2HAUA

Apo-human serum transferrin (non-glycosylated)
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Serotransferrin
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 170
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA03
2PBWA 2HZKA 1Q35A 5L8DA 1MQHA 5H8QB 4G77A 4YICA 2QPQA 1D4NA 3UP9A 3CFXA 4ZEFA 3ECRA 5IKBA 4FEDA 3MVYA 3H7MA 4GF8A 5AA2D 2XD3A 2H99A 1B3EA 5H8FB 5H8QA 1OLCA 1BP5A 3FVNA 3KEIA 4RPNA 3SEYA 3OO8A 3Q27A 4U1OA 2GRVA 2Q89A 3MAMA 1DTGA 2M8CA 2VD2A 1USYH 3MUQA 4K3FA 2E1SA 5TPAA 3OENA 4Q30B 3PPPA 2I58A 1M5EA 2V3QA 1IXHA 3D4GA 3N94A 4KQPA 4DCXA 1OIBA 4DXBA 2I4BA 1Y20A 4NE4A 3CG1A 3AXFA 1M5FA 5I2KA 4G4PA 4LP2B 4PFTA 1JEUA 4YU0A 1B05A 1IQ7A 4LZ5A 4IO6A 4F19A 2XXRA 4HW8A 4QFOA 5JTYB 4L17A 5H8SA 5I2NA 2I0CA 1B3LA 2V25A 3U93A 4UACA 2GHBA 1A40A 1PB8A 4R2BA 3O6IA 2DVCA 3CR9A 4OXVA 1Y9UA 3CIJA 5CI5A 3RGYA 4YKIA 4DZ1A 3CSGA 3LSXA 2O51A 1MXXA 2F6GA 2DE3A 1MY3A 1B2HA 3PPOA 3THIA 5H8NB 1MXWA 2XX7A 4C0RA 3K6VA 3G3JA 1P1OA 5M2VA 1UTBB 2QL3A 3VLWA 3VV5A 3H3GA 5A5XB 2F7CA 4THIA 4LVQA 3RQTA 3TMGA 4LZ7A 3TCGA 1SI0A 4JBZA 5JK4A 4RA1A 3IOVA 2HQ0A 4XKRA 5A5XA 3PUZE 2PMSA 2UVIA 1II5A 4N6PA 1FTJA 3FJGA 4R2FA 2HCAA 1N04A 4IO3A 3MPLA 4R6KA 2XXPA 3G3GA 5FHOA 4YKKA 1LAFE 1RYOA 1OQHA 4OWDA 5ITOA 3CVGA 3SETA 3KN8A 5BUUA 3N26A 2UYEA 4GFRA 5FTIA 3IR1A 3A3CA 4BDNA 1PB9A 2IEEA 3FJMA 1AIVA 1NNKA 1YTVA 1TFAA 5TP9B 4EF1A 1PC3A 3B6TA 3C33A 3PPRA 1B4HA 2HZLA 1XOCA 2VOZA 1EZOA 1SW1A 3G3HA 1NH8A 1TXFA 3T9VA 4XIGQ 4JXIA 4Q0CA 4BDQA 3C4MA 2F6PA 1A8EA 2YLNA 1HSLA 3TZAA 2CMOA 3PUWE 3RPWA 1D9YA 4QSCA 2F34A 4YB6A 3TPAA 4EQ9A 1F9BA 3K02A 3K6UA 2R6GE 5AA4A 1LSTA 1B3FA 3GLBA 4KCCA 2LAOA 2O7IA 4R74A 3ONMA 4KD5A 3PPQA 1B40A 3MQ9A 4H1XA 4IGTA 1MQJA 4DCYA 3OO9A 2NOOA 4HTGA 5I59A 1VFDA 1MQGA 4IY6A 1B5HA 3CSBA 1A55A 3RUMA 3OMBA 3FATA 3EHUA 4I62A 2DYXA 4U1ZA 3L6GA 4YKPA 5KDTA 4RYAA 3IOWA 2D5WA 1RKMA 4E0XA 2VP1A 3TTLA 3FD3A 3UORA 1UQWA 1NL5A 3QAXA 4E0WA 1O64A 2XX9A 4OENA 3VFJA 5H8HB 4HCWA 3IK6B 4OETA 3OELA 1ZJLA 4KR5A 4MBPA 4H67A 1LB8A 1DSNA 3MJNA 4F1YA 5H8HA 1SW5A 2QMXA 3DP8A 2RINA 3OXNA 3B7DA 5DVFA 2ANJA 4EDPA 3HSTA 4QRZA 2O69A 4O3AA 1QUIA 2XXIA 5FTHA 3VXCA 2BJJX 3E9XA 1MXYA 1WDNA 3ODBA 3MZ1A 3DLNA 3T96B 2UVJA 2DQVA 3EN3A 1DTZA 3LUYA 2P1SA 4U23A 2G29A 2I3WA 4F3BA 2HAVA 1QJMA 4EXKA 3IAZA 4BDOA 2V3UA 3V8XB 1I69A 2O6AA 4G68B 1FQCA 3CFZA 3KJTA 4MLQA 2NVUB 2ZNSA 1B0LA 3K1PA 4KPTA 4G8HA 3MP6A 4DXUA 2DVZA 1YAEA 1A7LA 1MQIA 4IY5A 4GVOA 3TTNA 1DOTA 3KGCA 1SYIA 4I1DA 3RN8A 5HM4B 3KG2A 4I9DA 2UVHA 4FORA 1M5CA 4XTCQ 1FCKA 5I58B 2X7QA 4P0IA 4R9GA 4ELOA 3FVOA 1FW0A 4NTLA 3FV2A 3CRBA 4F3SA 2HXWA 4XKPA 5I58A 4ZDMA 3C34A 1MH3A 2ALUA 4GLIA 2X7PA 1MY0A 1NNPA 3M3FA 2HAUA 3BKIB 3O97A 4ESXA 1HSJA 4PETA 4X1DA 4DLDA 2D3IA 5B7DA 3C31A 2QS3A 3FXRA 2Y7IA 3KOSA 2H4IA 4GXSB 5K2XA 3ZSFA 2HEUA 4NF5A 1FQDA 3H4ZA 1IZ1A 1OVTA 4IO4A 1LAXA 3U1OA 3K00A 1OLAA 2V84A 1YPNA 4H6DA 3R7XA 1Y3PA 3MC2A 2GFEA 3JYRA 3TTMA 3S4UA 1MQDA 3K2DA 3DELB 1LCTA 3G3IA 4H5GA 5JEIA 2OWTA 1ZU0A 1N0TA 1JW1A 3K0VA 1H45A 1EZ9A 1IUDA 4ZZEA 5L9SA 2DE4A 2UXAA 1IXGA 5TPAB 4X9TA 4U4XA 4TLLB 4OFJA 2UYFA 5DVIA 2B65A 3DP6A 5B70A 1ELJA 3V89B 2OZZA 1QKBA 4OESA 4JSDA 4Q5TA 4F22A 2F7AA 1IXCA 3O9PA 2P0SA 3PPNA 3F11A 1B7HA 1RYXA 1XC1A 1B32A 5I2KB 3PMXA 1N84A 2PX1A 4ISUA 3TQWA 3SKPA 2F5XA 3VVEA 3FVGA 3G7WA 2OCUA 1LFIA 2F35A 5I2NB 1B7ZA 2QJEA 5ICTA 1Y4CA 4Z0IA 4F2QA 3Q26A 3QUFA 3IJOB 4KCDA 3TKDA 5HBCA 5I57A 4LQ2A 3IOUA 2XXTA 4H8IA 2ONKE 2R9JA 2QS2A 1J1NA 4EUOA 2DSFA 4ELPA 3T9HB 3FVKA 4R73A 3QXMA 3HCQA 4JWXA 4N07A 1MPBA 1IEJA 3R26A 2E0SA 3QSLA 3R6UA 2ZYNA 1GV8A 4GOTA 1N3WA 2Y7PA 4Q8RA 3H6WA 4LQ5A 3EPEA 1FQFA 4MFIA 3SEWA 3B6QA 1AMFA 3HV1A 2GH9A 3MVXA 4XKNA 4ELRA 2QS1A 1N7XA 2I4CA 2DXYA 4NF4A 1JQFA 3LBSA 2AL5A 1PBQA 3OD7A 2RC7A 1UIUA 3T22A 1WODA 4XKQA 2VHAA 4ZEKA 4ZE8A 3C32A 4I8CA 2Q8JA 1P99A 1Y3NA 1QW0A 4JSOA 1M5DA 3KSXA 3L6HA 1B51A 2YJPA 4ZECA 1FQBA 1DMBA 4MF3A 4BDLA 4OFLA 4NWDA 1L5TA 3OSRA 1Y1ZA 1JEVA 5DVJA 2A5TB 1GVCA 3UK4A 5AA4B 4GRKA 5I56A 4O3BA 3S9MC 2H98A 1URDA 3Q29A 3B6WA 2A5TA 1S9TA 4OYVA 4FEBA 1FTMA 2WKYA 4U4SA 4DXCA 1NH7A 5I59B 3QK6A 3O6HA 2I3VA 1SYHA 3TELA 1B9JA 4KFQA 3VXBA 4QF9A 4XXUA 4GL0A 1XVXA 3W9WA 3I3VA 2RC9A 3E3KA 1HSEA 2H5YA 3K4UA 5AA2B 3USDA 5KDTB 1QVSA 4F31B 1TWYA 4YZZA 3HN0A 2QMWA 2I6EA 4GWOA 3M3KA 5AA2A 3FJ7A 4F1UA 1Y1MA 4PQJA 1Y4TA 1BIYA 3CG3A 4RJZA 4F2OA 1ANFA 1YCJA 3UA8A 1O63A 3QYTA 2I49A 4LA9A 5CMCA 4OTEA 3S9LC 1MXUA 2DWAA 2H25A 4KYEA 1LCFA 3GBAA 4FJPA 5CMMA 3S9EA 2XXHA 3SEUA 3OOAA 4NF8A 5HPQA 1A8FA 2DWJA 1OMPA 3TCHA 3ILUB 4G8NA 1XS5A 4LONB 1WVJA 3MPKA 1UTHB 4RXLA 4RPOA 4ZS9A 3HO7A 3IB2A 3BFTA 3C35A 5CC2A 2R71A 1URSA 1H3DA 1UTHA 2Y7RA 4FE8A 3PV0E 1GGGA 1BKAA 4N13A 2A5SA 1MY2A 1I6BA 3RTWB 5DT6A 3OEKA 5CM6A 1H76A 4M1VA 2F8DA 3BFUA 4M4GA 2F36A 5CBRA 4ONYA 2AL4A 4JWYA 4KYDA 3FGSA 4JB7A 2ZXTA 2OBGA 1ZKBA 2YPNA 1I6AA 2ONRA 3M8UA 3A3UA 4KYSA 1B3HA 3D4CA 3PD8A 1ZTYA 2NXOA 4EQ7A 2UVGA 3T9UA 3LSLA 2D21A 4KHZE 2X26A 3PU5A 3FASA 1LBBA 2RC8A 4ND9A 4KI0E 4DIGA 5CMKA 2Y7WA 2VGQA 3FZVA 1B5JA 1D3KA 1JETA 1EH3A 1MM6A 4FAJA 2FYIA 4YB7A 1USYE 1ZMGA 3H6TA 4G68C 1P1QA 3E4RA 4OVJA 1B1XA 3MZ9A 4FECA 1DPEA 2XD2A 3SERA 4NF5B 5DTBA 1PB7A 4WXJA 3GZGA 3ZKKA 3SESA 2V3TA 4F1VA 2DWIA 1BTJA 1JW5A 1TFDA 5EHMA 4EF2A 1SVXB 1SI1A 3S2VA 3MZBA 5FHMA 4Z7EA 3I6VA 4GD5A 3H03A 1SD3A 1JVXA 2I0BA 3O66A 2DWHA 3JZJA 5ISUA 1MS7A 1VFEA 1ZLQA 2Q88A 1H44A 1SW2A 3RT6B 5ITPA 3U92A 1B0HA 2B3FA 4YMBA 4R6YA 2KLFA 3T9XB 4NWCA 3HPIA 3WAFA 5TU0A 2Q9TA 3P7IA 2CZLA 4DDDA 4FATA 3N5LA 3Q28A 4NF6B 1DPPA 3MP8A 1GTKA 4PFUA 3VE1B 3O6GA 4QFNA 4MH5A 4YB5A 2F7BA 3OEMA 3MVZA 3RLFE 2OK2A 4HS7A 3TAJA 4H5FA 3PD9A 5DEXB 1FTKA 4NF6A 1MH4A 4RNSA 4OZ9A 1IIWA 5EYFA 1O7TA 1R1NA 4PFWA 5H8FA 3KBRA 2F78A 3TQLA 1D9VA 3IOTA 2ABHA 2GHAA 1GR2A 1IXIA 5DEXA 1LFGA 4C1UA 3SEXA 1PDAA 2NUVA 4H0WA 3PGFA 5F1QA 3VLVA 1POTA 3C36A 2G93A 4X48A 2Z22A 2O68A 2O7UA 3LSWA 4U2RA 5I57B 1NMUA 3K6WA 3KN3A 4JWOA 1NFTA 4ZEBA 3V83A 3W15C 3RTFB 1LAGE 5AA1A 2XXWA 3O28A 2O1LA 2XX8A 1XT8A 1URGA 1ATGA 4H65A 4PP0A 1Z7ME 1JW4A 1POY1 3PUXE 4WEDA 3K01A 1R9LA 2DE2A 4OMBA 3OO6A 3EF7A 4BDMA 1US5A 4IB2A 1AL3A 1CE2A 4LUBA 4G2ZA 4C1TA 1MXZA 1ZBMA 5JTYA 3HHFA 3VVDA 2ZMBA 3VDFA 3K6XA 1N76A 4GIZA 2OWSA 3DM0A 4TLMB 3VVFA 4DE8A 3IO4A 2OLBA 4NF4B 2ZNTA 2XXYA 3QIMA 2PVUA 3OO7A 3E13X 3W9VA 5L9OA 2RKMA 2RCBA 5H8NA 4AB5A 3TUSA 3IB1A 4F29A 4QSEA 1CB6A 2ZYKA 1UTBA 1NKXA 2Q2AA 2Z8EA 3KN7A 1MG1A 4YKJA 3T93B 4QHQA 2PYYA 4YAHX 3PUYE 4U22A 1NNFA 1MPCA 5J1DA 3S9NC 2F97A 4QSDA 5F7VA 3WAEA 5K2YA 5I56B 3EHSA 1FTOA 3TTKA 4NEDA 4U21A 1B6HA 3EQ1A 3CFLA 3CI8A 3IB0A 3KOTA 1B46A 3UN6A 2I48A 1MDQA 5CBSA 3H06B 4TOZA 4P11A 1AOVA 4ZZAA 2QS4A 3H6VA 3IL1B 3H6UA 1MY1A 4R72A 3IORA 4X1BA 4OEUA 3FXQA 1H43A 2DS9A 3TDJA 1EU8A 5TP9A 4ESWA 1B5IA 4H8JA 3FIRA 3TFLA 4O3CA 3U94A 1ZIUA 4RK2A 2ONSA 1Z7NE 4ZE9A 1AH5A 2Z23A 2PT2A 3K1NA 4OHNA 3TODA 2RCAA 4F3PA 4OFOA 5CMBA 3SEVA 5KCJB 1PBPA 4GQOA 1LB9A 3U8QA 4OERA 1KWHA 1LGBC 3QUJA 1B7UA 5FHNA 2PT1A 4R75A 4P0GA 2ZYMA 5DYHA 5KCJA 1SDXA 3GXAA 1PEBA 4OEVA 3N6UA 4F18A 4IO2A 3TEPA 5AE4A 5AA3A 2Z8FA 3DP4A 5EHSA 2REJA 5L9MA 4LATA 2ZNUA 4HCYA 1LLSA 3ZS6A 2FA7A 4POXA 5ELVA 2XXXA 3FUZA 3MP1A 4AB6A 4LZ8A 3PMVA 1B52A 3A09A 3RT8A 4NF8B 2RF1A 1FQEA 1FQAA 4JDFA 1MPDA 1S7YA 1QUJA 3ILTB 1VR5A 1MRPA 4YMAA 1B4ZA 3JV9A 1MXVA 1B3GA 3KZGA 1LAHE 3EHTA 1LBCA 3GBBA 3IO6A 2Q2CA 1T0KA 2NWJA 2AYSA 4R6HA 1QKAA 1QUKA 2O1MA 3O29A 3ZKLA 1TT1A 4ELQA 1Q1KA 3RY3A 1EZPA 4PE5B 4MLVA 3RNNA 1VSOA 1A54A 4WKMA 4WEPA 1A99A 1NNTA 3MWBA 2AIXA 4RK9A 3SDFA 2XXUA 4FIMA 4UA8A 4GXAA 2DXRA 1B58A 2W7YA 4EXLA 2Y84A 3FXUA 4EQBA 1N3XA 1OQGA 3TTRA 1XVYA 2QRYA 2XXVA 1FTLA 3LSFB 1UIVA 1P1NA 5IAIA 1M5BA 3PMWA 1P1UA 3UIFA 5KZTA 2REGA 2HFBA 3IX1A 2VD3A 2P2AA 3T66A 4BDRA 3M3LA 1MY4A 2Y7KA 3Q25A 3VLUA 3KSJA 2Z8DA 4G68A 4OQOA 1P1WA 1JVYA 4QFPA 2OJTA 2O84X 1MM7A 1R6ZA 4QFLA 4IO7A 1XHYA 2ESNA 1IITA 3KJ7A 5ICQA 2XHDA 4RY1A 1B1HA 3V5AA 3HHGA 1I6QA 3FV1A 4AQ4A 4QFKA 4R9FA 3KFMA 3LC8A 3LR1A 4IO5A 4ECFA 2DP8A 5I84A 4BLAA 3OSQA 2QSXA 3PUVE 4GL8A 2FNCA 3IJXB 4F39A 3MVWA 1JNFA 3MW0A 4F3GA 2H9BA 1OVBA 3G3KA 1BLFA 3G3FA 3MBPA 4PFYA 2V93A 1SW4A 3TCFA 5BWJA 1Y3QA 3I5OA 3O2AA 3UGWA 1SQYA 1SBPA 4ZEIA 4ZEDA 4POWA 4TQUQ 3N6TA 5LOMA 1MDP1 1VE4A 3U72A 3TYHA 3C9HA 5CRYA 4G8MA 1QULA 2B3BA 1US4A 1S50A 3BBRA 1R9QA 2THIA 4NMYA 2DOJA 3K1MA 1LFHA 1N7WA 4IGRA 2ZYOA 2XXQA 2IA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PBWA 4MNIA 2HZKA 1Q35A 5L8DA 1MQHA 5H8QB 4G77A 4YICA 2QPQA 1D4NA 3UP9A 3CFXA 4ZEFA 3ECRA 4X04A 4P47A 5IKBA 4FEDA 3MVYA 3H7MA 4GF8A 4P56A 5AA2D 2XD3A 2H99A 1B3EA 4PAIA 5H8FB 5H8QA 1OLCA 1BP5A 1IMFA 3FVNA 3KEIA 4RPNA 3SEYA 4OVTA 3OO8A 3Q27A 4I3EA 4U1OA 2GRVA 2Q89A 3MAMA 1DTGA 2M8CA 2VD2A 4OVSA 4IR8A 4KXPA 1USYH 3MUQA 4K3FA 2P3NA 2E1SA 5I3SA 5TPAA 3OENA 1FBGA 4Q30B 3PPPA 2I58A 1M5EA 3E78A 2V3QA 1IXHA 3D4GA 4OA4A 1RDZA 4NQ8A 3N94A 4KQPA 4DCXA 1NV2A 2PFYA 1OIBA 4DXBA 1FBEA 2I4BA 1Y20A 4NE4A 3CG1A 3AXFA 1M5FA 5I2KA 2FIXA 3RPLA 4G4PA 4LP2B 4OVPA 4PFTA 1JEUA 4YU0A 1B05A 1IQ7A 4LZ5A 4IO6A 4F19A 4O7IA 2XXRA 4P8BA 2XWOA 4HW8A 4QFOA 5JTYB 4L17A 4LN5A 5H8SA 5I2NA 2I0CA 5J16A 1B3LA 1FPGA 2V25A 1YYZA 5DW8A 3U93A 4UACA 2GHBA 1A40A 1PB8A 4R2BA 3O6IA 2DVCA 3CR9A 2ZZXA 2KQZA 4OXVA 1Y9UA 3CIJA 5IZ3A 1DBZA 5CI5A 3RGYA 4YKIA 4DZ1A 3CSGA 3LSXA 2O51A 1MXXA 2F6GA 2DE3A 2L5VA 1MY3A 1B2HA 3PPOA 3THIA 5H8NB 1MXWA 2XX7A 4DI4B 4C0RA 3K6VA 3G3JA 4N91A 3T1BA 1P1OA 1NV4A 1UTBB 5M2VA 5T3JA 2QL3A 3VLWA 3VV5A 3H3GA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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