4FATA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Functional analysis of a novel positive allosteric modulator of AMPA receptors derived from a structure-based drug design strategy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 91
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA02
3Q29A 4ZE8A 1J1NA 1RYXA 2O7UA 2WKYA 5FHMA 1LB9A 3G3GA 3D4CA 3MP1A 1JEVA 3DLNA 4TLMB 1N3XA 4UA8A 3RT8A 2VHAA 2Q2AA 5ITPA 1OQHA 5TPAA 2UVIA 4G68C 4G68B 4BDQA 2UVHA 3FATA 4U21A 2E0SA 1Z7ME 2A5TA 2F36A 5I59A 1VFEA 1MY3A 2P2AA 3BFUA 4OXVA 1II5A 3B6QA 3BFTA 2FYIA 4E0WA 5H8FA 4NWDA 4JDFA 2DYXA 4H65A 4LUBA 1PB8A 4PFWA 1UTBB 1UIVA 3BKIB 4LP2B 1B05A 3O6HA 2Z8DA 3CI8A 1Y4CA 1LFGA 4WKMA 1QUIA 3LSXA 3IX1A 2AYSA 1POTA 2PX1A 4H6DA 5B70A 4KYSA 1MDQA 3FGSA 5KCJA 1URGA 1YPNA 5DTBA 3V83A 4FEBA 3TELA 1ATGA 1MQHA 4F29A 1B2HA 3MP8A 1B1HA 4P11A 2V25A 3IK6B 4ESWA 2QS3A 3LSLA 4ELOA 2REJA 3T9VA 5AA4A 3E13X 3PMWA 3KG2A 4YKIA 2XXHA 4YB6A 2V3TA 3K1NA 1P1NA 1R1NA 5J1DA 1GR2A 3RUMA 1MXUA 2KLFA 4IO6A 5EHMA 4NF5B 4OERA 3OO6A 3O28A 2XD3A 2VGQA 4DXUA 2ZYMA 1BKAA 2UXAA 2HAVA 5CBSA 3K01A 3KSXA 1BLFA 4KYEA 4OFOA 1N84A 4DIGA 4NF6A 1SYIA 5DT6A 2HAUA 4LQ5A 4F3PA 1IITA 5CC2A 5KDTA 3SDFA 3UGWA 4F2OA 4HCWA 3OEKA 4R72A 2O1MA 3U8QA 2P0SA 5HM4B 3U94A 2GHBA 4YKJA 4YKKA 1DPPA 5BWJA 2Y7RA 1UQWA 3VV5A 2QL3A 4PFUA 1A99A 1ZTYA 1GVCA 3G3FA 1OVTA 1B3GA 4DCXA 3CSBA 4RYAA 3MUQA 4Z0IA 2QMWA 2I6EA 5TU0A 1B40A 4KPTA 1N7XA 4H67A 5L9MA 3RTFB 4DZ1A 3TFLA 3N94A 2X26A 3GBBA 3KJTA 1B5JA 5M2VA 4KR5A 5A5XA 1URDA 1NMUA 4JXIA 3A3UA 3MJNA 4MLVA 3FXRA 4LQ2A 3IL1B 1Z7NE 2Q89A 1B3EA 1B5HA 3QUJA 4YU0A 2OWSA 3SEYA 3VVFA 4H1XA 4OZ9A 1I6BA 4BDNA 1IIWA 2VP1A 4PE5B 2XXPA 1FW0A 3UIFA 4GOTA 3D4GA 5DYHA 3PPRA 5CMCA 2OBGA 5AE4A 4OEVA 3M8UA 5JK4A 2ALUA 1FTKA 4LZ7A 2ONRA 2O69A 2QS4A 3V8XB 4U2RA 2PYYA 1LB8A 2HZLA 5I2KA 1PDAA 1B9JA 2XXVA 3E3KA 4X1DA 1MS7A 4OFLA 2I49A 2V3UA 3PMXA 4NTLA 1P99A 4OFJA 2NUVA 1FTOA 3EN3A 3VE1B 4EQ9A 4QSCA 4FORA 4QSEA 2GFEA 4EXLA 5AA3A 4RA1A 3TQLA 5CMKA 4U22A 1DPEA 4LONB 4G77A 4E0XA 5L9SA 4GIZA 3I6VA 2F7CA 3CSGA 1B4ZA 4XTCQ 4R75A 4H8JA 3QXMA 2OJTA 3VXCA 2O6AA 2HFBA 2Q2CA 4AQ4A 2I3WA 3FVNA 4KCCA 5AA1A 1CB6A 1VSOA 3OSQA 3S9MC 4IO3A 1GGGA 4TOZA 3DP8A 4FJPA 2I48A 3IJOB 4ZECA 2CMOA 5H8SA 5FTHA 2Y84A 1SI1A 4FECA 2RKMA 4YB7A 1SDXA 3TZAA 3MVXA 5DEXA 1Y3NA 4H0WA 4QFPA 4NF8B 1JVXA 2IEEA 5I2KB 3EF7A 1Y1ZA 2UVJA 3DM0A 5H8QA 2O68A 3LC8A 4MH5A 1XT8A 1URSA 4U1OA 4ELRA 1N04A 2RC7A 5HBCA 3T9UA 1JVYA 3HN0A 2ANJA 3GLBA 2XXTA 2QJEA 3IO4A 1N76A 3C32A 3MQ9A 3QAXA 4G8NA 3VVDA 2QSXA 3O29A 5JTYA 3TTNA 1P1UA 5CBRA 1EZOA 2VD3A 4THIA 4U4XA 4MF3A 1LAXA 3P7IA 2PT1A 4F18A 4YZZA 3SEVA 3HHFA 1PB9A 2D5WA 1Q35A 3DP4A 3H03A 1MH3A 3W9VA 2DQVA 1B1XA 4EQBA 3KGCA 4ZS9A 3CFZA 5FHNA 3FJMA 4G68A 3T93B 1VFDA 4F3BA 2DWIA 4AB6A 3LBSA 4IB2A 2ZYKA 4C1TA 3DELB 3FD3A 2XXUA 1H76A 3HPIA 3GXAA 1O63A 3G3KA 3QYTA 4Q30B 1A55A 2ZMBA 3TUSA 1UTHB 4OENA 5LOMA 4OEUA 1UTBA 4WEPA 3HHGA 3SEXA 4EXKA 2AL4A 3Q26A 1M5BA 1SYHA 4BDRA 5CRYA 3OSRA 3IOWA 3RPWA 4XKRA 1MQDA 1MY4A 1FTMA 1SW1A 1VE4A 5L9OA 3L6GA 3GZGA 2V3QA 4QF9A 3SEUA 4RPNA 1LAGE 2LAOA 3OO9A 4PETA 3O66A 4ELQA 3OD7A 4IGRA 2YPNA 4AB5A 1OQGA 4ONYA 3F11A 3K6WA 5F7VA 3TEPA 3RY3A 3O6IA 3W15C 3CFXA 3PD8A 3KOSA 4EDPA 1ZIUA 3JZJA 3KFMA 3C35A 3O9PA 4JWOA 3MP6A 5DVIA 1F9BA 1YTVA 3K6VA 3N6TA 3M3KA 5ICQA 3LSWA 3K1MA 2B3BA 1FQCA 3A3CA 3K2DA 3TMGA 4Q0CA 1B52A 2D21A 1D3KA 1B7UA 5I56B 1M5DA 5IKBA 2F7BA 5AA2B 4NF4B 2M8CA 3TODA 4F1UA 3KSJA 2CZLA 4LA9A 1LGBC 1FCKA 4NF5A 4C1UA 2P1SA 3HV1A 3IO6A 3KN8A 4F31B 4G2ZA 5EHSA 1LFIA 3KN7A 3T22A 4XXUA 5IAIA 4OYVA 1EU8A 5L8DA 1OMPA 4GWOA 1N0TA 1PEBA 4R2FA 3V89B 3TCGA 3USDA 2DWHA 3PPPA 1P1OA 4GVOA 1MQIA 4POXA 1B0LA 2F97A 4ESXA 1JETA 1USYE 3K0VA 1MY0A 3TYHA 3MZ1A 3FV1A 4DE8A 2I4BA 2ZXTA 4K3FA 4OVJA 1JEUA 4QSDA 2THIA 1BP5A 5ICTA 2RCBA 2FNCA 3SKPA 1MM7A 1B5IA 3TCHA 1GV8A 4ZEDA 2HEUA 3EPEA 4GF8A 3ILTB 1QUKA 2B3FA 2DE2A 1VR5A 1MRPA 2H5YA 1NKXA 4F39A 5I2NB 1TFDA 2DXRA 5CI5A 3ZKLA 1R9LA 1NNTA 4O3AA 4ISUA 3LR1A 2AL5A 4IO2A 2QPQA 2ZYOA 5I58B 3RTWB 3CR9A 1ZKBA 1IXIA 4IO4A 1LBCA 2AIXA 3C36A 3T9XB 3S9EA 2VD2A 3VXBA 1O64A 4DLDA 2NXOA 2ONSA 2R9JA 2I0BA 4RK2A 4EF1A 1WVJA 2F78A 2F6GA 4F22A 3CG3A 4C0RA 1L5TA 3V5AA 1SW5A 4F3GA 3T96B 4ND9A 3ILUB 4F1VA 3EHSA 3MBPA 3WAEA 4HW8A 3KOTA 4HTGA 3VFJA 1DTGA 5I57B 1LAHE 1EH3A 3H6WA 2DS9A 2REGA 3S9NC 1OLCA 3R7XA 1QJMA 2XX7A 3RQTA 1B4HA 2X7PA 2VOZA 2F35A 1SW4A 3UA8A 1M5CA 3PU5A 2UVGA 4N6PA 4NF8A 3ZS6A 1NH7A 4YB5A 5K2YA 3MZ9A 4F2QA 4KQPA 1Q1KA 4WEDA 1MQGA 2BJJX 4PP0A 1N7WA 1H44A 2NWJA 3MC2A 4ZZEA 2DXYA 2ZNTA 4XKNA 3K00A 2GH9A 4ZE9A 3H6UA 2Y7KA 4R6HA 4RY1A 1S7YA 3C33A 2OWTA 1XVXA 2W7YA 3PPNA 4JB7A 5KZTA 1DMBA 1B46A 3HSTA 4G8HA 4ZEIA 3RNNA 3LUYA 4YICA 4YMAA 3OENA 3EHUA 3ECRA 3B6TA 1Y9UA 4GRKA 4BDLA 4FEDA 4RK9A 4G4PA 1D9VA 1LCTA 4L17A 5HPQA 5CMBA 3U92A 3SESA 1A8FA 2PMSA 3UN6A 3R6UA 4FE8A 3FJ7A 3IB2A 3PUXE 5ITOA 4OQOA 3CIJA 3MZBA 3CFLA 1DTZA 3H6VA 4O3CA 3H7MA 3THIA 3EHTA 4M4GA 3IOVA 4FAJA 2E1SA 1B3LA 4F3SA 1UTHA 3WAFA 3MPKA 4R2BA 1T0KA 1JQFA 4JSOA 4BDOA 2DE4A 4RNSA 4PFTA 3ZKKA 4JBZA 1B0HA 5DVJA 1I6AA 2PBWA 1A40A 2NOOA 3RGYA 4OHNA 3HCQA 3TTKA 1B6HA 1EZ9A 3ZSFA 1MXZA 3OMBA 4N13A 4HCYA 1IEJA 3OO7A 4DCYA 4IGTA 4KI0E 3FVGA 3S2VA 5I84A 1SBPA 1AL3A 3H06B 2IA4A 1P1QA 1EZPA 1TT1A 4OWDA 3C9HA 1B51A 4X9TA 2XXRA 1MG1A 2YLNA 1SQYA 1TWYA 4IY5A 3U1OA 1IXCA 2HQ0A 4KD5A 3PGFA 2I58A 5I56A 2Y7WA 2H99A 5AA2A 4I8CA 4NF4A 1US4A 3TTRA 5TP9B 5ISUA 3VLVA 1SD3A 2I0CA 3HO7A 4TQUQ 3PPOA 4LZ8A 4R6KA 4NMYA 4KFQA 2ONKE 3PUZE 3C34A 4MFIA 1QUJA 2Z8EA 3IB1A 3BBRA 4YMBA 1FQFA 1PB7A 4IY6A 1A54A 1PBQA 4EQ7A 4IO7A 2XXYA 5CM6A 3AXFA 1PC3A 1FQBA 1TXFA 1ZBMA 1AOVA 3QSLA 3C4MA 1MY1A 4LATA 5H8HA 4PQJA 2X7QA 3ODBA 3OXNA 3T9HB 1ZLQA 2R6GE 4BLAA 2XHDA 2RINA 1OVBA 2HZKA 4FATA 2OK2A 1ZMGA 2DWJA 4ECFA 2XXXA 2DSFA 5BUUA 1RYOA 2F5XA 2V93A 3PUYE 3KZGA 3O6GA 1JW5A 3MPLA 2UYEA 4H5FA 3IJXB 3TKDA 4G8MA 3PPQA 1FQEA 3H4ZA 2XX8A 4I9DA 3PD9A 4LZ5A 3FASA 2Z22A 1IXGA 1XOCA 1O7TA 2XX9A 3PUWE 3VVEA 4RXLA 4LVQA 4OTEA 4QFNA 4R6YA 3VLUA 2Z23A 4DXCA 5I2NA 3K6UA 1HSLA 4FIMA 4DXBA 4XKQA 3N5LA 4OESA 5I58A 3K4UA 1UIUA 1HSEA 4Q8RA 1Y3QA 1PBPA 1LSTA 1AMFA 3KBRA 4GQOA 2O51A 2GRVA 4TLLB 4XIGQ 3I3VA 3H3GA 3MVZA 4WXJA 4GXAA 1SI0A 4HS7A 5H8HB 1FTLA 5K2XA 3UORA 4BDMA 3L6HA 3PMVA 4R9FA 3CG1A 1R9QA 1P1WA 3ONMA 3IAZA 3S9LC 1IUDA 3FIRA 1QKBA 3EQ1A 3OOAA 5AA2D 2V84A 1DSNA 1FQAA 4GL8A 5TPAB 2H9BA 2D3IA 3IR1A 1D9YA 3OO8A 5CMMA 2A5TB 5I59B 1M5FA 2Q88A 4XKPA 4UACA 5I57A 1A8EA 1NNKA 2G29A 2OCUA 2DWAA 1WODA 3FV2A 5H8FB 3VLWA 3QIMA 3CVGA 2QS2A 3FXQA 1GTKA 4NE4A 3KN3A 3MVWA 4JSDA 4ZDMA 4U23A 3MWBA 4ZEBA 2HXWA 4YAHX 1Y20A 4JWYA 1MXWA 1XVYA 2HCAA 1FTJA 4P0GA 3U93A 1US5A 2I4CA 1ZJLA 2F34A 3QUFA 5ELVA 1LFHA 3E4RA 3TTLA 1MPBA 2O7IA 3MW0A 3RT6B 2OLBA 4YKPA 3U72A 5KCJB 2O84X 3SEWA 3LSFB 2B65A 3M3FA 4R74A 3VDFA 2QMXA 2YJPA 3K02A 3MAMA 1H43A 4DDDA 1H45A 1MPDA 5AA4B 2XXWA 4OMBA 3DP6A 3H6TA 3MVYA 1ZU0A 3PUVE 2PT2A 3QK6A 1XHYA 3B7DA 4GFRA 3TAJA 1MM6A 4KHZE 4QHQA 4PFYA 4NEDA 3A09A 3N6UA 1S9TA 1NNFA 1IZ1A 1Y4TA 4NWCA 1YCJA 3E9XA 4ZEFA 1LBBA 1N3WA 4MBPA 2DOJA 4NF6B 1LAFE 1B58A 1S50A 4KYDA 1MPCA 4F1YA 4RJZA 1LLSA 3K1PA 1A7LA 3O2AA 5KDTB 2F7AA 1NNPA 2R71A 1TFAA 1Y3PA 4Z7EA 4QRZA 1AIVA 3SERA 1JW4A 2QRYA 2F8DA 3UP9A 3OEMA 1MXYA 2Q9TA 3Q27A 3Q25A 4M1VA 1WDNA 4JWXA 4KCDA 3FVKA 3KJ7A 1B3HA 1FQDA 4U4SA 2F6PA 3OELA 3KEIA 2DE3A 1QVSA 3TTMA 2RF1A 1QW0A 2ESNA 1RKMA 3TCFA 5A5XB 3FVOA 3PV0E 5FHOA 2G93A 2Y7IA 4I1DA 4O3BA 1M5EA 1LCFA 4GD5A 2ZNSA 4GL0A 3Q28A 3JV9A 4X48A 4EF2A 4R73A 5B7DA 2OZZA 4H8IA 4POWA 1MXVA 1OLAA 3TPAA 2ABHA 1MY2A 5FTIA 1XS5A 3CRBA 1POY1 3R26A 3G7WA 2UYFA 1XC1A 1B3FA 2DVCA 1I69A 5F1QA 5H8NA 1H3DA 1NH8A 1MDP1 1BIYA 1Y1MA 1DOTA 4P0IA 3JYRA 2XXIA 3IOUA 3B6WA 2DP8A 3S4UA 4ZZAA 1ANFA 5DVFA 3UK4A 5TP9A 2Z8FA 3RN8A 2ZYNA 1BTJA 4H5GA 4IO5A 4RPOA 3N26A 1CE2A 1I6QA 1NL5A 1D4NA 2QS1A 3IOTA 4R9GA 4ZEKA 4ELPA 1B7HA 1MQJA 4EUOA 2DVZA 3M3LA 2FA7A 4OETA 2H98A 3W9WA 1IXHA 1OIBA 1MXXA 3G3HA 3FUZA 2Q8JA 2ZNUA 4N07A 1YAEA 2NVUB 1HSJA 3RLFE 4X1BA 1IQ7A 1B7ZA 1KWHA 2O1LA 4GXSB 5EYFA 2H25A 4GLIA 5H8NB 3C31A 3GBAA 2GHAA 3FXUA 5DEXB 2XD2A 1ELJA 3FZVA 1JW1A 1MH4A 2I3VA 3O97A 3TQWA 2A5SA 3IORA 5H8QB 2RCAA 3I5OA 2RC8A 3SETA 2PVUA 3G3JA 2XXQA 1R6ZA 2H4IA 1B32A 4I62A 1JNFA 2RC9A 4QFKA 1NFTA 4QFOA 3K6XA 1SVXB 3FJGA 2Y7PA 4F19A 4MLQA 3IB0A 1USYH 3TDJA 5JEIA 1AH5A 4U1ZA 4QFLA 1QULA 3G3IA 1SW2A 5JTYB 4Q5TA 1QKAA 3T66A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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