3CVGA

Crystal structure of a periplasmic putative metal binding protein
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
280
structure length
270
Chain Sequence
EDVYDGPVQLRIGNGGAGQSGLVKELADAFIKSKVDSGFKVAWYKSDTTVTINYLKDGIVDVGITYSPVAERISIKHGISESPSYYAFRDHFMLIGPPSNPAKLSGDSDIADMFSKMHDAAEAGNTKPPVRFLSRYDKSATNIKEAELWLSIGQVPWATAYSTWYHQYITFPIQALTAAILLREYTITDYGTYLSIPRGLRDQMVIYKKGTNDADDPLLNPAHLLVGARAKNAEMAKEFAKWLVSKEGGQKVIEGFKKDGQQLYSPAPYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Coccidioides immitis
publication title Crystal structure of a periplasmic putative metal binding protein.
rcsb
molecule keywords Putative metal binding protein
total genus 80
structure length 270
sequence length 280
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cvgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cvgA02
4ZEFA 2RC9A 3JYRA 1PDAA 2AYSA 5K2XA 2M8CA 2UVJA 4IO7A 3Q25A 5I57B 3SETA 1BKAA 3H7MA 2H9BA 4TOZA 3RQTA 1SW1A 1EZOA 4F22A 1Z7NE 3CVGA 4U21A 4XXUA 3HV1A 5L9OA 3L6GA 4R6YA 4IO2A 2OBGA 4ECFA 3EF7A 2CMOA 3MZ9A 3TQLA 3UORA 3O6IA 1EZPA 1P1WA 1N0TA 4ESWA 2R71A 5K2YA 1XOCA 4ZDMA 1IEJA 3MWBA 3A3CA 1LB9A 2P0SA 1ELJA 4WXJA 1O63A 3O66A 3RNNA 1JNFA 2NVUB 4M1VA 2ZXTA 4GFRA 4LQ5A 4E0XA 1SQYA 3PPRA 1FQEA 1I6QA 5TU0A 2NUVA 3K02A 3U8QA 3T96B 3VLVA 5F7VA 4FAJA 1B05A 3IORA 3SKPA 2F7AA 2D5WA 4OZ9A 2PBWA 4QFNA 4ISUA 3OXNA 4G8HA 4YMBA 1RKMA 4O3BA 3SEXA 1ZJLA 4NF8A 2I3VA 1Q1KA 2VHAA 2XXRA 2QJEA 1MQGA 3PUYE 4ELOA 5DT6A 3KJ7A 3R6UA 4KHZE 1WDNA 5ITOA 1Y4TA 3RY3A 1O64A 3MUQA 3CSGA 4DCXA 3TDJA 5TP9B 1UTBA 1N04A 4BLAA 1MY4A 2VD3A 3ILTB 4QFOA 1WVJA 1BIYA 3PD9A 4MLVA 3VLWA 2AL5A 2DWAA 3QUFA 5HM4B 3Q29A 1MXUA 3T22A 3TCHA 3G3FA 2F8DA 2QSXA 3TODA 1B40A 2RC7A 3Q26A 2X7QA 4NE4A 4PE5B 4LA9A 4RJZA 3BBRA 4F3PA 3KZGA 3E4RA 2DXRA 4R2BA 3VVDA 1PBQA 4RA1A 2F35A 2OZZA 4X9TA 3TQWA 1UIVA 5CBSA 2XD3A 4NF4B 2UYEA 3RPWA 3IB0A 1MQDA 1EZ9A 3W9WA 4YMAA 2Y7KA 1GGGA 1PB9A 1P1NA 5CRYA 5CM6A 4FECA 3VVEA 2XD2A 4OFOA 3K6UA 4NEDA 4OETA 3G3HA 3VFJA 3G3KA 1FQCA 2Q8JA 1FTJA 2DWHA 3LBSA 3CI8A 4DLDA 4N13A 1JW4A 4BDRA 4IY6A 1MRPA 3EHUA 3CRBA 1ATGA 1NFTA 1TXFA 1H3DA 2PMSA 3C34A 3FZVA 2FNCA 3PD8A 4DXUA 2FA7A 2ZNSA 1MXWA 2YLNA 3TTMA 1HSEA 4PFTA 3FUZA 4IO4A 1JEUA 1QUIA 2I49A 1US5A 2GRVA 4XKRA 2Y7WA 3O6HA 5L8DA 2R9JA 3EHTA 3CIJA 1TT1A 4JB7A 3VXBA 3JZJA 1A8EA 5I57A 5TPAB 4FATA 5FTIA 4F1YA 2O7IA 3D4GA 4EQBA 2F7BA 4H65A 1YAEA 2HQ0A 1S50A 3DLNA 3B6TA 1AH5A 5DVIA 3FVOA 3VV5A 5BWJA 3AXFA 4DE8A 4OXVA 4F1VA 3SDFA 2G93A 4KI0E 3N26A 2ALUA 1BP5A 4GOTA 5I2KB 4KCCA 4U4XA 3R26A 3T9UA 1LLSA 1SW2A 5L9MA 4ZEIA 4GIZA 4QSDA 4XKPA 1I69A 5CMMA 4H8IA 1Y9UA 4MFIA 1ANFA 1XVXA 2QS3A 2D21A 2QS1A 1JEVA 3CG3A 1H44A 3G3IA 1MPDA 2OCUA 4XKQA 2V25A 1VSOA 3TCFA 1B1HA 4YB5A 1M5EA 1MXXA 4RPNA 2R6GE 1TWYA 2UYFA 2YJPA 5EYFA 3DP6A 3MVZA 3KN7A 3ODBA 3K6XA 3KEIA 1A8FA 3PPNA 2RKMA 4U22A 1LB8A 1XC1A 3PU5A 2LAOA 1N3WA 2V84A 5H8NB 4G68B 3MW0A 4GQOA 2I0CA 2I4CA 1EH3A 2ZYMA 4NTLA 4WKMA 1B58A 1GTKA 1MY0A 1MDP1 1LFHA 4NWDA 4R6HA 1ZMGA 5CMKA 1M5FA 4OYVA 1XVYA 4ZZAA 4O3CA 3PMXA 1UTHA 4N6PA 4PFUA 4ELPA 3IJXB 4FEDA 3IK6B 3IB2A 3IO6A 4G2ZA 4OVJA 3UP9A 1R6ZA 1A99A 1A7LA 4Q8RA 3T9XB 1SW4A 1USYE 4BDMA 4YKKA 4R6KA 5AE4A 4EF1A 3M3LA 3FVGA 4C1UA 1OVTA 4RPOA 3U1OA 3TKDA 3MPKA 1B4HA 3KGCA 4ZECA 2VD2A 3MP1A 3FJGA 3M3KA 3O28A 4F29A 3FD3A 2VP1A 1B32A 3E3KA 3IX1A 4OWDA 2D3IA 4NF4A 3MBPA 1Y20A 4I8CA 1QW0A 1IUDA 3MPLA 5KDTA 4LVQA 3G7WA 3SEWA 3ZS6A 1SD3A 3OELA 1QULA 1R9QA 5I84A 1JETA 4U1OA 4WEPA 3JV9A 3S4UA 1QKAA 3H3GA 4YAHX 3E13X 1SVXB 4ND9A 1B5IA 5M2VA 1IXGA 2THIA 2OJTA 3QAXA 4H5FA 4TLMB 1B4ZA 4P11A 4H1XA 1DTZA 2F6GA 3EQ1A 3O9PA 2Q2CA 3TAJA 1LAHE 3OSRA 3RUMA 4EXKA 2XXYA 3CFZA 1L5TA 2I4BA 4OESA 3H03A 2ONKE 2ZNTA 3TTNA 3I3VA 2BJJX 4JWOA 4R75A 5H8FB 3TYHA 1GV8A 2E1SA 1F9BA 3K1NA 3UN6A 4YB6A 1N7WA 4OERA 4Q30B 4H6DA 3IL1B 3B7DA 4GWOA 1IZ1A 1SW5A 4R9FA 3C35A 4KPTA 1OLAA 2RCBA 4FE8A 4ZEBA 5CI5A 2HFBA 1UIUA 2DWIA 2UXAA 4ZZEA 1OQGA 1Z7ME 1FTOA 4H5GA 2Z22A 3A09A 1YPNA 3FVNA 5I59A 2UVHA 3FVKA 1VR5A 2HCAA 2DVCA 1DMBA 4R72A 3ZKKA 2Q89A 3N5LA 5HBCA 5JK4A 1EU8A 2E0SA 1IXHA 3V5AA 2F6PA 1LFGA 5KCJB 4C1TA 5IAIA 2HAUA 4KCDA 3LR1A 3S9EA 4BDQA 3V8XB 4NF6B 2F97A 4HS7A 2Q2AA 4LZ5A 5AA1A 5I56B 3UK4A 4K3FA 3KOTA 4F3BA 1B3LA 3RT6B 3KOSA 5H8NA 2ZYNA 4U1ZA 4LQ2A 3FGSA 4QFKA 4LUBA 1LAFE 2PT1A 1Y3QA 1IXCA 1N3XA 1GVCA 3A3UA 3ECRA 3IO4A 1FCKA 1FQAA 2XXWA 4R74A 5ISUA 3MVWA 3I5OA 3K1PA 2DVZA 1H45A 1FQDA 1ZIUA 3DM0A 4JSDA 4KFQA 1D4NA 2DQVA 5H8QB 5CBRA 1H76A 1TFAA 1YCJA 3PUVE 4UA8A 3MC2A 4RYAA 3VE1B 1LCFA 2HZLA 4ZE9A 4G8NA 1MPCA 1MY3A 3RN8A 2F34A 5H8HB 1B46A 3GBAA 1A55A 4QSEA 3USDA 5AA2B 2F7CA 4ONYA 2A5TB 3HHFA 1QJMA 5J1DA 4HTGA 4IY5A 3QUJA 4RY1A 4GLIA 1B1XA 2DWJA 4JXIA 4MF3A 1B7HA 4H8JA 1B5JA 3K01A 3IJOB 2DS9A 4PETA 3LSLA 1MQIA 4YICA 1LAXA 2IA4A 5IKBA 4LATA 4DDDA 1XHYA 1TFDA 4QRZA 1OQHA 3O2AA 4KR5A 4EUOA 4U4SA 4OFJA 2XXHA 1JVYA 2QMWA 4O3AA 1P1UA 4G4PA 5KZTA 3HCQA 3S2VA 4F2OA 5ICQA 1LBBA 1MM6A 5CC2A 4G77A 3GZGA 5ELVA 3V89B 3K0VA 4GVOA 2DE4A 3SEUA 3U93A 4XIGQ 5H8FA 2GHBA 1ZLQA 1N76A 1B0HA 4YKPA 3CG1A 3ILUB 3IOUA 4IGRA 2I58A 3MJNA 4BDOA 1MPBA 5FTHA 1IQ7A 3OD7A 4E0WA 3MVXA 1ZTYA 3H6UA 1P1QA 1B0LA 2ONRA 4ZE8A 1B5HA 4AQ4A 3IOWA 3RLFE 1AL3A 3C32A 3OENA 3N6TA 1JQFA 3PV0E 1B7ZA 3TUSA 2HEUA 4C0RA 3KG2A 3KN8A 4ZEKA 3SEYA 3D4CA 3GLBA 4NF5B 2Q88A 3N94A 1M5DA 4F19A 2W7YA 5I2NB 1US4A 3S9NC 1PBPA 4I9DA 1QUKA 2FYIA 4M4GA 1P99A 4OFLA 2WKYA 3PPQA 3L6HA 4EQ7A 2XHDA 5ICTA 1B9JA 4OENA 4F3GA 1GR2A 3WAEA 4KYSA 3FXUA 2ABHA 3H06B 2DP8A 5A5XB 2QRYA 3IOVA 2AIXA 3DP4A 1AMFA 2H5YA 5FHOA 1NNFA 3S9LC 4YZZA 2O51A 1PC3A 5BUUA 3FJ7A 2I3WA 1SYHA 1B52A 2PVUA 3LSFB 1DTGA 4NF6A 4F2QA 5TP9A 2DYXA 4NWCA 3K4UA 4ZEDA 1J1NA 4EDPA 4L17A 2UVIA 5I56A 3GXAA 3IOTA 4MLQA 2OWTA 4ELRA 3LC8A 2RC8A 1AOVA 3MQ9A 3T66A 4ELQA 3RGYA 1Y3PA 1SDXA 4F39A 2Y7PA 1POY1 4YKIA 1DPPA 1MXYA 2CZLA 1B7UA 2HXWA 5DVFA 5AA4B 1IIWA 3I6VA 4N07A 3IAZA 2H99A 2YPNA 2ESNA 3Q27A 5DVJA 2O6AA 4IB2A 3CFLA 3OO6A 1PEBA 3RT8A 1OVBA 5F1QA 3IR1A 3P7IA 2DE3A 3V83A 4IO5A 3DELB 4KYDA 1B3EA 1O7TA 3TMGA 3FATA 4TQUQ 3M3FA 4AB6A 3H4ZA 1OMPA 4PP0A 5H8QA 4PFYA 4POWA 3OMBA 5AA3A 3BKIB 1S7YA 1YTVA 3DP8A 4LONB 5B70A 2DOJA 3O6GA 3SESA 2OLBA 1NKXA 2RINA 4LZ8A 4HCWA 3UA8A 1SBPA 5H8HA 3U94A 3FV1A 4FJPA 4Z7EA 4QFPA 2OWSA 3U72A 4X1BA 3U92A 1II5A 3WAFA 2A5TA 3LSWA 4PQJA 5DYHA 3PMWA 1Q35A 3OO8A 3ZKLA 1NMUA 4POXA 2GFEA 1MXVA 1CE2A 3K6WA 1MG1A 2XX9A 3C31A 4RNSA 3FV2A 5HPQA 5I58B 4OHNA 4G68C 3C9HA 4MH5A 2Q9TA 3KBRA 5TPAA 1SI1A 3HSTA 2XXUA 2DXYA 3GBBA 1P1OA 2QS4A 1UQWA 2REGA 2XX8A 1QVSA 4NMYA 1OLCA 4F31B 3SEVA 1JW5A 2XXVA 1Y1MA 3TTRA 2XXPA 2ONSA 3MZBA 4GF8A 2XXTA 2RCAA 4R73A 3PMVA 4EQ9A 4JSOA 3MP8A 3K6VA 1URSA 2REJA 1SI0A 5I2KA 4KD5A 5FHMA 3UIFA 3TELA 2Y7RA 1R9LA 4OTEA 5EHMA 4OQOA 4DCYA 1IITA 4NF5A 1LSTA 1B6HA 5I2NA 3B6WA 1NNTA 5H8SA 4OEUA 2B3FA 2VGQA 4DIGA 3O29A 4BDLA 3T9VA 3QYTA 1MQJA 1XT8A 2G29A 4YB7A 3FXQA 1VFEA 2H98A 5A5XA 4I62A 3S9MC 2DSFA 3TTLA 2P2AA 4GXAA 2O1LA 3KSXA 2O84X 1JW1A 3MZ1A 2I48A 4DZ1A 1I6AA 1RYXA 4H67A 4FORA 4KYEA 4G68A 4OEVA 3VVFA 2XXIA 1N7XA 2F5XA 4FEBA 4JWYA 2PX1A 1D3KA 4Q5TA 2UVGA 4IO6A 3CR9A 5DEXB 1H43A 3PGFA 4Z0IA 4YU0A 1FQBA 4QSCA 3TCGA 3H6WA 3M8UA 3PUWE 1ZBMA 1HSLA 1UTHB 2XXXA 5JTYB 3TTKA 1FTLA 4LP2B 5L9SA 1FW0A 1Y1ZA 3VDFA 1M5BA 2ZNUA 1MH4A 2F36A 3RTFB 4QFLA 3THIA 5AA4A 4EF2A 4Q0CA 1USYH 2Z8DA 2Z8EA 4XKNA 1BLFA 4QHQA 1B3FA 4GRKA 2GH9A 1PB7A 5JEIA 2Z23A 1CB6A 2IEEA 3KFMA 2H4IA 4WEDA 4QF9A 4F1UA 1PB8A 1URDA 1HSJA 4OMBA 2O7UA 2H25A 2XXQA 3H6VA 2F78A 5KDTB 4GXSB 3OEMA 2V3TA 1SYIA 1KWHA 4GL8A 4ZS9A 3T9HB 2Y84A 1QUJA 3QSLA 2PT2A 4YKJA 2B3BA 1A40A 4THIA 4JDFA 3C36A 3G3JA 3ZSFA 2RF1A 1ZU0A 1NNKA 4AB5A 2I0BA 3Q28A 1B2HA 1B3HA 2A5SA 2AL4A 3EN3A 3HO7A 3PPPA 3OOAA 2NOOA 5AA2D 1LAGE 4XTCQ 3W15C 1QKBA 3FIRA 2GHAA 3H6TA 5LOMA 3K00A 3OO9A 1S9TA 2I6EA 3OEKA 2ZMBA 1WODA 3KSJA 2Z8FA 2XX7A 4EXLA 1NH8A 1Y3NA 5I58A 3C4MA 4RXLA 2QL3A 1MDQA 4U2RA 4JWXA 3OO7A 3B6QA 4JBZA 3TEPA 4GD5A 3IB1A 3PUZE 3G3GA 2V3QA 2NXOA 1RYOA 1Y4CA 1M5CA 2X7PA 2QS2A 3UGWA 2DE2A 4MBPA 1DSNA 3HPIA 1BTJA 4BDNA 1VE4A 3BFTA 1D9VA 1LBCA 1MS7A 5I59B 1MH3A 4DXBA 3W9VA 1I6BA 4KQPA 3FASA 1DOTA 3E9XA 3FJMA 5B7DA 3EPEA 2X26A 1LFIA 4HCYA 2O69A 3ONMA 3HN0A 1MM7A 4NF8B 1A54A 1T0KA 5CMBA 2OK2A 1AIVA 4IO3A 1JVXA 5KCJA 4G8MA 3K2DA 3BFUA 3LSXA 1UTBB 5EHSA 1B3GA 3CSBA 3KN3A 1MXZA 3MP6A 4P0IA 3QXMA 3C33A 4TLLB 1NNPA 2QPQA 3KJTA 2ANJA 4HW8A 1URGA 4U23A 2V93A 1B51A 1FTKA 5DTBA 3LUYA 3EHSA 1D9YA 3QK6A 4RK2A 4RK9A 2KLFA 3F11A 4FIMA 5DEXA 3OSQA 1NL5A 2VOZA 4H0WA 3FXRA 3HHGA 5CMCA 4R9GA 4F3SA 5JTYA 3N6UA 4I1DA 4PFWA 1VFDA 1XS5A 2O1MA 3MVYA 3CFXA 3VLUA 3RTWB 1NH7A 1N84A 4IGTA 2O68A 3K1MA 1FQFA 1LGBC 3QIMA 4UACA 2P1SA 4DXCA 3PUXE 1MY2A 1POTA 1IXIA 3TFLA 2B65A 3MAMA 1LCTA 3R7XA 1FTMA 1R1NA 4R2FA 3PPOA 5ITPA 2HZKA 3O97A 5AA2A 2ZYOA 4F18A 4LZ7A 4X1DA 3VXCA 3T93B 2PYYA 4ESXA 5FHNA 1DPEA 1MQHA 4X48A 1MY1A 4P0GA 2ZYKA 2HAVA 3SERA 2Y7IA 3TPAA 2NWJA 1ZKBA 3TZAA 1OIBA 2V3UA 2QMXA 4GL0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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