2AIXA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-thio-atpa at 2.2 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct kinetics of ionotropic glutamate receptor 2 splice variants characterized by fast agonist application and crystallization of a receptor-ligand complex.
rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2aixA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2aixA02
1H44A 2XXQA 3K02A 3UA8A 2ZYNA 1JEVA 4FJPA 3N5LA 3U8QA 3FASA 3P7IA 2GRVA 2H98A 3IO6A 1WVJA 4GD5A 1SYIA 5I57A 1YPNA 4JWYA 3CVGA 2FYIA 4YU0A 2HAVA 1JEUA 2H25A 5DVFA 1FTKA 1IUDA 2Y7IA 4OWDA 1AH5A 1ATGA 2XXTA 4H6DA 1I6BA 3RN8A 3FXRA 3T9HB 3JV9A 2O69A 2OWSA 4LA9A 5H8HB 4PFYA 1PBPA 1B52A 4F39A 3BBRA 2R6GE 3RPWA 4IO2A 2Z23A 2BJJX 2ZYMA 1ZJLA 5CMCA 1H45A 2F7CA 4OEVA 3QUJA 2OLBA 5DEXB 4OXVA 4YMBA 1EZOA 2XXWA 1BIYA 5TPAA 4LVQA 5K2YA 1MM6A 2DXRA 1B5IA 4R2BA 2F8DA 5JTYB 4I1DA 1S9TA 4G68A 4RJZA 2DE4A 2ONSA 4FE8A 3FVGA 1SW1A 5KDTB 1MY2A 4ZEFA 1JW4A 2DWAA 3N94A 2AL4A 3E13X 1EU8A 4KHZE 2XXHA 3T96B 2B65A 2XXUA 4KYEA 3KFMA 3TQLA 3A3UA 5CBRA 5I2NA 5AE4A 5I2KA 5DVJA 3FJ7A 3DM0A 4OERA 2I0BA 3TUSA 3IK6B 1N0TA 1GVCA 3LSXA 3IO4A 3O66A 4TQUQ 3KSJA 3RQTA 3RT8A 2XHDA 2VGQA 4DXCA 3KG2A 5DTBA 1OVTA 3I5OA 4R2FA 4IO6A 3W15C 2P0SA 1XVXA 5L9MA 2DSFA 3IORA 1XT8A 1BP5A 3OXNA 5AA2B 2Q9TA 3TTMA 4XKNA 4FEBA 2V3UA 3OELA 2QS1A 4KQPA 3TFLA 3V8XB 4POXA 4OTEA 2XXPA 3FJGA 1LCTA 2R9JA 1BLFA 3C36A 2PT1A 1SDXA 1NNPA 3HN0A 3K6XA 5FTIA 3MZBA 1NKXA 3VDFA 1LGBC 4N13A 3PUVE 3LBSA 1MY3A 4U22A 3VV5A 3SEXA 4BDQA 1VFDA 2H4IA 4KCCA 4XXUA 3ZKLA 4GQOA 1GV8A 1MXWA 2YJPA 3K0VA 1Z7NE 3SEWA 5CC2A 5I58B 4GL0A 1FW0A 1IXHA 2F6GA 1HSJA 1MXYA 4IO5A 1P99A 4GVOA 4RK9A 3ZSFA 5CMBA 1A55A 4KR5A 3B6TA 3PMVA 1B9JA 4F2OA 2ZNTA 3O9PA 3FV2A 1RYOA 3T9VA 3TODA 4DDDA 1NNKA 4EQBA 5F1QA 4AB5A 3H03A 3KN7A 4OYVA 1Y4CA 1WDNA 3Q25A 3TTRA 1XC1A 3A09A 1OLCA 3ECRA 3TQWA 2B3BA 3MZ1A 1IXCA 5BUUA 4YKJA 3Q27A 5AA2D 2UYFA 3THIA 2H99A 3K6VA 4JWOA 3I6VA 3IB1A 3SESA 3BFTA 2H9BA 2I3WA 1SI0A 2HZKA 1LAFE 2RC9A 3KGCA 2NWJA 3KZGA 2OCUA 3MBPA 3G3HA 5ELVA 1B5JA 4G8NA 4U1ZA 2F34A 3K1NA 3F11A 4X9TA 1JW5A 1II5A 3LUYA 4JXIA 4F3GA 5AA1A 3UK4A 1MY1A 1JQFA 3W9WA 4NF6B 3H4ZA 3C4MA 3S2VA 1D4NA 2HZLA 1MXUA 4MFIA 3PV0E 4WXJA 3D4GA 4YICA 3CIJA 1B3FA 4I62A 2LAOA 5AA3A 3UN6A 2XX7A 1QW0A 3FIRA 4H67A 2E1SA 3H3GA 1LAGE 1A7LA 2F78A 2GH9A 2ZYKA 3KJTA 3R26A 4ZECA 2O7IA 4QRZA 4MLVA 4ONYA 3ILUB 4QFNA 2O1LA 3M3FA 5EYFA 1SYHA 3PUYE 2NVUB 1LLSA 1IXIA 4NF8A 2AYSA 2Q2AA 1P1QA 4X1DA 5A5XA 3QIMA 4LZ5A 1ANFA 1OMPA 3GBBA 4NWDA 5H8FA 2XXRA 5KCJB 3VXCA 4IGTA 4O3AA 5J1DA 1Y3NA 3IX1A 4RNSA 4F1VA 3SEVA 1R9QA 2VOZA 1M5BA 2W7YA 3MJNA 2V3QA 3O29A 4LZ7A 4OQOA 3HSTA 4POWA 4C0RA 3TAJA 5TU0A 2VD2A 1POTA 1YCJA 4E0XA 1BKAA 3OO8A 1VR5A 1IZ1A 1H43A 1US5A 5DT6A 2DWHA 3HHFA 4IB2A 5AA4A 4H8IA 1UTBB 1A8FA 1NH7A 4N6PA 3TCHA 1QVSA 1SW4A 3OENA 4TLMB 4DLDA 3V5AA 4BDNA 3E3KA 4F1YA 3TYHA 2HAUA 3HCQA 4MBPA 1FTOA 1LFGA 3RTWB 3MZ9A 4PQJA 1R9LA 2O6AA 4XKQA 2GHAA 5I59B 2D3IA 5CM6A 3U94A 3TZAA 4KPTA 3H6WA 1B6HA 4R72A 1DOTA 5HPQA 3QXMA 1PEBA 1QUJA 2XXIA 5FHOA 4KCDA 2PT2A 2RF1A 2RINA 4OMBA 2ZNSA 2XXYA 1A40A 3R6UA 4RK2A 1URSA 1O64A 1TFDA 5DYHA 1MDQA 1D9VA 3MP6A 4LQ2A 3LSWA 4PFUA 2RC7A 1ZU0A 3BKIB 5IKBA 1B3GA 5BWJA 1ZLQA 3Q28A 3T9XB 4O3BA 4ZS9A 1PB7A 5L9SA 3RY3A 4BDRA 3RLFE 3H06B 3CRBA 3H6TA 1IXGA 4EF2A 1OIBA 1MRPA 1IEJA 4RPOA 1P1WA 2KLFA 4F2QA 1I69A 3G3FA 1AIVA 3DP6A 4DXBA 3A3CA 3E9XA 2XD2A 3S9EA 3CSBA 3OSQA 1MM7A 4E0WA 2I48A 3KN3A 3OEKA 3QYTA 4L17A 1GR2A 3SETA 4YKIA 1URGA 2P1SA 4OVJA 1NNTA 3S9LC 4XKPA 5I84A 3WAEA 5H8QA 3HV1A 3IB2A 3Q29A 1JVXA 4F3SA 1B32A 4KD5A 1NMUA 3GBAA 2IA4A 5H8NA 2H5YA 1MQIA 4MF3A 1Y9UA 2ZMBA 3CG1A 2O68A 3QUFA 3CFXA 1LAXA 1JETA 2O7UA 4ESWA 5CMKA 3RTFB 3TMGA 3RUMA 5I57B 4HCYA 2NXOA 4FORA 4YKKA 2PMSA 1B1HA 1N7WA 1O63A 2I58A 5I56A 3FVKA 3IB0A 2QPQA 4R9GA 1NFTA 1AOVA 1SI1A 1FTMA 1TFAA 3H7MA 3VVEA 4RA1A 4ZEDA 2RKMA 4ZEBA 1LBCA 2R71A 4Q5TA 2ALUA 1QUIA 1WODA 4HCWA 1F9BA 4GRKA 2G93A 3WAFA 2F7AA 4XIGQ 1TT1A 1MH4A 1B7UA 3U1OA 1AL3A 2DVCA 2Y7WA 1UTHA 1NNFA 1MDP1 5TPAB 4BDLA 3T22A 2GFEA 4R75A 3PMWA 1B0LA 5TP9A 4G68B 3FD3A 1LAHE 4NEDA 4P0IA 1B46A 5H8SA 1D9YA 1S7YA 4H65A 3IOUA 4YB7A 5ICQA 2ZXTA 4YB5A 3MUQA 2I4BA 3FXQA 1N7XA 4QFLA 3K1PA 3TTLA 2DS9A 1B4HA 4JWXA 2XXXA 3T9UA 4JB7A 2F97A 2O51A 5I2NB 2Q2CA 2CZLA 4X1BA 1AMFA 1XVYA 5I2KB 2ZNUA 1P1NA 1IIWA 4GIZA 3GXAA 2Y7PA 1JW1A 4KYSA 1B7ZA 2ONKE 4P0GA 4IO7A 3USDA 1N3WA 3HPIA 3T93B 3IAZA 1FTJA 3DP8A 2UVGA 4FAJA 4WEDA 2VHAA 1RKMA 1RYXA 3K00A 1OVBA 5CI5A 2PX1A 4WKMA 1CE2A 3G3IA 2B3FA 4Q0CA 4OETA 3KOTA 4HW8A 1B1XA 5ITPA 3CG3A 3Q26A 2I4CA 4GWOA 1B0HA 3VLWA 2A5TA 2QSXA 3QSLA 4YKPA 1H76A 1M5EA 4F18A 4NTLA 2I0CA 1XS5A 3EHTA 1US4A 1ZTYA 3GLBA 3DELB 3B6QA 1M5CA 1VE4A 4G68C 3VVDA 3RNNA 4Q8RA 2Z8EA 2G29A 4QFOA 4G2ZA 3C31A 3PPOA 5B7DA 1DTGA 3PUWE 4JDFA 2F36A 1Y1ZA 3ZKKA 5ISUA 3MP8A 3FJMA 5FTHA 5M2VA 4NF4A 1DTZA 4AB6A 4U2RA 3OMBA 4QSDA 1FQEA 4LP2B 1LFHA 4FECA 1EZ9A 4QSCA 3K6UA 1S50A 4G4PA 3V89B 1QULA 4JBZA 4R9FA 4UACA 2VD3A 3MW0A 1M5FA 2YLNA 3LSFB 1QUKA 2HFBA 3SEUA 2F5XA 3C32A 2DE2A 1TXFA 3DLNA 3SERA 2XD3A 3VE1B 3PMXA 2P2AA 4C1TA 1MH3A 2O84X 2YPNA 2DWIA 3MWBA 3TTNA 3N6TA 1B3EA 4TLLB 3G7WA 4PFTA 1LCFA 4NF5A 2IEEA 2X7QA 1SD3A 4LQ5A 1R6ZA 1EH3A 3UORA 2DWJA 4ZE8A 4ELQA 4GXSB 3H6UA 2THIA 2OWTA 3C34A 4ZEKA 2XXVA 3VXBA 2E0SA 4IGRA 4ND9A 2DE3A 4N07A 4UA8A 1GTKA 1DPPA 4U21A 3CR9A 4IO4A 2QRYA 3DP4A 1PB8A 2V84A 3D4CA 1I6QA 3RGYA 2Q8JA 1Y20A 5H8HA 4LUBA 3TCFA 3OO9A 3TDJA 4ZEIA 1CB6A 1PB9A 3UP9A 3CFLA 3G3JA 3MP1A 2X26A 3B6WA 4BDMA 5DEXA 1Q1KA 1FQFA 3MAMA 3CSGA 1B58A 2DP8A 4NF8B 2DYXA 5JTYA 2QMXA 1YTVA 3W9VA 3FZVA 1PC3A 4OEUA 2UVJA 1Y3QA 3QAXA 5A5XB 2A5SA 4R73A 5KDTA 1SW5A 4FEDA 2AL5A 5H8FB 3MVWA 2FNCA 3N6UA 4WEPA 2DVZA 4F3BA 1LB9A 1MPCA 1KWHA 2PYYA 4P11A 1FTLA 2XX9A 4H5GA 4H8JA 3FV1A 3PPNA 2Z22A 2UYEA 1B4ZA 3VLVA 3FVNA 3IR1A 1DMBA 3K4UA 5HBCA 1MPDA 4OESA 3E4RA 3MVYA 1EZPA 2I3VA 1I6AA 4G77A 1Q35A 1B05A 2DOJA 4H5FA 1LB8A 1OQHA 3K6WA 2NUVA 5CRYA 2UVIA 4MH5A 3ONMA 5FHMA 3O28A 4EQ9A 3TKDA 3KN8A 3FUZA 1MXZA 2ZYOA 4ZZEA 2F6PA 5AA4B 3VVFA 3ODBA 2DXYA 5EHSA 4QHQA 3M3KA 5CBSA 4ZDMA 5AA2A 1FCKA 4U4SA 1MXXA 2QL3A 1PDAA 4K3FA 2HCAA 1J1NA 3EHUA 1N04A 1H3DA 4ZE9A 2FA7A 4GLIA 4YMAA 3KJ7A 3O97A 4HTGA 4ELPA 2X7PA 4DCXA 5B70A 3MQ9A 3U93A 3TPAA 4LZ8A 5L9OA 3IOTA 2Z8FA 4EQ7A 1Y3PA 4U23A 4DCYA 4U4XA 1LBBA 4QSEA 1FQDA 4XKRA 1Y1MA 1NL5A 3EPEA 3O2AA 1A99A 4HS7A 2HEUA 3RT6B 2HXWA 4ECFA 1B3LA 4QFKA 3FGSA 2AIXA 4QF9A 4KYDA 3O6HA 4DE8A 2CMOA 1ELJA 4KFQA 2V25A 4R6HA 5I58A 3TELA 4NWCA 5FHNA 4F1UA 4ELRA 4OFJA 4PETA 3U72A 2Y84A 3S9MC 4LONB 3O6IA 3IOVA 4YAHX 3EQ1A 3IOWA 3V83A 3CFZA 5HM4B 4NE4A 1DSNA 1LSTA 1Z7ME 4GFRA 3M3LA 2HQ0A 3U92A 3PPPA 2DQVA 3K1MA 3BFUA 1NH8A 2QJEA 1POY1 2REJA 5H8QB 1ZIUA 3TTKA 5DVIA 4AQ4A 1MS7A 5KZTA 5H8NB 3S4UA 3C9HA 2WKYA 3HHGA 2Q88A 4F29A 1SVXB 3OSRA 2V3TA 1B51A 2REGA 3K01A 2M8CA 3UIFA 2PBWA 4RYAA 1GGGA 1MQJA 4MLQA 3CI8A 5L8DA 5EHMA 4F3PA 2XX8A 4PFWA 5I56B 4NF6A 4I8CA 2QMWA 4RXLA 3B7DA 3M8UA 1B40A 1N76A 4IY5A 4Q30B 3EF7A 1LFIA 3HO7A 4JSOA 4GXAA 4Z0IA 4F19A 2OK2A 3SKPA 4BDOA 3PPRA 1MQGA 1PBQA 1UTHB 5ITOA 1SQYA 1A54A 5K2XA 3G3KA 5IAIA 1B7HA 1MQHA 2ABHA 4EXKA 2QS2A 2F35A 2I49A 4O3CA 4EF1A 5F7VA 4F22A 3FXUA 3OD7A 4H1XA 5LOMA 3K2DA 1VSOA 5TP9B 3ZS6A 3C33A 2UVHA 4BLAA 4IY6A 5CMMA 4M1VA 1B5HA 3KBRA 2RC8A 1P1UA 3OOAA 4C1UA 1B3HA 3MPLA 2Y7KA 4GL8A 4IO3A 3JZJA 3L6HA 4OFLA 4H0WA 3ILTB 2F7BA 4OFOA 2ANJA 4EDPA 4DZ1A 4EXLA 2RCAA 1ZBMA 5KCJA 4TOZA 1XHYA 1VFEA 3O6GA 3JYRA 3SDFA 4FIMA 3MC2A 1N84A 4EUOA 3T66A 1MG1A 2ONRA 4PP0A 4JSDA 1SBPA 1P1OA 2OJTA 3OEMA 3FVOA 2I6EA 4M4GA 1D3KA 3VLUA 3MVXA 2QS3A 1DPEA 3GZGA 3FATA 4ZZAA 1O7TA 1JNFA 1XOCA 1TWYA 4LATA 4OZ9A 1M5DA 1QKBA 2UXAA 1FQAA 4XTCQ 3PU5A 2VP1A 3R7XA 1BTJA 4R6YA 3OO7A 4R74A 3N26A 1MXVA 4NMYA 3AXFA 1L5TA 5ICTA 4QFPA 3H6VA 3OO6A 3EN3A 1UTBA 1FQCA 2O1MA 1ZKBA 1YAEA 1MY4A 3KSXA 3IJOB 4OENA 3LC8A 2OBGA 2A5TB 4R6KA 3PD8A 1R1NA 2Z8DA 1A8EA 5JK4A 2Y7RA 3LSLA 4THIA 3MPKA 4ELOA 4GF8A 1SW2A 5I59A 1MPBA 4G8HA 3KEIA 1UQWA 1ZMGA 3PD9A 2QS4A 2Q89A 3PUXE 3C35A 4DIGA 4FATA 1URDA 3IL1B 2ESNA 4ISUA 4ESXA 4G8MA 1IQ7A 1Y4TA 3I3VA 2NOOA 3UGWA 4Z7EA 4NF4B 4RY1A 3VFJA 1MY0A 3EHSA 1HSEA 4YZZA 3QK6A 1UIVA 2D5WA 1QKAA 4OHNA 1OLAA 3TCGA 4F31B 3PPQA 3PGFA 3PUZE 1MQDA 1USYE 1JVYA 4GOTA 1IITA 3L6GA 1N3XA 1HSLA 4PE5B 3G3GA 2D21A 1FQBA 3MVZA 5JEIA 1T0KA 3IJXB 3KOSA 2V93A 4DXUA 1OQGA 2OZZA 3LR1A 1QJMA 4RPNA 1USYH 1B2HA 4X48A 4U1OA 1UIUA 2PVUA 3SEYA 3TEPA 2RCBA 3S9NC 4I9DA 4NF5B 4YB6A 2GHBA 4KI0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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