3B6WA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) t686s mutant in complex with glutamate at 1.7 resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTSAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural and single-channel results indicate that the rates of ligand binding domain closing and opening directly impact AMPA receptor gating.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6wA02
3FV2A 1J1NA 3SEXA 2THIA 4Z7EA 2V25A 1Y3NA 2CMOA 2ZYMA 1MH3A 4ZDMA 5AA2A 1B7UA 4OQOA 3TFLA 3FVGA 3DP6A 4OEVA 3IO6A 3PV0E 3QUFA 4FAJA 2DVCA 1LCTA 4R75A 1N04A 4ZEBA 3E4RA 2OBGA 3PPPA 2GHAA 1N7WA 1MQGA 3MUQA 3KN8A 3S9EA 2HFBA 2AL5A 4ELQA 1PDAA 3FVNA 3EN3A 2FA7A 3KOSA 1I6AA 4LUBA 2PVUA 2Z8DA 4PFWA 4RK2A 1QVSA 4GXSB 2I4BA 2RC8A 3ZS6A 2XXPA 3N94A 2RF1A 4GXAA 4QFLA 1P1NA 3VFJA 4F2QA 1YAEA 1JVYA 4NF4B 1PB7A 3I6VA 1T0KA 3PUYE 4G77A 3H06B 1D3KA 3TDJA 4LA9A 3VVFA 1Y3PA 4GOTA 4OETA 4Q8RA 4QFPA 2QJEA 4GL0A 4TLLB 3SERA 2F7BA 3IJXB 3KN7A 1P99A 1LAHE 1S50A 3RN8A 1NH8A 4OFJA 4QHQA 4BDQA 1MXZA 2YJPA 1A55A 4MH5A 4U22A 3HSTA 3ZSFA 2REGA 2QS2A 4GRKA 2I4CA 3H03A 1B6HA 2ONKE 3R6UA 5I57A 3VVEA 4QF9A 1XT8A 5CRYA 3QYTA 3FD3A 4G8MA 1WVJA 1CB6A 3O9PA 4UACA 4R73A 4H8JA 5I56A 1M5EA 4ONYA 4WEPA 4LONB 4IO6A 3EQ1A 1LBBA 3GLBA 1MQHA 2O7IA 1OLCA 1UTHB 4YZZA 3HV1A 2O1MA 5H8HA 2Y7RA 1B7HA 2B65A 2QPQA 4E0XA 4F18A 5BWJA 1FTKA 1XS5A 3KJ7A 4OEUA 1QKBA 3VDFA 3TUSA 1SI0A 3MQ9A 3V8XB 2XXXA 3OO7A 2QL3A 3UN6A 3IOUA 4ZZEA 5H8NB 3DELB 1ZIUA 4ZECA 2DVZA 4HCYA 5I2NB 4I9DA 1Y20A 3N6UA 4H1XA 4ZEDA 4RPNA 2PT2A 3ILUB 1LAGE 1D9VA 5ITPA 2I3WA 4QSDA 5KCJA 5AA4B 2I49A 1ZBMA 4IB2A 2ZMBA 3OSRA 4LZ5A 3RQTA 4YB6A 2HEUA 2V3UA 4R2FA 3M3KA 3Q28A 4R6KA 5LOMA 1LBCA 1ATGA 3PPOA 1MPBA 4OTEA 1POTA 3QSLA 3N6TA 4N07A 1FQEA 3SESA 3Q25A 1N76A 4RK9A 3B6QA 1JW5A 1FW0A 5DEXA 3QXMA 5H8FA 3ZKKA 2HQ0A 2O69A 1MRPA 4O3BA 1O63A 4BDLA 2RCAA 2XXWA 4AB5A 4EXKA 3T96B 1LLSA 4EQ9A 3C35A 5IAIA 1Y4CA 4R72A 1KWHA 3FXQA 4BDOA 1NMUA 3U72A 3ECRA 1EZOA 1IITA 3OD7A 2DOJA 4ZS9A 1Z7ME 3IX1A 2H98A 3DLNA 1CE2A 4F22A 2UVIA 2ANJA 1USYH 3OMBA 2YLNA 2NUVA 1OMPA 1YTVA 3USDA 1H76A 3FUZA 4NWDA 1LFIA 4MLQA 4THIA 4N13A 5KDTA 3OELA 2H99A 1MXYA 2HZLA 2VOZA 1AH5A 3Q26A 4LATA 4FEBA 4BDMA 5EHSA 2QMXA 1I6QA 1VFDA 3MVZA 1SW4A 2D3IA 2VHAA 3THIA 3G7WA 1B7ZA 2ZNUA 1EH3A 2B3FA 5AA3A 5B70A 1IQ7A 1A99A 3SKPA 4EQBA 3PMVA 3ODBA 1GGGA 4X9TA 1IZ1A 5CBSA 1SYIA 4LZ7A 1QULA 4NTLA 3IL1B 4C0RA 4AB6A 2ALUA 1SD3A 3PD8A 1L5TA 1WDNA 3UIFA 3GXAA 4F1UA 4KCCA 1RKMA 2AIXA 4FE8A 4PP0A 3PMWA 3TQWA 1FTLA 3T9XB 2F78A 4ECFA 3MWBA 5I58B 2REJA 3EHUA 4OVJA 3VXBA 4YMBA 2QMWA 3QUJA 2F7CA 3MJNA 2VGQA 1B2HA 3TTRA 5L9SA 4TOZA 4R6YA 1NH7A 5AA2B 5L8DA 3KFMA 4ZEKA 3IB0A 3IR1A 3PUXE 1MPDA 2DE2A 3RGYA 3Q29A 4IO5A 4ZE8A 1B1HA 1O7TA 3UK4A 3C34A 5CC2A 2DXRA 3S2VA 1EU8A 3G3FA 1B05A 3QAXA 4GL8A 3FJ7A 1B3FA 4FECA 2UXAA 4XXUA 2A5SA 2I6EA 3K0VA 4R74A 1A7LA 1Y1ZA 5DVIA 4OXVA 4PETA 4F3SA 4EXLA 5DVJA 1LB8A 3SEUA 4JWXA 2A5TA 5FHMA 1B9JA 1JW1A 3ONMA 3PUWE 1LFHA 2ABHA 3TCFA 4NF6A 1H44A 1NL5A 4MBPA 3VXCA 3VVDA 1B32A 4F19A 4KQPA 3RPWA 5CMKA 3TEPA 4H8IA 1FCKA 3OEMA 4H0WA 2P2AA 1XVYA 1MXVA 4GWOA 1DTZA 4RA1A 2H25A 3E9XA 3KSXA 1OIBA 3MVXA 1A40A 2XHDA 3M8UA 5ITOA 4YKIA 4POXA 3TAJA 5CI5A 4PQJA 2O68A 1B3HA 4Q0CA 4NE4A 5AE4A 4DCYA 4IO4A 1Y1MA 3M3LA 4H5GA 3G3GA 2I0CA 2I0BA 4OMBA 1MDQA 4IY5A 3L6HA 5I57B 5K2YA 4L17A 4WEDA 3TTKA 4FATA 4YMAA 3S9MC 1NFTA 1R9QA 2QRYA 3RTFB 2F36A 1ZKBA 2IA4A 5I56B 4RYAA 1IXHA 1TXFA 4RNSA 4KFQA 2OLBA 4YKJA 3IO4A 1VFEA 3LSLA 3LSWA 3B7DA 5H8SA 4XKPA 3CG3A 3TQLA 5H8HB 3FXRA 1Y3QA 2GFEA 2DE4A 4DIGA 4OWDA 2XD3A 3RUMA 1MY4A 2F8DA 3VE1B 1IIWA 3A3CA 4R6HA 3OSQA 4NEDA 1MH4A 1URDA 3MBPA 3K1MA 1TT1A 2NVUB 1P1OA 4ELPA 4F3BA 3FATA 1GV8A 1M5DA 3KZGA 4ZE9A 1UIUA 4IGRA 3OOAA 3IOTA 1B0HA 2DP8A 3PU5A 2H9BA 1WODA 1RYOA 5IKBA 1YCJA 2QS1A 5KCJB 3BBRA 3PUVE 2OZZA 4G2ZA 3CIJA 1B3LA 3W9VA 2QS4A 2DSFA 3TKDA 3U93A 4YKKA 4PE5B 2X26A 2PX1A 4HTGA 4YU0A 4JBZA 4F3PA 2CZLA 1URGA 2D21A 4O3AA 4F1YA 5A5XB 3IB2A 2P0SA 4ISUA 2GH9A 2Z22A 4OHNA 5HBCA 4XTCQ 1JEUA 3HO7A 1PBQA 3KGCA 1MQJA 1SW5A 4HS7A 1B3GA 5EYFA 5DEXB 5H8FB 5B7DA 2RKMA 3CR9A 1TFAA 1XHYA 3K4UA 1DMBA 3PPQA 4DLDA 1SDXA 1US5A 4TLMB 3PGFA 4IGTA 1OLAA 4DCXA 1FQFA 3M3FA 3K1NA 1Q35A 3LC8A 5M2VA 1ZTYA 3H6WA 2DS9A 4NF8A 4G4PA 3TMGA 2XXUA 1QUJA 1IEJA 3FJGA 4DXCA 3WAFA 1BP5A 2DWHA 3R26A 3IAZA 3KBRA 4GIZA 1USYE 4I62A 1XVXA 2V84A 3V83A 3H6UA 3OEKA 2Q2CA 3R7XA 5KDTB 2R71A 1Z7NE 5DVFA 1I6BA 5JEIA 5L9MA 2HAUA 3H6VA 2HAVA 3SDFA 4NMYA 4HW8A 1H3DA 2Y7KA 4N6PA 2D5WA 3HHGA 3CI8A 2OK2A 1M5FA 4JWOA 3MAMA 3JV9A 3G3JA 4POWA 1PC3A 5CMBA 1HSEA 3MW0A 1SI1A 2ZYOA 3PPRA 1BKAA 3H3GA 1LFGA 3SEVA 2ZYKA 2Y7IA 4GVOA 3ZKLA 2AYSA 3BFUA 1LAFE 1BIYA 3FGSA 3PD9A 1QJMA 2PT1A 2Q9TA 3G3HA 1TWYA 3MPLA 3BFTA 4K3FA 2ONSA 2XXQA 4IO3A 1D4NA 1II5A 3DP8A 3K2DA 4F1VA 3G3IA 5CMMA 4EQ7A 4DDDA 1VE4A 2ESNA 3FV1A 1US4A 1B1XA 2UVGA 3RY3A 4X1BA 2DYXA 4M4GA 1PEBA 4EDPA 4AQ4A 1M5CA 3L6GA 5HPQA 3TCHA 2RC9A 4NF5A 3OENA 4QFKA 3TYHA 1MQDA 2UYFA 2ZXTA 3KG2A 1ELJA 5ICTA 1IXCA 1YPNA 1N3WA 5F1QA 2LAOA 5ICQA 3MC2A 4DXBA 4R9FA 1EZPA 3KN3A 3MZBA 3I5OA 3MPKA 4ELOA 3A3UA 5AA2D 1O64A 1DOTA 2ZYNA 1H43A 3UORA 3EF7A 3FASA 5TP9A 5AA1A 3TODA 2XXHA 1MQIA 3IJOB 3PMXA 4GFRA 2Q88A 1AIVA 4QRZA 2DQVA 2UYEA 2FYIA 1MM6A 4QFNA 1MXUA 5CBRA 2UVHA 3IORA 2A5TB 2DWIA 2VP1A 3VLWA 1S7YA 5I2KA 2Q8JA 4I8CA 4G68C 1UTBA 4NF6B 1SW2A 4U4SA 1R1NA 4GLIA 2ONRA 3V89B 1GTKA 4C1TA 3VV5A 5I84A 1URSA 4RJZA 3P7IA 3PPNA 1MY2A 3TPAA 3UA8A 4E0WA 1BTJA 1N3XA 4ZEFA 1SBPA 5F7VA 4LQ5A 4R2BA 3RNNA 4NWCA 3K02A 3O6GA 3DP4A 3O97A 1N0TA 2Q2AA 5TPAA 5JTYA 4R9GA 4X48A 3K00A 2E0SA 1QUIA 5I59A 5H8QA 1NNFA 1B40A 2OWTA 4DXUA 2H4IA 4RXLA 4H6DA 1DPPA 4P0IA 4JSDA 3D4CA 4G8HA 3U1OA 3G3KA 3DM0A 3OXNA 3IOVA 4U1OA 1IXIA 4C1UA 1H45A 2NWJA 2F34A 1N84A 2O51A 3C36A 1AMFA 4FEDA 3O66A 2DE3A 1NKXA 1SVXB 1XOCA 1Y4TA 2NXOA 2FNCA 4JWYA 4FJPA 3K01A 4JXIA 1POY1 2PBWA 4RY1A 2Q89A 2WKYA 2XXIA 2G29A 4MFIA 3JZJA 5FHNA 4U1ZA 3T66A 3GBAA 4PFYA 4WKMA 4G68A 4XIGQ 1AOVA 1RYXA 4BLAA 2XD2A 2QS3A 2NOOA 4QSEA 1XC1A 1MM7A 5KZTA 2F35A 1I69A 1FQDA 2OCUA 4KHZE 3T9VA 4ESXA 1QW0A 3SEYA 1B51A 3KOTA 4F39A 2BJJX 3CRBA 1MXWA 1FTOA 2VD2A 4KYEA 4QSCA 3LUYA 3A09A 3Q27A 3JYRA 1VSOA 5HM4B 2PMSA 3FIRA 3FZVA 5DTBA 4OZ9A 4YB5A 3TELA 3FVOA 3OO8A 4Q5TA 2Z23A 4O3CA 4Q30B 4KPTA 4FIMA 5FHOA 1OQGA 3E13X 1TFDA 4OYVA 2F7AA 3K6WA 3AXFA 2Y84A 4RPOA 4TQUQ 3H4ZA 2GHBA 3MVYA 3C31A 1SYHA 3HCQA 1JEVA 3F11A 3T9UA 1R9LA 3FXUA 3CSBA 3H7MA 4KYSA 3ILTB 5EHMA 3O2AA 2B3BA 3K6UA 3C33A 1MDP1 3S9NC 3KSJA 2O1LA 2OJTA 2G93A 2R9JA 2QSXA 3QK6A 1B5JA 2I48A 3HHFA 3O6HA 4IO7A 3BKIB 4NF8B 1NNKA 4JDFA 2HZKA 4YICA 1FTMA 3MZ9A 1JQFA 4X1DA 2OWSA 3EPEA 1OQHA 4YKPA 2RCBA 3MVWA 5FTHA 4NF4A 1LSTA 2V3TA 1B4ZA 2F6GA 4OERA 1LAXA 1UQWA 4QFOA 3K6VA 3T9HB 3RLFE 3KJTA 1MS7A 1NNTA 4WXJA 4OENA 2RINA 1ZMGA 3MP1A 4OFLA 3CFZA 2I58A 3C4MA 1QKAA 2XXTA 2H5YA 1P1WA 2GRVA 4F2OA 3N5LA 1M5BA 4YB7A 4DZ1A 4G8NA 1GVCA 3TCGA 1B5IA 1ZLQA 2PYYA 2KLFA 1Y9UA 3SEWA 4LZ8A 3TTLA 3HN0A 4BDNA 1F9BA 1PBPA 3EHTA 3U8QA 1A8EA 3HPIA 3MP6A 1OVBA 4P11A 1JETA 2F6PA 2XX7A 3RTWB 3FVKA 3E3KA 4UA8A 3KEIA 3D4GA 2O84X 4F29A 2Y7PA 3TTNA 4FORA 4I1DA 4HCWA 3WAEA 3T93B 1Q1KA 1MY3A 1P1QA 1PB8A 1UTHA 1A54A 3RT8A 1JVXA 4NF5B 4U2RA 5BUUA 4EF1A 3W15C 5K2XA 5A5XA 4BDRA 3OO9A 1ZJLA 2W7YA 4M1VA 5JK4A 3O6IA 4KI0E 1DTGA 3LBSA 4ND9A 1FQAA 4JSOA 5H8NA 3SETA 2R6GE 3S4UA 2V3QA 4GD5A 5I2NA 2P1SA 3IK6B 3I3VA 5TP9B 2DWAA 3GZGA 3FJMA 3K6XA 5J1DA 3O28A 1VR5A 1DPEA 1JNFA 1LGBC 1FQBA 5AA4A 5I2KB 3K1PA 1UTBB 4KCDA 3CFXA 1B5HA 2X7QA 1LCFA 1HSLA 4ZZAA 3RT6B 1S9TA 1DSNA 1SW1A 3V5AA 3VLVA 4ESWA 2F97A 2Z8FA 3LR1A 3PUZE 3IOWA 4PFTA 2HXWA 5CMCA 5TU0A 5TPAB 5JTYB 2Z8EA 5I59B 5H8QB 4LQ2A 4MF3A 4Z0IA 2AL4A 3B6WA 3EHSA 2YPNA 1JW4A 2VD3A 2RC7A 1B52A 5ELVA 3UGWA 4OESA 2XXYA 4KD5A 4P0GA 4DE8A 1A8FA 1B46A 2UVJA 4H5FA 2V93A 4XKNA 4U4XA 4F3GA 5CM6A 4GQOA 3CVGA 2I3VA 2ZNSA 3QIMA 3UP9A 1MPCA 1B4HA 3B6TA 1MY1A 4KYDA 3VLUA 2O6AA 3N26A 4OFOA 4F31B 2IEEA 1B0LA 2XX8A 5FTIA 2XXVA 1R6ZA 1P1UA 4EF2A 1PB9A 4U23A 1FQCA 3LSFB 1UIVA 4G68B 4IY6A 1MG1A 5L9OA 3CSGA 4PFUA 4LVQA 1MXXA 2HCAA 1N7XA 3OO6A 3T22A 4GF8A 1GR2A 3CFLA 1EZ9A 3MZ1A 4XKQA 4EUOA 1IUDA 3GBBA 3C32A 4LP2B 5ISUA 4MLVA 3H6TA 1LB9A 2X7PA 4U21A 3IB1A 4ELRA 1B3EA 2ZNTA 1HSJA 4H67A 1D9YA 3TTMA 2XX9A 2DWJA 2E1SA 1IXGA 2XXRA 3CG1A 4H65A 5DT6A 1QUKA 4JB7A 4KR5A 4ZEIA 3TZAA 1NNPA 2DXYA 1ANFA 2F5XA 1BLFA 1OVTA 4YAHX 3S9LC 5DYHA 2Y7WA 1B58A 2M8CA 3MP8A 3U94A 4XKRA 3LSXA 1AL3A 1ZU0A 1SQYA 5I58A 3U92A 3C9HA 4IO2A 3W9WA 1FTJA 1MY0A 2O7UA 3O29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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