5I2NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 81
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB02
3ECRA 3I5OA 3MPLA 1DOTA 1B5HA 3RUMA 5HBCA 5KDTB 4H0WA 2LAOA 3FV1A 2ANJA 2I58A 3AXFA 3RY3A 1XVXA 1YPNA 4DCYA 1NNTA 3PMXA 1H76A 1N3WA 5DEXA 4UA8A 5H8HA 1FQCA 5KCJA 4RA1A 3OEKA 2DS9A 1S50A 2FYIA 3N5LA 4YKIA 2GHAA 2Y7RA 3SEVA 3CIJA 5H8QB 3K0VA 4R75A 3T22A 2DWAA 1BP5A 1QUIA 4GL8A 1B1XA 3OO7A 2HCAA 5K2YA 4OYVA 4R73A 4YB6A 3C31A 5HM4B 2VHAA 4ELPA 2A5SA 1P1UA 5CMMA 5KDTA 5H8FB 3F11A 3PPOA 1LSTA 3HV1A 5DVIA 2QJEA 1B3HA 5L9MA 3KSXA 2DVZA 1IXHA 1SW2A 2ZYOA 4C1TA 1OVBA 3PPRA 1MM7A 3TMGA 5I2KB 4G77A 3H06B 4TLMB 1P1WA 2Y7IA 2W7YA 5H8QA 3G3IA 3MZ1A 4XXUA 3S4UA 2DWHA 4JWYA 1MXUA 2DE4A 3IOVA 1N76A 3PUVE 4DIGA 3FGSA 4RPNA 3ONMA 2V3UA 3DP4A 4G68C 3R6UA 3TYHA 5CMKA 2Q88A 5AA2D 4POWA 1D3KA 1QUJA 2Y7KA 4EF2A 4HTGA 3IB0A 2UVGA 2Z8FA 3IL1B 4F3PA 3MBPA 4MFIA 1OLAA 5H8FA 3PPNA 2B65A 3OO9A 4HCYA 3Q28A 3Q29A 2RC7A 4XKPA 5H8NB 1UTBB 1GV8A 3O6HA 4JB7A 1MQHA 4IO7A 4BLAA 2DE3A 4IGRA 3IOTA 2FA7A 2O69A 4QSEA 1MXWA 5TU0A 1MDQA 4ESXA 3FVOA 5I2KA 3OENA 4WXJA 3TDJA 4UACA 2D21A 3C33A 4P0GA 2XXTA 4YB7A 5I59B 3ILTB 1QVSA 1SYIA 4OTEA 2P2AA 4PFWA 1B7HA 2O51A 5M2VA 1SI0A 2GHBA 4IO3A 2ESNA 3QUJA 2XXWA 4ZEKA 3IAZA 1SD3A 2ONKE 3SERA 1NNFA 4OETA 3BFUA 2V3QA 1FQAA 5L9OA 2HAUA 4YZZA 4FJPA 1P99A 4QSDA 5H8NA 3H7MA 3G7WA 4IO2A 4GVOA 3S9LC 2D5WA 3FJMA 1XC1A 4R9FA 4FAJA 2DE2A 4JBZA 3TODA 3FUZA 3V8XB 2F7CA 4LONB 4N13A 1B58A 3EPEA 2XXYA 3LSLA 1IXIA 1A99A 4BDLA 1MY1A 3CI8A 1YCJA 3VVEA 2IA4A 3EQ1A 4YKJA 1EU8A 4OFOA 3T96B 1MQGA 3IORA 2HZKA 1Y4TA 1JVYA 3FD3A 2G29A 3VLWA 3IB2A 4U1OA 1MS7A 5FTIA 1IIWA 4ZEFA 4PE5B 1FTMA 4N6PA 4LZ8A 2F35A 2QPQA 3U8QA 1O64A 3C35A 4RK9A 4BDRA 1S7YA 3HCQA 1LAFE 4U2RA 4XTCQ 3VXCA 4R9GA 3MAMA 3M3LA 1JW1A 3UK4A 4NF8B 5I84A 1US5A 1MY0A 5I2NB 1M5BA 4JSOA 4KYDA 3TCFA 2XXHA 2ZYMA 4OXVA 2DWJA 3K01A 5TPAA 3FV2A 1Z7ME 1RYOA 3MZ9A 4ZZEA 4LVQA 2XXQA 3PD9A 4FEDA 4AB6A 1US4A 1NNKA 5ICQA 1B3GA 1Z7NE 4ZZAA 2VD2A 3R7XA 2VP1A 1MXYA 1QKAA 2H5YA 5CI5A 3K6XA 3TQWA 4F1UA 2M8CA 4RNSA 1ATGA 1PC3A 4L17A 3OXNA 2NXOA 4X1BA 1XHYA 1TFDA 4HCWA 3T93B 2DOJA 1SBPA 4GFRA 3QSLA 5H8SA 3EHTA 2F7BA 4NF8A 3C34A 3I3VA 1ZBMA 3PU5A 3V5AA 5I2NA 5IKBA 4QFOA 3HHGA 3HSTA 4YMAA 4X48A 2B3BA 3KEIA 1XVYA 2O7UA 4AQ4A 2VGQA 1AL3A 2OJTA 4F3SA 2QL3A 1TWYA 1BLFA 4ZECA 3UA8A 4DXBA 1AIVA 3QXMA 1SQYA 3H6WA 1M5DA 2F97A 5AE4A 4OEVA 1JW5A 3H6TA 1ZMGA 4WEDA 4U4SA 3Q25A 1VSOA 1IQ7A 3RTWB 1LCFA 4JXIA 3G3GA 3KOTA 3RPWA 1H3DA 3V89B 1IXCA 2H98A 1D9YA 3L6GA 1CE2A 5CMCA 1P1OA 3T9HB 3IJOB 2OLBA 4BDQA 3FVGA 3IJXB 1URSA 3M3KA 4THIA 3TPAA 1DMBA 2ZYNA 3C4MA 4G8HA 4LQ2A 2DP8A 4G68B 2XX7A 4OFLA 1POTA 2F7AA 3ZKLA 4M4GA 3CRBA 1CB6A 2F34A 3SDFA 3DP8A 1MY2A 1FQDA 4OWDA 2Q89A 4U21A 3O2AA 1A40A 4H6DA 4MBPA 2O7IA 1KWHA 4H5GA 3MP6A 1FQBA 4OZ9A 3KFMA 1Y3QA 2THIA 3D4CA 1Q35A 4ONYA 1AOVA 5FHMA 1JETA 1AH5A 1ZTYA 1SDXA 2VD3A 2Q8JA 3KBRA 1B6HA 4NEDA 4C1UA 3TCHA 2XXUA 2YPNA 1F9BA 2IEEA 4R6HA 1R6ZA 2PT1A 3K1MA 3BFTA 4XIGQ 2Z8EA 1WDNA 3DP6A 2XX8A 3PUZE 3D4GA 4NE4A 4QFKA 1B5IA 1UIUA 2Q2AA 3ODBA 1PBPA 3IB1A 1WVJA 5B7DA 3RGYA 2RKMA 1AMFA 5CM6A 3FVKA 3MZBA 2P0SA 3DLNA 2GH9A 3KSJA 1B32A 2I4CA 1PEBA 4K3FA 1PDAA 2CMOA 3UGWA 4YB5A 4F3BA 4MH5A 1QJMA 1ANFA 4H8IA 3JZJA 4ZE9A 3USDA 1MDP1 2I3VA 3I6VA 2AIXA 4U4XA 4KQPA 1UTHB 2ALUA 3RNNA 3TQLA 1MPDA 3E9XA 1B3FA 2HFBA 3H03A 3TTNA 3MUQA 4O3BA 1J1NA 5I57B 2F6PA 4H65A 2DXRA 4X9TA 2F78A 5CC2A 1MY3A 3K00A 3A09A 3VVFA 5CMBA 1OVTA 4NF4B 2RC9A 3N6TA 1P1QA 5ITPA 1MY4A 3CSGA 2RC8A 3O6GA 4O3CA 3PPPA 3S9NC 3MVZA 4OENA 3HHFA 2AYSA 3KN3A 4FIMA 4ZDMA 2PYYA 2Z22A 2Q2CA 3HO7A 4DLDA 3PV0E 4TOZA 2Y84A 4U22A 4OMBA 3K02A 1ZU0A 1UTHA 2RINA 4Q0CA 5I56B 2UXAA 4OERA 5L9SA 3OO8A 4R72A 4KYEA 2OWSA 1N84A 4PQJA 1B2HA 4QRZA 1DPPA 5AA2B 2D3IA 3E4RA 1JVXA 5ICTA 1MXZA 2HQ0A 4Q5TA 2ZNTA 4JDFA 2DQVA 1HSEA 4I62A 3T9UA 2UVHA 1OLCA 5JK4A 4JSDA 5BUUA 4RK2A 1A54A 4PFYA 4F31B 1LLSA 4NWDA 4XKRA 3G3KA 3EHUA 4QFLA 1M5FA 4G8NA 4QFPA 2CZLA 5CBSA 1M5CA 4H1XA 1UTBA 3K2DA 2QS4A 4YKPA 4OVJA 4PFUA 3VLVA 1N7XA 4EQ7A 2PT2A 2ONRA 2O84X 3KJTA 3P7IA 3U92A 2AL4A 3O29A 2OK2A 1IUDA 4MF3A 3VDFA 1N0TA 3THIA 3UORA 3G3FA 4NF5B 1LFHA 4JWOA 3KN7A 3DELB 3RT8A 1JW4A 3M8UA 5I59A 3IX1A 2DXYA 4DXUA 3OO6A 2RF1A 3JYRA 1YTVA 1USYE 1B52A 1SVXB 4I1DA 2QS3A 4G4PA 3M3FA 3PUXE 2ONSA 4KPTA 3B7DA 2R6GE 3QUFA 4KFQA 3WAFA 1B46A 1FQFA 5JEIA 1B7ZA 1NFTA 3BKIB 4N07A 3FJGA 4O3AA 4KR5A 4LQ5A 3G3JA 5EYFA 3H6UA 3IOUA 1RKMA 1A8EA 2P1SA 1MPBA 2ABHA 4G8MA 1ZIUA 2V84A 4GL0A 4NF5A 3V83A 2GFEA 1LGBC 2HEUA 3O66A 4GD5A 1O63A 3OEMA 3N6UA 4KD5A 3E13X 3CR9A 3FXUA 4KCDA 1I69A 3SEWA 5B70A 4EXKA 3LR1A 3MW0A 1EH3A 4R2BA 3EF7A 4GOTA 4EF1A 3T9VA 1II5A 3RLFE 4EUOA 4GXSB 3TTMA 4TLLB 4F39A 1N3XA 1GTKA 2G93A 2OBGA 3TUSA 2XXXA 4OQOA 1FCKA 1OQGA 3IO4A 2DYXA 4LZ5A 4IO6A 3TFLA 3SEUA 4DCXA 5TP9B 1MQIA 2F36A 3W9VA 2QMXA 4YICA 3A3CA 5AA1A 1LAHE 4Z7EA 2HXWA 1OMPA 1BIYA 3OSQA 4F1VA 4PETA 3S9EA 3K1PA 4OEUA 4YKKA 3C32A 4DXCA 2H9BA 4DZ1A 3EHSA 5AA4B 1TT1A 1EZ9A 1B4ZA 3U94A 5DVFA 4KI0E 1MH3A 3LUYA 3OELA 2BJJX 1A55A 1R9QA 1SI1A 3SESA 2I4BA 4KYSA 1HSJA 3CVGA 4GQOA 3IR1A 2PMSA 3B6WA 1B3EA 1LCTA 3SETA 4GF8A 4QSCA 1B5JA 3PUWE 3LSXA 5TP9A 4IB2A 3TTLA 3CSBA 1Y1MA 4FORA 1QULA 3MVXA 1D4NA 3BBRA 2RCAA 4MLQA 2RCBA 2E0SA 1FTOA 1I6QA 3C36A 5AA4A 3FJ7A 3IO6A 3PD8A 4FECA 3N26A 2Q9TA 1B7UA 2V93A 3MQ9A 4EQ9A 2A5TB 4MLVA 3K6WA 5CBRA 3TTRA 5H8HB 4QF9A 1Q1KA 2XXIA 2R9JA 3TEPA 2DVCA 1Y3PA 2PVUA 5J1DA 3OSRA 3IOWA 4XKQA 3B6TA 4H67A 4R6KA 4PP0A 1Y9UA 2I0CA 4GWOA 2KLFA 3K4UA 1O7TA 3KOSA 4GLIA 1DTZA 1Y20A 4ZE8A 4F2OA 1GR2A 1BKAA 2Z23A 3TELA 2O68A 4OHNA 3W9WA 2YJPA 4POXA 3MJNA 3U72A 4I9DA 4IY6A 4QHQA 4G68A 4E0WA 3VE1B 2I3WA 1SYHA 2XXRA 4F3GA 5ISUA 4YMBA 3K6UA 1FQEA 3PUYE 3CG1A 4XKNA 3VFJA 3RTFB 3C9HA 3K6VA 3T66A 2A5TA 2XXPA 5DT6A 4IO4A 1DPEA 2X7QA 1ZKBA 2QRYA 4C0RA 4BDOA 4DE8A 2I6EA 2XD3A 4IO5A 1MQJA 1MXXA 1IEJA 1URDA 1B4HA 1D9VA 4RJZA 1R1NA 4RPOA 1XOCA 4KHZE 3HN0A 4ELOA 3MWBA 2UYFA 3MP1A 1T0KA 4JWXA 5DYHA 4ISUA 3GBBA 3QYTA 4FEBA 3CFXA 1ZLQA 3N94A 4F2QA 5BWJA 3QIMA 1FW0A 1MQDA 1PBQA 3UP9A 4F19A 5I58B 2ZNUA 5ITOA 1MH4A 1JEUA 5CRYA 1MRPA 1VFEA 4ELQA 1GGGA 2I48A 3L6HA 3KJ7A 3GLBA 5ELVA 4WEPA 4U1ZA 3ZS6A 1B0LA 1QUKA 1LFIA 3O9PA 1LAXA 5K2XA 3GZGA 4HS7A 3E3KA 4ZEBA 4P0IA 5F7VA 5L8DA 3LSWA 5DVJA 4NMYA 3KG2A 2HAVA 1B51A 1JEVA 3A3UA 1UIVA 1MPCA 2AL5A 3LBSA 1LBCA 3VLUA 2REGA 1SW4A 3ILUB 4EXLA 1EZPA 1A8FA 4IY5A 3WAEA 2QS2A 4F22A 4F29A 1XS5A 2I0BA 4PFTA 1XT8A 5I58A 3S2VA 5I57A 1JQFA 4RY1A 3ZSFA 3MVYA 1YAEA 1MG1A 3B6QA 4ND9A 2XD2A 5A5XB 2X26A 1MXVA 4NF4A 4OFJA 1B05A 2Y7PA 1S9TA 2NOOA 1ELJA 1DTGA 3LC8A 2Z8DA 1TXFA 3S9MC 2QMWA 3QK6A 4AB5A 2OZZA 2FNCA 1LB8A 3KN8A 4U23A 1SW5A 2ZNSA 2UYEA 4X1DA 3UN6A 4DDDA 4H8JA 4ELRA 1FTJA 1IITA 2R71A 2ZMBA 4ZEIA 5KZTA 3SEYA 3EN3A 1NH8A 3CG3A 4LZ7A 4ZEDA 5I56A 3GXAA 1URGA 4FATA 1LFGA 2HZLA 5FHNA 4I8CA 1NH7A 3RT6B 4KCCA 1Y1ZA 3QAXA 5A5XA 2UVJA 2ZXTA 3PGFA 4P11A 4LUBA 5AA2A 1NNPA 1PB8A 1IZ1A 1UQWA 4BDNA 1L5TA 1H43A 3KGCA 4ZS9A 1B3LA 2PBWA 4TQUQ 5TPAB 2O6AA 2H25A 3ZKKA 4R6YA 4BDMA 3MVWA 4LP2B 2YLNA 3FATA 1H45A 4IGTA 2GRVA 1VE4A 5JTYB 1NMUA 1M5EA 3U1OA 3MP8A 2DSFA 3TZAA 4RYAA 1HSLA 3SKPA 2XXVA 4RXLA 2PX1A 1QW0A 3FASA 3FIRA 5LOMA 1H44A 4QFNA 2H4IA 3CFLA 2F5XA 2QS1A 5DTBA 3OD7A 1Y4CA 5FHOA 3FXQA 4LA9A 3VVDA 1NL5A 1I6AA 4F1YA 4OESA 3H4ZA 1NKXA 3O6IA 1R9LA 4NWCA 3K1NA 3VV5A 1A7LA 1LAGE 3JV9A 4E0XA 2XHDA 1USYH 2UVIA 1LB9A 5IAIA 2REJA 3T9XB 1IXGA 4LATA 3O97A 5FTHA 5JTYA 3H3GA 3UIFA 3PMWA 4YAHX 1N04A 1FTLA 2O1LA 2H99A 1WODA 5EHSA 2NUVA 3TAJA 3RN8A 1ZJLA 5EHMA 1TFAA 1B9JA 3OMBA 1LBBA 1I6BA 3PPQA 4R74A 2NWJA 3MC2A 3U93A 5F1QA 2QSXA 4GXAA 1BTJA 3FVNA 1OIBA 2V25A 3TTKA 1MM6A 3IK6B 2B3FA 4GRKA 1B40A 1JNFA 3Q27A 3KZGA 3R26A 3GBAA 1Y3NA 2X7PA 4F18A 2E1SA 4NTLA 3O28A 5AA3A 1P1NA 3FZVA 3G3HA 4HW8A 3TKDA 4GIZA 3DM0A 2I49A 1VFDA 4EDPA 1OQHA 2ZYKA 4NF6B 1QKBA 2XX9A 4EQBA 1PB7A 3VXBA 1VR5A 4FE8A 3TCGA 3CFZA 3PMVA 1SW1A 3RQTA 3Q26A 3FXRA 1FTKA 2DWIA 2Y7WA 4WKMA 4M1VA 4G2ZA 1B1HA 1RYXA 1POY1 4Q30B 3W15C 2OWTA 4YU0A 3HPIA 4H5FA 5DEXB 2F8DA 1B0HA 3OOAA 2NVUB 3SEXA 5KCJB 4Q8RA 1GVCA 2O1MA 4ECFA 3MPKA 2OCUA 4Z0IA 4R2FA 2V3TA 2F6GA 1DSNA 3H6VA 1EZOA 5HPQA 2WKYA 4NF6A 1PB9A 2VOZA 1N7WA 4ESWA 3LSFB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MNPA 3ECRA 3I5OA 3MPLA 1DOTA 1B5HA 3RUMA 5HBCA 5ET5A 1EYIA 5KDTB 4H0WA 2LAOA 4N4UA 3FV1A 2ANJA 2I58A 3AXFA 3RY3A 1XVXA 1YPNA 4DCYA 1NNTA 3PMXA 1H76A 1N3WA 5DEXA 4UA8A 5H8HA 1FQCA 5KCJA 4RA1A 3OEKA 2DS9A 1S50A 1YZ0A 2FYIA 3N5LA 4YKIA 2GHAA 2Y7RA 4HE0A 3SEVA 3CIJA 5H8QB 3PTYA 1RDYA 3K0VA 4R75A 3T22A 2DWAA 1BP5A 1QUIA 4GL8A 1B1XA 3OO7A 4N6DA 2HCAA 3FBPA 5K2YA 4OYVA 4R73A 4YB6A 3U65A 3C31A 5HM4B 2VHAA 4ELPA 2A5SA 4QBAA 1P1UA 5CMMA 5KDTA 4OA4A 5H8FB 3F11A 3PPOA 1LSTA 3HV1A 5DVIA 2QJEA 1B3HA 2VT5A 4AS5A 4PBQA 1LEVA 5L9MA 3KSXA 4NF0A 2DVZA 5I5PA 1IXHA 4MNIA 1SW2A 2ZYOA 4C1TA 1OVBA 3PPRA 1MM7A 2QVVA 3TMGA 5I2KB 4G77A 3H06B 4PTKA 4TLMB 2WBBA 1P1WA 2Y7IA 2W7YA 5H8QA 1IMEA 3G3IA 3MZ1A 1LBWA 4XXUA 3S4UA 2DWHA 4JWYA 1MXUA 2DE4A 4MJOA 3IOVA 1N76A 3PUVE 4DIGA 3FGSA 4RPNA 3ONMA 3MYUA 2V3UA 3DP4A 4G68C 3R6UA 3TYHA 1FRPA 4N8YA 3KC0A 5CMKA 2Q88A 5AA2D 4POWA 1D3KA 1QUJA 2Y7KA 4HTGA 4EF2A 3IB0A 2UVGA 2Z8FA 3IL1B 4F3PA 3MBPA 3T0JA 4MFIA 1OLAA 5H8FA 3PPNA 2B65A 3OO9A 4MEVA 4HCYA 3Q28A 3Q29A 2RC7A 2CZKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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