4DZ1A

Crystal structure of dals, an atp binding cassette transporter for d-alanine from salmonella enterica
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
b'IVEGRTLNVAVSPASPPMLFKSADGKLQGIDLELFSSYCQSRHCKLNITEYAWDGMLGAVASGQADVAFSGISITDKRKKVIDFSEPYYINSFYLVSMANHKITLNNLNELNKYSIGYPRGMAYSDLIKNDLEPKGYYSLSKVKLYPTYNETMADLKNGNLDLAFIEEPVYFTFKNKKKMPIESRYVFKNVDQLGIAFKKGSPVRDDFNLWLKEQGPQKISGIVDSWMK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Characterization of DalS, an ATP-binding Cassette Transporter for D-Alanine, and Its Role in Pathogenesis in Salmonella enterica.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DalS D-Alanine transporter
source organism Salmonella enterica
molecule tags Transport protein
total genus 75
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A02
1MM7A 4ZEFA 1O63A 4LQ2A 2XXWA 3OELA 3GBBA 1AL3A 5K2YA 4LONB 3PPOA 4RY1A 3L6HA 2D21A 1NH8A 3K0VA 1DSNA 3K6WA 3I6VA 4LZ5A 5K2XA 4GXAA 3DLNA 3ZS6A 3ECRA 3CG3A 1DTGA 3T96B 3UN6A 1LAGE 4YKPA 2E0SA 1WDNA 1N04A 1RYXA 1NNFA 2DXYA 3TAJA 3DM0A 1Y20A 3FASA 3TELA 3OO8A 1ANFA 4OYVA 4R2BA 3N5LA 4EQ9A 5AE4A 1BIYA 1YAEA 4H65A 3TZAA 2UVJA 4M4GA 5B7DA 1QKAA 1IXHA 3IX1A 4QRZA 3TTKA 3C9HA 4ZE9A 3E9XA 4FEDA 3ONMA 3PD8A 2Q8JA 1DPPA 4F1YA 1P1WA 4F2QA 1SI0A 4NF6A 4H67A 3ZKKA 1D4NA 1H45A 5J1DA 3FJGA 4C1UA 3EN3A 4U4XA 3PUWE 3R7XA 2DVCA 3VDFA 4F39A 3O9PA 3PUXE 2ONRA 3B6WA 4OTEA 4I1DA 4JSOA 1S50A 5AA1A 2FNCA 1N0TA 1XHYA 1SW1A 2UVIA 2H4IA 1LB8A 2XX7A 3JYRA 2O7IA 4YU0A 2DYXA 4DLDA 3SDFA 1OVBA 1B6HA 3K02A 4LVQA 5DTBA 1LBCA 1R1NA 4ND9A 2XX8A 2DS9A 4PFYA 4TOZA 3SEYA 3O6IA 4G77A 3HPIA 4OESA 3TUSA 2O84X 1RYOA 5HBCA 4GD5A 3KJTA 3K2DA 1OVTA 3O66A 1UTHA 3HV1A 4MLVA 4IB2A 1PC3A 4BDMA 1NNTA 1B5JA 1ZLQA 3UK4A 5I2KA 4QHQA 5TPAB 3E4RA 4NWCA 4OXVA 3N94A 2V93A 3OSQA 4H5GA 5CBSA 1QULA 2KLFA 3EQ1A 2B3FA 3IB2A 3V5AA 1ZJLA 2Z8DA 3G3HA 2H99A 3ILUB 2OLBA 4R9FA 3MQ9A 4G8NA 3S9MC 1Y1ZA 1B7HA 5DVJA 4ISUA 4F19A 4EDPA 2REGA 3PUZE 3MP6A 1LFIA 5FHOA 5I2NA 1URGA 4YZZA 4HCWA 4OEUA 3FVNA 1XVXA 5AA2A 1B3GA 1GR2A 1PDAA 3LC8A 4EF1A 3KOSA 3N6TA 3PPRA 3BKIB 3V89B 2UYFA 1EU8A 2I0CA 2V3UA 3RQTA 5CMBA 2UVGA 3FXQA 5B70A 2VP1A 4X9TA 3T9UA 3R6UA 3TMGA 3MC2A 4ELQA 2HAVA 1YCJA 5HPQA 5AA4B 1Y4TA 4JB7A 3VVDA 4C0RA 5DVFA 4BDLA 4KCCA 3PV0E 4U22A 1UIVA 4E0WA 3PMWA 3OO9A 3PMXA 1SW5A 3S2VA 4OEVA 2UYEA 1NNKA 3U94A 1MQHA 4MFIA 3EHSA 2Y7KA 3VXBA 2ZXTA 1B2HA 3CSBA 1LB9A 3MAMA 4LZ7A 5AA2D 5I57A 3A3CA 1T0KA 3OEMA 2ALUA 1MQGA 2ZYKA 2R71A 1A55A 2XXXA 4F3SA 4X1DA 2ZYMA 2OBGA 4GVOA 4XKQA 2OCUA 3C34A 4QFNA 2VOZA 1H44A 4TLLB 1MDQA 2O68A 4NF4B 5IKBA 5H8NB 2F5XA 3THIA 2HAUA 1Q35A 2AYSA 3CG1A 1Y3PA 1MXUA 3FGSA 4QFOA 3OEKA 5L9SA 1QUKA 5DEXB 1LSTA 3MVWA 3VE1B 2F6GA 2O7UA 3PUVE 4E0XA 3N26A 2HZLA 5ICQA 4GFRA 4IO2A 1WODA 1P1NA 3OO6A 4BDRA 4YKIA 2I48A 1R9LA 5A5XA 3TCGA 2OWSA 3OENA 3C4MA 1LBBA 4N13A 4DXUA 2DWIA 3PMVA 1LFHA 4ZZAA 4MLQA 1MH4A 1ZBMA 4FATA 3SEXA 4C1TA 1AIVA 5TP9B 1B3FA 4G2ZA 2H25A 4IY5A 3HHGA 4OWDA 2PX1A 3TEPA 3L6GA 4LUBA 3Q29A 1IIWA 1I6AA 1MY0A 2QS4A 2F8DA 1VSOA 2XX9A 4YMBA 1ELJA 2RC8A 4F3GA 3UA8A 2RC7A 3D4CA 4TQUQ 2QRYA 3OSRA 4DZ1A 4NTLA 4H6DA 1RKMA 1TFDA 1PB8A 4YMAA 4R9GA 4M1VA 1MQJA 2ZNUA 3CVGA 1GTKA 1OLCA 4NF8B 2HXWA 4ELRA 3T9XB 1P1UA 1SI1A 4I62A 2LAOA 4LATA 1Y9UA 3FJ7A 2A5TB 4JSDA 4RK9A 2BJJX 4I9DA 3W9VA 1S9TA 3BFTA 1WVJA 1TWYA 3S4UA 1JW5A 3IORA 2Q88A 1EZPA 1SD3A 1B5IA 2AIXA 3FV2A 3G3IA 2XD3A 3U72A 5DYHA 3G7WA 3QSLA 5JTYA 3RTFB 3VVFA 2R9JA 1NMUA 5I58A 1MQIA 2R6GE 2Y7PA 5H8QB 2A5SA 4R6HA 4U21A 3K1MA 1SW4A 4ZEBA 4YB5A 3A09A 2X26A 1MPCA 4OETA 4Q0CA 1URSA 5KZTA 4YICA 3S9NC 3BFUA 5ITOA 1B5HA 4F22A 3KZGA 4JWYA 1FQCA 4GL8A 5BUUA 2PBWA 2I58A 3U93A 1B1HA 4KD5A 4KI0E 5I56B 3LSFB 4LP2B 2PVUA 3QXMA 1MQDA 3O97A 4ESWA 1POTA 3K6XA 4TLMB 1QKBA 2I4CA 4BDOA 1JVXA 1HSEA 2O1LA 5AA4A 1OQGA 4IO3A 3IR1A 4F3PA 1O64A 2IEEA 4L17A 5CC2A 1UTBA 3VV5A 3S9EA 4HS7A 2NWJA 3O6HA 4OFJA 4F29A 4NEDA 3V8XB 1XOCA 4RK2A 5CMKA 4I8CA 4Q8RA 3IOVA 2RCAA 3KFMA 4QFPA 3QAXA 5BWJA 3ILTB 4KCDA 5I59B 3MW0A 3MVYA 3H06B 3CFZA 4Z7EA 1FW0A 4NF5B 3T9HB 2ONSA 1HSLA 3O2AA 4OQOA 1LFGA 2DE2A 1M5BA 3M3KA 4LA9A 3TDJA 5KCJB 2PT1A 3SESA 4PFUA 2FA7A 2RKMA 4XKRA 5H8NA 4FE8A 3H7MA 1MXVA 1QVSA 2HCAA 2REJA 3O28A 4WEDA 1US4A 5CRYA 5DEXA 2V84A 3O29A 3FIRA 4R72A 1JQFA 4OZ9A 4ZDMA 4EQ7A 2Y7RA 4MF3A 3QYTA 1M5EA 1EH3A 4OFLA 2CZLA 3ZKLA 2QSXA 3TTLA 2THIA 2PT2A 3Q28A 4G68B 4AB5A 1LCTA 2F34A 3RT6B 1XT8A 4NE4A 4GXSB 5KDTA 1ATGA 2XD2A 4R2FA 4RNSA 1CE2A 5M2VA 4Q5TA 3IOTA 3VVEA 4G68C 1M5CA 5JEIA 3MUQA 3KEIA 2V3TA 1P99A 2RINA 1VFDA 4KQPA 1J1NA 2F7AA 4MH5A 4QSDA 1I6BA 4YKJA 5L8DA 2ESNA 4WXJA 3K00A 2XXVA 3KSXA 3MPKA 3KN7A 4EXLA 1GGGA 2XXTA 2QS3A 1FTKA 1Y3QA 1MG1A 5H8FA 5EYFA 4XKNA 1B9JA 3KOTA 4POWA 3LUYA 2DOJA 3SKPA 3USDA 3PPNA 4NF8A 3UGWA 4DXBA 5CMMA 3FZVA 2I49A 4YKKA 3PGFA 3ZSFA 1A8FA 4P0IA 5ISUA 4IO7A 3MJNA 4RPOA 5FHNA 3FXUA 2H5YA 5IAIA 2Q9TA 1ZTYA 4OENA 2Y7IA 3TYHA 1YPNA 1MDP1 1B05A 3K1PA 1A99A 4ZECA 4FEBA 3TODA 2Z8FA 1US5A 3D4GA 3AXFA 1R9QA 1FCKA 1POY1 4RXLA 1SYHA 4RYAA 2DWAA 2Q2CA 3B6QA 4DCXA 1IQ7A 4KR5A 4BLAA 4G8HA 1A7LA 3SEUA 5H8HB 3QUFA 1N7XA 4GLIA 4XKPA 4U1OA 2ZNSA 2F36A 4YB6A 3H6UA 4THIA 4JXIA 5JK4A 1SDXA 4GIZA 2O69A 3LBSA 3VXCA 1L5TA 2VD2A 1ZU0A 3U8QA 3GZGA 1B46A 4H8IA 1LAXA 4OVJA 4P0GA 4BDNA 3EHUA 4U2RA 4NF6B 3EF7A 3K6VA 1VE4A 3B7DA 3CFLA 3RY3A 2GH9A 5AA3A 3U1OA 3CRBA 3SERA 1N7WA 3IJXB 3H03A 1N3WA 3UIFA 1MPDA 1Q1KA 3I3VA 4H0WA 4F1UA 2B3BA 3IL1B 1QUIA 4H5FA 4N07A 2DQVA 3K01A 4POXA 3M8UA 4ZZEA 1M5DA 3VLVA 1UQWA 5EHMA 4PFTA 4Z0IA 1TXFA 2NXOA 3A3UA 2DWJA 5CM6A 3TFLA 2HFBA 1GV8A 2WKYA 1BLFA 2Q2AA 4JWOA 4NF5A 5F7VA 2AL4A 2GHBA 1DTZA 3PU5A 1ZIUA 4R75A 1GVCA 5FTIA 2M8CA 3Q25A 2F7BA 1UTHB 3MVXA 2RCBA 4EF2A 3TQLA 5I2KB 4PFWA 2GFEA 2XXIA 3BBRA 1B58A 4JWXA 4WKMA 2Y7WA 4BDQA 2X7QA 3LR1A 1H43A 1VR5A 4G8MA 4ZS9A 3F11A 1MXZA 2P2AA 2DE3A 4KYDA 4O3AA 4F3BA 4OERA 3MP8A 1B0LA 1UIUA 1B3HA 5CMCA 1B1XA 1R6ZA 3SEVA 1A40A 3P7IA 5TPAA 2ZYOA 1LAHE 4KYSA 5EHSA 2ONKE 3RT8A 4U1ZA 4GOTA 1IXIA 3MVZA 3JZJA 3IOWA 3VFJA 4LZ8A 4U4SA 4GF8A 4FJPA 3FVGA 4IO4A 3TKDA 3OD7A 4IGRA 1SYIA 4KYEA 5I2NB 1OMPA 1IZ1A 3KJ7A 4FECA 5AA2B 1B7UA 3RUMA 4F2OA 3LSWA 4HTGA 1MXXA 4F1VA 3UORA 1OIBA 1AH5A 2D3IA 3N6UA 2ZYNA 3W15C 1PBQA 1Y1MA 4QFLA 4IO5A 4OMBA 4EXKA 2O1MA 1DOTA 1P1OA 1MY2A 2PMSA 4DXCA 1FQBA 2DE4A 1QUJA 1MY3A 1BTJA 1TT1A 1MPBA 4IY6A 4QSCA 1MH3A 3TPAA 1B40A 3FATA 4DIGA 2P1SA 4GWOA 3VLWA 3HHFA 4XXUA 3DP6A 2D5WA 2X7PA 2QMXA 3FUZA 1A8EA 4JBZA 2DP8A 5CI5A 2GRVA 4OHNA 2CMOA 3FVOA 3KBRA 1N76A 5I57B 4G4PA 3HO7A 1MRPA 3QUJA 4AQ4A 3RN8A 2XXQA 5F1QA 4RJZA 3O6GA 3TTMA 2DWHA 2QS2A 2HEUA 5ICTA 1LGBC 4FAJA 5I84A 4PE5B 3GLBA 2XXPA 1BKAA 1D3KA 3CSGA 5H8HA 4YB7A 3SETA 5TU0A 1XS5A 3EPEA 1FTMA 3IJOB 4MBPA 5DVIA 3T22A 1MS7A 3B6TA 1I69A 2W7YA 3MZBA 4DDDA 3PPPA 4U23A 3Q26A 2IA4A 3RLFE 2Z8EA 2XXRA 1FQFA 4ONYA 3TCFA 5H8SA 4ZEIA 5A5XB 3TCHA 3MWBA 3MP1A 4NF4A 3CI8A 4GQOA 3M3FA 3I5OA 3Q27A 1SBPA 4XTCQ 2I3WA 2FYIA 3PUYE 4DCYA 1Y3NA 1EZ9A 2QPQA 1OQHA 4NMYA 3T93B 1VFEA 5CBRA 4JDFA 3C36A 3RPWA 1DMBA 4ESXA 3WAFA 3IOUA 2Q89A 3H6VA 1LCFA 4F31B 2XXYA 3LSXA 2Z23A 1D9VA 2G29A 2OZZA 3K6UA 2HQ0A 1FTOA 4F18A 2YPNA 1EZOA 3IB1A 1B32A 1M5FA 1AOVA 4RPNA 4R73A 5TP9A 1URDA 1S7YA 1ZKBA 4KPTA 3QIMA 2G93A 2O51A 4DE8A 2HZKA 2YLNA 3FXRA 3MBPA 4O3CA 3W9WA 2NOOA 4PP0A 4R74A 4IO6A 3MPLA 2AL5A 4KFQA 1N3XA 3QK6A 2F6PA 1N84A 4XIGQ 2QMWA 3C33A 2ABHA 4HCYA 1D9YA 1FTLA 3GBAA 1IITA 2QS1A 2F78A 4ECFA 5JTYB 1IEJA 4LQ5A 5I58B 5L9OA 1LAFE 3CFXA 2A5TA 2DSFA 2PYYA 3U92A 3H6WA 1Z7NE 3IAZA 1FQEA 1H3DA 4ZEDA 1FQAA 2VHAA 5FHMA 5HM4B 3M3LA 3CR9A 1JVYA 3RTWB 1YTVA 2H9BA 3RNNA 4UACA 2QL3A 3H6TA 3G3KA 1PB7A 1JEVA 3KN8A 3KGCA 3K4UA 3JV9A 3VLUA 1XC1A 4ELOA 5H8QA 3OMBA 1FQDA 1B4ZA 3EHTA 5DT6A 2I0BA 2Y84A 1MXWA 5FTHA 4R6YA 3DP4A 3H4ZA 1HSJA 2V25A 3LSLA 1UTBB 3V83A 1MXYA 3FJMA 1IXCA 3R26A 1B3EA 3C32A 1SW2A 2H98A 5ITPA 1B3LA 1QW0A 5I56A 4RA1A 1KWHA 3RGYA 2NVUB 2E1SA 3H3GA 3HN0A 1JNFA 4NWDA 2I6EA 3IB0A 4QF9A 1A54A 2V3QA 3TTNA 2OK2A 1B7ZA 1Y4CA 3DP8A 1PBPA 1Z7ME 2VGQA 3ODBA 3CIJA 2F35A 2F7CA 2F97A 3G3GA 3HCQA 1DPEA 2RC9A 1JW4A 3G3JA 4N6PA 2Z22A 3T66A 1I6QA 2I3VA 2DVZA 3C31A 1NNPA 4Q30B 1NL5A 3TTRA 1MY4A 2XXUA 5I59A 2XXHA 4AB6A 3MZ1A 4EQBA 4H8JA 1CB6A 4YAHX 3PD9A 2NUVA 2UXAA 2ZMBA 1XVYA 4PQJA 3FD3A 3KN3A 5KCJA 2RF1A 3DELB 3TQWA 3FVKA 1USYE 3PPQA 4FIMA 1TFAA 3SEWA 4OFOA 3IO6A 2B65A 3E13X 2GHAA 3IO4A 2OJTA 4H1XA 2O6AA 5KDTB 3C35A 1B52A 1FTJA 2ZNTA 4PETA 1BP5A 3GXAA 3G3FA 1SQYA 1P1QA 4WEPA 4ELPA 2YJPA 3OO7A 4K3FA 2QJEA 1PEBA 3MZ9A 3IK6B 4X48A 5L9MA 4HW8A 3OXNA 3WAEA 4X1BA 1F9BA 2DXRA 4FORA 2UVHA 3E3KA 1II5A 1JEUA 1IXGA 4QSEA 1IUDA 4O3BA 5H8FB 4G68A 3OOAA 1JETA 1NFTA 5ELVA 2I4BA 3K1NA 1USYH 4GL0A 1NH7A 4R6KA 1LLSA 2VD3A 3HSTA 2P0SA 1ZMGA 1B4HA 1SVXB 4UA8A 1JW1A 1AMFA 3S9LC 1NKXA 2ANJA 4ZE8A 3UP9A 1OLAA 4EUOA 4IGTA 1B51A 4KHZE 1H76A 4ZEKA 1MY1A 1O7TA 2OWTA 3FV1A 3KSJA 4P11A 5LOMA 1QJMA 1PB9A 1MM6A 1B0HA 3KG2A 4QFKA 2XHDA 3T9VA 4GRKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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