2BJJX

Structure of recombinant human lactoferrin produced in the milk of transgenic cows
Total Genus 228
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
228
sequence length
692
structure length
692
Chain Sequence
GRRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNDAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
publication title The Protein Structure of Recombinant Human Lactoferrin Produced in the Milk of Transgenic Cows Closely Matches the Structure of Human Milk-Derived Lactoferrin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal binding protein
total genus 228
structure length 692
sequence length 692
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2bjjX03
3H6UA 2XXXA 5FTHA 2AYSA 4AB6A 1PB9A 3LBSA 3GBBA 1KWHA 3LUYA 1FQAA 2ZYNA 3UA8A 1D9YA 1OMPA 3PD8A 1XT8A 4GOTA 4LA9A 5EYFA 2OK2A 2XXYA 3BBRA 4OTEA 4HTGA 4RNSA 3SEUA 1JNFA 3CFXA 4IO4A 5KCJA 5KCJB 3MP6A 3PD9A 1MDQA 1BTJA 5A5XB 2O69A 1LFHA 2UXAA 2ZMBA 2I58A 1DPPA 2B3BA 5DYHA 2OWSA 3TAJA 1VE4A 1LAXA 2GHBA 1AIVA 4E0XA 2H25A 5AA1A 1QUIA 4KCDA 4AB5A 1EU8A 2QMWA 1HSJA 3TKDA 5LOMA 1MXUA 4F19A 3VXBA 3B6QA 4C1UA 1H43A 2QPQA 4N07A 3Q27A 3KSXA 3OSQA 2H9BA 5I2NA 2DXRA 1WVJA 5AA2A 5AA2B 1ZIUA 4GFRA 1YTVA 1ZU0A 3E4RA 3R7XA 4X1BA 3RGYA 4I62A 4QFKA 4G4PA 2VHAA 1QKBA 4EUOA 4EQ7A 3VXCA 3EF7A 2WKYA 3FJGA 3R6UA 1MPDA 4ZDMA 3CI8A 1FW0A 1MQHA 3RTWB 1GV8A 2F36A 4OMBA 3CG1A 4IB2A 3T9UA 3OOAA 4JWYA 1SQYA 3FV1A 2DYXA 4OFLA 3TTMA 3GBAA 2RCBA 5J1DA 1P1NA 4FECA 3TTLA 1FCKA 4TQUQ 1NL5A 1NNTA 4I1DA 2ZYKA 4LATA 5ELVA 2X26A 2Q89A 1RKMA 3N5LA 3U93A 2DSFA 2A5TA 2A5TB 2UVGA 2XXTA 4NF6A 3B6TA 4NF6B 3EQ1A 1B3FA 3GZGA 3K6UA 1MG1A 4OERA 4RXLA 3MJNA 4ZZEA 4HCYA 1MY0A 4L17A 1B7HA 4DZ1A 1VFEA 4MF3A 4GL0A 1PEBA 2X7PA 1MM7A 3H7MA 2IEEA 3VFJA 3FVGA 1AOVA 3QYTA 2Y7RA 1JEUA 4KQPA 1SDXA 2R6GE 3PV0E 4DXBA 1FTJA 3T22A 1UQWA 4ZZAA 1POY1 1UIUA 2PBWA 3KN3A 2VP1A 1A8FA 1NFTA 1QVSA 3IO4A 2PT2A 3EHTA 3A3CA 2R71A 3MPKA 3OO7A 3Q29A 4HW8A 2F7CA 2NVUB 2HCAA 5DVIA 2H5YA 3K4UA 5L9SA 1EZ9A 1US4A 2O1MA 4OHNA 2ABHA 4NMYA 1IXGA 2Q2AA 2CMOA 1LAFE 1FTMA 3IB0A 3CFZA 2V25A 2XXRA 3K1PA 2AIXA 3HPIA 4ZE9A 4H1XA 3KGCA 3TQWA 2XXIA 3PPNA 3EHSA 2XD3A 3H6WA 5H8SA 3R26A 3KOTA 1IZ1A 3M3LA 1A55A 1JQFA 1SW2A 4GWOA 1P1QA 3RTFB 3RT6B 2QSXA 1IXIA 1N7WA 4HS7A 3QAXA 3OELA 4UACA 3VLVA 5CRYA 1B1HA 5BWJA 1D4NA 3BFTA 1FQBA 4LQ5A 2W7YA 3CRBA 3ZS6A 1SYIA 4MH5A 4GQOA 2I49A 4DXUA 4QFPA 2Q88A 4IGRA 2DS9A 3KZGA 3RN8A 4RA1A 3H6VA 4C0RA 2HEUA 3C31A 1SBPA 5DEXA 5DEXB 3KEIA 3O9PA 3TDJA 3HV1A 3THIA 4GF8A 3T9HB 4F2OA 1BP5A 1HSEA 1R1NA 2ZXTA 2H99A 1DSNA 2DE2A 3EPEA 4JWOA 4FORA 1SW5A 1ZKBA 4ZEBA 4DE8A 1P1UA 3FUZA 2ONRA 5CMCA 1OLCA 2M8CA 2V3UA 3OENA 4KD5A 4LUBA 3SETA 3G3IA 2XXUA 1ZBMA 1TWYA 4YKIA 5HBCA 3F11A 4TLMB 2O68A 5DT6A 3C9HA 1XS5A 2I3WA 2BJJX 1A7LA 4NEDA 1MH3A 4OZ9A 4ZECA 3S9MC 3M3FA 2UVHA 1L5TA 1OLAA 4JWXA 3TPAA 1MY2A 1A8EA 2HXWA 3TELA 2F7BA 3N26A 4MFIA 1JETA 2XXWA 1LB8A 1TFDA 3Q28A 1MQGA 4NE4A 3IOWA 1B9JA 2AL5A 2DWJA 5HPQA 1A40A 4KYDA 1MXXA 1Q1KA 3O6GA 4EXLA 1ZTYA 4WEDA 4EDPA 3IK6B 4R9FA 4U4SA 3E13X 4BDOA 1RYXA 2XX9A 1Y4TA 4R2BA 3SKPA 3JV9A 1B4ZA 3K2DA 3UK4A 4Q8RA 3O6HA 3IO6A 1I69A 2P0SA 1MY3A 1H44A 5ITPA 4RY1A 4LZ5A 3K01A 4F39A 3N6UA 4BDNA 3O28A 3JZJA 3O29A 1R9QA 1WDNA 3PPRA 1H76A 1FQCA 2Q2CA 2Q9TA 2QS2A 1QKAA 3MVYA 5CM6A 5TU0A 3KOSA 3MC2A 1MXWA 5KZTA 3HSTA 1LLSA 4F1YA 4OEVA 2GFEA 3FVKA 3L6HA 4WEPA 3PMWA 2RF1A 3KJ7A 4OFJA 5KDTA 1N7XA 5KDTB 1N3WA 4KYEA 4Z0IA 3K00A 4R72A 5H8QA 5H8QB 2PYYA 2Y84A 2RCAA 3FIRA 3LSWA 4GVOA 3N6TA 1LAHE 1Y1ZA 4U23A 3TTKA 4ESXA 1EZPA 4KYSA 5BUUA 2G93A 3A3UA 3O66A 2QRYA 3ILUB 1Y1MA 1S7YA 2B3FA 1YCJA 3K02A 3K1NA 2DQVA 4YMAA 1B51A 1AL3A 1B2HA 1QW0A 1B0LA 5EHMA 1SI0A 3C32A 4AQ4A 5CMKA 2Y7KA 2NXOA 5I57A 2ANJA 2I6EA 3MUQA 4KHZE 2PT1A 1CE2A 2Z8EA 4OENA 1UIVA 3RUMA 1XC1A 4G68C 2Z22A 1MY1A 1MS7A 5I58A 5I58B 1M5EA 3T66A 3MWBA 4FAJA 4YB7A 4XKPA 3GLBA 5TP9A 5TP9B 1I6QA 5ICTA 4QRZA 1IIWA 3MP1A 5I2NB 3IOVA 5CMBA 5K2YA 1LAGE 2OZZA 2DWAA 4C1TA 4QFNA 1Y9UA 3VVDA 1SW4A 4R74A 3HO7A 4F3SA 4PFTA 1M5BA 1B6HA 1B7ZA 3D4CA 4KR5A 3OO9A 3MVZA 5JEIA 4LONB 1NNKA 1ANFA 3T9XB 2B65A 3KBRA 4FEDA 1IQ7A 3UIFA 1B3GA 3ZSFA 1N76A 1JW1A 5H8NA 1B32A 4R73A 1UTBA 1UTBB 3G7WA 4OETA 4F29A 3T9VA 2I4BA 2THIA 5B7DA 4H5FA 4OWDA 4NTLA 4F1UA 3KG2A 1AMFA 3LR1A 3V89B 1SVXB 3QSLA 1B3LA 1BLFA 3PUXE 4P0GA 1FQEA 1H45A 4U1ZA 3VE1B 2OJTA 5AA2D 3IORA 1MQDA 4F22A 2RC7A 1B58A 3E3KA 3T93B 4PETA 1CB6A 1XHYA 4G8MA 5I84A 4PFWA 3TTNA 3G3GA 2ONSA 1D9VA 1DOTA 5CI5A 4U1OA 4F18A 1NNFA 2D3IA 1B46A 1MQJA 5JTYA 4FIMA 1P99A 4O3BA 1URGA 1PB8A 4NF8A 4NF8B 5DVJA 1OIBA 2NUVA 4OXVA 2DWHA 4R6KA 5AA3A 3TFLA 4PFYA 3K6XA 4ZE8A 1LGBC 1IXCA 1B05A 3FVOA 4ESWA 1O64A 3VDFA 3PUZE 1JW5A 3B6WA 4YB6A 3V8XB 3FXQA 2F6GA 1Q35A 1US5A 2RC9A 4GL8A 1XVXA 3PPPA 5L9OA 5CC2A 3LSXA 5AE4A 2KLFA 3UORA 4KFQA 4U21A 2Y7WA 1S50A 4JBZA 4EXKA 3WAFA 4ZEDA 5ISUA 1B3HA 4QSDA 1XVYA 3O2AA 3H6TA 3MVXA 4R9GA 4LP2B 1DTZA 1TXFA 3I3VA 2UYFA 4OVJA 3OD7A 1M5CA 3MPLA 4I9DA 3MZBA 4RK2A 1MPBA 4GIZA 2I48A 4IGTA 3ZKKA 4K3FA 4RJZA 2QS3A 4R6HA 2UYEA 1N04A 2G29A 2NOOA 3FV2A 4IO5A 4ELQA 3RY3A 4G68A 4G68B 4ZS9A 2HZLA 4POWA 1ATGA 3ILTB 2HAVA 3I5OA 2ZYMA 1LCFA 3DP8A 1IITA 1Z7NE 4H6DA 4IO3A 4U22A 3ODBA 3RLFE 4LVQA 4MLVA 2ONKE 3HHFA 4WKMA 4DCXA 1JVXA 3QUFA 1JW4A 4ZEKA 3USDA 3PU5A 4THIA 2Y7IA 4R75A 3QXMA 4G8HA 2A5SA 4LZ8A 2F78A 5TPAA 5TPAB 2VD3A 2PMSA 3TZAA 2QS4A 1OQGA 4OESA 3FGSA 4OEUA 2F5XA 5ICQA 4JDFA 2HAUA 4TLLB 4UA8A 1O7TA 5K2XA 1O63A 3PGFA 5B70A 1ZLQA 1P1WA 5EHSA 5JK4A 3TEPA 4EQBA 1R6ZA 3H4ZA 3U92A 1TT1A 4ZEFA 3FD3A 2H98A 1S9TA 4I8CA 2XX7A 3HHGA 4YB5A 3OO8A 4R6YA 1OVTA 4E0WA 3S9EA 1USYE 2YJPA 1NKXA 3O97A 2Y7PA 1N3XA 4GXAA 4F3GA 4OYVA 3RNNA 2I0CA 4G2ZA 4DDDA 4KI0E 1Y3PA 3M3KA 4FJPA 3RPWA 1NMUA 3CG3A 3IL1B 4Q0CA 1LBCA 3BKIB 2ESNA 1QJMA 4MBPA 3KFMA 3OMBA 3CFLA 3KJTA 1XOCA 5L8DA 3IR1A 4XXUA 3FASA 3IOUA 2QMXA 1SYHA 4WXJA 3PUVE 3VLUA 2XXHA 3PMVA 4XKRA 5IKBA 5DVFA 4MLQA 2HFBA 4XKQA 5F7VA 4F2QA 1Z7ME 1B5IA 1P1OA 2IA4A 2VGQA 4JB7A 3FXUA 3LSFB 4TOZA 4DIGA 3U8QA 4EQ9A 4GXSB 2XXPA 1MPCA 2H4IA 2X7QA 1FTLA 2ZYOA 2OLBA 4P0IA 3SERA 4BDRA 3G3FA 4EF2A 2OWTA 4JSOA 4XTCQ 1FTKA 3CSGA 3MBPA 1EZOA 2GH9A 2PX1A 5H8FA 5H8FB 4X48A 2HQ0A 3VV5A 5DTBA 2NWJA 1HSLA 2AL4A 1VSOA 1R9LA 4YKJA 3IOTA 4QF9A 3FJMA 3UGWA 3JYRA 3DM0A 4G8NA 3ONMA 2O51A 3RT8A 1URSA 3SESA 1FQDA 3SEVA 3D4GA 1ELJA 4HCWA 5AA4A 5AA4B 4H67A 1MH4A 2PVUA 3FZVA 4QSCA 4NWDA 2LAOA 1LB9A 2REJA 5I56A 5I56B 4H0WA 4XIGQ 5H8HA 5H8HB 3MQ9A 1B40A 4PE5B 3MAMA 2Q8JA 1FQFA 5CBRA 3FXRA 3QIMA 5I57B 3CIJA 4U2RA 1A54A 2DXYA 1IEJA 2OCUA 1LFIA 1UTHA 1UTHB 1LCTA 5A5XA 3KN7A 3GXAA 4YMBA 4KPTA 3IJOB 3K0VA 4PP0A 4ECFA 1JEVA 4QFOA 1PB7A 4FEBA 3B7DA 1GVCA 4BDQA 2FA7A 3IB2A 3CSBA 3V5AA 2ZNTA 3EN3A 3O6IA 1I6AA 2P2AA 3IJXB 2YPNA 2GHAA 3UN6A 3OO6A 4YICA 4RPOA 1ZMGA 1MDP1 3MP8A 1FTOA 4NF4A 4NF4B 4O3CA 2F7AA 3DP6A 4NWCA 3PMXA 1MY4A 3FVNA 4KCCA 3HCQA 3E9XA 1JVYA 4H8JA 3MZ9A 4H65A 4BDLA 3IX1A 3S9LC 1USYH 2XXVA 1LSTA 3W9WA 1YPNA 1TFAA 4GRKA 3FATA 3SEXA 5H8NB 3G3KA 1VFDA 1VR5A 4YU0A 2UVIA 1SI1A 3H03A 1WODA 4ZEIA 3PUYE 3BFUA 3AXFA 1B0HA 1MXZA 4EF1A 4IO2A 1MRPA 1YAEA 2RKMA 3OSRA 3G3JA 1Y20A 4LQ2A 4PFUA 2DE4A 2ZNSA 4BLAA 2P1SA 5FTIA 2F8DA 3P7IA 4BDMA 1GGGA 1MXVA 3IB1A 2E0SA 2XHDA 5FHNA 4M4GA 4F3PA 2FYIA 3ZKLA 2I0BA 4FE8A 1QULA 2XD2A 3PUWE 3U72A 4ISUA 4RYAA 4X9TA 2Z8FA 1N84A 5JTYB 4N13A 1POTA 1PBPA 4F31B 4N6PA 3V83A 4Q5TA 3M8UA 2Z8DA 4ELOA 4IO6A 2Z23A 1PBQA 5HM4B 3K6VA 3TQLA 4RK9A 2DOJA 1MXYA 2I4CA 4DLDA 3A09A 3HN0A 3MW0A 2DP8A 3W15C 1LBBA 2UVJA 3DELB 4ONYA 5CBSA 4POXA 2DVCA 1SD3A 3S4UA 3QUJA 2FNCA 4ND9A 3K1MA 2RC8A 2DWIA 3PPQA 2O1LA 4F3BA 3H06B 1M5FA 3QK6A 3OXNA 3TCHA 2V84A 1B1XA 1D3KA 3U1OA 3TUSA 4LZ7A 3TCGA 3Q26A 4IO7A 1MQIA 4YKKA 3SDFA 5F1QA 3CR9A 5IAIA 1GTKA 2O84X 3I6VA 5M2VA 1B7UA 3VLWA 5I2KB 5I2KA 3VVEA 2O7IA 3KN8A 3TODA 4DXCA 2O7UA 3C33A 2VOZA 3K6WA 4Z7EA 1MM6A 3G3HA 3SEWA 3RQTA 1II5A 3EHUA 2V3TA 2F35A 2REGA 1B5JA 3LSLA 2RINA 2CZLA 3C4MA 3MZ1A 2OBGA 4NF5A 4NF5B 1N0TA 2ALUA 4GLIA 1LFGA 2ZNUA 1IUDA 4F1VA 4GD5A 2E1SA 2QS1A 3CVGA 4FATA 1OVBA 2R9JA 1AH5A 4Q30B 1Y4CA 1M5DA 1Y3QA 3FJ7A 2GRVA 3VVFA 2XX8A 2V93A 4PQJA 4X1DA 3Q25A 4M1VA 1Y3NA 2F6PA 2D21A 4H5GA 4U4XA 3UP9A 4OQOA 5ITOA 3C35A 3C34A 3OEKA 3T96B 1A99A 5I59B 5I59A 2I3VA 3S2VA 3C36A 5CMMA 1NH8A 3N94A 2DE3A 3MVWA 2QJEA 1RYOA 4XKNA 4ELRA 3DLNA 1B3EA 3TCFA 2D5WA 1URDA 4RPNA 1B4HA 1F9BA 3W9VA 3LC8A 4ELPA 1DPEA 1H3DA 2QL3A 4O3AA 1BIYA 4YZZA 3DP4A 4G77A 1J1NA 2HZKA 4QSEA 1QUKA 5FHMA 2VD2A 1ZJLA 1I6BA 1NNPA 3IAZA 3L6GA 3TTRA 4H8IA 4YKPA 4DCYA 1DMBA 4OFOA 5FHOA 4JXIA 3WAEA 1B5HA 2F97A 1T0KA 1NH7A 1DTGA 3H3GA 1GR2A 4R2FA 2F34A 3TMGA 1BKAA 2V3QA 3S9NC 3SEYA 2O6AA 4IY5A 1OQHA 1PDAA 3ECRA 4QHQA 4IY6A 2YLNA 1SW1A 1QUJA 4QFLA 1EH3A 1B52A 3U94A 2XXQA 3KSJA 4YAHX 4P11A 4JSDA 1PC3A 3TYHA 3OEMA 3PPOA 2DVZA 1IXHA 5L9MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H6UA 2XXXA 5FTHA 2AYSA 3CHGA 4AB6A 4O7MA 1PB9A 3LBSA 3GBBA 1KWHA 3LUYA 1EYJA 1FQAA 2ZYNA 3UA8A 1D9YA 1OMPA 3PD8A 4NGUA 1XT8A 2FHYA 4GOTA 4LA9A 5EYFA 2OK2A 2XXYA 3BBRA 4OTEA 4HTGA 4RNSA 5EYHA 3SEUA 1JNFA 3CFXA 4IO4A 5KCJA 5KCJB 1LBVA 3MP6A 3PD9A 1MDQA 1BTJA 5A5XB 2HHMA 2O69A 1LFHA 4HXVA 1KZ8A 2UXAA 4QXDA 2ZMBA 2I58A 1DPPA 2B3BA 5DYHA 2OWSA 3TAJA 1VE4A 2GQ1A 1LAXA 2GHBA 1AIVA 4E0XA 2H25A 5AA1A 1QUIA 4KCDA 4AB5A 1EU8A 2QMWA 2ZZWA 1VDWA 1HSJA 3TKDA 5LOMA 1MXUA 4F19A 5T3JA 3VXBA 3B6QA 5A5LA 4C1UA 1H43A 2QPQA 2DDKA 4N07A 3Q27A 2WBBA 3KSXA 1AWBA 1LBXA 3OSQA 3BIGA 4H45A 2H9BA 5I2NA 2DXRA 1WVJA 5AA2A 5AA2B 1ZIUA 4GFRA 1YTVA 4PCDA 1ZU0A 3E4RA 3R7XA 4X1BA 3RGYA 4I62A 4QFKA 3HFUA 4G4PA 2VHAA 1QKBA 4EUOA 4EQ7A 3VXCA 3EF7A 2WKYA 5IZ3A 5IZ3B 3FJGA 3R6UA 1MPDA 2Q8MA 3E79A 4ZDMA 3CI8A 1FW0A 1MQHA 1NV1A 3RTWB 1GV8A 4HE2A 5I3SA 2F36A 4OMBA 4PFRA 3CG1A 4IB2A 3T9UA 3OOAA 4JWYA 1SQYA 3FV1A 2DYXA 4OFLA 3TTMA 3GBAA 2RCBA 5J1DA 2WX9A 1P1NA 4FECA 3TTLA 1FCKA 4TQUQ 1NL5A 3LV0A 1NNTA 5EQ9A 4I1DA 4PAKA 2ZYKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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