3K6UA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in unliganded open form
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina acetivorans
total genus 104
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6uA02
4MF3A 2HQ0A 4R6YA 1SDXA 4NE4A 3T9XB 2P1SA 3PMVA 3RN8A 3K02A 4K3FA 1B4ZA 2I49A 4RPNA 3N94A 4KQPA 4KHZE 4TQUQ 2D3IA 4BDRA 1FQAA 2PMSA 5ICQA 3B6TA 4Q5TA 4GFRA 4WXJA 4JWOA 1POY1 2OLBA 5L9SA 1UIVA 5I84A 2PT1A 3KN8A 1B0LA 1OLCA 1Q35A 1NH8A 4EQ7A 4HS7A 1L5TA 3PD9A 1JVXA 3FVKA 3H6WA 1UTHA 3TODA 4EDPA 1Y3NA 1OMPA 2HCAA 4WEPA 2H9BA 3A3CA 1USYE 4IO3A 4G77A 3ZKLA 2ZYOA 3MVYA 3PMWA 2I48A 4Q30B 2XXHA 1NMUA 5CRYA 3H4ZA 4LUBA 1QKAA 3OSQA 3MWBA 1JQFA 4DXUA 4IO7A 2AL5A 2ZYKA 1B1HA 3O29A 5AA3A 2DXRA 5CM6A 4PP0A 1DMBA 3FXRA 4H65A 5FTHA 3TTKA 1BTJA 3IB1A 1Z7ME 3TKDA 3QUJA 3IJXB 4AB5A 2HFBA 5I2NA 2FNCA 4LONB 4DE8A 1B3GA 2I4BA 4ELOA 1HSLA 3Q27A 3WAEA 1B1XA 3V5AA 4EUOA 2H98A 1MPCA 5H8NA 2OK2A 5FHNA 3JZJA 1PDAA 1Y3PA 2DP8A 3K2DA 3G3IA 4P11A 1FTLA 1MY0A 3T22A 1KWHA 1URDA 3FJ7A 3PMXA 1DSNA 1TWYA 1XHYA 3RUMA 3A3UA 3VLWA 1QKBA 2NUVA 1QVSA 4G8HA 2H4IA 3VDFA 4DCXA 3G3FA 3IB2A 3QIMA 1IQ7A 1EZPA 3M3LA 1NKXA 4FEDA 4ZZEA 4KD5A 2QMXA 2UVJA 4C1TA 2A5SA 5IKBA 1PC3A 4OZ9A 4AQ4A 2HAVA 1B3EA 3DP4A 4IO2A 1MH3A 3SEVA 2UXAA 5I2KB 1OLAA 2QL3A 4TOZA 3GBAA 2DVCA 2O84X 4WEDA 2AIXA 5ISUA 3ILUB 4EQBA 4PFTA 3EPEA 1DOTA 1MQGA 3HHGA 1LAGE 3ODBA 4GIZA 2X7QA 3PD8A 3S9MC 1LAXA 1LFIA 1AIVA 1FTOA 1IEJA 3R26A 3U1OA 1NNTA 3N5LA 1RYXA 3PUXE 3W9VA 1QUJA 3IAZA 1MG1A 3O97A 1LGBC 3KN7A 3TYHA 3SERA 1OQHA 4OERA 3CG3A 3PPQA 3OO6A 4NF8B 5I56A 1SVXB 3CR9A 3PU5A 2DWHA 5AA2A 1IUDA 2DVZA 3ILTB 1N7WA 5H8QB 1UIUA 1SBPA 1GV8A 4XKNA 3MC2A 1LAFE 2FA7A 2I0BA 4O3CA 2F7AA 5H8NB 3ZSFA 4F31B 2DWIA 3IOWA 5HM4B 2XXYA 2R9JA 4F3GA 2RC9A 5AA2D 3MQ9A 1B9JA 4YAHX 3SETA 2PBWA 1SYIA 4QSCA 4H5GA 5L8DA 3SEYA 5KCJA 5DEXB 2XX8A 3V89B 2IA4A 1IZ1A 4UA8A 1WVJA 5H8FA 1A55A 4MBPA 3UA8A 4R73A 3HCQA 1NH7A 3LUYA 1A8EA 1EZOA 3IOTA 3PPPA 4IY5A 2Y84A 3SEUA 2WKYA 2IEEA 5DVIA 3G3HA 3VVEA 1JW5A 3B6WA 3T66A 3TCGA 3V83A 4O3BA 3VXBA 5AE4A 3K1MA 4HCYA 4FATA 3CFZA 2XXIA 4U2RA 5KDTA 4QSDA 3DP6A 4ELRA 1IXGA 2O68A 4XTCQ 4JB7A 3UIFA 4LP2B 1OQGA 3UK4A 5EYFA 1P1UA 1JW1A 3MPKA 1H76A 1Y1ZA 1N3WA 3EHSA 1TFDA 4NF5A 4RXLA 3BBRA 4R9FA 3L6HA 1P1QA 3KOTA 3HHFA 1MXZA 4QRZA 4QHQA 4ZEIA 4U21A 3U93A 3GXAA 5I58A 3KJ7A 5TPAA 4OFOA 4KFQA 3RQTA 1EZ9A 1LFGA 2CZLA 3FXQA 3OOAA 4GQOA 3G3JA 4ESXA 3CSGA 4PQJA 3WAFA 1FQEA 4ZECA 2VGQA 4ZEBA 4R74A 3GBBA 2UYFA 5I56B 2ZNTA 3KEIA 5ITPA 1M5BA 3B7DA 5AA2B 3USDA 4JDFA 3PV0E 3V8XB 1LCTA 5FHOA 4OWDA 3OO9A 4OEVA 4P0IA 4F1UA 1BP5A 4U1OA 3A09A 1A7LA 1OVBA 3KGCA 1WDNA 2RINA 4R6KA 2NXOA 2XX7A 2F7BA 3IOUA 4X1BA 4YKIA 1YPNA 5CMCA 5H8SA 1B52A 4LQ2A 1QUKA 3KZGA 5FTIA 3H6TA 3FJGA 2NOOA 5TP9B 1Y3QA 3VVDA 3K6XA 4MFIA 5IAIA 2R6GE 2OCUA 4KCCA 1R9LA 2XXWA 3CSBA 1DPEA 2I6EA 4HW8A 1IITA 2OWTA 4H8IA 4F22A 5KDTB 4DXCA 2DWAA 1MY2A 1MXYA 1R6ZA 4F2QA 2ONRA 2GH9A 1WODA 1N76A 2PX1A 1LB9A 5DYHA 4F3SA 1ZBMA 4YZZA 4TLLB 4I9DA 4ISUA 2VOZA 3KJTA 4ZDMA 1TFAA 3K01A 1T0KA 1XOCA 2I0CA 1B46A 2F36A 3OMBA 2F7CA 2I4CA 2RKMA 1B7ZA 2QPQA 4F18A 3M3FA 5CMMA 2BJJX 3C33A 2Q2AA 1MDP1 4RPOA 1MRPA 1M5DA 2Z22A 3H6UA 4BDQA 3CI8A 1B58A 3QXMA 2B3FA 2QRYA 3TDJA 2HXWA 3PUZE 2Z8FA 1JW4A 4G4PA 1N04A 3O6HA 2P2AA 1MH4A 2RC8A 3KBRA 1PB7A 5CBSA 3FV2A 2HEUA 4F3BA 2XD2A 5H8HA 3UN6A 2O1LA 3ECRA 1AOVA 1MY4A 4G8MA 2O6AA 2DWJA 4GOTA 2HZLA 5F1QA 4U1ZA 3EQ1A 4IO4A 4EQ9A 1MPBA 2I3WA 4NF6B 4OFLA 2Z8DA 2FYIA 2DQVA 5J1DA 3FGSA 3S9NC 5CC2A 1JVYA 1FTKA 2DOJA 1GVCA 3MP1A 4RY1A 4G68A 1D9VA 4H67A 1CB6A 4FORA 3EF7A 3FASA 4F19A 5DT6A 1M5EA 4F1VA 4O3AA 3TTMA 4LVQA 1I6QA 5JTYA 4FJPA 4U4XA 4BDLA 1EH3A 3TCHA 2GRVA 3PPNA 4GL8A 4U23A 3TTRA 2G93A 3C4MA 2VP1A 1P1OA 3D4CA 3C32A 4LZ5A 4IGTA 2VD2A 4GXAA 4TLMB 3T9VA 3IX1A 4KR5A 1UTHB 1B4HA 2DXYA 1M5FA 1QW0A 3IK6B 5JK4A 1O7TA 3I6VA 1O64A 2Q88A 1EU8A 4OTEA 3PUWE 1AMFA 3CG1A 3OEMA 4FEBA 4G8NA 4YB7A 1ZLQA 1N7XA 4N13A 3FZVA 1I6BA 2Q8JA 2DS9A 5CMKA 4ZEFA 3MZ9A 4E0WA 2O51A 1S7YA 3IORA 3IO6A 3TELA 1ELJA 4LA9A 1AH5A 5K2XA 2HAUA 2RC7A 3HV1A 5EHMA 1POTA 4H6DA 2V3QA 3EN3A 1VR5A 1MY3A 3RLFE 4IO5A 3TFLA 4PFUA 2F35A 2H5YA 4G2ZA 4POXA 1D9YA 2E1SA 4NF4A 3U72A 1NNFA 1SW2A 1MQDA 1BLFA 3CFLA 1D3KA 5I59A 1FTJA 2OZZA 4H0WA 2LAOA 3ONMA 5I2NB 5FHMA 1DTGA 4JBZA 1ANFA 3MVXA 5ELVA 4G68C 4PE5B 5CBRA 3VLUA 3T93B 1Y4CA 2F6PA 1S50A 3BKIB 1B5JA 3H06B 1B6HA 4X9TA 2P0SA 1D4NA 1MXXA 3C34A 1YAEA 4EXKA 3TZAA 1N0TA 4MLVA 3SDFA 1O63A 3MPLA 5ITOA 1MPDA 1MS7A 4BLAA 1Y1MA 4IO6A 4DZ1A 1Q1KA 3TQLA 1LBBA 3KOSA 4XKPA 1II5A 2O1MA 2YPNA 3LSWA 3KFMA 2X26A 3DELB 4EF2A 2XX9A 3HN0A 3E13X 4QFOA 1SW5A 4I1DA 3RY3A 2Q89A 1A8FA 1Z7NE 1GR2A 4XIGQ 2ZYNA 3K00A 4YMBA 1DPPA 1MQHA 4NEDA 2V3UA 5JEIA 4OFJA 2ZMBA 5TU0A 3MW0A 4JSDA 1LAHE 2XXXA 5M2VA 3G3GA 1LB8A 5BUUA 3N6TA 4OETA 2UVHA 1Y4TA 4ZEKA 4QFPA 1ATGA 3PPOA 1US5A 4L17A 1URSA 3OSRA 1VSOA 4FE8A 4H5FA 4I62A 4YB6A 4F29A 5DTBA 2QS1A 3VE1B 4WKMA 2O69A 1B0HA 5B7DA 4C0RA 3OXNA 5I57A 3S9EA 1MQJA 1H43A 3MP6A 2B3BA 3O6IA 2OBGA 2XHDA 4Q8RA 4ZS9A 5AA4A 4X1DA 3H03A 3K1NA 3CRBA 1YCJA 2ZNUA 1VFDA 1LFHA 2D21A 1MM7A 4OHNA 3H3GA 2ZNSA 4R2FA 1IXHA 1Y9UA 3RT6B 3TUSA 2DYXA 1NNPA 2O7UA 4HCWA 3HSTA 4GRKA 1ZKBA 2GHBA 4XKQA 1B7HA 2F6GA 3W15C 3VXCA 4OVJA 1S9TA 1HSJA 1FQBA 4LZ8A 3BFTA 3QAXA 1SW4A 2ZXTA 3I3VA 2M8CA 4N6PA 2REJA 4F39A 1CE2A 4PFWA 2QS2A 1F9BA 5KCJB 4FECA 3S9LC 5H8FB 3MAMA 3JYRA 4C1UA 4ND9A 5A5XA 4MH5A 5DVFA 4N07A 1US4A 3U94A 1B5IA 3I5OA 3FUZA 3TQWA 1VE4A 4YU0A 1PBPA 4OYVA 2RF1A 1SD3A 2V84A 3RTFB 3B6QA 2XXTA 4I8CA 3E4RA 3UORA 1LBCA 4NMYA 2A5TA 3Q28A 2CMOA 5CMBA 4JWYA 5BWJA 1I6AA 4NTLA 5L9OA 3FVOA 5F7VA 3IR1A 4OMBA 4QFLA 1SI1A 4NF5B 4Q0CA 2XXRA 3FJMA 4RYAA 3RT8A 1LSTA 4OQOA 1I69A 3O9PA 3R7XA 3U92A 2YLNA 1IIWA 1XT8A 3RGYA 2E0SA 3DP8A 2F5XA 3HO7A 4YICA 2Z23A 4F1YA 5I58B 4JWXA 5TPAB 2ZYMA 5I2KA 1B3FA 1YTVA 4ESWA 5I57B 1OIBA 1QUIA 1ZMGA 2B65A 3FD3A 2RCAA 1MM6A 4ZZAA 2NVUB 3TAJA 1OVTA 4ZE9A 2UVIA 3L6GA 4XXUA 3H6VA 5B70A 5AA4B 2Q9TA 4Z0IA 4RNSA 2Q2CA 2DE3A 3O2AA 4GXSB 1P1WA 4M4GA 2O7IA 4F2OA 1MDQA 2ALUA 3OO7A 3KG2A 3OELA 3DLNA 3FIRA 3CIJA 3T96B 2XXVA 1ZIUA 4QF9A 3TEPA 3EHUA 3PUYE 2XD3A 3QSLA 4U22A 3LC8A 3VVFA 3FV1A 3MVZA 2R71A 4JXIA 3ZKKA 4NF8A 3W9WA 2QJEA 3K6UA 2ONSA 2PT2A 2Y7KA 4IGRA 5H8QA 3KSXA 3MVWA 2XXQA 3KN3A 3MZBA 5AA1A 5LOMA 3T9HB 1B7UA 5A5XB 4DDDA 3F11A 3M3KA 3ZS6A 1IXCA 2F97A 3R6UA 4BDNA 3PPRA 4MLQA 3UGWA 4GWOA 4OENA 2UYEA 2Y7WA 3K6WA 1BKAA 5DEXA 1J1NA 3RNNA 1UTBA 2A5TB 1FQDA 1MXWA 4KCDA 1A99A 5L9MA 4ECFA 1USYH 3HPIA 1LCFA 4YB5A 2QMWA 4DIGA 4DXBA 4GF8A 4EXLA 3FVNA 3MZ1A 1DTZA 3G7WA 3O6GA 4Z7EA 4KYSA 4E0XA 1ZU0A 4ZEDA 1TT1A 4ELPA 1FW0A 3THIA 1PBQA 4IY6A 1VFEA 1NNKA 4P0GA 1Y20A 4H1XA 3RTWB 4F3PA 2ESNA 3SESA 3GLBA 1NL5A 1HSEA 4DLDA 4X48A 1BIYA 2AL4A 1MY1A 4PFYA 3D4GA 2YJPA 1SYHA 1R9QA 3SKPA 3JV9A 3OD7A 3IOVA 1JEVA 3GZGA 3IB0A 1GGGA 4QSEA 3KSJA 4OEUA 4H8JA 3S4UA 2ONKE 1RYOA 1IXIA 1MXVA 1SI0A 2V93A 1B40A 4RK9A 3SEWA 1QJMA 3FATA 2UVGA 3C36A 1FCKA 1RKMA 4YKJA 1FQFA 1P1NA 5H8HB 3LSLA 4RA1A 4BDOA 2XXUA 5DVJA 3LSXA 3N26A 2Z8EA 4R2BA 4YKPA 4OXVA 3TMGA 1AL3A 2VHAA 3IO4A 4KI0E 4POWA 1MQIA 3VLVA 5HBCA 1A40A 4NWDA 2QS4A 2V25A 3TTNA 3QYTA 2D5WA 2G29A 4GD5A 4NWCA 1SQYA 2Y7PA 3Q26A 2AYSA 3LSFB 4HTGA 1M5CA 1H3DA 1PB9A 5HPQA 1JEUA 3MUQA 2ANJA 4G68B 3P7IA 1JETA 3K4UA 4LATA 2H25A 3O66A 2GFEA 3SEXA 2F8DA 3S2VA 2X7PA 1N3XA 4R75A 3C9HA 1UTBB 2GHAA 4KPTA 5JTYB 3O28A 3U8QA 4KYDA 1XS5A 5TP9A 4FIMA 1URGA 3T9UA 3MJNA 4BDMA 4RK2A 1PEBA 2ABHA 4ONYA 1H44A 3Q25A 4YKKA 1ZTYA 3K1PA 2Y7IA 4DCYA 1B3LA 2PVUA 4ELQA 3LBSA 3QUFA 1XVXA 5CI5A 3IL1B 4GL0A 3BFUA 3H7MA 1MXUA 3PGFA 4GVOA 4ZE8A 3FXUA 4AB6A 1P99A 1B32A 4IB2A 4GLIA 2REGA 3E9XA 4M1VA 3AXFA 2HZKA 3TPAA 1SW1A 2NWJA 5K2YA 1XC1A 1UQWA 4EF1A 4THIA 1JNFA 1PB8A 3C35A 3C31A 1LLSA 1TXFA 4KYEA 3FVGA 1A54A 1B05A 3QK6A 4NF4B 4QFNA 2DE4A 2PYYA 5I59B 3RPWA 2QSXA 3OENA 1H45A 3M8UA 1XVYA 3G3KA 4JSOA 3K0VA 4LQ5A 2QS3A 2DSFA 1B3HA 2I58A 4U4SA 1GTKA 3TTLA 3TCFA 2Y7RA 3PUVE 4OESA 4R72A 1R1NA 4YMAA 3CFXA 3OEKA 2OJTA 4RJZA 1B51A 4PETA 1ZJLA 3EHTA 3Q29A 5ICTA 2F34A 4XKRA 2F78A 2RCBA 3VFJA 5KZTA 3LR1A 3MP8A 3UP9A 5EHSA 2DE2A 2VD3A 3OO8A 1QULA 3DM0A 3K6VA 3CVGA 3N6UA 2H99A 2V3TA 4QFKA 2I3VA 4UACA 4NF6A 1FQCA 1FTMA 4FAJA 3MBPA 4R6HA 3E3KA 3VV5A 2OWSA 3IJOB 1B5HA 2XXPA 1N84A 4LZ7A 2W7YA 1NFTA 1B2HA 2KLFA 2THIA 4R9GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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