2ZNTA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, dysiherbaine
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA02
4N07A 2HZLA 4QFLA 5CC2A 3KBRA 4DZ1A 3TMGA 3VDFA 1PB8A 1PEBA 1B6HA 2XXYA 4QF9A 5K2YA 3G7WA 1PBQA 4TQUQ 2QMXA 5FHOA 2V25A 3G3JA 4RK9A 1MS7A 1AMFA 3PUVE 1FQFA 4F22A 3O9PA 1WODA 2I4CA 2R9JA 3CI8A 2A5SA 2XXWA 3HO7A 3QUJA 1B7ZA 4OERA 5IAIA 3CG3A 3IX1A 5AA2A 5I57A 3K4UA 1LBBA 3G3IA 1P1OA 2F6PA 3O6GA 3K6XA 4GD5A 2ZNSA 2E1SA 4C1UA 4PE5B 4OXVA 1H43A 2Y7IA 1IUDA 3P7IA 1B32A 4OQOA 4P0GA 2E0SA 4R2BA 3CR9A 3RLFE 1B9JA 2F8DA 2HFBA 1FW0A 1MM6A 3S9LC 1GV8A 1O7TA 4ONYA 5FHMA 3H6WA 3R6UA 1M5DA 2X26A 3RTWB 2I58A 4R9FA 1BKAA 2F7AA 1N7XA 4ZS9A 3IR1A 1ZIUA 2HAUA 4ND9A 5CI5A 4LATA 4PFWA 3T9VA 4EQ9A 2VGQA 1NNPA 1MXUA 2G29A 3TTMA 2AIXA 1BP5A 4YKKA 1VR5A 4FORA 3FJ7A 1MY1A 1QUJA 3R26A 4MFIA 5L9MA 4FAJA 3C34A 3RN8A 1FQDA 1IITA 3H6UA 4U2RA 5BWJA 1DOTA 5TP9B 3RGYA 4F1UA 3DP6A 1XC1A 5H8FB 3DLNA 5ELVA 5FHNA 2RC9A 5H8FA 3WAEA 3L6HA 4XKNA 2XD3A 2QS3A 3IB1A 3M3FA 1MY4A 1MQJA 5I58B 1QW0A 1FQEA 2OJTA 3OENA 4JXIA 5I58A 1Y9UA 3RPWA 4U22A 3AXFA 3S2VA 1B52A 1P1UA 4XKQA 1FQAA 3PMVA 4X48A 3PUXE 2XXQA 3CG1A 1B3FA 3ZSFA 2WKYA 1JETA 3TTRA 3JZJA 2DVCA 2D21A 3CFXA 2REGA 3KOTA 4LUBA 1I6QA 1LFHA 2M8CA 2IA4A 5EHMA 4BDQA 4H5GA 4FIMA 1B7UA 1Y1ZA 2QRYA 5F7VA 4E0WA 1A40A 1BIYA 1AOVA 3I6VA 3V89B 3FXUA 3FJGA 2UVHA 4GL0A 2I6EA 3MAMA 4U23A 2UYEA 3RUMA 3V8XB 3FGSA 5BUUA 1B3GA 3LSWA 2O7UA 1ELJA 5FTIA 3JV9A 3IOUA 3ZKKA 2XHDA 4IGRA 4KYSA 3VXBA 1R9QA 3TFLA 4IB2A 1R6ZA 4ZEDA 4NF4B 1TFAA 2O84X 5ISUA 4QHQA 3QXMA 4NF4A 3CIJA 4GVOA 1TFDA 4NF6B 5AA1A 2P1SA 1USYE 5KDTB 1HSEA 4NF6A 3PPNA 4F29A 3PMWA 2PMSA 4ISUA 3ONMA 2XXXA 4IO2A 4H8JA 5DVFA 2ONRA 1D4NA 1N04A 1SI1A 2ZYOA 2Z22A 4ZE9A 1D3KA 4N6PA 4LA9A 3EF7A 2GFEA 1EZ9A 4IY6A 3KOSA 1YAEA 5I2NA 2XXVA 4KYDA 1MG1A 5TU0A 1SI0A 1YTVA 4LZ8A 4R75A 1PB9A 3VLUA 1RYXA 2GH9A 4LVQA 3F11A 3SEVA 2F5XA 2P0SA 4N13A 1NNKA 2RCBA 3TDJA 3MJNA 4ZEFA 1UIVA 4YU0A 3M3LA 3K6WA 3MVWA 1SD3A 3Q27A 4I8CA 4HS7A 1JVXA 3CFZA 4OEVA 4UACA 3VVEA 3C36A 5ICTA 3SDFA 2ALUA 3N6UA 4IO6A 3K1MA 3PUYE 1DPPA 4KR5A 1US5A 4ELPA 1KWHA 1R9LA 1UTBB 3TEPA 1LAXA 4R6KA 3FJMA 2V3UA 2PT1A 2Q88A 4GOTA 5ITOA 4ELRA 4POWA 3MVYA 1GTKA 3K1NA 4H65A 4OWDA 5A5XB 2FYIA 2CZLA 3MZ1A 4QFOA 3FXRA 1QULA 3D4GA 4GWOA 4YKIA 4KCCA 4C0RA 4FECA 2DP8A 2ZNTA 2DE2A 3FXQA 3DM0A 2O6AA 1SQYA 2X7QA 2UVGA 3M8UA 3RTFB 4F2QA 5KCJB 2Y7WA 5KCJA 2VD2A 4F3SA 2DQVA 5B70A 2Q8JA 4ZZEA 1N76A 3GLBA 4X1BA 4R74A 1BLFA 3KFMA 3KGCA 3UP9A 1PC3A 4JWOA 4EF1A 3TAJA 4H67A 2THIA 3TELA 1B1HA 4H5FA 3O6IA 4TLMB 3TCFA 1FQCA 3Q29A 4RA1A 1FQBA 3O6HA 1MH3A 2QJEA 1FTOA 2HAVA 4YB7A 2OWTA 4G4PA 3E13X 2DXRA 5I56B 3I5OA 1VE4A 5H8QA 4F18A 1LFIA 4OESA 5I56A 2DVZA 4JSOA 2NVUB 1A7LA 4F3BA 3MW0A 2XX7A 4ECFA 1Y4TA 4EF2A 3QAXA 1RYOA 4NWDA 3HHGA 3W9VA 3VFJA 3CSBA 2OCUA 4UA8A 2RC8A 2ESNA 1EZOA 2YPNA 1F9BA 3V5AA 2B3FA 1HSJA 1A8FA 1M5FA 2YJPA 4F2OA 1QUKA 4NF8B 1MH4A 3K2DA 4NF8A 5I84A 1POY1 3PPPA 3BKIB 4MLVA 4OHNA 3H7MA 3KN7A 1SW2A 2RF1A 2DS9A 1LAGE 5K2XA 1LGBC 3OO8A 3ZKLA 1LB9A 4Z0IA 1T0KA 1M5BA 4YMBA 4QSEA 4O3CA 1B5HA 1MQGA 1XVXA 1SW5A 2UXAA 4PQJA 4YMAA 3MPLA 4AB5A 3HN0A 5CMCA 1D9YA 1CB6A 2Q9TA 3QIMA 2Z23A 1B1XA 5AA4B 1MQDA 2P2AA 3B6TA 3CVGA 3H3GA 1IXCA 2I3VA 1ATGA 5AA4A 1IXIA 3VXCA 3HSTA 5EHSA 3QSLA 3RT8A 2BJJX 4HW8A 1BTJA 4XTCQ 2RCAA 5DT6A 3SEUA 1Q35A 2QSXA 5CRYA 3RQTA 1LB8A 3OEKA 4MH5A 4KCDA 4YKJA 1GR2A 3G3GA 1MXXA 2H9BA 2RINA 3H4ZA 4FJPA 5J1DA 3U92A 3B6WA 4LONB 2VD3A 1PBPA 3SERA 3TCHA 2LAOA 4JWXA 1N84A 4OVJA 1B0LA 1LCTA 2W7YA 2H25A 4F3GA 4K3FA 3A3CA 4BDNA 1FCKA 4F3PA 3OMBA 4ZEBA 3K01A 1MPDA 3N94A 3BBRA 4R2FA 3G3KA 5H8HB 2ONSA 3A09A 4MBPA 3O29A 5TP9A 5H8HA 1IXHA 4YAHX 3FVOA 1SVXB 4XKPA 3D4CA 1DTZA 2DWHA 3ECRA 2ANJA 4Q5TA 1ZLQA 4LZ5A 4H1XA 1FTKA 2ONKE 1NKXA 4XIGQ 4NF5B 1A99A 2HQ0A 3TTNA 4NF5A 2REJA 3MVXA 1TXFA 3THIA 3R7XA 3EPEA 3IL1B 4E0XA 2QS2A 1NH7A 2PBWA 4RPOA 3ILTB 3ODBA 4U21A 2D3IA 1ZBMA 4F1YA 2ABHA 5IKBA 4R6HA 4NE4A 5DEXB 1NH8A 2R6GE 3KG2A 2I0BA 3G3HA 1MQIA 3K02A 5DEXA 1B3LA 4EDPA 1IXGA 3MQ9A 1B2HA 3EHTA 4YKPA 4KHZE 3K00A 3PGFA 3IB2A 1OVBA 3MZ9A 1LSTA 4I9DA 4EQBA 2OBGA 3HCQA 1MDQA 3M3KA 3T93B 3I3VA 2I3WA 2FA7A 3TQLA 4ELOA 3CRBA 3SEYA 1I69A 1LAFE 2XXPA 3VLWA 5CM6A 2NOOA 2I48A 3K6UA 3GXAA 4ELQA 3KN3A 1MXYA 1OLAA 4OENA 5KDTA 1US4A 1B7HA 5FTHA 2ZYKA 3VE1B 2A5TB 1OQGA 1J1NA 2DWAA 1XOCA 1ZMGA 2DWJA 1MY2A 3W15C 2NWJA 3IOVA 1Y1MA 4RJZA 3TTLA 3DELB 4KYEA 1NNFA 4LQ5A 2O68A 1YPNA 2RC7A 1NNTA 2Y7RA 4OMBA 4GQOA 5I2KB 2CMOA 1OLCA 3TTKA 2Q89A 3OSRA 3GBBA 2ZNUA 3MWBA 2GHBA 5I2KA 3O66A 2YLNA 4RK2A 5B7DA 1XHYA 3C32A 4NWCA 3T9XB 2UYFA 1N3WA 1B3HA 4NEDA 4C1TA 4G8NA 3EQ1A 2G93A 5CBSA 2DYXA 4BDOA 3PD8A 4Z7EA 1WDNA 1Y3PA 1R1NA 3T96B 3KSJA 5HM4B 1N0TA 1XS5A 5DTBA 1OIBA 4AQ4A 3EHSA 3KZGA 1GGGA 1ZTYA 3A3UA 3FV2A 1JVYA 3VVDA 1B4ZA 1QUIA 3H06B 1I6BA 4AB6A 4DIGA 1UTBA 5H8SA 2Q2AA 3O28A 3HV1A 2XD2A 3OO7A 4U4XA 1M5EA 1O64A 5A5XA 3PPQA 1MXWA 4FE8A 3UGWA 4EQ7A 2ZMBA 1VFEA 1Y3NA 3TPAA 1JEUA 3MP6A 1FTMA 1B46A 4OFOA 1MQHA 1N3XA 3HPIA 4RYAA 3OEMA 4KPTA 4BDRA 4TLLB 4ZZAA 4QRZA 3SEXA 1RKMA 3LR1A 3IK6B 4ZEIA 2V3QA 4G77A 4H6DA 1GVCA 5DYHA 3OO6A 3B6QA 2PYYA 3ZS6A 1H45A 3Q26A 4P11A 3LSFB 4FEBA 1EZPA 3U93A 3PUWE 5AA2D 1LBCA 1H76A 4OZ9A 3FVGA 5H8NB 4NMYA 2X7PA 5F1QA 2OK2A 2Y7KA 4DCXA 3UN6A 4O3BA 2F34A 5H8NA 1CE2A 1MXZA 1QVSA 5DVJA 3C31A 2I4BA 2FNCA 3LBSA 1S50A 1JW4A 3DP4A 3N26A 3GBAA 3T66A 4GF8A 1MPBA 4QFPA 5CBRA 2AYSA 4M1VA 2GHAA 3KSXA 4RXLA 2V93A 3Q28A 4G8MA 3MPKA 5JTYB 1AH5A 1XT8A 2H99A 1EH3A 5JTYA 3IOTA 2HZKA 3H6VA 2HCAA 1B58A 4OTEA 3KJTA 2QS1A 3OELA 4IO3A 4ZEKA 1JW1A 5AA3A 2O69A 3S9NC 2F97A 3FVNA 4OETA 2XXHA 3OD7A 3O2AA 3TCGA 3RY3A 2HXWA 3EN3A 3E9XA 2DE4A 4RNSA 3Q25A 4IO4A 3UK4A 1B5JA 2PVUA 3QUFA 4DLDA 3EHUA 3FUZA 4MLQA 5ITPA 1S9TA 5EYFA 4Q8RA 3MP1A 1MY3A 2V3TA 4BLAA 4BDLA 3PPOA 5AA2B 5I57B 2GRVA 4WEDA 1NL5A 3DP8A 3E3KA 3BFTA 3FATA 2HEUA 2O51A 3T9UA 1DSNA 4PP0A 3FV1A 1LLSA 1NMUA 1Q1KA 1Y20A 1URSA 1P1QA 1MXVA 4GFRA 4EXLA 1YCJA 3N5LA 2F7CA 4U1OA 3FVKA 1JNFA 2NUVA 1DMBA 3PU5A 1FTLA 3V83A 5CMBA 1B3EA 4RPNA 4OFJA 3E4RA 2ZYMA 2AL4A 3PMXA 3HHFA 1SW1A 2NXOA 2XXUA 3IJXB 4GLIA 3QYTA 2RKMA 4POXA 3UORA 4KQPA 2XXTA 3H6TA 3QK6A 1O63A 1UIUA 1NFTA 3FD3A 2XXIA 4QSDA 2I0CA 1OVTA 2DXYA 1ZKBA 2OWSA 1P99A 4DXCA 1FTJA 4DDDA 1B0HA 3T9HB 4JB7A 1IEJA 1AIVA 3TUSA 1OMPA 4JDFA 3MZBA 4ESXA 4Q30B 4EUOA 1USYH 3UIFA 4F1VA 2QS4A 3H03A 3OSQA 1N7WA 2H5YA 1M5CA 1I6AA 2DWIA 2D5WA 3B7DA 4F31B 4M4GA 3TYHA 3S9EA 3SESA 2UVIA 4XXUA 3SETA 4G68C 4L17A 3IAZA 2DSFA 3U94A 4JWYA 4YB5A 3U1OA 3W9WA 4DXBA 5I59B 4ZDMA 2O1LA 2PT2A 4YICA 5I59A 1H44A 2ZYNA 1PDAA 4JBZA 1B40A 2DOJA 1JW5A 3IOWA 1SBPA 1A55A 3L6GA 4HCWA 3VLVA 3LSLA 2VOZA 4QSCA 4WEPA 3OOAA 4O3AA 4FEDA 5L9SA 3S9MC 2PX1A 5ICQA 1II5A 2DE3A 3PV0E 1PB7A 3MVZA 5HBCA 5CMKA 1MRPA 3OO9A 3OXNA 3N6TA 1H3DA 4YZZA 4TOZA 1A8EA 4THIA 5TPAB 1QJMA 2V84A 5TPAA 3MBPA 3LC8A 4IO7A 1LFGA 4U1ZA 2F78A 2Z8EA 4DCYA 1URGA 5M2VA 3ILUB 1URDA 1QKBA 2A5TA 2Y7PA 2OLBA 4GRKA 2QL3A 2Z8DA 1B4HA 2QMWA 4IY5A 4X1DA 4F19A 3KN8A 3K1PA 1SW4A 3U8QA 4BDMA 3BFUA 4Q0CA 1AL3A 3PD9A 3UA8A 1OQHA 2O1MA 5I2NB 3CSGA 1Z7NE 3IO4A 3KJ7A 3CFLA 4GIZA 4OYVA 2F35A 2QPQA 3S4UA 1SYIA 3RT6B 5LOMA 1MDP1 1LAHE 3C35A 1SYHA 3IB0A 2B65A 5KZTA 4FATA 4KI0E 4QFNA 3USDA 4DXUA 1JQFA 3TQWA 4RY1A 3U72A 4XKRA 5JEIA 3O97A 3KEIA 4X9TA 1EU8A 1IQ7A 5JK4A 1QKAA 1IIWA 4GL8A 4LQ2A 1IZ1A 4ZE8A 4H0WA 1UQWA 1D9VA 1L5TA 1MM7A 4PFYA 4ESWA 1SDXA 1B51A 2R71A 2AL5A 4WXJA 4LZ7A 1Y4CA 4R6YA 5DVIA 4KFQA 3PPRA 4ZECA 2XX9A 2B3BA 4DE8A 4GXSB 1TT1A 3IO6A 1ZU0A 3FZVA 2OZZA 4R9GA 5AE4A 5HPQA 4QFKA 4H8IA 4EXKA 3IORA 3JYRA 3G3FA 2XXRA 2F6GA 1Z7ME 1Y3QA 3LUYA 1JEVA 3T22A 4KD5A 4JSDA 4LP2B 3MUQA 2Y84A 3K6VA 3FASA 3MP8A 1WVJA 1MPCA 4I1DA 4I62A 3C4MA 4OEUA 4OFLA 2H98A 4HTGA 3GZGA 4YB6A 1B05A 3TZAA 3SKPA 1A54A 2IEEA 4U4SA 3TODA 4IO5A 3C33A 2ZXTA 2H4IA 3PUZE 3K0VA 1MY0A 2VHAA 4GXAA 1P1WA 1VSOA 2F36A 2VP1A 1S7YA 2UVJA 4P0IA 1UTHB 1ANFA 3WAFA 3VVFA 5H8QB 3C9HA 1B5IA 1TWYA 1UTHA 4PFTA 5CMMA 1XVYA 4R73A 3VV5A 4MF3A 3RNNA 1DPEA 4G68B 3LSXA 1P1NA 1LCFA 4G68A 3FIRA 4NTLA 3IJOB 2F7BA 4HCYA 4PFUA 4G8HA 1ZJLA 1DTGA 4WKMA 4F39A 2Z8FA 2I49A 4G2ZA 2Q2CA 5L8DA 1VFDA 4R72A 4IGTA 1HSLA 2XX8A 5L9OA 3SEWA 3MC2A 1POTA 3TKDA 4PETA 2KLFA 2O7IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3M3FA 1MY4A 1Q9DA 1MQJA 5I58B 1QW0A 1FQEA 2OJTA 5IGAA 3OENA 1XI6A 4JXIA 5I58A 1Y9UA 2CZKA 3RPWA 1LBVA 4U22A 3AXFA 3S2VA 1B52A 1P1UA 4XKQA 1FQAA 3PMVA 4X48A 3PUXE 2XXQA 4OA4A 3CG1A 1B3FA 3ZSFA 2PFYA 2WKYA 1JETA 5T3JA 3TTRA 3JZJA 2DVCA 3QMFA 2D21A 3CFXA 2REGA 1NUZA 3KOTA 4LUBA 1I6QA 1LFHA 2M8CA 2IA4A 5EHMA 4H5GA 4BDQA 4FIMA 1B7UA 1Y1ZA 2QRYA 5F7VA 4E0WA 1A40A 1BIYA 1AOVA 3I6VA 3V89B 3FXUA 3FJGA 2UVHA 2QVRA 2I6EA 3MAMA 4GL0A 4P3LA 4U23A 2UYEA 3RUMA 3V8XB 3FGSA 5BUUA 1B3GA 3LSWA 2O7UA 1ELJA 5FTIA 3JV9A 3IOUA 3IFCA 4HE0A 3ZKKA 4HXVA 2XHDA 1DCUA 1LEVA 1FPKA 4IGRA 4KYSA 3VXBA 1R9QA 3TFLA 4IB2A 1R6ZA 4ZEDA 4NF4B 1TFAA 2O84X 5ISUA 1BK4A 4QHQA 3QXMA 4NF4A 3KC1A 3CIJA 4GVOA 1TFDA 4NF6B 5AA1A 2P1SA 3GYYA 1USYE 2P3VA 5KDTB 1HSEA 4NF6A 3PPNA 4F29A 3PMWA 4N91A 2PMSA 4ISUA 3ONMA 2XXXA 4IO2A 4H8JA 5DVFA 2ONRA 3FXBA 1D4NA 1N04A 1SI1A 4N15A 2ZYOA 2Z22A 4ZE9A 1D3KA 4N6PA 4LA9A 2P3NA 3EF7A 1NI9A 2GFEA 2WBBA 1EZ9A 4IY6A 1FPFA 3KOSA 1YAEA 5I2NA 4O8MA 2XXVA 4KYDA 1MG1A 5TU0A 1SI0A 1YTVA 3E79A 4LZ8A 4NF0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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