1MY3A

Crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with bromo-willardiine in the zn crystal form
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my3A01
1SQYA 3RTFB 2FYIA 3MZ1A 1AIVA 1MG1A 3HO7A 3MP6A 4JWXA 1O7TA 3FVGA 1NH8A 3HSTA 4BDQA 2BJJX 2QS1A 4HTGA 5I84A 3S2VA 1SW1A 3M8UA 3CI8A 2VHAA 4YB5A 2QS3A 1MY1A 3CR9A 1M5CA 5H8QA 1ZBMA 2XX8A 3H6TA 1JEVA 3CFZA 2XD3A 4Z0IA 3G7WA 3VVFA 1URGA 3MZBA 3SDFA 4L17A 2M8CA 4NF4B 5DT6A 1PB9A 4RYAA 3H7MA 3THIA 2OWSA 4ZEIA 3IL1B 3GBBA 1B3LA 3PMWA 1B6HA 2V3UA 4N6PA 4R73A 3TMGA 1B05A 2E1SA 1IXGA 4MF3A 4AQ4A 4X48A 1SYHA 1EZPA 4F3BA 3ONMA 1NNPA 4GF8A 2I6EA 1P1QA 3FXUA 5JTYA 4ELQA 2DOJA 4F19A 4MLVA 2PT2A 1PBPA 3PPQA 1EH3A 2UVHA 4KFQA 2HFBA 3MVYA 4O3AA 4PQJA 2O7UA 2DE3A 1Q35A 3M3LA 4DZ1A 4ESXA 1D4NA 3C34A 2XXYA 2Z23A 3FASA 3K1PA 4YKJA 1B7ZA 3EPEA 5I56B 4LZ5A 1MRPA 4AB6A 1MXXA 1N76A 2ZXTA 3HN0A 3KSXA 4RA1A 1VR5A 4JWOA 1FTKA 3D4GA 3K00A 1H43A 1Q1KA 2XXWA 1OLAA 1MDQA 1B0LA 3K02A 3OEKA 4WEDA 4F3GA 3K6WA 1A99A 3FV1A 4Q0CA 4R72A 4FEBA 4F1YA 3SEWA 5AA3A 3HCQA 1OLCA 2O1MA 3H4ZA 2O69A 3OOAA 5LOMA 2Z8FA 1B52A 4H67A 5H8HB 3S9NC 3L6GA 3HHFA 1L5TA 1BIYA 4OYVA 4GQOA 3V5AA 5AA2D 3VXCA 3LR1A 1MXZA 4OENA 4OFLA 2Y7IA 3IOVA 4YAHX 1B4ZA 1EZOA 3ECRA 5CC2A 3SETA 2YPNA 4DLDA 1R6ZA 2R6GE 4KR5A 3MQ9A 4R74A 1S7YA 3ZSFA 4R75A 3OO9A 3PD9A 1ATGA 3SEVA 3TTMA 4KD5A 1SW2A 1IXIA 1O63A 4RNSA 2ZYNA 3O6GA 4PFYA 1B3GA 3VV5A 1GTKA 3PD8A 2XD2A 4F2OA 1S50A 4QFLA 5FTHA 3QYTA 1IIWA 3CG1A 4OETA 1B58A 4KYDA 1NL5A 2F7BA 1POTA 5I58A 5HM4B 2ONRA 5EHSA 1KWHA 3IOWA 3QUJA 4BDNA 1ZJLA 1PEBA 4XKNA 2XXIA 1NNKA 1JQFA 3DLNA 1LLSA 2LAOA 4YKPA 2GRVA 3IX1A 2Q8JA 1Y4TA 2Z8DA 4ESWA 2A5TA 3LSXA 4NF5B 1SD3A 2RF1A 3K4UA 1LFIA 3Q29A 2YJPA 4I62A 1JW4A 3T9UA 4DXBA 3RPWA 4FE8A 4YU0A 3IOTA 3HPIA 3JYRA 4PETA 3H03A 3UORA 2F97A 2I3VA 2F6GA 1UTHA 1H3DA 2PYYA 4GWOA 3H6VA 4U23A 5HBCA 3ZKLA 3MW0A 4LVQA 4GL0A 1WDNA 2F34A 2D21A 3FATA 3VLVA 1NFTA 1MQHA 4YZZA 3PUXE 1SDXA 3RGYA 5I58B 2O1LA 4K3FA 1SYIA 3PUYE 2ONSA 4F22A 2ZYOA 2OZZA 3CRBA 2B65A 4GXAA 2V93A 4G68B 2GH9A 2DXYA 3LC8A 3PUVE 1P1UA 3G3GA 1B9JA 3QIMA 4GD5A 1GR2A 1XS5A 3FV2A 4YICA 1M5FA 1GV8A 4TOZA 3IK6B 3V8XB 4BDMA 5ICTA 3MWBA 1LFHA 3TAJA 1MS7A 1N04A 1D9YA 1YCJA 4EQBA 4GIZA 3E3KA 5ICQA 2DWHA 2G93A 4LQ2A 5AA4B 4R6KA 2VP1A 4QRZA 3O29A 5CRYA 3DELB 4JB7A 3KN3A 4U21A 4YB7A 1LGBC 4JSDA 4Q8RA 5IAIA 4XKQA 3TTLA 2QS4A 1HSLA 1EZ9A 1PBQA 4YMBA 3GZGA 5H8FA 3TCFA 3OO7A 1SBPA 1CE2A 3RLFE 1UTBA 2HXWA 3S9LC 1SVXB 3EHSA 4JXIA 2DWIA 4I1DA 1LFGA 4P0IA 1B51A 2GHAA 2UXAA 3PMXA 1IEJA 2OBGA 3K1NA 2VGQA 4QSCA 5M2VA 5AA2B 3RY3A 1H45A 3IB0A 1LBCA 1ANFA 1P1NA 4KYEA 4LZ7A 1FQCA 2D3IA 2WKYA 4NEDA 1QUKA 3MP8A 1BKAA 3EF7A 3N26A 4GLIA 1OMPA 4GL8A 3KN7A 2DWJA 1XHYA 2THIA 3IB1A 5ITOA 3MJNA 5AA1A 3UN6A 3W9WA 2UYEA 4TLMB 5EYFA 2G29A 4TLLB 4QFOA 4PP0A 1DOTA 1NH7A 3RT6B 2H9BA 4OMBA 2ZYMA 3VFJA 4HW8A 3SERA 3S9EA 1N3WA 5CMKA 1SW4A 1LSTA 3I6VA 1FTJA 3IJXB 3JV9A 4QFPA 4WEPA 5CBSA 2H98A 3CFLA 3TCGA 3MC2A 1EU8A 1R9QA 4XXUA 3SEXA 1MY2A 3O6IA 3T9XB 3TQLA 1FQAA 4G2ZA 1ZIUA 2B3FA 2OCUA 4Z7EA 1A7LA 2DQVA 3TELA 5BWJA 1DTGA 2XX9A 2CZLA 3KOTA 4G4PA 4ZEBA 3TDJA 1XVYA 1IUDA 2NWJA 4GRKA 1SI0A 1CB6A 3UA8A 2REJA 4HCYA 1Y1ZA 1B1HA 2RCBA 2UVIA 5TP9A 1A8FA 3VLWA 5CMBA 5IKBA 1A8EA 1MPDA 1D9VA 3U93A 4F39A 1GVCA 3RQTA 3QK6A 3H6WA 4ZE9A 4MH5A 4P11A 3T96B 5KDTB 3K2DA 4BDRA 4XIGQ 1B40A 2AIXA 2QRYA 3FVNA 3DM0A 1LAFE 3PPRA 1VFEA 4NMYA 1TFDA 3IO6A 1RYOA 3V83A 1TWYA 5I59A 1I6BA 1M5DA 1M5BA 3KFMA 1OQGA 3KN8A 2REGA 4KI0E 3CIJA 4EUOA 3LBSA 5H8QB 2DP8A 4RY1A 3RTWB 3ILTB 1MXUA 3CG3A 3M3FA 1AMFA 4JBZA 3RUMA 4C1UA 1QKBA 4DDDA 1A54A 2HAUA 1FQFA 4QSEA 1Z7NE 2ZNTA 3ZKKA 3SEUA 3O9PA 5ELVA 2DWAA 3TTKA 1Y1MA 3H6UA 1DSNA 3VE1B 1B1XA 2VD2A 2GFEA 1FTMA 2DYXA 2A5SA 1VE4A 2PBWA 3BFUA 2ZNSA 4XTCQ 1GGGA 3TFLA 5HPQA 3G3FA 4YKIA 1XT8A 3VVEA 4RK2A 4OTEA 4EF1A 4MLQA 4E0XA 1SW5A 1UIUA 2O7IA 4GFRA 4KCDA 2RCAA 4HCWA 4H5FA 4UA8A 3SKPA 4YMAA 4R6YA 3GXAA 4OHNA 5I2NB 3TEPA 4LP2B 1B7HA 3B6WA 1AOVA 3MAMA 3TODA 2B3BA 1B7UA 2ZNUA 3LSWA 3MVWA 3C4MA 3TQWA 1ZLQA 2DVZA 3TZAA 3W15C 2VOZA 4H6DA 4EXLA 3Q25A 3OMBA 4KQPA 3C9HA 4ZDMA 1PB7A 5H8NA 2XXHA 4ZEKA 3TCHA 5FHOA 3CSBA 3O2AA 4ND9A 3IB2A 3FVOA 2XXRA 5EHMA 2I49A 2I0BA 2FNCA 2X7QA 2Q2CA 3B7DA 5DVJA 4ELRA 1IITA 4WKMA 2XXPA 1R9LA 1TXFA 5DTBA 4U2RA 4OFJA 1BP5A 2O6AA 4G77A 4NE4A 4KCCA 4PFTA 1OVTA 2VD3A 2Q2AA 2Y7PA 3D4CA 1MQGA 2R9JA 3PPNA 1FTLA 1S9TA 4JWYA 2I58A 4EQ9A 1B46A 5FHMA 2V3TA 2OK2A 3K01A 4OVJA 4PFWA 3V89B 2ZMBA 4BDLA 4ZZAA 3T66A 4YB6A 5FHNA 2NOOA 2XXTA 3PMVA 5ISUA 4DXUA 1M5EA 3OXNA 2F35A 2ABHA 4G68C 4WXJA 5CI5A 4AB5A 1URSA 2V25A 4PE5B 4BDOA 2D5WA 2IEEA 3KBRA 3LUYA 2XHDA 1HSJA 5TP9B 5TU0A 3LSLA 3GLBA 3EN3A 2H5YA 5I2KA 5I56A 3QSLA 4X1BA 1FCKA 4IGTA 1FQDA 2ANJA 3U94A 4F29A 2P2AA 2XXUA 4PFUA 1LB9A 3FJGA 5CMMA 2OLBA 1WVJA 4OXVA 3PV0E 2P0SA 3CVGA 2IA4A 3GBAA 1A40A 4I9DA 4KYSA 4NF5A 4EQ7A 4NTLA 1MDP1 3U72A 4ZE8A 3T93B 4IGRA 2I0CA 5J1DA 2HEUA 4OQOA 1WODA 1HSEA 4FORA 4H0WA 3ZS6A 3K0VA 2H4IA 4Q5TA 1O64A 1H76A 3OD7A 2UVJA 4I8CA 1Y9UA 4POWA 1LAHE 2PX1A 3N6TA 3Q27A 3MPKA 4JSOA 3QXMA 1MM7A 2XX7A 3I5OA 4NWDA 2QPQA 4ELOA 3VLUA 4F2QA 1R1NA 3KJ7A 2V84A 3PPPA 4IB2A 5A5XA 1MY4A 1II5A 1DTZA 1JW5A 2RINA 3EHTA 3G3HA 2F8DA 3N5LA 4F1UA 4F1VA 1N84A 1PC3A 3S4UA 3FXQA 4OEUA 3OSRA 5CBRA 3H06B 4JDFA 1NMUA 2O51A 5I57B 4R9FA 3WAEA 2I4CA 4FEDA 3RT8A 1XOCA 3MUQA 4X1DA 5H8NB 4MBPA 1RKMA 4QSDA 3B6TA 2DXRA 2DSFA 4NF6B 4QFKA 1VSOA 5JTYB 3B6QA 2Z8EA 3VXBA 2Q9TA 3QAXA 4DXCA 4H8JA 5DEXB 5AA2A 1LAGE 2H99A 3F11A 3OEMA 3KEIA 4G68A 2ONKE 1FW0A 4LA9A 4X9TA 4ZZEA 4C1TA 1IQ7A 1MXYA 3N94A 5L9OA 5TPAA 3P7IA 1B32A 1POY1 1XVXA 5BUUA 1IZ1A 3FJMA 4IO4A 2F6PA 5K2XA 1LAXA 1PDAA 1NNFA 4LQ5A 5JEIA 1DPEA 4RK9A 5L8DA 4LONB 3DP6A 2Y7WA 1I6QA 2Q89A 5AA4A 1B3FA 1JEUA 4G8MA 4HS7A 3G3IA 4NF8B 4RJZA 3IORA 4F18A 1F9BA 2P1SA 3KGCA 1LCFA 3PU5A 2F36A 1MQIA 3A3CA 1TT1A 3CSGA 1OIBA 3OENA 4EDPA 3EHUA 1ZTYA 3G3KA 2AL5A 1FQBA 1LCTA 2I4BA 4M1VA 3UGWA 1B5JA 3R6UA 2F78A 4ZEFA 3TUSA 1MQDA 1FTOA 1TFAA 5I59B 1BTJA 1BLFA 1MY3A 1JVXA 3KG2A 1JETA 4F3SA 3MPLA 4YKKA 3AXFA 4DCXA 4FECA 1RYXA 1B0HA 1QVSA 1US4A 2Q88A 1YTVA 2QSXA 3EQ1A 3IR1A 2QL3A 3MVXA 3FIRA 3O97A 4IY5A 1QKAA 3PUZE 3SESA 5KDTA 1MXWA 3Q28A 5K2YA 4EF2A 4GXSB 5DVFA 1Y4CA 3FUZA 1MH4A 1AL3A 3BFTA 1ZKBA 2HZKA 4LATA 4NF6A 3A09A 1P1OA 1I69A 2DVCA 4NF8A 4OZ9A 1MPCA 2KLFA 5I57A 4KPTA 3RN8A 4EXKA 4IO3A 1I6AA 1LB8A 3FVKA 4FJPA 2UVGA 3KZGA 3CFXA 1JVYA 4IY6A 3U1OA 4ECFA 3C33A 2PVUA 3U8QA 5A5XB 3PPOA 3E9XA 2E0SA 3L6HA 1OQHA 1URDA 2QMWA 1OVBA 2RC8A 2RKMA 4KHZE 4MFIA 4OWDA 5FTIA 5TPAB 4E0WA 3N6UA 4LZ8A 3TPAA 2YLNA 1P1WA 3KJTA 1UQWA 4TQUQ 2UYFA 3TYHA 2RC7A 1IXHA 2GHBA 2O84X 3Q26A 4LUBA 4R9GA 4ZEDA 4OERA 4XKRA 2HQ0A 3KOSA 1YAEA 1Z7ME 3K6UA 2CMOA 1USYE 3PGFA 3H3GA 3WAFA 4QFNA 4DIGA 3K6XA 1YPNA 3DP8A 3LSFB 4FIMA 5B70A 2NUVA 2ZYKA 4F31B 4U4XA 2DE2A 3BBRA 2NXOA 3FJ7A 1B3EA 1JW1A 4G8HA 4M4GA 3I3VA 4RPOA 1B4HA 3VVDA 1DMBA 1T0KA 4Q30B 1B5IA 2RC9A 1P99A 1QUIA 5L9SA 4H1XA 2HCAA 1QJMA 3M3KA 3TTRA 5H8SA 1VFDA 5H8HA 3MVZA 3HV1A 4O3CA 4F3PA 4XKPA 3K1MA 3OO8A 4N07A 3MZ9A 5DVIA 5L9MA 1MM6A 1N3XA 1Y3QA 3VDFA 2F5XA 3W9VA 1MY0A 4H5GA 3MBPA 4NF4A 3MP1A 1UTBB 2F7AA 1DPPA 4THIA 4FATA 3E4RA 4IO7A 3A3UA 5H8FB 3DP4A 3HHGA 2X26A 4ZS9A 1ELJA 5F1QA 3FZVA 1US5A 3C31A 3R7XA 2XXXA 2FA7A 2XXQA 3FXRA 4R2BA 1UIVA 4QHQA 1XC1A 3OO6A 3RNNA 1J1NA 5I2KB 3KSJA 4POXA 3ILUB 3UIFA 2I3WA 3IOUA 3UK4A 1Y3NA 3QUFA 4GVOA 4C0RA 1ZU0A 1AH5A 2HAVA 1N7XA 4FAJA 5KCJA 1Y20A 1Y3PA 3ODBA 4U4SA 2QMXA 3BKIB 5AE4A 1H44A 1SI1A 3FGSA 4P0GA 2XXVA 4DCYA 3OELA 1B3HA 4N13A 5CM6A 1LBBA 4QF9A 3SEYA 1A55A 1IXCA 2X7PA 5DYHA 3USDA 2Z22A 4BLAA 2H25A 3S9MC 1N0TA 1MXVA 4G8NA 3U92A 4O3BA 2R71A 1B2HA 2O68A 3IAZA 4R2FA 3C32A 3T9VA 3O28A 2AL4A 1B5HA 1NNTA 1UTHB 1JNFA 2DE4A 2Y7KA 1D3KA 2OWTA 3C36A 3TKDA 2Y84A 4DE8A 5KZTA 3R26A 4IO5A 4RPNA 1NKXA 3O66A 4H65A 2W7YA 3O6HA 4U1OA 4ZECA 5JK4A 2A5TB 2OJTA 3FD3A 3OSQA 2Y7RA 2PMSA 2ALUA 2DS9A 4OFOA 4RXLA 4R6HA 4ONYA 2PT1A 3TTNA 3G3JA 3IJOB 4OEVA 4ISUA 3K6VA 2ESNA 3UP9A 4ELPA 2QJEA 4H8IA 2QS2A 4NWCA 3T9HB 1MQJA 2V3QA 3C35A 3IO4A 3PUWE 4IO6A 1QULA 5CMCA 5F7VA 5I2NA 2AYSA 4OESA 5B7DA 1N7WA 1QUJA 1QW0A 2I48A 2HZLA 2F7CA 1MH3A 4U22A 3E13X 1PB8A 1USYH 4GOTA 4IO2A 3T22A 4UACA 5ITPA 1MPBA 5DEXA 1FQEA 2NVUB 5KCJB 4U1ZA 3JZJA 1ZMGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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