5KCJA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
279
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 279
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA02
2E0SA 3KOTA 1US4A 4BLAA 3P7IA 3PUWE 3WAFA 4NMYA 1SW2A 4BDMA 1MDP1 4DXBA 3MVWA 4YKKA 3W9VA 2I3VA 3DP6A 1A8EA 1F9BA 4O3AA 2QMWA 4GL0A 4ZEKA 1MQJA 1JETA 5I2KB 2XXVA 4RK2A 2I4CA 2V84A 1Z7ME 5JK4A 4G77A 4GD5A 1SD3A 4GF8A 1DSNA 1P1OA 3DLNA 1SW1A 5CMKA 2I48A 4U1OA 4OFLA 3S9NC 1A55A 4U2RA 4FEBA 1XC1A 5KDTA 3CR9A 4QHQA 3OEKA 1MXWA 2NWJA 5ISUA 4IGTA 1VE4A 3DM0A 1I69A 4ZECA 2Q9TA 4GRKA 4YICA 3FJGA 4OMBA 1QUIA 4LP2B 4JDFA 5I2NA 4DXCA 1AH5A 4RPNA 3MZ1A 3QK6A 5B70A 3T9XB 5I57B 3LUYA 3FVOA 4RJZA 2GRVA 4YB6A 3FJ7A 3R26A 2REJA 5I59B 1MG1A 4IO3A 1TT1A 1MXYA 3IJOB 1MXXA 3D4CA 4PFTA 1QJMA 2XX9A 3BKIB 2DWJA 3CG3A 2ESNA 1B7ZA 2OWSA 2A5TB 3KBRA 3OELA 1OLAA 5H8SA 2QS4A 4KYEA 3PV0E 2I3WA 5AA4B 4WKMA 3EHSA 2I0CA 5JTYA 1O63A 5CM6A 3TKDA 2P0SA 1JQFA 2Y7IA 2QS2A 3VV5A 3O97A 4RY1A 4HCYA 5DVJA 5ICQA 1JVYA 1I6QA 3KJ7A 5CMBA 1H45A 4YKJA 2P2AA 3PMVA 3UGWA 3UP9A 2QMXA 4KPTA 4R73A 1CB6A 4EDPA 3OSQA 3IORA 4TQUQ 3TTKA 1QULA 5ITOA 1EH3A 4MH5A 4PE5B 3QIMA 3IB2A 4PQJA 4RK9A 2X7QA 1URSA 3PUXE 3PMWA 4NWCA 3U72A 1D9VA 4Q30B 4QSCA 2H98A 3V8XB 4R6HA 1R9LA 3TAJA 2H99A 1XVYA 2V3QA 1IXGA 1IITA 4KI0E 3IB1A 1ATGA 1HSEA 4G68B 3PPPA 4Q8RA 1AMFA 3G3GA 1UTBB 2D3IA 4KFQA 3QXMA 4GLIA 1A8FA 2XD3A 2REGA 1BTJA 2XXYA 2XXUA 3KGCA 2ZYKA 4TOZA 3KFMA 1MPDA 3SEVA 3C36A 4G8HA 4YZZA 3C35A 4G4PA 3EHTA 4ZZAA 2QJEA 1OMPA 3KSJA 3CSGA 3HSTA 3JZJA 4H1XA 3FIRA 4IGRA 1DTGA 4XKPA 3C34A 3LSWA 4HTGA 1A54A 3RT6B 3TCHA 3IR1A 1N0TA 5CMCA 1LBBA 4AQ4A 1PDAA 3TTNA 5I59A 5IKBA 4R2BA 1MQDA 3U1OA 3IAZA 3RGYA 3B6WA 5HPQA 3CFXA 1WODA 3KN8A 4MLVA 2Y7PA 3HV1A 3O9PA 5TPAA 2A5TA 4DCXA 3G7WA 1JW5A 3M3KA 1ZIUA 2DQVA 4QFKA 5FTIA 4OTEA 1NNPA 2CZLA 3K6XA 1B3GA 2DE3A 2RINA 3K0VA 4NF6A 4ECFA 3PMXA 2R9JA 2PT1A 4ZEIA 3HCQA 4P11A 2QL3A 4JWXA 1IUDA 1Y3QA 5F7VA 4P0IA 1NMUA 1M5BA 4KHZE 2O51A 3UA8A 3PPOA 4DLDA 4QRZA 1UQWA 3KN3A 4EXLA 1FQAA 4YKPA 2VHAA 2XXQA 4F2QA 3KZGA 3T9VA 2PVUA 4F3GA 2FNCA 1N76A 4WEDA 3RTFB 3B6QA 3K2DA 1XVXA 3TTLA 1II5A 4RYAA 3M3LA 1FTKA 1RYXA 3H4ZA 1FQFA 1N3XA 5FTHA 5EHMA 1B0LA 4M1VA 2HXWA 3H3GA 4E0WA 2I58A 3C32A 4GFRA 5KDTB 3ILTB 2OLBA 3I5OA 5I56B 4ESXA 3KOSA 1FQCA 1SVXB 1ZU0A 2Z8DA 2DVCA 2DWHA 1FQBA 1P99A 1Y1MA 2NOOA 2DYXA 2VP1A 3ONMA 4PETA 1Q35A 5CBRA 1LLSA 2Y7RA 2GFEA 4H8JA 1MS7A 2F7AA 3E9XA 3VLVA 4GWOA 1Y9UA 4DIGA 2HZKA 2DE4A 1R9QA 1GTKA 2O1MA 5JEIA 1FCKA 1B3FA 2HCAA 3A3UA 3B7DA 3V89B 2QRYA 2RKMA 4POXA 1XS5A 4H67A 3EHUA 4LONB 1UTHA 4R75A 1LAGE 3H6TA 1ANFA 3BFUA 5JTYB 4MLQA 1IZ1A 3USDA 3RQTA 1FTJA 4LZ7A 3M8UA 3KJTA 3EQ1A 3ZS6A 3S9LC 5H8FB 2CMOA 3G3KA 4XKQA 2Z23A 2HFBA 1NFTA 3O28A 3VXCA 1HSJA 1EZOA 1EU8A 3S9EA 1LGBC 1B3EA 2ALUA 3PUZE 2ZYMA 3QSLA 2E1SA 4R72A 3H6WA 1USYE 3TTRA 4F22A 3SEXA 3U92A 4MBPA 3F11A 3FVNA 1USYH 5KCJA 1ZJLA 1IXCA 1FTOA 4C1UA 4BDRA 1XOCA 3PPRA 2H5YA 3O6IA 2AL5A 2V3TA 3IX1A 3OO9A 4FAJA 1YCJA 4ELOA 4KR5A 1NNFA 5HM4B 4LQ2A 2H9BA 4GQOA 3GZGA 2ZNUA 3T66A 1ZBMA 2GH9A 5I56A 2B3FA 1B51A 4AB5A 1Y4CA 4OFJA 1DPEA 1H44A 1GV8A 4HS7A 2ONSA 5M2VA 2NXOA 1UIUA 2W7YA 3ILUB 3V83A 3ZKLA 3OSRA 4U22A 3MP1A 2DVZA 5BWJA 2V93A 2OCUA 3VDFA 4I9DA 4R6KA 2H4IA 3KN7A 1LAHE 3K4UA 4Z0IA 3FVKA 5B7DA 4JXIA 3PD8A 2O69A 2XX7A 4OERA 1B2HA 2OWTA 2DXYA 5TPAB 2O7IA 4I1DA 2PYYA 1XT8A 2UVGA 3MPLA 2OZZA 3U8QA 2AYSA 1DPPA 4JWYA 3S2VA 2M8CA 4NF6B 1IXIA 1LFGA 4YMBA 5AA1A 2XXHA 2NVUB 3QYTA 2Z22A 1H76A 3T96B 5H8FA 3FZVA 4U4SA 1FTLA 2KLFA 2X26A 2ABHA 1B3LA 2D5WA 1M5FA 1B52A 2GHAA 2F36A 3JV9A 2F7CA 4OESA 2QS1A 2QPQA 4OZ9A 2UVJA 1NNKA 4U4XA 4O3BA 5DVIA 5DVFA 4HCWA 4BDOA 3MP6A 4OYVA 3O66A 4NEDA 3IOTA 1EZPA 2D21A 3UIFA 3RTWB 3Q26A 4NF4A 1ZLQA 1JEVA 3FD3A 4GOTA 3RY3A 4OHNA 4LVQA 1LAFE 4TLMB 1R6ZA 2Q88A 1OQGA 1MXUA 4QSEA 4IY6A 4FATA 3Q29A 3IOVA 4LUBA 2P1SA 1TFDA 4IO5A 2O1LA 2PT2A 1B46A 4N07A 4ZE9A 3SESA 4PP0A 4AB6A 4NF5A 5DYHA 4G68C 2QS3A 1P1UA 4LZ8A 4OETA 3K1PA 1QUKA 3HHGA 3TQWA 4R9FA 5AA2B 5H8NA 1DTZA 4ZE8A 1UTHB 2O7UA 4THIA 4OQOA 3SDFA 4F3PA 4JSOA 3V5AA 3MVZA 3THIA 1M5DA 3MQ9A 3L6GA 3TQLA 1UIVA 4NTLA 2VOZA 1MH3A 2I6EA 2B3BA 1OVBA 4EQBA 2UYEA 3DP8A 1S9TA 3Q25A 3QUJA 1Q1KA 5CRYA 2GHBA 1H43A 3AXFA 4H8IA 2Q2CA 1IQ7A 2I4BA 2O84X 2ZMBA 4KYDA 1B6HA 1H3DA 1TFAA 3MVYA 2R71A 1R1NA 5TP9A 4Q0CA 3OENA 1ZKBA 3C31A 3L6HA 4ND9A 2UVHA 5K2YA 1Y1ZA 3TPAA 4P0GA 3IOUA 4OWDA 2OJTA 4EF1A 1SW4A 1A40A 4ESWA 1GR2A 3KG2A 1LCFA 3MW0A 5KCJB 3EPEA 1I6AA 1LAXA 4OEVA 1IEJA 2DOJA 3B6TA 1POY1 3OD7A 2V3UA 2I49A 2Y7KA 3K00A 4RPOA 1PEBA 1MY4A 4JWOA 3MVXA 3TYHA 1O64A 3RN8A 4FIMA 4N13A 3T22A 5F1QA 4PFYA 1GVCA 2Y84A 4EQ7A 4EQ9A 3VLWA 1B05A 1Y3PA 2AIXA 1P1QA 1NL5A 1MPBA 3CRBA 1MRPA 3WAEA 1M5EA 2ONRA 3OMBA 3PPQA 4WEPA 5AE4A 4ZEDA 4YB7A 4R9GA 4EXKA 1LB9A 4YMAA 1FQEA 2H25A 4DXUA 4GXSB 1N3WA 3MPKA 1B5JA 2PX1A 2YLNA 4MF3A 3TCGA 3VVFA 2Q89A 3R6UA 3T9HB 1MQGA 2XXXA 2F8DA 3N5LA 2IEEA 5H8QA 1MY3A 2X7PA 3U93A 1B3HA 3W15C 3GLBA 2RC9A 2DXRA 5A5XA 4LZ5A 4E0XA 3JYRA 3FVGA 1MM6A 1NNTA 2FA7A 2OBGA 3N26A 2IA4A 3O29A 3MUQA 4PFWA 2Z8EA 2RC8A 3RT8A 5AA2A 4YKIA 4IO4A 2O6AA 4ZDMA 1BP5A 4R74A 4UACA 4FE8A 5I58A 1XHYA 1AIVA 4GVOA 3TUSA 3SEYA 3SKPA 1B1XA 1BLFA 1MY2A 4X1BA 3OOAA 3BFTA 3R7XA 3MJNA 1MPCA 3EN3A 1DMBA 1URDA 3K02A 4U23A 4H65A 1A7LA 3FATA 1Y3NA 3IK6B 3MWBA 2Q8JA 1OQHA 2HQ0A 3PUVE 3VE1B 2OK2A 1IXHA 3RUMA 1MQHA 1FW0A 5L8DA 3SEWA 1OIBA 4H5GA 2F5XA 1US5A 4XTCQ 2PBWA 4RA1A 1VFEA 3UORA 1B0HA 4OENA 2DWIA 3IJXB 5BUUA 4X48A 5L9SA 4NF4B 4F1YA 1B40A 4LQ5A 3LBSA 3H6VA 3E3KA 3FJMA 2RCBA 2G93A 3IO4A 4TLLB 1MY0A 4ELRA 2BJJX 1PB9A 3H6UA 1YAEA 4ZZEA 3DELB 1P1NA 3FGSA 4K3FA 1ELJA 1O7TA 4FECA 3Q28A 1B4ZA 4H6DA 4I62A 1EZ9A 2XXPA 1FTMA 1B5IA 3IOWA 3ZKKA 4EF2A 2UYFA 3RPWA 1QKAA 1LCTA 4NF8A 1RYOA 1I6BA 4C0RA 4F39A 4KCCA 3FXQA 2ZYNA 5AA3A 4NF5B 4RNSA 1URGA 1N04A 2XHDA 3MP8A 1B32A 5EYFA 4QFNA 3UN6A 3K1MA 3TODA 2DE2A 4DZ1A 3GBBA 4IY5A 1B5HA 3LC8A 5H8NB 5DEXA 2V25A 3G3FA 1ZTYA 3FUZA 1MDQA 3E4RA 3DP4A 4OVJA 1QUJA 4KYSA 3K6UA 2A5SA 4YB5A 3K01A 4ISUA 2HEUA 4ELPA 1SI0A 3CG1A 4BDLA 4XKNA 3TELA 1LFHA 1PB8A 1P1WA 3OO6A 1NH8A 2QSXA 1LFIA 3TMGA 1BIYA 1HSLA 4NWDA 3IB0A 1LSTA 4MFIA 2ZXTA 3TEPA 3G3JA 2XXRA 3O6HA 2PMSA 4PFUA 3MZBA 3PPNA 5TP9B 2Z8FA 1VSOA 3CI8A 4F19A 4F1UA 5DT6A 3VVDA 3TTMA 1SYHA 1B9JA 2FYIA 1JW1A 3FASA 1WVJA 1LB8A 1M5CA 3C33A 3A09A 1AOVA 2RCAA 5CMMA 4Z7EA 4LA9A 1LBCA 5H8HA 3OXNA 1SQYA 4GIZA 3QAXA 1Y20A 4X1DA 3SETA 3UK4A 2RC7A 4IO6A 3H06B 4LATA 2VGQA 3K6VA 1MM7A 3O2AA 2XXTA 3OEMA 4ZEBA 1D3KA 1B58A 1VR5A 3SERA 3MC2A 4WXJA 3HPIA 1DOTA 4G8MA 5I2KA 3CFZA 3CIJA 3D4GA 4M4GA 4HW8A 4JBZA 4G8NA 5L9OA 4R2FA 1S50A 3U94A 4QSDA 4N6PA 2ZNSA 3S9MC 4OEUA 5DTBA 3MBPA 1B4HA 1D4NA 4FJPA 1SBPA 5H8QB 1QVSA 2DP8A 3FXUA 4FEDA 5KZTA 1MXVA 5A5XB 3PGFA 1IIWA 3GXAA 2O68A 4DCYA 2ZYOA 3FV1A 4QFLA 4U21A 4I8CA 5ITPA 3QUFA 2DWAA 4POWA 1PBPA 3N94A 3VXBA 2THIA 3I6VA 2YJPA 3T9UA 5ICTA 3W9WA 1NH7A 3CVGA 4UA8A 3ZSFA 4C1TA 1OVTA 3HN0A 1MQIA 5CI5A 4KCDA 1RKMA 1JNFA 1WDNA 2F7BA 5I58B 5I57A 5FHNA 1BKAA 5AA2D 3MZ9A 4ONYA 4BDQA 1B1HA 3OO8A 1T0KA 4RXLA 2XD2A 2WKYA 5J1DA 5K2XA 4U1ZA 4OFOA 3CSBA 1VFDA 4F18A 5IAIA 4G2ZA 2DS9A 4YAHX 1Y4TA 1SYIA 3HO7A 2F78A 1JVXA 2F6PA 3IO6A 4EUOA 3PD9A 5AA4A 4XKRA 3TCFA 1J1NA 3FV2A 3M3FA 1TWYA 1MXZA 5FHOA 3LSLA 3T93B 4Q5TA 2ONKE 5CC2A 3A3CA 4FORA 3HHFA 1N7XA 1Z7NE 1YTVA 3K1NA 3K6WA 2B65A 3TDJA 3TFLA 3ECRA 4F1VA 4NE4A 1KWHA 1PB7A 5ELVA 2ANJA 4GL8A 1CE2A 1QW0A 2HZLA 1GGGA 1PBQA 1JEUA 1JW4A 3RLFE 2DSFA 2HAVA 3OO7A 3Q27A 3IL1B 4XXUA 4F29A 4XIGQ 2ZNTA 2XX8A 3MAMA 4ZS9A 4NF8B 4F31B 3TZAA 2NUVA 1ZMGA 3O6GA 2UXAA 2Y7WA 1SI1A 4BDNA 4G68A 1L5TA 4QF9A 1FQDA 3H03A 4YU0A 2XXIA 2F97A 1S7YA 1TXFA 2G29A 1UTBA 3VLUA 1N7WA 4OXVA 4KD5A 3C4MA 1POTA 4QFPA 3VVEA 2YPNA 2VD2A 4DE8A 5DEXB 4IO7A 3RNNA 4F2OA 5I2NB 3EF7A 1MY1A 2RF1A 3LR1A 4R6YA 1SW5A 4H5FA 5L9MA 4F3BA 3ODBA 1MH4A 2AL4A 4QFOA 2R6GE 1QKBA 3VFJA 1NKXA 1B7HA 2LAOA 5TU0A 5CBSA 3KEIA 4IO2A 3LSFB 3GBAA 2I0BA 3N6UA 3BBRA 3H7MA 2F35A 3C9HA 1SDXA 2F6GA 1AL3A 5EHSA 1OLCA 4DDDA 1YPNA 3FXRA 5FHMA 5I84A 2XXWA 5HBCA 3I3VA 4JSDA 3S4UA 1B7UA 3LSXA 4KQPA 3N6TA 3PUYE 4X9TA 4ZEFA 3PU5A 2Q2AA 1PC3A 3KSXA 4H0WA 4F3SA 4JB7A 5H8HB 3G3IA 5LOMA 2VD3A 4IB2A 1D9YA 4O3CA 1A99A 2F34A 3CFLA 2HAUA 1N84A 3E13X 4GXAA 4L17A 4ELQA 2UVIA 3SEUA 3G3HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IZ3B 2E0SA 3KOTA 1US4A 4BLAA 3P7IA 3PUWE 1FPFA 3WAFA 4NMYA 1SW2A 4BDMA 1MDP1 4DXBA 3MVWA 4YKKA 3W9VA 2I3VA 3DP6A 1A8EA 1F9BA 4O3AA 2QMWA 2VPOA 4GL0A 4ZEKA 1MQJA 1JETA 1LBXA 3D1RA 5ESYA 3KBZA 5I2KB 2XXVA 4RK2A 5IGAA 5T3JA 2I4CA 5EQAA 2V84A 1Z7ME 5JK4A 2WBDA 4G77A 4GD5A 1SD3A 4GF8A 1DSNA 1P1OA 3DLNA 1SW1A 5CMKA 2I48A 3LV0A 4U1OA 4OFLA 3S9NC 2Q74A 1A55A 4U2RA 4FEBA 1XC1A 5KDTA 3CR9A 4QHQA 3OEKA 1MXWA 2NWJA 5ISUA 4GWUA 1RDYA 4IGTA 1VE4A 3DM0A 1I69A 4HE2A 4ZECA 2Q9TA 4GRKA 4PGPA 4YICA 3FJGA 4OMBA 1QUIA 4NF0A 4LP2B 4JDFA 5I2NA 4DXCA 1FPBA 1AH5A 4RPNA 3MZ1A 3QK6A 5B70A 3T9XB 5I57B 2QVUA 3LUYA 3FVOA 4RJZA 2GRVA 4YB6A 3FJ7A 3R26A 2REJA 5I59B 1MG1A 4IO3A 3U65A 1TT1A 1MXYA 1NV6A 1RDZA 1G0IA 3IJOB 1MXXA 3D4CA 4PFTA 1QJMA 2XX9A 3BKIB 2DWJA 3CG3A 2ESNA 1B7ZA 3LUZA 2OWSA 2WX9A 2A5TB 3BIHA 3KBRA 3OELA 4NHBA 1OLAA 5H8SA 2QS4A 4KYEA 3PV0E 4PF8A 2I3WA 5AA4B 4WKMA 3EHSA 2I0CA 3B50A 5JTYA 1O63A 3GYYA 5CM6A 4NAPA 4P1EA 3TKDA 2P0SA 1JQFA 2WYPA 2Y7IA 2QS2A 3VV5A 3O97A 4RY1A 2FHYA 4HCYA 5DVJA 5ICQA 1JVYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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