5H8FB

Structure of the apo human glun1/glun2a lbd
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
286
structure length
283
Chain Sequence
RLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 283
sequence length 286
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fB02
4O3BA 4XXUA 3O6HA 5M2VA 4WXJA 4JWOA 3UA8A 4YKPA 1CB6A 4HCYA 4FATA 2LAOA 1TT1A 1NKXA 4ZEFA 4ZEBA 1XVYA 2OZZA 3K1NA 4EF1A 2OBGA 1B6HA 5ISUA 4F2OA 3KN8A 1GTKA 5H8HB 4PFWA 2B3FA 1B7UA 2QJEA 3MVYA 4PFTA 4TLMB 2AYSA 1LB8A 3RT6B 2O84X 5CBSA 3PUXE 3KN7A 1FTKA 1N0TA 4PFYA 1J1NA 1EU8A 3BFTA 4R9FA 2XXTA 1FTOA 2QMWA 3G3FA 5LOMA 4EQ9A 2ZYKA 4OWDA 4OEVA 4YAHX 3C35A 1MM6A 3OENA 4ZZAA 4IGRA 1LAFE 3B6WA 3T9XB 5AA4A 4WEPA 1ZU0A 5DVFA 4OQOA 1SD3A 2D5WA 2ZNSA 1D9VA 3GBBA 4KD5A 3VLVA 1MPCA 4G77A 4FJPA 5TPAA 4ZDMA 5JEIA 2XXIA 4QRZA 1LCFA 4F3SA 3IAZA 4F1VA 1PEBA 3V89B 2DS9A 3H06B 5DVJA 3IORA 5AA2D 3VDFA 3T9HB 2I0CA 3T9UA 4LUBA 3QUFA 4ELRA 2DE3A 4JXIA 1IZ1A 4JWYA 3HPIA 4X9TA 3IX1A 1QJMA 4GVOA 3A09A 4ZEKA 5CRYA 3FVNA 2QSXA 5CBRA 2A5SA 3HV1A 4RK2A 2I48A 4IO5A 1EZ9A 1P1NA 3SESA 3H6TA 1FQBA 1WVJA 4ELOA 5I57B 2Q89A 2PX1A 4O3CA 3K1PA 1YAEA 3OO7A 1H3DA 3OO8A 4YB6A 3PPRA 3BBRA 2Z23A 4ELQA 5I59A 4Z0IA 5IKBA 3RY3A 3G7WA 1DPEA 1MG1A 1SW1A 3P7IA 2GHBA 1HSJA 5KDTA 5CMMA 3FATA 3TYHA 3PUZE 3G3HA 4OZ9A 2DYXA 1ZIUA 1NL5A 3SEUA 5DVIA 4OFOA 4QFLA 5A5XA 5CI5A 5K2XA 3THIA 2F5XA 1Y4TA 1O63A 1EZPA 1AH5A 1A40A 3S9NC 3C4MA 1Y9UA 2GH9A 3MVZA 4EF2A 1HSEA 1I6QA 4GFRA 4R72A 1A8EA 3KGCA 3U92A 3MPKA 1DSNA 1VE4A 3FVKA 1B40A 5EHMA 2G29A 1IUDA 4GXSB 2UVJA 1ZJLA 1N3WA 3M3KA 2DOJA 2HZLA 2ONKE 4JSOA 1MH4A 1TXFA 1B05A 1EZOA 1N84A 3MBPA 1LLSA 3TEPA 3SKPA 3N6TA 4F3BA 4H8IA 1D4NA 3EF7A 1B5HA 3QIMA 3ZKKA 2F6PA 2X26A 1FQEA 2Z22A 1FTMA 4LQ2A 1DMBA 4I9DA 2X7QA 3D4GA 2AIXA 4NF8B 1P1UA 3ONMA 1PB9A 5IAIA 1LCTA 4H0WA 3TPAA 1Y3QA 4NEDA 3OSRA 4EXLA 2THIA 3ODBA 5B70A 4M1VA 4ESXA 4U4SA 4ISUA 4IY5A 3T96B 2XX8A 1IIWA 4DXBA 2O6AA 1MY0A 5FTHA 4OTEA 5EHSA 5H8SA 2DE4A 3W15C 4HTGA 3MZBA 2DQVA 2Q8JA 4TLLB 1XOCA 4U1OA 1H45A 3EPEA 3QYTA 4R73A 2H98A 1NH8A 1D3KA 3S4UA 3T93B 2I3VA 5JTYA 4PQJA 3LUYA 4I8CA 3MP6A 2IA4A 2QRYA 1YTVA 5BWJA 3HN0A 4ZECA 2RINA 4RJZA 4N07A 4BDOA 5L9SA 1B0HA 4F1YA 2DWJA 3MPLA 3Q27A 3Q25A 1MQHA 2HZKA 1PB8A 3N26A 4OFJA 2CZLA 2O69A 2O7IA 4QHQA 1S50A 5FHMA 1T0KA 1OVBA 5JK4A 3UORA 3FV1A 3USDA 4EDPA 4RYAA 4KR5A 5AA1A 4NF6B 4QFKA 3TMGA 3IOTA 2D3IA 5K2YA 2ZYMA 1XS5A 3TDJA 3UK4A 4GQOA 1IQ7A 3UP9A 3IOUA 2V93A 4EUOA 1FW0A 2Y7KA 3PD8A 2P2AA 3ZSFA 1NH7A 1LSTA 4GRKA 2RCAA 4OVJA 5H8FB 2HQ0A 2F7BA 4LZ8A 2V3QA 5CMBA 3TCHA 4QF9A 4R9GA 3RTWB 3S2VA 4F18A 2RF1A 3IJOB 4IO3A 3O28A 4KQPA 3S9EA 3A3CA 3PMVA 2ABHA 4U2RA 3M3LA 2CMOA 1H43A 4QFPA 3CSGA 2A5TA 3QXMA 1IXHA 1Y4CA 5ICQA 3K6XA 3RLFE 1IXGA 4OFLA 3TCGA 3MWBA 4X48A 4Q0CA 1SI1A 3CIJA 4EQBA 4XTCQ 3FXRA 3TTRA 1Q35A 3LSXA 5FHNA 1BTJA 1A55A 4C1TA 1Q1KA 4U23A 2OLBA 4ZE9A 1NMUA 1ZLQA 2DWAA 1B3EA 3HHGA 5FHOA 4L17A 4R6HA 3SDFA 1SBPA 2XXRA 4MF3A 4NE4A 1H76A 2HFBA 4MLVA 3MW0A 1R1NA 1S7YA 4H8JA 4FE8A 5ITOA 5ITPA 2NVUB 3PUVE 1MXYA 3V8XB 2OWSA 4O3AA 1QUIA 3PGFA 3TTKA 2X7PA 2F35A 3C36A 4POWA 1L5TA 3VVDA 1MXZA 3H4ZA 3ILTB 3FD3A 1MQJA 2NWJA 4R75A 3LSWA 4FORA 4GL8A 3PPQA 3C32A 3FJ7A 3SEXA 3IJXB 4ELPA 4YMAA 2ZXTA 5AA2A 2ZMBA 1SVXB 3IOVA 3MAMA 4YKJA 2PYYA 1URGA 4Z7EA 3N5LA 1MXXA 4WEDA 4EXKA 2PT1A 3IB2A 3OO9A 2GRVA 3H3GA 4IB2A 3OSQA 1MXUA 4KCCA 4F3PA 1MY2A 2RC8A 3PMXA 1M5FA 3DP4A 1VFEA 1MDP1 3DM0A 1GGGA 1JNFA 3QAXA 5I2KA 1MPDA 2V3UA 4G68A 5H8NA 2AL4A 1B1HA 4BDRA 3IR1A 2OJTA 4Q30B 2DWHA 4KI0E 2F8DA 1I6BA 5I84A 5I56B 2I0BA 3S9MC 4ZS9A 1M5DA 2WKYA 2DVCA 1SQYA 4QSCA 3KJ7A 2F97A 4BDLA 1LAGE 5ICTA 2YJPA 3GLBA 1EH3A 1SW4A 4RK9A 4YU0A 2H99A 1POY1 2DE2A 4RY1A 2D21A 3H7MA 5H8HA 1QUJA 3LSFB 3C33A 3OXNA 4LA9A 1BKAA 1OVTA 2R6GE 4RPNA 3K4UA 4U1ZA 2XX7A 2QMXA 1FQCA 4U21A 1URSA 5HBCA 3N6UA 1JETA 2QS3A 1DTGA 2I4CA 3RUMA 3N94A 1B3GA 3VLUA 5CMKA 3C34A 4P11A 1QW0A 1OMPA 3M8UA 2FYIA 3I5OA 1MS7A 1IXCA 1B51A 1UQWA 3MP1A 1WODA 2F7CA 1N7XA 3GXAA 3QK6A 4JDFA 4LZ5A 3VV5A 3OELA 1ANFA 3VE1B 2XXQA 4F3GA 2ZNUA 1UTHB 1NNFA 1R6ZA 5TP9B 1OLCA 1RYXA 4UACA 2PMSA 3OEMA 3VFJA 4HS7A 4DXCA 2DVZA 1DPPA 4TQUQ 4NWCA 3B6TA 3O6IA 3CI8A 4FIMA 5I2NB 1P99A 2RKMA 3IO4A 3KJTA 1I6AA 1MXWA 5KCJB 4OYVA 4DCXA 2UVGA 4YB7A 5HPQA 1UTBB 3Q28A 2ZYNA 3IL1B 2VHAA 2RC7A 2ONRA 5AA3A 1N7WA 4Q8RA 5I57A 2HXWA 3H6WA 5DYHA 3E4RA 2KLFA 1B3HA 4F39A 1P1OA 1USYH 4PFUA 3FGSA 3KN3A 2DSFA 3FV2A 5I58B 5J1DA 3FVOA 3OOAA 4MFIA 2Z8EA 2IEEA 1OQHA 5H8QB 1FTJA 3EHSA 3VXCA 1B7ZA 4GD5A 1B3FA 3F11A 3TTMA 1SW2A 3G3JA 3QSLA 1US5A 4R6YA 4I1DA 2NXOA 4R2FA 2O1MA 4H67A 1NNTA 3DP6A 1I69A 2F78A 2Y7PA 1ATGA 3K1MA 4ECFA 4QFNA 3U72A 4H5GA 2REGA 4MH5A 4RA1A 2XXUA 1FCKA 2XXVA 4OESA 4X1BA 3G3GA 3RT8A 1RYOA 1Y3NA 2HEUA 4H6DA 4NF5B 3IK6B 4KYEA 3H03A 4YB5A 3I3VA 1PB7A 1MXVA 1XT8A 3RQTA 1LBBA 3CR9A 2R71A 1Y20A 4LVQA 5DEXB 3DP8A 3R26A 3T22A 3SETA 3O6GA 3H6UA 2FNCA 3KG2A 4NF8A 3PMWA 4HW8A 4JBZA 1IXIA 2Y7WA 5L9OA 3KBRA 1B7HA 2V3TA 3TTNA 5H8QA 3ECRA 2QS2A 4F1UA 3AXFA 5CC2A 1ZTYA 4BDNA 4YKIA 4DZ1A 3T9VA 2UYFA 1B3LA 3M3FA 1N04A 2O1LA 4DE8A 3K00A 4E0WA 3VXBA 3SEWA 3CRBA 4POXA 4AQ4A 2B3BA 3WAFA 4LZ7A 1A54A 1FTLA 4IY6A 1MPBA 3FASA 4KFQA 1B4ZA 1N3XA 4U22A 3LSLA 3MVXA 4OHNA 3MP8A 2O51A 2I4BA 1JW1A 3S9LC 3MVWA 2UYEA 3RNNA 3Q26A 1TFDA 4ZE8A 4DDDA 4X1DA 1YPNA 4G8NA 3PV0E 1MQDA 3LC8A 1SYIA 2VD3A 4JB7A 5BUUA 1POTA 4LQ5A 5TU0A 1D9YA 3TTLA 4R2BA 3FJGA 2UXAA 2YLNA 4GOTA 4NF6A 4ND9A 1ZKBA 4H65A 1VSOA 3MJNA 4IO4A 1AOVA 1B58A 2ESNA 1A99A 2QS4A 3KSJA 2F7AA 1LAXA 2B65A 4AB6A 3EN3A 3TCFA 2ZNTA 5H8FA 1MM7A 1QUKA 3E13X 5AA4B 2QS1A 4NWDA 4HCWA 4DLDA 5L8DA 2DP8A 3PUYE 1B9JA 4FEDA 1USYE 2HAVA 4THIA 4NF4B 2XXHA 3C9HA 5TPAB 3IB0A 1GR2A 2O7UA 1B5JA 3TODA 5B7DA 4G8MA 2DWIA 3OO6A 4GIZA 3U94A 3RTFB 4C1UA 2REJA 1XVXA 1QVSA 4IO2A 3DELB 3MQ9A 1O64A 4M4GA 1GVCA 2ALUA 1MQIA 4G8HA 4E0XA 4KYSA 3BFUA 4OENA 1MRPA 3QUJA 1XC1A 4ZZEA 3K0VA 4IO6A 3OMBA 4LP2B 2DXRA 2ONSA 2OK2A 4DXUA 2Z8FA 3TQLA 3CSBA 3TZAA 1BP5A 2ZYOA 2Q9TA 4I62A 1Z7NE 4F19A 4XKQA 2OCUA 4RXLA 2XHDA 4NMYA 1IEJA 2E1SA 1LGBC 1HSLA 2VP1A 2P0SA 4GF8A 3Q29A 4XKPA 2Y84A 4BDMA 1NNKA 3CVGA 3ZKLA 4G2ZA 2RCBA 5I59B 2NUVA 3GBAA 1BIYA 1B5IA 4XKRA 1IITA 5KDTB 1TWYA 1XHYA 3PPOA 3TUSA 5CMCA 3O2AA 1JQFA 3TFLA 4NF4A 1URDA 2NOOA 3LBSA 5A5XB 2QL3A 1PBPA 2Y7IA 3MZ1A 3K6VA 3FIRA 3MUQA 4G68C 3KZGA 1SDXA 3O66A 4MBPA 2F36A 2PT2A 4YZZA 1R9QA 4PP0A 4ZEDA 3JYRA 1VFDA 3PPNA 4H1XA 2XXPA 5F7VA 5CM6A 1A8FA 4JWXA 3FJMA 5F1QA 3U8QA 1JEVA 4Q5TA 4QSDA 2XXWA 2QPQA 3FZVA 4QFOA 3IB1A 1FQAA 1B52A 2VOZA 4ONYA 1N76A 3O9PA 3PPPA 3LR1A 3G3KA 4N13A 4FAJA 3SEVA 3TELA 2H9BA 3SEYA 4R6KA 4P0IA 1MQGA 3D4CA 3KFMA 1LFHA 2M8CA 4KYDA 4OMBA 4TOZA 3UN6A 3ILUB 4F31B 1ELJA 5I56A 3EHTA 3HSTA 4NTLA 3B6QA 1CE2A 3O29A 4H5FA 1P1WA 2XD3A 1FQDA 4GLIA 3G3IA 1LAHE 3KEIA 5DTBA 1LFGA 1JEUA 3FXQA 1UIUA 4U4XA 1ZBMA 4FEBA 1FQFA 1MY4A 2AL5A 2VGQA 4K3FA 1Z7ME 4MLQA 1LB9A 1PBQA 1DOTA 2XXXA 4WKMA 1M5BA 3FVGA 4QSEA 5JTYB 3RN8A 3TAJA 1O7TA 3PU5A 3KOTA 1LBCA 3W9WA 3MC2A 2VD2A 2I49A 2I3WA 4XKNA 2Z8DA 4F2QA 3KOSA 1LFIA 2XD2A 3HO7A 4ESWA 3PD9A 2YPNA 1MY1A 1JVXA 1PDAA 2GFEA 5EYFA 2FA7A 3VLWA 2P1SA 2XX9A 1PC3A 5L9MA 5HM4B 1SW5A 4P0GA 1UTHA 3CFXA 5AE4A 1RKMA 5ELVA 5TP9A 2GHAA 3VVFA 4EQ7A 3TKDA 1NNPA 1JW4A 4YMBA 2PBWA 3K2DA 4KHZE 4KCDA 4YKKA 1II5A 1B2HA 1Y3PA 3CG1A 2F6GA 3UIFA 1B32A 3BKIB 2DXYA 2Y7RA 5I2NA 4LATA 1B0LA 2Q2CA 1AIVA 4GL0A 4OEUA 4PE5B 2I6EA 4DIGA 1M5CA 3H6VA 4GWOA 1B4HA 1R9LA 5KCJA 2O68A 4OETA 1VR5A 1DTZA 1UTBA 4F22A 1SI0A 3A3UA 1MH3A 2A5TB 3HHFA 3WAEA 3L6GA 3V83A 3OEKA 4G4PA 5DT6A 3E3KA 2RC9A 3V5AA 4KPTA 4GXAA 3K01A 3HCQA 3VVEA 1P1QA 5I58A 3FUZA 3C31A 1B46A 1WDNA 2HCAA 3W9VA 4AB5A 3U93A 1B1XA 4YICA 3OD7A 3B7DA 1BLFA 3IO6A 4BLAA 4BDQA 1QULA 3EHUA 3ZS6A 1OLAA 1AL3A 3R7XA 1GV8A 4N6PA 5FTIA 2I58A 4LONB 3UGWA 1OIBA 2H5YA 3JV9A 3K02A 3CFZA 3SERA 3CG3A 1MY3A 1UIVA 1A7LA 4OXVA 1QKBA 4JSDA 2H4IA 4ZEIA 2V84A 4XIGQ 5KZTA 2V25A 4R74A 4NF5A 1Y1MA 4F29A 1MDQA 1NFTA 1US4A 4IO7A 1AMFA 1SYHA 5AA2B 2UVHA 3R6UA 3U1OA 1M5EA 5DEXA 3EQ1A 4PETA 4RPOA 1ZMGA 1YCJA 2R9JA 4OERA 3O97A 2XXYA 2PVUA 2Q88A 3TQWA 4IGTA 2UVIA 1OQGA 2OWTA 3E9XA 3PUWE 3FXUA 4RNSA 3CFLA 2W7YA 1H44A 3K6UA 2HAUA 2BJJX 1TFAA 3T66A 4C0RA 3I6VA 3GZGA 4UA8A 2H25A 3MZ9A 1F9BA 4DCYA 1KWHA 1Y1ZA 3L6HA 2E0SA 2Q2AA 1JW5A 3JZJA 2G93A 3RPWA 5I2KB 2ANJA 2F34A 3RGYA 3K6WA 4FECA 3KSXA 1S9TA 1JVYA 4G68B 3DLNA 3IOWA 1QKAA 5H8NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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