1RYXA

Crystal structure of hen serum transferrin in apo- form
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
686
structure length
686
Chain Sequence
APPKSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal transport
molecule keywords Ovotransferrin
publication title Tertiary structural changes associated with iron binding and release in hen serum transferrin: a crystallographic and spectroscopic study
pubmed doi rcsb
total genus 75
structure length 686
sequence length 686
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryxA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryxA03
3BBRA 4H65A 2O1MA 5ELVA 4FIMA 3W15C 4IY6A 2V3QA 2QMWA 3FJMA 2F6PA 4OVJA 1MY4A 4ZEFA 1SDXA 4DXBA 3OEMA 3H6TA 4YB6A 1GR2A 1QJMA 1VFDA 2QJEA 3ODBA 5AA2B 1A99A 2Y7WA 4OFOA 3O6HA 1Y9UA 1B5IA 1AH5A 2DVCA 3SEXA 3QXMA 1B1XA 2NVUB 3MZ9A 4P0GA 4FECA 3TCFA 1ZMGA 3PPOA 2ZYNA 3IB0A 3FGSA 4F39A 5KZTA 2H4IA 3DP6A 3MWBA 4DXCA 1QVSA 2W7YA 2XXVA 1QUKA 2XXIA 2I4BA 2F5XA 1LFIA 1WODA 3FZVA 3A09A 1IXIA 3UN6A 4HCWA 1SBPA 3S2VA 4KQPA 5CMCA 3PPRA 3IORA 4R73A 5I57B 3KN8A 1D9YA 3FXUA 3RTWB 3C4MA 1MDP1 3MVWA 1PEBA 4U1OA 1SW2A 4I8CA 1MG1A 1Z7NE 2VD3A 3OENA 1OMPA 3HHGA 2ZYOA 5AA2A 3K0VA 4N13A 1FQFA 2DXYA 2UVIA 3IK6B 2ONSA 1OVBA 2DWIA 2HZKA 1DTGA 3IJXB 2R71A 1RYOA 3N6TA 4IGRA 2F78A 4YMBA 4MH5A 5J1DA 4NF6B 3FVKA 4GXSB 4JWXA 3AXFA 2VGQA 1N84A 2PT2A 4R6HA 1URDA 1A40A 1DOTA 3IB2A 1XHYA 4F2OA 1B5JA 4MFIA 1BKAA 2XXHA 1SI0A 3K01A 1MDQA 3LUYA 3EHTA 2PYYA 1EZ9A 4UA8A 3V5AA 1MY0A 4L17A 1ANFA 2UYEA 1LAFE 1POY1 4Q30B 3TZAA 2ABHA 3IJOB 4F1YA 4YAHX 4PQJA 5FHNA 1MXYA 4YU0A 5HM4B 1H45A 3W9WA 1B7ZA 5FHOA 4YB7A 4O3CA 3FD3A 3TKDA 3VVFA 3TMGA 4E0WA 3KJTA 4OESA 3PUWE 3DP4A 4EQ9A 3VVDA 3EHUA 3O6IA 4YZZA 4NF6A 1SD3A 1XS5A 3SETA 1MQDA 2NUVA 3IB1A 3L6GA 5CC2A 4RPNA 3SEWA 5K2YA 3N5LA 1JNFA 5F1QA 1T0KA 1J1NA 1ELJA 2R6GE 3HPIA 3TAJA 3EN3A 2Q9TA 1LAXA 4G8HA 3FVNA 3G3JA 1O7TA 4BDLA 1NNTA 1LCFA 2QS1A 5TPAA 3U94A 3MC2A 5IKBA 1FTOA 1B0LA 3OELA 4XKPA 1NMUA 4WXJA 3UIFA 4RK9A 1NKXA 1YCJA 5ITPA 3M8UA 1LGBC 2UVGA 2OJTA 2H9BA 4F31B 1OQGA 4HW8A 4R6YA 4NF8B 1LAGE 1B5HA 1B6HA 5L9OA 3Q26A 5H8SA 2ESNA 4ZE8A 4F2QA 3N6UA 4KI0E 4QFOA 2Z8EA 1LFGA 3O2AA 1QUIA 2VP1A 5CM6A 1HSJA 4DIGA 2NXOA 2UVHA 4YMAA 1R1NA 3G7WA 3KJ7A 3SKPA 5CMKA 4NF4A 3PGFA 1MPBA 3E3KA 2PT1A 4GWOA 4JSDA 1Y1MA 3KBRA 3DM0A 1L5TA 5JTYA 3OO7A 4KCCA 4OMBA 2Y7IA 4F3BA 3S4UA 2ANJA 3O29A 4NF8A 1P1NA 4LATA 2OK2A 1Y4TA 3C36A 4G8MA 1B9JA 1AIVA 2VOZA 1FQEA 3U1OA 1SW4A 1QKBA 3USDA 2FYIA 1CB6A 3D4CA 1UTHA 2Q2CA 4PFWA 2I0CA 3CFZA 5TP9B 3HV1A 4IB2A 4ESWA 3K1PA 4JDFA 4ZECA 1N0TA 4F1UA 3OO6A 1OLCA 3FXRA 1USYH 3SEVA 4E0XA 4F3SA 1MY1A 3S9NC 5I56A 5I58A 4EQBA 1GV8A 4ZZEA 2H98A 5JK4A 1QKAA 1SW1A 1XVXA 4R9FA 1RKMA 1URSA 2RF1A 3PPNA 1EZPA 4IO4A 3K4UA 4G2ZA 3PV0E 2HXWA 3OD7A 1TFAA 2REJA 5I59B 4QSDA 4H5FA 5KDTB 4GOTA 3ILUB 2DE3A 4K3FA 3LR1A 4YKJA 4ZEBA 5HPQA 4QF9A 3I5OA 3L6HA 5ICQA 1OVTA 3FV2A 4RXLA 1Y1ZA 1JVXA 5KCJB 4XKRA 3EF7A 2OBGA 1IIWA 1NNFA 3FIRA 5CBSA 4U2RA 2XXPA 2A5SA 5CMMA 4BDRA 1SYHA 1B4ZA 4H6DA 4PFUA 3CR9A 1PBPA 4G8NA 4EF1A 1SQYA 2AL5A 1B2HA 5ICTA 1NFTA 1IUDA 3B6WA 3K6UA 4F22A 1SYIA 1QW0A 4ELRA 1M5FA 1XOCA 4KD5A 1ZBMA 4NWDA 1FTLA 3I6VA 3R6UA 4C1UA 1P1QA 2G29A 3IX1A 4IGTA 3ZSFA 3TTLA 5H8HB 2RC9A 4EXKA 5H8QB 1ZU0A 1FCKA 3LSLA 4WEPA 3KOTA 3WAFA 3JZJA 3GBBA 3HO7A 5JEIA 1MPCA 4GXAA 1ZTYA 5EHSA 4C0RA 3PD9A 1A54A 3VLVA 5EYFA 3H03A 4I9DA 3TODA 3H06B 1JW1A 2Y7RA 3C34A 4ESXA 3CFXA 1JQFA 1N04A 2ZYMA 4BDMA 1NH7A 2I0BA 5DYHA 3KEIA 3ZKLA 4JB7A 4KYEA 2DSFA 4XKNA 1JETA 2Y84A 2OWSA 2DWHA 4U1ZA 3U93A 3O66A 2H25A 4JXIA 3RT8A 3QSLA 2CZLA 1A8EA 1OQHA 1MXXA 1D3KA 2I48A 4ZE9A 2ZNSA 3OOAA 5H8HA 3QAXA 1BLFA 3U92A 5H8QA 3B6TA 3Q25A 3UGWA 1MH3A 2YPNA 2UVJA 2GHAA 1FQAA 3MP1A 4NF5B 4G68B 3CSBA 3VLUA 1LAHE 2F7AA 1PDAA 2ZXTA 3MPLA 4PP0A 1LB9A 4ELPA 2ONKE 3G3FA 2NOOA 3LBSA 3VXBA 1Y3PA 2XXQA 1MH4A 2OCUA 1LSTA 3TDJA 4LVQA 1IXGA 4R9GA 4DXUA 3V89B 4DE8A 3MW0A 3UK4A 4AB5A 4G68C 4O3BA 3MP8A 2DYXA 5DT6A 4ZZAA 5M2VA 3U72A 5HBCA 2OZZA 1M5BA 2O6AA 4OYVA 2GH9A 4H8IA 3N26A 3EHSA 4IO5A 5ISUA 4DLDA 3N94A 4EXLA 4LQ2A 1PBQA 2I3WA 3IR1A 3K6VA 3ECRA 5IAIA 4I62A 1S7YA 3T9VA 4IO7A 2OWTA 3GBAA 4GFRA 1D9VA 4JWYA 1ZKBA 4WKMA 5I57A 3KFMA 3H7MA 4KYDA 2BJJX 3QK6A 4UACA 2OLBA 4Q5TA 4OEUA 5H8NB 4POWA 1AMFA 2Z8DA 3MVYA 2DQVA 1JEUA 1I6QA 3PUVE 3K1NA 2I4CA 3OMBA 4YB5A 1HSEA 4IO6A 5DVFA 5AA3A 1NNKA 3R26A 4QFNA 4RYAA 2G93A 2UYFA 3F11A 1S50A 1MY2A 4FJPA 3MJNA 1FQBA 2RINA 1A7LA 5FTHA 1A8FA 3HN0A 1B1HA 1Z7ME 4F18A 3E9XA 4GRKA 1FQDA 1H76A 1US5A 1WVJA 2B65A 3RLFE 1A55A 4MF3A 3R7XA 3JYRA 3RT6B 4OTEA 5H8NA 5A5XB 1FQCA 4YICA 2ZMBA 3RY3A 1PB7A 1Q1KA 1B3EA 1MY3A 4AB6A 1MXVA 4ONYA 3TYHA 3PD8A 1LBCA 1VE4A 4RA1A 1BTJA 1IZ1A 1B46A 2O1LA 4X1BA 1URGA 3VVEA 1FTKA 3PMXA 4GL0A 4Z7EA 3CIJA 3THIA 3MP6A 1N3XA 1PC3A 4FORA 3MQ9A 2R9JA 3PUZE 4GLIA 4NMYA 2ALUA 3WAEA 2RCBA 4KR5A 3HHFA 3VE1B 3QYTA 4OFLA 4ELOA 4RY1A 1B52A 4H67A 2XXWA 4EUOA 4LZ5A 4R2FA 2I6EA 4TOZA 2E1SA 5BWJA 1H3DA 3DLNA 3T66A 3M3FA 3A3CA 4QSEA 4YKPA 2H5YA 1P1WA 5A5XA 2XXTA 4GD5A 2I49A 4IO2A 3PU5A 3SERA 4OFJA 2ZNTA 5B70A 4KCDA 1IXHA 3KGCA 4XXUA 2QS2A 3T96B 3LSWA 3IO4A 4THIA 3T22A 1XT8A 3MBPA 5CMBA 5I2KB 3OSRA 4N07A 3KSJA 3UP9A 5AA2D 1B40A 3QIMA 3M3LA 2Q88A 3KZGA 4GF8A 2QSXA 4X9TA 3FJGA 2Y7KA 2V93A 4ZEKA 2AIXA 2D21A 3GZGA 1S9TA 2V84A 2DWJA 2O7UA 4O3AA 3B7DA 2QS4A 1LFHA 5LOMA 1DPEA 4NE4A 4DCYA 3RTFB 3SEYA 5DEXB 3K00A 5L9SA 4PE5B 4KPTA 2Y7PA 3CVGA 1IEJA 2Q2AA 2VHAA 4BDOA 3DP8A 3K6WA 3K02A 5BUUA 4BLAA 3C9HA 4JSOA 1B3GA 1O64A 1ZJLA 1PB9A 4LZ8A 2IEEA 4R75A 4U23A 1MXUA 1MXZA 4H8JA 4HS7A 1DMBA 5TP9A 1XC1A 2XD2A 3TQWA 4FATA 2F97A 2P1SA 2RCAA 3PUYE 5CBRA 4Q0CA 3ILTB 2ONRA 3ZKKA 1EU8A 1B51A 4C1TA 1I69A 3IL1B 4JWOA 1EZOA 2QS3A 4IO3A 2P0SA 1YTVA 4N6PA 4QRZA 1QUJA 3FASA 4ISUA 3K2DA 2O68A 3E4RA 2I58A 3O28A 5I59A 3BFUA 4OWDA 3I3VA 2X7PA 5KDTA 2O69A 1MS7A 4OENA 4OERA 3C31A 4ND9A 1POTA 1NL5A 2B3BA 3Q28A 4NEDA 2HAUA 4XKQA 3V83A 1UQWA 3T9UA 5KCJA 3LSFB 1TXFA 3VLWA 4GL8A 1MPDA 3H6UA 1B3HA 4OZ9A 4PFTA 3TQLA 3OSQA 4OQOA 4GVOA 1OLAA 3S9MC 1BIYA 4HCYA 2X7QA 5F7VA 2DWAA 3SESA 3GXAA 3C33A 4LA9A 4QSCA 1FTJA 5AA4B 2FNCA 2PMSA 2NWJA 1M5CA 5DTBA 1B3FA 3M3KA 3EQ1A 2DXRA 3W9VA 2GRVA 2Z8FA 4Q8RA 1LCTA 3CFLA 2VD2A 3Q29A 2KLFA 1B32A 1SVXB 4FEBA 3S9LC 2RC7A 1N7WA 3MZBA 2HEUA 1N76A 4OHNA 5DVIA 2UXAA 3TTNA 3C32A 1VR5A 3TTRA 3LC8A 2H99A 1ZLQA 4PETA 4WEDA 4AQ4A 2Q89A 4MLVA 1JW5A 1MXWA 3CG1A 2ZYKA 3DELB 5L8DA 4ECFA 4XTCQ 2QRYA 4F3GA 1CE2A 4LP2B 2CMOA 4F19A 1R6ZA 2P2AA 3C35A 4XIGQ 1SI1A 1B0HA 4RJZA 5DVJA 2PBWA 1FW0A 1VFEA 4FAJA 3OEKA 4H0WA 4FEDA 4GIZA 3H6WA 5AA4A 4G4PA 3QUJA 3JV9A 1B3LA 4ZEIA 2PVUA 2RC8A 3RNNA 4RK2A 4LZ7A 5I2NB 3S9EA 4KFQA 2XX8A 3K1MA 1PB8A 1AOVA 1JEVA 2E0SA 3FV1A 3ZS6A 3A3UA 5I84A 1TWYA 4NF5A 4QHQA 3RPWA 4R72A 2XX9A 4G68A 4R74A 4ELQA 3EPEA 1MQHA 1D4NA 1LBBA 1N3WA 1Y20A 1GGGA 2D3IA 1FTMA 3O97A 1P1OA 1QULA 5B7DA 1RYXA 1HSLA 4IY5A 2DP8A 4HTGA 1B7UA 2QPQA 1II5A 5K2XA 3OO9A 3H4ZA 2XD3A 2DVZA 1MQJA 3HSTA 1MQGA 3IO6A 3PPQA 3RN8A 1TT1A 3IOVA 2HCAA 2QL3A 3IOWA 3Q27A 3T9HB 1F9BA 4QFPA 3VXCA 2O7IA 5TPAB 5I2NA 4KYSA 3SDFA 2GHBA 2WKYA 4Z0IA 2HFBA 3HCQA 3G3KA 4BDNA 4ZDMA 2I3VA 4EQ7A 2M8CA 2REGA 1N7XA 4I1DA 2X26A 3U8QA 1H43A 5ITOA 2QMXA 4LONB 2F7CA 3G3GA 3B6QA 1IITA 3FVOA 1B05A 2F7BA 2F8DA 4M1VA 4ZS9A 3TEPA 3CRBA 5CRYA 1B58A 3FVGA 3BKIB 2DOJA 4YKIA 3FUZA 4JBZA 3FATA 2XHDA 4OEVA 4DZ1A 4MBPA 3KN7A 2PX1A 3OO8A 1I6AA 3OXNA 4OXVA 4NF4B 3IOUA 3TTMA 2FA7A 2F6GA 3MUQA 4U4SA 2V25A 3LSXA 1ZIUA 1Y3QA 1IXCA 1M5DA 5FTIA 4EDPA 2DE2A 5JTYB 2DS9A 2GFEA 4NWCA 1DPPA 1DSNA 4TLMB 3CG3A 3GLBA 3KG2A 4FE8A 2XXYA 4G77A 3KN3A 1GTKA 3VDFA 2XXXA 4ZEDA 2HQ0A 1IQ7A 4MLQA 2HAVA 3PMVA 3D4GA 3TELA 3MAMA 4TQUQ 3T9XB 1R9LA 3TCGA 3E13X 1UTBB 2V3TA 1P99A 3TTKA 1UTHB 4H5GA 1US4A 3K6XA 4RNSA 2F35A 1XVYA 3UORA 1MRPA 4PFYA 5L9MA 4EF2A 3RQTA 2F34A 1JVYA 3RUMA 5I56B 5I58B 4LUBA 1VSOA 5AA1A 5H8FB 2F36A 1JW4A 2Q8JA 1O63A 3PMWA 1MM7A 3PUXE 2RKMA 4R2BA 1WDNA 3MPKA 3IAZA 5CI5A 4F3PA 1H44A 4YKKA 1ATGA 4TLLB 1UIVA 4KHZE 4GQOA 3ONMA 1TFDA 1UTBA 2DE4A 2B3FA 1NH8A 4U22A 1USYE 3BFTA 3PPPA 3MZ1A 1GVCA 3TUSA 2D5WA 4X48A 3TPAA 3P7IA 1Q35A 2O51A 4LQ5A 3QUFA 1DTZA 3FJ7A 2XX7A 4P0IA 4H1XA 1EH3A 1KWHA 2AL4A 5H8FA 1B4HA 3MVXA 3G3HA 1YPNA 2HZLA 1I6BA 2IA4A 4P11A 3VV5A 1LB8A 5FHMA 3H3GA 5TU0A 5I2KA 2A5TB 1Y3NA 2O84X 4OETA 2XXUA 4F29A 3T93B 4QFLA 3V8XB 1NNPA 3TCHA 1B7HA 3G3IA 3MVZA 4QFKA 1Y4CA 2Z23A 2Z22A 4X1DA 1UIUA 4U4XA 3KSXA 3SEUA 5EHMA 2YJPA 3IOTA 5DEXA 4DDDA 1MQIA 4F1VA 4R6KA 2V3UA 3CI8A 1R9QA 4DCXA 4RPOA 4BDQA 3CSGA 3FXQA 3O6GA 3H6VA 2AYSA 4M4GA 1P1UA 3UA8A 1BP5A 1M5EA 1SW5A 1LLSA 2LAOA 2XXRA 2A5TA 2YLNA 2ZNUA 4NTLA 1YAEA 3TFLA 3O9PA 3VFJA 5AE4A 2THIA 1MM6A 1OIBA 4U21A 3KOSA 4POXA 1AL3A 3RGYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PAKA 3BBRA 4H65A 2O1MA 5ELVA 2XWVA 4FIMA 3W15C 3FXBA 4IY6A 2V3QA 4OVPA 2QMWA 3FJMA 2WBDA 2F6PA 4OVJA 1MY4A 4ZEFA 1FBGA 1SDXA 4DXBA 3OEMA 3H6TA 4YB6A 1GR2A 2QVUA 1QJMA 1VFDA 2QJEA 3ODBA 5AA2B 1A99A 2Y7WA 4OFOA 3O6HA 3T1BA 1Y9UA 1B5IA 1AH5A 2DVCA 3SEXA 3QXMA 1B1XA 2NVUB 1IMBA 3MZ9A 4P0GA 4FECA 3TCFA 1ZMGA 3PPOA 4G61A 2ZYNA 2CZHA 3IB0A 3FGSA 4F39A 5KZTA 2H4IA 3DP6A 3MWBA 4JVIA 4HE2A 4OVRA 4DXCA 4OVTA 4QXDA 4X8RA 1QVSA 4P1EA 2W7YA 2XXVA 1QUKA 2XXIA 4GBWA 5FBPA 2I4BA 2F5XA 4PGPA 1LFIA 3B50A 1WODA 3FZVA 3A09A 4GX6A 1IXIA 3UN6A 4HCWA 1SBPA 3S2VA 4KQPA 5CMCA 3PPRA 3IORA 4R73A 3A29A 5ET7A 5I57B 3KN8A 1D9YA 3FXUA 3RTWB 3C4MA 4PBQA 1MDP1 3MVWA 1PEBA 4U1OA 1SW2A 3SZPA 4I8CA 1MG1A 1Z7NE 2VD3A 3OENA 1OMPA 3HHGA 2ZYOA 5AA2A 3K0VA 1YXIA 4N13A 1FQFA 4PAIA 2DXYA 2UVIA 3IK6B 2ONSA 4GWYA 1OVBA 3RYDA 2DWIA 2HZKA 1DTGA 3IJXB 2R71A 1RYOA 3N6TA 4N81A 4IGRA 2F78A 4YMBA 4MH5A 5J1DA 4NF6B 3FVKA 4GXSB 4JWXA 3AXFA 2VGQA 1N84A 2PT2A 4R6HA 1URDA 1A40A 4MNPA 1DOTA 4NGUA 3IB2A 1XHYA 2ZZXA 4F2OA 1B5JA 4MFIA 1BKAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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