3IJXB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, hydrochlorothiazide
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijxB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijxB02
2ESNA 4H65A 1ANFA 1H44A 2Y7IA 2Y7PA 3PUVE 1JW4A 1EZOA 1TWYA 1DTGA 4N13A 1D3KA 4YMAA 4F29A 4RJZA 3KEIA 2PT1A 4JWYA 5CRYA 5ICTA 2ANJA 4U1ZA 1B5HA 4Z0IA 3M3KA 2NUVA 1B7UA 1IXCA 4G77A 1R9QA 3MVWA 4XIGQ 3CFXA 3PPNA 3W15C 1NNFA 3HCQA 1B58A 1XOCA 1VSOA 1AH5A 5H8FB 2FNCA 2HQ0A 4QSEA 1B52A 3TEPA 2X7PA 3LR1A 2H4IA 1MPDA 2XD2A 4OQOA 4H5FA 5I59A 4RNSA 3JZJA 2XXIA 4YU0A 3QUFA 3K0VA 1FW0A 4H0WA 3CFLA 5KDTB 1AOVA 1B32A 3IJXB 4U23A 3PGFA 4M1VA 4F3SA 5FHOA 4YMBA 3IO6A 4AQ4A 3RQTA 2F8DA 3FD3A 1MS7A 3R26A 4LUBA 3L6GA 1WDNA 5FTHA 3G3HA 1MPBA 4MH5A 4WXJA 2X26A 3BFTA 1JW1A 4NF5B 4G68C 1LB9A 2UXAA 1LAXA 1LB8A 3G3JA 4H8JA 3VVEA 3MP1A 3OELA 4ZEBA 4JSDA 4R72A 1M5CA 1MM6A 2R6GE 3TFLA 4P11A 2I4BA 4QFNA 5JK4A 3WAFA 1VR5A 1ZTYA 3IJOB 1UTHB 4JXIA 2OJTA 3VXCA 3TAJA 2ZYNA 2XX7A 4HW8A 5JEIA 4AB5A 2P2AA 2UVJA 2ZMBA 1QVSA 3O29A 1SVXB 1M5DA 1LCFA 1SQYA 3FGSA 3G3KA 1R9LA 1P1UA 2B65A 5DVIA 5EYFA 3MAMA 3ZKKA 3TCGA 1A8EA 3TPAA 1GR2A 1M5FA 4G68B 2P0SA 3KOTA 3HO7A 1EU8A 1POY1 2F6GA 2I0BA 2Z22A 3PPOA 5I58B 4JDFA 1FCKA 5H8NA 4DXBA 3ZS6A 4U22A 4R75A 1URDA 5HPQA 3MVZA 1MH4A 3LC8A 3KGCA 4ZECA 1B0HA 2DWHA 4PP0A 1N04A 2PT2A 1MQHA 3MQ9A 3FVOA 2LAOA 2XXYA 3FXRA 3OO9A 3T22A 1H45A 3KOSA 2F7CA 4GIZA 5I2NB 1AIVA 4MF3A 1EH3A 2NOOA 2PMSA 2XXHA 3C32A 4QSDA 1NNKA 2F34A 5K2XA 4IGTA 4YZZA 5TPAB 1RYXA 3S9EA 5I2KB 1ZIUA 1B3FA 1JVYA 3EF7A 3K1NA 3CSBA 1YTVA 3KSXA 3FIRA 4MBPA 5ISUA 1YPNA 2IEEA 5L8DA 4F31B 5CBSA 4KYDA 2H5YA 4PFTA 1Y9UA 3O66A 3OMBA 4F2QA 3D4GA 5CBRA 3KZGA 2QJEA 1Y4CA 3UP9A 5KCJB 1SYIA 3KFMA 3S9LC 4X48A 1O7TA 4H6DA 4Q8RA 2VP1A 3RPWA 3Q26A 4RY1A 4KFQA 1B3HA 2ABHA 1IZ1A 5IAIA 4U4XA 2DOJA 1TT1A 4QRZA 1NH8A 4FORA 1NKXA 1NNTA 2OBGA 4R9FA 2H9BA 2UYEA 3R6UA 2VD2A 5HBCA 5BWJA 3CVGA 4ECFA 4OMBA 1MDQA 3FJGA 1Y3QA 3G3GA 2R71A 1ATGA 5TU0A 4YB7A 4O3CA 5AA4B 2XD3A 3LUYA 2GHAA 1LBCA 2XXWA 1QUKA 1B51A 3MWBA 3RY3A 2Q8JA 3T9HB 3MUQA 3A3CA 1J1NA 4QFOA 5H8QB 4E0WA 2RINA 4R73A 2AL4A 4FIMA 2V93A 1B05A 3IB1A 3PU5A 1MQIA 2RC9A 2XX9A 4JWOA 5DEXB 2DS9A 3KN7A 3FV2A 4OFLA 1II5A 5CMMA 4DXCA 2NXOA 4ZS9A 4KR5A 3Q28A 3U94A 1VFEA 4ESXA 4IO5A 4TOZA 3TTLA 3A3UA 3IOWA 4RXLA 3OXNA 3PMVA 2UVIA 1GTKA 3MP6A 1OIBA 2I49A 4Q0CA 3Q27A 4OVJA 3R7XA 4KCDA 2VGQA 1JEUA 1OLAA 4R6YA 1QJMA 3TQLA 4Q5TA 1URSA 4YKJA 3KSJA 4NF6A 2DVZA 3E13X 4MLQA 1AL3A 3C33A 4EQBA 2X7QA 3HSTA 1JEVA 2XXXA 1DOTA 2ONSA 1Y1ZA 3VLUA 2UVHA 4HTGA 5BUUA 2O7IA 1FQBA 2F5XA 1USYH 3N5LA 1B4HA 5IKBA 1SD3A 5K2YA 3ZKLA 1S9TA 4OERA 4KQPA 1MQDA 3JYRA 4DXUA 2UYFA 4NF5A 2CMOA 1ZU0A 2QMXA 3G3FA 4I9DA 3TKDA 1Y3NA 3LSLA 4F1UA 3V5AA 1SDXA 4F39A 5ITOA 1Z7ME 2XXVA 3I6VA 2QRYA 4IO3A 1YCJA 4H8IA 2QS4A 3K6XA 3T9VA 1ELJA 1LFIA 3ZSFA 3IX1A 2F7BA 4FAJA 5EHMA 5I56B 4HS7A 3SETA 4GL8A 2O84X 2Y7RA 1SW4A 1FQFA 4G4PA 2YPNA 1O63A 3K4UA 4F2OA 1ZJLA 1LAFE 4LZ8A 4U2RA 1FTJA 3OEMA 3CIJA 4G68A 4OETA 3E9XA 4ISUA 5AA2D 1LLSA 2KLFA 3EN3A 1N3WA 4GXAA 3S2VA 4C0RA 3CRBA 4YICA 3TELA 4GOTA 2OZZA 3UORA 2ONKE 5CMBA 3OSRA 3BBRA 3H6VA 1NNPA 2Q2AA 2DWJA 2PBWA 3G3IA 4XKQA 3SESA 5I2NA 1SW1A 4KYEA 3TODA 2D5WA 3DP8A 2ZNUA 1CE2A 4NTLA 2I3VA 1JNFA 2DE3A 5I2KA 1JVXA 4NF4B 1XC1A 5TP9B 4EXLA 5CM6A 5L9SA 5FHMA 3EHUA 3N26A 1MY0A 1LBBA 4GVOA 4YKKA 4GRKA 5CMCA 4PETA 3TMGA 5H8HB 3GBBA 3QAXA 5KCJA 3I5OA 1B5JA 4PE5B 1DSNA 3KBRA 1UQWA 3CSGA 2I48A 2DWIA 3KN3A 5ELVA 3CG1A 1SI1A 4BDRA 1T0KA 3IOVA 3B6TA 2QS2A 2Q88A 2O1MA 3RT6B 2XHDA 4KD5A 1IXGA 1QW0A 3H06B 4OESA 1OVTA 1MY1A 1B9JA 2THIA 5AA4A 1L5TA 1H3DA 4P0IA 2V25A 2REJA 4OENA 1LAGE 5H8QA 3RTFB 4EQ7A 2Z8EA 4G8NA 2ALUA 4ZEIA 1DPPA 3JV9A 3FVGA 1JW5A 2QS1A 2HAVA 4ZDMA 2NWJA 1F9BA 2O6AA 4GQOA 1B1XA 4ZEKA 1UTBB 3PMWA 2HFBA 3T9UA 3TTKA 5LOMA 3F11A 5A5XB 4TLLB 3DLNA 2B3FA 3K02A 3O2AA 1UIVA 3VFJA 3OOAA 2HZLA 3MPLA 3S9NC 2D21A 3LSXA 4DCXA 2I6EA 2F35A 4H5GA 3G7WA 2QSXA 4YKPA 3H3GA 4UA8A 3MP8A 1A8FA 2HXWA 2HAUA 3OO7A 3O6GA 1XVXA 4R6KA 1QKBA 3RTWB 3I3VA 2Y7KA 2V3QA 4BDQA 3E4RA 5CI5A 3KJTA 2DE2A 4F1VA 4LZ5A 4N07A 4G2ZA 3FUZA 3HV1A 1RYOA 2QPQA 4XKPA 2HCAA 3H7MA 4ZE9A 5I59B 1MH3A 3PUZE 1A40A 5ICQA 2QL3A 3K01A 3B6WA 2A5TA 4UACA 1VE4A 1I6AA 2AYSA 4BDNA 3KN8A 1B5IA 3LBSA 2ZYOA 4JWXA 3T96B 3O9PA 3O97A 2RC7A 4F1YA 4O3BA 1D9YA 2VD3A 5I57A 3TYHA 4R2BA 1IITA 4ELOA 3B7DA 1MRPA 1SI0A 1DMBA 1N7WA 4GL0A 3RT8A 1N3XA 3IB0A 3TTMA 3VLWA 4QSCA 1R1NA 4GD5A 1A55A 2XXRA 1LCTA 4ZE8A 3IAZA 2B3BA 1SW5A 3O28A 2GFEA 4DLDA 1IUDA 4MFIA 3K2DA 1MQGA 3FASA 1LAHE 1P1QA 4IY5A 1LFHA 5I56A 3S4UA 3MZ1A 4EF1A 1P1NA 1PB9A 3OO6A 3K1PA 4NF8B 1MM7A 2RKMA 1RKMA 4ESWA 1I6QA 5DVFA 1ZMGA 4OFJA 3H03A 4NE4A 3VXBA 3VVFA 1PB8A 1HSEA 5HM4B 3LSWA 5DYHA 4AB6A 3IOTA 3K1MA 2DXRA 3UN6A 5EHSA 1B4ZA 1PBQA 1XS5A 2GRVA 4ONYA 5H8FA 1FTKA 3U93A 3A09A 3OEKA 4LA9A 4G8HA 2OCUA 1JETA 3H6UA 4POXA 1A99A 4L17A 4OZ9A 5F7VA 4FECA 5H8NB 4YB5A 2XXPA 1DTZA 1FQCA 4NF4A 4F22A 4FEBA 5AE4A 4H1XA 5TP9A 3WAEA 3PV0E 1IIWA 2NVUB 5KDTA 1GVCA 1XVYA 2I0CA 3B6QA 3K6WA 3FV1A 2HZKA 1I6BA 2F7AA 5F1QA 3SEXA 5DT6A 3EPEA 2XXQA 3SERA 5H8HA 3S9MC 4IO6A 4FE8A 4YKIA 3MZBA 4ELRA 2BJJX 5I84A 1B1HA 3DM0A 4R74A 1OQHA 4DCYA 1IXHA 2XXUA 3PUYE 1POTA 1FTMA 4TQUQ 3EHTA 2G29A 3IR1A 1NMUA 1H43A 4M4GA 3QSLA 4KCCA 1CB6A 3IB2A 3IOUA 1UIUA 2XX8A 3QYTA 4I62A 3TQWA 3T9XB 1BIYA 1QUIA 5CMKA 1M5BA 1UTHA 4G8MA 3IO4A 1GV8A 2O68A 2O7UA 4H67A 3FJ7A 4IGRA 1GGGA 3TTRA 2Q9TA 1PDAA 4Q30B 4HCYA 4XXUA 3MBPA 5L9OA 4U4SA 1D9VA 4OXVA 2I58A 5B70A 3MZ9A 3HHFA 1UTBA 4X1DA 1WODA 2ZYMA 3EHSA 3OSQA 3PD8A 4BDMA 1XHYA 1B3EA 4F19A 1BLFA 4BDOA 1QULA 3FXQA 4TLMB 5I58A 3RUMA 3ILUB 4HCWA 3TCFA 2Y84A 5FTIA 1B3GA 1TFAA 2PYYA 3SDFA 4LONB 3N6UA 3L6HA 3PPQA 4OTEA 4ZEFA 4JBZA 4BDLA 2DXYA 3CFZA 4RA1A 1Z7NE 5ITPA 4FATA 3Q29A 1B0LA 4DIGA 3U72A 3K6VA 3THIA 3IORA 3U8QA 4EQ9A 5CC2A 3TZAA 3C36A 3RLFE 1B46A 3FVKA 4RK2A 5TPAA 5FHNA 1TXFA 1AMFA 5JTYB 1M5EA 4YB6A 3W9VA 3N94A 3CG3A 1SW2A 3GLBA 1URGA 2DYXA 3TDJA 3LSFB 5J1DA 4FJPA 3U92A 4IB2A 1DPEA 3O6IA 2ZXTA 2Z8FA 3ODBA 3OO8A 3T66A 4NF6B 3BKIB 4EF2A 4QF9A 1MDP1 4LQ5A 2E1SA 3OENA 2F97A 1P1OA 4C1TA 2FYIA 1OVBA 3PPRA 3H6TA 1PC3A 3FXUA 4ELQA 1HSLA 1MQJA 1B6HA 3AXFA 4MLVA 1IEJA 4U1OA 2O69A 3V89B 3IK6B 2DWAA 1FQDA 3MC2A 4LZ7A 4FEDA 3MVXA 2VHAA 2YJPA 3RGYA 2ZNSA 1US5A 3PUWE 2RF1A 1B7HA 4NF8A 4OYVA 5AA1A 5H8SA 4P0GA 4X9TA 1EZPA 1MXVA 2FA7A 5DVJA 2DSFA 1Y20A 1N76A 2PX1A 2O1LA 2H98A 2D3IA 4DDDA 4OEVA 1Q1KA 4F3BA 5DEXA 1Q35A 1LGBC 3TCHA 1MY4A 3HPIA 3UIFA 3VVDA 3QXMA 1MXWA 3QUJA 5AA2B 2AL5A 4Z7EA 2DE4A 1FTLA 1SBPA 1JQFA 2CZLA 3KJ7A 3SEWA 2P1SA 2V3UA 3MVYA 2PVUA 2OWSA 4NEDA 2E0SA 2DQVA 4WKMA 4OHNA 4KYSA 3USDA 4K3FA 3PPPA 1R6ZA 1FTOA 4RK9A 1Y1MA 2Z23A 2F36A 4F3GA 2H99A 3VV5A 1I69A 1D4NA 1N0TA 4X1BA 2OWTA 5M2VA 2REGA 4LQ2A 4NWCA 5KZTA 3FZVA 3UA8A 4NMYA 2A5SA 2QS3A 1ZBMA 3MPKA 4GF8A 3T93B 2UVGA 4RPOA 2G93A 1Y3PA 3CI8A 1BKAA 4GXSB 3ECRA 2GH9A 4OWDA 4I1DA 2VOZA 2ZYKA 2ONRA 1A54A 4EXKA 3SEVA 4KPTA 4RPNA 1B40A 4THIA 1H76A 3KG2A 3VDFA 3HN0A 1B7ZA 2V84A 1NH7A 4LVQA 2IA4A 4KHZE 3C35A 2HEUA 3PUXE 1NFTA 4GWOA 1PBPA 4ZZAA 4RYAA 3RNNA 1B3LA 3FATA 1WVJA 4U21A 3SKPA 3GZGA 2RC8A 3H6WA 1HSJA 3E3KA 1MPCA 1MXZA 1IXIA 4F18A 4XTCQ 1O64A 3M8UA 1P99A 4QFKA 4JSOA 2F6PA 4I8CA 3DP4A 2OLBA 3RN8A 4QFLA 4ELPA 1N7XA 2ZNTA 3M3FA 3QIMA 3GXAA 4R2FA 1MG1A 1MXXA 4PQJA 1XT8A 4QFPA 1OQGA 3IL1B 4QHQA 2Q89A 1NL5A 1YAEA 3HHGA 1LSTA 3DP6A 4ZEDA 3MW0A 4EUOA 1FQAA 4WEDA 3MJNA 2DP8A 4LP2B 3FJMA 3V83A 4O3AA 1US4A 3UK4A 4E0XA 1MXYA 2H25A 2I3WA 1B2HA 3OD7A 4GFRA 4POWA 3Q25A 4YAHX 3PMXA 2R9JA 5JTYA 3PD9A 3C31A 1USYE 3VLVA 5AA3A 1A7LA 3VE1B 1Y4TA 4OEUA 3BFUA 1SYHA 3UGWA 2XXTA 1MY2A 4WEPA 1P1WA 1PB7A 4R6HA 1LFGA 3V8XB 1FQEA 2QMWA 2M8CA 4NWDA 5L9MA 4IO4A 2DVCA 1BP5A 3D4CA 4N6PA 1QKAA 1ZLQA 2OK2A 1VFDA 5B7DA 4GLIA 2AIXA 1PEBA 3TUSA 2WKYA 4KI0E 3H4ZA 2I4CA 3EQ1A 3W9WA 3DELB 4R9GA 3P7IA 3C4MA 2A5TB 4PFWA 4PFUA 3SEUA 4IY6A 4PFYA 3CR9A 4XKNA 3QK6A 1OLCA 4XKRA 4LATA 2V3TA 5I57B 3C34A 2RCBA 4ZZEA 3O6HA 4DE8A 1OMPA 2F78A 3N6TA 3ILTB 4C1UA 4IO2A 1MXUA 3TTNA 1MY3A 1S50A 1TFDA 4F3PA 3M3LA 4ND9A 3K6UA 2Z8DA 3C9HA 2W7YA 2O51A 4EDPA 4BLAA 5DTBA 1N84A 4DZ1A 2RCAA 1S7YA 1KWHA 1ZKBA 1BTJA 3GBAA 1IQ7A 3U1OA 3SEYA 3FVNA 1QUJA 2Y7WA 3ONMA 1EZ9A 4JB7A 3K00A 5AA2A 4IO7A 5A5XA 4OFOA 2Q2CA 2GHBA 2YLNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ESNA 4H65A 2CZHA 1ANFA 1H44A 5ET8A 2Y7IA 2BJIA 2Y7PA 3PUVE 1JW4A 1EZOA 1TWYA 1DTGA 4N13A 1D3KA 4YMAA 4F29A 4RJZA 3KEIA 2PT1A 2OWZA 4JWYA 5CRYA 5ICTA 2ANJA 4U1ZA 1B5HA 4Z0IA 3M3KA 2NUVA 1B7UA 1IXCA 4G77A 1NV7A 1R9QA 3MVWA 4XIGQ 3CFXA 3PPNA 3W15C 1NNFA 3HCQA 1B58A 1XOCA 1VSOA 1AH5A 5H8FB 2FNCA 2HQ0A 4QSEA 1B52A 1YZ0A 1IMAA 3TEPA 2X7PA 4NF0A 3LR1A 2H4IA 3RYDA 1MPDA 2XD2A 4OQOA 4H5FA 5I59A 1SPIA 4RNSA 3JZJA 2XXIA 4YU0A 3QUFA 1FPIA 3K0VA 1FW0A 4H0WA 3CFLA 4PDHA 5KDTB 1AOVA 1B32A 3IJXB 4U23A 2FIXA 5EQAA 3PGFA 4PAFA 4M1VA 4F3SA 5FHOA 4YMBA 3IO6A 4AQ4A 3RQTA 1LEVA 2F8DA 3FD3A 1MS7A 3R26A 4LUBA 3L6GA 1WDNA 5FTHA 3G3HA 1MPBA 4MH5A 2KQZA 4WXJA 2X26A 3BFTA 1JW1A 4NF5B 4G68C 1LB9A 2UXAA 4MAGA 1LAXA 1LB8A 2CEXA 3G3JA 4H8JA 3VVEA 3NOHA 1FBHA 3MP1A 3OELA 4ZEBA 4JSDA 4R72A 5DW8A 1FPBA 1M5CA 1MM6A 2R6GE 3CHGA 3TFLA 4P11A 2I4BA 4QFNA 5JK4A 3WAFA 1VR5A 1ZTYA 3IJOB 2XWVA 1UTHB 5I3SA 4N15A 4JXIA 2OJTA 3VXCA 3TAJA 2ZYNA 1EYKA 2XX7A 4HW8A 5JEIA 4AB5A 2P2AA 4O7IA 2UVJA 2ZMBA 1QVSA 3O29A 1SVXB 1M5DA 1LCFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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