1MS7A

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-des-me-ampa at 1.97 a resolution, crystallization in the presence of zinc acetate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor subunit 2
publication title GluR2 ligand-binding core complexes: importance of the isoxazolol moiety and 5-substituent for the binding mode of AMPA-type agonists
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A01
3PPNA 1PEBA 1S7YA 1B51A 2ZYOA 3UIFA 3G3FA 3JV9A 2ZYKA 1B5JA 2F7AA 2VD3A 1B40A 4IO2A 3C31A 5F7VA 4DXBA 2XXWA 3C9HA 3KSJA 5BUUA 2WKYA 1IITA 1Q1KA 3I3VA 2CZLA 3S9NC 1B58A 3PMXA 2DWIA 4ZE9A 4QRZA 1MDP1 3CI8A 4X48A 3DP4A 2QS1A 2XXPA 5AA4B 2ZXTA 3P7IA 1PC3A 1O64A 1DPEA 4O3AA 3V5AA 3QIMA 4IO5A 4F2QA 3K6UA 2DYXA 2HFBA 2DQVA 2E1SA 2PMSA 2XX7A 4LQ2A 2O6AA 2X7PA 4U4SA 2LAOA 2YPNA 4OWDA 4U21A 4IGRA 3IJXB 4AB5A 1MQJA 3TUSA 3RTWB 3PMVA 5TU0A 3QSLA 3MAMA 5KZTA 1H43A 1WODA 3TCGA 4QFLA 3Q27A 1N3WA 3WAEA 3MQ9A 1M5FA 1NNPA 2XD2A 2HAVA 2NVUB 1FQFA 3SERA 4FATA 1QKBA 1IXIA 2VD2A 1M5EA 3IB2A 1JNFA 1GGGA 4H8JA 2KLFA 1EU8A 2I3WA 3IOVA 3G3HA 4F3SA 3T9UA 4I9DA 3VFJA 3FD3A 1LFHA 3IORA 2FYIA 2I58A 1AL3A 3KN3A 4O3BA 3PGFA 1QUKA 3LSWA 4LUBA 3VLUA 1PB9A 4POWA 3H7MA 1BIYA 3BFUA 5DVIA 2O1MA 1OIBA 3U72A 1DTGA 4YZZA 1MS7A 3Q29A 4WEPA 1M5DA 2HEUA 3FUZA 1OLAA 1Y3QA 2Y7WA 4RA1A 3G3IA 4DIGA 1URDA 3VVFA 3MWBA 4EQ7A 4N6PA 3QUFA 2F78A 1RKMA 3O29A 4ZDMA 3K0VA 3CSBA 2ALUA 4U1ZA 5HBCA 4LZ7A 1MQGA 3R26A 4KD5A 4H5FA 4R74A 5CMMA 1B5HA 3TTRA 1IIWA 1AMFA 1FQBA 4YMBA 3C36A 4F22A 3PPPA 4OQOA 3FATA 3ECRA 1B3GA 4ESWA 3O9PA 3N6UA 2F97A 2V84A 3H6UA 1MY2A 4FIMA 5DVJA 2RC8A 5ISUA 1FQDA 4NE4A 1PBQA 3LSLA 1Q35A 1IUDA 4G68A 2V25A 1OLCA 4GVOA 4P11A 1L5TA 4R9GA 5ICTA 3TTKA 4F31B 3K1MA 1JVYA 2F36A 5L8DA 4WKMA 1JETA 3PPRA 4ZE8A 3ODBA 4AQ4A 3U8QA 3Q28A 3O66A 4EXKA 5ITOA 2RC9A 5KCJA 4ZEBA 4LATA 3FXUA 3C4MA 3KOSA 2Y7IA 3W15C 4PQJA 1LB9A 3MZ9A 4YMAA 2RC7A 3B7DA 4QFOA 1IXGA 2H9BA 3K2DA 3PV0E 1B0LA 1GV8A 4GQOA 1SW1A 1EZPA 1O63A 4R2BA 4EDPA 2X7QA 5CI5A 3VVDA 4C1TA 1UIVA 4ELPA 2HQ0A 2IEEA 2OLBA 2QMWA 2HAUA 1A40A 4PP0A 3IO4A 4EF1A 4JWYA 3OEKA 3K6XA 3K01A 3KZGA 4G68B 2Y7KA 4FJPA 4F1VA 5L9SA 2NWJA 3SDFA 4R72A 4IO3A 2H98A 5I56A 4KQPA 3LUYA 4YICA 1A8EA 3O6IA 5ICQA 3T93B 2ONRA 4ZS9A 1ZLQA 1B46A 3TFLA 2RCBA 1IQ7A 1N04A 4OVJA 1XVYA 3IB0A 5CMBA 4OMBA 1H3DA 1S9TA 2NUVA 2XXHA 5KCJB 1B4ZA 3FVKA 2DWJA 1NNFA 3MUQA 3SEUA 4GXSB 4IB2A 4I62A 3RN8A 5AA1A 4EQ9A 1SI0A 1ZIUA 3V8XB 5KDTA 1MQDA 3N6TA 2YLNA 2XXRA 2R71A 1D3KA 2DWAA 2Y7RA 3MZ1A 3RQTA 1BLFA 1GR2A 2QS2A 4H6DA 5TP9A 4BDMA 3K02A 3MC2A 2UYEA 4GL8A 2DVZA 3MPKA 1JW1A 3T22A 3FV2A 1NMUA 2VGQA 4NF4A 5H8SA 3MVZA 1MPDA 2H25A 3H6VA 1ATGA 4OEVA 1LGBC 4DCYA 5I56B 1P1UA 1JEVA 1UIUA 4WXJA 1R9QA 4KYDA 1WVJA 1FTKA 2Q8JA 2I6EA 3S9EA 2ZNSA 1II5A 4AB6A 1NH8A 3MP6A 1KWHA 5DVFA 4F1UA 3D4GA 2I48A 3O2AA 3TCFA 3OENA 4F1YA 1ANFA 3Q25A 1AIVA 3BKIB 3H06B 2X26A 1I6BA 4POXA 5KDTB 4MLVA 2P1SA 3QXMA 3K6WA 2O51A 4KR5A 1EZ9A 2RINA 4ND9A 4YB6A 3RT8A 4H1XA 1UTHA 3Q26A 4RPOA 2O7UA 2ABHA 3SEXA 5K2XA 1BKAA 5TP9B 2V3QA 4IY5A 1ZBMA 3DP6A 2PX1A 2PBWA 1ZTYA 2I49A 1ZMGA 4RPNA 2F6GA 4X1DA 3TTLA 4H8IA 1OVBA 1LB8A 4NF4B 4EQBA 3CR9A 5L9MA 2P0SA 1IZ1A 3QAXA 2D3IA 4DDDA 2RF1A 1P1WA 4G77A 3H3GA 2QL3A 5BWJA 3FVNA 3OXNA 5CBRA 1SBPA 1QVSA 2BJJX 2OZZA 5L9OA 3OD7A 3G3KA 4H67A 3MZBA 4ECFA 1LBCA 3O28A 1GTKA 3PUZE 3RGYA 5A5XA 4HCWA 4JDFA 4PFTA 5TPAA 2M8CA 1LFIA 3FV1A 4F3PA 3OMBA 3THIA 1IXCA 2XXIA 2DE4A 4X9TA 1NNKA 1UTBA 3ILTB 3N94A 3UP9A 3KJ7A 1UTHB 3HHGA 4ZECA 4GFRA 3FVOA 1SDXA 1T0KA 3VE1B 1I6QA 3L6GA 3TTMA 2H99A 5K2YA 1N7XA 1TFDA 2QS3A 1MXUA 2R6GE 4C1UA 3TQWA 3BBRA 1LCTA 1AH5A 4YAHX 4R73A 3FJ7A 3SESA 4PE5B 1YAEA 3MW0A 3LSXA 3LSFB 4MFIA 5B70A 1ZU0A 1I6AA 5CMCA 3QK6A 4F39A 1OVTA 1NFTA 2XXQA 5A5XB 3KFMA 3OO7A 3ZS6A 5TPAB 3EHUA 1DTZA 4QHQA 1UTBB 1MH3A 3O6HA 1QJMA 3T66A 1SYIA 1Y20A 2D21A 4THIA 4TQUQ 1N76A 4UACA 1SVXB 1MPCA 4LQ5A 5I84A 4PFYA 1XT8A 4IO4A 3D4CA 5DT6A 3UN6A 3PUYE 1EH3A 4ISUA 3LR1A 4OHNA 1MQIA 2REJA 1QW0A 3U93A 2V3TA 4ONYA 3KOTA 2I4CA 5H8HA 1B4HA 4KYSA 4JBZA 2V93A 3RLFE 4U23A 3HHFA 3N26A 1HSEA 4MH5A 4NWDA 1Z7NE 4XTCQ 1Y3NA 4PFUA 3DM0A 1FTJA 4L17A 4ELOA 1FTOA 3LBSA 1NL5A 4M4GA 3FIRA 1J1NA 1Y4TA 5CM6A 4RY1A 1BP5A 4NMYA 4R2FA 3VVEA 1R6ZA 3KGCA 1MXXA 4XIGQ 3ILUB 4OESA 3T9VA 3RTFB 2VOZA 4LONB 2DXRA 5FTIA 3GLBA 1LCFA 2PT1A 3AXFA 1RYXA 3K6VA 2Z8EA 3OO6A 2XX8A 1SW4A 1MH4A 4R75A 2XXUA 3PD8A 1XS5A 2P2AA 1D9YA 3H6TA 2DXYA 5AA2D 5ELVA 3IAZA 3HCQA 3IR1A 5H8HB 2IA4A 1BTJA 1P1OA 2DE2A 2O84X 2O7IA 2UVGA 4HS7A 1QULA 2YJPA 4G2ZA 1B1HA 1USYH 1B2HA 4RK2A 3VV5A 2QPQA 3RPWA 1PB8A 1FTMA 4R6YA 2A5TA 2VP1A 5EYFA 4R6KA 2F6PA 3UORA 3DELB 2F7CA 1URGA 4BLAA 4OFOA 3OSRA 3CIJA 3FJGA 3L6HA 4GRKA 4Q0CA 1B3LA 2XXVA 1RYOA 3MVXA 4HCYA 1S50A 1XC1A 2ZNUA 4RYAA 5HPQA 2I0CA 1B5IA 1SD3A 4BDNA 4F18A 3KJTA 3VLVA 4F29A 3K1PA 4FECA 4OYVA 2DP8A 4LP2B 4LA9A 1VR5A 4Q30B 3DLNA 3HPIA 4OERA 2DVCA 1MY4A 3MBPA 5I2NA 3OELA 3MJNA 2HCAA 3TODA 2H4IA 4DCXA 3S4UA 3TELA 4U22A 2Q2AA 1I69A 2A5TB 1URSA 5DEXA 4RNSA 1CE2A 4DZ1A 1JQFA 5I2KA 3TAJA 4NF8A 2Q89A 3G3JA 1Y9UA 4X1BA 4O3CA 5JTYA 1XHYA 1A55A 2Z23A 4JSOA 3QYTA 4GOTA 4YKJA 4H5GA 2D5WA 1LAHE 3VXCA 4QSDA 4NTLA 1D9VA 5FTHA 1MXYA 1LLSA 3PMWA 1R9LA 1JW4A 2NXOA 3C32A 5FHMA 2CMOA 1QUIA 4DXUA 2XX9A 4ZZEA 5H8FA 2ANJA 4TLLB 2QMXA 4JSDA 1Y3PA 3HSTA 1H76A 2ZYMA 5I2NB 4KFQA 1TFAA 4H0WA 1P1NA 1LAGE 1EZOA 4FE8A 1AOVA 1QKAA 2AYSA 3FXRA 3UGWA 4M1VA 3KEIA 3ZSFA 1YTVA 5H8NA 5DEXB 4R6HA 4E0WA 4NF5A 1JW5A 3FVGA 2B3FA 5I2KB 1MY1A 2Z8FA 4NF8B 3UK4A 5I57A 5H8QA 4E0XA 3PUXE 3SEVA 3TDJA 1ZJLA 3G7WA 3R6UA 5JTYB 2RKMA 3SEYA 4PETA 1SI1A 2XHDA 2DE3A 5HM4B 3DP8A 3EHSA 5F1QA 2B3BA 5M2VA 3CFXA 1F9BA 4F3BA 4RK9A 1H44A 4MLQA 3M8UA 4DLDA 1GVCA 1SW5A 4LZ5A 1VFDA 2QJEA 1MQHA 4RXLA 2I0BA 1DOTA 3MP1A 3IOTA 1QUJA 5H8FB 4BDQA 3M3FA 4UA8A 1FCKA 2AL4A 3C34A 4U2RA 2GHAA 2Q9TA 2O69A 4F3GA 5I58A 1TT1A 3S2VA 4GF8A 3ZKKA 1NKXA 3HV1A 1FW0A 3EN3A 1ELJA 1US4A 4G8NA 5H8NB 4WEDA 3T9XB 2OJTA 3B6TA 4NF5B 5AA2A 3TTNA 4XKQA 3HO7A 3PUWE 3IOWA 2ZYNA 2RCAA 4ZZAA 3G3GA 2V3UA 5I57B 5H8QB 2NOOA 3TPAA 4YU0A 2R9JA 3I6VA 4QF9A 4DXCA 4ELRA 3CVGA 4FORA 4OFJA 3RT6B 1ZKBA 3K1NA 3IOUA 4GLIA 3MVWA 3KBRA 3PD9A 3VXBA 4RJZA 3VDFA 4ZEIA 3C35A 5CBSA 3JYRA 2F7BA 2ONKE 4KYEA 3SEWA 4HW8A 5LOMA 4NEDA 1MXVA 1B1XA 3U94A 1R1NA 1YPNA 3T96B 3KN7A 3S9LC 1MDQA 4ZEFA 1A7LA 4YB5A 3TQLA 1MRPA 2UXAA 4IY6A 1B7UA 2VHAA 3M3LA 1N0TA 4FEDA 3CSGA 4K3FA 3OEMA 5I58B 4IO6A 1MM7A 3FZVA 1B7HA 2I3VA 4U1OA 1B3EA 2PYYA 4YB7A 1PB7A 3N5LA 4G8HA 3M3KA 3CG3A 5AA2B 4JWXA 2OK2A 3S9MC 2E0SA 4QFKA 2O1LA 4OTEA 1N7WA 3OO9A 1FQAA 4KI0E 4EF2A 4Q5TA 3TZAA 3CFZA 3TCHA 5DYHA 3OO8A 1US5A 2GH9A 5CRYA 4MF3A 4NF6A 5CMKA 1B52A 3EQ1A 2F34A 3K4UA 2A5SA 2GHBA 3FGSA 3MP8A 4OXVA 4GIZA 4G8MA 3U92A 4N07A 2XXXA 3E9XA 3JZJA 4FAJA 5I59A 4EUOA 4G4PA 4YKKA 2ZMBA 3KSXA 1MM6A 2UVIA 1IXHA 1VE4A 4QSEA 1JVXA 3BFTA 4GL0A 4XKRA 2ESNA 2PT2A 2G29A 1H45A 3A3UA 2F5XA 3LC8A 1Y1MA 4U4XA 1MG1A 4XKNA 4Q8RA 1USYE 4R9FA 4GXAA 1Z7ME 4G68C 2OBGA 1LBBA 3FJMA 3PPQA 3SETA 2I4BA 3OSQA 3PUVE 2O68A 5EHMA 4TLMB 2Z8DA 4QFNA 3HN0A 3PU5A 1XOCA 3K00A 2PVUA 1LFGA 3A3CA 4HTGA 4KHZE 1P99A 1MXWA 3E3KA 4BDRA 1XVXA 1B6HA 4JXIA 1B0HA 4OEUA 1WDNA 1FQEA 4NF6B 1POTA 3EPEA 2AL5A 1DPPA 4XKPA 4BDLA 4F19A 3IL1B 2UVHA 2Q88A 1Y1ZA 2UYFA 3MPLA 5I59B 1N84A 3O6GA 1N3XA 3TYHA 1P1QA 4Z7EA 4EXLA 1Y4CA 4OENA 3RUMA 4MBPA 3TEPA 3SKPA 2Y84A 4IO7A 3IK6B 4H65A 2QRYA 2FA7A 4OETA 1FQCA 2HZKA 3EF7A 4ZEKA 1M5BA 3IB1A 4P0IA 3FASA 2QSXA 1LAXA 1D4NA 4BDOA 5AE4A 3ONMA 4QFPA 5FHOA 4LVQA 3CG1A 5AA3A 1DMBA 5B7DA 2FNCA 3MVYA 1TXFA 3KN8A 1A54A 2XD3A 3RNNA 1VFEA 2DSFA 4ELQA 1NH7A 4KCDA 3W9WA 3H6WA 3GXAA 1YCJA 1PBPA 1IEJA 3IJOB 1B9JA 2XXYA 4FEBA 2REGA 1B32A 5FHNA 4OZ9A 3F11A 3H03A 5IAIA 1A8FA 3O97A 4KCCA 2Q2CA 1HSJA 5DTBA 5ITPA 1JEUA 3B6WA 1M5CA 1LSTA 2DS9A 1OQHA 2G93A 1OMPA 2XXTA 1LAFE 3IO6A 3QUJA 2H5YA 2DWHA 3T9HB 1B05A 4KPTA 2F8DA 3TKDA 4Z0IA 5CC2A 3E4RA 1SYHA 3U1OA 4TOZA 1HSLA 3EHTA 3C33A 1CB6A 4DE8A 2GFEA 4P0GA 3IX1A 4ZEDA 1POY1 3GBAA 5IKBA 1DSNA 3B6QA 2OWTA 4JB7A 3V83A 2Y7PA 3RY3A 5JK4A 1NNTA 4N13A 4F2OA 4ESXA 4GWOA 3CRBA 4XXUA 2AIXA 2W7YA 2ZNTA 4I1DA 1B7ZA 1MY3A 2HZLA 3WAFA 2OWSA 4LZ8A 3OOAA 1O7TA 3FXQA 1B3HA 3E13X 3VLWA 2ONSA 4IGTA 4GD5A 4OFLA 4YKIA 3CFLA 4NWCA 1MXZA 4PFWA 5JEIA 1PDAA 2F35A 4QSCA 3UA8A 4YKPA 3TMGA 2DOJA 2GRVA 1A99A 3ZKLA 1OQGA 3USDA 2B65A 4I8CA 5AA4A 2Z22A 3GBBA 3H4ZA 5EHSA 3A09A 2THIA 1VSOA 3KG2A 3R7XA 4JWOA 1TWYA 1FTLA 2UVJA 2OCUA 1SQYA 1MPBA 1UQWA 2HXWA 1SW2A 3PPOA 4C0RA 1MY0A 3GZGA 3W9VA 1B3FA 2QS4A 3I5OA 5J1DA 3V89B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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