1MS7A

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-des-me-ampa at 1.97 a resolution, crystallization in the presence of zinc acetate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor subunit 2
publication title GluR2 ligand-binding core complexes: importance of the isoxazolol moiety and 5-substituent for the binding mode of AMPA-type agonists
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A01
3H6TA 5CBRA 5I2NA 2XXTA 3R7XA 3LBSA 3S4UA 4G4PA 4BDNA 3RN8A 3CVGA 5I56B 3QIMA 1EU8A 2XXHA 5IAIA 3FJ7A 2DXRA 2XXWA 1M5BA 2DVCA 4RA1A 4UACA 1D3KA 1EZOA 4OZ9A 3I5OA 3EPEA 4QFOA 4R74A 5DEXA 3H7MA 4R9GA 1M5FA 1B4ZA 4DLDA 4ZZAA 4GL8A 1MH3A 5L9OA 1LSTA 3MVWA 5L9MA 3N6TA 1D9YA 2Y7IA 2I3WA 4BDOA 1TT1A 1MQJA 3S2VA 4LATA 2H4IA 1R6ZA 4G2ZA 2R9JA 1ZKBA 1DSNA 2G29A 4YICA 4OEVA 4KYSA 1ZLQA 3TKDA 2HFBA 3PPRA 1B46A 2OWTA 1GTKA 2I4CA 3RT6B 1JW4A 1LFHA 3D4GA 5H8NA 1TXFA 1XT8A 1B7HA 1PB9A 3TDJA 3U92A 3IB1A 1IITA 2DWAA 4R75A 2DE3A 4F31B 1O63A 3TPAA 3TMGA 1LBBA 1H43A 4GD5A 1A40A 4DXUA 5I84A 3VLWA 1KWHA 3IR1A 4Q8RA 3S9NC 3R26A 3PUXE 4KYDA 3IJXB 1WODA 1LAHE 1P1QA 2ZXTA 5F1QA 3OMBA 3LSXA 2ZYMA 4IO5A 3FATA 4FE8A 4JBZA 4XKPA 3O28A 2F7BA 5EHMA 3RT8A 1QULA 2QL3A 1CB6A 4QFNA 2OLBA 1P1NA 1N76A 1ZU0A 5FHMA 2PYYA 3FJGA 5L8DA 1NNTA 2Z22A 3O6HA 1XS5A 3HCQA 1MPBA 1FTLA 4FAJA 1DTZA 3IAZA 1MM6A 4RK9A 4F3SA 2YLNA 5CMBA 4HS7A 1TWYA 3LUYA 3KZGA 4GFRA 1I6BA 3PUZE 3I3VA 1M5CA 3CFZA 4N6PA 3O6IA 3MBPA 1B9JA 3RLFE 1US5A 1PBQA 4K3FA 1Y3QA 5H8HA 4NF8A 3LSLA 2Z8DA 2RC7A 5CMCA 3RQTA 3ZKLA 2X26A 2HQ0A 2F7CA 5DVJA 3LSFB 3IOWA 4YKKA 2H98A 4EQ7A 3QYTA 3K1MA 2DS9A 1MXYA 4IO6A 2UXAA 4QF9A 4L17A 2V25A 4U4SA 2VHAA 5AA2B 3MZ1A 3LC8A 5M2VA 4JB7A 1US4A 3QUJA 1ANFA 4TQUQ 3CR9A 4RK2A 1T0KA 2UVIA 3IOTA 1GGGA 3VXBA 1HSJA 2XXRA 3OELA 2E0SA 1SW1A 2NVUB 4NF6B 4GRKA 5CMKA 4OHNA 3ZKKA 2GRVA 2QJEA 4U1OA 2DSFA 4F3GA 4YB5A 4IO4A 3MQ9A 3UIFA 2I0BA 4LONB 3N94A 2B65A 3THIA 4DZ1A 2VGQA 5ITPA 4NMYA 4Q30B 4QSEA 3C9HA 1EH3A 1RYXA 1DTGA 4I9DA 1D4NA 3EF7A 1LB9A 4F3BA 1O64A 3K00A 3ONMA 2DWJA 5J1DA 4YKIA 3T93B 1SDXA 4GOTA 2QRYA 4NWCA 3B6QA 1R9QA 1FTJA 3V89B 3PUVE 4PETA 4KPTA 5TP9B 1WVJA 1SW2A 5JK4A 3LR1A 3H6UA 1LAXA 4MBPA 2REJA 3PPPA 3MP6A 4LQ2A 3TQLA 1FTMA 2PMSA 5TPAB 4AB5A 2UYFA 2RCBA 3GBBA 4MFIA 3QK6A 1XVXA 4I1DA 2XHDA 4ELQA 1TFAA 4RXLA 1MQIA 4H5GA 4R6YA 1N0TA 4Q0CA 3TAJA 1B7ZA 4BDLA 3Q27A 4OVJA 4LZ5A 2FYIA 4OENA 4XXUA 3CRBA 1VR5A 4AQ4A 3DELB 2F78A 2DWIA 3V8XB 4U1ZA 1M5EA 1URSA 2ONRA 1O7TA 3HHGA 3H6WA 3T66A 4YMBA 3S9EA 4WEPA 3RUMA 1XHYA 4GF8A 3G7WA 2P0SA 4DDDA 4ONYA 5KCJA 2F7AA 1A54A 1XC1A 2HZKA 4DXBA 4RPOA 4NE4A 3TODA 2O1LA 4F2QA 1XVYA 4GQOA 4GIZA 3EHSA 1MH4A 1LLSA 3HN0A 3JV9A 1B05A 1SYIA 3DP6A 3TCHA 1N3WA 1I6AA 3PMWA 2I3VA 2UYEA 2O1MA 3B6TA 2XXVA 2V93A 5K2YA 3DM0A 1BP5A 1A8EA 1FTOA 4KFQA 3KGCA 3U93A 2M8CA 4G77A 3MJNA 2A5SA 5JTYA 2YPNA 1ZMGA 1B3GA 3WAFA 2DP8A 4NF4A 2AL4A 3PMXA 4OWDA 3MW0A 1ZJLA 3PD8A 4ZS9A 1SI0A 5AE4A 3MPLA 1GR2A 5TU0A 4YMAA 1POTA 3K4UA 3CSBA 4U22A 2VP1A 1QUKA 2REGA 1N7WA 1MQHA 4IY5A 1MXXA 2F8DA 3K6VA 1LGBC 1OVBA 1LCFA 3C31A 3C35A 3VE1B 4ELRA 3FV1A 1EZ9A 4MLVA 3KOTA 1MXWA 2CZLA 4YKPA 1SYHA 3PUYE 4LP2B 4O3AA 3U94A 4EF1A 3E3KA 3CFXA 3OENA 1Z7NE 3MP1A 1UTBA 3Q29A 2ZMBA 4GL0A 3G3KA 4I62A 4KCCA 3UK4A 2E1SA 4IO7A 2NOOA 4NF5B 4Z0IA 1DOTA 5AA4A 4NEDA 3EQ1A 4XTCQ 1FQBA 1SW4A 3H6VA 3CSGA 1MY0A 4Z7EA 5CC2A 3OO8A 1Y4TA 4R9FA 2X7QA 1IXHA 5AA2D 1I69A 1NNPA 1Y4CA 2DYXA 1IQ7A 2UVJA 2NWJA 4LVQA 2F97A 1IXIA 5IKBA 3M8UA 3OOAA 3RGYA 1B3FA 4UA8A 4KYEA 3SEWA 3A3CA 2OZZA 4X1DA 3FUZA 3QSLA 4GXSB 4ND9A 2XXYA 2P2AA 4IY6A 2RINA 2OCUA 3CFLA 2ABHA 3GXAA 3DP8A 5HBCA 1GV8A 1MY1A 5TP9A 1B6HA 2IA4A 1URGA 4DCYA 3BBRA 3JYRA 4WXJA 3TELA 3HSTA 3FXUA 3K1PA 4HW8A 3VFJA 3CI8A 2KLFA 3QUFA 4G68A 4O3CA 2I0CA 1AMFA 5I59B 1UTHA 1B4HA 2V3TA 1QVSA 4ZEBA 4XIGQ 3D4CA 1H3DA 3FZVA 3VLVA 3C32A 3U1OA 2HCAA 4EQ9A 2O69A 4OYVA 1AH5A 5LOMA 1IXCA 5I58B 1USYE 3MVXA 3K6UA 2A5TB 4U23A 4KI0E 4JXIA 2R6GE 1BTJA 1NL5A 2AIXA 3CG3A 2X7PA 3RTFB 4MH5A 4DE8A 5ELVA 4H0WA 4ZEKA 1PB8A 5A5XB 3DLNA 3N26A 3HV1A 2CMOA 4PFTA 4H65A 4NTLA 4U4XA 3IX1A 3ZSFA 1LB8A 3V83A 4E0XA 1FTKA 2RKMA 1IIWA 1QKAA 3ECRA 5L9SA 1SW5A 4F3PA 2Z23A 2WKYA 2V3UA 4RJZA 3PPOA 2DOJA 1OLAA 3VVEA 1N04A 3H06B 4LQ5A 3FVOA 3B6WA 2AL5A 2GHBA 3N6UA 3PPNA 4F1UA 4POXA 3IL1B 1II5A 3ODBA 4RY1A 2Q9TA 3V5AA 3MP8A 3U72A 2FNCA 4R6HA 3K2DA 1IXGA 3FASA 3T9UA 3G3JA 5AA1A 4X48A 4BDRA 5BUUA 4F19A 3TZAA 1MRPA 3C4MA 3IOVA 5H8QB 3TTKA 4QRZA 3VV5A 3UN6A 2PT2A 1B0LA 1NH7A 4YZZA 2B3FA 2HEUA 1Y1MA 4C1UA 4MLQA 1A55A 4WKMA 2PVUA 3H4ZA 1SBPA 5I2NB 3O2AA 5I56A 4GWOA 3IJOB 4M1VA 4F29A 4DXCA 2RC8A 4HCWA 1P1UA 4ZEDA 2Z8FA 4FEBA 5K2XA 3FVNA 4ISUA 3OO7A 1RKMA 4BLAA 3MWBA 2XXUA 4NWDA 5CBSA 3IO4A 3E13X 4ZECA 4IO3A 3EHUA 4H5FA 2ONKE 3L6GA 2GFEA 1S7YA 1YTVA 3VDFA 3M3KA 5DTBA 3IOUA 1B5HA 1JNFA 3OXNA 3PUWE 1JVXA 5JEIA 2I48A 3OEKA 5CRYA 4PFWA 1CE2A 3G3GA 5DVFA 4H8IA 3T9VA 4EQBA 4JSDA 1SD3A 3PD9A 1NMUA 4R2FA 4X9TA 4ZE8A 5H8FB 1IUDA 3AXFA 1MDQA 2O7UA 3TYHA 1AOVA 4RPNA 3UGWA 1N3XA 3GZGA 3TCGA 4PQJA 2XD2A 2BJJX 5CM6A 4POWA 5H8NB 3L6HA 2VD3A 2DXYA 1Y3PA 1LAFE 3VXCA 1MY3A 5CMMA 5DYHA 4TLMB 5ITOA 3KN3A 2HXWA 3MAMA 3OO6A 2Q8JA 3VVDA 1P99A 4X1BA 3IK6B 5KZTA 4P0IA 2Q2AA 4QSDA 3IB2A 3GBAA 2GHAA 1NNKA 1Q1KA 1HSEA 2XXIA 1AL3A 4FATA 1F9BA 2ALUA 4ZE9A 1LAGE 1Y3NA 3CG1A 2GH9A 4JWXA 4KCDA 2Y7RA 2UVGA 5BWJA 1YPNA 1P1OA 3U8QA 2Q89A 1OLCA 5DVIA 4OETA 3TTNA 2ZNUA 4ZZEA 1OQHA 2PX1A 2AYSA 2H5YA 5FHOA 1R9LA 4M4GA 3FIRA 2QSXA 1ZIUA 3FV2A 5I2KB 4JWYA 4R73A 1OIBA 3SEVA 1YCJA 2Y7PA 4R2BA 1JQFA 1QUIA 3IB0A 2XX8A 2OWSA 3UA8A 2DE4A 2I49A 2HZLA 3IO6A 4EDPA 5H8HB 2ZNSA 1Y20A 1LFIA 1FQFA 1EZPA 2Z8EA 3TTLA 2G93A 2O51A 4OTEA 4F1YA 5AA2A 3TUSA 3TQWA 2ONSA 3TFLA 3C36A 4RNSA 5HM4B 1MQGA 3KN7A 1FCKA 2I58A 1B58A 3TEPA 4H6DA 1MG1A 3M3FA 2VD2A 4LZ8A 1QJMA 5I57B 1IEJA 2F5XA 3R6UA 1BKAA 2XX9A 3KBRA 1SI1A 4NF6A 4OFJA 2O7IA 2NXOA 5ICTA 1MPDA 2YJPA 4ESWA 3KJTA 3EN3A 4C0RA 4QHQA 1A99A 1DPEA 4G8NA 3KSXA 3OD7A 2QS2A 1DPPA 4E0WA 3TCFA 3E4RA 4H1XA 4OFOA 4I8CA 4G68C 4ZEIA 1B3EA 4XKQA 1URDA 1USYH 4XKNA 3A09A 2HAUA 2QMWA 3F11A 1HSLA 3MZBA 3HHFA 3K02A 4RYAA 3QAXA 3WAEA 1DMBA 1NNFA 3FXRA 1MY4A 3PPQA 2QS1A 4QFPA 3SDFA 4TOZA 3ZS6A 1Y9UA 4ESXA 4KHZE 3Q25A 5FHNA 1QKBA 4IB2A 4N07A 1XOCA 2DE2A 4FJPA 2XXQA 4YU0A 2F6PA 3KJ7A 5H8FA 2THIA 1B32A 1MS7A 4IGTA 2D21A 3UP9A 1NFTA 5TPAA 4IGRA 4MF3A 3OSQA 2QS3A 2QS4A 4OESA 2UVHA 2RCAA 1FQDA 4LA9A 1MXVA 1VSOA 1B0HA 2F35A 2V84A 3O97A 1JETA 4ECFA 1VFDA 3BFTA 3SETA 3N5LA 3BFUA 4ZEFA 5AA3A 1OQGA 3W15C 1FQCA 3HO7A 3H03A 3PGFA 1QUJA 4ELPA 3USDA 3O6GA 2D5WA 3Q26A 4QFLA 3E9XA 3W9WA 3RPWA 5KCJB 1RYOA 2DWHA 2O6AA 4BDMA 4U2RA 4H8JA 3HPIA 3P7IA 1JW1A 4C1TA 2RF1A 2LAOA 4IO2A 5F7VA 4ZDMA 2F36A 1A8FA 1B5IA 1ELJA 1IZ1A 4OQOA 2Y84A 3I6VA 2Q88A 1SQYA 5I2KA 2Y7KA 4F39A 3SESA 5JTYB 1TFDA 3CIJA 3MC2A 4NF4B 4QSCA 4AB6A 4EXLA 1H44A 1L5TA 4EF2A 4YAHX 2PBWA 4F1VA 2H99A 4LUBA 3PU5A 3C34A 1B1HA 1D9VA 5B70A 2ESNA 3BKIB 4GVOA 3KOSA 3KN8A 2I6EA 3SEYA 5KDTB 3EHTA 4U21A 2Q2CA 3TTRA 3OO9A 1Y1ZA 2W7YA 4F18A 1S50A 3KG2A 5EYFA 1LFGA 1UIUA 3TTMA 4DIGA 1J1NA 3B7DA 1UTBB 4NF5A 3FVGA 5I57A 1JW5A 2O68A 3VLUA 3H3GA 3M3LA 3GLBA 1FQEA 2HAVA 5AA4B 5ISUA 3MPKA 1JEVA 4EXKA 3KEIA 4F2OA 1B1XA 4R6KA 3G3IA 4H67A 1PC3A 1YAEA 4YB7A 2H25A 4PFUA 4BDQA 4OERA 3JZJA 4HTGA 2ZYNA 1GVCA 1P1WA 3W9VA 3K1NA 2NUVA 1H45A 1UQWA 2R71A 3C33A 4PFYA 5DEXB 4KD5A 3K0VA 5CI5A 1BLFA 4OMBA 2DVZA 4PP0A 1PDAA 1ATGA 4P11A 1AIVA 1N7XA 4OFLA 3SERA 1Z7ME 3PMVA 1MY2A 4OXVA 2H9BA 1B40A 5FTIA 2ANJA 2IEEA 3SEUA 1B51A 4YB6A 3O9PA 1SVXB 4KQPA 2PT1A 3KFMA 4G8HA 3G3HA 4ELOA 3FD3A 1S9TA 1VFEA 4JWOA 5HPQA 3ILUB 2XXPA 3G3FA 1JVYA 4FORA 3T9XB 2DQVA 3SEXA 2XXXA 2P1SA 3VVFA 3T9HB 5I59A 4OEUA 3T96B 3PV0E 3DP4A 1FQAA 3FJMA 4G68B 4YKJA 3T22A 1MDP1 3S9LC 2ZNTA 4G8MA 5B7DA 4XKRA 1LBCA 3Q28A 1UTHB 2XX7A 1NKXA 3UORA 1I6QA 1OVTA 1PBPA 5I58A 1UIVA 5ICQA 1FW0A 2A5TA 2ZYOA 3RY3A 2VOZA 1QW0A 3SKPA 3MVZA 1MQDA 1WDNA 1ZTYA 4EUOA 3FGSA 4O3BA 5A5XA 1H76A 2Y7WA 3LSWA 3RTWB 1VE4A 4Q5TA 5H8SA 2B3BA 2XD3A 3K6XA 4N13A 1OMPA 4TLLB 2OBGA 2FA7A 4QFKA 4WEDA 4FIMA 1LCTA 4JDFA 3MZ9A 1JEUA 3FXQA 2QPQA 2O84X 5FTHA 4GXAA 3O29A 1R1NA 3RNNA 4F22A 3IORA 1PB7A 1POY1 1MXZA 2F34A 1B3LA 4HCYA 2OJTA 2F6GA 1B3HA 1BIYA 1B2HA 2QMXA 1MXUA 3KSJA 3S9MC 3OSRA 3QXMA 1B7UA 4JSOA 1PEBA 1ZBMA 4THIA 4NF8B 3K6WA 3MUQA 1MPCA 5DT6A 3A3UA 4DCXA 2D3IA 2OK2A 3ILTB 4LZ7A 3O66A 5KDTA 4PE5B 1N84A 5H8QA 1A7LA 1M5DA 1Q35A 4P0GA 1B52A 4FECA 1NH8A 4KR5A 3K01A 1MM7A 2ZYKA 2V3QA 4R72A 3FVKA 4FEDA 2RC9A 2I4BA 4GLIA 3OEMA 5EHSA 1B5JA 3MVYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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