2ZNTA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, dysiherbaine
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA02
1AOVA 2PT1A 3MAMA 4MF3A 2ABHA 2ONKE 4U2RA 3LUYA 4QFKA 5EHSA 3T96B 4EDPA 4P0GA 2HEUA 3KN3A 4THIA 1Y4TA 3TODA 1MS7A 2X7QA 1NNTA 3O6IA 3O66A 1PDAA 4XIGQ 1QUJA 4WEPA 1IXIA 3PPNA 4FIMA 3C33A 4LP2B 1RYOA 5H8HB 1GR2A 2F35A 4XKQA 5L9SA 4RK9A 2Y7RA 1XHYA 2D5WA 2HCAA 2XD3A 3W9VA 1B3HA 1OVBA 4OVJA 3ZKLA 3RTFB 1IXHA 1P99A 4GXSB 5CBRA 3KOSA 3USDA 3VVDA 4EF1A 1B7HA 4FJPA 4NTLA 4NF5B 4ELQA 4LZ5A 2HAVA 2I3WA 3MP6A 5CMKA 4OETA 1US5A 4GFRA 3U8QA 3KSJA 1ZIUA 2DXYA 2W7YA 1ZJLA 1H76A 3RPWA 1M5DA 4X9TA 2ANJA 5B70A 5I2KA 4R2BA 2X26A 5ISUA 4DIGA 1FQFA 2X7PA 2ZYKA 3WAEA 5ITPA 1J1NA 2GH9A 1EZPA 2UVHA 4KCCA 1N3WA 2Q8JA 1ZKBA 5H8NB 1LGBC 2Z8EA 1ELJA 4MBPA 3HHFA 3FVNA 2YJPA 1XVXA 1MH3A 3CSBA 3MWBA 3N94A 3SEYA 4LA9A 1B0LA 4OZ9A 4I8CA 4F31B 1N84A 2QS3A 1XVYA 3E13X 3HHGA 2NXOA 1LB9A 2P0SA 1SYIA 3MVZA 1S9TA 2OJTA 4H5FA 5IKBA 4IO6A 1Y4CA 2I0CA 2HQ0A 4R2FA 3TTMA 3U72A 1DPPA 3FIRA 4TLLB 4ELOA 1LBBA 1JW4A 2IA4A 4JDFA 3RN8A 1FCKA 1ATGA 3MW0A 5DT6A 3THIA 1GTKA 4BDQA 3CIJA 5CBSA 3JZJA 1SBPA 1Z7ME 1DPEA 1UIVA 2O69A 1VR5A 3O97A 5CMCA 5HPQA 2ONSA 1P1UA 1N76A 3N6TA 5KCJB 1O64A 1GGGA 2V3UA 1RKMA 2Y7PA 2ZNUA 1B3GA 3TYHA 3C9HA 1B1XA 1A55A 1JW1A 4OEUA 1UQWA 2V93A 3GLBA 4X48A 5KCJA 2I49A 2HZLA 3C34A 2P1SA 4PFUA 2QS1A 5IAIA 1Y9UA 3FVGA 5F7VA 1XC1A 4NWDA 4F1VA 3A3UA 4WKMA 1Y20A 2O1MA 3FJ7A 3RUMA 4EF2A 3PD8A 2Z23A 3RGYA 4GF8A 4R6HA 4H0WA 3MUQA 3UORA 3SETA 2XD2A 3OEMA 4KPTA 4DLDA 3S2VA 5CMMA 2AL5A 4N07A 3V5AA 3KGCA 4Z7EA 3C4MA 1B1HA 1SW2A 1DSNA 1JQFA 2ZYOA 5M2VA 1FQCA 4EQBA 1Y3QA 3IAZA 3K1NA 3MZ9A 3LSFB 3PMWA 2XX9A 3H6VA 1PEBA 1SQYA 1MY2A 4GOTA 4KHZE 4NF4A 3K6VA 2ZYNA 5H8FB 1OVTA 2P2AA 3IX1A 1QULA 3MP1A 4I62A 4DXBA 3U1OA 4P0IA 2V3QA 4POWA 1PBQA 3W15C 2OWSA 3C32A 2DVCA 3MPKA 3PUXE 1MXYA 2QMXA 4DXUA 2QPQA 2DS9A 4NEDA 3T22A 3T9XB 5FHOA 3DP8A 1URDA 3V89B 1PB7A 1Z7NE 1OQGA 3SEUA 2RC8A 3TTLA 3FZVA 4IO3A 4EQ7A 3GBAA 3CR9A 3QYTA 2QMWA 3IL1B 4BDLA 3LSXA 5I59A 3PPOA 2O84X 4YKKA 3KJTA 4NF6B 4EXLA 5KDTA 1NL5A 1PC3A 2R6GE 3DLNA 3K1MA 3KBRA 4FECA 1A8FA 1UTHB 4XKRA 1I6QA 2VOZA 4ZZEA 2A5TA 4RA1A 4PFWA 3QIMA 1UTBA 1BKAA 3IB2A 3B6WA 3GBBA 1XS5A 2G93A 4K3FA 1ANFA 4R9FA 2A5TB 3TZAA 1FTOA 4R6YA 5TU0A 4U21A 3TMGA 5I58A 3TUSA 3RY3A 3S9LC 1B9JA 1B7ZA 2OWTA 4IGRA 5JTYB 3FD3A 4C1TA 1EZOA 1EU8A 4DCXA 1A7LA 1FQEA 1QVSA 4G2ZA 4IY6A 1MQGA 4OFOA 4YICA 3IOVA 3PV0E 4G8NA 1RYXA 3PMVA 1GVCA 4E0WA 5AE4A 1O7TA 2ZXTA 3PPQA 4ZECA 3RT6B 1EH3A 4HS7A 4BDMA 3SKPA 4YU0A 5AA4A 4MLQA 1P1WA 1SDXA 1JVXA 3U93A 1Q35A 3B7DA 2O6AA 3G3JA 1XOCA 1PB9A 1EZ9A 1SVXB 3WAFA 5K2XA 4YKJA 5J1DA 3I5OA 3KG2A 2CZLA 1N7WA 3PGFA 4GD5A 4QFLA 3VXBA 4OESA 1SW1A 1MXWA 2Y84A 3L6GA 4OHNA 4AB5A 3RT8A 2B3FA 5I56A 2RF1A 3LC8A 1B5HA 1HSEA 3MVWA 3OSRA 2OCUA 5L9MA 4JXIA 4OXVA 4C1UA 1TWYA 2M8CA 3IB1A 2ONRA 4NWCA 1IUDA 2QS2A 2DWIA 3H4ZA 2GRVA 5HBCA 2F34A 1POTA 4PP0A 1B4HA 1MRPA 4FE8A 5L9OA 1SW5A 1LCFA 3IOWA 3DP6A 4GRKA 2VD2A 3IOUA 3EN3A 1D3KA 1MM7A 2I0BA 1B3LA 4IY5A 4LQ2A 3BKIB 4YB6A 1N7XA 3E4RA 5H8QB 3PMXA 2PMSA 3TQWA 1B5IA 4ESXA 3ODBA 1LFHA 3E9XA 3EQ1A 2PYYA 4F22A 1N0TA 2DXRA 1SI0A 4G8HA 1MXVA 2XXHA 1YTVA 4TLMB 3T9UA 4OERA 3EPEA 5H8SA 3O29A 3K6UA 1JW5A 3RLFE 2RC9A 3EHSA 3ZKKA 3K6XA 4QSCA 2O7UA 2FYIA 1IITA 4F1YA 3CFXA 2DE3A 3CRBA 5DVFA 3UK4A 2DSFA 2Z8DA 3QUFA 3SEXA 4U1OA 4IO2A 4GL0A 1WDNA 4ECFA 1MQJA 1TXFA 1OLCA 2H9BA 4H8JA 4OEVA 4GQOA 4LZ7A 4KFQA 3DM0A 4R6KA 4WXJA 5EHMA 4F18A 4R73A 3HPIA 2Q9TA 3G3FA 3G3KA 3IO4A 4H67A 4NF4B 2I4BA 5I2NB 3UN6A 3EHTA 3KOTA 3OO7A 4TQUQ 5DEXA 2UXAA 2ALUA 4H65A 3TKDA 3QXMA 1B46A 1MPBA 2D21A 4PFYA 1MQHA 3U94A 2F8DA 2OK2A 4G68A 4JWXA 2FA7A 2QL3A 2QSXA 3G3HA 2F78A 3S9NC 5DEXB 2HXWA 1A8EA 3RTWB 1B3FA 3K4UA 4FAJA 3T66A 4LVQA 4UACA 2HAUA 4H5GA 2GFEA 4RJZA 3KZGA 4NF8B 4O3BA 1FTLA 2XXUA 4TOZA 5DYHA 2NWJA 1D9VA 1MDQA 3VLWA 2BJJX 3KSXA 4OQOA 1GV8A 1HSJA 2H98A 1AMFA 1Y3NA 5CRYA 3TFLA 2DP8A 3T9VA 3HV1A 4F39A 2LAOA 4F2OA 4L17A 5K2YA 4OMBA 1FQBA 4QSEA 3TQLA 3KJ7A 2RKMA 4P11A 1DTZA 4JB7A 3O2AA 1OLAA 3IORA 1VSOA 4Q0CA 2RCBA 4FEBA 5A5XA 4YAHX 3K00A 2QRYA 1A54A 3IB0A 2I48A 4M1VA 3UA8A 1QUIA 3KFMA 4YB7A 3K02A 2RINA 3D4CA 3FJGA 3O6GA 3O28A 4ISUA 1D4NA 3H7MA 3L6HA 1H44A 3ONMA 2XXRA 3RQTA 1P1OA 4O3AA 2I58A 2NUVA 3CG1A 4F19A 5TP9A 3Q25A 2PT2A 3PD9A 3PUZE 4Q5TA 1H3DA 2AYSA 2B3BA 3W9WA 3S9EA 2IEEA 1R6ZA 1N3XA 3HO7A 4IO5A 1QKAA 1MG1A 3GZGA 2XXPA 3RNNA 3FV1A 1AH5A 3M3LA 4LUBA 4QF9A 5B7DA 3MJNA 3K0VA 4KR5A 2VGQA 2XHDA 3MBPA 3TTKA 4KI0E 3PUVE 4Z0IA 2PVUA 4H1XA 1B4ZA 2Q89A 2XX8A 5JK4A 1T0KA 3M3KA 1YAEA 1MXXA 1JVYA 1N04A 1LAXA 1YCJA 1KWHA 3O9PA 1B58A 4E0XA 4IO7A 1NH8A 5AA3A 3I6VA 4JWYA 2Y7WA 1OIBA 1URGA 2YPNA 2PX1A 5I2KB 2DOJA 1MQDA 1SYHA 1POY1 2ESNA 3FVKA 4MLVA 3D4GA 3FVOA 1MPDA 3CG3A 2R9JA 4WEDA 2HZKA 1QW0A 2H25A 1US4A 1LB8A 1WVJA 3K1PA 4GWOA 4M4GA 4O3CA 5CC2A 3A09A 4RY1A 1ZTYA 3Q28A 1BLFA 2REGA 1CB6A 3OO9A 3OSQA 3P7IA 4RPNA 5TPAB 3EF7A 3TDJA 3B6TA 1QUKA 1B3EA 1BIYA 4ND9A 3H3GA 1VE4A 4R72A 4YKIA 3M8UA 3FGSA 1LLSA 2ZNSA 5I57A 1FTKA 2XXWA 2GHBA 1B32A 2I6EA 2DYXA 3LR1A 1OQHA 4U23A 4IB2A 1MH4A 2WKYA 4ZDMA 3UP9A 2O1LA 4GIZA 1TT1A 2HFBA 1B40A 1I69A 4QFPA 4FEDA 5CM6A 1Y3PA 4JWOA 3VDFA 1JETA 1S7YA 2VHAA 4XKPA 4C0RA 1FW0A 2RCAA 5I59B 1MQIA 1IXGA 2ZNTA 3MZBA 3ILUB 3MC2A 1B0HA 1LAFE 1F9BA 4I1DA 2VP1A 2QS4A 3CI8A 3R26A 3VVFA 3IJOB 4DDDA 4G68B 5BUUA 3MQ9A 3OEKA 3N6UA 2OLBA 3MP8A 5F1QA 1BP5A 3VVEA 5HM4B 5I58B 4OFJA 1P1QA 5CMBA 4KYDA 4YKPA 4JSDA 4BLAA 2NOOA 2Q2AA 4KYEA 4F3PA 4NF8A 3QSLA 4U1ZA 3FXUA 2OBGA 3G3GA 3QK6A 2XXQA 4RPOA 4QSDA 2FNCA 1LBCA 4JBZA 1I6BA 1MDP1 4Q30B 3VLVA 2F7CA 4BDRA 4LQ5A 1H45A 3H6UA 3JYRA 1DTGA 1WODA 3IK6B 1L5TA 4GL8A 5JTYA 2RC7A 5CI5A 3R7XA 1IZ1A 2UVJA 1B52A 3OOAA 5H8NA 4RYAA 3TELA 4DXCA 4U4SA 5FTHA 3T9HB 4RXLA 3TAJA 2REJA 4ZEBA 1CE2A 3F11A 2Y7IA 5ITOA 3E3KA 4KD5A 4YB5A 2UYEA 4EUOA 2I3VA 4AB6A 3MVXA 3CVGA 3SDFA 3U92A 3TCHA 1ZMGA 3JV9A 4X1DA 2Y7KA 2QJEA 3I3VA 3OELA 4MH5A 2Q2CA 3HCQA 5DVIA 1S50A 4F2QA 4YMAA 2DVZA 1USYH 3R6UA 3TPAA 3VLUA 3S4UA 2UYFA 3A3CA 4R74A 3UIFA 1B6HA 1IXCA 2ZMBA 3Q27A 3IOTA 1JNFA 2PBWA 2UVIA 3MPLA 5FHMA 5H8FA 1R1NA 1UTBB 1ZLQA 5A5XB 1YPNA 1MXUA 1USYE 3N5LA 3S9MC 5TP9B 2V84A 3FV2A 2O7IA 1A99A 2O68A 4YZZA 2XXIA 2GHAA 3PU5A 5TPAA 3ECRA 3K2DA 4LATA 4OTEA 1HSLA 2Q88A 4ZEKA 1Q1KA 2DE2A 2F6GA 3FXQA 2Z22A 4ZZAA 4G4PA 5BWJA 1ZU0A 5JEIA 4RK2A 4EQ9A 1P1NA 3OO6A 4HW8A 2CMOA 2DWAA 4AQ4A 5I57B 2NVUB 3BFUA 4DCYA 3PUWE 3KN7A 3LSLA 3UGWA 5AA2A 3H6WA 4ELPA 3TEPA 4XKNA 1IQ7A 1TFAA 3K6WA 3FATA 1NH7A 3H06B 5AA4B 1LCTA 1DMBA 1UTHA 3DELB 3QAXA 2B65A 4U4XA 4X1BA 4NMYA 5AA2D 4N6PA 1NNPA 3ZS6A 5KDTB 4ZE9A 1NFTA 4QFOA 4POXA 2E0SA 5KZTA 2F7AA 1MY3A 1D9YA 1LSTA 1LFIA 2DQVA 3H03A 3OO8A 4F3BA 2O51A 3FUZA 2F36A 1M5EA 3H6TA 1MY1A 1R9QA 2F7BA 2XXTA 3AXFA 3KN8A 3PUYE 4DE8A 3V83A 1XT8A 4KCDA 3MVYA 5ELVA 1SI1A 2F5XA 3FJMA 3CFZA 3SEVA 3T93B 1NKXA 3VE1B 4ELRA 3OD7A 4ESWA 5H8HA 1ZBMA 1MPCA 4LONB 2R71A 4FATA 3CSGA 4OFLA 4I9DA 1MY0A 3TCGA 3Q26A 4RNSA 1IIWA 3BFTA 1JEVA 3LBSA 3EHUA 2D3IA 4QHQA 1LAHE 4UA8A 4BDNA 4YMBA 3KEIA 3M3FA 3OMBA 4ONYA 3TCFA 2DWJA 5EYFA 3C35A 1FTMA 1I6AA 2A5SA 2G29A 2I4CA 4QRZA 3SERA 4GXAA 3V8XB 5H8QA 1NMUA 1NNKA 2H5YA 4OENA 4ZE8A 4H8IA 4MFIA 4GVOA 1AIVA 4QFNA 2AL4A 4F29A 4HCWA 5AA2B 2KLFA 3FXRA 4PFTA 4XXUA 1B05A 4G68C 4OWDA 5FTIA 4G77A 1TFDA 3G7WA 1MY4A 3OENA 1FQAA 5ICQA 3O6HA 1B7UA 1SD3A 3HSTA 1BTJA 1FQDA 3B6QA 3DP4A 3ILTB 3N26A 4NF6A 5DTBA 4LZ8A 1B2HA 3G3IA 4NF5A 2V25A 5L8DA 3PPPA 3VFJA 4ZEDA 1B5JA 2UVGA 1JEUA 1II5A 3FASA 4R75A 1Y1ZA 2DWHA 4JSOA 4IGTA 3LSWA 1A40A 4PE5B 2XXYA 1M5BA 4R9GA 4HCYA 3C36A 4KQPA 3IJXB 1R9LA 3QUJA 1MM6A 2Z8FA 3VV5A 1M5FA 1URSA 4IO4A 4KYSA 3K01A 4PQJA 2OZZA 4XTCQ 3SEWA 1PBPA 1QJMA 1Y1MA 5ICTA 4Q8RA 1B51A 1O63A 4FORA 2THIA 3OXNA 3SESA 5I84A 1IEJA 2E1SA 2H4IA 3Q29A 1LFGA 4NE4A 2XXXA 1H43A 5FHNA 4ZEFA 1VFDA 3IR1A 3MZ1A 4PETA 1M5CA 4N13A 2YLNA 3BBRA 1FTJA 1OMPA 1PB8A 3GXAA 5I2NA 3HN0A 4GLIA 4BDOA 2XX7A 3CFLA 4HTGA 1LAGE 2V3TA 1VFEA 1AL3A 1NNFA 3VXCA 4ZEIA 3ZSFA 4F1UA 4U22A 4F3GA 5I56B 2DE4A 2F97A 2XXVA 3C31A 4OYVA 5DVJA 5LOMA 3TTRA 4ZS9A 4DZ1A 4F3SA 2F6PA 3IO6A 2VD3A 1UIUA 1SW4A 1DOTA 3TTNA 2ZYMA 2AIXA 5AA1A 4H6DA 4EXKA 1MXZA 2H99A 3PPRA 4G8MA 1QKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U2RA 5EHSA 4EDPA 2HEUA 1MS7A 1NNTA 1JP4A 2F3DA 1PDAA 1IXIA 3PPNA 5H8HB 1XHYA 2D5WA 2HCAA 2XD3A 1P99A 2XXKA 3KOSA 4GWZA 4EF1A 5IZZA 4FJPA 4N91A 1US5A 1ZIUA 2DXYA 5B70A 1FPFA 2ANJA 2FBPA 5H8NB 2Z8EA 3B8BA 1ELJA 3HHFA 3FVNA 3CSBA 3LUZA 4LA9A 1B0LA 4OZ9A 4I8CA 1SYIA 4IO6A 4R2FA 2HQ0A 1DPPA 3RN8A 1ATGA 3MW0A 5DT6A 5CBSA 3JZJA 1N76A 2Y7PA 2V3UA 1B1XA 4OEUA 5IAIA 2KR0A 1XC1A 4N81A 4NWDA 4P3LA 4F1VA 3RUMA 3GYYA 3OEMA 3S2VA 5CMMA 2AL5A 3V5AA 2ZYOA 1JQFA 4O94A 3B50A 2VPNA 3KBZA 5TP9A 3H6VA 5H8FB 3U1OA 2VPOA 3C32A 2DVCA 3T9XB 3DP8A 3TTLA 4PF6A 3IFCA 4PTKA 5I59A 2O84X 3KJTA 5KDTA 1NL5A 1PC3A 2VOZA 4H45A 1UTBA 1BKAA 2B4LA 2G93A 4K3FA 2A5TB 4U21A 1FPEA 3TUSA 1B7ZA 4C1TA 1EZOA 1EU8A 4DCXA 4G2ZA 4YICA 5AE4A 1NV4A 2ZXTA 4HS7A 4YU0A 4MLQA 3U93A 1Q35A 3B7DA 3KG2A 3PGFA 4O7IA 1K9ZA 1FBDA 3L6GA 1IMDA 2B3FA 2RF1A 3MVWA 4DI3D 3IB1A 2ONRA 2CZKA 3U65A 1KA0A 2F34A 2JJKA 2PCRA 2VD2A 4LQ2A 3BKIB 2KQZA 1LFHA 3E9XA 1YTVA 4TLMB 5H8SA 1NUZA 3O29A 3K6UA 3EHSA 2FYIA 4HE0A 3CRBA 3SEXA 1WDNA 2H9BA 4LZ7A 4KFQA 5EHMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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