3K6UA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in unliganded open form
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule tags Transport protein
total genus 104
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA02
3WAFA 3I3VA 4NF4A 4NF8B 4OFOA 4ZS9A 3O29A 4HW8A 2BJJX 1JQFA 3RQTA 3DP8A 3N5LA 1PC3A 1NNPA 4F1VA 3OOAA 4Q5TA 5L8DA 3EN3A 3TPAA 3KZGA 4FE8A 4HCWA 2PYYA 1MXZA 4G68A 2ONKE 1N7WA 4Q8RA 4I62A 3H06B 3S9LC 5AA4A 1US4A 3VVFA 1MH4A 1B5JA 1B4ZA 3G3IA 3M3KA 4DE8A 5H8FB 2F34A 5H8NB 3TEPA 1D9VA 2Q89A 3SDFA 2V3QA 2OLBA 4YKKA 4F3PA 3LSWA 4YAHX 1H43A 3KOTA 1MQDA 2Q2CA 1XOCA 4R2FA 3C36A 5I2NA 1MDP1 1B51A 4U4XA 3VVEA 3PUYE 4KPTA 4MH5A 1LBCA 4GVOA 3OMBA 3KN7A 1NNTA 2H9BA 3MC2A 1Y4CA 2QPQA 1DTZA 2XXYA 2I6EA 1SVXB 1LLSA 2AIXA 5AA2A 3FIRA 2CMOA 4YZZA 4ND9A 3KFMA 4U1ZA 2UVGA 4R6KA 2ONRA 4OZ9A 2CZLA 4ZDMA 2REJA 4PFUA 1ANFA 1Z7ME 4TLMB 4F2OA 3HV1A 4JSOA 3RGYA 2XXXA 3MPLA 3KJ7A 4GLIA 5CMKA 5I58B 4YICA 1LB8A 5FHNA 2Z8FA 4MBPA 1ZLQA 3K00A 3E9XA 1LCFA 3T66A 1MXWA 4F3BA 1MXVA 1Q1KA 3T93B 1P99A 1NKXA 2F7BA 4M1VA 2Y7IA 1QKAA 4NF8A 4PFTA 3THIA 4I1DA 3D4GA 1BLFA 3TKDA 4BDNA 1LGBC 3TELA 3C4MA 2A5TB 4WEDA 1B3EA 4YB6A 2DWJA 1A7LA 3ZS6A 2OJTA 4DIGA 1MQIA 5L9OA 2IA4A 1JETA 1TT1A 3ILUB 4OESA 2XXWA 3VXCA 4NF6B 1OIBA 3FUZA 4POXA 4XIGQ 1XS5A 3IOTA 1JEVA 3O66A 1MY3A 1MM7A 4QFNA 2P2AA 5H8FA 4GWOA 5H8NA 2FA7A 4P11A 4U22A 4ZZAA 5HBCA 2ZMBA 3N94A 1LBBA 1FTJA 1UTHA 4DXUA 5AE4A 2O1LA 4F29A 4ELPA 3PV0E 4EXLA 4NE4A 1IEJA 5CC2A 4GL8A 1LCTA 2I3WA 2DXRA 4KI0E 3PPPA 4G8HA 1M5DA 4ZE8A 5I57B 3KN3A 2HAUA 3O2AA 2DWHA 5AA3A 3ZKLA 3VDFA 4R73A 2DE4A 4Z7EA 2I48A 3FVOA 4RPOA 2O1MA 3PPOA 5CI5A 4KD5A 4QFKA 1PDAA 2VHAA 3S9NC 3VVDA 1VFDA 3H6TA 1ZIUA 4ONYA 1FTLA 2ONSA 3O9PA 4LZ5A 1SBPA 2Y84A 5DVIA 5I58A 1GGGA 4FEDA 1B3HA 1B7ZA 5TP9B 3TCHA 1IXIA 4JWXA 2I4CA 4HCYA 3VV5A 1MXXA 2VGQA 4IY5A 5DYHA 4BDLA 2O7IA 1PEBA 3EQ1A 4PP0A 2V25A 2ABHA 3EPEA 4Q30B 4FJPA 2A5TA 1Y1MA 1ZMGA 4GD5A 2DSFA 3TCGA 3TUSA 2UVJA 1HSEA 1DPPA 3OSQA 4LA9A 4YB5A 3MZ9A 1R9LA 4UACA 4JWYA 1MG1A 2OWTA 1MPDA 3ODBA 4ESXA 1A54A 2XD3A 1AL3A 2F36A 2B3BA 5FHOA 2UVIA 3G3JA 4XKNA 1JW5A 5M2VA 2GHAA 3CG3A 4GRKA 5DVFA 3CSBA 4ZECA 5ITOA 3N6TA 1B0LA 4IO4A 2HZLA 1D3KA 1B5IA 4G8MA 3O6IA 4OENA 4JBZA 3I6VA 1ZKBA 2B3FA 2ESNA 4OXVA 3MZ1A 1XHYA 3LBSA 5I57A 2XXUA 1H76A 4QRZA 4R75A 5CBRA 1JW1A 4ELQA 2O6AA 1B4HA 2QSXA 1IQ7A 2IEEA 3IO6A 1I69A 1N0TA 1FQCA 4LQ2A 1FW0A 3W9VA 4BDQA 1MY4A 3PMXA 3PPNA 3MZBA 4X9TA 2X7QA 4PETA 4F3SA 1EZ9A 1QUKA 2HEUA 4HTGA 5K2XA 4RNSA 4C1UA 4NWDA 1CB6A 3T9VA 2QS4A 3QSLA 1ZU0A 2ZYKA 3B6TA 3Q25A 2YPNA 3KSXA 4O3BA 5TP9A 1UTBA 1B46A 3IK6B 4FATA 1FQBA 1OLCA 2UYFA 4EDPA 2YLNA 4THIA 1XVYA 3MAMA 3Q29A 5KCJB 4L17A 5CMMA 5CMBA 4QFOA 1MPCA 1XVXA 4OERA 2ZNUA 3FXRA 1PBQA 1YCJA 1MQHA 1GR2A 3H03A 2FNCA 4H8IA 4KQPA 4FAJA 2PT2A 1N3XA 2H98A 4RY1A 3D4CA 3PUXE 2QMWA 1QULA 3TTKA 2I49A 1SI0A 4NEDA 3O6GA 1LAGE 1N04A 1AH5A 1FQAA 2F97A 1VFEA 4ISUA 4OFJA 4IO2A 3MVZA 4IO3A 3FXUA 4GOTA 3G3FA 3I5OA 1B1XA 3C9HA 3TZAA 4H1XA 4RXLA 5ICTA 3FASA 3K01A 4ELRA 2F7AA 5BUUA 2OCUA 3RNNA 5TPAB 3KGCA 3CIJA 1ELJA 2Z8EA 3EHUA 4NMYA 1MQJA 1A40A 3TAJA 1QUJA 3MBPA 4IO7A 2PT1A 1FQFA 3UORA 1B9JA 3RY3A 3GBAA 1XT8A 5H8QB 3IORA 3DELB 5EYFA 4YKIA 2DWIA 1ZTYA 1MXUA 2Z8DA 4FEBA 5H8HB 3H6VA 5CBSA 3BFTA 1R9QA 4EXKA 3LSFB 1I6AA 2Z23A 3FD3A 2I58A 3LSLA 2G29A 1O64A 1FTMA 3F11A 3IO4A 1P1OA 3T9HB 3VXBA 1PBPA 4DDDA 3ECRA 1TFDA 1QJMA 3G3KA 5B7DA 4GQOA 3FVKA 3HN0A 1FQDA 2DS9A 3O6HA 3PPQA 1PB8A 5KCJA 4NTLA 1Y9UA 5CRYA 2R9JA 1D9YA 3L6HA 2NUVA 4OWDA 2W7YA 5I59B 4WEPA 4DZ1A 5AA2D 3IOWA 4AB5A 4DXBA 3H6UA 1SW5A 3SKPA 2F35A 2P0SA 4FECA 1I6QA 4X1BA 2DXYA 3CR9A 4IY6A 4OETA 1MXYA 3UA8A 4YU0A 3VLVA 4BDOA 2Q2AA 4FORA 4BDRA 4OQOA 1M5EA 2AL4A 1DTGA 3U94A 3MP1A 4KHZE 3IJOB 3A3CA 4OEVA 4H5FA 5TPAA 1JVYA 4R74A 2X7PA 4F2QA 1SYIA 2ALUA 5DVJA 2XX8A 2QL3A 1J1NA 1MRPA 3MVYA 3V83A 4F19A 3OELA 4LP2B 2HFBA 3MP8A 2PVUA 5H8QA 2XXTA 5J1DA 2ZXTA 1TXFA 2GH9A 5H8HA 1Y4TA 5CMCA 4KCDA 3S9EA 2A5SA 1N84A 3U1OA 3FV1A 3K1PA 3VFJA 3FGSA 2O51A 1F9BA 3B7DA 3T96B 5IKBA 3OXNA 1BP5A 3IB0A 3PMVA 4P0IA 4EUOA 3HHFA 1P1NA 1OQHA 3PU5A 4WXJA 2HAVA 3K1NA 5L9MA 1UIUA 3GLBA 1GVCA 2D5WA 1N7XA 1POY1 2KLFA 3FZVA 3QUJA 2V3UA 3OO6A 4WKMA 1M5BA 3TQWA 1WVJA 2DE3A 3TFLA 2DE2A 5I59A 1A8FA 1B58A 1EU8A 1AMFA 1S50A 1LB9A 3L6GA 3TDJA 4XTCQ 4RA1A 3RUMA 1MY0A 3EHTA 4JDFA 2DVZA 1MPBA 2Z22A 4F22A 2RCBA 3B6QA 4R9GA 1LAFE 3E13X 4X1DA 3OEKA 5K2YA 1B05A 1SQYA 1B3GA 5I56B 1DMBA 4RK2A 4N13A 2HCAA 1RYXA 2E0SA 2UYEA 5FTHA 3C31A 3TCFA 4N6PA 4ESWA 3IOVA 4C1TA 1NNKA 1SD3A 2VOZA 4ZE9A 3ONMA 2RC8A 3E4RA 3LUYA 1H45A 4F1YA 4KYDA 3TYHA 5DTBA 1URSA 3USDA 3UP9A 3K4UA 4JWOA 3H7MA 5L9SA 1PB9A 4AB6A 4YMBA 1NNFA 2Y7RA 5TU0A 1TFAA 1URGA 3C34A 4NF6A 3IL1B 3C33A 3RTWB 1JNFA 3KJTA 1Y3PA 1LFHA 4H0WA 2H5YA 3RT8A 1OLAA 3U8QA 2D3IA 3SERA 4XXUA 3QXMA 4LVQA 4PQJA 1T0KA 3AXFA 4H6DA 1DPEA 2GRVA 3LC8A 3HHGA 1UIVA 5I2KB 4EF1A 2XHDA 1WDNA 1OMPA 3ILTB 2RKMA 3SEVA 4OFLA 4TOZA 2YJPA 1LFGA 1D4NA 3HCQA 3S9MC 1MY2A 5FTIA 3SETA 1BTJA 4GF8A 2O7UA 2LAOA 3TTMA 5JEIA 2R71A 5ICQA 3SEUA 3CI8A 1SI1A 3FVNA 2XXQA 3EF7A 1USYE 1XC1A 2G93A 4M4GA 3JV9A 2F5XA 3K6XA 3M3FA 3MPKA 2OK2A 4ZEIA 4LONB 1JW4A 2QJEA 5F7VA 4PE5B 1ATGA 3IB1A 3W9WA 5FHMA 4F3GA 5B70A 3Q26A 2H25A 3CFLA 4OMBA 4DXCA 3U72A 2XXIA 4KYEA 5I56A 1EZPA 1QUIA 4MFIA 1ZJLA 3HO7A 4GXAA 3PUZE 3FJGA 3QK6A 3K0VA 3R6UA 1MS7A 1IZ1A 4R6HA 4U4SA 3QAXA 4GIZA 1UQWA 3W15C 3GZGA 2QMXA 1ZBMA 2H99A 4F1UA 1MM6A 3DP6A 3EHSA 4G8NA 2NWJA 3RN8A 3OO7A 4G4PA 3N26A 4OEUA 4X48A 2VP1A 1RYOA 1PB7A 1IITA 1Z7NE 4KYSA 1MQGA 2THIA 2NXOA 3FATA 5I2KA 1B3FA 3K2DA 4HS7A 3VE1B 3CFXA 2I0BA 3OO8A 1OQGA 4H5GA 1A99A 3TODA 2RCAA 1N76A 3OSRA 4NF5B 2Q9TA 2OBGA 4JXIA 3TTNA 1B2HA 1TWYA 1Y3NA 3U93A 2P1SA 2QS3A 4Q0CA 2OZZA 4EQ7A 4JSDA 1A8EA 2XD2A 3FJMA 2QRYA 1SW2A 3RPWA 5A5XB 2I0CA 2V3TA 3LR1A 4LATA 2ANJA 2DOJA 4DLDA 1M5FA 4ZZEA 4RYAA 4OTEA 4I9DA 2VD2A 4N07A 3OD7A 3S4UA 3CSGA 3UIFA 2XXRA 3TTRA 2RINA 3PD8A 5DT6A 1IUDA 3BKIB 4ELOA 3DLNA 3TTLA 3V89B 1IXGA 3O28A 4QHQA 3B6WA 1NH7A 2VD3A 4G77A 4ZEKA 4FIMA 2R6GE 1JEUA 3K6WA 2HXWA 3QIMA 1CE2A 1B7HA 5JK4A 1UTHB 1B5HA 4QFLA 4YKPA 2DQVA 1O63A 1R6ZA 4RJZA 4G68C 1VR5A 4MLVA 1N3WA 3V5AA 2O84X 2Q88A 4LZ7A 4QFPA 2QS1A 4F18A 5ISUA 2D21A 1B3LA 1HSJA 3VLWA 4TQUQ 4PFYA 5LOMA 2V93A 4EQBA 1POTA 1NH8A 4GFRA 3N6UA 4OYVA 3G3GA 1SYHA 2I3VA 3MVWA 4KR5A 3U92A 5JTYB 2PBWA 4C0RA 4R6YA 4YMAA 2ZNSA 2I4BA 1AIVA 3C32A 1OVTA 4YB7A 3K6VA 4IO6A 1R1NA 4DCYA 3DP4A 1B40A 4H8JA 4NF5A 4MLQA 4ECFA 3BFUA 1USYH 5EHMA 5ELVA 4QF9A 1EZOA 3V8XB 1P1WA 2H4IA 4JB7A 3H3GA 4PFWA 4R2BA 4U2RA 1MH3A 1QVSA 2ZYOA 5A5XA 4QSCA 1NMUA 2UXAA 1B7UA 3OENA 1SW4A 4Z0IA 1YAEA 4BLAA 2E1SA 3R7XA 1DOTA 2FYIA 3K1MA 4R72A 3IJXB 1IXCA 3C35A 4U1OA 3DM0A 4XKPA 2Y7PA 3KBRA 1B6HA 5DEXB 4TLLB 3KN8A 3M3LA 3TQLA 5HM4B 4OVJA 1FTOA 3H4ZA 3RT6B 1I6BA 3FVGA 3KEIA 1QKBA 1NFTA 2DP8A 2Y7KA 4GXSB 3Q28A 1MY1A 3ZKKA 1YTVA 3SEYA 2QS2A 4LZ8A 4ZEBA 2DVCA 4G2ZA 4QSDA 1DSNA 1H44A 4F39A 3PD9A 1P1QA 3M8UA 4E0WA 3P7IA 4E0XA 4DCXA 2XXHA 3T9UA 1BKAA 3FJ7A 3FV2A 3CVGA 2XXVA 5JTYA 4IO5A 2PX1A 1MDQA 4GL0A 4YKJA 3BBRA 4LUBA 2AYSA 3G7WA 4NWCA 2XXPA 4R9FA 3R26A 5CM6A 2PMSA 4LQ5A 3A3UA 2X26A 1IIWA 5KDTB 1H3DA 1O7TA 1UTBB 1VSOA 4KFQA 4OHNA 1LAHE 3IR1A 3HSTA 1Y1ZA 1Q35A 1B32A 3MW0A 3MQ9A 1S9TA 3KG2A 4XKQA 1YPNA 2XX7A 2RF1A 3SESA 4IGTA 4H67A 4AQ4A 4ZEFA 2HQ0A 4MF3A 1HSLA 1KWHA 1S7YA 3S2VA 2F6GA 1GV8A 1SW1A 1NL5A 5HPQA 2UVHA 1A55A 3PUWE 1LSTA 3MJNA 3CFZA 2XX9A 1URDA 3RLFE 3MVXA 2ZYMA 3A09A 5DEXA 3SEWA 4K3FA 1B0HA 3KSJA 2F8DA 2F78A 2RC7A 3RTFB 5KZTA 2O68A 2NVUB 2O69A 3MUQA 2F6PA 3IOUA 3H6WA 1EH3A 2RC9A 1Y3QA 3CRBA 1Y20A 4NF4B 2DWAA 3OEMA 3GBBA 3QUFA 1FQEA 3QYTA 4RPNA 1FCKA 1LFIA 4ZEDA 1B1HA 2AL5A 4XKRA 1RKMA 4O3CA 5AA1A 4RK9A 4IB2A 3UGWA 4U21A 4F31B 4KCCA 4I8CA 1M5CA 2WKYA 4G68B 1WODA 4IGRA 5H8SA 1US5A 5I84A 3K02A 2OWSA 4EQ9A 1AOVA 5AA4B 2ZNTA 4QSEA 3JZJA 3ZSFA 2V84A 3T9XB 4P0GA 2F7CA 1II5A 3MP6A 1BIYA 3PPRA 3CG1A 2HZKA 4H65A 5KDTA 3PUVE 5I2NB 3E3KA 3GXAA 3SEXA 2ZYNA 1LAXA 3TMGA 2GFEA 3PMWA 4BDMA 3WAEA 3IB2A 1GTKA 2M8CA 1IXHA 1FTKA 4O3AA 2NOOA 2Q8JA 3UK4A 3HPIA 4U23A 3IX1A 3G3HA 3T22A 1P1UA 5AA2B 5IAIA 2GHBA 1VE4A 4UA8A 1JVXA 1SDXA 3OO9A 3O97A 1QW0A 2DYXA 3FXQA 4POWA 4EF2A 3JYRA 2B65A 3PGFA 3Q27A 3VLUA 5BWJA 1B52A 3KOSA 3K6UA 5F1QA 5EHSA 5ITPA 2REGA 1L5TA 3UN6A 3MWBA 1OVBA 2Y7WA 3IAZA 3LSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WAFA 4MAGA 3I3VA 4NF4A 2V4CA 3BIHA 4NF8B 2Q8MA 4OFOA 4ZS9A 3O29A 4HW8A 2BJJX 1JQFA 3RQTA 5LTCA 3DP8A 3N5LA 1PC3A 1NNPA 4F1VA 2B4LA 3OOAA 4Q5TA 5L8DA 3EN3A 3TPAA 3KZGA 4FE8A 5EYHA 4HCWA 4PE3A 4MJOA 2PYYA 1MXZA 4G68A 2ONKE 4QXDA 1N7WA 1EYIA 4Q8RA 4I62A 3H06B 3S9LC 5AA4A 1US4A 2L5VA 3ISPA 3VVFA 4H45A 1MH4A 1B5JA 1B4ZA 3G3IA 3M3KA 4DE8A 5H8FB 2F34A 5H8NB 3TEPA 1D9VA 2Q89A 3SDFA 2V3QA 2OLBA 4YKKA 4F3PA 3LSWA 4YAHX 1FPEA 1FRPA 1H43A 2FVZA 3KOTA 4I40A 4N4UA 1NV6A 1MQDA 1XI6A 4OVPA 2Q2CA 1XOCA 4R2FA 3C36A 5I2NA 1MDP1 1B51A 4U4XA 3VVEA 3PUYE 4GWYA 4KPTA 4MH5A 1NV0A 1LBCA 4GVOA 3OMBA 5IZ3A 3KN7A 1NNTA 2H9BA 1FPDA 3MC2A 1Y4CA 2QPQA 1DTZA 2XXYA 2I6EA 1SVXB 1LLSA 2AIXA 5AA2A 3FIRA 2CMOA 4YZZA 4ND9A 1SPIA 3KFMA 4U1ZA 2UVGA 4R6KA 2ONRA 4OZ9A 2CZLA 4ZDMA 2REJA 4PFUA 1ANFA 1Z7ME 4TLMB 4F2OA 3HV1A 4JSOA 3RGYA 2XXXA 3MPLA 3KJ7A 1FBCA 4JVDA 1YZ0A 5ET8A 4GLIA 5CMKA 5I58B 4YICA 1LB8A 1NUZA 3IFCA 5FHNA 5ET7A 4NX1A 2Z8FA 4MBPA 1ZLQA 3K00A 3E9XA 1LCFA 2OX3A 3T66A 1MXWA 4F3BA 1MXVA 1Q1KA 1LBWA 2HPGA 1FPGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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