5I2NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 81
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB02
3B7DA 3K2DA 1CB6A 2QS2A 2OJTA 2FNCA 3VXBA 3V83A 4HTGA 1I69A 1BKAA 1MG1A 1MPCA 4JDFA 4MBPA 4F1YA 2G29A 3G3GA 3ZKKA 3K01A 4FORA 4WEPA 1B4ZA 5I58A 1LAFE 1TT1A 1R6ZA 1LFIA 3VVEA 5CM6A 4F3PA 3FXRA 3KOSA 2QS3A 3O6GA 4RK2A 1L5TA 5B7DA 4NTLA 2REJA 4UACA 5H8SA 3I6VA 1Y1MA 1VR5A 1B7ZA 4OETA 2Z8FA 3PUWE 2Q9TA 1B3HA 3ILUB 4PQJA 3W15C 4RK9A 3T9VA 4MFIA 4U22A 1OMPA 2RCAA 1B1XA 4ESXA 4JB7A 3DP6A 1ZLQA 3KN3A 1P1OA 3MVZA 3PUXE 4H67A 5DEXB 3EN3A 1HSLA 1ZTYA 2H9BA 3FVOA 3H03A 4I62A 3U72A 4EF1A 3KBRA 3KFMA 2DVCA 1GVCA 4OESA 3C36A 1LSTA 2QS1A 2YPNA 2ZYKA 3ODBA 1B1HA 4H65A 1MRPA 1VFDA 3RPWA 5H8FA 1B7UA 4F3BA 3S9EA 1QUKA 1B2HA 4GRKA 2D5WA 2AL5A 3ECRA 4KCDA 4UA8A 1FQAA 2F78A 5H8HA 3G3KA 1ATGA 2CMOA 4IY6A 1HSEA 3KN7A 1WODA 1NKXA 3TTLA 1B58A 2DXYA 1FCKA 4YKPA 3LSLA 4EQBA 1JW5A 3MZBA 5I59B 4IO6A 5ICQA 1D9YA 2V3UA 4FECA 2P2AA 3OENA 5I56B 1DPEA 1PDAA 1MDP1 2PVUA 3CSGA 3K1PA 1DOTA 2P1SA 1WDNA 4NF6A 4R2BA 4RYAA 3N6TA 3UA8A 4RPOA 3K4UA 2ALUA 4ECFA 3RLFE 4N07A 1JW4A 1YTVA 2QL3A 4IO4A 4R9GA 1RYOA 4F31B 2GFEA 5I2NB 3QYTA 3RQTA 2Y7RA 4H6DA 4G8MA 3T93B 5EHMA 1LCFA 3OELA 2GHAA 4YB7A 2UXAA 3UK4A 3A09A 1IXHA 4WXJA 5IKBA 1N76A 3GZGA 3HV1A 4IO5A 4TLMB 4IO7A 1MS7A 2ZYMA 1LFGA 3MUQA 2HCAA 3PD8A 1M5CA 2ESNA 4K3FA 2RINA 3MVYA 1OIBA 4QFLA 1NNKA 1QULA 2OWTA 5L9OA 2DE4A 1MXXA 1MH4A 3IL1B 2IA4A 3AXFA 1Z7NE 3OSQA 3FASA 5H8NB 4ELQA 1US4A 4GL8A 1KWHA 3CRBA 3D4CA 3WAFA 4H5FA 4IO3A 3O28A 2IEEA 2Y7IA 2REGA 4E0XA 3OEMA 3PD9A 4YAHX 1S9TA 3HHGA 2Q89A 4POXA 5KCJB 3K6XA 4EQ9A 3EQ1A 1M5FA 3IOVA 4O3BA 5KDTA 4AB5A 5ELVA 1AH5A 3OEKA 1B4HA 1ZU0A 4NEDA 5DEXA 3OMBA 4G2ZA 3CI8A 4DZ1A 1XT8A 2F97A 4OFLA 4H8IA 1SW1A 1H45A 5I57A 3LSWA 4ND9A 4OHNA 1D4NA 2ZYNA 4FIMA 3IX1A 4GVOA 4LP2B 5TP9A 1XC1A 1ELJA 4QRZA 3LC8A 4JSDA 4KHZE 4KI0E 4OTEA 3TCHA 1SDXA 1UIUA 2Z22A 3PPNA 2PMSA 1GTKA 1DTGA 4E0WA 4N6PA 4ONYA 4DDDA 4F1UA 1MM6A 3N26A 4QSCA 3BBRA 4F3GA 4LZ8A 1EZOA 3EHTA 3FJ7A 3IO6A 1I6BA 1MY2A 1FTJA 3ILTB 1P99A 4QFPA 2PT1A 3Q28A 4G68B 2ABHA 1POY1 1SYHA 1URSA 2Y84A 5FHOA 4LVQA 3TELA 3MP8A 3TZAA 4ZECA 3CSBA 3TKDA 1RKMA 3BFUA 1TFDA 4QSEA 4KQPA 4KD5A 1N04A 5HBCA 4PFWA 5ISUA 1QUIA 3PUYE 4YKKA 3TCGA 1IITA 3L6GA 2DSFA 2E1SA 1MY4A 3VLUA 3FGSA 3PU5A 4GQOA 5JTYA 2DWAA 2R71A 4XKNA 4MLQA 1P1QA 1SVXB 1SBPA 3N6UA 4G4PA 1PBPA 1LAGE 3RTFB 5I84A 1R1NA 1EZPA 1ZJLA 1VFEA 1B7HA 2XXYA 3DP8A 3HHFA 2O51A 3O6HA 4RPNA 4GXAA 1EU8A 3TFLA 1BTJA 1MQIA 3E9XA 3U1OA 1VE4A 3OO6A 4FE8A 4PETA 3OD7A 2Z8DA 2D21A 3OO8A 4H0WA 3W9VA 3SERA 1MDQA 1NMUA 3S9NC 1SW4A 3C32A 3UN6A 3TUSA 4H1XA 1T0KA 1SW5A 5H8QA 1B3LA 4WEDA 2DQVA 3VVDA 5I2KB 3FJGA 1N7XA 1QUJA 2F5XA 1XOCA 1LBCA 2DP8A 4KPTA 4ZEKA 4PFTA 4JXIA 3KGCA 4BDQA 2UVGA 3K6WA 2RKMA 1B5IA 4Z0IA 5ICTA 3SEWA 1XVYA 1UTHB 1POTA 4RA1A 1QW0A 3Q29A 1B6HA 4OERA 4I1DA 4WKMA 4R72A 3CVGA 4LA9A 5JK4A 4RXLA 3HPIA 2HQ0A 5CMCA 3LBSA 4EUOA 4F18A 4MF3A 4Q30B 3T9XB 2F7AA 1USYE 2XD3A 4OFOA 4PP0A 3TQWA 3S2VA 1FTMA 2Y7PA 1ANFA 3HSTA 3E3KA 4JWYA 4O3AA 1A8EA 1B3FA 5K2YA 1I6QA 3PMWA 3UORA 4LATA 3VLWA 3SEVA 2F7BA 2QMWA 3FXUA 2R9JA 4DCYA 5FHNA 3A3UA 2UYFA 3RUMA 2O1MA 1HSJA 2V84A 1IXGA 4ISUA 4ZEBA 4ELPA 3FV2A 4OMBA 2PT2A 4YMBA 3H6UA 3SEYA 2HXWA 3E4RA 2V3TA 3H6TA 3MC2A 3RY3A 4ZEFA 3B6WA 2DOJA 3GXAA 5B70A 2DE3A 3EHSA 4DXUA 4ELOA 3N94A 5HPQA 2X26A 3I5OA 3O9PA 2F7CA 3PUVE 4ZEDA 1DTZA 2CZLA 2O84X 2ZNSA 1VSOA 4GXSB 1FQDA 3FVNA 3G3FA 4X1DA 2XX7A 4Z7EA 1MXWA 2V25A 2F6GA 2DWHA 2ZNTA 3K6VA 2Y7KA 4U4XA 5L8DA 4U2RA 2RC8A 1DSNA 4BDLA 3S9LC 1P1WA 3ONMA 3RT8A 4H8JA 1JEUA 5CMKA 1BIYA 3KN8A 4G77A 1MPBA 1IXCA 3QSLA 5AA2A 3FXQA 1M5BA 3QUFA 1MXVA 1URDA 2ZNUA 4JWXA 2BJJX 2VGQA 1FTLA 3UGWA 3HO7A 5TPAB 3IO4A 2VP1A 4KYSA 3CFZA 2H5YA 1OLCA 5LOMA 4OQOA 1N0TA 1Y9UA 3FATA 2XX8A 3T9UA 4QSDA 1MQGA 2NXOA 4XKPA 4AB6A 2ZXTA 4OENA 1FQEA 1N7WA 4L17A 2NOOA 4NF8B 1FW0A 2HAVA 1OVBA 3OO9A 3BFTA 4R6HA 4XTCQ 4AQ4A 1B0HA 2GH9A 1P1NA 4U1ZA 2XD2A 3FZVA 3IB1A 4RNSA 1D3KA 3MWBA 4LZ7A 3LSXA 5K2XA 1B3EA 1LGBC 1LLSA 2P0SA 2XXVA 3K6UA 4OXVA 1NNPA 3TCFA 3USDA 3TAJA 5IAIA 2HAUA 3H4ZA 1IIWA 3CR9A 3V89B 4GD5A 1H76A 1O7TA 1NFTA 2HZLA 3DELB 3IB2A 1B52A 3IOWA 1F9BA 2F6PA 1MQJA 1UTBA 3JV9A 4ZE9A 5A5XA 1JVXA 2I58A 4GOTA 4GWOA 2O1LA 4YB6A 2YJPA 3MW0A 3GLBA 5AA1A 3RGYA 3VVFA 4POWA 1YCJA 3O6IA 4HS7A 4EQ7A 3M8UA 4XIGQ 3C4MA 4OWDA 3G3HA 3QK6A 1JW1A 2OK2A 1RYXA 2H4IA 2ONRA 3C31A 1DPPA 1B46A 4F19A 4F3SA 3BKIB 4R73A 1A54A 4KR5A 2RC7A 2DWIA 4OYVA 2A5TB 1Y20A 1B9JA 1XHYA 1AL3A 4NF4A 1PEBA 1JQFA 1OLAA 4R6YA 4XKQA 2QPQA 4PFYA 1Q1KA 3L6HA 4HW8A 3M3LA 4R74A 4TQUQ 1SYIA 4X48A 4P0GA 4ZDMA 2HEUA 4DLDA 3IOUA 3PGFA 1R9LA 1IUDA 2O69A 2PX1A 3PPPA 1US5A 4NE4A 3SETA 1Z7ME 3TTNA 1USYH 4BLAA 3MVWA 2UVIA 1NL5A 2XXQA 3F11A 1R9QA 3JZJA 5I59A 4BDNA 3QIMA 4XKRA 2QRYA 1H3DA 3IAZA 3IJXB 3QAXA 4NF5B 1JETA 1B51A 5HM4B 1Y1ZA 2O7IA 5CMMA 3DP4A 1N84A 2NVUB 4ELRA 5I58B 3QXMA 4QFOA 5ITOA 2D3IA 1NH7A 3G3IA 2H25A 1NNTA 3E13X 2OZZA 4KFQA 1LB8A 1YAEA 3FV1A 3FUZA 4F39A 2QS4A 3RT6B 4G68A 3KSXA 1ZIUA 2QJEA 2RF1A 1GGGA 4G68C 4RJZA 3KOTA 1B40A 4NWCA 4ZZAA 3MBPA 1DMBA 5FTIA 4H5GA 3R6UA 1A7LA 5F7VA 1GV8A 3G7WA 4X9TA 4U4SA 1S50A 4BDOA 5FHMA 3S4UA 5EYFA 3C33A 4NF5A 1SI1A 5DYHA 2B3BA 4QFNA 3MVXA 1PB9A 3OXNA 2VD3A 5AA4A 3LR1A 4KYDA 5JTYB 1UTBB 1NNFA 2Q88A 4LQ2A 2XXWA 3GBBA 5H8FB 5H8NA 3SDFA 3IK6B 3TMGA 3K02A 4TOZA 2Z23A 3Q27A 4Q5TA 3TTRA 4DE8A 3FD3A 1YPNA 1B0LA 3R26A 2OWSA 4P11A 1QJMA 3A3CA 2Z8EA 1PC3A 4U1OA 2XXHA 3C34A 4IGTA 5CBRA 2XXUA 5DTBA 1GR2A 2XXXA 4I8CA 3R7XA 3TYHA 1B3GA 2UVJA 2VOZA 1B5JA 4GIZA 4HCYA 5DVFA 1SW2A 3TDJA 1Y3PA 5EHSA 3U92A 3WAEA 1MY0A 2QSXA 3O97A 2RCBA 1A55A 4R75A 3MZ1A 3PMVA 4DXBA 2A5TA 3KJ7A 1O63A 3VDFA 2Q2AA 5F1QA 4IO2A 3O66A 4EDPA 2OCUA 3VXCA 5AA4B 1SQYA 4NF6B 4YB5A 4F29A 1P1UA 3H06B 2O68A 3D4GA 3MJNA 4FJPA 5FTHA 4ZZEA 3SKPA 4N13A 3U94A 1OQGA 2PBWA 1MXZA 4G8NA 1IEJA 2THIA 4G8HA 2R6GE 1LBBA 4JWOA 3HN0A 1AOVA 3HCQA 2VD2A 3SEUA 2XXTA 1TXFA 2Q8JA 1TWYA 1H44A 3H3GA 3T66A 2VHAA 1LAXA 4IY5A 3H6VA 1Y3NA 3Q26A 1UIVA 1Y4CA 1IQ7A 2XX9A 2YLNA 1TFAA 3C35A 1ZMGA 4ZS9A 1N3WA 2X7PA 5CRYA 3OO7A 4YKJA 2ONSA 2H99A 4R2FA 3B6TA 3RTWB 3SEXA 3CIJA 2F35A 1URGA 2W7YA 1OQHA 1QKAA 2I0BA 3N5LA 2A5SA 4GLIA 1MY1A 2XXIA 2UVHA 3IJOB 4GF8A 5H8QB 1LFHA 1JNFA 4C1UA 4YZZA 4PE5B 2I4BA 2XHDA 5I57B 1UQWA 4THIA 4EF2A 1O64A 2DYXA 3IORA 3PPRA 5M2VA 4FATA 4RY1A 2DXRA 1NH8A 3PUZE 4BDRA 1AMFA 1MY3A 3VFJA 1JVYA 4ZE8A 1ZBMA 2X7QA 5KCJA 3K1MA 1MQHA 5AA2B 3DM0A 1Q35A 4F2QA 3THIA 3K00A 2AIXA 4QF9A 3RN8A 3ZS6A 2V93A 1MPDA 1S7YA 3QUJA 4OEUA 2HFBA 1M5DA 2UYEA 5TPAA 2F36A 1IZ1A 1PBQA 1MQDA 2ZMBA 3OOAA 4M4GA 2I3WA 1MXUA 2QMXA 5CI5A 2PYYA 5AE4A 3T96B 3K0VA 2I4CA 3ZSFA 5L9SA 1A99A 2I49A 1D9VA 1CE2A 1EZ9A 3H6WA 2DVZA 3I3VA 3KJTA 3MAMA 4IGRA 4F22A 1SI0A 4M1VA 3C9HA 3MP6A 4JSOA 1A8FA 1FQBA 1I6AA 2FYIA 3IOTA 4YICA 3B6QA 3O29A 4EXKA 3Q25A 2M8CA 4QFKA 2ONKE 3MQ9A 2O7UA 4MH5A 2Q2CA 1JEVA 2AL4A 4ZEIA 1Y3QA 2B65A 1LCTA 3CG3A 5DT6A 3MPLA 3VE1B 3CFLA 4IB2A 5KDTB 4NWDA 3MP1A 4LUBA 3V5AA 2FA7A 4LONB 1AIVA 4NMYA 4U21A 3TQLA 2OBGA 1FQCA 5TP9B 2V3QA 3PMXA 5I2KA 1OVTA 2ANJA 5CMBA 1A40A 3UIFA 1ZKBA 3SESA 4DXCA 3G3JA 3LUYA 1B05A 2DWJA 3O2AA 1BLFA 3KSJA 3CG1A 3UP9A 4O3CA 4F2OA 2I0CA 4HCWA 3EF7A 1IXIA 4YKIA 3K1NA 4DIGA 3IB0A 4FEDA 4I9DA 1B32A 3DLNA 4LQ5A 3IR1A 4R6KA 3KG2A 2KLFA 5JEIA 3PV0E 2DE2A 3RNNA 3EHUA 5TU0A 4FAJA 4FEBA 1PB7A 2HZKA 1QVSA 4DCXA 3U8QA 3PPQA 4ESWA 4KCCA 5DVJA 1EH3A 2NUVA 4F1VA 4P0IA 1Y4TA 1M5EA 3M3FA 3T9HB 2AYSA 5I56A 5BUUA 3MZ9A 3ZKLA 1FTKA 4OFJA 1J1NA 3MPKA 1BP5A 4U23A 1MXYA 2I3VA 3FJMA 2RC9A 3FVGA 4X1BA 1FTOA 4GL0A 2H98A 4C0RA 3JYRA 1LB9A 2NWJA 5ITPA 1N3XA 3EPEA 3M3KA 1MH3A 4Q0CA 1B5HA 5A5XB 4QHQA 2F8DA 3TEPA 5AA3A 2F34A 1PB8A 4LZ5A 3FVKA 1XVXA 4OVJA 4YMAA 4OEVA 3S9MC 4BDMA 5CBSA 5H8HB 1SD3A 3TODA 3T22A 3VV5A 3H7MA 3VLVA 4Q8RA 2GHBA 1MM7A 1LAHE 1FQFA 2DS9A 3KZGA 3V8XB 1QKBA 5CC2A 5L9MA 2GRVA 1H43A 3GBAA 3LSFB 4MLVA 3TPAA 4KYEA 3P7IA 3TTMA 1UTHA 1WVJA 2ZYOA 2XXRA 4OZ9A 5J1DA 4YU0A 3FIRA 3KEIA 4NF4B 4TLLB 5AA2D 1II5A 4R9FA 5DVIA 3TTKA 2Y7WA 2B3FA 5BWJA 2I48A 2OLBA 4XXUA 5KZTA 2I6EA 3OSRA 3W9WA 3PPOA 2WKYA 2LAOA 2XXPA 3CFXA 2G93A 4PFUA 5I2NA 4NF8A 3U93A 2E0SA 4C1TA 4EXLA 4GFRA 1XS5A 4JBZA 2O6AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GX3A 4PE3A 2FNCA 4F1YA 1BKAA 4MBPA 3ZKKA 3K01A 4JVDA 4RK2A 5IZZA 1L5TA 4UACA 3W15C 2Q9TA 3BIHA 1OMPA 2RCAA 1B1XA 4ESXA 1ZLQA 5IZ3B 4H67A 4OESA 1B1HA 3S9EA 3ECRA 4NG7A 1FQAA 3GYYA 3G3KA 2CMOA 1FCKA 3K1PA 4NF6A 4R2BA 3ISPA 3MSTA 2ALUA 4P1LA 1YTVA 4IO4A 1RYOA 2GFEA 5I2NB 3QYTA 5EHMA 3OELA 3UK4A 4WXJA 2FBPA 1MH4A 5H8NB 1US4A 2IEEA 3OEMA 1S9TA 3EQ1A 1K9YA 4O3BA 5ELVA 1ZU0A 5DEXA 4G2ZA 4DZ1A 1SW1A 3LSWA 4ND9A 4OHNA 4GVOA 4LP2B 5TP9A 4QRZA 4JSDA 4KHZE 4KI0E 4OTEA 3PPNA 1GTKA 4DDDA 1MM6A 4QSCA 3HFUA 1EZOA 4GBVA 3IO6A 4QFPA 1MY2A 3ILTB 1P99A 4G68B 5FHOA 3TKDA 1KZ8A 4QSEA 1TFDA 5ISUA 2DSFA 4GQOA 5JTYA 2DWAA 2WX9A 1SBPA 3N6UA 1VFEA 4ZE9A 2XXYA 2O51A 1VE4A 4FE8A 4PETA 3OD7A 2D21A 2ZZWA 4H1XA 1T0KA 1B3LA 4WEDA 3NOHA 1QUJA 4KPTA 4PFTA 4JXIA 4BDQA 5ICTA 1XVYA 1IMAA 4RA1A 3Q29A 1B6HA 4WKMA 3CVGA 2HQ0A 5CMCA 4F18A 4MF3A 1USYE 1I6QA 2DDKA 2XWKA 2UYFA 1RDXA 3BIGA 3H6TA 3RY3A 4ZEFA 2DOJA 4DXUA 3IFAA 3O9PA 2F7CA 4N4UA 1VSOA 1BK4A 2DWHA 3K6VA 4OANA 4H8JA 5CMKA 3FXQA 1URDA 4O94A 5TPAB 3IO4A 4OQOA 1FBHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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