3FXUA

Crystal structure of tsar in complex with its effector p-toluenesulfonate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA03
3KSJA 4CDGA 5CVJA 4K2EA 3K2DA 4G68C 4LZ5A 5DEXB 2Q0OA 2H99A 1P1UA 2DOJA 2MH9A 2CQKA 3E3KA 3O28A 2OBPA 1S29A 2M87A 1XB4A 2A6HF 1LEBA 2XHDA 1N0TA 4O3MA 2KIUA 4U7BA 1ZLJA 3JSPA 1USYH 2F7AA 1IXCA 1JHHA 3B6QA 2DLLA 2HZLA 5K5QA 4EJTA 2OZ6A 3I64A 2VBYA 4AIKA 1Z6TA 2HCAA 3K6UA 3KLOA 2VE8A 5DEQA 3TO7A 4LJZF 2O7UA 2NNNA 4MEYF 2Y0MA 4F3BA 3SZTA 1W7PD 4UVCA 4WXHA 3KN8A 2M45A 4RB0A 5JTYA 1KU3A 4F19A 3FVOA 3ILTB 3PPNA 3KN3A 4ZECA 1NNPA 1XDSA 4X1BA 4OIRF 1SW1A 3JZJA 2F5XA 1YTVA 1IIWA 2ZYKA 4GCVA 5CYVA 1K7AA 3USDA 1B0HA 2NUVA 4L17A 3KFMA 4OHNA 5DTBA 2ZO4A 3MZ9A 4NEDA 4NMYA 3LQQA 2WTEA 4YB7A 2P5VA 3MUQA 4KI0E 2ZNZA 3KEQA 2D21A 2DSFA 2VBXA 1OIBA 5HLHA 2TDXA 1PDNC 5AONA 3V5AA 1MY0A 3F8BA 1H45A 2D5WA 4FATA 2E1SA 3FMRA 3FVGA 1NL5A 2BV6A 2CGPA 3KBRA 2DWAA 1NKXA 3FXRA 3KP3A 5F1QA 4R8HA 2D45A 3Q27A 4ZEDA 1OR7A 4EQQA 2EFWA 4UV8A 1SD7A 4H0WA 1A8FA 3U1DA 3H06B 1ZAOA 1WKMA 2UVHA 3CI8A 2KJCA 5H8HA 3TELA 2Y75A 1XGNA 4FX0A 3LR1A 3WGHA 2STTA 2R6GE 3G3GA 3LSXA 5LOMA 4RJZA 3IK6B 2HKXA 1KGSA 4Y13A 1PP7U 1GGGA 4BQAA 1GVCA 2Z33A 3K1PA 4OFOA 3ISPA 3OSRA 4KCCA 1K79A 2R7DA 4I9DA 1JHFA 4M9XA 3Q9SA 4PDKA 3E9XA 3ML6A 4DNCA 3S2VA 3A09A 5ILUA 4YICA 1R1UA 1Z7UA 2W57A 3OOAA 3UN6A 4NF6A 5K5OA 4LP2B 1A04A 4YMBA 1OYIA 1W4MA 2P5LC 4FECA 1R1TA 1FBQA 2IPQX 2A3SA 2AYSA 3CVGA 2HAUA 2H94A 5H20A 3V83A 4DXBA 3FXQA 4PGHA 2RVCA 4CGZA 2PBIA 1G4DA 2DWIA 4LK0F 4YKIA 3B02A 3E5XA 3RI4A 1B0LA 4JQFA 4BDMA 3COAC 4RK9A 5HLGA 3U8QA 5TPAA 3CFXA 4A5NA 4HX8A 1EH8A 3KCCA 4MFIA 3HOSA 2OK2A 1EU8A 2FA5A 5LHHA 4JBZA 4C1UA 2NRAC 3D4GA 5I57A 4IO7A 4EJVA 2X26A 3S9NC 2P7VB 4WCGA 2XXRA 3ILUB 4BDRA 2VT3A 3TCHA 4QFKA 2DTRA 3PUVE 5D5VB 1US4A 2X7PA 3KZGA 1YO5C 5DVFA 2GHBA 1LAFE 3N97A 1MM7A 4MQ9F 1H3DA 3F6VA 4LZ8A 5J6XA 2F8DA 5IAIA 4I0AA 1AWCA 2W7YA 3CG3A 4I01A 4GWOA 5FLXK 2A5YB 1EZOA 3PQJA 2DQVA 2BE5F 1U2WA 2VP1A 3PUWE 1R9LA 3DPTA 3KZZA 2M1BA 4YB5A 4LQ2A 2H5YA 3OEKA 3T9HB 4ELOA 3BPXA 1WVJA 1R23A 4UVAA 1M5CA 1I27A 1JW4A 1W5SA 2DQLA 5CMMA 2QM3A 4P0IA 3DFGA 2H6CA 3MPKA 2VOZA 3FD3A 4FJPA 5DEXA 2K86A 4F7ZA 2UVJA 2V93A 4R73A 2UXXA 3GYHX 5I58A 2EK5A 2ONSA 1QZYA 2CZLA 2NOOA 1B46A 2A69F 2QSXA 1P1QA 2FNCA 4O3CA 3GZ5A 4U1ZA 5BUUA 3BBRA 2CW0F 4B8XA 1Q1HA 4HQMA 3ZMUA 3PUYE 2M5WA 4NWCA 4U0WA 4O3AA 2AIXA 1O63A 1DPUA 2I3VA 4OIQF 4GYIA 2QPQA 4U0YA 1UTBB 3HCQA 2D2WA 3TUSA 5FD6A 1OQHA 3O97A 4XBFA 2AL5A 1T98A 3GO5A 3ZKLA 4GRKA 3WTXC 1ZRCA 2E1CA 2XXXA 1T6SA 1BIYA 1KYZA 4RS8A 2UVGA 4WWCA 3G3IA 2GIVA 2XROA 2ZMEB 4KIFA 1POY1 2FNPA 4EGYA 2QUFA 1ZMGA 3IKVA 1KU2A 4TV7A 2PLYA 2BEOA 4BDNA 1OYWA 3F8FA 1P2FA 4KN7X 1URDA 2IEEA 1D8KA 2Y7RA 1SD3A 5K1YA 4EF2A 2JZYA 2ZNTA 3F8MA 1MXUA 4BDLA 2HQRA 4YG2F 4I0BA 3B6WA 4HQEA 4IHTA 3RUMA 3PD8A 1Y0UA 1I6AA 4LQ5A 5H6RA 5F7VA 1FZPB 1RUNA 2L54A 2DK5A 2EA2A 4F3SA 4HF0A 4DCYA 4G6DA 2DXRA 3HTSB 4QFOA 2DS9A 2QBYA 3BWGA 1SFEA 3E5QA 5D6FA 3JW4A 1DDNA 3E6CC 1LAXA 1MD0A 3E3VA 5L3FA 3G3HA 5ICTA 1O64A 1LB9A 3N94A 5DT6A 2V1DA 4RB1A 2RQPA 4O3BA 4RB2C 1FNNA 1BI1A 5CVRA 4QLCU 2I0BA 3QPTA 5AA3A 3EF7A 3TAJA 5KCJB 4UHTA 2OD5A 1R9QA 2FYIA 4ZE9A 4F3PA 3MEXA 2QENA 3K1MA 1MPCA 1A54A 1D4NA 4Q5SF 3OSQA 1D3KA 2QMWA 2GA2A 2AXLA 3O6IA 3ZPLA 4THIA 4N9HA 1G3WA 2XAFA 2F5EA 1B1XA 1EH3A 1OVBA 2PBWA 2ZNSA 3R0JA 1YS7A 1VFDA 4KHZE 4WXJA 2I48A 2L3DA 3FV2A 3OXNA 2YU3A 3Q5FA 1R00A 4L9TA 5IT3A 2VOOA 1B1HA 1J7KA 3V89B 4ZE8A 2CYYA 3KP4A 2GQQA 2MLGA 5L3BA 2O8XA 4X1DA 4PGGA 5AA1A 5TJJA 3T0YA 5CLSA 1FQEA 1FSHA 2HZTA 2EFQA 4A6EA 4ENJA 3MQ0A 1G3SA 3EUHA 5ERIA 1MXZA 4Q48A 3VFJA 2HWVA 1XOCA 4P55A 3C31A 4LLNA 2NXOA 3H3GA 3MP8A 4H65A 4OWDA 2Z23A 3KLNA 3ZN1A 2DWJA 4YU0A 2UYFA 5DD8A 1KQ8A 1SMYF 1LSTA 4CZZA 3LBSA 3VVDA 2DK8A 1IF1A 4YMAA 3SETA 4KIBA 2YX4A 3T93B 4IO2A 2OQGA 3EYYA 4GO1A 4KYWA 5CBSA 5ICFA 1TFAA 5FLXZ 3TCFA 3GLXA 4H5FA 1LFGA 3U1OA 3MBPA 3FM3A 4U2RA 1QPMA 4I09A 4NF4B 4DIGA 4GL8A 4KIGA 4A2UA 5D4RA 1LBCA 3W6JB 4L9JA 3K69A 2FBIA 1QO0D 4P9UA 4I7HA 3BJOA 2QS2A 2G9WA 3I54A 4ELPA 1WQ2A 2XV4S 3DV8A 5H8QB 1B7ZA 1F4KA 4AVPA 2ZXTA 3ONMA 3R0AA 4ZYDA 2GXBA 2F36A 3QP5A 3PMXA 4LVQA 5EHMA 2L02A 5D5XB 3AXFA 3TEPA 4HLYA 3G7WA 3PFIA 4A0YA 1SW2A 2AL4A 4JK1X 1R36A 2GAUA 1E2XA 1Z6RA 1S7YA 2EB7A 2O69A 4ZDMA 2XXIA 2IVMA 2CWEA 1A40A 2IA1A 3TTKA 1SAXA 2A61A 3ULQB 3MC2A 2OJTA 1SYIA 4WXDA 2DVZA 1QUJA 2X7QA 4NWDA 4U4SA 3O3KA 3O66A 2V3TA 2L4AA 4FE8A 4MNUA 2A07F 4G8MA 4RGRA 2REJA 4EUOA 5HS7A 2LAOA 4AD9A 2MLKA 3WODF 1AL3A 5DCMA 3F6OA 5I59B 4Y17A 1D9VA 4CXFA 1BJAA 2DFIA 1MGTA 3FHZA 3NEUA 3H6UA 3LUYA 4H8IA 3BJAA 3JTGA 1NNTA 4FEBA 3ECRA 3DP4A 2HYGD 4I62A 4M72A 1YW8A 3RT6B 3BROA 5LBQA 4GXSB 5A5XB 4R6YA 2XVCA 3M8UA 2ETHA 5FTHA 1MKMA 1B3GA 4EQ9A 4IJAA 3K01A 1MDMB 2ZMEA 2IJLA 3FJMA 5KDTA 3IOVA 4G8HA 4OERA 4U7DA 1R5GA 1ZN2A 4F31B 3LA7A 3RTWB 4XSXF 3WTVC 1P1NA 3R6SA 3LAPA 2FA7A 2V6CA 1B3EA 4OMYA 2H6BA 1UTHB 3FIRA 4EVIA 2HXWA 4GD5A 5A2QZ 1JGSA 1JVYA 1TT1A 3IKTA 4QSEA 5KK1A 3L2CA 2MA3A 2RC7A 1IUDA 3WTZA 2G29A 3ECHA 3FMQA 2P7CB 4LGWA 1LGBC 3PUZE 4CO8A 1ZRDA 4KYDA 1LNWA 4ONYA 1B05A 4F18A 3WE2A 4MEXF 2V9VA 4WF2A 5H8SA 4BHCA 5FHNA 4P96A 2RF1A 3JYRA 3L6GA 4LATA 3RGYA 3DM0A 5D8KB 5JVTA 2XUBA 3A3UA 3LSFB 3BDDA 2MC3A 1Y1MA 2BGCA 5J8FA 3TODA 1P1WA 2J5OA 5ED4A 2YPNA 3C1DA 3WTYC 2KRFA 1J59A 4ZYHA 4ZYGA 4Q47A 4F1UA 2M8CA 3QOPA 3EHSA 2OA4A 1X3UA 3IJOB 4HV6A 3CUOA 2L4MA 1O3SA 3PV0E 2Q88A 5KCJA 4HDUA 4OXVA 4QRZA 1QUIA 3C9HA 4AB5A 3R6UA 5H6QA 4U4XA 3K1NA 5L9OA 3VLUA 5ITOA 1MZBA 1US5A 2F7BA 4EJWA 4L0YB 3TPAA 1BLFA 4YKPA 1DPEA 1J9IA 5ICQA 4EXLA 4Q0CA 3V8JA 2ZYOA 1FQCA 2K02A 3WTUC 4R6KA 1TFDA 5DCFA 2PT1A 1XSDA 4N07A 3ABUA 1BOAA 5FGMA 3K6WA 3FXUA 3V8KA 3HHFA 2DO7A 3IR1A 3PD9A 3TGNA 2QQ9A 4MTEA 3QPHA 3Q9VA 2Q2AA 1Y3NA 3H03A 4LLLA 1PBPA 3RLFE 5ISUA 1XDUA 3N6TA 3CJNA 1R1VA 3TTRA 2Z3YA 1LFIA 1B4AA 3HTUA 1FX7A 1N3XA 4P9FA 1D8JA 3PMWA 1LLSA 1FP1D 1IXRC 1B2HA 4PP0A 3GVAA 4KUMA 1JXSA 3M8FA 5B70A 1FLIA 3KP5A 5EEGA 2F6GA 3KOSA 3OEMA 2UWMA 3R7XA 1RYOA 2LF7A 2Z5UA 1B3HA 3M7GA 2PQ8A 4G94A 4GLIA 5I2NB 3FJGA 1WWXA 3WGIA 4NTLA 1QZZA 3C36A 1NNFA 4EQBA 3RPUA 5J8CA 3T9VA 1SFUA 5LGTA 4NF8B 2I4CA 2F2EA 3NQOA 1ZIUA 2H4IA 2DPDA 4AB6A 4HS7A 3MVZA 1IN8A 2XXPA 4NF4A 5AIPA 2FEZA 5LRSA 3MZYA 2UZKA 1QBJA 1B3LA 3M3FA 3KETA 5H8QA 1QGPA 2X0LA 1OKRA 4XTCQ 4IRIA 2DE3A 4PQJA 4OVJA 4DDDA 2I58A 3VVFA 2HTSA 4ON0A 1G3TA 3HHGA 1MH3A 3FUZA 3Q28A 4OFJA 3C34A 3G3FA 4AIJA 4NF5B 1LAGE 4R75A 1HW1A 3CO7C 1AMFA 4U21A 5JEIA 3WU1B 4YAHX 4I8CA 1PB7A 1FOKA 1ZREA 3HSEA 3EHTA 3PQKA 4IVNA 5CBRA 1EH7A 3I53A 2QL3A 5E17F 3Q26A 4WK8F 3QSLA 5AA4A 2RCBA 1QJMA 2VC1A 4L5JA 2F5DA 2HEUA 1IN4A 2QVOA 4MF3A 5I59A 4HF2A 2VN2A 4IO6A 2XKPA 3M1EA 1OPCA 4HX4A 4KFCA 3D5LA 3M3KA 4YFNF 3I5UA 3FASA 5A5XA 2XD2A 2HQNA 3RDIA 2PMSA 3EN3A 4NQWA 3IO4A 3TTNA 3V8LA 1B7HA 3BJ6A 1BBYA 2GA1A 1MDMA 3PPRA 1TQPA 2B0LA 1SI1A 5CJ9A 1N04A 3P7NA 3KN7A 2Z8DA 4JSDA 1TTYA 3CSBA 4DQ2A 3IRRA 1I6QA 3V7SA 2VONA 1L0OC 1DTZA 1UTHA 1B58A 4BHPA 1IXSB 2J5PA 2P8TA 4ZYEA 4C1TA 3QAXA 2B65A 4CYDA 4BAYA 1IN7A 3MW0A 4OFLA 2FU4A 3FMSA 3BFTA 2XXTA 3OD7A 4FEDA 1HQCA 4QWQA 2O68A 1TLHB 3H92A 5H8NB 2XAHA 1U5TB 3OV8A 2QQBA 3VVEA 2GWRA 4LONB 4L9NA 1XT8A 1NMUA 3GLBA 4QF9A 5ICGA 3RIRA 2I49A 1CF7B 1JE8A 1LDJA 1ZLQA 3M3LA 4EM0B 5I56B 3CUQA 2A6EF 3HRUA 1H0MA 1OVTA 1HSTA 4F39A 5HM4B 2RCAA 3IOUA 3RY3A 4E0WA 3SEUA 2DE2A 1XHYA 1ATGA 4IGTA 4BYYA 1L3LA 4UV9A 4F22A 4E70A 2HR3A 3J81Z 2UVIA 1A7LA 2KJBA 1P4XA 4HAMA 2RNJA 1CGPA 1MQDA 1Z91A 2G7HA 4TLLB 3DP7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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