2BJJX

Structure of recombinant human lactoferrin produced in the milk of transgenic cows
Total Genus 228
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
228
sequence length
692
structure length
692
Chain Sequence
GRRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNDAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The Protein Structure of Recombinant Human Lactoferrin Produced in the Milk of Transgenic Cows Closely Matches the Structure of Human Milk-Derived Lactoferrin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
total genus 228
structure length 692
sequence length 692
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX03
2IEEA 2GFEA 4KR5A 2QJEA 5I58A 4IY6A 1JW5A 3O6IA 4GFRA 2PYYA 3ZSFA 2X26A 4R2FA 4ELPA 4F31B 1OVBA 3UGWA 1MRPA 3FV2A 3OEKA 4U21A 2X7PA 3AXFA 5H8HA 1ELJA 4H8IA 5BWJA 2OBGA 2H99A 4ELQA 5I56B 4N07A 1UIVA 5AA1A 3T9HB 3VVFA 1IXIA 1N0TA 3H4ZA 3LBSA 1D3KA 3T22A 4EXKA 5B70A 2OLBA 4AQ4A 4U1OA 4OYVA 1TFAA 1IXCA 3M3KA 1US5A 1UTHA 2RC8A 3K02A 1IIWA 4BDRA 4DZ1A 2F78A 2XXQA 1B58A 2B3BA 3PPOA 4PFWA 2I3VA 3E9XA 3CFZA 1P1UA 2XXYA 3L6HA 4LZ5A 3FUZA 3H6TA 1FTLA 4H5GA 3O28A 3IK6B 4RK2A 4FAJA 1JVXA 2HQ0A 2XXVA 2QS4A 4X1BA 4EQ7A 5AA4B 3V89B 1B3EA 4Q5TA 4EQBA 3QUFA 3KSXA 1DTGA 4QRZA 1GTKA 4H1XA 4YB6A 5ICTA 4ZEIA 4E0WA 3K6VA 4LZ7A 4ZE8A 4R74A 3LSWA 3H06B 3KBRA 2I6EA 4RPNA 3RLFE 3SEUA 5FTIA 3PPNA 3C31A 3RTFB 4DXUA 3N5LA 3RY3A 3GBBA 2XXXA 3MBPA 4O3CA 3RPWA 3VVDA 4EDPA 1OQGA 4M4GA 4U23A 5DTBA 4QFPA 4NF8A 4PQJA 4U4SA 4JBZA 4NE4A 2VD2A 1ANFA 2OCUA 2I49A 3U92A 2I58A 4F2OA 2HAVA 5DT6A 3MP6A 2ZYOA 3JV9A 4OFLA 5KZTA 3C9HA 4JSOA 3CFLA 2V25A 3FXUA 1M5DA 1IQ7A 3PMVA 4GD5A 3V83A 5L8DA 2R9JA 1R9QA 3O6HA 3FJGA 4QF9A 1B40A 1AL3A 2V3UA 1OLCA 4KFQA 3FJ7A 4JDFA 1B0LA 1CE2A 4P0IA 4OWDA 2ZNTA 4THIA 3FD3A 2F36A 4M1VA 4WKMA 3H03A 1FTMA 4NMYA 1GVCA 3THIA 1N7XA 3K6UA 1MH3A 3TELA 3WAFA 1GGGA 3EHUA 4DCYA 3IOWA 3MVYA 1MXUA 3V5AA 4PP0A 5ITOA 2RKMA 1O63A 1UTBA 3IAZA 5JK4A 1H45A 4R73A 3IJOB 2O7UA 4U22A 1IZ1A 4OERA 2XD3A 4IO5A 4NF6A 3FASA 3MUQA 4LVQA 4NF8B 4RJZA 3VDFA 4TLLB 4F18A 3K1PA 5TP9A 3ILUB 1IUDA 2PT2A 2WKYA 1B5JA 1LCTA 2LAOA 5AA2B 3S9MC 2YPNA 2ALUA 2ESNA 2REGA 3U93A 1QUIA 4ZZAA 3ZKKA 4Q8RA 1F9BA 2THIA 2DE3A 2Z23A 3IB2A 4OMBA 3C4MA 2DE4A 3DP8A 3G3GA 4ZEFA 4FATA 1I6QA 1EZPA 1N7WA 4HW8A 3TMGA 4GXAA 3TDJA 4G8MA 4H5FA 1BP5A 3G7WA 3CG1A 1B3GA 2QMXA 3MZBA 4GOTA 5F1QA 1QJMA 1A55A 3DP4A 3TTMA 4E0XA 4PFTA 5K2YA 1DPEA 1HSLA 1TFDA 1B7ZA 1ZKBA 1N04A 3KG2A 1B1HA 4LA9A 4O3BA 3BKIB 4RK9A 5CC2A 2F5XA 1IXHA 3CI8A 1D4NA 4JWOA 3M3LA 3MPLA 3TEPA 1A7LA 2NOOA 2O1MA 5I59A 3PPPA 1A54A 1NKXA 4O3AA 1ZLQA 4G8HA 4EXLA 5AE4A 2PVUA 4ELOA 4NEDA 4N6PA 3PGFA 1O64A 1Q35A 4OFJA 4OEUA 1MQHA 3DELB 3EN3A 2F6PA 3G3FA 3K1MA 3PUVE 2Y7PA 4Q30B 2FNCA 4MLVA 4OXVA 1HSJA 4WXJA 5KCJB 2ZNSA 2A5TA 4YZZA 3EF7A 5DEXA 3PUYE 1MQIA 4GL8A 4QFOA 1QUKA 4KCCA 4DE8A 3HCQA 3FGSA 4MF3A 1EZ9A 4DIGA 3RN8A 1FQCA 1NNKA 3UA8A 2HCAA 1TXFA 2YLNA 2VHAA 4P0GA 3VXCA 2DOJA 3EQ1A 3OEMA 4LQ2A 4HS7A 1OQHA 1YAEA 2F97A 4NTLA 3OXNA 4OFOA 4AB6A 3K00A 1MM6A 3Q29A 3I5OA 2QL3A 3M8UA 4H0WA 3SEVA 1POY1 3IR1A 4GVOA 3N6TA 4XXUA 2ANJA 2I0CA 1P1NA 4IB2A 5H8QA 1DSNA 1BIYA 3QUJA 2H25A 4FIMA 3WAEA 1GV8A 3TCFA 1XS5A 1M5BA 4RPOA 3FATA 3IL1B 4DLDA 1JNFA 3E13X 4U1ZA 3D4CA 4Z0IA 1A40A 2GHBA 1PBPA 3IB1A 2G93A 5FHMA 5H8HB 2XXTA 1QUJA 1N84A 2H4IA 3KJTA 4UA8A 1B4HA 3KEIA 2XXHA 3BBRA 4R9GA 3UIFA 4BDLA 1MQGA 1B4ZA 1Y9UA 4LONB 1OIBA 2DS9A 3VLUA 2I48A 1LBBA 1KWHA 3C36A 3HO7A 4LQ5A 1EZOA 4EQ9A 1SD3A 1S50A 3HSTA 4YU0A 3PMXA 4RXLA 3VVEA 3Q26A 1LFHA 1Y20A 1PB9A 5CMCA 5FHOA 3MVXA 1SW5A 2ZYNA 5ISUA 1MQJA 1IITA 2DWIA 2H9BA 1B6HA 1CB6A 1IEJA 4HCYA 3FVOA 3V8XB 1WODA 1EH3A 5JTYB 1LFIA 3W9WA 5TU0A 4BDOA 4DDDA 3O6GA 4WEPA 3JYRA 4GIZA 2BJJX 3CVGA 3G3KA 2OK2A 5B7DA 4IO4A 4RA1A 3BFUA 3TZAA 1VFEA 3ONMA 4F3BA 2D3IA 3T66A 1ZBMA 4U4XA 4F3PA 3TFLA 3CG3A 3G3HA 1LBCA 1SQYA 3MP1A 4QFLA 1D9YA 1XT8A 3KFMA 3SESA 5I2KA 1A8EA 1NFTA 2Y7IA 4KCDA 2ABHA 1QVSA 1Y3PA 3HN0A 2Q88A 4OETA 1URSA 5DEXB 3RUMA 4G68A 3H3GA 4LP2B 2ZNUA 3KN3A 2I0BA 4ZECA 2F34A 3K1NA 4FORA 1HSEA 3PPQA 3RGYA 1B7HA 1USYE 3VLVA 4JWYA 4YMBA 1B7UA 2HFBA 3L6GA 2P2AA 3OSRA 4IY5A 3PV0E 4FJPA 4JSDA 4GXSB 3FVNA 3D4GA 3RQTA 5BUUA 3ZS6A 3R6UA 1LSTA 2F7AA 1VFDA 5HBCA 1MY2A 1WVJA 2OJTA 2VP1A 3Q25A 4FEBA 4MFIA 4OESA 1WDNA 2R71A 2X7QA 2O51A 4PETA 2Q8JA 2RF1A 4DCXA 3TCHA 3A3UA 1MXVA 2IA4A 1ATGA 3IX1A 2Q89A 3IOVA 3KGCA 4BLAA 2QMWA 3TYHA 4I1DA 1MH4A 2CMOA 2F7BA 1URGA 4IGTA 2G29A 1MPBA 1SW2A 2FYIA 3TAJA 2RCAA 2A5TB 4NWDA 3CSBA 1SW1A 3KOTA 3O97A 1I69A 4H67A 1QKBA 1S9TA 2FA7A 1LAHE 4UACA 3LUYA 3FVGA 4RY1A 5H8FB 5I2NA 4GRKA 1BTJA 1UTHB 3E3KA 1AH5A 2Z22A 1ZJLA 3TTLA 1RYXA 2I4CA 4NF6B 4F3SA 2KLFA 3F11A 5M2VA 5JTYA 4ESWA 1US4A 2AL5A 2DSFA 4KYSA 1LAXA 1DMBA 4BDNA 3G3JA 4F1UA 1LAGE 3MJNA 2Z8DA 4XKNA 2DWHA 3G3IA 1T0KA 2NXOA 3MZ9A 3U72A 1POTA 3H6WA 3BFTA 1SYHA 4ZZEA 5KDTB 1LB8A 2ZMBA 2GH9A 3MW0A 3I3VA 3IOTA 1M5FA 4F2QA 1MY4A 2NWJA 3VV5A 2RC7A 5AA4A 1QKAA 3N6UA 3QK6A 1NH7A 4XKQA 3UK4A 2ONRA 5IAIA 5TPAB 1LLSA 2UVGA 4FEDA 2AIXA 5FTHA 1RYOA 5ELVA 1UIUA 4R75A 1LGBC 2D21A 1B2HA 3S9NC 4GLIA 4YKIA 2HXWA 3LR1A 3ZKLA 3KOSA 4H65A 1I6BA 4F29A 4LUBA 2PBWA 3O2AA 1O7TA 1VR5A 5A5XA 3HV1A 3E4RA 2ONSA 4JWXA 3VLWA 5DYHA 3IB0A 1JW4A 3TQWA 1Y4TA 4OEVA 5TPAA 1N3XA 1NH8A 4KHZE 2DQVA 5L9OA 1NNFA 1XOCA 4TLMB 2QPQA 4NF4A 4NF5B 4GWOA 5H8NB 3SERA 4NF4B 1MXYA 1ZU0A 1P1WA 2Y7WA 4OENA 3K6WA 4R6YA 1NMUA 4IO2A 2UVJA 1S7YA 1ZIUA 3HHFA 5I57A 4H6DA 3C32A 2CZLA 3OSQA 3CRBA 5I2KB 3N94A 4BDMA 2B3FA 3TPAA 2NVUB 1OLAA 1RKMA 2DYXA 2Z8EA 3O66A 4ZDMA 3MPKA 5DVJA 2UYFA 2XXWA 3LSXA 3B6QA 2HZKA 5H8QB 3VXBA 3SEYA 5HPQA 3IOUA 4OTEA 1GR2A 2F35A 3QIMA 5I59B 1FQDA 3ILTB 3PD9A 1FTJA 4NWCA 2I3WA 1JEVA 2O68A 4R2BA 2D5WA 4YAHX 1MY3A 2M8CA 3W9VA 4BDQA 1MY0A 1JQFA 4XKPA 2XX8A 4LATA 2YJPA 5CBRA 3S2VA 3LSFB 5EYFA 1IXGA 4I62A 3MWBA 1FQFA 4PFUA 1A8FA 4XKRA 3T96B 2DXYA 2VGQA 2XD2A 1JEUA 1XC1A 2Q2AA 3GBAA 1R6ZA 1B51A 3PMWA 4NF5A 4XTCQ 5H8NA 1H43A 3FXQA 5DVFA 1PB8A 2Q9TA 3OELA 3OO8A 4GQOA 3TODA 1MDP1 1SYIA 1B1XA 3SKPA 4F1VA 4KPTA 2F6GA 1A99A 1YPNA 4G4PA 1FCKA 1P99A 1TWYA 5ICQA 1OVTA 3CR9A 3FV1A 2Q2CA 4RYAA 1Z7ME 4P11A 2OWSA 4G2ZA 2QS2A 3GLBA 4MLQA 5KDTA 4AB5A 2QSXA 2H98A 1II5A 1H44A 2XX7A 1P1QA 3MAMA 1ZTYA 3FZVA 4DXCA 1MXWA 2QS3A 5AA3A 3PU5A 4N13A 1FW0A 2V3TA 1SBPA 1J1NA 4OHNA 4PE5B 2B65A 4K3FA 3K6XA 1N3WA 4LZ8A 1MY1A 3QXMA 4POXA 2V93A 2V84A 4IGRA 2ONKE 1I6AA 3OO7A 2V3QA 3MQ9A 2PMSA 2Y84A 4ZE9A 5TP9B 2A5SA 3HHGA 1MXXA 1B32A 1MG1A 5EHSA 5AA2D 1YCJA 2UXAA 3A09A 2QS1A 1SI0A 3KSJA 3SETA 2AYSA 4ESXA 4ONYA 3EPEA 3C34A 3C35A 5I84A 4RNSA 5CMBA 1DPPA 3TQLA 1Y1ZA 4HCWA 1PDAA 4QFKA 3H6UA 3OD7A 3P7IA 3U8QA 1XVYA 3MVZA 3RNNA 4F22A 3TUSA 4G77A 4ZEDA 3RT6B 1B52A 2OWTA 2RC9A 4F3GA 1LCFA 1MXZA 3MC2A 2RCBA 3S4UA 4EF2A 1OMPA 1UQWA 1LB9A 4ELRA 4YMAA 3TTKA 1Q1KA 1B3HA 3T93B 3DLNA 3DP6A 1AIVA 1BLFA 3U1OA 5LOMA 1XHYA 3FXRA 3I6VA 3B6WA 1NNPA 1R1NA 4IO7A 1DOTA 1Y3NA 3Q28A 4GL0A 5CM6A 4ZS9A 3W15C 5CMMA 4YB7A 3U94A 4KI0E 3TTNA 3SDFA 5CBSA 4DXBA 3OO6A 3VFJA 1R9LA 1B0HA 1PEBA 1LAFE 1M5EA 3OMBA 4F1YA 1Y3QA 1B46A 2QRYA 5I57B 3ECRA 2XXIA 5CRYA 2O7IA 2VOZA 3A3CA 3DM0A 3KN8A 3MZ1A 1PC3A 1L5TA 3T9XB 1AOVA 4ND9A 3Q27A 1B9JA 3TKDA 4R72A 2DP8A 2DVCA 3PPRA 2ZXTA 4QSCA 4YKJA 5HM4B 1ZMGA 1MDQA 5EHMA 1P1OA 2Y7RA 3SEXA 3IO6A 1TT1A 3UP9A 2H5YA 3QSLA 2DE2A 1QULA 2GHAA 2ZYMA 1JW1A 3K2DA 3M3FA 3PD8A 2VD3A 2XXPA 3CSGA 4YICA 4C1TA 5JEIA 5A5XB 3T9VA 3KJ7A 1JVYA 4OZ9A 3RT8A 3TCGA 1NL5A 2O84X 1SI1A 2UVIA 3QAXA 4OQOA 5L9MA 4IO6A 4X1DA 3T9UA 3EHTA 2PX1A 1MQDA 4QSEA 1XVXA 1Y4CA 2W7YA 4KQPA 4ZEBA 1JETA 2HAUA 5J1DA 5I56A 4WEDA 4X9TA 1USYH 3IORA 5CI5A 2DXRA 1URDA 2DWJA 2NUVA 5DVIA 3S9EA 4KD5A 5CMKA 4KYDA 2AL4A 2R6GE 2XXRA 3LSLA 4G68C 5I2NB 4JXIA 1M5CA 4QSDA 2F7CA 5KCJA 1PBQA 4MH5A 1NNTA 3H6VA 3IO4A 4YKPA 3B7DA 3SEWA 1YTVA 2DVZA 3MVWA 4QHQA 1FQEA 5F7VA 4F19A 4F39A 2I4BA 3OENA 1FTKA 4X48A 1QW0A 1AMFA 5FHNA 3CFXA 1H76A 1B5IA 1MPDA 3RTWB 2REJA 3FVKA 4R6KA 2XX9A 3JZJA 2RINA 3R26A 3UN6A 2HZLA 3R7XA 3H7MA 3PUWE 2F8DA 2XXUA 1PB7A 4IO3A 2GRVA 2UVHA 4XIGQ 4YKKA 2O69A 1BKAA 1Z7NE 3CIJA 2XHDA 3KZGA 1B3LA 3O29A 2E1SA 3VE1B 1FQAA 4ECFA 3GXAA 3S9LC 2P0SA 1Y1MA 1B5HA 3C33A 3ODBA 4GF8A 4TOZA 3KN7A 2HEUA 3FJMA 4I8CA 1VSOA 3QYTA 2O1LA 1N76A 2DWAA 4POWA 4OVJA 3EHSA 3HPIA 4Q0CA 1SVXB 4JB7A 4ISUA 2Y7KA 2E0SA 1MM7A 4PFYA 4I9DA 4U2RA 1EU8A 3FIRA 5I58B 1MS7A 4R9FA 5H8SA 5ITPA 1D9VA 4C0RA 3K0VA 1LFGA 2PT1A 3MP8A 1H3DA 2Z8FA 4L17A 1FTOA 3UORA 3PUZE 5AA2A 3IJXB 3TTRA 1DTZA 2O6AA 4HTGA 4EF1A 2OZZA 5IKBA 3K4UA 1B3FA 1B05A 4Z7EA 5L9SA 3B6TA 4H8JA 4EUOA 4YB5A 4G8NA 4KYEA 4C1UA 3OOAA 2P1SA 4TQUQ 1VE4A 4R6HA 4FECA 2ZYKA 1UTBB 3OO9A 3PUXE 5H8FA 3LC8A 4ZEKA 3USDA 1SDXA 4MBPA 3O9PA 1SW4A 3K01A 2UYEA 1FQBA 4QFNA 3GZGA 4G68B 5K2XA 1MPCA 4FE8A 3N26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IEEA 4KR5A 1JW5A 3ZSFA 1LBZA 5H8HA 1ELJA 4H8IA 5L9SA 2OBGA 2H99A 4N07A 5AA1A 1IXIA 3H4ZA 4H45A 1US5A 2XXQA 2B3BA 3H6TA 4PDHA 3IK6B 4FAJA 2HQ0A 4X1BA 4Q5TA 3QUFA 3KSXA 4ZEIA 4E0WA 3K6VA 1FSAA 4RPNA 5FTIA 3RTFB 4PE3A 2WEFA 4QFPA 4JBZA 5I5PA 1IMEA 2I58A 4OFLA 3CFLA 1R9QA 3O6HA 4XKQA 5A5LA 4WKMA 4M1VA 3H03A 3THIA 1N7XA 3K6UA 1GGGA 3IOWA 1MXUA 4PP0A 5ITOA 2RKMA 1CNQA 2O7UA 3IFAA 4OERA 2XD3A 4GWZA 4TLLB 3K1PA 2Y5KA 3ILUB 2LAOA 2ESNA 2VT5A 2THIA 2Z23A 4OMBA 1RDZA 4FATA 1I6QA 4G8MA 3G7WA 5F1QA 1QJMA 3TTMA 1FPBA 5CC2A 3BKIB 2F5XA 4JWOA 2NOOA 2Q8MA 4NEDA 4OFJA 4OEUA 3PUVE 2FIXA 4WXJA 2ZNSA 3PUYE 1MQIA 4PDDA 2HCAA 4P0GA 2DOJA 4LQ2A 4OFOA 4X04A 2QL3A 3M8UA 4H0WA 3IR1A 4XXUA 3N6TA 4IB2A 2H25A 3WAEA 1XS5A 4RPOA 3FATA 4DLDA 2GHBA 1PBPA 2P3NA 5H8HB 3SZPA 1N84A 2XXHA 3BBRA 1Y9UA 3C36A 1KWHA 2OX3A 3PMXA 2DDKA 2ZYNA 1IITA 2DWIA 2H9BA 1CB6A 4BDOA 4DDDA 3O6GA 5B7DA 4U4XA 3KC1A 3MP1A 1A8EA 3U94A 4UABA 2ZNUA 4ZECA 4PAKA 3VLVA 1USYE 4YMBA 2P2AA 4O7MA 3ZS6A 4I3EA 1VFDA 1MY2A 1WVJA 2OJTA 4FEBA 4OESA 1K9ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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