3QYTA

Diferric bound human serum transferrin
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
VPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title Iron and bismuth bound human serum transferrin reveals a partially-opened conformation in the N-lobe
pubmed doi rcsb
total genus 204
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA03
1MM6A 1TFAA 3PUXE 4G2ZA 4YU0A 3H3GA 4MLVA 3EHUA 1FTOA 4BDRA 3SERA 4NWCA 3T93B 4LZ7A 5AA2D 1N7WA 3TDJA 4GWOA 4QFPA 3TAJA 2ONSA 1YAEA 5BUUA 3L6HA 1B05A 5TPAB 1ZU0A 1NMUA 3JYRA 1B7HA 2QJEA 2XD3A 1B3EA 2YLNA 3S9MC 2A5SA 4KD5A 2F6GA 3IORA 4LQ2A 3RQTA 3I6VA 3H7MA 1UIVA 4F18A 4IGRA 2V84A 3IX1A 4GXAA 4ZDMA 4QF9A 4OTEA 3FXUA 3QAXA 2B3FA 2DWAA 2QS3A 2QRYA 4F22A 1SYHA 1LCFA 3QXMA 2AL4A 4XKRA 1NL5A 3UGWA 2D5WA 3UORA 2A5TA 3D4CA 4U2RA 1Y3QA 5K2XA 1YPNA 3FJ7A 1PEBA 1DPPA 4R6HA 2GHAA 1BKAA 4JWOA 1PDAA 3EF7A 1FQDA 3BBRA 3OSQA 5H8SA 3U72A 1MPDA 1PB9A 4H5GA 3G3IA 1PC3A 1JW1A 1VR5A 4G68B 4RK2A 2G93A 5I58B 4WXJA 1D4NA 1JETA 2XXIA 1EZOA 1B5IA 4GOTA 4TOZA 3IOTA 1HSJA 2THIA 3CFLA 4R75A 3Q28A 4ZEKA 3O97A 2XXPA 4LVQA 2XX9A 3P7IA 3QUFA 4ZEBA 2OZZA 3PUVE 5DT6A 1SDXA 3FVGA 4DXUA 2F6PA 3V89B 3K6XA 4JB7A 3PPPA 4ESWA 2I6EA 3IAZA 3I5OA 1LGBC 4OMBA 1SI0A 3OSRA 2RF1A 4YKKA 4GF8A 3C34A 2KLFA 3S9NC 2ONKE 2DSFA 1A40A 3FD3A 3CVGA 4GVOA 1LFIA 1BTJA 2XXVA 1MY3A 3ILUB 1LAXA 3FIRA 4I8CA 3ZKLA 1B5JA 3Q29A 3FVKA 5I59A 4H6DA 1ZMGA 2DE3A 4R73A 3LSWA 1B1HA 4F3BA 1MXWA 3K6UA 3H6UA 1O63A 3PPQA 2I0CA 3RY3A 3KEIA 1S9TA 4R6KA 3K00A 5JEIA 3KBRA 4UACA 3KN8A 4WEPA 5AA2A 2DE4A 4KYDA 3MZBA 4GFRA 1DSNA 1EH3A 1JEUA 5H8FB 1D3KA 1EZ9A 3LUYA 1WODA 4FATA 4YKPA 5HM4B 3IOUA 2I48A 5H8HA 4RYAA 3PPRA 3KJTA 4NF5B 3TMGA 2RCBA 2ZYKA 3FXRA 4PFYA 4NF6B 1D9YA 3FZVA 3CRBA 4Q8RA 3TCHA 4IY5A 1RYXA 2ZYOA 4IO2A 4P0IA 2GRVA 3TCGA 1VFDA 3KN3A 2X7PA 2ESNA 4LATA 4G77A 1MH4A 4BDLA 2XXXA 4U21A 5F1QA 4YMAA 4POWA 1MPBA 1P99A 1LAGE 1IEJA 1B1XA 3BKIB 4U1ZA 1Y3NA 1MQJA 4X1BA 3OENA 1Y4TA 2I58A 4G8HA 4MFIA 4ZEDA 4BDNA 1QUKA 2XXRA 2HAUA 4DIGA 3CG1A 4NTLA 2BJJX 2NVUB 4BDOA 2B3BA 3EN3A 3IR1A 3G3HA 2Y7PA 4AB6A 4PP0A 2DXYA 2AYSA 4R2BA 2Q2CA 4NWDA 3PPNA 2O6AA 3OO7A 4GLIA 4ELOA 3Q25A 1NNTA 5AE4A 1MQHA 4ISUA 2RCAA 2XXQA 4QFOA 2ZNUA 5I56B 4GIZA 1N04A 1N84A 4Q5TA 3O6IA 3VLVA 3DP8A 2ANJA 3C33A 1I6BA 3I3VA 3SDFA 2GFEA 3MWBA 1A8EA 4IO6A 4IY6A 4QFKA 4OESA 5K2YA 4R9FA 4FECA 1MY2A 2QPQA 1L5TA 1OIBA 4RNSA 1ELJA 4UA8A 3O29A 4NF4B 1N76A 1Y20A 1FTJA 4HS7A 1BP5A 2B65A 1HSEA 2ALUA 3PUZE 1AL3A 2OCUA 4LQ5A 3H6WA 3CIJA 5L9OA 3R7XA 2QMXA 3K01A 1NFTA 3O28A 5ISUA 4ONYA 3FJGA 4XKQA 5DYHA 3Q27A 1P1WA 2Q2AA 1I6AA 3PD9A 2P1SA 1FTKA 3N26A 2DOJA 3TZAA 2HZLA 3TPAA 1PBPA 4QFLA 3UP9A 4F39A 4Z7EA 3B6QA 3RT8A 1PB8A 5I57B 1CB6A 4MH5A 4JDFA 1B2HA 3QIMA 3MVYA 4FIMA 4HCWA 3K4UA 3OO9A 4GL0A 1IUDA 2OJTA 4ZZAA 2ZYMA 3IB0A 4H1XA 2O7UA 3A3UA 1II5A 3IJOB 4H67A 4QHQA 1NKXA 1H76A 1OLCA 2PX1A 1MS7A 4F1VA 5HBCA 1FW0A 4MF3A 5L9SA 4DXBA 3LSFB 2HXWA 3C31A 1LAFE 3MVWA 3E4RA 3MBPA 2UYEA 4U4XA 2E0SA 1B46A 1DMBA 4F29A 4YICA 1TFDA 3MVZA 3N6UA 3U8QA 4ESXA 2LAOA 3GBAA 1A54A 1DPEA 1LSTA 1B3LA 3N94A 4Z0IA 1FQEA 5LOMA 2RC9A 1OQGA 2DE2A 2F8DA 1Y1ZA 2DQVA 5CBRA 1LCTA 4F3PA 2VD3A 1P1OA 3UK4A 3C35A 2XX7A 1RKMA 2HEUA 5CMKA 3MZ9A 1POY1 3CR9A 3CSBA 3C36A 2UVGA 1MXXA 1SI1A 1Q35A 2NXOA 4C1TA 1FQCA 1P1UA 4WKMA 4JWXA 4NF8A 4G8MA 4X48A 1XVXA 2Z8EA 3B6WA 2FNCA 4XKPA 4P11A 2D3IA 3TTKA 4N07A 2UVJA 4KYEA 3ODBA 1B7ZA 2H9BA 4EXLA 3W9VA 1JNFA 1MY4A 1MY0A 1MDP1 2XD2A 3HSTA 1MRPA 1SD3A 1UIUA 1HSLA 5JTYA 1URGA 1Z7NE 5TP9A 4OZ9A 4THIA 1I69A 4IO3A 3IO4A 3PUYE 2V3UA 3ILTB 1JW5A 3SEWA 3ECRA 1MXVA 2DVCA 4IO4A 1R6ZA 5ELVA 1P1NA 1JW4A 1M5EA 1B3FA 4FEBA 1AMFA 3R26A 1B52A 4GL8A 3MQ9A 5A5XA 1IXGA 1MXZA 1A7LA 3K02A 2O68A 4BDQA 2XXYA 4PQJA 1RYOA 1QUJA 3TQLA 1SBPA 4BDMA 1B32A 3TQWA 1IZ1A 1JEVA 3HPIA 4ELQA 1Z7ME 4FE8A 1US5A 2IA4A 4KHZE 2ZYNA 1A8FA 3O6GA 3W9WA 5I59B 5CMBA 3M3LA 1CE2A 3M3KA 5BWJA 2ZXTA 4N6PA 3G3KA 4OEUA 3HCQA 3PPOA 3ZSFA 1NNFA 3PUWE 5I2KA 5I2NA 1NNKA 4YAHX 4F1UA 3TEPA 2ABHA 5HPQA 2HAVA 2DS9A 2H5YA 5AA2B 3MVXA 3A09A 1MM7A 4OENA 5I84A 3GLBA 4OFLA 4XKNA 1FTLA 3KOTA 1YTVA 1A55A 5H8HB 1FCKA 4WEDA 4AQ4A 2PVUA 3FXQA 1R9LA 4F2QA 4XIGQ 3K1MA 3T9UA 4X1DA 1H44A 1XT8A 4YKIA 2H25A 2F97A 4MBPA 2XXWA 4DZ1A 3S4UA 1SW1A 1AH5A 1URSA 5M2VA 4OWDA 4PE5B 3HV1A 4KYSA 1H3DA 4H8IA 4YB5A 5JK4A 2PBWA 3KSXA 4RA1A 3MZ1A 4KI0E 2O69A 2V25A 1QKBA 1N3WA 3H4ZA 3K1PA 4O3CA 2I49A 1XC1A 5KDTA 1M5DA 3PMWA 5ITPA 4PFUA 4ZZEA 1LAHE 3ZKKA 3HO7A 3L6GA 4YZZA 3KG2A 1H43A 3VVFA 4OVJA 5KCJA 3TTLA 1N3XA 1LLSA 5IKBA 4POXA 3TTRA 3T9VA 1QW0A 4JXIA 3KSJA 4JSDA 5CI5A 3MW0A 4I62A 3KN7A 4OFOA 4F31B 1LBCA 4IO7A 5EYFA 1ATGA 3HHFA 3OO6A 4DXCA 4TQUQ 5TU0A 2Z8FA 4M1VA 3KJ7A 4EF2A 3IK6B 3FUZA 1Q1KA 4ZEFA 1D9VA 4ZECA 3UN6A 4FORA 2F7CA 4PETA 1BLFA 1ZTYA 3RN8A 2OLBA 4EQBA 2UYFA 3MC2A 3LSLA 2R9JA 4QSDA 2F7AA 3SKPA 2I3VA 5DEXA 1XVYA 3E9XA 2VD2A 3WAFA 1O7TA 4OYVA 4NE4A 2ZNSA 3RTWB 2CMOA 3MP1A 3H06B 5CBSA 5L9MA 2RINA 4OEVA 5B7DA 3T9HB 3FVNA 2Q89A 3MJNA 1O64A 4R72A 3FJMA 3THIA 4FAJA 4ND9A 2CZLA 1ZIUA 1POTA 3RPWA 2Q8JA 3G7WA 1GGGA 1UTHA 3DM0A 4YB7A 2QL3A 2I4BA 3IB1A 1DOTA 5ICQA 3GXAA 3C32A 3M3FA 4I1DA 2OBGA 2VOZA 3S9LC 3T66A 1MQIA 3K1NA 1NNPA 3KFMA 2FA7A 2HFBA 1R1NA 3E13X 4KCCA 1LBBA 4HW8A 1JVYA 1ZLQA 5IAIA 2AL5A 4OERA 3PU5A 5DVJA 1DTZA 2Z8DA 5CM6A 2P2AA 5DVFA 3FVOA 3R6UA 2RC8A 4U1OA 1N0TA 3O66A 3TODA 1VE4A 5CRYA 4RPNA 3UIFA 3VFJA 4Q30B 3CFXA 3G3GA 1WVJA 3F11A 1US4A 1PB7A 4DE8A 3CI8A 2R71A 3RNNA 4XXUA 5FHOA 5H8NA 1XHYA 3V5AA 1SQYA 3VVDA 1SYIA 3OO8A 3SETA 2HCAA 4G68C 5J1DA 5DTBA 5AA4A 1UTBA 1QUIA 1B3GA 3KOSA 5H8QA 4F3SA 2I3WA 2P0SA 2QSXA 4QSEA 1ZKBA 2PT2A 2DYXA 3GBBA 1PBQA 5EHSA 3U1OA 3CSGA 4FEDA 4E0WA 1KWHA 1FQBA 1GVCA 3RTFB 2O1MA 4RXLA 2YPNA 3HN0A 2I0BA 3FV1A 5FHNA 2DWHA 2XHDA 2NWJA 3VXBA 4ZE8A 3VVEA 2X7QA 1MY1A 2O84X 3ONMA 2PT1A 4KPTA 4LUBA 1OLAA 3FGSA 3TELA 4ELPA 3SESA 1T0KA 4ZEIA 4YB6A 1B4ZA 2GH9A 3OMBA 4R6YA 2Z22A 3FV2A 1GV8A 3CFZA 3G3FA 2H4IA 4NF8B 4EUOA 1OQHA 1B0LA 3M8UA 4KFQA 4C0RA 3T9XB 4TLMB 4F1YA 2A5TB 3TCFA 2F35A 2V3QA 1IQ7A 1AIVA 4OQOA 4L17A 1OVBA 3D4GA 3VLUA 1MQGA 4O3AA 4EQ7A 3G3JA 3C9HA 5TPAA 5JTYB 5TP9B 4R2FA 1VSOA 1B9JA 2ONRA 3N6TA 3USDA 1B7UA 3V8XB 4EQ9A 4H5FA 3MP8A 2WKYA 4I9DA 3MPLA 1FQAA 4EDPA 2UXAA 3PV0E 3OXNA 4RPOA 1URDA 2O51A 4HCYA 5A5XB 5ITOA 3KGCA 2ZNTA 4GQOA 4U23A 2RC7A 1Y1MA 3IL1B 4OHNA 1N7XA 2OK2A 1LFHA 4KQPA 2G29A 2F78A 4HTGA 1SVXB 4ZS9A 3E3KA 4K3FA 4BLAA 2Q88A 2VGQA 3K6VA 3VV5A 4IGTA 1WDNA 3RT6B 4X9TA 4N13A 3U94A 1EU8A 1ZJLA 5DVIA 3T96B 3PMVA 3EHSA 3DP4A 3S9EA 1QKAA 3RUMA 1LB9A 3V83A 5I2KB 5I2NB 2XXTA 2F36A 4DDDA 4C1UA 2RKMA 4G68A 2VHAA 5I58A 2REJA 4M4GA 2FYIA 4FJPA 2R6GE 1FTMA 5B70A 3LBSA 4GD5A 3UA8A 2PMSA 2W7YA 2NUVA 1ANFA 3IJXB 1AOVA 4O3BA 1YCJA 3C4MA 1LB8A 3K2DA 3T22A 4AB5A 2DWIA 1M5CA 1MQDA 1IIWA 1XS5A 1VFEA 4OXVA 2F34A 3B7DA 3OELA 2Y7KA 1BIYA 4EXKA 2DXRA 3OD7A 1B0HA 1SW2A 5AA3A 1USYH 3PD8A 4DCYA 3TTNA 3QUJA 1M5FA 5KDTB 2NOOA 2H99A 5CMCA 4PFTA 1NH8A 5KCJB 1QULA 1B40A 1DTGA 2QS2A 1S50A 4F19A 3VE1B 3PMXA 3MP6A 1MH3A 2XXUA 1QVSA 3U92A 2OWSA 1B58A 1B51A 3SEUA 2D21A 1Y9UA 3CG3A 4H65A 4U4SA 2UVHA 2O1LA 5H8FA 4G8NA 1I6QA 5FTHA 3IO6A 1Y3PA 4ECFA 4YKJA 4NF5A 1MDQA 3TTMA 3ZS6A 1P1QA 2Y84A 1B5HA 3O2AA 3BFTA 4NF6A 3VXCA 4NEDA 1J1NA 2IEEA 3TYHA 1EZPA 4EF1A 2V93A 5CC2A 4NMYA 2REGA 1S7YA 3TKDA 1JQFA 3TFLA 3SEVA 5DEXB 3B6TA 1SW4A 2OWTA 3HHGA 2ZMBA 5ICTA 2F5XA 3FATA 3MPKA 4IB2A 4LZ8A 3VLWA 4ELRA 3EHTA 4QRZA 3JZJA 2AIXA 3AXFA 3DP6A 4OETA 3DLNA 4LONB 5FTIA 4U22A 3O6HA 4LA9A 1OVTA 2QS1A 2Q9TA 3S2VA 3K0VA 4OFJA 2F7BA 4DCXA 4JWYA 3W15C 1UTHB 1ZBMA 4QSCA 3FASA 3KZGA 3O9PA 3SEYA 1Y4CA 1IITA 4E0XA 3IOWA 1TXFA 4DLDA 4YMBA 2E1SA 3SEXA 1LFGA 1F9BA 4PFWA 4H0WA 3H6VA 1TT1A 3N5LA 4IO5A 1R9QA 2XXHA 4JSOA 3DELB 3IB2A 3JV9A 2H98A 4P0GA 3K6WA 1GR2A 4R74A 5I56A 3OEKA 4KR5A 1IXCA 3H03A 2DWJA 2DVZA 5CMMA 3OEMA 1B4HA 2I4CA 2Y7WA 5FHMA 5F7VA 3Q26A 1QJMA 3RGYA 1MG1A 1GTKA 4LZ5A 4QFNA 4TLLB 3LC8A 5AA1A 5H8NB 1OMPA 3IOVA 2O7IA 1IXIA 2Y7RA 2UVIA 2M8CA 1B3HA 1MXYA 4NF4A 1SW5A 2VP1A 3MAMA 2V3TA 4F2OA 5AA4B 1UTBB 3LR1A 2X26A 3VDFA 5H8QB 1TWYA 3U93A 4RY1A 1JVXA 4MLQA 3QYTA 3EQ1A 1XOCA 3BFUA 4LP2B 3A3CA 5KZTA 2YJPA 2HZKA 4ZE9A 2GHBA 4KCDA 1MXUA 2HQ0A 4R9GA 3QSLA 3GZGA 3RLFE 2Y7IA 1H45A 3EPEA 1MPCA 2DP8A 4Q0CA 1A99A 2QMWA 5EHMA 1USYE 4RJZA 1FQFA 1B6HA 1NH7A 3TUSA 2QS4A 3MUQA 4GXSB 4H8JA 4GRKA 2Z23A 1UQWA 4JBZA 2XX8A 4XTCQ 4RK9A 3WAEA 1M5BA 3LSXA 5I57A 3H6TA 3OOAA 4G4PA 5L8DA 2PYYA 3PGFA 3QK6A 1IXHA 4F3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MM6A 1TFAA 1AWBA 3PUXE 4G2ZA 4YU0A 3H3GA 4MLVA 3EHUA 1FTOA 4BDRA 3SERA 4NWCA 3T93B 4LZ7A 5AA2D 1N7WA 4HE0A 3TDJA 4GWOA 4QFPA 3TAJA 4HXVA 1Q9DA 2ONSA 1YAEA 2GQ1A 5BUUA 3L6HA 1B05A 5TPAB 3E78A 1ZU0A 1NMUA 3JYRA 1B7HA 2QJEA 4PGNA 2XD3A 1B3EA 2YLNA 3S9MC 2A5SA 4DI4B 4KD5A 2F6GA 3IORA 4GX6A 4LQ2A 3RQTA 3I6VA 4PCDA 1FBPA 3H7MA 1UIVA 4F18A 4IGRA 2V84A 3IX1A 4GXAA 4ZDMA 4QF9A 2V4CA 2FIEA 2R8TA 4OTEA 3FXUA 3QAXA 2B3FA 2DWAA 2QS3A 2QRYA 4F22A 4PDDA 1SYHA 1LCFA 5ET5A 3QXMA 2AL4A 4XKRA 1NL5A 3UGWA 2D5WA 3UORA 2A5TA 3D4CA 4U2RA 1Y3QA 5K2XA 1YPNA 2QVUA 3FJ7A 3KC1A 1PEBA 1DPPA 3A29A 4R6HA 2GHAA 1BKAA 4JWOA 1PDAA 3EF7A 1FQDA 3BBRA 3OSQA 5H8SA 3U72A 1MPDA 1PB9A 4H5GA 3G3IA 1PC3A 2MKZA 1JW1A 3HFUA 1IMFA 1VR5A 4G68B 4RK2A 2G93A 5I58B 4MJOA 4WXJA 1D4NA 1JETA 2XXIA 1EZOA 1B5IA 1NUYA 4GOTA 2WEFA 2ZZWA 4TOZA 5I3SA 3IOTA 1HSJA 2THIA 3CFLA 2HXRA 4R75A 3Q28A 4ZEKA 3O97A 2XXPA 4LVQA 2XX9A 3P7IA 3QUFA 4ZEBA 1G0IA 2OZZA 3PUVE 5I5PA 5DT6A 1SDXA 3FVGA 3B50A 4O7MA 4DXUA 2F6PA 3V89B 3K6XA 5IM2A 4JB7A 3PPPA 4ESWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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