2DWAA

Structure of the complex of lactoferrin c-terminal half with fucose at 2.07 a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of lactoferrin C-terminal half with fucose at 2.07 A resolution
rcsb
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwaA02
2RC8A 5KZTA 2QRYA 1A8EA 4H8JA 3HO7A 2PBWA 2XXYA 1B52A 2ZYNA 5TPAA 3OELA 4GL0A 2AIXA 1DTGA 1Y1ZA 3EN3A 3IB0A 1DSNA 4GWOA 5TU0A 2XXHA 1O63A 1HSJA 3KEIA 5I58B 4U4SA 3B6WA 3IL1B 3HSTA 5CBSA 3IOUA 3LC8A 2QPQA 1MY0A 3N5LA 1IZ1A 3GZGA 3VVFA 3K02A 3VDFA 2A5SA 3TMGA 1NNKA 1ZJLA 3OEKA 2V3QA 5I58A 3R7XA 4WEDA 2HAUA 3JYRA 4ZZAA 3K1MA 3THIA 3IJXB 4KYSA 3VLUA 4AB6A 3TFLA 5TP9B 1M5FA 1MXYA 4BDMA 3PV0E 4NWDA 1B0LA 2IA4A 3H7MA 1MPCA 3SKPA 4MLVA 3T66A 3G3JA 5AA4B 4O3AA 3ZS6A 1DTZA 1LFHA 4C0RA 4ZS9A 5TP9A 4I1DA 4OXVA 2R9JA 3KZGA 3OSQA 2I48A 3VXBA 2G93A 1JVXA 3HCQA 3SEWA 2R6GE 3CRBA 3H06B 4U4XA 1XT8A 1OLAA 1AL3A 3LSFB 1B4HA 1H76A 5ISUA 3O6HA 2G29A 1DPPA 4EQBA 4F31B 3VVEA 1H45A 4MLQA 3PUVE 4LVQA 3IJOB 3KN3A 2FYIA 1QKBA 4OYVA 5L9OA 1D3KA 4RPOA 3K6XA 2Y7RA 4QRZA 1NMUA 2H25A 4R2BA 1B3LA 1URGA 3N6TA 3HV1A 4WEPA 4RY1A 4QFKA 3O97A 4F3PA 2FNCA 4PFUA 5JK4A 1M5EA 2DQVA 2XXXA 4QFPA 2DE4A 1YPNA 1JVYA 2VD2A 4EF2A 1P99A 4FAJA 5L9MA 4U23A 3CVGA 2RINA 3RNNA 3CSBA 1FQDA 2CZLA 4TLMB 4F3GA 1MS7A 2XX7A 3IOVA 2GH9A 1R9QA 3CIJA 2X7QA 3CG1A 3U93A 4ELOA 4U1ZA 5H8FB 2O1MA 3OSRA 4XTCQ 3MAMA 1NNPA 4LA9A 2F6GA 2QJEA 4EXKA 4H5GA 5CM6A 3EPEA 2O51A 4YKPA 2F5XA 4GFRA 1B05A 5CBRA 2CMOA 4IY5A 5DT6A 1MXWA 4GD5A 3TEPA 3AXFA 2OCUA 3BFUA 4X48A 3TCFA 4OWDA 2E1SA 3WAEA 2HFBA 3JZJA 4OFLA 3CSGA 1VSOA 3S4UA 1AOVA 1SW1A 4OVJA 4BDOA 3EQ1A 2YPNA 2W7YA 3QIMA 1M5DA 3IO4A 2QMWA 2O84X 1P1QA 4DZ1A 4RNSA 3QUFA 1SYHA 4OENA 3Q26A 3IB1A 1B46A 4GXSB 4TQUQ 1LAFE 4MH5A 2Q89A 2VOZA 4G68C 1TWYA 4ISUA 1NH7A 1BLFA 4YB7A 4ESWA 1Y3PA 4I62A 3OXNA 1GR2A 2IEEA 1JNFA 1JEUA 3PPNA 2ZNUA 3ZKLA 1ATGA 1B7HA 4Q0CA 2UXAA 1Q1KA 2P0SA 4DE8A 3LSXA 3IAZA 3SESA 5I56A 3FVKA 3U94A 4EDPA 1SVXB 4PETA 3FJ7A 3H03A 4LUBA 4DXCA 4PP0A 1BP5A 3S9LC 1Y3NA 4FEDA 1R6ZA 3RGYA 2OJTA 3K4UA 2HZKA 3MVZA 4JSDA 2ZYOA 1FQFA 1YTVA 3UK4A 2OK2A 3JV9A 1IUDA 4G8MA 3OMBA 4IY6A 4U1OA 4LATA 1JW4A 3UN6A 4IGRA 1VE4A 4R6YA 3K6VA 3FVNA 4WKMA 1Y9UA 1MH3A 2D5WA 1H44A 1B0HA 3K01A 5I59A 3MZBA 3FGSA 1S9TA 4THIA 2F97A 2DS9A 2OBGA 4DDDA 1MPBA 3M3FA 2O69A 4BDNA 2ZNSA 4IO7A 2DP8A 3QAXA 5HBCA 2HXWA 2NXOA 4JXIA 2RCAA 1EZPA 3C32A 2I4BA 4DXUA 3TODA 5DVFA 2Q2AA 3G3GA 3MC2A 1LAGE 1VFEA 1POTA 4OFJA 2VGQA 4H6DA 4JB7A 2ALUA 2O68A 2B65A 1F9BA 2Y7PA 3N26A 3RT8A 3FJMA 4E0XA 4IO6A 1EU8A 1N76A 3FUZA 3O6IA 3SEVA 4ECFA 2HAVA 3PMXA 2ZYMA 3B6TA 1WDNA 1EZOA 4KPTA 2XXIA 3T9VA 2NWJA 2Y7KA 4OFOA 4LQ5A 4FJPA 5FHMA 5A5XB 3PUYE 4G8NA 3KJ7A 4JSOA 3MQ9A 1GTKA 1Y4TA 1SW5A 3PGFA 1UIVA 1L5TA 4OEUA 5A5XA 4G77A 3S9EA 1FCKA 2D21A 4XIGQ 3K00A 3KSJA 4O3BA 1MDQA 1B1HA 2DOJA 3O6GA 1BIYA 1MY4A 4KR5A 4C1TA 2Z8DA 4U2RA 4HW8A 1J1NA 4DLDA 2ZYKA 1BKAA 3K6WA 1PBPA 2VHAA 5DEXB 5JTYB 3QUJA 3IR1A 4O3CA 2F34A 2D3IA 2FA7A 2XD2A 3IORA 3OD7A 1RYOA 1Z7ME 4ZE9A 3I5OA 2AL5A 5AA1A 3HHGA 4LZ5A 2REJA 3GBBA 5L8DA 1IXIA 3FVGA 2NVUB 2REGA 5DEXA 5JTYA 5CRYA 1S7YA 3CFZA 1QVSA 1OQGA 3EHTA 5LOMA 4GXAA 3K1NA 2LAOA 4MF3A 1JEVA 3RLFE 3W9VA 5KDTB 2GRVA 4KYDA 3TTNA 2HEUA 2QS2A 4RYAA 4XKPA 4ZDMA 5EYFA 1FW0A 3SDFA 1FTMA 1XVYA 3RN8A 5KDTA 2F7AA 1Y3QA 3ILUB 1USYH 1H3DA 3CI8A 4NWCA 2A5TB 2I4CA 1FQBA 2Q2CA 1JETA 3UA8A 4K3FA 4OHNA 3H6TA 2XXTA 4QF9A 5CMBA 4R74A 3FZVA 1M5CA 3RTFB 3UIFA 3T9HB 2XXQA 1B58A 3MBPA 2XXVA 2A5TA 2DE3A 4BDRA 1FTOA 4YB5A 4PFTA 3U72A 1MQDA 3D4CA 4ONYA 4NTLA 3M8UA 4JDFA 1Y1MA 4ZEKA 1QKAA 3T9XB 1OIBA 4OERA 1N04A 4KHZE 1SI0A 1N3XA 2QS4A 2XXRA 5HM4B 3IB2A 3W15C 1CB6A 2F8DA 1I6AA 3V83A 3KGCA 3VV5A 1AMFA 3DP4A 3I6VA 1LBBA 4F22A 3EHSA 1URSA 4X9TA 1SD3A 4F39A 3GXAA 5J1DA 4GVOA 3N94A 3U8QA 1B2HA 5ITOA 1UQWA 3OO6A 4F3BA 1USYE 2QSXA 4H0WA 3RY3A 3MPLA 3RUMA 1LGBC 3HPIA 4FEBA 1TFAA 5F1QA 3A3CA 3G3KA 3CR9A 1A7LA 2UYFA 1BTJA 5FHNA 4G68B 3U92A 2O7UA 3SEYA 5H8NB 1MPDA 2OZZA 2DWIA 5I2KA 4QSEA 2RF1A 1R1NA 3TTKA 4QHQA 1PDAA 4MBPA 1P1OA 3K6UA 4QFOA 3I3VA 2V3UA 4EQ7A 2I3VA 4G68A 2I49A 4P11A 4TOZA 5H8NA 1FTKA 2UVGA 1SQYA 1UTBB 2V25A 4DIGA 5AA3A 5ELVA 4OQOA 4FECA 2OLBA 3VLVA 2UVHA 4XKRA 1TXFA 2THIA 2Q88A 1LAXA 3TYHA 5FTHA 1GVCA 2HQ0A 3MVWA 3O29A 2O1LA 1SBPA 1HSLA 5IAIA 1UTBA 3ILTB 4DCXA 3TQLA 1SW4A 3O2AA 4P0GA 1MQJA 1B6HA 4Q5TA 2DWAA 5AA2B 1PBQA 2PT1A 4R2FA 1NNTA 1B3HA 3KFMA 3FD3A 2DXYA 2V84A 3R26A 5B7DA 5I56B 3FVOA 3S9NC 4LZ7A 3PD9A 4GQOA 2XXPA 3G3HA 3H6UA 2QS1A 4PQJA 3Q25A 3VVDA 4GRKA 4Q8RA 5AA2A 1D4NA 3DELB 5B70A 4IO5A 3VE1B 4IGTA 4GF8A 3E13X 3H6WA 2QMXA 1NNFA 5EHMA 1ZTYA 4ELPA 4FIMA 3PPQA 1RYXA 3MPKA 2X7PA 2DE2A 3C35A 4GLIA 1B3FA 3R6UA 1AH5A 1Z7NE 3RQTA 1IITA 3D4GA 1OVBA 1IEJA 3TTRA 1II5A 1I6BA 1LB8A 4F1UA 4F2OA 1IXCA 5I59B 2H9BA 3V5AA 2F7BA 1I69A 2ONSA 2F7CA 1URDA 1NKXA 4OESA 3MZ1A 3RPWA 2DVZA 3FJGA 2Y84A 3FXQA 3FASA 1MXUA 1ELJA 5H8SA 5KCJA 4ZEBA 1SI1A 1B32A 4QSCA 1I6QA 2GHBA 3MZ9A 1QUJA 1XC1A 2DSFA 3KBRA 1OVTA 1A55A 4H65A 1FTJA 3TCHA 2PVUA 4EUOA 1MG1A 3PUXE 4GOTA 3PMWA 3A3UA 5DVJA 1Y20A 5K2YA 4OTEA 4DXBA 4JWYA 2I3WA 1EH3A 2XD3A 5ICTA 3LSWA 3TKDA 4JBZA 3IK6B 3DLNA 3B7DA 2F6PA 1NH8A 4R72A 3V8XB 1MH4A 4X1BA 1B1XA 2GFEA 3UP9A 2ZXTA 1B3GA 1B3EA 2XXUA 4KCDA 4LONB 4ZZEA 4YKJA 3MP8A 4GL8A 4UACA 3DP8A 1MM7A 3LUYA 3PPPA 2Z8EA 3O66A 3WAFA 1MDP1 3FIRA 4GIZA 4EXLA 3H4ZA 2RCBA 1M5BA 3TTMA 4POWA 1MXZA 2H99A 4R6HA 4YICA 3KN8A 5I2NB 4HS7A 1ZU0A 1P1WA 1D9VA 3GBAA 1VR5A 1NFTA 1SYIA 4PE5B 4EQ9A 5H8QB 3FXUA 3KG2A 1PB9A 2ZNTA 1UTHB 3MUQA 4E0WA 2VP1A 1N7XA 3FXRA 4IO2A 4N6PA 4HTGA 2DXRA 1N84A 5I2NA 3H6VA 3KJTA 3QSLA 3C33A 3B6QA 3LSLA 4NF6B 3C9HA 2WKYA 3ECRA 2F36A 1WVJA 4YAHX 3SEUA 5H8QA 2PT2A 1MY2A 3G3FA 1PB8A 3T93B 2PMSA 5FHOA 4AQ4A 1UTHA 1MQGA 2I0CA 1MM6A 5CMCA 1A40A 3K1PA 4YZZA 4IO3A 2I6EA 4Z0IA 4C1UA 3KOTA 4NF6A 1Y4CA 3BKIB 4YKIA 2O7IA 1QULA 3M3LA 1B51A 1PEBA 3TAJA 2XX9A 2XX8A 3A09A 1Q35A 4F1YA 2YLNA 3MP6A 1IIWA 2Z22A 3OO8A 5M2VA 3QXMA 1P1UA 3HN0A 4RPNA 4ESXA 5K2XA 4X1DA 1A99A 5ITPA 2O6AA 3P7IA 4JWOA 1MY3A 3PUWE 1KWHA 4IB2A 2P2AA 3TZAA 4FATA 1O64A 1DOTA 1AIVA 2I0BA 4N07A 1ANFA 1B5IA 3E9XA 1N7WA 3IOTA 4L17A 2Z23A 4HCWA 4F18A 3UGWA 4R75A 4N13A 2P1SA 2I58A 4XKNA 4RK9A 1ZIUA 4KYEA 5EHSA 1JW1A 1R9LA 3MVYA 2OWSA 3F11A 4KCCA 1O7TA 3UORA 5AA4A 3TDJA 1LAHE 2Y7WA 3KOSA 2NUVA 1SDXA 4I9DA 2AL4A 1LB9A 1DPEA 3K0VA 2Q8JA 3V89B 1DMBA 3CG3A 4PFWA 4ELRA 4Z7EA 4OETA 1GV8A 2PX1A 1TFDA 4Q30B 3Q27A 1A8FA 4XXUA 2GHAA 1QW0A 3MJNA 2RC9A 4OZ9A 5ICQA 2H4IA 3OENA 1S50A 2HCAA 5I2KB 2DYXA 4NF8B 5JEIA 3S9MC 5I84A 5H8HB 5HPQA 3Q29A 4PFYA 2PYYA 3TPAA 1MRPA 4RJZA 1GGGA 1LBCA 3HHFA 4P0IA 3FV1A 4M4GA 1CE2A 3U1OA 4H67A 5DTBA 4NF8A 4QFLA 4YMBA 4H8IA 3W9WA 1ZMGA 5H8HA 4KQPA 4ZEFA 4F29A 1SW2A 1FQCA 1LCFA 4BDLA 1IQ7A 3QYTA 4ZE8A 3ZKKA 1MXVA 2ONKE 1ZBMA 4WXJA 4F3SA 3GLBA 1EZ9A 4RA1A 3G3IA 4LZ8A 5DYHA 2E0SA 5FTIA 2UVIA 3C34A 2Z8FA 4POXA 1QJMA 3T9UA 5H8FA 2HZLA 3Q28A 2R71A 3M3KA 2ABHA 2XHDA 3MVXA 3N6UA 1UIUA 1LSTA 3T96B 1NL5A 3CFLA 3OO7A 4R9GA 2H5YA 1B40A 4R6KA 3TCGA 5CI5A 4G2ZA 2DWJA 2F78A 5I57B 3DM0A 3OEMA 3LBSA 1JW5A 1OMPA 4ND9A 1B5JA 4MFIA 3L6GA 3O9PA 3SERA 4NE4A 3E4RA 3PPRA 5CMKA 2ONRA 1MXXA 4RXLA 3H3GA 5I57A 1B4ZA 4FE8A 1XOCA 1XVXA 3C4MA 4R9FA 4I8CA 2QL3A 1LCTA 4ZEIA 2B3BA 4OMBA 2ESNA 2B3FA 1N3WA 2DWHA 1FQAA 3PUZE 1IXHA 4OEVA 2H98A 2YJPA 4IO4A 1N0TA 1US4A 5KCJB 3S2VA 1FQEA 3KN7A 3PD8A 3C31A 3MWBA 3IOWA 4KFQA 4LQ2A 4BLAA 2VD3A 3O28A 3IX1A 4G4PA 1MQHA 4F1VA 2V3TA 4ZECA 1HSEA 3SETA 4H1XA 4H5FA 1LFGA 4QSDA 5DVIA 1MY1A 1VFDA 4F2QA 2M8CA 4YMAA 4ZEDA 4QFNA 1ZLQA 5L9SA 4UA8A 4JWXA 1B7UA 1H43A 5CMMA 1QUKA 2RKMA 4NF4B 1US5A 3USDA 3BBRA 3CFXA 2OWTA 4U22A 3FATA 1FTLA 5IKBA 2XXWA 3E3KA 3ZSFA 1B7ZA 3RTWB 3PU5A 3TQWA 3EHUA 1PB7A 4G8HA 3QK6A 1T0KA 1MQIA 4NF4A 3OO9A 1P1NA 1LLSA 1LFIA 4XKQA 3TTLA 4F19A 1ZKBA 3ONMA 1IXGA 4NMYA 3VLWA 2UVJA 3MW0A 4EF1A 3SEXA 3ODBA 3VFJA 3TELA 2BJJX 4FORA 3TUSA 3BFTA 2F35A 3OOAA 3G7WA 4HCYA 1OQHA 1PC3A 2DVCA 2Y7IA 1B5HA 5BUUA 2UYEA 1POY1 5CC2A 4KI0E 4BDQA 3DP6A 2Q9TA 1B9JA 4U21A 2ZMBA 4KD5A 3RT6B 1XHYA 2X26A 3L6HA 3PPOA 4ELQA 3K2DA 3KSXA 1QUIA 4NF5B 3PMVA 5BWJA 1TT1A 1YAEA 2RC7A 1OLCA 3C36A 3FV2A 5AE4A 1RKMA 4DCYA 4RK2A 5F7VA 4M1VA 3IO6A 4YB6A 3EF7A 4YKKA 1YCJA 2V93A 4TLLB 2NOOA 4NF5A 5AA2D 1A54A 2KLFA 4LP2B 3T22A 2AYSA 3MP1A 1D9YA 3LR1A 5TPAB 2QS3A 4NEDA 4R73A 1XS5A 4YU0A 1WODA 2ANJA 4AB5A 1JQFA 3VXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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