2ZNTA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, dysiherbaine
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA02
1FTMA 1GVCA 3C4MA 2HEUA 2A5TB 1T0KA 4GLIA 1ANFA 1MQDA 5CBRA 1VSOA 3OSQA 1FQBA 3O66A 3T9VA 2OZZA 1JEVA 1DMBA 1US5A 3B6TA 1B0LA 1H3DA 1SDXA 4H1XA 5I2NB 1JW1A 4OFLA 1O64A 3OMBA 1MQJA 1A8FA 2V25A 2Z22A 5F7VA 1II5A 2NWJA 3GBAA 1CE2A 3IOUA 5I58B 4G4PA 1FTKA 1B40A 1OVTA 4OFOA 1M5DA 4I62A 2F7BA 2GHBA 3U94A 4X1DA 2KLFA 3PPNA 2HFBA 3KSJA 3SKPA 1FQEA 3FVKA 2CMOA 3P7IA 4OERA 3K0VA 2DVZA 4XTCQ 3CIJA 3HN0A 2B3BA 5H8FB 1LSTA 4YZZA 3FXUA 2F6GA 3CR9A 3EN3A 3N6TA 1OLAA 1B05A 4OZ9A 3S4UA 1B7ZA 2Q89A 2QS3A 5HPQA 3OO8A 4FORA 5FHMA 2ZYKA 4O3AA 3K6UA 1R6ZA 2NVUB 1SYIA 3QYTA 2G93A 3WAEA 4BDLA 3VV5A 1MM6A 3UIFA 3ZKLA 3G7WA 4RPOA 2NXOA 1I6AA 1N84A 3I6VA 4ZEBA 3N5LA 4FE8A 3SEUA 1LLSA 1ZKBA 4DCYA 1NNKA 3U93A 1YAEA 3QXMA 5DEXA 2XX9A 2DE4A 1XT8A 4U1ZA 3BFUA 3KEIA 4JSOA 4U22A 4K3FA 2ALUA 1B1XA 2HCAA 2F7CA 4OTEA 4QSEA 3K1NA 2Q2CA 4EF1A 2H99A 1MPCA 4TQUQ 1IUDA 3JYRA 3DELB 1B1HA 1NH7A 2RC7A 2DOJA 4YAHX 3MP8A 4EQ7A 4KI0E 3VVEA 1QUIA 4P0IA 3MZ9A 4MBPA 5KDTB 2OBGA 1NNPA 2Z23A 4RXLA 3PV0E 3SEXA 2XXQA 4QFPA 1H76A 2Q2AA 2RC9A 4QFOA 1SYHA 2DE2A 4C1TA 3QUJA 2R6GE 1EU8A 1POTA 2RCBA 4MF3A 1BKAA 3G3JA 5ITOA 5J1DA 3JV9A 3RPWA 3TCHA 5L9SA 3V5AA 2HAUA 1Q35A 3T9XB 3RNNA 4PP0A 4LP2B 4I1DA 4JWOA 2NUVA 1FQDA 1S50A 2OWSA 4F2OA 1MY3A 1IIWA 2Z8FA 3TPAA 3IOTA 3LSXA 1B3LA 1UTHB 4H5GA 4N6PA 1FQCA 1Q1KA 2ESNA 4KHZE 2V84A 2XX7A 1BTJA 5JTYA 3CVGA 4F1VA 1URSA 3RQTA 3PPRA 4ZECA 1OQGA 2H25A 3OENA 2PYYA 1MXXA 2PMSA 3A09A 1P1WA 1PB8A 5TP9B 2V3UA 2I58A 3FATA 4LQ2A 3U92A 2B65A 2LAOA 1BLFA 4YICA 2VHAA 1B3EA 1XVYA 4OEUA 3KN7A 2DVCA 1MH4A 5CBSA 3K6VA 3MZBA 3G3FA 4ND9A 3EHTA 1N0TA 1B52A 2P1SA 4LA9A 4GWOA 3OXNA 2IEEA 2OJTA 1XC1A 2XXYA 5H8SA 2A5TA 3IOVA 1LAXA 1DPEA 4ELPA 3T96B 3IAZA 4BDRA 5AA4B 1QUKA 1NNTA 3VVDA 3K1MA 1MXVA 4AB5A 2ANJA 2DWIA 3C36A 1URGA 1ZU0A 4I8CA 1LBBA 5I59A 2NOOA 5I2NA 2F35A 4WEDA 4YB5A 3TEPA 3KJ7A 3FVNA 2X7PA 1PB7A 5I58A 3QK6A 2XXPA 3O29A 3T9HB 3T93B 3LR1A 4EQ9A 4P11A 2I3WA 5H8NB 1MG1A 4G68C 2UVGA 4H6DA 4H8JA 3C9HA 2ZNSA 2THIA 1TXFA 2ONKE 3FJ7A 2I3VA 4NF4A 4XKPA 2VP1A 3OOAA 4JWXA 1L5TA 1IEJA 3DLNA 4U23A 4U4XA 5BUUA 2X26A 5BWJA 3TTNA 4MLQA 1UQWA 4DCXA 5ELVA 2AYSA 5H8FA 1Y20A 4KYDA 1LAFE 4DXCA 2ZNTA 5DVJA 1OMPA 1QKAA 4DZ1A 2E1SA 3AXFA 2O84X 3OD7A 1VFEA 3U8QA 2XXRA 4M1VA 4C1UA 4KYSA 1Y3NA 4GRKA 3C35A 1JW5A 4GOTA 1QW0A 4QFKA 2O7UA 5AA2B 2DSFA 1FQFA 2O51A 3PD9A 1SI1A 3CG1A 1LCFA 5LOMA 4KCDA 3S9EA 3ILUB 2O7IA 4YMBA 3FXRA 1PB9A 5L9MA 4X1BA 4F19A 3O6HA 1PEBA 3K00A 5CC2A 1DTGA 5H8QB 3G3IA 4G2ZA 3SETA 1N7XA 2PT2A 4M4GA 3RLFE 3MWBA 5KDTA 3RT6B 3TZAA 1D4NA 1N76A 3UGWA 4F1UA 4XXUA 3FD3A 4OFJA 3PMXA 3EPEA 1ZMGA 5CM6A 4IO3A 3QUFA 4POXA 2O1LA 4ZEKA 4YB6A 3HPIA 4KCCA 4MH5A 3TDJA 4R2BA 2WKYA 2XXWA 4O3BA 2R9JA 5L9OA 3FZVA 1TWYA 1WODA 5CMKA 3IB1A 1MS7A 4ZZEA 4NF5B 1IXCA 4YKIA 1MDP1 3H06B 4Q30B 5CMCA 2DYXA 2ONRA 3UORA 3TTKA 4U4SA 4EUOA 4FECA 2DWHA 4IO7A 1FCKA 3EQ1A 1EH3A 1XS5A 4FIMA 2H5YA 4UACA 1H45A 1J1NA 3ODBA 1TFDA 3DP4A 3BBRA 3PPQA 2P0SA 1LAGE 1FTOA 3O6IA 2F7AA 1SD3A 2VD3A 3GLBA 2I0CA 4OENA 2QMWA 3V8XB 2F78A 5TP9A 2F36A 1MQHA 3IX1A 1Y9UA 4H5FA 3THIA 5AA3A 1POY1 4RK2A 1R9QA 3TAJA 4BDNA 1D3KA 1US4A 2R71A 1P1UA 2O68A 1MQIA 4OEVA 1AL3A 4LQ5A 4G68B 2Y84A 3T22A 2V93A 2H9BA 4YB7A 5F1QA 2G29A 3HV1A 4NMYA 3TODA 4KYEA 1B0HA 4QRZA 1JVXA 3MUQA 5FTHA 3LSFB 5B7DA 2QRYA 4QSCA 5AA2D 3W9WA 1GR2A 2Q8JA 1FQAA 2QJEA 5CRYA 2W7YA 3IJXB 3JZJA 2HZKA 4H8IA 4IGTA 3TMGA 1LFHA 1TT1A 3QIMA 4OESA 1Y3PA 4NF6B 3VXCA 1OIBA 1LCTA 1AIVA 1PC3A 2HZLA 1B4HA 1JEUA 4R9GA 2XXIA 2RKMA 1SW2A 3G3HA 4O3CA 3EHUA 3HHFA 5I57A 2UVJA 5FTIA 3PPOA 5H8NA 3MZ1A 1IQ7A 1SI0A 3KFMA 2XXHA 3K02A 4YMAA 1DOTA 4N13A 1H44A 3CSGA 2XXXA 1MH3A 3MBPA 3PUYE 4GXSB 2E0SA 4F3GA 5I56B 3I3VA 3PD8A 4GVOA 5FHNA 4OVJA 4ZE8A 1MY0A 1I69A 3MVWA 3H6VA 3RTWB 2XD3A 4R9FA 3VLUA 3K2DA 4C0RA 2D21A 1RYXA 3DP6A 3LSLA 3B7DA 1VR5A 4F3BA 1PDAA 2DXRA 2Y7WA 1HSLA 5I2KB 2ZNUA 3H6WA 2OLBA 1MXWA 3FUZA 1B7HA 4RPNA 3SESA 3OO9A 3TQWA 3M3LA 2REJA 2RC8A 4JDFA 1USYH 3LUYA 3KZGA 1MQGA 1Y3QA 3TFLA 4YU0A 1B5JA 1UIVA 3MAMA 1H43A 1LBCA 1BIYA 3S9LC 3RUMA 4GD5A 4U21A 4LVQA 1SW5A 4RA1A 4EDPA 1I6BA 3ONMA 4FATA 3UA8A 2PBWA 4QFNA 3DP8A 4ZE9A 4NWDA 5EYFA 4BDQA 3O97A 1ATGA 4BDOA 3MVXA 3VDFA 3Q25A 3SEWA 3O2AA 3ZSFA 1O7TA 3FV1A 1YCJA 3IORA 2F8DA 4IB2A 4LONB 3KOTA 4XKRA 3PUWE 3CFLA 4OWDA 3V89B 4AB6A 2PVUA 2B3FA 4IO2A 4KD5A 1OQHA 1NKXA 2Q9TA 3MPLA 1AOVA 3I5OA 1MPDA 4DXBA 2GRVA 3FVGA 4PETA 4NF5A 3K6WA 3ILTB 5H8HB 4ZS9A 1AMFA 3FGSA 4NE4A 1A99A 1B3FA 3M3KA 3FIRA 2X7QA 4G77A 4GFRA 5M2VA 3Q28A 3K6XA 3U72A 2ZMBA 4TLLB 1VE4A 2A5SA 3VFJA 3RN8A 4GQOA 2GFEA 2RCAA 2VGQA 5DVFA 2DXYA 2D3IA 1Z7NE 3E4RA 3TCFA 4EXLA 4R75A 1XHYA 5IAIA 1GTKA 1LAHE 4TOZA 1ZBMA 2OWTA 3QAXA 5B70A 3HSTA 4HTGA 2UYEA 4ZZAA 4TLMB 3W15C 4R73A 2FNCA 1N04A 4ELRA 5K2XA 4FAJA 1UTBB 2OCUA 4HCWA 2PT1A 4H67A 5A5XB 4Z0IA 1EZOA 2UXAA 1B32A 2GHAA 3K1PA 3A3UA 3TTLA 4Q8RA 5CMMA 4ONYA 3FV2A 2V3QA 3CSBA 1BP5A 5KZTA 3OEMA 3PUZE 2REGA 5ISUA 3VLWA 1Y4CA 4JWYA 1JW4A 2AL5A 4X48A 4IGRA 5K2YA 4E0WA 1VFDA 1B58A 4I9DA 3HHGA 1USYE 3CFXA 3QSLA 4HW8A 1MDQA 4IY6A 3KSXA 4ELOA 2QMXA 2QSXA 1A8EA 3G3GA 2Z8DA 4OHNA 3SDFA 5JTYB 3O9PA 1M5FA 1B4ZA 4LZ5A 1IXIA 3MC2A 3H6UA 2RF1A 4XIGQ 2Z8EA 3R7XA 2ZXTA 4F39A 3RY3A 4KR5A 1JVYA 2DWAA 2UVIA 1ZIUA 5L8DA 5DYHA 2OK2A 3S9MC 5I84A 4X9TA 4ZEFA 3CRBA 3OSRA 3ZKKA 4DLDA 3UP9A 4RJZA 3Q27A 4EQBA 1O63A 3C33A 1IXGA 3SEYA 4GL0A 5JEIA 4ELQA 1D9YA 3E3KA 3HCQA 3KG2A 3N6UA 4R74A 5I2KA 2XD2A 1ZTYA 3LBSA 3GXAA 3KGCA 1LFGA 3GBBA 3T9UA 1YPNA 1JETA 4LATA 4Q5TA 1UTHA 3MVYA 1RYOA 1A54A 4NF8B 1N3WA 5AE4A 4GF8A 4OMBA 4DE8A 3HO7A 3BKIB 1D9VA 4F3PA 1M5BA 2QPQA 1R1NA 3OEKA 4YKPA 3IR1A 2V3TA 5I59B 2I48A 4PFWA 1B5IA 1OVBA 1MY4A 2DS9A 3IB0A 2Y7RA 3IJOB 2ZYOA 1JNFA 4F22A 5TPAB 2O6AA 3SERA 2GH9A 4HS7A 4G8MA 3C32A 5TU0A 2ZYMA 3K01A 3TYHA 3TTRA 3USDA 1TFAA 4FJPA 4DXUA 2RINA 4NF4B 3CI8A 3OELA 1QJMA 4HCYA 4WXJA 4ECFA 4DDDA 3U1OA 3KN3A 2QS1A 3SEVA 4GIZA 4NEDA 4QFLA 1IXHA 5EHSA 1P1OA 1B5HA 5AA4A 1XOCA 5H8HA 1A55A 1ZLQA 3CG3A 2QS2A 3PU5A 2D5WA 4KPTA 2I4BA 2Y7PA 1HSJA 2DP8A 3S2VA 1NFTA 2HXWA 1IITA 2ZYNA 3E9XA 3B6QA 1SQYA 2XHDA 3W9VA 4ESXA 1CB6A 4P0GA 1MXZA 5AA1A 3DM0A 4FEBA 1SW4A 1QKBA 2DE3A 2H98A 4U2RA 3TKDA 4YKJA 3O28A 4EXKA 1LFIA 5DTBA 3IK6B 1NH8A 4BDMA 5ICTA 4GXAA 4OXVA 2FA7A 2UVHA 1LGBC 1MY1A 3L6HA 3BFTA 4RK9A 2AIXA 4WEPA 4R6HA 1IZ1A 4ZDMA 1SBPA 4DIGA 4WKMA 4KQPA 1UTBA 3A3CA 4H0WA 3N26A 5A5XA 1B51A 4F29A 2VOZA 4F18A 2I49A 3Q26A 5KCJB 3TCGA 4NTLA 3VLVA 5JK4A 5AA2A 2I6EA 2F97A 2IA4A 3OO7A 3IO6A 3GZGA 1FTJA 4Q0CA 2O1MA 2F6PA 2I0BA 3IB2A 4GL8A 4LZ8A 4F1YA 1B3GA 1URDA 3MW0A 1EZ9A 4RYAA 3G3KA 1M5EA 1NNFA 3E13X 4OETA 5H8QA 3FXQA 2M8CA 2QS4A 4ISUA 3V83A 2QL3A 1MXUA 2XXUA 1B46A 4AQ4A 4OYVA 1P99A 3MVZA 3PPPA 4THIA 1UIUA 3N94A 5HM4B 4RY1A 4PFTA 1NL5A 1DPPA 3D4GA 3FJMA 3Q29A 4KFQA 1SVXB 3VE1B 2F5XA 4PE5B 4IO4A 4LZ7A 4MFIA 5CI5A 5HBCA 3MQ9A 1A40A 3MP6A 1B6HA 4POWA 1LB8A 3MPKA 4YKKA 4JXIA 4R2FA 3KOSA 3K4UA 2O69A 3ECRA 2I4CA 1I6QA 1SW1A 3KBRA 1ZJLA 1QULA 2Y7IA 3H7MA 5FHOA 1PBPA 4IY5A 2Y7KA 3H6TA 1FTLA 1S7YA 4N07A 3MJNA 4NF8A 2Q88A 1QUJA 4ZEDA 1OLCA 4JBZA 2DQVA 2PX1A 4PQJA 2XX8A 1A7LA 4U1OA 3FASA 3M3FA 1JQFA 3PUXE 5DEXB 2XXVA 4RNSA 2YJPA 1MY2A 4E0XA 3PMVA 2ONSA 5I57B 2XXTA 1QVSA 5TPAA 1GV8A 3R6UA 4NWCA 2FYIA 3B6WA 1PBQA 1S9TA 3PUVE 4ZEIA 4F3SA 1FW0A 4JSDA 4G68A 5ICQA 2P2AA 3TQLA 3ZS6A 4R6YA 3UN6A 3WAFA 5EHMA 3CFZA 3M8UA 1B9JA 1RKMA 2UYFA 3RTFB 1N7WA 1Y1ZA 2AL4A 2HQ0A 4FEDA 3LSWA 5IKBA 3TUSA 3H03A 1R9LA 1P1NA 3S9NC 1N3XA 5DVIA 5CMBA 1F9BA 1YTVA 3OO6A 3TELA 4BLAA 1MRPA 3FJGA 4XKNA 1AH5A 3TTMA 3LC8A 1DSNA 1XVXA 4NF6A 1WVJA 1Y4TA 1WDNA 4L17A 3O6GA 3F11A 2ABHA 5ITPA 1B2HA 1MXYA 1MPBA 3H3GA 1ELJA 3UK4A 3VXBA 1Y1MA 4PFYA 1P1QA 4JB7A 4IO5A 3IL1B 1GGGA 3R26A 3RGYA 4MLVA 4XKQA 4PFUA 4R6KA 2DWJA 1B7UA 3L6GA 3IOWA 2H4IA 3MP1A 3C34A 5I56A 4G8HA 1HSEA 2YPNA 1M5CA 3KJTA 2CZLA 4QSDA 2VD2A 3D4CA 3T66A 1MM7A 3C31A 3PMWA 3IO4A 3VVFA 3KN8A 2F34A 5DT6A 2HAVA 4LUBA 3EF7A 4F2QA 4G8NA 2BJJX 4ESWA 1LB9A 4H65A 4QHQA 3RT8A 4QF9A 3H4ZA 4EF2A 3EHSA 3FVOA 1EZPA 4F31B 4Z7EA 4UA8A 1B3HA 1Z7ME 1NMUA 5KCJA 1KWHA 4OQOA 2YLNA 1DTZA 4IO6A 4R72A 3PGFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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