2HAUA

Apo-human serum transferrin (non-glycosylated)
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 170
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA03
3V8XB 1MG1A 1M5CA 4GRKA 4R74A 3VLWA 1LAXA 4XKRA 3OENA 5EHMA 4IO5A 3T22A 5CBRA 4Q30B 1FQFA 2PBWA 4OESA 4F3PA 5JEIA 1YTVA 1B5HA 3E4RA 1LAGE 3FXUA 4X48A 4ZEKA 3V5AA 2XXXA 4O3AA 1N76A 3RY3A 4NMYA 4LA9A 4FORA 1QKAA 4LONB 4WEDA 1ELJA 4FEBA 4HTGA 4YMBA 4Z0IA 2P0SA 2V3QA 3OO7A 3KG2A 5AA3A 3IJOB 2ZXTA 3PUZE 2V93A 1S7YA 1DMBA 3PGFA 2GH9A 1PB9A 1XVYA 3OO8A 3RPWA 3OOAA 3H6TA 2F78A 3O9PA 2QS2A 3O28A 1XVXA 2RF1A 3HHGA 1B9JA 3I5OA 5DEXA 1ZJLA 2REGA 2F36A 4QHQA 1GGGA 3VDFA 1JEUA 2OWTA 3Q29A 4OEVA 2VOZA 3SETA 4GQOA 3FXRA 2Q2CA 4XXUA 3ONMA 4POXA 4XKPA 1N7XA 3DP6A 4PFWA 3T9UA 2QJEA 3QUJA 3SEYA 4H5FA 2OZZA 4KQPA 1N3XA 1N84A 3VFJA 2XD2A 3MWBA 4C0RA 3MW0A 2DWJA 3FASA 2F8DA 3U72A 1B3FA 3K4UA 3ODBA 2UXAA 4K3FA 2A5TB 2RC8A 4YKPA 3JZJA 3G7WA 3G3FA 1JNFA 2GHBA 2HZLA 3KJ7A 3CFXA 1SBPA 1MXVA 1YCJA 3SEWA 5TPAA 1P1NA 3R7XA 1MM7A 2O7IA 4UA8A 4YKJA 3H03A 5KDTA 4FJPA 4ZZAA 3TQLA 3M3KA 5AE4A 1Q1KA 2XXUA 5F7VA 5K2XA 2VHAA 1WVJA 4G8NA 1B7HA 3IB2A 4FEDA 1URDA 2E1SA 4U23A 3D4GA 4F19A 4DIGA 2ONSA 1OLCA 4I1DA 4BDMA 3ECRA 4OTEA 3G3JA 4HCWA 1FW0A 3GXAA 4U1ZA 3UORA 4AB5A 3C31A 4EUOA 2QMWA 5I2NB 3TEPA 1DPPA 4X1DA 2CZLA 3FV1A 2AIXA 4ONYA 1N0TA 1WDNA 4PE5B 3K6XA 4RPOA 1N7WA 1ZMGA 1F9BA 4ESWA 4GLIA 3HV1A 3QSLA 1NL5A 4IY5A 3IOTA 3FXQA 3H7MA 3TTLA 3OEMA 4R73A 5I2KB 3MZ9A 1B6HA 2RINA 4AQ4A 3PD8A 1SW4A 1NH7A 1DTZA 3A3CA 1UQWA 2Q9TA 4F1UA 2M8CA 3H06B 3TZAA 4U22A 4H0WA 4H67A 3G3KA 3EHUA 1ZKBA 4OVJA 3VVFA 3K00A 3LC8A 1AH5A 4ND9A 5CMMA 1SYIA 1PDAA 1EH3A 3B6TA 4JBZA 1MQDA 1Y4CA 3HSTA 3MJNA 3U92A 4ZZEA 4RK2A 1B4HA 4G77A 3MZBA 3N6TA 1AOVA 3UP9A 4Q0CA 5FHNA 4IGTA 3IX1A 4GIZA 1H3DA 4RJZA 4XKNA 3JV9A 4FECA 1PC3A 4QF9A 3OELA 1Q35A 2A5TA 3S9MC 3OO9A 1MY4A 5CM6A 3GZGA 2OCUA 5I59B 2QS3A 4IO2A 3HCQA 3K1MA 4F29A 3K01A 2ONRA 3KFMA 5FHMA 1MXUA 4YB7A 1GTKA 3SEUA 4ZEBA 3N5LA 1MM6A 4LP2B 4R72A 4TOZA 2F6GA 3H6WA 3DP4A 1KWHA 2ABHA 4UACA 3FGSA 2X7PA 2I48A 2PYYA 2OBGA 3CSBA 1XOCA 1MH4A 5KCJB 4NF6B 3FD3A 4YB6A 2O68A 1R9LA 4MBPA 2ANJA 4LVQA 2DE2A 2KLFA 1USYE 2DWAA 4QFLA 3VLVA 4OETA 3V83A 3LUYA 2YPNA 3TTMA 1IEJA 3FUZA 1SW2A 3TPAA 1VSOA 4R2BA 1MPCA 4YMAA 2F7AA 3O6GA 1B5JA 2O6AA 3OD7A 5I2NA 3VV5A 2DYXA 1B1XA 2Y7IA 4RNSA 1MXXA 1FQDA 4RXLA 4ZEIA 1LFIA 4EQ7A 4ZE8A 3QK6A 5H8QB 2DVCA 2Z8FA 1CE2A 1P99A 2AL4A 4MH5A 5K2YA 1M5FA 1MXWA 5I2KA 2XX9A 3BBRA 1ZBMA 4G4PA 1S9TA 3PPNA 3CI8A 4OFJA 3K02A 1RYOA 2ZNTA 1Y3QA 4POWA 3U1OA 1EU8A 2O7UA 2XD3A 3L6GA 2NVUB 3QAXA 4GXSB 4OWDA 1MY0A 3RTWB 3TFLA 3OXNA 5HBCA 2R71A 1NNFA 3TYHA 4F3SA 1L5TA 3FV2A 4MLQA 2I4BA 4U1OA 1HSJA 5DVFA 3TKDA 2PT2A 1DPEA 3PMWA 3R26A 2YLNA 2WKYA 1TFDA 3PPPA 1D3KA 2RCBA 4JWYA 1BTJA 2QRYA 1M5DA 3N94A 1JVXA 2OWSA 3CSGA 3A09A 1FQCA 2PVUA 5F1QA 4LZ5A 3OSQA 3K1NA 1ZU0A 3E13X 1JW5A 4F1VA 1HSLA 2QL3A 4QFPA 1BIYA 3I3VA 2I3WA 5KZTA 2REJA 1SI0A 1IXCA 4Z7EA 2UVJA 2XX7A 1FCKA 2PMSA 4LATA 3MBPA 3R6UA 2VD3A 3TCFA 3TCGA 2GHAA 5JK4A 1LAFE 2NWJA 2B3BA 3PUXE 1UTBB 1B58A 2RCAA 4XTCQ 4OZ9A 4G8MA 5H8HB 2FYIA 1A55A 4H5GA 1B2HA 1JVYA 1Z7ME 1B3EA 3KOTA 1T0KA 4E0XA 1SVXB 3QYTA 1SQYA 5KCJA 4NF6A 3UIFA 1B0HA 2DQVA 4IGRA 5L9OA 3IR1A 4ZE9A 1IQ7A 3O6IA 4KI0E 2Z23A 3ZKKA 4OERA 4U21A 2ZYMA 3USDA 2CMOA 2HFBA 1ANFA 4R6HA 2GFEA 1AL3A 3A3UA 1B46A 1FTKA 3M3FA 4KD5A 4LUBA 1SW5A 1LCTA 2H9BA 4FE8A 4X9TA 3KEIA 1ZTYA 1OLAA 1YPNA 1I6BA 3AXFA 4JXIA 5IAIA 1A40A 2XHDA 2UYEA 4PFUA 3FIRA 2OK2A 4GFRA 3T9VA 4DXUA 1FTOA 1PB7A 3D4CA 3IOVA 4KCDA 3QXMA 2H98A 3FZVA 2Z8DA 4IO7A 2V3UA 5H8QA 2F6PA 2XXPA 1POTA 5L8DA 2D3IA 3DLNA 3TUSA 1QW0A 3ZS6A 1H45A 4C1UA 4G68C 1GV8A 3K2DA 1FQAA 1DSNA 1MPBA 2I0CA 1MXYA 3MC2A 2F7BA 3PMVA 2XXRA 2I58A 2UVHA 4QRZA 4KCCA 4FAJA 3CVGA 1XC1A 3THIA 1CB6A 5ITPA 3K6VA 5I84A 3MQ9A 3UN6A 4EF1A 1OQGA 2I0BA 4BDRA 1FTLA 4LQ2A 1VFDA 3IO6A 3MVWA 4F22A 3RN8A 3UGWA 2XX8A 3PPQA 1NFTA 1UIUA 3E9XA 3O2AA 4JDFA 2NXOA 3GBBA 3W9VA 2YJPA 2F5XA 1A8FA 3S9EA 4QFOA 1PB8A 1LBCA 5B70A 1IXGA 4ISUA 4MLVA 4TQUQ 3T93B 3K0VA 1MQHA 3KJTA 4OFOA 1R9QA 3EQ1A 3B7DA 3B6WA 4EF2A 4L17A 2ZYOA 4N13A 3SESA 4IO4A 4NF5B 4YU0A 1TFAA 2DE4A 1Y1MA 4TLLB 1LFGA 1LB8A 1A99A 3EHTA 3M8UA 4P0IA 4H8JA 1H76A 1EZPA 1P1UA 4BDOA 1B3LA 1UTBA 3OO6A 1GVCA 3IB1A 4DDDA 3I6VA 5H8HA 3MZ1A 2UVIA 3KOSA 3RGYA 1OVBA 3FATA 2B3FA 3UK4A 3ILTB 3DP8A 2F7CA 1NNPA 1AIVA 1ZLQA 3U94A 3MPLA 3IL1B 1QVSA 1NNKA 4R9FA 1MQIA 1NH8A 3IOUA 5M2VA 3G3IA 3FJGA 4PP0A 3K1PA 4F2OA 1Y3NA 1R1NA 3LSFB 5AA1A 2G29A 3MP6A 3DM0A 3IAZA 4HW8A 3ILUB 1UIVA 4DCXA 2VP1A 5TU0A 2Y7WA 3KSXA 3C34A 2O1LA 4XKQA 3ZKLA 2DWIA 1JQFA 2HEUA 1A54A 4RPNA 1AMFA 1B7ZA 1XT8A 1VE4A 3K6UA 1EZ9A 3PUVE 1JEVA 5J1DA 5CC2A 4QFNA 4I8CA 1URSA 5ISUA 5FTHA 1MY1A 2QS1A 3G3HA 1JW1A 4DLDA 3TTKA 4ZECA 3EPEA 1MY3A 4FATA 3IJXB 4NWCA 3MVZA 2H99A 1SI1A 5DEXB 2LAOA 3TTRA 3ZSFA 1IUDA 5BWJA 1LGBC 1FTMA 4WXJA 3T9HB 3SERA 3O29A 5FHOA 2XXIA 1P1OA 1TWYA 2THIA 3FJ7A 2P2AA 2QPQA 4BDLA 2Q88A 1IXIA 1BLFA 3PV0E 3RUMA 1VFEA 1TXFA 3O97A 4IO3A 2UYFA 1JW4A 3CG3A 2B65A 2D21A 4QSDA 1SDXA 3PMXA 4RK9A 4WEPA 3KN3A 3GBAA 1PEBA 4NEDA 3C32A 3PUYE 4H65A 3Q27A 4X1BA 2HQ0A 5CI5A 3H4ZA 3T9XB 4JB7A 1H43A 4JSDA 5ICTA 4KYEA 2DP8A 4R6KA 4RA1A 4C1TA 1MDQA 5AA2B 3VE1B 2E0SA 3K6WA 3E3KA 4U4XA 2AYSA 2A5SA 3EN3A 1ZIUA 3C36A 1I6AA 3Q28A 4AB6A 5KDTB 3FVKA 4NE4A 4GL8A 1B52A 4PFYA 2Q89A 3FVNA 1JETA 3KGCA 4IY6A 2QS4A 4Q8RA 3BKIB 1FQBA 4NF4B 3OMBA 4OHNA 1RKMA 1NNTA 4ZS9A 3TQWA 4O3CA 4NF8B 1O63A 2Q8JA 1Y1ZA 2PT1A 2OJTA 4M1VA 2HAVA 1IZ1A 2HZKA 2I4CA 1Y9UA 1M5EA 1Y4TA 1Y3PA 3FJMA 2H25A 2DXYA 3VLUA 1MQJA 2QSXA 4YKKA 3C9HA 4JSOA 1OIBA 4GWOA 1LBBA 2BJJX 2XXQA 2HXWA 2AL5A 4EQBA 5I58B 4PQJA 4G2ZA 2DSFA 2R6GE 3IB0A 3S9LC 5I59A 1H44A 3SEXA 1B0LA 2O1MA 5I57B 2VD2A 5AA4B 5B7DA 2I3VA 3RT8A 1QUIA 3F11A 3TTNA 5DT6A 3IO4A 4I62A 4N6PA 4ELQA 3B6QA 1MDP1 2Y84A 2DWHA 2IEEA 4HS7A 1Z7NE 2ZNSA 4R9GA 5H8SA 2DE3A 2ONKE 5H8FB 2VGQA 4YAHX 3MUQA 2R9JA 3IOWA 2G93A 2ALUA 4F18A 1DTGA 3T96B 1PBQA 1LAHE 2I49A 3DELB 2OLBA 4GD5A 1B51A 3W9WA 5A5XB 3FVOA 1DOTA 5I56B 3IORA 4WKMA 4EXKA 4R2FA 4EDPA 2IA4A 3PPRA 3QIMA 1YAEA 4RY1A 5EYFA 4IB2A 4O3BA 1M5BA 1QKBA 1BP5A 1US5A 4M4GA 5TP9B 1B40A 4ZEDA 2Z22A 5H8NB 2ESNA 2FA7A 2V84A 2P1SA 1LCFA 4DE8A 1O64A 4YKIA 3CR9A 4KFQA 4DCYA 4GOTA 2W7YA 1RYXA 5EHSA 3W15C 4F3GA 3HPIA 4OYVA 3KZGA 5CRYA 1USYH 4P11A 3LSXA 5AA2A 1LLSA 3N6UA 4FIMA 1UTHB 1WODA 2GRVA 4H6DA 2I6EA 4PFTA 2NUVA 1QULA 3U8QA 4G68B 1MS7A 4F3BA 2H5YA 3T66A 3SKPA 1FTJA 4DZ1A 1IXHA 4NF4A 2RC7A 4ELOA 3TAJA 4H8IA 4GXAA 4NF8A 2ZMBA 4NTLA 3V89B 1IIWA 3KN8A 3VVDA 1P1WA 3TELA 1LFHA 1I6QA 2Y7KA 4F39A 4HCYA 4QSEA 4GL0A 1B3GA 3S9NC 1IITA 5L9MA 3LR1A 3MPKA 1ATGA 2DOJA 4YICA 4TLMB 2X7QA 2XXTA 3OEKA 4KYDA 1MXZA 5HPQA 3M3LA 1US4A 2RKMA 4RYAA 4F31B 4BDNA 3N26A 3RT6B 5ITOA 1B4ZA 5I58A 1O7TA 2F34A 4I9DA 3O6HA 1FQEA 1OMPA 1VR5A 4KR5A 3HHFA 4DXCA 4EXLA 3FVGA 3L6HA 3PPOA 2XXVA 3UA8A 3CIJA 5I57A 5AA4A 4THIA 5HM4B 2O84X 4OMBA 1N3WA 3LSLA 3C35A 4JWXA 3PU5A 4IO6A 1S50A 1NMUA 3P7IA 1MRPA 2HAUA 3EHSA 2O51A 1B5IA 5H8FA 4NWDA 4ECFA 3TMGA 5JTYB 1BKAA 1SYHA 1B7UA 4E0WA 3S2VA 1QJMA 5DVIA 4F2QA 4GF8A 3BFTA 5FTIA 1P1QA 3TODA 3C4MA 3OSRA 1B1HA 5A5XA 2O69A 5L9SA 3CFZA 2XXYA 5I56A 1B3HA 4ZDMA 3IK6B 1OQHA 3MP8A 4EQ9A 3EF7A 4OFLA 3VXCA 4R75A 4QSCA 4DXBA 3U93A 2QMXA 5DTBA 2ZNUA 5TP9A 4LQ5A 2Q2AA 1XHYA 2UVGA 4OEUA 1A7LA 1QUKA 5H8NA 3G3GA 5BUUA 1SW1A 4U4SA 4Q5TA 3H3GA 1D9YA 4LZ8A 4JWOA 2V25A 1GR2A 3H6UA 3WAEA 2RC9A 3MVXA 3RLFE 4KPTA 2F97A 3QUFA 3MAMA 2PX1A 1URGA 5AA2D 4G8HA 1QUJA 1POY1 1UTHA 3SEVA 3RTFB 4G68A 1N04A 5CMCA 5CMBA 1PBPA 3WAFA 1MQGA 2ZYKA 1D4NA 2Z8EA 1J1NA 1B05A 3HO7A 3JYRA 3O66A 3CFLA 2ZYNA 1LSTA 5LOMA 1MH3A 3H6VA 2XXWA 3MP1A 1B32A 4N07A 3LBSA 1LB9A 2FNCA 3Q26A 3CG1A 3PUWE 3Q25A 3BFUA 3RQTA 4MFIA 1XS5A 2X26A 1A8EA 4GVOA 1D9VA 2V3TA 3PD9A 3MVYA 3SDFA 4H1XA 4ZEFA 1Y20A 1HSEA 4OQOA 1I69A 2NOOA 4P0GA 5DYHA 4QFKA 4ELRA 4XIGQ 5DVJA 1R6ZA 3TDJA 1TT1A 3VVEA 4NF5A 4PETA 4YB5A 4BDQA 4ESXA 3TCHA 5CBSA 3LSWA 2F35A 5TPAB 4LZ7A 1II5A 2DVZA 2DXRA 4KYSA 3C33A 3KSJA 1EZOA 1OVTA 4ELPA 1SD3A 2D5WA 3S4UA 2DS9A 2Y7PA 4OENA 4BLAA 2Y7RA 4YZZA 5ELVA 4U2RA 5IKBA 2XXHA 3KN7A 5ICQA 5CMKA 1MY2A 5JTYA 3KBRA 4OXVA 2H4IA 4KHZE 3HN0A 1NKXA 4R6YA 3RNNA 3CRBA 3VXBA 2HCAA 3GLBA 1MPDA 4MF3A 4F1YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V8XB 1MG1A 2Y5KA 4MEVA 1M5CA 4GRKA 4P1EA 4R74A 3VLWA 2Q8MA 1LAXA 1NV7A 4XKRA 3OENA 5EHMA 4IO5A 3T22A 2VPOA 5CBRA 4Q30B 1FQFA 2PBWA 1Q9DA 4OESA 4PE3A 4F3PA 5JEIA 1YTVA 1B5HA 3E4RA 1LAGE 4DI4B 3FXUA 4X48A 4ZEKA 3V5AA 2XXXA 4O3AA 1N76A 3RY3A 4NMYA 4LA9A 4FORA 1QKAA 4LONB 4WEDA 1ELJA 2FIXA 4FEBA 4HTGA 4YMBA 4Z0IA 2P0SA 2V3QA 5EQAA 3OO7A 3KG2A 5AA3A 3IJOB 2ZXTA 3PUZE 2V93A 3IFAA 1S7YA 1DMBA 3PGFA 2GH9A 1PB9A 5T3JA 1XVYA 3OO8A 5I7IA 3RPWA 3OOAA 3H6TA 2F78A 4PFIA 3O9PA 2QS2A 3O28A 1XVXA 2RF1A 3HHGA 1B9JA 3I5OA 5DEXA 1ZJLA 2CZIA 2REGA 3T0JA 2FVZA 2F36A 2WYKA 4QHQA 1GGGA 3VDFA 5IZ3B 4NN3A 1JEUA 2OWTA 3Q29A 4OEVA 2VOZA 3SETA 4GQOA 3FXRA 2Q2CA 4XXUA 1NV1A 3ONMA 4POXA 4XKPA 1N7XA 3DP6A 1FPDA 4PFWA 1RDYA 3T9UA 2QJEA 3QUJA 4NHBA 3SEYA 4P9KA 3HFUA 4H5FA 2OZZA 4KQPA 1N3XA 1N84A 4N6DA 3VFJA 3T1BA 2XD2A 3MWBA 2ZZXA 4C0RA 3MW0A 2DWJA 3FASA 2F8DA 3U72A 3ISPA 1FPIA 1B3FA 3K4UA 4OANA 3ODBA 2UXAA 4LN5A 4K3FA 2A5TB 2RC8A 4YKPA 3JZJA 3G7WA 1BK4A 3G3FA 1JNFA 2GHBA 2HZLA 3KJ7A 3CFXA 5ET5A 1SBPA 1MXVA 1YCJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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