2BJJX

Structure of recombinant human lactoferrin produced in the milk of transgenic cows
Total Genus 228
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
228
sequence length
692
structure length
692
Chain Sequence
GRRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNDAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
publication title The Protein Structure of Recombinant Human Lactoferrin Produced in the Milk of Transgenic Cows Closely Matches the Structure of Human Milk-Derived Lactoferrin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 228
structure length 692
sequence length 692
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX03
1MS7A 3VLVA 5H8FA 1XVXA 1MG1A 3Q29A 4ELQA 4F3GA 3IB1A 3USDA 4F18A 4GLIA 1SW4A 2GRVA 4AQ4A 2Z23A 1LAGE 3KGCA 4HS7A 2R6GE 4MBPA 2XXQA 3MP8A 2W7YA 1BLFA 2P1SA 1AMFA 2OLBA 3TFLA 1J1NA 2I48A 4BDNA 1YCJA 4ZEKA 1ZU0A 4MLVA 5BUUA 2QPQA 4OETA 5AA2D 2X7PA 4KHZE 3R26A 3K4UA 1LLSA 4ELOA 1MM6A 4ZEIA 1HSLA 1Y9UA 3TTNA 2CZLA 1B32A 1OVBA 5TU0A 3KN8A 3MUQA 3FD3A 4ZECA 1UIVA 1SQYA 1S7YA 3HPIA 3ECRA 1WDNA 3M3LA 4NF4B 2DE4A 4M4GA 5AA3A 3O2AA 4G8HA 1Y1MA 4GXSB 4X48A 1IIWA 1M5BA 1DOTA 3UP9A 2DE3A 2O51A 4PFUA 1P1WA 4Q30B 2F78A 2UVJA 2ZYNA 3V5AA 4DCYA 3TUSA 3TDJA 5I2KB 1IXGA 2BJJX 5AA4A 1H3DA 4X9TA 3T9UA 1FQBA 4BDMA 4R6YA 2P0SA 2XXYA 4R2BA 3U94A 1AIVA 1AH5A 3O29A 2XD2A 3T66A 4F3PA 3KJ7A 3MVZA 1AOVA 1IXHA 4YKIA 3OMBA 4GXAA 2UVIA 3DP4A 3O66A 4ZEBA 3U8QA 1VE4A 1FTJA 2XXTA 1MQDA 3TPAA 1NNKA 1B3EA 4FJPA 3EF7A 4I1DA 2F7BA 1MXWA 3F11A 3PV0E 5TP9A 3U93A 4NMYA 4QFPA 2Q8JA 3SEVA 2NUVA 4U1OA 5AE4A 4OFJA 4OESA 1B4ZA 4E0WA 1A8EA 3RGYA 2PT2A 1A99A 4GRKA 4F3SA 3FVOA 1EU8A 2ONSA 1Y1ZA 2HXWA 3OXNA 3K02A 1OLAA 3GLBA 3HHGA 4P0GA 4F2QA 1RYOA 4JXIA 4H67A 4EQ9A 1XOCA 2QL3A 2OWTA 5FTHA 3U1OA 4KCCA 2F7CA 1Y4TA 4ZE8A 3R6UA 1JNFA 4LVQA 4F22A 3CVGA 5AA2A 3ZKKA 1B5HA 5DEXA 3QUFA 4EUOA 1MRPA 4QSDA 3V83A 4YB7A 3TTLA 4X1BA 4F2OA 3K6UA 3UN6A 3O97A 3MVYA 1OQGA 3PMWA 1NH8A 4NF6A 1IXCA 3N94A 4IO2A 5IAIA 2UYEA 3LUYA 5KCJA 3QAXA 1BP5A 1B7UA 3MZBA 2ZYKA 2DXYA 3H06B 4XKPA 1OQHA 3R7XA 2V3TA 2I58A 2XXHA 3H3GA 1Z7NE 1N04A 3QK6A 2OBGA 3MVXA 4RYAA 2Q89A 2I4CA 3VLWA 4JWXA 1URDA 1RYXA 3O6GA 4OEUA 2REJA 5I59B 3EQ1A 3PMVA 3OEMA 1JEVA 1US5A 4G68B 2O7UA 4NF8B 3H7MA 5K2YA 5DVJA 4DXBA 1A40A 3FV1A 4KI0E 5CI5A 1A55A 2HAVA 3TTMA 4R9GA 1SYIA 3M3FA 1II5A 4I8CA 3K2DA 5BWJA 2OK2A 2VP1A 4RA1A 5JEIA 1B3HA 2LAOA 1SDXA 3QXMA 1LBBA 4IO5A 1B3FA 3E4RA 3VFJA 4H5FA 4F19A 4YMAA 3MP6A 3G3JA 2DE2A 3K0VA 3RPWA 4TQUQ 2FNCA 5A5XA 3H6VA 4MLQA 4OXVA 4IGRA 3K6WA 3KEIA 4GF8A 1MXVA 2AL4A 1B6HA 1B0HA 4PFTA 2RKMA 3SEUA 1YTVA 1NFTA 4POWA 4OFOA 1MPDA 2B3FA 3EHTA 3T9XB 3K00A 4RPNA 4BDRA 3S9LC 3UGWA 1UTBB 1GR2A 4FIMA 2GHBA 3RQTA 3ILTB 1VFEA 3ODBA 3BKIB 5I58B 4GIZA 3PUXE 3Q25A 1P99A 4Z0IA 3EN3A 4DXCA 1QKBA 5FTIA 4PE5B 4WEDA 2F7AA 1M5EA 3C9HA 3D4GA 3LSFB 2V3QA 4EDPA 4ND9A 3K6VA 2DS9A 1A54A 2DYXA 4R72A 2GFEA 4PFYA 3RNNA 3TCGA 5CMMA 3W9VA 2FYIA 1MDP1 1B51A 3Q27A 4ONYA 3GBBA 1PBPA 3G3HA 2PBWA 2F6PA 3UA8A 4AB6A 4X1DA 5H8SA 3L6HA 4FECA 4LZ7A 2ZNUA 1D3KA 2F97A 4R6KA 1P1UA 2XXXA 3TELA 3IOVA 3VDFA 1NNTA 2QS4A 4WXJA 3ZKLA 3L6GA 4Q8RA 1M5CA 3LC8A 2Y7IA 4OWDA 2Q9TA 4DZ1A 1LAXA 2WKYA 1LAHE 4NTLA 2HZKA 1AL3A 2GHAA 3PPNA 2HEUA 1A7LA 3OO8A 3K1PA 1BIYA 2RCBA 1PDAA 2VHAA 4Q5TA 3C34A 4U1ZA 3GBAA 4FORA 2NOOA 5CC2A 2A5TA 2V3UA 1I6BA 4NWDA 5I2KA 1LGBC 4R75A 3RN8A 2M8CA 2GH9A 5CM6A 3V8XB 3IJXB 3PGFA 5FHNA 4H6DA 2PX1A 3OEKA 3A3UA 4GVOA 3S2VA 5B7DA 3FZVA 4TOZA 1NNFA 3B6TA 1DTGA 3MPLA 1M5FA 3C31A 3JYRA 3N26A 1QUIA 1GV8A 1SYHA 3OSRA 2Y7WA 2O1MA 3PPOA 3T22A 4E0XA 4YB5A 4N07A 2XX9A 1URSA 3DELB 3DP8A 2YLNA 1H43A 3TAJA 4LQ2A 4OHNA 4YZZA 2Y7RA 1IUDA 3A3CA 3SEWA 2DWJA 1FQDA 2V93A 1B9JA 4ZZEA 1MY1A 2H9BA 1NNPA 2G93A 1NL5A 2I0BA 4PQJA 4F1UA 1LB8A 4KYEA 5K2XA 4LUBA 3MBPA 1TWYA 4NWCA 2Q88A 2A5SA 1B1HA 3T93B 1P1OA 2KLFA 3FVGA 4IB2A 3RT6B 1ZJLA 3GZGA 5CMKA 2PMSA 3FJMA 2H5YA 3U92A 1NH7A 5AA1A 3LSWA 4TLMB 4G68C 4ESWA 3E9XA 1B3LA 4XKNA 4YMBA 2RINA 2I6EA 2D5WA 1B4HA 4DCXA 3M3KA 4OENA 3CRBA 1MPBA 5M2VA 5ELVA 4EXKA 5L8DA 1TXFA 3Q28A 2PVUA 4F39A 2Z8EA 1JEUA 2VD2A 3H4ZA 1TFDA 1O7TA 4MFIA 1D4NA 2RC7A 3FUZA 1MH3A 4R2FA 5I56B 3TEPA 4HCWA 1MXYA 2RF1A 5TPAB 2HQ0A 1MY3A 2OWSA 3MQ9A 4DIGA 4JBZA 3TODA 5H8HB 1JW1A 3OOAA 1I6QA 5I2NB 2CMOA 4G68A 1LFHA 4NF8A 2XX8A 1EZPA 1O64A 1TFAA 3FXRA 5ITPA 3VXBA 3D4CA 1UTHB 4G8NA 2RC9A 3QYTA 3HO7A 3TMGA 2QMWA 2XD3A 2IA4A 1XHYA 4F3BA 4DDDA 4PETA 1Y3QA 4BDQA 2NXOA 3PPRA 3QIMA 3MJNA 1P1NA 1N0TA 1P1QA 4U4XA 5JK4A 5HM4B 3H6TA 1CB6A 4QFKA 2REGA 1EZ9A 5I57B 3PPPA 5DVIA 1B58A 3N5LA 3RUMA 5H8QB 1S50A 4EQ7A 3UIFA 1B5JA 1B1XA 3OO7A 4ZEDA 4YKPA 1YPNA 5EHSA 1PEBA 1MQJA 3G7WA 3KG2A 1B5IA 3PU5A 2I0CA 2OZZA 3DP6A 4F1YA 1N84A 4QSCA 3FXQA 1OVTA 2V84A 4EQBA 1L5TA 2HCAA 4ZS9A 3VVDA 3OSQA 3KJTA 2VOZA 2ZYMA 1FTOA 3MVWA 1IZ1A 4NE4A 1UTBA 2RCAA 3RTFB 5JTYB 5EHMA 3FVKA 1QUJA 2THIA 5I58A 4P11A 1OLCA 3FIRA 4RK2A 1MXXA 5J1DA 1R9QA 4IO6A 1DPEA 1B52A 1UIUA 2ZNSA 1H76A 4XXUA 4DXUA 1USYH 1IEJA 4YU0A 1QULA 1SBPA 1LB9A 1Q35A 2ESNA 3KN3A 3RTWB 3ILUB 4C0RA 1MDQA 2ZMBA 3FGSA 1S9TA 4U4SA 4YICA 3OO6A 4ZEFA 2YPNA 1Y3PA 3IO6A 3OENA 1BKAA 3E13X 3PMXA 3CFZA 4FAJA 4MH5A 1FQEA 1XVYA 3HCQA 1JETA 2ANJA 3T96B 2DWIA 2RC8A 2VGQA 2H25A 3KOTA 3CSGA 3SEXA 3O6IA 1ZTYA 1JVYA 1DSNA 3MWBA 3IOTA 4O3AA 3IL1B 2QRYA 3IAZA 3K1MA 4NF5B 2HAUA 1ATGA 3K6XA 4ELRA 5H8NB 2F6GA 3HN0A 3T9HB 4HTGA 3PUWE 4QFNA 3PPQA 3CIJA 4YAHX 4BLAA 3BFUA 4LZ5A 4EXLA 1OIBA 2XXIA 3ZSFA 1PB8A 1B7HA 2I3WA 4BDOA 3C35A 4F1VA 1IQ7A 4GL8A 1UQWA 1B46A 1R1NA 1Q1KA 3AXFA 2AYSA 4ZZAA 4EF1A 1NMUA 4OERA 2YJPA 4R6HA 1POTA 2XX7A 5CBSA 1Y20A 3S4UA 4GFRA 2D3IA 5ITOA 1WVJA 3LBSA 2QJEA 4OZ9A 5DVFA 3SETA 3N6UA 4C1UA 4TLLB 5CRYA 2Z8FA 2QSXA 5HPQA 3IORA 3CR9A 4Q0CA 2F8DA 3MC2A 4XKRA 4KD5A 1RKMA 1FCKA 4BDLA 1LAFE 1ZLQA 3KOSA 1B7ZA 4G77A 3WAFA 3MZ1A 2PT1A 1Y3NA 4H65A 4JSOA 3IK6B 4ISUA 4NF4A 1B0LA 3MP1A 1FW0A 2ONRA 1SI1A 5KDTB 3QUJA 3I3VA 1R9LA 2AL5A 1FQCA 2G29A 2XXVA 3K1NA 4H5GA 3TTKA 3IX1A 1XT8A 1FTMA 3C33A 3TKDA 5L9MA 2VD3A 3HSTA 1B40A 1GVCA 3DLNA 1LCTA 5HBCA 2HZLA 4QF9A 4H0WA 2DQVA 2ONKE 2R9JA 4QHQA 2O1LA 1MXZA 3SESA 3O6HA 1QKAA 4N6PA 3ZS6A 4JSDA 3LSXA 1H44A 4AB5A 3DM0A 3G3KA 3VV5A 3H03A 4ZE9A 1FTKA 3FV2A 2R71A 2H98A 2ZYOA 4IY5A 4ELPA 3TQLA 4UACA 2QS2A 3BBRA 4FE8A 1QVSA 2X7QA 5DT6A 1MPCA 3CFXA 3TYHA 2F34A 1D9VA 3RY3A 4YB6A 2DXRA 3LSLA 4XIGQ 3PUYE 1YAEA 3IOUA 2Y7KA 1SW5A 5ISUA 1LFIA 4KR5A 4KPTA 1XS5A 2UVHA 4JDFA 1I6AA 1IITA 4RK9A 3C32A 1SI0A 4QFLA 5I56A 3HHFA 1GGGA 3V89B 5TPAA 3I5OA 4OMBA 4U2RA 5H8FB 3TTRA 1O63A 4M1VA 5H8HA 2O69A 4GWOA 5I2NA 1CE2A 4RY1A 3EHSA 2A5TB 1USYE 4P0IA 3TCFA 1ANFA 1UTHA 4XKQA 4HW8A 3OO9A 3GXAA 1BTJA 3VLUA 4WEPA 1ZMGA 4LA9A 3FATA 1LSTA 3KN7A 5ICTA 2E1SA 4GD5A 1FQAA 4MF3A 3TZAA 4H8JA 3KZGA 4KCDA 4H8IA 4OVJA 1ZKBA 5CMBA 3HV1A 5EYFA 4IY6A 3FJ7A 1QUKA 3S9NC 1N3XA 1N76A 2DVCA 4IO4A 4C1TA 5DTBA 2I3VA 1N7WA 4UA8A 4RJZA 5I57A 5H8QA 3QSLA 3CG3A 4HCYA 1QJMA 3SDFA 4R74A 2XXUA 4ZDMA 1HSJA 5FHOA 1MQGA 1KWHA 3S9EA 3MZ9A 1B2HA 4PFWA 4EF2A 1WODA 4RPOA 4KFQA 1EH3A 1LFGA 4OTEA 5L9SA 1JW4A 4G8MA 2ZNTA 3TQWA 4POXA 2DVZA 2O68A 3IR1A 5I59A 3MAMA 4R73A 2I49A 2Y84A 3B7DA 3PD8A 5JTYA 2IEEA 4O3CA 4OQOA 3IOWA 1PBQA 1FQFA 2DOJA 3CI8A 5AA4B 1I69A 1B3GA 2DP8A 3U72A 1FTLA 4OFLA 3W15C 2DWAA 1F9BA 1EZOA 1XC1A 1URGA 4OYVA 3SEYA 1D9YA 4QSEA 2FA7A 1A8FA 4U21A 2PYYA 1Y4CA 3THIA 1VFDA 4JWYA 3UORA 1T0KA 4F31B 1LCFA 2XHDA 4QFOA 5L9OA 1VSOA 4F29A 3PUVE 3IB0A 1PB7A 5TP9B 5DYHA 4LZ8A 2B3BA 4KYDA 4G2ZA 4GL0A 4JWOA 1HSEA 2UXAA 5F1QA 2DWHA 2Q2CA 1SVXB 1B05A 3KSXA 3VVEA 2ALUA 4I62A 5CMCA 2F35A 2QS3A 4OEVA 3ONMA 2NWJA 4WKMA 3PD9A 3O9PA 3FJGA 1M5DA 4NF5A 2Z22A 5H8NA 2V25A 1H45A 3SERA 3H6WA 3FXUA 4Z7EA 4JB7A 3VXCA 1N7XA 5AA2B 4IGTA 3EHUA 4YKKA 2D21A 3MPKA 2OJTA 4U22A 3FASA 5DEXB 3RT8A 2P2AA 1MY4A 3PUZE 1LBCA 4LP2B 4RNSA 2OCUA 3SKPA 2O6AA 4L17A 3K01A 3Q26A 3G3GA 4LQ5A 4NF6B 1TT1A 1ZIUA 4FEBA 3VVFA 3CSBA 2UYFA 4KQPA 1MH4A 2H99A 5KCJB 1US4A 3BFTA 1PB9A 1GTKA 2XXPA 1DTZA 3C4MA 3KFMA 1Z7ME 4RXLA 2Y7PA 4I9DA 1QW0A 3TCHA 1IXIA 4H1XA 4NEDA 4XTCQ 3E3KA 2ABHA 2F5XA 3C36A 4R9FA 3W9WA 3T9VA 3MW0A 3JV9A 2Q2AA 4FEDA 3WAEA 4KYSA 3KSJA 1OMPA 4ECFA 2XXRA 5FHMA 1ZBMA 3G3IA 1VR5A 4QRZA 2B65A 3S9MC 2AIXA 1DMBA 4IO7A 3N6TA 4LONB 3CFLA 1PC3A 4K3FA 3P7IA 5ICQA 4DLDA 5KDTA 3OELA 1DPPA 1SD3A 1MQIA 1MQHA 4U23A 2NVUB 3CG1A 2QMXA 3RLFE 3B6QA 2DSFA 2QS1A 4O3BA 3EPEA 3LR1A 5B70A 1MY0A 3JZJA 3A09A 1SW2A 1POY1 3UK4A 2HFBA 2I4BA 2H4IA 3IJOB 3M8UA 2O7IA 1MM7A 2O84X 2E0SA 4YKJA 2XXWA 2ZXTA 5A5XB 4LATA 1JVXA 5CBRA 4GOTA 1MXUA 5I84A 4DE8A 5KZTA 1MY2A 3I6VA 3B6WA 1ELJA 3VE1B 4N13A 3FVNA 3IO4A 3IB2A 3G3FA 1R6ZA 1JQFA 1SW1A 4FATA 3O28A 5IKBA 1NKXA 4ESXA 2UVGA 5F7VA 3KBRA 4GQOA 3OD7A 2F36A 4IO3A 1N3WA 1JW5A 2Z8DA 2X26A 3H6UA 5LOMA 4PP0A 4G4PA 4THIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MS7A 3VLVA 4IR8A 5H8FA 1XVXA 1MG1A 3Q29A 4GWUA 4ELQA 4F3GA 3IB1A 3USDA 4F18A 4GLIA 4FBPA 1SW4A 2BJIA 2GRVA 4AQ4A 2Z23A 1LAGE 4GX3A 3KGCA 4HS7A 2OX3A 2R6GE 4MBPA 2XXQA 3MP8A 1SPIA 2W7YA 1BLFA 2P1SA 1AMFA 2OLBA 3TFLA 1J1NA 2I48A 4BDNA 5IZ3A 1YCJA 1ZU0A 4ZEKA 4MLVA 5BUUA 2QPQA 4GWWA 4OETA 5AA2D 2X7PA 4KHZE 3R26A 3HFUA 3K4UA 1LLSA 4ELOA 1MM6A 4ZEIA 1HSLA 1Y9UA 3TTNA 2CZLA 1B32A 1OVBA 5TU0A 3KN8A 3MUQA 3FD3A 4ZECA 2VT5A 1UIVA 3FBPA 1NUWA 1SQYA 1S7YA 2F3BA 3HPIA 3ECRA 1WDNA 3M3LA 4NF4B 2DE4A 4M4GA 3T1BA 5AA3A 3O2AA 4G8HA 4P3LA 1Y1MA 4GXSB 4X48A 1IIWA 1M5BA 1DOTA 3UP9A 2DE3A 2O51A 4PFUA 1P1WA 4Q30B 2F78A 2UVJA 2ZYNA 4NF0A 3V5AA 4DCYA 3TUSA 3TDJA 1AWBA 5ET6A 5I2KB 1IXGA 2BJJX 4P9KA 5AA4A 1H3DA 4X9TA 3T9UA 1FQBA 4BDMA 4R6YA 2P0SA 2XXYA 4R2BA 3U94A 1AIVA 1AH5A 3O29A 2XD2A 3T66A 4F3PA 3KJ7A 3MVZA 1AOVA 1IXHA 4YKIA 2B4MA 3OMBA 4GXAA 2UVIA 3DP4A 3O66A 4ZEBA 3U8QA 4P8BA 1VE4A 1FTJA 2XXTA 1MQDA 3TPAA 1NNKA 1B3EA 4FJPA 3EF7A 4I1DA 2F7BA 1MXWA 3F11A 4N91A 3PV0E 5TP9A 3U93A 4NMYA 4QFPA 2Q8JA 3SEVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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