA 2LAOA 2PYYA 1N7WA 3VVDA 3M3KA 1B5IA 4IY6A 3OEMA 2XXPA 4IGTA 2XXVA 3RNNA 3OMBA 1BIYA 1QUIA 4ZECA 2DXRA 2E0SA 2HEUA 4O3CA 5HPQA 1ZU0A 3TKDA 3T93B 4G77A 4JXIA 4IO7A 4FEBA 1Y3NA 3BKIB 4NF5B 2RCBA 3TZAA 3PMXA 3D4GA 1B3FA 2R6GE 4G8HA 4QSCA 2VD3A 4N6PA 4F1VA 2QPQA 2XXWA 3N6TA 5DVIA 1M5DA 5EHMA 2F7CA 3G3IA 1B7UA 5FHNA 2UVGA 5A5XA 3FASA 3IAZA 1LAGE 5I56B 2DWIA 2O51A 3LBSA 2R71A 4G68C 5ELVA 2O68A 3G3HA 3ONMA 3IOTA 3G7WA 3ZSFA 1MY2A 3BBRA 2QS4A 4XIGQ 3VXCA 3B6TA 2AIXA 1XHYA 2Z22A 5BWJA 4EF1A 2UVJA 5F1QA 3HSTA 2XXHA 3UP9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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