1MY3A

Crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with bromo-willardiine in the zn crystal form
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A01
5HBCA 1LBCA 2Q2AA 3SEVA 3K6VA 1ZIUA 2H9BA 4YU0A 5ITOA 3TODA 2QMXA 2VOZA 3B6WA 3RN8A 1M5DA 2O7UA 1Y1ZA 3GXAA 5AA1A 3OO9A 3QAXA 4IO4A 1QUKA 4NF8B 1ZU0A 5I58A 3G3JA 1ZLQA 4AB6A 3IK6B 3PGFA 4OZ9A 3U93A 2IEEA 3CSBA 2I3WA 4KD5A 1XOCA 3G3KA 4JBZA 2O1MA 4XTCQ 3T9UA 2XXXA 3U94A 1IXGA 1FQCA 1MRPA 3IB0A 3E13X 3R26A 3UK4A 1P1NA 2REJA 2ANJA 1PB9A 2DE3A 1JW5A 3CFLA 2PYYA 3BKIB 1GV8A 5I58B 3C4MA 1FTOA 4FIMA 4LZ5A 4KR5A 3WAEA 2ZYMA 1IEJA 3MBPA 3M8UA 2X7QA 4HW8A 2RCAA 3QXMA 4IO6A 3DP8A 2HEUA 2HAUA 3MQ9A 1B40A 4U2RA 1NKXA 4YICA 1N3WA 1DPEA 4YKJA 4BDMA 1H76A 3EF7A 1QUIA 1SYIA 1JW1A 4JWYA 4XKPA 3FXRA 3K0VA 3TMGA 4H8JA 4OXVA 3FXQA 1A55A 3MZBA 2HQ0A 4R75A 3LSLA 3FD3A 4F31B 5ISUA 4GL8A 2ONRA 4WKMA 1ZBMA 3MWBA 4RY1A 3OENA 4JWXA 1FQDA 3T66A 4GF8A 4ZE9A 3OD7A 4UA8A 2OK2A 4QSDA 4BDQA 1LAGE 3W9WA 5ICQA 5CMCA 1PC3A 2Y7IA 3K00A 4PFUA 2QS1A 4AB5A 4NMYA 3R6UA 2NWJA 4MFIA 4YB6A 2DOJA 3TCHA 3K6XA 2YLNA 3KJ7A 3PPQA 1URGA 4EF1A 5A5XB 5ELVA 3KFMA 3CG3A 3OSQA 2F6GA 4R9GA 5L8DA 3MZ9A 4RK9A 1A8EA 3A09A 1J1NA 1M5BA 3S4UA 5I57A 3PUWE 2ZNUA 5FHMA 1R9QA 2RC7A 1EZOA 2Y7WA 4FJPA 1P1WA 3ZKKA 3TTNA 5H8HA 1QJMA 3T96B 4NF6A 1SDXA 3DELB 4F22A 3EQ1A 2UYFA 3VVFA 5K2YA 2X26A 1LAXA 2Z22A 3MC2A 5L9OA 2XX9A 3H06B 4LVQA 3M3LA 4DLDA 5BUUA 2VHAA 4NEDA 4TLLB 3L6GA 2P2AA 3OOAA 4M1VA 3OO7A 3SEYA 2OZZA 3IO4A 4TOZA 3IB2A 3C31A 3OEMA 2B3BA 5H8HB 4JXIA 1ZJLA 1AH5A 2NVUB 3VXBA 2IA4A 5KDTA 3MVZA 4ONYA 1H43A 2OWTA 2Y7RA 1LLSA 5CI5A 3KSXA 4F1VA 4MLVA 1S50A 3TYHA 2DXRA 3FIRA 3TELA 1AIVA 1HSEA 1UTBA 2DE4A 1B3GA 1SD3A 4RPOA 1FTJA 3CI8A 1UQWA 1D9YA 3FXUA 4G8HA 2Q2CA 4X1BA 4PETA 1JVYA 5DEXA 4IGTA 3KN7A 4OMBA 1B32A 4F29A 1QKAA 4JSOA 5EHMA 3C32A 5JK4A 2O68A 2Z8DA 1UTBB 1BP5A 4GQOA 1I6QA 1FQFA 1VSOA 3N26A 2D21A 4GIZA 3KOTA 4YB5A 1JETA 4QF9A 3QIMA 3O28A 3B7DA 4R2FA 1Z7NE 5B70A 2Q89A 3BFTA 3CFXA 2DYXA 5DVFA 4DDDA 2H98A 5DEXB 1OLCA 4H67A 1LSTA 4K3FA 1MDQA 2DVZA 2QL3A 4U4XA 3K01A 5ICTA 4X48A 3IOWA 1MM6A 4YMBA 2XXQA 1POTA 3K2DA 4YAHX 1B46A 5CMMA 4LP2B 5AA4B 4TQUQ 4LONB 1MY2A 3LSFB 3Q25A 4P0IA 1D9VA 1GR2A 3RLFE 4Z7EA 4U21A 4FATA 3TFLA 3GLBA 2F6PA 2PT2A 4ZEFA 4R9FA 4OVJA 3RNNA 1OMPA 5DTBA 2F97A 4LZ8A 3S9MC 3T9VA 3FVNA 3MW0A 2OCUA 1ATGA 1B7ZA 4YKPA 2H25A 4NWDA 5H8NA 4DCXA 3QUFA 1MY4A 2NXOA 1Y9UA 1B51A 3N6TA 1CE2A 1SW2A 1AMFA 1MXWA 4POXA 4ZS9A 1YPNA 1ZMGA 3C35A 3N6UA 1MXYA 1B3FA 4BDLA 3VDFA 5FHNA 4NF4B 1N76A 4WXJA 2HZLA 4THIA 1N7XA 2CMOA 3BFUA 3UIFA 3Q29A 4R72A 1B4HA 3CR9A 1N0TA 1DTZA 3RQTA 1Q35A 1BKAA 4G8MA 5H8NB 1MM7A 1WODA 2PMSA 1DMBA 5FTHA 4U1OA 4Q5TA 4MLQA 2B3FA 3HO7A 5I56A 5I59A 3RTFB 2O69A 4O3BA 2XHDA 1N7WA 1USYH 4YZZA 2XXIA 4U23A 3C33A 5CBRA 2NUVA 3VXCA 3T93B 3TAJA 2AYSA 2B65A 3TTKA 3IR1A 4YKIA 4JDFA 1MG1A 4G68C 1B1HA 4IY5A 3AXFA 3FVKA 2F78A 1LAFE 4F19A 1B6HA 3LC8A 4X1DA 3PUVE 4IB2A 1UIUA 3N5LA 2XXPA 1A40A 1OVBA 2F5XA 3D4GA 4G8NA 1LGBC 5I59B 3OEKA 5I2NA 1IZ1A 3V5AA 5EYFA 1TT1A 4DXUA 1YCJA 1SQYA 4H0WA 4IO2A 5I84A 4OERA 3OMBA 1SVXB 5DT6A 1VFDA 2ESNA 2ZYKA 2DVCA 1LB9A 2X7PA 4OHNA 3VLWA 3CRBA 3HHFA 5I2KA 4Q0CA 1A8FA 1QVSA 4DCYA 2PBWA 1IXHA 3G3GA 5I2NB 2BJJX 3B6QA 4F3BA 3CIJA 2OWSA 1NNTA 4F1UA 1B5IA 2R9JA 1MQGA 3IJOB 4L17A 4QRZA 3ECRA 4OTEA 1RKMA 1SBPA 3FJ7A 4R6HA 3PV0E 3I6VA 1FQEA 3MAMA 4Q30B 2RF1A 3SEWA 2R71A 1DPPA 3K6WA 1T0KA 5J1DA 3V83A 1RYOA 1NNPA 3G3IA 1II5A 3G7WA 3T9XB 4R2BA 5CRYA 5CM6A 3V8XB 4OFOA 4E0WA 1XHYA 2DE2A 1JNFA 1B0HA 2PVUA 3LR1A 3ZSFA 1B1XA 5M2VA 2QSXA 1LCTA 2Q9TA 3VE1B 2M8CA 3Q26A 3FGSA 4QHQA 4MF3A 4G68A 3VVDA 4GRKA 4IY6A 3USDA 4DXBA 1LFGA 3QSLA 2DSFA 4HS7A 1XVYA 1B3HA 3GBAA 4JB7A 3TQLA 3H4ZA 5TU0A 5DYHA 5CMKA 3ILUB 2PX1A 3D4CA 4PP0A 4H1XA 1M5CA 1R6ZA 4U22A 1FTKA 4XKRA 1I69A 3E4RA 4O3CA 4FE8A 2YPNA 3EN3A 3B6TA 3A3CA 1PB8A 4G68B 1B4ZA 3P7IA 3PPPA 1MQJA 2V3UA 1UTHA 3A3UA 3Q27A 1B52A 4R6YA 2DP8A 2I49A 3FJMA 3SDFA 2UVIA 4OFJA 1A99A 1EU8A 3U72A 1P1QA 3VLVA 3SEUA 3VV5A 3ONMA 4ZEBA 5I57B 2D5WA 2RCBA 3MVXA 4UACA 2I0BA 3TZAA 4OFLA 3KZGA 1MH3A 3RT8A 3S9NC 3UORA 4I62A 1UTHB 2F8DA 3UN6A 5JEIA 2I6EA 2ZMBA 3PU5A 4F18A 1JW4A 4NF6B 3DM0A 3W9VA 2V84A 3SKPA 4ZE8A 2H4IA 3KBRA 2QS2A 2F7CA 2OJTA 1HSJA 1US4A 2P1SA 2R6GE 5DVIA 1ANFA 1MPCA 5ITPA 4JWOA 1EZ9A 4F39A 2UXAA 4BLAA 5H8QA 4FORA 2DXYA 4ZZAA 3UA8A 4ELOA 4GD5A 2HXWA 1MQHA 4OEVA 3TEPA 1NH7A 5KDTB 4LZ7A 4N13A 2AL4A 1BIYA 1AOVA 1MQDA 1P1UA 4RXLA 4QFPA 3FV1A 5LOMA 4ISUA 2H5YA 2UVGA 3HHGA 2FNCA 5CMBA 2XX7A 3PPRA 2F34A 1ZKBA 4ESWA 5TP9A 1B7HA 1LB8A 5B7DA 2WKYA 3MVYA 2DWAA 5K2XA 1MXUA 5H8QB 2Y84A 1URSA 4PQJA 4N07A 3FUZA 1NNKA 3UP9A 2QPQA 1B7UA 1N3XA 2UVHA 3EHUA 2A5TA 2O84X 4FAJA 2F36A 3H6VA 3JZJA 2HZKA 3OXNA 4RA1A 1S9TA 2VD3A 3MZ1A 3VFJA 3PUYE 4JSDA 3BBRA 3M3KA 2I48A 1R9LA 1B05A 2Y7KA 2UYEA 4OQOA 4OENA 5H8SA 4P11A 3IOUA 3QK6A 4RK2A 4U1ZA 4GLIA 2ONKE 3RPWA 2ONSA 2AL5A 4R73A 4BDNA 2QJEA 4GXSB 1MY3A 4QFKA 4U4SA 5TPAA 4R6KA 4EQ9A 3S9LC 5JTYA 5F7VA 4N6PA 3H03A 4PFYA 3MPKA 4OEUA 2HAVA 4FEDA 3KN3A 2O6AA 1H44A 1MY1A 4QSEA 3LSXA 1IQ7A 5BWJA 3FVOA 2NOOA 4PE5B 3O6HA 1OVTA 2Z8EA 1B9JA 2GHBA 4LQ5A 2XXWA 1UIVA 1B3LA 1N04A 4OETA 3FVGA 3PPOA 4YB7A 4GOTA 4FEBA 4KQPA 1QUJA 3TTMA 1H45A 2O7IA 4ELPA 1FW0A 3WAFA 1YTVA 4MH5A 4WEPA 1OQHA 5JTYB 3MP8A 2GHAA 5L9SA 2REGA 2AIXA 4H65A 4HCYA 1LBBA 4PFWA 5FHOA 3L6HA 1Y1MA 1WVJA 5AA3A 1NMUA 2O51A 1JVXA 1JEVA 2QS3A 4F3GA 1Q1KA 3LUYA 3PUZE 4EQBA 4G77A 1US5A 3DLNA 5CBSA 1SI1A 3KEIA 3K1NA 2LAOA 2GFEA 4I9DA 4IO7A 2XD2A 3RGYA 3K6UA 4ECFA 3IJXB 3O97A 2OBGA 4LUBA 2ALUA 3IO6A 4LATA 4KCDA 3HSTA 1RYXA 3OSRA 4YMAA 2QMWA 3T9HB 2V25A 2I3VA 3RUMA 2F7BA 5IKBA 3DP4A 1Y3NA 4QFNA 5I56B 4OESA 5IAIA 3IOTA 1PEBA 3F11A 3I3VA 1POY1 1SW4A 4IO5A 5DVJA 1QW0A 4HTGA 3UGWA 3E9XA 1SW1A 2OLBA 1NH8A 1NL5A 3K4UA 1SYHA 4GWOA 1MPBA 1A54A 1B5JA 5H8FA 2XX8A 2E0SA 4RYAA 3LBSA 2VGQA 2DWJA 3N94A 1F9BA 3MVWA 1O64A 3EHTA 4ZEKA 3O6GA 3U1OA 3V89B 1PDAA 1Y3PA 4EQ7A 3JV9A 4ELQA 2RC9A 2VD2A 3PMXA 5FTIA 1O7TA 3G3HA 2DS9A 3EHSA 4ELRA 1MY0A 3H6UA 4DE8A 4DZ1A 3TCFA 3OELA 5CC2A 4KYDA 3E3KA 4EF2A 5H8FB 1XC1A 4ZEDA 4IGRA 1XVXA 3ZKLA 5HM4B 1PBQA 4WEDA 1PBPA 1DSNA 4TLMB 1EH3A 5AA2A 5I2KB 3W15C 4YKKA 4ESXA 1S7YA 2HCAA 3TUSA 3GZGA 3FZVA 2DWHA 4BDOA 1TFDA 4NE4A 1DTGA 1OQGA 1MQIA 3Q28A 4NF5A 5A5XA 4Q8RA 4X9TA 1IXIA 4QFOA 2V3QA 4BDRA 2V93A 1M5EA 3OO6A 1MS7A 4FECA 3RTWB 3DP6A 1O63A 2PT1A 3CG1A 5KCJA 3PUXE 4H5GA 1GTKA 4NTLA 1FQBA 3PPNA 5AA2B 1HSLA 1USYE 2G29A 4EDPA 3QUJA 3R7XA 3C34A 3FV2A 3JYRA 1B0LA 2XXVA 1B2HA 4NF5B 3KGCA 4C0RA 2I4BA 2Z23A 1BLFA 3MP1A 5EHSA 2XXHA 3MPLA 2Q88A 4I8CA 4GL0A 2F7AA 4EUOA 4F2OA 1IUDA 2ZYOA 3U92A 1Y20A 5KCJB 1I6AA 4LA9A 3S2VA 2Y7PA 3PD8A 3H3GA 3QYTA 4E0XA 3IB1A 3THIA 2QS4A 4NWCA 4RPNA 2VP1A 1LAHE 3H6WA 1VR5A 2Z8FA 1MXZA 3TDJA 1P1OA 4XKNA 2F35A 4KHZE 5KZTA 2QRYA 3FASA 1AL3A 3VLUA 2FYIA 1XT8A 3PD9A 1URDA 1FQAA 4KPTA 2DWIA 4XXUA 1VE4A 3O9PA 4XKQA 4HCWA 3K1PA 1Y4CA 1Y3QA 3TTRA 3TPAA 3CFZA 2D3IA 1BTJA 1IXCA 3M3FA 3HN0A 2ABHA 1LFIA 3HCQA 3KG2A 2H99A 3MUQA 1MXVA 4DIGA 2ZNTA 4EXKA 3SESA 4C1TA 4GVOA 1EZPA 1IITA 1YAEA 1MXXA 2THIA 2RC8A 1PB7A 4XIGQ 4QSCA 3C36A 3TKDA 2W7YA 3O29A 1MDP1 3SERA 1H3DA 4RJZA 2O1LA 2V3TA 2FA7A 1FTMA 3C9HA 4H6DA 2XD3A 1NFTA 4GFRA 1JEUA 3KJTA 1Y4TA 3EPEA 4POWA 1MH4A 4R74A 3IORA 3O6IA 1FTLA 1XS5A 4KCCA 3TQWA 3G3FA 3TCGA 1TXFA 3MP6A 4H5FA 3RY3A 2P0SA 1JQFA 2CZLA 2ZYNA 4F2QA 3KN8A 3S9EA 1GVCA 1WDNA 3K02A 5AA2D 4I1DA 4O3AA 2XXRA 3SEXA 1OLAA 2I0CA 3O2AA 4F3SA 3GBBA 2GRVA 4EXLA 3CVGA 4AQ4A 4ZDMA 1TFAA 4Z0IA 3PMVA 1L5TA 5AA4A 3PMWA 3FJGA 2RINA 3TTLA 1SW5A 4IO3A 1VFEA 3IL1B 1ELJA 1D4NA 1N84A 3KOSA 3ODBA 3OO8A 5TP9B 2UVJA 2XXTA 1P99A 2I58A 1ZTYA 4OYVA 5AE4A 3IOVA 4QFLA 4ZECA 3I5OA 2XXYA 4G2ZA 4RNSA 3LSWA 1SI0A 4KYSA 2A5TB 3O66A 4DXCA 4G4PA 4ND9A 1GGGA 1FCKA 1I6BA 3HV1A 1Z7ME 3HPIA 2A5SA 4H8IA 4GXAA 2KLFA 3VVEA 1KWHA 2HFBA 2XXUA 4NF4A 2DQVA 1A7LA 1OIBA 3ZS6A 4KI0E 1QULA 1TWYA 1NNFA 1LFHA 4PFTA 4F3PA 1R1NA 4F1YA 3FATA 3H7MA 1B3EA 2GH9A 3H6TA 3KSJA 5TPAB 4KFQA 1CB6A 3MJNA 1DOTA 3SETA 2RKMA 1MPDA 4P0GA 3RT6B 1B5HA 1QKBA 2ZNSA 2Q8JA 1M5FA 5HPQA 3CSGA 5F1QA 5L9MA 4M4GA 4C1UA 4MBPA 3IX1A 2E1SA 2YJPA 1B58A 3IAZA 1IIWA 4NF8A 4LQ2A 4OWDA 4KYEA 2I4CA 1D3KA 3U8QA 3K1MA 4ZEIA 2G93A 1LCFA 3ILTB 2ZXTA 4ZZEA 3T22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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