5I2NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
b'MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 81
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB02
1P1OA 1I69A 1MM7A 2XXQA 1D4NA 2R9JA 3RPWA 4F18A 2F8DA 4FEBA 3FASA 1QJMA 1J1NA 2QS1A 3G7WA 3OEKA 3U72A 4ZEKA 4BDRA 3SESA 1PB7A 1LSTA 4KYEA 1XVYA 3Q28A 4KYSA 4IY6A 4BDLA 2VOZA 4JB7A 4O3CA 4OESA 4OHNA 3F11A 1YAEA 4PFWA 3VLVA 3ZSFA 1SVXB 2I48A 1IEJA 4IGTA 1B4HA 1RYOA 1B52A 4GXSB 4TLLB 1BTJA 1JW1A 2Z8FA 2O1LA 2H5YA 5TPAB 1BKAA 5AA3A 1H45A 3O6GA 4EQ7A 4XKNA 3S9MC 2GHBA 3RNNA 1USYE 1Y4TA 3I3VA 3FVNA 4NF8A 1QVSA 5L8DA 3TZAA 1EZOA 1MH4A 3KJTA 3H4ZA 1MG1A 2I0CA 3TMGA 4FEDA 3VFJA 1MPBA 1GTKA 3S4UA 3SEXA 1MQJA 4R9GA 3S9NC 1LCTA 3SEUA 4BDMA 2QMXA 1UQWA 4MFIA 1LAXA 3PU5A 2H99A 4N13A 4YKJA 3GBAA 1B7UA 4GIZA 4ISUA 3CVGA 1TFAA 1IXHA 3SEVA 1B7HA 1H76A 1WVJA 3K6UA 1SYIA 2DP8A 2NUVA 1MRPA 4Q5TA 4BDNA 2HAUA 1B0LA 3OO8A 3QK6A 3EHSA 4KD5A 4AB5A 2PT1A 4KHZE 4DCXA 1HSEA 1GVCA 3TTLA 4ZECA 5H8QB 4NF8B 2Y84A 1JNFA 4L17A 3IOVA 3MW0A 1EZPA 4R6HA 3Q26A 3MAMA 3QUFA 1VFDA 5I84A 3N26A 1ELJA 4QHQA 2HZLA 3G3IA 4F19A 3QSLA 2ZNSA 1FQDA 4EXKA 4P0IA 2D21A 2RCBA 3C4MA 2WKYA 1OVBA 4IO3A 5DT6A 4NWCA 4XKRA 3IOWA 5EYFA 2DS9A 4XKPA 3KZGA 1NMUA 4DLDA 3SEWA 4F39A 3KG2A 1ZU0A 4ZE9A 4NF5A 3TDJA 1IXGA 2YPNA 1LB9A 5FHNA 3RUMA 1URSA 2RCAA 4QFOA 4GF8A 3IK6B 4NF6A 1JQFA 3BFTA 2KLFA 4F3PA 4RPNA 3TTMA 1LBBA 2ZYKA 3HCQA 1L5TA 3S9EA 3O28A 2XX9A 2D3IA 1JW5A 4NF4B 3MZ9A 2PT2A 3R26A 1Y20A 5KDTA 4GWOA 2AL5A 2I58A 4I9DA 2HZKA 5CI5A 1B3GA 3O2AA 3N6TA 3H7MA 1JETA 1B40A 3FV1A 1ZTYA 5CM6A 2XXXA 3FJGA 3UIFA 1ZKBA 3E3KA 4F3SA 2Z8EA 5H8NA 1D3KA 4O3BA 4EUOA 5H8HA 3EN3A 2QS4A 2XXIA 2Y7KA 3CFZA 3VVEA 3MJNA 2VP1A 2VD3A 3OENA 3PD9A 2UVIA 3C31A 1SDXA 2F34A 2HEUA 2F5XA 4NF5B 2XXUA 2ONRA 2XXYA 3MWBA 3OELA 1BIYA 4BDQA 5HPQA 1S9TA 5I2KA 4F31B 4NF6B 4YB5A 4ZEBA 5I57A 3U1OA 4PE5B 4X48A 3IJXB 3S2VA 2XX7A 1ZJLA 1S7YA 1N7XA 2NVUB 4OMBA 5BWJA 2XX8A 2XHDA 1B32A 1MXXA 3K02A 5I59A 1NH7A 2ONKE 1LFIA 2O68A 5KDTB 3FV2A 2O51A 1BLFA 3FJ7A 4G8HA 1IXCA 3R7XA 3MPKA 1WDNA 4LATA 3E9XA 4ESXA 2ZXTA 2G29A 4ZEIA 4H67A 1EZ9A 1B46A 3G3GA 1B3LA 5H8NB 4P11A 4MLQA 3L6HA 2OLBA 1YCJA 2I0BA 5H8HB 4XIGQ 1B3FA 4IO7A 3ODBA 1USYH 4F29A 1LGBC 2QS2A 1H3DA 3KJ7A 4EDPA 3FZVA 1MY3A 2DVCA 3MVZA 1P99A 1A8EA 3T9VA 4GLIA 4OETA 5I2NB 1AMFA 1N3WA 4RA1A 3H6TA 3SEYA 2DWHA 3ZKLA 5I57B 4R74A 3U8QA 4M1VA 4Z7EA 3O29A 1NNPA 1NL5A 3PUYE 3HN0A 3T9XB 4I62A 1PBPA 3FXQA 4RY1A 4QSEA 3THIA 1FQAA 3G3HA 3E4RA 5I59B 3RT8A 3H6VA 2X26A 4BLAA 1B2HA 3KSJA 3T66A 3UK4A 4TQUQ 5HBCA 4C1TA 3U94A 3TCFA 3HHFA 4LP2B 4OFJA 4F3GA 2I3VA 2ZMBA 1N04A 5EHSA 3V5AA 2XXRA 3T96B 3RTWB 2M8CA 3TPAA 1Y3NA 1LAFE 2B65A 4E0XA 2QPQA 3V83A 3O9PA 2VGQA 5CBSA 2HFBA 4PFYA 1I6AA 1M5EA 1UTHA 4NE4A 4PFTA 3TQWA 2ANJA 1POY1 2V93A 3N6UA 4JBZA 3V8XB 4R73A 2DXRA 1AL3A 2I49A 1NNFA 4BDOA 4F22A 1MQIA 3FIRA 4H65A 2W7YA 4DXUA 1TXFA 1B1HA 4IO5A 3B6WA 2XXPA 2DVZA 2X7PA 4QFNA 1R1NA 5F1QA 3H6WA 1B51A 4OERA 1ATGA 4IY5A 3OMBA 3VV5A 2XXHA 2B3FA 2O7UA 4IGRA 4GRKA 2DWAA 1B1XA 3K1PA 1XS5A 3CFXA 1H44A 4GD5A 4YMBA 3W9VA 5CMCA 4POWA 2DE4A 3M3LA 3RN8A 2FA7A 1YTVA 2P2AA 4M4GA 1R9QA 4G2ZA 1UTHB 3M3FA 1QKBA 3FGSA 3WAEA 1IUDA 1US4A 2Z23A 1QW0A 1VSOA 3BFUA 2FNCA 2QSXA 5FTHA 1P1UA 3MC2A 4JWXA 2O84X 2UVJA 4KPTA 3RTFB 5H8QA 1TFDA 4I1DA 1EU8A 2ZNUA 4KR5A 3MPLA 3LSXA 2OBGA 1IITA 3H3GA 1YPNA 1XHYA 1QKAA 4LA9A 2NWJA 1JVXA 3UGWA 2H25A 3ILUB 5ICQA 3MZBA 4R2FA 4POXA 4ZZEA 5B70A 4F2QA 4U22A 3FATA 2OZZA 2OK2A 1Y1MA 4TLMB 4YMAA 4FE8A 1POTA 4NWDA 3TODA 4DXCA 4WEDA 1B05A 3USDA 5F7VA 5FHMA 1A7LA 1GV8A 3QXMA 1B7ZA 1AIVA 5JK4A 3IO4A 4PFUA 1LB8A 4OQOA 3OSQA 3GZGA 5K2YA 4G8MA 2ABHA 1CE2A 1O7TA 3O6IA 4NEDA 4I8CA 3VE1B 2F36A 1FQFA 3HO7A 3PGFA 4NF4A 2DQVA 4R6KA 5H8SA 3L6GA 3K6XA 4ZEFA 2I4CA 4FORA 3S9LC 2F97A 4AB6A 2H9BA 3LUYA 2V3TA 1FTLA 3B7DA 2RC8A 2ZNTA 1JEUA 1XVXA 5CMBA 4UACA 1TWYA 4U1OA 1MQDA 3IL1B 1MQHA 1Q35A 4Q30B 3IOTA 4HTGA 4OZ9A 3U93A 4DZ1A 4YZZA 2O7IA 3TTNA 2AIXA 2Z22A 3LSLA 4JSOA 3EHUA 2FYIA 1JVYA 2E0SA 5LOMA 4F1UA 3IOUA 3FVKA 1II5A 3GBBA 4C0RA 1LLSA 4G77A 2IEEA 1SW4A 2H4IA 2DSFA 1D9VA 1MY4A 2H98A 4QFPA 4EQ9A 4F3BA 3LBSA 4YKIA 3K4UA 1MM6A 5I58A 1DSNA 3UORA 1OVTA 2V84A 3FUZA 4H8IA 2QMWA 4IO4A 5KZTA 3O66A 3OO9A 1MY1A 3I5OA 3CFLA 2V3UA 3K01A 4QRZA 4EF1A 4N07A 5CRYA 3EPEA 1MPDA 3EHTA 1LFGA 5AE4A 5ELVA 5I2NA 1MDQA 4X1DA 2QS3A 4JXIA 1IXIA 3T22A 4JSDA 1FTJA 3IB0A 2X7QA 2O6AA 3TKDA 3W9WA 3Q25A 2CMOA 3G3KA 1A40A 2Q88A 4RK2A 3Q29A 4OEUA 2UVGA 1PC3A 3KOSA 3SETA 3LR1A 1I6QA 2DWIA 2RC9A 3VLUA 2ZYNA 1MS7A 3CSBA 2V25A 3GXAA 4NTLA 3VLWA 1DPEA 2F7AA 5FTIA 1DPPA 3MUQA 5I58B 1N84A 3HV1A 5JTYA 2I4BA 3FXUA 2UYEA 4R6YA 3OEMA 1URDA 2HQ0A 5ITPA 1M5FA 3TYHA 4Z0IA 2RF1A 3K6WA 1MXZA 1ANFA 1Y3QA 3KN7A 1SBPA 2A5TA 1MDP1 1UTBA 1SW5A 3EQ1A 1AOVA 3N94A 3C9HA 3DM0A 1LBCA 1GGGA 1N0TA 3MP8A 3BBRA 4LVQA 1P1WA 3TELA 2UXAA 2RINA 3RLFE 1P1QA 3K00A 4OFLA 1LAGE 4IO2A 4K3FA 1ZLQA 4KFQA 1HSJA 5A5XA 3T9HB 2PBWA 5AA2A 3O97A 3RY3A 4DIGA 1PDAA 1SW2A 4WEPA 2Y7IA 4PQJA 4R72A 1LFHA 1A99A 1QUIA 5IAIA 3ILTB 3N5LA 1R6ZA 4OYVA 5BUUA 3G3FA 4NMYA 4RYAA 1Q1KA 4GL8A 4YB7A 1MPCA 3IB2A 5JTYB 4DXBA 3OO7A 3H6UA 4MLVA 4JWYA 1KWHA 5ICTA 3D4GA 3PMVA 4H8JA 3MVXA 1MY2A 3KN3A 3C34A 1FQCA 3IORA 2QJEA 3IR1A 2Y7RA 3M3KA 4LQ5A 4ONYA 2D5WA 4G68C 2ONSA 4G4PA 1Y9UA 4PP0A 4U21A 4YKKA 1DMBA 3TCHA 1RYXA 2A5TB 1VR5A 4FIMA 1UTBB 2YJPA 3CG3A 3CIJA 1MXVA 3TTRA 1MXYA 1IZ1A 3C33A 2GRVA 3CG1A 1B4ZA 1NH8A 4HS7A 1FCKA 4MF3A 3PMXA 3KSXA 3QYTA 5A5XB 1Y1ZA 5AA2B 3C32A 4RJZA 3Q27A 4G68B 4X1BA 5H8FA 1MH3A 1D9YA 2XXTA 4RPOA 1O63A 4OWDA 4R75A 4AQ4A 2Z8DA 5DYHA 4ZS9A 4DE8A 1ZMGA 1SI0A 4MH5A 3MVWA 5DEXB 4LUBA 4YU0A 1A55A 4HCWA 1XC1A 4FATA 1UIVA 1P1NA 4GOTA 4LZ8A 3G3JA 3QUJA 2Q9TA 5TU0A 1PEBA 3T93B 2F78A 5AA2D 4RK9A 4H5FA 1FQEA 1H43A 2Q2CA 3C35A 4YICA 2QRYA 3TUSA 2GHAA 4P0GA 1M5DA 2UVHA 3MVYA 4ZE8A 3WAFA 4GXAA 3LSWA 1PBQA 4H1XA 4ELPA 4DDDA 5CBRA 2O1MA 3OSRA 1UIUA 4EXLA 5I56A 3V89B 1NNTA 4JDFA 2DE3A 3R6UA 3PPRA 5H8FB 1XOCA 3C36A 2XXVA 3IB1A 2REGA 5KCJB 2LAOA 4EQBA 3DELB 2XXWA 3PPPA 3W15C 4QF9A 3EF7A 5TP9A 2G93A 4THIA 3PPQA 2R6GE 2RKMA 4H5GA 2R71A 5CMMA 1F9BA 2PVUA 1AH5A 2CZLA 3K1NA 3KGCA 4QFLA 2OWSA 2F6PA 4ECFA 5AA4A 3SERA 3O6HA 5IKBA 1QUJA 3A09A 1SQYA 4GFRA 2ZYMA 3T9UA 3VVDA 5JEIA 4U1ZA 2B3BA 2PYYA 3PUZE 1TT1A 2DE2A 1RKMA 4R9FA 1XT8A 3OOAA 4U23A 3BKIB 3HSTA 4LZ7A 1OQHA 3AXFA 2DXYA 1BP5A 5I56B 3GLBA 1NNKA 3H06B 3CI8A 5ISUA 3OXNA 2DWJA 3PUXE 3CSGA 4LONB 5FHOA 1NFTA 3H03A 3FVOA 3PUWE 1GR2A 3DLNA 1PB9A 3ZS6A 2Q8JA 5TP9B 4F1VA 2NOOA 5K2XA 3I6VA 3JZJA 2QL3A 1SI1A 2HAVA 2E1SA 3RQTA 3UA8A 2Y7WA 2IA4A 5CC2A 1DTZA 4ZEDA 4HW8A 1CB6A 1B3EA 4LZ5A 1JW4A 4WKMA 2PX1A 1EH3A 4FJPA 3KOTA 5AA4B 1ZIUA 3VXBA 5DVIA 1OQGA 1M5BA 4XTCQ 3CR9A 1PB8A 4OVJA 5DVFA 1OLCA 2P1SA 3MZ1A 2AYSA 3M8UA 3KBRA 2O69A 3JV9A 3IJOB 2I6EA 3SKPA 3FD3A 1FQBA 2OCUA 4UA8A 4KYDA 1T0KA 1SD3A 3D4CA 4N6PA 4XKQA 4ELRA 3TQLA 4OTEA 3B6QA 3DP4A 1MQGA 4KCDA 3HHGA 4U4SA 2A5SA 1B9JA 4ELQA 2BJJX 1Y4CA 2ESNA 5DVJA 1R9LA 4IB2A 3OO6A 4KCCA 1B5HA 1S50A 5L9OA 2VHAA 3LC8A 3HPIA 5CMKA 1IIWA 2OJTA 1B5IA 3DP8A 4YB6A 2Q2AA 3MP1A 4TOZA 5B7DA 4XXUA 5DTBA 4F1YA 4Q8RA 3UP9A 1Z7NE 2I3WA 4GVOA 4FECA 3FXRA 2THIA 4PETA 1DOTA 3CRBA 4YAHX 1MXWA 4G8NA 3PPOA 2DYXA 1N3XA 4KI0E 1OIBA 3P7IA 4QFKA 4KQPA 3TEPA 1LAHE 2ZYOA 1Z7ME 2XD3A 2F35A 2ALUA 3U92A 3TCGA 4ZZAA 4WXJA 1QUKA 3PD8A 4DCYA 3E13X 4FAJA 1M5CA 3ONMA 3A3UA 1JEVA 2PMSA 1LCFA 4GL0A 2GH9A 3TAJA 2DOJA 4C1UA 4ELOA 4H0WA 2V3QA 1FW0A 3MQ9A 1IQ7A 3UN6A 1B5JA 4RNSA 4HCYA 1NKXA 2P0SA 4RXLA 3VDFA 1B0HA 1FTKA 4OENA 2AL4A 1DTGA 3MP6A 1VE4A 1HSLA 2REJA 4OXVA 5AA1A 3PUVE 2GFEA 3DP6A 3VVFA 3B6TA 4IO6A 1B6HA 3ZKKA 1URGA 3K2DA 5I2KB 1SYHA 2Q89A 1US5A 4LQ2A 2UYFA 4X9TA 2HCAA 3SDFA 1MY0A 4JWOA 1N7WA 4Q0CA 2VD2A 3JYRA 4G68A 4E0WA 2F7BA 2Y7PA 1ZBMA 1FTOA 1OMPA 3KFMA 5J1DA 5M2VA 3IAZA 4ZDMA 4ND9A 3PPNA 5DEXA 1B58A 3QAXA 4QSDA 4GQOA 1WODA 5HM4B 3PMWA 3A3CA 2F7CA 3KN8A 2HXWA 1SW1A 3TTKA 1A54A 4MBPA 1B3HA 2OWTA 5L9SA 2F6GA 3QIMA 4R2BA 4ESWA 4OFOA 3IO6A 4F2OA 1FTMA 3RGYA 1OLAA 1QULA 1Y3PA 3PV0E 4YKPA 4U4XA 3VXCA 4H6DA 3ECRA 3FJMA 3TFLA 2XD2A 3LSFB 3FVGA 1A8FA 5TPAA 3K6VA 1N76A 2YLNA 1MXUA 4U2RA 3IX1A 3MBPA 3KEIA 4QSCA 5L9MA 2RC7A 5EHMA 4EF2A 5KCJA 3K1MA 4O3AA 5ITOA 3RT6B 4OEVA 2NXOA 3K0VA 1VFEA 3OD7A 1O64A 1I6BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P1OA 1I69A 3U65A 1FBEA 1MM7A 1NUYA 2XXQA 1D4NA 2R9JA 2WBBA 3RPWA 4P3LA 4F18A 2F8DA 4FEBA 2FIXA 3FASA 4KXPA 1QJMA 1J1NA 2QS1A 3G7WA 3OEKA 3U72A 4ZEKA 5IZZA 4PF8A 4BDRA 3SESA 1PB7A 1LSTA 4KYEA 1BK4A 1XVYA 3Q28A 4KYSA 4IY6A 4BDLA 2VOZA 4JB7A 4O3CA 4OESA 3LV0A 4P1LA 4OHNA 3F11A 1YAEA 4PFWA 3VLVA 3ZSFA 1SVXB 2I48A 1IEJA 4IGTA 1DK4A 1B4HA 1RYOA 1B52A 4GXSB 4TLLB 1BTJA 1JW1A 2Z8FA 2O1LA 2H5YA 5TPAB 1BKAA 1NUWA 4HXVA 5AA3A 1H45A 5I5PA 3O6GA 4EQ7A 4XKNA 3S9MC 2GHBA 3RNNA 1USYE 1FPDA 1Y4TA 3I3VA 3FVNA 4NF8A 1QVSA 5L8DA 3TZAA 1EZOA 1MH4A 3KJTA 3CHGA 3H4ZA 4JVCA 1MG1A 2P3NA 4I3EA 2I0CA 3TMGA 4FEDA 3VFJA 4PDHA 1MPBA 4PGPA 1GTKA 3S4UA 2WYPA 3SEXA 1MQJA 4R9GA 3S9NC 1LCTA 3SEUA 4BDMA 2QMXA 1UQWA 4MFIA 1LAXA 3PU5A 4PTKA 2H99A 4N13A 4YKJA 3GBAA 1B7UA 4GIZA 4ISUA 3CVGA 1TFAA 1IXHA 3SEVA 1B7HA 1FBHA 1H76A 1WVJA 3K6UA 1SYIA 2DP8A 2NUVA 1MRPA 1NV4A 4Q5TA 4BDNA 2HAUA 1B0LA 3OO8A 3QK6A 3EHSA 4MNIA 4KD5A 1NV7A 4AB5A 3FXBA 2PT1A 4KHZE 5ET6A 4DCXA 1HSEA 1GVCA 2CEXA 3TTLA 3IFCA 4N8YA 4ZECA 2JJKA 5H8QB 4NF8B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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