5KCJA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
279
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 279
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA02
3ZSFA 1N84A 2HZKA 4HW8A 4F18A 3KN8A 3K1MA 4O3CA 1S50A 4BDQA 3SEUA 3GBAA 2DYXA 3TEPA 4G68B 2AL4A 4YKKA 1LBCA 1HSLA 4H67A 3MBPA 3KN3A 1FQCA 4JB7A 4GL8A 2H25A 3MPKA 2DE2A 3S9MC 3S9EA 5F1QA 2R71A 3A3CA 1XT8A 3CFLA 3HO7A 2CZLA 4IO6A 2F7AA 5BWJA 3VV5A 2REJA 2ESNA 3MZ9A 4ZZAA 2I3VA 3QIMA 3KSXA 3V8XB 3OELA 4KQPA 4R9FA 1S9TA 5AA2B 3JZJA 2H4IA 2DP8A 3KEIA 1OVBA 5ELVA 4C1TA 3QK6A 1OQGA 3SDFA 1Y20A 1PB7A 1CE2A 4KI0E 3K2DA 4EXKA 2B65A 1GGGA 3B6QA 4ZDMA 2F97A 1B2HA 1B0LA 1DPPA 1MH3A 3G7WA 1Y9UA 3TCFA 3D4CA 3Q27A 1M5BA 3R7XA 3TFLA 5B7DA 5KDTB 4NF6A 2QMWA 3HHFA 3FVNA 1MG1A 3MQ9A 4LQ5A 5L8DA 2F34A 3KJTA 4IO4A 5ITPA 2H9BA 3RUMA 5IKBA 3PPPA 5AA2D 1HSJA 3MWBA 3OSQA 2DE4A 4ZEFA 4LONB 3LC8A 2RC8A 4F1VA 2ZNUA 1IQ7A 1MPDA 5CRYA 2Z8FA 3VDFA 3OEMA 1UTBA 3S2VA 3IB0A 4NF4B 4X48A 3VVEA 1UTHA 1EH3A 1D9VA 3G3GA 3KZGA 4HTGA 2V93A 4PP0A 4F3GA 4YKPA 3VLUA 1QKAA 3I3VA 4NF5B 4R6HA 5JK4A 1N7XA 3IB2A 1YCJA 1LAXA 5M2VA 1UIUA 2ZNSA 1YTVA 1OLCA 4QSDA 4R74A 3FXUA 1PBQA 2AL5A 1EZPA 4DLDA 4F2QA 1Y3QA 2VP1A 3U1OA 4O3BA 2A5TA 2P2AA 1XOCA 1Y4CA 2IA4A 3KSJA 3IJXB 1RYXA 1NNPA 1JW4A 1SD3A 1QW0A 4POWA 2WKYA 1FTOA 1KWHA 5HPQA 3C34A 3LBSA 4EF2A 1SQYA 3TTMA 2X7QA 2BJJX 1OVTA 3GBBA 5DTBA 2HEUA 1ELJA 2XHDA 3IB1A 3PMWA 1QUIA 3DP8A 3FJMA 1D4NA 1A54A 3HCQA 3M3KA 1B5HA 1Y1ZA 5ICTA 5I57B 3MAMA 1A99A 3RGYA 5K2XA 3B6TA 4ZZEA 4DXBA 4MBPA 2DOJA 3TTRA 2D3IA 4Q0CA 3UA8A 4OMBA 3KOTA 4IO7A 2QPQA 4R2BA 1FTMA 1MQHA 1MXUA 2PMSA 2DWAA 3UGWA 4XIGQ 4P0IA 1Y1MA 5DYHA 4X1DA 4H6DA 3IK6B 2XXRA 1LAFE 1OQHA 3VFJA 5H8FA 4XKRA 3TKDA 1MQJA 1P99A 3QUFA 4EXLA 4P11A 4N07A 4GXSB 1JVYA 3MUQA 2Q2AA 1I69A 2HZLA 2O84X 4G77A 2Y7WA 1FCKA 2XD3A 2F6PA 1PEBA 4ESXA 4TQUQ 1EU8A 4YU0A 1WVJA 3TCHA 4PQJA 5TU0A 3OMBA 2DWHA 4YKIA 4RJZA 3V5AA 2I49A 4LZ8A 4KFQA 4BDLA 1H45A 2XX8A 1EZ9A 3HV1A 1B0HA 1BIYA 4FORA 3S9LC 3BKIB 5H8NA 3SESA 2G29A 3OO8A 3IOTA 4MFIA 3LUYA 3LSXA 2DXRA 1PBPA 2HAUA 4OFOA 1VE4A 3HPIA 1TWYA 4H1XA 2GFEA 1LAHE 2QS2A 3ILUB 4ZE8A 4DZ1A 4MLVA 2D21A 1A8EA 2O7UA 3EN3A 4F29A 3RTWB 2FYIA 2F36A 3PU5A 2QL3A 3V83A 4I9DA 4QRZA 3KG2A 4XKNA 4ZEBA 5CMMA 4X1BA 2A5TB 1NH7A 3TTLA 1MXZA 1DTGA 4KYSA 4IGRA 3UORA 3T9HB 4GFRA 4IO5A 5DVIA 4LUBA 4FEDA 3IO4A 3TZAA 2FA7A 1MY3A 1NNKA 2ABHA 1PDAA 3O29A 4KYEA 2YLNA 2VD3A 3MZBA 2Y7PA 4F1YA 5BUUA 4OEVA 1B3HA 4RYAA 2XXVA 4KCCA 5FTIA 4F1UA 2DVCA 3K6XA 1B3GA 4LZ7A 5I2KA 1IIWA 4PFYA 2F7CA 3PPRA 4NE4A 4LA9A 1ZKBA 4LVQA 1JVXA 5JEIA 4ZEIA 4FE8A 1US4A 3GZGA 3O2AA 1FQAA 1LLSA 2YJPA 3PD9A 3K00A 5L9MA 5TPAB 3PUZE 1M5DA 2GHAA 2Q8JA 2HXWA 5H8FB 2LAOA 3EHUA 3PV0E 4EQ9A 1MPBA 2XXHA 1F9BA 2M8CA 3MZ1A 4DIGA 4L17A 1IZ1A 2I48A 3H03A 4K3FA 3RQTA 3FJGA 1QKBA 3KBRA 1JNFA 3HN0A 2VD2A 4EUOA 5AE4A 4U1OA 1MY4A 1B52A 1O63A 2VOZA 4N13A 4XTCQ 1UIVA 4M1VA 2UVHA 1QUJA 4G8NA 2Y7IA 4RPOA 1D9YA 1MM6A 4OWDA 1XVXA 1RKMA 1IITA 5F7VA 5JTYA 3IR1A 1Q1KA 1IUDA 1MXWA 3DELB 3DP4A 3OD7A 2UVGA 4YMBA 4JWYA 1SDXA 3EPEA 3KJ7A 5CMKA 2RKMA 1LSTA 1GR2A 1R1NA 3T22A 5CBSA 4NWDA 2ZNTA 1S7YA 4ZEDA 5TP9B 1IXGA 3LSLA 4XXUA 2V3TA 3MVWA 4G2ZA 3OEKA 1LB9A 2UVJA 3A3UA 4IO3A 1QULA 4WXJA 3H3GA 5AA4B 3BBRA 1RYOA 1VSOA 2DWIA 4OTEA 3W9VA 4M4GA 3TQWA 1JW1A 5DEXA 4MF3A 1N76A 2OK2A 3QXMA 3G3KA 4OEUA 3KFMA 2UXAA 3TELA 4G68C 4E0WA 4MLQA 3RT8A 3I6VA 2QS1A 4NTLA 1ZLQA 2HFBA 3FUZA 3Q25A 5I2KB 1NKXA 4U21A 3O6HA 1DOTA 2RC9A 1B3FA 2V3QA 3MJNA 4X9TA 1GTKA 3FVGA 3K4UA 1J1NA 1EZOA 1TT1A 3OO9A 4GL0A 1QJMA 1ATGA 2P0SA 2V3UA 3ONMA 5K2YA 4AB6A 2QS4A 1P1QA 5DVFA 1POY1 4Z7EA 1JEUA 2O51A 5H8HA 2VGQA 4TLMB 4HS7A 4U23A 1URDA 3O97A 4TLLB 1NFTA 1A7LA 4HCYA 2YPNA 1R9LA 4OERA 2DXYA 2I4BA 4QFOA 2XX7A 2PVUA 3RNNA 2I3WA 4PFTA 1ZMGA 3IOUA 3TDJA 1XHYA 1LCTA 3IORA 1B51A 1B05A 4OHNA 4ZE9A 1AIVA 4LATA 2XXQA 2ALUA 3RN8A 4GQOA 4U4SA 4YB7A 2A5SA 2ZYKA 3S4UA 1B5JA 1MH4A 5HBCA 5JTYB 3MW0A 4DCYA 2XXYA 4YKJA 3AXFA 1N3XA 3RTFB 3UK4A 3U94A 1R9QA 4QSCA 5A5XA 3QSLA 1TFAA 4ELPA 1MM7A 1O7TA 3H6VA 3C35A 1H3DA 4EQBA 1B4HA 3UN6A 2I0CA 4IGTA 2F78A 2HCAA 3U93A 1SI1A 4DXCA 3H06B 2F6GA 2RF1A 3N26A 2THIA 3QUJA 1NMUA 4NMYA 2RCBA 1LGBC 4ELOA 3E3KA 3HSTA 4GOTA 4Q30B 3PUVE 1NNTA 2ZYMA 5DEXB 5I56A 3RPWA 3CI8A 3H7MA 3O9PA 3USDA 4F31B 4NF6B 2QS3A 3MP1A 2IEEA 4RPNA 1H43A 1FTLA 4RK2A 4KPTA 2D5WA 2DWJA 3SEVA 5ICQA 4KCDA 1YAEA 3C9HA 4ECFA 2GHBA 1FTJA 3CG3A 4JDFA 2ZYNA 1UTBB 1N0TA 3B7DA 2Z23A 1UTHB 4FATA 1T0KA 4NWCA 3S9NC 2F7BA 2XXIA 3ECRA 3TYHA 2O7IA 4WEDA 1SW1A 3FV1A 1JW5A 5FHMA 4F39A 1ZTYA 3CIJA 2DVZA 2I6EA 2O6AA 3C33A 1ANFA 4YMAA 5H8HB 1B4ZA 1GV8A 3O6GA 3UIFA 1SW5A 4RY1A 1MQGA 4N6PA 3BFTA 1AMFA 3CG1A 4RXLA 4ISUA 4EDPA 2UYEA 1M5FA 4ZS9A 1FQEA 2DQVA 4H8IA 4GVOA 3WAEA 5CBRA 1H76A 4QSEA 5AA2A 1I6AA 2DS9A 4FIMA 5DT6A 2VHAA 2XXTA 2OJTA 5EYFA 5HM4B 3QAXA 2V84A 4ZECA 1B1HA 4RK9A 1IXHA 3JYRA 3OOAA 1IXIA 5CMBA 5A5XB 1FQBA 4JBZA 3VLWA 1FQFA 4GLIA 4G8HA 4R6KA 4RNSA 1CB6A 5FHOA 3PUWE 3EHTA 2ONRA 2Q2CA 1B3EA 3Q26A 2RCAA 4OVJA 2REGA 3MP8A 3RLFE 1Z7NE 4JWXA 4OZ9A 4POXA 1JEVA 5CC2A 1P1UA 3K0VA 3VVFA 1MXYA 1M5CA 1MY2A 4ELQA 3R6UA 4G4PA 4R2FA 2QJEA 5I58A 4JWOA 3T9UA 3ILTB 4ND9A 2F5XA 3L6HA 4XKQA 3K02A 4U22A 1H44A 3TODA 1MPCA 4THIA 3PPQA 4GF8A 3FXQA 3IL1B 4JSOA 5I59A 4TOZA 2R6GE 5H8QA 1SI0A 3FXRA 3RT6B 3ZS6A 4ZEKA 3M3LA 3IO6A 3B6WA 1XVYA 2OWSA 2ANJA 3TTNA 3SKPA 1DPEA 4BDOA 5AA1A 3OSRA 4PFWA 3DLNA 1B7UA 2Q9TA 4PFUA 2PYYA 2NOOA 1QVSA 4E0XA 5H8NB 4R9GA 5CM6A 1Y3PA 2OCUA 5DVJA 5CI5A 4O3AA 2PT1A 4F3BA 3I5OA 3SETA 1SYHA 4XKPA 1AOVA 1UQWA 4YB6A 3PUXE 3OENA 2NUVA 1ZJLA 1LB8A 1USYE 3FASA 4KYDA 1DTZA 1Z7ME 3C4MA 1PC3A 3PUYE 2KLFA 3KOSA 1MY0A 3OO6A 1B1XA 5IAIA 5FHNA 1FQDA 4KHZE 5I57A 2V25A 5EHSA 2OBGA 4PE5B 5J1DA 3T66A 1P1NA 1B6HA 3JV9A 3FIRA 2ZMBA 1VFEA 4GD5A 1ZIUA 1TFDA 3T96B 1SW4A 3N5LA 1OLAA 4GXAA 4FEBA 2PBWA 3Q28A 5EHMA 4YAHX 2F8DA 1LAGE 5I2NA 2DE3A 2O1MA 4DCXA 3TPAA 3N94A 3MPLA 3TAJA 4U1ZA 1A8FA 1LBBA 4Z0IA 3VXBA 3LSFB 2XXXA 1LCFA 3VE1B 3VLVA 2X26A 2OZZA 1Y4TA 4Q5TA 3N6UA 2GH9A 1USYH 3K1PA 2QRYA 4UA8A 2H99A 4KR5A 1TXFA 3TMGA 3THIA 1XC1A 4DDDA 1LFGA 4I1DA 2PT2A 4GWOA 3VXCA 1N04A 3CVGA 1B7HA 3K1NA 4P0GA 3G3FA 4HCWA 4AB5A 2Y84A 4PETA 1URSA 2GRVA 5B70A 3BFUA 3TCGA 2P1SA 1NH8A 4R72A 3FD3A 2G93A 2B3BA 4QHQA 1SW2A 1MXXA 4OENA 3KGCA 2CMOA 4H5FA 5I58B 4R75A 1QUKA 3U8QA 3CRBA 1BLFA 1URGA 3FJ7A 1VFDA 3MVYA 2I58A 1B7ZA 4WKMA 1IXCA 3E9XA 1POTA 3T93B 5I59B 4YICA 4IB2A 5H8QB 4FJPA 4Q8RA 3IOVA 3PPOA 2NXOA 3CSBA 3IAZA 1NL5A 1BTJA 3ZKKA 1JQFA 1MQDA 5LOMA 2Q88A 3PPNA 1Q35A 4LP2B 1II5A 1WDNA 4F19A 1B5IA 1MDQA 2R9JA 3M3FA 3C31A 3MP6A 2B3FA 5KCJA 4R6YA 4IY6A 4UACA 1L5TA 2Y7RA 2ONSA 3H6UA 2RINA 2O68A 4IO2A 4OFJA 1DSNA 3EF7A 3DM0A 2QSXA 2X7PA 4NEDA 3FVOA 1PB8A 5AA3A 4BDRA 1A40A 3V89B 4OESA 3H6TA 3FGSA 4LQ2A 1B46A 1YPNA 4NF8A 1AL3A 3WAFA 3A09A 1B58A 3W9WA 3T9XB 1NNFA 2ZXTA 3TQLA 4G8MA 4GIZA 5L9SA 5H8SA 3O28A 2XD2A 2OWTA 3R26A 2XXUA 3N6TA 2E0SA 3E4RA 2RC7A 3OO7A 1SVXB 5I2NB 4LZ5A 1R6ZA 3M8UA 2OLBA 1OMPA 4OFLA 1FTKA 5TPAA 2ZYOA 3C32A 4QFPA 5ITOA 3FZVA 3MVXA 4H65A 1XS5A 2XXWA 4DE8A 2I0BA 3TUSA 1MY1A 2Q89A 3EHSA 1ZU0A 4F2OA 3MVZA 3GXAA 3CFZA 1JETA 2HAVA 3PD8A 4QF9A 1OIBA 4OQOA 1MQIA 1PB9A 4U4XA 3IJOB 4DXUA 4C1UA 3DP6A 3UP9A 3EQ1A 3O6IA 2AYSA 2UYFA 2NWJA 3FATA 3C36A 4G68A 3E13X 4MH5A 3L6GA 1B32A 1I6BA 3LR1A 3H4ZA 2I4CA 3ODBA 2AIXA 1WODA 2ONKE 3LSWA 3KN7A 4JSDA 3D4GA 4I8CA 3HHGA 2QMXA 4C0RA 1US5A 2HQ0A 1Y3NA 4OXVA 3W15C 4QFKA 1LFIA 4EF1A 1B9JA 4KD5A 5L9OA 3SERA 1LFHA 3VVDA 3CSGA 3H6WA 4FECA 2O1LA 4H5GA 4F22A 3G3HA 1AH5A 1IEJA 3G3JA 3TTKA 4AQ4A 2XXPA 4QFLA 4I62A 2NVUB 1FW0A 5TP9A 2FNCA 3IX1A 4BDMA 4JXIA 5CMCA 4OYVA 3ZKLA 3K6UA 1M5EA 1D3KA 4ONYA 1MS7A 2H5YA 2UVIA 3SEXA 1DMBA 3MC2A 3PMVA 4OETA 5AA4A 2F35A 5KCJB 4ELRA 2Z8DA 3OXNA 2W7YA 4YB5A 5KZTA 1ZBMA 3PGFA 1B40A 1VR5A 5KDTA 2Z22A 1MXVA 3K01A 1N7WA 4GRKA 1P1OA 3U92A 3T9VA 4RA1A 4EQ7A 4ESWA 4R73A 3FVKA 2E1SA 3QYTA 5ISUA 2DSFA 3U72A 3P7IA 3SEYA 5I84A 1BKAA 2O69A 4YZZA 5FTHA 2Y7KA 1A55A 2Z8EA 3G3IA 4NF8B 3FV2A 1MDP1 3GLBA 1MRPA 1GVCA 4NF4A 3SEWA 3IOWA 3F11A 3O66A 4H0WA 3PMXA 4F3SA 1P1WA 4WEPA 2PX1A 4BLAA 1SYIA 1N3WA 4IY5A 2H98A 3K6WA 3RY3A 1SBPA 4QFNA 3Q29A 5I56B 4FAJA 1I6QA 4H8JA 1HSEA 4NF5A 4BDNA 3CFXA 3CR9A 3K6VA 1O64A 1B3LA 2XX9A 1BP5A 4U2RA 4F3PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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