4FATA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Functional analysis of a novel positive allosteric modulator of AMPA receptors derived from a structure-based drug design strategy.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 91
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA02
3Q26A 2DYXA 4MLQA 3K6WA 3MPLA 5CI5A 3PMWA 5ITOA 1WVJA 1B1XA 5JK4A 1Y20A 2QRYA 5DEXB 2I4CA 1N7XA 3MPKA 4WKMA 2PT2A 1OQHA 2XHDA 2DOJA 4FIMA 4JXIA 4LQ2A 1P1WA 4PETA 2Q9TA 3CI8A 5J1DA 5H8HB 4Z7EA 4JWXA 4RXLA 4PFWA 1NH7A 1B2HA 1MY1A 3IOUA 1NMUA 3FVOA 4G77A 3TAJA 4DZ1A 1P99A 3HCQA 1QJMA 1Q1KA 4QHQA 5AA2B 1I69A 5DT6A 3VLVA 1PDAA 2YPNA 3HV1A 3MZ1A 3WAEA 2PT1A 2X26A 2Z22A 3IB0A 5ICTA 2XD2A 4TLLB 3GXAA 3GLBA 3OMBA 5AE4A 4POWA 4P11A 1LFGA 1FTMA 4F1UA 3T9XB 3T96B 5CMKA 1XS5A 4F19A 3ZKKA 4NTLA 4R2BA 2V93A 3CR9A 4DXCA 4LA9A 2V3TA 1WODA 2UYEA 3G3IA 1QUKA 3K1NA 3MZ9A 3M3LA 3OOAA 4OESA 4JB7A 4OQOA 4R75A 3UK4A 2HAUA 2RC8A 2NXOA 3FVNA 4G4PA 1TFDA 4KCDA 2R71A 4MBPA 1SD3A 4R9GA 4X1BA 3TEPA 2OBGA 1N3XA 3PGFA 2UVJA 1GV8A 3H06B 2DS9A 2ZYMA 5JTYB 4R72A 4M4GA 3EF7A 1YPNA 3C9HA 1A7LA 4C1UA 1ZIUA 1ZMGA 1FQAA 4WEDA 3BFTA 3FV2A 1WDNA 1VFDA 3OSQA 4H1XA 3K1PA 1PB9A 4RY1A 1YAEA 1B5IA 3RTWB 2XXPA 4E0XA 3CRBA 4EF2A 4L17A 2UVIA 2W7YA 3CFLA 3DP6A 4IO7A 4FEBA 4AB5A 4EQ9A 2Q2CA 5I57B 1YTVA 3KOSA 3LUYA 5AA1A 1TXFA 3TTKA 5DEXA 2GFEA 4JWOA 1P1OA 1XVYA 3ILTB 3JZJA 1EZPA 4EUOA 1B3GA 5KCJA 1OIBA 2QS3A 1IITA 1FTLA 4I62A 5FTHA 1N84A 2I6EA 4K3FA 4F3BA 4ND9A 3H3GA 3H6VA 3LC8A 3Q25A 3TQLA 1Z7NE 5I59B 4E0WA 1NNFA 3FV1A 1TFAA 4GL8A 4XKRA 3FXRA 3B6TA 3RPWA 3Q28A 1NFTA 4TQUQ 1KWHA 1MRPA 1Y3PA 2I0CA 3E9XA 3IX1A 4H5GA 1LAGE 3BFUA 3SEVA 4AB6A 1MG1A 4F31B 1ZLQA 1NNKA 1MXZA 1B1HA 1PEBA 3EHSA 1US5A 2AIXA 3G7WA 3OO7A 4JSOA 4DLDA 4ZEFA 2WKYA 5CMBA 1LB9A 2R9JA 4R6HA 3PV0E 4ZEIA 3H7MA 2AL4A 3R6UA 2I4BA 4IB2A 2XXYA 4LATA 1Y1ZA 1QULA 3O66A 4IGRA 3OENA 2O7IA 4F18A 1IQ7A 1NNTA 3KBRA 3IJOB 2F97A 4ONYA 1JW4A 1A40A 3CIJA 1DSNA 1MXWA 1SW2A 3CSBA 4GL0A 4MH5A 3FXQA 2GRVA 1OLAA 4QFPA 2ZNTA 4GD5A 1MPBA 3TMGA 3KOTA 1N3WA 3PD8A 4OFLA 4QRZA 4R6KA 2QSXA 5B70A 4U1OA 4MFIA 4F29A 1BTJA 3KN8A 4GFRA 4NEDA 3U93A 5JTYA 1XOCA 2NUVA 3K4UA 3K6XA 3T22A 1P1QA 3PPRA 1A8FA 4OYVA 3DM0A 5H8NA 3FJ7A 5DYHA 5IKBA 2VHAA 4G8HA 4LZ5A 4R6YA 4ZE9A 3S4UA 1RYXA 1A54A 1DTGA 1LFHA 1IIWA 3PUZE 1MDQA 4ELPA 1O63A 4I8CA 1F9BA 3LSWA 1IXIA 4ZS9A 4KQPA 1D3KA 1LSTA 3O6IA 5AA4A 4RA1A 1NNPA 5CMCA 1SBPA 2XXIA 4ZZEA 4F1VA 4Q8RA 2VD3A 1N76A 2Y7KA 4OERA 5K2XA 5HM4B 3KZGA 4QSEA 1UIVA 2G93A 3G3HA 3K6UA 1MQDA 3KSXA 3USDA 4DXBA 3A3UA 4YKIA 3V83A 4Q0CA 4RK9A 4XIGQ 4BDLA 5I2NB 2YLNA 1UTHB 2RINA 1URGA 2AL5A 4XTCQ 3TTRA 4FJPA 5AA2D 1SYHA 3CG3A 3ECRA 3EQ1A 3FVKA 2PMSA 3S9LC 4BDRA 1Y4TA 3TDJA 1A99A 1I6QA 1MXYA 3C4MA 3F11A 4PE5B 4ZEBA 1B4ZA 2OCUA 3FUZA 1B3LA 1QUIA 3I5OA 5I2KA 2R6GE 5L9SA 3N5LA 2E0SA 3TCFA 4EF1A 2M8CA 4EXLA 2UXAA 3MVWA 2PBWA 1UIUA 3PUWE 4U4XA 4XKQA 1QUJA 1S7YA 5HBCA 4HCWA 1URSA 2P1SA 4F22A 1PB7A 3IORA 1BIYA 2H99A 5H8NB 1URDA 4PFYA 1R9LA 1DOTA 5TPAA 4TOZA 3O97A 4GLIA 1MS7A 3PPPA 1VR5A 4OENA 3PUXE 4YMBA 2P0SA 3OD7A 1ZTYA 3IK6B 3LSFB 4BDQA 5I59A 2A5TB 4QSDA 2LAOA 1HSEA 2F34A 4IGTA 1LAXA 1XT8A 5KCJB 2V3QA 1XC1A 4ESWA 3O9PA 4F3GA 1IXGA 3T9UA 3S9EA 1PBQA 4IO2A 4XKNA 5F1QA 3FXUA 2DXRA 2Q2AA 3EHTA 4H8IA 5F7VA 1Y1MA 4NWCA 4IO4A 1TT1A 3OXNA 3C35A 4WXJA 4ISUA 3UGWA 4XXUA 4TLMB 3S9NC 4OWDA 3FZVA 1B5HA 2RC7A 2F7CA 1ELJA 1BP5A 3MAMA 3SESA 4DE8A 3HSTA 3KGCA 4EXKA 1MY2A 3TKDA 1UTBA 2I0BA 3GBAA 1UTHA 3CSGA 3G3KA 4QFOA 3CVGA 1VSOA 4QFNA 1FQCA 1H76A 4PFUA 2ZYKA 1MY4A 2KLFA 3G3JA 2NOOA 3PUYE 1NH8A 4FORA 2ONSA 5BUUA 2XXVA 2XXXA 4ZEKA 3MVXA 5I2KB 4UACA 2XXUA 4BLAA 3W15C 1JEVA 4RNSA 1LAHE 1CB6A 1B7HA 5TP9A 3FD3A 2Z8EA 2I48A 3B6QA 4G68A 4ZEDA 2RKMA 2ZYNA 2REJA 4KYSA 1LBCA 3VV5A 2HCAA 3IOTA 2XXHA 1PBPA 4G2ZA 2FYIA 1H45A 3C36A 4I1DA 4NF4B 4QF9A 3VLUA 4DXUA 1MQHA 3CFZA 4U4SA 1SYIA 3TTNA 4IY6A 4RYAA 4NWDA 1HSJA 2A5TA 2QS1A 4EQ7A 3CG1A 5H8HA 4F2OA 4H67A 3H03A 1S50A 2BJJX 2O68A 3IL1B 2D21A 3UP9A 4NF8A 2CZLA 3TODA 3VE1B 4BDNA 1N7WA 1P1NA 2VD2A 3W9WA 5H8QB 5H8FA 3H6TA 4GQOA 5B7DA 1OVBA 4G68C 4O3BA 2QPQA 2X7QA 4LP2B 3TCHA 4NF5A 4KPTA 1M5DA 1SW4A 2F7AA 1ATGA 3SKPA 2OZZA 1B32A 3PU5A 3RUMA 2F5XA 1H44A 1USYE 3I3VA 1GR2A 3O2AA 3LR1A 3R7XA 2F6PA 2GHBA 2PX1A 1US4A 3PPQA 2O51A 2Y84A 3C34A 4H0WA 5CMMA 3B6WA 1PB8A 4OXVA 4G8NA 2QJEA 2B3BA 4N13A 4NF8B 5FHOA 1H43A 2P2AA 4JWYA 3TZAA 3ZSFA 2FA7A 5ICQA 3CFXA 2B65A 2ESNA 1EH3A 1FQBA 1JVYA 3N6TA 5ELVA 5I57A 2V25A 2QL3A 3JYRA 4NF5B 2F6GA 2V84A 4HCYA 4QFKA 1MDP1 4EQBA 2D5WA 3T9VA 3PD9A 2O7UA 2HAVA 4KCCA 1SDXA 4LQ5A 4YAHX 3SEXA 5I58B 4GXSB 2G29A 1IXHA 5H8SA 4OEVA 3MWBA 3SEWA 2XXWA 2I3VA 2DSFA 2DP8A 4YU0A 1B7ZA 1B5JA 3Q29A 4Q5TA 3C33A 3SEUA 1MQIA 4KYDA 4OFJA 4X9TA 1POTA 1VE4A 3KN3A 1ZBMA 1I6BA 2O6AA 3LSLA 3G3FA 3D4GA 3HHFA 3R26A 1SW1A 2GHAA 3IB1A 3RLFE 4LZ7A 3VVDA 3WAFA 5EHMA 4ELOA 3QYTA 3IJXB 4YICA 4OETA 2XX9A 4GXAA 1GTKA 4AQ4A 2H98A 3E3KA 2YJPA 4EDPA 1MXUA 3HPIA 3T66A 1FTKA 3P7IA 2X7PA 4FAJA 4NF6B 3K1MA 4PP0A 3ILUB 2V3UA 4NMYA 2O69A 1MQGA 2Z8DA 3H4ZA 1B58A 1LLSA 5CM6A 4KFQA 4YB5A 1A55A 4LONB 1USYH 4JBZA 2I49A 1QKBA 1SQYA 2Q88A 3HO7A 5CBSA 3U94A 1FTOA 1B3HA 4RJZA 5AA4B 3C31A 1L5TA 2OK2A 4IO6A 2DVZA 4H6DA 1B3EA 3RN8A 1FQEA 3K2DA 3RY3A 3UORA 3TUSA 1MH3A 5EYFA 4U1ZA 2F7BA 1O64A 1ZJLA 2HEUA 2RCAA 4NF6A 5KZTA 5TU0A 2DE4A 3QUFA 3RNNA 1MXVA 3OELA 3M3FA 4N07A 5AA3A 3KN7A 2RCBA 2RC9A 1B40A 1UQWA 3A3CA 4KI0E 3TTMA 1NKXA 2F8DA 2DWAA 2O1MA 3SETA 1MM6A 2HXWA 4F3PA 2F36A 3QXMA 3V5AA 2IEEA 3Q27A 1MPDA 2NVUB 3OEMA 5LOMA 1DMBA 1Y4CA 2IA4A 3IR1A 1EZOA 2ABHA 3DELB 1LCTA 3K01A 3FATA 1AIVA 1FTJA 2XXTA 3KJ7A 2XXRA 4KR5A 3IAZA 3W9VA 2DE2A 2VOZA 2Y7PA 3VXCA 1AMFA 4U23A 1SVXB 1ZU0A 4U22A 5I56B 1Y3QA 5H8QA 4ELRA 5I58A 2ALUA 4PFTA 3OO9A 1GVCA 1B05A 3EHUA 3LSXA 3ZS6A 4KHZE 5EHSA 1D9YA 1EU8A 1XHYA 1GGGA 3C32A 3MW0A 3QIMA 3DP4A 4KD5A 2QMXA 1MM7A 3A09A 5H8FB 3TCGA 2QMWA 1N04A 2XX8A 2UVGA 3KJTA 3T93B 1D4NA 2VP1A 5CRYA 4IO3A 3TPAA 3KSJA 3UIFA 1LAFE 3MJNA 4PQJA 5K2YA 3OO6A 3QUJA 4LUBA 1SW5A 3IB2A 4F1YA 1B0HA 1JEUA 2ZXTA 1B52A 3B7DA 1Y9UA 5I2NA 4IY5A 1OQGA 3E4RA 3PMXA 1B46A 4OEUA 1POY1 2ONRA 3RGYA 4H65A 2PYYA 2UYFA 1AH5A 5M2VA 3T9HB 3VDFA 1JW1A 4GF8A 1MY3A 4C1TA 1FW0A 3K02A 3KG2A 1UTBB 3O6HA 4LVQA 4OFOA 1LGBC 2FNCA 3GBBA 4ECFA 1YCJA 1RKMA 1R1NA 1I6AA 4G8MA 4O3AA 4R73A 1P1UA 4H8JA 4M1VA 4RK2A 2DVCA 4XKPA 5JEIA 1IEJA 2H4IA 3QAXA 2Y7RA 2REGA 2DWJA 1FCKA 2H9BA 3PUVE 2ANJA 3E13X 3MP1A 5IAIA 4R9FA 3TFLA 1MY0A 5CBRA 4OMBA 1R9QA 4R74A 2DQVA 2RF1A 2H5YA 3N94A 3H6UA 2I58A 3I6VA 4HTGA 3TTLA 3VVEA 1JVXA 3O6GA 5TP9B 1JNFA 3PPNA 4G68B 1AOVA 3S2VA 1JW5A 2OLBA 3OSRA 4YKKA 3FJGA 1N0TA 1ANFA 4HS7A 3MC2A 1TWYA 3SDFA 2Z8FA 4Q30B 2DWIA 1M5CA 3TYHA 1BKAA 1SI0A 1Z7ME 4JDFA 4JSDA 4OZ9A 3MZBA 2ZYOA 1II5A 3OO8A 2F35A 3DP8A 3FGSA 3MQ9A 4GVOA 4YKJA 2Q8JA 1IUDA 1MQJA 4ZZAA 1RYOA 3O29A 2ZNSA 4U2RA 3SEYA 3U92A 1B51A 2DE3A 2B3FA 2OWSA 2UVHA 2Y7WA 3RT6B 4ELQA 4THIA 2F78A 1QW0A 4FECA 1ZKBA 3QSLA 4H5FA 4DCYA 2H25A 4YKPA 3KFMA 2Z23A 1IZ1A 1B3FA 1R6ZA 3IOVA 1LCFA 2PVUA 2XD3A 3PPOA 3THIA 3FVGA 2GH9A 4R2FA 2E1SA 4OHNA 5BWJA 1J1NA 4O3CA 3U72A 3ONMA 1FQDA 3FASA 2OWTA 5L9OA 3S9MC 4F2QA 1DPPA 3MBPA 5DVIA 2I3WA 5DVJA 1Q35A 3PMVA 4ZECA 3EPEA 1IXCA 4GRKA 3N6UA 4GIZA 2CMOA 3AXFA 3M3KA 1MXXA 4POXA 4DCXA 4ESXA 5I56A 4UA8A 1T0KA 4LZ8A 1EZ9A 1S9TA 2AYSA 2A5SA 3MVYA 1FQFA 3MUQA 3RT8A 1QVSA 4N6PA 4GWOA 2HFBA 5FHMA 5I84A 2ZNUA 4F39A 5KDTB 3KEIA 1DTZA 4BDMA 2HQ0A 4FATA 1B0LA 3MP6A 1AL3A 1B4HA 4NF4A 2THIA 4P0IA 4MF3A 5DVFA 4GOTA 1LFIA 2DXYA 3SERA 2OJTA 1B6HA 3EN3A 1Y3NA 3IO6A 5ITPA 5A5XA 2QS2A 3G3GA 4U21A 1LBBA 2ZMBA 3ZKLA 3GZGA 5HPQA 4IO5A 2VGQA 1JQFA 4DDDA 3HHGA 1A8EA 1OLCA 5FHNA 3FJMA 4FE8A 2O84X 3K0VA 1MH4A 3BBRA 1BLFA 1XVXA 1D9VA 3V89B 3HN0A 3O28A 4X1DA 4YB6A 4OVJA 1B9JA 4ZE8A 2NWJA 1QKAA 3L6HA 5L9MA 1PC3A 3OEKA 4RPOA 4WEPA 5A5XB 1HSLA 4MLVA 1LB8A 3VLWA 3V8XB 3TELA 4QSCA 1OMPA 2Q89A 3K6VA 3JV9A 4P0GA 3DLNA 4QFLA 2D3IA 3H6WA 3IOWA 4Z0IA 3VXBA 1SI1A 1JETA 1H3DA 1M5FA 1OVTA 2Y7IA 5AA2A 1CE2A 2DWHA 4DIGA 5ISUA 3RTFB 3FIRA 3IO4A 4HW8A 3RQTA 2ONKE 4KYEA 3VFJA 1DPEA 3K00A 5L8DA 4BDOA 3VVFA 3BKIB 3D4CA 3U1OA 5CC2A 4NE4A 4YB7A 2O1LA 3MP8A 3N26A 3TQWA 4C0RA 1M5EA 1NL5A 4YMAA 4FEDA 2XX7A 3M8UA 5FTIA 3U8QA 1M5BA 3ODBA 2HZLA 5DTBA 5TPAB 2XXQA 3UN6A 4X48A 4F3SA 3LBSA 3MVZA 5KDTA 4OTEA 4RPNA 3QK6A 1B7UA 2QS4A 1O7TA 1VFEA 4I9DA 4YZZA 1MPCA 2HZKA 4ZDMA 3L6GA 3UA8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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