2DWHA

Crystal structure of n-acetylglucosamine complex of bovine lactoferrin c-lobe at 2.8 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of N-acetylglucosamine complex of bovine lactoferrin C-lobe at 2.8 A resolution
rcsb
total genus 108
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwhA02
2ALUA 3H7MA 4ELPA 1LBBA 2PVUA 4F3SA 1B51A 3WAEA 3MJNA 4F1VA 1ATGA 4E0WA 2B3FA 2GH9A 3RT8A 2QS3A 3PPPA 3TCFA 2DE2A 1B40A 4QSCA 3VLVA 3KG2A 3T9VA 4KR5A 3F11A 3VXBA 4XKNA 3E9XA 3HN0A 3BFTA 5EYFA 2ZNUA 4H1XA 2DVCA 3H6VA 4Q8RA 5KZTA 1Y1MA 2HAVA 4BDMA 3MW0A 3T22A 3FJMA 2RC8A 4NWCA 3PD8A 3IX1A 2XX8A 1DTZA 1Q35A 1I69A 5AA3A 3TYHA 3R6UA 1MRPA 3W15C 2DE3A 4HTGA 1B4HA 1IXIA 2AL4A 3JZJA 1NNFA 2E1SA 1XOCA 2ZYKA 1M5BA 5AA2B 4U1ZA 3N5LA 3C32A 3UGWA 3PPNA 3EF7A 1UIVA 1OQHA 3UIFA 3IOTA 4GQOA 2R71A 4R9FA 2X7QA 3OMBA 2XXHA 3PUWE 2LAOA 3G3FA 3TTKA 5BWJA 1SVXB 3K0VA 4QFOA 4GXAA 1KWHA 4RYAA 4IY6A 5JTYA 2UVHA 4OTEA 4Z0IA 1JEUA 1IXGA 1LB9A 4H0WA 2FA7A 1NH8A 1IUDA 3OO6A 3MVYA 1SW1A 3D4GA 4PP0A 3HHGA 4YB5A 3ECRA 3VVEA 4ZE8A 4RJZA 4MFIA 4H6DA 1ZMGA 3OO9A 2O7IA 3PMXA 3I5OA 4PFYA 4G68A 4DIGA 3TUSA 3EPEA 2QJEA 4X1DA 3GBAA 1P1UA 3IJOB 4YU0A 3T96B 4U22A 3CI8A 3V89B 2P1SA 1WDNA 1A99A 1FTMA 4YB7A 2CZLA 3M3LA 1AMFA 4F18A 1SD3A 4RPOA 2HFBA 1TT1A 4RA1A 5B7DA 1H43A 4ZEBA 3T9XB 1YCJA 3MUQA 5DVIA 1IITA 4C0RA 2F78A 1PB8A 3I3VA 5FTHA 2E0SA 2ABHA 4H65A 4ZEFA 2NVUB 4U2RA 3TKDA 4LUBA 2F35A 2ZNSA 3O66A 3AXFA 2DE4A 4MF3A 3S9EA 4F2OA 1A8FA 4YKPA 3D4CA 3U72A 4M1VA 4OQOA 1YTVA 3QAXA 3FUZA 1M5DA 2F97A 2X26A 2ZNTA 5JEIA 4I9DA 1B52A 4NEDA 5FHNA 3TCHA 4F3BA 1B32A 1I6AA 2H25A 1B7HA 5CC2A 2ONKE 1HSEA 3UORA 3UN6A 2VGQA 3EHSA 4O3BA 4OZ9A 4HCWA 4X9TA 4EXLA 3C31A 1EZ9A 2DXYA 1LFHA 1D9VA 3L6HA 1SBPA 4QF9A 5I84A 4JDFA 4ZEKA 2XXQA 2GHBA 4KQPA 5I57B 1MQDA 3JV9A 5H8QA 1ZJLA 3L6GA 4JWXA 3USDA 5AA2D 1NNTA 3FXUA 4XTCQ 4EF1A 3H6TA 4EUOA 4BLAA 4OETA 1HSJA 3KZGA 4I62A 4JWOA 4U21A 1JW1A 3OO7A 4BDLA 1NKXA 3M8UA 2DYXA 2I49A 4OEVA 4R6YA 3QSLA 4FAJA 3TELA 3ZKLA 4PQJA 4EDPA 3ONMA 1A7LA 1B3GA 2DVZA 5H8HA 3LUYA 2Q2CA 2P2AA 1QVSA 2O69A 1IXHA 4BDRA 1FTOA 3FXQA 1BTJA 4KYDA 3RPWA 3TFLA 3PUXE 3U92A 4OYVA 4EQ7A 4NF5B 4Q30B 2D5WA 2F5XA 4F3PA 3TQWA 4F1YA 4GIZA 1TFAA 1RKMA 5K2YA 1F9BA 2O7UA 4RNSA 2ONSA 2ZXTA 3A3CA 2DWAA 5ICTA 1B3EA 3TODA 2IEEA 3IAZA 4PFTA 3CR9A 3K6UA 5BUUA 4LZ7A 3DM0A 4PETA 1BKAA 4ECFA 2Q8JA 3CFLA 3EHUA 5M2VA 1ZU0A 1ZTYA 4EF2A 4FEBA 1MPCA 1XHYA 4HS7A 2RF1A 2Y7PA 3O28A 1NMUA 2A5TA 1MY3A 3KOSA 1BP5A 1XVYA 3U8QA 4NF8B 3DP4A 1FQDA 4DZ1A 1OVBA 2DSFA 3PUYE 1MXVA 3KJTA 1EZOA 3TQLA 3RN8A 3RLFE 4EQBA 4QFKA 1S50A 5CRYA 1MH4A 4TLLB 2ZYMA 1H44A 5DVJA 3S9LC 2RINA 1LFIA 3Q27A 3RNNA 4RK9A 3K6WA 2UXAA 1OQGA 1FTLA 3OXNA 3HCQA 2RC9A 1PBPA 1B1XA 3N6TA 1AH5A 5I58A 2R9JA 3O6IA 4G2ZA 3U93A 1AIVA 3PMWA 2DOJA 4NTLA 5HPQA 3G7WA 1VFDA 2X7PA 5KDTA 2OLBA 4GLIA 1MXWA 1ANFA 2QL3A 3TTMA 2XXUA 4FORA 4ZE9A 2F7BA 3CG1A 5TPAA 2M8CA 2F8DA 1WVJA 2Z22A 3T9HB 4WXJA 3HV1A 1N0TA 1Q1KA 2XXIA 5ITOA 4F31B 3HO7A 3FD3A 5CMMA 3MVZA 3GXAA 2O1MA 2QS4A 3TTRA 1Y3QA 1N76A 2BJJX 1TWYA 3FJGA 2RCBA 1JW4A 3UK4A 4WEDA 2F7CA 3CVGA 3H4ZA 4RPNA 3O2AA 3VV5A 4EQ9A 3KOTA 4YKJA 3N94A 4R9GA 1EZPA 4XXUA 4R75A 1FQEA 3MWBA 4KCCA 2XXYA 2OJTA 4LVQA 2I48A 3FZVA 3E3KA 3IO4A 4R6KA 4IO4A 1DPPA 1IEJA 1MY2A 3DLNA 4GRKA 1LLSA 1O7TA 4N13A 5JK4A 2I3WA 3WAFA 1MXXA 3KBRA 1ZIUA 1LGBC 4NF4B 2OCUA 2B3BA 4IGTA 5DT6A 3BKIB 3B6TA 1MDP1 4KYEA 4Q5TA 3TAJA 4G8MA 1SI1A 4DXCA 2V93A 2H99A 1LCFA 3B7DA 4BDQA 3HHFA 2OWSA 3KN3A 5I57A 5K2XA 4YICA 5L9SA 4OFOA 1MDQA 4YMAA 1MS7A 3VXCA 3LBSA 1Y9UA 4GOTA 3OENA 2DQVA 3R26A 4DXBA 3O97A 5I2NB 2NXOA 4JWYA 1QUIA 1DTGA 1Y4TA 1YAEA 3RGYA 3OD7A 1XT8A 1UIUA 1MM6A 2P0SA 4R2BA 2VD2A 3N6UA 3FVGA 4OHNA 1P1NA 4F29A 2AYSA 3PU5A 3QYTA 5CI5A 1DOTA 2V3UA 3FJ7A 4JBZA 4E0XA 3VFJA 4AQ4A 3GZGA 1ZKBA 2RC7A 2HAUA 1PDAA 1OIBA 2I4CA 1B0HA 4G4PA 3K1NA 2UYFA 2FNCA 1WODA 2V3QA 1R6ZA 4ESXA 1Y20A 4NF5A 4FECA 4KYSA 5DEXB 1GTKA 2ZYNA 2I4BA 4POWA 4R74A 1GGGA 3RUMA 4JB7A 4ZEIA 4OMBA 4OERA 2NOOA 4PFUA 4X48A 3C34A 2O84X 1Y1ZA 3MZ9A 2I6EA 2ONRA 4NMYA 4R72A 3KJ7A 1QKBA 4P0IA 1A8EA 4QRZA 1N7XA 4MLVA 3U94A 3GLBA 4WEPA 4HCYA 5FHOA 3FXRA 1LAHE 3TMGA 4QFLA 2Y7IA 4ND9A 5FHMA 4F3GA 2CMOA 3LSLA 4OWDA 3CSBA 4GWOA 3S9MC 3MVXA 3FGSA 2Z8EA 1R1NA 2Y7KA 1DPEA 4NF6B 5H8NA 4AB5A 1S9TA 1I6QA 1FQAA 2F36A 4LQ5A 5I59B 3PUVE 3IL1B 2PBWA 5KCJA 5IKBA 2Y84A 4ZECA 1UQWA 4KD5A 1USYH 1M5CA 4AB6A 1QW0A 1B7UA 4R6HA 4YZZA 2UVIA 2V25A 1MY1A 1URDA 4PE5B 4H8IA 1MQHA 4YMBA 5IAIA 3SETA 3V5AA 1P99A 2DWJA 2I58A 1H76A 3SDFA 3KN8A 1LFGA 1T0KA 4MH5A 4EXKA 2QRYA 3P7IA 3O6HA 4F2QA 2IA4A 1DMBA 3O9PA 2PMSA 3MQ9A 3MP1A 2R6GE 2VOZA 3HPIA 4M4GA 3KFMA 5F1QA 1UTHB 3DP6A 2Q9TA 3IORA 3OEMA 1PC3A 4P0GA 2O1LA 1LAGE 5JTYB 1N84A 4ZDMA 1YPNA 1UTBB 5I56B 1MXZA 2NWJA 4TQUQ 2XHDA 3H06B 3O6GA 4IGRA 1LBCA 1D3KA 4ONYA 1A40A 1JETA 4FIMA 5TP9B 1ZLQA 4Q0CA 2H98A 2XXWA 4UACA 3E13X 1PB9A 2F34A 1B5HA 2O51A 3H3GA 3LSWA 3Q29A 4DE8A 1SI0A 5EHSA 3C35A 3H03A 3VLWA 4QHQA 2O68A 1NL5A 3TTLA 3M3FA 1LSTA 3Q28A 2GHAA 4G8NA 1D4NA 1IXCA 3S9NC 2GFEA 4YKIA 1BIYA 3V83A 4XKQA 5L9MA 3RT6B 3LR1A 5DTBA 2Q2AA 3K1MA 3IB2A 3QUFA 5H8FB 5HBCA 1XC1A 3LSXA 1B9JA 1M5EA 3CRBA 1IQ7A 3GBBA 4UA8A 1SW4A 4HW8A 4NF4A 1JW5A 4H5GA 3RY3A 1II5A 2HZKA 3BFUA 3PPOA 3S4UA 5AA2A 2QPQA 1B5JA 3CIJA 3S2VA 1AOVA 3Q26A 5ELVA 4XKRA 1Y3NA 1L5TA 1MY4A 4QFNA 3T66A 5ITPA 3BBRA 2NUVA 3OOAA 2ZMBA 1MXYA 1AL3A 3G3JA 4I8CA 5I2NA 2DS9A 4OESA 1OMPA 3FATA 3SERA 1MH3A 5AA4B 1SDXA 3QUJA 5H8QB 1NH7A 5CMCA 2XXRA 1QKAA 4N07A 4I1DA 1N3XA 3KN7A 4RY1A 2XXPA 3C36A 3THIA 2B65A 3CG3A 3G3GA 5LOMA 2F6GA 2I0CA 3OSRA 3SEUA 3FVNA 3FV2A 5AA1A 3FIRA 5L8DA 5A5XB 2HQ0A 3K2DA 5DEXA 4LQ2A 3TDJA 2PT2A 3UA8A 4U23A 2QSXA 3SEVA 3CFZA 1LB8A 3IB0A 2W7YA 4F39A 2OZZA 2YJPA 4IB2A 3EN3A 1FQBA 3K01A 4FATA 5L9OA 1POY1 1B5IA 4FEDA 5AE4A 3I6VA 3PUZE 4OVJA 3SESA 4N6PA 2Z8FA 1EU8A 5ICQA 4X1BA 1B7ZA 4H8JA 2WKYA 1GR2A 3H6UA 1OLCA 3RTFB 2YPNA 1CB6A 1EH3A 4IO2A 4OEUA 3ZKKA 4JSOA 1RYOA 5CMBA 4NF6A 4IO5A 3IR1A 1B58A 4THIA 1A54A 1O63A 1Y4CA 3PPQA 1LAXA 3K02A 1B0LA 3QXMA 4ZZEA 4OFJA 5I59A 3MZ1A 4ELQA 2A5TB 3C33A 3MPLA 2XX9A 4ISUA 1FQCA 3DP8A 3DELB 2F7AA 2Q89A 3W9WA 2UVJA 3MPKA 2AL5A 3K6XA 3OO8A 4GFRA 1MQJA 1B2HA 1R9LA 3G3KA 3QIMA 1A55A 4GL8A 4TOZA 3TZAA 4YAHX 2RKMA 1LAFE 2PYYA 1JVXA 4PFWA 3M3KA 3PV0E 5DVFA 5FTIA 4GD5A 2XX7A 1SYIA 2Y7WA 3VDFA 3E4RA 3K00A 2DWIA 1B3HA 1B6HA 2H9BA 1MM7A 1UTHA 3IK6B 3KEIA 1O64A 3MAMA 2V3TA 3LC8A 3R7XA 5I2KB 4ZS9A 3HSTA 5EHMA 1BLFA 3MP6A 1UTBA 5I56A 3KSXA 5I58B 3MVWA 5TU0A 1FQFA 4P11A 1LCTA 3SEYA 3Q25A 4LZ8A 4LP2B 3B6QA 2UYEA 4LONB 1QULA 5B70A 5KDTB 3PPRA 4O3AA 4R2FA 2H4IA 2DP8A 5F7VA 3T93B 3MZBA 1JNFA 5TP9A 4BDOA 1RYXA 1B1HA 5TPAB 4DXUA 3TEPA 2REGA 1N3WA 3KGCA 3O29A 4FE8A 3IOVA 4QSEA 3IOWA 1M5FA 4IO7A 3CFXA 3OEKA 1N04A 4ZEDA 1FTJA 3K6VA 1POTA 4H5FA 4F19A 2UVGA 4U4XA 1TXFA 1Z7NE 4F1UA 1P1OA 2DWHA 4XIGQ 4G8HA 1B3LA 5H8FA 1Z7ME 1MXUA 4IO3A 4DLDA 4IO6A 1SQYA 1MY0A 1CE2A 4DDDA 4KCDA 2XD3A 2QS2A 4NF8A 4C1TA 4GXSB 2XXXA 3ILTB 1QUJA 1H3DA 1MPBA 1NNPA 2XXTA 1FW0A 2FYIA 3PD9A 5CBRA 2A5SA 4LZ5A 4YB6A 1VFEA 1MG1A 2PX1A 3QK6A 2Z8DA 4JXIA 3VVFA 1QUKA 1D9YA 1J1NA 4DCYA 4JSDA 1B46A 1GVCA 3VLUA 4U4SA 3B6WA 3A09A 3C9HA 2Y7RA 1URGA 5AA4A 2V84A 1H45A 2VD3A 1JVYA 4NWDA 4KHZE 4QSDA 1P1WA 1B05A 2REJA 4ELRA 2I3VA 2O6AA 3IB1A 4GVOA 1XS5A 1XVXA 1N7WA 4L17A 3IOUA 4OENA 1B3FA 2YLNA 3IJXB 5A5XA 4DCXA 1Y3PA 1SW5A 3IO6A 1NNKA 5ISUA 1QJMA 2THIA 4QFPA 4NE4A 3V8XB 5HM4B 2PT1A 2XXVA 1VSOA 3FV1A 3PMVA 4G68B 1OLAA 3N26A 3MP8A 3K1PA 2HEUA 3K4UA 3KSJA 3U1OA 1ZBMA 1PBQA 4Z7EA 1NFTA 2HCAA 4MLQA 3H6WA 5H8SA 4RXLA 1USYE 2HXWA 3SEXA 3T9UA 1MQIA 4R73A 1P1QA 4O3CA 2AIXA 2OBGA 2HZLA 1OVTA 2H5YA 3EHTA 4LATA 3G3HA 2Q88A 1DSNA 5CBSA 5CMKA 1TFDA 1VR5A 4FJPA 3W9VA 2G29A 3PGFA 5DYHA 2Z23A 3TTNA 1ELJA 3ILUB 3JYRA 3SEWA 3UP9A 4IY5A 4GF8A 1MQGA 3FVKA 5J1DA 3ZSFA 4U1OA 3MBPA 2I0BA 5H8NB 2QMXA 4G77A 3G3IA 3ODBA 4LA9A 1US5A 4YKKA 3C4MA 4KPTA 2DXRA 3RTWB 5KCJB 4BDNA 3VE1B 2VP1A 4TLMB 3OSQA 4F22A 1B4ZA 1S7YA 1IZ1A 3ZS6A 1FTKA 4OFLA 3MC2A 1SYHA 1URSA 3LSFB 3EQ1A 1FCKA 3TPAA 4ELOA 1HSLA 2KLFA 4C1UA 4H67A 1US4A 1IIWA 1MPDA 2VHAA 1VE4A 4MBPA 2QS1A 1PB7A 5I2KA 4ESWA 4RK2A 2F6PA 4KFQA 4GL0A 3VVDA 4KI0E 1JEVA 1SW2A 3FASA 1PEBA 2OWTA 4ZZAA 2G93A 4XKPA 2D3IA 2ESNA 2GRVA 1R9QA 3FVOA 3A3UA 2RCAA 4POXA 2ZYOA 3CSGA 3RQTA 4WKMA 2D21A 5H8HB 3OELA 2ANJA 4OXVA 1I6BA 3TCGA 5CM6A 1JQFA 2XD2A 2QMWA 3SKPA 4K3FA 2OK2A 4G68C 1GV8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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