1MY3A

Crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with bromo-willardiine in the zn crystal form
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A01
4KCCA 4PP0A 3IORA 4IY6A 3CIJA 5CMKA 2ABHA 3OO7A 2XXHA 1B3LA 2R71A 1AOVA 4BDOA 3S9MC 1YAEA 5L8DA 1R9LA 2I0CA 2Y7IA 3UA8A 3UORA 1IQ7A 1BLFA 3PUYE 1N04A 2ONSA 3S2VA 4GF8A 2G29A 1R1NA 1H45A 3C34A 4KYDA 2Z23A 1T0KA 4GL8A 1B3EA 1SI0A 3IAZA 1B0HA 1B6HA 3USDA 3O29A 5BUUA 4RK9A 2I49A 4F3PA 2F7BA 3MUQA 5BWJA 5CMMA 4G2ZA 4NF8B 1TFDA 3G3FA 1B52A 3Q27A 3ZS6A 3SEWA 2HAUA 1P1WA 3O97A 3MVZA 1YCJA 1ATGA 1Y3PA 5CM6A 2PVUA 2P1SA 3MWBA 1DOTA 1QVSA 2XXUA 3OMBA 1LCTA 4MF3A 4ELRA 4ESXA 3UN6A 3O66A 3KGCA 1JEVA 1HSJA 4MLQA 1AL3A 2F6GA 1GV8A 3FXRA 2I6EA 3P7IA 2RKMA 1EU8A 4FAJA 1Y1ZA 4GQOA 5FTIA 1I6QA 2V93A 1ZLQA 3KJ7A 3TQWA 2O84X 4ELOA 3CSBA 4QSDA 3R26A 4F2QA 3PD9A 4H5GA 1MDP1 1N7XA 3GXAA 1ZBMA 2DWHA 3LUYA 5H8FB 3PPNA 5HBCA 3IO6A 3W9WA 3Q25A 4GWOA 4ISUA 3CFZA 1FQBA 4NF6B 3WAFA 1S9TA 3EN3A 3S9EA 2XXIA 1LCFA 3PPPA 1S7YA 3N94A 4NMYA 2VD3A 1RYOA 2QS3A 3W9VA 1MS7A 1P1OA 3MPKA 1NH7A 4H1XA 3MBPA 3Q28A 1HSEA 3PD8A 4IGTA 3U94A 3HSTA 1LAFE 4U23A 2I4CA 2Y7WA 3K0VA 1I6AA 5TP9B 4EXLA 4LZ5A 1N3WA 5H8QA 3HN0A 3FATA 1MH4A 3CFLA 2ZYNA 1LAHE 4EUOA 3TUSA 4FATA 3N5LA 1SI1A 2A5TA 4NE4A 3TMGA 4F31B 3G7WA 4X48A 1YTVA 4JBZA 4RNSA 3TCGA 3TAJA 1FQAA 2PMSA 2I4BA 4FEBA 1N76A 2F36A 4OHNA 4KPTA 5CRYA 3VLVA 3TTRA 2D3IA 3TELA 5DEXA 3LC8A 1O63A 5CMCA 2KLFA 2E0SA 1JETA 3MZBA 4HCYA 3MZ1A 2FNCA 3M8UA 3FV2A 4U1ZA 4IO5A 3RTFB 3ZKKA 3SEUA 3FJMA 2Y84A 4EQ7A 1LLSA 4EXKA 2Q2CA 4NEDA 4FE8A 5KCJA 3IOWA 4EDPA 1TT1A 3ZKLA 2OCUA 3PPOA 4G8NA 4PFYA 4OZ9A 3MW0A 3C31A 1IEJA 1PC3A 3SETA 1AH5A 3U92A 2V3UA 3H6UA 2HAVA 2F34A 4I1DA 4RPNA 4DXCA 4H65A 3T93B 1ANFA 3HO7A 3QUFA 4QFNA 1KWHA 3CG3A 5H8SA 2O68A 2XX9A 1EZOA 2Y7RA 4G77A 4GL0A 3KSXA 3TFLA 1AMFA 1OLCA 4OWDA 2PT2A 2XXVA 4Q8RA 4PFTA 3K6VA 3T96B 2Q89A 2HZLA 2GFEA 1MXZA 2GHAA 3N6TA 1LAXA 3U72A 3C33A 2QMXA 1UTHA 1MXUA 1USYE 4U21A 3HHGA 1O7TA 3MZ9A 2ANJA 1WDNA 4U4XA 4AQ4A 2DQVA 2ZNTA 3LSFB 2XXRA 1MY4A 2QPQA 2I3WA 5ITPA 2AL4A 1IXHA 2HXWA 1XHYA 2YPNA 4G68A 4PE5B 2O51A 4IO6A 4OFOA 2DP8A 1Y20A 1M5EA 4DXUA 1VE4A 1QKBA 2DS9A 4JSDA 1Y9UA 4DCYA 4LZ7A 2G93A 4WEPA 1GTKA 4N07A 4M4GA 5H8QB 4TQUQ 1PDAA 3SEXA 4NF5A 4LZ8A 2ALUA 1GR2A 2A5TB 4KFQA 4H8JA 4DDDA 3TZAA 5AA4A 1S50A 5DYHA 1RKMA 4QSEA 1QJMA 2QRYA 3SKPA 3TTLA 3G3KA 3RNNA 2QS4A 3U8QA 1IXCA 1M5FA 4JSOA 4OENA 2DWJA 5DEXB 3VVEA 4YKJA 2DVCA 3R6UA 1EZPA 3FGSA 1EZ9A 2DE4A 2RC9A 2NUVA 1B3GA 3K1PA 3QK6A 1B05A 3FVKA 4KYEA 1QW0A 2ONRA 1XT8A 3GBAA 1IXGA 2Z8DA 2UYEA 3IR1A 4MH5A 2UVHA 2RC8A 4ZEFA 2ZYOA 3RPWA 4OERA 1A99A 4IO2A 5I84A 2UXAA 3KOSA 1O64A 3FD3A 3N26A 2V3QA 2OZZA 1SYHA 1TXFA 2REGA 5I2NA 2F78A 2VD2A 4F22A 1OIBA 1B46A 3SERA 4LONB 1POY1 2DYXA 1NNTA 5I57A 4G68C 3O6HA 4LQ2A 3V83A 2NVUB 1N0TA 2ESNA 1M5CA 4U2RA 5AA2A 1L5TA 1M5BA 1NH8A 3C9HA 1FQDA 2Y7KA 1NNKA 3MPLA 3N6UA 3ONMA 2B65A 4DLDA 3E3KA 4RPOA 3EHSA 3IJOB 4R6YA 4FJPA 4QSCA 2VHAA 3K4UA 4QHQA 5I56A 4KCDA 1II5A 1FTMA 1FTKA 2ZMBA 4OVJA 2DSFA 4DXBA 1Y4CA 4DIGA 3DP4A 3FV1A 4OFLA 4YMAA 2ZYKA 1UTHB 4KI0E 1LAGE 1SW1A 4IY5A 4ELPA 3OO6A 3ILUB 2ZNSA 2GH9A 4TLLB 2FYIA 5I59B 1YPNA 3OD7A 3OEMA 5DVJA 3DELB 1H43A 1B5JA 1LGBC 3TEPA 2PBWA 1QUKA 1UIVA 4AB6A 4F19A 4ESWA 2ZXTA 3I6VA 1FTJA 2D5WA 4G68B 4H6DA 3KFMA 4RA1A 1LSTA 3FJGA 4ZEDA 1XC1A 1R6ZA 2Q2AA 4ZZAA 5L9SA 3C4MA 2P2AA 3H7MA 3MQ9A 2F6PA 2REJA 1VSOA 3H6VA 3O2AA 2DOJA 3LBSA 3DP6A 1PB7A 2F97A 5A5XA 3K6WA 2UVGA 4JB7A 2UVJA 1N7WA 1JNFA 1LFGA 1MM6A 5I2KA 3V89B 3TQLA 4ONYA 2QS2A 5FTHA 5FHMA 3QUJA 4YAHX 4PFUA 1H76A 3G3GA 2O6AA 5L9MA 1B58A 1P1NA 1XOCA 1Q1KA 3M3KA 4O3AA 3RUMA 3FZVA 2O7IA 2XD2A 5TPAA 4Z0IA 3UIFA 3THIA 3TTMA 4POXA 2RCBA 2IEEA 1MY1A 3KOTA 1UTBA 1VFEA 1N3XA 4GXAA 3UP9A 2Y7PA 2DXYA 4ELQA 3RY3A 3VXCA 2LAOA 3GZGA 4RYAA 1IITA 2CMOA 3KEIA 1MG1A 5H8NA 1MQIA 3VVFA 4Q0CA 5KDTB 1XVXA 4QFKA 1Q35A 1MQJA 1GGGA 4ZEIA 2HZKA 1VR5A 1H44A 4NWCA 3MP6A 4G8HA 3MVXA 1MQDA 1A55A 4IB2A 5I57B 3F11A 4MBPA 1B40A 3R7XA 3W15C 3IO4A 4QF9A 4DCXA 3IOVA 4RJZA 4G4PA 2NWJA 2H98A 5AA2B 4YB7A 4ZEKA 1PBQA 2Z8FA 3QAXA 4RY1A 1Y1MA 4E0WA 3K01A 3K02A 3Q26A 3OSRA 4EQBA 4F3BA 4OYVA 2H5YA 4F29A 2Q88A 5I56B 3C32A 5CBSA 3HHFA 1NMUA 3TKDA 3B6TA 3IOTA 1R9QA 2OWTA 4OXVA 2XHDA 2V3TA 3T9XB 5ICTA 4IO4A 2O1MA 1XS5A 5F7VA 2DXRA 3UGWA 3MVWA 1NNPA 3VV5A 3PUWE 1LB9A 1MY0A 4OFJA 3OO8A 4R6KA 2W7YA 1A54A 2D21A 3HV1A 3U93A 1FQFA 2F8DA 4XKPA 3TCFA 2OBGA 5JTYA 1I6BA 3VXBA 4R74A 1B3FA 2FA7A 5K2XA 4GD5A 3MVYA 1B5HA 3PUXE 3K1MA 4FIMA 2H9BA 3L6GA 2XXPA 1MY2A 3H4ZA 2RF1A 1OQGA 4GVOA 4ZS9A 1B2HA 2RCAA 4QFLA 2QS1A 2WKYA 1PBPA 2I3VA 4C0RA 1D9VA 4F3GA 5IAIA 4JDFA 3G3JA 5CBRA 4FORA 4G8MA 4THIA 5TPAB 5ISUA 4R9FA 3IX1A 4HW8A 4R6HA 5H8HA 2DE3A 3K6XA 3VLWA 4N13A 2B3FA 5KZTA 3VVDA 3S9LC 3IOUA 4YB6A 1Z7ME 3OEKA 4AB5A 3LSXA 4HCWA 3CR9A 3D4GA 5H8NB 4UACA 2OK2A 3OSQA 4OEVA 1NFTA 3VE1B 2X7QA 1IIWA 4BDNA 3LR1A 3A3UA 3IL1B 3ILTB 3JYRA 1MXWA 3H3GA 3E4RA 1FQEA 3CG1A 1BP5A 4FEDA 3RT8A 3T66A 2UVIA 1SW2A 4NF4A 1JEUA 4TLMB 3V5AA 2NOOA 4R73A 3EPEA 3PGFA 4LP2B 3QYTA 3JV9A 2HCAA 3EHUA 1SYIA 5TU0A 4U4SA 3PU5A 3FVNA 2QMWA 4H5FA 3I3VA 4XTCQ 1VFDA 3K6UA 1XVYA 4YMBA 1DPPA 3IK6B 1BTJA 2R6GE 1J1NA 1AIVA 1Y3QA 3ODBA 4H8IA 2H25A 1RYXA 4F2OA 3BKIB 1A8EA 4P0GA 1URDA 5AE4A 3CSGA 3TCHA 1LFHA 4GLIA 3JZJA 3FASA 4R2FA 2Q9TA 5AA3A 1PEBA 5H8FA 5KCJB 4Z7EA 4DZ1A 3ECRA 3HCQA 2DWIA 3RGYA 4R9GA 2GRVA 4UA8A 2I58A 4ZE8A 5EHSA 5JTYB 3V8XB 1P1UA 2OWSA 5I58A 3OOAA 3PPQA 1FCKA 3FIRA 2XXWA 4YKIA 4HS7A 1IXIA 5CC2A 4ND9A 1HSLA 4QFPA 1UIUA 3SDFA 1ELJA 3S9NC 1JVYA 1SW4A 3O6GA 3IJXB 1MH3A 4YKKA 5TP9A 3QXMA 3A3CA 4MLVA 1JW4A 4GRKA 1ZIUA 3OXNA 3BFTA 4GOTA 3K2DA 4IO3A 3FVGA 1JW1A 3U1OA 4X1DA 2H4IA 3IB0A 1USYH 1QKAA 2F7AA 3G3HA 5LOMA 2M8CA 5H8HB 1M5DA 2DWAA 4QRZA 4JWXA 1MM7A 1MRPA 2ZYMA 1DTZA 3SEYA 4R72A 4XXUA 3KSJA 5IKBA 5FHOA 5JEIA 1JQFA 1B3HA 2B3BA 4LVQA 5FHNA 5EHMA 3FXQA 1LBBA 4BDQA 4OETA 4LUBA 3O9PA 4F1YA 1B4HA 1OQHA 4R75A 4KR5A 3TPAA 5CMBA 1FW0A 1US5A 4KHZE 1DPEA 2O69A 1A40A 2RINA 4NF5B 4NF4B 3ZSFA 4F1UA 3FJ7A 4IGRA 2V84A 4IO7A 2DVZA 5AA4B 4X1BA 5L9OA 1B7HA 3KJTA 4OTEA 2E1SA 3IB2A 5JK4A 2PYYA 3GLBA 1DSNA 2ZNUA 1B4ZA 4KQPA 3T9HB 1DTGA 4EQ9A 1TFAA 2A5SA 4U1OA 2YLNA 1NKXA 2QSXA 4HTGA 4ECFA 5J1DA 5DVFA 2X7PA 3KG2A 4L17A 1DMBA 1URGA 1MY3A 4GXSB 4PETA 1B7UA 2X26A 3AXFA 4F3SA 4O3CA 1BKAA 5B7DA 4PFWA 4BDRA 1I69A 2AYSA 1WODA 1OVBA 4ZECA 3EF7A 1MQHA 1IZ1A 4F18A 5I2NB 2XXXA 4OEUA 1MPDA 1Z7NE 4ZZEA 1N84A 1P99A 5M2VA 5I58B 4YKPA 1MXYA 4ZEBA 4MFIA 5F1QA 4XIGQ 3E9XA 1SQYA 1D4NA 1SBPA 4E0XA 1D3KA 1SD3A 1FQCA 3L6HA 4P11A 4WEDA 1D9YA 4BDMA 3T9UA 3CFXA 1B9JA 4RK2A 2P0SA 5ITOA 2Q8JA 1B0LA 3A09A 2QL3A 3O28A 3TTKA 3QIMA 2BJJX 3PUZE 1US4A 4I8CA 5DVIA 4OQOA 3S4UA 3VDFA 3KN8A 3PMVA 3VLUA 5HM4B 3B7DA 3MAMA 1B32A 2CZLA 4KD5A 4C1TA 4TOZA 3TDJA 1SVXB 3PV0E 3TODA 1LFIA 4KYSA 3FXUA 3BBRA 1UQWA 2RC7A 3HPIA 4OESA 2VGQA 2F35A 3RQTA 3FUZA 4F39A 3CRBA 5DT6A 3TYHA 3OENA 4Q30B 1B5IA 1MDQA 2NXOA 3RN8A 5HPQA 2ONKE 1ZKBA 2Z22A 3O6IA 4NWDA 1F9BA 1OMPA 2Z8EA 2HEUA 3FVOA 4X9TA 4C1UA 3PMXA 2GHBA 1A8FA 2YJPA 3QSLA 4GFRA 2IA4A 1CB6A 2F5XA 5A5XB 3RTWB 3B6QA 3BFUA 3KN3A 1MXXA 1QUIA 4DE8A 2HQ0A 1ZU0A 4YICA 5I2KB 4P0IA 1FTLA 3RT6B 3T22A 1QULA 3IB1A 4PQJA 1MQGA 3SEVA 3H6WA 2XX7A 1GVCA 1ZMGA 3H06B 3MP1A 2PT1A 4LATA 2F7CA 3M3LA 2AL5A 1H3DA 1B1HA 4RXLA 1NNFA 5DTBA 3E13X 3MP8A 1ZTYA 2UYFA 1URSA 4XKRA 4Q5TA 2VP1A 2I48A 4YZZA 3K1NA 3UK4A 2XXTA 1UTBB 3PPRA 3OELA 2XD3A 4ZDMA 4LA9A 4M1VA 3LSWA 4QFOA 3TTNA 4N6PA 3Q29A 1JW5A 4WKMA 4JWOA 1JVXA 5CI5A 3KZGA 4XKNA 5I59A 3M3FA 4YB5A 3PUVE 4H67A 1EH3A 4FECA 4NF8A 4EF1A 5K2YA 2XX8A 4R2BA 1Y3NA 2THIA 1TWYA 3EHTA 5B70A 3EQ1A 1PB9A 2I0BA 4BLAA 2XXYA 3CVGA 4U22A 1MXVA 4LQ5A 3SESA 3I5OA 1B1XA 1QUJA 3G3IA 1MPCA 1SDXA 1FTOA 2OJTA 4JXIA 3MJNA 2O1LA 3KN7A 4XKQA 1OLAA 3VFJA 5ICQA 1NL5A 2PX1A 3B6WA 1P1QA 1PB8A 1B7ZA 4GIZA 1A7LA 1CE2A 3KBRA 3OO9A 5AA1A 3LSLA 3H03A 4YU0A 4K3FA 4BDLA 3WAEA 2V25A 4ZE9A 2H99A 3DM0A 1BIYA 4H0WA 3PMWA 3H6TA 4O3BA 3D4CA 2DE2A 1POTA 5ELVA 4OMBA 1LB8A 3RLFE 3C36A 4NF6A 1MPBA 3K00A 1LBCA 3T9VA 2VOZA 1WVJA 4I9DA 3MC2A 1OVTA 4F1VA 1Y4TA 2AIXA 2XXQA 4I62A 2HFBA 4WXJA 4JWYA 3C35A 5KDTA 3DLNA 4NTLA 1B51A 3GBBA 3CI8A 2R9JA 1IUDA 5AA2D 2O7UA 2OLBA 2QJEA 4POWA 4EF2A 3DP8A 1ZJLA 5EYFA 1SW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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