1MY3A

Crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with bromo-willardiine in the zn crystal form
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A01
3S9EA 5DEXA 5AA3A 3U92A 4NF8A 1H76A 1B46A 4I8CA 1B1HA 4ISUA 2HCAA 1HSLA 3I5OA 5A5XB 2O84X 1WVJA 3ODBA 4DXCA 1ZIUA 1XHYA 3IAZA 3SESA 3TZAA 1SW5A 3K0VA 3S9NC 1QUKA 2FA7A 3KFMA 4NF4A 2QMXA 5CMBA 5AA4A 3OEKA 4THIA 3CSBA 3K1NA 1B4ZA 3N5LA 4DZ1A 3TKDA 4H0WA 4LQ2A 3LSLA 1QW0A 2Q88A 5CMKA 5I56B 2PT1A 1HSJA 4XKRA 4G8MA 5F7VA 3LSFB 4LZ8A 2Y7IA 3TDJA 2DE3A 2XX7A 4RK9A 2XXPA 3E9XA 1Z7ME 4DXUA 1B3GA 3U72A 4WKMA 4H5GA 1SBPA 2OBGA 5EYFA 4H8IA 4N6PA 4PFUA 3CIJA 2BJJX 1ZJLA 3K00A 3FVOA 4O3BA 4KYDA 4RNSA 3S4UA 5ICQA 5ELVA 1FTJA 3IJXB 4I9DA 3PUZE 1FTOA 1N76A 3PPRA 1PB7A 4BDRA 5CMCA 3ZSFA 4KI0E 1QKAA 3FXQA 5CRYA 4F3PA 4OFOA 2PVUA 4FORA 1VFDA 5HM4B 4RK2A 4IO4A 4ESWA 1IUDA 5H8HA 1S9TA 2REGA 2XD2A 1HSEA 3RT6B 4ZEIA 3WAEA 4KD5A 1A8EA 3FXRA 3IO6A 1QULA 3MVWA 2DWJA 2ZNUA 4XXUA 4LA9A 4JBZA 3H7MA 3TQLA 3OMBA 1FQDA 1XC1A 3FATA 3JV9A 4GD5A 3DELB 1Q1KA 2THIA 4YB5A 1B51A 3N6TA 1OMPA 1Y4CA 4QSDA 4OETA 4ZE8A 1WDNA 5H8QB 3TFLA 5TP9B 1BTJA 1NH8A 1MPDA 2GRVA 3R7XA 5ITOA 1ZTYA 5B70A 3FUZA 5F1QA 3OO9A 4OERA 5IAIA 2DWHA 3T9UA 1P1NA 2Q89A 3C34A 3LSWA 1OQHA 5BUUA 4DXBA 1RYOA 2DOJA 5K2YA 4YB7A 4OYVA 5EHMA 2ZNTA 3QSLA 1SYHA 4R2BA 4M1VA 4FATA 2I4CA 1SI0A 3CG3A 4HS7A 2G93A 3N94A 2VD2A 3T93B 4QFPA 4FECA 2QRYA 1MXUA 3T96B 4R9GA 4QRZA 2UVJA 4P11A 1N84A 2DXRA 3CI8A 1XT8A 1USYH 4JXIA 1JEVA 1JEUA 4YZZA 3VVEA 2DS9A 4ELQA 2YPNA 2HQ0A 4BDOA 2W7YA 4H65A 3MZ9A 1DTGA 2R6GE 3EHTA 5I59B 1B0LA 3W9WA 2ALUA 5H8NB 4MFIA 2A5TA 4KYSA 1P99A 5ITPA 3DP6A 5DT6A 4QFOA 3TUSA 1QUJA 1T0KA 2HFBA 4C1TA 2DWAA 1MY1A 3IOVA 1CB6A 4L17A 4GIZA 4ONYA 1FQAA 5I2NA 3T9XB 1B7UA 1JVXA 2XXYA 1B9JA 4F22A 3K6XA 2G29A 3PUXE 1N3WA 3VVFA 4F18A 3W15C 2KLFA 1DTZA 1RYXA 3PUYE 4G2ZA 3H06B 2HAVA 1IQ7A 5ISUA 2O1MA 3THIA 3TTKA 3WAFA 4F3GA 5I58B 1Y1MA 2ZXTA 3MP6A 4PQJA 3CFXA 3IO4A 2R71A 3CFLA 4N07A 3UORA 1LFIA 4I62A 3MBPA 1IZ1A 1B5IA 1US5A 1UIVA 4BDQA 3RPWA 1MPCA 4EUOA 1A8FA 2H25A 1NNKA 2PMSA 3BFUA 1O7TA 2ANJA 2WKYA 2RKMA 3UN6A 1DOTA 1MXWA 3KN8A 4DLDA 2IA4A 3TCFA 3H6WA 4FEBA 2XXQA 4OQOA 4C0RA 2I49A 1M5CA 3F11A 4KYEA 2DE2A 3SEYA 1LBCA 1WODA 4ESXA 3VLVA 2GH9A 4NWCA 1MY3A 3MPLA 3VDFA 4IO6A 2D3IA 4AB6A 3N26A 4M4GA 1M5DA 2HEUA 3O2AA 1FQCA 2RCBA 1OQGA 3I6VA 4ELPA 5DVJA 4OMBA 3V5AA 3W9VA 1Y3PA 2YLNA 4R73A 2QSXA 2OJTA 1N3XA 2LAOA 4MF3A 3DP8A 3KSJA 5DVFA 1UTBB 3OELA 5KCJA 4ZZEA 1P1OA 2PBWA 4POWA 1FTMA 3GBAA 1UIUA 3R26A 1BKAA 3IB0A 3PPOA 3K1PA 3FVKA 1ZMGA 1I6AA 1LGBC 3OD7A 5H8SA 2RC7A 4OZ9A 1N04A 4U22A 2I0BA 3O6IA 5FTIA 3CFZA 3CVGA 4HCWA 1Y1ZA 4ZECA 4U1OA 3JYRA 2Y7RA 5JTYA 4OEUA 4Q5TA 4RA1A 1TWYA 2Y7WA 3EHSA 5AA2B 4XKPA 2O6AA 4QHQA 3SKPA 1B4HA 2NOOA 5DEXB 4EF2A 4NF8B 4IO5A 1LAXA 5FTHA 5FHMA 1B40A 3CSGA 3CG1A 4FE8A 4OVJA 1LFGA 4LP2B 4F31B 1N7WA 1Y3NA 3TEPA 2A5SA 2I3VA 3FJMA 4NMYA 2D21A 1LSTA 1TFAA 2QS4A 4NF4B 4JWOA 1OLCA 2Q2AA 5AA4B 1DMBA 1L5TA 4R2FA 4HTGA 3MQ9A 1FW0A 1D9YA 3FIRA 4KR5A 3O9PA 4IGTA 3FZVA 3MJNA 1B52A 1FTLA 1EZPA 2Z23A 3TYHA 3S9LC 3VFJA 1ZU0A 3MP1A 1AH5A 1LCTA 4G4PA 5DVIA 3O6GA 4ZEFA 1B32A 1H45A 2REJA 3H3GA 1YTVA 4ELRA 4F1YA 4OESA 2QS3A 1ELJA 1J1NA 2O7IA 3K2DA 1SW2A 3L6HA 4ZEDA 2H5YA 1SYIA 5LOMA 2O51A 2R9JA 3LSXA 4X1BA 3C9HA 4F1VA 3RUMA 5H8FA 2NVUB 1GVCA 1URGA 1MXZA 4FEDA 2V25A 2Y84A 1LCFA 3CR9A 1TT1A 4TOZA 3PU5A 2ZYNA 3IK6B 4IY5A 4O3AA 2AL4A 2HZKA 2DP8A 4YMBA 1LFHA 3H6UA 2NXOA 3G3KA 2UYEA 4AB5A 1DPPA 3M3FA 2D5WA 2B3FA 4I1DA 1Y9UA 2Z8EA 2H98A 3QAXA 5H8HB 1S7YA 2F6PA 5TPAA 4E0XA 2VOZA 4Q8RA 4NTLA 2FNCA 3U94A 2OZZA 1B2HA 3A09A 1NFTA 3A3UA 1LB8A 1IXGA 2I58A 2OLBA 4LZ7A 3SDFA 4EQ9A 3ILUB 3VXBA 4RJZA 4TQUQ 3KG2A 1USYE 5HBCA 2NWJA 4MLVA 3K02A 3MVYA 3ECRA 1MQJA 3TCGA 4ECFA 1ZKBA 1PB9A 1B7HA 1FQBA 1MRPA 5AA2D 1QVSA 3PV0E 3T66A 3Q26A 1FCKA 1SQYA 4R75A 4EQBA 2GFEA 2XHDA 4R6KA 5JK4A 3G7WA 3B6WA 4UA8A 3VXCA 3SERA 3TTLA 3MZ1A 4Q0CA 1NNFA 4LATA 3OSQA 2DVZA 2F97A 5L9OA 1MM6A 3O29A 1JNFA 1SDXA 5JEIA 3OO6A 1MQIA 3QXMA 4U23A 2X7QA 1B5JA 3PMVA 4ZE9A 2RINA 4JDFA 3SEVA 3MW0A 1XS5A 3VV5A 2X26A 4RYAA 4UACA 4OTEA 3FJGA 4E0WA 3PPQA 4JWYA 4DCYA 3USDA 2Q2CA 4H5FA 4X9TA 4Q30B 3K01A 3GZGA 3OXNA 2ZYOA 4NE4A 1POTA 2XXWA 3U1OA 1UTHA 4GXSB 5I2KA 3G3IA 2XXVA 2CMOA 2P0SA 4ZS9A 2PX1A 4R6YA 4H6DA 1Y4TA 1MDP1 1M5FA 1NL5A 2A5TB 3VVDA 3T9HB 2OK2A 3OENA 3RLFE 4U21A 1MXYA 3A3CA 1R9LA 4OWDA 2QJEA 4OENA 3RQTA 4JWXA 2UYFA 4BLAA 4YU0A 3GLBA 1IITA 3RT8A 2AYSA 4ZEKA 3IOWA 3KN7A 5I2NB 4U2RA 3DP4A 4G8NA 3MVZA 3ONMA 4EQ7A 5I59A 4H8JA 3V89B 3RTFB 3EQ1A 1TXFA 1IIWA 2I48A 5H8NA 3HPIA 3U8QA 3O97A 1XVYA 3VLUA 3PMWA 4GFRA 2I0CA 3O6HA 3TTNA 2DSFA 3TCHA 3BFTA 2UXAA 3P7IA 1OLAA 5TU0A 2Y7KA 3D4CA 4O3CA 4FAJA 3DLNA 1FQFA 3KEIA 3FD3A 1SI1A 3ZS6A 3MWBA 4F3BA 4JB7A 2Z8DA 2XX8A 1MM7A 2FYIA 5L9MA 4POXA 4G77A 1MQGA 4DIGA 2O7UA 4NF5B 1B3LA 5IKBA 2DXYA 2Q9TA 4R72A 4X48A 2O69A 3EPEA 1AIVA 1JETA 1OVTA 1JVYA 3S9MC 2GHBA 3QUFA 4NF6A 1R9QA 3TTRA 1SW1A 2X7PA 3C35A 1POY1 1I69A 4R9FA 3MAMA 2UVHA 3K6VA 1PC3A 2YJPA 3UK4A 2F5XA 3HHFA 3OEMA 2Q8JA 1DSNA 1LAFE 5J1DA 3PD8A 2F7AA 2XXTA 2I6EA 3FGSA 3KBRA 5CBSA 5CM6A 2ZYMA 1O63A 1MPBA 4YKJA 4Z0IA 3I3VA 3SETA 3UA8A 1KWHA 1MXVA 4AQ4A 3KOSA 3OO7A 1N7XA 1LAGE 4YB6A 5KCJB 3QIMA 4G68A 1GGGA 2VHAA 4P0IA 5K2XA 3T22A 4EDPA 3MZBA 4FJPA 1LB9A 3HN0A 4EXLA 3BKIB 3MUQA 2Y7PA 1ANFA 3ZKKA 2HZLA 1CE2A 5FHOA 1QJMA 4KFQA 3M3KA 3M3LA 1B0HA 5L9SA 4QFKA 3TQWA 3UP9A 5JTYB 4U1ZA 3G3JA 4GL0A 4OHNA 5CI5A 4TLLB 1F9BA 3O66A 1PEBA 1D4NA 3TTMA 4F39A 4TLMB 1YCJA 2B3BA 1YPNA 2DE4A 4EF1A 1Y3QA 2AL5A 2NUVA 5DTBA 1B3FA 1LAHE 3H6VA 1A54A 1P1QA 1OVBA 2F7CA 5I57A 5I84A 3GBBA 1BP5A 1AMFA 3IB1A 5KDTA 4F1UA 3C33A 1NKXA 3GXAA 4XKNA 2XXRA 4YICA 3HV1A 3O28A 4WEPA 4GF8A 2F7BA 4LVQA 3IORA 4ND9A 3OOAA 1YAEA 1IXIA 1RKMA 1UQWA 3SEWA 4QF9A 3Q27A 3RNNA 2I3WA 3E3KA 3HO7A 4YKKA 3IOTA 1H3DA 1PDAA 3TODA 5A5XA 1GR2A 4QSEA 1MY0A 4WXJA 3LBSA 2RCAA 3HHGA 3DM0A 3IR1A 4IO3A 2GHAA 3Q25A 4IO7A 4P0GA 2IEEA 2O68A 2VGQA 4NEDA 4F2OA 4BDLA 2HXWA 4OFJA 4PETA 4GRKA 2F36A 5H8FB 1VE4A 1PBPA 4PFYA 1JQFA 3FASA 3IB2A 2V93A 1B3HA 3EHUA 4X1DA 5I56A 4MLQA 2PYYA 3MVXA 2V3TA 3PPNA 1BIYA 1XOCA 4XTCQ 2ABHA 1JW4A 1A40A 4FIMA 1SVXB 5HPQA 1O64A 5L8DA 4NWDA 2ZMBA 4KCDA 1BLFA 3TAJA 4IO2A 4U4XA 5TPAB 2H99A 4ZZAA 3K4UA 1URSA 4RXLA 2M8CA 3HCQA 2OCUA 2XXIA 3HSTA 2DYXA 3VE1B 3L6GA 1B05A 4U4SA 2VD3A 4GQOA 4DCXA 2ESNA 4KHZE 2ONKE 1D3KA 3N6UA 2DQVA 3UIFA 3E4RA 4DDDA 4PFWA 4JSOA 2DWIA 3IOUA 1SW4A 2P2AA 2E0SA 3G3HA 1IEJA 3IL1B 3IJOB 1VFEA 4HCYA 4YKIA 3Q29A 3KSXA 2RC8A 1VSOA 2H9BA 4F19A 1A7LA 1B1XA 3PPPA 3TELA 3LUYA 1I6BA 4H67A 5EHSA 1A99A 3H4ZA 4GVOA 1IXCA 5H8QA 4XIGQ 1H44A 1B6HA 2V84A 5TP9A 4LONB 4PE5B 5M2VA 2UVIA 3C31A 3H6TA 4PP0A 3ZKLA 4RY1A 1UTHB 4EXKA 4K3FA 5I2KB 4GL8A 4IB2A 3KN3A 1AOVA 5ICTA 2ONSA 1N0TA 1GV8A 3FVGA 3ILTB 4RPOA 4GXAA 1M5BA 2B65A 3C4MA 4LUBA 1QUIA 1US4A 3MPKA 4ZEBA 4R74A 1MH4A 2I4BA 1NMUA 2PT2A 3MC2A 4JSDA 4YKPA 3VLWA 3K6UA 1Y20A 4KCCA 2XX9A 1AL3A 3K1MA 1II5A 1EH3A 4IY6A 2OWTA 1R6ZA 4ZDMA 4G8HA 4N13A 1EU8A 3FXUA 3EF7A 5DYHA 1VR5A 2XXUA 1B58A 2H4IA 4F29A 3EN3A 2CZLA 1Q35A 3SEXA 2O1LA 3OSRA 4GOTA 1NH7A 4OXVA 2QL3A 4Z7EA 1MG1A 1XVXA 4BDMA 3KJTA 3H03A 2OWSA 1B7ZA 1I6QA 1JW5A 3Q28A 4QFLA 3S2VA 3C36A 2F6GA 3RN8A 2P1SA 4OFLA 3R6UA 1MH3A 3K6WA 4F3SA 1JW1A 3FV1A 1PBQA 3UGWA 3B6TA 1D9VA 2V3UA 3QYTA 2RC9A 1TFDA 3BBRA 1ZBMA 4F2QA 1P1UA 1ZLQA 4OEVA 2Z22A 3FVNA 1URDA 2XXHA 2DVCA 4GLIA 4QSCA 4NF6B 2XD3A 3M8UA 3RY3A 2F78A 3C32A 3PD9A 1MS7A 1OIBA 1DPEA 1MY2A 3LC8A 3KJ7A 5I58A 5KZTA 4DE8A 1H43A 3QUJA 3MP8A 3KOTA 1ATGA 2VP1A 4NF5A 3T9VA 3PUWE 1S50A 3E13X 4GWOA 4LQ5A 2V3QA 2ZNSA 3SEUA 4LZ5A 2QS2A 3TMGA 1LLSA 3QK6A 3LR1A 2Z8FA 5FHNA 2RF1A 3PMXA 1EZOA 2QMWA 2XXXA 4G68B 3PGFA 3V83A 3FJ7A 2QPQA 3TPAA 4PFTA 3U93A 4YMAA 3CRBA 1A55A 4HW8A 5CBRA 2F34A 1B5HA 3FV2A 1B3EA 3RTWB 4H1XA 1LBBA 1P1WA 5CC2A 4IGRA 5B7DA 3D4GA 5AE4A 2UVGA 2ZYKA 2AIXA 1IXHA 5AA1A 4KQPA 1MQDA 1MXXA 3B6QA 3JZJA 1NNTA 1EZ9A 4C1UA 1FTKA 2E1SA 2ONRA 4MH5A 1MY4A 1PB8A 1M5EA 3KGCA 3AXFA 2F8DA 2HAUA 4KPTA 1UTBA 1QKBA 4YAHX 2QS1A 3B7DA 4BDNA 3G3GA 1MDQA 4G68C 5CMMA 4ELOA 1GTKA 4R6HA 3G3FA 5I57B 3KZGA 1NNPA 4MBPA 5KDTB 4RPNA 1SD3A 3RGYA 5BWJA 1R1NA 4WEDA 3OO8A 4XKQA 2F35A 3PUVE 1FQEA 1MQHA 1Z7NE 4QFNA 3V8XB 3IX1A 5AA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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