3KN8A

Crystal structure of haemophilus influenzae y196a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYAWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 114
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn8A02
2GHAA 3RLFE 1LBCA 4ELPA 4OFOA 4F3GA 3O6GA 3IO6A 3FJGA 3PMVA 1EZOA 5FHOA 4EF2A 4H6DA 4LQ5A 2H99A 3FVKA 3FV1A 5TPAB 2DVZA 2KLFA 2O7IA 3TELA 4O3CA 4PQJA 4KHZE 3ILTB 1MXVA 5H8QB 1P1UA 4NF6B 3GLBA 1EU8A 3U94A 5CBSA 1ZIUA 4LQ2A 1PB9A 2F7AA 3N6TA 4YZZA 2GFEA 3PMWA 4OYVA 5ICTA 3H7MA 3MZBA 3V8XB 2ZYMA 4LVQA 4KFQA 2OBGA 4RPNA 4U1OA 2F78A 3K00A 4RNSA 4JWOA 2AL5A 3RTFB 1MDQA 4NF4A 1A7LA 4XKNA 4RPOA 3RT8A 1PEBA 3C34A 1JEVA 3PD9A 5H8FB 4G68A 4N6PA 1P1NA 1D9VA 3SERA 1B1HA 1MQJA 2DE2A 4DZ1A 1R1NA 3OELA 4XKQA 3O97A 2HZLA 1NH7A 4YKPA 2RCAA 2GH9A 4JB7A 2YJPA 3D4CA 3G3FA 3T93B 4PE5B 1Q1KA 5H8HB 5FHNA 3VDFA 2O69A 3IO4A 3PPRA 3MWBA 4I62A 4U4XA 4OHNA 3LSLA 4ZE8A 2Q8JA 5TPAA 3CFXA 3ONMA 1SQYA 2O1MA 4G77A 4ZEFA 3LSWA 3VVFA 3V83A 1LB8A 1F9BA 5LOMA 5H8QA 1LFIA 4NF6A 4BLAA 2HAUA 2PBWA 1B4ZA 1M5CA 4LA9A 1QKBA 5HPQA 3S9LC 5I59A 2HXWA 3TTKA 1H43A 2XXUA 3RUMA 4JDFA 5BWJA 4F18A 2PT2A 4ISUA 4MBPA 3OOAA 2O68A 3EN3A 2CZLA 1MDP1 1MY1A 1HSJA 2VP1A 4R73A 5H8FA 1B5HA 3M8UA 4G4PA 2QS4A 4IY5A 3MVZA 3KN7A 1DMBA 3N6UA 2RC8A 4EXLA 1B9JA 2I48A 2HFBA 2E0SA 4IO4A 1M5DA 3O66A 2UVJA 4HTGA 3QK6A 3IOVA 4X1BA 4P0GA 2DWIA 1SBPA 2REGA 2REJA 5H8HA 2ZYKA 4UACA 4YU0A 3G3HA 2UYEA 4KI0E 2Y7WA 1UTBA 2XXTA 2XXHA 2RC7A 2BJJX 4F31B 5DEXB 2X7PA 2I4BA 4PFYA 4GQOA 4PFUA 3HPIA 1UTHB 4H5GA 3U1OA 1AL3A 3TKDA 4GRKA 1B3EA 4GL8A 4H0WA 3IL1B 1MPDA 3TTMA 1FTJA 3G3KA 4OFLA 2XD3A 1ZMGA 3C31A 4MLQA 1OQHA 3K1MA 3FVNA 2ZYNA 1FTLA 2I49A 4X9TA 5B70A 1LAFE 1USYH 4QFOA 4RK9A 3M3KA 5JTYA 4YB6A 3CVGA 3HCQA 1BTJA 3I5OA 1M5BA 1R9LA 2OCUA 1URGA 4JXIA 1POY1 1TFDA 3RY3A 2FNCA 4OETA 1B58A 1LGBC 4RJZA 2XXYA 3TTRA 1FTMA 4OXVA 3I3VA 3IOWA 2AIXA 3CR9A 1AOVA 2RINA 5DEXA 3TODA 3TPAA 3G3JA 3PPQA 3GBBA 2DE3A 5L9OA 3PUXE 1S9TA 1UTHA 3MC2A 5DTBA 1BP5A 4TOZA 2Q88A 5K2XA 4KYSA 4BDMA 1XT8A 1JETA 1Y9UA 3JZJA 2Y7RA 3QIMA 2ABHA 1LFHA 1B46A 4OEVA 1XC1A 3E3KA 4MH5A 5K2YA 1H45A 2IA4A 2OZZA 3IK6B 3K4UA 5AE4A 1YCJA 1MPCA 3RN8A 4F39A 1A8FA 4XKRA 3QAXA 3W15C 3TUSA 5EHSA 4AB5A 1MM7A 1ZKBA 1MQDA 2F7CA 3S9EA 4ESXA 5I57B 2FA7A 5L9SA 3PD8A 1MPBA 1B7HA 3E13X 3LUYA 1LLSA 1QKAA 3CSBA 4OQOA 1ELJA 3CFZA 3LBSA 1Y3NA 5ISUA 5EHMA 3R26A 3HO7A 5F1QA 1Y3QA 3TTNA 3VFJA 3DM0A 3V5AA 1CE2A 1IXCA 1S7YA 1NNFA 4E0XA 4GLIA 4FAJA 1LAXA 3RT6B 3MAMA 3MZ1A 3K1PA 4JBZA 1AMFA 2GHBA 1Y4TA 3KZGA 3IOUA 4OENA 2XX7A 2UVIA 3ZS6A 4C1UA 4AQ4A 2IEEA 3FV2A 3SEUA 4JWXA 3FVGA 1FQFA 2B3BA 1VFDA 5TU0A 3O2AA 1Z7ME 2NXOA 2P1SA 4FEBA 5FHMA 3C35A 5I2NA 4OEUA 2I58A 5I57A 5CRYA 1B32A 3VVEA 1O7TA 4H67A 1MY2A 3U72A 4PFTA 3HN0A 4F2QA 3V89B 2XXVA 1JW1A 1NFTA 4R9FA 1M5FA 3K6VA 1TFAA 5AA3A 1H76A 3ECRA 3LSXA 4YKKA 2DS9A 1ZU0A 4BDQA 3WAFA 3TZAA 2H9BA 5ELVA 1GR2A 2QL3A 1MXUA 3PUYE 2XD2A 1JW4A 4DDDA 4U23A 5M2VA 3E4RA 4C1TA 4M4GA 2XHDA 2WKYA 3UIFA 3IAZA 1O63A 1B0LA 5IKBA 3O6HA 2VGQA 5KCJB 2V3QA 1ZBMA 3TAJA 1OLCA 1PBPA 4IGRA 1SVXB 2V25A 3KEIA 4UA8A 1XVXA 5I59B 4M1VA 3L6GA 3L6HA 1MS7A 4GXSB 4BDRA 4Q8RA 4LONB 1MY3A 1FW0A 5AA2B 1IXGA 4QHQA 2UXAA 2F7BA 1MH4A 4YKIA 1Y20A 4XXUA 2PVUA 3Q26A 3UP9A 4YMBA 1QUJA 4HCWA 1NH8A 3PGFA 3KGCA 3DP8A 1P1QA 1DSNA 3EHUA 1POTA 1N7WA 4ZECA 2G93A 2PYYA 5DVIA 4H65A 4NMYA 1FCKA 4ELRA 3KSXA 4OVJA 2GRVA 3KSJA 3M3FA 5H8NA 1US4A 1UTBB 3BKIB 3K01A 3Q27A 4I1DA 3UORA 4DXBA 2Q89A 1FQCA 1MG1A 2ALUA 3IORA 1B5JA 4WEPA 5I84A 3ILUB 1QUIA 5KCJA 1MQHA 2DXYA 1ANFA 4DXUA 1Z7NE 3BFUA 1R6ZA 2UYFA 3HV1A 1FTOA 2XXRA 5AA2A 4F3SA 2THIA 2D3IA 4ZDMA 3DELB 5JEIA 5JTYB 2ONSA 4IO6A 1URDA 4N07A 2DVCA 3CFLA 1IZ1A 5I56B 2XXIA 3RTWB 1MXWA 4ZEIA 3H06B 3C4MA 3KOTA 2ESNA 3UGWA 1MXZA 1TXFA 1SYIA 1B7ZA 4G8MA 3T9VA 1B7UA 3E9XA 1UIVA 2ONRA 3T22A 4IO7A 3G7WA 4ZZEA 4R2BA 3OO8A 1PB7A 4GD5A 3P7IA 3Q29A 3K0VA 3HHFA 3H6UA 3MP6A 1ATGA 5BUUA 5H8SA 1B3LA 3OXNA 4MLVA 2XXXA 3GBAA 2V93A 1FQEA 1XHYA 4G68C 2DWAA 4N13A 4NWDA 3PV0E 4OTEA 1R9QA 1PBQA 1EZPA 1URSA 3TCGA 3U8QA 3I6VA 2I0CA 3UA8A 1QUKA 3C36A 5CI5A 4X48A 3FJMA 3BFTA 2X7QA 1B3HA 1B5IA 4Q0CA 4LZ7A 1Q35A 2M8CA 3R7XA 3ZSFA 1B05A 2DOJA 1A54A 4P11A 4LUBA 4R72A 4OWDA 5I56A 5FTIA 3EF7A 4EQ7A 1OQGA 3KBRA 5ITPA 3IB2A 1B51A 3OSRA 3T9XB 4TQUQ 1SW2A 2OK2A 4BDNA 1NMUA 4U2RA 5I2KB 1LBBA 1WODA 1MM6A 5CC2A 2R6GE 2XX9A 3HSTA 2H5YA 4XTCQ 2I3WA 4Z0IA 2QPQA 3SEYA 4K3FA 1LFGA 4IO2A 1SW1A 2HZKA 4EXKA 1OIBA 2P2AA 3O28A 3A3CA 4R6HA 1IQ7A 3TFLA 3H6WA 3OEKA 3JYRA 2F5XA 5CMKA 2Q2CA 1IUDA 1D3KA 4WKMA 5CMMA 2Z8DA 2F6GA 4O3AA 3K2DA 4ZS9A 3RGYA 1VFEA 2RCBA 3T9UA 4C0RA 1N3XA 1JEUA 5I2NB 1FQAA 4R2FA 1UIUA 2Z22A 3MUQA 4KYDA 4R6KA 3Q25A 4R75A 5L9MA 4POXA 2ZNUA 1T0KA 3RQTA 2D5WA 1HSLA 3IOTA 2HCAA 3C33A 1JW5A 3QSLA 3DLNA 2VHAA 3S4UA 4ESWA 2Q9TA 4MFIA 2DP8A 4H8JA 1GV8A 3OENA 5I2KA 4XKPA 1A8EA 1JQFA 1Y4CA 4EDPA 4U21A 1A55A 1LAHE 4FIMA 4GWOA 3TTLA 3FATA 1SDXA 3FGSA 2O51A 3ZKKA 1AH5A 2AL4A 3VLUA 2Q2AA 3N26A 4ELQA 1D9YA 3PU5A 4FECA 4QF9A 3KFMA 3MW0A 1BIYA 5B7DA 1DOTA 1DTGA 2DE4A 1HSEA 2F35A 1N3WA 2R71A 4ZEBA 4IY6A 2V84A 3B6QA 4H5FA 2NUVA 4Z7EA 2VD3A 4QFLA 3F11A 4TLLB 2D21A 1KWHA 2NOOA 2HQ0A 3OO7A 3PUVE 4MF3A 3EHTA 2QSXA 3EHSA 1NNPA 3AXFA 3U93A 3LR1A 5TP9B 3FASA 4PP0A 3VLWA 3DP6A 4LATA 1FQDA 2DQVA 1D4NA 4DIGA 3T66A 4KYEA 1IXHA 5KZTA 4XIGQ 4QRZA 2UVHA 1MXXA 2PX1A 1TT1A 2NWJA 2A5TB 4TLMB 4FATA 1A99A 4G2ZA 3B6WA 4F1UA 1LB9A 3FXQA 1OLAA 1S50A 3EPEA 1B3FA 4THIA 4HW8A 4OESA 2ONKE 2E1SA 2RF1A 3MP1A 1H44A 3H6TA 2G29A 2A5SA 5H8NB 2RC9A 3FJ7A 5EYFA 4ZZAA 3QXMA 4YAHX 1MH3A 4GIZA 3KN3A 4KR5A 4LZ8A 2ZXTA 1BKAA 3QYTA 4OFJA 1P1OA 3W9VA 3IB1A 2I6EA 4ONYA 4GOTA 3LC8A 3SEXA 2DYXA 1SI1A 4H8IA 4F19A 1JNFA 1XVYA 2X26A 4POWA 2PMSA 1EZ9A 3RPWA 2QS2A 3JV9A 1QULA 2Y7PA 4I9DA 4AB6A 1XOCA 3OO6A 3K6WA 4PETA 5TP9A 4F3BA 1IXIA 1MY0A 3DP4A 3PPNA 3IJXB 1II5A 1WVJA 2A5TA 3ZKLA 5J1DA 4NF5A 5CBRA 3PPOA 4BDOA 1N04A 2F97A 4FE8A 3C9HA 1N84A 2I3VA 1NNKA 1P1WA 1B0HA 3H4ZA 3PUZE 1BLFA 4FORA 1DPEA 1P99A 4U4SA 5DVJA 1YAEA 5I58A 2O7UA 4EQBA 4KCCA 3FIRA 2Y7IA 4WXJA 4QFPA 1SW4A 3MBPA 2QS1A 1SD3A 5ICQA 2OWSA 2O6AA 4U22A 5HBCA 3OEMA 3VLVA 3THIA 3VXCA 3QUJA 2XX8A 3WAEA 1B4HA 1B6HA 3TEPA 4F29A 4ZEDA 2PT1A 4KQPA 4JSDA 2V3UA 1SW5A 2F8DA 2AYSA 4OERA 1QW0A 3K6XA 2YLNA 4FJPA 5ITOA 1JVXA 1NNTA 5HM4B 2Y7KA 1OMPA 3S2VA 3QUFA 3PMXA 4P0IA 5AA4B 4PFWA 3IJOB 2Z23A 3IB0A 4IGTA 1NKXA 4U1ZA 3CG3A 4DE8A 4Q30B 2DWJA 4HS7A 1Y1ZA 4YB7A 3FUZA 4LP2B 4NTLA 3VVDA 3MVYA 3OMBA 4F2OA 4RXLA 1I6QA 4RY1A 2B3FA 2LAOA 2Y84A 4GFRA 3SESA 1TWYA 1USYE 1Y3PA 2H98A 2O1LA 2QMWA 4OZ9A 3MPLA 5AA2D 5KDTB 3FZVA 4R6YA 2HEUA 1ZLQA 5DYHA 4NF8B 4F3PA 3FD3A 2CMOA 5FTHA 2B65A 3TYHA 1RYOA 1WDNA 3A3UA 3SEVA 3LSFB 1IIWA 4WEDA 1VSOA 3SETA 4DCXA 4QSDA 2ZYOA 3MVWA 1ZTYA 5AA4A 4F1VA 3SKPA 3HHGA 4NEDA 3OO9A 3KG2A 2F6PA 2ANJA 2P0SA 1YTVA 3CI8A 3VXBA 1XS5A 3SEWA 1GVCA 2F34A 3Q28A 1L5TA 3VV5A 4G8HA 1N0TA 3A09A 1QVSA 3VE1B 1H3DA 4RA1A 2OWTA 3SDFA 4EUOA 3GXAA 1N7XA 3N5LA 4KPTA 3UN6A 3TDJA 3TMGA 4F22A 1IEJA 4YB5A 2I4CA 2OJTA 5KDTA 5DVFA 4RK2A 5A5XB 4NF8A 4H1XA 3BBRA 5DT6A 3MQ9A 2DSFA 2QMXA 4O3BA 1LSTA 2H4IA 2VOZA 2Z8FA 3M3LA 3FXUA 4IB2A 3B7DA 3G3GA 4NWCA 4YKJA 2ZNSA 3KOSA 4GF8A 3R6UA 1DPPA 3K1NA 1B52A 1N76A 3H03A 1RKMA 1OVBA 4EQ9A 2XXWA 1ZJLA 4GXAA 3FVOA 3USDA 2XXPA 3K6UA 3MPKA 5L8DA 2W7YA 4RYAA 1LAGE 1B1XA 3EQ1A 3H3GA 1B2HA 1UQWA 1GGGA 3TCFA 2RKMA 1LCFA 3KJ7A 3O6IA 3KJTA 1MXYA 4QSEA 4Q5TA 2DXRA 4QFNA 4R9GA 3G3IA 3CG1A 1MQGA 4R74A 1I69A 3TQWA 3S9MC 1O64A 3TCHA 4LZ5A 1OVTA 3OSQA 2YPNA 3UK4A 2QJEA 1I6BA 4ELOA 2H25A 2VD2A 4JSOA 4ZE9A 2I0BA 5A5XA 1A40A 3O29A 4NE4A 3MP8A 4JWYA 3IX1A 3W9WA 2ZNTA 4E0WA 1IITA 2HAVA 4G8NA 3RNNA 1MY4A 3PPPA 1Y1MA 3MJNA 2R9JA 4BDLA 2V3TA 3TQLA 5JK4A 1SI0A 4L17A 1PC3A 3MZ9A 1CB6A 1JVYA 2OLBA 4YMAA 3FXRA 1LCTA 4IO3A 1I6AA 1EH3A 1GTKA 1PDAA 4I8CA 3H6VA 4X1DA 4KCDA 1M5EA 1VE4A 4YICA 3ODBA 4F1YA 4FEDA 5IAIA 2XXQA 3O9PA 4DCYA 4ND9A 1YPNA 3OD7A 5CM6A 3CSGA 3CRBA 4DXCA 4ZEKA 5CMCA 2O84X 3C32A 4IO5A 4QFKA 2FYIA 3GZGA 2NVUB 1NL5A 1US5A 3B6TA 4KD5A 1MRPA 4HCYA 4GL0A 4DLDA 1PB8A 1J1NA 2DWHA 2QRYA 3D4GA 1DTZA 2ZMBA 2Z8EA 4ECFA 5AA1A 4QSCA 4NF5B 4OMBA 1FTKA 4NF4B 3U92A 4EF1A 1QJMA 2UVGA 3N94A 3T9HB 1SYHA 5CMBA 4GVOA 3MVXA 1B3GA 4G68B 2F36A 5F7VA 2QS3A 3PUWE 3K02A 3S9NC 3IR1A 3T96B 1RYXA 5I58B 1MQIA 3CIJA 1VR5A 1AIVA 3KN8A 1FQBA 1B40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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