4DZ1A

Crystal structure of dals, an atp binding cassette transporter for d-alanine from salmonella enterica
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
IVEGRTLNVAVSPASPPMLFKSADGKLQGIDLELFSSYCQSRHCKLNITEYAWDGMLGAVASGQADVAFSGISITDKRKKVIDFSEPYYINSFYLVSMANHKITLNNLNELNKYSIGYPRGMAYSDLIKNDLEPKGYYSLSKVKLYPTYNETMADLKNGNLDLAFIEEPVYFTFKNKKKMPIESRYVFKNVDQLGIAFKKGSPVRDDFNLWLKEQGPQKISGIVDSWMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Characterization of DalS, an ATP-binding Cassette Transporter for D-Alanine, and Its Role in Pathogenesis in Salmonella enterica.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DalS D-Alanine transporter
molecule tags Transport protein
source organism Salmonella enterica
total genus 75
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A02
2XXHA 3FZVA 4GF8A 4TOZA 3TTNA 2V84A 2O1LA 2ZMBA 1FTKA 1MXZA 2Q2AA 2AL4A 3W15C 3KSXA 4TQUQ 2REGA 4OZ9A 1WVJA 4MLQA 1US4A 4PFUA 1B5HA 1QJMA 3MVYA 4OETA 3MP1A 3CG3A 3MZ9A 3H4ZA 1DSNA 4OWDA 3SEXA 2GH9A 1JW1A 4IY6A 4LP2B 2O51A 5I58A 2Y7WA 1TT1A 1NNPA 3VE1B 2O7UA 3VXCA 5H8SA 1ZBMA 1ZLQA 3C34A 4BDQA 3E4RA 2R71A 1PC3A 3U1OA 3OSRA 3U8QA 3O97A 2VD3A 1Q35A 4EUOA 2ALUA 5I58B 3TODA 3VLWA 2O6AA 1ZU0A 2V93A 3B6QA 4RNSA 1JETA 4PFYA 1DPPA 2DQVA 1URGA 4ZEBA 1OQHA 4EXKA 4X48A 4HTGA 3UP9A 2H4IA 2GHAA 2UVIA 4PQJA 1VSOA 2RC8A 3EN3A 5ICQA 2F36A 2A5TA 3IORA 3PMWA 4KPTA 4QSDA 4BDOA 3VVDA 2F34A 3KG2A 3OO6A 4RPOA 1OQGA 3O2AA 1MQDA 4NF8A 2G29A 1UTBA 5I84A 2A5TB 4PE5B 1IXHA 3KBRA 1JW5A 1MS7A 2V3QA 1NNFA 5DYHA 1NNKA 3FIRA 3O6HA 4R74A 2GFEA 3BFUA 3C33A 5K2XA 2DWIA 3K1MA 1MQIA 4NWDA 2V3UA 2QMXA 3TKDA 1UTBB 4WEDA 3B6WA 4JSOA 3TQWA 4F1YA 4ZS9A 4U1ZA 1MH4A 2F7CA 3ILTB 2ABHA 3OELA 5H8FB 2I0BA 4H8JA 3USDA 3HPIA 2XX9A 1NH8A 1YTVA 1JNFA 1MXUA 2UYFA 2XXXA 2GRVA 2Y7PA 1VFDA 1D9YA 4QFLA 4AB5A 2FYIA 1Y20A 3N26A 1P1WA 3VVEA 1MDQA 3RUMA 4TLLB 1LAGE 4ZEKA 5HM4B 2Y84A 5FHMA 3IB1A 4F3SA 2I3WA 1QUIA 2D5WA 4MFIA 1M5DA 4U21A 4OESA 4KYSA 4ELOA 4NF5A 3UORA 2AYSA 3M8UA 1LB9A 1IXIA 2X7QA 2UVHA 4JBZA 3L6GA 2DVCA 1Z7NE 4OHNA 1B52A 4IO3A 3UA8A 4NEDA 1FQEA 5H8HB 4C1UA 1QKBA 2XXQA 3FXRA 4RXLA 3G7WA 3IJOB 4F3GA 1RYOA 4U4SA 2QS2A 1EU8A 3IB0A 3PUZE 2ZXTA 3VFJA 4AQ4A 4N13A 3VLVA 1DTGA 3PMVA 1QUKA 4MLVA 1D9VA 3K1NA 5H8NB 2ONSA 3A3CA 3QXMA 3KSJA 1R6ZA 4LZ8A 3MQ9A 4C0RA 1FTMA 4IO6A 2RKMA 2I6EA 3GBBA 3T9VA 1NH7A 3DP4A 4IGRA 4RPNA 3IOVA 5TP9A 3EQ1A 4WXJA 3W9VA 1SW4A 5EYFA 1CB6A 2DWHA 1GTKA 4R2FA 1FW0A 3N5LA 4QRZA 4QFPA 1I6QA 2NOOA 5AE4A 2DXYA 1R1NA 1BTJA 1LCFA 3BBRA 2THIA 1B4HA 3PD9A 1URSA 4YKIA 5L9OA 3V5AA 1MXXA 2F35A 3VXBA 3MP8A 4IO2A 4NTLA 1LAFE 3Q26A 2UYEA 4QFNA 1M5CA 3PUVE 3C4MA 2Z22A 4OEVA 3I3VA 1B7UA 1MQHA 3TZAA 3TTMA 1SYIA 5F7VA 3MWBA 4PFTA 3MBPA 2R9JA 3TAJA 2OWSA 4R75A 3HV1A 3SERA 3W9WA 4C1TA 3IOUA 4U23A 2D21A 4LZ5A 4IGTA 2XXRA 3KOSA 2VHAA 1A55A 3ZS6A 3G3GA 3ONMA 4OFLA 3LR1A 5I2NA 1IXGA 4YU0A 4F2OA 3H06B 4NF4A 3IB2A 1MM6A 4GL8A 1YPNA 5KZTA 4FORA 2GHBA 4PFWA 4HCWA 3ZKLA 4ZEDA 5I2NB 3PPRA 4I8CA 5I2KA 1B40A 2DP8A 2Q88A 3BKIB 1B51A 5BUUA 4H5GA 3QUFA 4WKMA 1L5TA 3JZJA 4G68B 4Q8RA 1LSTA 3MC2A 3KFMA 3FXUA 3MJNA 2ZYKA 5AA4B 3UN6A 4R2BA 1HSLA 5I59A 1N7XA 1T0KA 4F3PA 3LBSA 3EHSA 5CI5A 3P7IA 3PUYE 1A99A 1TFDA 3OENA 1FQBA 1UQWA 1B2HA 5DVJA 1DTZA 1FQFA 3G3FA 3K02A 3R7XA 4F18A 3FASA 5DTBA 5ITPA 4JWXA 3OOAA 3QSLA 4U1OA 2LAOA 1B7HA 3IO6A 2YJPA 4KFQA 3TCFA 1HSEA 1P1OA 3S9LC 1B3FA 3RLFE 3V89B 3Q29A 2XXTA 2F7AA 4GXSB 2HZLA 4ELRA 3OSQA 1LLSA 4PP0A 5I56A 2HEUA 3THIA 2R6GE 4GXAA 1A7LA 2ZYMA 4ELPA 1B05A 1POY1 5CRYA 4DZ1A 2UVJA 4DDDA 1TWYA 1A8EA 3I6VA 2ZNUA 3TFLA 4OVJA 4ZE9A 1BP5A 5I56B 3IX1A 3PGFA 1UTHB 3FVOA 3GXAA 4H5FA 1JEVA 3Q28A 3IOTA 4RA1A 2OLBA 5L8DA 3SKPA 4QHQA 4FE8A 5JTYB 3DM0A 4GL0A 4KQPA 1B1XA 4LVQA 1LGBC 1O7TA 3DELB 3H03A 3D4GA 4ONYA 1MM7A 5ICTA 3H6TA 1XC1A 2HZKA 4FAJA 4QFOA 2F97A 1SQYA 3C35A 2F8DA 1ZKBA 2VGQA 1VR5A 4KI0E 4R6KA 2OBGA 4I1DA 5L9SA 4YZZA 3FGSA 4FECA 3U94A 3Q27A 4E0XA 3CFLA 4POWA 3OXNA 5AA1A 3MPKA 3N6TA 2PT1A 1P1NA 4FATA 3PV0E 3O66A 3CFXA 3OO9A 1Y3NA 1B9JA 1GGGA 5CMMA 1B7ZA 4XXUA 3CIJA 4G77A 4Q5TA 3T9HB 4QF9A 3LUYA 2Y7RA 5CMBA 3S9EA 2QRYA 1LFHA 3DP8A 2AIXA 5J1DA 5B70A 3S4UA 1JVXA 5M2VA 4BDRA 3JYRA 4F31B 3RNNA 4XIGQ 1SW2A 4R73A 1BIYA 2NWJA 4F39A 2PBWA 3RGYA 4DIGA 3OO8A 3IL1B 1P99A 4ND9A 4P0IA 4X1DA 1SI1A 2XXVA 3HN0A 2RINA 1SDXA 4GWOA 1VE4A 1O64A 4QSCA 4DXBA 1FTJA 1OLCA 4KCDA 4BDLA 3SEVA 5H8FA 1B3HA 4IO4A 3K4UA 3MAMA 1N3XA 1D3KA 1OMPA 2OJTA 4M1VA 5FHOA 4O3BA 1Z7ME 3GLBA 3RT6B 2DYXA 1B5JA 1MY2A 3MPLA 3F11A 1N7WA 3ZKKA 4R6HA 1BLFA 1MPBA 4O3CA 4FJPA 2BJJX 2OCUA 3KJ7A 4MBPA 4ISUA 1YCJA 4GRKA 1XVXA 1H45A 2FNCA 2ONKE 1Y1ZA 3MVZA 1IIWA 1NKXA 1QVSA 2P2AA 1XT8A 2VP1A 4NF6B 2Z8FA 5H8HA 1PBPA 3EPEA 1WDNA 3K6WA 1WODA 3HCQA 4JDFA 1IXCA 3C31A 3ILUB 4EQ9A 2Z8DA 4EF1A 4F3BA 4GD5A 3H6UA 2HXWA 4H6DA 4YB7A 1B3LA 3ECRA 4GOTA 3QIMA 1B1HA 4RK9A 2DWJA 3KN3A 5H8NA 4G8HA 4R9FA 2DE3A 1FQCA 1MDP1 4H65A 3C36A 1NL5A 1IEJA 2ANJA 3WAFA 2PYYA 1JQFA 2HAVA 4QSEA 4H1XA 3O9PA 3SDFA 3SEWA 2O1MA 3FV1A 1B32A 4QFKA 2RF1A 3RY3A 3KGCA 4YB6A 2Y7IA 4O3AA 1N0TA 2ZNTA 5IAIA 1D4NA 4P0GA 4FEBA 1A40A 1AL3A 2M8CA 3G3KA 2QJEA 4LA9A 2XXPA 4JB7A 3K00A 5H8QA 3FJMA 1DOTA 1HSJA 4YICA 4G2ZA 1P1UA 3MP6A 3FV2A 3FJ7A 1OLAA 3O6GA 1Y3PA 3H6VA 5H8QB 3OO7A 3TCGA 3K1PA 5I57A 4NE4A 5TU0A 4IO7A 3PPNA 2RC9A 3SEYA 5DT6A 1QUJA 3A3UA 1RKMA 4POXA 1B0LA 5I57B 4Q0CA 3U92A 3N94A 5JEIA 1XOCA 1LB8A 4JXIA 2YLNA 2ZYOA 3RQTA 3PPQA 4WEPA 2F6GA 1SVXB 4LONB 3TTKA 2F6PA 3K2DA 5A5XA 1B46A 1B3GA 4LQ2A 1AH5A 1CE2A 1PEBA 3H3GA 2O68A 3CSBA 4P11A 4HS7A 4Q30B 1MQGA 5JK4A 1H3DA 1PB8A 1LBBA 1P1QA 1ELJA 2QS3A 1LFGA 5A5XB 3EHUA 2FA7A 4G68A 4ESWA 3KJTA 4F2QA 3E13X 5DVFA 4DCXA 1A54A 2HQ0A 5AA4A 1FQAA 2I58A 2XXIA 4GVOA 1Y4TA 1MPCA 2QS4A 2X26A 3GZGA 3MW0A 4DXUA 3V83A 3IAZA 1DPEA 1MXVA 1R9LA 1URDA 2DE2A 4ZZAA 3FATA 5KDTB 1OIBA 4YMAA 2UVGA 1R9QA 1KWHA 1UIUA 1JW4A 1Y1MA 5AA2B 4LATA 2H98A 2HAUA 4TLMB 4YKJA 4MF3A 3EF7A 2F78A 1MRPA 3T96B 2HCAA 1M5FA 4E0WA 1Y4CA 3K01A 4G68C 1Y3QA 3FUZA 1EZ9A 5DVIA 1VFEA 4EDPA 1N76A 1SD3A 4G8NA 3B6TA 1A8FA 3MVXA 2I4BA 1OVTA 3IO4A 1LAHE 4XKPA 1US5A 1J1NA 3G3JA 1Y9UA 1XVYA 3KOTA 2O69A 5TPAB 1ATGA 4PETA 2DVZA 3KN7A 4DE8A 1UTHA 2VD2A 3K6XA 3PUXE 1M5BA 2Q8JA 3PU5A 4R6YA 1SBPA 3PD8A 3LC8A 2B3BA 3LSWA 4I62A 3H6WA 1I6BA 5JTYA 2H9BA 2QPQA 2KLFA 2XXYA 1MG1A 3FJGA 3OMBA 3T9UA 4U4XA 4AB6A 5B7DA 1EZOA 2H99A 2IEEA 3T66A 3SETA 3UIFA 2RC7A 3LSXA 2XHDA 1MH3A 2NXOA 4YMBA 2DOJA 2IA4A 3CRBA 4RYAA 3SESA 5CM6A 3K0VA 3VDFA 4H0WA 3TEPA 4KR5A 1AOVA 3VVFA 3FVKA 5HBCA 3ODBA 4ZEIA 5EHMA 1Q1KA 1XHYA 3MUQA 4JWYA 2REJA 3FXQA 1MPDA 1NNTA 1H44A 5FHNA 3O29A 2YPNA 1MXWA 2B3FA 1LBCA 4EXLA 4FIMA 3PUWE 2XXWA 4KYDA 3LSLA 1MY1A 3T93B 3QK6A 3QAXA 3FVGA 3BFTA 3PPPA 4FEDA 3C9HA 1GV8A 2XD3A 1PB9A 1QULA 4X9TA 1N3WA 2Y7KA 2QMWA 1LCTA 4UA8A 4THIA 1B58A 1QW0A 4BDNA 4F1UA 5K2YA 5CMKA 3HO7A 3ZSFA 2E1SA 1O63A 2ESNA 4NMYA 1GVCA 1DMBA 4OQOA 3TQLA 1POTA 4GLIA 4ELQA 1BKAA 4X1BA 4F19A 2X7PA 2AL5A 3JV9A 3S2VA 5ITOA 2QS1A 2PT2A 3Q25A 2XXUA 1B5IA 4N07A 1OVBA 2F5XA 4KYEA 4XKQA 1FTOA 4OFOA 3RTFB 3WAEA 3CVGA 3RPWA 1EH3A 5L9MA 3D4CA 2O84X 1H76A 5AA3A 3M3FA 4OFJA 4ZEFA 2PVUA 3IOWA 4F22A 3OEKA 1ZJLA 4OYVA 4XKRA 2ONRA 3TUSA 3R26A 2P0SA 3S9MC 4NF8B 1FQDA 4RK2A 4EF2A 3QYTA 5KCJA 3RTWB 4NF6A 2Z23A 1F9BA 1SYHA 1ANFA 4Z7EA 1IQ7A 3C32A 2Z8EA 1USYH 2V3TA 5IKBA 1QKAA 1FCKA 5KCJB 1TXFA 5AA2D 4DLDA 1MQJA 3CR9A 1FTLA 4Z0IA 5CC2A 3HHFA 3TCHA 3TELA 4GFRA 3E3KA 1MXYA 2OK2A 3RN8A 4ZECA 4IO5A 1IZ1A 3K6VA 1ZMGA 3M3LA 1I6AA 4XTCQ 2I0CA 1S50A 3A09A 3LSFB 1AMFA 5FTHA 4I9DA 4BDMA 3CFZA 4M4GA 1B4ZA 1NFTA 3VLUA 1NMUA 2ZYNA 3AXFA 2W7YA 4LQ5A 4ECFA 1I69A 4HCYA 2DS9A 1AIVA 4RY1A 4NF5B 3B7DA 2NUVA 4H8IA 3N6UA 2VOZA 3T9XB 3FD3A 3T22A 4KCCA 1RYXA 5DEXA 5BWJA 4RJZA 2Q2CA 3RT8A 1H43A 3O28A 1PBQA 4YB5A 4F29A 2DXRA 3MZ1A 1II5A 1UIVA 2O7IA 1SW5A 3PPOA 3MZBA 1B6HA 3HSTA 1S7YA 5DEXB 3KN8A 2PMSA 1ZIUA 1LFIA 4YAHX 1SI0A 1SW1A 4OMBA 3V8XB 4BLAA 3G3HA 1MY0A 3TTRA 2A5SA 2RCAA 2I48A 4F1VA 2H25A 1USYE 3TDJA 3KZGA 4GQOA 3TPAA 5ELVA 5CBRA 4H67A 5F1QA 1M5EA 3VV5A 1XS5A 4G4PA 2ZNSA 2OWTA 3CI8A 2DWAA 4JWOA 2XX8A 4UACA 4KHZE 4U22A 5TP9B 2DSFA 4LZ7A 1N04A 4IB2A 2I3VA 2OZZA 2F7BA 3I5OA 4GIZA 4ZDMA 5FTIA 1IITA 1YAEA 4YKPA 2I49A 2Q9TA 3OEMA 3KEIA 5ISUA 1EZPA 4N6PA 2HFBA 3OD7A 4HW8A 2I4CA 3IR1A 3U72A 3FVNA 1IUDA 2RCBA 3HHGA 3CG1A 1B0HA 3EHTA 5CMCA 2G93A 4ZZEA 1MY4A 2UXAA 3IK6B 3TTLA 3IJXB 3K6UA 5KDTA 4IY5A 5CBSA 2P1SA 2CMOA 2V25A 4ZE8A 2XX7A 5AA2A 1JEUA 3R6UA 4JSDA 3U93A 4OENA 4NF4B 1MY3A 3QUJA 4EQBA 3UGWA 1PDAA 1S9TA 4KD5A 3TYHA 4OXVA 5EHSA 2CZLA 3DLNA 3UK4A 4OERA 1ZTYA 3M3KA 4MH5A 4NWCA 2Q89A 1PB7A 4OEUA 3DP6A 4EQ7A 3E9XA 5I2KB 3L6HA 3PMXA 4XKNA 4DXCA 3H7MA 2QL3A 4U2RA 4K3FA 2QSXA 1TFAA 5LOMA 4YKKA 1JVYA 1GR2A 5TPAA 2D3IA 1N84A 3O6IA 3CSGA 4G8MA 4DCYA 2B65A 3GBAA 4L17A 5I59B 2E0SA 3MVWA 1LAXA 1B3EA 2H5YA 3S9NC 3G3IA 4ESXA 2PX1A 3TMGA 2DE4A 3SEUA 4OTEA 4R9GA 2XD2A 5HPQA 4LUBA 4R72A 2WKYA 2NVUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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