5KCJA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
279
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 81
structure length 279
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA02
4GXAA 4QSEA 3S2VA 1JQFA 1SBPA 3Q26A 1LB8A 4PFUA 2AYSA 5I59A 3RT6B 3H4ZA 2RC7A 1LB9A 4IB2A 2YJPA 1Y1ZA 2ZYNA 2UVGA 1XVXA 2XXQA 1M5CA 2XHDA 4R9FA 3VV5A 1NNTA 3DM0A 4H5FA 2DYXA 1ZU0A 2Z22A 3I3VA 1MRPA 3O6IA 1VSOA 3KOTA 2HAUA 1YCJA 4NF4B 4TQUQ 3SEYA 3U1OA 3VLWA 3O9PA 3Q28A 5AA2B 1R9QA 3RGYA 3F11A 2F78A 1IUDA 2O51A 1XVYA 3KGCA 4P11A 4Z7EA 2R9JA 5AA3A 3OMBA 1R6ZA 3PUXE 4HCYA 3N6TA 2DWIA 3L6HA 1CB6A 3TCHA 4EQBA 4QF9A 4U1OA 2QL3A 1EH3A 4C1UA 4ESXA 4YB5A 4WKMA 2NXOA 1D9VA 1EZPA 1IITA 2PT2A 1IXGA 1NL5A 4U22A 3G3KA 3FVNA 4FEDA 3DLNA 3D4CA 5A5XA 4KCDA 1UTBB 1PBPA 4ND9A 4X9TA 3FXQA 2WKYA 2I3VA 2DQVA 1OQHA 2W7YA 1AL3A 2UVHA 3JV9A 5ICQA 5DT6A 2NWJA 1DSNA 1A8FA 1M5EA 1BLFA 3A3UA 1R1NA 4XKPA 4HCWA 4X1DA 1ZIUA 1HSJA 4M1VA 4GL0A 3S9MC 2QMXA 4KCCA 5ICTA 4YMBA 3FD3A 2QSXA 4UACA 1TFDA 5H8SA 1A55A 3H3GA 3MAMA 4HS7A 2GH9A 3EQ1A 3FJGA 4YMAA 4KI0E 5JTYB 1MY4A 1PDAA 3G3IA 3ZSFA 3T9HB 1CE2A 1PB8A 2VGQA 3PD9A 3RNNA 2Y7RA 2D3IA 3SEXA 2O1LA 4NF6A 1SW2A 4OEUA 2I6EA 5KDTB 2CMOA 4NMYA 1LGBC 1FQBA 4POXA 5J1DA 1LCFA 3QUFA 5FTIA 1KWHA 4ELRA 3VLUA 1LAGE 1GVCA 2RC9A 3QYTA 1Y4TA 2D5WA 5DVFA 1MQJA 1FQEA 1N76A 4XTCQ 2DWJA 5CMKA 1VR5A 1UQWA 4GVOA 1MDP1 5I2NA 1B3HA 2O7UA 5DEXA 1A8EA 4DZ1A 3PV0E 3V8XB 1OQGA 4YAHX 3CG3A 3PGFA 3TTLA 3ZS6A 1B3LA 3TPAA 2VD2A 3I5OA 1A7LA 3IX1A 2Y7IA 3G7WA 2O6AA 4F3PA 3V5AA 4JBZA 3G3HA 4R6HA 4F3GA 1PC3A 3U8QA 1BP5A 4ONYA 4U1ZA 2F7AA 5ISUA 4DE8A 1US5A 1IXCA 3GBBA 1H76A 4ZEIA 3HV1A 4RPNA 3UIFA 1OLAA 1A54A 1B7HA 4KHZE 2I49A 1SVXB 4OVJA 4KR5A 3PPPA 3U72A 2QJEA 2OBGA 4OFJA 4XKQA 2FNCA 3PPRA 4ELQA 4NTLA 4XKNA 3EF7A 4ZEDA 2DE3A 3EHSA 1MPCA 4H8IA 1LBBA 2P1SA 1NMUA 2DVZA 1HSEA 4PP0A 4MLVA 4PFYA 3B6WA 5I57B 2E1SA 1FQCA 1ZTYA 2I58A 2V25A 1ELJA 3UP9A 4DCYA 4IO2A 2O84X 4MF3A 1I6AA 4DCXA 2I48A 3RUMA 3CFZA 5B7DA 4ZS9A 3PUWE 2XXWA 2DS9A 3OSRA 2XXXA 3H6TA 2X7QA 4F2QA 4G77A 4RK2A 4H6DA 4C1TA 5L9SA 2DP8A 4G68C 2QS4A 5AA2A 1S9TA 3QXMA 2Y84A 1MXZA 1QUJA 3B6TA 1YPNA 3BKIB 3TQWA 1JW1A 1N3WA 1HSLA 5CI5A 1WVJA 1UTHA 3C32A 3MUQA 1N7XA 2PMSA 2G93A 5KCJB 2I4CA 3VDFA 1MQIA 1N7WA 1ZLQA 5H8NA 3W9VA 4KFQA 5I58B 3PU5A 4LP2B 1B1HA 4DDDA 3IOUA 2OWSA 2ONRA 3RN8A 2RCBA 3IK6B 4AB5A 1UTBA 5FHMA 2X7PA 3IORA 3I6VA 4JXIA 2FA7A 2RCAA 4GOTA 5ITOA 1JEUA 1Q35A 2CZLA 1PB7A 3HO7A 5AA1A 1J1NA 2THIA 4THIA 2XXUA 3KEIA 2G29A 4OERA 2ZMBA 3TTKA 3TODA 1QUIA 3CIJA 1QKBA 1B2HA 2DE2A 2F97A 3E9XA 1D3KA 4IO4A 2REJA 4R9GA 2OJTA 3OO6A 4YZZA 4PETA 3IOVA 5JTYA 5K2YA 3UK4A 4GL8A 4O3CA 1T0KA 4HW8A 3SETA 4Q8RA 2O7IA 3C9HA 3Q27A 4F2OA 5DVIA 2IEEA 3V83A 5F1QA 4F3BA 5KDTA 4G8NA 4QFLA 4F1VA 3FXUA 2Z8EA 4FE8A 4ZEBA 4IGRA 4OHNA 4R75A 4EQ9A 1TT1A 3MQ9A 4H65A 2HFBA 1FTJA 4FORA 2DVCA 3KN7A 1TWYA 3C34A 2HZLA 3O6HA 3K0VA 3T93B 3S9EA 3MW0A 1M5FA 3DP4A 1AMFA 2F35A 1VFDA 4YU0A 2V3TA 3QAXA 1MY0A 1SYHA 4KQPA 3CFXA 3FIRA 1FTMA 3V89B 5DTBA 4GQOA 2V3UA 2H5YA 3TYHA 4OMBA 4TLLB 3M3KA 1P1NA 4QFOA 4XKRA 3TKDA 5H8FB 2QPQA 3M8UA 1MM7A 2BJJX 4ECFA 3UA8A 3VLVA 5KZTA 1OVTA 1SI0A 3IJOB 2PBWA 3TELA 4DXUA 1DMBA 4QSDA 1XC1A 4PFTA 1MH3A 4TOZA 2GRVA 4TLMB 4RY1A 2GHAA 4ELOA 3TUSA 3N94A 4NF5B 2QMWA 1L5TA 1QKAA 2FYIA 3GLBA 3O28A 2XXPA 4FAJA 4I8CA 4GFRA 4RPOA 3FVOA 1JW5A 3SDFA 4EUOA 4JWXA 2A5SA 4BDLA 3PPNA 4I62A 2HCAA 2HXWA 4R6KA 3OEKA 1USYH 4RNSA 1LAXA 5FHOA 2NOOA 4EXLA 2Q89A 1YTVA 1R9LA 1B0HA 3H6UA 2XD3A 4G4PA 4KD5A 2ZYMA 4M4GA 2QS3A 5ELVA 4ZDMA 1QJMA 1RYXA 2A5TB 5H8HB 3T96B 5H8QB 2Y7KA 4Q30B 3OSQA 4MH5A 3QSLA 5CMCA 3IO6A 4OWDA 1IQ7A 3R6UA 3CSGA 3K4UA 3TTNA 1N84A 1LAFE 1DTZA 3HN0A 4BDOA 3OO8A 4U21A 1B3EA 3FJMA 1USYE 1JVXA 2RF1A 1LSTA 4ELPA 3IR1A 1D9YA 5CRYA 3CSBA 1ZBMA 5I58A 3H6WA 3OD7A 3T9XB 1Y3QA 4NEDA 4AB6A 4GIZA 3W9WA 1Y4CA 4MFIA 4F1UA 1B3GA 4MLQA 3C31A 1POY1 2OCUA 4XXUA 5AA4A 1O63A 3VFJA 1Y3NA 1LAHE 5I56A 1FCKA 2IA4A 3VE1B 1N04A 2DXYA 1B51A 3Q25A 5JEIA 2RC8A 3FJ7A 1MY1A 4GD5A 1TFAA 2DOJA 3VVEA 1P99A 4QFNA 5BUUA 5I59B 3C36A 2KLFA 3N5LA 1IZ1A 3GBAA 1PB9A 1I6QA 3R26A 2O68A 1TXFA 3IL1B 3SESA 3O2AA 3LC8A 4FATA 2F7BA 4O3AA 4R2BA 1B32A 4JWYA 1URSA 1LFIA 1NFTA 1O64A 3ILTB 5CM6A 1Q1KA 3G3JA 2ZYKA 1LFGA 3TMGA 1B3FA 3TCFA 3ZKKA 2XXRA 4LVQA 2I0CA 4JSOA 4LZ7A 3KFMA 3T9VA 4KYEA 3SEUA 4LQ5A 3CI8A 4OYVA 1LBCA 4G68B 3EPEA 2DSFA 3K1MA 2UYFA 4F22A 2B3BA 2HEUA 3BBRA 3KOSA 3P7IA 1VFEA 3KBRA 1II5A 1EZOA 3PUYE 2UVIA 1B7UA 3FUZA 1UIUA 3L6GA 3TTMA 3TEPA 1QVSA 4KYSA 5A5XB 1BIYA 3MZ1A 3THIA 4IY6A 2GFEA 2QS1A 2QRYA 3VXBA 5ITPA 1MY3A 3HPIA 3KN3A 4EF1A 3RY3A 1NNPA 1MXYA 4GLIA 5DVJA 2LAOA 1US4A 1B4HA 4DIGA 1H44A 4JWOA 4PE5B 1IEJA 4NF4A 1MXXA 2X26A 3QIMA 3PMVA 5H8FA 1SQYA 3VXCA 1A40A 1OVBA 3KZGA 3H06B 2PX1A 4F31B 3ONMA 4IO6A 3MPLA 2XX9A 3AXFA 1SDXA 4FJPA 1M5BA 4EDPA 2HAVA 1MM6A 2VOZA 2AL5A 1IXIA 1B0LA 3OEMA 2ZNSA 1FW0A 4LA9A 5L8DA 3S9LC 3FV2A 1VE4A 2P0SA 4BDMA 2B65A 5CBSA 1P1QA 2Q9TA 4NF8B 2XXTA 3MZBA 1EU8A 3PPQA 5DYHA 3EN3A 5I84A 3LSXA 2VP1A 3IOTA 2RINA 3HHFA 3LR1A 3K02A 3MZ9A 4C0RA 3WAEA 1SD3A 4GXSB 1XT8A 4GRKA 4P0GA 4LONB 3K6XA 2V84A 5BWJA 4E0WA 3USDA 4FECA 3W15C 4E0XA 2R71A 1FQFA 2ANJA 4OZ9A 4OXVA 1YAEA 2ESNA 4H1XA 2DE4A 4N13A 2XX7A 2ZXTA 4OETA 3TCGA 4OESA 3B6QA 5H8HA 3FGSA 2H98A 1FTOA 3CVGA 3D4GA 3GZGA 1AOVA 3R7XA 3U92A 4K3FA 5L9OA 3IB1A 3EHUA 2OWTA 3JYRA 5CMBA 5EHSA 1N3XA 4F29A 1F9BA 3N26A 3IJXB 3M3FA 1NH8A 5TP9B 1O7TA 3MVYA 1PEBA 2R6GE 2YPNA 2F5XA 3LSWA 2B3FA 1Z7NE 3SEVA 3SEWA 2I0BA 3K2DA 2DXRA 3G3GA 3U94A 4IGTA 1Y3PA 3TTRA 1NKXA 1B4ZA 5IAIA 2DWHA 1ZMGA 4RK9A 2VD3A 1Y1MA 3G3FA 4BDQA 3H6VA 1ZJLA 4R73A 3S9NC 1MY2A 5AE4A 4Q0CA 4BDRA 2NUVA 4RA1A 1NNKA 3KJ7A 3OO9A 4BLAA 1Y9UA 2XD2A 1AIVA 3K6UA 3RT8A 2NVUB 3E4RA 4X48A 1B9JA 1JW4A 4F3SA 4L17A 2ABHA 3GXAA 1LFHA 2P2AA 3O29A 1H45A 4ZE9A 1S50A 4MBPA 4IY5A 4WEDA 1DPPA 3UGWA 2F34A 2UYEA 1DOTA 1ANFA 2UXAA 4IO5A 4QRZA 1I69A 2ONKE 5M2VA 1MPDA 3RPWA 1Y20A 1SI1A 3T22A 4NWDA 5LOMA 1UTHB 4DXCA 2E0SA 3HSTA 2HQ0A 1XHYA 5B70A 3QK6A 4YKIA 5AA2D 2Q2AA 4G68A 3CR9A 2H25A 1B52A 5H8NB 5JK4A 4G2ZA 4U4XA 4R6YA 4H8JA 3DP6A 3TDJA 3KJTA 5I57A 2XXIA 2XXHA 3EHTA 4XIGQ 5I2KB 1OLCA 4RXLA 3KG2A 5FHNA 1N0TA 4FEBA 4PFWA 4EF2A 3OENA 1OIBA 4BDNA 5EHMA 4QSCA 1URDA 4YB7A 2F6PA 3IB0A 3K6WA 1B5JA 1EZ9A 1JETA 3ZKLA 3LSFB 5TPAB 1JNFA 2UVJA 2QS2A 3O97A 3PD8A 4KYDA 3TZAA 3C33A 4ISUA 4GWOA 4LZ8A 1GV8A 2Z8FA 3K01A 1POTA 1A99A 2XX8A 3M3LA 1B5HA 1QULA 3HHGA 1H43A 4YKJA 1WDNA 5KCJA 2PVUA 4F19A 2Q8JA 3KN8A 3B7DA 4U4SA 4NF8A 4OFOA 3T66A 2PYYA 1GTKA 4O3BA 4I9DA 1B40A 3MP8A 4DLDA 3MVXA 1H3DA 2Z8DA 4LZ5A 3CG1A 1I6BA 2F36A 1RKMA 1FQDA 1XS5A 3OELA 4YICA 1P1UA 1B5IA 2ALUA 1MQHA 2O1MA 4G8HA 4IO3A 3IAZA 4ZZAA 3OXNA 3U93A 2O69A 2Q2CA 3WAFA 3O6GA 3OO7A 3E13X 1MS7A 4WEPA 5HM4B 4UA8A 4LQ2A 4POWA 4OENA 1XOCA 3C35A 1P1WA 1MQDA 3MPKA 2H4IA 2OK2A 1QW0A 4WXJA 2V3QA 3CRBA 3H7MA 3MVWA 3ILUB 3T9UA 2ZYOA 3N6UA 2Z23A 4ZECA 3SERA 4DXBA 1PBQA 2ZNTA 1FTKA 5TP9A 1SYIA 4H67A 4ESWA 2I3WA 3K1PA 3K6VA 4IO7A 3PPOA 2F6GA 1B7ZA 3RQTA 2H99A 1IXHA 4R72A 1ATGA 3LSLA 1GGGA 4JDFA 4OQOA 1ZKBA 3S4UA 1MH4A 2F8DA 3ECRA 3FASA 5IKBA 5K2XA 3KSXA 4LATA 3UN6A 5HPQA 3QUJA 2AL4A 1UIVA 2YLNA 1M5DA 4YKKA 1FQAA 3C4MA 2XXYA 5CMMA 3DELB 1JVYA 1D4NA 1SW1A 1P1OA 3JZJA 3MBPA 3MP1A 3K1NA 4YB6A 1SW5A 5CC2A 2AIXA 3O66A 1AH5A 4AQ4A 1RYOA 5CBRA 4ZZEA 4OEVA 2PT1A 4OTEA 3MP6A 3PMXA 4EQ7A 3DP8A 2I4BA 3E3KA 2OZZA 4YKPA 4H0WA 3RTFB 4QHQA 1B58A 1B46A 3KSJA 4H5GA 4NF6B 4NF5A 4ZEFA 4NWCA 1MXWA 1WODA 2D21A 3MVZA 3H03A 4OFLA 1FTLA 2VHAA 3TQLA 5L9MA 5EYFA 2OLBA 3FV1A 4HTGA 4F18A 3A3CA 3PMWA 3Q29A 4JSDA 3FVKA 4N07A 1MG1A 4P0IA 2XXVA 4R74A 1MDQA 4F1YA 5I2KA 1NH7A 5I2NB 5AA4B 1S7YA 2Q88A 1OMPA 5I56B 2REGA 5DEXB 4FIMA 3FVGA 3TFLA 4QFPA 3MJNA 4GF8A 3MWBA 1IIWA 2GHBA 4RYAA 2Y7PA 1LLSA 4N6PA 1LCTA 2F7CA 2A5TA 4U2RA 4G8MA 4JB7A 1DPEA 4PQJA 4EXKA 3LUYA 4NE4A 1GR2A 1SW4A 3K00A 4ZEKA 5H8QA 4QFKA 5TPAA 3MC2A 1MQGA 4KPTA 3RTWB 3RLFE 1URGA 3VVFA 4Z0IA 3ODBA 1MPBA 1B1XA 1DTGA 1MXUA 1NNFA 2ONSA 3BFTA 3TAJA 4X1BA 1QUKA 3A09A 5HBCA 4LUBA 3PUVE 4R2FA 2M8CA 2HZKA 2H9BA 3VVDA 1B6HA 2V93A 3LBSA 4U23A 3SKPA 3OOAA 4ZE8A 2ZNUA 3FZVA 4Q5TA 3IOWA 1MXVA 1BTJA 5F7VA 3BFUA 5FTHA 3PUZE 1JEVA 4I1DA 3CFLA 3HCQA 2DWAA 1BKAA 3FXRA 4RJZA 5TU0A 2RKMA 3IB2A 3IO4A 2Y7WA 3UORA 3FATA 1Z7ME 4F39A 1B05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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