5I2NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 81
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB02
3QUFA 3FATA 4YMAA 3MVWA 4KYEA 1ZLQA 2A5TA 3U1OA 3B6QA 4OHNA 2HFBA 2AL5A 2CMOA 4QFOA 4OFLA 2XXUA 1OIBA 1OQGA 3TTNA 3CFLA 3BFTA 3IL1B 2QSXA 4XKPA 4MFIA 5ITOA 3RLFE 1H43A 2A5SA 1N3WA 1Q1KA 3UN6A 2IEEA 5CMBA 3H6UA 3DP4A 4QSEA 4BDRA 2DS9A 3S2VA 1MQGA 4R2FA 5F7VA 1P1QA 2B3FA 2P1SA 4QSCA 3JYRA 4IO2A 3IB0A 3T93B 4NEDA 4GL0A 4Q8RA 4YB7A 1DTGA 4N07A 2REGA 4P11A 3F11A 4PFYA 3L6HA 4QFLA 3T9XB 1I6AA 4F22A 4RPNA 3IORA 4G2ZA 2XXRA 1PB9A 3D4CA 2XXQA 4LVQA 1DOTA 3QK6A 1Y1MA 4OTEA 4EF1A 1IXIA 1A7LA 4OFJA 1FW0A 4F31B 2H98A 2I3VA 2I0BA 3BBRA 4JSOA 4F39A 1Y4TA 3IO4A 3K6WA 3SESA 4C1UA 1B0HA 4GOTA 5DVJA 4H5FA 5I59B 5H8HB 2LAOA 3VLUA 4FATA 3KBRA 1D9YA 3FGSA 3HHGA 4UACA 3BFUA 3KZGA 3S9NC 2Q89A 4OYVA 3HHFA 3G3FA 4HCYA 1H76A 2DWJA 3PD8A 4U4SA 2GH9A 1B3EA 4P0IA 2Y7PA 1MPBA 5I58A 5I2NA 1AL3A 1SI1A 3LSWA 1B6HA 2XD2A 1MXZA 4X1DA 3Q25A 4IO6A 2Y7IA 3TODA 1JW4A 3EHUA 1N76A 4XXUA 4JWYA 2XXPA 3RGYA 3FJ7A 2QJEA 4IO3A 4GFRA 4HCWA 4O3CA 2QMWA 2P2AA 4I8CA 2ONKE 3IOVA 3KEIA 1FQDA 3DELB 1PDAA 2PMSA 3IB1A 1D4NA 3RY3A 2AYSA 4IGTA 1PB7A 1XVYA 2Z8FA 3PUVE 3IX1A 4QFPA 3QAXA 1H44A 1MQIA 1MPCA 2RINA 5KDTA 2AL4A 3O29A 4E0XA 4N13A 2F34A 4R6KA 4YMBA 3HV1A 5DVIA 5AA2D 3LC8A 1ZJLA 1OLAA 3HPIA 1IXGA 3SDFA 4KCDA 3G3JA 3SEUA 1B51A 3LSXA 3TQWA 1EZOA 4R9GA 4YKIA 4GWOA 3IR1A 1FQAA 3ODBA 5TPAB 1VFEA 1VFDA 5CMCA 3G3KA 5JEIA 3QIMA 4RYAA 3E3KA 3PD9A 1TFAA 1M5FA 1SBPA 4RK9A 1SDXA 1MQDA 3CG3A 3FJMA 3Q28A 1OQHA 1II5A 1OMPA 3OMBA 1MXYA 3LSLA 4LUBA 3C34A 4F3PA 4I62A 4EQ7A 3IJXB 4YB6A 3H6TA 3HCQA 4ZEDA 4H8JA 5CBSA 5FTIA 4MH5A 2ZYMA 4R75A 3C32A 1J1NA 4FE8A 2ONSA 2DP8A 4QFNA 3RN8A 4KQPA 2UVIA 1LFIA 3D4GA 4AQ4A 4WEPA 1JEVA 1PC3A 5FHOA 4LONB 3VVFA 1XS5A 2I6EA 3O97A 4LZ8A 1USYE 3UGWA 3B6TA 3G7WA 2HEUA 3KGCA 5CBRA 2PT1A 5B70A 1GTKA 3E13X 4JBZA 2V93A 3EQ1A 3CG1A 1P1UA 2PT2A 4G8MA 2HQ0A 4ZE9A 1B7HA 3C33A 5ISUA 3S4UA 3PMWA 3O2AA 2I0CA 3RUMA 3QUJA 2Z8EA 2NWJA 3TDJA 3S9MC 2D21A 1A54A 3MP8A 2YPNA 3PMVA 2PX1A 4OEUA 3C9HA 2F5XA 4XKNA 1MXWA 5B7DA 5LOMA 4ELQA 1ELJA 4GXSB 1UTBA 3FUZA 3CVGA 4O3BA 4QRZA 4G68A 2VGQA 1A8EA 4YICA 5CMKA 2F6PA 2OBGA 4KYSA 3MAMA 3V89B 3W9VA 5A5XB 2VHAA 5I84A 3K01A 4NF5B 4ONYA 4TQUQ 3GBBA 5FHMA 4JWXA 4JXIA 1LAGE 1SW5A 4DXCA 1URGA 5KCJA 1JW5A 2DSFA 3EHSA 2CZLA 2Q88A 4P0GA 1YTVA 1TWYA 3VXCA 4THIA 1ZTYA 4LQ5A 3MWBA 3Q29A 5EHSA 4MLQA 4DLDA 3G3IA 2UVJA 5CC2A 3ZKLA 3UIFA 4YB5A 4XTCQ 1QKBA 5TP9B 5I56A 1SYHA 3EF7A 5FHNA 1DPPA 4PE5B 5TP9A 3SEVA 3WAFA 3EN3A 5K2XA 3IJOB 1AOVA 3FXUA 5I57B 1R9QA 3S9LC 3IB2A 1B46A 2F8DA 2ZNSA 3LUYA 2Q2CA 3USDA 4ELPA 2QMXA 4ELOA 1B1HA 1LCTA 1T0KA 3MVZA 1OLCA 2UYFA 4NF6B 4YU0A 2VD3A 2X7QA 3GLBA 3TCGA 3P7IA 4RPOA 2OZZA 1O63A 1MH4A 2BJJX 1N7WA 3K00A 3SEXA 1MRPA 3BKIB 1LFHA 4JSDA 4RK2A 4U23A 2VD2A 2OK2A 5IAIA 2XX7A 1B52A 1MQHA 4O3AA 4ZE8A 1HSJA 2OWTA 4NF4B 4H1XA 3OEMA 1UIUA 1Q35A 5DT6A 3CFXA 4NWDA 1LB8A 2DVCA 2XXVA 3U94A 4U4XA 2WKYA 2DOJA 3PUWE 3KSJA 4ND9A 4KYDA 2HZLA 2YLNA 3UP9A 2H5YA 3UK4A 1I69A 2O68A 1FTMA 4PFTA 3CSGA 4RY1A 1IUDA 2OJTA 3MZ9A 3MJNA 3CIJA 4G8HA 4H65A 2I49A 3RTFB 5M2VA 4EXLA 1B2HA 1IXHA 1I6QA 3ONMA 3ECRA 3M8UA 4PFWA 2GHAA 1ANFA 2P0SA 1RYOA 1ATGA 1NH7A 4C0RA 4KPTA 1B0LA 1FQBA 1AIVA 4Q30B 4XKQA 4LP2B 1B32A 3C35A 5AA3A 1B4ZA 2QS2A 4H67A 1LAHE 2NVUB 1QVSA 2V3TA 3FVOA 1A99A 3RTWB 2V3UA 3MC2A 3O9PA 1LLSA 2UXAA 4NF8B 1XVXA 2H25A 2OLBA 2X26A 1S50A 1N3XA 4I9DA 3KN3A 4QFKA 3N5LA 1MY0A 3IK6B 4BDLA 2O69A 1B9JA 1WVJA 2RCBA 1LFGA 4FEBA 4EXKA 4X9TA 5I59A 5H8HA 1S7YA 2G93A 3KSXA 2O6AA 2E1SA 4MBPA 1VE4A 3A3UA 2M8CA 4OETA 3OENA 3U93A 3LSFB 2Z8DA 4GL8A 3THIA 3OEKA 4PETA 4ZS9A 1BKAA 2Y84A 2D5WA 1VSOA 1QW0A 3DLNA 4ECFA 1LAFE 5TU0A 5JK4A 1BIYA 4ELRA 3M3FA 3EHTA 1ZKBA 4BDMA 1LCFA 2H9BA 1KWHA 1BTJA 2XXIA 2DE4A 1NNPA 3K0VA 5H8NB 4IO7A 4I1DA 3OO8A 3MZBA 1QULA 4LZ5A 3ZSFA 3FZVA 1LBBA 1SW4A 5L8DA 4PFUA 4DCXA 3M3LA 4OXVA 4H8IA 1GVCA 4BDQA 4L17A 5J1DA 2XXYA 1POTA 4RNSA 1XT8A 1HSEA 1DPEA 2GHBA 1R6ZA 2NUVA 3B6WA 1CE2A 4G4PA 4GIZA 4TOZA 4FIMA 4IY6A 3ILTB 1UQWA 4LA9A 3TELA 2F78A 3I5OA 3SKPA 4F3BA 3R6UA 4KR5A 3SERA 2F7CA 1JW1A 4G8NA 1M5DA 3C4MA 4XIGQ 5H8QB 4K3FA 1B58A 5I2KB 3E4RA 4R6HA 4QSDA 3PPRA 5H8QA 5KZTA 3FIRA 1JETA 2B65A 3MP6A 4PQJA 3VFJA 2XXXA 5TPAA 4TLLB 2DE3A 1P1OA 2HAUA 2Y7RA 1F9BA 3PV0E 3MPKA 3V8XB 1DMBA 3GZGA 4UA8A 4Z7EA 3TTRA 1FTJA 4LZ7A 3G3HA 4OESA 3TUSA 3TCFA 2Z22A 4ZEIA 1MXXA 3MQ9A 4WKMA 1P99A 2R9JA 2O1MA 2V3QA 5AA4B 2HCAA 4RA1A 2VOZA 3OXNA 1MQJA 5DEXB 1SI0A 4F18A 1MG1A 4OQOA 4X1BA 2XXWA 2ZNUA 1JNFA 1MDP1 1PEBA 3IOWA 4JWOA 1P1NA 2XXHA 2F97A 3FV1A 1B3GA 2F35A 1M5EA 4Q0CA 3HN0A 4F3GA 3TQLA 2PYYA 3RT6B 3MVXA 3H06B 3HSTA 5H8FB 3Q26A 4EQ9A 4IO5A 3TTKA 3DP8A 4FORA 1DTZA 4H6DA 1I6BA 1IQ7A 1M5BA 2DVZA 5H8FA 3KJ7A 3PPQA 2DXYA 4IY5A 3K1MA 5AA1A 3TTLA 4FECA 4FAJA 2OWSA 3U8QA 4R72A 2ALUA 1B3LA 2V25A 4OVJA 3VE1B 1MH3A 3A3CA 2V84A 4WEDA 4Z0IA 2O1LA 3LR1A 3OO9A 4NMYA 5L9SA 3TKDA 1MM7A 2XHDA 3KG2A 3KJTA 3VLVA 4DZ1A 3PPPA 1P1WA 3UORA 2QL3A 5CMMA 2QPQA 2QS1A 4H0WA 4OZ9A 3K6UA 4WXJA 2R6GE 1URDA 2Y7WA 3VXBA 5H8SA 5JTYB 3N26A 5AA2B 4F1UA 3MUQA 1JQFA 3AXFA 4U2RA 5A5XA 1H45A 3TTMA 4NF5A 4EUOA 1QUKA 2Q2AA 4U1OA 3IAZA 2ZYOA 1LBCA 1O7TA 3K02A 3T22A 3PUXE 3H03A 2I58A 2HZKA 3I3VA 4HS7A 3S9EA 4GVOA 2UVGA 4F19A 4OERA 2FA7A 3K1PA 1MS7A 4IB2A 1TT1A 2O7IA 4ISUA 4R6YA 4GXAA 2ZXTA 1POY1 4DDDA 4QHQA 3O66A 4NE4A 1PBPA 1Y1ZA 5DVFA 3DM0A 1YAEA 3FASA 4OWDA 1Z7ME 3C36A 2AIXA 1FTKA 3TFLA 3MW0A 5I57A 1IIWA 3MVYA 3CSBA 1B4HA 5EHMA 1B1XA 3HO7A 4GLIA 2DWIA 4NF6A 4OMBA 3OELA 4GD5A 1RYXA 4XKRA 1FCKA 1B3FA 1GR2A 1D9VA 3T9VA 1NFTA 3V5AA 3VDFA 5ICQA 2G29A 3GXAA 4U22A 2ZYNA 3T9HB 4F1VA 4F1YA 4NF4A 3KN7A 4EQBA 3Q27A 1A8FA 3N6TA 5BUUA 5DTBA 3TAJA 3CR9A 4C1TA 3O6GA 4YKKA 1NNTA 1QUIA 3N6UA 3TZAA 4LATA 3DP6A 1B7ZA 3VVDA 2R71A 2HAVA 2ZNTA 3U92A 4EDPA 1Y9UA 1LAXA 1FTLA 1GGGA 3FVKA 1SYIA 3QYTA 5F1QA 3PUZE 4LQ2A 3TCHA 3WAEA 4OEVA 3EPEA 3H7MA 1R9LA 1JEUA 1EZ9A 1N0TA 1RKMA 4MLVA 3L6GA 1OVBA 5DYHA 1Z7NE 4U1ZA 4NTLA 3OD7A 2F6GA 1FQFA 1H3DA 1XHYA 1UTHB 4Q5TA 1SW2A 1PBQA 2ABHA 1AMFA 5L9OA 1IEJA 4M1VA 3TEPA 1UTHA 1PB8A 3G3GA 4OFOA 3OO7A 1EZPA 1UIVA 2XXTA 3FVNA 3IOTA 2DWHA 2FNCA 4KD5A 3MPLA 1ZBMA 2ONRA 1FTOA 3C31A 4NF8A 4N6PA 1TFDA 2W7YA 3TYHA 1NMUA 4AB6A 3T96B 4DE8A 1ZIUA 2KLFA 2HXWA 4BDNA 4ZEFA 4KCCA 4F2QA 1MPDA 1AH5A 1SQYA 1LGBC 2Q8JA 1Y20A 2IA4A 3E9XA 1A55A 5I58B 1N84A 5I2NB 4ZECA 3PMXA 1JVYA 2REJA 1M5CA 2FYIA 2OCUA 3R7XA 4MF3A 4FJPA 3UA8A 1XC1A 3OSRA 1IZ1A 5HBCA 4POWA 3O6IA 2DE2A 5H8NA 3JZJA 5HPQA 3JV9A 2ZYKA 4GQOA 1WDNA 4YKJA 1USYH 1MXUA 4R73A 1EU8A 3LBSA 2DQVA 3K6XA 1YPNA 3H4ZA 2PBWA 3KN8A 4X48A 3K1NA 2B3BA 4R74A 1NH8A 1Y3NA 3FXQA 2H99A 4ZDMA 3M3KA 3R26A 2RC9A 2QS3A 5KDTB 1SVXB 2THIA 1QKAA 1LSTA 1Y4CA 3K2DA 4M4GA 1LB9A 2Y7KA 1ZMGA 4JDFA 4YZZA 2XX9A 3N94A 3O28A 2RCAA 4IGRA 1NKXA 3OO6A 5I2KA 3MBPA 3FV2A 2RF1A 3K4UA 1SW1A 4KFQA 4AB5A 2Q9TA 3H3GA 2XD3A 3CI8A 4YKPA 1NL5A 4BLAA 2X7PA 1TXFA 3CFZA 1R1NA 2RC8A 4E0WA 1US4A 5HM4B 4YAHX 1QJMA 3O6HA 4PP0A 3A09A 2O51A 3QSLA 3H6VA 2ANJA 1NNFA 4NWCA 3FVGA 2ESNA 1FQCA 1DSNA 1URSA 4OENA 4G68C 2F7BA 2I4CA 4DIGA 3V83A 5AA4A 5ICTA 3ZS6A 3W9WA 4KI0E 1Y3PA 2O84X 2NXOA 3PPNA 5DEXA 1O64A 3IO6A 4F2OA 2I48A 4JB7A 2GFEA 1B7UA 2GRVA 5ITPA 3RNNA 5BWJA 2QS4A 1MXVA 5CRYA 1MY1A 1N04A 2UVHA 1L5TA 1NNKA 4H5GA 5CI5A 4ZZEA 3B7DA 1B5IA 1B3HA 3ZKKA 1HSLA 2QRYA 5CM6A 2O7UA 2NOOA 3QXMA 3FD3A 2RKMA 4GF8A 4F29A 4G77A 4BDOA 2YJPA 4ESWA 1FQEA 2VP1A 3VLWA 4DXBA 3VVEA 3SEWA 1B5JA 4U21A 5FTHA 4DCYA 3I6VA 5L9MA 4ZEKA 1WODA 4FEDA 1CB6A 1ZU0A 1UTBB 3RPWA 1EH3A 3U72A 4G68B 3K6VA 3RT8A 3W15C 1XOCA 4POXA 4DXUA 4F3SA 2DYXA 3ILUB 2H4IA 3RQTA 4IO4A 4GRKA 3TPAA 2Z23A 3VV5A 1US5A 4RXLA 3OSQA 5AE4A 1OVTA 1JVXA 5JTYA 1A40A 1D3KA 3PU5A 5AA2A 1IXCA 2F7AA 4KHZE 3CRBA 4ESXA 3KOSA 2I3WA 5K2YA 3PPOA 1B05A 1VR5A 2XX8A 5KCJB 3PGFA 3H6WA 1IITA 2PVUA 4ZEBA 3FJGA 2UYEA 1MY2A 3KOTA 3MP1A 2DXRA 1MY3A 3GBAA 3IOUA 1MDQA 1QUJA 1N7XA 1MM6A 5I56B 3KFMA 4R9FA 1S9TA 5EYFA 1B5HA 3T66A 2ZMBA 2I4BA 3TMGA 1GV8A 2RC7A 1BP5A 4RJZA 1BLFA 4ZZAA 4TLMB 3PUYE 3OOAA 2F36A 1MY4A 1B40A 1SD3A 3SEYA 3SETA 3T9UA 1YCJA 2D3IA 5IKBA 4R2BA 4HTGA 4QF9A 1Y3QA 2DWAA 5ELVA 4EF2A 3MZ1A 3FXRA 4HW8A 2E0SA 2A5TB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QUFA 3FATA 4YMAA 3MVWA 4KYEA 1ZLQA 2A5TA 3U1OA 3B6QA 4OHNA 2HFBA 2QFLA 2AL5A 2CMOA 4QFOA 4MNIA 1NUYA 4OFLA 2XXUA 1OIBA 1OQGA 3TTNA 3CFLA 2R8TA 3BFTA 3IL1B 4PF8A 2QSXA 4XKPA 4MFIA 5ITOA 3RLFE 2Q8MA 1H43A 4AS4A 1K9ZA 2A5SA 1N3WA 1Q1KA 5DW8A 3UN6A 2IEEA 5CMBA 3H6UA 2CZKA 3DP4A 4QSEA 4BDRA 2DS9A 4X8RA 3S2VA 2PFZA 1MQGA 4R2FA 5F7VA 1P1QA 2B3FA 2P1SA 4QSCA 3JYRA 1FBDA 4IO2A 3IB0A 3T93B 4PBHA 4NEDA 4GL0A 4Q8RA 4YB7A 1DTGA 4N07A 4PFIA 2REGA 1EYKA 4P11A 3F11A 4PFYA 3L6HA 4QFLA 3T9XB 1I6AA 4F22A 4RPNA 3IORA 4G2ZA 2XXRA 1PB9A 2HXRA 3D4CA 2XXQA 4LVQA 1DOTA 3QK6A 1Y1MA 4MIJA 4OTEA 4EF1A 1IXIA 1A7LA 4OFJA 1FW0A 4PCDA 4F31B 2H98A 2I3VA 2XWIA 2I0BA 3BBRA 3ISPA 4JSOA 4F39A 1Y4TA 1RDZA 3IO4A 3K6WA 3SESA 4C1UA 1B0HA 4GOTA 5I5PA 5DVJA 2PCRA 4H5FA 5I59B 5H8HB 2LAOA 4O8MA 3VLUA 4FATA 3KBRA 1D9YA 3FGSA 3E79A 3HHGA 4UACA 3BFUA 3KZGA 3S9NC 1RDXA 2Q89A 4OYVA 3HHFA 3G3FA 4HCYA 1H76A 2DWJA 4I3EA 3PD8A 4U4SA 2GH9A 3D1RA 1B3EA 4P0IA 2Y7PA 1MPBA 5I58A 5I2NA 1AL3A 1SI1A 1NUXA 3LSWA 1FPLA 2P3NA 1B6HA 1IMFA 2XD2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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