3DELB

The structure of ct381, the arginine binding protein from the periplasm chlamydia trachomatis
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
EKFIVGTNATYPPFEFVDKRGEVVGFDIDLAREISNKLGKTLDVREFSFDALILNLKQHRIDAVITGMSITPSRLKEILMIPYYGEEIKHLVLVFKGENKHPLPLTQYRSVAVQTGTYQEAYLQSLSEVHIRSFDSTLEVLMEVMHGKSPVAVLEPSIAQVVLKDFPALSTATIDLPEDQWVLGYGIGVASDRPALALKIEAAVQEIRKEGVLAELEQKWGLNNLEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
source organism Chlamydia trachomatis
molecule tags Protein binding, transport protein
molecule keywords Arginine Binding Protein
total genus 65
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence C, D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3delB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3delB02
4U4XA 2H98A 2QS2A 1N3WA 3H6TA 4GVOA 3IOTA 4NEDA 4XKRA 3RNNA 3FVGA 3ZKKA 1UTHA 2M8CA 3KN3A 5K2YA 2Y7RA 4IO6A 3ZSFA 2F34A 3M8UA 4QF9A 3U94A 3K1PA 4KQPA 3I5OA 5DTBA 1Y1MA 1JNFA 3OXNA 1URDA 3MZ9A 1N3XA 2Q88A 1M5FA 4FECA 4LZ8A 1JVXA 2DOJA 4P0IA 4RXLA 3PUYE 1ATGA 4U4SA 1EZ9A 4F1UA 3H6WA 4QHQA 4K3FA 3FJMA 4EF1A 4EF2A 1B05A 4KFQA 5EHSA 5J1DA 4YKPA 3SEYA 4F1YA 3T66A 1IQ7A 4OXVA 1PB8A 1MS7A 1ANFA 3FZVA 3GXAA 2OLBA 3IK6B 4QSEA 4F22A 2QPQA 2UYFA 4IO4A 3S4UA 4JSOA 5AA4A 2RC9A 2I4CA 3VVEA 2F6PA 3B7DA 4KYSA 3HHFA 3PPNA 4U2RA 1NH8A 3K0VA 4U1OA 1N7XA 2V25A 4JWYA 4R9FA 5I2NB 2RC8A 3ZKLA 1B3FA 4JWOA 4NF8A 1Z7NE 2B3BA 2HAVA 2GHAA 2XD3A 1JW4A 2QRYA 3KZGA 4I8CA 4OYVA 4DCXA 1B7UA 1GR2A 3ECRA 2PBWA 4MH5A 1P99A 3DP4A 2DVCA 3BFTA 3ILUB 3M3KA 3TCFA 3LSXA 3TQWA 5KDTB 3L6GA 1UTBA 4GIZA 3T22A 1AOVA 4R74A 3UN6A 2VP1A 4I9DA 4F2OA 4F1VA 1M5CA 4F18A 3C35A 4F3GA 3LBSA 4GD5A 1A55A 3MP8A 1MH4A 1AIVA 3THIA 3KSXA 1CB6A 2XXXA 1H76A 1IITA 1SDXA 1Y3NA 2H25A 2ZXTA 1B4ZA 1DPPA 3OO6A 5AA4B 3BBRA 2Z8DA 4IY6A 1LB9A 3OMBA 4OESA 3S2VA 2X26A 2I0BA 3VXBA 4OFJA 3SEWA 4HW8A 4H67A 3O6IA 3MZBA 5AA2A 1N76A 3OEKA 3UORA 1B4HA 4M1VA 5I2KB 2RCAA 3CSGA 3FV1A 2B65A 5EYFA 5AA2D 3PPQA 3HN0A 1WODA 1FTKA 3T9UA 1OQHA 2XHDA 3RGYA 2YLNA 3U1OA 3WAFA 3V89B 4DXBA 5I59A 5I59B 1LLSA 5AE4A 1B9JA 1B0LA 2F7BA 5I56A 1DTGA 1VFDA 3S9NC 2UXAA 1SD3A 3GLBA 1UTBB 3CFLA 3H03A 4G68A 4G68B 1PEBA 4OERA 3IOVA 3PUWE 5I56B 4HS7A 3QIMA 3MVXA 3UGWA 1B3GA 1GTKA 2DE2A 1TFDA 4GOTA 4X9TA 4X1DA 4BDQA 1FTOA 2HCAA 3FVOA 2HZLA 4ZZEA 3ILTB 2XXWA 4NF8B 3RT8A 3DELB 1NL5A 5I2NA 1Y4TA 4ZZAA 4EQ7A 1H44A 4YZZA 3PUXE 3KOTA 1CE2A 3T9XB 5IKBA 2VOZA 2O7IA 1RYOA 5I2KA 4JWXA 5B7DA 4EQ9A 4N07A 3TMGA 1ZMGA 4IY5A 4C1TA 3DP6A 2XXHA 4LA9A 1B3EA 1S9TA 4QSCA 1ZIUA 1A99A 4AB5A 5FHOA 5CBSA 1IXHA 3IJOB 2Z23A 1MDP1 5L9OA 2DVZA 3HCQA 4GLIA 4ND9A 2I49A 4RPNA 4XIGQ 3RQTA 3Q28A 2ZMBA 3OSRA 3QSLA 3LUYA 3QYTA 4BDOA 3CG1A 1SYIA 1HSJA 4KR5A 4M4GA 2F36A 4R6KA 4AB6A 4ZEDA 3OELA 2V93A 4C1UA 2ZYOA 3IJXB 2I0CA 4R73A 2BJJX 1JQFA 1Z7ME 2RCBA 1OMPA 3FUZA 3KBRA 4KYDA 1B3HA 2G29A 3FVKA 1EZPA 5H8QA 2DSFA 4QFLA 2OZZA 1VFEA 1NMUA 1LAXA 3DM0A 3G3GA 3H3GA 1LAFE 4UACA 1LCFA 2O1LA 4YU0A 4LVQA 4ZDMA 1A40A 1PDAA 5ISUA 3O29A 5H8FA 3SEXA 4X1BA 3T9VA 4FAJA 4DXCA 1MM6A 4YMBA 2XXPA 3H6VA 5AA2B 5JTYA 2CZLA 2O51A 4LQ5A 2R6GE 2XX9A 3C34A 4NMYA 4KCDA 1TFAA 2OWSA 4ZEBA 2REJA 1B5JA 3LR1A 2ABHA 2Z8EA 4MF3A 4EDPA 4Q8RA 4GQOA 2Z8FA 4F3PA 1B40A 2ALUA 2RC7A 4FJPA 4R72A 4QRZA 4DE8A 3QK6A 1ZBMA 3VDFA 1LSTA 3FIRA 1B46A 2FNCA 1XVXA 1FCKA 2H99A 1MXUA 2HAUA 3E4RA 1MXXA 1H3DA 2P1SA 3OD7A 2UVIA 4RPOA 4E0WA 2XXUA 1XS5A 2F6GA 4FATA 4QFPA 5I58A 2DE3A 4PFWA 5H8NA 1BLFA 3IAZA 3N5LA 5AA1A 2GRVA 5HBCA 3MC2A 2QMXA 5CRYA 4H0WA 3VLUA 1FQBA 1JW1A 5H8NB 5ICTA 1SW5A 1L5TA 1FQFA 1M5DA 3G7WA 4KHZE 2QS1A 3R26A 4FEBA 3P7IA 3FJGA 1D3KA 3FJ7A 3HHGA 4DZ1A 2XXTA 4THIA 1MY0A 1QKBA 1QJMA 1TWYA 2QS4A 1F9BA 3MVWA 1B52A 2I48A 4LZ5A 3G3KA 3FV2A 3FVNA 3W15C 4IB2A 1GGGA 2DYXA 3A3UA 4LATA 4H5GA 4ELOA 3DLNA 1B1HA 1N84A 1B7ZA 3U72A 3O2AA 1IXCA 1AH5A 2HEUA 5TPAB 3RT6B 3T93B 3KOSA 1BIYA 3O28A 4YKIA 1BP5A 1OLAA 1XT8A 4JXIA 1R9QA 1B0HA 4Q0CA 3V83A 4GL0A 3C36A 3TODA 1MG1A 2ONRA 4H1XA 4KI0E 2OK2A 2A5TA 4OEVA 3BKIB 4QFNA 3U92A 3V5AA 4GWOA 1A8FA 2D5WA 1PBPA 3GBBA 1B1XA 4L17A 1ZLQA 2ONKE 5B70A 2I4BA 4QFKA 3VVFA 3N26A 1O7TA 1SVXB 4KYEA 1XVYA 4OFLA 1MQJA 1P1NA 1UQWA 2V3QA 3K1NA 4I1DA 4JBZA 4TOZA 3RY3A 1LCTA 4ZEKA 3FGSA 3H7MA 2E0SA 3JV9A 4NF5A 4ELQA 3C32A 3IB2A 2H5YA 1IUDA 4BDMA 5DEXA 2KLFA 2PMSA 1LBBA 4OEUA 2I6EA 1VE4A 1I6AA 3JZJA 4TQUQ 3TCHA 3Q29A 1POY1 1USYE 1MY2A 2ZYMA 2ONSA 3MAMA 5ITOA 3TYHA 2UYEA 1JW5A 4RNSA 2F35A 3K02A 3MP1A 5LOMA 3IR1A 4H65A 5H8HA 1P1OA 2FYIA 3G3HA 1LFHA 1ZKBA 2HFBA 3FXUA 5DVIA 2Y7PA 3EHSA 4DXUA 4ELRA 1OVTA 1XHYA 3CFZA 3TDJA 3HPIA 2HQ0A 5ITPA 1FTLA 2QSXA 3Q25A 5I57B 1B51A 1MRPA 3KSJA 4G68C 1SBPA 5ELVA 4F29A 3N94A 4MFIA 1YAEA 2D3IA 2DXRA 4GXAA 4OETA 3RLFE 4YICA 1TXFA 2F7CA 1NNKA 4ZEFA 3SDFA 1FQCA 3B6WA 5FTHA 1XOCA 4YB6A 3VVDA 4XKNA 4XTCQ 4DDDA 3H4ZA 5H8SA 5I58B 3KJTA 1Q1KA 3KN7A 1MXVA 1EU8A 5CMCA 4F2QA 1IEJA 3CIJA 4OENA 1A7LA 1JETA 1SW4A 2CMOA 4NF4A 1VR5A 4OMBA 5DEXB 3K6XA 4WKMA 4YKJA 4U21A 4BDNA 2PX1A 3N6UA 5FHMA 1Q35A 1HSLA 2XXQA 4EUOA 2ZYKA 2NVUB 1DTZA 5AA3A 1B3LA 1OQGA 2DWIA 2QJEA 3PMWA 2V3TA 3QAXA 1NFTA 4WEPA 2XXVA 3MPLA 3CSBA 1I69A 2OJTA 4JDFA 5TU0A 4YB7A 4ESWA 1HSEA 2H4IA 5JK4A 3PPRA 1UIUA 3TTRA 4QFOA 3M3LA 1B58A 1MQHA 1MXYA 2V3UA 1NH7A 2DP8A 3MW0A 4PFTA 4Q5TA 1USYH 4OQOA 1EZOA 4NF6A 2GFEA 3B6QA 1OLCA 5H8QB 2AYSA 3CRBA 2LAOA 1RKMA 3VE1B 4YAHX 3S9EA 2Q8JA 3MVZA 1DMBA 1MXZA 4FORA 5DVFA 3TTKA 4F19A 2XXYA 3EN3A 1O63A 2IEEA 3M3FA 2B3FA 4IGRA 5H8FB 5TP9A 2X7QA 4F39A 2NWJA 3K00A 3VLVA 2QL3A 2AIXA 2Q2CA 3L6HA 3QUJA 4G8HA 3T96B 1Y1ZA 2QMWA 3CR9A 4Z0IA 5A5XA 5CMKA 1URGA 4GF8A 1EH3A 3TELA 1JEVA 1MXWA 3PPPA 4LQ2A 3K6WA 3OO9A 1QUIA 5L8DA 4KPTA 4U22A 2Q89A 1P1WA 4FIMA 2XXIA 2YPNA 4AQ4A 5KCJA 1SI1A 2GHBA 2PT2A 5JEIA 3PD9A 2F78A 2IA4A 2PYYA 1XC1A 4NWCA 4FE8A 4OVJA 3SKPA 2GH9A 3HSTA 3UIFA 1US4A 1N04A 1POTA 3MZ1A 3PU5A 3EHUA 4POXA 3VLWA 1H43A 1DPEA 2ANJA 4NE4A 3TKDA 1MQIA 3BFUA 3FD3A 4GRKA 2RF1A 3HV1A 1MH3A 2O7UA 4IGTA 4ECFA 3A3CA 3VXCA 3D4GA 2F97A 5BUUA 1B32A 4N13A 2DS9A 3EHTA 3OENA 3TEPA 3G3JA 5KDTA 1FTJA 4NWDA 1NKXA 4H5FA 3TQLA 3PMVA 1MPCA 2O69A 3C4MA 4YKKA 4EXLA 3RUMA 3C33A 2DWHA 5CMMA 4NTLA 4RYAA 2D21A 5JTYB 3Q26A 5DYHA 4F3BA 4ZE9A 3TUSA 4U23A 2R71A 5L9MA 1I6BA 2PVUA 4BLAA 4LONB 1RYXA 2REGA 5HPQA 3PV0E 4R2FA 5K2XA 3IO6A 3T9HB 2X7PA 2RINA 1PB9A 4RA1A 2F8DA 3GBAA 2VGQA 4N6PA 3TTMA 4JB7A 4PE5B 1URSA 2HZKA 1QUJA 3PUZE 2XXRA 3HO7A 4H8JA 2XD2A 4HCYA 4JSDA 1MY1A 3RTWB 3W9WA 1O64A 3F11A 3ODBA 1DOTA 4OZ9A 3A09A 1ELJA 1MPDA 1LAGE 2DXYA 3O6HA 1B5HA 4NF6B 5F7VA 2UVHA 3G3IA 4XKPA 1LB8A 1ZTYA 4OHNA 1I6QA 4YB5A 3IO4A 2Y7IA 4POWA 4R9GA 2Y7WA 3KN8A 3FASA 1TT1A 3H6UA 3OOAA 4IO5A 3UP9A 2O6AA 2DWAA 1LBCA 3FXQA 3UA8A 4UA8A 1FTMA 2UVJA 1M5BA 1Y4CA 1PC3A 2P2AA 4ISUA 4G8NA 2FA7A 4DIGA 3LC8A 5FHNA 4P0GA 3MVYA 1GVCA 5TP9B 1MQGA 1WDNA 2DWJA 4O3AA 1B5IA 2W7YA 4RJZA 3KG2A 2AL5A 3AXFA 2VHAA 3K2DA 3MBPA 4OTEA 2DQVA 3E9XA 3PGFA 4TLMB 3K01A 2I58A 1R1NA 3IB1A 1GV8A 3QXMA 1WVJA 3MWBA 4YMAA 1JVYA 3ZS6A 1NNPA 4U1ZA 1LAHE 2F7AA 4IO2A 1Y3PA 3QUFA 4R6HA 1BTJA 3C9HA 3K6VA 1B7HA 1MY3A 2H9BA 3I6VA 4KCCA 4PQJA 4RK2A 3WAEA 4DCYA 3U93A 1US5A 5CBRA 3R7XA 2O84X 2Q2AA 2I3WA 3FXRA 4MLVA 1QULA 4PFYA 1PBQA 2NOOA 3LSLA 5CM6A 3IOUA 3OO8A 4GXSB 4MBPA 4MLQA 1B6HA 3SETA 3K6UA 1IZ1A 1SW1A 1QW0A 3K1MA 4I62A 1ZU0A 3U8QA 4E0XA 3D4CA 5L9SA 1QKAA 1QUKA 1Y20A 4HCWA 4NF4B 5HM4B 3G3FA 3FATA 3W9VA 2NXOA 1MY4A 3DP8A 4PP0A 3SEVA 3TCGA 1R9LA 2XX7A 4G2ZA 2THIA 5A5XB 2VD2A 3S9MC 3GZGA 5CMBA 1IIWA 3KFMA 5FTIA 1MQDA 3IORA 3N6TA 3TTNA 3TZAA 4EXKA 1UTHB 2OWTA 4LZ7A 4RK9A 4ELPA 2DE4A 2HXWA 3S9LC 2OCUA 1FQDA 2ZNUA 4XXUA 1MPBA 3IB0A 5F1QA 4R2BA 3MUQA 2Z22A 1N7WA 4EQBA 2ESNA 3IOWA 5KCJB 2XX8A 3V8XB 2NUVA 3EQ1A 1Y9UA 3SERA 3MJNA 3TAJA 3TTLA 1B2HA 2E1SA 2P0SA 3CG3A 4C0RA 1KWHA 4WEDA 1II5A 1OIBA 5BWJA 3MP6A 4ESXA 3O66A 4ZECA 1A54A 3LSFB 1SYHA 1VSOA 1FQAA 3LSWA 3MQ9A 2UVGA 4TLLB 5CI5A 3RPWA 4F31B 4G4PA 4WXJA 4F3SA 3CI8A 1DSNA 2F5XA 1J1NA 1YPNA 1M5EA 3B6TA 3R6UA 1SI0A 3USDA 5ICQA 1P1QA 1FW0A 1QVSA 1S7YA 2RKMA 3K4UA 3O6GA 4Q30B 3RTFB 5I84A 5KZTA 1LFIA 4KD5A 2ZNSA 4NF5B 2PT1A 3SEUA 1YTVA 4OFOA 4XKQA 1AL3A 5H8HB 1SQYA 2R9JA 4OWDA 4GFRA 4QSDA 5CC2A 3JYRA 2ZYNA 4PFUA 1MDQA 5EHMA 3I3VA 3UK4A 2QS3A 2Q9TA 3IL1B 2G93A 2I3VA 2O68A 3E3KA 4R6YA 4H6DA 3PMXA 4X48A 5DVJA 1NNFA 4O3BA 1P1UA 1Y3QA 4BDLA 1YCJA 3CFXA 4G77A 4H8IA 4ONYA 4RY1A 2A5TB 3IX1A 1D4NA 3PUVE 3Q27A 5DT6A 1D9VA 4P11A 4BDRA 1OVBA 3MPKA 4LP2B 1BKAA 1S50A 4ZE8A 4GL8A 4HTGA 3OSQA 3H06B 1JEUA 3CVGA 5TPAA 3TPAA 2VD3A 1LFGA 4LUBA 5I57A 3VFJA 4IO3A 3VV5A 1D9YA 1A8EA 3C31A 1AMFA 4PETA 1IXIA 4DLDA 4IO7A 1H45A 1PB7A 1SW2A 2ZNTA 2OBGA 4ZS9A 2Y7KA 1UIVA 3OEMA 2YJPA 3EF7A 4O3CA 4ZEIA 1LGBC 5M2VA 3TFLA 3KJ7A 2A5SA 1NNTA 1R6ZA 4R75A 3KEIA 3RN8A 2AL4A 3O9PA 1ZJLA 3KGCA 3OO7A 4Z7EA 5IAIA 2Y84A 4G8MA 3O97A 2V84A 3EPEA 2WKYA 3E13X 1IXGA 3ONMA 1N0TA 3PD8A 3PPOA 4FEDA 2O1MA 1FQEA 1MM7A 3SESA 1T0KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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