4DZ1A

Crystal structure of dals, an atp binding cassette transporter for d-alanine from salmonella enterica
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
IVEGRTLNVAVSPASPPMLFKSADGKLQGIDLELFSSYCQSRHCKLNITEYAWDGMLGAVASGQADVAFSGISITDKRKKVIDFSEPYYINSFYLVSMANHKITLNNLNELNKYSIGYPRGMAYSDLIKNDLEPKGYYSLSKVKLYPTYNETMADLKNGNLDLAFIEEPVYFTFKNKKKMPIESRYVFKNVDQLGIAFKKGSPVRDDFNLWLKEQGPQKISGIVDSWMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Characterization of DalS, an ATP-binding Cassette Transporter for D-Alanine, and Its Role in Pathogenesis in Salmonella enterica.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DalS D-Alanine transporter
molecule tags Transport protein
source organism Salmonella enterica
total genus 75
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A02
2XXVA 4BLAA 5F1QA 1ZJLA 2ZYMA 4U21A 3QXMA 4R9FA 2REJA 2DWIA 5ICTA 3KBRA 3R7XA 3H6VA 1MH3A 1YPNA 5ISUA 4YKJA 1EZPA 4G4PA 3WAEA 2LAOA 3HV1A 3MP1A 3OMBA 2Z23A 4IGTA 3DLNA 1PB7A 3K6UA 4DXBA 3OO8A 3T9UA 3MQ9A 5H8FB 3BFUA 3TEPA 1FQBA 2RF1A 1SYHA 4ZEDA 4GF8A 4X9TA 3LR1A 1BTJA 2Z22A 3VXBA 1NH7A 5DEXA 4RNSA 4XKPA 1YTVA 1GR2A 4YKKA 1OVBA 3SEYA 4KYSA 2ZYNA 3CFXA 1MQIA 3OELA 4NF8A 2B65A 4IO4A 3T9VA 3U1OA 3FVGA 4EF1A 3Q28A 4ZECA 1ZMGA 3H6WA 1YAEA 4H5GA 1URDA 4GVOA 5BWJA 3B7DA 2I48A 3K6WA 3Q27A 3TTMA 4OYVA 5I59B 3CR9A 1EZOA 1Q1KA 1VE4A 4F3SA 3A3CA 1N7WA 1LAFE 4KPTA 5L9SA 1QKAA 1LFHA 3CG1A 4LP2B 4JBZA 4GXSB 4XKNA 4OZ9A 4FEBA 3KSXA 2OCUA 4QFLA 4XIGQ 4UA8A 2PVUA 4ELPA 1NNPA 4YB6A 5I56B 4JDFA 2E0SA 1SD3A 4N6PA 1MG1A 4LONB 4R6KA 4F22A 3TQLA 1OQHA 1GV8A 4IGRA 2H25A 4O3BA 1B9JA 3IO6A 3IK6B 4F18A 3RTWB 1TXFA 4OQOA 2XXPA 3RY3A 4ELQA 3U72A 2THIA 4GWOA 2Y7IA 1Y1MA 1YCJA 3LSWA 2X26A 3S9MC 3KJTA 3VE1B 3S9EA 1B1XA 1LFGA 3CI8A 4ISUA 1P1QA 4R6YA 2XXIA 3MVWA 1GVCA 3PPOA 4OWDA 3OO7A 4DE8A 3PD9A 2NOOA 3TUSA 2DS9A 2H5YA 2D3IA 2DP8A 4C1UA 2RCAA 2ZNTA 1FTJA 3R6UA 4H0WA 4EUOA 1P1WA 2Q89A 1USYE 4ESXA 5L9OA 3HHFA 2XXHA 4U22A 3IORA 3PPPA 3W15C 4KCDA 4NWDA 1LGBC 1A40A 5TPAB 4FORA 3N6TA 3MJNA 3KSJA 1H3DA 3PV0E 4PFTA 3TDJA 4IY5A 1IUDA 1BLFA 2F6GA 3KGCA 2GH9A 4E0XA 5F7VA 2XXQA 5H8NB 2Z8FA 5DEXB 4BDLA 5I2NA 2UYFA 1LCTA 1P1OA 2XXXA 1PBPA 2G93A 4NF8B 1RKMA 1OMPA 4F31B 3QUFA 5L9MA 1PC3A 1US5A 3LSXA 3O29A 1MY2A 4XKRA 2E1SA 3TTRA 3RT6B 1SW4A 3N6UA 2QSXA 2VOZA 4U1ZA 1B1HA 1R9LA 2DWHA 5DVJA 1B5JA 3O9PA 1MQJA 2XD3A 2AL4A 3KG2A 5A5XB 3S2VA 2XX8A 5CMCA 2F7BA 4K3FA 4LQ2A 3TKDA 2DXYA 5HPQA 2HXWA 3IR1A 4GD5A 4G8MA 5AA4B 2NVUB 3RTFB 3K1NA 5FHOA 4F39A 2F34A 3IJOB 1FQAA 3OO9A 1QVSA 3MBPA 1FTKA 3IAZA 3KN3A 4PFUA 3T22A 2P1SA 3OXNA 4P0IA 5EYFA 3UGWA 3MAMA 3FVNA 1AIVA 2P0SA 2QPQA 2I0CA 5HBCA 1N3WA 1SW1A 2ZMBA 3C9HA 3K02A 2F8DA 1FCKA 3A09A 4QSEA 3UN6A 4NWCA 3TTLA 1VSOA 2A5TA 4IY6A 3E4RA 5KDTA 3FV2A 4FEDA 3B6TA 2UXAA 3CVGA 2Z8EA 4OEVA 4ZZAA 3EN3A 2RCBA 1UTBA 1GTKA 1B0HA 4LZ8A 4H8JA 1LB9A 3MZ1A 4MFIA 3G3KA 2AL5A 4I62A 4RPNA 4PFYA 4ZE8A 1LBCA 4MLVA 3IX1A 1B7UA 3K6XA 4L17A 3VFJA 4ONYA 2PT1A 1NNTA 2O51A 5H8HB 3B6QA 3BKIB 2OK2A 4HTGA 2RINA 1I6QA 1BP5A 1FTLA 4G68A 3V89B 4OFLA 4OHNA 3FIRA 4U23A 3Q25A 4NE4A 4BDOA 1SI0A 3U8QA 2V3TA 3EF7A 2ANJA 2V25A 3T66A 4MBPA 2H9BA 5I2NB 1B40A 3JYRA 4E0WA 2QS3A 2QMXA 4X1DA 3B6WA 4RYAA 4G8HA 4PE5B 4UACA 2VD2A 3MPLA 2UVGA 2V84A 4M1VA 1EZ9A 3TMGA 1ZTYA 3H7MA 2O84X 1I6BA 4C1TA 1R1NA 4PQJA 1H45A 3OSQA 3C33A 1Y1ZA 5ELVA 4RPOA 2F7AA 4I1DA 4R72A 3U93A 4WXJA 4MF3A 2XX7A 1NL5A 5ITOA 2QMWA 2AYSA 4IB2A 1A7LA 5FHNA 4U4XA 4ZEIA 3MW0A 3GZGA 5JEIA 1Y3NA 1M5FA 3FXUA 1IITA 4FATA 4DCXA 3RN8A 3UA8A 1QUKA 4LVQA 4LA9A 4QHQA 5I2KA 1B5HA 2I58A 3T9XB 4O3AA 3PMXA 4R9GA 2P2AA 4ELRA 3KN7A 4R2BA 3O6IA 4KI0E 3HO7A 3SEXA 3CSBA 3U92A 4ELOA 1N04A 3I3VA 4LQ5A 3PPNA 2A5TB 1O63A 2GHAA 2OWTA 3UIFA 4R75A 4BDNA 4JSOA 2GFEA 3L6GA 1I6AA 5ICQA 4NF5A 1A8EA 4WKMA 3G3FA 4FE8A 1IEJA 3CFZA 1A55A 4X1BA 5DVIA 1N84A 3FVKA 1N0TA 2GHBA 2O1MA 1JW4A 1B46A 1D9YA 3PUXE 4FJPA 3PPRA 2F35A 4G68B 4QF9A 3VVFA 2DOJA 1MM7A 1UTHA 1IIWA 5I84A 4GRKA 3F11A 3PMWA 4MLQA 2I3VA 4NMYA 2I4BA 4U4SA 2O6AA 1B51A 1USYH 3S9LC 1ELJA 1SW2A 3M3KA 4YICA 4JXIA 1P1NA 4YU0A 1S7YA 3SEUA 2ZYOA 4OENA 3RGYA 2UVIA 4BDRA 4KQPA 1MY4A 1SYIA 1S9TA 3TCHA 4XKQA 2B3BA 5AA2A 3M3LA 1T0KA 4PFWA 1MQGA 4F2OA 4F3PA 3LC8A 4JB7A 5CBRA 1BKAA 2DQVA 3MVYA 4QFPA 4OMBA 1EU8A 2OZZA 1XHYA 3IOUA 3IL1B 4ZEKA 5CMMA 3GBBA 2FYIA 5FTIA 4H5FA 1H43A 3PMVA 1P99A 4H67A 1XOCA 5DVFA 4Z7EA 1IXIA 1OLCA 4EDPA 2D5WA 4Q5TA 3VVDA 3G3HA 3KJ7A 3D4CA 2Q88A 3Q26A 2OWSA 5JK4A 3ONMA 1H76A 4TOZA 1PB8A 2ONRA 3G3IA 3PUVE 3K1PA 3W9VA 3FJ7A 5EHSA 4LZ7A 4HW8A 1R9QA 2O68A 4FAJA 3IOVA 3K00A 4BDMA 2ONSA 4EXLA 4IO7A 1MXWA 3RUMA 1VR5A 1D4NA 3DP6A 3EHUA 1OQGA 3AXFA 3EPEA 5I58A 2NXOA 4XTCQ 3FZVA 4EQ9A 2Y7WA 4F3GA 2NWJA 5EHMA 1VFEA 3KEIA 3Q29A 3VV5A 2ZNUA 1A54A 4KHZE 4IO6A 2Y7PA 3QAXA 3C36A 2I4CA 4JWXA 4QRZA 1S50A 3UK4A 5B70A 1SI1A 3PUWE 4H8IA 3TODA 1MY1A 4OTEA 2V3UA 4DCYA 1B0LA 2HEUA 3QIMA 2I3WA 1GGGA 3VDFA 3FXQA 1URGA 5HM4B 2HQ0A 4QFOA 1HSLA 4F1YA 4EXKA 4O3CA 4FECA 5JTYA 1NNKA 3VLUA 5AA1A 2D21A 5AA2B 1O7TA 1TFAA 3TCGA 3MVXA 4H6DA 3I5OA 4RJZA 3USDA 5TP9A 5CC2A 2IA4A 1DTZA 3S4UA 4QSDA 3C32A 1TT1A 3O28A 2O69A 4YZZA 2HZKA 3BFTA 4DXUA 2UVJA 3TQWA 4YMAA 4JSDA 3H6UA 4DZ1A 1LBBA 3TAJA 2XX9A 2XXWA 3MC2A 4P0GA 1POY1 3ECRA 1DOTA 5CMKA 4G77A 4F3BA 3DM0A 3E9XA 3THIA 2Y84A 4NF4A 2REGA 1OIBA 1B5IA 4YKPA 3FUZA 1TWYA 4QSCA 1CE2A 3O66A 1QUJA 4DDDA 2Z8DA 1I69A 1Q35A 3OSRA 4OVJA 3O97A 1N7XA 1HSEA 1QJMA 4NF6A 1MXXA 1IQ7A 1UIUA 3GLBA 4F19A 5IKBA 4Q0CA 5CI5A 5K2YA 2DVZA 4AB6A 4DIGA 4KYDA 3FASA 5FTHA 5I59A 4M4GA 2HFBA 1QUIA 5J1DA 3KN8A 3G3GA 3QSLA 2RC8A 4OXVA 5I58B 3OOAA 1MQHA 1JETA 1UQWA 1AMFA 3HCQA 4H1XA 3O2AA 2F78A 1IXGA 5I56A 1DSNA 1D9VA 3G7WA 4KYEA 4YKIA 4DXCA 1MPDA 1A99A 1MDQA 1ZLQA 3LBSA 3RLFE 3SESA 3UP9A 3MVZA 1II5A 3PGFA 3QK6A 4RK2A 5AA2D 2V93A 3EHTA 3IOTA 1B2HA 3MWBA 4OESA 1B4HA 3K0VA 5H8QA 5K2XA 2H98A 2HAVA 2Q2CA 3TPAA 1AH5A 4OFOA 2FNCA 5M2VA 2UYEA 1IZ1A 2DXRA 4GQOA 2H4IA 1NH8A 2I6EA 2ESNA 1URSA 2VP1A 1RYOA 1FQCA 5I57A 3PUYE 4HCWA 4F1UA 3N5LA 2CMOA 4ZEBA 3CSGA 4TLMB 1QW0A 5TP9B 1UIVA 2X7QA 2YLNA 2VD3A 3BBRA 4ESWA 1ZBMA 2M8CA 2Y7RA 3HSTA 2DVCA 1N76A 1US4A 1WVJA 3HPIA 1B7HA 3SKPA 1M5CA 3MUQA 3C4MA 1MY3A 3KFMA 5KDTB 1XVXA 1WDNA 2Q2AA 3L6HA 4RXLA 3FVOA 1M5EA 2F7CA 1UTBB 3FJGA 1RYXA 3V5AA 3K01A 5TPAA 1JVYA 1VFDA 3PU5A 4NF4B 5FHMA 2X7PA 3SDFA 1MM6A 1IXHA 1OVTA 2DE4A 3TTKA 3G3JA 5CBSA 4G8NA 3E13X 3U94A 1KWHA 1Y3PA 3H3GA 4RK9A 3OD7A 1SBPA 1R6ZA 5H8NA 1FTOA 3V8XB 4HS7A 3VVEA 3OEKA 4THIA 3VXCA 2V3QA 4RA1A 3LSLA 4R2FA 4NF6B 1B3LA 1LB8A 3TFLA 4QFNA 1J1NA 2A5SA 3IOWA 4DLDA 4NEDA 3CFLA 3O6HA 3SERA 4EQBA 3M8UA 4Q30B 4G2ZA 1NNFA 1QULA 3OENA 4ZE9A 5TU0A 3ILUB 1PB9A 2OBGA 2VGQA 1FW0A 2QRYA 3FJMA 1TFDA 2DYXA 3T93B 1LAGE 2HZLA 3HN0A 5A5XA 2Q8JA 4Q8RA 1JW5A 2RC7A 2RKMA 4N13A 2XHDA 1JW1A 3C35A 3TELA 1AOVA 2QJEA 3N94A 1EH3A 3SETA 3TCFA 4EQ7A 5BUUA 2DWAA 3FV1A 2DE3A 5AA4A 1POTA 1NFTA 1ZU0A 2PX1A 2Q9TA 3FD3A 1Y3QA 3TZAA 2BJJX 3JZJA 3GXAA 4GIZA 1Y4TA 1M5DA 3KOTA 1DTGA 4RY1A 1Z7ME 2ZNSA 1B58A 5H8QB 1FQEA 3MPKA 5B7DA 3VLWA 1ANFA 4I8CA 4QFKA 1FTMA 1F9BA 3MZBA 1B3FA 5I57B 4N07A 2QL3A 5I2KB 4F2QA 3TYHA 4U2RA 3IB1A 4POWA 3MZ9A 4ZZEA 4NTLA 4F1VA 3QYTA 3OEMA 4YB5A 4AB5A 1B52A 2PMSA 4OETA 1MPBA 1NKXA 4AQ4A 2WKYA 2O7IA 1MRPA 3WAFA 2QS4A 1FQFA 4TQUQ 4P11A 5KZTA 3O6GA 4YB7A 5CMBA 3FGSA 4I9DA 5H8HA 5IAIA 5H8SA 1QKBA 5DT6A 2R71A 1SW5A 4NF5B 4GOTA 5DYHA 3HHGA 1NMUA 3K6VA 4LZ5A 1LCFA 2HAUA 3W9WA 1LLSA 4PP0A 1JVXA 1H44A 4IO2A 3TTNA 3M3FA 4FIMA 1B05A 1MXUA 2HCAA 2F6PA 2B3FA 4H65A 5DTBA 5LOMA 1OLAA 2XXYA 1M5BA 2I0BA 3PPQA 2PBWA 3RQTA 1UTHB 1MH4A 4GL8A 4X48A 2OLBA 4GLIA 1CB6A 1P1UA 1B3EA 2ABHA 1B32A 2XXUA 4EF2A 1DPPA 3CG3A 3IB0A 3D4GA 3ZS6A 4U1OA 4WEDA 3KZGA 3CRBA 2DWJA 2R6GE 3T9HB 3QUJA 1B3GA 3C34A 2R9JA 1IXCA 1HSJA 3K1MA 4C0RA 5KCJA 3IJXB 3IO4A 1Y9UA 2I49A 3ILTB 1PBQA 1XC1A 2QS2A 3LSFB 4MH5A 4ECFA 4KD5A 1B7ZA 3H03A 1PDAA 3H6TA 2AIXA 2OJTA 1WODA 4ZS9A 1Z7NE 4GXAA 3VLVA 3ODBA 1AL3A 1DMBA 4KCCA 3MP8A 1FQDA 2RC9A 3E3KA 4R74A 3K4UA 4F29A 2Y7KA 2ZXTA 3C31A 3SEVA 2FA7A 3FXRA 1XVYA 3EQ1A 1MQDA 1A8FA 4OEUA 4G68C 3V83A 4YMBA 2UVHA 3PD8A 4OERA 1MS7A 2DSFA 2KLFA 1SQYA 4ZDMA 3SEWA 4ZEFA 1MDP1 4POXA 3ZSFA 5H8FA 1MXVA 3RNNA 4R73A 4GL0A 3MP6A 1MY0A 2DE2A 3S9NC 3IB2A 1B4ZA 1LFIA 3H06B 1Y20A 4JWOA 4IO3A 1LAHE 4LUBA 3DELB 3T96B 3RT8A 1PEBA 1L5TA 4JWYA 1MPCA 5L8DA 3ZKLA 4IO5A 3RPWA 1N3XA 2F97A 1ATGA 2W7YA 3ZKKA 2F5XA 4KR5A 1O64A 2XXTA 2YPNA 4TLLB 3LUYA 3UORA 1DPEA 5CM6A 1JEUA 3OO6A 4YAHX 1JNFA 3R26A 2O1LA 3N26A 4WEPA 4R6HA 5ITPA 3A3UA 1ZKBA 3EHSA 1LAXA 2H99A 4ND9A 5AE4A 2NUVA 3P7IA 1B3HA 1BIYA 3K2DA 2G29A 1LSTA 1JQFA 4GFRA 1SVXB 4KFQA 1B6HA 3CIJA 3KOSA 2GRVA 2PT2A 4LATA 1Y4CA 4HCYA 1XS5A 2YJPA 1D3KA 2O7UA 2ONKE 2QS1A 5KCJB 1MXYA 2F36A 2PYYA 4PETA 5CRYA 3I6VA 3DP8A 3JV9A 2VHAA 1SDXA 2XXRA 2ALUA 5JTYB 1MXZA 3PUZE 3DP4A 1ZIUA 4BDQA 1XT8A 4XXUA 2IEEA 3H4ZA 1JEVA 3FATA 2XD2A 4Z0IA 2ZYKA 3GBAA 4OFJA 2CZLA 5AA3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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