1MY3A

Crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with bromo-willardiine in the zn crystal form
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A01
1MXYA 4EF1A 1B5HA 4FEBA 5H8NB 2QS2A 4WKMA 1QVSA 3L6GA 4WEDA 3MVYA 5H8QB 1US5A 4KI0E 3CI8A 4MBPA 1A55A 1M5EA 4R74A 5I57A 2Q2AA 2V3UA 3R6UA 3CIJA 5HBCA 5KDTA 2D3IA 1ZU0A 4IO7A 2RC7A 4I8CA 1QJMA 1IXHA 4ZZAA 3PGFA 3TMGA 2DVZA 3M8UA 3LSXA 1S7YA 1L5TA 1SYHA 1USYE 2UYEA 1N7WA 3SDFA 4POWA 5DTBA 4YAHX 2O6AA 4ESXA 2F34A 4R75A 4X48A 4H6DA 4PFYA 2Y84A 2X7PA 3DP8A 3IAZA 3RGYA 4YB7A 4QFOA 2E1SA 4AQ4A 4U21A 4F3BA 1TT1A 1B3HA 2R71A 5EHMA 1ZMGA 4JB7A 3RT8A 1B7HA 5EYFA 1DPEA 1UIVA 2RC9A 1RYOA 2I48A 2Z8EA 1B51A 3IB1A 3OO8A 5B7DA 3K02A 4MLVA 1MY4A 1CB6A 2PT2A 4LA9A 1B4HA 3C31A 3MP8A 1NMUA 4H67A 2H5YA 2M8CA 4OERA 3RUMA 3QAXA 3SEVA 3TTLA 1OQGA 4M4GA 3HO7A 3OO7A 1MS7A 1MQHA 2H4IA 3IB0A 2IEEA 3KJTA 3TPAA 2Q8JA 4MF3A 4GF8A 3ONMA 2Y7WA 1MXZA 4O3CA 2X26A 2AIXA 1B05A 4THIA 3S9MC 5H8HA 1BIYA 3LC8A 3EN3A 3T9VA 4KPTA 1B6HA 3MQ9A 2DQVA 4G8MA 4GLIA 1RYXA 1ANFA 2DE3A 3EPEA 3HSTA 3T96B 4R6HA 2XD2A 3BBRA 3CRBA 3C36A 3TCHA 2OBGA 4IO6A 4UACA 3O66A 2Y7RA 1B32A 1WVJA 2E0SA 5K2YA 1FTJA 2XX9A 1R9LA 4NF4B 3I6VA 3N6UA 2UVIA 3PUWE 3GLBA 3KSJA 1DTGA 4F2QA 3RLFE 4FORA 3U94A 4OZ9A 2YJPA 1N3XA 4DCYA 3MW0A 4LZ8A 1BP5A 3FV2A 3IO6A 2V3QA 2Z22A 5I56B 4BDQA 4YZZA 4QSCA 1ZLQA 3EHSA 3TFLA 3SKPA 4KYEA 2A5TB 1MG1A 4YB6A 1H44A 5ICTA 4QFLA 2F36A 2DXRA 3ZKLA 3MC2A 4HTGA 2O7IA 2Y7IA 2FNCA 2ZYOA 1B3LA 3OD7A 4TLMB 1ELJA 3ZSFA 4LZ5A 4QRZA 4LATA 3DLNA 4NF6B 2QS1A 3CVGA 4LUBA 1B2HA 3M3KA 4RK2A 1EZPA 1UTHB 4U2RA 3IO4A 2O7UA 5J1DA 3TKDA 3T9XB 3MUQA 3VLVA 1FW0A 3PMXA 3K0VA 4G68A 3KBRA 4GXAA 3VE1B 2CMOA 3RTFB 3IOUA 3RNNA 3L6HA 1LFIA 1D9VA 1SDXA 2AL4A 1FQEA 1JW5A 1B46A 2VGQA 4IO2A 3JV9A 4XIGQ 1Y20A 3HPIA 3ILUB 5I58B 4OWDA 3V83A 5AE4A 1FQBA 2G93A 3QIMA 2NVUB 1R6ZA 2I0CA 4ZDMA 2PX1A 4QFKA 5ICQA 1H3DA 3GBBA 4F31B 1EZOA 4O3BA 2A5SA 3OENA 1JEVA 3MZ1A 4R73A 1H43A 2XXVA 5TPAA 4OVJA 1UTBA 4OFLA 4ELRA 2P2AA 4C1UA 3FXRA 3QUFA 3LUYA 2XXPA 3IX1A 1MXXA 1D9YA 5I2KA 2RKMA 4F22A 2Q9TA 2HZKA 1LAGE 3DP6A 2NWJA 4EQBA 1PB8A 2G29A 2XXIA 3G7WA 4DXUA 1PB9A 3FJMA 3OEMA 4DE8A 3S9EA 2RINA 1JQFA 3KSXA 2RCAA 4YB5A 2F8DA 4QFPA 3A3UA 3TQWA 3MZ9A 1XVYA 3K01A 1US4A 1NH8A 3H6WA 1XHYA 1MY0A 3LR1A 5I59B 1AIVA 1MXWA 2THIA 1D4NA 4NF5A 1GVCA 4E0XA 4U1OA 3B6TA 3N5LA 1B3FA 4HCWA 3FASA 1QKBA 2X7QA 1T0KA 3BKIB 2XHDA 4OEVA 5KCJB 5ISUA 4KD5A 3O28A 5JTYA 2XXRA 1TXFA 2ZNSA 3THIA 4FEDA 3UIFA 4WXJA 2QMXA 4F1YA 3SEWA 1O64A 5H8FB 2P0SA 3VFJA 4BDRA 3B7DA 2O84X 1TFAA 2DP8A 3KN3A 4NEDA 4N13A 3G3KA 2GH9A 1OVBA 2AYSA 2H9BA 3M3FA 2BJJX 3HN0A 3KFMA 5DT6A 1LLSA 4Q8RA 4YMAA 1CE2A 1DPPA 3OMBA 1AL3A 4H8JA 1OLCA 4RY1A 4Z0IA 3FGSA 2UYFA 4OTEA 5I57B 2HAVA 3TTRA 4H65A 2F97A 4IGTA 2ZYNA 2QS3A 1JVXA 3G3IA 5KDTB 4I9DA 4DXCA 1MXUA 1NNFA 1IXIA 3TODA 4ZEIA 3EQ1A 3TQLA 4XKQA 3G3HA 2B3BA 3CSBA 1GV8A 2OLBA 3BFUA 1A99A 4PFUA 1OMPA 3IOVA 1M5CA 3K6UA 3VXBA 5F7VA 1GTKA 3VVEA 4EUOA 3K1PA 3V89B 2NXOA 5HM4B 1S50A 3OSRA 5A5XA 1B58A 4YU0A 3K6VA 3WAFA 4ELOA 1NNTA 5I2NA 3U72A 1VE4A 1JW4A 1M5DA 4P11A 1B9JA 3E3KA 2H98A 4PP0A 1A54A 2IA4A 2V3TA 3F11A 5DVFA 5AA1A 5DEXB 4RPOA 1OQHA 4IO3A 2VOZA 3SETA 4EXKA 5JEIA 1LB8A 5AA4A 1Q1KA 1Y4TA 1A40A 3A09A 2ZYMA 4YKKA 4K3FA 1VSOA 1MY1A 4M1VA 3UN6A 4X1BA 3HV1A 1VFDA 2PMSA 1FQFA 3UORA 1PBPA 1P1UA 4ZE9A 3FXUA 1NH7A 1EZ9A 2XXXA 4R6KA 3KJ7A 1NL5A 4TQUQ 4R72A 1B52A 4PFWA 5LOMA 4XKPA 1MQGA 2OWSA 4DIGA 3GZGA 5DVJA 5H8HB 1TFDA 4FECA 3UGWA 4GIZA 1OIBA 1PB7A 5I84A 1Y1MA 2I6EA 2I0BA 3ECRA 5BUUA 3B6WA 3H4ZA 3EF7A 3IR1A 1JETA 3Q26A 1URSA 3CFXA 1JVYA 3JYRA 1SW5A 3KZGA 4F19A 3VVFA 1Y9UA 4NWCA 2CZLA 2F7BA 3PPQA 4RXLA 3T9UA 3QUJA 3T22A 2NOOA 3IOTA 1FQCA 4QSEA 1LFHA 1DMBA 1R9QA 4DXBA 2UVHA 4ZEKA 1MDQA 1AH5A 4ZECA 5CRYA 4GXSB 2XX7A 3FV1A 5L8DA 3FD3A 5FHMA 1Q35A 3H6VA 4ISUA 3IK6B 5CC2A 3EHUA 3KEIA 1I69A 1VFEA 1LB9A 1LSTA 5TU0A 4XTCQ 1B5IA 3A3CA 3W15C 4IO5A 2QMWA 4ZEFA 1EU8A 3D4CA 1MQJA 1IUDA 3FJ7A 4GL0A 3N6TA 1MPCA 3O29A 2QS4A 3TELA 3RY3A 2ONKE 2B65A 1MM7A 1YPNA 2Q88A 1B40A 1PEBA 3G3FA 5CMKA 3PUYE 4OETA 4GQOA 1MDP1 3W9WA 3TTNA 4BLAA 3O6IA 4OENA 5IKBA 2F78A 4G68B 1BTJA 3FJGA 1DSNA 5DYHA 2REJA 3K4UA 2I58A 2Z23A 4Z7EA 2DOJA 1Z7ME 2PBWA 2HQ0A 3KN8A 4OHNA 2QJEA 3BFTA 4G2ZA 1XVXA 2XXQA 3FATA 3S9NC 5DVIA 4BDNA 1OVTA 1EH3A 1I6AA 2I3WA 2UVGA 2XD3A 3S9LC 3LSWA 1SW4A 1FQAA 3KOSA 1KWHA 2DS9A 3O2AA 3QXMA 5F1QA 1NFTA 1IEJA 3OXNA 3H6TA 3MBPA 1LFGA 2RCBA 1QW0A 4KR5A 3TDJA 1PC3A 1P99A 4KFQA 4L17A 4FE8A 5L9SA 1MRPA 2Z8DA 3MPLA 1UTBB 4EXLA 4ZE8A 4GOTA 4C0RA 4ELQA 5IAIA 4QF9A 1D3KA 4TLLB 2WKYA 1SBPA 5AA2A 2VD2A 1Z7NE 5I2KB 5AA3A 4DLDA 4QSDA 1MH4A 2QRYA 3Q27A 5AA2D 2PT1A 3T9HB 1N7XA 3FZVA 3S4UA 2GRVA 3UA8A 1SD3A 3CG1A 2V84A 4C1TA 1N04A 1B1HA 2GFEA 4GFRA 1IXCA 3U1OA 1Y3PA 4OEUA 1OLAA 2F35A 1HSLA 2QPQA 4G4PA 2F7CA 1AOVA 1IQ7A 2HEUA 3D4GA 1MY3A 5ITPA 3E13X 4NF5B 3MZBA 4N6PA 4AB6A 3OO6A 4TOZA 2H99A 1ZJLA 3ZS6A 3PUZE 3FVGA 3VDFA 3M3LA 1PDAA 4JXIA 3PMVA 4ZZEA 3CR9A 2XXWA 2ZYKA 1URDA 2DWAA 1PBQA 4OESA 1Y3NA 3LSFB 2DVCA 5CBSA 5L9MA 1LCTA 1JEUA 1A8FA 3C34A 4HCYA 4LONB 3IB2A 2ANJA 2DWHA 1SI0A 4GVOA 4NF8B 1LBCA 3KGCA 3KOTA 4ESWA 5EHSA 3VLWA 1QUIA 5TP9B 1ZTYA 2XXTA 5M2VA 4OFOA 1P1NA 2F5XA 4YKJA 1POY1 1IIWA 4EQ9A 4PE5B 1Y1ZA 4XKNA 1FTMA 1NNKA 4RPNA 3IJXB 3LSLA 4I62A 1SQYA 2NUVA 2Q2CA 2ZNUA 3K00A 4H5FA 4KQPA 2REGA 2XX8A 4GRKA 1JW1A 4G68C 4JSOA 3GBAA 2XXYA 1YAEA 1DOTA 4YICA 2Q89A 5I59A 1S9TA 2OWTA 4KCCA 3T93B 3PPOA 5ITOA 1FTKA 5A5XB 4F18A 5I2NB 1IZ1A 3VLUA 1MPDA 1XC1A 1SYIA 2P1SA 3LBSA 4PETA 1SW1A 1POTA 2GHBA 4PFTA 4YKIA 1II5A 1B5JA 4P0GA 1B0LA 1B4ZA 3KN7A 2O68A 4UA8A 4Q30B 4O3AA 1USYH 5AA4B 5H8FA 3TTKA 3FVOA 4Q0CA 3V5AA 2UXAA 2I49A 1A8EA 3USDA 4GL8A 1H45A 2DE4A 3K6WA 4OQOA 3CFZA 1FTLA 2DWJA 3K1MA 3K2DA 2ABHA 2ESNA 3SESA 4HW8A 4JWYA 3TUSA 3QYTA 3VXCA 4GWOA 3PU5A 1SI1A 4Q5TA 4EQ7A 1O7TA 3JZJA 2HZLA 1ZKBA 4LP2B 2F7AA 2O1LA 2VD3A 1B1XA 2DE2A 4XXUA 2YPNA 2DWIA 2RF1A 4IY5A 4RA1A 3K1NA 3FUZA 4N07A 4POXA 1Y3QA 3CSGA 4E0WA 3UP9A 3SEYA 5H8NA 2I4CA 2I3VA 4YMBA 3O9PA 1P1QA 5H8QA 2XXHA 3V8XB 3IORA 1MQIA 4R9GA 4ND9A 5BWJA 3C33A 3C9HA 1VR5A 3C32A 4G8HA 2PYYA 4EDPA 1IXGA 2ZNTA 1RKMA 3N26A 2O69A 5L9OA 2V25A 4JWOA 3G3GA 1LAXA 5JK4A 4IO4A 5DEXA 4IY6A 1DTZA 3TYHA 1LAFE 1N76A 4BDOA 3ILTB 3TCGA 4R6YA 3DM0A 3MVWA 3EHTA 3K6XA 4NE4A 4JSDA 2I4BA 3O97A 3PV0E 4LQ2A 3MP1A 4EF2A 1J1NA 4RK9A 1MY2A 1QUKA 1B7UA 3H3GA 1F9BA 3H6UA 4F39A 3FXQA 1P1WA 3TAJA 4FATA 3P7IA 4HS7A 4LQ5A 1GGGA 3R26A 2HCAA 3E9XA 3PD9A 2ONRA 5FTIA 4JWXA 4OMBA 1HSJA 1UQWA 2R9JA 4KCDA 4DZ1A 3Q25A 4FIMA 4R2BA 1NKXA 1XT8A 4MFIA 3IJOB 4H8IA 3VVDA 1I6BA 1TWYA 2F6PA 2ZXTA 4JBZA 3DP4A 2OZZA 4MLQA 4ZEBA 2Z8FA 4IGRA 4ECFA 1JNFA 4BDMA 4KYSA 1N3WA 4X1DA 3PD8A 3OSQA 1NNPA 2QL3A 1UIUA 1WODA 5CMCA 2HAUA 4XKRA 4R9FA 3MAMA 5CI5A 4DCXA 1LAHE 3MJNA 4NMYA 2OJTA 3CFLA 3FVNA 3H7MA 4NF4A 4U22A 4OFJA 4H5GA 3MPKA 5CM6A 4QHQA 4U4SA 2XXUA 3TZAA 3FIRA 5AA2B 4FAJA 2AL5A 3H03A 1WDNA 3OO9A 2PVUA 3PMWA 3U93A 5CMBA 2FYIA 3HHGA 2GHAA 5HPQA 2HXWA 5I56A 4ZEDA 4F2OA 3HCQA 4KHZE 4H1XA 1IITA 2B3FA 2A5TA 4GD5A 1N0TA 3O6HA 1H76A 1QULA 4RYAA 3H06B 2D21A 5TPAB 3RTWB 4DDDA 3ZKKA 2HFBA 2ALUA 1MPBA 1MXVA 3O6GA 4QFNA 3HHFA 2YLNA 1QUJA 3PPRA 4NF6A 1LCFA 4AB5A 4G8NA 4F1UA 2Y7PA 3DELB 3R7XA 4LVQA 4P0IA 1UTHA 5ELVA 2RC8A 4OYVA 3RQTA 1QKAA 3TCFA 1XS5A 1HSEA 5H8SA 2LAOA 3Q29A 2DXYA 3N94A 2QSXA 3MWBA 2DSFA 4LZ7A 5FTHA 1Y4CA 4KYDA 4ONYA 1ZBMA 3Q28A 2FA7A 2W7YA 1URGA 1B0HA 1R1NA 1N84A 3U92A 3KG2A 4JDFA 5JTYB 1FCKA 1MH3A 4R2FA 4I1DA 3OELA 5I58A 5KZTA 1B3GA 2Y7KA 3TTMA 4U1ZA 1MQDA 1LGBC 3AXFA 4G77A 3I3VA 2H25A 3S2VA 2DYXA 3PPNA 1SW2A 2OCUA 4MH5A 1FQDA 4PQJA 2V93A 3PUVE 3PPPA 3FVKA 3RT6B 4F29A 1BLFA 4NTLA 3VV5A 3SEUA 3T66A 4RJZA 1B3EA 4F1VA 4U4XA 3E4RA 5FHOA 4ZS9A 3GXAA 1O63A 3PUXE 3ODBA 2O1MA 1AMFA 4YKPA 1YCJA 2R6GE 3QK6A 1XOCA 1MM6A 1YTVA 3C4MA 1I6QA 1ATGA 4FJPA 4BDLA 5FHNA 3MP6A 1M5FA 1SVXB 4NWDA 4OXVA 3IL1B 4F3SA 5B70A 4X9TA 3MVXA 3C35A 2KLFA 2OK2A 2ONSA 3UK4A 1LBBA 3MVZA 3RN8A 4ELPA 3OEKA 3CG3A 1B7ZA 3QSLA 2VHAA 3SERA 2ZMBA 4F3GA 3RPWA 3I5OA 4NF8A 4F3PA 5KCJA 2F6GA 3W9VA 1BKAA 1ZIUA 4IB2A 3IOWA 5TP9A 3TEPA 2D5WA 5CMMA 4U23A 3OOAA 2UVJA 1A7LA 1FTOA 1GR2A 4RNSA 5K2XA 1P1OA 1M5BA 3WAEA 4WEPA 2VP1A 3B6QA 3G3JA 5CBRA 3SEXA 3U8QA 2O51A 4H0WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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