2ONSA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda with bound tungstate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
GHMNVKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPLVPPRADTAVPSLKAMVEVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of an ABC transporter in complex with its binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
molecule tags Ligand binding protein
source organism Archaeoglobus fulgidus dsm 4304
total genus 110
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA02
4PFYA 4ND9A 3R7XA 4FAJA 2PYYA 3PD9A 4LP2B 3G7WA 1SQYA 2QMXA 1MPBA 3FJGA 3MPLA 4BDRA 4F1UA 3HN0A 3PMWA 1NKXA 2OWSA 4DXCA 1YAEA 4XKQA 1JW4A 3O29A 4OMBA 3LUYA 2M8CA 4KCCA 2ZXTA 4NF4A 4KPTA 5DTBA 4OFJA 1Y3PA 1SBPA 1B05A 1LLSA 4FE8A 1EZOA 4IO7A 4IGTA 3VFJA 1N0TA 3RT6B 2PT1A 1B9JA 4LUBA 5H8NA 4GFRA 4FORA 1PDAA 1XHYA 2O69A 4IO4A 1QUIA 5H8QA 4QSCA 4KFQA 3CG3A 4LQ2A 4O3CA 2D3IA 1S7YA 4N07A 3H3GA 1EZ9A 1JW1A 3TYHA 2FA7A 3ILTB 3P7IA 1M5FA 2A5SA 3KSXA 2Z23A 4MLQA 1GR2A 4WEPA 3KSJA 4ZECA 1OLCA 2D5WA 3A3CA 3CSBA 1O64A 4ZEBA 3BFUA 2BJJX 5L9MA 3KN8A 4BDQA 4PETA 3N6TA 4OETA 4QSDA 5DEXA 2Z22A 3FV1A 1FW0A 1XT8A 4E0XA 1CB6A 3RPWA 4THIA 3HHGA 4H5GA 2V93A 3PUYE 2HFBA 3A3UA 1NNFA 1ANFA 3GXAA 1HSLA 4NTLA 3S9MC 3S4UA 3PU5A 5TPAA 5AA4A 2QMWA 1EU8A 3KGCA 5JTYB 3MUQA 4R6YA 1UIVA 2QS1A 3V5AA 1N3WA 3TTRA 3IO6A 4HCYA 1SYIA 3IO4A 3DP6A 3FVGA 4OESA 1URSA 4OTEA 5AE4A 3G3FA 3SEYA 3UK4A 4F1YA 4YB6A 5HBCA 2XX9A 3L6HA 2Q9TA 1MY4A 5BUUA 5I2NA 4OWDA 2H25A 1XOCA 2OZZA 4KYDA 1OVBA 1GTKA 2H98A 3LSFB 4FECA 3PUVE 4OQOA 3AXFA 3S2VA 4JBZA 4JB7A 4EUOA 1B7UA 1HSJA 1LFGA 2F8DA 3DLNA 4GD5A 5I59B 2I58A 4DIGA 2XXVA 2XXUA 3C9HA 1YCJA 3EHTA 1WVJA 4GWOA 2I6EA 3V89B 1LBBA 3I3VA 4YU0A 4EQ9A 1SW1A 5H8SA 4GQOA 2NVUB 2Y7RA 4ONYA 1R1NA 1VSOA 3LBSA 4RNSA 1A54A 4C0RA 4PQJA 4L17A 1MQGA 2RINA 1RYOA 3MWBA 3SEXA 3IK6B 1A40A 3ODBA 2VD2A 3TPAA 1AH5A 4F3BA 4HCWA 1B51A 1NNPA 4F29A 1B3HA 2O51A 1ATGA 4H6DA 1Y4TA 2Z8DA 4XTCQ 3SDFA 4ZEIA 5HM4B 2XHDA 3FJ7A 4FEDA 2DWAA 1AL3A 3N94A 3VLUA 1B7HA 1DOTA 2THIA 4ZEKA 2Q89A 3U93A 1OQGA 2ZYKA 3T9HB 3KJ7A 3GZGA 2O7UA 1B40A 3IOUA 4YICA 3O6GA 3PPNA 1FTKA 4F22A 4G68A 3H7MA 4OVJA 2XXTA 4ZZAA 2NWJA 4MF3A 2HEUA 3ZSFA 1II5A 1SW2A 3B6TA 4BDMA 4OFOA 3E4RA 1B7ZA 2FYIA 3MZBA 3B6WA 4ZZEA 2HQ0A 1JVYA 3PUXE 1B1HA 4GF8A 2DE3A 3PGFA 3WAEA 1N7XA 2DSFA 2Y7WA 3FVKA 3QYTA 2RC7A 3LC8A 1TFAA 2DS9A 5DVIA 3TZAA 3OSQA 3K00A 4TLLB 4XKRA 4YB5A 2R6GE 3L6GA 1S9TA 5I56B 3O6HA 1N3XA 3CFXA 1NH7A 3VLVA 3M3KA 2O1MA 3E9XA 3CIJA 4R2BA 2ONSA 5TP9B 3M3LA 2OK2A 3LSXA 4U1OA 1PB9A 3DELB 4KI0E 1H43A 1R9LA 2O6AA 1MRPA 4R2FA 1USYH 2GRVA 4H8JA 5A5XA 1ZKBA 2RKMA 3QK6A 5H8HB 3QIMA 1DTZA 5KCJB 2NUVA 3K1MA 1MPCA 4U1ZA 1FTOA 4MH5A 3V8XB 2F35A 3CFLA 4KD5A 2P1SA 1CE2A 1P1UA 3KJTA 1L5TA 3E13X 1Z7NE 1MG1A 3UORA 2F6PA 5DVJA 1MXZA 1DPPA 4P0IA 4RJZA 2X7QA 1ZLQA 3PPPA 2DE2A 3HCQA 1LGBC 2AIXA 3FV2A 2XXPA 1NMUA 5ITPA 3TTNA 3K01A 4POWA 1MDP1 4FIMA 2I3VA 4ZDMA 1ZIUA 4HTGA 3IL1B 1BLFA 3O97A 4M4GA 1VR5A 5ISUA 1MH4A 3N6UA 1VFDA 3OENA 3QAXA 5JK4A 1AOVA 2F36A 5DVFA 3VXCA 3U92A 1Q1KA 3VDFA 5I59A 5ICQA 2F7AA 1TFDA 4KHZE 1POTA 1Y9UA 2HAVA 2DVZA 5CMMA 1EZPA 3M3FA 2PBWA 4TQUQ 4JWOA 1JW5A 1MH3A 3CRBA 3RNNA 3TDJA 1MM6A 5J1DA 2ABHA 4RK2A 2UXAA 3BBRA 3CR9A 4EDPA 1ZJLA 5DT6A 4F2QA 1HSEA 5DYHA 4PFUA 1QULA 3RQTA 2Y7KA 2I3WA 4N6PA 5AA2B 4QFKA 2ANJA 3TELA 1SYHA 1JEUA 1QUKA 1XC1A 3MW0A 1Q35A 4X1DA 3VV5A 3LR1A 3MP8A 4Q0CA 1MQHA 5B70A 3TTLA 4R75A 4AB6A 1TWYA 2DOJA 2QS4A 2R71A 1EH3A 3JZJA 2PT2A 1B58A 4M1VA 5K2YA 3OOAA 1B0LA 4F3SA 4BLAA 3OO7A 3H6UA 4EXKA 1B6HA 1B3EA 1LCTA 2B3FA 2NOOA 1SD3A 3PD8A 3KN7A 5FTIA 3C34A 3IOVA 3QUFA 4IY5A 1LAXA 1WODA 2ZYNA 2R9JA 1MDQA 4GXAA 2ZNUA 1D9YA 4JSOA 3RY3A 5IAIA 4BDNA 3FXUA 4G8NA 3OELA 2F7CA 3RTWB 1UTHB 1MPDA 2H5YA 3S9NC 3IORA 4QHQA 4AQ4A 4F39A 1I6QA 4XIGQ 2Y84A 5EYFA 4R6KA 3RUMA 1OMPA 1A99A 4O3BA 4F18A 3Q29A 4G4PA 3PPOA 5M2VA 3H06B 3KEIA 2ZNTA 4EF1A 3O28A 1RKMA 4RY1A 4RXLA 4RA1A 2X7PA 4OERA 5TP9A 4WEDA 2W7YA 1SI1A 4JXIA 1MM7A 5L9OA 3MPKA 1PBQA 3U8QA 1T0KA 3K2DA 4I62A 4JDFA 4WXJA 3C32A 1FQDA 5F1QA 1OLAA 4IB2A 3G3IA 1QUJA 3G3GA 3UA8A 3T96B 3H4ZA 2ZNSA 4F3GA 5H8HA 5H8FB 1H45A 5KCJA 1OQHA 1MXYA 5KDTB 1NL5A 1B3FA 2ONRA 3HSTA 1TT1A 2X26A 3BFTA 1I6AA 5I2KB 2XXIA 2A5TB 4OEVA 4LA9A 2VGQA 1IXIA 4H1XA 2DYXA 1NFTA 4OXVA 1BKAA 3H03A 1P1WA 2WKYA 1MY0A 4C1UA 3R26A 2O68A 4GVOA 4NE4A 3S9EA 4OEUA 5KZTA 2VHAA 4FJPA 1DTGA 3LSLA 3SKPA 2YPNA 2QSXA 4GRKA 4C1TA 3RTFB 3G3KA 3C35A 3DP4A 4JSDA 2XXYA 2V3QA 3A09A 3B7DA 3TFLA 4IO6A 4DZ1A 4NF6B 4YKKA 2HCAA 3THIA 3ECRA 4ELOA 1UTBB 2I49A 1F9BA 1QKBA 2IEEA 2XXQA 1WDNA 2D21A 2QRYA 4NF8B 2H99A 4ESXA 3T22A 4ELPA 1A7LA 3IR1A 2RF1A 2OWTA 1B3GA 2V3UA 3CSGA 5AA1A 2Q2AA 5FTHA 3Q25A 4OHNA 3T93B 1OVTA 2B65A 3OSRA 4TOZA 2PX1A 1FTLA 5CM6A 1LAGE 4ESWA 3I6VA 3PUWE 2AL5A 2GFEA 3SEWA 2F78A 5L8DA 5CI5A 4U2RA 3PV0E 1O63A 3T9VA 3C36A 3UGWA 1POY1 3C4MA 3RLFE 1A8EA 4XXUA 1FQCA 3FXRA 1H76A 3FZVA 1XS5A 4HS7A 4NWDA 4Q30B 1LAFE 5AA2A 4O3AA 1Y3NA 3HO7A 1PBPA 2GHBA 3EQ1A 3G3JA 1XVXA 1N04A 3O9PA 4G8MA 1B3LA 3RN8A 4QFPA 1LAHE 3IAZA 5I2NB 4U4SA 1IXCA 2QS3A 1VFEA 3MZ9A 1M5EA 3MP1A 3TODA 3PPRA 1MQJA 3WAFA 3TAJA 3FVOA 3IB1A 4AB5A 1Z7ME 4G68C 2QJEA 4QFOA 3QSLA 4ELQA 2AL4A 1S50A 2DQVA 4RYAA 4YKJA 2REJA 3C33A 2PVUA 3FVNA 5CMKA 2I4BA 1ZMGA 3MJNA 4GL8A 3IJOB 1N76A 4UACA 3I5OA 4ZE9A 3MVWA 1UTHA 4IGRA 1JQFA 4UA8A 2V84A 1QW0A 3FGSA 3MQ9A 1MY3A 2I4CA 2XXXA 5AA3A 5TU0A 2UVJA 2XXRA 4GIZA 3OO9A 5JTYA 3VVDA 4IO2A 1NNKA 1XVYA 1MXXA 3W15C 1Y3QA 3TCGA 4F1VA 2Q2CA 5I57B 3MVYA 2VOZA 5CBSA 3T9XB 4YZZA 1TXFA 1DMBA 5CRYA 2I0CA 4DLDA 2RCAA 4JWYA 5CC2A 5I84A 3CG1A 3IOWA 3CI8A 1R9QA 1B5HA 4DDDA 5FHNA 1O7TA 1H44A 4OYVA 1AIVA 4LQ5A 4YB7A 1URGA 4YKPA 4U23A 2YLNA 2VP1A 1P1NA 5H8FA 1DSNA 1FCKA 4P0GA 5KDTA 4LONB 3TEPA 1M5CA 5AA2D 4NEDA 4Z7EA 2Y7IA 2XXWA 5I2KA 3Q28A 4IY6A 2A5TA 1FTJA 4DXUA 5EHMA 3OEKA 3FIRA 1A55A 4TLMB 1LSTA 1MQDA 2UVGA 4I1DA 4QRZA 4ISUA 3QUJA 1PEBA 3Q26A 1LB9A 3K6WA 3H6WA 2V3TA 3UP9A 4JWXA 2DE4A 2QPQA 3O6IA 4QSEA 5B7DA 3N5LA 3FATA 4G2ZA 4G77A 4F2OA 2GHAA 1SDXA 4WKMA 3TTMA 4LVQA 4DCYA 3MVZA 1SW5A 4NF6A 2HZLA 1LFIA 4I9DA 3W9WA 2KLFA 2DXYA 1UTBA 2XD2A 2RC8A 3KBRA 4PFWA 4ZS9A 2ESNA 3OXNA 3ONMA 5A5XB 1MXUA 4F31B 4NF8A 2V25A 2FNCA 2UYEA 1B4HA 3KOSA 4NMYA 3G3HA 3H6TA 2VD3A 1SI0A 5HPQA 3OMBA 3FJMA 1QKAA 3R6UA 4GXSB 3RGYA 3TQWA 3HV1A 4N13A 1BIYA 2DWJA 4LZ8A 3IB0A 2REGA 4QFNA 4F3PA 4PE5B 3CFZA 4POXA 3TCFA 4X1BA 1A8FA 1PB8A 4I8CA 4QFLA 3H6VA 1LBCA 1ZU0A 3U72A 4PFTA 3VE1B 3MC2A 3MZ1A 3MAMA 2Q8JA 1B1XA 4EF2A 2XX7A 2YJPA 1PC3A 1MXWA 1P1QA 5I56A 2OBGA 1SVXB 3PMVA 2XD3A 1H3DA 2H9BA 4U21A 4EQ7A 1KWHA 4DXBA 1IITA 4NF5B 3USDA 4ZE8A 1FQAA 1M5BA 1VE4A 2Y7PA 3K6XA 4R74A 4YAHX 4YMBA 3SEVA 4BDOA 3LSWA 3HHFA 3N26A 3EF7A 3KFMA 1BTJA 1Y1ZA 2HAUA 1NH8A 3KG2A 2Z8EA 3UN6A 5I58B 4KCDA 3VLWA 4PP0A 3PUZE 4R9FA 2NXOA 1MXVA 1LB8A 5IKBA 4G8HA 3C31A 3K6UA 4X9TA 2E0SA 1N7WA 4MBPA 4GLIA 1B0HA 4ECFA 4LZ5A 1GVCA 1FTMA 2ZYOA 3M8UA 1USYE 4OFLA 4OZ9A 4KYEA 4K3FA 4FATA 3E3KA 1B5JA 3KOTA 3IB2A 2F7BA 3GLBA 3GBAA 1YPNA 4HW8A 3BKIB 5CMBA 3ZS6A 3IOTA 4H5FA 3S9LC 3EHSA 3TKDA 3T66A 3ILUB 3MBPA 4IO3A 4NWCA 1D3KA 3EPEA 2I0BA 5K2XA 1B52A 4GOTA 4NF4B 3SETA 2Q88A 1SW4A 2HZKA 4Q8RA 3T9UA 1B5IA 1N84A 3K1PA 5JEIA 3TTKA 2RCBA 1MS7A 3SESA 2O7IA 1FQBA 5H8NB 1MY2A 4OENA 3MVXA 1LCFA 2H4IA 5H8QB 5I57A 3OO8A 4ZEDA 2OLBA 3K0VA 3Q27A 4P11A 1Y4CA 1D9VA 3KZGA 2XXHA 1US5A 4XKPA 1QJMA 1BP5A 2Z8FA 3TQLA 1UQWA 4MFIA 3U94A 3GBBA 5FHOA 4BDLA 3K02A 4DCXA 4R73A 4U22A 3D4GA 3K1NA 4U4XA 1GV8A 1JVXA 1B32A 3OD7A 4R72A 1D4NA 5ICTA 5FHMA 2DWIA 2HXWA 1AMFA 5F7VA 1ZBMA 1IXHA 5DEXB 3F11A 2OCUA 3QXMA 4KR5A 1MQIA 3ZKKA 5BWJA 3K4UA 4DE8A 5CBRA 4YKIA 2P0SA 4Q5TA 4RPNA 2GH9A 1NNTA 3V83A 4F19A 1B2HA 3FASA 4RK9A 4R9GA 3KN3A 5TPAB 5AA4B 1US4A 2PMSA 3TCHA 5LOMA 3K6VA 1B46A 5L9SA 1J1NA 4YMAA 2XX8A 4X48A 3O66A 4QF9A 1JEVA 3HPIA 4Z0IA 4LZ7A 4R6HA 1IUDA 3PPQA 3IJXB 4E0WA 2B3BA 3DM0A 2DP8A 4H65A 2F5XA 3SERA 2AYSA 2CZLA 1I69A 4MLVA 4IO5A 2O1LA 3MP6A 4FEBA 1URDA 1FQFA 3VXBA 3CVGA 3FD3A 1YTVA 4H0WA 2ONKE 2CMOA 2ZMBA 4LATA 1IQ7A 2UYFA 3FXQA 2I48A 1P1OA 1ELJA 2F6GA 3RT8A 1RYXA 3OEMA 1P99A 1Y1MA 1LFHA 1IZ1A 3D4CA 1IEJA 3JYRA 5ITOA 3EHUA 2RC9A 4H67A 1GGGA 1UIUA 1IIWA 2IA4A 2UVIA 2QL3A 1QVSA 2QS2A 5CMCA 4RPOA 2DXRA 2P2AA 3SEUA 4XKNA 4H8IA 1MY1A 1ZTYA 1FQEA 3U1OA 2F34A 3EN3A 4EXLA 1I6BA 2OJTA 5ELVA 4EQBA 2LAOA 3TMGA 4ELRA 4KQPA 1OIBA 4GL0A 2E1SA 2F97A 2UVHA 1JNFA 3ZKLA 1JETA 4NF5A 1Y20A 1IXGA 3B6QA 4ZEFA 3OO6A 1B4ZA 1M5DA 3FUZA 2DWHA 2DVCA 3TUSA 2ZYMA 2ALUA 3W9VA 5EHSA 3JV9A 1R6ZA 3IX1A 2G29A 3VVEA 5I58A 4KYSA 1PB7A 3VVFA 1DPEA 3O2AA 3UIFA 4G68B 2O84X 3PMXA 3DP8A 2G93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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