3KN8A

Crystal structure of haemophilus influenzae y196a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYAWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
total genus 114
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn8A02
2XHDA 3PPRA 2X26A 1B40A 4OEVA 4KQPA 4AB6A 3VLUA 2CZLA 3MWBA 4RY1A 1IEJA 3RT8A 3S9LC 4OTEA 1M5BA 5ELVA 5AA3A 1RYXA 4YZZA 4JSOA 1MQDA 2DXYA 3KN3A 1ZBMA 2W7YA 2AIXA 1MY3A 5DVJA 2RKMA 2GH9A 3SETA 2RF1A 4LVQA 4OESA 5AA2A 3RGYA 1T0KA 2PVUA 4Q30B 3B6QA 3PD8A 1B7ZA 3LUYA 4QHQA 5I56B 4RPOA 3IL1B 1J1NA 3SEWA 4GL0A 2HEUA 4GRKA 1WDNA 4HCYA 2DE4A 2F35A 3H03A 3IX1A 4DE8A 2F78A 4Q8RA 2NXOA 4R6HA 4F1UA 3MPLA 4ESWA 2XXUA 3O6IA 3C9HA 1QW0A 1ZJLA 1FQEA 4NMYA 3K2DA 3RTWB 1M5CA 3EHSA 3ZS6A 2QJEA 1Y3PA 4MLQA 3SEXA 2PT1A 4OVJA 4I9DA 5FTIA 3OXNA 2ALUA 1MM6A 3TELA 1SI1A 3TAJA 1F9BA 2F34A 4R73A 4THIA 3UN6A 5TP9B 4ND9A 3N6UA 4IO4A 4IO2A 4OETA 3VFJA 1SW1A 1MXWA 2X7QA 3IK6B 4XKRA 4IY6A 2OWTA 3RT6B 3MVWA 2UXAA 3OO9A 1B6HA 1LBCA 2Z8FA 5H8FB 1I6AA 3SERA 5A5XA 3UP9A 3L6HA 2XXYA 1B3HA 1Y20A 3N5LA 1B3FA 2AL5A 4U1OA 1XVXA 1RKMA 2A5SA 5CMBA 4U4SA 4NF6B 3MZBA 1R1NA 5KCJA 2GFEA 3KOSA 1MM7A 2VD2A 2O69A 3TFLA 1JW5A 4OERA 1N04A 5CMMA 4F31B 4YKJA 1P1QA 3E4RA 3PGFA 4FATA 4KD5A 1MXYA 1FQAA 2QS4A 4XKPA 3HHFA 2ZYMA 3Q29A 2F36A 2Z22A 1FW0A 4DIGA 3VLVA 2PX1A 1N3XA 1SW5A 4LZ8A 1ZTYA 1M5DA 3GLBA 3G3JA 1P1NA 1MS7A 5ITPA 1HSLA 1LAGE 4NTLA 5I57B 2DYXA 3CG1A 1CB6A 2AL4A 4ESXA 1B9JA 1A55A 4EXKA 4X48A 3VVDA 2HZLA 1MQGA 2PBWA 4EQ7A 3H7MA 3MVZA 3TPAA 3TTNA 2OK2A 1PB8A 3PU5A 3TCGA 2QMXA 3UGWA 3QSLA 3UORA 2DWHA 4R9GA 2XD3A 1MG1A 3DM0A 3SDFA 3MAMA 3PPQA 3MP1A 5DVIA 3EN3A 3MBPA 2ONKE 1B5HA 3CFLA 4OHNA 4AB5A 2XXHA 5H8SA 3M3LA 3SEYA 1MY0A 2NOOA 4UACA 1IXCA 1WVJA 4FAJA 5L9MA 1TFAA 4MBPA 4LATA 4EDPA 1LB8A 2KLFA 1PC3A 1URDA 3IB0A 1LSTA 2DS9A 4NEDA 5BWJA 2QPQA 1P1WA 1B3EA 3G3FA 2R6GE 4RPNA 3FASA 5I57A 4LONB 3F11A 3H6VA 2ZYKA 4LZ7A 5JK4A 4YB7A 5FHMA 2G93A 2VD3A 2XXQA 3PMWA 3OEKA 3KZGA 1SQYA 4GXSB 5H8HA 1KWHA 2NUVA 3TYHA 2GHBA 2YLNA 2GHAA 3U72A 3KBRA 5H8QB 3U8QA 1MQHA 4R6YA 4HS7A 1UTHA 1Q1KA 3K01A 4RYAA 2DVZA 3FXQA 1XT8A 3EPEA 1NFTA 2H4IA 4ZZAA 3W9VA 1JW1A 1CE2A 4PFWA 1LB9A 3T9HB 1MQIA 2FYIA 2DWAA 4I8CA 3E9XA 4YB6A 3O66A 4F29A 1GVCA 4NWCA 4TOZA 3PPNA 3IO4A 2GRVA 3T9UA 3FV2A 4RK2A 3L6GA 3LSFB 4HCWA 5AE4A 3BFTA 1AIVA 1H45A 3C31A 3RUMA 3PPOA 1POTA 3S9EA 3RPWA 1JQFA 3TKDA 4ZEDA 5AA4B 5AA1A 5KZTA 2P1SA 1QVSA 4KYSA 3S4UA 3VXCA 1MH3A 2H99A 4GD5A 1TFDA 3WAEA 1DSNA 2O1LA 3G3HA 1VFEA 4GVOA 1OIBA 1B1HA 2HAUA 1SI0A 1S50A 1N84A 1B5JA 4JWXA 3V83A 1SW2A 5CMKA 1II5A 3LSLA 3PV0E 2PYYA 4JBZA 1JEUA 4ZEKA 4NF4A 5CI5A 2HZKA 2DP8A 2Q89A 3IOUA 4NE4A 5KDTB 3HV1A 1FTMA 3FIRA 3MQ9A 5LOMA 3MZ1A 5TPAB 1QKBA 2VHAA 3H6UA 1B5IA 1QULA 3G7WA 2DSFA 3TTLA 1ANFA 4IO3A 2ZNTA 2HXWA 3ECRA 5I2NB 2UYFA 1SDXA 4PFTA 2F97A 1MDP1 5H8NA 2THIA 4XTCQ 2QS2A 4KHZE 4U2RA 3RN8A 4F19A 1SW4A 4F1VA 3FVGA 3T93B 3SKPA 5AA4A 1JETA 3FZVA 3KOTA 3Q27A 5J1DA 4PQJA 1EZPA 2UVGA 4QFPA 2DXRA 4KI0E 4WEDA 3FXUA 5I58B 1B0HA 3JV9A 1TWYA 1N7WA 4U23A 1IQ7A 1MXZA 3U93A 1IZ1A 3MVXA 2UVIA 3S9NC 4C1TA 1ZU0A 2Y7RA 4P0IA 2ZXTA 5IAIA 4IY5A 3H06B 5DEXB 3D4CA 1B0LA 1JEVA 4OQOA 1UIUA 3C33A 1FQCA 2O7UA 2CMOA 4HTGA 3QYTA 3CI8A 3MC2A 1D9VA 4OFJA 5TPAA 1B1XA 3K1NA 5K2XA 4MF3A 3HSTA 4YMAA 4GIZA 2DWIA 4XIGQ 2DWJA 3DP4A 3TTMA 3K02A 2QS1A 3OSRA 4NF8B 1OVBA 2I48A 1NH8A 1GR2A 3RTFB 4G68B 4QFOA 2P2AA 4F22A 4OXVA 4EUOA 4H1XA 4KCCA 5CMCA 3BBRA 4G2ZA 1B52A 2F6PA 5L9SA 2I4BA 2OCUA 4OFOA 1Y3QA 3MJNA 3GXAA 5ICTA 1SD3A 4ZZEA 5I84A 5I56A 4ZEBA 5DVFA 1P1OA 1IIWA 3QUFA 1SVXB 2A5TB 4F2OA 4XXUA 3PUYE 3BKIB 3TDJA 2B3FA 4ONYA 2F7BA 1VR5A 1FTLA 2REJA 4G77A 3RLFE 2XX7A 3U92A 4PETA 2D3IA 3MUQA 3TZAA 4OENA 4O3BA 4GQOA 1MY1A 1ZLQA 2XX8A 4MFIA 3KJ7A 3FVKA 3FUZA 3USDA 1EH3A 4DDDA 2LAOA 2ZNSA 1OLAA 4KCDA 5CC2A 1GGGA 2D5WA 4DXUA 1D9YA 4BDRA 1DTZA 1HSEA 2V3UA 1H43A 4XKNA 2Y7KA 1MY2A 3IJOB 3IB1A 2XD2A 5DTBA 5TP9A 1Y1MA 4JB7A 4QSEA 4YU0A 1NMUA 3IB2A 1I6QA 3KSXA 3VVEA 3C36A 3OO8A 1QUJA 2E1SA 5FHNA 3E3KA 5L8DA 3W15C 1D3KA 4EQ9A 4O3AA 3KG2A 1H76A 1MXXA 3C32A 3DP6A 4NF5B 3PUVE 5EHMA 2YJPA 1B7UA 1BIYA 5CBSA 4PE5B 3T9VA 3TUSA 1B46A 4H0WA 5EYFA 2ONSA 4IO6A 1ZIUA 2A5TA 2IA4A 5H8FA 4WXJA 3H6WA 4GL8A 4H5FA 4JWYA 4YICA 2DQVA 4EF1A 4IO7A 4Q0CA 2HAVA 2FNCA 3EQ1A 1MXUA 3DELB 4P11A 5TU0A 4C1UA 3OENA 1LAXA 4ZE8A 3PUZE 4NF6A 4QSCA 3PUXE 3G3KA 3CFZA 1NL5A 3K6UA 5ICQA 4H8JA 3M3FA 1VFDA 3K0VA 4OMBA 4YKPA 1OLCA 1TXFA 1OQHA 3IAZA 5JEIA 2VGQA 1OQGA 2NWJA 1LAFE 2DE2A 3FATA 1H3DA 2Z8EA 2ZMBA 3H6TA 3ZSFA 2O84X 1N76A 5HPQA 4LQ2A 2H98A 3TQLA 1LFIA 4R6KA 4QSDA 1XC1A 1I6BA 2QL3A 3C34A 1L5TA 2I58A 4GWOA 3SEVA 5BUUA 5JTYB 3RNNA 4QF9A 2V93A 4GOTA 3O28A 2H5YA 3GZGA 1PB7A 4EXLA 3HN0A 1B7HA 1B2HA 1QUKA 1SYIA 4M1VA 4F3BA 2XXPA 1URSA 2RCAA 4G4PA 3O6HA 1FTJA 1FQFA 2XXVA 1QUIA 4KR5A 3FVNA 3QK6A 2Q8JA 4U22A 2F6GA 3LC8A 3VXBA 3HHGA 2O68A 3HO7A 3I6VA 1R6ZA 4PFUA 4ELOA 2Q2CA 1Q35A 1DTGA 1SYHA 3MP8A 2Q88A 3T22A 3K00A 2OWSA 4F39A 4TLMB 2RINA 4IGTA 3T96B 1ATGA 4AQ4A 1TT1A 2AYSA 1UIVA 1FTOA 3EHTA 3CRBA 1A8FA 3OEMA 3C4MA 4F1YA 2DOJA 5HBCA 3GBAA 1XOCA 1UQWA 4FIMA 2NVUB 3MW0A 3E13X 3FGSA 3UK4A 4FORA 2P0SA 5EHSA 3M8UA 5FTHA 4EF2A 4NWDA 1OVTA 2R71A 3QUJA 4OYVA 1NNPA 4ZECA 1IXIA 4XKQA 5JTYA 3PMVA 1LCFA 4R74A 3EHUA 3S2VA 1USYH 3Q25A 4RA1A 1VE4A 1P99A 1M5EA 5AA2B 5I2KB 3VE1B 2ONRA 1BTJA 3BFUA 3V89B 3TCHA 2D21A 4YKKA 4ELQA 1B51A 1BKAA 1B58A 3IOTA 3I3VA 3PMXA 3AXFA 3OSQA 1AL3A 2HCAA 2V25A 5B70A 1LLSA 3DP8A 1Y1ZA 4QRZA 3KEIA 4YAHX 5H8QA 3ONMA 4ISUA 2F7CA 1PB9A 1N7XA 1M5FA 4G8NA 4DXCA 4F2QA 4ELPA 1DMBA 4RK9A 3VLWA 1B32A 2H9BA 3Q26A 4BDNA 4ZE9A 4Z7EA 3T9XB 2VOZA 1MDQA 3PD9A 4Q5TA 1NH7A 2I3VA 4C0RA 2O1MA 4H8IA 4L17A 1NNFA 1Y3NA 3N94A 4TQUQ 4PP0A 3U94A 4OEUA 3A3CA 1Z7ME 1UTBB 4Z0IA 4GFRA 3CFXA 3A3UA 1LFHA 1FQDA 1MRPA 3T66A 3FJGA 2ESNA 4ZEFA 1Y4TA 4KYEA 3FVOA 4ZDMA 3OO7A 2XXWA 3O97A 3VDFA 1NNKA 4H65A 4OWDA 5I2KA 2RCBA 1A99A 1IUDA 1O64A 1PBPA 3SESA 3K4UA 4IB2A 3UA8A 1POY1 3G3IA 3KN7A 4E0WA 1JNFA 1OMPA 1I69A 5A5XB 4GXAA 4FJPA 2Y84A 1IITA 5KDTA 1ZMGA 2I4CA 4KYDA 1S9TA 4F18A 4TLLB 4OZ9A 1P1UA 1RYOA 4ZEIA 4QFNA 1MXVA 4R75A 4JWOA 5KCJB 1PBQA 1B3LA 2O6AA 3OOAA 5F7VA 1USYE 3DLNA 5AA2D 4MLVA 4IO5A 3EF7A 4U21A 4WKMA 2RC8A 5I2NA 1A8EA 1NNTA 1UTBA 1YAEA 1ELJA 3V5AA 2Y7WA 2E0SA 4H67A 2H25A 2REGA 4FECA 3W9WA 1XVYA 4GF8A 2F7AA 1GTKA 1PDAA 3RY3A 5I59B 3H3GA 1YTVA 2I0CA 3O9PA 2Q9TA 3FD3A 4JSDA 3CR9A 1H44A 1B05A 1DOTA 2M8CA 1MPCA 3LSWA 3IOVA 5I58A 4DCXA 4YB5A 4RJZA 3ODBA 3TODA 3R26A 2Y7PA 2VP1A 2ZYOA 3B6TA 1N3WA 4UA8A 4G8MA 5F1QA 3JYRA 2RC9A 5ISUA 3S9MC 5DEXA 3K6VA 4EQBA 3Q28A 2I6EA 3WAFA 1YPNA 1FTKA 3N6TA 3D4GA 2B3BA 3VV5A 2Z23A 2OBGA 2BJJX 2F8DA 4YKIA 3QIMA 3RQTA 4DLDA 3KJTA 4LUBA 1Y4CA 2XXXA 3ILUB 4KPTA 2YPNA 3B7DA 3JZJA 2I0BA 2QMWA 2OLBA 1R9QA 4I62A 2ABHA 3ZKKA 3MPKA 3TMGA 4ZS9A 4NF8A 1LBBA 4POWA 4X9TA 4IGRA 1B3GA 3IO6A 4E0XA 2I3WA 3MZ9A 1MH4A 1EZOA 3K6XA 5IKBA 4KFQA 4G68A 1XHYA 2X7PA 4G68C 1A7LA 2PT2A 3THIA 3G3GA 3V8XB 3R6UA 1R9LA 1EZ9A 4PFYA 5I59A 4FE8A 2IEEA 4LP2B 1QJMA 1GV8A 2ANJA 3FV1A 1A40A 3GBBA 4MH5A 3KGCA 5DYHA 1FQBA 5CM6A 3A09A 2V84A 4R72A 4N6PA 3CSGA 4R2BA 3OMBA 4JDFA 5FHOA 1JVXA 3MVYA 3OELA 4I1DA 1Z7NE 4H5GA 2V3TA 1MQJA 1MPBA 3O29A 3TQWA 1ZKBA 2HFBA 1IXGA 3FJMA 3MP6A 3TCFA 1B4HA 2UYEA 3CSBA 4POXA 1VSOA 2XXRA 2ZNUA 4H6DA 1WODA 4FEBA 3H4ZA 3ZKLA 4RNSA 5H8HB 4ELRA 1B4ZA 1LGBC 4QFLA 2V3QA 2XXTA 1MY4A 1JVYA 1HSJA 2I49A 1DPEA 2Z8DA 2QSXA 3HPIA 1UTHB 3QAXA 4YMBA 3ILTB 5CBRA 2XXIA 1LCTA 4M4GA 3FJ7A 3CG3A 1EU8A 2QS3A 2HQ0A 4F3PA 2XX9A 4OFLA 2DVCA 2QRYA 4BDOA 4JXIA 1JW4A 2G29A 1BLFA 4HW8A 4ECFA 4O3CA 4R2FA 4NF5A 2DE3A 3R7XA 1O63A 1PEBA 1US4A 3IORA 2OJTA 3K1PA 5K2YA 5DT6A 3KFMA 3PPPA 1MPDA 2F5XA 4BDQA 1SBPA 4GLIA 2PMSA 5HM4B 3B6WA 1AH5A 3LBSA 2UVHA 4BLAA 4N07A 1A54A 4BDLA 4K3FA 2FA7A 4X1DA 2RC7A 4P0GA 1LFGA 3CVGA 3FXRA 1AOVA 5B7DA 3O6GA 3SEUA 3PUWE 2R9JA 3C35A 2OZZA 1NKXA 3OD7A 4FEDA 3I5OA 4R9FA 1O7TA 2ZYNA 5CRYA 5M2VA 1AMFA 3N26A 1URGA 3LR1A 4NF4B 4BDMA 4F3SA 4QFKA 2B65A 3QXMA 2Q2AA 4G8HA 3VVFA 3O2AA 3HCQA 4LZ5A 4DCYA 1US5A 1YCJA 5L9OA 1QKAA 4LQ5A 3IR1A 3IJXB 3CIJA 3TTKA 3U1OA 5ITOA 1S7YA 1LAHE 5H8NB 3M3KA 4X1BA 4DXBA 3KN8A 4WEPA 2O7IA 2UVJA 3LSXA 1Y9UA 2O51A 3K6WA 3UIFA 1DPPA 1XS5A 3OO6A 1BP5A 1N0TA 4U1ZA 1IXHA 4N13A 1FCKA 2Y7IA 4RXLA 3TTRA 3IOWA 3K1MA 1D4NA 2WKYA 4F3GA 3TEPA 3P7IA 3KSJA 4DZ1A 4LA9A 4U4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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