2DWHA

Crystal structure of n-acetylglucosamine complex of bovine lactoferrin c-lobe at 2.8 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of N-acetylglucosamine complex of bovine lactoferrin C-lobe at 2.8 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 108
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwhA02
3RY3A 2QS2A 3ONMA 4JWXA 2DOJA 1JW5A 1SDXA 3I3VA 1N76A 1MPCA 3OSQA 5L9OA 3V89B 3RN8A 2NVUB 3VLUA 2YLNA 2Z22A 1B52A 3TODA 2QMWA 3LBSA 2I3VA 4RXLA 4R9FA 3OSRA 4GRKA 1LCFA 4OYVA 5M2VA 3ZKLA 5I2KB 2F5XA 3O9PA 2G93A 3KOTA 3TTRA 5I56B 1B2HA 4DZ1A 4KYDA 1B32A 1O7TA 1VE4A 3ZSFA 3MPKA 4Q5TA 1F9BA 2A5TA 4R6YA 4O3AA 3QYTA 4TLLB 5FHOA 5I59A 4I1DA 3E4RA 1KWHA 4FIMA 4TOZA 4UACA 4QSCA 3MVXA 1LAXA 5ITPA 5I58A 3PPPA 3OENA 2XXIA 1B4HA 5CMCA 4ZS9A 2QMXA 5DTBA 1FQCA 4AB5A 1Z7ME 1B58A 5TPAA 4NF8A 1LCTA 1B0HA 4HCYA 4GL8A 1MDQA 2QS3A 3IOTA 4NF5A 1ZLQA 1ZKBA 1SQYA 3U1OA 3LSLA 3OO6A 2O7UA 4N13A 1BLFA 2UYFA 4KCDA 1OVTA 4HTGA 1II5A 4I62A 1SW1A 4DXCA 3R26A 4F1YA 3GLBA 3RUMA 4ZEIA 2AIXA 5H8SA 4O3CA 1J1NA 2OWTA 1HSJA 4ELQA 4ZECA 3FVKA 2AL4A 4M1VA 4XKNA 2RC9A 5IAIA 4F2QA 2HFBA 3K00A 4F39A 3KZGA 1MS7A 4R75A 5I57A 5BWJA 1IUDA 1FQFA 1YCJA 5DVJA 3H7MA 4KI0E 1A8EA 4PFYA 3C34A 2Z8FA 1A40A 4F18A 4F1VA 2RC8A 1P1QA 3T9HB 1JVXA 1GR2A 2FNCA 3C35A 3FIRA 1M5BA 2X7QA 3MP8A 4AQ4A 4WEPA 2REGA 4DXUA 5L9SA 3SERA 4H6DA 1P1OA 3P7IA 4KQPA 3K6UA 1LFGA 3MQ9A 3K1PA 4EUOA 2XXHA 1WODA 1PBPA 4P0GA 4R74A 2ZYOA 3I6VA 1M5DA 4FJPA 4EQ7A 5KDTB 3UGWA 3K02A 1A99A 4AB6A 5HPQA 2YJPA 1ZBMA 3A3UA 5DEXB 1EH3A 1S7YA 4G4PA 3K6XA 2RF1A 2QL3A 4DCYA 5I2KA 1MY0A 5AA1A 1M5FA 5I56A 4YMBA 2D21A 4N6PA 1AH5A 1DPEA 4YKJA 3K2DA 3C9HA 1MG1A 3A3CA 1URSA 3A09A 1UTBA 5FTHA 1NH8A 4PP0A 1OLAA 3FXRA 1NNTA 3K6VA 3MJNA 1B6HA 2DE2A 4OFLA 1H45A 1N04A 3PMWA 1IXCA 4HCWA 2RCAA 2Q8JA 3CI8A 2F6PA 1AMFA 3R6UA 3TAJA 2M8CA 4P11A 2I58A 4IO5A 4POWA 3M8UA 1FQEA 4GL0A 1O64A 3T22A 3JYRA 3QAXA 2ZMBA 5FTIA 1GV8A 3ZS6A 4Q30B 3V5AA 3ECRA 2O84X 1B5HA 4F2OA 4KYSA 1MDP1 4GXSB 1CB6A 1B7UA 3JV9A 4RK9A 3E13X 2Q2AA 2V25A 2E0SA 3MZ1A 1XVYA 4N07A 3FXUA 1P1WA 1FTMA 3S4UA 2IEEA 3RQTA 1B1XA 2I49A 2F7AA 1FTJA 3O97A 4BDOA 4ZEDA 4F19A 3W15C 2XXTA 2P1SA 4DLDA 1BIYA 2H98A 1Q35A 2DYXA 1N3XA 3RGYA 2F6GA 3H6VA 1HSLA 5FHNA 3MWBA 3B6QA 3PUYE 2Q2CA 1TFDA 1MQJA 3CVGA 3KN7A 5HM4B 3TZAA 4LZ8A 3IJOB 3TUSA 4RY1A 3DM0A 3CR9A 1NMUA 2HCAA 3PPOA 5JK4A 3HN0A 1I6QA 3KFMA 4OXVA 3VVDA 3T9XB 1IIWA 3K4UA 2F78A 3IORA 3MVWA 4RPNA 3CG1A 1JW4A 3EF7A 2RKMA 5I2NB 1TT1A 1SD3A 4OFOA 1S9TA 3S2VA 1D3KA 1GTKA 5CI5A 3EN3A 3C36A 5KDTA 3RNNA 1UIUA 4YU0A 3ILUB 1VSOA 3PU5A 4JSOA 1UQWA 4H67A 3M3KA 4GVOA 2O1MA 4RJZA 5DEXA 3DP8A 1LAFE 1MPBA 1WDNA 3QSLA 1FTLA 3KN3A 1TFAA 3K01A 1Y4TA 4GF8A 4WXJA 2F34A 4IGTA 1R9LA 1MY2A 3UN6A 3CFXA 3MP1A 3JZJA 3SESA 4PQJA 4YZZA 3TQLA 1LBBA 4EF1A 1M5EA 3OO7A 1UTHB 4YB6A 1MPDA 3G3HA 2OWSA 4EXKA 3IB0A 1MQGA 1B05A 4G68B 2ABHA 5AA3A 1B3EA 2Y7RA 3V83A 1NKXA 2O51A 1JEUA 4DE8A 4QFNA 1QUIA 3FV2A 5H8QB 4JSDA 4PFTA 3AXFA 2XX8A 5AE4A 4R6KA 2RC7A 1MQDA 2E1SA 2DWAA 2V93A 2P0SA 1MXZA 5JTYB 4RA1A 3FV1A 1O63A 5ICTA 2PVUA 5JEIA 3TTLA 3K0VA 4ELRA 3ZKKA 3PD8A 3B6WA 2DWJA 3Q25A 1FQAA 4R72A 1GVCA 3RTFB 5KCJB 1L5TA 4MFIA 4MF3A 3O29A 3G3FA 1MXXA 1IXIA 1N3WA 1YTVA 1XS5A 2FA7A 1BP5A 1UTBB 4E0WA 1B40A 1ZIUA 1I6BA 2QS1A 4QSDA 2I0BA 3KOSA 3VVEA 1DMBA 1LAHE 3UORA 1Y3NA 3G3GA 2H5YA 2DWIA 1LGBC 1USYH 3MZBA 4FE8A 3LSWA 5DVIA 1MXVA 1US5A 2A5SA 3T9UA 1US4A 3QUJA 2GH9A 4GWOA 4GOTA 3DP4A 2HAUA 1FCKA 4IO4A 3FUZA 2ALUA 2DWHA 2AL5A 2ANJA 5CC2A 4U1ZA 1IEJA 3E3KA 3KSJA 5I2NA 1AIVA 4EQBA 4F3SA 1EZOA 3QIMA 3OO8A 3PUVE 3IOUA 3G3JA 4U21A 3FD3A 3BBRA 1JEVA 4F31B 3KGCA 4OQOA 2DP8A 1Y1ZA 2Y7KA 2D5WA 1SBPA 1QUKA 3FZVA 5CRYA 3OXNA 1SW5A 1QKAA 2NUVA 3CSBA 3HPIA 1DOTA 2XXYA 4OTEA 1ANFA 4KHZE 4YICA 1HSEA 3H06B 1B5JA 3KBRA 2XXWA 2F8DA 3O2AA 4HS7A 1FQDA 2F7CA 1H3DA 1UTHA 1DPPA 4R9GA 4RNSA 4GFRA 3CIJA 3MP6A 1MY4A 5TP9B 2DSFA 4G68A 1MQHA 2OLBA 5CMKA 3F11A 3V8XB 2DE3A 4KR5A 3VVFA 2ONKE 3B6TA 3N26A 5F7VA 3S9MC 3SEXA 2XD2A 5H8QA 3CRBA 2XD3A 3H03A 4YKIA 4LQ5A 1EZ9A 3PD9A 1N7XA 1MH4A 5JTYA 5CMBA 1DSNA 3CFZA 2HZKA 3HHGA 3PUWE 4X48A 3ILTB 1P1NA 3RT8A 4NWCA 4OVJA 3FGSA 5H8NB 1D9VA 3MUQA 5AA2D 4QFKA 3T93B 4XXUA 2CMOA 3FATA 3IAZA 5KCJA 2NOOA 1XVXA 2H25A 1ZMGA 1OVBA 3MAMA 4C1UA 4F3PA 1MH3A 2H4IA 5TU0A 1XT8A 3L6HA 1N84A 1Y20A 2ZNUA 5H8HB 4GD5A 4GQOA 4ZEKA 4YMAA 3VE1B 4OFJA 1DTZA 1H44A 5FHMA 4Q8RA 2HEUA 3O6IA 1BKAA 2O6AA 3TTKA 4IO6A 5L8DA 2LAOA 3EHTA 4PFWA 4ELOA 4JB7A 2XXVA 3IO4A 1RYOA 4R73A 1IZ1A 4GLIA 4JBZA 3RPWA 5L9MA 2ONSA 1QVSA 3IX1A 5H8FB 4BDRA 4QSEA 3BFTA 5IKBA 2F97A 3IB2A 3WAFA 3H6TA 1B7ZA 3VFJA 1QULA 3W9WA 1BTJA 2PT2A 4JWYA 1B4ZA 2XX7A 3RTWB 1IXHA 1PDAA 4X1DA 4Q0CA 1VFEA 3K1MA 5CMMA 4OEVA 1MXWA 2Y7IA 2DQVA 3T66A 4X1BA 5K2XA 2DVCA 1LFHA 4XKRA 4C1TA 1IQ7A 1A7LA 4ESXA 4QF9A 2O69A 3E9XA 4QRZA 5ISUA 5I84A 5BUUA 3O28A 1Q1KA 4R2FA 3C4MA 3S9EA 1XC1A 2R71A 3FVNA 3BKIB 4H8JA 3D4GA 3OMBA 4H5GA 3VV5A 5B7DA 1POTA 1PBQA 4RYAA 2UXAA 2ZXTA 4NF4A 3IB1A 2XXUA 3SEUA 2B3BA 4U1OA 5K2YA 5TP9A 4FECA 4DXBA 3PPRA 3GBAA 3U94A 1YPNA 4QFOA 1LB9A 4THIA 2GFEA 2I3WA 3TFLA 1B0LA 1PB9A 3U8QA 5AA4B 1A54A 5A5XB 1OQGA 4MLVA 2XXQA 1LFIA 3BFUA 3OOAA 4NF6B 2O1LA 1Y3QA 4OEUA 2F7BA 3N94A 1JETA 2OBGA 1B51A 2O68A 3IL1B 2XHDA 4UA8A 3FXQA 4EXLA 5H8NA 1R1NA 3FJGA 3T9VA 1P1UA 3H4ZA 2WKYA 4QHQA 1N0TA 3KN8A 1MXYA 4DIGA 4OERA 4L17A 1NL5A 3FVOA 3HO7A 4F3GA 3IOWA 4GXAA 4U4XA 2XX9A 2I6EA 3HHFA 4PFUA 1POY1 1RYXA 3EQ1A 1B46A 4GIZA 3PGFA 2P2AA 5EHSA 2PX1A 2HZLA 5H8HA 1USYE 3PUZE 1NFTA 4BDLA 4BDMA 3B7DA 1ATGA 1YAEA 2VOZA 1Y3PA 2GHBA 4C0RA 1NH7A 2IA4A 4G68C 1TWYA 3TDJA 4G8NA 3TCGA 3MBPA 4YKKA 3MVYA 3GBBA 3TCFA 3VXCA 3LUYA 1ZU0A 3TELA 1A55A 3T96B 5H8FA 2G29A 4LA9A 4K3FA 1B9JA 3WAEA 5AA2B 4H8IA 5J1DA 4OWDA 2XXRA 3HV1A 1OMPA 1A8FA 3R7XA 2O7IA 4QFPA 3SEVA 2V3UA 4BLAA 2Z23A 2VD2A 2Q89A 2Q9TA 4BDQA 3G7WA 3O6HA 2KLFA 3O66A 3H6WA 1Y1MA 3TTMA 3H3GA 3C33A 4E0XA 4MH5A 4RPOA 1SI0A 3SKPA 3RT6B 3C32A 2W7YA 4EF2A 4YAHX 2VP1A 3DELB 1D9YA 3TTNA 4NE4A 1S50A 2VGQA 3LSFB 3SEYA 3ODBA 5CM6A 2F36A 1SI1A 3IK6B 4WKMA 1URDA 4H0WA 4POXA 4FEBA 4G77A 1XHYA 1FQBA 4H1XA 1NNKA 1AL3A 1FW0A 5EHMA 1MM7A 2V3QA 4OENA 4FEDA 3SDFA 2Z8DA 3U92A 5ITOA 1T0KA 4ZE8A 4ZDMA 2REJA 3OEKA 4ZZEA 1JNFA 5LOMA 2B3FA 2H9BA 2XXXA 5AA4A 5A5XA 4MBPA 4YB5A 3I5OA 3EHUA 1MY1A 4IB2A 3TMGA 4NF6A 3PMXA 1B3LA 4BDNA 1NNFA 2DS9A 3KJ7A 4I9DA 4G8HA 2ZYMA 4R6HA 1OLCA 3U93A 3TQWA 3EPEA 4WEDA 3Q27A 2R6GE 4R2BA 3QK6A 1LLSA 3USDA 3MC2A 2UVGA 3IOVA 4TLMB 3MVZA 4ESWA 3MPLA 3N5LA 4KPTA 4QFLA 1QKBA 4X9TA 3U72A 4KCCA 1LAGE 3THIA 2HAVA 1SW4A 2PMSA 2BJJX 4KD5A 5F1QA 1FTKA 4ECFA 3Q26A 1XOCA 1SW2A 2OCUA 3IR1A 2QSXA 4NF4B 3TCHA 3D4CA 3OEMA 2ZYNA 4OHNA 5B70A 3DLNA 2PYYA 4XIGQ 3HSTA 3O6GA 1I69A 1B7HA 1URGA 2ESNA 5DYHA 4F22A 4IGRA 1MXUA 1SYIA 2DVZA 1IITA 4TQUQ 4LUBA 1B3FA 2X7PA 3TYHA 2VD3A 4DCXA 3KSXA 5AA2A 4YB7A 3PV0E 5CBSA 4NEDA 2H99A 2XXPA 3M3FA 1ELJA 1JVYA 2R9JA 3UK4A 4F3BA 3VLWA 1RKMA 1ZJLA 2OZZA 4RK2A 3SEWA 1VFDA 1EZPA 2I48A 3UIFA 4OMBA 4LONB 3CFLA 2UVJA 3G3KA 1Y9UA 3IJXB 3UA8A 1B1HA 4G2ZA 2I0CA 2QRYA 2GRVA 3MZ9A 2B65A 3N6TA 4IO7A 3K6WA 2YPNA 4I8CA 2V3TA 3N6UA 3W9VA 4LP2B 3VXBA 4IO3A 1PB7A 3G3IA 2DE4A 4F1UA 1SVXB 1R9QA 3K1NA 4EDPA 4KYEA 4HW8A 1WVJA 3CSGA 2OJTA 1H43A 5CBRA 3PPNA 1UIVA 4FAJA 5DVFA 1EU8A 2NWJA 2ONRA 2AYSA 2OK2A 3GZGA 4ZZAA 1QJMA 1LB8A 1P99A 3PPQA 3M3LA 4NTLA 1JW1A 2PT1A 1PC3A 4FATA 1PEBA 4LZ7A 1QUJA 2Y84A 2NXOA 2RCBA 4IY6A 3PUXE 1TXFA 2RINA 1MQIA 2Q88A 3FVGA 2DXRA 3QXMA 4NWDA 1M5CA 3VDFA 2PBWA 2QJEA 2THIA 2VHAA 3VLVA 3KEIA 3PMVA 1LBCA 2Y7WA 1CE2A 2A5TB 1VR5A 1D4NA 4LZ5A 5I59B 4DDDA 4H65A 2V84A 1IXGA 4Z0IA 1R6ZA 5I58B 2HXWA 4ND9A 4M4GA 3IO6A 3OO9A 1OQHA 3DP6A 4XTCQ 4O3BA 2QPQA 4ELPA 1Z7NE 4ZE9A 5TPAB 3FASA 4NF8B 4G8MA 1PB8A 1OIBA 2X26A 2ZNTA 3Q28A 5ICQA 3OD7A 4Z7EA 3LSXA 3GXAA 4NF5B 4P0IA 3KJTA 1AOVA 4MLQA 1FTOA 3TKDA 4PE5B 1B5IA 2FYIA 2QS4A 3OELA 3LR1A 5DT6A 2Y7PA 4LVQA 3S9NC 4YKPA 4ONYA 4U2RA 4JDFA 4U4SA 5KZTA 1H76A 2UVIA 1SYHA 5EYFA 4PETA 3C31A 3KG2A 1GGGA 5HBCA 4FORA 4ZEFA 4H5FA 2I4BA 4LATA 2ZNSA 4U23A 1MRPA 4NMYA 1DTGA 3QUFA 2GHAA 3S9LC 4IY5A 4U22A 1ZTYA 3CG3A 3TPAA 4ISUA 3H6UA 2Z8EA 3FJMA 2UYEA 1B3HA 3EHSA 4KFQA 1JQFA 5I57B 2DXYA 3Q29A 4ZEBA 3FJ7A 4EQ9A 4XKPA 4JWOA 3MW0A 4IO2A 1LSTA 2UVHA 4F29A 3SETA 1N7WA 5ELVA 2HQ0A 1MY3A 1I6AA 4JXIA 1NNPA 3RLFE 3HCQA 3UP9A 1QW0A 4OZ9A 4OETA 4LQ2A 2D3IA 4XKQA 3LC8A 3TEPA 2I4CA 2F35A 1B3GA 1MM6A 2ZYKA 1Y4CA 3L6GA 2CZLA 4OESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RY3A 2QS2A 3ONMA 4JWXA 2DOJA 4I40A 1JW5A 1SDXA 3I3VA 5IZ3A 1N76A 4AS4A 1MPCA 4GBVA 3OSQA 5L9OA 2R8TA 3V89B 3RN8A 2NVUB 3VLUA 2YLNA 2Z22A 1B52A 3TODA 2QMWA 3LBSA 2WYPA 2I3VA 4RXLA 1DCUA 4R9FA 3OSRA 4GRKA 1LCFA 4OYVA 5M2VA 3ZKLA 5I2KB 2F5XA 3O9PA 2G93A 3KOTA 3TTRA 5I56B 1B2HA 4DZ1A 4KYDA 4PC9A 1B32A 1O7TA 1VE4A 2QFLA 5ET8A 3ZSFA 3MPKA 4Q5TA 1F9BA 2A5TA 4R6YA 4O3AA 3QYTA 4TLLB 5FHOA 3RPLB 5I59A 4I1DA 3E4RA 1KWHA 2Q74A 4FIMA 4TOZA 4UACA 4QSCA 3MVXA 1LAXA 5ITPA 2P3VA 5I58A 3PPPA 3OENA 2XXIA 1B4HA 1IMDA 4MEVA 5CMCA 4ZS9A 2QMXA 5DTBA 1FQCA 5F24A 4AB5A 1Z7ME 1B58A 5TPAA 4NF8A 1LCTA 1B0HA 4HCYA 4GL8A 1MDQA 2QS3A 3IOTA 4N81A 4NF5A 1ZLQA 1ZKBA 1SQYA 3U1OA 3LSLA 3OO6A 2O7UA 4N13A 1BLFA 4GWSA 2UYFA 4KCDA 4GWXA 1OVTA 4HTGA 1II5A 4JVIA 2QVRA 4I62A 1SW1A 4DXCA 3R26A 4F1YA 3D1RA 2F3DA 3GLBA 3RUMA 4NX1A 4GX6A 4ZEIA 2AIXA 4GWYA 5H8SA 4O3CA 5I7IA 1J1NA 2OWTA 4N4UA 1HSJA 4ELQA 4ZECA 4OA4A 3FVKA 2AL4A 4IR8A 4M1VA 4XKNA 2RC9A 5IAIA 4F2QA 2B4MA 2HFBA 3K00A 4F39A 3KZGA 1MS7A 4R75A 1KA1A 5I57A 5BWJA 1IUDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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