2ONSA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda with bound tungstate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
GHMNVKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPLVPPRADTAVPSLKAMVEVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ligand binding protein
source organism Archaeoglobus fulgidus dsm 4304
publication title Structure of an ABC transporter in complex with its binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
total genus 110
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA02
1BLFA 3T22A 3FXRA 5EHSA 3W9VA 3OELA 2XXYA 4OEUA 5DTBA 5FTIA 1R6ZA 3MW0A 4JXIA 2NXOA 4EQ7A 1GR2A 1H44A 4C0RA 5IAIA 4ZZAA 4LZ8A 4R6HA 1CE2A 4MFIA 1P1NA 2ZMBA 1SW1A 3IORA 4F3PA 1A55A 2P2AA 4C1UA 4G68C 2NOOA 5KDTB 1A8FA 1SDXA 2RKMA 2XX9A 4O3CA 3IK6B 1B7UA 3RUMA 3MQ9A 3MZBA 3RNNA 3DELB 1SYIA 2B3BA 1FQCA 4WEPA 1R9LA 4NF6B 3RY3A 3MPLA 4PQJA 3UIFA 2OK2A 1IXGA 1FQFA 1IIWA 5KCJB 2YJPA 2PT2A 3KGCA 1LCTA 3T9HB 4DXBA 5H8NA 3M3KA 3G3KA 4ZE8A 3MP8A 1MY1A 4DDDA 1LBBA 3G3IA 1PB8A 3MZ1A 4ONYA 3BFUA 1N04A 3VLWA 2I58A 3MP6A 2I0CA 1N3WA 2FNCA 3FJ7A 4NF5A 1LAHE 2F8DA 5JK4A 3FUZA 4FECA 1Y3NA 2ZYOA 3MWBA 4ELOA 3TELA 1Y1ZA 5CMBA 4R75A 3V5AA 2W7YA 4ELRA 2HAUA 3PUWE 2DE3A 3UGWA 4ZE9A 1UIVA 3SETA 2R71A 1YAEA 3O6GA 2Q88A 1Y4CA 1Y4TA 2CZLA 2DYXA 1HSLA 4MBPA 3K2DA 3DP8A 1O64A 2UXAA 3O28A 1B32A 3IOWA 1B05A 4ZEFA 3HN0A 4IO2A 1QVSA 1QJMA 1M5FA 4QF9A 4TLMB 2H4IA 3K6WA 3C32A 3QSLA 3G3FA 4HTGA 4G8HA 4RYAA 4ZZEA 3MP1A 4POWA 4MLQA 3CFLA 4R9GA 2XXQA 4FORA 1IXHA 3PPOA 2O69A 4XIGQ 3SEVA 5CM6A 3UA8A 5TU0A 2DOJA 3CIJA 4YB7A 2Q89A 2F7AA 2OJTA 3S2VA 2VHAA 5TPAA 4Q5TA 3R26A 1LB9A 3HO7A 4XKQA 3GLBA 3E4RA 2B3FA 5DVIA 5CBSA 1B2HA 2GHBA 3JYRA 4LVQA 3MBPA 1UTBB 4G8MA 1D4NA 4U4XA 2ZXTA 4XXUA 1IQ7A 2V3UA 4K3FA 4ZEDA 4KCDA 4RNSA 2Q2AA 2NWJA 4OYVA 5I2KA 1S9TA 2O84X 5H8HA 3S9MC 2LAOA 1FTKA 4HCYA 3FATA 1YPNA 1ZKBA 2O51A 2Y84A 2PX1A 4X1DA 3UORA 3IAZA 3ONMA 4THIA 5H8FB 2ZYKA 2ONRA 4ESXA 3FVNA 4RA1A 2G29A 1JVXA 5H8QA 1B3GA 5I56A 1LCFA 1ZU0A 1MQGA 1SI0A 4EF2A 5H8NB 1FTMA 3OENA 2ALUA 2O6AA 5ITOA 1XC1A 2DVZA 1II5A 1JQFA 3V8XB 3TMGA 1SW2A 3C33A 3DLNA 1B52A 3VFJA 1MXVA 3H06B 3K1NA 3C9HA 3RQTA 4H5FA 3MUQA 5CMMA 2GRVA 1JETA 3OSQA 1IXCA 2DXYA 3FVKA 3RPWA 3OOAA 4HS7A 3OEKA 1M5DA 1T0KA 4ZEKA 2VD3A 4LUBA 4E0XA 1VFEA 5ICQA 4IGTA 3TTLA 3R6UA 1AH5A 3C31A 3I5OA 2ZYMA 1XVYA 3M3FA 4U4SA 3KN7A 3G7WA 4GOTA 4PETA 1H45A 3L6HA 2Y7RA 1MQJA 4UA8A 4Q0CA 2F6PA 3N26A 4OQOA 4GF8A 2NVUB 2RC7A 3LSXA 4NF6A 4UACA 1SYHA 5EHMA 3VV5A 2XXTA 4EDPA 3LR1A 4QFNA 3IB0A 3HCQA 2AL4A 3K02A 3BFTA 2QS3A 4N13A 4PFTA 1B4HA 3PUYE 4KCCA 1ZIUA 4LATA 4H8IA 2XXIA 2QRYA 3FXUA 3H3GA 1OIBA 3SEYA 3TCHA 4FATA 2XXRA 5TPAB 3PPPA 4JSOA 4U2RA 3Q25A 2AL5A 4OENA 3C34A 4F1YA 3G3HA 3KOSA 2FA7A 2VGQA 5CC2A 5I2KB 3MVYA 4DCXA 5ICTA 3SERA 5H8HB 2XHDA 4F1UA 4NMYA 1OLCA 1EZ9A 3PMVA 4I62A 4YB5A 1Y3PA 3ZKLA 3O66A 3GBAA 1HSJA 1POTA 4IY5A 5FHMA 2R9JA 2RC9A 1B4ZA 4EQ9A 2XD2A 3H6TA 5F7VA 4KQPA 3MAMA 5H8QB 5HBCA 2GHAA 3VDFA 2ANJA 1MQHA 3FVGA 4JWYA 1OVBA 4JB7A 4ND9A 4H5GA 3PUZE 4R9FA 4NWCA 4ECFA 1WVJA 3MPKA 2XXPA 3TTMA 3VVEA 1XOCA 3TFLA 1QW0A 3RGYA 1MY3A 2O1MA 5H8SA 4OESA 3O29A 1MXUA 1VR5A 2Z22A 2QMXA 1B1XA 3SEWA 5B70A 3U94A 3A3CA 2HZKA 2H99A 3KBRA 2ZNSA 1OQGA 3USDA 4DXUA 4IB2A 3EN3A 2HAVA 3UP9A 1UTBA 3MVXA 3EHSA 1BKAA 4G8NA 2XXUA 2E0SA 4F19A 1B0HA 4C1TA 2DVCA 5JTYB 3TTNA 1QKBA 1LFHA 4O3BA 4YAHX 4NF8B 1AMFA 2F7BA 3CG3A 2I4CA 2F5XA 3LSFB 4ELPA 3LSWA 4YZZA 5BUUA 5CMCA 5CBRA 1FCKA 4JBZA 4YICA 1F9BA 1NL5A 1M5EA 2I4BA 1URGA 4U1OA 3Q28A 5H8FA 2UVHA 1RYXA 1NKXA 1GVCA 3PPQA 2O7IA 3RT8A 2D21A 1DSNA 3K6VA 1M5CA 3KJTA 2V3TA 2XX7A 1TT1A 2V84A 4G68B 3FASA 4EXKA 3TCFA 4XKRA 2F36A 3KN8A 4DZ1A 3Q29A 4G77A 3N5LA 1H3DA 3K01A 1N3XA 1B5JA 4BDLA 4EF1A 4XKNA 4F3SA 1US5A 3C35A 2OCUA 4BDRA 3SDFA 1DTGA 1LGBC 4OFOA 1ZLQA 3M8UA 3TDJA 1FQAA 1B1HA 3H6VA 3TTRA 4OXVA 3PPRA 2YPNA 3D4GA 3MVZA 2P0SA 2THIA 5AA2A 4GFRA 3O6IA 1MDQA 1LLSA 2Z8FA 3ZKKA 4I1DA 4H67A 1Q1KA 4HCWA 1VFDA 5ISUA 2I48A 4Z0IA 3KJ7A 1B40A 2A5TA 2UVIA 3N6UA 3G3JA 1LFGA 4ZECA 4PFYA 5K2YA 4P11A 1JVYA 2VD2A 3K1MA 2DS9A 4WXJA 3WAFA 3OO6A 3JV9A 2I49A 1YCJA 2KLFA 3RT6B 1LB8A 3CRBA 4KPTA 1UIUA 3PUXE 5DT6A 2V93A 3BKIB 3PMXA 2AIXA 4N07A 2H5YA 2Y7WA 4H6DA 1B7HA 5A5XA 1FTLA 5DVJA 1B46A 2ZYNA 1ZJLA 3TCGA 2Z23A 1UQWA 3H6UA 1L5TA 3QIMA 2ABHA 3RTFB 2DWJA 4PFWA 4NF4B 1RYOA 3R7XA 2G93A 1D9YA 3CFXA 1FW0A 1YTVA 2F97A 2D3IA 5I57A 3GBBA 1UTHA 4QFPA 1ATGA 4RXLA 1MXYA 3EPEA 2P1SA 4PP0A 1MXXA 1PDAA 4BDQA 3TZAA 4IY6A 3QAXA 2DQVA 2WKYA 4FIMA 1FTOA 1I6BA 2PT1A 3CVGA 2ZNTA 4EUOA 4IO4A 4DLDA 1Z7ME 5J1DA 4TLLB 4YKJA 1I6QA 5DEXA 3UN6A 4XKPA 4QFOA 4MH5A 1PC3A 5L8DA 3K0VA 3T66A 2GFEA 1M5BA 1PB7A 3GXAA 4NTLA 1USYH 4FE8A 5AA2D 2ONSA 4QSDA 3PU5A 3I6VA 1POY1 1MS7A 4QSEA 1O63A 4N6PA 1B3LA 4RJZA 3OXNA 3B6WA 3H4ZA 1GTKA 3PUVE 1BIYA 1IXIA 4LZ7A 1Y1MA 1LAGE 4DXCA 4IO6A 5AA2B 1OVTA 1A8EA 4M1VA 3IO6A 5JTYA 4E0WA 3PGFA 3EF7A 1QUKA 4YMBA 2RCAA 4NF8A 3MZ9A 5I2NA 3BBRA 3V89B 2H25A 5L9SA 2A5TB 3LBSA 2DWIA 2O7UA 1XS5A 1DPEA 1NH8A 3TPAA 4OEVA 3P7IA 1A7LA 1QULA 1FQEA 4GIZA 3QYTA 3VXCA 1I6AA 3HPIA 4YU0A 3TUSA 5FTHA 3T9VA 3S9LC 4X48A 4Z7EA 3Q27A 4F22A 1I69A 4G68A 4R72A 5A5XB 3HV1A 4GXSB 3FD3A 4FEBA 3UK4A 4WEDA 2RCBA 3KSJA 4R6KA 5ITPA 2Q9TA 3ZS6A 4JDFA 3PD9A 4FEDA 1WODA 4RPOA 3U72A 2QS2A 5L9OA 5I57B 1B3HA 1VE4A 3FV2A 1IZ1A 3EQ1A 2HFBA 1UTHB 1DMBA 3PMWA 3TAJA 1A99A 1IEJA 2V3QA 2YLNA 5AA4B 2Z8EA 4F2QA 3C4MA 1IUDA 3W15C 3V83A 5AE4A 4F3GA 2Z8DA 1R1NA 3HSTA 2OLBA 4ZS9A 3K4UA 1MXWA 3A3UA 1IITA 2DP8A 2QJEA 5JEIA 3H03A 4IGRA 5CRYA 4RY1A 2DWHA 4I9DA 3M3LA 2NUVA 4FJPA 4H65A 1MQDA 1ZBMA 3VLVA 5DEXB 1ELJA 3CR9A 5KZTA 4ESWA 2Q8JA 1BTJA 4GRKA 2M8CA 4BDOA 1XT8A 3U1OA 1N76A 2F34A 4QFKA 4YKKA 2F6GA 4KHZE 1S50A 3K6XA 1TFDA 3FXQA 4YMAA 3QUJA 4OETA 3OEMA 2VOZA 3KZGA 1JNFA 3FJGA 4R6YA 1ANFA 4GVOA 4OMBA 3CFZA 2RINA 1LAFE 3CG1A 1SI1A 4OVJA 3LSLA 2IA4A 2H9BA 3C36A 4NF4A 4BDMA 1JW5A 1AL3A 2H98A 4P0GA 2HZLA 1CB6A 4AB6A 4BDNA 3E13X 3IO4A 3B6TA 1MPDA 3FV1A 4NE4A 4U22A 1A54A 2F35A 1US4A 5I2NB 3FJMA 3QK6A 4DIGA 1B3EA 4OFJA 3K00A 2QMWA 5CI5A 2O1LA 4NWDA 3JZJA 3O9PA 4OFLA 3PV0E 3IX1A 1O7TA 1LBCA 2VP1A 3ECRA 5TP9B 4H1XA 3OO7A 4RK2A 1B5HA 4F2OA 4F31B 3TEPA 4XTCQ 1LFIA 2CMOA 1N84A 4GQOA 1PBPA 2REJA 1H76A 1BP5A 3QUFA 1TXFA 4YB6A 5I59B 2Q2CA 1PBQA 4KYEA 1XHYA 3MVWA 3B6QA 1FQDA 4GD5A 2OWSA 1MPCA 3CI8A 1AIVA 4GWOA 5AA1A 1MY4A 3IR1A 2R6GE 4HW8A 1J1NA 1FQBA 2PVUA 4KFQA 1N7XA 4ZEBA 2Y7KA 4OHNA 2PBWA 4Q8RA 3IB2A 4YKPA 1LSTA 3U92A 4BLAA 2QS1A 3OSRA 4M4GA 5LOMA 1MPBA 2I3WA 1XVXA 2UVGA 5IKBA 3IJOB 2Y7PA 4F1VA 3KOTA 3KEIA 2GH9A 4FAJA 3SESA 1D9VA 3CSGA 3E3KA 4IO5A 4LP2B 3H7MA 5M2VA 1B58A 3ILUB 4H8JA 4F29A 5F1QA 1Y20A 4MF3A 4ISUA 2DWAA 3S4UA 2AYSA 4JWXA 4OWDA 3SKPA 4RPNA 1JEUA 5ELVA 1QUIA 1NMUA 1RKMA 3T9XB 1NNTA 4QHQA 1MDP1 3KFMA 4KD5A 5I58B 4YKIA 1N0TA 1TWYA 1DTZA 1H43A 1EZPA 4IO7A 4OTEA 4G2ZA 3K6UA 1P99A 2F7CA 3ILTB 3KSXA 4LA9A 3SEXA 1B9JA 2PYYA 3WAEA 2O68A 2DSFA 1NNKA 3FZVA 4EXLA 2OWTA 4QRZA 1MY2A 1LAXA 5L9MA 5AA4A 1NNFA 3EHTA 3L6GA 3ZSFA 1MM7A 1MQIA 1PB9A 1QKAA 3DM0A 1TFAA 4U23A 3K1PA 3KG2A 4IO3A 3N6TA 3LC8A 4ZDMA 2BJJX 4PE5B 4ELQA 2XX8A 3KN3A 1ZMGA 3IOTA 4DCYA 2RC8A 2X7PA 4RK9A 4KYDA 1Q35A 3MC2A 2I0BA 1SBPA 1SW5A 1DOTA 1MM6A 4LZ5A 2B65A 1DPPA 3S9EA 3CSBA 1P1WA 4R73A 1JEVA 1URDA 2DE2A 1MXZA 4GL0A 3IB1A 3TQWA 5DVFA 4MLVA 3T96B 3TKDA 1R9QA 3O6HA 3RLFE 2I6EA 4F39A 1MY0A 3T9UA 3PD8A 1HSEA 1S7YA 1B51A 2HQ0A 4GLIA 4POXA 1JW4A 2V25A 4R2FA 1JW1A 4NF5B 1P1QA 3VVFA 3THIA 4LONB 3TTKA 1URSA 2HXWA 2X7QA 5FHNA 1P1UA 1QUJA 4OZ9A 4JSDA 3O2AA 1B3FA 3IOVA 5K2XA 4R74A 2Y7IA 1Y3QA 2DE4A 3U8QA 2QPQA 2XXWA 3TYHA 3E9XA 1MH4A 1USYE 2D5WA 3F11A 3G3GA 1NH7A 4JWOA 1SQYA 1OMPA 1D3KA 2PMSA 3ODBA 4O3AA 1OLAA 1SD3A 4GXAA 1KWHA 5KDTA 3S9NC 5BWJA 2I3VA 3B7DA 5TP9A 4L17A 4KYSA 3OO8A 3VE1B 2OZZA 3DP4A 4WKMA 1B7ZA 1Y9UA 3FGSA 1FTJA 4TQUQ 5CMKA 1AOVA 3LUYA 4DE8A 1VSOA 5HM4B 5I59A 5KCJA 4EQBA 3PPNA 3AXFA 2QSXA 1EH3A 3D4CA 2E1SA 3OMBA 3OD7A 4F18A 2XD3A 4P0IA 4G4PA 2OBGA 4ZEIA 2UYEA 3Q26A 2IEEA 4GL8A 4F3BA 1B0LA 3SEUA 3RN8A 5I84A 5DYHA 1SW4A 4H0WA 3VLUA 4KI0E 4LQ5A 2REGA 3HHFA 4NEDA 1GGGA 3FIRA 4AB5A 1N7WA 2XXVA 2RF1A 3H6WA 5EYFA 3W9WA 4QSCA 3HHGA 4QFLA 1MRPA 3RTWB 2QL3A 2UYFA 1B6HA 3OO9A 4LQ2A 2FYIA 2A5SA 2ZNUA 4Q30B 3MJNA 2UVJA 3DP6A 4I8CA 2ONKE 3GZGA 5FHOA 3VXBA 3I3VA 5AA3A 5HPQA 3N94A 2X26A 1EZOA 1Z7NE 4U1ZA 3TQLA 1EU8A 1ZTYA 4PFUA 4R2BA 2ESNA 1NNPA 3TODA 1OQHA 3IOUA 2HCAA 1MH3A 2XXHA 1B5IA 5I56B 3IL1B 4OERA 5B7DA 1WDNA 3VVDA 1A40A 3FVOA 5I58A 1GV8A 4AQ4A 4X9TA 2QS4A 2F78A 3EHUA 1MG1A 3A09A 3U93A 1NFTA 2DXRA 4U21A 1P1OA 4TOZA 3T93B 3O97A 4X1BA 3QXMA 3IJXB 1SVXB 4KR5A 2XXXA 1PEBA 2HEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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