2HAUA

Apo-human serum transferrin (non-glycosylated)
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 170
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA03
4GXAA 3PPOA 3LSLA 4GIZA 3FASA 3MWBA 5I2NB 3CR9A 1GV8A 3RN8A 1FTMA 3H6VA 2VD3A 2DE2A 1B2HA 4NWDA 1QKBA 1US5A 4R74A 2Y7PA 2R9JA 1SI0A 4OHNA 4IO3A 2UVHA 1LFHA 3E4RA 1UQWA 3UORA 4YMBA 1MRPA 2XXIA 3P7IA 4H8IA 4YB7A 3T96B 4ESXA 1B40A 4N07A 2Z8EA 1IXCA 3MBPA 2OZZA 4AB6A 2DE4A 4ECFA 5ICTA 4ZZAA 1PEBA 3H7MA 3MVWA 1M5FA 4OFJA 3FD3A 3CG1A 1DPPA 4R2BA 1IIWA 3TAJA 3W9VA 5F1QA 1ELJA 1YCJA 3IOVA 3KSXA 3MC2A 4IO6A 2RCAA 1PBQA 3HSTA 3IK6B 4NF6A 4Q5TA 4R9FA 4QSEA 5AA2A 2XX8A 2OWTA 4YMAA 5EHSA 3IO4A 1UTHB 3SEXA 3T66A 2RC9A 4N6PA 4YB5A 1BIYA 3QIMA 4GQOA 4I9DA 1POTA 3QXMA 4GF8A 3TQLA 4HW8A 3HCQA 3S9EA 4HCWA 2RF1A 4I8CA 3CVGA 1L5TA 2OK2A 2OBGA 3VXBA 3QYTA 1MXYA 2RINA 3G3FA 1B05A 4PQJA 1JETA 1B3EA 3N6TA 4JXIA 4YB6A 1EH3A 1LFGA 4Q0CA 1JVXA 2NOOA 4FORA 5CC2A 1Y3NA 2HCAA 4R6HA 1USYE 4PFTA 1OQGA 1QUJA 4G68C 5AA3A 1DPEA 4IY6A 1UTBB 1ZTYA 3TTMA 3CSBA 3D4GA 3E3KA 3CFLA 4M4GA 4G4PA 1FQAA 3EQ1A 1YAEA 3MPKA 5FHNA 5LOMA 4Q8RA 1LBBA 3O6IA 3OOAA 3OO6A 3UGWA 4MH5A 1MPBA 5I57A 4QFPA 4H6DA 5CBRA 1FQEA 4BDQA 4H8JA 1IQ7A 2Q88A 1GR2A 4F31B 2V3TA 3KN8A 2NVUB 1BTJA 5H8FA 5F7VA 1SYHA 3O97A 4WKMA 2O51A 2VOZA 3RUMA 2BJJX 1D9VA 1SBPA 4NMYA 1JEVA 3FATA 1TWYA 3K02A 1B6HA 1ZJLA 4RNSA 2ONRA 2DP8A 2M8CA 4PFWA 2O6AA 4TLLB 2PMSA 1AMFA 1H44A 3OO8A 4JWYA 2PVUA 5CM6A 1JW5A 3PUZE 1XS5A 2QL3A 1QJMA 2DXYA 3B6QA 3MUQA 2O7IA 3RT8A 2KLFA 3O6GA 1MDP1 4HCYA 3SEUA 3HO7A 2I48A 1N84A 2QPQA 3H6WA 3DELB 3Q27A 3DP4A 1BKAA 3B6WA 4UACA 4JDFA 1I6QA 4OYVA 2ZXTA 4FIMA 3TMGA 2YLNA 2XXYA 3V8XB 1FQDA 1M5BA 3GLBA 1MPCA 3CI8A 2UXAA 1UIVA 3KEIA 3AXFA 4EQ9A 3C36A 2I58A 1XOCA 2REJA 1B4HA 3TCFA 2O1LA 3VE1B 5EHMA 4BDLA 4ZE9A 3MQ9A 4LZ7A 3FUZA 4R6KA 4DXBA 3SESA 1QKAA 4O3BA 4OWDA 1B3FA 4GWOA 4BDNA 1DSNA 4F29A 4BLAA 1B51A 3TTLA 4HTGA 2HZLA 3V5AA 4KCDA 2Y84A 1MY4A 2RC8A 3G3GA 4EF1A 3MP6A 2AYSA 4O3AA 2XX9A 4YKJA 4C1UA 3OEKA 3S9MC 1D4NA 3EPEA 2UVGA 3SERA 1B3GA 2RKMA 4IO2A 4OERA 4XKRA 4GRKA 1SW5A 1ZIUA 3LSFB 2F7AA 4OXVA 5CMBA 2QS2A 2QS3A 1JEUA 5I2KB 4GOTA 1H43A 4F3SA 2GH9A 3CRBA 2P1SA 3IL1B 4ZEBA 3IORA 1FW0A 4LQ2A 1EU8A 1IZ1A 5I56A 1JW1A 3K00A 1OIBA 3TUSA 3MJNA 5K2YA 1R9QA 2NXOA 1Y1MA 4DIGA 2W7YA 1MXWA 4ONYA 3FXUA 3N94A 3L6GA 3FV2A 4JWOA 3IOTA 1MQDA 4PETA 5ICQA 2ZYNA 2F36A 1MM6A 3OELA 1SDXA 2FYIA 3LR1A 1OLCA 4QFLA 4H5FA 3MAMA 1B1XA 2ZNUA 3S2VA 1MXZA 2XXUA 4XKNA 1XVXA 4QSDA 3O29A 1TFDA 2ABHA 4K3FA 1ZBMA 2X7PA 5KDTA 4H65A 5L9MA 1A8EA 2REGA 4LP2B 3GBBA 4FJPA 4JWXA 1EZPA 3DM0A 3ONMA 5ITOA 2RCBA 1DTGA 5IKBA 4IGTA 4WXJA 4X1BA 2DWJA 3EF7A 1AIVA 5H8HA 3Q25A 1D9YA 1SW1A 1FTJA 3KGCA 1B5HA 1RYOA 1ATGA 4PP0A 3KN3A 4ELQA 3MVXA 5DT6A 5TPAB 3TTKA 5FHMA 1WODA 3HHGA 1MG1A 3EN3A 3U72A 3LUYA 4NF4B 3TQWA 4KYDA 4DCXA 5JTYB 5A5XA 2E1SA 3UIFA 3C32A 4F3BA 2O1MA 4GLIA 3KJTA 2P0SA 2X7QA 5ISUA 4ZEFA 4LATA 1MS7A 3O9PA 1IXHA 1SD3A 3PD9A 2VGQA 1SYIA 2F34A 4U23A 1MM7A 1SVXB 4XIGQ 3IB1A 5KCJA 4WEPA 3QUJA 2ZYMA 3H3GA 4M1VA 1VSOA 3U93A 2D5WA 2PX1A 1OVBA 4POWA 3ILUB 5CRYA 4U2RA 3K01A 4OEVA 1R6ZA 4RY1A 2XXRA 4U21A 1O64A 3FGSA 3KJ7A 1B7UA 4IGRA 3O6HA 4OVJA 5L8DA 3IO6A 1MY1A 4EUOA 3K1PA 3JZJA 5CMCA 1LAXA 2HAVA 4KYEA 3ECRA 3IR1A 2HFBA 1XC1A 4G2ZA 4QHQA 2DS9A 1B5IA 4GD5A 4F18A 2ALUA 5TP9B 3T22A 3CFZA 5FHOA 3S4UA 1IITA 4QFOA 1B3HA 1SW4A 2F7CA 5L9SA 2H4IA 3G3JA 3MVZA 1IXIA 4I62A 4G8HA 4GFRA 4LQ5A 2IA4A 4P0IA 1PC3A 3K0VA 4Z0IA 1P99A 4NTLA 4OTEA 5DTBA 1FTKA 1P1NA 3G3HA 4F2QA 4OETA 1LAHE 3MZBA 4F1YA 1B58A 3V83A 5B70A 1N76A 4NF5A 1B46A 2F35A 3FV1A 3U92A 1NL5A 1M5DA 2UYEA 2AIXA 3VLUA 1FQCA 4YKIA 4ZEKA 3UA8A 3IOUA 3OO7A 4HS7A 2QMXA 2I0BA 3TYHA 2XXXA 1J1NA 4E0XA 5M2VA 4PE5B 4EXLA 3FVGA 3FJMA 4GL0A 4O3CA 4LONB 1P1QA 4GXSB 3S9NC 2R71A 5JK4A 3CG3A 1O7TA 5KZTA 4ZE8A 3B7DA 3FZVA 2HEUA 3TPAA 3G3IA 4X9TA 3SEYA 1H76A 2Y7KA 2D3IA 1R1NA 1FQFA 2ESNA 4DXUA 1NH7A 3DP8A 1URDA 4OESA 5I58B 4P11A 1DOTA 2XHDA 4POXA 1IXGA 4TOZA 1PB7A 4ELOA 3ZKKA 2Y7RA 5DEXB 2O69A 1VFDA 1P1OA 3FJ7A 2DYXA 3SKPA 4ESWA 3QAXA 2PT1A 2Z8FA 3G7WA 3H4ZA 3KN7A 3IAZA 2WKYA 1S7YA 4JSOA 4P0GA 4G68B 1MPDA 4YKPA 3M8UA 3TZAA 2DQVA 2NUVA 1I69A 1A7LA 1GTKA 4NF6B 1B1HA 1D3KA 3G3KA 3VXCA 3PMWA 1XT8A 3ZKLA 1WDNA 4MLQA 1KWHA 4ZECA 3N6UA 1B4ZA 3HV1A 2DVZA 4FAJA 1LBCA 2A5TA 3LSWA 4F19A 2DWAA 4ISUA 1MY0A 1S50A 2V25A 3TTNA 2GFEA 5H8NB 3LC8A 3FVKA 1SI1A 4KI0E 2UVJA 3PUVE 3RY3A 4DLDA 5DVIA 3H03A 4FECA 1YPNA 5B7DA 5H8QA 4QSCA 3IX1A 1ZMGA 2NWJA 5AE4A 1DMBA 4F2OA 4AB5A 4N13A 3FIRA 1BLFA 1GGGA 1B32A 3CIJA 1YTVA 1GVCA 4Z7EA 1CE2A 4RA1A 2I4CA 3N26A 4QRZA 1B52A 2A5SA 2YPNA 3FXRA 2OWSA 3TEPA 4OFLA 3I6VA 1MY3A 1VR5A 1B0LA 1LCFA 3RQTA 4MF3A 3KOSA 5ITPA 1CB6A 5I2NA 3RLFE 4U4XA 4OMBA 1II5A 4ZEIA 1LCTA 3M3LA 3HN0A 1URGA 3PUXE 1LAFE 1PB8A 3OO9A 3MW0A 3LBSA 5H8FB 3PMVA 2DWHA 4DCYA 2DOJA 4QFNA 3C9HA 5AA4B 3UP9A 1Y20A 3IB2A 4IO5A 1XVYA 2DXRA 3O66A 1Z7NE 3M3KA 3VLWA 4H5GA 2Y7IA 1MY2A 2ZNTA 4NF8B 1MXXA 4KD5A 1FCKA 4F3GA 2YJPA 3CFXA 1NFTA 2QSXA 4DE8A 2Y7WA 4NEDA 3BKIB 3GBAA 4XKPA 4YKKA 4IB2A 2ZYOA 1I6AA 5DVJA 5K2XA 1MXUA 3C33A 2Z22A 2PT2A 1OQHA 4NWCA 1Q35A 1M5EA 3VVFA 4G8MA 1NH8A 3OEMA 2HZKA 3F11A 5TP9A 3T9UA 1Y4CA 1UTHA 4EQ7A 3K1MA 3PUYE 1IUDA 3BFUA 3IOWA 3TKDA 4F1VA 2GHAA 2V93A 3OSQA 4Q30B 2V84A 4U1ZA 2ZNSA 4L17A 3EHSA 3L6HA 1Q1KA 1USYH 3RTFB 4OEUA 3VVEA 5I59B 2XXPA 1N3XA 2Q2CA 3HHFA 1OMPA 2DSFA 3MZ9A 3A3CA 4OQOA 1SW2A 1NMUA 2DE3A 3K6WA 1PB9A 3BFTA 1N0TA 2XD2A 1H45A 3MP1A 4MFIA 1PBPA 5CBSA 2XXVA 2THIA 2QS4A 4DXCA 4ELPA 2O84X 1HSJA 3KZGA 2ZMBA 3RTWB 3C34A 2F97A 3KSJA 2O68A 1FTOA 3DP6A 4OZ9A 4I1DA 3KG2A 1LGBC 1NNKA 2FA7A 2I6EA 1UTBA 1ZKBA 1XHYA 3U8QA 4G77A 4G8NA 4QF9A 5DVFA 1B7HA 3HPIA 2XXTA 2ONSA 4R75A 5HPQA 3M3FA 1RYXA 3TCHA 1ANFA 4GL8A 5CMKA 4EQBA 2V3UA 1Y1ZA 3KOTA 3VV5A 4FE8A 2PYYA 4OFOA 2QJEA 1F9BA 2Z8DA 3DLNA 5I56B 4IO4A 1AH5A 5I58A 4R73A 3ZS6A 2F5XA 1I6BA 4MBPA 2GHBA 2DVCA 3B6TA 3THIA 4JB7A 4X48A 1TFAA 5DEXA 3USDA 4ZS9A 2X26A 3T93B 1OLAA 3O28A 2FNCA 1JQFA 3SDFA 2Z23A 2I0CA 3K6VA 3VFJA 3PPPA 3TCGA 4G68A 3K2DA 4YICA 1HSLA 3K6UA 3Q28A 4KR5A 4LUBA 3ODBA 4EDPA 5BWJA 2LAOA 4ELRA 3MP8A 2Q9TA 3SEWA 2H99A 3IJXB 3PU5A 4F39A 4BDRA 4IO7A 1A54A 3S9LC 3PUWE 4NE4A 5KDTB 4R72A 3K6XA 3E13X 4EF2A 5H8NA 3EHTA 2XXHA 4YZZA 1Y9UA 3PPRA 1LFIA 2H5YA 3I5OA 3Q29A 3R26A 4ZZEA 1LB8A 5H8HB 2CMOA 2D21A 3R7XA 2HAUA 2XXQA 1LSTA 2HQ0A 2OCUA 4PFYA 4ZEDA 2HXWA 2ZYKA 3VLVA 1MQJA 4H67A 4F22A 1MQIA 4BDOA 1NNPA 1B3LA 4F3PA 2IEEA 3V89B 3LSXA 3ZSFA 5A5XB 1N7XA 2Q8JA 1SQYA 1MH4A 3JV9A 4KFQA 2P2AA 3VDFA 4AQ4A 3QK6A 4RXLA 5AA2D 3KFMA 3EHUA 1A40A 4FATA 2R6GE 4MLVA 1N04A 5KCJB 1UIUA 1BP5A 1MXVA 1MQHA 3C31A 4KPTA 1B9JA 1LLSA 3WAEA 3RT6B 5IAIA 3BBRA 3OD7A 2H98A 4XTCQ 4KCCA 3A3UA 2B65A 1LAGE 1AOVA 2H25A 2QMWA 1QUIA 1A55A 2G93A 4ZDMA 2QS1A 2I4BA 3T9HB 3MVYA 5CMMA 3OMBA 1H3DA 5AA4A 5I84A 5I2KA 3K1NA 1QVSA 1T0KA 3RPWA 1EZOA 2I3VA 5AA2B 2F7BA 3FVOA 3D4CA 3C4MA 3OSRA 4NF8A 4E0WA 4RK2A 3E9XA 3ILTB 4KHZE 3WAFA 3MPLA 4RPNA 1O63A 1EZ9A 1Z7ME 5FTHA 4R2FA 3N5LA 5H8SA 5BUUA 2I49A 2O7UA 3MZ1A 3PGFA 2I3WA 1B5JA 1N7WA 2ONKE 2XX7A 5ELVA 3H06B 1AL3A 4RYAA 3H6TA 3RGYA 1OVTA 3O2AA 4OENA 4RK9A 3Q26A 2XXWA 4NF5B 1ZU0A 2V3QA 4X1DA 4PFUA 2UVIA 2XD3A 1P1WA 2E0SA 1QW0A 1P1UA 2B3BA 1VE4A 1HSEA 2G29A 4ND9A 2UYFA 1NNFA 4TQUQ 2CZLA 3GXAA 4KYSA 1LB9A 3R6UA 3T9XB 1R9LA 2H9BA 5HM4B 3RNNA 3I3VA 5L9OA 3UN6A 5I59A 1DTZA 4LZ8A 5J1DA 4JBZA 4LVQA 3C35A 3PV0E 2Q89A 1MQGA 4IY5A 4LZ5A 5TPAA 4F1UA 3VVDA 1QULA 4XXUA 3CSGA 1N3WA 3FVNA 4DZ1A 3PMXA 4NF4A 5I57B 1US4A 1JVYA 1Y4TA 1TXFA 1S9TA 5JTYA 3QSLA 4FEBA 4C1TA 3GZGA 1JW4A 5CI5A 2QRYA 2AL5A 4QFKA 4U4SA 2VHAA 5HBCA 1Y3PA 2ANJA 1WVJA 1NNTA 4H1XA 4JSDA 4UA8A 4GVOA 4U22A 3IJOB 4DDDA 4LA9A 1A99A 4YAHX 2F6GA 4C0RA 1QUKA 3KBRA 3TODA 4RPOA 2AL4A 3H6UA 2PBWA 3PPNA 1FQBA 5JEIA 1B0HA 3TELA 3TTRA 2A5TB 3QUFA 4WEDA 1ZLQA 3JYRA 3OXNA 4YU0A 3SETA 2F6PA 3W15C 1MH3A 3PD8A 2OJTA 5FTIA 2B3FA 1TT1A 4RJZA 2F78A 5EYFA 5DYHA 2F8DA 1IEJA 2GRVA 1URSA 3PPQA 4EXKA 4TLMB 3FJGA 1JNFA 5TU0A 5H8QB 4R9GA 2OLBA 3UK4A 1PDAA 4FEDA 1FTLA 4H0WA 3SEVA 3T9VA 5AA1A 4XKQA 1M5CA 1B7ZA 3IB0A 4KQPA 4R6YA 1MDQA 1Y3QA 1NKXA 4BDMA 3U1OA 2VD2A 4THIA 1VFEA 3A09A 4U1OA 3TDJA 2Q2AA 3W9WA 2RC7A 3OENA 3FXQA 1RKMA 3U94A 3TFLA 3K4UA 2VP1A 2DWIA 1A8FA 1POY1
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KA1A 4GXAA 3PPOA 3LSLA 4GIZA 3FASA 3MWBA 5I2NB 3CR9A 1GV8A 3RN8A 1FTMA 1FTAA 4HXVA 3H6VA 2VD3A 2DE2A 1B2HA 4NWDA 1QKBA 1US5A 4R74A 2Y7PA 2R9JA 1SI0A 4LN5A 4OHNA 1Q9DA 4IO3A 2UVHA 1LFHA 3E4RA 1UQWA 3UORA 5I7IA 4YMBA 1MRPA 4NQ8A 2XXIA 1DK4A 3P7IA 4H8IA 4YB7A 2B4MA 3T96B 4ESXA 1B40A 4N07A 2Z8EA 1IXCA 3MBPA 2OZZA 4AB6A 2DE4A 1NV3A 4GWWA 4ECFA 5ICTA 4ZZAA 1PEBA 3H7MA 3MVWA 1M5FA 4OFJA 3FD3A 3CG1A 1DPPA 4R2BA 1IIWA 2GQ1A 3TAJA 3W9VA 5F1QA 1ELJA 1YCJA 3IOVA 3KSXA 3MC2A 4IO6A 2RCAA 2WEFA 1PBQA 3HSTA 2CEYA 3IK6B 4NF6A 4Q5TA 4R9FA 1EYKA 4QSEA 5AA2A 2XX8A 2OWTA 4YMAA 5EHSA 3IO4A 1UTHB 3SEXA 3T66A 2RC9A 4N6PA 4YB5A 1BIYA 3QIMA 4GQOA 4I9DA 1POTA 3QXMA 4GF8A 3TQLA 4GWSA 4PC9A 4HW8A 3HCQA 3S9EA 4HCWA 2RF1A 4I8CA 3CVGA 1L5TA 2OK2A 2QVRA 2OBGA 4PBHA 3VXBA 3QYTA 1MXYA 2RINA 2VT5A 3G3FA 1LBWA 1B05A 3LV0A 4PQJA 3KC1A 1JETA 1B3EA 3N6TA 4JXIA 4YB6A 1NV7A 1EH3A 1LFGA 4Q0CA 1JVXA 2NOOA 4FORA 5CC2A 1Y3NA 3BIGA 2HCAA 4R6HA 1USYE 4PFTA 1OQGA 1QUJA 4G68C 5AA3A 1LBZA 1DPEA 4IY6A 1UTBB 1FSAA 1ZTYA 3TTMA 3CSBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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