3K6UA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in unliganded open form
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
b'EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule tags Transport protein
total genus 104
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA02
1O7TA 3IO4A 1JEVA 2QJEA 3MAMA 4UA8A 1II5A 3M3FA 4BDRA 3S9NC 1NKXA 1JQFA 3U1OA 4Q0CA 2REJA 1ELJA 3GBBA 3ODBA 1B32A 4BDQA 1FQBA 5CMBA 5H8SA 1IXHA 2HQ0A 1A99A 1ZU0A 3U72A 3GBAA 4WKMA 1T0KA 3LSXA 2B3FA 4LZ8A 1PBPA 3IK6B 2OLBA 2V93A 4YAHX 1LAHE 1UQWA 4HW8A 1LAFE 4C0RA 3G3JA 1LCTA 3FD3A 1LB9A 1H45A 4G2ZA 3OELA 3FXRA 3K6VA 2RCAA 3IAZA 2DXYA 3CR9A 4GQOA 5CM6A 3U94A 5H8NA 5CI5A 1SI1A 4DLDA 4IO3A 5I2KB 3MPLA 4ZE8A 1FW0A 3QAXA 2FYIA 1B58A 3I3VA 4KR5A 1SYHA 2Q2AA 4NF6A 4Q30B 2F7AA 3T96B 4K3FA 3SEWA 1FTMA 4GRKA 2HEUA 4G68B 4DXCA 4KD5A 2H25A 1H76A 1VSOA 2PX1A 3KBRA 3USDA 3T9XB 5I56B 1RYXA 2AL4A 3ZS6A 4U22A 4GFRA 2DVZA 2CZLA 1B52A 4YZZA 1MXUA 2I48A 4H67A 2DXRA 1AMFA 1NH8A 1M5EA 3ZSFA 4R75A 1US5A 5ITOA 3CFLA 3H06B 4HS7A 4F1VA 1NH7A 3K1PA 5EHMA 2XXIA 2I58A 4NEDA 4O3BA 4QFKA 1D3KA 4F18A 5B7DA 3QSLA 3V5AA 5B70A 5I2NB 2NWJA 5EYFA 1MQJA 5TPAA 1OVBA 2IEEA 4NF8B 5FTIA 2GHBA 3I6VA 4DXBA 5I2KA 4R6YA 3KSJA 1B0HA 1EZPA 1MM6A 1B4ZA 3L6GA 1MDQA 3E9XA 3I5OA 3V8XB 1JVXA 4F3SA 5CC2A 2ONSA 2QS3A 4G68A 1DTZA 3QXMA 4OWDA 3RUMA 2IA4A 4F2QA 4NE4A 2DWHA 4ZEIA 5I56A 4FATA 3A3UA 4Q5TA 4BDNA 1FQDA 4YU0A 2M8CA 4OFOA 1MPCA 3D4GA 1ZJLA 1JETA 5DVJA 1CB6A 3EQ1A 1JVYA 4FEBA 3TFLA 1SW1A 3FGSA 2CMOA 2NOOA 3H7MA 3C4MA 3H3GA 4PETA 1SDXA 1PC3A 4JWOA 3RLFE 4ELQA 5L8DA 1YTVA 3KN3A 2H98A 1M5DA 4KPTA 3G3KA 4OFLA 4HTGA 3P7IA 3IJOB 1ANFA 2UYFA 1A8EA 1FQAA 3E3KA 1MY1A 1N3XA 4JB7A 3N5LA 3W9WA 4WEPA 3AXFA 1PB7A 3PUZE 3FVKA 4LVQA 1MS7A 4MH5A 2R71A 3MP6A 4YB5A 3OMBA 1XOCA 4NF5B 4NF8A 1S7YA 1B3EA 2NXOA 4Q8RA 3O66A 3R26A 1R1NA 3CRBA 4MF3A 3MVXA 5HM4B 1FTOA 4QFLA 1A8FA 2RCBA 3E13X 3HHFA 5AA1A 2UVGA 4NWDA 4X9TA 3WAEA 1GTKA 2OWSA 1Y4CA 1B1XA 5JEIA 2R9JA 1Y3QA 4M1VA 4OVJA 5KDTB 3RQTA 5HPQA 3MZBA 4TLLB 3A3CA 4H0WA 3CFZA 3TZAA 3O97A 5FTHA 4O3AA 1CE2A 1QJMA 1NNKA 3VVFA 2YPNA 3PD9A 4FIMA 3FVOA 3OO8A 3KN7A 2UVIA 1B7HA 3KJTA 1LGBC 3OEKA 1I69A 3VXCA 4XKRA 4ZEBA 1LBBA 1NFTA 4BDOA 5TP9B 1NMUA 4F2OA 2OZZA 3TEPA 5KCJB 1Y3NA 1B2HA 2X7QA 3ECRA 4RJZA 4R6HA 3OOAA 3KOTA 4X1DA 2QS1A 5H8QA 1TXFA 3B6WA 1OQHA 4KHZE 3KJ7A 4GIZA 4ELPA 1YCJA 5CMMA 4MBPA 1QUIA 4U21A 5AA4B 4EXKA 2Y84A 2O7IA 4DXUA 1Z7NE 4F39A 2GRVA 3K1MA 3FJGA 1O63A 4ELOA 3LC8A 3H6VA 3G3IA 1LCFA 2HZLA 1IQ7A 4H1XA 1US4A 3PMWA 5IKBA 4NF5A 4FE8A 1RKMA 1A40A 3K02A 3ZKKA 3EHUA 2D5WA 3QIMA 3MP1A 2ANJA 4IO5A 2Y7WA 3DP6A 3OENA 5JTYB 2O51A 4GOTA 3RGYA 2E0SA 2F34A 3FVGA 1M5FA 4I1DA 3EHTA 3IL1B 4QSDA 3O29A 1A54A 1WVJA 4G8MA 4H65A 5TU0A 1BP5A 2NVUB 3K6XA 4X48A 2ZYOA 2P2AA 3FUZA 3C32A 4G68C 1B5JA 2UVHA 1FQCA 4IB2A 1EU8A 2DWJA 3VVDA 1N04A 2ONKE 2AL5A 3TUSA 3TTKA 3CSGA 3U8QA 1Y1ZA 3Q25A 1XC1A 3SEVA 4P0IA 1B40A 3FASA 3LSFB 2A5SA 5TP9A 1IXIA 3SEXA 4R73A 1XVXA 3C9HA 1LSTA 5I58B 1I6BA 1MQDA 1LLSA 3UORA 1URGA 3IORA 1R6ZA 2H5YA 1N0TA 1PBQA 4AQ4A 4E0WA 1P1OA 4TOZA 5L9OA 2ZMBA 1SI0A 4IO2A 5AA4A 5ICQA 3PMXA 3KN8A 3C31A 4N13A 2XXXA 1MQIA 1A55A 1BIYA 3QYTA 3TCGA 4M4GA 5A5XB 2VD3A 3KGCA 4XKQA 2QSXA 3TQWA 4GD5A 4QSEA 1AL3A 1S9TA 4NF4B 1OQGA 4F31B 3KFMA 5JTYA 2ZNTA 3MVZA 4JWYA 4BDLA 1URDA 3O6IA 1Y20A 3CG1A 2Q88A 2VOZA 4GF8A 5ISUA 3C36A 5DVFA 3RT8A 1BTJA 1B46A 4JDFA 4F3PA 3O2AA 4QRZA 3DM0A 3S2VA 5TPAB 1TFAA 4YB6A 1A7LA 1USYH 4RA1A 4WEDA 3R7XA 1XVYA 1DPEA 3B6TA 1I6QA 5DVIA 3OO6A 4FJPA 2V84A 2DE2A 1ZMGA 2DQVA 3BFUA 4DDDA 3SKPA 1IXCA 2ZNSA 1Q1KA 2PYYA 3G3GA 2OWTA 3MVWA 2XXRA 1MXZA 4KYSA 5I58A 3TYHA 1UIUA 3TPAA 3DP4A 4QHQA 4C1TA 2O84X 3QUFA 4I62A 5CRYA 2F35A 3JYRA 5DT6A 2XXHA 2F6GA 1IZ1A 3G3FA 4GVOA 1MQHA 4KYEA 2H9BA 3QK6A 3O28A 1B05A 1QUKA 2HZKA 4DCXA 1AOVA 2VD2A 3T22A 3OEMA 2O6AA 3PUYE 2KLFA 5H8HB 3FV2A 3RT6B 5A5XA 4FAJA 2Z22A 3M3LA 1ZKBA 1PB8A 1XS5A 5ITPA 2G29A 2REGA 2I4BA 4IGRA 1IIWA 5DEXB 2UXAA 2XX9A 4NF4A 2I6EA 2YLNA 2OCUA 4HCYA 3HHGA 2R6GE 3RTWB 4N07A 1HSEA 1ATGA 4RK9A 3PUWE 3KG2A 2AYSA 2D21A 3WAFA 3PPNA 1OMPA 4PFWA 1NNPA 2B65A 3SESA 4GXAA 1AH5A 4IO4A 1JEUA 4ELRA 1B3GA 3H6WA 1YAEA 3CSBA 3GLBA 4GL8A 3EHSA 1LFGA 3UA8A 3G7WA 5FHOA 4U1ZA 3FIRA 1OLAA 5JK4A 4ECFA 3HPIA 3A09A 3MC2A 2XD3A 2DYXA 3IB1A 2HXWA 2ONRA 4YMBA 2OBGA 4GLIA 5I57A 1MXYA 3DP8A 4KQPA 1ZIUA 3MPKA 4BDMA 2WKYA 2RC7A 4U23A 1FTJA 4POXA 1LAXA 5H8FB 1MG1A 3LUYA 4JXIA 1QW0A 5I84A 1M5BA 3S4UA 3TTLA 4ISUA 5H8HA 4QFOA 4XKPA 2NUVA 3K01A 4LATA 1DMBA 1WODA 2DE4A 1DOTA 3QUJA 1FTLA 2XXPA 4NMYA 4EQ7A 5DEXA 5H8QB 1FTKA 3TELA 4U1OA 3N94A 2THIA 1D9VA 3Q26A 1MH4A 3L6HA 3VLWA 4F1YA 2DVCA 4KCCA 3VXBA 1HSLA 3FXUA 1FCKA 4HCWA 3MWBA 1MY4A 5F1QA 4R2FA 3OD7A 1Q35A 3TTRA 1BKAA 1POTA 2Z8DA 1MH3A 5FHNA 1LAGE 1MDP1 1EZOA 3K2DA 4RYAA 3G3HA 3MZ1A 4OZ9A 3PD8A 4LUBA 4BLAA 4EF1A 3W15C 2F5XA 1Y9UA 3PUVE 1Z7ME 4ZEDA 4GL0A 4EF2A 3TCFA 3PUXE 1WDNA 3RTFB 5J1DA 3HN0A 5CBRA 1UTBB 1P1QA 2Z8EA 2ZYNA 3FJMA 1S50A 3U92A 1OVTA 5AA3A 3OSQA 4G8NA 5H8FA 2G93A 3EF7A 3MJNA 1TFDA 4OTEA 1GV8A 1P1WA 1IXGA 1DSNA 5I59B 1B51A 3SEYA 1XHYA 3TCHA 4F22A 3IOTA 4R9FA 1MY3A 2O68A 3IOUA 3B7DA 3ZKLA 3IJXB 2XX7A 4G4PA 1EH3A 1SYIA 5FHMA 3UGWA 4F19A 3R6UA 4EQ9A 4G77A 1D4NA 3O9PA 1ZTYA 2ABHA 1ZLQA 4PFTA 4FEDA 4ZE9A 3HCQA 5F7VA 3U93A 1JW1A 3IB2A 1H43A 1I6AA 2F78A 1EZ9A 1QKAA 3SETA 2Q2CA 1IITA 4LONB 1M5CA 1IUDA 2Z8FA 1POY1 1SD3A 1N7WA 3SEUA 2Y7PA 4E0XA 1B1HA 2ZXTA 1N76A 2HAVA 4OEUA 3JZJA 3RY3A 3LSLA 3GZGA 4ND9A 1B9JA 1GGGA 3PU5A 3FJ7A 4XXUA 4F1UA 3Q27A 5IAIA 5M2VA 4JSOA 1UTBA 2RKMA 3E4RA 4YKJA 2DWIA 2O7UA 3K6WA 3LSWA 1N84A 4H5GA 3N6UA 4TLMB 1SW4A 3T9VA 1PDAA 3KSXA 3MP8A 2QS4A 4I8CA 1AIVA 3O6HA 3MW0A 5I59A 1H3DA 1PEBA 2I3WA 3KOSA 4POWA 3SDFA 1B4HA 4RY1A 3BKIB 1QVSA 1QULA 1IEJA 3K4UA 2O69A 4ZDMA 1RYOA 4IGTA 1B3HA 1XT8A 5K2XA 1N7XA 5AA2D 3N26A 4U4SA 4ZS9A 4DZ1A 4OQOA 4ZZEA 2QS2A 1JW5A 4H6DA 4P0GA 4MLVA 2Q8JA 3T9UA 1L5TA 4R6KA 2DOJA 3PPOA 4ZEFA 2QMXA 1KWHA 1SW5A 4P11A 1J1NA 3PV0E 1Y4TA 5K2YA 3TTMA 3FXQA 2P0SA 4RNSA 3M3KA 1B6HA 2QMWA 4U2RA 3OO9A 3TDJA 3K1NA 3BBRA 3C34A 4Z0IA 2DE3A 2XD2A 1P1UA 3OXNA 3FV1A 3PGFA 2F36A 2O1LA 3T93B 3MQ9A 3KZGA 1B5IA 2BJJX 4OERA 5L9SA 4IY5A 3K6UA 3HV1A 5L9MA 4ESWA 3SERA 4RXLA 3UN6A 2RF1A 3MBPA 3ONMA 2UYEA 1GR2A 2GHAA 3MVYA 2FNCA 2LAOA 2W7YA 3N6TA 1FQEA 4R72A 3DELB 5I57B 1MXVA 4ZECA 2GFEA 3EPEA 4EQBA 3CFXA 4EUOA 3H6TA 3W9VA 4NTLA 3THIA 1F9BA 3H6UA 2RC9A 2P1SA 2F97A 2X7PA 4PP0A 2H4IA 1N3WA 1PB9A 4OFJA 4WXJA 5AA2B 3S9MC 1MM7A 3B6QA 2ZNUA 3S9EA 3T66A 3IO6A 4N6PA 1QUJA 2F8DA 4KFQA 2XHDA 2I4CA 2D3IA 1VFDA 1B7ZA 4XTCQ 4LQ2A 4NWCA 4XIGQ 3KEIA 2PT1A 2X26A 4F29A 4JSDA 1MXWA 4OMBA 5CMKA 1MY2A 2VP1A 2RINA 3CVGA 3F11A 4JWXA 1MPBA 2PMSA 2FA7A 4EDPA 3PMVA 3VFJA 1O64A 4FORA 1LFIA 2DSFA 2F6PA 2I0BA 1P1NA 3O6GA 1Y3PA 4C1UA 2RC8A 3MZ9A 4RPNA 2UVJA 4YB7A 3TTNA 4AB5A 4R9GA 2V3QA 4PFYA 2YJPA 1B5HA 4DCYA 2I3VA 3TQLA 4RPOA 4OENA 2XXQA 2PT2A 4QFNA 1SBPA 2ALUA 3IB0A 3LBSA 3K00A 4OETA 3M8UA 3TODA 4F3GA 2VHAA 3VVEA 4THIA 1D9YA 1BLFA 3VV5A 3RPWA 5DYHA 4IO6A 1NNFA 5AA2A 1DPPA 2A5TB 2XXVA 3PPQA 4MLQA 2DWAA 2Q89A 2ESNA 1MQGA 2B3BA 1GVCA 3H4ZA 4OEVA 3OSRA 1LBCA 1B7UA 3UP9A 3C33A 1NL5A 4PQJA 2AIXA 5CMCA 3JV9A 2V25A 2XX8A 1VE4A 2XXYA 1DTGA 2F7CA 5ICTA 4G8HA 3ILUB 3UIFA 2QPQA 2F7BA 2DS9A 1R9QA 3FVNA 4LZ7A 4H8IA 1LB8A 4LZ5A 1MRPA 4RK2A 4OESA 5BUUA 3RNNA 1MPDA 2GH9A 4I9DA 2ZYKA 4YMAA 1SVXB 1VFEA 5DTBA 4QSCA 4O3CA 2Y7RA 5I2NA 2XXTA 1H44A 3CG3A 3UK4A 3FATA 1LFHA 2H99A 3D4CA 3T9HB 4DE8A 3S9LC 4OYVA 1TT1A 2E1SA 3VLVA 3RN8A 2VGQA 1OLCA 3V83A 1URSA 3MUQA 4ZZAA 2V3UA 1YPNA 2XXUA 3Q29A 4AB6A 2DP8A 2OJTA 4KCDA 1JNFA 3TAJA 2I49A 1VR5A 4ONYA 4GXSB 1NNTA 1OIBA 1UTHB 4PE5B 3OO7A 4PFUA 1QKBA 3IR1A 2A5TA 1MY0A 3CIJA 2ZYMA 3IOWA 4IY6A 4LP2B 3PPPA 2O1MA 4Z7EA 2HCAA 5KZTA 2I0CA 4KYDA 5LOMA 1B3LA 3HO7A 3FZVA 4IO7A 2QRYA 4H8JA 2XXWA 3VDFA 2PVUA 5CBSA 4R2BA 1B0LA 4YKPA 4H5FA 4DIGA 3PPRA 1P99A 4YKIA 3GXAA 3EN3A 3VE1B 4MFIA 4ESXA 1HSJA 4XKNA 4TQUQ 1JW4A 2Y7IA 4L17A 4U4XA 4EXLA 1Y1MA 1FQFA 3VLUA 4YKKA 4LQ5A 5BWJA 2PBWA 5ELVA 4LA9A 4FECA 4R74A 2Y7KA 3CI8A 3ILTB 3Q28A 1SQYA 3LR1A 3IOVA 1R9LA 3BFTA 4OXVA 4KI0E 3HSTA 1TWYA 1MXXA 2HFBA 3K0VA 3V89B 4F3BA 4GWOA 2V3TA 5HBCA 3H03A 1UTHA 5KDTA 4OHNA 5H8NB 1SW2A 1B3FA 4UACA 1UIVA 5EHSA 3DLNA 3TMGA 2Q9TA 1ZBMA 4X1BA 4JBZA 2HAUA 4QF9A 3IX1A 3C35A 4YICA 4NF6B 4QFPA 2Z23A 2OK2A 3TKDA 1USYE 5AE4A 4ZEKA 5KCJA 2QL3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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