4FATA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Functional analysis of a novel positive allosteric modulator of AMPA receptors derived from a structure-based drug design strategy.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 91
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA02
4TQUQ 1D3KA 4F3BA 3TCFA 4DXCA 3MVYA 3Q25A 5DT6A 3U93A 1R1NA 1MY3A 3I3VA 2OBGA 3LSXA 2Y7PA 5F7VA 3OEKA 2ZYOA 2ZMBA 3MVXA 1NNTA 1B40A 3R7XA 3MJNA 4KCCA 1JEUA 5DTBA 3H6WA 5K2YA 3G3JA 2XD3A 4IO7A 1P99A 1IXGA 2UVHA 1LAFE 1LB9A 2GHAA 4EDPA 2OZZA 4YAHX 1B1HA 2Y7IA 3TQWA 2QS4A 1JQFA 3PU5A 5JEIA 3PPRA 1D9YA 4ELRA 3QK6A 1I6AA 4R72A 5FTIA 2DE3A 1PB9A 3RTFB 1UTHA 4LUBA 1OQGA 3H4ZA 3Q28A 4U21A 1FW0A 3IO6A 3T93B 3T9HB 2THIA 3G3GA 2O1LA 2ESNA 1VFDA 4RPNA 1LGBC 4O3AA 4ZZEA 1ELJA 2H25A 2F97A 1P1WA 5FHMA 2Z8DA 1TXFA 4PQJA 5KCJA 2X26A 1LB8A 1OVBA 2D3IA 3I5OA 4K3FA 1LLSA 3GBAA 4NF4B 2I0BA 5DEXA 4AB5A 3O6IA 3VV5A 5H8QB 4ZE9A 1NNKA 1Y3NA 3K02A 4ELQA 4U23A 3ZKLA 3EF7A 2CMOA 4H67A 2QPQA 2O84X 4ECFA 4JWYA 2H99A 2NWJA 4I9DA 4IO4A 4YMAA 2F8DA 4BDLA 2ABHA 4ZZAA 1MXWA 4F31B 2A5TB 1S7YA 3E4RA 1MRPA 5KDTA 3OMBA 4N07A 3K1MA 3HO7A 4ZE8A 1EZ9A 1NFTA 3W15C 1GR2A 5DVIA 5AA3A 1USYH 4HTGA 3AXFA 5ISUA 1MPCA 5I58B 1I69A 4G77A 1MPDA 1PEBA 2F36A 1MY1A 2GHBA 1IEJA 1GV8A 1QUIA 2GRVA 3U1OA 4Q0CA 3HCQA 1I6QA 2PT1A 1A40A 1OLCA 1GTKA 3TODA 1B32A 3LBSA 2ZYNA 4ZEFA 1CE2A 3H6TA 2ALUA 4R9FA 3O66A 1HSJA 5K2XA 3CRBA 1KWHA 5FHOA 4F29A 4OHNA 2G29A 2DXYA 4LQ5A 2E0SA 1JW5A 4FAJA 1IZ1A 3CFZA 3PD9A 3TTMA 2PBWA 2XXVA 4ELOA 3KN7A 2F7CA 3IJOB 5B7DA 2F7BA 4IO5A 4QHQA 4EF2A 3O97A 2DYXA 4UA8A 2VP1A 3C31A 4WEPA 4QFOA 1HSLA 1SD3A 1B1XA 3TCHA 1IQ7A 1QUKA 2X7QA 2O7UA 1JVYA 1RYOA 3IOVA 4EUOA 2XXHA 3R6UA 1Q1KA 1TFAA 5CMMA 3HSTA 3P7IA 1Z7NE 3UA8A 2UVJA 4POXA 3K1PA 3O28A 4KYDA 4XIGQ 1ATGA 2O6AA 1NL5A 2HCAA 3RY3A 1PB7A 2KLFA 5JTYB 3BBRA 2NOOA 2H9BA 2XX8A 3K01A 4NE4A 4RK2A 3OOAA 2RC8A 2Q2AA 4MH5A 2X7PA 2HXWA 2V25A 1H45A 3OO7A 4Z7EA 2RCAA 3BFTA 5AA2B 4KPTA 4O3CA 5I57A 2A5SA 1EZOA 2RCBA 2Z22A 2H4IA 2RC9A 3VLUA 1YTVA 4N13A 4OYVA 1TWYA 1XS5A 3EHTA 1Y1MA 1B4ZA 3N6TA 3N5LA 1VR5A 5I2NB 3OO9A 3K0VA 1AIVA 3G3IA 3THIA 1B0HA 1H44A 3OELA 2NUVA 3C35A 1JETA 4G68A 1UQWA 2NVUB 3CIJA 1LBCA 4PP0A 3O6HA 1EH3A 4NF5B 3IB2A 4LZ7A 3BFUA 4M4GA 3MAMA 2Q88A 3PD8A 4JXIA 4R2FA 3MPLA 3V83A 3TTNA 1J1NA 1LAGE 1NNFA 4EF1A 1P1NA 2IEEA 1POTA 1JW1A 2ZYKA 1UTBB 4IY6A 2XXRA 4DZ1A 3SETA 4C1TA 3BKIB 3I6VA 3IB0A 3KN3A 3B6WA 1O64A 4LONB 5KZTA 4POWA 1SI0A 3JYRA 4JSDA 3C9HA 4H5GA 1WVJA 2E1SA 2B3BA 3TDJA 3IAZA 3MP6A 1DOTA 2ONSA 3RQTA 2D21A 2V84A 1CB6A 4YICA 4ZEBA 3VE1B 1N04A 2I6EA 2XXIA 3Q29A 4R9GA 5M2VA 5I56A 1LCTA 4H1XA 1NMUA 3VVFA 5EHSA 1US5A 4XKNA 3FXQA 2M8CA 3RNNA 1PBQA 4GVOA 4IB2A 1ZIUA 3LC8A 3K6WA 4EQ7A 5I84A 1WODA 3B7DA 4PFUA 4E0WA 3O29A 4FATA 3CSBA 2Z8FA 1AMFA 1S9TA 3E13X 3O9PA 1UTHB 1Z7ME 3V5AA 1M5CA 2I58A 5AA1A 4KI0E 3FV1A 4PFTA 4EQBA 3K1NA 1ZKBA 2V3UA 1LAXA 1SYIA 2DVCA 3LUYA 3T9UA 3OO8A 3ZS6A 3TUSA 1Y4CA 5I2KA 3M3LA 2DWAA 4KFQA 1GVCA 1WDNA 5I59B 1JW4A 1H43A 3IL1B 3PV0E 1MG1A 4QRZA 5CRYA 3MQ9A 2B65A 4JBZA 4DCXA 1VFEA 3RN8A 5TPAB 5BUUA 2Z23A 1EU8A 4KCDA 2QS1A 1AH5A 3L6GA 1LAHE 4TLMB 3G3FA 4JSOA 3VDFA 2XXTA 1GGGA 3C33A 3PMVA 4YB7A 4KQPA 2P1SA 4U4XA 4X9TA 5AA4B 4OMBA 5CM6A 3DM0A 1LFGA 1MM7A 4LVQA 5L9OA 3R26A 4DCYA 2DE4A 4ZEDA 1NKXA 1SQYA 5A5XB 5HPQA 4PE5B 3A09A 3ONMA 5HBCA 4GXAA 1MDQA 2DS9A 4LZ8A 4NF8A 3VLVA 1PBPA 4FIMA 4BDOA 3S9EA 2Y84A 4H5FA 3IOTA 4R73A 3OD7A 3KSJA 2FYIA 1N0TA 5F1QA 4YKIA 1R9QA 5CI5A 3A3UA 4YMBA 4NF6A 1B3GA 4IGRA 3KGCA 2AL4A 2LAOA 1HSEA 1MS7A 4YKJA 1IXHA 2XXXA 4I1DA 4OTEA 1M5FA 3WAFA 1BP5A 1B0LA 3IOWA 3GLBA 1O7TA 3FJ7A 3FVNA 1A7LA 1Q35A 3C34A 1LFHA 3FGSA 1A55A 4UACA 4WXJA 3TQLA 2Q89A 1ZLQA 1US4A 3TYHA 3DP4A 1POY1 3U92A 2PMSA 3TFLA 2F5XA 3CVGA 2QJEA 3MC2A 2O7IA 2REJA 4Q8RA 4EXLA 3FVOA 3QUFA 1F9BA 2H5YA 1TT1A 2FA7A 4DXBA 2O1MA 3FD3A 2XXWA 4G8HA 3D4CA 4R6YA 2CZLA 2P0SA 1ZJLA 4OXVA 1B05A 1XT8A 3E9XA 3IR1A 5TP9B 1FQBA 2I48A 4JWOA 3GZGA 3RGYA 4WKMA 2BJJX 3TCGA 4RY1A 3IJXB 4F1UA 3ILUB 1I6BA 1OVTA 3UP9A 3VFJA 4NEDA 4RA1A 3JZJA 1AL3A 1FCKA 3KG2A 2UYEA 4H8IA 2VHAA 2XX9A 4NMYA 2ZNTA 4GLIA 4GWOA 4NF4A 5H8QA 1MQHA 3W9WA 1MM6A 2F7AA 2UVIA 3CFXA 4QFNA 2I3WA 1B3EA 1QW0A 3PUXE 3T9VA 1YAEA 1MY4A 4LATA 1SDXA 3QXMA 3Q27A 2YJPA 3ZKKA 2A5TA 4XKRA 3C4MA 3GXAA 3S9LC 1JNFA 3K6UA 2XXUA 1IXIA 2I49A 1MXVA 4H6DA 1B5IA 3T9XB 3M8UA 3KJ7A 4RJZA 4ONYA 4GRKA 2HFBA 4RNSA 2P2AA 1B6HA 2OCUA 4F3SA 2Z8EA 3TEPA 5JK4A 4BLAA 1B5HA 2HAUA 3SESA 4QSDA 4ZEIA 3CR9A 3L6HA 4DDDA 3M3KA 3MW0A 2OWSA 3RT6B 1SVXB 2QRYA 3U72A 5L9MA 1Y20A 1SW4A 1FQFA 1N7WA 2ONRA 3EHSA 1QULA 1XOCA 2RKMA 3IOUA 3IX1A 1QKBA 1MDP1 2FNCA 3TELA 4EQ9A 5H8FA 4HCYA 3MVZA 3FASA 4YB5A 3FIRA 3DP6A 2OWTA 3LSLA 5AE4A 1TFDA 3O2AA 2HAVA 3SEVA 2RINA 4U22A 2Q2CA 3TTRA 1YPNA 4G8MA 3MZ1A 3DELB 4OZ9A 4PFYA 1M5BA 1MQDA 1MQGA 2G93A 3K4UA 4OESA 3RPWA 4C1UA 3TPAA 1DTZA 2R9JA 2B3FA 4F18A 4F19A 1XHYA 5H8HB 3HPIA 3TZAA 1Y9UA 2VOZA 4R6KA 1SW1A 3PGFA 4HS7A 3EQ1A 3O6GA 1IUDA 4HCWA 3VVDA 4TOZA 2DWHA 4GQOA 3KFMA 4L17A 3FUZA 3VLWA 3G7WA 2VD2A 3SEXA 3UORA 2I3VA 1FTJA 3OSRA 5HM4B 3SDFA 4YZZA 5H8NA 2GFEA 4G8NA 4MBPA 1MY2A 4U1ZA 5JTYA 3G3HA 2ONKE 1IIWA 3G3KA 3TTKA 1LBBA 4MF3A 3UIFA 2AL5A 2XHDA 1URGA 1SBPA 3MP8A 2Y7WA 2O69A 3VVEA 5DVFA 3S2VA 5AA2A 1QUJA 4E0XA 1FTLA 4F2OA 2QS3A 2Y7RA 3M3FA 2QL3A 3PUYE 4HW8A 1DMBA 1MY0A 3KOTA 2XX7A 5ELVA 1USYE 5IKBA 1B4HA 4QFKA 4F3GA 3MVWA 4U2RA 1B7UA 4ZDMA 4H0WA 1FQEA 1MPBA 4P0IA 3B6TA 5I2NA 4GL0A 2QMXA 1URSA 4THIA 2F34A 2HQ0A 4BDNA 3E3KA 3KEIA 4NF5A 3CG3A 1LSTA 2D5WA 4LA9A 2PT2A 1II5A 1FTKA 2YPNA 3K2DA 4DIGA 5B70A 2DWIA 3IORA 3N26A 4G68C 2DXRA 3OSQA 3UK4A 2PX1A 3RTWB 1DSNA 2DOJA 4OWDA 4EXKA 4OEUA 3K6XA 4OETA 3ZSFA 3S9MC 1BKAA 1ZU0A 4F1VA 1ZTYA 4NF6B 2OK2A 4QFPA 3KJTA 3PUZE 1Y4TA 2V93A 1QJMA 1FQAA 1RKMA 2I4BA 5KCJB 3USDA 3OEMA 3RUMA 4RXLA 1B3HA 1BLFA 4DLDA 5DEXB 4OFJA 2ZNUA 2XD2A 3FJGA 1BIYA 1MQIA 3PPPA 1MH3A 4QF9A 1D4NA 4I8CA 4I62A 1JEVA 2XXYA 3UN6A 3RT8A 3ECRA 4KYEA 2VD3A 2Q9TA 1R9LA 4FORA 4JWXA 1B9JA 2DE2A 4GL8A 5H8SA 4GOTA 3IB1A 4F2QA 1B46A 3FXRA 1Y3PA 5KDTB 1MXZA 3S4UA 3OXNA 4M1VA 1MH4A 2I0CA 5CMCA 1L5TA 3FXUA 3MP1A 4YB6A 1B3LA 1XC1A 3PPNA 4FEBA 5CBRA 3TAJA 3FV2A 2ANJA 1SW2A 5FHNA 2YLNA 5J1DA 3TKDA 1RYXA 2HEUA 1FQCA 5I59A 4KHZE 2UVGA 4ESXA 2REGA 3FVKA 5EHMA 4R6HA 3OO6A 1DPEA 3KZGA 5CBSA 4DE8A 4GFRA 1PB8A 1OIBA 4DXUA 1B3FA 1N3XA 4G4PA 5TPAA 1SI1A 3A3CA 1LCFA 4ZS9A 3V8XB 4ESWA 4U1OA 3T96B 1UIVA 4YKPA 3PMWA 3CSGA 1PC3A 3H7MA 5AA4A 1DPPA 3C36A 2DP8A 4IO3A 4BDQA 5A5XA 2VGQA 2Y7KA 3LR1A 5DYHA 3FVGA 3V89B 3UGWA 3MZBA 3TTLA 1URDA 4GD5A 4F22A 5ICQA 1A54A 4F39A 3SEYA 2DWJA 2PYYA 3VXBA 4U4SA 1OLAA 2R6GE 4R2BA 1N84A 1ZBMA 4Q5TA 4X48A 2AIXA 5EYFA 5FTHA 4PFWA 4QSCA 3H03A 4G2ZA 3VXCA 1B7ZA 2DVZA 5TU0A 1UIUA 4MLVA 2H98A 3KN8A 4F3PA 4AB6A 2O68A 5ICTA 2XXQA 1P1QA 2ZYMA 4QFLA 1VE4A 4YKKA 1PDAA 2WKYA 3DP8A 5ITOA 4P11A 3N6UA 1N7XA 2F6PA 1DTGA 1P1OA 1NH7A 3SEWA 2R71A 3EN3A 4XTCQ 3RLFE 3T66A 4H8JA 5CMKA 3MWBA 3JV9A 1SW5A 5H8FB 4GF8A 4IO6A 4QSEA 1A8FA 5TP9A 5BWJA 3QSLA 3KSXA 4P0GA 4F1YA 2PVUA 4XKPA 5I58A 4JDFA 1XVYA 5I57B 1MXUA 3U8QA 2XXPA 3LSWA 3H6VA 3CG1A 3DLNA 1YCJA 4ND9A 1N76A 4GIZA 3U94A 3HHGA 1VSOA 2AYSA 3K00A 4X1BA 1A8EA 1QVSA 3T22A 1FQDA 1ANFA 3PPQA 2HZKA 5CMBA 2OLBA 2O51A 4IY5A 4NWDA 4LP2B 4ZECA 4FEDA 4G68B 4XKQA 3OENA 4PETA 3TMGA 1D9VA 2UXAA 4MFIA 2QS2A 4ELPA 1B2HA 4FE8A 3PUWE 2ZXTA 3MBPA 2Q8JA 3D4GA 3C32A 4Z0IA 1LFIA 3HHFA 3W9VA 4XXUA 1N3WA 5H8NB 2OJTA 3FJMA 5DVJA 3K6VA 4RK9A 1FTMA 3ILTB 2QSXA 3H06B 3FATA 3ODBA 4OFLA 3IO4A 1MXYA 4NTLA 4R74A 3CFLA 4JB7A 4FJPA 1AOVA 1B51A 1R6ZA 1OQHA 1JVXA 2UYFA 1XVXA 4IO2A 1OMPA 1BTJA 2F6GA 3IK6B 3S9NC 4BDMA 5I56B 1B58A 1M5EA 5L8DA 3PPOA 2NXOA 3F11A 3H3GA 3LSFB 4OFOA 2F78A 3MZ9A 1B52A 1IXCA 3SKPA 2I4CA 4WEDA 2F35A 4BDRA 1H3DA 2V3TA 4NWCA 1IITA 3HN0A 5LOMA 5ITPA 1QKAA 2QMWA 1B7HA 4RPOA 4YU0A 5I2KB 4LQ2A 3B6QA 2V3QA 3N94A 4N6PA 1MQJA 2RC7A 2W7YA 1MXXA 4IGTA 3GBBA 4ZEKA 3H6UA 4OQOA 1EZPA 1M5DA 3QYTA 4KR5A 3PUVE 1H76A 1SYHA 4MLQA 4OERA 4ISUA 2DQVA 3PMXA 4AQ4A 3KOSA 3CI8A 4TLLB 5IAIA 2HZLA 1Y3QA 4C0RA 3KBRA 3EHUA 4FECA 3FZVA 4Q30B 4RYAA 3QIMA 1ZMGA 3QUJA 4OEVA 5CC2A 3SERA 5AA2D 3MUQA 4OVJA 5H8HA 3MPKA 4GXSB 1A99A 1S50A 4KYSA 2ZNSA 1T0KA 3Q26A 4H65A 4KD5A 1NNPA 5L9SA 2DSFA 4NF8B 2IA4A 3EPEA 2GH9A 1FTOA 1P1UA 3QAXA 4O3BA 4OENA 4LZ5A 1B5JA 2RF1A 1NH8A 1O63A 1UTBA 3SEUA 3WAEA 3HV1A 4R75A 4X1DA 1Y1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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