2ZNTA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, dysiherbaine
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA02
1UTBB 2UYEA 2F78A 2O7UA 1AOVA 1MXYA 2B3FA 2HEUA 2DWAA 2PYYA 3HPIA 4O3AA 3SESA 4EF2A 4E0XA 1GR2A 3EPEA 1I69A 1ZJLA 2V25A 1BLFA 2I3WA 4MH5A 1A7LA 2F6PA 4MF3A 2F7CA 3I6VA 3H06B 1B05A 1MDP1 2I0CA 4YKPA 4YKKA 2NUVA 1XHYA 1JNFA 2XHDA 2REJA 4KR5A 1EZ9A 3HHFA 4NF6B 3VXCA 3UORA 3SETA 3WAFA 1H45A 3HO7A 5JTYB 2ZYOA 2DOJA 1YTVA 1MH4A 3FZVA 3TTKA 2HAVA 3U8QA 1LSTA 1R6ZA 2ANJA 4G4PA 2I6EA 4AB6A 2O1MA 3FIRA 3T22A 3S9MC 2RC9A 1MXXA 3QUFA 3TZAA 1XVXA 1Y4TA 2GH9A 4N07A 2OZZA 3E9XA 3IL1B 4IO7A 3T93B 1P1OA 1FQDA 2DS9A 1JW4A 1II5A 1B0HA 1TWYA 3N26A 1FQBA 2H9BA 4UA8A 2DE2A 3M3LA 4FIMA 1XOCA 4QFPA 4XKRA 4DZ1A 3FGSA 2A5TB 3DP6A 2GRVA 3FJMA 4NWDA 2DWJA 1N3WA 3DELB 4G8HA 1P1NA 3DLNA 4OZ9A 4PFYA 3SEYA 3ZS6A 2UVGA 1R9QA 3LR1A 1QUJA 2I58A 3G7WA 3O2AA 3O97A 4LQ2A 1LAXA 4M4GA 4Z7EA 5H8QB 2QJEA 1YCJA 3PUVE 3TTNA 1NMUA 1MY3A 1PC3A 4U21A 5I2KB 1ZTYA 3UK4A 1R1NA 1Y3PA 3ZSFA 3D4GA 3FV2A 2FA7A 4F3SA 3MVWA 4F3GA 4GRKA 3Q25A 3TQWA 4OEUA 3KZGA 4JWOA 1PB7A 2IA4A 1A55A 3BBRA 5F7VA 1CB6A 2F6GA 4NTLA 5K2XA 2BJJX 4N13A 4ND9A 3T96B 1MM6A 1OMPA 3OENA 5ITPA 5EHSA 3IR1A 1T0KA 1B51A 2DVCA 3KJ7A 4K3FA 4XKQA 2XXPA 5B70A 4OHNA 3K01A 1QJMA 5ELVA 4F1VA 3K00A 3MP8A 1B58A 3IORA 3IX1A 2QSXA 1NNFA 4G68C 2DYXA 3HV1A 4KQPA 4DXUA 1EZOA 3DM0A 2QPQA 3A3UA 1TFDA 2WKYA 3SEUA 4LP2B 2PX1A 3C34A 4MFIA 2NOOA 3K0VA 4G2ZA 5CI5A 2FYIA 2O51A 4I8CA 1B5IA 3VLWA 1B3HA 3RTWB 1OQGA 5DEXA 5FTIA 4QHQA 4IGRA 3TODA 3KFMA 3RGYA 3RPWA 5AA2B 3G3FA 3IOWA 2DE3A 4PETA 4UACA 2P0SA 3CFXA 4ISUA 3V5AA 4DCYA 2I0BA 1GTKA 2DQVA 4IY6A 1ZU0A 4LATA 4R9FA 5IAIA 1P99A 1A40A 1O7TA 4AQ4A 5DVJA 3PD9A 1NKXA 3FXUA 4POWA 4RXLA 3F11A 4H5GA 4ELOA 5L9SA 4RNSA 2PT1A 4YMBA 3TELA 1B5HA 3ONMA 4NF4A 4EQBA 3MZ9A 5AA2D 1QKBA 2HXWA 1MDQA 1MPBA 1A99A 4IO5A 4WXJA 5KDTB 1CE2A 4OVJA 2E0SA 3ODBA 2QS1A 3O6GA 4IB2A 2XXTA 2ZYKA 2XX9A 3KGCA 4HS7A 4QFNA 1ANFA 5H8NB 3IJXB 3TAJA 1D9YA 1SW1A 3QUJA 4R2FA 1SQYA 1Z7ME 1JVYA 5J1DA 3QAXA 2DVZA 4JXIA 3W15C 3TPAA 1M5DA 1DMBA 1MQDA 4QFKA 5FHNA 5CM6A 1XS5A 3SDFA 3HHGA 2Y7RA 3H4ZA 3K6WA 1FTOA 1WDNA 2RCBA 1IZ1A 3KEIA 1PB9A 2F8DA 3C33A 2AL4A 1MY0A 2A5TA 3Q28A 4ZECA 3CSGA 3FD3A 3VV5A 3PPOA 3MAMA 5KCJA 2D21A 4OENA 3C35A 2DWIA 3GXAA 3G3IA 1EZPA 3SEVA 4NWCA 3S4UA 1IXCA 5CC2A 3TEPA 3BFUA 2ESNA 1IXGA 3N5LA 4C0RA 2NVUB 4F1UA 3I3VA 4GWOA 4FORA 3V83A 5TPAA 1DTGA 1B7UA 3FUZA 2H25A 2ONSA 4YB7A 1ZLQA 4POXA 4R6KA 1IITA 3OO9A 1L5TA 2F35A 1SI0A 1N7WA 1M5FA 3RN8A 5LOMA 4RY1A 3EHTA 2G29A 2HCAA 3R7XA 3RT6B 1B1XA 1VE4A 1SYIA 1UIUA 2NXOA 1QVSA 4H5FA 1LLSA 2XXXA 3TMGA 3IB0A 3KSJA 4LA9A 5DTBA 4F19A 4QSDA 4NEDA 1JETA 2XXVA 3K6UA 5F1QA 3RQTA 3Q27A 3IAZA 3H6TA 1KWHA 1MY2A 3GZGA 2ABHA 2F34A 2XD2A 1B1HA 1Y1ZA 3VVDA 3IB1A 1MG1A 3L6HA 3RLFE 1TXFA 4JWXA 4DLDA 2I4BA 4HTGA 3S9LC 3EHSA 1B7HA 1F9BA 1FTKA 3K02A 1SVXB 2V93A 1LFGA 2Z8EA 4LZ7A 3U92A 4BDRA 4C1TA 4OFOA 3OELA 4H1XA 3SERA 3QK6A 4JWYA 4Q0CA 4EXLA 5AA2A 3VXBA 2AYSA 1RYOA 4FAJA 5I56B 2F97A 3QIMA 1LBCA 1MQGA 3FVKA 1B9JA 3EHUA 3WAEA 1US5A 3M3FA 1UTHB 3C32A 4NF8B 5CRYA 2O84X 2VD3A 2Q89A 4YB6A 1AIVA 4QSEA 3N6UA 4XKNA 5H8FB 4IO2A 4ELQA 2XXUA 4JSOA 4X9TA 1BKAA 3MVZA 1UTBA 2F7BA 3IOVA 3QSLA 3O6HA 5A5XA 2RC7A 1P1WA 2Y7KA 5ICTA 5I84A 1ELJA 5HBCA 1O64A 4OFLA 4FECA 4ELPA 3BKIB 3OSQA 3O66A 4RYAA 1Z7NE 1M5CA 3Q26A 4RPNA 3USDA 1SDXA 1TT1A 3LSWA 4KPTA 1TFAA 1OVTA 4NF6A 5ITOA 1I6AA 3U72A 1IUDA 1LCFA 3W9VA 3HN0A 1Y20A 3PMWA 2P2AA 3IO6A 1Y9UA 2QMXA 5I2KA 1B4HA 1YPNA 3K2DA 4X1BA 1QULA 4F39A 1FCKA 1MM7A 1RKMA 1B52A 2Z8FA 1POY1 4G68B 4OMBA 4OTEA 4GD5A 4QFOA 5CMCA 4EDPA 5CBRA 1SYHA 4U4SA 2IEEA 3E13X 2THIA 3I5OA 1YAEA 1MXWA 3FJ7A 3PMXA 4LQ5A 4OXVA 4RK9A 3MZ1A 4R9GA 1SW4A 1B5JA 2UVHA 1PEBA 4IGTA 3TTRA 2D3IA 3TYHA 1MXUA 1IXIA 2UYFA 3G3KA 4ZE8A 5AA1A 3DP8A 3TFLA 4JDFA 4R6YA 2QRYA 3M8UA 3RY3A 3ZKLA 1H3DA 1SBPA 3MW0A 3PPRA 4KCDA 3T9VA 1JQFA 2V84A 3O29A 2PT2A 2QS2A 1LB8A 1DSNA 1IQ7A 2ZXTA 3C9HA 3H6UA 4TQUQ 3VE1B 5HM4B 5CBSA 1B2HA 2QS3A 4RPOA 1I6BA 3IOTA 2NWJA 5M2VA 1R9LA 2Z23A 1N7XA 1O63A 3CRBA 1JEVA 3EF7A 3MVXA 4OQOA 2XX8A 4H65A 4QF9A 4DXBA 4BLAA 4XTCQ 3JYRA 1D3KA 2VHAA 4KCCA 4KYSA 3W9WA 1LAFE 1N04A 3EQ1A 1MPDA 4OYVA 1NH7A 2O69A 1DPEA 3ILTB 4GXSB 3RNNA 3TCHA 3TUSA 4GL8A 3PU5A 1MQIA 4KD5A 4NE4A 2VP1A 4IY5A 4HW8A 3CIJA 1JVXA 2X7PA 4KHZE 1S7YA 5I56A 5IKBA 1URDA 3C31A 4MLQA 3PUZE 2VOZA 4XKPA 5DEXB 4PE5B 2G93A 2QMWA 4NF8A 1Y3NA 2DE4A 3BFTA 3KSXA 3O6IA 1N84A 1USYH 4Q30B 5H8SA 3CR9A 2HZLA 1A8EA 3P7IA 2R71A 4FEBA 3B6TA 3T9UA 1B46A 2B65A 4R2BA 1D9VA 1Q1KA 1POTA 1DPPA 1LAHE 4PQJA 2ZNTA 4EUOA 5H8HA 4DXCA 5DVIA 5ICQA 2HQ0A 3TDJA 5H8NA 3C4MA 3OMBA 2UXAA 3CSBA 3O9PA 1NNTA 4GQOA 2OWTA 5TP9A 4DE8A 3K1NA 1ZBMA 5EHMA 4F29A 4R75A 4Q5TA 3OD7A 4GL0A 5DYHA 5I57B 2CZLA 1A8FA 3UA8A 3SEXA 5TPAB 4BDQA 4KYEA 5I59A 5EYFA 2Y7WA 4E0WA 1SD3A 2GHBA 4G68A 4DCXA 5ISUA 4I9DA 2E1SA 1MXVA 2GFEA 3KG2A 3U93A 5CMKA 3SKPA 2Z8DA 4IO6A 3MZBA 2CMOA 2F36A 2ZYNA 4FATA 2GHAA 4RJZA 3UIFA 2R9JA 1LCTA 2ALUA 4F3BA 1RYXA 1BIYA 4WEPA 1N3XA 3ZKKA 3UN6A 2RKMA 1NNKA 2AL5A 4F31B 4NF4B 2RC8A 4EQ9A 3B6WA 1OIBA 4H67A 4RA1A 2M8CA 3L6GA 4EF1A 3OO8A 4LONB 4NF5B 5I58B 2Q88A 3K6VA 1FTJA 1LFHA 1LB9A 2H5YA 3KBRA 1NFTA 4OESA 3MVYA 5AA4A 1MS7A 3OSRA 3JV9A 3FVNA 4Z0IA 1M5BA 2DXRA 3FATA 2O1LA 4IO4A 1ATGA 1UQWA 3RTFB 4F1YA 1FQFA 5JTYA 4GFRA 3OOAA 3UGWA 1Y4CA 1MPCA 4ZEFA 3IO4A 3DP4A 2A5SA 4ESWA 2F7AA 4KFQA 1LAGE 3MC2A 3MWBA 1M5EA 3CFLA 4YKJA 5K2YA 2UVJA 2XXIA 3GBAA 3MJNA 4MBPA 1BTJA 4R72A 4M1VA 4U22A 1USYE 3B7DA 4ONYA 3V89B 4GLIA 3GBBA 3T9XB 3RT8A 1JW5A 4PFTA 4G8MA 4QFLA 4F2QA 1OLAA 1WODA 2OJTA 1PB8A 3LBSA 3R26A 1LFIA 1IEJA 2KLFA 3PUYE 3TCGA 3PUXE 1GVCA 5A5XB 1FTLA 3G3HA 3KOSA 1MRPA 2B3BA 3PPNA 2V3QA 3B6QA 3JZJA 1B0LA 4LUBA 4U2RA 1HSLA 1MY1A 3S9EA 3OXNA 4YB5A 1GV8A 4DIGA 4GXAA 4OWDA 4U1ZA 5I2NA 2H98A 4MLVA 1Y3QA 3PGFA 3PD8A 4NMYA 5I57A 3AXFA 2OWSA 4PP0A 2XX7A 1UTHA 2ZNUA 4OERA 2Q8JA 3H03A 1B3EA 3EN3A 1AL3A 2W7YA 2DP8A 3OEMA 3N6TA 3T66A 3THIA 4BDLA 2AIXA 3VLUA 1J1NA 4YZZA 4ESXA 2HZKA 1QUKA 1NH8A 3SEWA 2UVIA 4C1UA 2DWHA 4ECFA 4Q8RA 5H8HB 3A3CA 1PDAA 1DOTA 3H7MA 4U1OA 5AA3A 1OQHA 1A54A 4LVQA 1FQEA 4WKMA 4OFJA 1ZKBA 4NF5A 2Q2AA 3C36A 4F18A 3QXMA 5L9OA 1URSA 1P1UA 1XT8A 2I48A 3ECRA 3IB2A 4ZS9A 4ZEKA 1B4ZA 3LSLA 1OLCA 4N6PA 2HFBA 4JSDA 3LSFB 1Y1MA 2H4IA 5KZTA 1DTZA 4PFWA 4H0WA 5JEIA 3VFJA 1HSJA 2H99A 5CMMA 5FHMA 4EQ7A 1EH3A 1VFEA 2OCUA 4R73A 1VR5A 4OETA 1MQHA 2PMSA 3FXQA 4X1DA 3TKDA 4HCWA 2HAUA 2O7IA 4THIA 2V3UA 2I3VA 1N0TA 2XXHA 3CFZA 1NL5A 4YICA 5I58A 4G77A 2RINA 2ZYMA 2LAOA 4LZ8A 3IK6B 2XD3A 4I1DA 5DVFA 3CI8A 3S9NC 2ONRA 3OO6A 3FASA 1MH3A 5AA4B 4X48A 2YLNA 3CG3A 4ELRA 1Q35A 4H6DA 3PV0E 4I62A 5KDTA 4H8IA 2X7QA 3OEKA 3VVFA 1FQCA 3G3JA 2Q9TA 3TTMA 2XXQA 3MQ9A 3S2VA 3G3GA 2RF1A 3M3KA 5L9MA 3VLVA 3HSTA 1US4A 4LZ5A 2F5XA 5I2NB 1FW0A 1H43A 1B3FA 4TOZA 2YJPA 1SI1A 4O3BA 4JB7A 4FEDA 4F3PA 3VVEA 4JBZA 3MP1A 4KI0E 2Y84A 1MY4A 1VFDA 1VSOA 4TLLB 1QKAA 3PMVA 1S50A 5DT6A 5AE4A 4YAHX 2REGA 3IJOB 3IOUA 3H6VA 4F22A 4QRZA 4O3CA 2QS4A 4R6HA 3FXRA 4U4XA 2VGQA 2Y7PA 2X26A 3PPQA 3U1OA 3MBPA 2QL3A 3GLBA 3LUYA 2YPNA 3FVOA 3HCQA 3KN8A 2VD2A 4L17A 1B40A 5CMBA 4BDOA 1JW1A 3CVGA 3V8XB 2FNCA 2O68A 2RCAA 3FV1A 4GVOA 1B32A 1B3LA 4QSCA 4F2OA 2OBGA 2O6AA 5HPQA 2XXWA 5JK4A 1B6HA 3RUMA 3TTLA 1GGGA 4P0GA 3LSXA 5TP9B 1IXHA 3Q29A 1BP5A 1WVJA 2ZNSA 3K1PA 4FJPA 4DDDA 2DSFA 5BWJA 3KJTA 4RK2A 1FQAA 5FTHA 3TQLA 1H76A 3O28A 2XXRA 3PUWE 4P11A 5KCJB 2XXYA 1AMFA 1H44A 1PBQA 2OLBA 2Q2CA 4XXUA 4YMAA 3VDFA 4TLMB 5FHOA 2I4CA 1SW5A 3K1MA 1NNPA 3LC8A 3H3GA 3E4RA 1HSEA 4PFUA 1S9TA 2ZMBA 4XIGQ 3FJGA 4ZE9A 4YU0A 4IO3A 4AB5A 3CG1A 1LGBC 3MUQA 5B7DA 2V3TA 4KYDA 5H8QA 4ZZAA 1MXZA 1PBPA 4WEDA 1QW0A 2P1SA 3TCFA 2Z22A 1B7ZA 1D4NA 3KOTA 2Y7IA 3OO7A 1P1QA 4U23A 3MPLA 4OEVA 3N94A 4ZEIA 1N76A 3KN3A 4GIZA 4ZEBA 3U94A 1URGA 2PVUA 4HCYA 3K4UA 4P0IA 5I59B 3K6XA 4FE8A 1XC1A 3R6UA 1ZIUA 1MQJA 2OK2A 4ZEDA 2D5WA 4R74A 3UP9A 1LBBA 3MPKA 1FTMA 4BDMA 1QUIA 3ILUB 4GOTA 4GF8A 4H8JA 1SW2A 5L8DA 3H6WA 1JEUA 1XVYA 3A09A 2ONKE 1I6QA 1UIVA 2I49A 2DXYA 1IIWA 3D4CA 3E3KA 5TU0A 3QYTA 4BDNA 3FVGA 4ZDMA 4EXKA 1OVBA 5BUUA 3PPPA 1ZMGA 2PBWA 4YKIA 4ZZEA 3T9HB 4G8NA 1EU8A 5H8FA 3MP6A 1AH5A 1B3GA 2R6GE 3KN7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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