2BJJX

Structure of recombinant human lactoferrin produced in the milk of transgenic cows
Total Genus 228
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
228
sequence length
692
structure length
692
Chain Sequence
GRRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNDAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal binding protein
source organism Homo sapiens
publication title The Protein Structure of Recombinant Human Lactoferrin Produced in the Milk of Transgenic Cows Closely Matches the Structure of Human Milk-Derived Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
total genus 228
structure length 692
sequence length 692
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX03
4F1YA 1B2HA 4U4SA 2RKMA 1M5BA 4UA8A 3CSBA 4ELQA 3O2AA 3V83A 3IOWA 3CG1A 3TPAA 4IO5A 1PBQA 4PFYA 3USDA 5DVJA 3I5OA 4FORA 2DWIA 2G93A 2DSFA 2RC7A 3U93A 4MFIA 2I48A 5I84A 3DELB 4NTLA 5ICQA 3DLNA 3UN6A 3VE1B 3IK6B 1Z7ME 3LSWA 4ZS9A 3MP1A 1JW5A 5AA2A 1B0HA 1S7YA 4XKQA 1USYH 2PVUA 3CFZA 4R6YA 3CFLA 2PMSA 3OSQA 1D3KA 4F1UA 2I0BA 4EDPA 3OELA 1XOCA 3OO7A 4PFUA 1SW2A 5TP9A 1USYE 1N0TA 1N3XA 3FXRA 1B05A 2G29A 2O69A 4G68A 5FHNA 4Q30B 2DQVA 3V8XB 4IB2A 4JWOA 2LAOA 1NNFA 2GHBA 2H99A 3TTLA 1MY1A 4DXCA 4YZZA 2V93A 1LCFA 5L8DA 2DVCA 1B3FA 1DSNA 1B58A 4YAHX 2NUVA 1I69A 1B4HA 2RC9A 3PPOA 3K1NA 3FJMA 4DZ1A 2DXRA 3PGFA 5AA1A 4YICA 2XXYA 1YPNA 1TFAA 1ZKBA 1MDP1 3HCQA 2REJA 1BLFA 1B3EA 2XXTA 3EHTA 4FATA 3MW0A 2H4IA 1JEUA 1A55A 4BDOA 3LSLA 4ESWA 3IB1A 1RKMA 2H9BA 3IB2A 3TTKA 2VD3A 3Q26A 4OQOA 1P1QA 4E0WA 2VP1A 4KCCA 3KOTA 2YPNA 2X7QA 3I3VA 3K6UA 1QULA 3CRBA 3MVZA 3QAXA 1FTKA 1LFIA 4DDDA 4LZ8A 1N7XA 1B1HA 4O3BA 1R1NA 2I49A 1VE4A 3VVDA 3CI8A 1UTBA 1PB7A 4RJZA 2HZKA 1LGBC 3PMXA 1SW5A 3VLWA 1R9QA 4HS7A 4OXVA 3RLFE 1IXIA 1N76A 4QFPA 3K6WA 1HSEA 4YKJA 5ELVA 1D9YA 2CMOA 1Y20A 2VOZA 3KJ7A 3VVFA 1M5FA 4EXKA 2Z22A 1Q35A 2ZNTA 3FJGA 1QUJA 4NE4A 4AB5A 4BDLA 2ZNSA 3FXUA 4YKPA 5HPQA 3TTNA 4ZDMA 1VFEA 5I58B 2DWHA 2DE3A 3PV0E 5DYHA 3F11A 5CBSA 4ZEKA 3KFMA 3RTFB 2UYFA 1IEJA 3LSFB 1PB8A 4IO6A 3ZSFA 1MRPA 3E13X 2UVHA 4TLLB 2F8DA 1H44A 2B65A 3O6HA 4MH5A 4HCYA 1Z7NE 3FUZA 3PU5A 4P11A 3K00A 4BLAA 3IJXB 3QYTA 4H67A 2XXQA 5I56B 2O6AA 2F35A 4G8MA 4F19A 3FASA 5I2NB 5JTYA 3R6UA 1DOTA 4NWDA 5JEIA 3OEKA 1CE2A 1NNKA 3MVXA 4NF5B 3K2DA 1IXGA 4OENA 4KYDA 5KCJA 3HHGA 3IO4A 1R9LA 2V84A 5DVFA 4XIGQ 4EQ7A 1US5A 4XKNA 2V3UA 1A40A 3TMGA 3TKDA 3SDFA 3UP9A 4DXUA 1N84A 3V89B 3HSTA 4YMBA 4BDMA 1ANFA 1LAXA 4ELPA 1POY1 2QS1A 3C9HA 4WKMA 4RYAA 2YJPA 4BDNA 3EPEA 3RUMA 2DS9A 5F1QA 2Q89A 5H8SA 4F31B 1Y9UA 4R9GA 3HV1A 1HSJA 3RNNA 1LAGE 2XXHA 4OEVA 3OSRA 2KLFA 3FVOA 3KSJA 4TOZA 1GV8A 1SD3A 3FVKA 2NWJA 1B3GA 3OD7A 4LONB 3N5LA 2XD3A 4F22A 1N7WA 3A3CA 4DCXA 3FD3A 1RYXA 3MJNA 1ELJA 4GL0A 3QIMA 4KCDA 2UXAA 2HZLA 3K6XA 3SEXA 3H7MA 5A5XA 2O7UA 1A8EA 3EQ1A 4OFJA 3CSGA 4IY6A 4OYVA 4OERA 2VHAA 1QJMA 2FA7A 1URGA 2O51A 2VGQA 3KN8A 4EXLA 4BDRA 4BDQA 1UQWA 3Q25A 5AA4B 1MM6A 3G3HA 3C31A 5AA2B 3VLVA 1XC1A 3DP8A 5KDTA 3O66A 2ZYNA 5DEXB 1RYOA 1TT1A 1WODA 4POXA 4I8CA 2PBWA 1MXVA 3TTMA 2F7BA 2RC8A 4LVQA 1MPBA 2DXYA 4GQOA 4QFLA 4U22A 4ZECA 1FQEA 2I3WA 3KOSA 2XXWA 1N3WA 3HHFA 4WEPA 5TP9B 1LB9A 5CC2A 5M2VA 5FHMA 4G68B 4RPNA 1P1NA 1AH5A 4C1TA 4XKRA 1ZLQA 1IQ7A 4FIMA 3EHSA 3JZJA 3C4MA 3K1PA 3FZVA 4DCYA 4QF9A 1XT8A 4RK2A 1A54A 4LZ7A 4TLMB 3O6IA 4YMAA 3H6VA 3H6UA 4GXSB 4NMYA 2DP8A 1B6HA 1MXWA 2PT1A 2ZYMA 2ZYOA 4YB6A 3CVGA 2BJJX 5I59A 5IAIA 1KWHA 3B6TA 4G4PA 3CG3A 5AA2D 3G3JA 4F2OA 1QVSA 3Q27A 3KSXA 3T9UA 5EHSA 4N07A 4AB6A 4H8IA 2RCBA 3FJ7A 5H8NA 1ZIUA 5CBRA 3S9EA 1FW0A 3U1OA 2DE2A 4G8HA 4MBPA 4X1BA 5ISUA 1B7ZA 4U1OA 2Z8FA 4DXBA 4GWOA 1B51A 1GR2A 4R2BA 3OO8A 3IORA 4H8JA 3UORA 4QSEA 4NEDA 2OK2A 3S4UA 1JNFA 4MLQA 1PEBA 3CR9A 3H4ZA 1DMBA 5IKBA 2E1SA 1IUDA 3O28A 3W15C 3OOAA 4Q0CA 4R75A 1UTBB 1D9VA 4QSCA 3C33A 4ZZEA 1QKBA 3M8UA 1L5TA 1URSA 2QJEA 3FVGA 1ZJLA 1Q1KA 2UYEA 3EHUA 3N94A 2PYYA 3M3FA 2DOJA 4R73A 1N04A 5CM6A 3H6TA 3IOUA 5DT6A 2UVJA 2ONSA 3BFUA 4X1DA 2O1LA 3FVNA 1WVJA 4F3PA 4ONYA 3PUWE 3GBBA 4LATA 3O9PA 3CFXA 1LB8A 4JB7A 4KI0E 5I57A 4ND9A 1M5CA 2X26A 4HTGA 2Y7RA 3G7WA 3N26A 4ELRA 3K1MA 4ZE9A 4PE5B 2D5WA 1PC3A 3OXNA 4DE8A 4WEDA 3B7DA 4KD5A 2QS2A 1FTLA 3IAZA 3R7XA 1FTJA 3IL1B 2OZZA 5JTYB 3IR1A 2XD2A 3LBSA 2QMWA 4X9TA 4WXJA 3MVWA 5L9MA 5K2YA 2Y7KA 3VXCA 2VD2A 2Z8DA 5KCJB 1FCKA 1NNTA 4RPOA 1JQFA 1Y3PA 3PUXE 3GZGA 4IO7A 1EZPA 4DIGA 4ECFA 2F7AA 4LUBA 3CIJA 4QHQA 1MM7A 3P7IA 4UACA 3H03A 5KZTA 3PMVA 3M3LA 5K2XA 3I6VA 3DP6A 2HCAA 1OQGA 3ONMA 4U23A 5JK4A 3OO6A 5CMCA 4KQPA 3TYHA 1JW4A 5ICTA 1LFGA 2R9JA 1P1UA 2O7IA 1NMUA 3A09A 1LSTA 3VFJA 3KN3A 1B3HA 5A5XB 5CMBA 1HSLA 4Z7EA 3UK4A 4NF8A 3QUJA 1B4ZA 1LLSA 1ZMGA 4KYEA 2GFEA 4NF4B 1SQYA 4E0XA 4GD5A 4YB7A 1NKXA 4OZ9A 1GVCA 1B46A 4ZEIA 3TELA 4EUOA 4ISUA 1O63A 3U8QA 3G3KA 4I9DA 3G3IA 5KDTB 3B6WA 1LAHE 3Q29A 1Y1MA 1UTHB 4POWA 1TFDA 2REGA 1FTMA 2OLBA 3TZAA 5B70A 3RGYA 5EHMA 3PUZE 2A5SA 3U94A 5F7VA 2HQ0A 1B3LA 3SEVA 2R6GE 3DM0A 4GLIA 4G68C 1P1WA 4I1DA 4Q8RA 3FGSA 3TFLA 3MWBA 3VV5A 3MQ9A 4R6HA 2IEEA 3C36A 4R6KA 3FXQA 1GGGA 3ZKLA 3L6GA 4NF6A 1ATGA 5AA3A 2HXWA 3N6TA 2Y7WA 2RCAA 2QL3A 1MQHA 1MXZA 4U4XA 2QSXA 3DP4A 2M8CA 1MQIA 1R6ZA 3ECRA 3GBAA 3PPNA 2Y84A 1OMPA 2ESNA 1YAEA 1ZTYA 3ILTB 5BWJA 4OTEA 2Q8JA 2ALUA 2D3IA 2P2AA 5FTIA 2I3VA 2PX1A 3IO6A 2DE4A 1M5EA 5H8NB 3K02A 3H6WA 4KFQA 3K0VA 5TPAB 4KHZE 4FJPA 2NVUB 4ELOA 3HO7A 3R26A 3SEWA 1MS7A 1FQFA 4YB5A 3TUSA 4F1VA 2QPQA 3MP8A 3KBRA 5DVIA 2B3FA 4EF2A 1XS5A 1QUIA 1VR5A 4N13A 3ODBA 4KPTA 2ZXTA 1O7TA 4GL8A 2DYXA 2PT2A 5ITPA 3MZBA 1B5HA 2THIA 4RXLA 2GHAA 1MH4A 3OENA 2I58A 1OIBA 4GXAA 4IGTA 3RQTA 5J1DA 1SDXA 1NH7A 4X48A 5H8FA 3LUYA 1SW1A 1B5IA 1T0KA 2XXIA 3SEUA 4LQ5A 2XX8A 4N6PA 2ZNUA 4IO4A 1YCJA 3UA8A 1LAFE 5LOMA 1TXFA 4LP2B 3O97A 3VXBA 1P99A 3TTRA 4R74A 3PD9A 4FAJA 3C35A 3MP6A 2ONKE 2OWSA 3C32A 2F78A 3M3KA 4JSOA 1I6QA 3K01A 2HAVA 3THIA 3SETA 2B3BA 3KEIA 1MXXA 4ZEDA 1S9TA 4ZE8A 3A3UA 2Z8EA 4G8NA 3FIRA 3MC2A 1I6AA 4OWDA 1Y3NA 3QK6A 2F97A 2XXUA 3PUVE 4OHNA 4IO2A 3N6UA 4OESA 4AQ4A 3KZGA 4C1UA 4QFKA 1MDQA 3H3GA 5I2KA 5H8HA 3BKIB 1URDA 3TQWA 1MQDA 1IXCA 3TAJA 1SVXB 1J1NA 3AXFA 2RINA 2A5TA 3G3FA 2UVIA 3S9LC 3RTWB 5B7DA 2F5XA 3IB0A 1H76A 4ZZAA 3JYRA 1NL5A 1II5A 3E3KA 1NH8A 3IJOB 4R2FA 4R9FA 1MY2A 1FTOA 2AYSA 4F3GA 4O3AA 1EH3A 2QS4A 1SI1A 2CZLA 4DLDA 3RT8A 2GRVA 1H45A 4L17A 5H8QA 3BFTA 1A7LA 1IIWA 3KGCA 5AA4A 2DVZA 4Q5TA 4KYSA 3IOTA 3K4UA 2I4CA 4PP0A 3LR1A 3PPQA 3T9XB 5DEXA 2E0SA 1D4NA 2HAUA 4IY5A 4H65A 4RNSA 3SESA 4FE8A 2I4BA 1LCTA 4NF8B 3RT6B 3EN3A 1Y3QA 3T9HB 1QUKA 1UIVA 1SW4A 3KG2A 4KR5A 1MQGA 2XHDA 3T93B 4FECA 1MG1A 2WKYA 1JVYA 2I6EA 4H0WA 2F6PA 2IA4A 2DWAA 4FEDA 2NOOA 4YKIA 3VDFA 2V25A 1MY4A 1NNPA 3MVYA 4THIA 2ANJA 1B5JA 4F3SA 4F2QA 5HBCA 5CMMA 4QSDA 3HN0A 3OMBA 2D21A 1B7HA 1MPDA 5TU0A 5DTBA 3IOVA 1OVBA 1PB9A 4GF8A 4YU0A 3RPWA 1JW1A 2QMXA 3S2VA 2F6GA 1MQJA 4ZEFA 1BKAA 4IGRA 2X7PA 1B0LA 2FNCA 5ITOA 2Y7IA 1MY3A 2XX7A 4NF6B 1A99A 1OQHA 3ZS6A 1AOVA 3GLBA 2OBGA 3RY3A 3SERA 1FQAA 4NWCA 5EYFA 1SYHA 4P0IA 3HPIA 3T9VA 4QFOA 4OETA 2HFBA 1DPPA 3IX1A 5CRYA 1EZ9A 1LBBA 3FV2A 3D4GA 1H43A 4Z0IA 3D4CA 1DPEA 3SKPA 2FYIA 1PBPA 4JSDA 1OVTA 4OVJA 1NFTA 1MXUA 1OLAA 3W9VA 4F3BA 2XXXA 4MLVA 2V3QA 3QUFA 2O68A 1Y4CA 4OMBA 1AIVA 3MZ1A 4H5FA 2F7CA 4ESXA 1XVYA 4EQBA 2YLNA 2P0SA 3B6QA 2Q9TA 4U21A 4H5GA 1FQBA 3OO9A 3T66A 3MPKA 4QFNA 1M5DA 4RY1A 2QS3A 3G3GA 3SEYA 2O1MA 4JWYA 3PPRA 5FHOA 4H1XA 1IITA 1DTZA 2DWJA 4OFOA 3KJTA 2I0CA 2Q2CA 5H8FB 1IXHA 2QRYA 2Q2AA 3TQLA 1YTVA 1Y4TA 2OWTA 1MXYA 5HM4B 1A8FA 1S50A 3QXMA 1BP5A 2GH9A 2AIXA 2AL5A 2F36A 2XXVA 4XKPA 2ONRA 1AL3A 4O3CA 2ZYKA 1OLCA 2O84X 4GIZA 1TWYA 2NXOA 3BBRA 3O6GA 1I6BA 4M4GA 1PDAA 4LQ2A 3MUQA 4H6DA 4I62A 4FEBA 4PETA 3TCGA 1O64A 3VVEA 3S9MC 4JDFA 3TCHA 3UGWA 2V3TA 4U1ZA 5I59B 3TDJA 2W7YA 5AE4A 1MPCA 4U2RA 2XXRA 2ABHA 4XTCQ 3OEMA 3S9NC 1US4A 5I2KB 5L9OA 5H8HB 2Q88A 3U72A 3FV1A 1B52A 3MZ9A 3RN8A 4GFRA 2P1SA 3MAMA 4PQJA 1XHYA 4GVOA 2A5TB 3TEPA 2ZMBA 1JEVA 2XX9A 4GRKA 4F39A 1SYIA 3EF7A 4G77A 5L9SA 4RK9A 3MBPA 2UVGA 4M1VA 4F18A 4K3FA 2H98A 1VFDA 5I58A 2R71A 3TCFA 4LZ5A 3FATA 1H3DA 2Y7PA 3LSXA 4PFWA 1VSOA 3GXAA 1B7UA 4NF4A 4GOTA 1QW0A 3K6VA 5H8QB 3E9XA 1XVXA 5BUUA 3TODA 2HEUA 1AMFA 1CB6A 1MH3A 1B40A 2H25A 1B32A 4JBZA 4RA1A 1IZ1A 3WAEA 4PFTA 3C34A 4F29A 2Z23A 3UIFA 1QKAA 1UTHA 4C0RA 1SI0A 1ZU0A 3KN7A 1LFHA 5I56A 4ZEBA 4XXUA 3E4RA 4JWXA 4EQ9A 2F34A 5I2NA 3VLUA 4EF1A 3O29A 1EU8A 3T22A 5I57B 4JXIA 3T96B 3LC8A 4LA9A 3Q28A 5FTHA 3ZKKA 2OCUA 4NF5A 1F9BA 5CMKA 3JV9A 1FQCA 1UIUA 4R72A 4IO3A 4HW8A 1P1OA 2XXPA 3PUYE 4QRZA 1JETA 2H5YA 3U92A 1B1XA 3ILUB 1FQDA 5CI5A 1WDNA 2OJTA 4HCWA 1SBPA 4P0GA 1DTGA 4YKKA 3L6HA 4MF3A 3H06B 3PD8A 3PPPA 3PMWA 1MY0A 3WAFA 1EZOA 1BTJA 1LBCA 1JVXA 2RF1A 1B9JA 3QSLA 1POTA 3W9WA 1BIYA 1GTKA 4OFLA 4OEUA 4TQUQ 2AL4A 3MPLA 1Y1ZA 3V5AA 1ZBMA 5TPAA 4G2ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F1YA 1B2HA 4U4SA 2RKMA 1M5BA 4UA8A 3CSBA 4ELQA 3O2AA 3V83A 3IOWA 3CG1A 3TPAA 4IO5A 4JVDA 2PFYA 5EQAA 1PBQA 4PFYA 3USDA 3IFAA 5DVJA 3I5OA 4FORA 2DWIA 2G93A 2DSFA 2RC7A 3U93A 4MFIA 2I48A 1NV1A 5I84A 3BIGA 2QVVA 3DELB 4NTLA 5ICQA 3DLNA 3UN6A 3VE1B 3IK6B 3ISPA 1Z7ME 3LSWA 4ZS9A 3MP1A 1JW5A 5AA2A 1B0HA 1S7YA 1VDWA 4N8GA 4XKQA 1USYH 2PVUA 3CFZA 4R6YA 3CFLA 4GX6A 2PMSA 3OSQA 1D3KA 4F1UA 2I0BA 4EDPA 1LBXA 3OELA 4P3LA 2OWZA 1XOCA 2FIXA 3OO7A 4PFUA 1SW2A 5TP9A 1N0TA 1USYE 2Y5LA 1N3XA 3FXRA 1B05A 2G29A 2O69A 4G68A 5FHNA 4Q30B 2DQVA 1LBWA 3V8XB 4IB2A 4JWOA 2LAOA 1NNFA 2GHBA 2H99A 3TTLA 1FBFA 1MY1A 4DXCA 4YZZA 2V93A 1LCFA 5L8DA 2KQZA 2DVCA 1B3FA 1DSNA 4PC9A 2ZZVA 1B58A 4YAHX 1KZ8A 2NUVA 4OA4A 5ET8A 1I69A 1B4HA 2RC9A 3PPOA 3K1NA 3FJMA 4DZ1A 3BIHA 2DXRA 3PGFA 4AS4A 5AA1A 1FRPA 4YICA 2XXYA 1FBDA 1YPNA 1TFAA 1ZKBA 1MDP1 3HCQA 2REJA 1BLFA 1NI9A 1B3EA 2XXTA 3EHTA 4FATA 3MW0A 2H4IA 1JEUA 1A55A 1LBZA 4BDOA 3LSLA 4ESWA 4GWXA 2WBDA 4P56A 3IB1A 2WBBA 1RKMA 2H9BA 3IB2A 3TTKA 2WX9A 2VD3A 3Q26A 4OQOA 1P1QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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