3QAXA

Crystal structure analysis of the cpb0502
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
RIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQYSSVAVQTGTYQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAYEAAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Probable ABC transporter arginine-binding protein ArtJ
publication title Crystal structure of the cpb0502
rcsb
source organism Chlamydophila pneumoniae
molecule tags Transport protein
total genus 64
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qaxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qaxA02
2R71A 2DE4A 2W7YA 1B3GA 2XX8A 2RF1A 3Q26A 2DP8A 2F6GA 4G4PA 3OXNA 3H6UA 2P1SA 4JWOA 2B3BA 3IB2A 4KCDA 2XXHA 3ODBA 3U8QA 3FGSA 4FJPA 3T93B 2PT1A 3FZVA 4G2ZA 1NMUA 2F97A 3PPQA 4GLIA 4L17A 1Y4TA 2HFBA 3PUXE 1ZKBA 2DE2A 4EQBA 5DVIA 4FECA 5I2NA 1SVXB 3LUYA 4IGTA 4G68B 3T96B 4DCXA 5CMKA 5EHSA 2NVUB 3N6TA 4P0GA 3FJMA 2O6AA 3O66A 3KOSA 3SEWA 4OERA 1SBPA 3TUSA 4EQ7A 4NEDA 4ELPA 2FNCA 3KBRA 1L5TA 1B4HA 1LCFA 4NF8A 4NF5B 3K4UA 3VXBA 2G93A 2H99A 2X7QA 3SEXA 4IGRA 4IY5A 4ELOA 1PBQA 1SYHA 3CFLA 5A5XA 2OJTA 3FVGA 4F31B 2A5TB 1JVYA 1LFHA 2ZXTA 3FVOA 3ZSFA 3FD3A 1B9JA 4F1UA 3A3CA 3T9UA 4TOZA 3OEMA 4LONB 3MVXA 1EZOA 3DM0A 1Y9UA 3A09A 3IJXB 1NFTA 2UVIA 1N7WA 1USYE 1JW5A 5H8QA 3SETA 3O97A 1FW0A 1FTLA 4DDDA 1LGBC 1PEBA 1B2HA 1URSA 2DSFA 3T9XB 3PMVA 3C35A 4ELQA 4EXLA 1SDXA 1A8EA 1LB9A 3L6GA 5F1QA 2I3VA 2RC7A 4EF1A 3TQLA 2OK2A 2ONRA 1TXFA 1S7YA 3IB1A 1R9QA 1FQCA 2F34A 2X26A 5I59B 3E4RA 1FQAA 2V3UA 1PB8A 4GF8A 3K6VA 2OLBA 4QSEA 2O69A 5AA2D 1IQ7A 5I56A 1MXZA 4G8MA 1UTBB 3DELB 4JSDA 1MPBA 4F19A 4G68A 1VE4A 1Q1KA 2REJA 3CSGA 1YPNA 1EH3A 5EHMA 3IOUA 3S9NC 3MW0A 4GL8A 3FVKA 3ILTB 3Q29A 3AXFA 1RKMA 2DVZA 4LZ8A 4DLDA 4BDRA 5I84A 3SEYA 4QF9A 2QL3A 2VGQA 1UQWA 4RK9A 4BDLA 2XXVA 3THIA 2XXUA 2I0CA 4JBZA 3KN7A 5TU0A 1NH8A 1OVTA 3E13X 3MP6A 4ZEFA 2REGA 3VFJA 2RC8A 3DP4A 2RCAA 3S4UA 2QJEA 3JZJA 3TPAA 2V25A 3KFMA 2E0SA 1ZLQA 1B05A 4ZEIA 2NOOA 3TEPA 1PDAA 3VVDA 2DXYA 2E1SA 4OTEA 3U94A 3CIJA 3GBAA 1B7UA 2QS1A 3CI8A 4I1DA 5CMBA 2OWTA 1XT8A 2GHBA 2X7PA 3EHUA 3IJOB 3K0VA 4ZDMA 1QKAA 1UTBA 1LBBA 4DXBA 4LZ7A 4DIGA 4H8IA 3UP9A 3VV5A 3KSXA 1ZJLA 4GRKA 1B7HA 4OZ9A 1N3XA 5HBCA 3OD7A 5BUUA 2D21A 2UYEA 4F3PA 3FIRA 1JVXA 1EZ9A 3OO9A 1IXHA 2Q2AA 4ZZEA 4KCCA 4PETA 4UACA 3H06B 2O68A 4ONYA 3T66A 3VVFA 3VVEA 3KGCA 3N6UA 3O6HA 3PD8A 1ZTYA 3K01A 4F18A 3UORA 4DZ1A 3K6XA 4ZZAA 1GVCA 2Z8FA 4PFYA 5FHOA 4IO5A 1URDA 1R1NA 3HN0A 3OEKA 2R9JA 2PBWA 5ITOA 2NWJA 1QUKA 2Y7PA 3MP1A 3H6VA 3EQ1A 5KDTB 3CSBA 1MQGA 4ESXA 3V8XB 4GL0A 1B3FA 3OO7A 5FHNA 1B5IA 1FQBA 3FV1A 3PMWA 1TWYA 1IXCA 5CBRA 1EZPA 2HEUA 5KZTA 5I2NB 4MH5A 5KCJA 4KYSA 5B7DA 4O3AA 5ICTA 4R74A 3RPWA 4N07A 2XX7A 2OWSA 4DCYA 4MFIA 4X1BA 3DP8A 4OFJA 4AB6A 1BIYA 5L9SA 1N0TA 4LVQA 5AA1A 3ZKKA 3QK6A 1BLFA 1P1NA 4OYVA 4POXA 4NF8B 3T9HB 2V3QA 5ITPA 3MBPA 1SW1A 5A5XB 3G3KA 1MXUA 2Z22A 2DVCA 5CC2A 1URGA 5DTBA 1VFEA 1Q35A 2HQ0A 5K2YA 2PVUA 4QFKA 2PYYA 2GH9A 2P2AA 3G7WA 5L9OA 1Y20A 4XKRA 4F2QA 2XHDA 2DWHA 4QFOA 1NNTA 1PC3A 4U4SA 1QVSA 4G8NA 5DVJA 3OOAA 4Q0CA 1UTHA 2O84X 5H8QB 1MPCA 5HPQA 1JW1A 4RPNA 4LQ5A 3PU5A 3SESA 4F3GA 4FEBA 4GWOA 2GFEA 2BJJX 4IB2A 1FTMA 4OFOA 1B58A 2Q9TA 4JWYA 1SI0A 4YMBA 1DOTA 5KDTA 4RYAA 1SW5A 2UVGA 4ESWA 4NF6B 1DTGA 1PBPA 4NWCA 1GGGA 2XXPA 5I56B 4OESA 1TFAA 4BDMA 3I3VA 1MH3A 3QSLA 1HSEA 3RLFE 1IZ1A 3HSTA 2Q2CA 3LSWA 1UIVA 3TYHA 2F5XA 3TFLA 2Q88A 5M2VA 1MDQA 4FATA 3PPPA 3IAZA 1OVBA 4DXCA 1M5DA 5I57A 2THIA 5JTYA 4GFRA 3K6UA 1I6QA 4GVOA 1Z7NE 3G3FA 3MPKA 3O6GA 4PFWA 4WEPA 2ZYMA 3K1NA 3V83A 2XD2A 3KSJA 1B51A 4EF2A 3M8UA 1TFDA 3I5OA 4ISUA 5CMCA 5I2KA 5BWJA 3S9LC 4LP2B 4UA8A 3MZBA 3KG2A 4IO6A 1ZMGA 4R9GA 3PUYE 1VFDA 3TCGA 3IL1B 3TAJA 1QUIA 1POY1 2NXOA 3CVGA 3BBRA 2F7AA 3MJNA 4ND9A 3O9PA 1AIVA 3C32A 2F35A 3QIMA 3H4ZA 4OHNA 4FE8A 4PP0A 5B70A 3OO6A 4U23A 3VLVA 4NWDA 2PMSA 2H9BA 3E3KA 3GBBA 5F7VA 1XS5A 2B3FA 3HHFA 2DE3A 5FTHA 3B6WA 4WXJA 2O1LA 3PGFA 3FJ7A 2RKMA 4C0RA 3FATA 4K3FA 4KI0E 2OZZA 3LC8A 4U2RA 4NF6A 1Y3QA 4TQUQ 2D5WA 3LSFB 3RTWB 4PE5B 2H98A 1UIUA 2P0SA 1B5HA 1QULA 3CRBA 3O29A 3TTKA 2I48A 4GOTA 2H25A 1MY4A 1FQFA 4R73A 5L9MA 2A5SA 3CR9A 3GXAA 1FQEA 1CE2A 4RXLA 3TCFA 3G3IA 1Y3PA 4R72A 1S50A 1MM6A 2ZNSA 1LCTA 3KEIA 4OETA 1P1OA 2ZYOA 1MY2A 2GRVA 4O3BA 1D9VA 4MLVA 1MY3A 5AA3A 4ZEBA 1A55A 2DYXA 2O7UA 4Q30B 4AB5A 5DYHA 1DPEA 2UYFA 1TT1A 4FAJA 3C31A 4RNSA 1I69A 3G3JA 2I49A 3QXMA 1LBCA 4H65A 3FV2A 3VDFA 4ZEKA 5HM4B 3RGYA 4RY1A 3CFXA 1H45A 2I4BA 5FTIA 3RT6B 4U21A 2G29A 5AA4B 3RNNA 1I6BA 1KWHA 3RQTA 1I6AA 5H8FB 1MS7A 5AE4A 4IO4A 4E0WA 2XXRA 2F7CA 1NL5A 3ECRA 3EHTA 1B5JA 1VSOA 1D3KA 4I9DA 1JEVA 1XVXA 3W9WA 3EF7A 4YKIA 3Q27A 3K6WA 3M3LA 2V84A 2HAVA 4BDOA 1M5CA 2NUVA 3BKIB 1LFIA 3SEVA 2HXWA 2ONKE 1MXVA 2OCUA 1B3HA 2QPQA 4F3SA 4F1VA 1FTJA 4YAHX 5KCJB 5TPAB 2AYSA 4BDNA 2VOZA 3D4GA 5CRYA 2DS9A 1MXWA 1SQYA 4HTGA 2Q89A 2QS4A 1YTVA 2KLFA 1OQGA 2DWIA 3KZGA 3SEUA 4TLLB 3MZ1A 1IIWA 4G8HA 2ABHA 1B0HA 3BFTA 3K1MA 4QRZA 2VHAA 2I58A 3TTNA 3JYRA 2QMWA 5CI5A 1SW4A 2OBGA 3KN8A 2IA4A 3TDJA 4DXUA 3RUMA 3JV9A 3MPLA 4THIA 2F78A 3H03A 1ZU0A 4KR5A 3B6TA 5K2XA 1Y4CA 2XD3A 4XIGQ 5AA4A 3C4MA 3WAFA 1UTHB 1DTZA 5H8FA 4GXSB 3UGWA 1LAXA 3M3KA 1B32A 3FUZA 3OELA 2O51A 2I3WA 3A3UA 4NF4A 1BP5A 3HPIA 3TCHA 1XC1A 1N04A 3EPEA 3RY3A 1OQHA 5JK4A 2WKYA 4MF3A 1H43A 2XXTA 5AA2B 3H3GA 3VXCA 3UN6A 1US4A 5IAIA 2ONSA 2O1MA 5DVFA 2O7IA 1NNPA 3U92A 2H4IA 4KD5A 1ATGA 3C33A 5TPAA 1B52A 3IK6B 1EU8A 3TTRA 4QSCA 4EDPA 3TMGA 2XXIA 4H1XA 5CMMA 3BFUA 2CZLA 1LB8A 4ZE8A 5I57B 4R6HA 2I4CA 3RTFB 5JTYB 1FQDA 4I8CA 4N6PA 3K2DA 3B6QA 1AL3A 3C9HA 1MXXA 4OEUA 4R6YA 1USYH 1S9TA 4NE4A 3S9EA 1XOCA 1LLSA 3TTMA 1GTKA 3MAMA 1BKAA 5I2KB 4RPOA 1AH5A 4ZE9A 2FA7A 2Z8DA 4YICA 3TTLA 3T9VA 4Z7EA 2Y84A 2XX9A 1DMBA 1A8FA 4OWDA 1B3LA 2Q8JA 2DXRA 2F6PA 2R6GE 2HCAA 1OMPA 1N7XA 4H5GA 4PFTA 3MUQA 4GQOA 3C34A 4RJZA 3OENA 3N26A 3H6TA 4WEDA 2ANJA 1YCJA 1QKBA 3R6UA 4OMBA 2RCBA 2AIXA 4KFQA 1MQJA 5H8HB 3QUFA 3F11A 2H5YA 1P99A 5H8SA 3IOTA 1PB7A 5LOMA 1XVYA 5AA2A 5IKBA 3FVNA 2M8CA 3Q28A 1MG1A 3PUWE 4KYEA 3VLWA 1VR5A 2XXXA 4OVJA 4ZEDA 1II5A 5H8NB 2B65A 4BDQA 4KQPA 5J1DA 2VP1A 4X1DA 1WODA 3KJTA 3MC2A 4LUBA 1PB9A 4QFPA 3U93A 4QSDA 5DT6A 3PPOA 3S2VA 3G3HA 4HCYA 1RYXA 1LAFE 4RK2A 4KYDA 3MZ9A 3DP6A 1H76A 3IOWA 3K00A 3KOTA 5EYFA 4AQ4A 3FXQA 1CB6A 3USDA 4OXVA 4YB5A 1RYOA 3MWBA 1Y1MA 2GHAA 5I58A 1MQIA 4JXIA 3S9MC 4R6KA 1QUJA 3N94A 5FHMA 4RA1A 4FEDA 4QHQA 3R26A 1IXIA 3DLNA 2ZNUA 4U22A 3GLBA 2ZYNA 3SDFA 4C1UA 4HS7A 4ZECA 3TZAA 3PD9A 1H44A 2YPNA 1B3EA 4R9FA 3RN8A 3PUZE 2PT2A 3VE1B 2Y7WA 4YU0A 4YZZA 5DEXA 5TP9B 3HHGA 5H8HA 3TODA 4JDFA 3I6VA 4EXKA 3CFZA 4ECFA 1YAEA 3T22A 4TLMB 3IR1A 1F9BA 4EUOA 4X48A 1NNKA 2HZKA 2AL5A 5H8NA 1N84A 4Q5TA 1OLAA 4R2FA 4HW8A 3OO8A 2F8DA 4LA9A 4O3CA 2Z23A 2ESNA 3O6IA 2Y7IA 2ZNTA 3MQ9A 2HAUA 2ZMBA 1QW0A 1MM7A 4GXAA 4XKQA 1J1NA 3OMBA 4NTLA 1H3DA 2UVJA 3WAEA 3OSRA 2V93A 4OENA 2QS3A 4C1TA 1XHYA 1GR2A 3QYTA 1SW2A 1MXYA 4NF5A 4GIZA 1N3WA 3HCQA 2FYIA 1T0KA 2A5TA 1P1UA 4H0WA 4PFUA 2Y7KA 1AOVA 3HV1A 3EHSA 5L8DA 2DWJA 5ELVA 4F29A 1MY1A 1LFGA 3FASA 3H7MA 2YJPA 4P11A 1HSJA 3MVYA 1HSLA 3O2AA 4OFLA 1QJMA 1A99A 3R7XA 1A54A 1B4ZA 1B40A 1SYIA 2I0BA 5TP9A 3W9VA 4IO2A 3LSXA 4NF4B 4IY6A 3C36A 5CBSA 4IO3A 3B7DA 1NKXA 3V5AA 1DPPA 5JEIA 4JWXA 4P0IA 1OLCA 2F36A 2Z8EA 3LSLA 5I59A 1P1WA 1LSTA 4XKPA 2QRYA 1MDP1 3N5LA 1MQDA 4QFNA 1WDNA 1R6ZA 4F39A 1DSNA 2V3TA 1D4NA 2AL4A 1POTA 1B46A 4XTCQ 4R75A 4JSOA 4LQ2A 2RC9A 5ISUA 3P7IA 4M4GA 4M1VA 2IEEA 3FXUA 1O64A 4GD5A 4YB6A 4EQ9A 3FJGA 3U1OA 3CG3A 3CG1A 4F22A 5CM6A 1R9LA 4G77A 3V89B 4XKNA 1MQHA 3KN3A 3FXRA 3IO6A 3PV0E 1IUDA 1Y3NA 4WKMA 1MPDA 1IEJA 1O7TA 5ICQA 3SKPA 1N76A 4YKJA 4MLQA 4NMYA 2QMXA 1JQFA 4E0XA 3KJ7A 3M3FA 3QAXA 4I62A 1JW4A 2HZLA 1ZIUA 3SERA 1A40A 4YKPA 1LAHE 3K02A 1ANFA 4FORA 2DOJA 3IORA 1US5A 1GV8A 2ALUA 3TELA 4U1OA 4N13A 4G68C 3ILUB 1M5EA 3UK4A 2D3IA 1MY0A 1NNFA 4R2BA 4POWA 3EN3A 3ONMA 4F3BA 2XXQA 4U1ZA 2CMOA 2Y7RA 2RINA 2DWAA 1B0LA 1M5FA 3IX1A 4H8JA 3TKDA 1Z7ME 2XXYA 4YB7A 2UXAA 4KHZE 3LBSA 1NH7A 3PUVE 4H67A 2QS2A 2I6EA 3ZS6A 3QUJA 3PPNA 3MVZA 2ZYKA 1JEUA 3W15C 1ZBMA 4HCWA 2QSXA 3MVWA 3HO7A 4H6DA 1A7LA 1OIBA 4DE8A 2LAOA 1Y1ZA 3G3GA 4ZS9A 2VD2A 3UIFA 4YMAA 1B6HA 3VLUA 4OEVA 3LR1A 4MBPA 1B1HA 3E9XA 1O63A 3PPRA 4JB7A 2UVHA 4BLAA 1LAGE 3UA8A 3O28A 3RT8A 4XXUA 1FCKA 3GZGA 2F7BA 3L6HA 1JETA 1AMFA 3H6WA 4LATA 1MRPA 4U4XA 4LZ5A 1JNFA 1D9YA 1B7ZA 3OSQA 3U72A 1B1XA 3IO4A 5I58B 3K1PA 1FTKA 4F2OA 1IITA 4PQJA 3PMXA 1IXGA 1FTOA 3TQWA 4Z0IA 1P1QA 2YLNA 4H5FA 1M5BA 3IOVA 1WVJA 1BTJA 4X9TA 4KPTA 3ZKLA 4ELRA 2PX1A 3Q25A 4YKKA 4IO7A 4FIMA 1SD3A 2VD3A 2XXWA 1ELJA 4OQOA 1SI1A 3IB0A 1MH4A 5DEXB 3D4CA 2DQVA 4F1YA 4Q8RA 4QFLA 3MP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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