3QYTA

Diferric bound human serum transferrin
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
VPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal transport
publication title Iron and bismuth bound human serum transferrin reveals a partially-opened conformation in the N-lobe
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
total genus 204
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA03
5L9MA 2ZXTA 1JEVA 1SQYA 2RCAA 4GD5A 3K2DA 3IORA 3TYHA 4UA8A 3MWBA 4FAJA 4LQ5A 5DVIA 2ONSA 4F29A 3SEWA 4ISUA 1S7YA 1AOVA 2F78A 5AA2B 2M8CA 3S9LC 1CB6A 1LB9A 2FYIA 3SERA 2F7AA 2V3QA 1AL3A 1LAGE 3WAEA 3I6VA 3OEKA 5ISUA 1QUIA 4KPTA 3MW0A 1ZMGA 4EDPA 1NKXA 3Q28A 5H8QA 1FQDA 4GXSB 2QPQA 3K02A 3KJ7A 1ZBMA 2H4IA 1ELJA 4QHQA 4OTEA 4G8MA 4PQJA 2UVJA 1SW1A 4Q8RA 4ZEIA 3UK4A 2THIA 2DWJA 5JEIA 3RT6B 5A5XA 3L6HA 1LAXA 1YPNA 4MF3A 3H6WA 5H8QB 3C32A 4YB6A 3HCQA 3IB2A 4NF5A 4DE8A 1P1OA 1EZOA 4PFWA 1II5A 2UXAA 3MBPA 3OO9A 3U93A 2HXWA 2NWJA 1R9QA 4X1BA 3MPLA 2DYXA 4EF1A 4GXAA 2DWAA 3SKPA 2RC8A 5KCJB 4FORA 2I48A 2DSFA 5EYFA 4KI0E 1SW2A 2XXYA 5A5XB 4OZ9A 2BJJX 2Q88A 2QSXA 1N3WA 3G3JA 3LC8A 1B5JA 3FV2A 1B5HA 4WKMA 3TODA 1GV8A 2GHBA 4NF5B 3S9NC 3T22A 3UORA 1N0TA 4C1UA 2HAVA 3MUQA 4H65A 2OK2A 1GTKA 3CFLA 1ZLQA 3V89B 1T0KA 5CMCA 1B52A 3DP6A 1R1NA 4GVOA 3C36A 4PFTA 2XXIA 3V5AA 3Q27A 3N26A 4KYEA 1QJMA 2F6PA 4F3SA 1SD3A 3E9XA 1PBPA 3B6WA 4BDNA 4BDLA 3FASA 1PEBA 4ELQA 3MP1A 5I2NB 2XD2A 4F1VA 4GQOA 1TWYA 4YAHX 4BDRA 4QFNA 4EXKA 4ZEFA 3MAMA 2HFBA 3BKIB 3FIRA 1I6QA 1O63A 3VLUA 5BUUA 3PV0E 4F1UA 4R9GA 1LCFA 1POTA 3EN3A 4HCWA 1P1WA 3SEXA 1H3DA 2GFEA 3OENA 4O3BA 4EUOA 3TCFA 1B7ZA 3OMBA 3TQLA 4U22A 3C35A 3SEYA 1MXYA 4GWOA 4E0WA 4MFIA 1I6AA 2XXRA 1MPBA 3K6WA 5HPQA 2HEUA 1FTMA 5CMKA 4I8CA 2RCBA 1IUDA 2ZMBA 3FJMA 3LSXA 4OENA 1A99A 3KOSA 4I9DA 2NOOA 1J1NA 2VP1A 4RK9A 2P2AA 3PPPA 3M3LA 3M3FA 2D5WA 4UACA 3EHTA 3QK6A 1MPCA 5CRYA 3EHSA 2O51A 1QULA 3QSLA 4H5FA 4KYDA 4ELOA 2IEEA 4HCYA 5F1QA 3G3GA 4C1TA 5FTIA 3T9XB 1S9TA 1A40A 3IX1A 3TELA 1YCJA 4R6HA 3ONMA 1B7HA 1QKBA 4EF2A 4H6DA 5AE4A 3EHUA 1B58A 4ZEKA 3E13X 3MZ9A 3KN8A 4M4GA 2Q9TA 3BFTA 4OETA 4JSOA 3CSGA 4LP2B 1O7TA 4OFLA 3P7IA 3U72A 1L5TA 1JNFA 4GL8A 5I58A 1MG1A 1H45A 4H5GA 2VD3A 2ONRA 2F7CA 4R72A 4YMBA 1M5DA 3WAFA 1B32A 3H4ZA 3K6UA 2XXVA 3KOTA 1GVCA 2F8DA 4OFJA 2F36A 2HZKA 3MC2A 4L17A 4U4XA 1US5A 3UIFA 3DP8A 1IXIA 4TLMB 3N94A 2DVZA 2LAOA 4KD5A 4XKNA 1FQAA 2PYYA 3TMGA 3CIJA 3TKDA 2O7IA 1B3EA 3PMXA 3BBRA 3K01A 1JVXA 2O68A 5I58B 3OO8A 4JXIA 2G93A 3ILTB 4G68C 3MQ9A 1SDXA 4RA1A 4EXLA 2QL3A 4ZEBA 3TAJA 4XIGQ 1R6ZA 3DM0A 3CVGA 3G3FA 3FXRA 3ECRA 3MP6A 3FGSA 4XKRA 5K2XA 5KZTA 1LFHA 5CMBA 1OVBA 2Y7PA 1MY0A 2XXWA 1Q35A 2F97A 1DSNA 3ILUB 4AB6A 3CI8A 1FTLA 3QXMA 1B4HA 1NMUA 3H03A 2P1SA 3IL1B 3SETA 1D4NA 3QIMA 3N5LA 2UYEA 3OSRA 4U21A 1LFIA 5ITPA 1LSTA 4QFKA 1MRPA 3MP8A 4N13A 1MQJA 3K00A 3M8UA 4POXA 3PPRA 4PFUA 4KCCA 4PE5B 2IA4A 3LR1A 1NH7A 1B3HA 3H6UA 3V8XB 3VE1B 1A7LA 3PUYE 4YB5A 2Z8FA 1NNFA 5TP9A 2GHAA 1OIBA 3RNNA 4DIGA 1M5CA 5KDTA 4NF6B 4X1DA 3C33A 4OEVA 3O29A 4Z7EA 1H43A 3T93B 1B51A 5L8DA 2I4CA 4KR5A 4ZZAA 4NWDA 1NFTA 2O1LA 1B1XA 3LBSA 1MXZA 2I49A 3IB0A 2OWTA 1XOCA 2PBWA 1DTZA 1US4A 2I0CA 3IB1A 3IAZA 5TP9B 5DTBA 4X48A 5JTYA 5KDTB 2YPNA 1YAEA 1EH3A 5AA4A 4IO4A 4H0WA 1XHYA 4TOZA 5IKBA 2PT1A 3THIA 2Y7WA 4RPOA 1IITA 3G7WA 3TPAA 1DPEA 3RTFB 2E1SA 3PPNA 4ZECA 3FD3A 4OWDA 4IO6A 3VFJA 4GOTA 4JWXA 4U1OA 5JTYB 5AA4B 1A8FA 4GF8A 3VVDA 1SBPA 1JETA 1Y1ZA 4TQUQ 4F31B 1XS5A 3UA8A 1Y1MA 4ZS9A 5H8NA 1DMBA 3G3KA 3DP4A 1FTKA 3G3HA 2ZYKA 1SW4A 2I0BA 3MVXA 2REGA 2F5XA 2QRYA 1IXCA 1IEJA 4ND9A 1XT8A 1QVSA 3TEPA 4YICA 4R9FA 3O97A 3JZJA 3FVNA 4F19A 4LATA 1OVTA 5DVFA 1EZPA 4THIA 2D3IA 3QUJA 1B4ZA 1JQFA 3R6UA 3RTWB 4LQ2A 4IO2A 3ZS6A 4FEBA 3GBAA 3HHFA 5H8NB 4IGRA 4KYSA 2XXPA 2AIXA 3SESA 3K6VA 1BKAA 2H98A 1IZ1A 4U23A 3FATA 3VLVA 4DXCA 4M1VA 3OD7A 1URDA 4JDFA 4DLDA 3TTMA 2A5TA 3PUVE 3T66A 1OQHA 3RLFE 2VHAA 1FW0A 5AA1A 5AA2D 3N6UA 2QMWA 4H1XA 3QYTA 4ZZEA 4MLVA 1MY2A 2O84X 4FIMA 4IO5A 4IGTA 2DE2A 2GH9A 3C31A 4Q30B 1LAHE 1UTHA 3FJ7A 3KSXA 4OVJA 2O69A 1OLAA 3GXAA 4F2QA 1MQGA 3PD8A 4LONB 1PBQA 5B7DA 1TT1A 2Q2CA 4G68A 1OQGA 1MM7A 2ABHA 4GLIA 1POY1 1RYXA 2R71A 3SEVA 3TTKA 3DELB 4RY1A 4IY5A 5DEXA 4KCDA 3GBBA 3HSTA 4XTCQ 4FJPA 2ONKE 2VD2A 4PETA 4MLQA 1TFAA 4OMBA 1Y4TA 1B05A 4ELRA 2OBGA 1I69A 3G3IA 3MVWA 3W9VA 4G68B 4FEDA 2I58A 1IXHA 3I3VA 1ANFA 5ICTA 3K4UA 1BIYA 3KBRA 3S2VA 3FV1A 5J1DA 2H99A 4KQPA 1AIVA 2I3WA 1YTVA 3PPOA 3N6TA 1XVYA 4IO3A 4GIZA 3FZVA 3RPWA 2W7YA 4LA9A 4BDMA 3KG2A 3KJTA 3W9WA 3IOVA 3PD9A 1B46A 1VR5A 1M5EA 4LZ5A 4DCXA 5I57A 2XX9A 3EF7A 1MQHA 3RN8A 1WVJA 1DOTA 2X7PA 4NE4A 3JV9A 1JW1A 1Y4CA 1N3XA 3FUZA 3CRBA 2B3BA 2R6GE 4NMYA 2V25A 2I4BA 2F35A 3TCHA 2RC7A 5IAIA 4WEPA 1A8EA 4ZE8A 1OMPA 2O1MA 4QFOA 4QSDA 4F39A 1D9YA 4RYAA 3IJOB 1JW5A 4F3BA 5ICQA 4G8HA 2HAUA 3PPQA 4DXBA 2PT2A 2REJA 5I56A 1QUKA 2HCAA 2VOZA 1N7XA 2ZYNA 3MZBA 1UIUA 5TU0A 4E0XA 1LLSA 4OESA 4OHNA 4IO7A 5I2KA 4ESWA 5BWJA 2DP8A 3A3UA 3H6VA 3RQTA 1NNPA 4OQOA 3IO6A 4LVQA 1B3FA 2DE3A 4K3FA 4RK2A 4QRZA 4Q5TA 1FTJA 5FHMA 1RKMA 3C4MA 2AYSA 2OWSA 5F7VA 3MVZA 5I56B 5CC2A 1SW5A 1VFDA 4H8JA 1Q1KA 2V3TA 2QS1A 1VFEA 1HSEA 3K6XA 3L6GA 1USYH 2ZNSA 1S50A 3TCGA 5I2KB 1KWHA 4ONYA 2R9JA 3IOTA 3I5OA 5DYHA 4HS7A 1PC3A 5H8SA 5HBCA 1RYOA 1LBCA 4XKPA 3OOAA 4OERA 3GZGA 3AXFA 2HQ0A 2DWHA 2VGQA 1B9JA 5DVJA 4GFRA 3MJNA 3KSJA 3O6HA 2DXYA 5I84A 4R2BA 1MY3A 3OO6A 3S9EA 3FVKA 3CFXA 1A54A 4MH5A 1ATGA 1MQDA 1JW4A 2H25A 3O28A 4O3CA 1GGGA 2O6AA 1UQWA 4OYVA 4F3PA 1DTGA 3ODBA 4R6KA 2WKYA 1M5BA 5HM4B 4P11A 3QAXA 3A09A 5I59A 3H7MA 2XXXA 2ZNTA 1QW0A 3MZ1A 2E0SA 2F34A 3CG3A 3IOWA 2B3FA 2XX8A 3RGYA 1URGA 4YB7A 4RJZA 3F11A 3UGWA 4U2RA 3VVFA 2DE4A 3H6TA 1Y20A 2XX7A 5CBRA 2F7BA 3HHGA 3OO7A 3FVOA 4R6YA 1ZJLA 3M3KA 3R26A 3BFUA 4R74A 5L9OA 2I3VA 2QS2A 2ANJA 3O6IA 3VXBA 4N07A 3OSQA 1FQCA 5I59B 3ZKKA 3E3KA 4IY6A 2O7UA 1B3LA 2D21A 4DCYA 1LCTA 3MVYA 5H8HA 4FECA 4AQ4A 3PUZE 4POWA 4EQBA 1N84A 1MDP1 4I62A 3RUMA 2Y7KA 4G8NA 3T9HB 4DZ1A 4IB2A 4AB5A 1TFDA 2DQVA 1VE4A 3CFZA 4LUBA 1N76A 4Q0CA 3O66A 5CBSA 3EPEA 3T96B 3S4UA 2ZYOA 3PMWA 2Z8DA 4NF8A 2QS4A 1B6HA 4U1ZA 4Z0IA 5ITOA 3LUYA 5H8HB 1B40A 4KFQA 4HTGA 2YJPA 3SDFA 2OZZA 5M2VA 1ZTYA 4NTLA 1MXUA 2P0SA 3B6QA 1IXGA 3D4CA 5KCJA 1FCKA 4YKJA 1VSOA 4PFYA 1P99A 2DS9A 1PB8A 3CG1A 3PUXE 1LBBA 3K1PA 1H76A 2DXRA 1XVXA 2Y7IA 4JSDA 4R2FA 2GRVA 4TLLB 4NF8B 4ZE9A 2H5YA 2V93A 2ALUA 1QKAA 1B3GA 3ZKLA 2RINA 3U1OA 2PMSA 1NNTA 3VVEA 3B7DA 5H8FA 4OXVA 1QUJA 1D3KA 4PP0A 3H06B 3LSWA 5ELVA 2PVUA 1AH5A 3VXCA 1MPDA 4RNSA 4G4PA 2CZLA 4NF4A 4H8IA 1B2HA 2F6GA 3Q26A 4QSEA 2Q89A 4EQ7A 2NVUB 4QSCA 1FQBA 3U8QA 2V84A 4KHZE 4P0IA 3H3GA 2QS3A 5I2NA 2ZNUA 1MY4A 2XHDA 3HPIA 1R9LA 4LZ8A 2A5SA 3KGCA 5H8FB 3TZAA 5EHMA 3JYRA 1AMFA 1Z7NE 3O9PA 2Z23A 1B1HA 4ECFA 4F18A 3C9HA 3FXQA 1SI1A 3LSLA 3C34A 1LFGA 3Q29A 4YZZA 4NF4B 4YKIA 4XXUA 1PDAA 3S9MC 1TXFA 4RPNA 3TUSA 3B6TA 4JWOA 2OJTA 1MXVA 1O64A 1SYHA 1FQEA 1B0LA 4GL0A 4F22A 3RY3A 3T9VA 5TPAA 2XXHA 5JK4A 4NWCA 2UYFA 2A5TB 1MS7A 1P1UA 3GLBA 3IOUA 3T9UA 3Q25A 3MPKA 1B0HA 1JEUA 1Y3NA 2QJEA 1MH3A 3U94A 1IIWA 1N7WA 1PB7A 3D4GA 3SEUA 1UTHB 5CI5A 1Y3QA 4BDQA 3CSBA 2DOJA 5TPAB 2B65A 2XXTA 3OEMA 2UVIA 1EZ9A 1H44A 4OFOA 2AL5A 5DEXB 1LAFE 4YKPA 1UIVA 2AL4A 3VDFA 1NNKA 4C0RA 3TQWA 2X7QA 3OXNA 2V3UA 3FJGA 1MY1A 5EHSA 3K1NA 1Y9UA 2Y7RA 4F3GA 3KN7A 2RF1A 4F1YA 4U4SA 5FHOA 5B70A 4ZEDA 1NL5A 1OLCA 3E4RA 3W15C 5AA3A 4XKQA 2FNCA 2CMOA 3TTRA 4P0GA 2OLBA 3PU5A 1ZU0A 1SVXB 4O3AA 2Q8JA 2H9BA 3UN6A 1DPPA 1WODA 4BDOA 1FTOA 4F2OA 3HO7A 3LSFB 2RKMA 3VLWA 4YKKA 4LZ7A 2UVHA 3EQ1A 1LGBC 4I1DA 1HSJA 3KZGA 4DDDA 5CMMA 2YLNA 3TTNA 5FHNA 4WEDA 2Z22A 3TFLA 2PX1A 1HSLA 3KN3A 5I57B 1B7UA 4R75A 5DT6A 2X26A 1BLFA 2HZLA 2XD3A 3CR9A 4ZDMA 1BTJA 1Z7ME 3DLNA 4RXLA 4YMAA 4QFPA 3KFMA 3O6GA 4JBZA 3ZSFA 1ZKBA 2Y84A 2Z8EA 4G77A 1MDQA 3TTLA 1NH8A 1MXXA 3PMVA 2QMXA 3FXUA 3OELA 3IK6B 4JWYA 4BLAA 1EU8A 4HW8A 3R7XA 1CE2A 4QF9A 3IO4A 3RT8A 3QUFA 3K0VA 4R73A 3A3CA 3PGFA 3U92A 1URSA 1FQFA 4NEDA 3HN0A 1I6BA 5CM6A 3K1MA 1MM6A 4WXJA 2G29A 3KEIA 3IR1A 1M5FA 3FVGA 4G2ZA 2DWIA 1WDNA 4DXUA 2ZYMA 1MH4A 2KLFA 1USYE 5L9SA 2XXQA 1SYIA 1MXWA 3V83A 3IJXB 4OEUA 5K2YA 1A55A 2DVCA 3O2AA 2NUVA 1D9VA 3TDJA 3UP9A 4FATA 1UTBA 4FE8A 4GRKA 1XC1A 2XXUA 2ESNA 3USDA 1N04A 4ELPA 2Q2AA 4NF6A 1IQ7A 2NXOA 1SI0A 4N6PA 2FA7A 5FTHA 1Y3PA 2OCUA 1P1QA 2I6EA 1F9BA 4YU0A 3VV5A 2RC9A 1GR2A 4ESXA 4JB7A 4EQ9A 1UTBB 3PUWE 1LB8A 1JVYA 4H67A 5LOMA 4X9TA 1B5IA 1ZIUA 1MQIA 4QFLA 5AA2A 3HV1A 1P1NA 1PB9A 4MBPA 1BP5A 2UVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5L9MA 2ZXTA 4O7IA 1JEVA 1VDWA 1SQYA 2RCAA 4GD5A 3K2DA 3IORA 3TYHA 4UA8A 4N91A 3MWBA 4FAJA 4LQ5A 5DVIA 2ONSA 4F29A 3SEWA 4ISUA 1S7YA 1AOVA 2F78A 4NG7A 5AA2B 2M8CA 3S9LC 2P3VA 1CB6A 1LB9A 2FYIA 3SERA 2F7AA 2V3QA 1AL3A 1LAGE 3WAEA 3I6VA 3OEKA 5ISUA 1G0IA 1QUIA 4KPTA 3MW0A 1ZMGA 4PFBA 4EDPA 1NKXA 3Q28A 4PAIA 5H8QA 1FQDA 4GXSB 2QPQA 3K02A 3KJ7A 2QVRA 1ZBMA 2H4IA 1ELJA 4QHQA 1FBPA 4OTEA 4G8MA 2XWOA 4PDDA 4GWUA 4PQJA 2UVJA 1SW1A 4Q8RA 1K9ZA 4ZEIA 5A5LA 3UK4A 2THIA 2DWJA 5JEIA 3ISPA 4MCOA 3RT6B 4N4UA 5A5XA 1NV5A 3L6HA 1FPJA 1DK4A 1LAXA 1YPNA 4MF3A 1Q9DA 3H6WA 2DDKA 5H8QB 4P9KA 3C32A 4YB6A 2CEXA 3HCQA 3IB2A 4NF5A 4DE8A 1P1OA 1EZOA 4PFWA 1II5A 2UXAA 3MBPA 3OO9A 3U93A 2HXWA 2NWJA 1R9QA 4X1BA 3MPLA 2DYXA 4JVIA 4HE2A 4EF1A 4GXAA 2DWAA 5ET6A 3SKPA 2RC8A 5KCJB 4FORA 2I48A 4PCDA 2DSFA 2PFYA 5EYFA 4MAGA 4KI0E 1SW2A 2XXYA 2CZHA 2Q74A 5A5XB 4OZ9A 2BJJX 2Q88A 2QSXA 1N3WA 3G3JA 1CNQA 3LC8A 1B5JA 3FV2A 1B5HA 4WKMA 3TODA 1GV8A 2GHBA 4NF5B 3S9NC 3T22A 3UORA 1N0TA 4P8BA 1FPDA 4C1UA 2HAVA 3MUQA 4DI3D 4H65A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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