1N7XA

Human serum transferrin, n-lobe y45e mutant
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASELDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title THE POSITION OF ARGININE 124 CONTROLS THE RATE OF IRON RELEASE FROM THE N-LOBE OF HUMAN SERUM TRANSFERRIN. A STRUCTURAL STUDY
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7xA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7xA01
4LVQA 1UQWA 2ZYNA 4ZE9A 3H06B 3HN0A 1FTKA 1DTGA 2F36A 4G68A 5DT6A 2B3FA 1SVXB 2XXPA 5H8HA 1B3FA 4G68C 4NTLA 3IJOB 2F78A 3N6TA 3ILTB 4ZEBA 2GRVA 2QSXA 1OQGA 4WEPA 1AIVA 3RT6B 4RK9A 1FQFA 2X7QA 5CMBA 1LCFA 1MDQA 2XX7A 4G68B 2HCAA 1ANFA 1CE2A 5H8HB 1Z7ME 3WAEA 2QJEA 3OD7A 1B5HA 2Q2AA 3VE1B 3G3HA 4EDPA 5H8FB 5IKBA 3PUXE 4KYEA 2XXTA 3BFTA 3FV1A 5DVIA 1UIUA 3UA8A 4JSOA 3OEMA 4IY5A 3MW0A 4KYDA 3PPNA 1A54A 3DM0A 2FYIA 3A3CA 2OBGA 3CIJA 3LC8A 4MBPA 3VLVA 1SD3A 4MLQA 3IB0A 1MY2A 3CR9A 4RA1A 2E0SA 3FZVA 4I62A 5CMCA 2M8CA 4NF8A 1LFHA 2DSFA 1T0KA 5K2XA 4NEDA 4POXA 4F3PA 1IXIA 4U1OA 4GXSB 1SDXA 1POTA 3S9EA 1HSJA 5M2VA 2F7AA 4IY6A 3K2DA 1FQEA 2O7UA 3MVWA 2H5YA 2Z22A 4LQ5A 3G3KA 1NH8A 1UTBA 3U72A 4RJZA 4YMAA 1DPPA 3KN3A 3Q28A 5HPQA 4OVJA 3KGCA 1H76A 5DVJA 2ZNUA 2P1SA 1SW5A 1JEUA 1DMBA 2XD2A 1H45A 1M5CA 2G93A 1WDNA 2Z23A 4EQ9A 3CSGA 1M5DA 4Q30B 1B1XA 1A8EA 4KD5A 1NNKA 3K6VA 3T9UA 3EHSA 3GLBA 4XIGQ 4F2QA 1FTMA 1B3GA 3O66A 1Q1KA 1URGA 3B6QA 3PUYE 4C1TA 3RTWB 4N6PA 2HQ0A 2RC7A 4QFKA 4AQ4A 1B0HA 5CMMA 4BDQA 3FJMA 3KJ7A 4F3SA 3TPAA 4RYAA 3PD9A 1N76A 4TLMB 3F11A 5L8DA 1AH5A 4TOZA 2DP8A 5JK4A 3Q25A 3HHFA 1ZU0A 2ONRA 2VGQA 5I2KB 4FJPA 1BTJA 4OWDA 3OSQA 2OCUA 4FECA 4PETA 3GZGA 4IGRA 1PC3A 4H65A 3H3GA 4R9FA 4ND9A 3TZAA 4C0RA 3JV9A 1MG1A 1GGGA 2Y7WA 1ZIUA 2O1MA 1MXVA 1MY0A 2HAVA 1TWYA 3Q27A 1MXZA 3C32A 1QVSA 4NF5A 1P1UA 2XX8A 1EH3A 3FGSA 4KI0E 4H8JA 1JEVA 1VR5A 5IAIA 1B58A 3V8XB 4F1VA 3MAMA 3TQWA 3E4RA 4LATA 1TT1A 1O7TA 3KEIA 2REJA 3PMXA 3CFLA 4HCYA 1M5EA 4NF5B 2F7BA 2IA4A 2H99A 2DOJA 3PD8A 3EN3A 1OQHA 4TQUQ 5AA4A 1GR2A 2O68A 4H6DA 2Q88A 2H98A 3EF7A 1B4HA 4GIZA 2PT1A 4ZZEA 3KG2A 2FNCA 1EZOA 1B3LA 1SQYA 1FQBA 3TTRA 4YAHX 3MWBA 5AA4B 4RXLA 1NFTA 1QUIA 2OWSA 3RPWA 1GTKA 1IXCA 1SYIA 3O28A 3TQLA 3R6UA 3K6UA 3FJ7A 4ELPA 3OMBA 2O1LA 3FATA 1Y9UA 2XXVA 3QK6A 1B7HA 4C1UA 4YU0A 1RYOA 2F97A 3C34A 2BJJX 4F19A 3TELA 1IXGA 1Z7NE 1A55A 2AIXA 3OELA 4LA9A 3RLFE 4THIA 4NE4A 3H6UA 3VVDA 4KYSA 4QFPA 5FHMA 1B6HA 4AB6A 3T93B 4R9GA 3D4CA 3ODBA 4IO4A 3K1PA 3O2AA 1GV8A 4GF8A 3I3VA 3VFJA 1JW1A 2I49A 2NVUB 1IIWA 1B0LA 5F7VA 2XX9A 3TCGA 3SEYA 1LFIA 3M3KA 4I1DA 4Q5TA 3HHGA 4BDOA 4Z7EA 5H8NB 2DWJA 4RPOA 3RN8A 4KFQA 4E0XA 3OSRA 2F5XA 3U92A 4GL8A 1JW5A 1D4NA 5AA2B 3OO9A 2I3VA 3TODA 3I6VA 1QKAA 1QW0A 3R7XA 4ELOA 1ZBMA 1IZ1A 3MQ9A 3C4MA 1Y4CA 3UORA 3K00A 4IGTA 3S9LC 5CBRA 4ZEIA 3RNNA 3B6WA 1DPEA 4X1BA 4U21A 1NMUA 4DZ1A 4RK2A 3T9HB 5DVFA 5AA2D 3BKIB 1FQCA 4XKRA 4R75A 3MUQA 1M5BA 2GHBA 3FASA 4LZ8A 4FEDA 2QMWA 3FV2A 1P1NA 2DXRA 4NF6A 3VVFA 1Y1MA 2HFBA 3MZ9A 1KWHA 3KFMA 1N7WA 3UIFA 3CRBA 5BWJA 1D3KA 1RKMA 4QFNA 1QKBA 1B5IA 2XXWA 1BKAA 2I0CA 4MF3A 4BDRA 3FXUA 5F1QA 4E0WA 2Y7IA 4R72A 4NF6B 3VXCA 1J1NA 1NNFA 5H8FA 5B7DA 4JB7A 5L9OA 4KCCA 1N0TA 3O97A 5FHNA 1OVTA 3TDJA 2THIA 4IO5A 2VP1A 1IITA 4BDLA 2D3IA 1UTHA 4JSDA 4O3AA 2AL5A 3DLNA 1SW4A 2GHAA 3PPOA 4WXJA 4HW8A 1XT8A 4ZS9A 3TEPA 1UTHB 2FA7A 1QJMA 4KCDA 4GRKA 4BDNA 1A8FA 3IOUA 3IR1A 5AE4A 3IB2A 5KZTA 4EF1A 2OZZA 1USYH 3SEUA 2GFEA 1MQDA 3JYRA 2D21A 4JDFA 1B46A 2I4CA 5FTHA 4R6YA 2ZYKA 3EQ1A 1SI0A 1WODA 3CFZA 4PFUA 4H8IA 1B1HA 4UA8A 1IQ7A 2RF1A 3RGYA 2Y7KA 4U1ZA 4OFJA 3USDA 1II5A 1MY1A 4ZEFA 4O3CA 3OOAA 3HV1A 2PBWA 1B52A 3H4ZA 1VE4A 3MVZA 1JNFA 2I6EA 1LBCA 2PYYA 1URDA 4PFWA 3TUSA 1DSNA 1MM6A 3U93A 4QFLA 4GQOA 4GXAA 3RY3A 2HZKA 3CSBA 1Y20A 2ZNTA 1I6AA 2ZYOA 1LBBA 4BLAA 1AMFA 1I6BA 2W7YA 1MPDA 2F7CA 1MXYA 4GFRA 1LB9A 3N94A 4X1DA 1I69A 2PX1A 3KOTA 1Y3NA 1BIYA 4XKQA 2DVCA 1OLCA 4GVOA 3N26A 2V3QA 4X9TA 2AYSA 1P99A 4GLIA 1Y1ZA 1XVYA 5ELVA 4BDMA 4ONYA 4H1XA 5I2NA 4NWCA 3DP8A 2Y84A 1Y3QA 2PMSA 4OFOA 5I2KA 1L5TA 4QSCA 3PUVE 1N84A 4OHNA 4IB2A 3MPKA 2I3WA 2QMXA 3KBRA 1LAXA 1TXFA 1SBPA 3OO7A 1TFAA 5I2NB 5ICTA 1PDAA 1ELJA 3PV0E 3W9VA 2R71A 3CG3A 4F2OA 4H5GA 3ZSFA 5KDTB 4U22A 5EHMA 4IO3A 2DWIA 1SYHA 2H25A 4RY1A 3EHTA 2F34A 3C31A 4F29A 3T9XB 4NMYA 1JVYA 4XXUA 3G3GA 4KHZE 4PE5B 2RC8A 2HEUA 4H67A 4ZEKA 1TFDA 1NH7A 2A5SA 3B7DA 3PMVA 4JWYA 2B3BA 3FJGA 2X26A 3PPRA 3PUZE 1B32A 3MZBA 1XS5A 4DCYA 1I6QA 1ZTYA 3IO4A 3W15C 3ZKLA 2XD3A 5B70A 3G3FA 4LONB 3QYTA 5KCJA 5EYFA 2O6AA 3K1NA 1UIVA 5CM6A 1B3EA 1FW0A 4F3BA 1XHYA 3CFXA 4ESWA 5ITOA 2X7PA 2OK2A 3K6WA 3GBAA 3L6HA 3KJTA 1ZJLA 2Z8DA 5KCJB 4ZE8A 1MPCA 1M5FA 3PMWA 2O7IA 2QL3A 2NWJA 4POWA 2DVZA 1YTVA 3LBSA 3THIA 4PQJA 1FTOA 3BBRA 4U2RA 2QRYA 4OQOA 3ZS6A 2F6PA 2O84X 2R9JA 2PVUA 2NUVA 3ILUB 4P0GA 1P1OA 4OTEA 4F1UA 1OLAA 3QIMA 1HSLA 4G8MA 3KSJA 2RCBA 3Q29A 3TTKA 3UP9A 4F31B 1QUJA 1MY4A 2Y7RA 3SEVA 1S50A 4OESA 2QPQA 4DLDA 3UK4A 3D4GA 4FAJA 3RT8A 5FTIA 2VOZA 5LOMA 3FVNA 4YKPA 4Q0CA 4HS7A 1LB8A 5H8QA 4EQ7A 3O6GA 1YPNA 2OJTA 2H9BA 3OENA 5HM4B 2KLFA 1NNPA 4JBZA 3E9XA 3IOTA 1N3XA 2PT2A 3KSXA 1MQHA 2OWTA 3MP8A 5H8NA 4ZECA 5DEXA 1H3DA 4HTGA 1JW4A 2XXXA 3U1OA 3SEXA 5H8QB 4DXUA 1SW2A 4YICA 3O9PA 4I8CA 5DYHA 3VVEA 3V83A 5AA2A 2UVJA 1LFGA 4OETA 3DP4A 3KZGA 2OLBA 3B6TA 2QS1A 1MRPA 1MPBA 1QUKA 1URSA 2V3TA 3IORA 5DEXB 1IEJA 1NKXA 2DS9A 4OERA 3ZKKA 4H0WA 3IK6B 4YZZA 1LAHE 2ABHA 1O64A 3SERA 3QUFA 4F39A 2UXAA 1S9TA 4JWOA 2B65A 1FQDA 4G77A 1FTLA 1PB8A 1B7UA 1OMPA 3IO6A 3QSLA 1LAFE 4GD5A 1N7XA 5L9MA 3MVYA 1XVXA 1FQAA 2ZYMA 5AA3A 1LGBC 1GVCA 4F3GA 3QXMA 1LLSA 1DOTA 4DDDA 3CG1A 4ZDMA 5I59B 2AL4A 1JVXA 2F8DA 3FIRA 2DWHA 2RCAA 4G8HA 4EUOA 3C33A 3OEKA 3S4UA 4OEVA 4TLLB 3FD3A 1B9JA 1IXHA 2YJPA 3CVGA 1MH4A 1ZLQA 1USYE 4QFOA 3IAZA 3IX1A 3CI8A 2HZLA 1YAEA 1PBQA 1JQFA 3N6UA 2GH9A 4GWOA 4X48A 3RUMA 4U4XA 1ZKBA 4R2BA 4EQBA 3RTFB 4KR5A 3VV5A 1YCJA 5H8SA 5EHSA 3GXAA 2QS3A 4O3BA 2XHDA 4LZ7A 3MZ1A 2XXHA 2RC9A 3MPLA 3A3UA 1D9VA 4U4SA 3E13X 1A7LA 2I58A 1A99A 4YKIA 3OO6A 1FTJA 2ZMBA 4GL0A 5K2YA 4G8NA 5L9SA 4R2FA 3PUWE 4YB6A 4P0IA 2UYFA 3LSWA 5AA1A 3EHUA 4KPTA 4L17A 1BLFA 1B2HA 5JTYA 1D9YA 4LZ5A 4MLVA 2ZXTA 1MH3A 3TMGA 1B51A 3S9MC 1ZMGA 4LUBA 3O29A 4IO6A 2UVIA 4DIGA 5I57A 5TP9A 2I0BA 2VHAA 3K1MA 4R6KA 4OZ9A 4DE8A 5ISUA 1US5A 1Q35A 5JTYB 3ONMA 3IOWA 4F18A 4YB7A 2UVGA 2Q2CA 4M4GA 4DXCA 2CZLA 1LSTA 2A5TA 5CI5A 2F6GA 3HCQA 2D5WA 1QULA 4U23A 3TYHA 3VXBA 2ONSA 5I57B 2V93A 5TP9B 5I56A 3UN6A 4JXIA 2DE3A 1WVJA 3T66A 1MQJA 4FIMA 3FXRA 1VSOA 3UGWA 2A5TB 4N13A 4PFTA 5I84A 3V5AA 4OYVA 2XXYA 5I56B 3T9VA 1F9BA 3IOVA 1B3HA 3U8QA 1AL3A 4OMBA 1BP5A 1MXUA 4HCWA 4NF8B 4OEUA 1OIBA 5DTBA 4OFLA 1P1QA 3G7WA 3TCHA 3C9HA 3HPIA 4JWXA 4FE8A 3TTNA 3PU5A 5CRYA 2ESNA 4Z0IA 1UTBB 4K3FA 3BFUA 2DQVA 5TU0A 2E1SA 3MC2A 4ISUA 1P1WA 3H6VA 4H5FA 2Z8FA 3SKPA 4PP0A 1H43A 4EF2A 1MXXA 5KDTA 1N3WA 5TPAA 4GOTA 4QHQA 3V89B 1CB6A 4PFYA 3QAXA 3SDFA 1MQGA 2YPNA 3M3FA 3C36A 2VD2A 4F1YA 4YMBA 2ZNSA 3FVOA 1R9QA 3SETA 4ELRA 4XKPA 2NOOA 5TPAB 4EXLA 1PEBA 2RKMA 4R6HA 2QS4A 4ECFA 4QSDA 4N07A 3DELB 2YLNA 3LSLA 4R74A 3TTMA 2Q89A 3HSTA 4AB5A 3MJNA 3A09A 4IO2A 1JETA 3P7IA 1US4A 2V3UA 3LUYA 2Z8EA 1B4ZA 4P11A 4ESXA 5ICQA 3I5OA 2UYEA 2DE4A 5A5XA 1MQIA 4LP2B 5HBCA 5I58A 3R26A 3G3JA 2VD3A 3TTLA 3LSXA 3T96B 3JZJA 3LSFB 3T22A 1B7ZA 2DWAA 4QSEA 5A5XB 4LQ2A 2Q9TA 4XTCQ 1R9LA 5I58B 2DE2A 1RYXA 2UVHA 4I9DA 4NF4A 4QRZA 4OXVA 1VFEA 4ZEDA 4YKKA 3TAJA 1EZ9A 3DP6A 3KN7A 4Q8RA 3Q26A 3K6XA 2ALUA 2R6GE 1A40A 3VLWA 3H03A 4NF4B 1NNTA 4UACA 2I48A 1EU8A 3WAFA 2QS2A 1AOVA 2V84A 4NWDA 2I4BA 2O51A 4YB5A 3MVXA 3PPPA 1MY3A 2P0SA 3O6IA 1OVBA 3U94A 3M8UA 1HSEA 1LCTA 2H4IA 3FVKA 2WKYA 3VDFA 5CC2A 4OENA 2XXUA 3O6HA 3OO8A 1SI1A 3SEWA 3MP1A 1B5JA 2DYXA 2XXQA 2RINA 3ECRA 3PPQA 2Q8JA 2DXYA 2LAOA 3KOSA 4G2ZA 2REGA 3KN8A 1SW1A 3FVGA 1XC1A 5J1DA 3FXQA 1FCKA 1XOCA 4DXBA 1Y3PA 3FUZA 3RQTA 3TCFA 1IUDA 5BUUA 4FEBA 4KQPA 3E3KA 1R6ZA 2NXOA 1PB7A 3AXFA 3HO7A 3QUJA 4F22A 3S9NC 3L6GA 4DCXA 1MDP1 1ATGA 4ZZAA 2O69A 3K01A 5ITPA 2V25A 3G3IA 1NL5A 4FATA 1N04A 1POY1 4EXKA 3C35A 3MP6A 2XXRA 3SESA 3GBBA 2ANJA 1MS7A 4MFIA 1DTZA 1MM7A 5CBSA 3K4UA 4YKJA 1B40A 1H44A 3S2VA 3EPEA 2P2AA 5I59A 2HAUA 3N5LA 3VLUA 4RNSA 2CMOA 1B05A 4RPNA 2G29A 3OXNA 3H6WA 3TKDA 4R73A 3TFLA 3K0VA 1O63A 4ELQA 2F35A 3IJXB 4M1VA 5JEIA 2Y7PA 4WKMA 5CMKA 4IO7A 1R1NA 5FHOA 2IEEA 1PB9A 3H6TA 2ONKE 3IL1B 3H7MA 1PBPA 4G4PA 4MH5A 1MXWA 3IB1A 3M3LA 4XKNA 4FORA 3PGFA 4QF9A 1Y4TA 2HXWA 4WEDA 2XXIA 3K02A 1EZPA 3W9WA 3MBPA 1LAGE 3LR1A 1VFDA 1S7YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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