3K6UA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in unliganded open form
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Methanosarcina acetivorans
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
total genus 104
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA02
2G29A 4P0GA 4GWOA 3V5AA 5TPAA 1MPDA 3O6GA 4FATA 1B1HA 3BFTA 2Z8DA 1N04A 3HPIA 1T0KA 4KD5A 1SW5A 2F35A 3DELB 1NNKA 1NMUA 4NMYA 1Z7ME 4BDRA 2NOOA 3L6GA 3KGCA 3EHSA 3MWBA 3R7XA 2R71A 2DQVA 2VHAA 1ZKBA 2O7IA 1FQFA 4KI0E 1MXZA 2PVUA 2RC7A 1SVXB 5AA2B 4XKRA 1EZ9A 5I57A 5CMBA 4G68A 4H67A 3C36A 3OSQA 2PT2A 4NF5A 5HBCA 1DTGA 4IO7A 3MC2A 4Q30B 3SEUA 4ZZAA 3KOSA 4U22A 1LAHE 3FZVA 1FQEA 1NFTA 3G7WA 3T22A 3MPLA 2DSFA 3K1MA 3TUSA 4YMBA 4KYDA 4RXLA 3C33A 4LUBA 3LSFB 1B3LA 1LAFE 1BIYA 2O69A 4R73A 4F19A 4PE5B 1USYH 2I3WA 2F78A 3SETA 4OWDA 4C0RA 2Y7IA 2O1LA 3DP6A 3TYHA 1MDQA 2H25A 2QS4A 2OBGA 5DEXB 3VVFA 4H65A 3T96B 2XXTA 3IJOB 2LAOA 4IY6A 2RCBA 2HFBA 4YB6A 2RC8A 4PFUA 3OEKA 4WXJA 1A8EA 4Q5TA 3FGSA 5EHMA 3PUZE 4QHQA 3C9HA 3W9WA 3O6HA 4NF6A 2XXXA 2B3BA 4H1XA 4EF1A 1NL5A 2B3FA 3LBSA 3U8QA 2I4BA 2ESNA 2I58A 1ATGA 1SD3A 5AA2A 1AMFA 4NF8B 3FVKA 2ZMBA 3O2AA 4I8CA 2I49A 2UVGA 4X1BA 4E0WA 1PBQA 4F1UA 2Y7RA 4O3AA 1B5IA 5AA1A 3ILTB 4DZ1A 4TQUQ 1IUDA 1TXFA 3IB0A 3WAEA 1WODA 3TTMA 1MRPA 1LAGE 3T9XB 1B2HA 4M1VA 4OEUA 5FTHA 1DMBA 1IXCA 3THIA 3SEVA 4UACA 3JZJA 5I2KB 1ZLQA 3VXBA 1DPEA 2UYFA 5CMKA 3ONMA 1P1OA 1B0LA 1FTLA 2V3QA 3SESA 1S50A 4EQ9A 1CB6A 2RC9A 3OELA 5CC2A 4GL8A 1LBBA 1ZJLA 4QFOA 1LFGA 3G3GA 4OETA 3LC8A 2RF1A 1B4HA 4PFYA 3RQTA 1VFEA 2ANJA 2PYYA 5DEXA 5H8QB 3V89B 2Z23A 2V3TA 1XVYA 1IZ1A 1B46A 4EUOA 5CBSA 2NUVA 4EF2A 2Q8JA 4JB7A 3H6VA 5L9SA 4ZZEA 2VGQA 2OWTA 3IJXB 4TLMB 1QUKA 3KN8A 4QFNA 1Q1KA 1OVBA 1MPCA 5CBRA 2G93A 3M3FA 3K02A 3SKPA 4QFKA 3T93B 3KZGA 4ZE9A 4F29A 3TKDA 5M2VA 3MUQA 3IOWA 4WEDA 4KPTA 3HO7A 2QS1A 3Q29A 4YICA 1SYIA 1PB8A 4GVOA 2H99A 4GXSB 3UK4A 1OQHA 4R2FA 1QW0A 1B05A 4OHNA 4RK2A 4OESA 5IKBA 3K01A 1IITA 4KCDA 4F2OA 3CVGA 4ZEDA 2PBWA 1B3FA 4O3BA 4GF8A 4ELOA 2OK2A 1B3EA 3ODBA 4KQPA 3FJMA 4BDOA 3KOTA 1XS5A 3C4MA 4NE4A 4N07A 4RPOA 1AL3A 1M5DA 4MF3A 1LFIA 4WKMA 4R9FA 4OFJA 3O9PA 2NWJA 2AL4A 3HN0A 2UXAA 2VOZA 5H8QA 1LGBC 2ZYMA 3H7MA 4EQBA 4G8HA 4PQJA 1A99A 1SW1A 3VLVA 1ZBMA 1MH3A 3KBRA 1P99A 2HZKA 3MZ9A 1LLSA 1S7YA 1A8FA 4U2RA 4G68C 1JQFA 2IA4A 1HSJA 2W7YA 1JVXA 3QUFA 1D3KA 2QMXA 1NH7A 3VVDA 3PUXE 1H43A 4QSDA 3FJ7A 3HCQA 4H6DA 4RYAA 1A40A 1DOTA 2RKMA 4ZEFA 4EQ7A 1PB9A 2Y7WA 4LP2B 1SI0A 4R6YA 4YAHX 3M8UA 2P2AA 5CMMA 3OO9A 1XHYA 2HXWA 1UTBB 2XXWA 2A5SA 5F7VA 1SBPA 1MY2A 4Z0IA 1EH3A 3RLFE 4GIZA 3G3HA 3UA8A 1M5BA 2I6EA 4GXAA 2ZYOA 3FXUA 2OCUA 3U1OA 4MFIA 1O64A 2YPNA 4LA9A 2ZXTA 5ELVA 2I0BA 3EF7A 1TWYA 4G8MA 4Q0CA 3I6VA 4F18A 3CFXA 4HS7A 3MQ9A 3CSGA 3C34A 2Z8FA 5JK4A 2THIA 3G3KA 4BDMA 3SEXA 1YCJA 2Q88A 2O6AA 4PFTA 3QK6A 5CM6A 1FTKA 3V83A 1EU8A 1URGA 1H3DA 4DXBA 2UVHA 4HTGA 1ZIUA 3MP1A 1XVXA 5FTIA 4ZEBA 2H98A 1MQHA 1OVTA 2IEEA 4NF6B 3MW0A 3PPQA 3FV2A 5BWJA 1Y4CA 1PEBA 3M3KA 3TTRA 5I59B 3W9VA 3N6UA 3EHUA 3IO6A 3O97A 2P0SA 3I3VA 3N6TA 5AA3A 3P7IA 4F22A 3OMBA 3G3JA 3LSWA 3FUZA 2F36A 1L5TA 1QVSA 1FQCA 4LATA 4OYVA 3U92A 4OFLA 1D9YA 2BJJX 2Q89A 1MDP1 4ZEIA 2XD2A 4R9GA 1SYHA 3B6WA 3PUVE 4U4XA 3GXAA 3Q27A 3USDA 3TTNA 1QKAA 4QSEA 2ZYNA 3K1NA 4OERA 1WDNA 4Q8RA 2QSXA 3MVYA 3HV1A 3LUYA 2QMWA 5H8SA 2ONKE 3B6TA 1B7ZA 3FIRA 3KN7A 2RCAA 3UP9A 3QAXA 3FVOA 1UTBA 2GHAA 5I2NB 3LSXA 1B6HA 1CE2A 1FTMA 3FD3A 1JW5A 3SERA 4OFOA 3IB1A 5J1DA 2VD2A 2WKYA 1J1NA 3TEPA 2ABHA 5DVIA 4LQ2A 3K1PA 3TPAA 1SW2A 1I6QA 2Y7KA 2O7UA 1ZU0A 3CI8A 3VVEA 1LB9A 4ELPA 1I6AA 3OEMA 1GR2A 5K2XA 5BUUA 3TZAA 3FXQA 3HSTA 1YPNA 4BDNA 1I6BA 2ONSA 2Y7PA 1R1NA 3CSBA 4PETA 3G3FA 5CMCA 1H76A 4Z7EA 4IO3A 1Y4TA 5JTYB 4QFPA 3JV9A 3JYRA 4LZ8A 1JW1A 3UORA 1Y20A 4GLIA 5I59A 3RUMA 1MXUA 1TFAA 4F3GA 3SDFA 1R9QA 4F3SA 3S9NC 3U93A 1LBCA 4OZ9A 3U72A 3Q25A 4KR5A 5I84A 1PC3A 4ZE8A 2OWSA 2QRYA 4IO4A 3K6UA 4MLVA 1SDXA 4JSDA 4HCYA 1LFHA 2I3VA 3PPOA 4IO5A 1MPBA 3A3UA 3K0VA 5EYFA 5I2NA 5ISUA 4YKKA 3CRBA 2HEUA 2XX8A 4DDDA 2DYXA 1N7XA 4FEBA 2D21A 3GLBA 3TDJA 4RJZA 1Y1MA 1B5JA 5FHOA 2QL3A 4XKQA 3S9MC 1XT8A 1MS7A 1VFDA 4POXA 4GRKA 4OMBA 1D4NA 1GGGA 2XXRA 2O51A 1B1XA 1UIVA 3BBRA 4NEDA 4F1VA 1A7LA 1ZMGA 1B3HA 2D3IA 2I48A 4YKPA 3VXCA 4R74A 3TCFA 1P1QA 1JEVA 4OEVA 4ZECA 4P0IA 2FA7A 3MAMA 3CFZA 4ECFA 2GHBA 2ZNTA 3IR1A 3RY3A 5JTYA 2H9BA 1B51A 2ZNUA 3SEYA 4NWDA 1IIWA 2I4CA 3CR9A 3KN3A 1US5A 4ELQA 3FVGA 1USYE 1URDA 2DP8A 5DVFA 4YMAA 2DE3A 1JVYA 4QF9A 3DP8A 5B7DA 3MZ1A 1FQDA 2REGA 1R9LA 4YU0A 2REJA 1SI1A 3PUWE 3IO4A 3ZKKA 3BFUA 3DLNA 4R75A 4DLDA 4ONYA 3RNNA 1HSEA 1N3WA 3IOVA 1YAEA 4QFLA 4U21A 1B40A 2F8DA 2QS3A 3R6UA 4I9DA 4P11A 3R26A 4R2BA 3LR1A 4U1OA 4OQOA 1MY4A 2A5TA 3ECRA 3MVXA 3E13X 1RKMA 3H6WA 1MH4A 2H5YA 3GZGA 2DWJA 4K3FA 4LVQA 1FCKA 3K4UA 3SEWA 3OO8A 4U1ZA 3IK6B 1TFDA 2P1SA 3LSLA 1A55A 4HCWA 3IORA 2X7QA 3KJ7A 1MQIA 3TODA 3CG1A 3IL1B 4F31B 1VR5A 3TELA 1Y3PA 1UTHB 2OZZA 3A3CA 1UIUA 3MP8A 5DYHA 1B32A 3RN8A 1EZOA 1I69A 4RPNA 1B7HA 3C35A 3MVWA 4LQ5A 3GBBA 5H8HB 3B7DA 4ELRA 4N6PA 2VP1A 5L9MA 3D4CA 4YB7A 1POTA 1Y3QA 4DXCA 4H8JA 4ESWA 3ZSFA 1IEJA 3TFLA 4FJPA 4G2ZA 3FJGA 1MQDA 3TTKA 3IAZA 1B0HA 3VLWA 4GQOA 1OLCA 4YKJA 3UN6A 4YZZA 4KCCA 3CIJA 1MY0A 4G77A 1AH5A 1MXVA 4LONB 4KYEA 3VLUA 4M4GA 2XXIA 3AXFA 1LAXA 1UQWA 5HM4B 2DVCA 3PPRA 4H5FA 1HSLA 4H8IA 1N7WA 2QJEA 4DIGA 3W15C 2F6GA 1N84A 1VE4A 1ELJA 2HAUA 2XXPA 3E4RA 2O1MA 1JNFA 2XXUA 2HZLA 3K6WA 4FAJA 1O63A 1BKAA 3Q28A 4MBPA 5F1QA 1FTJA 3G3IA 1A54A 3OD7A 2F7CA 4BDQA 1JETA 2XXQA 3N26A 3T9UA 4O3CA 3IOUA 3C32A 1UTHA 4OVJA 3MP6A 1MM7A 3FATA 2DXYA 4GD5A 2CMOA 1MXWA 4UA8A 4LZ5A 4R6HA 4OTEA 5ICTA 1M5EA 5IAIA 5ITOA 1DSNA 2DXRA 4AB5A 3N94A 2HCAA 5H8FB 1AIVA 2DOJA 1B7UA 3HHGA 2GRVA 5H8HA 1N76A 3E9XA 2O68A 4XTCQ 5A5XB 4JXIA 1H44A 4MH5A 2Q9TA 2PMSA 4KHZE 3N5LA 3QIMA 4ZDMA 5TP9B 1XC1A 4X48A 1MY1A 3B6QA 2DWAA 5I56B 2QPQA 3TMGA 3QUJA 3H6UA 3PPNA 3K00A 1N3XA 4FORA 1QUIA 2CZLA 4FE8A 4R72A 2V25A 3OXNA 1TT1A 2UYEA 4TOZA 2AYSA 4HW8A 3CG3A 4KFQA 2FYIA 3K6XA 4WEPA 4DCYA 2XXYA 1XOCA 3KFMA 1NNPA 5DTBA 1US4A 3T9HB 1LCFA 3H06B 3L6HA 1ZTYA 1LSTA 3OO6A 3MJNA 1IXGA 1SQYA 5FHMA 1OMPA 1GVCA 1MQGA 4XIGQ 2AIXA 5FHNA 5CRYA 4X1DA 3RT8A 4I62A 3T66A 4G8NA 1IXIA 1QKBA 3DM0A 4NTLA 2UVIA 2RINA 3PPPA 2E1SA 1ANFA 2DE2A 1FQAA 3CFLA 1NNFA 3PMXA 3ILUB 3O6IA 2GH9A 4MLQA 4GL0A 1MXXA 2NVUB 3EQ1A 1LB8A 3TCHA 3PMVA 1SW4A 1URSA 3EPEA 4EXKA 1MM6A 4GOTA 4XXUA 3E3KA 2QS2A 3MVZA 4NF4B 4ZEKA 4FEDA 5H8FA 3QYTA 1GTKA 4F2QA 2HQ0A 3VDFA 3IOTA 4KYSA 4GFRA 3F11A 3OO7A 3PD9A 2KLFA 5A5XA 4F39A 3BKIB 1NKXA 4R6KA 1B52A 3S9LC 3DP4A 3TQLA 4F3PA 5EHSA 4AB6A 5TP9A 4FECA 5L8DA 1LCTA 4H5GA 1B9JA 5KDTB 3S2VA 3FASA 1MG1A 3OOAA 5H8NB 3VFJA 5I56A 1OLAA 2A5TB 3VV5A 2V3UA 1Y1ZA 2V84A 2F34A 2AL5A 2XHDA 5AA2D 3RT6B 1S9TA 4E0XA 4AQ4A 1H45A 3PV0E 3T9VA 1Y3NA 5AA4B 1BP5A 3KG2A 4C1UA 1DPPA 5KZTA 2DS9A 4PFWA 1GV8A 3RTFB 1FTOA 1JW4A 4H0WA 4RNSA 3IB2A 1F9BA 3QSLA 3FV1A 1KWHA 1R6ZA 2XX7A 2XXVA 2DE4A 3TQWA 3O66A 2YLNA 3U94A 1BTJA 2Z22A 2E0SA 1P1UA 2H4IA 3H6TA 3D4GA 3H03A 1QUJA 3KSJA 2XX9A 3PGFA 4C1TA 1MY3A 1M5CA 4EXLA 1IQ7A 2DWHA 3H3GA 3PU5A 2D5WA 3S4UA 4RY1A 4JSOA 1PDAA 2F7AA 3C31A 2HAVA 4DE8A 5L9OA 4DXUA 1AOVA 1POY1 1NNTA 1B58A 2X7PA 3PMWA 4NF4A 1JEUA 2DWIA 1MXYA 1PBPA 4U23A 5DT6A 1D9VA 2Q2CA 3PD8A 5K2YA 1MQJA 5JEIA 1P1WA 2X26A 1Y9UA 3FXRA 4RA1A 3RTWB 3TTLA 4JBZA 3KEIA 4YKIA 1Z7NE 1FW0A 4YB5A 3OENA 2VD3A 4NF8A 3A09A 3RPWA 1QJMA 3IX1A 5KCJB 1B5HA 3O28A 5KDTA 4IB2A 4I1DA 5H8NA 5LOMA 5I58B 2UVJA 2NXOA 3TCGA 1PB7A 3HHFA 3V8XB 3K2DA 1DTZA 3UIFA 1BLFA 2FNCA 5B70A 5AA4A 2R6GE 4PP0A 4JWOA 5I2KA 5TU0A 2ZNSA 1II5A 1B4ZA 2V93A 4POWA 3EHTA 4IY5A 3ZS6A 4NWCA 2F6PA 2OJTA 1IXHA 4EDPA 1Q35A 4U4SA 4JWYA 4G68B 3WAFA 4DCXA 1O7TA 5TPAB 1M5FA 1EZPA 2O84X 3TAJA 5ICQA 2XD3A 3KJTA 3MPKA 3FVNA 4L17A 1B3GA 1QULA 2XXHA 4F3BA 2F7BA 4G4PA 2B65A 3KSXA 2ALUA 1N0TA 3S9EA 5ITPA 1FQBA 2OLBA 4IO6A 5DVJA 4THIA 3VE1B 4XKNA 4QSCA 3MZBA 2F5XA 3RGYA 5I57B 4BDLA 4X9TA 2Z8EA 1NH8A 4BLAA 4OENA 4NF5B 4OXVA 5AE4A 4ND9A 4ISUA 3ZKLA 4ZS9A 2DVZA 2PT1A 4QRZA 3QXMA 4FIMA 5HPQA 1YTVA 2GFEA 5KCJA 2Y84A 3M3LA 1VSOA 2YJPA 5I58A 3MBPA 2Q2AA 3UGWA 4JDFA 4IO2A 3I5OA 3Q26A 2ONRA 3GBAA 4XKPA 3PUYE 4TLLB 4IGTA 4ESXA 4JWXA 2ZYKA 1WVJA 1P1NA 5CI5A 3OSRA 1OIBA 4N13A 2R9JA 3H4ZA 2F97A 3EN3A 3O29A 2PX1A 1OQGA 4LZ7A 1RYOA 3K6VA 4F1YA 4RK9A 2I0CA 1RYXA 2M8CA 4IGRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CZHA 2G29A 4P0GA 4GWOA 4JVCA 3V5AA 5TPAA 1MPDA 3O6GA 4FATA 1B1HA 3BFTA 2Z8DA 1AWBA 1N04A 3HPIA 1T0KA 4KD5A 1SW5A 2F35A 3DELB 1NNKA 1NMUA 1YXIA 4NMYA 4PCDA 1Z7ME 4BDRA 2NOOA 3L6GA 3KGCA 3EHSA 3MWBA 3R7XA 2R71A 2DQVA 2VHAA 1ZKBA 2O7IA 1FQFA 4KI0E 4AS5A 1MXZA 2PVUA 2RC7A 1SVXB 5AA2B 4XKRA 1EZ9A 5I57A 5CMBA 4G68A 4H67A 3C36A 4NX1A 3OSQA 2PT2A 4X04A 1DCUA 1FPFA 4NF5A 5HBCA 1DTGA 4IO7A 3MC2A 4Q30B 4I3EA 3SEUA 4ZZAA 3KOSA 4U22A 1LAHE 1IMCA 3FZVA 1FQEA 1NFTA 3G7WA 3T22A 4PFIA 4HE2A 3MPLA 2DSFA 3K1MA 3TUSA 4YMBA 2R8TA 4KYDA 4RXLA 3C33A 4LUBA 3LSFB 1B3LA 1LAFE 1BIYA 2O69A 4PC9A 4R73A 4F19A 4G61A 4PFBA 1NUYA 4PE5B 1USYH 2I3WA 2F78A 3SETA 4OWDA 4C0RA 2Y7IA 2O1LA 3DP6A 4HE0A 2QVUA 4P8BA 3TYHA 1MDQA 2H25A 2QS4A 2OBGA 5DEXB 2DDKA 4XFEA 3VVFA 4H65A 3T96B 2XXTA 3IJOB 2LAOA 4IY6A 3KBZA 3ISPA 2RCBA 2HFBA 1NV7A 4YB6A 1VDWA 2RC8A 4PFUA 2XXKA 5ET7A 3OEKA 4WXJA 1A8EA 1SPIA 4N8GA 4Q5TA 3FGSA 5EHMA 3PUZE 4QHQA 3C9HA 3W9WA 3O6HA 4NF6A 2XXXA 2B3BA 2GQ1A 4H1XA 4EF1A 1NL5A 2B3FA 3LBSA 3U8QA 4NHBA 2I4BA 1IMEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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