1MS7A

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-des-me-ampa at 1.97 a resolution, crystallization in the presence of zinc acetate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluR2 ligand-binding core complexes: importance of the isoxazolol moiety and 5-substituent for the binding mode of AMPA-type agonists
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor subunit 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A01
3RY3A 1IXHA 2PX1A 1A8EA 3O28A 4ZS9A 4I1DA 5DEXB 3O29A 4ZEIA 1LLSA 3TTLA 2ANJA 4JWXA 2B3FA 1O63A 2RF1A 4IO7A 4F18A 1SW5A 3RGYA 4FEDA 3OD7A 3CSBA 1SYIA 4TLLB 3K6UA 4YB6A 2QS2A 2Q8JA 4YU0A 5TPAB 3BBRA 1DSNA 1IZ1A 1MXVA 4R6KA 3T9HB 3OEKA 1RYXA 4LQ2A 2ONRA 1II5A 5BWJA 3H03A 1TT1A 4NE4A 1ANFA 1ZKBA 4XTCQ 1MQDA 5KZTA 3KBRA 3G3IA 3I6VA 3EHSA 5A5XA 2XXPA 4OQOA 5HM4B 1VSOA 1MXZA 2NWJA 3TCFA 1POTA 1MDQA 1JEVA 4MBPA 4R72A 4H67A 4XKQA 1MY2A 1MG1A 3IB2A 4O3AA 2DWHA 3TDJA 1IXIA 5KCJA 1R9LA 2XXQA 3C34A 5BUUA 2HZLA 3N5LA 4OHNA 5AA1A 1LGBC 1PB9A 5H8SA 1H76A 3ZKLA 3S9NC 2H5YA 4O3CA 4OENA 4FEBA 4QRZA 2XXIA 1PBPA 1QUJA 4YB7A 3UIFA 3W9VA 1R6ZA 2D21A 4BDOA 4U4XA 2DSFA 4PFYA 3OOAA 3N26A 1IUDA 2NOOA 4G4PA 3SETA 3TZAA 1P1OA 1PBQA 4R9GA 3Q29A 3TAJA 3UN6A 2RCAA 3JV9A 2OBGA 3FVGA 4H8JA 5CMBA 4KR5A 1BIYA 3KEIA 3HHGA 3PV0E 4H6DA 1M5CA 4LP2B 5TP9B 3OELA 4OEVA 1MY0A 4LQ5A 2Y7RA 3KSXA 2ZYOA 2IA4A 1QULA 4U23A 3UORA 1YTVA 4DIGA 3E4RA 1NNPA 3E13X 1I6QA 1SI0A 4UACA 3IOUA 2I3WA 4KFQA 5A5XB 3RLFE 5L9MA 3KJ7A 1OLAA 3O2AA 5ITOA 3WAEA 4WEPA 1AOVA 3T96B 2HXWA 1OVBA 1OVTA 3GBBA 4U1OA 5CM6A 4QFOA 3U1OA 1MXYA 3DELB 1DPEA 2YLNA 4U1ZA 4QFNA 1URSA 4YAHX 1B32A 3FJ7A 2AIXA 2I4CA 3FXQA 1M5FA 2F97A 3B6QA 4HCYA 5JTYB 5CMKA 3RT6B 3KGCA 1IQ7A 1Y3PA 1PB7A 1ZIUA 4RPOA 1IXCA 2HAVA 4H0WA 1DMBA 4JBZA 3M3KA 2XD3A 5AA2A 1F9BA 1QKBA 3DP8A 5AA3A 4RK9A 2E0SA 3IB0A 4OXVA 3MC2A 3PPQA 3K02A 3A09A 3SDFA 1B52A 2QMXA 1PEBA 3G3JA 4ELOA 4GXAA 3K1NA 4LUBA 4PFUA 2DVCA 3RN8A 1TXFA 4QF9A 4MFIA 2QS3A 4JSDA 2Y7PA 1B5IA 4YKJA 1LBCA 2F7AA 2V25A 3A3UA 1FTJA 3ONMA 4PP0A 4X48A 2F36A 3L6HA 1B3HA 3SEYA 1PDAA 4R75A 4NTLA 1A99A 3RNNA 1NNTA 4WKMA 4HS7A 3MZ9A 2I49A 3H6UA 3FV2A 3K6VA 2Q88A 2VOZA 4IY6A 1USYE 4TLMB 3TCGA 4DXBA 2PT1A 3C9HA 3CI8A 1NH8A 3VV5A 2UYFA 3KG2A 4PFWA 3EPEA 2I0CA 1Y1ZA 1JEUA 4IGRA 1GTKA 1D3KA 2UVIA 1KWHA 2HFBA 4F29A 3EQ1A 4KHZE 4DCYA 4KCDA 1DOTA 5HPQA 1MQGA 2O51A 3G7WA 1N04A 4YKKA 2RINA 1B5JA 3FZVA 4MH5A 2AYSA 4QSEA 1MQJA 3T9VA 1YAEA 1LBBA 3U93A 1FQCA 2O68A 5EYFA 4GVOA 1CB6A 5DEXA 3G3HA 3MQ9A 3CSGA 4WXJA 3SEXA 4QFLA 1XC1A 1MPCA 4OWDA 2VGQA 4R74A 1DTZA 2XXTA 4EXKA 4RXLA 1UIUA 4F3GA 1SW2A 3DLNA 4F1UA 3WAFA 4E0WA 3TKDA 3PD8A 2YPNA 1N0TA 1MH3A 3HSTA 2F5XA 3IX1A 2Q89A 2DXYA 3FJMA 4FORA 4AQ4A 4F22A 5CBRA 1ATGA 4HCWA 3SERA 2P2AA 3MBPA 2GRVA 4MLVA 3T9XB 3H6WA 1UTBA 3SEUA 4FE8A 1P99A 2ALUA 1FTMA 1LAGE 4QSDA 3H7MA 1URGA 4THIA 1Y3NA 4IO5A 4OETA 1VR5A 3TCHA 3IJOB 3IR1A 4X1DA 3MVXA 4OMBA 3VVDA 1Z7NE 3VXBA 1MXXA 3HN0A 2RC9A 2CZLA 2P0SA 4H5FA 4N13A 2XXWA 4RYAA 1QW0A 2QPQA 4ZDMA 1P1UA 1B3FA 3IO6A 2M8CA 1MY3A 1ELJA 1NH7A 2Q9TA 3MPLA 2FNCA 2O1LA 3O6HA 2RC8A 3CR9A 4R73A 1IITA 1B46A 1QKAA 1A40A 3UGWA 2HQ0A 3KN3A 4PFTA 2UVGA 3USDA 1ZTYA 3L6GA 5H8FB 3GBAA 4LZ5A 1VFEA 1B1XA 3PMXA 5FTHA 1JW5A 1AIVA 4F3BA 4O3BA 1A7LA 3KOSA 4Q8RA 3CFZA 3PUWE 3H6VA 4G8HA 1OQHA 1GVCA 1B7HA 5FHNA 3B6TA 3H3GA 3O97A 5ICQA 5TP9A 1B4HA 1MM6A 4IO6A 4YZZA 3ODBA 3GXAA 4PQJA 4GWOA 4EXLA 1IIWA 4DXCA 3RPWA 4FECA 2XXHA 1GR2A 1MPBA 3SEVA 2VP1A 2Y7WA 1I6BA 2W7YA 4P0GA 3PUVE 3K6XA 5CBSA 4G68A 1NNKA 1LAFE 1UTBB 4RY1A 3VXCA 1OLCA 4N07A 3E9XA 4GIZA 1O7TA 2I4BA 4EUOA 2DE3A 1LFHA 2UYEA 3PPPA 4HW8A 2R71A 3MJNA 3R26A 1S7YA 3O9PA 3VVFA 4JWOA 4BDRA 2D3IA 4OFOA 4JXIA 3MVWA 4QSCA 3MUQA 4F31B 2DS9A 3E3KA 4KYEA 1HSEA 3RTWB 1JQFA 2ESNA 5JTYA 1N7WA 1JW1A 1NKXA 2OWTA 5DVIA 3AXFA 4YMAA 4YICA 2GHBA 5TU0A 4ISUA 4OESA 3CRBA 2Z8DA 2QS4A 5I84A 1BLFA 5I2NA 4ESWA 3V8XB 5FHOA 1B7UA 4FJPA 4GFRA 2DWJA 3SEWA 2PT2A 1QUIA 4U21A 4YB5A 1EH3A 2X26A 3OO8A 1YCJA 3TODA 1B3GA 1XHYA 3QSLA 5F7VA 3MZBA 3S9MC 3KSJA 2DWAA 1JETA 2P1SA 2XX9A 3Q25A 3U72A 1B0LA 1PB8A 3QK6A 2NVUB 4FIMA 1NL5A 1M5EA 4BDNA 4NEDA 4LVQA 2QSXA 3QAXA 1OQGA 4G68B 3KOTA 4L17A 3ILUB 2Z22A 3BKIB 4C1TA 2Q2CA 3BFTA 4Q5TA 4ZEKA 3IJXB 1B0HA 2I0BA 4RA1A 3N94A 4PETA 2YJPA 3TFLA 4FATA 3HHFA 4YKIA 3C32A 4ZEDA 2QS1A 4OFLA 3FVKA 3HV1A 1DTGA 3KN7A 4ZZEA 4H8IA 1O64A 1MPDA 5CRYA 3G3FA 3EN3A 3PMVA 3TTKA 3FXUA 4OERA 4GOTA 2PMSA 3CVGA 2VD3A 2DE4A 3CFXA 4C1UA 3IAZA 1H45A 1TFDA 2A5SA 3K00A 2VHAA 2O7IA 1N7XA 3QYTA 4IO2A 2H9BA 1AL3A 1D4NA 5I2NB 4OYVA 4QFPA 3OENA 1FCKA 2V3QA 3MP6A 1H3DA 1N3XA 1SD3A 2REJA 3FVOA 4PE5B 4EDPA 2RCBA 3JZJA 3CG1A 4NF5A 1Q35A 5F1QA 3QUJA 2XXRA 4P11A 3T93B 5ELVA 4NF8A 4GF8A 1H44A 4G68C 2BJJX 3C4MA 4XXUA 3UK4A 4AB6A 3S4UA 1B9JA 3N6UA 3FUZA 1XVXA 2THIA 3T66A 2ZNTA 1OIBA 5CMCA 3RTFB 2XX7A 4KI0E 1SW4A 4IO4A 1MQHA 2Z8EA 5IKBA 2V93A 3Q26A 1FQDA 5FHMA 4F1VA 2F78A 2HCAA 3DM0A 1US4A 3ZKKA 2ONKE 5KDTA 1P1WA 5B70A 2Z8FA 3OO7A 3HO7A 1TFAA 2RKMA 4ZE8A 4BLAA 5CI5A 2DOJA 4EQ7A 3IK6B 3ZS6A 3TYHA 2HZKA 3MVYA 4IY5A 4I62A 4KPTA 4U22A 1FTOA 1IXGA 2I48A 1R1NA 1B5HA 2GFEA 1MY4A 3F11A 2QL3A 1B51A 2FYIA 4ZEBA 3FGSA 4U2RA 1P1NA 1VFDA 3Q27A 1MM7A 3TUSA 1ZMGA 4QHQA 2REGA 3PPOA 5H8FA 3RT8A 3TELA 4OFJA 1EZOA 4NF5B 5H8QA 2OK2A 4NF8B 1B7ZA 2OCUA 3OSRA 3OMBA 1DPPA 1S9TA 4FAJA 3GLBA 4BDLA 4IB2A 4Q30B 3VDFA 5DT6A 3BFUA 2G93A 1LAXA 3PUZE 2B65A 4R6HA 1URDA 3EHTA 3GZGA 4DDDA 2V3UA 4E0XA 3LBSA 3M3FA 4NMYA 5M2VA 3HCQA 3T9UA 4GXSB 5ISUA 3IOWA 3KFMA 4KCCA 4NF6B 4QFKA 3RQTA 3C31A 5B7DA 3VVEA 5KDTB 2F7BA 4OVJA 1B1HA 2H99A 1XVYA 4H65A 2ZXTA 4R2BA 1FQFA 1T0KA 3IOTA 1YPNA 3R7XA 5CC2A 4F1YA 5EHSA 2ZYNA 4NWDA 3DP6A 1GV8A 2I3VA 1D9VA 1FQEA 3MPKA 3OO9A 4EQ9A 2D5WA 1WVJA 3H06B 3Q28A 4JWYA 1IEJA 1CE2A 4P0IA 1L5TA 4DXUA 3G3GA 2ZMBA 4GQOA 3HPIA 3QIMA 5I58A 4YMBA 3QXMA 4ELPA 4LZ7A 1HSLA 3TTRA 4EF1A 1B3EA 4WEDA 5H8QB 3FATA 3O6IA 2Q2AA 5I57A 4BDQA 2O84X 2QRYA 4JSOA 1B2HA 1VE4A 2XXVA 1B6HA 4R6YA 2XD2A 2Y7IA 4XKNA 3QUFA 3TTMA 4KYDA 4F2QA 3N6TA 3TQWA 2B3BA 3ILTB 3KZGA 2XXUA 4Z7EA 2KLFA 2V3TA 2X7PA 1EZ9A 4LONB 1FTLA 2OLBA 1FTKA 3IORA 1H43A 3FJGA 2DVZA 4GD5A 4ZECA 1XS5A 3KN8A 5IAIA 4I9DA 4F2OA 1ZBMA 2ZYMA 4EF2A 3VLVA 2X7QA 1UQWA 3K1MA 1SW1A 3PUYE 1LSTA 2H98A 5L9OA 3VLUA 2PYYA 2XXYA 3KJTA 3S9EA 3K0VA 4C0RA 4M1VA 4XKPA 1MXWA 1MQIA 4UA8A 2ONSA 2Y7KA 1A55A 3IO4A 2DYXA 5H8HB 3O66A 1JNFA 2OJTA 3IB1A 2A5TB 3R6UA 3C36A 3CFLA 4Q0CA 3M8UA 3SESA 1NNFA 3W9WA 3PUXE 2AL5A 2F6PA 3PD9A 2HAUA 5I58B 4DLDA 2H4IA 4IO3A 1A8FA 4NWCA 2DWIA 1Y4CA 3S2VA 2WKYA 3RUMA 5I2KA 3D4GA 1I69A 1BKAA 1R9QA 2F7CA 5I57B 1Q1KA 5K2XA 4JB7A 2F8DA 4TOZA 2O1MA 3V83A 3LUYA 5ITPA 2ZNUA 4LATA 3S9LC 4R2FA 1EU8A 1I6AA 3FXRA 3A3CA 1B4ZA 5AA4A 1SYHA 1JW4A 2QJEA 4TQUQ 5CMMA 2O69A 5ICTA 4H5GA 4MF3A 2ABHA 4KQPA 4DE8A 2DP8A 1B3LA 3K6WA 4ZE9A 3LSWA 5AA2D 1S50A 5LOMA 2ZNSA 1MS7A 4POWA 1Y4TA 3EHUA 2QMWA 2GH9A 1LCFA 3IOVA 4ELQA 5J1DA 2V84A 5AE4A 3B7DA 2R9JA 1NFTA 3G3KA 4OEUA 3B6WA 4R9FA 4DCXA 1QUKA 3TTNA 3FV1A 4KD5A 5DVJA 4X9TA 2FA7A 1B58A 1M5BA 1TWYA 2XHDA 1UTHA 3OXNA 1Y3QA 4RK2A 3THIA 1NMUA 2G29A 4M4GA 3PU5A 3OSQA 3P7IA 2DQVA 1ZLQA 2R6GE 5KCJB 4POXA 1RKMA 3H6TA 4G8NA 3U92A 1QVSA 2F34A 2NUVA 3U94A 4XKRA 3LSLA 1FQAA 1HSJA 2OZZA 2NXOA 5HBCA 1ZU0A 3PMWA 4LA9A 1BP5A 3T22A 2I58A 5I2KB 3K01A 4X1BA 2IEEA 5H8NA 1OMPA 3IL1B 4RPNA 3MP1A 3FVNA 4ND9A 3M3LA 5FTIA 5DYHA 1PC3A 2UVHA 3C35A 4NF4A 3PPNA 3OEMA 3K2DA 1WODA 4DZ1A 3V89B 2HEUA 4OZ9A 1P1QA 5AA4B 1MDP1 1LB9A 4ZEFA 4F19A 4IGTA 4ONYA 1LFGA 1SQYA 3C33A 4ELRA 4HTGA 3ZSFA 4RNSA 3MZ1A 4OTEA 1A54A 4K3FA 4NF6A 3O6GA 5I56A 3FD3A 1MH4A 4G8MA 4ZZAA 1LB8A 1D9YA 4XIGQ 1MY1A 3TEPA 1RYOA 3CG3A 1USYH 1Y9UA 3FASA 4H1XA 4YKPA 1UTHB 5I59A 2DE2A 4GRKA 1WDNA 4EQBA 3I5OA 3SKPA 3JYRA 2F35A 4BDMA 1SDXA 2O6AA 4G2ZA 3VFJA 1LAHE 3OO6A 4LZ8A 1SI1A 1MXUA 3MWBA 3LSXA 2GHAA 4G77A 1Z7ME 2DXRA 4GL0A 3DP4A 1Y20A 1SVXB 2XXXA 3K4UA 2O7UA 1ZJLA 5JK4A 3MAMA 1UIVA 3FIRA 3VLWA 5DTBA 4AB5A 5DVFA 3TMGA 3W15C 1FQBA 4MLQA 5AA2B 3MP8A 5H8NB 4ESXA 4F39A 2RC7A 2I6EA 1US5A 1Y1MA 3UA8A 1SBPA 5L9SA 1AMFA 4NF4B 1LFIA 4F3PA 4Z0IA 2VD2A 1BTJA 3I3VA 2XX8A 1N76A 5EHMA 3EF7A 1AH5A 4GLIA 4I8CA 5TPAA 3U8QA 1N3WA 2F6GA 1JVYA 3TQLA 3TPAA 5JEIA 2LAOA 1EZPA 4N6PA 3K1PA 2Y84A 1XOCA 5I56B 1XT8A 2PBWA 3ECRA 3LC8A 3MW0A 2AL4A 4ECFA 3LSFB 1QJMA 1B05A 3PPRA 2OWSA 5I59B 4JDFA 5K2YA 3PGFA 4RJZA 3MVZA 1GGGA 3H4ZA 3V5AA 4U4SA 2E1SA 2PVUA 3LR1A 2Z23A 4KYSA 1N84A 1LCTA 1JVXA 4GL8A 5H8HA 1MRPA 2ZYKA 1J1NA 2UXAA 2A5TA 3D4CA 5L8DA 2CMOA 3CIJA 1B40A 2UVJA 1POY1 1M5DA 4F3SA 2H25A 1FW0A 3VE1B 3UP9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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