2AIXA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-thio-atpa at 2.2 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct kinetics of ionotropic glutamate receptor 2 splice variants characterized by fast agonist application and crystallization of a receptor-ligand complex.
rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2aixA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2aixA02
2WKYA 3FXUA 4F1VA 4NF5A 3HCQA 4G8HA 3O6GA 2O6AA 1SW5A 2UYEA 2O84X 1IQ7A 1Y1ZA 2R6GE 1B05A 5HBCA 4FJPA 4H0WA 3E3KA 2QS2A 4KYSA 5AA4B 4ELQA 3VVEA 3SESA 2P2AA 2DWAA 1JQFA 5ELVA 1MY3A 3TUSA 3K2DA 1RYXA 1BIYA 1FW0A 3H4ZA 1B58A 1AOVA 2XX7A 2D21A 5L9OA 4BDOA 3CVGA 1N7WA 1B3HA 2YJPA 2V3TA 3A3CA 3K1MA 4N6PA 3LBSA 4GXSB 4BDNA 4GXAA 2UVHA 3T9HB 4ZE9A 3B6TA 1NH8A 1ZJLA 2XXPA 4I1DA 2O51A 4ZZAA 1MY4A 3ODBA 1A8EA 2G93A 4ZE8A 1F9BA 2DP8A 4F31B 1A99A 1I6AA 2NVUB 5DVJA 1Q1KA 4HCYA 3MP6A 4ZEFA 3N6TA 2D5WA 4OVJA 4ESWA 3TTKA 1I6BA 3RT8A 2V3QA 4YKPA 3RN8A 2PT2A 5CMKA 5J1DA 4YKIA 1A40A 1IUDA 3Q28A 1LAFE 4JSOA 1PB7A 2OLBA 3DM0A 4O3BA 4YMAA 4YKJA 5EHMA 3SEUA 2QRYA 4F29A 3Q25A 1VE4A 2F7BA 2DE4A 2GFEA 3HV1A 2HQ0A 5AA2B 4AB6A 1ZU0A 5DEXB 3T9UA 4ISUA 1PB9A 2OCUA 2Y7KA 3TTMA 4U2RA 2O68A 2DE3A 5ICQA 1S9TA 3TCGA 4GOTA 4OETA 2Q8JA 4LQ2A 2XXYA 4BDMA 3MP1A 5FTIA 3O6IA 1B5HA 3C32A 4K3FA 1FTLA 2DVCA 4QFLA 2KLFA 4KYEA 4YU0A 4LQ5A 4BLAA 4H8JA 2HFBA 2DSFA 3K6XA 3EHUA 3L6GA 3IJOB 2ZNTA 4KYDA 2F36A 4F3BA 3F11A 3R26A 4IGRA 2RC9A 2HXWA 5H8QB 4YB7A 1POTA 1FTOA 2V93A 1DTZA 3U94A 1ZMGA 4GD5A 4KHZE 4H5GA 3T22A 2O7UA 3C36A 4BDLA 2UVGA 1EZPA 2QL3A 4MBPA 3IL1B 2REJA 2Y7IA 1UTHA 5I2NA 3S4UA 1S7YA 2ZNUA 1H43A 3PMWA 1JW5A 3CR9A 1IIWA 2FA7A 4QSDA 4EUOA 2ANJA 3TCHA 4EDPA 4DXCA 4AB5A 4OENA 4XKQA 3T9VA 1BLFA 2HZKA 2B3FA 4LZ7A 1A7LA 2RCAA 3K02A 4MLVA 4NMYA 1M5EA 3H06B 4DXUA 1B51A 1B3GA 3LUYA 5F1QA 4DIGA 2XXTA 5I59A 4U23A 5TPAB 2X7QA 1Y20A 4PQJA 2I49A 3O66A 1CB6A 3FJ7A 3MVZA 1GVCA 5DVFA 1NNTA 1SVXB 2Z23A 2XXQA 1CE2A 4F1YA 3MZ1A 1B52A 1QULA 3TAJA 3ZSFA 1Z7NE 2OZZA 1LCTA 4LATA 4RK9A 2Y7PA 2F6PA 4LP2B 1MQDA 3PGFA 5I2KB 4KCCA 2OJTA 4GF8A 5JTYA 3MZ9A 4G8NA 2DOJA 3QAXA 4TQUQ 1USYH 3PD9A 2A5SA 2PX1A 3QXMA 3T96B 3CI8A 3G3IA 1LCFA 3FIRA 1JVXA 2AYSA 5B70A 4N07A 3HO7A 4OFLA 4IO3A 4G8MA 1OQGA 3V83A 1URDA 1B0HA 3KJ7A 3H7MA 1LBCA 3P7IA 4ZEKA 2XX8A 3QK6A 5L8DA 2HZLA 2BJJX 4Z0IA 3H6TA 3GZGA 4X1DA 5I84A 2FNCA 3TQWA 1M5FA 3MQ9A 1N84A 1QJMA 1OVBA 5AA4A 3OOAA 2Z8EA 3H6UA 1IXCA 3RT6B 4H1XA 1H3DA 1UIVA 1NNFA 4X48A 2F97A 2DXYA 2F6GA 2B65A 4DLDA 2NUVA 1PBQA 4F2OA 3HN0A 3K1NA 5JEIA 2Y84A 1UIUA 3MJNA 5FTHA 1XT8A 1ELJA 2Q88A 2H4IA 3IOTA 4EXLA 3D4CA 1FQCA 4R74A 3SEXA 2ZMBA 2Y7WA 3IOWA 2QS3A 3PPNA 3G7WA 3MAMA 3A3UA 3RNNA 3B6QA 3MW0A 1US4A 1H45A 3TQLA 2G29A 4QSEA 5K2YA 2AL5A 3OO7A 3PPRA 3ZKLA 4MH5A 4G68C 3O28A 3W9VA 2ONKE 1B32A 4G77A 3S2VA 4IY6A 1MDQA 1N76A 4U22A 1B4ZA 1SW1A 1PDAA 3OEKA 2XHDA 4F39A 1SW2A 4I62A 2E1SA 3FV1A 1H76A 4P11A 3V89B 4HTGA 1EU8A 4OESA 2NXOA 5AA2A 5DEXA 2HAUA 4R6YA 4IO2A 1LAXA 4UA8A 3IR1A 5K2XA 1MDP1 3THIA 4X9TA 3RPWA 2DWJA 3JYRA 1NH7A 4IO4A 4ZZEA 2DWIA 1NL5A 2DVZA 3FJGA 4KQPA 1LFIA 4G2ZA 2AIXA 3CFZA 3IX1A 2M8CA 3IAZA 5KCJB 3M3LA 3FVKA 3B7DA 3OSRA 4IO6A 3TELA 5KDTB 3PV0E 4F1UA 2XD3A 5M2VA 2HEUA 2H99A 4ESXA 4H65A 1O64A 3O6HA 3RGYA 3DP8A 5H8QA 1AL3A 4EF1A 3LC8A 3U92A 1LLSA 4OWDA 4GFRA 1TFAA 3K01A 4GWOA 3KN3A 3FGSA 4P0IA 1JETA 4E0WA 3VXCA 4R2BA 3FVNA 5DVIA 4JXIA 4QFNA 1DOTA 4P0GA 2XXVA 2UVJA 1B7HA 4TLLB 4ECFA 1URSA 1PC3A 3UN6A 2V3UA 4WEDA 3KN7A 4R9FA 3VLUA 3W15C 4ONYA 3EHSA 2OWTA 4LA9A 3EPEA 3LSWA 2XD2A 1EZ9A 3QYTA 2ABHA 3EQ1A 1MXXA 3TODA 3K00A 4GL0A 3FUZA 3TKDA 4GVOA 4LZ5A 2LAOA 5TPAA 1OMPA 1Y4TA 1MXUA 1LGBC 3K0VA 2OWSA 2DXRA 3HPIA 4IGTA 1SBPA 2I48A 5H8HB 1R9LA 4OYVA 3MPLA 3O2AA 4H67A 4PETA 3PPQA 1B40A 4L17A 2I58A 2REGA 1PBPA 2ALUA 3FASA 1FQBA 2ZYNA 1Z7ME 2XXIA 4QHQA 4XKRA 2Y7RA 3UK4A 3LSXA 5I2KA 2ONRA 5DYHA 1WODA 4DDDA 4I9DA 1MPBA 3S9NC 3LR1A 3MVXA 5AA1A 2V25A 1MH3A 2I3WA 4NE4A 3FVOA 5CM6A 1PB8A 4XXUA 1AH5A 2XXXA 4DCXA 1MM7A 3T93B 2CZLA 3RY3A 2VD3A 1MQJA 4GLIA 4DXBA 3U93A 1B3FA 3M8UA 2A5TB 3OO8A 4IB2A 4I8CA 4QRZA 3IOVA 4GQOA 1QKBA 3JZJA 3QUJA 2DQVA 4G4PA 4JBZA 3VVDA 3OO9A 1R1NA 1B3EA 2VGQA 1O63A 3PPPA 1S50A 1XC1A 4U4SA 4X1BA 2P1SA 4F19A 5TP9B 3O97A 1M5DA 4U21A 3R7XA 4KR5A 3PU5A 5ITPA 3CSBA 3KOSA 4OMBA 2ONSA 1SI1A 1MY0A 1RYOA 3S9LC 4NF8B 3PUYE 3ONMA 4MFIA 1OLCA 5A5XB 1NKXA 4H6DA 5B7DA 4H8IA 2Q89A 2HCAA 3C35A 4O3AA 4N13A 2QS4A 5ISUA 3QUFA 4Q30B 3V8XB 2I4BA 1GV8A 4OEVA 1MG1A 3IORA 4F3SA 3I3VA 3PUVE 4HCWA 1SQYA 2XX9A 4FORA 2AL4A 5ITOA 3KGCA 3IB0A 4TLMB 1MQHA 4ZEIA 1TT1A 4JWYA 1OQHA 3VLVA 3VLWA 4C0RA 4LONB 5FHNA 5I58B 3H03A 1DPPA 3OD7A 3UORA 4C1TA 1IXHA 1JVYA 1TFDA 1LB8A 1B1XA 1Y3QA 2GHAA 1R6ZA 1MXWA 3FVGA 5AE4A 2FYIA 3IB1A 3C4MA 2PBWA 1HSLA 5CBRA 1SI0A 4QFOA 4NWCA 3DELB 1MRPA 3C34A 1MY1A 1TWYA 3GBAA 3FD3A 4NEDA 1JW4A 1XS5A 4YKKA 4F22A 1P1NA 4U1OA 4G68B 4KPTA 2DE2A 2CMOA 3CSGA 2ZYMA 4PFYA 1B3LA 1UTBB 3I6VA 4DCYA 1SW4A 4U4XA 4ELOA 5F7VA 3CFLA 1KWHA 5I57B 2ZNSA 1B7ZA 3K6WA 4XTCQ 4DE8A 1IITA 1Y9UA 1SDXA 1D9YA 1QW0A 1MS7A 2H5YA 1Y4CA 1LSTA 3KOTA 3SERA 4RPOA 2E0SA 4RYAA 1AMFA 3MBPA 1SD3A 4IY5A 3SKPA 1LBBA 5KCJA 4XKNA 2QSXA 1B6HA 1A8FA 1MXVA 5CI5A 4PFUA 3TTNA 1T0KA 2F34A 1XVYA 1L5TA 3B6WA 5KDTA 4ZDMA 4IO5A 4E0XA 4RY1A 1GGGA 4EF2A 1D3KA 3TEPA 3T66A 2DYXA 2Q2CA 1D4NA 3FXQA 1DPEA 3OENA 1QUIA 2VOZA 4RNSA 1N0TA 1YTVA 1I69A 2Q2AA 3VVFA 4PP0A 3DP6A 4ZS9A 5H8FB 2H98A 4WXJA 3LSFB 1WVJA 2YPNA 3N5LA 4QFPA 4YICA 3ECRA 1Y1MA 1MXYA 1B0LA 3OSQA 4KI0E 4OFOA 2RKMA 2V84A 1P1WA 2OK2A 4NF6B 2ZXTA 3TPAA 3SDFA 5H8NB 1BTJA 4QF9A 4BDRA 3BKIB 3N6UA 3OEMA 1HSJA 1MH4A 1NFTA 4FAJA 4OFJA 1B2HA 1XVXA 2OBGA 1ZBMA 4JDFA 1M5CA 5BWJA 5H8HA 2Z22A 3RTWB 5HM4B 3TTLA 3M3FA 2O1MA 1AIVA 3MVWA 1MPCA 3IO4A 5LOMA 3G3HA 3IO6A 4BDQA 1H44A 1DTGA 3PUWE 1ZIUA 2B3BA 2I6EA 5CMMA 4QFKA 3KN8A 1LFHA 4M4GA 2F7CA 3PUZE 1MQIA 3O29A 3OELA 1FCKA 2I4CA 3TDJA 5KZTA 4NF4B 2IEEA 2ZYKA 3M3KA 3ZKKA 1LAGE 3KBRA 1BP5A 2A5TA 3I5OA 1QKAA 4M1VA 1YPNA 5FHMA 5IAIA 3GXAA 2Z8FA 4YZZA 5IKBA 3TZAA 1FTKA 3WAEA 5CC2A 5TP9A 4PE5B 3C31A 1JEVA 5I56B 1P99A 4R6HA 4OQOA 2H25A 1UQWA 4NF8A 4C1UA 3KJTA 3VXBA 5A5XA 1IEJA 3S9MC 1SYIA 3IJXB 3HHGA 3A09A 1JW1A 2QJEA 1RKMA 2PMSA 4Z7EA 2HAVA 5TU0A 3UIFA 1MXZA 1J1NA 1ZLQA 2P0SA 2O7IA 2W7YA 3RLFE 1B1HA 1BKAA 3SEVA 1VFEA 5DT6A 2O1LA 5I58A 2UYFA 2NOOA 1D9VA 4TOZA 4JWOA 4F3GA 4LVQA 1FTMA 3SEWA 3VE1B 1B4HA 1QUKA 3E13X 1LB9A 3PD8A 4R2FA 5H8SA 2O69A 4LZ8A 1FTJA 4YB6A 1ZTYA 3DP4A 1ZKBA 1VFDA 2F78A 2QS1A 1DMBA 5HPQA 3KG2A 3CFXA 5AA2D 1MM6A 1ANFA 3FV2A 4FECA 3FZVA 1Y3PA 4YB5A 4YAHX 2F5XA 3CRBA 4JSDA 2X26A 3UP9A 3IK6B 2UXAA 3G3JA 4G68A 3N26A 3GLBA 1Y3NA 2DS9A 4DZ1A 3D4GA 2D3IA 1UTBA 1N3XA 2I3VA 2RC7A 4NF5B 3Q29A 1OVTA 1B5JA 4RA1A 3ZS6A 3G3GA 5JK4A 3MVYA 3KZGA 3HSTA 2F8DA 3UGWA 4ZEBA 4QSCA 1MY2A 1I6QA 5I57A 3JV9A 2F35A 3C33A 1YAEA 2Z8DA 3Q26A 1FQFA 2R71A 3QIMA 1IXGA 4EXKA 2VD2A 3GBBA 4O3CA 4F3PA 4LUBA 4FEBA 1MQGA 4KFQA 2ZYOA 3T9XB 3EN3A 3K1PA 4FE8A 4AQ4A 2RINA 1QUJA 1NMUA 4XIGQ 1IZ1A 1HSEA 3BBRA 4OTEA 4OEUA 3AXFA 2IA4A 3EHTA 4U1ZA 3BFTA 3IOUA 3PMVA 1B7UA 1IXIA 4R73A 2VHAA 2ESNA 3USDA 1EZOA 4ZECA 2PYYA 2XXWA 3S9EA 3ILTB 4R72A 1Q35A 5H8FA 4OHNA 4HS7A 4NWDA 3VFJA 3TMGA 3WAFA 4RK2A 3MPKA 5BUUA 1JEUA 4ZEDA 3VV5A 5CRYA 1II5A 4NF6A 4NTLA 3N94A 2XXRA 2F7AA 3KFMA 5H8NA 3G3KA 2PT1A 3IB2A 3PPOA 1US5A 5AA3A 1B9JA 1OLAA 4GIZA 3FJMA 3RUMA 3TTRA 5CMCA 4ELPA 3DLNA 1VSOA 4PFWA 4FIMA 3R6UA 3EF7A 5CMBA 1ATGA 4EQ9A 3ILUB 2UVIA 1FQDA 3RTFB 1OIBA 1P1OA 2RCBA 1P1UA 2GH9A 2I0BA 5CBSA 4PFTA 3LSLA 3CIJA 3SETA 1YCJA 4ELRA 1NNPA 2PVUA 1SYHA 4RJZA 3OMBA 4Q8RA 2GHBA 4THIA 4IO7A 4EQBA 4Q0CA 4EQ7A 3U72A 4ND9A 1USYE 2Q9TA 3PMXA 4RXLA 4Q5TA 4NF4A 4XKPA 4OERA 3FXRA 1N7XA 2R9JA 2YLNA 1DSNA 3V5AA 3K6VA 2GRVA 2XXHA 2NWJA 3H6WA 4JB7A 2I0CA 1M5BA 2XXUA 1LFGA 3TFLA 4YMBA 3CG3A 4JWXA 3PUXE 1N3WA 4H5FA 4FATA 4RPNA 1B5IA 3KSXA 1N04A 1JNFA 1B46A 5I56A 1UTHB 4R75A 5I2NB 5L9SA 4FEDA 1FQAA 2QMWA 3C9HA 3SEYA 1EH3A 1O7TA 1URGA 1LAHE 3CG1A 3KEIA 4GL8A 4UACA 3H6VA 5L9MA 5DTBA 1PEBA 1XOCA 5EHSA 4MLQA 2X7PA 3BFUA 1XHYA 3MZBA 4F18A 1VR5A 3L6HA 2RC8A 3KSJA 4R6KA 5ICTA 2RF1A 3UA8A 4POWA 3U8QA 1GR2A 4R9GA 3RQTA 5I59B 1NNKA 1A55A 1A54A 1R9QA 4POXA 4KCDA 4WKMA 2VP1A 5FHOA 2THIA 2QMXA 3E4RA 1TXFA 3E9XA 3OXNA 4OXVA 3FATA 4KD5A 3MP8A 3H3GA 2DWHA 3O9PA 1P1QA 3K4UA 3MWBA 3Q27A 4GRKA 3TCFA 3G3FA 1MPDA 3MC2A 4F2QA 3HHFA 1GTKA 2QPQA 5JTYB 4HW8A 3K6UA 4WEPA 1QVSA 3VDFA 4OZ9A 3OO6A 3U1OA 1WDNA 5EYFA 3W9WA 3QSLA 1FQEA 1POY1 2H9BA 3MUQA 3TYHA 4MF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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